SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2617 FitnessBrowser__WCS417:GFF2617 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q3L181 Perakine reductase; EC 1.1.1.317 from Rauvolfia serpentina (Serpentine wood) (Ophioxylon serpentinum) (see paper)
41% identity, 95% coverage: 5:316/328 of query aligns to 4:317/337 of Q3L181

query
sites
Q3L181
I
 
V
T
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
V
 
V
G
 
S
R
 
K
I
 
L
G
 
G
L
 
F
G
 
G
C
 
C
M
 
M
G
 
G
M
 
L
S
 
S
Q
 
G
W
 
D
Y
 
Y
G
 
N
-
 
D
A
 
A
T
 
L
D
 
P
D
 
E
N
 
E
E
 
Q
S
 
G
L
 
I
R
 
A
T
 
V
L
 
I
H
 
K
R
 
E
A
 
A
L
 
F
E
 
N
L
 
C
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
F
F
 
F
D
|
D
S
 
T
A
 
S
E
 
D
A
 
I
Y
|
Y
G
 
G
P
 
E
F
 
N
-
 
G
T
 
S
N
 
N
E
 
E
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
L
A
 
K
G
 
Q
-
 
L
R
 
P
R
 
R
G
 
E
E
 
K
V
 
I
V
 
Q
I
 
V
A
 
G
T
 
T
K
|
K
F
 
F
G
 
G
F
 
I
R
 
H
I
 
E
V
 
I
D
 
G
G
 
F
Q
 
S
I
 
G
V
 
V
G
 
K
V
 
A
D
 
K
S
 
G
S
 
T
E
 
P
S
 
D
N
 
Y
L
 
V
Q
 
R
R
 
S
V
 
C
V
 
C
E
 
E
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
D
T
 
V
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
F
Y
 
Y
Q
 
I
H
|
H
R
 
R
L
 
I
D
 
D
P
 
T
T
 
T
V
 
V
P
 
P
I
 
I
E
 
E
E
 
I
V
 
T
V
 
M
G
 
G
A
 
E
M
 
L
G
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
K
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
L
 
L
C
 
S
E
 
E
V
 
A
G
 
S
T
 
P
R
 
D
T
 
T
I
 
I
E
 
R
R
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
A
T
 
V
H
 
H
P
 
P
I
 
V
S
 
T
V
 
A
I
 
L
Q
 
Q
G
 
I
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
W
 
W
E
 
T
R
 
R
N
 
D
V
 
I
E
 
E
Q
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
C
H
 
R
N
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
A
 
P
F
 
Y
C
 
S
P
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
F
 
L
L
 
F
T
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
A
A
 
I
S
 
K
A
 
E
T
 
S
H
 
-
Y
 
L
D
 
P
A
 
E
N
 
N
D
 
S
F
 
V
R
 
L
Q
 
T
Q
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
R
F
 
F
R
 
V
E
 
G
E
 
E
N
 
N
F
 
L
A
 
E
A
 
K
N
 
N
T
 
K
F
 
Q
L
 
I
T
 
Y
E
 
Y
S
 
R
I
 
I
L
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
Q
S
 
K
W
 
H
S
 
G
M
 
C
T
 
T
P
 
P
A
 
V
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
V
L
 
L
T
 
H
R
 
Q
S
 
G
P
 
E
H
 
D
L
 
V
A
 
V
V
 
P
I
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
T
K
 
T
R
 
K
V
 
I
A
 
K
Y
 
N
L
 
L
E
 
H
E
 
N
N
 
N
V
 
V
A
 
G
A
 
A
D
 
L
A
 
K
C
 
V
V
 
K
L
 
L
N
 
T
D
 
K
E
 
E
Q
 
D
S
 
L
H
 
K
A
 
E
I
 
I
Q
 
S
A
 
D
L
 
A
L
 
V
G
 
P
Q
 
L
W
 
D
A
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E

3v0sA Crystal structure of perakine reductase, founder member of a novel akr subfamily with unique conformational changes during NADPH binding (see paper)
39% identity, 91% coverage: 5:304/328 of query aligns to 4:273/287 of 3v0sA

query
sites
3v0sA
I
 
V
T
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
Q
 
E
V
 
V
G
 
S
R
 
K
I
 
L
G
 
G
L
 
F
G
 
G
C
 
C
M
 
M
G
 
G
M
 
L
S
 
S
Q
 
P
W
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
D
 
E
N
 
E
E
 
Q
S
 
G
L
 
I
R
 
A
T
 
V
L
 
I
H
 
K
R
 
E
A
 
A
L
 
F
E
 
N
L
 
C
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
F
F
 
F
D
|
D
S
 
T
A
 
S
E
 
D
A
 
I
Y
|
Y
G
 
G
P
 
E
F
 
N
-
 
G
T
 
S
N
 
N
E
 
E
R
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
L
A
 
K
G
 
Q
-
 
L
R
 
P
R
 
R
G
 
E
E
 
K
V
 
I
V
 
Q
I
 
V
A
 
G
T
 
T
K
 
K
F
 
F
G
 
G
F
 
I
R
 
H
I
 
E
V
 
I
D
 
G
G
 
F
Q
 
S
I
x
G
V
 
V
G
 
K
V
 
A
D
 
K
S
 
G
S
 
T
E
 
P
S
 
D
N
 
Y
L
 
V
Q
 
R
R
 
S
V
 
C
V
 
C
E
 
E
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
D
T
 
V
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
F
Y
 
Y
Q
 
I
H
|
H
R
 
R
L
 
I
D
 
D
P
 
T
T
 
T
V
 
V
P
 
P
I
 
I
E
 
E
E
 
I
V
 
T
V
 
M
G
 
G
A
 
E
M
 
L
G
 
K
R
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
K
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
L
 
L
C
 
S
E
 
E
V
 
A
G
 
S
T
 
P
R
 
D
T
 
T
I
 
I
E
 
R
R
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
A
T
 
V
H
 
H
P
 
P
I
 
V
S
 
T
V
 
A
I
 
L
Q
 
Q
G
 
I
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
W
 
W
E
 
T
R
 
R
N
 
D
V
 
I
E
 
E
Q
 
D
E
 
E
I
 
I
L
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
C
H
 
R
N
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
A
 
P
F
 
Y
C
x
S
P
|
P
L
x
I
G
|
G
R
 
R
G
 
G
F
x
L
L
 
F
T
 
W
G
 
G
K
 
K
A
 
A
A
 
I
S
 
K
A
 
E
T
 
Y
H
 
Y
Y
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
S
 
R
I
 
I
L
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
Q
S
 
K
W
 
H
S
 
G
M
 
C
T
 
T
P
 
P
A
 
V
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
V
L
 
L
T
 
H
R
 
Q
S
 
G
P
 
E
H
 
D
L
 
V
A
 
V
V
 
P
I
 
I
P
|
P
G
|
G
T
|
T
K
x
T
R
 
K
V
 
I
A
 
K
Y
x
N
L
 
L
E
 
H
E
x
N
N
|
N
V
 
V
A
 
G
A
 
A
D
 
L
A
 
K
C
 
V
V
 
K
L
 
L
N
 
T
D
 
K
E
 
E
Q
 
D
S
 
L
H
 
K
A
 
E
I
 
I

O14295 Pyridoxal reductase; PL reductase; PL-red; EC 1.1.1.65 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
31% identity, 95% coverage: 10:322/328 of query aligns to 5:327/333 of O14295

query
sites
O14295
Q
 
S
G
 
G
L
 
F
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
R
 
P
I
 
I
G
 
G
L
 
F
G
 
G
C
 
L
M
 
M
G
 
G
M
 
L
S
 
T
Q
 
W
W
 
K
Y
 
P
G
 
K
A
 
Q
T
 
T
D
 
P
D
 
D
N
 
E
E
 
E
S
 
A
L
 
F
R
 
E
T
 
V
L
 
M
H
 
N
R
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
S
L
 
Q
G
 
G
V
 
S
N
 
N
F
 
Y
F
 
W
D
 
D
S
 
A
A
 
G
E
 
E
A
 
F
Y
 
Y
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
P
 
P
F
 
T
T
 
S
N
 
N
E
 
L
R
 
D
L
 
L
L
 
L
Q
 
A
R
 
R
A
 
Y
F
 
F
A
 
E
G
 
K
-
 
Y
-
 
P
-
 
E
R
 
N
R
 
A
G
 
N
E
 
K
V
 
V
V
 
F
I
 
L
A
 
S
T
 
V
K
 
K
F
 
G
G
 
G
F
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
L
D
 
D
G
 
F
Q
 
K
I
 
T
V
 
L
G
 
V
V
 
P
D
 
D
S
 
G
S
 
N
E
 
P
S
 
D
N
 
F
L
 
V
Q
 
S
R
 
K
V
 
S
V
 
V
E
 
E
A
 
N
S
 
V
L
 
I
K
 
A
R
 
H
L
 
L
-
 
R
G
 
G
T
 
T
D
 
K
Y
 
K
I
 
L
D
 
D
V
 
L
L
 
F
Y
 
Q
Q
 
C
H
 
A
R
 
R
L
 
V
D
 
D
P
 
P
T
 
N
V
 
V
P
 
P
I
 
I
E
 
E
E
 
T
V
 
T
V
 
M
G
 
K
A
 
T
M
 
L
G
 
K
R
 
G
L
 
F
V
 
V
E
 
D
Q
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
S
Y
 
C
L
 
V
G
 
G
L
 
L
C
 
S
E
 
E
V
 
V
G
 
S
T
 
A
R
 
E
T
 
T
I
 
I
E
 
K
R
 
R
A
 
A
H
 
H
A
 
A
T
 
V
H
 
V
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
A
I
 
V
Q
 
E
G
 
V
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
W
 
F
E
 
S
R
 
R
N
 
D
V
 
I
E
 
E
Q
 
T
E
 
N
-
 
G
I
 
I
L
 
M
P
 
D
L
 
I
L
 
C
H
 
R
N
 
K
L
 
L
G
 
S
I
 
I
G
 
P
Y
 
I
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
C
 
S
P
 
P
L
 
F
G
 
C
R
 
R
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
R
A
 
I
A
 
K
S
 
T
A
 
V
T
 
E
H
 
-
Y
 
-
D
 
D
A
 
L
N
 
K
D
 
E
F
 
F
R
 
A
Q
 
K
Q
 
S
D
 
F
P
 
P
-
 
F
-
 
L
-
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
D
R
 
R
F
 
F
R
 
S
E
 
P
E
 
D
N
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
K
N
 
N
T
 
L
F
 
P
L
 
F
T
 
L
E
 
Q
S
 
A
I
 
V
L
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
K
S
 
K
W
 
F
S
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
M
A
 
P
Q
 
E
L
 
F
A
 
S
L
 
L
A
 
L
W
 
F
L
 
I
L
 
M
T
 
A
R
 
S
S
 
G
P
 
N
H
 
G
L
 
L
A
 
V
V
 
I
-
 
P
I
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
S
K
 
T
R
 
S
V
 
V
A
 
S
Y
 
R
L
 
T
E
 
K
E
x
S
N
 
N
V
 
L
A
 
N
A
 
A
D
 
L
A
 
N
C
 
K
V
 
S
L
 
L
N
 
S
D
 
P
E
 
E
Q
 
Q
S
 
F
H
 
K
A
 
E
I
 
A
Q
 
K
A
 
E
L
 
V
L
 
L
G
 
S
Q
 
K
W
 
Y
A
 
P
V
 
I
A
 
Y
G
 
G
E
 
L
R
 
R
Y
 
Y
E
 
N
Q
 
E
R
 
Q
M
 
L

P80874 Aldo-keto reductase YhdN; AKR11B; General stress protein 69; GSP69; EC 1.1.1.- from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
31% identity, 92% coverage: 6:308/328 of query aligns to 5:310/331 of P80874

query
sites
P80874
T
 
S
L
 
I
G
 
A
T
 
D
Q
 
T
G
 
G
L
 
I
Q
 
E
V
 
A
G
 
S
R
 
R
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
-
x
T
-
x
W
C
 
A
M
 
I
G
 
G
M
 
G
S
 
T
Q
 
M
W
 
W
Y
 
-
G
 
G
A
 
G
T
 
T
D
 
D
D
 
E
N
 
K
E
 
T
S
 
S
L
 
I
R
 
E
T
 
T
L
 
I
H
 
R
R
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
Q
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
L
F
 
I
D
|
D
S
 
T
A
 
A
E
 
P
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
P
 
F
F
 
G
T
 
Q
N
 
S
E
 
E
R
 
E
L
 
I
L
 
V
Q
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
K
-
 
E
-
 
Y
G
 
G
R
 
K
R
 
R
G
 
D
E
 
Q
V
 
V
V
 
I
I
 
L
A
 
A
T
 
T
K
 
K
F
 
T
G
 
A
F
 
L
R
 
D
I
 
W
V
 
K
D
 
N
G
 
N
Q
 
Q
I
 
L
V
 
F
G
 
-
V
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
R
E
 
H
S
 
A
N
 
N
L
 
R
Q
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
N
S
 
S
L
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
Q
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
Y
Y
 
Q
Q
 
V
H
 
H
R
 
W
L
 
P
D
 
D
P
 
P
T
 
L
V
 
V
P
 
P
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
T
V
 
A
G
 
E
A
 
V
M
 
M
G
 
K
R
 
E
L
 
L
V
 
Y
E
 
D
Q
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
R
Y
 
A
L
 
I
G
 
G
L
 
V
C
 
S
E
 
N
V
 
F
G
 
S
T
 
I
R
 
E
T
 
Q
I
 
M
E
 
D
R
 
T
A
 
F
H
 
R
A
 
A
T
 
V
H
 
A
P
 
P
I
 
L
S
 
H
V
 
T
I
 
I
Q
|
Q
G
 
P
E
 
P
Y
 
Y
S
 
N
L
 
L
W
 
F
E
 
E
R
 
R
N
 
E
V
 
M
E
 
E
Q
 
E
E
 
S
I
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
Y
L
 
A
H
 
K
N
 
D
L
 
N
G
 
K
I
 
I
G
 
T
Y
 
T
V
 
L
A
 
L
F
x
Y
C
x
G
P
x
S
L
|
L
G
x
C
R
|
R
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
|
K
A
 
M
A
 
T
S
 
E
A
 
E
T
 
Y
H
 
T
Y
 
F
D
 
E
A
 
G
N
 
D
D
 
D
F
 
L
R
|
R
Q
 
N
Q
 
H
D
 
D
P
 
P
R
 
K
F
 
F
R
 
Q
E
 
K
E
 
P
N
 
R
F
 
F
A
 
K
A
 
E
N
 
Y
T
 
L
F
 
S
L
 
A
T
 
V
E
 
N
S
 
Q
I
 
L
L
 
D
A
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
K
S
 
T
-
 
R
W
 
Y
S
 
G
M
 
K
T
 
S
P
 
V
A
 
I
Q
 
H
L
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
R
W
 
W
L
 
I
L
 
L
T
 
D
R
 
Q
S
 
P
P
 
G
H
 
A
L
 
D
A
 
I
V
 
A
I
 
L
P
 
W
G
|
G
T
x
A
K
x
R
R
 
K
V
 
P
A
 
G
Y
x
Q
L
 
L
E
 
E
E
 
A
N
 
L
V
 
S
A
 
E
A
 
I
D
 
T
A
 
G
C
 
W
V
 
T
L
 
L
N
 
N
D
 
S
E
 
E
Q
 
D
S
 
Q
H
 
K
A
 
D
I
 
I
Q
 
N
A
 
T
L
 
I
L
 
L

8hnqA The structure of a alcohol dehydrogenase akr13b2 with NADP
35% identity, 88% coverage: 12:298/328 of query aligns to 23:279/286 of 8hnqA

query
sites
8hnqA
L
 
L
Q
 
T
V
 
I
G
 
N
R
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
F
G
|
G
C
 
A
M
|
M
-
x
R
-
 
I
-
 
T
G
 
G
M
 
E
S
 
G
Q
 
I
W
 
W
Y
 
G
G
 
Q
A
 
P
T
 
K
D
 
D
D
 
V
N
 
E
E
 
E
S
 
A
L
 
R
R
 
R
T
 
V
L
 
L
H
 
R
R
 
R
A
 
L
L
 
K
E
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
F
 
F
F
 
V
D
 
D
S
 
T
A
 
A
E
 
E
A
 
S
Y
|
Y
G
 
G
P
 
P
F
 
E
T
 
V
N
 
S
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
I
Q
 
A
R
 
D
A
 
E
F
 
L
A
 
Y
G
 
P
R
 
Y
R
 
D
G
 
G
E
 
-
V
 
F
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
F
 
A
G
 
G
F
x
L
R
 
Q
I
 
R
V
 
P
D
 
G
G
 
P
Q
 
N
I
 
H
V
x
W
G
 
V
V
 
Q
D
 
D
S
 
G
S
 
R
E
 
P
S
 
E
N
 
V
L
 
L
Q
 
R
R
 
R
V
 
G
V
 
L
E
 
E
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
K
T
 
V
D
 
E
Y
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
W
Y
 
Q
Q
 
L
H
 
H
R
|
R
L
 
I
D
 
D
P
 
S
T
 
K
V
 
V
P
 
P
I
 
R
E
 
D
E
 
E
V
 
Q
V
 
F
G
 
A
A
 
A
M
 
I
G
 
A
R
 
G
L
 
F
V
 
V
E
 
K
Q
 
D
G
 
G
K
 
L
V
 
V
K
 
R
Y
 
H
L
 
V
G
 
G
L
 
L
C
 
S
E
 
E
V
 
V
G
 
T
T
 
V
R
 
E
T
 
E
I
 
I
E
 
E
R
 
A
A
 
A
H
 
Q
A
 
K
T
 
Y
H
 
F
P
 
P
I
 
V
S
 
A
V
 
T
I
 
I
Q
|
Q
G
 
N
E
 
R
Y
 
Y
S
 
N
L
 
L
W
 
F
E
 
D
R
 
R
N
 
A
V
 
S
E
 
E
Q
 
E
E
 
E
I
 
-
L
 
L
P
 
E
L
 
F
L
 
C
H
 
E
N
 
A
L
 
N
G
 
A
I
 
I
G
 
G
Y
 
F
V
 
I
A
 
P
F
x
W
C
x
A
P
|
P
L
|
L
G
 
A
R
x
S
G
|
G
F
 
R
L
 
V
T
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
P
A
 
V
S
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
Y
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
L
L
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
A
D
 
Q
S
 
R
W
 
H
S
 
G
M
 
A
T
 
S
P
 
P
A
 
G
Q
 
Q
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
M
L
 
L
T
 
K
R
 
R
S
 
S
P
 
P
H
 
V
L
 
I
A
 
L
V
 
P
I
|
I
P
|
P
G
|
G
T
|
T
K
 
G
R
x
K
V
 
V
A
 
A
Y
x
H
L
 
L
E
 
E
E
|
E
N
|
N
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
G
C
 
I
V
 
T
L
 
L
N
 
S
D
 
E

1pz1A Structure of NADPH-dependent family 11 aldo-keto reductase akr11b(holo) (see paper)
31% identity, 92% coverage: 6:308/328 of query aligns to 5:310/333 of 1pz1A

query
sites
1pz1A
T
 
S
L
 
I
G
 
A
T
 
D
Q
 
T
G
 
G
L
 
I
Q
 
E
V
 
A
G
 
S
R
 
R
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
|
G
-
 
T
-
x
W
C
 
A
M
 
I
G
 
G
M
 
G
S
 
T
Q
 
M
W
 
W
Y
 
-
G
 
G
A
 
G
T
 
T
D
 
D
D
 
E
N
 
K
E
 
T
S
 
S
L
 
I
R
 
E
T
 
T
L
 
I
H
 
R
R
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
Q
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
L
F
 
I
D
|
D
S
 
T
A
 
A
E
 
P
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
P
 
F
F
 
G
T
 
Q
N
 
S
E
 
E
R
 
E
L
 
I
L
 
V
Q
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
I
A
 
K
G
 
E
-
 
Y
-
 
M
R
 
K
R
 
R
G
 
D
E
 
Q
V
 
V
V
 
I
I
 
L
A
 
A
T
 
T
K
 
K
F
 
T
G
 
A
F
 
L
R
 
D
I
 
W
V
x
K
D
 
N
G
 
N
Q
|
Q
I
 
L
V
 
F
G
 
-
V
 
-
D
 
-
S
 
-
S
 
R
E
 
H
S
 
A
N
 
N
L
 
R
Q
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
E
 
E
A
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
N
S
 
S
L
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
Q
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
Y
Y
 
Q
Q
 
V
H
|
H
R
 
W
L
 
P
D
 
D
P
 
P
T
 
L
V
 
V
P
 
P
I
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
T
V
 
A
G
 
E
A
 
V
M
 
M
G
 
K
R
 
E
L
 
L
V
 
Y
E
 
D
Q
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
R
Y
 
A
L
 
I
G
 
G
L
 
V
C
 
S
E
 
N
V
 
F
G
 
S
T
 
I
R
 
E
T
 
Q
I
 
M
E
 
D
R
 
T
A
 
F
H
 
R
A
 
A
T
 
V
H
 
A
P
 
P
I
 
L
S
 
H
V
 
T
I
 
I
Q
|
Q
G
 
P
E
 
P
Y
 
Y
S
 
N
L
 
L
W
 
F
E
 
E
R
 
R
N
 
E
V
 
M
E
 
E
Q
 
E
E
 
S
I
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
Y
L
 
A
H
 
K
N
 
D
L
 
N
G
 
K
I
 
I
G
 
T
Y
 
T
V
 
L
A
 
L
F
x
Y
C
x
G
P
 
S
L
|
L
G
 
C
R
|
R
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
|
K
A
 
M
A
 
T
S
 
E
A
 
E
T
 
Y
H
 
T
Y
 
F
D
 
E
A
 
G
N
 
D
D
 
D
F
 
L
R
 
R
Q
 
N
Q
 
H
D
 
D
P
 
P
R
 
K
F
 
F
R
 
Q
E
 
K
E
 
P
N
 
R
F
 
F
A
 
K
A
 
E
N
 
Y
T
 
L
F
 
S
L
 
A
T
 
V
E
 
N
S
 
Q
I
 
L
L
 
D
A
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
K
S
 
T
-
 
R
W
 
Y
S
 
G
M
 
K
T
 
S
P
 
V
A
 
I
Q
 
H
L
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
R
W
 
W
L
 
I
L
 
L
T
 
D
R
 
Q
S
 
P
P
 
G
H
 
A
L
 
D
A
 
I
V
 
A
I
 
L
P
 
W
G
|
G
T
 
A
K
x
R
R
 
K
V
 
P
A
 
G
Y
x
Q
L
 
L
E
 
E
E
 
A
N
 
L
V
 
S
A
 
E
A
 
I
D
 
T
A
 
G
C
 
W
V
 
T
L
 
L
N
 
N
D
 
S
E
 
E
Q
 
D
S
 
Q
H
 
K
A
 
D
I
 
I
Q
 
N
A
 
T
L
 
I
L
 
L

P46336 Aldo-keto reductase IolS; AKR11A; Vegetative protein 147; VEG147; EC 1.1.1.- from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
31% identity, 92% coverage: 7:309/328 of query aligns to 6:310/310 of P46336

query
sites
P46336
L
 
L
G
 
G
T
 
K
Q
 
S
G
 
D
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
G
 
F
R
 
P
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
-
 
T
-
 
N
C
 
A
M
 
V
G
 
G
M
 
G
S
 
H
Q
 
N
W
 
L
Y
 
Y
G
 
P
A
 
N
T
 
L
D
 
N
D
 
E
N
 
E
E
 
T
S
 
G
L
 
K
R
 
E
T
 
L
L
 
V
H
 
R
R
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
R
L
 
N
G
 
G
V
 
V
N
 
T
F
 
M
F
 
L
D
 
D
S
 
T
A
 
A
E
 
Y
A
 
I
Y
 
Y
G
 
G
P
 
I
F
 
G
T
 
R
N
 
S
E
 
E
R
 
E
L
 
L
L
 
I
Q
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
L
R
 
R
A
 
E
F
 
F
A
 
-
G
 
-
R
 
N
R
 
R
G
 
E
E
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
F
 
A
G
 
A
F
 
H
R
 
R
I
 
K
V
 
Q
D
 
G
G
 
N
Q
 
D
I
 
F
V
 
V
G
 
-
V
 
F
D
 
D
S
 
N
S
 
S
E
 
P
S
 
D
N
 
F
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
V
 
S
V
 
V
E
 
D
A
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
N
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
F
Y
 
Y
Q
 
I
H
 
H
R
 
F
L
 
P
D
 
D
P
 
E
T
 
H
V
 
T
P
 
P
I
 
K
E
 
D
E
 
E
V
 
A
V
 
V
G
 
N
A
 
A
M
 
L
G
 
N
R
 
E
L
 
M
V
 
K
E
 
K
Q
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
R
Y
 
S
L
 
I
G
 
G
L
 
V
C
x
S
E
x
N
V
 
F
G
 
S
T
 
L
R
 
E
T
 
Q
I
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
A
H
 
N
A
 
K
T
 
D
H
 
G
P
 
L
I
 
V
S
 
D
V
 
V
I
 
L
Q
|
Q
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
S
 
N
L
 
L
W
 
L
E
 
N
R
 
R
N
 
E
V
 
A
E
 
E
Q
 
K
E
 
T
I
 
F
L
 
F
P
 
P
L
 
Y
L
 
T
H
 
K
N
 
E
L
 
H
G
 
N
I
 
I
G
 
S
Y
 
F
V
 
I
A
 
P
F
x
Y
C
x
F
P
|
P
L
|
L
G
x
V
R
x
S
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
A
G
 
G
K
|
K
A
 
Y
A
 
T
S
 
E
A
 
D
T
 
T
H
 
T
Y
 
F
D
 
P
A
 
E
N
 
G
D
 
D
F
 
L
R
 
R
Q
 
N
Q
 
E
D
 
Q
P
 
E
R
 
H
F
 
F
R
 
K
E
 
G
E
 
E
N
 
R
F
 
F
A
 
K
A
 
E
N
 
N
T
 
I
F
 
R
L
 
K
T
 
V
E
 
N
S
 
K
I
 
L
L
 
A
A
 
P
L
 
I
A
 
A
D
 
E
S
 
K
W
 
H
S
 
N
M
 
V
T
 
D
P
 
I
A
 
P
Q
 
H
L
 
I
A
 
V
L
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
Y
L
 
L
T
 
A
R
 
R
S
 
P
P
 
E
H
 
I
L
 
D
A
 
I
V
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
A
K
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
D
Y
 
Q
L
 
L
E
 
I
E
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
K
A
 
T
D
 
A
A
 
D
C
 
V
V
 
T
L
 
L
N
 
S
D
 
Q
E
 
E
Q
 
D
S
 
I
H
 
S
A
 
F
I
 
I
Q
 
D
A
 
K
L
 
L
L
 
F
G
 
A

1pz0A Structure of NADPH-dependent family 11 aldo-keto reductase akr11a(holo) (see paper)
31% identity, 92% coverage: 7:309/328 of query aligns to 5:309/311 of 1pz0A

query
sites
1pz0A
L
 
L
G
 
G
T
 
K
Q
 
S
G
 
D
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
G
 
F
R
 
P
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
-
 
T
-
 
N
C
 
A
M
 
V
G
 
G
M
 
G
S
 
H
Q
 
N
W
 
L
Y
 
Y
G
 
P
A
 
N
T
 
L
D
 
N
D
 
E
N
 
E
E
 
T
S
 
G
L
 
K
R
 
E
T
 
L
L
 
V
H
 
R
R
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
R
L
 
N
G
 
G
V
 
V
N
 
T
F
 
M
F
 
L
D
|
D
S
 
T
A
 
A
E
 
Y
A
 
I
Y
|
Y
G
 
G
P
 
I
F
 
G
T
 
R
N
 
S
E
 
E
R
 
E
L
 
L
L
 
I
Q
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
L
R
 
R
A
 
E
F
 
F
A
 
-
G
 
-
R
 
N
R
 
R
G
 
E
E
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
F
 
A
G
 
A
F
 
H
R
 
R
I
 
K
V
 
Q
D
 
G
G
x
N
Q
 
D
I
 
F
V
 
V
G
 
-
V
 
F
D
 
D
S
 
N
S
 
S
E
 
P
S
 
D
N
 
F
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
V
 
S
V
 
V
E
 
D
A
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
N
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
F
Y
 
Y
Q
 
I
H
|
H
R
 
F
L
 
P
D
 
D
P
 
E
T
 
H
V
 
T
P
 
P
I
 
K
E
 
D
E
 
E
V
 
A
V
 
V
G
 
N
A
 
A
M
 
L
G
 
N
R
 
E
L
 
M
V
 
K
E
 
K
Q
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
R
Y
 
S
L
 
I
G
 
G
L
 
V
C
 
S
E
 
N
V
 
F
G
 
S
T
 
L
R
 
E
T
 
Q
I
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
A
H
 
N
A
 
K
T
 
D
H
 
G
P
 
L
I
 
V
S
 
D
V
 
V
I
 
L
Q
|
Q
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
S
 
N
L
 
L
W
 
L
E
 
N
R
 
R
N
 
E
V
 
A
E
 
E
Q
 
K
E
 
T
I
 
F
L
 
F
P
 
P
L
 
Y
L
 
T
H
 
K
N
 
E
L
 
H
G
 
N
I
 
I
G
 
S
Y
 
F
V
 
I
A
 
P
F
x
Y
C
x
F
P
|
P
L
|
L
G
 
V
R
x
S
G
|
G
F
 
L
L
 
L
T
x
A
G
 
G
K
|
K
A
 
Y
A
 
T
S
 
E
A
 
D
T
 
T
H
 
T
Y
 
F
D
 
P
A
 
E
N
 
G
D
 
D
F
 
L
R
 
R
Q
 
N
Q
 
E
D
 
Q
P
 
E
R
 
H
F
 
F
R
 
K
E
 
G
E
 
E
N
 
R
F
 
F
A
 
K
A
 
E
N
 
N
T
 
I
F
 
R
L
 
K
T
 
V
E
 
N
S
 
K
I
 
L
L
 
A
A
 
P
L
 
I
A
 
A
D
 
E
S
 
K
W
 
H
S
 
N
M
 
V
T
 
D
P
 
I
A
 
P
Q
 
H
L
 
I
A
 
V
L
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
Y
L
 
L
T
 
A
R
 
R
S
 
P
P
 
E
H
 
I
L
 
D
A
 
I
V
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
T
 
A
K
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
D
Y
 
Q
L
 
L
E
 
I
E
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
K
A
 
T
D
 
A
A
 
D
C
 
V
V
 
T
L
 
L
N
 
S
D
 
Q
E
 
E
Q
 
D
S
 
I
H
 
S
A
 
F
I
 
I
Q
 
D
A
 
K
L
 
L
L
 
F
G
 
A

4aubB The complex structure of the bacterial aldo-keto reductase akr14a1 with NADP and citrate (see paper)
33% identity, 87% coverage: 8:291/328 of query aligns to 17:303/335 of 4aubB

query
sites
4aubB
G
 
G
T
 
K
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
R
V
 
L
G
 
P
R
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
G
|
G
C
 
L
M
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
-
Q
 
-
W
|
W
-
 
H
-
 
N
Y
 
F
G
 
G
A
 
H
T
 
V
D
 
N
D
 
A
N
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
Q
R
 
R
T
 
A
-
 
I
L
 
L
H
 
R
R
 
K
A
 
A
L
 
F
E
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
H
F
 
F
D
|
D
S
 
L
A
 
A
E
 
N
A
 
N
Y
|
Y
G
 
G
P
 
P
F
 
P
T
 
P
N
 
G
E
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
F
-
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
R
 
E
A
 
D
F
 
F
A
 
A
G
 
A
R
 
Y
R
 
R
G
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
S
T
 
T
K
 
K
F
 
A
G
 
G
F
 
Y
R
 
D
I
 
M
V
 
W
D
 
P
G
 
G
Q
 
P
I
 
-
V
 
Y
G
 
G
V
 
S
D
 
G
S
 
G
S
 
S
E
 
R
S
 
K
N
 
Y
L
 
L
Q
 
L
R
 
A
V
 
S
V
 
L
E
 
D
A
 
Q
S
 
S
L
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
M
G
 
G
T
 
L
D
 
E
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
F
Y
 
Y
Q
 
S
H
|
H
R
 
R
L
 
V
D
 
D
P
 
E
T
 
N
V
 
T
P
 
P
I
 
M
E
 
E
E
 
E
V
 
T
V
 
A
G
 
S
A
 
A
M
 
L
G
 
A
R
 
H
L
 
A
V
 
V
E
 
Q
Q
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
A
K
 
L
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
L
 
I
C
 
S
E
 
S
V
 
Y
G
 
S
T
 
P
R
 
E
T
 
R
I
 
T
E
 
Q
R
 
K
A
 
M
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
R
H
 
E
A
 
W
T
 
K
H
 
I
P
 
P
I
 
L
S
 
L
V
 
I
I
 
H
Q
|
Q
G
 
P
E
 
S
Y
 
Y
S
 
N
L
 
L
W
 
L
E
 
N
R
 
R
N
 
W
V
 
V
E
 
D
Q
 
K
E
 
S
-
 
G
I
 
L
L
 
L
P
 
D
L
 
T
L
 
L
H
 
Q
N
 
N
L
 
N
G
 
G
I
 
V
G
 
G
Y
 
C
V
 
I
A
 
A
F
|
F
C
x
T
P
|
P
L
|
L
G
 
A
R
x
Q
G
|
G
F
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
|
K
A
 
Y
A
 
L
S
 
N
A
 
G
T
 
I
H
 
P
Y
 
Q
D
 
D
A
 
S
N
 
-
D
 
-
F
 
-
R
|
R
Q
 
M
Q
 
H
D
x
R
P
 
P
R
 
K
-
 
M
F
 
L
R
 
T
E
 
E
E
 
A
N
 
N
F
 
L
A
 
N
A
 
S
N
 
L
T
 
R
F
 
L
L
 
L
T
 
N
E
 
E
S
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
M
A
 
A
D
 
Q
S
 
Q
W
 
R
S
 
G
M
 
Q
T
 
S
P
 
M
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
S
W
 
W
L
 
L
L
 
L
T
 
K
R
 
D
S
 
D
P
 
R
H
 
V
L
 
T
A
 
S
V
 
V
I
x
L
P
 
I
G
|
G
T
 
A
K
x
S
R
 
R
V
 
A
A
 
E
Y
x
Q
L
 
L
E
 
E
E
|
E
N
|
N
V
 
V
A
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

8jwmB Crystal structure of akrtyl-NADP-tylosin complex (see paper)
35% identity, 89% coverage: 7:299/328 of query aligns to 6:310/331 of 8jwmB

query
sites
8jwmB
L
 
L
G
 
G
T
 
R
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
G
 
S
R
 
R
I
 
L
G
 
V
L
 
L
G
|
G
C
 
T
M
|
M
G
 
N
M
 
F
S
 
G
Q
 
P
W
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
T
T
 
T
D
 
D
D
 
E
N
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
H
R
 
A
T
 
I
L
 
M
H
 
D
R
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
N
F
 
F
F
 
F
D
|
D
S
 
T
A
 
A
E
 
N
A
 
V
Y
|
Y
G
 
G
P
x
W
F
 
G
T
 
E
N
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
R
-
 
T
E
 
E
R
 
E
L
 
I
L
 
L
Q
 
G
R
 
S
A
 
W
F
 
F
A
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
G
 
D
R
 
R
R
 
R
G
 
D
E
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
T
K
 
K
-
 
V
F
 
Y
G
 
G
F
 
N
R
 
M
I
 
G
V
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
P
I
 
A
V
 
W
G
 
P
V
 
N
D
 
H
S
 
D
S
 
K
E
 
L
S
 
S
-
 
A
-
 
L
N
 
N
L
 
I
Q
 
R
R
 
R
V
 
S
V
 
V
E
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
Y
Y
 
Q
Q
 
F
H
|
H
R
 
H
L
 
V
D
 
D
P
 
R
T
 
D
V
 
T
P
 
P
I
 
W
E
 
D
E
 
E
V
 
I
V
 
W
G
 
Q
A
 
A
M
 
M
G
 
D
R
 
V
L
 
L
V
 
V
E
 
R
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
L
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
L
 
S
C
 
S
E
x
N
V
 
F
G
 
A
T
 
G
R
 
W
T
 
N
I
 
I
E
 
A
R
 
Q
A
 
A
H
 
N
A
 
E
T
 
T
H
 
A
P
 
A
-
 
R
-
 
H
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
G
I
 
L
S
 
V
V
 
S
I
 
E
Q
|
Q
G
 
C
E
 
L
Y
 
Y
S
 
N
L
 
L
W
x
C
E
|
E
R
 
R
N
x
R
V
 
A
E
 
E
Q
 
M
E
 
E
I
 
V
L
 
V
P
 
P
L
 
A
L
 
A
H
 
R
N
 
E
L
 
Y
G
 
G
I
 
L
G
 
G
Y
 
V
V
 
I
A
 
A
F
x
W
C
x
S
P
|
P
L
|
L
G
 
H
R
x
G
G
|
G
F
 
L
L
 
L
T
 
G
G
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
Q
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
x
R
K
x
R
A
|
A
A
 
A
S
 
S
A
x
G
T
x
R
H
 
A
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
Q
 
L
Q
 
K
D
 
D
P
 
P
R
x
Q
F
 
Q
R
 
R
E
|
E
E
x
Q
N
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
I
E
 
Q
S
x
R
I
 
Y
L
 
E
A
 
D
L
 
L
A
 
L
D
 
D
S
 
K
W
 
H
S
 
G
M
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
G
Q
 
E
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
L
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
P
P
 
G
H
 
V
L
 
T
A
 
G
V
 
P
I
|
I
P
 
V
G
|
G
T
 
P
K
x
R
R
 
T
V
 
A
A
 
D
Y
x
Q
L
 
L
E
 
A
E
x
S
N
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
A
D
 
A
A
 
E
C
 
L
V
 
T
L
 
L
N
 
T
D
 
D
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8jwkD The second purified state crystal structure of akrtyl (see paper)
35% identity, 89% coverage: 7:299/328 of query aligns to 6:293/314 of 8jwkD

query
sites
8jwkD
L
 
L
G
 
G
T
 
R
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
G
 
S
R
 
R
I
 
L
G
 
V
L
 
L
G
|
G
C
 
T
M
|
M
G
 
N
M
 
F
S
 
G
Q
 
P
W
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
T
T
 
T
D
 
D
D
 
E
N
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
H
R
 
A
T
 
I
L
 
M
H
 
D
R
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
N
F
 
F
F
 
F
D
|
D
S
 
T
A
 
A
E
 
N
A
 
V
Y
|
Y
G
 
G
P
 
W
F
 
G
T
 
E
N
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
R
-
 
T
E
 
E
R
 
E
L
 
I
L
 
L
Q
 
G
R
 
S
A
 
W
F
 
F
A
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
G
 
D
R
 
R
R
 
R
G
 
D
E
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
T
K
 
K
-
 
V
F
 
Y
G
 
G
F
 
N
R
 
M
I
 
G
V
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
P
I
 
A
V
 
W
G
 
P
V
 
N
D
 
H
S
 
D
S
 
K
E
 
L
S
 
S
-
 
A
-
 
L
N
 
N
L
 
I
Q
 
R
R
 
R
V
 
S
V
 
V
E
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
Y
Y
 
Q
Q
 
F
H
|
H
R
 
H
L
 
V
D
 
D
P
 
R
T
 
D
V
 
T
P
 
P
I
 
W
E
 
D
E
 
E
V
 
I
V
 
W
G
 
Q
A
 
A
M
 
M
G
 
D
R
 
V
L
 
L
V
 
V
E
 
R
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
L
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
L
 
S
C
 
S
E
 
N
V
 
F
G
 
A
T
 
G
R
 
W
T
 
N
I
 
I
E
 
A
R
 
Q
A
 
A
H
 
N
A
 
E
T
 
T
H
 
A
P
 
A
-
 
R
-
 
H
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
G
I
 
L
S
 
V
V
 
S
I
 
E
Q
|
Q
G
 
C
E
 
L
Y
 
Y
S
 
N
L
 
L
W
 
C
E
 
E
R
 
R
N
 
R
V
 
A
E
 
E
Q
 
M
E
 
E
I
 
V
L
 
V
P
 
P
L
 
A
L
 
A
H
 
R
N
 
E
L
 
Y
G
 
G
I
 
L
G
 
G
Y
 
V
V
 
I
A
 
A
F
x
W
C
x
S
P
|
P
L
|
L
G
 
H
R
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
G
G
 
G
K
 
I
A
 
R
A
 
K
S
 
D
A
 
A
T
 
L
H
 
-
Y
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
K
D
 
D
P
 
P
R
 
Q
F
 
Q
R
 
R
E
 
E
E
 
Q
N
 
I
F
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
S
 
Q
I
 
R
L
 
Y
A
 
E
L
 
L
A
 
L
D
 
D
S
 
K
W
 
H
S
 
G
M
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
G
Q
 
E
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
L
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
P
P
 
G
H
 
V
L
 
T
A
 
G
V
 
P
I
|
I
P
 
V
G
|
G
T
 
P
K
x
R
R
 
T
V
 
A
A
 
D
Y
x
Q
L
 
L
E
 
A
E
x
S
N
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
A
D
 
A
A
 
E
C
 
L
V
 
T
L
 
L
N
 
T
D
 
D
E
 
E

8jwoL Crystal structure of akrtyl-tylosin complex (see paper)
35% identity, 89% coverage: 7:299/328 of query aligns to 6:290/311 of 8jwoL

query
sites
8jwoL
L
 
L
G
 
G
T
 
R
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
G
 
S
R
 
R
I
 
L
G
 
V
L
 
L
G
 
G
C
 
T
M
 
M
G
 
N
M
 
F
S
 
G
Q
 
P
W
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
T
T
 
T
D
 
D
D
 
E
N
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
H
R
 
A
T
 
I
L
 
M
H
 
D
R
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
N
F
 
F
F
 
F
D
 
D
S
 
T
A
 
A
E
 
N
A
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
W
F
 
G
T
 
E
N
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
R
-
 
T
E
 
E
R
 
E
L
 
I
L
 
L
Q
 
G
R
 
S
A
 
W
F
 
F
A
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
G
 
D
R
 
R
R
 
R
G
 
D
E
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
T
K
 
K
-
 
V
F
 
Y
G
 
G
F
 
N
R
 
M
I
 
G
V
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
P
I
 
A
V
 
W
G
 
P
V
 
N
D
 
H
S
 
D
S
 
K
E
 
L
S
 
S
-
 
A
-
 
L
N
 
N
L
 
I
Q
 
R
R
 
R
V
 
S
V
 
V
E
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
Y
Y
 
Q
Q
 
F
H
 
H
R
 
H
L
 
V
D
 
D
P
 
R
T
 
D
V
 
T
P
 
P
I
 
W
E
 
D
E
 
E
V
 
I
V
 
W
G
 
Q
A
 
A
M
 
M
G
 
D
R
 
V
L
 
L
V
 
V
E
 
R
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
L
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
L
 
S
C
 
S
E
 
N
V
 
F
G
 
A
T
 
G
R
 
W
T
 
N
I
 
I
E
 
A
R
 
Q
A
 
A
H
 
N
A
 
E
T
 
T
H
 
A
P
 
A
-
 
R
-
 
H
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
G
I
 
L
S
 
V
V
 
S
I
 
E
Q
 
Q
G
 
C
E
 
L
Y
 
Y
S
 
N
L
 
L
W
x
C
E
|
E
R
 
R
N
 
R
V
 
A
E
 
E
Q
 
M
E
 
E
I
 
V
L
 
V
P
 
P
L
 
A
L
 
A
H
 
R
N
 
E
L
 
Y
G
 
G
I
 
L
G
 
G
Y
 
V
V
 
I
A
 
A
F
 
W
C
 
S
P
 
P
L
 
L
G
 
H
R
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
G
G
 
G
K
 
A
A
 
I
A
 
R
S
 
K
A
 
P
T
x
Q
H
 
Q
Y
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
R
Q
 
E
Q
|
Q
D
 
I
P
 
Q
R
|
R
F
 
Y
R
 
E
E
 
D
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
L
D
 
D
S
 
K
W
 
H
S
 
G
M
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
G
Q
 
E
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
L
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
P
P
 
G
H
 
V
L
 
T
A
 
G
V
 
P
I
 
I
P
 
V
G
 
G
T
 
P
K
 
R
R
 
T
V
 
A
A
 
D
Y
 
Q
L
 
L
E
 
A
E
 
S
N
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
A
D
 
A
A
 
E
C
 
L
V
 
T
L
 
L
N
 
T
D
 
D
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8jwkH The second purified state crystal structure of akrtyl (see paper)
34% identity, 92% coverage: 7:308/328 of query aligns to 6:295/307 of 8jwkH

query
sites
8jwkH
L
 
L
G
 
G
T
 
R
Q
 
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
G
 
S
R
 
R
I
 
L
G
 
V
L
 
L
G
|
G
C
 
T
M
|
M
G
 
N
M
 
F
S
 
G
Q
 
P
W
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
T
T
 
T
D
 
D
D
 
E
N
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
H
R
 
A
T
 
I
L
 
M
H
 
D
R
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
A
G
 
G
V
 
I
N
 
N
F
 
F
F
 
F
D
|
D
S
 
T
A
 
A
E
 
N
A
 
V
Y
|
Y
G
 
G
P
 
W
F
 
G
T
 
E
N
 
N
-
 
K
-
 
G
-
 
R
-
 
T
E
 
E
R
 
E
L
 
I
L
 
L
Q
 
G
R
 
S
A
 
W
F
 
F
A
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
G
 
D
R
 
R
R
 
R
G
 
D
E
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
T
K
 
K
F
 
V
G
 
Y
F
 
G
R
 
N
I
 
M
V
 
G
D
 
D
G
 
G
Q
 
P
I
 
A
V
 
W
G
 
P
V
 
N
D
 
H
S
 
D
S
 
K
E
 
L
S
 
S
-
 
A
-
 
L
N
 
N
L
 
I
Q
 
R
R
 
R
V
 
S
V
 
V
E
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
 
D
Y
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
Y
Y
 
Q
Q
 
F
H
|
H
R
 
H
L
 
V
D
 
D
P
 
R
T
 
D
V
 
T
P
 
P
I
 
W
E
 
D
E
 
E
V
 
I
V
 
W
G
 
Q
A
 
A
M
 
M
G
 
D
R
 
V
L
 
L
V
 
V
E
 
R
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
L
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
L
 
S
C
 
S
E
x
N
V
 
F
G
 
A
T
 
G
R
 
W
T
 
N
I
 
I
E
 
A
R
 
Q
A
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
R
H
 
H
A
 
G
T
 
R
H
 
L
P
 
G
I
 
L
S
 
V
V
 
S
I
 
E
Q
|
Q
G
 
C
E
 
L
Y
 
Y
S
 
N
L
 
L
W
 
C
E
 
E
R
 
R
N
 
R
V
 
A
E
 
E
Q
 
M
E
 
E
I
 
V
L
 
V
P
 
P
L
 
A
L
 
A
H
 
R
N
 
E
L
 
Y
G
 
G
I
 
L
G
 
G
Y
 
V
V
 
I
A
 
A
F
x
W
C
x
S
P
|
P
L
|
L
G
 
H
R
x
G
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
G
G
 
G
K
 
I
A
 
R
A
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
Y
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
K
Q
 
E
Q
 
Q
D
 
R
P
 
E
R
 
Q
F
 
I
R
 
R
E
 
Y
E
 
E
N
 
D
F
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
L
D
 
D
S
 
K
W
 
H
S
 
G
M
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
G
Q
 
E
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
L
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
P
P
 
G
H
 
V
L
 
T
A
 
G
V
 
P
I
|
I
P
 
V
G
|
G
T
 
P
K
x
R
R
 
T
V
 
A
A
 
D
Y
x
Q
L
 
L
E
 
A
E
x
S
N
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
A
D
 
A
A
 
E
C
 
L
V
 
T
L
 
L
N
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
V
S
 
L
H
 
T
A
 
A
I
 
L
Q
 
D
A
 
E
L
 
I
L
 
F

3n6qD Crystal structure of yghz from e. Coli (see paper)
32% identity, 87% coverage: 8:291/328 of query aligns to 18:290/315 of 3n6qD

query
sites
3n6qD
G
 
G
T
 
K
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
R
V
 
L
G
 
P
R
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
G
 
G
C
 
L
M
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
-
Q
 
-
W
 
W
-
 
H
-
 
N
Y
 
F
G
 
G
A
x
H
T
 
V
D
 
N
D
 
A
N
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
Q
R
 
R
T
 
A
-
 
I
L
 
L
H
 
R
R
 
K
A
 
A
L
 
F
E
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
H
F
 
F
D
 
D
S
 
L
A
 
A
E
 
N
A
 
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
F
 
P
T
 
P
N
 
G
E
 
S
-
 
A
-
 
E
-
x
E
-
 
N
-
 
F
-
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
R
 
E
A
 
D
F
 
F
A
 
A
G
 
A
R
 
Y
R
 
R
G
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
S
T
 
T
K
 
K
F
 
A
G
 
G
F
 
Y
R
 
D
I
 
M
V
 
W
D
 
P
G
 
G
Q
 
P
I
 
-
V
 
Y
G
 
G
V
 
S
D
 
G
S
 
G
S
 
S
E
 
R
S
 
K
N
 
Y
L
 
L
Q
 
L
R
 
A
V
 
S
V
 
L
E
 
D
A
 
Q
S
 
S
L
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
M
G
 
G
T
 
L
D
 
E
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
F
Y
 
Y
Q
 
S
H
 
H
R
 
R
L
 
V
D
 
D
P
 
E
T
 
N
V
 
T
P
 
P
I
 
M
E
 
E
E
 
E
V
 
T
V
 
A
G
 
S
A
 
A
M
 
L
G
 
A
R
 
H
L
 
A
V
 
V
E
 
Q
Q
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
A
K
 
L
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
L
 
I
C
 
S
E
 
S
V
 
Y
G
 
S
T
 
P
R
 
E
T
 
R
I
 
T
E
 
Q
R
 
K
A
 
M
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
R
H
 
E
A
 
W
T
 
K
H
 
I
P
 
P
I
 
L
S
 
L
V
 
I
I
 
H
Q
 
Q
G
 
P
E
 
S
Y
 
Y
S
 
N
L
 
L
W
 
L
E
 
N
R
 
R
N
 
W
V
 
V
E
 
D
Q
 
K
E
 
S
-
 
G
I
 
L
L
 
L
P
 
D
L
 
T
L
 
L
H
 
Q
N
 
N
L
 
N
G
 
G
I
 
V
G
 
G
Y
 
C
V
 
I
A
 
A
F
 
F
C
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
Q
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
Y
A
 
L
S
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
Y
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
F
 
L
R
 
T
E
 
E
E
 
A
N
 
N
F
 
L
A
 
N
A
 
S
N
 
L
T
 
R
F
 
L
L
 
L
T
 
N
E
 
E
S
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
M
A
 
A
D
 
Q
S
 
Q
W
 
R
S
 
G
M
 
Q
T
 
S
P
 
M
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
S
W
 
W
L
 
L
L
 
L
T
 
K
R
 
D
S
 
D
P
 
R
H
 
V
L
 
T
A
 
S
V
 
V
I
 
L
P
 
I
G
 
G
T
 
A
K
 
S
R
 
R
V
 
A
A
 
E
Y
 
Q
L
 
L
E
 
E
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
Q
A
 
A

6ow0A Crystal structure of mithramycin 3-side chain keto-reductase mtmw in complex with NAD+ and peg (see paper)
35% identity, 80% coverage: 6:267/328 of query aligns to 5:275/323 of 6ow0A

query
sites
6ow0A
T
 
S
L
 
L
G
 
G
T
 
R
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
S
V
 
V
G
 
S
R
 
E
I
 
I
G
 
V
L
 
Y
G
|
G
C
 
N
M
x
L
G
 
L
M
 
Y
S
 
P
Q
 
Q
W
 
-
Y
 
-
G
 
D
A
 
D
T
 
T
D
 
P
D
 
D
N
 
E
E
 
V
S
 
V
L
 
L
R
 
S
T
 
S
L
 
I
H
 
R
R
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
T
F
 
T
F
 
F
D
|
D
S
 
T
A
 
A
E
 
D
A
 
V
Y
|
Y
G
 
G
P
 
M
F
 
F
T
 
R
N
 
S
E
 
E
R
 
S
L
 
L
L
 
L
Q
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
T
-
 
P
R
 
R
G
 
E
E
 
E
V
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
C
T
 
T
K
 
K
F
 
V
G
 
G
F
 
M
R
 
P
I
 
T
V
 
G
D
 
F
G
 
G
Q
 
P
I
 
-
V
 
N
G
 
G
V
 
R
D
 
G
S
 
L
S
 
S
E
 
R
S
 
K
N
 
H
L
 
V
Q
 
M
R
 
E
V
 
S
V
 
V
E
 
D
A
 
G
S
 
S
L
 
L
K
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
R
T
 
V
D
 
D
Y
 
H
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
Y
 
T
Q
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
A
V
 
T
P
 
P
I
 
L
E
 
E
E
 
E
V
 
L
V
 
M
G
 
W
A
 
T
M
 
F
G
 
S
R
 
D
L
 
L
V
 
V
E
 
R
Q
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
L
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
L
 
M
C
x
S
E
 
E
V
 
W
G
 
P
T
 
V
R
 
E
T
 
R
I
 
I
E
 
A
R
 
E
A
 
A
H
 
A
A
 
G
T
 
I
H
 
G
-
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
V
P
 
P
I
 
V
S
 
I
V
 
C
I
 
H
Q
 
M
G
 
P
E
 
R
Y
 
Y
S
 
S
L
 
M
W
 
L
E
 
W
R
 
R
N
 
A
V
 
P
E
 
E
Q
 
A
E
 
E
I
 
V
L
 
I
P
 
P
L
 
A
L
 
C
H
 
R
N
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Q
V
 
I
A
 
C
F
x
Y
C
x
F
P
 
T
L
|
L
G
 
E
R
x
Q
G
|
G
F
 
V
L
 
L
T
|
T
G
 
G
K
|
K
A
 
Y
A
 
A
S
 
P
A
 
G
T
 
A
H
 
P
Y
 
P
D
 
P
A
 
A
N
 
G
D
 
S
F
 
-
R
|
R
Q
 
A
Q
 
T
D
 
A
P
 
P
R
 
K
F
 
G
R
 
G
E
 
R
E
 
A
N
 
P
F
 
L
A
 
M
A
 
R
N
 
R
T
 
W
F
 
L
L
 
D
T
 
D
E
 
D
S
 
K
I
 
V
L
 
L
A
 
G
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
R
-
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
E
S
 
E
W
 
A
S
 
G
M
 
L
T
 
T
P
 
T
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8tf1A Crystal structure of pyridoxal reductase (pdxi)in complex with NADPH and pyridoxal
33% identity, 91% coverage: 3:299/328 of query aligns to 5:276/286 of 8tf1A

query
sites
8tf1A
S
 
N
T
 
T
I
 
F
T
 
T
L
 
L
G
 
G
T
 
T
Q
 
K
G
 
-
L
 
-
Q
 
S
V
 
V
G
 
N
R
 
R
I
 
L
G
 
G
L
 
Y
G
|
G
C
 
A
M
|
M
-
x
Q
-
 
L
-
 
A
G
 
G
M
 
P
S
 
G
Q
 
V
W
 
F
Y
 
G
G
 
P
A
 
P
T
 
R
D
 
D
D
 
R
N
 
H
E
 
V
S
 
A
L
 
I
R
 
T
T
 
V
L
 
L
H
 
R
R
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
F
 
H
F
 
I
D
|
D
S
 
T
A
 
S
E
 
D
A
 
F
Y
|
Y
G
 
G
P
 
P
F
 
H
T
 
V
N
 
T
E
 
N
R
 
Q
L
 
I
L
 
I
Q
 
R
R
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
Y
G
 
P
R
 
Y
R
 
S
G
 
D
E
 
D
V
 
L
V
 
T
I
 
I
A
 
V
T
 
T
K
|
K
F
 
I
G
 
G
F
 
A
R
 
R
I
 
R
V
 
G
D
 
E
G
 
D
Q
 
A
I
 
S
V
x
W
G
 
L
V
 
P
D
 
A
S
 
F
S
 
S
E
 
P
S
 
A
N
 
E
L
 
L
Q
 
Q
R
 
K
V
 
A
V
 
V
E
 
H
A
 
D
S
 
N
L
 
L
K
 
R
R
 
N
L
 
L
G
 
G
T
 
L
D
 
D
Y
 
V
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
V
Y
 
N
Q
 
L
H
x
R
R
 
V
L
 
M
-
 
M
-
 
G
D
 
D
P
 
G
T
 
H
V
 
G
P
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
S
I
 
I
E
 
E
E
 
A
V
 
S
V
 
L
G
 
T
A
 
V
M
 
L
G
 
A
R
 
E
L
 
M
V
 
Q
E
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
K
 
L
V
 
V
K
 
K
Y
 
H
L
 
I
G
 
G
L
 
L
C
 
S
E
 
N
V
 
V
G
 
T
T
 
P
R
 
T
T
 
Q
I
 
V
E
 
A
R
 
E
A
 
A
H
 
R
A
 
K
T
 
I
H
 
A
P
 
E
I
 
I
S
 
V
V
 
C
I
 
V
Q
|
Q
G
 
N
E
 
E
Y
 
Y
S
 
N
L
 
I
W
 
A
E
 
H
R
 
R
N
 
A
V
 
D
E
 
D
Q
 
A
E
 
M
I
 
I
L
 
D
P
 
A
L
 
L
L
 
A
H
 
H
N
 
D
L
 
-
G
 
G
I
 
I
G
 
A
Y
 
Y
V
 
V
A
 
P
F
|
F
C
x
F
P
|
P
L
 
L
G
 
G
R
 
-
G
 
G
F
 
F
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
Y
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
T
 
T
F
 
P
L
 
L
T
 
Q
E
 
S
S
 
S
I
 
T
L
 
L
A
 
S
-
 
D
L
 
V
A
 
A
D
 
A
S
 
S
W
 
L
S
 
G
M
 
A
T
 
T
P
 
P
A
x
M
Q
 
Q
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
R
 
R
S
 
S
P
 
P
H
 
N
L
 
I
A
 
L
V
 
L
I
|
I
P
 
P
G
|
G
T
|
T
K
x
S
R
 
S
V
 
V
A
 
A
Y
x
H
L
 
L
E
 
R
E
|
E
N
|
N
V
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
K
C
 
L
V
 
H
L
 
L
N
 
S
D
 
E
E
 
E

P77256 NADH-specific methylglyoxal reductase; AKR11B2; EC 1.1.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
31% identity, 96% coverage: 2:317/328 of query aligns to 1:326/326 of P77256

query
sites
P77256
V
 
M
S
 
K
T
 
K
I
 
I
T
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
T
Q
 
T
G
 
D
L
 
I
Q
 
T
V
 
L
G
 
S
R
 
R
I
 
M
G
 
G
L
 
L
G
 
G
C
 
T
M
 
W
-
 
A
-
 
I
-
 
G
G
 
G
M
 
G
S
 
P
Q
 
A
W
 
W
Y
 
N
G
 
G
A
 
D
T
 
L
D
 
D
D
 
R
N
 
Q
E
 
I
S
 
C
L
 
I
R
 
D
T
 
T
L
 
I
H
 
L
R
 
E
A
 
A
L
 
H
E
 
R
L
 
C
G
 
G
V
 
I
N
 
N
F
 
L
F
 
I
D
 
D
S
 
T
A
 
A
E
 
P
A
 
G
Y
 
Y
G
 
N
P
 
F
F
 
G
T
 
N
N
 
S
E
 
E
R
 
V
L
 
I
L
 
V
Q
 
G
R
 
Q
A
 
A
F
 
L
A
 
K
G
 
K
-
 
L
R
 
P
R
 
R
G
 
E
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
E
T
 
T
K
 
K
F
 
C
G
 
G
F
 
I
-
 
V
-
 
W
-
 
E
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
N
R
 
K
I
 
V
V
 
G
D
 
D
G
 
R
Q
 
Q
I
 
L
V
 
Y
G
 
K
V
 
N
D
 
L
S
 
S
S
 
P
E
 
E
S
 
S
N
 
-
L
 
I
Q
 
R
R
 
E
V
 
E
V
 
V
E
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
I
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
Y
Y
 
M
Q
 
T
H
 
H
-
 
W
-
 
Q
R
 
S
L
 
V
D
 
P
P
 
P
T
 
F
-
 
F
V
 
T
P
 
P
I
 
I
E
 
A
E
 
E
V
 
T
V
 
V
G
 
A
A
 
V
M
 
L
G
 
N
R
 
E
L
 
L
V
 
K
E
 
S
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
K
 
R
Y
 
A
L
 
I
G
 
G
L
 
A
C
 
A
E
 
N
V
 
V
G
 
D
T
 
A
R
 
D
T
 
H
I
 
I
E
 
R
R
 
E
A
 
Y
H
 
L
A
 
Q
T
 
Y
H
 
G
P
 
E
I
 
L
S
 
D
V
 
I
I
 
I
Q
 
Q
G
 
A
E
 
K
Y
 
Y
S
 
S
L
 
I
W
 
L
E
 
D
R
 
R
N
 
A
V
 
M
E
 
E
Q
 
N
E
 
E
I
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
C
H
 
R
N
 
D
L
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
V
Y
 
V
V
 
Q
A
 
V
F
 
Y
C
 
S
P
 
P
L
 
L
G
 
E
R
 
Q
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
T
A
 
I
A
 
T
S
 
R
A
 
-
T
 
-
H
x
D
Y
 
Y
D
 
V
A
 
P
N
 
G
D
 
G
F
 
A
R
 
R
Q
 
A
Q
 
N
D
 
K
P
 
V
R
 
W
F
 
F
R
 
Q
E
 
R
E
 
E
N
 
N
F
 
M
A
 
L
A
 
K
N
 
V
T
 
I
F
 
D
L
 
M
T
 
L
E
 
E
S
 
Q
I
 
W
L
 
Q
A
 
P
L
 
L
A
 
C
D
 
A
S
 
R
W
 
Y
S
 
Q
M
 
C
T
 
T
P
 
I
A
 
P
Q
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
I
L
 
L
T
 
K
R
 
Q
S
 
S
P
 
D
H
 
L
L
 
I
A
 
S
V
 
I
I
 
L
P
 
S
G
 
G
T
 
A
K
 
T
R
 
A
V
 
P
A
 
E
Y
 
Q
L
 
V
E
 
R
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
-
A
 
-
C
 
-
V
 
-
L
 
L
N
 
N
D
 
I
E
 
N
Q
 
L
S
 
S
H
 
D
A
 
A
I
 
D
Q
 
A
A
 
T
L
 
L
L
 
M
G
 
R
Q
 
E
W
 
M
A
 
A
V
 
E
A
 
A
G
 
L
E
 
E
R
 
R

4aubE The complex structure of the bacterial aldo-keto reductase akr14a1 with NADP and citrate (see paper)
31% identity, 87% coverage: 8:291/328 of query aligns to 18:278/297 of 4aubE

query
sites
4aubE
G
 
G
T
 
K
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
Q
 
R
V
 
L
G
 
P
R
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
G
|
G
C
 
L
M
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
-
Q
 
-
W
|
W
-
 
H
-
 
N
Y
 
F
G
 
G
A
 
H
T
 
V
D
 
N
D
 
A
N
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
Q
R
 
R
T
 
A
-
 
I
L
 
L
H
 
R
R
 
K
A
 
A
L
 
F
E
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
N
 
T
F
 
H
F
 
F
D
|
D
S
 
L
A
 
A
E
 
N
A
 
N
Y
|
Y
G
 
G
P
 
P
F
 
P
T
 
P
N
 
G
E
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
F
-
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
R
 
E
A
 
D
F
 
F
A
 
A
G
 
A
R
 
Y
R
 
R
G
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
S
T
 
T
K
 
K
F
 
A
G
 
G
F
 
Y
R
 
D
I
 
M
V
 
W
D
 
P
G
 
G
Q
 
P
I
 
-
V
 
Y
G
 
G
V
 
S
D
 
G
S
 
G
S
 
S
E
 
R
S
 
K
N
 
Y
L
 
L
Q
 
L
R
 
A
V
 
S
V
 
L
E
 
D
A
 
Q
S
 
S
L
 
L
K
 
K
R
 
R
L
 
M
G
 
G
T
 
L
D
 
E
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
F
Y
 
Y
Q
 
S
H
 
H
R
 
R
L
 
V
D
 
D
P
 
E
T
 
N
V
 
T
P
 
P
I
 
M
E
 
E
E
 
E
V
 
T
V
 
A
G
 
S
A
 
A
M
 
L
G
 
A
R
 
H
L
 
A
V
 
V
E
 
Q
Q
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
A
K
 
L
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
L
 
I
C
 
S
E
 
S
V
 
Y
G
 
S
T
 
P
R
 
E
T
 
R
I
 
T
E
 
Q
R
 
K
A
 
M
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
R
H
 
E
A
 
W
T
 
K
H
 
I
P
 
P
I
 
L
S
 
L
V
 
I
I
 
H
Q
|
Q
G
 
P
E
 
S
Y
 
Y
S
 
N
L
 
L
W
 
L
E
 
N
R
 
R
N
 
W
V
 
V
E
 
D
Q
 
K
E
 
S
-
 
G
I
 
L
L
 
L
P
 
D
L
 
T
L
 
L
H
 
Q
N
 
N
L
 
N
G
 
G
I
 
V
G
 
G
Y
 
C
V
 
I
A
 
A
F
|
F
C
x
T
P
|
P
L
|
L
G
 
A
R
x
Q
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
|
T
G
 
G
K
|
K
A
 
L
A
 
-
S
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
Y
 
-
D
 
-
A
 
L
N
 
N
D
 
E
F
 
M
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
D
 
R
P
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
W
 
-
S
 
G
M
 
Q
T
 
S
P
 
M
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
S
W
 
W
L
 
L
L
 
L
T
 
K
R
 
D
S
 
D
P
 
R
H
 
V
L
 
T
A
 
S
V
 
V
I
x
L
P
 
I
G
|
G
T
 
A
K
x
S
R
 
R
V
 
A
A
 
E
Y
x
Q
L
 
L
E
 
E
E
|
E
N
|
N
V
 
V
A
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1ynqB Aldo-keto reductase akr11c1 from bacillus halodurans (holo form) (see paper)
29% identity, 92% coverage: 7:307/328 of query aligns to 7:287/298 of 1ynqB

query
sites
1ynqB
L
 
L
G
 
G
T
 
T
Q
 
S
G
 
D
L
 
L
Q
 
H
V
 
V
G
 
S
R
 
E
I
 
L
G
 
G
L
 
F
G
|
G
C
|
C
M
|
M
G
x
S
M
 
L
S
 
-
Q
 
-
W
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
G
T
 
T
D
 
D
D
 
E
N
 
T
E
 
K
S
 
A
L
 
R
R
 
R
T
 
I
L
 
M
H
 
D
R
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
I
N
|
N
F
 
Y
F
 
L
D
|
D
S
 
T
A
 
A
E
 
D
A
 
L
Y
|
Y
G
 
N
P
 
Q
F
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
E
R
 
Q
L
 
F
L
 
V
Q
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
Q
E
x
D
V
 
I
V
 
I
I
 
L
A
 
A
T
 
T
K
|
K
F
 
V
G
 
G
F
 
N
R
 
R
I
 
F
V
 
E
D
 
Q
G
 
G
Q
x
K
I
 
E
-
 
G
V
 
W
G
 
W
V
 
W
D
 
D
S
 
P
S
 
S
E
 
K
S
 
A
N
 
Y
L
 
I
Q
 
K
R
 
E
V
 
A
V
 
V
E
 
K
A
 
D
S
 
S
L
 
L
K
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
Q
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
Y
Y
 
Q
Q
 
L
H
|
H
R
 
G
L
 
G
D
 
T
P
 
I
T
 
D
V
 
D
P
 
P
I
 
I
E
 
D
E
 
E
V
 
T
V
 
I
G
 
E
A
 
A
M
 
F
G
 
E
R
 
E
L
 
L
V
 
K
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
K
 
V
V
 
I
K
 
R
Y
 
Y
L
 
Y
G
 
G
L
 
I
C
x
S
E
 
S
V
 
I
G
 
R
T
 
P
R
 
N
T
 
V
I
 
I
E
 
K
R
 
E
A
 
Y
H
 
L
A
 
K
T
 
R
H
 
S
P
 
N
I
 
I
S
 
V
V
 
S
I
 
I
Q
x
M
G
 
M
E
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
L
 
I
W
 
L
E
 
D
R
 
R
N
 
R
V
 
P
E
 
E
Q
 
-
E
 
E
I
 
W
L
 
F
P
 
P
L
 
L
L
 
I
H
 
Q
N
 
E
L
 
H
G
 
G
I
 
V
G
 
S
Y
 
V
V
 
V
A
 
V
F
x
R
C
x
G
P
|
P
L
x
V
G
 
A
R
|
R
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
x
S
G
 
R
K
x
R
A
 
P
A
 
L
S
 
P
A
 
E
T
 
G
H
 
E
Y
 
G
D
 
Y
A
 
L
N
 
N
D
 
-
F
 
Y
R
 
R
Q
 
Y
Q
 
D
D
 
E
P
 
L
R
 
K
F
 
L
R
 
L
E
 
R
E
 
E
N
 
S
F
 
L
A
 
P
A
 
T
N
 
D
T
 
R
F
 
P
L
 
L
T
 
H
E
 
E
S
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
W
 
-
S
 
-
M
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
W
 
Y
L
 
C
L
 
L
T
 
A
R
 
H
S
 
D
P
 
V
H
 
V
L
 
A
A
 
T
V
 
V
I
x
A
P
x
A
G
|
G
T
 
A
K
x
S
R
 
S
V
 
I
A
 
D
Y
x
Q
L
 
V
E
 
K
E
 
A
N
|
N
V
 
V
-
 
Q
A
 
A
A
 
V
D
 
E
A
 
A
C
 
T
V
 
P
L
 
L
N
 
T
D
 
A
E
 
E
Q
 
E
S
 
R
H
 
Q
A
 
H
I
 
I
Q
 
Q
A
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1ynpB Aldo-keto reductase akr11c1 from bacillus halodurans (apo form) (see paper)
29% identity, 92% coverage: 7:307/328 of query aligns to 7:287/298 of 1ynpB

query
sites
1ynpB
L
 
L
G
 
G
T
 
T
Q
 
S
G
 
D
L
 
L
Q
 
H
V
 
V
G
 
S
R
 
E
I
 
L
G
 
G
L
 
F
G
 
G
C
 
C
M
 
M
G
 
S
M
 
L
S
 
-
Q
 
-
W
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
G
T
 
T
D
 
D
D
 
E
N
 
T
E
 
K
S
 
A
L
 
R
R
 
R
T
 
I
L
 
M
H
 
D
R
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
I
N
|
N
F
 
Y
F
 
L
D
|
D
S
 
T
A
 
A
E
 
D
A
 
L
Y
|
Y
G
 
N
P
 
Q
F
 
G
T
 
L
N
 
N
E
 
E
R
 
Q
L
 
F
L
 
V
Q
 
G
R
 
K
A
 
A
F
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
Q
E
x
D
V
 
I
V
 
I
I
 
L
A
 
A
T
 
T
K
 
K
F
 
V
G
 
G
F
 
N
R
 
R
I
 
F
V
 
E
D
 
Q
G
 
G
Q
x
K
I
 
E
-
 
G
V
 
W
G
 
W
V
 
W
D
 
D
S
 
P
S
 
S
E
 
K
S
 
A
N
 
Y
L
 
I
Q
 
K
R
 
E
V
 
A
V
 
V
E
 
K
A
 
D
S
 
S
L
 
L
K
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
Q
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
V
 
L
L
 
Y
Y
 
Q
Q
 
L
H
|
H
R
 
G
L
 
G
D
 
T
P
 
I
T
 
D
V
 
D
P
 
P
I
 
I
E
 
D
E
 
E
V
 
T
V
 
I
G
 
E
A
 
A
M
 
F
G
 
E
R
 
E
L
 
L
V
 
K
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
K
 
V
V
 
I
K
 
R
Y
 
Y
L
 
Y
G
 
G
L
 
I
C
 
S
E
 
S
V
 
I
G
 
R
T
 
P
R
 
N
T
 
V
I
 
I
E
 
K
R
 
E
A
 
Y
H
 
L
A
 
K
T
 
R
H
 
S
P
 
N
I
 
I
S
 
V
V
 
S
I
 
I
Q
 
M
G
 
M
E
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
L
 
I
W
 
L
E
 
D
R
 
R
N
 
R
V
 
P
E
 
E
Q
 
-
E
 
E
I
 
W
L
 
F
P
 
P
L
 
L
L
 
I
H
 
Q
N
 
E
L
 
H
G
 
G
I
 
V
G
 
S
Y
 
V
V
 
V
A
 
V
F
 
R
C
 
G
P
 
P
L
 
V
G
 
A
R
 
R
G
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
S
G
 
R
K
 
R
A
 
P
A
 
L
S
 
P
A
 
E
T
 
G
H
 
E
Y
 
G
D
 
Y
A
 
L
N
 
N
D
 
-
F
 
Y
R
 
R
Q
 
Y
Q
 
D
D
 
E
P
 
L
R
 
K
F
 
L
R
 
L
E
 
R
E
 
E
N
 
S
F
 
L
A
 
P
A
 
T
N
 
D
T
 
R
F
 
P
L
 
L
T
 
H
E
 
E
S
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
W
 
-
S
 
-
M
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
W
 
Y
L
 
C
L
 
L
T
 
A
R
 
H
S
 
D
P
 
V
H
 
V
L
 
A
A
 
T
V
 
V
I
 
A
P
 
A
G
 
G
T
 
A
K
 
S
R
 
S
V
 
I
A
 
D
Y
 
Q
L
 
V
E
 
K
E
 
A
N
 
N
V
 
V
-
 
Q
A
 
A
A
 
V
D
 
E
A
 
A
C
 
T
V
 
P
L
 
L
N
 
T
D
 
A
E
 
E
Q
 
E
S
 
R
H
 
Q
A
 
H
I
 
I
Q
 
Q
A
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF2617 FitnessBrowser__WCS417:GFF2617
MVSTITLGTQGLQVGRIGLGCMGMSQWYGATDDNESLRTLHRALELGVNFFDSAEAYGPF
TNERLLQRAFAGRRGEVVIATKFGFRIVDGQIVGVDSSESNLQRVVEASLKRLGTDYIDV
LYQHRLDPTVPIEEVVGAMGRLVEQGKVKYLGLCEVGTRTIERAHATHPISVIQGEYSLW
ERNVEQEILPLLHNLGIGYVAFCPLGRGFLTGKAASATHYDANDFRQQDPRFREENFAAN
TFLTESILALADSWSMTPAQLALAWLLTRSPHLAVIPGTKRVAYLEENVAADACVLNDEQ
SHAIQALLGQWAVAGERYEQRMMQFIDR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory