SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF282 FitnessBrowser__psRCH2:GFF282 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3triA Structure of a pyrroline-5-carboxylate reductase (proc) from coxiella burnetii (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:272/274 of query aligns to 2:271/272 of 3triA

query
sites
3triA
S
 
T
P
 
S
R
 
N
I
 
I
A
 
T
F
 
F
I
 
I
G
|
G
A
 
G
G
|
G
N
|
N
M
|
M
A
 
A
A
 
R
S
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
I
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
D
A
 
P
E
 
N
A
 
R
I
 
I
R
 
C
A
 
V
S
 
T
D
x
N
P
x
R
G
x
S
A
 
L
E
 
D
Q
x
K
R
 
L
A
 
D
K
 
F
I
 
F
S
 
K
A
 
E
E
 
K
H
 
C
G
 
G
I
 
V
Q
 
H
T
 
T
F
 
T
A
 
Q
Q
 
D
N
|
N
A
 
R
D
 
Q
A
 
G
L
 
A
A
 
L
G
 
N
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
L
S
x
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
V
x
Q
M
 
I
Q
 
K
S
x
M
V
 
V
C
 
C
R
 
E
D
 
E
L
 
L
V
 
K
P
 
D
H
 
I
L
 
L
D
 
S
H
 
E
A
 
T
P
 
K
-
 
I
L
 
L
I
 
V
V
 
I
S
 
S
I
x
L
A
|
A
A
x
V
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
T
D
 
P
S
 
L
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
W
L
 
L
G
 
G
P
 
-
R
 
K
P
 
A
Q
 
S
A
 
R
I
 
I
V
 
V
R
 
R
C
 
A
M
|
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
S
L
 
S
L
 
V
R
 
R
Q
 
A
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
A
N
 
N
A
 
E
Q
 
T
V
 
V
S
 
D
A
 
K
E
 
D
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
N
Q
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
S
L
 
I
L
 
M
S
 
R
A
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
V
L
 
I
W
 
W
L
 
V
E
 
S
E
 
S
E
 
E
R
 
D
L
 
Q
I
 
I
D
 
E
A
 
K
V
 
I
T
 
A
A
 
A
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
I
I
 
M
E
 
E
A
 
A
M
 
L
T
 
Q
A
 
E
A
 
A
G
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
T
R
 
K
D
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
E
Q
 
L
L
 
L
T
 
T
M
 
E
Q
 
Q
T
 
T
A
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
M
 
M
A
 
A
C
 
L
E
 
E
S
 
T
D
 
E
V
 
Q
D
 
S
A
 
V
A
 
V
E
 
Q
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
R
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
N
F
 
L
E
 
R
R
 
E
L
 
L
V
 
F
Q
 
I
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
V
Q
 
N
R
 
R
S
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
K
Q
 
T
L
 
V

2ag8A NADP complex of pyrroline-5-carboxylate reductase from neisseria meningitidis (see paper)
37% identity, 97% coverage: 6:272/274 of query aligns to 3:262/263 of 2ag8A

query
sites
2ag8A
I
 
V
A
 
Y
F
 
F
I
x
L
G
|
G
A
 
G
G
|
G
N
|
N
M
|
M
A
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
V
A
 
K
Q
 
Q
G
 
G
V
 
-
A
 
-
A
 
G
E
 
Y
A
 
R
I
 
I
R
 
Y
A
 
I
S
x
A
D
x
N
P
x
R
G
|
G
A
 
A
E
 
E
Q
x
K
R
 
R
A
 
E
K
 
R
I
 
L
S
 
E
A
 
K
E
 
E
H
 
L
G
 
G
I
 
V
Q
 
E
T
 
T
F
 
S
A
 
A
Q
 
T
N
 
L
A
 
P
D
 
E
A
 
-
L
 
L
A
 
H
G
 
S
A
 
D
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
I
L
 
L
S
x
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
V
 
D
M
 
M
Q
 
E
S
 
A
V
x
A
C
 
C
R
 
K
D
 
N
L
 
I
V
 
R
P
 
T
H
 
N
L
 
-
D
 
-
H
 
-
A
 
G
P
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
L
S
 
S
I
x
V
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
L
S
 
S
C
 
V
D
 
G
S
 
T
L
 
L
Q
 
S
R
 
R
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
P
 
G
R
 
-
P
 
T
Q
 
R
A
 
R
I
 
I
V
 
V
R
 
R
C
 
V
M
|
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
G
L
 
K
L
 
I
R
 
G
Q
 
L
G
 
G
V
 
V
S
 
S
G
 
G
L
 
M
F
 
Y
A
 
A
N
 
E
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
E
E
 
T
Q
 
D
K
 
R
Q
 
R
Q
 
I
A
 
A
E
 
D
Q
 
R
L
 
I
L
 
M
S
 
K
A
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
T
L
 
V
W
 
W
L
 
L
E
 
D
E
 
D
E
 
E
R
 
E
L
 
K
I
 
M
D
 
H
A
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
G
V
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
V
F
 
F
L
 
Y
L
 
L
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
 
Q
A
 
N
A
 
A
G
 
A
E
 
I
Q
 
R
L
 
Q
G
 
G
L
 
F
P
 
D
R
 
M
D
 
A
T
 
E
A
 
A
A
 
R
Q
 
A
L
 
L
T
 
S
M
 
L
Q
 
A
T
 
T
A
 
F
L
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
V
R
 
A
M
 
L
A
 
A
C
 
E
E
 
Q
S
 
T
D
 
G
V
 
E
D
 
D
A
 
F
A
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
R
 
K
R
 
N
V
 
V
T
 
T
S
 
S
P
 
K
N
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
E
 
H
A
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
E
A
 
A
F
 
F
Q
 
R
A
 
R
G
 
H
G
 
R
F
 
V
E
 
A
R
 
E
L
 
A
V
 
I
Q
 
S
Q
 
E
A
 
G
L
 
V
N
 
C
A
 
A
A
 
C
A
 
V
Q
 
R
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
E
 
E
L
 
M
A
 
E
E
 
R
Q
 
Q
L
 
Y

5bshA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with l-proline (see paper)
38% identity, 97% coverage: 3:269/274 of query aligns to 8:272/272 of 5bshA

query
sites
5bshA
S
 
S
P
 
Y
R
 
T
I
 
L
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
A
 
A
A
 
E
S
 
S
L
 
I
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
V
A
 
R
Q
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
E
 
P
A
 
S
-
 
R
I
 
I
R
 
K
A
 
T
S
 
A
D
 
I
P
 
H
G
 
S
A
 
N
E
 
P
Q
 
A
R
 
R
A
 
R
K
 
T
I
 
A
S
 
F
A
 
E
E
 
S
H
 
I
G
 
G
I
 
I
Q
 
T
T
 
V
F
 
L
A
 
S
Q
 
S
N
 
N
A
 
D
D
 
D
A
 
V
L
 
V
A
 
R
G
 
D
A
 
S
D
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
F
S
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
V
 
L
M
 
L
Q
 
K
S
 
D
V
 
V
C
 
V
R
 
L
D
 
K
L
 
L
V
 
K
P
 
P
H
 
L
L
 
L
D
 
T
H
 
K
A
 
D
P
 
K
L
 
L
I
 
L
V
 
V
S
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
K
C
 
M
D
 
K
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
E
W
 
W
L
 
A
G
 
G
P
 
H
R
 
-
P
 
-
Q
 
E
A
 
R
I
 
F
V
 
I
R
 
R
C
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
L
 
V
R
 
G
Q
 
E
G
 
A
V
 
A
S
 
S
G
 
V
L
 
M
F
 
S
A
 
L
N
 
G
A
 
G
Q
 
A
V
 
A
S
 
T
A
 
E
E
 
E
Q
 
D
K
 
A
Q
 
N
Q
 
L
A
 
I
E
 
S
Q
 
Q
L
 
L
L
 
F
S
 
G
A
 
S
V
 
I
G
 
G
I
 
-
A
 
K
L
 
I
W
 
W
L
 
K
E
 
A
E
 
D
E
 
D
R
 
K
L
 
Y
I
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
D
T
 
L
A
 
A
A
 
L
Q
 
S
L
 
L
T
 
A
M
 
S
Q
 
Q
T
 
T
A
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
S
M
 
M
A
 
A
C
 
T
E
 
Q
S
 
S
D
 
G
V
 
K
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
D
V
|
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
|
T
T
|
T
E
 
I
A
 
A
A
 
G
I
 
V
K
 
H
A
 
E
F
 
L
Q
 
E
A
 
K
G
 
A
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
G
L
 
I
V
 
L
Q
 
M
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
S

5bsgA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NADP+ (see paper)
38% identity, 97% coverage: 3:269/274 of query aligns to 8:272/272 of 5bsgA

query
sites
5bsgA
S
 
S
P
 
Y
R
 
T
I
 
L
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
A
 
A
A
 
E
S
 
S
L
 
I
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
V
A
 
R
Q
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
E
 
P
A
 
S
-
 
R
I
 
I
R
 
K
A
 
T
S
 
A
D
 
I
P
x
H
G
x
S
A
x
N
E
 
P
Q
 
A
R
 
R
A
 
R
K
 
T
I
 
A
S
 
F
A
 
E
E
 
S
H
 
I
G
 
G
I
 
I
Q
 
T
T
 
V
F
 
L
A
 
S
Q
 
S
N
|
N
A
 
D
D
 
D
A
 
V
L
 
V
A
 
R
G
 
D
A
 
S
D
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
F
S
|
S
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
V
x
L
M
 
L
Q
 
K
S
 
D
V
|
V
C
 
V
R
 
L
D
 
K
L
 
L
V
 
K
P
 
P
H
 
L
L
 
L
D
 
T
H
 
K
A
 
D
P
 
K
L
 
L
I
 
L
V
 
V
S
 
S
I
x
V
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
I
S
 
K
C
 
M
D
 
K
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
E
W
 
W
L
 
A
G
 
G
P
 
H
R
 
-
P
 
-
Q
 
E
A
 
R
I
 
F
V
 
I
R
 
R
C
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
L
 
V
R
 
G
Q
 
E
G
 
A
V
 
A
S
 
S
G
 
V
L
 
M
F
 
S
A
 
L
N
 
G
A
 
G
Q
 
A
V
 
A
S
 
T
A
 
E
E
 
E
Q
 
D
K
 
A
Q
 
N
Q
 
L
A
 
I
E
 
S
Q
 
Q
L
 
L
L
 
F
S
 
G
A
 
S
V
 
I
G
 
G
I
 
-
A
 
K
L
 
I
W
 
W
L
 
K
E
 
A
E
 
D
E
 
D
R
 
K
L
 
Y
I
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
D
T
 
L
A
 
A
A
 
L
Q
 
S
L
 
L
T
 
A
M
 
S
Q
 
Q
T
 
T
A
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
S
M
 
M
A
 
A
C
 
T
E
 
Q
S
 
S
D
 
G
V
 
K
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
E
 
I
A
 
A
A
 
G
I
 
V
K
 
H
A
 
E
F
 
L
Q
 
E
A
 
K
G
 
A
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
G
L
 
I
V
 
L
Q
 
M
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
S

5bsfA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NAD+ (see paper)
38% identity, 97% coverage: 3:269/274 of query aligns to 8:272/272 of 5bsfA

query
sites
5bsfA
S
 
S
P
 
Y
R
 
T
I
 
L
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
A
 
A
A
 
E
S
 
S
L
 
I
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
V
A
 
R
Q
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
E
 
P
A
 
S
-
 
R
I
 
I
R
 
K
A
 
T
S
 
A
D
 
I
P
x
H
G
 
S
A
 
N
E
 
P
Q
 
A
R
 
R
A
 
R
K
 
T
I
 
A
S
 
F
A
 
E
E
 
S
H
 
I
G
 
G
I
 
I
Q
 
T
T
 
V
F
 
L
A
 
S
Q
 
S
N
|
N
A
 
D
D
 
D
A
 
V
L
 
V
A
 
R
G
 
D
A
 
S
D
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
F
S
|
S
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
V
x
L
M
 
L
Q
 
K
S
 
D
V
|
V
C
 
V
R
 
L
D
 
K
L
 
L
V
 
K
P
 
P
H
 
L
L
 
L
D
 
T
H
 
K
A
 
D
P
 
K
L
 
L
I
 
L
V
 
V
S
 
S
I
x
V
A
 
A
A
|
A
G
 
G
I
 
I
S
 
K
C
 
M
D
 
K
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
E
W
 
W
L
 
A
G
 
G
P
 
H
R
 
-
P
 
-
Q
 
E
A
 
R
I
 
F
V
 
I
R
 
R
C
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
L
 
V
R
 
G
Q
 
E
G
 
A
V
 
A
S
 
S
G
 
V
L
 
M
F
 
S
A
 
L
N
 
G
A
 
G
Q
 
A
V
 
A
S
 
T
A
 
E
E
 
E
Q
 
D
K
 
A
Q
 
N
Q
 
L
A
 
I
E
 
S
Q
 
Q
L
 
L
L
 
F
S
 
G
A
 
S
V
 
I
G
 
G
I
 
-
A
 
K
L
 
I
W
 
W
L
 
K
E
 
A
E
 
D
E
 
D
R
 
K
L
 
Y
I
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
D
T
 
L
A
 
A
A
 
L
Q
 
S
L
 
L
T
 
A
M
 
S
Q
 
Q
T
 
T
A
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
S
M
 
M
A
 
A
C
 
T
E
 
Q
S
 
S
D
 
G
V
 
K
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
E
 
I
A
 
A
A
 
G
I
 
V
K
 
H
A
 
E
F
 
L
Q
 
E
A
 
K
G
 
A
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
G
L
 
I
V
 
L
Q
 
M
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
S

5bseA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) (see paper)
38% identity, 97% coverage: 3:269/274 of query aligns to 8:272/272 of 5bseA

query
sites
5bseA
S
 
S
P
 
Y
R
 
T
I
 
L
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
A
 
A
A
 
E
S
 
S
L
 
I
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
V
A
 
R
Q
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
E
 
P
A
 
S
-
 
R
I
 
I
R
 
K
A
 
T
S
 
A
D
 
I
P
 
H
G
 
S
A
 
N
E
 
P
Q
 
A
R
 
R
A
 
R
K
 
T
I
 
A
S
 
F
A
 
E
E
 
S
H
 
I
G
 
G
I
 
I
Q
 
T
T
 
V
F
 
L
A
 
S
Q
 
S
N
 
N
A
 
D
D
 
D
A
 
V
L
 
V
A
 
R
G
 
D
A
 
S
D
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
F
S
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
V
 
L
M
 
L
Q
 
K
S
 
D
V
 
V
C
 
V
R
 
L
D
 
K
L
 
L
V
 
K
P
 
P
H
 
L
L
 
L
D
 
T
H
 
K
A
 
D
P
 
K
L
 
L
I
 
L
V
 
V
S
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
K
C
 
M
D
 
K
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
E
W
 
W
L
 
A
G
 
G
P
 
H
R
 
-
P
 
-
Q
 
E
A
 
R
I
 
F
V
 
I
R
 
R
C
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
L
 
V
R
 
G
Q
 
E
G
 
A
V
 
A
S
 
S
G
 
V
L
 
M
F
 
S
A
 
L
N
 
G
A
 
G
Q
 
A
V
 
A
S
 
T
A
 
E
E
 
E
Q
 
D
K
 
A
Q
 
N
Q
 
L
A
 
I
E
 
S
Q
 
Q
L
 
L
L
 
F
S
 
G
A
 
S
V
 
I
G
 
G
I
 
-
A
 
K
L
 
I
W
 
W
L
 
K
E
 
A
E
 
D
E
 
D
R
 
K
L
 
Y
I
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
D
T
 
L
A
 
A
A
 
L
Q
 
S
L
 
L
T
 
A
M
 
S
Q
 
Q
T
 
T
A
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
S
M
 
M
A
 
A
C
 
T
E
 
Q
S
 
S
D
 
G
V
 
K
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
E
 
I
A
 
A
A
 
G
I
 
V
K
 
H
A
 
E
F
 
L
Q
 
E
A
 
K
G
 
A
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
G
L
 
I
V
 
L
Q
 
M
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
S
 
S
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
S

8td1A Structure of pycr1 complexed with 3-(6-oxa-9-azaspiro(4.5)decane-9- carbonyl)benzoic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 3:268/274 of query aligns to 7:275/280 of 8td1A

query
sites
8td1A
S
 
S
P
 
M
R
 
S
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
K
I
 
I
R
 
M
A
 
A
S
 
S
D
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
-
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
R
E
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
 
N
A
 
K
D
 
E
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
G
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
Q
 
P
S
 
F
V
 
I
C
 
L
R
 
D
D
 
E
L
 
I
V
 
G
P
 
A
H
 
D
L
 
I
D
 
E
H
 
D
A
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
I
D
 
S
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
-
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
V
L
 
Y
F
 
A
A
 
T
N
 
G
A
 
T
Q
 
H
V
 
A
S
 
Q
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
K
 
G
Q
 
R
Q
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
L
 
T
W
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
-
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
G
M
 
A
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
L
C
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
V
 
Q
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
I
 
L
K
 
H
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
S
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
Q
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

8td0A Structure of pycr1 complexed with 5-oxo-7a-phenyl-hexahydropyrrolo[2, 1-b][1,3]thiazole-3-carboxylic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 3:268/274 of query aligns to 7:275/280 of 8td0A

query
sites
8td0A
S
 
S
P
 
M
R
 
S
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
K
I
 
I
R
 
M
A
 
A
S
 
S
D
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
-
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
R
E
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
 
N
A
 
K
D
 
E
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
G
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
Q
 
P
S
 
F
V
 
I
C
 
L
R
 
D
D
 
E
L
 
I
V
 
G
P
 
A
H
 
D
L
 
I
D
 
E
H
 
D
A
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
I
D
 
S
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
-
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
V
L
 
Y
F
 
A
A
 
T
N
 
G
A
 
T
Q
 
H
V
 
A
S
 
Q
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
K
 
G
Q
 
R
Q
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
L
 
T
W
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
-
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
G
M
 
A
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
L
C
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
V
 
Q
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
I
 
L
K
 
H
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
S
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
Q
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

8tczA Structure of pycr1 complexed with 2-(pyridin-2-yl)cyclopropane-1- carboxylic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 3:268/274 of query aligns to 7:275/280 of 8tczA

query
sites
8tczA
S
 
S
P
 
M
R
 
S
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
K
I
 
I
R
 
M
A
 
A
S
 
S
D
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
-
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
R
E
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
 
N
A
 
K
D
 
E
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
G
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
Q
 
P
S
 
F
V
 
I
C
 
L
R
 
D
D
 
E
L
 
I
V
 
G
P
 
A
H
 
D
L
 
I
D
 
E
H
 
D
A
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
I
D
 
S
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
-
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
V
L
 
Y
F
 
A
A
 
T
N
 
G
A
 
T
Q
 
H
V
 
A
S
 
Q
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
K
 
G
Q
 
R
Q
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
L
 
T
W
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
-
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
G
M
 
A
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
L
C
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
V
 
Q
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
I
 
L
K
 
H
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
S
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
Q
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcxA Structure of pycr1 complexed with 2,4-dioxo-1,2,3,4- tetrahydroquinazoline-6-carboxylic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 3:268/274 of query aligns to 7:275/280 of 8tcxA

query
sites
8tcxA
S
 
S
P
 
M
R
 
S
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
K
I
 
I
R
 
M
A
 
A
S
 
S
D
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
-
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
R
E
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
 
N
A
 
K
D
 
E
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
G
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
Q
 
P
S
 
F
V
 
I
C
 
L
R
 
D
D
 
E
L
 
I
V
 
G
P
 
A
H
 
D
L
 
I
D
 
E
H
 
D
A
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
x
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
I
D
 
S
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
-
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
V
L
 
Y
F
 
A
A
 
T
N
 
G
A
 
T
Q
 
H
V
 
A
S
 
Q
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
K
 
G
Q
 
R
Q
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
L
 
T
W
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
-
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
G
M
 
A
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
L
C
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
V
 
Q
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
I
 
L
K
 
H
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
S
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
Q
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcwA Structure of pycr1 complexed with 2-methyl-3-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 3:268/274 of query aligns to 7:275/282 of 8tcwA

query
sites
8tcwA
S
 
S
P
 
M
R
 
S
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
K
I
 
I
R
 
M
A
 
A
S
 
S
D
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
E
 
D
Q
 
-
R
 
L
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
R
E
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
 
N
A
 
K
D
 
E
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
G
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
S
 
A
V
|
V
K
 
K
P
|
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
Q
 
P
S
 
F
V
 
I
C
 
L
R
 
D
D
 
E
L
 
I
V
 
G
P
 
A
H
 
D
L
 
I
D
 
E
H
 
D
A
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
I
D
 
S
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
-
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
V
L
 
Y
F
 
A
A
 
T
N
 
G
A
 
T
Q
 
H
V
 
A
S
 
Q
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
K
 
G
Q
 
R
Q
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
L
 
T
W
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
-
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
G
M
 
A
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
L
C
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
V
 
Q
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
I
 
L
K
 
H
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
S
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
Q
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

6xp3A Structure of human pycr1 complexed with cyclopentanecarboxylic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 3:268/274 of query aligns to 3:271/276 of 6xp3A

query
sites
6xp3A
S
 
S
P
 
M
R
 
S
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
K
I
 
I
R
 
M
A
 
A
S
 
S
D
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
-
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
R
E
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
 
N
A
 
K
D
 
E
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
G
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
Q
 
P
S
 
F
V
 
I
C
 
L
R
 
D
D
 
E
L
 
I
V
 
G
P
 
A
H
 
D
L
 
I
D
 
E
H
 
D
A
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
I
D
 
S
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
-
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
V
L
 
Y
F
 
A
A
 
T
N
 
G
A
 
T
Q
 
H
V
 
A
S
 
Q
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
K
 
G
Q
 
R
Q
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
L
 
T
W
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
-
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
|
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
G
M
 
A
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
L
C
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
V
 
Q
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
I
 
L
K
 
H
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
S
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
Q
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

P32322 Pyrroline-5-carboxylate reductase 1, mitochondrial; P5C reductase 1; P5CR 1; EC 1.5.1.2 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
37% identity, 96% coverage: 6:268/274 of query aligns to 3:268/319 of P32322

query
sites
P32322
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
|
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
K
I
 
I
R
 
M
A
 
A
S
 
S
D
x
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
-
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
R
E
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
|
N
A
 
K
D
 
E
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
G
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
S
x
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
Q
 
P
S
 
F
V
 
I
C
 
L
R
 
D
D
 
E
L
 
I
V
 
G
P
 
A
H
 
D
L
 
I
D
 
E
H
 
D
A
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
I
D
 
S
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
-
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
V
L
 
Y
F
 
A
A
 
T
N
 
G
A
 
T
Q
 
H
V
 
A
S
 
Q
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
K
 
G
Q
 
R
Q
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
L
 
T
W
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
-
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
x
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
G
M
 
A
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
L
C
 
L
E
 
H
S
 
S
D
x
E
V
 
Q
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
I
 
L
K
 
H
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
|
G
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
S
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
Q
 
I
R
 
R
S
 
T
A
x
R
E
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8tcyA Structure of pycr1 complexed with 7-fluoro-2-oxo-1,2,3,4- tetrahydroquinoline-6-carboxylic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 3:268/274 of query aligns to 7:275/281 of 8tcyA

query
sites
8tcyA
S
 
S
P
 
M
R
 
S
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
K
I
 
I
R
 
M
A
 
A
S
 
S
D
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
E
 
D
Q
 
-
R
 
L
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
R
E
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
 
N
A
 
K
D
 
E
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
G
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
Q
 
P
S
 
F
V
 
I
C
 
L
R
 
D
D
 
E
L
 
I
V
 
G
P
 
A
H
 
D
L
 
I
D
 
E
H
 
D
A
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
x
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
I
D
 
S
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
-
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
V
L
 
Y
F
 
A
A
 
T
N
 
G
A
 
T
Q
 
H
V
 
A
S
 
Q
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
K
 
G
Q
 
R
Q
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
L
 
T
W
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
-
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
G
M
 
A
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
L
C
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
V
 
Q
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
I
 
L
K
 
H
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
S
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
Q
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

5uavA Structure of human pycr-1 complexed with NADPH and l-tetrahydrofuroic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 3:268/274 of query aligns to 4:272/278 of 5uavA

query
sites
5uavA
S
 
S
P
 
M
R
 
S
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
K
I
 
I
R
 
M
A
 
A
S
 
S
D
x
S
P
|
P
G
x
D
A
 
M
E
 
D
Q
 
-
R
 
L
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
R
E
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
|
N
A
 
K
D
 
E
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
G
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
S
x
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
Q
 
P
S
 
F
V
x
I
C
 
L
R
 
D
D
 
E
L
 
I
V
 
G
P
 
A
H
 
D
L
 
I
D
 
E
H
 
D
A
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
I
D
 
S
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
-
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
V
L
 
Y
F
 
A
A
 
T
N
 
G
A
 
T
Q
 
H
V
 
A
S
 
Q
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
K
 
G
Q
 
R
Q
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
L
 
T
W
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
-
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
G
M
 
A
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
L
C
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
V
 
Q
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
I
 
L
K
 
H
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
S
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
Q
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

5uatC Structure of human pycr-1 complexed with NADPH (see paper)
37% identity, 97% coverage: 3:268/274 of query aligns to 4:272/277 of 5uatC

query
sites
5uatC
S
 
S
P
 
M
R
 
S
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
K
I
 
I
R
 
M
A
 
A
S
 
S
D
x
S
P
|
P
G
x
D
A
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
-
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
R
E
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
|
N
A
 
K
D
 
E
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
G
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
S
x
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
Q
 
P
S
 
F
V
x
I
C
 
L
R
 
D
D
 
E
L
 
I
V
 
G
P
 
A
H
 
D
L
 
I
D
 
E
H
 
D
A
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
I
D
 
S
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
-
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
V
L
 
Y
F
 
A
A
 
T
N
 
G
A
 
T
Q
 
H
V
 
A
S
 
Q
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
K
 
G
Q
 
R
Q
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
L
 
T
W
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
-
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
G
M
 
A
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
L
C
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
V
 
Q
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
I
 
L
K
 
H
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
S
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
Q
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

2izzA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase
37% identity, 97% coverage: 3:268/274 of query aligns to 1:269/272 of 2izzA

query
sites
2izzA
S
 
S
P
 
M
R
 
S
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
K
I
 
I
R
 
M
A
 
A
S
 
S
D
x
S
P
|
P
G
 
D
A
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
-
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
R
E
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
|
N
A
 
K
D
 
E
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
G
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
S
x
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
Q
 
P
S
 
F
V
x
I
C
 
L
R
 
D
D
 
E
L
 
I
V
 
G
P
 
A
H
 
D
L
 
I
D
 
E
H
 
D
A
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
I
D
 
S
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
-
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
V
L
 
Y
F
 
A
A
 
T
N
 
G
A
 
T
Q
 
H
V
 
A
S
 
Q
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
K
 
G
Q
 
R
Q
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
L
 
T
W
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
-
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
G
M
 
A
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
L
C
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
V
 
Q
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
I
 
L
K
 
H
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
S
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
Q
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcuA Structure of pycr1 complexed with 2-chloro-5-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
37% identity, 97% coverage: 3:268/274 of query aligns to 7:275/279 of 8tcuA

query
sites
8tcuA
S
 
S
P
 
M
R
 
S
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
K
I
 
I
R
 
M
A
 
A
S
 
S
D
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
-
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
R
E
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
 
N
A
 
K
D
 
E
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
G
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
S
x
A
V
|
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
Q
 
P
S
 
F
V
 
I
C
 
L
R
 
D
D
 
E
L
 
I
V
 
G
P
 
A
H
 
D
L
 
I
D
 
E
H
 
D
A
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
I
D
 
S
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
-
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
L
 
V
R
 
R
Q
 
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
V
L
 
Y
F
 
A
A
 
T
N
 
G
A
 
T
Q
 
H
V
 
A
S
 
Q
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
K
 
G
Q
 
R
Q
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
C
L
 
T
W
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
-
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
G
M
 
A
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
L
C
 
L
E
 
H
S
 
S
D
 
E
V
 
Q
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
I
 
L
K
 
H
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
S
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
Q
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

2graA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase complexed with NADP (see paper)
37% identity, 96% coverage: 6:268/274 of query aligns to 5:270/277 of 2graA

query
sites
2graA
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
K
I
 
I
R
 
M
A
 
A
S
 
S
D
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
-
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
R
E
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
 
N
A
 
K
D
 
E
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
G
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
Q
 
P
S
 
F
V
 
I
C
 
L
R
 
D
D
 
E
L
 
I
V
 
G
P
 
A
H
 
D
L
 
I
D
 
E
H
 
D
A
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
I
D
 
S
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
-
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
L
 
V
R
|
R
Q
x
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
V
L
 
Y
F
 
A
A
 
T
N
 
G
A
 
T
Q
 
H
V
 
A
S
 
Q
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
K
 
G
Q
 
R
Q
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
|
S
A
x
S
V
 
V
G
|
G
I
x
F
A
 
C
L
 
T
W
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
-
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
G
M
 
A
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
L
C
x
L
E
x
H
S
|
S
D
 
E
V
 
Q
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
I
 
L
K
 
H
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
S
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
Q
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

2gr9A Crystal structure of p5cr complexed with nadh (see paper)
37% identity, 96% coverage: 6:268/274 of query aligns to 5:270/277 of 2gr9A

query
sites
2gr9A
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
A
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
K
I
 
I
R
 
M
A
 
A
S
 
S
D
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
M
E
 
D
Q
 
L
R
 
-
A
 
A
K
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
L
-
 
R
E
 
K
H
 
M
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
A
 
P
Q
 
H
N
 
N
A
 
K
D
 
E
A
 
T
L
 
V
A
 
Q
G
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
M
 
I
Q
 
P
S
 
F
V
 
I
C
 
L
R
 
D
D
 
E
L
 
I
V
 
G
P
 
A
H
 
D
L
 
I
D
 
E
H
 
D
A
 
R
P
 
H
L
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
C
 
I
D
 
S
S
 
S
L
 
I
Q
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
R
 
A
P
 
P
Q
 
R
A
 
-
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
L
 
V
R
|
R
Q
x
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
G
 
V
L
 
Y
F
 
A
A
 
T
N
 
G
A
 
T
Q
 
H
V
 
A
S
 
Q
A
 
V
E
 
E
Q
 
D
K
 
G
Q
 
R
Q
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
|
S
A
 
S
V
 
V
G
|
G
I
x
F
A
 
C
L
 
T
W
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
E
E
 
D
R
 
-
L
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
V
Q
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
T
 
G
M
 
A
Q
 
Q
T
 
A
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
L
C
x
L
E
x
H
S
 
S
D
 
E
V
 
Q
D
 
H
A
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
E
 
I
A
 
H
A
 
A
I
 
L
K
 
H
A
 
V
F
 
L
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
R
R
 
S
L
 
L
V
 
L
Q
 
I
Q
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
Q
 
I
R
 
R
S
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

Query Sequence

>GFF282 FitnessBrowser__psRCH2:GFF282
MISPRIAFIGAGNMAASLIGGLRAQGVAAEAIRASDPGAEQRAKISAEHGIQTFAQNADA
LAGADVVVLSVKPQVMQSVCRDLVPHLDHAPLIVSIAAGISCDSLQRWLGPRPQAIVRCM
PNTPALLRQGVSGLFANAQVSAEQKQQAEQLLSAVGIALWLEEERLIDAVTAVSGSGPAY
FFLLIEAMTAAGEQLGLPRDTAAQLTMQTALGAARMACESDVDAAELRRRVTSPNGTTEA
AIKAFQAGGFERLVQQALNAAAQRSAELAEQLGQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory