SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF2911 FitnessBrowser__Marino:GFF2911 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3pk0B Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr from mycobacterium smegmatis (see paper)
38% identity, 96% coverage: 9:255/256 of query aligns to 5:253/262 of 3pk0B

query
sites
3pk0B
M
 
M
F
 
F
D
 
D
F
 
L
H
 
Q
G
 
G
R
 
R
R
 
S
V
 
V
I
 
V
V
 
V
A
 
T
G
 
G
G
 
G
S
 
T
K
 
K
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
T
G
 
V
F
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
N
V
 
V
S
 
A
V
 
V
C
 
A
A
 
G
R
 
R
G
 
S
Q
 
T
A
 
A
S
 
D
L
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
C
A
 
V
E
 
A
E
 
D
V
 
L
A
x
D
S
 
Q
E
 
L
G
|
G
L
 
S
A
x
G
L
 
K
H
 
V
V
 
I
-
 
G
T
 
V
P
 
Q
C
 
T
D
 
D
I
 
V
G
 
S
D
 
D
K
 
R
A
 
A
E
 
Q
L
 
C
E
 
D
A
 
A
Y
 
L
L
 
A
Q
 
G
N
 
R
A
 
A
M
 
V
G
 
E
E
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
-
N
 
-
C
 
C
A
 
A
S
 
N
A
 
A
F
 
G
G
 
V
R
 
F
E
 
P
D
 
D
N
 
A
E
 
P
E
 
L
G
 
A
W
 
T
L
 
M
S
 
T
S
 
P
V
 
E
E
 
Q
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
I
-
 
F
-
 
A
V
 
V
D
 
N
L
 
V
M
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
F
R
 
Y
A
 
A
G
 
V
H
 
Q
I
 
A
C
 
C
L
 
L
P
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
I
E
 
A
T
 
S
G
 
G
-
 
S
G
 
G
T
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
L
I
 
T
A
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
T
A
 
G
-
 
P
L
 
I
H
 
T
A
 
G
S
 
Y
T
 
P
R
 
G
T
x
W
A
 
S
P
 
H
Y
|
Y
A
 
G
A
 
A
I
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
Q
A
 
L
H
 
G
Y
 
F
T
 
M
G
 
R
S
 
T
L
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
E
M
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
H
K
 
K
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
M
P
 
P
G
 
G
S
 
N
I
 
I
E
 
M
F
 
T
P
 
E
G
 
G
G
 
-
V
 
-
W
 
-
D
 
-
Q
 
-
A
 
L
R
 
L
Q
 
E
N
 
N
N
 
G
P
 
E
E
 
E
L
 
Y
Y
 
I
Q
 
A
R
 
S
I
 
M
R
 
A
E
 
R
G
 
S
I
 
I
P
 
P
F
 
A
G
 
G
R
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
G
D
 
H
V
 
L
A
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
D
 
K
L
 
E
A
 
A
R
 
G
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
L
 
I
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
38% identity, 95% coverage: 9:252/256 of query aligns to 2:254/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
M
 
I
F
 
F
D
 
D
F
 
L
H
 
S
G
 
G
R
 
R
R
 
K
V
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
T
G
 
G
G
 
G
S
 
S
K
|
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
R
G
 
A
F
 
L
A
 
D
R
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
T
V
 
V
S
 
A
V
 
I
C
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
A
S
x
D
L
|
L
D
 
D
A
 
V
L
 
M
A
 
A
E
 
A
E
 
Q
V
 
A
A
 
V
S
 
V
E
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
E
L
 
N
-
 
G
-
 
G
H
 
F
V
 
A
T
 
V
P
 
E
C
x
V
D
|
D
I
x
V
G
 
T
D
 
K
K
 
R
A
 
A
E
 
S
L
 
V
E
 
D
A
 
A
Y
 
A
L
 
M
Q
 
Q
N
 
K
A
 
A
M
 
I
G
 
D
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
-
N
 
-
C
 
C
A
 
A
S
x
N
A
|
A
-
x
G
-
 
V
-
 
S
-
 
T
-
 
M
-
 
R
F
 
P
G
 
A
R
 
V
E
 
D
D
 
I
N
 
T
E
 
D
E
 
E
G
 
E
W
 
W
L
 
D
S
 
F
S
 
N
V
 
F
E
 
D
V
 
V
D
 
N
L
 
A
M
 
R
G
 
G
T
 
V
V
 
F
R
 
L
A
 
A
G
 
N
H
 
Q
I
 
I
-
 
A
C
 
C
L
 
R
P
 
H
A
 
F
L
 
L
-
 
A
K
 
S
E
 
N
T
 
T
G
 
K
G
 
G
T
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
I
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
K
H
 
V
A
 
G
S
 
A
T
 
P
R
 
L
T
x
L
A
 
A
P
 
H
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
I
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
A
 
F
H
 
G
Y
 
W
T
 
T
G
 
Q
S
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
R
T
 
E
M
 
M
A
 
A
P
 
P
H
 
K
K
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
C
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
|
G
S
 
F
I
x
V
E
 
K
F
x
T
P
 
A
G
x
M
G
 
Q
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
I
V
 
I
W
 
W
D
x
E
-
 
A
Q
 
E
A
 
L
R
 
R
Q
 
G
N
 
M
N
 
T
P
 
P
E
 
E
L
 
A
Y
 
V
Q
 
R
R
 
A
I
 
E
R
 
Y
E
 
V
G
 
S
I
 
L
-
 
T
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
E
T
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
A
 
V
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
A
A
 
A
R
 
R
W
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
G
L
 
I
V
 
N
V
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
33% identity, 95% coverage: 12:255/256 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
F
 
L
H
 
Q
G
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
I
 
V
V
 
V
A
 
T
G
|
G
G
 
G
S
|
S
K
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
N
F
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
N
V
 
I
S
 
F
V
 
F
C
x
N
A
x
Y
R
x
N
G
|
G
Q
x
S
-
 
P
A
 
E
S
 
A
L
 
A
D
 
E
A
 
E
L
 
T
A
 
A
E
 
K
E
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
E
E
 
H
G
 
G
L
 
V
A
 
E
L
 
V
H
 
E
V
 
A
T
 
M
P
 
K
C
 
A
D
x
N
I
x
V
G
 
A
D
 
I
K
 
A
A
 
E
E
 
D
L
 
V
E
 
D
A
 
A
Y
 
F
L
 
F
Q
 
K
N
 
Q
A
 
A
M
 
I
G
 
E
E
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
S
 
-
A
 
G
F
x
I
G
 
T
R
 
R
E
 
D
D
 
N
-
 
L
-
 
L
-
 
M
-
 
R
-
 
M
N
 
K
E
 
E
E
 
D
G
 
E
W
 
W
L
 
D
S
 
D
S
 
V
V
 
I
E
 
N
V
x
I
D
 
N
L
 
L
M
 
K
G
 
G
T
 
T
V
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
H
 
F
I
 
L
C
 
C
L
 
T
P
 
K
A
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
R
-
 
T
-
 
M
L
 
M
K
 
K
E
 
Q
T
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
L
H
 
I
A
 
G
S
 
N
T
 
A
R
 
G
T
x
Q
A
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
I
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
A
 
I
H
 
G
Y
 
L
T
 
T
G
 
K
S
 
T
L
 
T
A
 
A
V
 
R
T
 
E
M
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
R
K
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
S
 
F
I
|
I
E
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
T
W
x
T
D
 
D
Q
 
M
A
 
T
R
 
D
Q
 
K
N
 
L
N
 
D
P
 
E
E
 
K
L
 
T
Y
 
K
Q
 
E
R
 
A
I
 
M
R
 
L
E
 
A
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
T
 
T
P
 
T
E
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
N
V
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
A
A
 
S
R
 
K
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
L
V
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
V
 
V
L
 
M

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
38% identity, 96% coverage: 12:256/256 of query aligns to 3:239/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
F
 
F
H
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
G
V
 
V
I
 
L
V
 
V
A
 
T
G
|
G
G
 
G
S
 
A
K
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
Q
G
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
L
V
 
V
S
 
A
V
 
L
C
 
C
A
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
x
D
L
|
L
D
x
R
A
 
P
L
 
E
A
 
G
E
 
K
E
 
E
V
 
V
A
 
A
S
 
-
E
 
E
G
 
A
L
 
I
A
 
G
L
 
G
H
 
A
V
 
F
T
 
F
P
 
Q
C
x
V
D
|
D
I
x
L
G
 
E
D
 
D
K
 
E
A
 
R
E
 
E
L
 
R
E
 
V
A
 
R
Y
 
F
L
 
V
Q
 
E
N
 
E
A
 
A
M
 
A
G
 
Y
E
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
-
x
A
-
x
I
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
G
S
 
S
A
 
A
F
 
L
G
 
T
R
 
V
E
 
R
D
 
L
N
 
P
E
 
E
E
 
-
G
 
-
W
 
W
L
 
R
S
 
R
S
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
V
D
 
N
L
 
L
M
 
T
G
 
A
T
 
P
V
 
M
R
 
H
A
 
L
G
 
S
H
 
A
I
 
L
C
 
A
L
 
A
P
 
R
A
 
E
L
 
M
K
 
R
E
 
K
T
 
V
G
 
G
G
 
G
-
 
G
T
 
A
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
V
A
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
Q
A
 
G
L
 
L
H
 
F
A
 
A
S
 
E
T
 
Q
R
 
E
T
x
N
A
 
A
P
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
I
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
L
A
 
V
H
 
N
Y
 
L
T
 
T
G
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L
T
 
D
M
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
L
K
 
R
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
S
 
A
I
|
I
E
 
A
F
x
T
P
 
E
G
x
A
G
x
V
V
 
L
W
 
E
D
 
A
Q
 
I
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
N
 
D
N
 
W
P
 
E
E
 
D
L
 
L
Y
 
H
Q
 
A
R
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
F
 
L
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
V
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
L
 
K
A
 
A
R
 
S
W
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
T
 
I
L
 
L
V
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
V
 
T
L
 
A
S
 
S

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
36% identity, 95% coverage: 9:252/256 of query aligns to 1:248/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
M
 
V
F
 
F
D
 
D
F
 
L
H
 
R
G
 
G
R
 
R
R
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
A
 
T
G
|
G
G
 
G
S
 
S
K
x
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
F
A
 
G
I
 
I
A
 
A
L
 
Q
G
 
G
F
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
C
S
 
S
V
 
V
S
 
V
V
 
V
C
 
A
A
x
S
R
|
R
G
 
N
-
 
L
-
 
E
Q
 
E
A
 
A
S
 
S
L
 
E
D
 
A
A
 
A
-
 
Q
-
 
K
L
 
L
A
 
T
E
 
E
E
 
K
V
 
Y
A
 
G
S
 
V
E
 
E
G
 
T
L
 
M
A
 
A
L
 
F
H
 
R
V
 
-
T
 
-
P
 
-
C
|
C
D
|
D
I
x
V
G
 
S
D
 
N
K
 
Y
A
 
E
E
 
E
L
 
V
E
 
K
A
 
K
Y
 
L
L
 
L
Q
 
E
N
 
A
A
 
V
M
 
K
G
 
E
E
 
K
L
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
D
V
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
C
x
A
A
|
A
S
x
G
A
x
I
F
 
N
G
 
R
R
 
R
E
 
H
D
 
P
N
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
F
W
 
P
L
 
L
S
 
D
S
 
E
-
 
F
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
V
 
I
E
 
E
V
|
V
D
 
N
L
 
L
M
 
F
G
 
G
T
 
T
V
 
Y
R
 
Y
A
 
V
G
 
C
H
 
R
I
 
E
C
 
A
L
 
F
P
 
S
A
 
L
L
 
L
K
 
R
E
 
E
T
 
S
G
 
D
G
 
N
-
 
P
T
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
G
S
|
S
I
 
L
A
 
T
A
 
V
L
 
E
H
 
E
A
 
V
S
 
T
T
 
M
-
 
P
R
 
N
T
x
I
A
 
S
P
 
A
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
S
Y
 
L
T
 
T
G
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
K
T
 
E
M
 
W
A
 
G
P
 
R
H
 
Y
K
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
V
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
S
 
-
I
 
-
E
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
W
 
W
D
x
Y
Q
 
R
A
x
T
R
 
K
Q
x
M
-
x
T
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
F
N
 
S
N
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
K
Y
 
L
Q
 
D
R
 
Y
I
 
M
R
 
L
E
 
K
G
 
R
I
 
I
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
T
G
 
G
T
 
V
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
L
A
 
K
D
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
L
 
E
A
 
A
R
 
K
W
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
L
 
I
V
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2zatA Crystal structure of a mammalian reductase (see paper)
34% identity, 94% coverage: 12:252/256 of query aligns to 3:246/251 of 2zatA

query
sites
2zatA
F
 
L
H
 
E
G
 
N
R
 
K
R
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
A
 
T
G
x
A
G
 
S
S
x
T
K
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
R
G
 
R
F
 
L
A
 
A
R
 
Q
A
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
H
V
 
V
S
 
V
V
 
V
C
 
S
A
x
S
R
|
R
G
x
K
Q
 
Q
A
 
E
S
x
N
L
 
V
D
 
D
A
 
R
L
 
T
A
 
V
E
 
A
E
 
T
V
 
L
A
 
Q
S
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
S
L
 
V
H
 
T
V
 
G
T
 
T
P
 
V
C
 
C
D
x
H
I
 
V
G
 
G
D
 
K
K
 
A
A
 
E
E
 
D
L
 
R
E
 
E
A
 
R
Y
 
L
L
 
V
Q
 
A
N
 
M
A
 
A
M
 
V
G
 
N
E
 
L
L
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
C
x
N
A
 
A
S
x
A
A
 
V
-
 
N
-
 
P
-
 
F
F
 
F
G
 
G
R
 
N
-
 
I
-
 
I
E
 
D
D
 
A
N
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
V
W
 
W
L
 
D
S
 
K
S
 
I
V
 
L
E
 
H
V
 
V
D
 
N
L
 
V
M
 
K
G
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
L
A
 
M
G
 
T
H
 
K
I
 
A
C
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
E
L
 
M
-
 
E
K
 
K
E
 
R
T
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
S
I
 
V
I
 
L
N
 
I
I
x
V
A
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
Y
H
 
H
A
 
P
S
 
F
T
 
P
R
 
N
T
x
L
A
 
G
P
 
P
Y
|
Y
A
 
N
A
 
V
I
 
S
K
|
K
A
 
T
A
 
A
V
 
L
A
 
L
H
 
G
Y
 
L
T
 
T
G
 
K
S
 
N
L
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
E
M
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
R
K
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
C
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
S
 
L
I
|
I
E
 
K
-
x
T
-
 
N
F
|
F
P
x
S
G
 
Q
G
 
V
V
 
L
W
 
W
-
 
M
D
 
D
Q
x
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
K
N
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
Y
 
-
Q
 
E
R
 
Y
I
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
S
I
 
L
P
 
R
F
 
I
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
N
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
C
A
 
A
D
 
G
V
 
I
A
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
L
 
D
A
 
A
R
 
S
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

Q8WNV7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; PHCR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NDRD; Peroxisomal carbonyl reductase; PerCR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; EC 1.1.1.184; EC 1.1.1.300 from Sus scrofa (Pig) (see 2 papers)
35% identity, 92% coverage: 18:252/256 of query aligns to 37:274/279 of Q8WNV7

query
sites
Q8WNV7
I
x
L
V
|
V
A
x
T
G
x
A
G
x
S
S
x
T
K
x
D
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
x
L
A
|
A
I
|
I
A
|
A
L
x
R
G
x
R
F
x
L
A
|
A
R
x
Q
A
x
D
G
|
G
A
|
A
S
x
H
V
|
V
S
x
V
V
 
V
C
 
S
A
 
S
R
 
R
G
 
K
Q
 
Q
A
 
E
S
 
N
L
 
V
D
 
D
A
 
R
L
 
T
A
 
V
E
 
A
E
 
T
V
 
L
A
 
Q
S
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
S
L
 
V
H
 
T
V
 
G
T
 
T
P
 
V
C
 
C
D
 
H
I
 
V
G
 
G
D
 
K
K
 
A
A
 
E
E
 
D
L
 
R
E
 
E
A
 
R
Y
 
L
L
 
V
Q
 
A
N
 
M
A
 
A
M
 
V
G
 
N
E
 
L
L
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
C
 
N
A
 
A
S
 
A
A
 
V
-
 
N
-
 
P
-
 
F
F
 
F
G
 
G
R
 
N
-
 
I
-
 
I
E
 
D
D
 
A
N
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
V
W
 
W
L
 
D
S
 
K
S
 
I
V
 
L
E
 
H
V
 
V
D
 
N
L
 
V
M
 
K
G
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
L
A
 
M
G
 
T
H
 
K
I
 
A
C
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
E
L
 
M
-
 
E
K
 
K
E
 
R
T
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
S
I
 
V
I
 
L
N
 
I
I
 
V
A
 
S
S
 
S
I
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
Y
H
 
H
A
 
P
S
x
F
T
 
P
R
 
N
T
x
L
A
 
G
P
 
P
Y
|
Y
A
 
N
A
 
V
I
 
S
K
|
K
A
 
T
A
 
A
V
 
L
A
 
L
H
 
G
Y
 
L
T
 
T
G
 
K
S
x
N
L
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
E
M
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
R
K
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
C
I
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
L
I
 
I
E
 
K
-
 
T
-
 
N
F
 
F
P
 
S
G
 
Q
G
 
V
V
 
L
W
 
W
-
 
M
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
R
 
R
Q
 
K
N
 
-
N
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
Y
 
-
Q
 
E
R
 
Y
I
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
S
I
 
L
P
 
R
F
 
I
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
N
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
C
A
 
A
D
 
G
V
 
I
A
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
L
 
D
A
 
A
R
 
S
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
33% identity, 94% coverage: 15:255/256 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
R
 
K
R
 
S
V
 
A
I
 
L
V
 
V
A
 
T
G
 
G
G
 
A
S
 
S
K
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
I
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
Q
F
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
S
 
N
V
 
V
S
 
A
V
 
V
C
 
N
A
 
Y
R
 
A
G
 
G
-
 
S
Q
 
K
A
 
E
S
 
K
L
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
K
S
 
A
E
 
K
G
 
G
L
 
V
A
 
D
L
 
S
H
 
F
V
 
A
T
 
I
P
 
Q
C
 
A
D
 
N
I
 
V
G
 
A
D
 
D
K
 
A
A
 
D
E
 
E
L
 
V
E
 
K
A
 
A
Y
 
M
L
 
I
Q
 
K
N
 
E
A
 
V
M
 
V
G
 
S
E
 
Q
L
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
S
 
-
A
 
G
F
 
I
G
 
T
R
 
R
E
 
D
D
 
N
-
 
L
-
 
L
-
 
M
-
 
R
-
 
M
N
 
K
E
 
E
E
 
Q
G
 
E
W
 
W
L
 
D
S
 
D
S
 
V
V
 
I
E
 
D
V
 
T
D
 
N
L
 
L
M
 
K
G
 
G
T
 
V
V
 
F
R
 
N
A
 
C
G
 
I
H
 
Q
I
 
K
C
 
A
L
 
T
P
 
P
A
 
Q
-
 
M
L
 
L
K
 
R
E
 
Q
T
 
R
G
 
S
G
 
G
T
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
L
A
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
A
H
 
V
A
 
G
S
 
N
T
 
P
R
 
G
T
x
Q
A
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
I
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
A
 
I
H
 
G
Y
 
L
T
 
T
G
 
K
S
 
S
L
 
A
A
 
A
V
 
R
T
 
E
M
 
L
A
 
A
P
 
S
H
 
R
K
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
F
I
 
I
E
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
V
W
 
S
D
 
D
Q
 
M
A
 
T
R
 
D
Q
 
A
N
 
L
N
 
S
P
 
D
E
 
E
L
 
L
Y
 
K
Q
 
E
R
 
Q
I
 
M
R
 
L
E
 
T
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
F
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
T
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
N
V
 
T
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
K
A
 
A
R
 
K
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
I
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
V
 
Y
L
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
35% identity, 96% coverage: 10:255/256 of query aligns to 1:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
F
 
M
D
 
S
F
 
F
H
 
E
G
 
G
R
 
K
R
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
A
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
K
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
G
 
T
F
 
L
A
 
V
R
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
S
 
I
V
 
G
C
 
T
A
 
A
R
x
T
G
 
S
Q
 
E
A
 
S
S
 
G
L
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
S
E
 
D
E
 
Y
V
 
L
A
 
G
S
 
A
-
 
N
-
 
G
E
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
M
L
|
L
H
x
N
V
|
V
T
 
T
P
 
-
C
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
D
 
D
K
 
P
A
 
A
E
 
S
L
 
I
E
 
E
A
 
S
Y
 
V
L
 
L
Q
 
E
N
 
N
A
 
V
M
 
R
G
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
 
N
A
|
A
-
x
G
-
x
I
-
 
T
-
 
R
-
 
D
S
 
N
A
 
L
F
 
L
G
 
M
R
 
R
E
 
M
D
 
K
N
 
D
E
 
D
E
 
E
G
 
-
W
 
W
L
 
N
S
 
D
S
 
I
V
 
I
E
 
E
V
 
T
D
 
N
L
 
L
M
 
S
G
 
S
T
 
V
V
 
F
R
 
R
A
 
L
G
 
S
H
 
K
I
 
A
C
 
V
L
 
M
P
 
R
A
 
A
L
 
M
-
 
M
K
 
K
E
 
K
T
 
R
G
 
H
G
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
T
H
 
M
A
 
G
S
 
N
T
 
A
R
 
G
T
 
Q
A
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
I
H
 
G
Y
 
F
T
 
S
G
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
R
T
 
E
M
 
V
A
 
A
P
 
S
H
 
R
K
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
F
I
 
I
E
 
E
F
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
W
 
T
D
 
D
Q
 
M
A
 
T
R
 
R
Q
 
A
N
 
L
N
 
T
P
 
D
E
 
E
L
 
Q
Y
 
R
Q
 
A
R
 
G
I
 
T
R
 
L
E
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
F
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
N
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
V
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
E
A
 
A
R
 
S
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
V
 
Y
L
 
M

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
35% identity, 97% coverage: 4:252/256 of query aligns to 1:251/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
Q
 
H
E
 
H
H
 
H
S
 
H
V
 
H
M
 
M
F
 
S
D
 
K
F
 
L
H
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
K
|
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
K
G
 
A
F
 
L
A
 
A
R
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
A
V
 
V
S
 
V
V
 
V
-
 
N
C
 
Y
A
|
A
R
x
S
G
x
S
Q
 
K
A
 
A
S
 
G
L
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
V
E
 
S
E
 
A
V
 
I
A
 
T
S
 
E
E
 
A
G
 
G
L
 
G
A
 
R
L
 
A
H
 
V
V
 
A
T
 
V
P
 
G
C
x
G
D
|
D
I
x
V
G
 
S
D
 
K
K
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
A
E
 
Q
A
 
R
Y
 
I
L
 
V
Q
 
D
N
 
T
A
 
A
M
 
I
G
 
E
E
 
T
L
 
Y
G
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
x
S
S
x
G
A
 
V
F
x
Y
G
 
E
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
I
R
 
E
E
 
A
D
 
I
N
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
H
W
 
Y
L
 
R
S
 
R
S
 
Q
V
 
F
E
 
D
V
 
T
D
 
N
L
 
V
M
 
F
G
 
G
T
 
V
V
 
L
R
 
L
A
 
T
G
 
T
H
 
Q
I
 
A
C
 
A
L
 
V
P
 
K
A
 
H
L
 
L
K
 
G
E
 
E
T
 
-
G
 
G
G
 
A
T
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
V
A
 
T
L
 
S
H
 
I
A
 
T
S
 
P
T
 
P
R
 
A
T
 
S
A
 
A
P
 
V
Y
|
Y
A
 
S
A
 
G
I
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
D
H
 
A
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
L
T
 
E
M
 
L
A
 
G
P
 
P
H
 
R
K
 
K
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
N
P
|
P
G
|
G
S
x
M
I
|
I
E
 
V
F
x
T
P
 
E
G
|
G
G
 
-
V
 
-
W
x
T
D
 
H
Q
 
S
A
 
A
R
 
G
Q
x
I
N
 
I
N
 
G
P
 
S
E
 
D
L
 
L
Y
 
E
Q
 
A
R
 
Q
I
 
V
R
 
L
E
 
G
G
 
Q
I
 
T
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
P
 
P
E
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
S
V
 
V
A
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
D
A
 
A
R
 
R
W
 
W
I
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
T
 
H
L
 
L
V
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

3o4rA Crystal structure of human dehydrogenase/reductase (sdr family) member 4 (dhrs4)
34% identity, 92% coverage: 18:252/256 of query aligns to 12:249/254 of 3o4rA

query
sites
3o4rA
I
 
L
V
 
V
A
 
T
G
x
A
G
 
S
S
x
T
K
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
F
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
R
G
 
R
F
 
L
A
 
A
R
 
Q
A
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
H
V
 
V
S
 
V
V
 
V
C
 
S
A
x
S
R
|
R
G
x
K
Q
 
Q
A
 
Q
S
x
N
L
 
V
D
 
D
A
 
Q
L
 
A
A
 
V
E
 
A
E
 
T
V
 
L
A
 
Q
S
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
S
L
 
V
H
 
T
V
 
G
T
 
T
P
 
V
C
 
C
D
x
H
I
x
V
G
 
G
D
 
K
K
 
A
A
 
E
E
 
D
L
 
R
E
 
E
A
 
R
Y
 
L
L
 
V
Q
 
A
N
 
T
A
 
A
M
 
V
G
 
K
E
 
L
L
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
C
x
N
A
 
A
S
x
A
A
 
V
-
 
N
-
 
P
-
 
F
F
 
F
G
 
G
R
 
S
-
 
I
-
 
M
E
 
D
D
 
V
N
 
T
E
 
E
E
 
E
G
 
V
W
 
W
L
 
D
S
 
K
S
 
T
V
 
L
E
 
D
V
 
I
D
 
N
L
 
V
M
 
K
G
 
A
T
 
P
V
 
A
R
 
L
A
 
M
G
 
T
H
 
K
I
 
A
C
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
E
L
 
M
-
 
E
K
 
K
E
 
R
T
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
S
I
 
V
I
 
V
N
 
I
I
 
V
A
 
S
S
|
S
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
F
H
 
S
A
 
P
S
 
S
T
 
P
R
 
G
T
x
F
A
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
N
A
 
V
I
 
S
K
|
K
A
 
T
A
 
A
V
 
L
A
 
L
H
 
G
Y
 
L
T
 
T
G
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
I
T
 
E
M
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
R
K
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
C
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
S
x
L
I
|
I
E
 
K
-
x
T
-
 
S
F
|
F
P
x
S
G
 
R
G
 
M
V
 
L
W
 
W
-
 
M
D
 
D
Q
x
K
A
 
E
R
 
K
Q
 
E
N
 
E
N
 
S
P
 
M
E
 
K
L
 
E
Y
 
T
Q
 
L
R
 
R
I
 
I
R
 
R
E
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
C
A
 
A
D
 
G
V
 
I
A
 
V
L
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
L
 
D
A
 
A
R
 
S
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
35% identity, 97% coverage: 7:255/256 of query aligns to 1:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
S
 
S
V
 
Q
M
 
F
F
 
M
D
 
N
F
 
L
H
 
E
G
 
G
R
 
K
R
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
A
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
K
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
G
 
L
F
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
S
 
I
V
 
G
C
 
T
A
 
A
R
x
T
G
 
S
Q
 
E
A
 
S
S
 
G
L
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
S
E
 
D
E
 
Y
V
 
L
A
 
G
S
 
D
-
 
N
-
 
G
E
 
K
G
 
G
L
 
M
A
 
A
L
 
L
H
x
N
V
|
V
T
 
T
P
 
N
C
 
P
D
 
E
I
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
-
E
 
S
L
 
I
E
 
E
A
 
A
Y
 
V
L
 
L
Q
 
K
N
 
A
A
 
I
M
 
T
G
 
D
E
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
S
 
-
A
 
G
F
x
I
G
 
T
R
 
R
E
 
D
D
 
N
-
 
L
-
 
L
-
 
M
-
 
R
-
 
M
N
 
K
E
 
E
E
 
E
G
 
E
W
 
W
L
 
S
S
 
D
S
 
I
V
 
M
E
 
E
V
 
T
D
 
N
L
 
L
M
 
T
G
 
S
T
 
I
V
 
F
R
 
R
A
 
L
G
 
S
H
 
K
I
 
A
C
 
V
L
 
L
P
 
R
A
 
G
L
 
M
-
 
M
K
 
K
E
 
K
T
 
R
G
 
Q
G
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
V
A
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
T
H
 
M
A
 
G
S
 
N
T
 
A
R
 
G
T
 
Q
A
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
A
 
I
H
 
G
Y
 
F
T
 
T
G
 
K
S
 
S
L
 
M
A
 
A
V
 
R
T
 
E
M
 
V
A
 
A
P
 
S
H
 
R
K
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
S
 
F
I
|
I
E
 
E
F
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
W
x
T
D
 
D
Q
x
M
A
 
T
R
 
K
Q
 
A
N
 
L
N
 
N
P
 
D
E
 
E
L
 
Q
Y
 
R
Q
 
T
R
 
A
I
 
T
R
 
L
E
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
F
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
S
V
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
L
 
E
A
 
A
R
 
A
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
V
 
Y
L
 
M

3toxA Crystal structure of a short chain dehydrogenase in complex with NAD(p) from sinorhizobium meliloti 1021
36% identity, 94% coverage: 12:252/256 of query aligns to 3:249/254 of 3toxA

query
sites
3toxA
F
 
L
H
 
E
G
 
G
R
 
K
R
 
I
V
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
K
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
L
F
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
K
V
 
V
S
 
V
V
 
V
C
 
T
A
|
A
R
|
R
G
x
N
Q
 
G
A
 
N
S
 
A
L
 
L
D
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
T
E
 
D
E
 
E
V
 
I
A
 
A
S
 
G
E
 
G
G
 
G
L
 
G
A
 
E
L
 
A
H
 
A
V
 
A
T
 
L
P
 
A
C
 
G
D
 
D
I
x
V
G
 
G
D
 
D
K
 
E
A
 
A
E
 
L
L
 
H
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
L
 
V
Q
 
E
N
 
L
A
 
A
M
 
V
G
 
R
E
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
T
L
 
A
V
 
F
N
 
N
C
x
N
A
|
A
S
x
G
A
 
A
F
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
M
-
 
G
-
 
E
-
 
I
R
 
S
E
 
S
D
 
L
N
 
S
E
 
V
E
 
E
G
 
G
W
 
W
L
 
R
S
 
E
S
 
T
V
 
L
E
 
D
V
 
T
D
 
N
L
 
L
M
 
T
G
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
L
A
 
A
G
 
A
H
 
K
I
 
Y
C
 
Q
L
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
I
K
 
A
E
 
A
T
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
G
I
 
S
I
 
L
N
 
T
I
 
F
A
x
T
S
 
S
I
x
S
A
 
F
A
 
V
L
 
G
H
 
H
A
 
T
S
 
A
-
 
G
-
 
F
T
 
A
R
 
G
T
x
V
A
 
A
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
A
 
I
H
 
G
Y
 
L
T
 
V
G
 
Q
S
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
T
 
E
M
 
L
A
 
G
P
 
A
H
 
R
K
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
L
A
 
L
P
|
P
G
 
G
S
x
G
I
x
T
E
 
D
F
x
T
P
 
P
G
 
A
G
 
N
V
 
F
W
 
-
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
A
N
 
N
N
 
L
P
 
P
E
 
G
L
 
A
Y
 
A
Q
 
P
R
 
E
I
 
T
R
 
R
-
 
G
-
 
F
-
 
V
E
 
E
G
 
G
I
 
L
-
 
H
P
 
A
F
 
L
G
 
K
R
 
R
L
 
I
G
 
A
T
 
R
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
E
V
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
G
A
 
A
R
 
S
W
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
T
 
A
L
 
L
V
 
L
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1ahhA 7 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
33% identity, 95% coverage: 12:254/256 of query aligns to 9:251/253 of 1ahhA

query
sites
1ahhA
F
 
L
H
 
D
G
 
G
R
 
K
R
 
C
V
 
A
I
 
I
V
 
I
A
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
G
K
x
A
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
K
A
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
S
 
V
V
 
V
C
 
S
A
x
D
R
x
I
G
 
N
Q
 
A
A
 
D
S
 
A
L
 
A
D
 
N
A
 
H
L
 
V
A
 
V
E
 
D
E
 
E
V
 
I
A
 
Q
S
 
Q
E
 
L
G
 
G
L
 
G
A
 
Q
L
 
A
H
 
F
V
 
A
T
 
C
P
 
R
C
|
C
D
|
D
I
|
I
G
 
T
D
 
S
K
 
E
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
L
 
A
Q
 
D
N
 
F
A
 
A
M
 
I
G
 
S
E
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
K
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
S
x
G
A
 
G
F
 
G
G
 
G
R
 
P
E
 
K
D
 
P
N
 
F
E
 
D
-
 
M
-
 
P
-
 
M
E
 
A
G
 
D
W
 
F
L
 
R
S
 
R
S
 
A
V
 
Y
E
 
E
V
 
L
D
 
N
L
 
V
M
 
F
G
 
S
T
 
F
V
 
F
R
 
H
A
 
L
G
 
S
H
 
Q
I
 
L
C
 
V
L
 
A
P
 
P
A
 
E
L
 
M
-
 
E
K
 
K
E
 
N
T
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
V
I
 
I
I
 
L
N
 
T
I
 
I
A
x
T
S
|
S
I
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
E
H
 
N
A
 
K
S
 
N
T
 
I
R
 
N
T
x
M
A
 
T
P
 
S
Y
|
Y
A
 
A
A
 
S
I
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
S
H
 
H
Y
 
L
T
 
V
G
 
R
S
 
N
L
 
M
A
 
A
V
 
F
T
 
D
M
 
L
A
 
G
P
 
E
H
 
K
K
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
S
 
A
I
|
I
E
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
L
W
 
T
D
 
D
Q
 
A
A
 
L
R
 
K
Q
 
S
N
 
V
-
 
I
N
 
T
P
 
P
E
 
E
L
 
I
Y
 
E
Q
 
Q
R
 
K
I
 
M
R
 
L
E
 
Q
G
 
H
I
 
T
P
 
P
F
 
I
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
Q
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
N
V
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
P
L
 
A
A
 
A
R
 
S
W
 
W
I
 
V
T
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
L
 
L
V
 
T
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
G
V
 
V

1ahiA 7 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase complexed with nadh and 7-oxo glycochenodeoxycholic acid (see paper)
33% identity, 95% coverage: 12:254/256 of query aligns to 9:251/255 of 1ahiA

query
sites
1ahiA
F
 
L
H
 
D
G
 
G
R
 
K
R
 
C
V
 
A
I
 
I
V
 
I
A
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
G
K
x
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
S
 
V
V
 
V
C
 
S
A
x
D
R
x
I
G
 
N
Q
 
A
A
 
D
S
 
A
L
 
A
D
 
N
A
 
H
L
 
V
A
 
V
E
 
D
E
 
E
V
 
I
A
 
Q
S
 
Q
E
 
L
G
 
G
L
 
G
A
 
Q
L
 
A
H
 
F
V
 
A
T
 
C
P
 
R
C
 
C
D
|
D
I
|
I
G
 
T
D
 
S
K
 
E
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
L
 
A
Q
 
D
N
 
F
A
 
A
M
 
I
G
 
S
E
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
K
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
S
 
G
A
 
G
F
 
G
G
 
G
R
 
P
E
 
K
D
 
P
N
 
F
E
 
D
-
 
M
-
 
P
-
 
M
E
 
A
G
 
D
W
 
F
L
 
R
S
 
R
S
 
A
V
 
Y
E
 
E
V
 
L
D
 
N
L
 
V
M
 
F
G
 
S
T
 
F
V
 
F
R
 
H
A
 
L
G
 
S
H
 
Q
I
 
L
C
 
V
L
 
A
P
 
P
A
 
E
L
 
M
-
 
E
K
 
K
E
 
N
T
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
V
I
 
I
I
 
L
N
 
T
I
 
I
A
 
T
S
|
S
I
 
M
A
|
A
A
 
A
L
 
E
H
x
N
A
 
K
S
 
N
T
 
I
R
 
N
T
x
M
A
 
T
P
 
S
Y
|
Y
A
 
A
A
 
S
I
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
S
H
 
H
Y
 
L
T
 
V
G
 
R
S
 
N
L
 
M
A
 
A
V
 
F
T
 
D
M
 
L
A
 
G
P
 
E
H
 
K
K
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
S
 
A
I
|
I
E
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
L
W
x
T
D
 
D
Q
x
A
A
 
L
R
 
K
Q
 
S
N
x
V
-
 
I
N
 
T
P
 
P
E
 
E
L
 
I
Y
 
E
Q
 
Q
R
 
K
I
 
M
R
 
L
E
 
Q
G
 
H
I
 
T
P
 
P
F
 
I
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
Q
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
N
V
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
P
L
 
A
A
 
A
R
 
S
W
 
W
I
 
V
T
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
L
 
L
V
 
T
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P0AET8 7alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; 7alpha-HSDH; NAD-dependent 7alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.159 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
33% identity, 95% coverage: 12:254/256 of query aligns to 9:251/255 of P0AET8

query
sites
P0AET8
F
 
L
H
 
D
G
 
G
R
 
K
R
 
C
V
 
A
I
 
I
V
 
I
A
 
T
G
 
G
G
 
A
S
 
G
K
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
S
 
V
V
 
V
C
 
S
A
x
D
R
x
I
G
 
N
Q
 
A
A
 
D
S
 
A
L
 
A
D
 
N
A
 
H
L
 
V
A
 
V
E
 
D
E
 
E
V
 
I
A
 
Q
S
 
Q
E
 
L
G
 
G
L
 
G
A
 
Q
L
 
A
H
 
F
V
 
A
T
 
C
P
 
R
C
 
C
D
|
D
I
|
I
G
 
T
D
 
S
K
 
E
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
S
A
 
A
Y
 
L
L
 
A
Q
 
D
N
 
F
A
 
A
M
 
I
G
 
S
E
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
K
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
S
 
G
A
 
G
F
x
G
G
 
G
R
 
P
E
 
K
D
 
P
N
 
F
E
 
D
-
 
M
-
 
P
-
 
M
E
 
A
G
 
D
W
 
F
L
 
R
S
 
R
S
 
A
V
 
Y
E
 
E
V
 
L
D
 
N
L
 
V
M
 
F
G
 
S
T
 
F
V
 
F
R
 
H
A
 
L
G
 
S
H
 
Q
I
 
L
C
 
V
L
 
A
P
 
P
A
 
E
L
 
M
-
 
E
K
 
K
E
 
N
T
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
V
I
 
I
I
 
L
N
 
T
I
 
I
A
 
T
S
|
S
I
 
M
A
 
A
A
 
A
L
 
E
H
x
N
A
 
K
S
 
N
T
 
I
R
 
N
T
 
M
A
 
T
P
 
S
Y
|
Y
A
 
A
A
 
S
I
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
S
H
 
H
Y
 
L
T
 
V
G
 
R
S
 
N
L
 
M
A
 
A
V
 
F
T
 
D
M
 
L
A
 
G
P
 
E
H
 
K
K
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
A
I
|
I
E
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
V
x
L
W
x
T
D
 
D
Q
 
A
A
 
L
R
 
K
Q
 
S
N
 
V
-
 
I
N
 
T
P
 
P
E
 
E
L
 
I
Y
 
E
Q
 
Q
R
 
K
I
 
M
R
 
L
E
 
Q
G
 
H
I
 
T
P
 
P
F
 
I
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
Q
E
 
D
V
 
I
A
 
A
D
 
N
V
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
P
L
 
A
A
 
A
R
 
S
W
 
W
I
 
V
T
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
I
L
 
L
V
 
T
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
G
V
 
V

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
35% identity, 96% coverage: 11:255/256 of query aligns to 1:242/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
D
 
N
F
 
F
H
 
E
G
 
G
R
 
K
R
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
A
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
K
x
R