SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3145 FitnessBrowser__psRCH2:GFF3145 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5bt9C Crystal structure of folm alternative dihydrofolate reductase 1 from brucella canis complexed with NADP (see paper)
29% identity, 98% coverage: 4:233/234 of query aligns to 8:242/250 of 5bt9C

query
sites
5bt9C
A
 
C
P
 
P
I
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
S
 
A
Q
 
R
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
K
H
 
A
C
 
I
A
 
V
E
 
E
R
 
D
L
 
L
L
 
A
E
 
S
D
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
P
V
 
V
I
 
A
V
 
I
T
 
H
Y
x
C
R
x
N
R
|
R
E
x
S
R
 
L
D
 
D
S
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
I
I
 
A
D
 
N
R
 
R
L
 
I
R
 
N
T
 
D
L
 
S
G
 
G
-
 
G
-
 
N
A
 
A
S
 
C
T
 
V
L
 
V
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
-
D
 
-
E
|
E
A
 
G
G
 
D
I
 
V
T
 
R
G
 
G
F
 
L
I
 
V
A
 
K
A
 
Q
L
 
A
R
 
S
E
 
D
Q
 
R
T
 
I
A
 
G
S
 
P
L
 
I
R
 
R
A
 
L
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
E
 
L
W
 
F
R
 
Q
P
 
E
D
 
D
T
 
K
P
 
V
G
 
G
Q
 
A
-
 
L
E
 
D
A
 
M
E
 
A
A
 
L
F
 
W
R
 
D
Q
 
R
L
 
H
F
 
F
Q
 
A
V
 
V
H
 
H
M
 
L
L
 
K
A
 
T
P
 
P
Y
 
V
L
 
I
I
 
L
N
 
-
L
 
-
H
 
-
C
 
-
A
 
A
D
 
E
L
 
D
L
 
M
R
 
R
H
 
K
G
 
A
G
 
L
P
 
P
A
 
E
D
 
D
-
 
Q
-
 
D
-
 
G
-
 
L
I
 
V
V
 
V
H
 
N
I
|
I
G
 
I
D
 
D
D
 
Q
V
 
R
T
 
V
R
 
W
K
 
K
G
 
L
S
 
N
K
 
P
K
 
Q
H
 
F
I
 
F
A
 
S
Y
|
Y
A
 
T
A
 
L
S
 
S
K
|
K
A
 
T
G
 
A
L
 
L
D
 
W
N
 
N
L
 
A
T
 
T
L
 
R
S
 
T
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
S
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
R
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
P
I
x
T
Q
x
L
F
 
P
N
 
S
P
 
E
D
 
R
D
 
Q
D
 
R
E
 
P
E
 
E
Y
 
D
R
 
F
R
 
E
K
 
R
A
 
Q
L
 
V
A
 
S
K
 
K
S
 
L
A
 
P
L
 
L
G
 
Q
I
 
R
E
 
A
P
 
P
G
 
E
A
 
L
E
 
P
V
 
E
I
 
F
Y
 
G
Q
 
R
S
 
T
L
 
V
R
 
R
Y
 
Y
L
 
F
L
 
W
D
 
E
N
 
N
P
 
R
Y
 
S
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
M
L
 
I
T
 
A
V
 
L
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
H
 
H
L
 
L

8bcjB Crystal structure of short-chain dehydrogenase pa3128 from pseudomonas aeruginosa pao1 in complex with NADP+
30% identity, 97% coverage: 6:231/234 of query aligns to 7:250/250 of 8bcjB

query
sites
8bcjB
I
 
M
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
Q
x
R
R
x
G
I
|
I
G
 
G
L
 
A
H
 
A
C
 
T
A
 
A
E
 
L
R
 
L
L
 
A
L
 
A
E
 
E
D
 
R
G
 
G
F
 
Y
T
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
L
T
 
N
Y
 
Y
R
x
L
R
|
R
E
x
N
R
 
R
D
 
E
S
 
A
I
 
A
D
 
E
R
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
Q
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
R
L
 
Q
G
 
G
A
 
G
S
 
E
T
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
V
K
 
A
A
|
A
D
|
D
F
x
V
S
 
A
D
 
E
E
 
E
A
 
G
G
 
D
I
 
V
T
 
E
G
 
R
F
 
L
I
 
F
A
 
A
A
 
S
L
 
I
R
 
D
E
 
E
Q
 
R
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
L
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
x
G
E
 
M
W
 
L
R
 
E
P
 
A
D
 
Q
T
 
T
P
 
R
G
 
L
Q
 
E
E
 
N
A
 
I
E
 
D
A
 
A
F
 
A
R
 
R
-
 
L
-
 
H
Q
 
R
L
 
V
F
 
F
Q
 
A
V
x
T
H
 
N
M
 
V
L
 
T
A
 
G
P
 
S
Y
 
F
L
 
L
I
 
C
N
 
A
L
 
R
H
 
E
C
 
A
A
 
V
D
 
K
L
 
R
L
 
L
-
 
S
-
 
T
R
 
R
H
 
H
G
 
G
G
 
G
-
 
R
P
 
G
A
 
G
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
V
G
 
S
D
x
S
D
 
M
V
 
A
T
 
S
R
 
R
K
 
L
G
 
G
S
 
S
-
 
P
K
 
N
K
 
E
H
 
Y
I
 
I
A
 
D
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
I
D
 
D
N
 
S
L
 
M
T
 
T
L
 
I
S
 
G
F
 
L
A
 
A
A
 
R
S
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
A
-
 
E
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
R
P
|
P
A
x
G
L
 
L
I
|
I
-
 
D
-
x
T
Q
 
E
F
x
I
N
x
H
P
 
A
D
 
S
D
 
G
D
 
G
E
 
E
E
 
P
Y
 
G
R
 
R
R
 
I
K
 
E
A
 
R
L
 
L
A
 
K
K
 
G
S
 
G
A
 
I
-
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
R
E
 
G
P
 
G
G
 
T
A
 
A
E
 
E
V
 
E
I
 
V
Y
 
A
Q
 
R
S
 
A
L
 
I
R
 
L
Y
 
W
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
-
 
E
-
 
A
P
 
S
Y
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
F
L
 
I
T
 
D
V
 
V
N
 
S
G
 
G
G
 
G
R
 
R

1p33B Pteridine reductase from leishmania tarentolae complex with NADPH and mtx (see paper)
29% identity, 98% coverage: 4:233/234 of query aligns to 4:266/269 of 1p33B

query
sites
1p33B
A
 
A
P
 
P
I
 
V
-
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
x
L
G
 
G
L
 
S
H
 
S
C
 
I
A
 
A
E
 
E
R
 
A
L
 
L
L
 
H
E
 
A
D
 
E
G
 
G
F
 
Y
T
 
T
V
 
V
I
 
C
V
 
L
T
 
H
Y
 
Y
R
x
H
R
|
R
E
x
S
R
 
A
D
 
A
S
 
D
I
 
A
D
 
S
R
 
T
L
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
R
R
 
R
T
 
P
L
 
N
G
 
S
A
 
A
S
 
I
T
 
T
L
 
V
K
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
S
D
 
N
E
 
V
A
 
A
G
 
T
I
 
A
T
 
S
G
 
S
F
 
V
I
 
P
A
 
V
A
 
T
L
 
L
R
 
F
E
 
S
Q
 
R
T
 
C
A
 
S
S
 
A
L
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
C
-
 
Y
-
 
M
-
 
H
-
 
W
-
 
G
-
 
R
-
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
x
S
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
T
T
 
P
P
 
L
G
 
L
Q
 
R
E
 
K
A
 
K
E
 
E
A
 
S
F
 
L
R
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
A
Q
 
D
L
 
L
F
 
F
Q
 
G
V
 
S
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
I
 
L
N
 
I
L
 
K
H
 
A
C
 
F
A
 
A
D
 
Q
L
 
R
L
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
R
-
 
A
-
 
E
R
 
Q
H
 
R
G
 
G
G
 
T
P
 
S
A
 
Y
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
M
G
x
V
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
T
R
 
S
K
 
Q
G
 
P
S
 
L
K
 
L
K
 
G
H
x
Y
I
 
T
A
 
M
Y
|
Y
A
 
T
A
 
M
S
 
A
K
|
K
A
 
E
G
 
A
L
 
L
D
 
E
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
R
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
S
-
 
L
A
 
Q
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
S
P
 
P
A
x
G
L
|
L
I
x
S
Q
x
V
F
 
L
N
 
-
P
|
P
D
 
D
D
 
D
-
x
M
-
 
P
-
 
F
-
 
S
-
 
V
D
 
Q
E
 
E
E
 
D
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
-
 
P
L
 
L
A
 
Y
K
 
Q
S
 
R
A
 
N
L
 
S
G
 
S
I
 
A
E
 
E
P
 
E
G
 
V
A
 
S
E
 
D
V
 
V
I
 
V
Y
 
-
Q
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
Y
 
I
L
 
F
L
 
L
D
 
C
N
 
S
P
 
P
-
 
K
-
 
A
-
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
C
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
H
 
S
L
 
L

4cm7A Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:250/252 of 4cm7A

query
sites
4cm7A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
-
 
N
G
 
G
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
H
 
Q
G
 
S
G
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
K
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
-
x
S
-
x
L
-
 
L
-
 
P
I
 
V
Q
 
A
F
 
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
x
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

1mxhA Crystal structure of substrate complex of putative pteridine reductase 2 (ptr2) from trypanosoma cruzi (see paper)
33% identity, 96% coverage: 7:230/234 of query aligns to 5:242/248 of 1mxhA

query
sites
1mxhA
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
S
 
A
Q
 
R
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
H
H
 
S
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
R
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
Q
G
 
G
F
 
F
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
H
Y
|
Y
R
|
R
R
x
H
E
x
S
R
 
E
D
 
G
S
 
A
I
 
A
D
 
Q
R
 
R
L
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
A
R
 
R
T
 
A
L
 
G
G
 
S
A
 
A
S
 
V
T
 
L
L
 
C
K
 
K
A
 
G
D
 
D
F
x
L
S
 
S
D
 
L
E
 
S
A
 
S
G
 
S
I
 
L
T
 
L
G
 
D
F
 
C
I
 
C
A
 
E
A
 
D
L
 
I
R
 
I
E
 
D
Q
 
-
T
 
-
A
 
C
S
 
S
L
 
F
R
 
R
A
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
C
-
 
D
-
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
Y
R
 
Y
P
 
P
D
 
T
T
 
P
-
 
L
-
 
L
P
 
P
G
 
P
Q
 
I
E
 
D
A
 
A
E
 
Q
A
 
-
F
 
V
R
 
A
Q
x
E
L
 
L
F
 
F
Q
 
G
V
 
S
H
 
N
M
 
A
L
 
V
A
 
A
P
 
P
-
 
L
Y
 
F
L
 
L
I
 
I
N
 
R
L
 
-
H
 
-
C
 
-
A
 
A
D
 
F
L
 
A
L
 
R
R
 
R
H
 
Q
G
 
S
G
 
R
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
V
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
x
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
T
R
 
D
K
 
L
G
 
P
S
 
L
K
 
P
K
 
G
H
x
F
I
 
C
A
 
V
Y
|
Y
A
 
T
A
 
M
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
G
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
R
S
 
A
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
R
-
 
H
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
L
I
x
S
Q
x
L
F
 
L
N
x
P
P
 
P
-
 
A
-
 
M
-
 
P
-
 
Q
D
 
E
D
 
T
D
 
Q
E
 
E
E
 
E
Y
|
Y
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
-
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
Q
S
 
S
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
A
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
I
R
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
-
 
S
-
 
K
D
 
D
N
 
A
P
 
G
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
L
 
L
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

4clhA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:250/252 of 4clhA

query
sites
4clhA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
x
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
G
 
G
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
Q
L
 
R
L
 
Q
R
 
K
H
 
S
G
 
S
G
 
N
P
 
-
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
K
 
M
K
 
A
H
x
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
-
x
S
-
 
L
-
 
L
-
x
P
I
 
V
Q
 
A
F
 
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
x
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

4cleA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:250/252 of 4cleA

query
sites
4cleA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
G
 
G
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
Q
L
 
R
L
 
Q
R
 
K
H
 
S
G
 
S
G
 
N
P
 
-
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
 
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
K
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
-
x
S
-
 
L
-
 
L
-
x
P
I
 
V
Q
 
A
F
 
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
x
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

2c7vC Structure of trypanosoma brucei pteridine reductase (ptr1) in ternary complex with cofactor and the antifolate methotrexate (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:258/260 of 2c7vC

query
sites
2c7vC
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
x
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
|
P
D
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
-
 
G
G
 
G
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
Q
L
 
R
L
 
Q
R
 
K
H
 
G
G
 
T
G
 
N
P
 
P
A
 
N
-
 
C
-
 
T
-
 
S
-
 
S
-
 
N
-
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
x
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
K
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
 
G
L
 
V
-
x
S
-
 
L
-
 
L
-
x
P
I
 
V
Q
 
A
F
x
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
x
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

3bmoA Structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor (NADP+) and inhibitor (compound ax4) (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:253/255 of 3bmoA

query
sites
3bmoA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
G
 
G
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
Q
L
 
-
L
 
-
R
 
R
H
 
Q
G
 
K
G
 
G
P
 
T
A
 
T
-
 
S
-
 
S
-
 
N
-
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
K
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
x
V
-
x
S
-
 
L
-
x
L
-
x
P
I
 
V
Q
 
A
F
 
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
x
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

7opjA Trypanosoma brucei ptr1 (tbptr1) in complex with pyrimethamine (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:248/250 of 7opjA

query
sites
7opjA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
x
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
G
 
G
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
Q
H
 
R
G
 
Q
G
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
K
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
x
V
-
x
S
-
x
L
-
 
L
-
x
P
I
 
V
Q
 
A
F
 
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
 
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

6gd4A Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor 4c (f188) (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:248/250 of 6gd4A

query
sites
6gd4A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
G
 
G
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
Q
H
 
R
G
 
Q
G
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
K
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
-
x
S
-
 
L
-
 
L
-
 
P
I
 
V
Q
 
A
F
 
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
 
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

6gclA Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor 3a (f020) (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:248/250 of 6gclA

query
sites
6gclA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
G
 
G
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
Q
H
 
R
G
 
Q
G
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
K
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
-
x
S
-
x
L
-
 
L
-
x
P
I
 
V
Q
 
A
F
 
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
 
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

4wcdA Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor 10 (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:248/250 of 4wcdA

query
sites
4wcdA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
G
 
G
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
Q
H
 
R
G
 
Q
G
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
K
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
x
V
-
x
S
-
x
L
-
 
L
-
x
P
I
 
V
Q
 
A
F
 
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
x
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

4cmkA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:248/250 of 4cmkA

query
sites
4cmkA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
G
 
G
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
Q
H
 
R
G
 
Q
G
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
x
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
K
 
M
K
 
A
H
x
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
x
V
-
x
S
-
 
L
-
 
L
-
x
P
I
 
V
Q
 
A
F
 
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
 
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

4cm8A Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:248/250 of 4cm8A

query
sites
4cm8A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
G
 
G
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
Q
H
 
R
G
 
Q
G
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
x
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
K
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
-
x
S
-
x
L
-
 
L
-
 
P
I
 
V
Q
 
A
F
 
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
x
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

4clrA Crystal structure of pteridine reductase 1 (ptr1) from trypanosoma brucei in ternary complex with cofactor and inhibitor (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:248/250 of 4clrA

query
sites
4clrA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
 
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
|
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
G
 
G
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
Q
H
 
R
G
 
Q
G
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
K
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
x
V
-
x
S
-
x
L
-
 
L
-
x
P
I
 
V
Q
 
A
F
 
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
 
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

2x9vA High resolution structure of tbptr1 with trimetrexate (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:248/250 of 2x9vA

query
sites
2x9vA
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
G
 
G
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
Q
H
 
R
G
 
Q
G
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
K
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
x
V
-
x
S
-
 
L
-
 
L
-
x
P
I
 
V
Q
 
A
F
x
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
 
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

6gd0A Trypanosoma brucei ptr1 in complex with inhibitor 4g (f133) (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:252/254 of 6gd0A

query
sites
6gd0A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
-
T
 
T
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
G
 
G
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
Q
L
 
R
L
 
Q
R
 
K
-
 
C
H
 
T
G
 
S
G
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
x
C
K
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
x
V
-
x
S
-
x
L
-
 
L
-
 
P
I
 
V
Q
x
A
F
x
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
x
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

6rx6A Trypanosoma brucei ptr1 (tbptr1) in complex with inhibitor 4 (nmt- c0026) (see paper)
26% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:246/248 of 6rx6A

query
sites
6rx6A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
 
P
D
 
T
T
 
P
P
 
L
G
 
V
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
Q
H
 
R
G
 
Q
G
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
K
 
M
K
 
A
H
 
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
V
-
x
S
-
 
L
-
 
L
-
x
P
I
 
V
Q
 
A
F
x
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
x
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

6rx0A Trypanosoma brucei ptr1 (tbptr1) in complex with inhibitor 3 (nmt- c0013) (see paper)
26% identity, 97% coverage: 7:234/234 of query aligns to 6:246/248 of 6rx0A

query
sites
6rx0A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
Q
 
K
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
E
 
V
R
 
K
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
T
G
 
G
F
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
R
x
H
R
x
N
E
x
S
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
R
 
A
D
 
D
S
 
E
I
 
L
D
 
N
R
 
K
L
 
E
R
 
R
T
 
S
L
 
N
G
 
T
A
 
A
S
 
V
T
 
V
L
 
C
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
F
x
L
S
 
T
D
 
N
E
 
S
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
C
T
 
E
G
 
E
F
 
I
I
 
I
A
 
N
A
 
S
L
 
C
R
 
F
E
 
R
Q
 
A
T
 
F
A
 
G
S
 
R
L
 
C
R
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
F
R
 
Y
P
|
P
D
 
T
T
 
P
P
 
L
G
 
V
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
Q
F
 
V
R
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
G
V
x
T
H
 
N
M
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
L
I
 
L
N
 
T
L
 
M
H
 
S
C
 
F
A
 
A
D
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
Q
H
 
R
G
 
Q
G
 
S
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
L
G
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
G
 
P
S
 
C
K
 
M
K
 
A
H
x
F
I
 
S
A
 
L
Y
|
Y
A
 
N
A
 
M
S
 
G
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
V
N
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
Q
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
Y
A
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
 
G
L
 
V
-
x
S
-
 
L
-
 
L
-
x
P
I
 
V
Q
 
A
F
x
M
N
 
G
P
 
E
D
 
E
D
 
E
D
 
K
E
 
D
E
 
K
Y
x
W
R
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
V
L
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
-
 
R
I
 
R
E
 
E
P
 
A
G
 
S
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
R
 
I
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
N
 
G
P
 
S
-
 
A
-
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
I
L
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V

Query Sequence

>GFF3145 FitnessBrowser__psRCH2:GFF3145
MHQAPILITGASQRIGLHCAERLLEDGFTVIVTYRRERDSIDRLRTLGASTLKADFSDEA
GITGFIAALREQTASLRAIVHNASEWRPDTPGQEAEAFRQLFQVHMLAPYLINLHCADLL
RHGGPADIVHIGDDVTRKGSKKHIAYAASKAGLDNLTLSFAASLAPAIKVNGIAPALIQF
NPDDDEEYRRKALAKSALGIEPGAEVIYQSLRYLLDNPYVTGTTLTVNGGRHLI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory