SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3447 FitnessBrowser__psRCH2:GFF3447 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

3lzkC The crystal structure of a probably aromatic amino acid degradation protein from sinorhizobium meliloti 1021
65% identity, 99% coverage: 1:325/327 of query aligns to 7:341/343 of 3lzkC

query
sites
3lzkC
M
 
M
K
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
-
 
K
N
 
D
Q
 
S
G
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
S
R
 
K
D
 
D
L
 
L
A
 
T
Q
 
R
A
 
C
V
 
S
K
 
E
V
 
V
P
 
G
Q
 
H
I
 
I
A
 
A
A
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
W
 
W
N
 
A
Y
 
H
C
 
A
K
 
G
P
 
P
K
 
R
L
 
L
E
 
E
A
 
-
V
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
R
L
 
V
N
 
A
D
 
E
G
 
G
L
 
I
E
 
E
E
 
T
G
 
G
A
 
A
-
 
Q
-
 
P
-
 
T
F
 
M
A
 
R
F
 
F
D
 
H
Q
 
E
T
 
H
A
 
D
C
 
A
H
 
A
S
 
S
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
A
Y
 
F
H
 
Q
W
 
W
A
 
A
D
|
D
G
 
G
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
H
 
H
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
K
A
 
A
R
 
R
G
 
N
A
 
A
E
 
E
M
 
M
P
 
P
E
 
A
S
 
S
F
 
F
W
 
W
H
 
T
D
 
D
P
 
P
L
 
L
M
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
A
 
S
D
 
D
A
 
S
F
 
F
I
 
L
P
 
G
P
 
P
H
 
R
S
 
D
P
 
P
I
 
I
R
 
L
L
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
D
A
 
A
W
 
W
G
 
G
I
 
I
D
 
D
L
 
M
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
V
D
 
D
D
 
D
V
 
V
P
 
P
M
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
L
A
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
A
H
 
A
I
 
I
Q
 
R
L
 
L
L
 
V
M
 
M
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
|
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
R
 
R
N
 
G
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
P
 
P
S
 
S
S
 
S
S
 
A
F
 
F
S
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
E
 
E
T
 
A
W
 
W
R
 
D
D
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
L
H
 
H
R
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
H
S
 
V
H
 
D
I
 
L
N
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
P
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
P
 
A
D
 
N
A
 
A
G
 
G
T
 
I
D
 
D
M
 
M
T
 
T
F
 
F
N
 
D
F
 
F
P
 
P
T
 
Q
L
 
L
V
 
I
A
 
V
H
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
R
 
R
P
 
P
L
 
L
G
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
I
 
I
I
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
V
S
 
S
N
 
N
Y
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
V
-
 
S
D
 
E
R
 
G
S
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
Y
S
 
S
C
 
C
L
 
I
A
 
A
E
 
E
K
 
L
R
 
R
M
 
M
L
 
I
E
 
E
V
 
T
V
 
I
E
 
E
H
 
G
G
 
G
E
 
A
A
 
P
K
 
K
T
 
T
P
 
Q
F
 
F
L
 
L
K
 
K
F
 
F
G
 
G
D
 
D
R
 
V
V
 
V
R
 
R
I
 
I
E
 
E
M
 
M
F
 
K
D
 
D
A
 
R
A
 
T
G
 
G
Q
 
H
S
 
S
I
 
I
F
 
F
G
 
G
A
 
A
I
 
I
D
 
E
Q
 
Q
Q
 
K
V
 
V
E
 
G
R
 
K
Y
 
Y

6j5xB Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from corynebacterium glutamicum in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
28% identity, 55% coverage: 84:264/327 of query aligns to 74:242/280 of 6j5xB

query
sites
6j5xB
G
|
G
S
x
L
A
 
N
Y
 
Y
V
 
A
N
 
N
H
|
H
V
 
I
E
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
K
A
 
E
R
 
M
G
 
G
A
 
R
E
 
D
M
 
L
P
 
P
E
 
D
S
 
T
F
 
-
W
 
-
H
 
-
D
 
-
P
 
P
L
 
T
M
 
L
Y
x
F
Q
 
V
G
 
K
G
 
F
A
 
P
D
 
D
A
 
A
F
 
L
I
 
I
P
 
G
P
 
P
H
 
F
S
 
D
P
 
D
I
 
V
R
 
V
L
 
V
A
 
P
D
 
E
E
 
W
A
 
A
-
 
N
W
 
K
G
 
A
I
 
L
D
 
D
L
 
W
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
M
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
I
D
 
G
D
 
K
V
 
R
P
 
A
M
 
R
G
 
R
A
 
V
T
 
K
P
 
Q
A
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
E
H
 
Y
I
 
I
Q
 
A
L
 
G
L
 
Y
M
 
A
L
 
V
V
 
M
N
 
N
D
|
D
V
 
Y
S
 
T
L
 
T
R
 
R
N
 
D
L
 
F
I
 
Q
P
 
Y
G
 
A
E
 
A
L
 
P
A
 
A
K
 
K
G
 
T
F
 
P
G
 
Q
F
x
W
Y
 
H
Q
 
Q
S
 
G
K
|
K
-
 
S
-
 
L
-
 
E
P
 
K
S
 
S
S
 
A
S
 
G
F
 
F
S
 
G
P
 
P
V
 
W
A
 
M
V
 
T
T
 
T
P
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
F
G
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
E
V
 
F
H
 
G
R
 
G
P
 
E
L
 
L
V
 
A
S
 
T
H
 
Y
I
 
L
N
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
K
F
 
V
G
 
-
Q
 
Q
P
 
S
D
 
T
A
 
P
G
 
T
T
 
N
D
 
D
M
 
L
T
 
V
F
 
F
N
 
S
F
 
P
P
 
E
T
 
K
L
 
L
V
 
I
A
 
E
H
 
Y
A
 
I
A
 
T
R
 
H
T
 
I
R
 
Y
P
 
P
L
 
L
G
 
D
A
 
A
G
 
G
T
 
D
I
 
V
I
 
I
G
 
V
S
 
T
G
|
G
T
|
T

Sites not aligning to the query:

6j5xA Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from corynebacterium glutamicum in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
28% identity, 55% coverage: 84:264/327 of query aligns to 74:242/280 of 6j5xA

query
sites
6j5xA
G
 
G
S
 
L
A
 
N
Y
 
Y
V
 
A
N
 
N
H
 
H
V
 
I
E
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
K
A
 
E
R
 
M
G
 
G
A
 
R
E
 
D
M
 
L
P
 
P
E
 
D
S
 
T
F
 
-
W
 
-
H
 
-
D
 
-
P
 
P
L
 
T
M
 
L
Y
 
F
Q
 
V
G
 
K
G
 
F
A
 
P
D
 
D
A
 
A
F
 
L
I
 
I
P
 
G
P
 
P
H
 
F
S
 
D
P
 
D
I
 
V
R
 
V
L
 
V
A
 
P
D
 
E
E
 
W
A
 
A
-
 
N
W
 
K
G
 
A
I
 
L
D
 
D
L
 
W
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
M
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
I
D
 
G
D
 
K
V
 
R
P
 
A
M
 
R
G
 
R
A
 
V
T
 
K
P
 
Q
A
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
E
H
 
Y
I
 
I
Q
 
A
L
 
G
L
 
Y
M
 
A
L
 
V
V
 
M
N
 
N
D
|
D
V
 
Y
S
 
T
L
 
T
R
 
R
N
 
D
L
 
F
I
 
Q
P
 
Y
G
 
A
E
 
A
L
 
P
A
 
A
K
 
K
G
 
T
F
 
P
G
 
Q
F
 
W
Y
 
H
Q
 
Q
S
 
G
K
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
E
P
 
K
S
 
S
S
 
A
S
 
G
F
 
F
S
 
G
P
 
P
V
 
W
A
 
M
V
 
T
T
 
T
P
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
F
G
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
E
V
 
F
H
 
G
R
 
G
P
 
E
L
 
L
V
 
A
S
 
T
H
 
Y
I
 
L
N
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
K
F
 
V
G
 
-
Q
 
Q
P
 
S
D
 
T
A
 
P
G
 
T
T
 
N
D
 
D
M
 
L
T
 
V
F
 
F
N
 
S
F
 
P
P
 
E
T
 
K
L
 
L
V
 
I
A
 
E
H
 
Y
A
 
I
A
 
T
R
 
H
T
 
I
R
 
Y
P
 
P
L
 
L
G
 
D
A
 
A
G
 
G
T
 
D
I
 
V
I
 
I
G
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
T

Q6P587 Acylpyruvase FAHD1, mitochondrial; Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 1; FAH domain-containing protein 1; Oxaloacetate decarboxylase; OAA decarboxylase; YisK-like protein; EC 3.7.1.5; EC 4.1.1.112 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
27% identity, 60% coverage: 70:264/327 of query aligns to 5:192/224 of Q6P587

query
sites
Q6P587
A
 
A
C
 
A
H
 
S
S
 
R
P
 
P
L
 
L
P
 
S
R
 
R
A
 
F
Y
 
W
H
 
E
W
 
W
A
 
G
D
 
K
G
 
N
S
 
I
A
 
V
Y
 
C
V
 
V
-
 
G
-
 
R
N
 
N
H
 
Y
V
 
A
E
 
D
L
x
H
V
 
V
R
 
R
K
x
E
A
 
M
R
 
R
G
 
S
A
 
A
E
 
V
M
 
L
P
 
S
E
 
E
S
 
-
F
 
-
W
 
-
H
 
-
D
 
-
P
 
P
L
 
V
M
 
L
Y
 
F
Q
 
L
G
 
K
G
 
P
A
 
S
D
 
T
A
 
A
F
 
Y
I
 
A
P
 
P
P
 
E
H
 
G
S
 
S
P
 
P
I
 
I
R
 
L
L
 
M
A
 
P
D
 
A
E
 
Y
A
 
T
W
 
R
G
 
N
I
 
L
D
 
H
L
 
H
E
|
E
G
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
I
 
V
T
 
M
D
 
G
D
 
K
V
 
R
P
 
C
M
 
R
G
 
A
A
 
V
T
 
P
P
 
E
A
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
M
S
 
D
H
 
Y
I
 
V
Q
 
G
L
 
G
L
 
Y
M
 
A
L
 
L
V
 
C
N
 
L
D
|
D
V
 
M
S
 
T
L
 
A
R
|
R
N
 
D
L
 
V
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
-
 
C
-
 
K
-
 
K
-
 
K
-
 
G
I
 
L
P
 
P
G
 
W
E
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
K
G
 
S
F
 
F
G
 
T
F
 
-
Y
 
-
Q
 
A
S
 
S
K
 
C
P
 
P
S
 
V
S
 
S
S
 
A
F
 
F
S
 
V
P
 
P
V
 
K
A
 
E
V
 
K
T
 
I
P
 
P
D
 
D
E
 
P
L
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
H
 
H
R
 
K
-
 
L
P
 
K
L
 
L
V
 
W
S
 
L
H
 
K
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
L
F
 
-
G
 
R
Q
 
Q
P
 
E
D
 
G
A
 
E
G
 
T
T
 
S
D
 
S
M
 
M
T
 
I
F
 
F
N
 
S
F
 
I
P
 
P
T
 
Y
L
 
I
V
 
I
A
 
S
H
 
Y
A
 
V
A
 
S
R
 
K
T
 
I
R
 
I
P
 
T
L
 
L
G
 
E
A
 
E
G
 
G
T
 
D
I
 
I
I
 
I
G
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T

6fogA X-ray structure of homo sapiens fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (fahd1) in complex with inhibitor oxalate at 1.94a resolution. (see paper)
27% identity, 58% coverage: 74:264/327 of query aligns to 4:187/218 of 6fogA

query
sites
6fogA
P
 
P
L
 
L
P
 
S
R
 
R
A
 
F
Y
 
W
H
 
E
W
 
W
A
 
G
D
x
K
G
x
N
S
 
I
A
 
V
Y
 
C
V
|
V
-
x
G
-
x
R
N
 
N
H
 
Y
V
 
A
E
 
D
L
x
H
V
 
V
R
 
R
K
 
E
A
 
M
R
 
R
G
 
S
A
 
A
E
 
V
M
 
L
P
 
S
E
 
E
S
 
-
F
 
-
W
 
-
H
 
-
D
 
-
P
 
P
L
 
V
M
 
L
Y
x
F
Q
 
L
G
 
K
G
 
P
A
 
S
D
 
T
A
 
A
F
 
Y
I
 
A
P
 
P
P
 
E
H
 
G
S
 
S
P
 
P
I
 
I
R
 
L
L
 
M
A
 
P
D
 
A
E
 
Y
A
 
T
W
 
R
G
 
N
I
 
L
D
 
H
L
 
H
E
|
E
G
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
I
 
V
T
 
M
D
 
G
D
 
K
V
 
R
P
 
C
M
 
R
G
 
A
A
 
V
T
 
P
P
 
E
A
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
M
S
 
D
H
 
Y
I
 
V
Q
 
G
L
 
G
L
 
Y
M
 
A
L
 
L
V
 
C
N
 
L
D
|
D
V
 
M
S
 
T
L
 
A
R
 
R
N
 
D
L
 
V
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
-
 
C
-
 
K
-
 
K
-
 
K
-
 
G
I
 
L
P
 
P
G
 
W
E
 
T
L
 
L
A
 
A
K
|
K
G
 
S
F
 
F
G
 
T
F
 
-
Y
 
-
Q
 
A
S
 
S
K
 
C
P
 
P
S
 
V
S
 
S
S
 
A
F
 
F
S
 
V
P
 
P
V
 
K
A
 
E
V
 
K
T
 
I
P
 
P
D
 
D
E
 
P
L
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
H
 
H
R
 
K
-
 
L
P
 
K
L
 
L
V
 
W
S
 
L
H
 
K
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
L
F
 
-
G
 
R
Q
 
Q
P
 
E
D
 
G
A
 
E
G
 
T
T
 
S
D
 
S
M
 
M
T
 
I
F
 
F
N
 
S
F
 
I
P
 
P
T
 
Y
L
 
I
V
 
I
A
 
S
H
 
Y
A
 
V
A
 
S
R
 
K
T
 
I
R
 
I
P
 
T
L
 
L
G
 
E
A
 
E
G
 
G
T
 
D
I
 
I
I
 
I
G
 
L
S
 
T
G
|
G
T
|
T

6iymA Fumarylacetoacetate hydrolase (eafah) from psychrophilic exiguobacterium antarcticum (see paper)
27% identity, 55% coverage: 84:264/327 of query aligns to 75:240/277 of 6iymA

query
sites
6iymA
G
 
G
S
 
K
A
 
N
Y
 
Y
V
 
A
N
 
D
H
 
H
V
 
I
E
 
K
L
 
E
V
 
M
R
 
D
K
 
T
A
 
A
R
 
G
G
 
A
A
 
G
E
 
K
M
 
F
P
 
-
E
 
-
S
 
-
F
 
-
W
 
-
H
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
V
M
 
L
Y
 
F
Q
 
T
G
 
K
G
 
A
A
 
P
D
 
S
A
 
S
F
 
I
I
 
V
P
 
G
P
 
P
H
 
F
S
 
D
P
 
P
I
 
I
-
 
E
R
 
R
L
 
H
A
 
A
D
 
D
E
 
L
A
 
T
W
 
Q
G
 
Q
I
 
L
D
 
D
L
 
Y
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
I
D
 
G
D
 
T
V
 
T
P
 
G
M
 
R
G
 
D
A
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
N
A
 
A
A
 
L
S
 
E
H
 
H
I
 
V
Q
 
F
L
 
G
L
 
Y
M
 
S
L
 
I
V
 
I
N
 
N
D
|
D
V
 
V
S
 
T
L
 
A
R
 
R
N
 
D
L
 
L
I
 
Q
P
 
K
G
 
E
E
 
H
L
 
V
A
 
Q
K
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
F
Y
 
F
Q
 
R
S
 
G
K
 
K
P
 
S
S
 
L
S
 
D
S
 
G
F
 
F
S
 
C
-
 
P
-
 
F
-
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
E
D
 
D
E
 
A
L
 
F
G
 
D
E
 
P
T
 
A
W
 
-
R
 
-
D
 
D
G
 
V
K
 
L
V
 
V
H
 
E
R
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
T
H
 
R
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
L
F
 
-
G
 
R
Q
 
Q
P
 
S
D
 
G
A
 
S
G
 
T
T
 
K
D
 
L
M
 
M
T
 
L
F
 
R
N
 
D
F
 
V
P
 
V
T
 
T
L
 
I
V
 
L
A
 
T
H
 
E
A
 
V
A
 
S
R
 
R
T
 
G
R
 
M
P
 
T
L
 
L
G
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
D
I
 
V
I
 
I
G
 
A
S
 
T
G
 
G
T
 
T

8gstC Crystal structure of l-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase from sphingomonas sp. (Pyruvate bound-form) (see paper)
26% identity, 67% coverage: 109:327/327 of query aligns to 94:283/290 of 8gstC

query
sites
8gstC
D
 
E
P
 
P
L
 
M
M
 
M
Y
x
F
Q
 
M
G
 
K
G
 
A
A
 
L
D
 
S
A
 
S
F
 
L
I
 
N
P
 
G
P
 
P
H
 
N
S
 
D
P
 
E
I
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
P
D
 
K
E
 
N
A
 
S
W
 
T
G
 
H
I
 
G
D
 
D
L
 
W
E
|
E
G
 
V
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
I
 
V
T
 
I
D
 
G
D
 
E
V
 
T
P
 
C
M
 
R
G
 
F
A
 
V
T
 
S
P
 
E
A
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
L
S
 
S
H
 
K
I
 
V
Q
 
A
L
 
G
L
 
Y
M
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
|
D
V
 
V
S
 
S
L
 
E
R
 
R
N
 
F
L
 
-
I
 
-
P
 
-
G
 
N
E
 
Q
L
 
K
A
 
Q
K
 
R
G
 
G
F
 
T
G
 
Q
F
 
W
Y
 
S
Q
 
K
S
 
G
K
|
K
P
 
G
S
 
H
S
 
D
S
 
T
F
 
F
S
 
C
P
 
P
V
 
V
A
 
G
-
 
P
-
 
W
-
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
D
E
 
E
L
 
V
G
 
G
E
 
D
T
 
P
W
 
-
R
 
Q
D
 
D
G
 
L
K
 
D
V
 
V
H
 
H
R
 
L
P
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
D
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
R
F
 
M
G
 
Q
Q
 
T
P
 
G
D
 
N
A
 
T
G
 
K
T
 
T
D
 
-
M
 
M
T
 
I
F
 
F
N
 
N
F
 
V
P
 
A
T
 
Q
L
 
L
V
 
I
A
 
S
H
 
Y
A
 
V
A
 
S
R
 
E
T
 
Y
R
 
I
P
 
T
L
 
L
G
 
Y
A
 
P
G
 
G
T
 
D
I
 
L
I
 
M
G
 
I
S
 
T
G
|
G
T
|
T
V
 
P
S
 
P
N
 
G
Y
 
V
D
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
R
 
-
M
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
E
 
-
H
 
-
G
 
G
E
 
E
A
 
G
K
 
K
T
 
K
P
 
P
-
 
Q
-
 
A
-
 
I
F
 
Y
L
 
L
K
 
K
F
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
V
V
 
M
R
 
E
I
 
L
E
 
-
M
 
-
F
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
Q
 
I
S
 
E
I
 
K
F
 
L
G
 
G
A
 
T
I
 
Q
D
 
R
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
E
 
S
R
 
E
Y
 
W
G
 
R
H
 
H

Sites not aligning to the query:

8gsrA Crystal structure of l-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase from sphingomonas sp. (Apo-form) (see paper)
26% identity, 67% coverage: 109:327/327 of query aligns to 94:283/290 of 8gsrA

query
sites
8gsrA
D
 
E
P
 
P
L
 
M
M
 
M
Y
 
F
Q
 
M
G
 
K
G
 
A
A
 
L
D
 
S
A
 
S
F
 
L
I
 
N
P
 
G
P
 
P
H
 
N
S
 
D
P
 
E
I
 
V
R
 
V
L
 
L
A
 
P
D
 
K
E
 
N
A
 
S
W
 
T
G
 
H
I
 
G
D
 
D
L
 
W
E
|
E
G
 
V
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
I
 
V
T
 
I
D
 
G
D
 
E
V
 
T
P
 
C
M
 
R
G
 
F
A
 
V
T
 
S
P
 
E
A
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
L
S
 
S
H
 
K
I
 
V
Q
 
A
L
 
G
L
 
Y
M
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
|
D
V
 
V
S
 
S
L
 
E
R
 
R
N
 
F
L
 
-
I
 
-
P
 
-
G
 
N
E
 
Q
L
 
K
A
 
Q
K
 
R
G
 
G
F
 
T
G
 
Q
F
 
W
Y
 
S
Q
 
K
S
 
G
K
 
K
P
 
G
S
 
H
S
 
D
S
 
T
F
 
F
S
 
C
P
 
P
V
 
V
A
 
G
-
 
P
-
 
W
-
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
D
E
 
E
L
 
V
G
 
G
E
 
D
T
 
P
W
 
-
R
 
Q
D
 
D
G
 
L
K
 
D
V
 
V
H
 
H
R
 
L
P
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
D
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
R
F
 
M
G
 
Q
Q
 
T
P
 
G
D
 
N
A
 
T
G
 
K
T
 
T
D
 
-
M
 
M
T
 
I
F
 
F
N
 
N
F
 
V
P
 
A
T
 
Q
L
 
L
V
 
I
A
 
S
H
 
Y
A
 
V
A
 
S
R
 
E
T
 
Y
R
 
I
P
 
T
L
 
L
G
 
Y
A
 
P
G
 
G
T
 
D
I
 
L
I
 
M
G
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
P
S
 
P
N
 
G
Y
 
V
D
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
R
 
-
M
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
E
 
-
H
 
-
G
 
G
E
 
E
A
 
G
K
 
K
T
 
K
P
 
P
-
 
Q
-
 
A
-
 
I
F
 
Y
L
 
L
K
 
K
F
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
V
V
 
M
R
 
E
I
 
L
E
 
-
M
 
-
F
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
Q
 
I
S
 
E
I
 
K
F
 
L
G
 
G
A
 
T
I
 
Q
D
 
R
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
E
 
S
R
 
E
Y
 
W
G
 
R
H
 
H

6sbiA X-ray structure of murine fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (fahd1) in complex with inhibitor oxalate (see paper)
25% identity, 58% coverage: 74:264/327 of query aligns to 3:186/216 of 6sbiA

query
sites
6sbiA
P
 
P
L
 
L
P
 
S
R
 
R
A
 
F
Y
 
W
H
 
E
W
 
W
A
 
G
D
 
K
-
 
N
-
 
I
-
 
V
-
 
C
-
x
V
G
|
G
S
x
R
A
 
N
Y
 
Y
V
 
A
N
 
D
H
|
H
V
 
V
E
 
K
L
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
M
 
M
P
 
R
E
 
S
S
 
T
F
 
V
W
 
L
H
 
S
D
 
E
P
 
P
L
 
V
M
 
L
Y
x
F
Q
 
L
G
 
K
G
 
P
A
x
S
D
 
T
A
 
A
F
 
Y
I
 
A
P
 
P
P
 
E
H
 
G
S
 
S
P
 
P
I
 
V
R
 
L
L
 
M
A
 
P
D
 
A
E
 
Y
A
 
C
W
 
R
G
 
N
I
 
L
D
 
H
L
 
H
E
|
E
G
 
V
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
I
 
L
T
 
L
D
 
G
D
 
K
V
 
R
P
 
G
M
 
E
G
 
A
A
 
I
T
 
P
P
 
E
A
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
M
S
 
D
H
 
Y
I
 
V
Q
 
A
L
 
G
L
 
Y
M
 
A
L
 
L
V
 
C
N
 
L
D
|
D
V
 
M
S
 
T
L
 
A
R
 
R
N
 
D
L
 
V
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
C
-
 
K
-
 
K
-
 
K
-
 
G
I
 
L
P
 
P
G
 
W
E
 
T
L
 
L
A
 
A
K
|
K
G
 
S
F
 
F
G
 
T
F
 
-
Y
 
-
Q
 
S
S
 
S
K
 
C
P
 
P
S
 
V
S
 
S
S
 
A
F
 
F
S
 
V
P
 
P
V
 
K
A
 
E
V
 
K
T
 
I
P
 
P
D
 
D
E
 
P
L
 
H
G
 
A
E
 
L
T
 
R
W
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
H
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
L
V
 
W
S
 
L
H
 
K
I
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
L
F
 
-
G
 
R
Q
 
Q
P
 
E
D
 
G
A
 
K
G
 
T
T
 
S
D
 
S
M
 
M
T
 
I
F
 
F
N
 
S
F
 
I
P
 
P
T
 
Y
L
 
I
V
 
I
A
 
S
H
 
Y
A
 
V
A
 
S
R
 
K
T
 
I
R
 
I
P
x
T
L
 
L
G
 
E
A
 
E
G
 
G
T
 
D
I
 
L
I
 
I
G
 
L
S
 
T
G
|
G
T
|
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>GFF3447 FitnessBrowser__psRCH2:GFF3447
MKLATLNQGRDGVLVVVSRDLAQAVKVPQIAATLQAALDDWNYCKPKLEAVYQRLNDGLE
EGAFAFDQTACHSPLPRAYHWADGSAYVNHVELVRKARGAEMPESFWHDPLMYQGGADAF
IPPHSPIRLADEAWGIDLEGELAVITDDVPMGATPAEAASHIQLLMLVNDVSLRNLIPGE
LAKGFGFYQSKPSSSFSPVAVTPDELGETWRDGKVHRPLVSHINGELFGQPDAGTDMTFN
FPTLVAHAARTRPLGAGTIIGSGTVSNYDRSAGSSCLAEKRMLEVVEHGEAKTPFLKFGD
RVRIEMFDAAGQSIFGAIDQQVERYGH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory