SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF38 FitnessBrowser__Marino:GFF38 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8skyB Crystal structure of yisk from bacillus subtilis in complex with oxalate (see paper)
30% identity, 95% coverage: 15:326/329 of query aligns to 14:301/303 of 8skyB

query
sites
8skyB
A
 
V
G
 
G
A
 
L
L
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
D
G
 
-
Q
 
E
A
 
K
V
 
I
L
 
M
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
Y
 
E
T
 
K
L
 
K
T
 
L
R
 
F
G
 
E
G
 
L
E
 
E
L
 
T
Q
 
I
A
 
P
L
 
G
S
 
S
S
 
L
V
 
I
L
 
E
A
 
C
L
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
G
G
 
D
K
 
K
P
 
F
E
 
V
Q
 
A
D
 
H
L
 
-
A
 
A
R
 
R
S
 
Q
L
 
L
V
 
A
E
 
E
-
 
W
-
 
A
K
 
K
A
 
K
P
 
P
F
 
N
D
 
D
A
 
E
V
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
M
T
 
Y
S
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
E
V
 
V
R
 
K
L
 
L
R
 
H
A
 
A
P
 
P
I
 
I
Q
 
P
P
 
K
P
 
P
P
 
S
Q
 
-
M
 
-
R
 
K
D
 
N
F
 
I
S
 
I
C
 
C
F
x
I
E
 
-
L
 
-
H
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
S
 
-
F
 
-
A
x
G
A
 
K
A
 
N
R
 
Y
R
 
R
A
 
D
R
x
H
A
 
A
L
 
I
R
 
E
T
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
-
M
 
M
N
 
G
T
 
S
S
 
E
A
 
A
D
 
D
D
 
-
R
 
-
V
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
I
N
 
P
R
 
E
Q
 
H
P
 
P
I
 
M
Y
 
V
Y
 
F
K
 
T
C
 
K
N
 
S
R
 
P
F
 
V
A
 
T
V
 
V
I
 
T
G
 
G
A
 
H
D
 
G
D
 
D
H
 
I
F
 
V
E
 
K
-
 
S
W
 
H
P
 
E
S
 
E
F
 
V
S
 
T
K
 
S
A
 
Q
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
L
 
G
E
|
E
F
 
L
G
 
A
C
 
V
Y
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
S
G
 
G
K
 
T
D
 
R
I
 
I
S
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
D
A
 
A
R
 
Y
E
 
D
H
 
H
I
 
V
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
F
 
V
N
 
N
D
|
D
I
 
I
S
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
 
Q
S
 
K
K
 
R
E
 
H
M
 
K
G
 
Q
G
 
F
M
 
F
L
 
I
G
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
G
K
|
K
D
 
S
F
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
T
N
 
C
V
 
P
M
 
M
G
 
G
P
 
P
C
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
H
A
 
K
D
 
S
E
 
S
L
 
I
E
 
Q
D
 
E
P
 
P
Y
 
E
N
 
R
L
 
L
E
 
K
M
 
V
I
 
E
A
 
T
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
E
 
L
W
 
R
G
 
Q
R
 
S
G
 
G
N
 
S
T
 
A
R
 
S
D
 
D
M
 
M
R
 
I
W
 
F
K
 
S
F
 
I
E
 
P
D
 
E
V
 
L
I
 
I
T
 
E
H
 
T
V
 
L
S
 
S
Q
 
K
S
 
G
E
 
M
T
 
T
L
 
L
H
 
E
S
 
A
G
 
G
E
 
D
F
 
I
L
 
I
G
 
A
S
 
T
G
|
G
T
|
T
-
 
P
V
 
S
G
 
G
N
 
V
G
 
G
C
 
K
G
 
G
L
 
F
E
 
T
Q
 
P
L
 
P
R
 
K
Y
 
F
L
 
L
Q
 
R
R
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
K
V
 
I
E
 
D
L
 
I
E
 
T
V
 
I
E
 
D
K
 
P
L
 
I
G
 
G
I
 
T
L
 
L
R
 
S
T
 
N
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G

8sutA Crystal structure of yisk from bacillus subtilis in complex with reaction product 4-hydroxy-2-oxoglutaric acid (see paper)
30% identity, 95% coverage: 15:326/329 of query aligns to 15:302/303 of 8sutA

query
sites
8sutA
A
 
V
G
 
G
A
 
L
L
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
D
G
 
-
Q
 
E
A
 
K
V
 
I
L
 
M
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
Y
 
E
T
 
K
L
 
K
T
 
L
R
 
F
G
 
E
G
 
L
E
 
E
L
 
T
Q
 
I
A
 
P
L
 
G
S
 
S
S
 
L
V
 
I
L
 
E
A
 
C
L
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
G
G
 
D
K
 
K
P
 
F
E
 
V
Q
 
A
D
 
H
L
 
-
A
 
A
R
 
R
S
 
Q
L
 
L
V
 
A
E
 
E
-
 
W
-
 
A
K
 
K
A
 
K
P
 
P
F
 
N
D
 
D
A
 
E
V
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
M
T
 
Y
S
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
E
V
 
V
R
 
K
L
 
L
R
 
H
A
 
A
P
 
P
I
 
I
Q
 
P
P
 
K
P
 
P
P
 
S
Q
 
-
M
 
-
R
 
K
D
 
N
F
 
I
S
 
I
C
 
C
F
x
I
E
 
-
L
 
-
H
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
S
 
-
F
 
-
A
x
G
A
x
K
A
 
N
R
 
Y
R
 
R
A
 
D
R
x
H
A
 
A
L
 
I
R
 
E
T
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
-
M
 
M
N
 
G
T
 
S
S
 
E
A
 
A
D
 
D
D
 
-
R
 
-
V
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
I
N
 
P
R
 
E
Q
 
H
P
 
P
I
 
M
Y
 
V
Y
x
F
K
 
T
C
 
K
N
 
S
R
 
P
F
 
V
A
 
T
V
 
V
I
 
T
G
 
G
A
 
H
D
 
G
D
 
D
H
 
I
F
 
V
E
 
K
-
 
S
W
 
H
P
 
E
S
 
E
F
 
V
S
 
T
K
 
S
A
 
Q
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
L
 
G
E
|
E
F
 
L
G
 
A
C
 
V
Y
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
S
G
 
G
K
 
T
D
 
R
I
 
I
S
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
D
A
 
A
R
 
Y
E
 
D
H
 
H
I
 
V
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
F
 
V
N
 
N
D
|
D
I
 
I
S
 
T
A
 
A
R
|
R
D
 
D
M
 
L
Q
|
Q
S
 
K
K
 
R
E
 
H
M
 
K
G
 
Q
G
 
F
M
 
F
L
 
I
G
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
G
K
|
K
D
 
S
F
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
T
N
 
C
V
 
P
M
 
M
G
 
G
P
 
P
C
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
H
A
 
K
D
 
S
E
 
S
L
 
I
E
 
Q
D
 
E
P
 
P
Y
 
E
N
 
R
L
 
L
E
 
K
M
 
V
I
 
E
A
 
T
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
E
 
L
W
 
R
G
 
Q
R
 
S
G
 
G
N
 
S
T
 
A
R
 
S
D
 
D
M
 
M
R
 
I
W
 
F
K
 
S
F
 
I
E
 
P
D
 
E
V
 
L
I
 
I
T
 
E
H
 
T
V
 
L
S
 
S
Q
 
K
S
 
G
E
 
M
T
 
T
L
 
L
H
 
E
S
 
A
G
 
G
E
 
D
F
 
I
L
 
I
G
 
A
S
 
T
G
|
G
T
|
T
-
 
P
V
 
S
G
 
G
N
 
V
G
 
G
C
 
K
G
 
G
L
 
F
E
 
T
Q
 
P
L
 
P
R
 
K
Y
 
F
L
 
L
Q
 
R
R
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
K
V
 
I
E
 
D
L
 
I
E
 
T
V
 
I
E
 
D
K
 
P
L
 
I
G
 
G
I
 
T
L
 
L
R
 
S
T
 
N
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G

6iymA Fumarylacetoacetate hydrolase (eafah) from psychrophilic exiguobacterium antarcticum (see paper)
32% identity, 75% coverage: 78:325/329 of query aligns to 59:274/277 of 6iymA

query
sites
6iymA
V
 
V
R
 
R
L
 
L
R
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
Y
Q
 
L
P
 
P
P
 
P
P
 
-
Q
 
-
M
 
-
R
 
R
D
 
N
F
 
V
S
 
I
C
 
C
F
 
-
E
 
-
L
 
-
H
 
-
L
 
V
R
 
G
Q
 
K
S
 
N
F
 
Y
A
 
A
A
 
D
A
 
H
R
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
I
K
 
K
A
 
E
M
 
M
N
 
D
T
 
T
S
 
A
A
 
G
D
 
A
D
 
G
R
 
K
V
 
F
I
 
V
E
 
-
V
 
L
F
 
F
N
 
T
R
 
K
Q
 
A
P
 
P
I
 
-
Y
 
-
Y
 
-
K
 
-
C
 
-
N
 
-
R
 
-
F
 
S
A
 
S
V
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
P
D
 
F
D
 
D
H
 
P
F
 
I
E
 
E
-
 
R
W
 
H
P
 
A
S
 
D
F
 
L
S
 
T
K
 
Q
A
 
Q
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
L
 
G
E
|
E
F
 
L
G
 
A
C
 
I
Y
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
T
P
 
T
G
 
G
K
 
R
D
 
D
I
 
L
S
 
T
R
 
P
D
 
E
A
 
N
A
 
A
R
 
L
E
 
E
H
 
H
I
 
V
F
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
S
I
 
I
F
 
I
N
 
N
D
|
D
I
 
V
S
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
 
Q
S
 
K
K
 
E
E
 
H
M
 
V
G
 
Q
G
 
F
M
 
F
L
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
R
G
 
G
K
 
K
D
 
S
F
 
L
D
 
D
T
 
G
A
 
F
N
 
C
V
 
P
M
 
F
G
 
G
P
 
P
C
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
E
D
 
D
E
 
A
L
 
F
E
 
-
D
 
D
P
 
P
Y
 
A
N
 
D
L
 
V
E
 
L
M
 
V
I
 
E
A
 
T
R
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
E
 
L
W
 
R
G
 
Q
R
 
S
G
 
G
N
 
S
T
 
T
R
 
K
D
 
L
M
 
M
R
 
L
W
 
R
K
 
D
F
 
V
E
 
V
D
 
T
V
 
I
I
 
L
T
 
T
H
 
E
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
S
 
G
E
 
M
T
 
T
L
 
L
H
 
E
S
 
A
G
 
G
E
 
D
F
 
V
L
 
I
G
 
A
S
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
P
V
 
A
G
 
G
N
 
V
G
 
G
C
 
H
G
 
G
L
 
M
E
 
K
Q
 
P
L
 
P
R
 
V
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
R
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
I
E
 
D
L
 
V
E
 
S
V
 
I
E
 
E
K
 
G
L
 
I
G
 
G
I
 
H
L
 
L
R
 
Q
T
 
N
Q
 
Q
V
 
V

8gstC Crystal structure of l-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase from sphingomonas sp. (Pyruvate bound-form) (see paper)
36% identity, 62% coverage: 122:325/329 of query aligns to 73:278/290 of 8gstC

query
sites
8gstC
L
 
I
K
 
V
A
 
A
M
x
I
N
x
G
T
 
L
S
 
N
A
 
Y
D
 
E
D
 
D
R
x
H
V
 
A
I
 
I
E
 
E
V
 
S
-
 
N
-
 
L
-
 
P
F
 
I
N
 
P
R
 
T
Q
 
E
P
 
P
I
 
M
Y
 
M
Y
 
F
K
 
M
C
 
K
N
 
A
R
 
L
F
 
S
A
 
S
V
 
L
I
 
N
G
 
G
A
 
P
D
 
N
D
 
D
H
 
E
F
 
V
E
 
V
W
 
L
P
 
P
S
 
K
F
 
N
S
 
S
K
 
T
A
 
H
L
 
G
D
 
D
F
 
W
E
|
E
L
 
V
E
|
E
F
 
L
G
 
G
C
 
V
Y
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
E
P
 
T
G
 
C
K
 
R
D
 
F
I
 
V
S
 
S
R
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
A
R
 
L
E
 
S
H
 
K
I
 
V
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
I
 
L
F
 
V
N
 
N
D
|
D
I
 
V
S
 
S
A
 
E
R
 
R
D
 
-
M
 
F
Q
 
N
S
 
Q
K
 
K
E
 
Q
M
 
R
G
 
G
G
 
T
M
 
Q
L
 
W
G
 
-
P
 
-
A
 
S
K
 
K
G
 
G
K
|
K
D
 
G
F
 
H
D
 
D
T
 
T
A
 
F
N
 
C
V
 
P
M
 
V
G
 
G
P
 
P
C
 
W
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
P
D
 
D
E
 
E
L
 
V
E
 
G
D
 
D
P
 
P
Y
 
Q
N
 
D
L
 
L
E
 
D
M
 
V
I
 
H
A
 
L
R
 
D
V
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
E
 
R
W
 
M
G
 
Q
R
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
T
R
 
K
D
 
T
M
 
M
R
 
I
W
 
F
K
 
N
F
 
V
E
 
A
D
 
Q
V
 
L
I
 
I
T
 
S
H
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
E
S
 
Y
E
 
I
T
 
T
L
 
L
H
 
Y
S
 
P
G
 
G
E
 
D
F
 
L
L
 
M
G
 
I
S
 
T
G
|
G
T
 
T
-
 
P
-
 
P
-
 
G
V
 
V
G
 
G
N
 
E
G
 
G
C
 
K
G
 
K
L
 
-
E
 
P
Q
 
Q
L
 
A
R
 
I
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
M
E
 
E
L
 
L
E
 
G
V
 
I
E
 
E
K
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
T
L
 
Q
R
 
R
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
V

8gsrA Crystal structure of l-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase from sphingomonas sp. (Apo-form) (see paper)
36% identity, 62% coverage: 122:325/329 of query aligns to 73:278/290 of 8gsrA

query
sites
8gsrA
L
 
I
K
 
V
A
 
A
M
 
I
N
 
G
T
 
L
S
 
N
A
 
Y
D
 
E
D
 
D
R
 
H
V
 
A
I
 
I
E
 
E
V
 
S
-
 
N
-
 
L
-
 
P
F
 
I
N
 
P
R
 
T
Q
 
E
P
 
P
I
 
M
Y
 
M
Y
 
F
K
 
M
C
 
K
N
 
A
R
 
L
F
 
S
A
 
S
V
 
L
I
 
N
G
 
G
A
 
P
D
 
N
D
 
D
H
 
E
F
 
V
E
 
V
W
 
L
P
 
P
S
 
K
F
 
N
S
 
S
K
 
T
A
 
H
L
 
G
D
 
D
F
 
W
E
|
E
L
 
V
E
|
E
F
 
L
G
 
G
C
 
V
Y
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
E
P
 
T
G
 
C
K
 
R
D
 
F
I
 
V
S
 
S
R
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
A
R
 
L
E
 
S
H
 
K
I
 
V
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
I
 
L
F
 
V
N
 
N
D
|
D
I
 
V
S
 
S
A
 
E
R
 
R
D
 
-
M
 
F
Q
 
N
S
 
Q
K
 
K
E
 
Q
M
 
R
G
 
G
G
 
T
M
 
Q
L
 
W
G
 
-
P
 
-
A
 
S
K
 
K
G
 
G
K
 
K
D
 
G
F
 
H
D
 
D
T
 
T
A
 
F
N
 
C
V
 
P
M
 
V
G
 
G
P
 
P
C
 
W
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
P
D
 
D
E
 
E
L
 
V
E
 
G
D
 
D
P
 
P
Y
 
Q
N
 
D
L
 
L
E
 
D
M
 
V
I
 
H
A
 
L
R
 
D
V
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
E
 
R
W
 
M
G
 
Q
R
 
T
G
 
G
N
 
N
T
 
T
R
 
K
D
 
T
M
 
M
R
 
I
W
 
F
K
 
N
F
 
V
E
 
A
D
 
Q
V
 
L
I
 
I
T
 
S
H
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
E
S
 
Y
E
 
I
T
 
T
L
 
L
H
 
Y
S
 
P
G
 
G
E
 
D
F
 
L
L
 
M
G
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
P
-
 
P
-
 
G
V
 
V
G
 
G
N
 
E
G
 
G
C
 
K
G
 
K
L
 
-
E
 
P
Q
 
Q
L
 
A
R
 
I
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
M
E
 
E
L
 
L
E
 
G
V
 
I
E
 
E
K
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
T
L
 
Q
R
 
R
T
 
Q
Q
 
Q
V
 
V

3r6oA Crystal structure of a probable 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1, 7- dioateisomerase from mycobacterium abscessus (see paper)
37% identity, 65% coverage: 112:325/329 of query aligns to 54:260/265 of 3r6oA

query
sites
3r6oA
A
 
A
L
 
L
R
 
G
T
 
A
P
 
P
D
 
I
P
 
P
E
 
E
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
A
 
V
T
 
I
L
 
A
K
 
L
A
 
G
M
 
F
N
 
N
T
 
Y
S
 
P
A
 
T
D
 
H
D
 
D
R
 
P
V
 
V
I
 
-
E
 
-
V
 
V
F
 
F
N
 
M
R
 
K
Q
 
S
P
 
P
I
 
T
Y
 
S
Y
 
I
K
 
S
C
 
G
N
 
P
R
 
R
F
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
A
A
 
-
D
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
E
 
-
W
 
-
P
 
P
S
 
R
F
 
T
S
 
S
K
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
L
 
I
E
|
E
F
 
I
G
 
A
C
 
V
Y
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
P
G
 
G
K
 
Y
D
 
R
I
 
I
S
 
E
R
 
R
D
 
S
A
 
Q
A
 
A
R
 
I
E
 
K
H
 
H
I
 
V
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
M
I
 
L
F
 
A
N
 
N
D
|
D
I
 
I
S
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
V
Q
 
A
S
 
L
K
 
P
E
 
F
M
 
-
G
 
-
G
 
G
M
 
Q
L
 
A
G
 
Q
P
 
V
A
 
V
K
 
R
G
 
G
K
 
K
D
 
G
F
 
Y
D
 
P
T
 
T
A
 
F
N
 
C
V
 
P
M
 
T
G
 
G
P
 
P
C
 
W
L
 
L
V
 
F
T
 
T
-
 
T
-
 
G
A
 
S
D
 
D
E
 
T
L
 
T
E
 
F
D
 
E
P
 
T
Y
 
F
N
 
D
L
 
F
E
 
E
M
 
L
I
 
-
A
 
-
R
 
R
V
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
E
E
 
L
W
 
R
G
 
Q
R
 
S
G
 
G
N
 
S
T
 
T
R
 
V
D
 
D
M
 
M
R
 
T
W
 
L
K
 
G
F
 
F
E
 
A
D
 
E
V
 
V
I
 
V
T
 
E
H
 
T
V
 
V
S
 
S
Q
 
A
S
 
T
E
 
I
T
 
A
L
 
L
H
 
R
S
 
A
G
 
G
E
 
D
F
 
I
L
 
I
G
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
P
G
 
G
N
 
-
G
 
G
C
 
C
G
 
G
L
 
F
E
 
Q
-
 
F
-
 
D
Q
 
P
L
 
P
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
R
R
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
I
E
 
E
L
 
A
E
 
H
V
 
S
E
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
K
L
 
M
R
 
R
T
 
L
Q
 
P
V
 
V

6v77B Crystal structure of a putative hpce protein from mycobacterium smegmatis
28% identity, 74% coverage: 86:329/329 of query aligns to 31:279/279 of 6v77B

query
sites
6v77B
P
 
P
P
 
D
P
 
P
Q
 
Q
-
 
D
-
 
L
M
 
Y
R
 
Q
D
 
H
F
 
W
S
 
D
C
 
A
F
 
F
E
 
Q
L
 
E
H
 
W
L
 
A
R
 
R
Q
 
T
S
 
A
F
 
A
A
 
L
A
 
P
A
 
A
R
 
P
R
 
S
A
 
A
R
 
R
A
 
V
-
 
G
-
 
T
L
 
I
R
 
G
T
 
S
P
 
P
D
 
A
P
 
P
-
 
L
E
 
P
A
 
R
T
 
Q
L
 
V
K
 
F
A
 
A
M
 
V
N
 
G
T
 
L
S
 
N
A
 
Y
D
 
D
D
 
D
R
 
H
V
 
A
I
 
T
E
 
E
V
 
S
-
 
G
-
 
L
-
 
S
F
 
K
N
 
P
R
 
E
Q
 
H
P
 
P
I
 
V
Y
 
I
Y
 
F
K
 
T
C
 
K
N
 
F
R
 
V
F
 
S
A
 
S
V
 
I
I
 
T
G
 
G
A
 
P
D
 
V
D
 
E
H
 
T
F
 
V
E
 
Q
W
 
L
P
 
P
S
 
A
F
 
G
S
 
S
K
 
-
A
 
-
L
 
V
D
 
D
F
 
W
E
|
E
L
 
V
E
|
E
F
 
L
G
 
V
C
 
V
Y
 
V
I
 
M
G
 
G
K
 
R
P
 
G
G
 
G
K
 
R
D
 
N
I
 
I
S
 
P
R
 
E
D
 
D
A
 
R
A
 
A
R
 
W
E
 
E
H
 
F
I
 
V
F
 
A
G
 
G
Y
 
V
T
 
S
I
 
V
F
 
G
N
 
Q
D
|
D
I
 
L
S
 
S
A
 
E
R
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
 
Q
S
 
-
K
 
-
E
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
-
M
 
L
L
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
A
K
 
P
-
 
Q
-
 
F
-
 
S
-
 
L
G
 
A
K
 
K
D
 
S
F
 
H
D
 
A
T
 
G
A
 
F
N
 
S
V
 
P
M
 
I
G
 
G
P
 
P
C
 
E
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
P
D
 
D
P
 
P
Y
 
D
N
 
D
L
 
L
E
 
E
M
 
L
I
 
G
A
 
A
R
 
E
V
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
E
E
 
T
W
 
V
G
 
Q
R
 
H
G
 
S
N
 
R
T
 
T
R
 
S
D
 
Q
M
 
L
R
 
I
W
 
F
K
 
P
F
 
V
E
 
S
D
 
N
V
 
L
I
 
I
T
 
A
H
 
Y
V
 
L
S
 
S
Q
 
D
S
 
T
E
 
V
T
 
E
L
 
L
H
 
Y
S
 
P
G
 
G
E
 
D
F
 
V
L
 
I
G
 
F
S
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
P
V
 
S
G
 
G
N
 
V
G
 
G
C
 
M
G
 
G
L
 
R
E
 
N
Q
 
P
L
 
K
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
Q
 
A
R
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
V
 
L
E
 
R
L
 
T
E
 
Y
V
 
I
E
 
T
K
 
G
L
 
V
G
 
G
I
 
E
L
 
F
R
 
T
T
 
Q
Q
 
R
V
 
F
G
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D

3qdfA Crystal structure of 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase from mycobacterium marinum (see paper)
32% identity, 56% coverage: 141:325/329 of query aligns to 76:247/252 of 3qdfA

query
sites
3qdfA
P
 
P
I
 
V
Y
 
I
Y
 
F
K
 
L
C
 
K
N
 
P
R
 
N
F
 
T
A
 
A
V
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
P
D
 
N
D
 
V
H
 
P
F
 
I
E
 
R
W
 
L
P
 
P
S
 
A
F
 
N
S
 
A
K
 
S
A
 
P
L
 
V
D
 
H
F
 
F
E
|
E
L
 
G
E
|
E
F
 
L
G
 
A
C
 
I
Y
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
R
P
 
P
G
 
C
K
 
K
D
 
D
I
 
V
S
 
S
R
 
A
D
 
A
A
 
Q
A
 
A
R
 
V
E
 
D
H
 
N
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
F
 
G
N
 
N
D
|
D
I
 
V
S
 
S
A
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
Q
Q
 
Q
S
 
K
K
 
S
E
 
D
M
 
-
G
 
-
G
 
G
M
 
Q
L
 
W
G
 
T
P
 
R
A
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
H
D
 
-
F
 
-
D
 
D
T
 
T
A
 
F
N
 
C
V
 
P
M
 
V
G
 
G
P
 
P
C
 
W
L
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
D
D
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
V
D
 
D
P
 
P
Y
 
A
N
 
D
L
 
L
E
|
E
M
 
L
I
 
R
A
 
T
R
 
E
V
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
A
E
 
V
W
 
K
G
 
Q
R
x
H
G
 
A
N
 
R
T
 
T
R
 
S
D
 
L
M
 
M
R
 
I
W
 
H
K
 
D
F
 
V
E
 
G
D
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
E
H
 
W
V
 
I
S
 
S
Q
 
A
S
 
V
E
 
M
T
 
T
L
 
L
H
 
L
S
 
P
G
 
G
E
 
D
F
 
L
L
 
I
G
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
P
G
 
A
N
 
-
G
 
G
C
 
V
G
 
G
L
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
Y
 
P
L
 
I
Q
 
E
R
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
T
V
 
V
E
 
S
L
 
I
E
 
T
V
 
I
E
 
E
K
 
G
L
 
I
G
 
G
I
 
T
L
 
L
R
 
T
T
 
N
Q
 
P
V
 
V

4dbhA Crystal structure of cg1458 with inhibitor (see paper)
30% identity, 65% coverage: 113:325/329 of query aligns to 55:266/269 of 4dbhA

query
sites
4dbhA
L
 
L
R
 
L
T
 
A
P
 
P
D
 
M
P
 
L
E
 
P
A
 
S
T
 
K
L
 
V
K
 
V
A
 
A
M
 
I
N
x
G
T
x
R
S
 
N
A
 
Y
D
 
A
D
 
D
R
x
H
V
 
V
I
 
A
E
 
E
V
 
V
F
 
F
N
 
K
R
 
K
Q
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
L
-
 
P
P
 
P
I
 
T
Y
 
L
Y
x
F
K
 
L
C
 
K
N
 
P
R
 
P
F
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
T
G
 
G
A
 
P
D
 
E
D
 
S
H
 
P
F
 
I
E
 
R
W
 
I
P
 
P
S
 
S
F
 
F
S
 
A
K
 
T
A
 
K
L
 
V
D
 
E
F
 
F
E
|
E
L
 
G
E
|
E
F
 
L
G
 
A
C
 
V
Y
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
P
G
 
C
K
 
K
D
 
N
I
 
V
S
 
K
R
 
A
D
 
D
A
 
D
A
 
W
R
 
K
E
 
S
H
 
V
I
 
V
F
 
L
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
F
 
I
N
 
N
D
|
D
I
 
V
S
 
S
A
 
S
R
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
 
Q
S
 
F
K
 
A
E
 
D
M
 
-
G
 
-
G
 
G
M
 
Q
L
 
W
G
 
A
P
 
R
A
 
A
K
|
K
G
 
G
K
 
-
D
 
-
F
 
I
D
 
D
T
 
T
A
 
F
N
 
G
V
 
P
M
 
I
G
 
G
P
 
P
C
 
W
L
 
I
V
 
E
T
 
T
A
 
D
D
 
I
E
 
N
L
 
S
E
 
I
D
 
D
P
 
L
Y
 
D
N
 
N
L
 
L
E
 
P
M
 
I
I
 
K
A
 
A
R
 
R
V
 
L
-
 
T
-
 
H
N
 
D
G
 
G
E
 
E
E
 
T
W
 
Q
G
 
L
R
 
K
-
 
Q
-
 
D
G
 
S
N
 
N
T
 
S
R
 
N
D
 
Q
M
 
M
R
 
I
W
 
M
K
 
K
F
 
M
E
 
G
D
 
E
V
 
I
I
 
I
T
 
E
H
 
F
V
 
I
S
 
T
Q
 
A
S
 
S
E
 
M
T
 
T
L
 
L
H
 
L
S
 
P
G
 
G
E
 
D
F
 
V
L
 
I
G
 
A
S
 
T
G
 
G
T
x
S
V
 
-
G
 
-
N
 
-
G
 
P
C
 
A
G
 
G
L
 
T
E
 
E
Q
 
A
L
 
-
R
 
-
Y
 
-
L
 
M
Q
 
V
R
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
Y
V
 
I
E
 
E
L
 
I
E
 
E
V
 
I
E
 
P
K
 
G
L
 
I
G
 
G
I
 
K
L
 
L
R
 
G
T
 
N
Q
 
P
V
 
V

6j5xB Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from corynebacterium glutamicum in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
29% identity, 53% coverage: 150:324/329 of query aligns to 101:275/280 of 6j5xB

query
sites
6j5xB
A
 
A
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
P
D
 
F
D
 
D
H
 
D
F
 
V
E
 
V
W
 
V
P
 
P
S
 
E
F
 
W
S
 
A
-
 
N
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
W
E
|
E
L
 
G
E
|
E
F
 
M
G
 
A
C
 
V
Y
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
R
G
 
A
K
 
R
D
 
R
I
 
V
S
 
K
R
 
Q
D
 
A
A
 
D
A
 
A
R
 
A
E
 
E
H
 
Y
I
 
I
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
I
 
V
F
 
M
N
 
N
D
|
D
I
 
Y
S
 
T
A
 
T
R
 
R
D
 
D
M
 
F
Q
 
Q
S
 
Y
K
 
A
E
 
A
M
 
P
G
 
A
G
 
K
M
 
T
L
 
P
G
 
Q
P
x
W
A
 
H
K
 
Q
G
 
G
K
|
K
D
 
S
F
 
L
D
 
E
T
 
K
A
 
S
N
 
A
V
 
G
M
 
F
G
 
G
P
 
P
C
 
W
L
 
M
V
 
T
T
 
T
A
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
F
E
 
E
D
 
-
P
 
-
Y
 
F
N
 
G
L
 
G
E
 
E
M
 
L
I
 
A
A
 
T
R
 
Y
V
 
L
N
 
E
G
 
G
E
 
E
E
 
K
W
 
V
G
 
Q
R
 
S
G
 
T
N
 
P
T
 
T
R
 
N
D
 
D
M
 
L
R
 
V
W
 
F
K
 
S
F
 
P
E
 
E
D
 
K
V
 
L
I
 
I
T
 
E
H
 
Y
V
 
I
S
 
T
Q
 
H
S
 
I
E
 
Y
T
 
P
L
 
L
H
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
D
F
 
V
L
 
I
G
 
V
S
 
T
G
|
G
T
|
T
V
 
P
G
 
G
N
 
G
-
 
V
G
 
G
C
 
H
G
 
A
L
 
R
E
 
N
Q
 
P
L
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
L
 
I
Q
 
G
R
 
D
G
 
G
D
 
E
V
 
T
V
 
V
E
 
K
L
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
A
K
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
F
L
 
I
R
 
E
T
 
N
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

6j5xA Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from corynebacterium glutamicum in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
29% identity, 53% coverage: 150:324/329 of query aligns to 101:275/280 of 6j5xA

query
sites
6j5xA
A
 
A
V
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
P
D
 
F
D
 
D
H
 
D
F
 
V
E
 
V
W
 
V
P
 
P
S
 
E
F
 
W
S
 
A
-
 
N
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
W
E
|
E
L
 
G
E
|
E
F
 
M
G
 
A
C
 
V
Y
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
R
G
 
A
K
 
R
D
 
R
I
 
V
S
 
K
R
 
Q
D
 
A
A
 
D
A
 
A
R
 
A
E
 
E
H
 
Y
I
 
I
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
I
 
V
F
 
M
N
 
N
D
|
D
I
 
Y
S
 
T
A
 
T
R
 
R
D
 
D
M
 
F
Q
 
Q
S
 
Y
K
 
A
E
 
A
M
 
P
G
 
A
G
 
K
M
 
T
L
 
P
G
 
Q
P
 
W
A
 
H
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
D
 
S
F
 
L
D
 
E
T
 
K
A
 
S
N
 
A
V
 
G
M
 
F
G
 
G
P
 
P
C
 
W
L
 
M
V
 
T
T
 
T
A
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
F
E
 
E
D
 
-
P
 
-
Y
 
F
N
 
G
L
 
G
E
 
E
M
 
L
I
 
A
A
 
T
R
 
Y
V
 
L
N
 
E
G
 
G
E
 
E
E
 
K
W
 
V
G
 
Q
R
 
S
G
 
T
N
 
P
T
 
T
R
 
N
D
 
D
M
 
L
R
 
V
W
 
F
K
 
S
F
 
P
E
 
E
D
 
K
V
 
L
I
 
I
T
 
E
H
 
Y
V
 
I
S
 
T
Q
 
H
S
 
I
E
 
Y
T
 
P
L
 
L
H
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
D
F
 
V
L
 
I
G
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
P
G
 
G
N
 
G
-
 
V
G
 
G
C
 
H
G
 
A
L
 
R
E
 
N
Q
 
P
L
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
L
 
I
Q
 
G
R
 
D
G
 
G
D
 
E
V
 
T
V
 
V
E
 
K
L
 
V
E
 
E
V
 
I
E
 
A
K
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
F
L
 
I
R
 
E
T
 
N
Q
 
K

6sbiA X-ray structure of murine fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (fahd1) in complex with inhibitor oxalate (see paper)
31% identity, 40% coverage: 161:292/329 of query aligns to 56:186/216 of 6sbiA

query
sites
6sbiA
P
 
P
S
 
A
F
 
Y
S
 
C
K
 
R
A
 
N
L
 
L
D
 
H
F
 
H
E
|
E
L
 
V
E
|
E
F
 
L
G
 
G
C
 
V
Y
 
L
I
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
R
G
 
G
K
 
E
D
 
A
I
 
I
S
 
P
R
 
E
D
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
M
E
 
D
H
 
Y
I
 
V
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
I
 
L
F
 
C
N
 
L
D
|
D
I
 
M
S
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
V
Q
 
Q
S
 
E
K
 
E
E
 
C
M
 
K
G
 
K
G
 
K
M
 
G
L
 
L
G
 
P
P
 
W
A
 
T
K
 
L
G
 
A
K
|
K
D
 
S
F
 
F
D
 
-
T
 
T
A
 
S
N
 
S
V
 
C
M
 
P
G
 
V
P
 
S
C
 
A
L
 
F
V
 
V
T
 
P
A
 
K
D
 
E
E
 
K
L
 
I
E
 
P
D
 
D
P
 
P
Y
 
H
N
 
A
L
 
L
E
 
R
M
 
L
I
 
W
A
 
L
R
 
K
V
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
E
 
L
W
 
R
G
 
Q
R
 
E
G
 
G
N
 
K
T
 
T
R
 
S
D
 
S
M
 
M
R
 
I
W
 
F
K
 
S
F
 
I
E
 
P
D
 
Y
V
 
I
I
 
I
T
 
S
H
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
K
S
 
I
E
 
I
T
|
T
L
 
L
H
 
E
S
 
E
G
 
G
E
 
D
F
 
L
L
 
I
G
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

6fogA X-ray structure of homo sapiens fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (fahd1) in complex with inhibitor oxalate at 1.94a resolution. (see paper)
31% identity, 40% coverage: 161:292/329 of query aligns to 57:187/218 of 6fogA

query
sites
6fogA
P
 
P
S
 
A
F
 
Y
S
 
T
K
 
R
A
 
N
L
 
L
D
 
H
F
 
H
E
|
E
L
 
L
E
|
E
F
 
L
G
 
G
C
 
V
Y
 
V
I
 
M
G
 
G
K
 
K
P
 
R
G
 
C
K
 
R
D
 
A
I
 
V
S
 
P
R
 
E
D
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
M
E
 
D
H
 
Y
I
 
V
F
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
I
 
L
F
 
C
N
 
L
D
|
D
I
 
M
S
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
V
Q
 
Q
S
 
D
K
 
E
E
 
C
M
 
K
G
 
K
G
 
K
M
 
G
L
 
L
G
 
P
P
 
W
A
 
T
K
 
L
G
 
A
K
 
K
D
 
S
F
 
F
D
 
-
T
 
T
A
 
A
N
 
S
V
 
C
M
 
P
G
 
V
P
 
S
C
 
A
L
 
F
V
 
V
T
 
P
A
 
K
D
 
E
E
 
K
L
 
I
E
 
P
D
 
D
P
 
P
Y
 
H
N
 
K
L
 
L
E
 
K
M
 
L
I
 
W
A
 
L
R
 
K
V
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
E
 
L
W
 
R
G
 
Q
R
 
E
G
 
G
N
 
E
T
 
T
R
 
S
D
 
S
M
 
M
R
 
I
W
 
F
K
 
S
F
 
I
E
 
P
D
 
Y
V
 
I
I
 
I
T
 
S
H
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
K
S
 
I
E
 
I
T
 
T
L
 
L
H
 
E
S
 
E
G
 
G
E
 
D
F
 
I
L
 
I
G
 
L
S
 
T
G
 
G
T
|
T

Sites not aligning to the query:

Q6P587 Acylpyruvase FAHD1, mitochondrial; Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 1; FAH domain-containing protein 1; Oxaloacetate decarboxylase; OAA decarboxylase; YisK-like protein; EC 3.7.1.5; EC 4.1.1.112 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
31% identity, 40% coverage: 161:292/329 of query aligns to 62:192/224 of Q6P587

query
sites
Q6P587
P
 
P
S
 
A
F
 
Y
S
 
T
K
 
R
A
 
N
L
 
L
D
 
H
F
 
H
E
|
E
L
 
L
E
|
E
F
 
L
G
 
G
C
 
V
Y
 
V
I
 
M
G
 
G
K
 
K
P
 
R
G
 
C
K
 
R
D
 
A
I
 
V
S
 
P
R
 
E
D
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
M
E
 
D
H
 
Y
I
 
V
F
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
I
 
L
F
 
C
N
 
L
D
|
D
I
 
M
S
 
T
A
 
A
R
|
R
D
 
D
M
 
V
Q
 
Q
S
 
D
K
 
E
E
 
C
M
 
K
G
 
K
G
 
K
M
 
G
L
 
L
G
 
P
P
 
W
A
 
T
K
 
L
G
 
A
K
 
K
D
 
S
F
 
F
D
 
-
T
 
T
A
 
A
N
 
S
V
 
C
M
 
P
G
 
V
P
 
S
C
 
A
L
 
F
V
 
V
T
 
P
A
 
K
D
 
E
E
 
K
L
 
I
E
 
P
D
 
D
P
 
P
Y
 
H
N
 
K
L
 
L
E
 
K
M
 
L
I
 
W
A
 
L
R
 
K
V
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
E
 
L
W
 
R
G
 
Q
R
 
E
G
 
G
N
 
E
T
 
T
R
 
S
D
 
S
M
 
M
R
 
I
W
 
F
K
 
S
F
 
I
E
 
P
D
 
Y
V
 
I
I
 
I
T
 
S
H
 
Y
V
 
V
S
 
S
Q
 
K
S
 
I
E
 
I
T
 
T
L
 
L
H
 
E
S
 
E
G
 
G
E
 
D
F
 
I
L
 
I
G
 
L
S
 
T
G
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

6j5yA Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from pseudomonas aeruginosa in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
27% identity, 57% coverage: 138:325/329 of query aligns to 45:230/233 of 6j5yA

query
sites
6j5yA
N
 
E
R
 
R
Q
 
E
P
 
P
I
 
P
Y
 
F
Y
 
F
K
x
F
C
 
C
N
 
K
R
 
P
F
 
A
A
 
D
V
 
A
I
 
V
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
A
G
 
G
A
 
S
D
 
T
D
 
L
H
 
E
F
 
L
E
 
A
W
 
Y
P
 
P
S
 
S
F
 
Q
S
 
T
K
 
G
A
 
N
L
 
Y
D
 
H
F
 
Y
E
|
E
L
 
I
E
|
E
F
 
L
G
 
V
C
 
A
Y
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
G
G
 
G
K
 
C
D
 
D
I
 
I
S
 
P
R
 
L
D
 
E
A
 
Q
A
 
A
R
 
E
E
 
E
H
 
H
I
 
V
F
 
W
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
I
 
V
F
 
G
N
 
L
D
|
D
I
 
M
S
 
T
A
 
R
R
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
 
Q
S
 
M
K
 
R
E
 
-
M
 
M
G
 
R
G
 
E
M
 
M
L
 
G
G
 
R
P
 
P
A
 
W
K
 
E
-
 
I
G
 
G
K
|
K
D
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
R
A
 
S
N
 
A
V
 
P
M
 
I
G
 
G
P
 
P
C
 
-
L
 
L
V
 
Y
T
 
P
A
 
A
D
 
S
E
 
Q
L
 
V
E
 
G
D
 
H
P
 
P
Y
 
R
N
 
H
L
 
A
E
 
A
M
 
I
I
 
S
A
 
L
R
 
Q
V
 
V
N
 
D
G
 
G
E
 
E
E
 
D
W
 
R
G
 
Q
R
 
R
G
 
S
N
 
D
T
 
I
R
 
D
D
 
Q
M
 
L
R
 
I
W
 
W
K
 
S
F
 
V
E
 
A
D
 
E
V
 
T
I
 
V
T
 
S
H
 
Y
V
 
L
S
 
S
Q
 
R
S
 
F
E
 
F
T
 
E
L
 
L
H
 
R
S
 
P
G
 
G
E
 
D
F
 
L
L
 
V
G
 
F
S
 
T
G
 
G
T
|
T
V
 
P
G
 
-
N
 
-
G
 
-
C
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
E
Q
 
G
L
 
V
R
 
G
Y
 
A
L
 
V
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
D
 
E
V
 
R
V
 
M
E
 
L
L
 
G
E
 
A
V
 
I
E
 
D
K
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
E
L
 
L
R
 
S
T
 
V
Q
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3bqbX Hexagonal kristal form of 2-keto-3-deoxyarabinonate dehydratase (see paper)
25% identity, 75% coverage: 78:325/329 of query aligns to 65:286/291 of 3bqbX

query
sites
3bqbX
V
 
I
R
 
R
L
 
I
R
 
T
A
 
K
P
 
P
I
 
I
Q
 
D
P
 
P
P
 
P
P
 
E
Q
 
V
M
 
W
R
 
G
D
 
S
F
 
G
S
 
I
C
 
S
F
 
Y
E
 
E
L
 
M
H
 
A
L
 
-
R
 
R
Q
 
E
S
 
R
F
 
Y
A
 
S
A
 
E
A
 
E
R
 
N
R
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
I
L
 
L
R
 
G
T
 
K
P
 
T
D
 
I
P
 
Y
E
 
E
A
 
K
T
 
V
L
 
Y
K
 
D
A
 
A
M
 
V
N
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
R
 
R
Q
 
P
P
 
E
I
 
I
Y
 
F
Y
 
F
K
 
K
C
 
A
N
 
T
R
 
P
F
 
N
A
 
R
V
 
C
I
 
V
G
 
G
A
 
H
D
 
G
D
 
E
H
 
A
F
 
I
E
 
A
W
 
V
P
 
R
S
 
S
F
 
D
S
 
S
K
 
E
A
 
W
L
 
T
D
 
L
F
 
P
E
 
E
L
 
P
E
|
E
F
 
L
G
 
A
C
 
V
Y
 
V
I
 
L
G
 
D
K
 
S
P
 
N
G
 
G
K
 
K
D
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
H
 
-
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
F
 
M
N
 
D
D
|
D
I
 
V
S
 
S
A
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
 
E
S
 
A
K
 
E
E
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
N
M
 
P
L
 
L
G
 
Y
P
 
L
A
 
P
K
 
Q
G
 
S
K
 
K
D
 
I
F
 
Y
D
 
A
T
 
G
A
 
C
N
 
C
V
 
A
M
 
F
G
 
G
P
 
P
C
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
I
E
 
K
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
N
 
S
L
 
L
E
 
D
M
 
I
I
 
T
A
 
L
R
 
K
V
 
I
N
 
V
G
 
R
E
 
E
E
 
G
W
 
R
-
 
V
-
 
F
-
 
F
-
 
E
G
 
G
R
 
S
G
 
V
N
 
N
T
 
T
R
 
N
D
 
K
M
 
M
R
 
R
W
 
R
K
 
K
F
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
Q
I
 
I
T
 
Q
H
 
Y
V
 
L
S
 
I
Q
 
R
S
 
D
E
 
N
T
 
P
L
 
I
H
 
P
S
 
D
G
 
G
E
 
T
F
 
I
L
 
L
G
 
T
S
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
P
G
 
G
N
 
R
G
 
D
C
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
K
Q
 
D
L
 
-
R
 
-
Y
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
G
 
E
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
I
E
 
T
V
 
I
E
 
S
K
 
N
L
 
I
G
 
G
I
 
T
L
 
L
R
 
I
T
 
T
Q
 
P
V
 
V

2q1cX 2-keto-3-deoxy-d-arabinonate dehydratase complexed with calcium and 2- oxobutyrate (see paper)
25% identity, 75% coverage: 78:325/329 of query aligns to 65:286/291 of 2q1cX

query
sites
2q1cX
V
 
I
R
 
R
L
 
I
R
 
T
A
 
K
P
 
P
I
 
I
Q
 
D
P
 
P
P
 
P
P
 
E
Q
 
V
M
 
W
R
 
G
D
 
S
F
x
G
S
x
I
C
 
S
F
 
Y
E
 
E
L
 
M
H
 
A
L
 
-
R
 
R
Q
 
E
S
x
R
F
 
Y
A
 
S
A
 
E
A
 
E
R
 
N
R
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
I
L
 
L
R
 
G
T
 
K
P
 
T
D
 
I
P
 
Y
E
 
E
A
 
K
T
 
V
L
 
Y
K
 
D
A
 
A
M
 
V
N
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
R
 
R
Q
 
P
P
 
E
I
 
I
Y
 
F
Y
 
F
K
 
K
C
 
A
N
 
T
R
 
P
F
 
N
A
 
R
V
 
C
I
 
V
G
 
G
A
 
H
D
 
G
D
 
E
H
 
A
F
 
I
E
 
A
W
 
V
P
 
R
S
 
S
F
 
D
S
 
S
K
 
E
A
 
W
L
 
T
D
 
L
F
 
P
E
|
E
L
 
P
E
|
E
F
 
L
G
 
A
C
 
V
Y
 
V
I
 
L
G
 
D
K
 
S
P
 
N
G
 
G
K
 
K
D
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
H
 
-
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
F
 
M
N
 
D
D
|
D
I
 
V
S
 
S
A
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
 
E
S
 
A
K
 
E
E
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
N
M
 
P
L
 
L
G
 
Y
P
 
L
A
 
P
K
 
Q
G
 
S
K
 
K
D
 
I
F
 
Y
D
 
A
T
 
G
A
 
C
N
 
C
V
 
A
M
 
F
G
 
G
P
 
P
C
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
I
E
 
K
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
N
 
S
L
 
L
E
 
D
M
 
I
I
 
T
A
 
L
R
 
K
V
 
I
N
 
V
G
 
R
E
 
E
E
 
G
W
 
R
-
 
V
-
 
F
-
 
F
-
 
E
G
 
G
R
 
S
G
 
V
N
 
N
T
 
T
R
 
N
D
 
K
M
 
M
R
 
R
W
 
R
K
 
K
F
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
Q
I
 
I
T
 
Q
H
 
Y
V
 
L
S
 
I
Q
 
R
S
 
D
E
 
N
T
 
P
L
 
I
H
 
P
S
 
D
G
 
G
E
 
T
F
 
I
L
 
L
G
 
T
S
 
T
G
 
G
T
|
T
V
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
P
G
 
G
N
 
R
G
 
D
C
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
K
Q
 
D
L
 
-
R
 
-
Y
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
G
 
E
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
I
E
 
T
V
 
I
E
 
S
K
 
N
L
 
I
G
 
G
I
 
T
L
 
L
R
 
I
T
 
T
Q
 
P
V
 
V

2q1aX 2-keto-3-deoxy-d-arabinonate dehydratase complexed with magnesium and 2-oxobutyrate (see paper)
25% identity, 75% coverage: 78:325/329 of query aligns to 65:286/291 of 2q1aX

query
sites
2q1aX
V
 
I
R
 
R
L
 
I
R
 
T
A
 
K
P
 
P
I
 
I
Q
 
D
P
 
P
P
 
P
P
 
E
Q
 
V
M
 
W
R
 
G
D
 
S
F
x
G
S
x
I
C
 
S
F
 
Y
E
 
E
L
 
M
H
 
A
L
 
-
R
 
R
Q
 
E
S
x
R
F
 
Y
A
 
S
A
 
E
A
 
E
R
 
N
R
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
I
L
 
L
R
 
G
T
 
K
P
 
T
D
 
I
P
 
Y
E
 
E
A
 
K
T
 
V
L
 
Y
K
 
D
A
 
A
M
 
V
N
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
R
 
R
Q
 
P
P
 
E
I
 
I
Y
 
F
Y
 
F
K
 
K
C
 
A
N
 
T
R
 
P
F
 
N
A
 
R
V
 
C
I
 
V
G
 
G
A
 
H
D
 
G
D
 
E
H
 
A
F
 
I
E
 
A
W
 
V
P
 
R
S
 
S
F
 
D
S
 
S
K
 
E
A
 
W
L
 
T
D
 
L
F
 
P
E
|
E
L
 
P
E
|
E
F
 
L
G
 
A
C
 
V
Y
 
V
I
 
L
G
 
D
K
 
S
P
 
N
G
 
G
K
 
K
D
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
H
 
-
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
F
 
M
N
 
D
D
|
D
I
 
V
S
 
S
A
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
 
E
S
 
A
K
 
E
E
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
N
M
 
P
L
 
L
G
 
Y
P
 
L
A
 
P
K
 
Q
G
 
S
K
 
K
D
 
I
F
 
Y
D
 
A
T
 
G
A
 
C
N
 
C
V
 
A
M
 
F
G
 
G
P
 
P
C
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
I
E
 
K
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
N
 
S
L
 
L
E
 
D
M
 
I
I
 
T
A
 
L
R
 
K
V
 
I
N
 
V
G
 
R
E
 
E
E
 
G
W
 
R
-
 
V
-
 
F
-
 
F
-
 
E
G
 
G
R
 
S
G
 
V
N
 
N
T
 
T
R
 
N
D
 
K
M
 
M
R
 
R
W
 
R
K
 
K
F
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
Q
I
 
I
T
 
Q
H
 
Y
V
 
L
S
 
I
Q
 
R
S
 
D
E
 
N
T
 
P
L
 
I
H
 
P
S
 
D
G
 
G
E
 
T
F
 
I
L
 
L
G
 
T
S
 
T
G
|
G
T
|
T
V
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
P
G
 
G
N
 
R
G
 
D
C
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
K
Q
 
D
L
 
-
R
 
-
Y
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
G
 
E
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
I
E
 
T
V
 
I
E
 
S
K
 
N
L
 
I
G
 
G
I
 
T
L
 
L
R
 
I
T
 
T
Q
 
P
V
 
V

Q97UA0 2-dehydro-3-deoxy-D-arabinonate dehydratase; 2-keto-3-deoxy-D-arabinonate dehydratase; KdaD; EC 4.2.1.141 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
25% identity, 75% coverage: 78:325/329 of query aligns to 70:291/298 of Q97UA0

query
sites
Q97UA0
V
 
I
R
 
R
L
 
I
R
 
T
A
 
K
P
 
P
I
 
I
Q
 
D
P
 
P
P
 
P
P
 
E
Q
 
V
M
 
W
R
 
G
D
 
S
F
 
G
S
x
I
C
 
S
F
 
Y
E
 
E
L
 
M
H
 
A
L
 
-
R
 
R
Q
 
E
S
 
R
F
 
Y
A
 
S
A
 
E
A
 
E
R
 
N
R
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
I
L
 
L
R
 
G
T
 
K
P
 
T
D
 
I
P
 
Y
E
 
E
A
 
K
T
 
V
L
 
Y
K
 
D
A
 
A
M
 
V
N
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
R
 
R
Q
 
P
P
 
E
I
 
I
Y
 
F
Y
 
F
K
 
K
C
 
A
N
 
T
R
 
P
F
 
N
A
 
R
V
 
C
I
 
V
G
 
G
A
 
H
D
 
G
D
 
E
H
 
A
F
 
I
E
 
A
W
 
V
P
 
R
S
 
S
F
 
D
S
 
S
K
 
E
A
 
W
L
 
T
D
 
L
F
 
P
E
|
E
L
 
P
E
|
E
F
 
L
G
 
A
C
 
V
Y
 
V
I
 
L
G
 
D
K
 
S
P
 
N
G
 
G
K
 
K
D
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
H
 
-
I
 
I
F
 
L
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
F
 
M
N
 
D
D
|
D
I
 
V
S
 
S
A
 
A
R
 
R
D
 
D
M
 
L
Q
 
E
S
 
A
K
 
E
E
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
N
M
 
P
L
 
L
G
 
Y
P
 
L
A
 
P
K
 
Q
G
 
S
K
|
K
D
 
I
F
 
Y
D
 
A
T
 
G
A
 
C
N
 
C
V
 
A
M
 
F
G
 
G
P
 
P
C
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
I
E
 
K
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
N
 
S
L
 
L
E
 
D
M
 
I
I
 
T
A
 
L
R
 
K
V
 
I
N
 
V
G
 
R
E
 
E
E
 
G
W
 
R
-
 
V
-
 
F
-
 
F
-
 
E
G
 
G
R
 
S
G
 
V
N
 
N
T
 
T
R
 
N
D
 
K
M
 
M
R
 
R
W
 
R
K
 
K
F
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
Q
I
 
I
T
 
Q
H
 
Y
V
 
L
S
 
I
Q
 
R
S
 
D
E
 
N
T
 
P
L
 
I
H
 
P
S
 
D
G
 
G
E
 
T
F
 
I
L
 
L
G
 
T
S
 
T
G
 
G
T
|
T
V
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
P
G
 
G
N
 
R
G
 
D
C
 
K
G
 
G
L
 
L
E
 
K
Q
 
D
L
 
-
R
 
-
Y
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
G
 
E
D
 
D
V
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
I
E
 
T
V
 
I
E
 
S
K
 
N
L
 
I
G
 
G
I
 
T
L
 
L
R
 
I
T
 
T
Q
 
P
V
 
V

1gttA Crystal structure of hpce (see paper)
26% identity, 60% coverage: 97:292/329 of query aligns to 208:387/421 of 1gttA

query
sites
1gttA
E
 
E
L
 
V
H
 
T
L
 
T
R
 
R
Q
 
K
S
 
S
F
 
F
A
 
P
A
 
T
A
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
L
P
 
P
D
 
H
P
 
P
E
 
H
A
 
G
T
 
T
L
 
L
K
 
F
A
 
A
M
 
L
N
 
G
T
 
L
S
 
N
A
 
Y
D
 
A
D
 
D
R
 
H
V
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
P
R
 
E
Q
 
E
P
 
P
I
 
L
Y
 
V
Y
 
F
K
 
L
C
 
K
N
 
A
R
 
P
F
 
N
A
 
T
V
 
L
I
 
T
G
 
G
A
 
D
D
 
N
D
 
Q
H
 
T
F
 
S
E
 
V
W
 
R
P
 
P
S
 
N
F
 
N
S
 
I
K
 
E
A
 
Y
L
 
M
D
 
H
F
 
Y
E
|
E
L
 
A
E
|
E
F
 
L
G
 
V
C
 
V
Y
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
Q
G
 
A
K
 
R
D
 
N
I
 
V
S
 
S
R
 
E
D
 
A
A
 
D
A
 
A
R
 
M
E
 
D
H
 
Y
I
 
V
F
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
I
 
V
F
 
C
N
 
N
D
|
D
I
 
Y
S
 
A
A
 
I
R
 
R
D
 
D
M
 
Y
Q
 
L
S
 
E
K
 
N
E
 
Y
M
 
Y
G
 
R
G
 
P
M
 
N
L
 
L
G
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
R
G
 
V
K
 
K
D
 
S
F
 
R
D
 
D
T
 
G
A
 
L
N
 
T
V
 
P
M
 
M
G
 
L
P
 
S
C
 
T
L
 
I
V
 
V
T
 
P
A
 
K
D
 
E
E
 
A
L
 
I
E
 
P
D
 
D
P
 
P
Y
 
H
N
 
N
L
 
L
E
 
T
M
 
L
I
 
R
A
 
T
R
 
F
V
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
E
 
L
W
 
R
G
 
Q
R
 
Q
G
 
G
N
 
T
T
 
T
R
 
A
D
 
D
M
 
L
R
 
I
W
 
F
K
 
S
F
 
V
E
 
P
D
 
F
V
 
L
I
 
I
T
 
A
H
 
Y
V
 
L
S
 
S
Q
 
E
S
 
F
E
 
M
T
 
T
L
 
L
H
 
N
S
 
P
G
 
G
E
 
D
F
 
M
L
 
I
G
 
A
S
 
T
G
 
G
T
 
T

Query Sequence

>GFF38 FitnessBrowser__Marino:GFF38
MRLVTFVGESGIEKAGALIDGGQAVLDLQRAYTLTRGGELQALSSVLALAEAGKPEQDLA
RSLVEKAPFDAVTSRSVVRLRAPIQPPPQMRDFSCFELHLRQSFAAARRARALRTPDPEA
TLKAMNTSADDRVIEVFNRQPIYYKCNRFAVIGADDHFEWPSFSKALDFELEFGCYIGKP
GKDISRDAAREHIFGYTIFNDISARDMQSKEMGGMLGPAKGKDFDTANVMGPCLVTADEL
EDPYNLEMIARVNGEEWGRGNTRDMRWKFEDVITHVSQSETLHSGEFLGSGTVGNGCGLE
QLRYLQRGDVVELEVEKLGILRTQVGTAD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory