SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF3914 FitnessBrowser__Phaeo:GFF3914 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5bjuA X-ray structure of the pglf dehydratase from campylobacter jejuni in complex with udp and NAD(h) (see paper)
44% identity, 51% coverage: 251:566/615 of query aligns to 3:303/340 of 5bjuA

query
sites
5bjuA
Q
 
E
N
 
D
F
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
K
T
 
P
R
 
K
D
 
D
V
 
L
P
 
D
L
 
D
Q
 
S
E
 
A
A
 
V
S
 
A
G
 
A
S
 
F
Y
 
L
Q
 
K
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
|
G
S
x
T
I
|
I
G
 
G
S
 
S
E
 
E
L
 
L
C
 
C
R
 
K
Q
 
Q
V
 
C
L
 
I
A
 
K
C
 
F
R
 
G
P
 
A
R
 
K
K
 
H
L
 
L
V
 
I
L
 
M
Y
 
V
E
x
D
L
x
H
S
 
S
E
 
E
L
 
Y
A
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
K
I
 
I
H
 
N
Q
 
D
E
 
D
L
 
L
E
 
N
Q
 
L
Q
 
Y
V
 
K
E
 
E
G
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
K
L
 
I
V
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
L
S
|
S
V
x
I
T
 
L
D
 
D
P
 
K
R
 
Q
Q
 
S
V
 
L
R
 
D
M
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
K
H
 
T
H
 
Y
G
 
K
V
 
P
Q
 
E
V
 
L
V
 
I
L
 
L
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
Y
 
Y
K
|
K
H
 
H
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
C
E
 
E
A
 
Q
N
 
N
P
 
P
L
 
H
P
 
S
G
 
A
L
 
V
A
 
I
N
|
N
N
 
N
V
 
I
F
 
L
G
 
G
T
 
T
Q
 
K
T
 
I
L
 
L
A
 
C
R
 
D
A
 
S
A
 
A
A
 
K
R
 
E
S
 
N
G
 
K
V
 
V
E
 
A
R
 
K
F
 
F
I
 
V
L
 
M
I
|
I
S
 
S
S
 
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
V
 
V
R
 
R
P
 
P
T
 
T
N
 
N
V
 
I
M
 
M
G
 
G
A
 
C
S
 
T
K
|
K
R
 
R
M
 
V
A
 
C
E
 
E
L
 
L
V
 
Y
V
 
T
Q
 
L
D
 
S
L
 
M
S
 
S
T
 
D
R
 
E
N
 
N
P
 
F
G
 
E
T
 
V
V
 
-
F
 
-
T
 
A
M
 
C
V
 
V
R
 
R
F
|
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
L
 
L
G
 
G
S
|
S
S
|
S
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
I
P
 
P
L
 
K
F
 
F
Q
 
K
E
 
A
Q
 
Q
I
 
I
S
 
A
R
 
N
G
 
N
G
 
E
P
 
P
V
 
L
T
|
T
V
x
L
T
|
T
D
 
H
P
 
P
R
 
D
V
x
I
K
 
V
R
|
R
Y
 
Y
F
 
F
M
 
M
T
 
L
I
 
V
R
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
I
A
 
A
L
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
L
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
E
 
K
P
 
P
I
 
V
S
 
K
I
 
I
L
 
I
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
V
 
M
I
 
L
E
 
L
S
 
L
A
 
S
G
 
N
Y
 
R
S
 
N
V
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
D
I
 
L
A
 
E
I
 
I
D
 
K
I
 
I
I
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
R
P
 
K
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
L
Q
 
Y
E
 
E
E
 
E
L
 
L
T
 
L
L
 
I
S
 
D
S
 
E
D
 
N
L
 
D
I
 
A
T
 
K
T
 
T
R
 
Q
H
 
Y
Q
 
E
K
 
S
I
 
I
F
 
F
C
 
V
A
 
A
R
 
K

5bjvA X-ray structure of the pglf udp-n-acetylglucosamine 4,6-dehydratase from campylobacterjejuni, d396n/k397a variant in complex with udp-n- acrtylglucosamine (see paper)
44% identity, 51% coverage: 251:566/615 of query aligns to 3:303/339 of 5bjvA

query
sites
5bjvA
Q
 
E
N
 
D
F
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
K
T
 
P
R
 
K
D
 
D
V
 
L
P
 
D
L
 
D
Q
 
S
E
 
A
A
 
V
S
 
A
G
 
A
S
 
F
Y
 
L
Q
 
K
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
|
G
S
x
T
I
|
I
G
 
G
S
 
S
E
 
E
L
 
L
C
 
C
R
 
K
Q
 
Q
V
 
C
L
 
I
A
 
K
C
 
F
R
 
G
P
 
A
R
 
K
K
 
H
L
 
L
V
 
I
L
 
M
Y
 
V
E
x
D
L
x
H
S
 
S
E
 
E
L
 
Y
A
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
K
I
 
I
H
 
N
Q
 
D
E
 
D
L
 
L
E
 
N
Q
 
L
Q
 
Y
V
 
K
E
 
E
G
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
K
L
 
I
V
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
L
S
|
S
V
x
I
T
 
L
D
 
D
P
 
K
R
 
Q
Q
 
S
V
 
L
R
 
D
M
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
K
H
 
T
H
 
Y
G
 
K
V
 
P
Q
 
E
V
 
L
V
 
I
L
 
L
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
Y
 
Y
K
|
K
H
|
H
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
C
E
 
E
A
 
Q
N
 
N
P
 
P
L
 
H
P
 
S
G
 
A
L
 
V
A
 
I
N
|
N
N
 
N
V
 
I
F
 
L
G
 
G
T
 
T
Q
 
K
T
 
I
L
 
L
A
 
C
R
 
D
A
 
S
A
 
A
A
 
K
R
 
E
S
 
N
G
 
K
V
 
V
E
 
A
R
 
K
F
 
F
I
 
V
L
 
M
I
|
I
S
 
S
S
x
T
D
 
N
K
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
R
P
 
P
T
 
T
N
 
N
V
 
I
M
 
M
G
 
G
A
 
C
S
 
T
K
|
K
R
 
R
M
 
V
A
 
C
E
 
E
L
 
L
V
 
Y
V
 
T
Q
 
L
D
 
S
L
 
M
S
 
S
T
 
D
R
 
E
N
 
N
P
 
F
G
 
E
T
 
V
V
 
-
F
 
-
T
 
A
M
 
C
V
 
V
R
 
R
F
|
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
L
 
L
G
 
G
S
|
S
S
|
S
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
I
P
 
P
L
 
K
F
 
F
Q
 
K
E
 
A
Q
 
Q
I
 
I
S
 
A
R
 
N
G
 
N
G
 
E
P
 
P
V
 
L
T
|
T
V
x
L
T
|
T
D
 
H
P
 
P
R
 
D
V
x
I
K
 
V
R
|
R
Y
 
Y
F
 
F
M
 
M
T
 
L
I
 
V
R
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
I
A
 
A
L
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
L
F
 
F
V
 
V
L
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
E
 
K
P
 
P
I
 
V
S
 
K
I
 
I
L
 
I
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
V
 
M
I
 
L
E
 
L
S
 
L
A
 
S
G
 
N
Y
 
R
S
 
N
V
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
D
I
 
L
A
 
E
I
 
I
D
 
K
I
 
I
I
 
T
G
 
G
L
 
L
R
|
R
P
 
K
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
L
Q
 
Y
E
 
E
E
 
E
L
 
L
T
 
L
L
 
I
S
 
D
S
 
E
D
 
N
L
 
D
I
 
A
T
 
K
T
 
T
R
 
Q
H
 
Y
Q
 
E
K
 
S
I
 
I
F
 
F
C
 
V
A
 
A
R
 
K

6bwcC X-ray structure of pen from bacillus thuringiensis (see paper)
36% identity, 45% coverage: 270:548/615 of query aligns to 3:271/327 of 6bwcC

query
sites
6bwcC
Y
 
F
Q
 
K
D
 
D
R
 
K
V
 
N
V
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
I
G
|
G
A
 
G
G
x
T
G
|
G
S
x
T
I
|
I
G
 
G
S
 
K
E
 
S
L
 
I
C
 
L
R
 
S
Q
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
Q
C
 
E
R
 
K
P
 
P
R
 
K
K
 
V
L
 
V
V
 
R
L
 
V
Y
 
F
E
x
S
L
x
R
S
|
S
E
 
E
L
 
Y
A
 
N
L
 
Q
Y
 
F
T
 
L
I
 
L
H
 
Q
Q
 
E
E
 
E
L
 
F
E
 
R
Q
 
D
Q
 
K
V
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
N
I
 
R
T
 
N
L
 
I
V
 
R
P
 
Y
V
 
L
L
 
I
G
 
G
S
x
D
V
x
I
T
 
R
D
 
N
P
 
Y
R
 
D
Q
 
-
V
 
-
R
 
R
M
 
V
V
 
F
L
 
S
A
 
A
H
 
M
H
 
E
G
 
N
V
 
I
Q
 
D
V
 
Y
V
 
V
L
 
F
H
 
H
A
x
V
A
|
A
A
 
A
Y
 
M
K
|
K
H
|
H
V
 
V
P
 
S
L
 
F
V
 
C
E
 
E
A
 
Y
N
 
N
P
 
P
L
 
F
P
 
E
G
 
A
L
 
V
A
 
L
N
 
T
N
 
N
V
 
I
F
 
F
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
T
 
N
L
 
V
A
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
I
R
 
A
S
 
Q
G
 
K
V
 
V
E
 
K
R
 
K
F
 
V
I
 
V
L
 
F
I
x
T
S
 
S
S
|
S
D
x
N
K
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
S
P
 
P
T
 
T
N
 
N
V
 
N
M
x
Y
G
 
G
A
 
A
S
 
T
K
|
K
R
 
L
M
 
T
A
 
A
E
 
E
L
 
R
V
 
L
V
 
I
Q
 
T
-
 
S
-
 
A
D
 
E
L
 
Y
S
 
S
T
 
K
R
 
G
N
 
S
P
 
S
G
 
E
T
 
T
V
 
T
F
 
F
T
 
T
M
 
S
V
 
V
R
 
R
F
|
F
G
 
G
N
|
N
V
|
V
L
 
M
G
 
G
S
|
S
S
x
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
I
P
 
P
L
|
L
F
 
F
Q
 
E
E
 
N
Q
 
Q
I
 
I
S
 
K
R
 
E
G
 
N
G
 
Q
P
 
K
V
 
I
T
|
T
V
 
V
T
|
T
D
 
D
P
 
L
R
 
S
V
x
M
K
 
S
R
|
R
Y
 
F
F
 
M
M
 
M
T
 
T
I
 
L
R
 
N
E
 
Q
A
 
A
V
 
T
Q
 
M
L
 
L
V
 
T
L
 
I
Q
 
E
A
 
A
G
 
M
A
 
K
E
 
I
A
 
A
L
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
T
F
 
F
V
 
I
L
 
L
D
 
K
M
 
M
G
 
-
E
 
-
P
 
P
-
 
V
I
 
I
S
 
S
I
x
L
L
 
N
Q
 
D
L
 
L
A
 
S
R
 
E
Q
 
V
V
 
M
I
 
I
E
 
E
S
 
E
A
 
V
G
 
T
-
 
K
-
 
L
Y
 
Y
S
 
G
V
 
L
R
 
E
D
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
N
I
 
I
A
 
K
I
 
I
D
 
E
I
 
E
I
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
K
P
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
M
Q
 
Y
E
 
E
E
 
E
L
 
L

4j2oC Crystal structure of NADP-bound wbjb from a. Baumannii community strain d1279779 (see paper)
33% identity, 47% coverage: 270:555/615 of query aligns to 2:271/316 of 4j2oC

query
sites
4j2oC
Y
 
F
Q
 
K
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
T
G
|
G
S
|
S
I
x
F
G
 
G
S
 
N
E
 
A
L
 
V
C
 
L
R
 
K
Q
 
R
V
 
F
L
 
L
A
 
E
C
 
T
R
 
D
P
 
I
R
 
K
K
 
E
L
 
I
V
 
R
L
 
I
Y
 
F
E
x
S
L
x
R
S
x
D
E
 
E
L
 
K
A
x
K
L
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
H
 
Q
Q
 
D
E
 
D
L
 
M
E
 
R
Q
 
K
Q
 
K
V
 
Y
E
 
H
G
 
S
T
 
A
G
 
K
I
 
L
T
 
K
L
 
F
V
 
Y
P
 
-
V
 
-
L
 
I
G
 
G
S
x
D
V
|
V
T
 
R
D
 
D
P
 
Y
R
 
N
Q
 
S
V
 
I
R
 
-
M
 
-
V
 
L
L
 
N
A
 
A
H
 
T
H
 
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
V
 
Y
V
 
I
L
 
Y
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
Y
 
L
K
|
K
H
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
S
V
 
C
E
 
E
A
 
F
N
 
H
P
 
P
L
 
M
P
 
E
G
 
A
L
 
V
A
 
K
N
x
T
N
 
N
V
 
V
F
 
L
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
T
 
N
L
 
V
A
 
L
R
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
I
R
 
Q
S
 
N
G
 
H
V
 
V
E
 
K
R
 
R
F
 
V
I
 
V
L
 
C
I
x
L
S
 
S
S
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
Y
P
 
P
T
 
I
N
 
N
V
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
I
S
 
S
K
|
K
R
 
A
M
 
M
A
 
M
E
 
E
-
 
K
-
 
V
L
 
M
V
 
V
V
 
A
Q
 
K
D
 
S
L
 
R
S
 
N
T
 
L
R
 
E
N
 
G
P
 
L
G
 
D
T
 
T
V
 
V
F
 
I
T
 
C
M
 
G
V
 
T
R
 
R
F
x
Y
G
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
M
G
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
I
P
 
P
L
 
L
F
 
F
Q
 
V
E
 
D
Q
 
Q
I
 
I
S
 
R
R
 
Q
G
 
G
G
 
K
P
 
P
V
 
L
T
 
T
V
 
I
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
N
V
 
M
K
 
T
R
 
R
Y
 
F
F
 
M
M
 
M
T
 
T
I
 
L
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L
Q
 
Y
A
 
A
G
 
F
A
 
E
E
 
H
A
 
G
L
 
E
G
 
N
G
 
G
E
 
D
V
 
I
F
 
F
V
 
V
L
 
Q
D
 
K
M
 
A
-
 
P
G
 
A
E
 
A
P
 
T
I
 
I
S
 
A
I
 
V
L
 
L
Q
 
A
L
 
E
A
 
A
-
 
L
R
 
K
Q
 
Q
V
 
L
I
 
L
E
 
N
S
 
V
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
E
D
 
D
H
 
H
P
 
P
D
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
-
I
 
I
D
 
S
I
 
I
I
 
M
G
 
G
L
 
T
R
 
R
P
 
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
M
 
A
Q
 
F
E
 
E
E
 
A
L
 
L
T
 
L
L
 
S
S
 
R
S
 
E
D
 
E
L
 
M
I
 
V

3w1vA Crystal structure of capsular polysaccharide synthesizing enzyme cape from staphylococcus aureus in complex with inihibitor (see paper)
33% identity, 47% coverage: 261:548/615 of query aligns to 3:272/347 of 3w1vA

query
sites
3w1vA
V
 
V
P
 
P
L
 
R
Q
 
G
E
 
S
A
 
A
S
 
M
G
 
G
S
 
-
Y
 
F
Q
 
D
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
F
G
 
G
S
 
N
E
 
A
L
 
V
C
 
M
R
 
K
Q
 
R
V
 
F
L
 
L
A
 
D
C
 
S
R
 
N
P
 
I
R
 
K
K
 
E
L
 
I
V
 
R
L
 
I
Y
 
F
E
 
S
L
 
R
S
 
D
E
 
E
L
 
K
A
 
K
L
 
Q
Y
 
D
T
 
D
I
 
I
H
 
R
Q
 
K
E
 
K
L
 
Y
E
 
N
Q
 
N
Q
 
S
V
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
K
L
 
L
V
 
K
P
 
F
V
 
Y
L
 
I
G
 
G
S
 
D
V
 
V
T
 
R
D
 
D
P
 
S
R
 
Q
Q
 
S
V
 
V
R
 
E
M
 
T
V
 
-
L
 
-
A
 
A
H
 
M
H
 
R
G
 
D
V
 
V
Q
 
D
V
 
Y
V
 
V
L
 
F
H
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
L
K
|
K
H
x
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
S
V
 
C
E
 
E
A
 
F
N
 
F
P
 
P
L
 
V
P
 
E
G
 
A
L
 
V
A
 
K
N
 
T
N
 
N
V
 
I
F
 
I
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
T
 
N
L
 
V
A
 
L
R
 
Q
A
 
S
A
 
A
A
 
I
R
 
H
S
 
Q
G
 
N
V
 
V
E
 
K
R
 
K
F
 
V
I
 
I
L
 
C
I
 
L
S
 
S
S
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
V
 
A
R
 
Y
P
 
P
T
 
I
N
 
N
V
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
I
S
 
S
K
 
K
R
 
A
M
 
M
A
 
M
E
 
E
-
 
K
-
 
V
L
 
F
V
 
V
V
 
A
Q
 
K
D
 
S
L
 
R
S
 
N
T
 
I
R
 
R
N
 
S
P
 
E
G
 
Q
T
 
T
V
 
L
F
 
I
T
 
C
M
 
G
V
 
T
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
N
|
N
V
 
V
L
 
M
G
 
A
S
|
S
S
x
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
I
P
 
P
L
|
L
F
 
F
Q
 
I
E
 
D
Q
 
K
I
 
I
S
 
K
R
 
A
G
 
G
G
 
E
P
 
P
V
 
L
T
|
T
V
x
I
T
|
T
D
 
D
P
 
P
R
 
D
V
x
M
K
 
T
R
|
R
Y
 
F
F
 
L
M
 
M
T
 
S
I
 
L
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
V
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
V
Q
 
H
A
 
A
G
 
F
A
 
K
E
 
H
A
 
A
L
 
E
G
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
I
F
 
M
V
 
V
L
 
-
D
 
-
M
 
Q
G
 
K
E
 
A
P
 
P
I
 
S
S
 
S
I
 
T
L
x
V
-
 
G
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
T
Q
 
A
V
 
L
I
 
L
E
 
E
S
 
L
A
 
F
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
E
G
 
A
D
 
D
I
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
E
I
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
T
R
|
R
P
 
H
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
K
Q
 
A
E
 
E
E
 
T
L
 
L

4g5hA Crystal structure of capsular polysaccharide synthesizing enzyme cape from staphylococcus aureus in complex with by-product (see paper)
33% identity, 47% coverage: 261:548/615 of query aligns to 3:272/346 of 4g5hA

query
sites
4g5hA
V
 
V
P
 
P
L
 
R
Q
 
G
E
 
S
A
 
A
S
 
M
G
 
G
S
 
-
Y
 
F
Q
 
D
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
T
G
|
G
S
|
S
I
x
F
G
 
G
S
 
N
E
 
A
L
 
V
C
 
M
R
 
K
Q
 
R
V
 
F
L
 
L
A
 
D
C
 
S
R
 
N
P
 
I
R
 
K
K
 
E
L
 
I
V
 
R
L
 
I
Y
 
F
E
x
S
L
x
R
S
x
D
E
 
E
L
 
K
A
x
K
L
 
Q
Y
 
D
T
 
D
I
 
I
H
 
R
Q
 
K
E
 
K
L
 
Y
E
 
N
Q
 
N
Q
 
S
V
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
K
L
 
L
V
 
K
P
 
F
V
 
Y
L
 
I
G
 
G
S
x
D
V
|
V
T
 
R
D
 
D
P
 
S
R
 
Q
Q
 
S
V
 
V
R
 
E
M
 
T
V
 
-
L
 
-
A
 
A
H
 
M
H
 
R
G
 
D
V
 
V
Q
 
D
V
 
Y
V
 
V
L
 
F
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
Y
 
L
K
|
K
H
x
Q
V
|
V
P
 
P
L
 
S
V
 
C
E
 
E
A
 
F
N
 
F
P
 
P
L
 
V
P
 
E
G
 
A
L
 
V
A
 
K
N
 
T
N
 
N
V
 
I
F
 
I
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
T
 
N
L
 
V
A
 
L
R
 
Q
A
 
S
A
 
A
A
 
I
R
 
H
S
 
Q
G
 
N
V
 
V
E
 
K
R
 
K
F
 
V
I
 
I
L
 
C
I
x
L
S
 
S
S
x
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
V
 
A
R
 
Y
P
 
P
T
 
I
N
 
N
V
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
I
S
 
S
K
|
K
R
 
A
M
 
M
A
 
M
E
 
E
-
 
K
-
 
V
L
 
F
V
 
V
V
 
A
Q
 
K
D
 
S
L
 
R
S
 
N
T
 
I
R
 
R
N
 
S
P
 
E
G
 
Q
T
 
T
V
 
L
F
 
I
T
 
C
M
 
G
V
 
T
R
 
R
F
x
Y
G
 
G
N
|
N
V
 
V
L
 
M
G
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
I
P
 
P
L
|
L
F
 
F
Q
 
I
E
 
D
Q
 
K
I
 
I
S
 
K
R
 
A
G
 
G
G
 
E
P
 
P
V
 
L
T
|
T
V
 
I
T
|
T
D
 
D
P
 
P
R
 
D
V
x
M
K
 
T
R
 
R
Y
 
F
F
 
L
M
 
M
T
 
S
I
 
L
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
V
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
V
Q
 
H
A
 
A
G
 
F
A
 
K
E
 
H
A
 
A
L
 
E
G
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
I
F
 
M
V
 
V
L
 
-
D
 
-
M
 
Q
G
 
K
E
 
A
P
 
P
I
 
S
S
 
S
I
 
T
L
x
V
-
 
G
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
T
Q
 
A
V
 
L
I
 
L
E
 
E
S
 
L
A
 
F
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
E
G
 
A
D
 
D
I
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
E
I
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
T
R
|
R
P
 
H
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
K
Q
 
A
E
 
E
E
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3vvcA Crystal structure of capsular polysaccharide synthesizing enzyme cape , k126e, in apo form (see paper)
32% identity, 45% coverage: 270:548/615 of query aligns to 3:264/318 of 3vvcA

query
sites
3vvcA
Y
 
F
Q
 
D
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
T
G
|
G
S
 
S
I
x
F
G
 
G
S
 
N
E
 
A
L
 
V
C
 
M
R
 
K
Q
 
R
V
 
F
L
 
L
A
 
D
C
 
S
R
 
N
P
 
I
R
 
K
K
 
E
L
 
I
V
 
R
L
 
I
Y
 
F
E
x
S
L
x
R
S
x
D
E
 
E
L
 
K
A
x
K
L
 
Q
Y
 
D
T
 
D
I
 
I
H
 
R
Q
 
K
E
 
K
L
 
Y
E
 
N
Q
 
N
Q
 
S
V
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
K
L
 
L
V
 
K
P
 
F
V
 
Y
L
 
I
G
 
G
S
x
D
V
|
V
T
x
R
D
 
D
P
 
S
R
 
Q
Q
 
S
V
 
V
R
 
E
M
 
T
V
 
-
L
 
-
A
 
A
H
 
M
H
 
R
G
 
D
V
 
V
Q
 
D
V
 
Y
V
 
V
L
 
F
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
Y
 
L
K
|
K
H
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
S
V
 
C
E
 
E
A
 
F
N
 
F
P
 
P
L
 
V
P
 
E
G
 
A
L
 
V
A
 
K
N
 
T
N
 
N
V
 
I
F
 
I
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
T
 
N
L
 
V
A
 
L
R
 
Q
A
 
S
A
 
A
A
 
I
R
 
H
S
 
Q
G
 
N
V
 
V
E
 
K
R
 
K
F
 
V
I
 
I
L
 
C
I
 
L
S
|
S
S
x
T
D
 
D
K
 
E
A
 
A
V
 
A
R
 
Y
P
 
P
T
 
I
N
 
N
V
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
I
S
 
S
K
|
K
R
 
A
M
 
M
A
 
M
E
 
E
-
 
K
-
 
V
L
 
F
V
 
V
V
 
A
Q
 
K
D
 
S
L
 
R
S
 
N
T
 
I
R
 
R
N
 
S
P
 
E
G
 
Q
T
 
T
V
 
L
F
 
I
T
 
C
M
 
G
V
 
T
R
 
R
F
x
Y
G
|
G
N
 
N
V
 
V
L
 
M
G
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
I
P
 
P
L
 
L
F
 
F
Q
 
I
E
 
D
Q
 
K
I
 
I
S
 
K
R
 
A
G
 
G
G
 
E
P
 
P
V
 
L
T
 
T
V
 
I
T
 
T
D
 
D
P
 
P
R
 
D
V
 
M
K
 
T
R
 
R
Y
 
F
F
 
L
M
 
M
T
 
S
I
 
L
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
V
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
V
Q
 
H
A
 
A
G
 
F
A
 
K
E
 
H
A
 
A
L
 
E
G
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
I
F
 
M
V
 
V
L
 
-
D
 
-
M
 
Q
G
 
K
E
 
A
P
 
P
I
 
S
S
 
S
I
 
T
L
 
V
-
 
G
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
T
Q
 
A
V
 
L
I
 
L
E
 
E
S
 
L
A
 
F
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
E
G
 
A
D
 
D
I
 
N
A
 
A
I
 
I
D
 
E
I
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
T
R
 
R
P
 
H
G
 
G
E
 
E
K
 
K
M
 
K
Q
 
A
E
 
E
E
 
T
L
 
L

2gn8A Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADP and udp (see paper)
31% identity, 45% coverage: 271:546/615 of query aligns to 3:259/327 of 2gn8A

query
sites
2gn8A
Q
 
D
D
 
N
R
 
Q
V
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
I
S
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
T
G
|
G
S
|
S
I
x
F
G
 
G
S
 
K
E
 
C
L
 
F
C
 
V
R
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
-
 
D
A
 
T
C
 
T
R
 
N
P
 
A
R
 
K
K
 
K
L
 
I
V
 
I
L
 
V
Y
 
Y
E
x
S
L
x
R
S
x
D
E
 
E
L
 
L
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
H
 
-
Q
x
K
E
 
Q
L
 
S
E
 
E
Q
 
M
Q
 
A
V
 
M
E
 
E
G
 
F
T
 
N
G
 
D
I
 
P
T
 
R
L
 
M
V
 
R
P
 
F
V
 
F
L
 
I
G
 
G
S
x
D
V
|
V
T
 
R
D
 
D
P
 
L
R
 
E
Q
 
-
V
 
-
R
 
R
M
 
L
V
 
N
L
 
Y
A
 
A
H
 
L
H
 
E
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
V
 
I
V
 
C
L
 
I
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
Y
 
L
K
|
K
H
 
H
V
 
V
P
 
P
L
 
I
V
 
A
E
 
E
A
 
Y
N
 
N
P
 
P
L
 
L
P
 
E
G
 
C
L
 
I
A
 
K
N
x
T
N
 
N
V
 
I
F
 
M
G
 
G
T
 
A
Q
 
S
T
 
N
L
 
V
A
 
I
R
 
N
A
 
A
A
 
C
A
 
L
R
 
K
S
 
N
G
 
A
V
 
I
E
 
S
R
 
Q
F
 
V
I
 
I
L
 
A
I
x
L
S
|
S
S
 
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
V
 
A
R
 
N
P
 
P
T
 
I
N
 
N
V
 
L
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
S
 
T
K
|
K
R
 
L
M
 
C
A
 
S
E
 
D
-
 
K
-
 
L
L
 
F
V
 
V
V
 
S
Q
 
A
D
 
N
L
 
N
S
 
F
T
 
K
R
 
G
N
 
S
P
 
S
G
 
Q
T
 
T
V
 
Q
F
 
F
T
 
S
M
 
V
V
 
V
R
 
R
F
x
Y
G
|
G
N
|
N
V
|
V
L
 
V
G
 
G
S
|
S
S
x
R
G
 
G
S
 
S
V
|
V
V
 
V
P
 
P
L
 
F
F
 
F
Q
 
K
E
 
K
Q
 
L
I
 
V
-
 
Q
S
 
N
R
 
K
G
 
A
G
 
S
P
 
E
V
 
I
T
x
P
V
x
I
T
|
T
D
 
D
P
 
I
R
 
R
V
x
M
K
 
T
R
|
R
Y
 
F
F
 
W
M
 
I
T
 
T
I
 
L
R
 
D
E
 
E
A
 
G
V
 
V
Q
 
S
L
 
F
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
A
 
S
G
 
L
A
 
K
E
 
R
A
 
M
L
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
V
L
 
P
D
 
K
M
 
I
G
 
P
E
 
S
P
 
-
I
 
M
S
 
K
I
x
M
L
 
T
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
V
 
L
I
 
A
E
 
P
S
 
N
A
 
T
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
P
I
 
T
D
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
K
M
 
L
Q
 
H
E
 
E

O25511 UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting); Pseudaminic acid biosynthesis protein B; UDP-GlcNAc-inverting 4,6-dehydratase; EC 4.2.1.115 from Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) (Campylobacter pylori) (see paper)
31% identity, 45% coverage: 271:546/615 of query aligns to 9:265/333 of O25511

query
sites
O25511
Q
 
D
D
 
N
R
 
Q
V
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
G
G
x
T
G
|
G
S
|
S
I
x
F
G
 
G
S
 
K
E
 
C
L
 
F
C
 
V
R
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
-
 
D
A
 
T
C
 
T
R
 
N
P
 
A
R
 
K
K
 
K
L
 
I
V
 
I
L
 
V
Y
 
Y
E
x
S
L
x
R
S
x
D
E
|
E
L
|
L
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
H
 
-
Q
x
K
E
 
Q
L
 
S
E
 
E
Q
 
M
Q
 
A
V
 
M
E
 
E
G
 
F
T
 
N
G
 
D
I
 
P
T
 
R
L
 
M
V
 
R
P
 
F
V
 
F
L
 
I
G
 
G
S
x
D
V
|
V
T
 
R
D
 
D
P
 
L
R
 
E
Q
 
-
V
 
-
R
 
R
M
 
L
V
 
N
L
 
Y
A
 
A
H
 
L
H
 
E
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
V
 
I
V
 
C
L
 
I
H
 
H
A
|
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
L
K
|
K
H
 
H
V
 
V
P
 
P
L
 
I
V
 
A
E
 
E
A
 
Y
N
 
N
P
 
P
L
 
L
P
 
E
G
 
C
L
 
I
A
 
K
N
 
T
N
 
N
V
 
I
F
 
M
G
 
G
T
 
A
Q
 
S
T
 
N
L
 
V
A
 
I
R
 
N
A
 
A
A
 
C
A
 
L
R
 
K
S
 
N
G
 
A
V
 
I
E
 
S
R
 
Q
F
 
V
I
 
I
L
 
A
I
x
L
S
|
S
S
 
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
V
 
A
R
 
N
P
 
P
T
 
I
N
 
N
V
 
L
M
x
Y
G
 
G
A
 
A
S
 
T
K
|
K
R
 
L
M
 
C
A
 
S
E
 
D
-
 
K
-
 
L
L
 
F
V
 
V
V
 
S
Q
 
A
D
 
N
L
 
N
S
 
F
T
 
K
R
 
G
N
 
S
P
 
S
G
 
Q
T
 
T
V
 
Q
F
 
F
T
 
S
M
 
V
V
 
V
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
N
 
N
V
|
V
L
x
V
G
|
G
S
|
S
S
x
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
F
F
 
F
Q
 
K
E
 
K
Q
 
L
I
 
V
-
 
Q
S
 
N
R
 
K
G
 
A
G
 
S
P
 
E
V
 
I
T
 
P
V
 
I
T
 
T
D
 
D
P
 
I
R
 
R
V
 
M
K
 
T
R
 
R
Y
 
F
F
 
W
M
 
I
T
 
T
I
 
L
R
 
D
E
 
E
A
 
G
V
 
V
Q
 
S
L
 
F
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
A
 
S
G
 
L
A
 
K
E
 
R
A
 
M
L
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
V
L
 
P
D
 
K
M
 
I
G
 
P
E
 
S
P
 
-
I
 
M
S
 
K
I
 
M
L
 
T
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
V
 
L
I
 
A
E
 
P
S
 
N
A
 
T
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
P
I
 
T
D
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
R
P
 
P
G
 
G
E
 
E
K
 
K
M
 
L
Q
 
H
E
 
E

2gnaA Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADP and udp-gal (see paper)
31% identity, 45% coverage: 271:546/615 of query aligns to 5:261/329 of 2gnaA

query
sites
2gnaA
Q
 
D
D
 
N
R
 
Q
V
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
I
S
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
T
G
|
G
S
|
S
I
x
F
G
 
G
S
 
K
E
 
C
L
 
F
C
 
V
R
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
-
 
D
A
 
T
C
 
T
R
 
N
P
 
A
R
 
K
K
 
K
L
 
I
V
 
I
L
 
V
Y
 
Y
E
x
S
L
x
R
S
x
D
E
 
E
L
 
L
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
H
 
-
Q
x
K
E
 
Q
L
 
S
E
 
E
Q
 
M
Q
 
A
V
 
M
E
 
E
G
 
F
T
 
N
G
 
D
I
 
P
T
 
R
L
 
M
V
 
R
P
 
F
V
 
F
L
 
I
G
 
G
S
x
D
V
|
V
T
 
R
D
 
D
P
 
L
R
 
E
Q
 
-
V
 
-
R
 
R
M
 
L
V
 
N
L
 
Y
A
 
A
H
 
L
H
 
E
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
V
 
I
V
 
C
L
 
I
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
Y
 
L
K
|
K
H
 
H
V
 
V
P
 
P
L
 
I
V
 
A
E
 
E
A
 
Y
N
 
N
P
 
P
L
 
L
P
 
E
G
 
C
L
 
I
A
 
K
N
 
T
N
 
N
V
 
I
F
 
M
G
 
G
T
 
A
Q
 
S
T
 
N
L
 
V
A
 
I
R
 
N
A
 
A
A
 
C
A
 
L
R
 
K
S
 
N
G
 
A
V
 
I
E
 
S
R
 
Q
F
 
V
I
 
I
L
 
A
I
x
L
S
|
S
S
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
V
 
A
R
 
N
P
 
P
T
 
I
N
 
N
V
 
L
M
x
Y
G
 
G
A
 
A
S
 
T
K
|
K
R
 
L
M
 
C
A
 
S
E
 
D
-
 
K
-
 
L
L
 
F
V
 
V
V
 
S
Q
 
A
D
 
N
L
 
N
S
 
F
T
 
K
R
 
G
N
 
S
P
 
S
G
 
Q
T
 
T
V
 
Q
F
 
F
T
 
S
M
 
V
V
 
V
R
 
R
F
x
Y
G
|
G
N
 
N
V
|
V
L
 
V
G
 
G
S
 
S
S
 
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
V
P
 
P
L
 
F
F
 
F
Q
 
K
E
 
K
Q
 
L
I
 
V
-
 
Q
S
 
N
R
 
K
G
 
A
G
 
S
P
 
E
V
 
I
T
 
P
V
 
I
T
|
T
D
 
D
P
 
I
R
 
R
V
x
M
K
 
T
R
|
R
Y
 
F
F
 
W
M
 
I
T
 
T
I
 
L
R
 
D
E
 
E
A
 
G
V
 
V
Q
 
S
L
 
F
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
A
 
S
G
 
L
A
 
K
E
 
R
A
 
M
L
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
V
L
 
P
D
 
K
M
 
I
G
 
P
E
 
S
P
 
-
I
 
M
S
 
K
I
x
M
L
 
T
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
V
 
L
I
 
A
E
 
P
S
 
N
A
 
T
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
P
I
 
T
D
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
L
Q
 
H
E
 
E

2gn9A Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADP and udp-glc (see paper)
31% identity, 45% coverage: 271:546/615 of query aligns to 5:261/329 of 2gn9A

query
sites
2gn9A
Q
 
D
D
 
N
R
 
Q
V
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
I
S
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
T
G
|
G
S
|
S
I
x
F
G
 
G
S
 
K
E
 
C
L
 
F
C
 
V
R
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
-
 
D
A
 
T
C
 
T
R
 
N
P
 
A
R
 
K
K
 
K
L
 
I
V
 
I
L
 
V
Y
 
Y
E
 
S
L
x
R
S
x
D
E
 
E
L
 
L
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
H
 
-
Q
x
K
E
 
Q
L
 
S
E
 
E
Q
 
M
Q
 
A
V
 
M
E
 
E
G
 
F
T
 
N
G
 
D
I
 
P
T
 
R
L
 
M
V
 
R
P
 
F
V
 
F
L
 
I
G
 
G
S
x
D
V
|
V
T
 
R
D
 
D
P
 
L
R
 
E
Q
 
-
V
 
-
R
 
R
M
 
L
V
 
N
L
 
Y
A
 
A
H
 
L
H
 
E
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
V
 
I
V
 
C
L
 
I
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
Y
 
L
K
|
K
H
 
H
V
 
V
P
 
P
L
 
I
V
 
A
E
 
E
A
 
Y
N
 
N
P
 
P
L
 
L
P
 
E
G
 
C
L
 
I
A
 
K
N
 
T
N
 
N
V
 
I
F
 
M
G
 
G
T
 
A
Q
 
S
T
 
N
L
 
V
A
 
I
R
 
N
A
 
A
A
 
C
A
 
L
R
 
K
S
 
N
G
 
A
V
 
I
E
 
S
R
 
Q
F
 
V
I
 
I
L
 
A
I
x
L
S
|
S
S
x
T
D
 
D
K
|
K
A
 
A
V
 
A
R
 
N
P
 
P
T
 
I
N
 
N
V
 
L
M
x
Y
G
 
G
A
 
A
S
 
T
K
|
K
R
 
L
M
 
C
A
 
S
E
 
D
-
 
K
-
 
L
L
 
F
V
 
V
V
 
S
Q
 
A
D
 
N
L
 
N
S
 
F
T
 
K
R
 
G
N
 
S
P
 
S
G
 
Q
T
 
T
V
 
Q
F
 
F
T
 
S
M
 
V
V
 
V
R
 
R
F
x
Y
G
|
G
N
|
N
V
|
V
L
 
V
G
 
G
S
 
S
S
x
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
V
P
 
P
L
 
F
F
 
F
Q
 
K
E
 
K
Q
 
L
I
 
V
-
 
Q
S
 
N
R
 
K
G
 
A
G
 
S
P
 
E
V
 
I
T
x
P
V
 
I
T
|
T
D
 
D
P
 
I
R
 
R
V
x
M
K
 
T
R
|
R
Y
 
F
F
 
W
M
 
I
T
 
T
I
 
L
R
 
D
E
 
E
A
 
G
V
 
V
Q
 
S
L
 
F
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
A
 
S
G
 
L
A
 
K
E
 
R
A
 
M
L
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
V
L
 
P
D
 
K
M
 
I
G
 
P
E
 
S
P
 
-
I
 
M
S
 
K
I
x
M
L
 
T
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
V
 
L
I
 
A
E
 
P
S
 
N
A
 
T
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
P
I
 
T
D
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
L
Q
 
H
E
 
E

2gn6A Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADP and udp-glcnac (see paper)
31% identity, 45% coverage: 271:546/615 of query aligns to 5:261/329 of 2gn6A

query
sites
2gn6A
Q
 
D
D
 
N
R
 
Q
V
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
I
S
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
T
G
|
G
S
|
S
I
x
F
G
 
G
S
 
K
E
 
C
L
 
F
C
 
V
R
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
-
 
D
A
 
T
C
 
T
R
 
N
P
 
A
R
 
K
K
 
K
L
 
I
V
 
I
L
 
V
Y
 
Y
E
 
S
L
x
R
S
x
D
E
 
E
L
 
L
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
H
 
-
Q
x
K
E
 
Q
L
 
S
E
 
E
Q
 
M
Q
 
A
V
 
M
E
 
E
G
 
F
T
 
N
G
 
D
I
 
P
T
 
R
L
 
M
V
 
R
P
 
F
V
 
F
L
 
I
G
 
G
S
x
D
V
|
V
T
 
R
D
 
D
P
 
L
R
 
E
Q
 
-
V
 
-
R
 
R
M
 
L
V
 
N
L
 
Y
A
 
A
H
 
L
H
 
E
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
V
 
I
V
 
C
L
 
I
H
 
H
A
 
A
A
|
A
A
|
A
Y
 
L
K
|
K
H
 
H
V
 
V
P
 
P
L
 
I
V
 
A
E
 
E
A
 
Y
N
 
N
P
 
P
L
 
L
P
 
E
G
 
C
L
 
I
A
 
K
N
 
T
N
 
N
V
 
I
F
 
M
G
 
G
T
 
A
Q
 
S
T
 
N
L
 
V
A
 
I
R
 
N
A
 
A
A
 
C
A
 
L
R
 
K
S
 
N
G
 
A
V
 
I
E
 
S
R
 
Q
F
 
V
I
 
I
L
 
A
I
 
L
S
|
S
S
 
T
D
|
D
K
|
K
A
 
A
V
 
A
R
 
N
P
 
P
T
 
I
N
 
N
V
 
L
M
x
Y
G
 
G
A
 
A
S
 
T
K
|
K
R
 
L
M
 
C
A
 
S
E
 
D
-
 
K
-
 
L
L
 
F
V
 
V
V
 
S
Q
 
A
D
 
N
L
 
N
S
 
F
T
 
K
R
 
G
N
 
S
P
 
S
G
 
Q
T
 
T
V
 
Q
F
 
F
T
 
S
M
 
V
V
 
V
R
 
R
F
x
Y
G
|
G
N
|
N
V
|
V
L
 
V
G
 
G
S
|
S
S
x
R
G
|
G
S
|
S
V
|
V
V
 
V
P
 
P
L
 
F
F
 
F
Q
 
K
E
 
K
Q
 
L
I
 
V
-
 
Q
S
 
N
R
 
K
G
 
A
G
 
S
P
 
E
V
 
I
T
x
P
V
x
I
T
 
T
D
 
D
P
 
I
R
 
R
V
x
M
K
 
T
R
|
R
Y
 
F
F
 
W
M
 
I
T
 
T
I
 
L
R
 
D
E
 
E
A
 
G
V
 
V
Q
 
S
L
 
F
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
A
 
S
G
 
L
A
 
K
E
 
R
A
 
M
L
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
V
L
 
P
D
 
K
M
 
I
G
 
P
E
 
S
P
 
-
I
 
M
S
 
K
I
x
M
L
 
T
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
V
 
L
I
 
A
E
 
P
S
 
N
A
 
T
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
P
I
 
T
D
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
L
Q
 
H
E
 
E

2gn4A Crystal structure of udp-glcnac inverting 4,6-dehydratase in complex with NADPH and udp-glcnac (see paper)
31% identity, 45% coverage: 271:546/615 of query aligns to 5:261/329 of 2gn4A

query
sites
2gn4A
Q
 
D
D
 
N
R
 
Q
V
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
I
S
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
T
G
|
G
S
|
S
I
x
F
G
 
G
S
 
K
E
 
C
L
 
F
C
 
V
R
 
R
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
-
 
D
A
 
T
C
 
T
R
 
N
P
 
A
R
 
K
K
 
K
L
 
I
V
 
I
L
 
V
Y
 
Y
E
x
S
L
x
R
S
x
D
E
 
E
L
 
L
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
H
 
-
Q
x
K
E
 
Q
L
 
S
E
 
E
Q
 
M
Q
 
A
V
 
M
E
 
E
G
 
F
T
 
N
G
 
D
I
 
P
T
 
R
L
 
M
V
 
R
P
 
F
V
 
F
L
 
I
G
 
G
S
x
D
V
|
V
T
 
R
D
 
D
P
 
L
R
 
E
Q
 
-
V
 
-
R
 
R
M
 
L
V
 
N
L
 
Y
A
 
A
H
 
L
H
 
E
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
V
 
I
V
 
C
L
 
I
H
 
H
A
|
A
A
|
A
A
|
A
Y
 
L
K
|
K
H
 
H
V
 
V
P
 
P
L
 
I
V
 
A
E
 
E
A
 
Y
N
 
N
P
 
P
L
 
L
P
 
E
G
 
C
L
 
I
A
 
K
N
x
T
N
 
N
V
 
I
F
 
M
G
 
G
T
 
A
Q
 
S
T
 
N
L
 
V
A
 
I
R
 
N
A
 
A
A
 
C
A
 
L
R
 
K
S
 
N
G
 
A
V
 
I
E
 
S
R
 
Q
F
 
V
I
 
I
L
 
A
I
x
L
S
|
S
S
x
T
D
|
D
K
|
K
A
 
A
V
 
A
R
 
N
P
 
P
T
 
I
N
 
N
V
 
L
M
x
Y
G
 
G
A
 
A
S
 
T
K
|
K
R
 
L
M
 
C
A
 
S
E
 
D
-
 
K
-
 
L
L
 
F
V
 
V
V
 
S
Q
 
A
D
 
N
L
 
N
S
 
F
T
 
K
R
 
G
N
 
S
P
 
S
G
 
Q
T
 
T
V
 
Q
F
 
F
T
 
S
M
 
V
V
 
V
R
 
R
F
x
Y
G
|
G
N
|
N
V
|
V
L
 
V
G
 
G
S
|
S
S
x
R
G
 
G
S
|
S
V
|
V
V
 
V
P
 
P
L
 
F
F
 
F
Q
 
K
E
 
K
Q
 
L
I
 
V
-
 
Q
S
 
N
R
 
K
G
 
A
G
 
S
P
 
E
V
 
I
T
x
P
V
 
I
T
|
T
D
 
D
P
 
I
R
 
R
V
x
M
K
 
T
R
|
R
Y
 
F
F
 
W
M
 
I
T
 
T
I
 
L
R
 
D
E
 
E
A
 
G
V
 
V
Q
 
S
L
 
F
V
 
V
L
 
L
Q
 
K
A
 
S
G
 
L
A
 
K
E
 
R
A
 
M
L
 
H
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
V
L
 
P
D
 
K
M
 
I
G
 
P
E
 
S
P
 
-
I
 
M
S
 
K
I
x
M
L
 
T
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
V
 
L
I
 
A
E
 
P
S
 
N
A
 
T
G
 
-
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
P
I
 
T
D
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
I
R
|
R
P
 
P
G
 
G
E
|
E
K
 
K
M
 
L
Q
 
H
E
 
E

3vvbA Crystal structure of capsular polysaccharide synthesizing enzyme cape from staphylococcus aureus in apo form (see paper)
27% identity, 37% coverage: 270:497/615 of query aligns to 1:198/270 of 3vvbA

query
sites
3vvbA
Y
 
F
Q
 
D
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
T
G
|
G
S
|
S
I
x
F
G
 
G
S
 
N
E
 
A
L
 
V
C
 
M
R
 
K
Q
 
R
V
 
F
L
 
L
A
 
D
C
 
S
R
 
N
P
 
I
R
 
K
K
 
E
L
 
I
V
 
R
L
 
I
Y
 
F
E
x
S
L
x
R
S
x
D
E
 
E
L
 
K
A
x
K
L
 
Q
Y
 
D
T
 
D
I
 
I
H
 
R
Q
 
K
E
 
K
L
 
Y
E
 
N
Q
 
N
Q
 
S
V
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
K
L
 
L
V
 
K
P
 
F
V
 
Y
L
 
I
G
 
G
S
x
D
V
|
V
T
 
R
D
 
D
P
 
S
R
 
Q
Q
 
S
V
 
V
R
 
E
M
 
T
V
 
-
L
 
-
A
 
A
H
 
M
H
 
R
G
 
D
V
 
V
Q
 
D
V
 
Y
V
 
V
L
 
F
H
 
H
A
 
A
A
|
A
A
|
A
Y
 
L
K
|
K
H
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
S
V
 
C
E
 
E
A
 
F
N
 
F
P
 
P
L
 
V
P
 
E
G
 
A
L
 
V
A
 
K
N
 
T
N
 
N
V
 
I
F
 
I
G
 
G
T
 
T
Q
 
E
T
 
N
L
 
V
A
 
L
R
 
Q
A
 
S
A
 
A
A
 
I
R
 
H
S
 
Q
G
 
N
V
 
V
E
 
K
R
 
K
F
 
V
I
 
I
L
 
C
I
x
L
S
 
S
S
x
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
V
 
A
R
 
Y
P
 
P
T
 
I
N
 
N
V
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
I
S
 
S
K
|
K
R
 
A
M
 
M
A
 
M
E
 
E
-
 
K
-
 
V
L
 
F
V
 
V
V
 
A
Q
 
K
D
 
S
L
 
R
S
 
N
T
 
I
R
 
R
N
 
S
P
 
E
G
 
Q
T
 
T
V
 
L
F
 
I
T
 
C
M
 
G
V
 
T
R
 
R
F
x
Y
G
|
G
N
 
N
V
 
V
L
 
M
G
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
Q
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
P
R
 
D
V
 
M
K
 
T
R
 
R
Y
 
F
F
 
L
M
 
M
T
 
S
I
 
L
R
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
V
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
V
Q
 
H
A
 
A
G
 
F
A
 
K
E
 
H
A
 
A
L
 
E
G
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
I
F
 
M
V
 
V

3pvzA Udp-n-acetylglucosamine 4,6-dehydratase from vibrio fischeri
28% identity, 40% coverage: 276:519/615 of query aligns to 34:278/372 of 3pvzA

query
sites
3pvzA
L
 
L
V
 
V
S
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
A
G
|
G
S
|
S
I
|
I
G
 
G
S
 
Q
E
 
A
L
 
V
C
 
T
R
 
K
Q
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
K
C
 
R
R
 
N
P
 
P
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
V
 
H
L
 
V
Y
 
V
E
x
D
L
x
I
S
 
S
E
 
E
L
 
N
A
 
N
L
 
M
Y
 
V
T
 
E
I
 
L
H
 
V
Q
 
R
E
 
D
L
 
I
E
 
R
Q
 
S
Q
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
Y
V
 
I
E
 
N
G
 
G
T
 
D
G
 
F
I
 
Q
T
 
T
L
 
F
V
 
A
P
 
L
V
x
D
L
x
I
G
 
G
S
 
S
V
 
I
T
 
E
D
 
Y
P
 
D
R
 
A
Q
 
F
V
 
I
R
 
K
M
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
A
H
 
D
H
 
G
G
 
Q
V
 
Y
Q
 
D
V
 
Y
V
 
V
L
 
L
H
 
N
A
x
L
A
x
S
A
|
A
Y
 
L
K
|
K
H
 
H
V
 
V
P
 
R
L
 
-
V
 
S
E
 
E
A
 
K
N
 
D
P
 
P
L
 
F
P
 
T
-
 
L
-
 
M
-
 
R
G
 
M
L
 
I
A
 
D
N
 
V
N
 
N
V
 
V
F
 
F
G
 
N
T
 
T
Q
 
D
T
 
K
L
 
T
A
 
I
R
 
Q
A
 
Q
A
 
S
A
 
I
R
 
D
S
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
K
R
 
K
F
 
Y
I
 
F
L
 
C
I
x
V
S
 
S
S
 
T
D
|
D
K
 
K
A
 
A
V
 
A
R
 
N
P
 
P
T
 
V
N
 
N
V
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
A
S
 
S
K
|
K
R
 
R
M
 
I
A
 
M
E
 
E
L
 
M
V
 
F
V
 
-
Q
 
-
D
 
-
L
 
L
S
 
M
T
 
R
R
 
K
N
 
S
P
 
E
G
 
E
T
 
I
V
 
A
F
 
I
T
 
S
M
 
T
V
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
A
N
 
N
V
|
V
L
 
A
G
 
F
S
|
S
S
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
L
V
 
L
P
 
H
L
 
G
F
 
F
Q
 
N
E
 
Q
Q
 
R
I
 
I
S
 
Q
R
 
K
G
 
N
G
 
Q
P
 
P
V
 
I
T
 
-
V
 
V
T
 
A
D
 
P
P
 
N
R
 
D
V
 
I
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
M
 
V
T
 
T
I
 
P
R
 
Q
E
 
E
A
 
S
V
 
G
Q
 
E
L
 
L
V
 
C
L
 
L
Q
 
M
A
 
S
G
 
C
A
 
I
E
 
F
A
 
G
L
 
E
G
 
N
G
 
R
E
 
D
V
 
I
F
 
F
V
 
F
L
 
P
D
 
K
M
 
L
G
 
S
E
 
E
P
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
L
I
 
I
S
 
S
I
 
F
L
 
A
Q
 
D
L
 
I
A
 
A
R
 
V
Q
 
K
V
 
Y
I
 
L
E
 
K
S
 
Q
A
 
L
G
 
G
Y
 
Y

3pvzB Udp-n-acetylglucosamine 4,6-dehydratase from vibrio fischeri
27% identity, 36% coverage: 276:496/615 of query aligns to 32:236/300 of 3pvzB

query
sites
3pvzB
L
 
L
V
 
V
S
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
A
G
|
G
S
|
S
I
|
I
G
 
G
S
 
Q
E
 
A
L
 
V
C
 
T
R
 
K
Q
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
K
C
 
R
R
 
N
P
 
P
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
V
 
H
L
 
V
Y
 
V
E
x
D
L
x
I
S
 
S
E
 
E
L
 
N
A
 
N
L
 
M
Y
 
V
T
 
E
I
 
L
H
 
V
Q
 
R
E
 
D
L
 
I
E
 
R
Q
 
S
Q
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
Y
V
 
I
E
 
N
G
 
G
T
 
D
G
 
F
I
 
Q
T
 
T
L
 
F
V
 
A
P
x
L
V
x
D
L
x
I
G
 
G
S
 
S
V
 
I
T
 
E
D
 
Y
P
 
D
R
 
A
Q
 
F
V
 
I
R
 
K
M
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
A
H
 
D
H
 
G
G
 
Q
V
 
Y
Q
 
D
V
 
Y
V
 
V
L
 
L
H
 
N
A
x
L
A
x
S
A
|
A
Y
 
L
K
|
K
H
 
H
V
 
V
P
 
R
L
 
-
V
 
S
E
 
E
A
 
K
N
 
D
P
 
P
L
 
F
P
 
T
-
 
L
-
 
M
-
 
R
G
 
M
L
 
I
A
 
D
N
 
V
N
 
N
V
 
V
F
 
F
G
 
N
T
 
T
Q
 
D
T
 
K
L
 
T
A
 
I
R
 
Q
A
 
Q
A
 
S
A
 
I
R
 
D
S
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
K
R
 
K
F
 
Y
I
 
F
L
 
C
I
 
V
S
 
S
S
 
T
D
|
D
K
 
K
A
 
A
V
 
A
R
 
N
P
 
P
T
 
V
N
 
N
V
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
A
S
 
S
K
|
K
R
 
R
M
 
I
A
 
M
E
 
E
L
 
M
V
 
F
V
 
-
Q
 
-
D
 
-
L
 
L
S
 
M
T
 
R
R
 
K
N
 
S
P
 
E
G
 
E
T
 
I
V
 
A
F
 
I
T
 
S
M
 
T
V
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
A
N
|
N
V
|
V
L
 
A
G
 
F
S
|
S
S
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
Q
 
-
E
 
-
Q
 
R
I
 
I
S
 
Q
R
 
K
G
 
N
G
 
Q
P
 
P
V
 
I
T
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
K
 
-
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
M
 
V
T
 
T
I
 
P
R
 
Q
E
 
E
A
 
S
V
 
G
Q
 
E
L
 
L
V
 
C
L
 
L
Q
 
M
A
 
S
G
 
C
A
 
I
E
 
F
A
 
G
L
 
E
G
 
N
G
 
R
E
 
D
V
 
I
F
 
F

4tqgA Crystal structure of megavirus udp-glcnac 4,6-dehydratase, 5-epimerase mg534 (see paper)
24% identity, 45% coverage: 271:548/615 of query aligns to 4:245/297 of 4tqgA

query
sites
4tqgA
Q
 
N
D
 
D
R
 
K
V
 
T
V
 
I
L
 
M
V
 
I
S
 
F
G
|
G
A
 
G
G
x
S
G
|
G
S
|
S
I
x
L
G
 
G
S
 
N
E
 
R
L
 
L
C
 
I
R
 
E
Q
 
T
V
 
Y
L
 
I
A
 
-
C
 
-
R
 
N
P
 
N
R
 
N
K
 
I
L
 
I
V
 
V
L
 
N
Y
 
Y
E
 
S
L
x
R
S
x
D
E
 
E
L
 
-
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
 
S
I
 
K
H
 
H
Q
 
W
E
 
S
L
 
M
E
 
E
Q
 
L
Q
 
K
V
 
Y
E
 
K
G
 
S
T
 
D
G
 
K
I
 
-
T
 
-
L
 
L
V
 
K
P
 
N
V
 
I
L
 
I
G
 
G
S
x
D
V
x
I
T
 
R
D
 
D
P
 
F
R
 
E
Q
 
K
V
 
V
R
 
Q
M
 
Q
V
 
S
L
 
I
A
 
M
H
 
R
H
 
I
G
 
N
V
 
P
Q
 
D
V
 
I
V
 
I
L
 
I
H
 
I
A
|
A
A
|
A
A
|
A
Y
 
L
K
|
K
H
 
H
V
 
I
P
 
D
L
 
R
V
 
C
E
 
E
A
 
Y
N
 
E
P
 
I
L
 
N
P
 
E
G
 
C
L
 
L
A
 
D
N
 
T
N
 
N
V
 
I
F
 
K
G
 
G
T
 
L
Q
 
Q
T
 
N
L
 
V
A
 
L
R
 
K
A
 
V
-
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
N
-
 
R
A
 
S
A
 
N
R
 
L
S
 
S
G
 
N
V
 
L
E
 
K
R
 
A
F
 
V
I
 
C
L
 
F
I
x
V
S
 
S
S
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
A
V
 
C
R
 
S
P
 
P
T
 
V
N
 
N
V
 
S
M
x
Y
G
 
G
A
 
M
S
 
S
K
|
K
R
 
A
M
 
I
A
 
C
E
 
E
L
 
T
V
 
L
V
 
V
Q
 
V
D
 
E
L
 
K
S
 
S
T
 
K
R
 
Y
N
 
I
P
 
K
G
 
D
T
 
I
V
 
K
F
 
Y
T
 
V
M
 
C
V
 
V
R
 
R
F
x
Y
G
|
G
N
 
N
V
|
V
L
 
L
G
 
N
S
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
Q
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
F
T
 
T
V
 
L
T
 
T
D
 
H
P
 
T
R
 
S
V
 
M
K
 
T
R
 
R
Y
 
F
F
 
I
M
 
M
T
 
T
I
 
L
R
 
D
E
 
D
A
 
S
V
 
V
Q
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
E
Q
 
Y
A
 
A
G
 
I
A
 
I
E
 
N
A
 
G
L
 
N
G
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
I
F
 
V
V
 
I
L
 
P
D
 
K
M
 
L
G
 
N
E
 
S
P
 
-
I
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
-
Q
 
M
L
 
Y
A
 
I
R
 
K
Q
 
D
V
 
M
I
 
I
E
 
E
S
 
L
A
 
F
G
 
A
Y
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
D
D
 
K
H
 
Y
P
 
P
D
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
-
I
 
I
D
 
V
I
 
I
I
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
R
P
 
S
G
 
G
E
 
E
K
 
R
M
 
M
Q
 
Y
E
 
E
E
 
S
L
 
L

Q9LPG6 Trifunctional UDP-glucose 4,6-dehydratase/UDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 3,5-epimerase/UDP-4-keto-L-rhamnose-reductase RHM2; NDP-rhamnose synthase; Protein MUCILAGE-MODIFIED 4; Protein RHAMNOSE BIOSYNTHESIS 2; Rhamnose biosynthetic enzyme 2; AtRHM2; UDP-L-rhamnose synthase MUM4; EC 4.2.1.76; EC 1.1.1.-; EC 5.1.3.- from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
24% identity, 41% coverage: 269:518/615 of query aligns to 5:272/667 of Q9LPG6

query
sites
Q9LPG6
S
 
T
Y
 
Y
Q
 
K
D
 
P
R
 
K
V
 
N
V
 
I
L
 
L
V
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
A
G
|
G
S
 
F
I
 
I
G
 
A
S
 
S
E
 
H
L
 
V
C
 
A
R
 
N
Q
 
R
V
 
L
L
 
I
A
 
R
C
 
N
R
 
Y
P
 
P
R
 
D
-
 
Y
K
|
K
L
 
I
V
 
V
L
 
V
Y
 
-
E
 
-
L
 
L
S
 
D
E
 
K
L
 
L
A
 
D
L
 
Y
Y
 
C
T
 
S
I
 
D
H
 
L
Q
 
K
E
 
N
L
 
L
E
 
D
Q
 
P
Q
 
S
V
 
F
E
 
S
G
 
S
T
 
P
G
 
N
I
 
F
T
 
K
L
 
F
V
 
V
P
 
K
V
 
-
L
 
-
G
 
G
S
 
D
V
 
I
T
 
A
D
 
S
P
 
D
R
 
D
Q
 
L
V
 
V
R
 
N
M
 
Y
V
 
L
L
 
L
A
 
I
H
 
T
H
 
E
G
 
N
V
 
I
Q
 
D
V
 
T
V
 
I
L
 
M
H
 
H
A
 
F
A
 
A
A
 
A
Y
 
Q
K
 
T
H
 
H
V
 
V
P
x
D
L
 
N
V
 
S
E
 
F
A
 
G
N
 
N
P
 
S
L
 
F
P
 
E
G
 
F
L
 
T
A
 
K
N
 
N
N
 
N
V
 
I
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
Q
 
H
T
 
V
L
 
L
A
 
L
R
 
E
A
 
A
A
 
C
A
 
K
R
 
V
S
 
T
G
 
G
-
 
Q
V
 
I
E
 
R
R
 
R
F
 
F
I
 
I
L
 
H
I
 
V
S
 
S
S
 
T
D
 
D
K
 
E
A
 
V
-
 
Y
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
N
-
 
H
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
Q
V
 
L
R
 
L
P
 
P
T
 
T
N
 
N
V
 
P
M
 
Y
G
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
R
 
A
M
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
M
V
 
L
V
 
V
Q
 
M
D
 
A
L
 
Y
S
 
G
T
 
-
R
 
R
N
 
S
P
 
Y
G
 
G
T
 
L
V
 
P
F
 
V
T
 
I
M
 
T
V
 
T
R
 
R
F
 
G
G
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
Y
G
|
G
S
 
P
S
 
N
-
 
Q
-
 
F
-
 
P
G
 
E
S
 
K
V
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
K
F
 
F
Q
 
I
E
 
L
Q
 
L
I
 
A
S
 
M
R
 
S
G
 
G
G
 
K
P
 
P
V
 
L
T
 
P
V
 
I
-
 
H
-
 
G
-
 
D
-
 
G
T
 
S
D
 
N
P
 
V
R
 
R
V
 
S
K
 
Y
R
 
L
Y
 
Y
F
 
C
M
 
E
T
 
D
I
 
V
R
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
F
Q
 
E
L
 
V
V
 
V
L
 
L
Q
 
H
A
 
K
G
 
G
A
 
E
E
 
I
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
G
E
 
H
V
 
V
F
 
Y
V
 
N
L
 
V
D
 
G
M
 
T
G
 
K
E
 
R
P
 
E
I
 
R
S
 
R
I
 
V
L
 
I
Q
 
D
L
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
D
V
 
I
I
 
C
E
 
K
S
 
L
A
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4zrnA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (tm0509) with udp-glucose from hyperthermophilic eubacterium thermotoga maritima (see paper)
23% identity, 45% coverage: 275:551/615 of query aligns to 3:300/309 of 4zrnA

query
sites
4zrnA
V
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
G
|
G
S
x
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
E
 
H
L
 
V
C
 
V
R
 
D
Q
 
K
V
 
L
L
 
I
A
 
E
C
 
N
R
 
G
P
 
Y
R
 
G
K
 
V
L
 
I
V
 
V
L
 
V
Y
x
D
E
x
N
L
 
L
S
|
S
E
x
S
L
 
-
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
H
 
-
Q
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
Q
x
G
Q
 
K
V
 
V
E
 
E
G
 
N
T
 
L
G
 
N
I
 
R
T
 
N
L
 
A
V
 
L
P
 
F
V
 
Y
L
 
E
G
 
Q
S
|
S
V
x
I
T
 
E
D
 
D
P
 
E
R
 
E
Q
 
M
V
 
M
R
 
E
M
 
R
V
 
I
L
 
F
A
 
S
H
 
L
H
 
H
G
 
R
V
 
P
Q
 
E
V
 
Y
V
 
V
L
 
F
H
 
H
A
x
L
A
|
A
A
|
A
Y
 
Q
K
 
A
H
 
S
V
 
V
P
 
A
L
 
I
V
 
S
E
 
V
A
 
R
N
 
E
P
 
P
L
 
A
P
 
R
G
 
D
L
 
A
A
 
K
N
x
T
N
 
N
V
 
I
F
 
I
G
 
G
T
 
S
Q
 
L
T
 
V
L
 
L
A
 
L
R
 
E
A
 
K
A
 
S
A
 
I
R
 
K
S
 
Y
G
 
G
V
 
V
E
 
K
R
 
K
F
 
F
I
 
I
L
 
F
I
x
S
S
|
S
S
x
T
D
 
G
K
x
G
A
|
A
V
 
I
R
 
Y
P
 
G
T
 
E
N
 
N
V
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
F
-
 
P
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
I
-
 
S
-
 
P
M
x
Y
G
 
G
A
 
I
S
 
A
K
|
K
R
 
Y
M
 
S
A
 
T
E
 
E
L
 
M
V
 
Y
V
 
L
Q
 
E
D
 
-
L
 
F
S
 
F
T
 
A
R
 
R
N
 
E
P
 
Y
G
 
G
T
 
L
V
 
K
F
 
Y
T
 
T
M
 
V
V
 
L
R
 
R
F
x
Y
G
 
A
N
|
N
V
|
V
L
 
Y
G
 
G
-
 
P
-
 
R
-
 
Q
-
 
D
-
 
P
-
x
Y
S
 
G
S
 
E
G
 
A
S
x
G
V
|
V
V
 
V
P
 
A
L
 
I
F
 
F
Q
 
T
E
 
E
Q
 
R
I
 
M
S
 
L
R
 
R
G
 
G
G
 
E
P
 
E
V
 
V
T
x
H
V
 
I
T
x
F
-
 
G
D
 
D
P
 
G
R
 
E
V
x
Y
K
 
V
R
|
R
Y
 
D
F
 
Y
M
 
V
T
 
Y
I
 
V
R
 
D
E
 
D
A
 
V
V
 
V
Q
 
R
L
 
A
V
 
N
L
 
L
Q
 
L
A
 
A
G
 
-
A
 
M
E
 
E
A
 
K
L
 
G
G
 
D
G
 
N
E
 
E
V
 
V
F
 
F
V
 
N
L
 
I
D
 
G
M
 
T
G
 
G
E
 
R
P
 
G
I
 
T
S
 
T
I
x
V
L
 
N
Q
 
Q
L
 
L
A
 
F
R
 
K
Q
 
L
V
 
L
I
 
K
E
 
E
S
 
I
A
 
T
G
 
G
Y
 
Y
S
 
D
V
 
K
R
 
E
D
 
P
E
 
V
D
 
Y
H
 
K
P
 
P
-
 
P
-
x
R
D
 
K
G
 
G
D
|
D
I
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
S
-
 
I
-
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
T
-
 
K
A
 
A
I
 
K
D
 
E
I
 
K
I
 
L
G
 
G
L
 
W
R
 
E
P
 
P
G
 
K
E
 
V
K
 
S
M
 
L
Q
 
E
E
 
E
E
 
G
L
 
L
T
 
K
L
 
L
S
 
T

7k3pA The structure of the udp-glc/glcnac 4-epimerase from the human pathogen campylobacter jejuni
27% identity, 28% coverage: 275:444/615 of query aligns to 4:181/329 of 7k3pA

query
sites
7k3pA
V
 
I
L
 
L
V
 
I
S
 
S
G
|
G
A
 
G
G
 
A
G
|
G
S
x
Y
I
|
I
G
 
G
S
 
S
E
 
H
L
 
T
C
 
L
R
 
R
Q
 
Q
V
 
F
L
 
L
A
 
K
C
 
T
R
 
D
P
 
H
R
 
E
K
 
I
L
 
C
V
 
V
L
 
L
Y
x
D
E
x
N
L
 
L
S
|
S
-
 
K
-
x
G
-
 
S
-
 
K
-
 
I
-
 
A
-
 
I
-
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
A
Y
 
T
T
 
R
I
 
A
H
 
F
Q
 
K
E
 
F
L
 
F
E
 
E
Q
 
Q
Q
x
D
V
x
L
E
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
T
 
S
D
 
D
P
 
F
R
 
Q
Q
 
G
V
 
V
R
 
K
M
 
A
V
 
L
L
 
F
A
 
E
H
 
R
H
 
E
G
 
K
V
 
F
Q
 
D
V
 
A
V
 
I
L
 
V
H
 
H
A
x
F
A
|
A
A
 
A
Y
 
S
K
x
I
H
 
E
V
 
V
P
 
F
L
 
E
V
 
S
E
 
M
A
 
Q
N
 
N
P
 
P
L
 
L
P
 
K
G
 
Y
L
 
Y
A
 
M
N
|
N
N
 
N
V
 
T
F
 
V
G
 
N
T
 
T
Q
 
T
T
 
N
L
 
L
A
 
I
R
 
E
A
 
T
A
 
C
A
 
L
R
 
Q
S
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
N
R
 
K
F
 
F
I
 
I
L
 
F
-
 
S
-
 
S
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
Y
-
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
V
I
 
V
S
 
S
S
 
E
D
 
T
K
 
S
A
 
P
V
 
L
R
 
A
P
 
P
T
 
I
N
 
N
V
 
P
M
x
Y
G
 
G
A
 
R
S
 
S
K
|
K
R
 
L
M
 
M
A
 
S
E
 
E
L
 
E
V
 
V
V
 
L
Q
 
R
D
 
D
L
 
A
S
 
S
T
 
M
R
 
A
N
 
N
P
 
P
G
 
E
T
 
F
V
 
K
F
 
H
T
 
C
M
 
I
V
 
L
R
 
R
F
x
Y
G
 
F
N
|
N
V
|
V
L
 
A
G
 
G
S
 
A

Query Sequence

>GFF3914 FitnessBrowser__Phaeo:GFF3914
MISGAISGHIKRPPQVYAVTGDWKWGRPGMFNLISALSRKQKSYIFLTIDLGLIPLALLL
TFLVQPLPGSALATLAAMLPVLPYVLAVSAGVALWLGLPPGTHVVFATTYFLCLLAARAV
LYQVVVAIYRRAQPRCRVLIYGAGTTGAQLAQALKAHDGIDPVAFVDDNTSLQGVTLVGL
PVFPPARIAEIAEARQIKRVLLAMPSQSQPKQAQIIQRLQRMQLEVQALPSFAQLIGEEA
LVDKLTPVAPQNFLGRATRDVPLQEASGSYQDRVVLVSGAGGSIGSELCRQVLACRPRKL
VLYELSELALYTIHQELEQQVEGTGITLVPVLGSVTDPRQVRMVLAHHGVQVVLHAAAYK
HVPLVEANPLPGLANNVFGTQTLARAAARSGVERFILISSDKAVRPTNVMGASKRMAELV
VQDLSTRNPGTVFTMVRFGNVLGSSGSVVPLFQEQISRGGPVTVTDPRVKRYFMTIREAV
QLVLQAGAEALGGEVFVLDMGEPISILQLARQVIESAGYSVRDEDHPDGDIAIDIIGLRP
GEKMQEELTLSSDLITTRHQKIFCAREAVLSEIEVATLIRGLRQAVAAGDEGVARALIKR
WVEGYRAPEEDRKTS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory