SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing GFF849 FitnessBrowser__psRCH2:GFF849 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1llsA Crystal structure of unliganded maltose binding protein with xenon (see paper)
58% identity, 93% coverage: 27:395/395 of query aligns to 2:370/370 of 1llsA

query
sites
1llsA
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
 
D
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
x
F
W
 
W
A
 
A
H
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
D
A
 
K
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
 
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
 
E
T
 
P
Y
 
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
E
D
 
N
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
 
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
K
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
|
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
 
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
K
 
T
R
 
R
I
 
I
T
 
T
R
 
K

1ez9B Structure of maltotetraitol bound to open-form maltodextrin binding protein in p1 crystal form (see paper)
58% identity, 93% coverage: 27:395/395 of query aligns to 2:370/370 of 1ez9B

query
sites
1ez9B
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
 
D
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
 
W
A
 
A
H
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
D
A
 
K
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
|
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
E
D
 
N
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
|
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
|
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
K
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
x
Y
S
 
A
M
 
V
A
x
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
K
 
T
R
 
R
I
 
I
T
 
T
R
 
K

4xajB Crystal structure of human nr2e1/tlx (see paper)
58% identity, 93% coverage: 24:389/395 of query aligns to 1:366/570 of 4xajB

query
sites
4xajB
L
 
M
A
 
A
A
 
K
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
D
A
 
K
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
E
D
 
N
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
 
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
K
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
 
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
D
 
D
A
 
A

3jyrA Crystal structures of the gach receptor of streptomyces glaucescens gla.O in the unliganded form and in complex with acarbose and an acarbose homolog. Comparison with acarbose-loaded maltose binding protein of salmonella typhimurium. (see paper)
58% identity, 93% coverage: 27:395/395 of query aligns to 2:370/370 of 3jyrA

query
sites
3jyrA
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
Q
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
x
E
D
x
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
V
T
 
T
P
 
P
S
 
D
A
 
K
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
F
A
 
E
D
 
N
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
I
D
 
D
L
 
M
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
N
M
 
M
P
 
S
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
|
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
K
S
 
S
G
 
K
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
L
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
K
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
F
M
 
Q
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
D
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
x
Y
S
 
A
M
 
V
A
x
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
K
 
S
R
 
R
I
 
I
T
 
T
R
 
K

6k7fA Crystal structure of mbpholo-tim21 fusion protein with a 17-residue helical linker (see paper)
58% identity, 93% coverage: 27:393/395 of query aligns to 3:369/499 of 6k7fA

query
sites
6k7fA
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
D
A
 
K
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
E
D
 
N
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
|
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
K
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
V
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
K
 
T
R
 
R
I
 
I

5z0rB Structural insight into the zika virus capsid encapsulating the viral genome (see paper)
58% identity, 93% coverage: 27:394/395 of query aligns to 3:370/445 of 5z0rB

query
sites
5z0rB
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
D
A
 
K
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
 
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
E
D
 
N
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
 
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
K
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
K
 
T
R
 
R
I
 
I
T
 
T

6m4wA Crystal structure of mbp fused split fkbp-frb t2098l mutant in complex with rapamycin (see paper)
59% identity, 92% coverage: 27:389/395 of query aligns to 3:365/403 of 6m4wA

query
sites
6m4wA
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
 
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
A
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
A
D
x
A
G
 
G
G
x
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
|
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
A
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
D
 
D
A
 
A

7wr3A Crystal structure of mbp-fused ospc3 in complex with calmodulin (see paper)
59% identity, 90% coverage: 27:383/395 of query aligns to 2:358/794 of 7wr3A

query
sites
7wr3A
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
A
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
|
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
A
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D

Sites not aligning to the query:

5tj2D Gasdermin-b c-terminal domain containing the polymorphism residues gly299:ser306 fused to maltose binding protein
59% identity, 90% coverage: 27:383/395 of query aligns to 2:358/528 of 5tj2D

query
sites
5tj2D
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
 
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
A
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
|
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
 
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
A
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
 
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D

5tj4E Gasdermin-b c-terminal domain containing the polymorphism residues gly299:pro306 fused to maltose binding protein (see paper)
59% identity, 90% coverage: 27:383/395 of query aligns to 2:358/556 of 5tj4E

query
sites
5tj4E
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
 
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
 
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
A
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
|
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
A
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D

6pfoA Crystal structure of n-glycosylated human calcitonin receptor extracellular domain in complex with salmon calcitonin (16-32) (see paper)
58% identity, 93% coverage: 24:389/395 of query aligns to 1:366/474 of 6pfoA

query
sites
6pfoA
L
 
M
A
 
A
A
 
K
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
x
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
D
A
 
K
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
|
Y
D
x
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
E
D
 
N
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
|
D
V
x
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
 
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
K
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
|
P
E
x
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
K
D
 
D
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3ob4A Mbp-fusion protein of the major peanut allergen ara h 2 (see paper)
59% identity, 90% coverage: 27:383/395 of query aligns to 2:358/474 of 3ob4A

query
sites
3ob4A
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
x
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
A
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
 
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
|
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
A
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
x
Y
S
 
A
M
 
V
A
x
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D

3vd8A Crystal structure of human aim2 pyd domain with mbp fusion (see paper)
59% identity, 90% coverage: 27:383/395 of query aligns to 2:358/467 of 3vd8A

query
sites
3vd8A
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
x
K
A
 
L
T
x
E
D
x
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
A
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
|
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
A
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
x
Y
S
 
A
M
 
V
A
x
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D

6sjvA Structure of hpv18 e6 oncoprotein in complex with mutant e6ap lxxll motif
59% identity, 90% coverage: 27:383/395 of query aligns to 2:358/529 of 6sjvA

query
sites
6sjvA
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
A
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
E
D
 
N
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
|
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
A
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D

Sites not aligning to the query:

7cy6A Crystal structure of cmd1 in complex with 5mc-DNA (see paper)
59% identity, 90% coverage: 27:383/395 of query aligns to 1:357/872 of 7cy6A

query
sites
7cy6A
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
 
D
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
 
W
A
 
A
H
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
A
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
 
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
 
E
T
 
P
Y
 
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
 
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
A
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
 
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D

Sites not aligning to the query:

8c5lB Nr2f6 ligand binding domain in complex with nsd1 peptide
59% identity, 90% coverage: 27:383/395 of query aligns to 3:359/557 of 8c5lB

query
sites
8c5lB
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
A
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
|
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
A
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D

Sites not aligning to the query:

4ikmA X-ray structure of card8 card domain (see paper)
59% identity, 90% coverage: 27:383/395 of query aligns to 3:359/463 of 4ikmA

query
sites
4ikmA
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
A
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
 
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
A
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D

5h7qA Crystal structure of human mnda pyd domain with mbp tag (see paper)
59% identity, 90% coverage: 27:383/395 of query aligns to 2:358/469 of 5h7qA

query
sites
5h7qA
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
A
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
|
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
|
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
A
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D

5t05B Crystal structure of heparan sulfate 6-o-sulfotransferase with bound pap and idoa2s containing hexasaccharide substrate (see paper)
59% identity, 90% coverage: 27:383/395 of query aligns to 1:357/677 of 5t05B

query
sites
5t05B
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
x
K
A
 
L
T
x
E
D
x
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
A
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
|
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
A
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
x
Y
S
 
A
M
 
V
A
x
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D

Sites not aligning to the query:

4irlB X-ray structure of the card domain of zebrafish gbp-nlrp1 like protein (see paper)
59% identity, 90% coverage: 27:383/395 of query aligns to 3:359/463 of 4irlB

query
sites
4irlB
I
 
I
E
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
I
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
G
D
|
D
K
|
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
S
 
K
A
 
L
T
x
E
D
x
E
K
 
K
F
 
F
Q
 
P
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
I
I
 
F
W
|
W
A
 
A
H
 
H
D
|
D
R
|
R
I
 
F
G
 
G
E
 
G
W
 
Y
A
 
A
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
P
 
E
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
A
 
A
D
 
A
T
 
F
K
 
Q
S
 
D
G
 
K
I
 
L
A
 
Y
D
 
P
F
 
F
S
 
T
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
R
Y
 
Y
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
L
W
 
I
G
 
A
Y
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
A
V
 
V
E
|
E
T
 
A
I
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
N
P
 
P
P
 
P
K
 
K
T
 
T
F
 
W
D
 
E
D
 
E
V
 
I
M
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
D
E
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
M
W
 
F
D
 
N
Y
 
L
N
 
Q
N
x
E
T
x
P
Y
|
Y
F
 
F
T
 
T
W
 
W
P
 
P
L
 
L
L
 
I
S
 
A
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
Y
A
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
K
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
D
T
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
Q
 
T
V
 
F
L
 
L
R
 
V
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
K
K
 
N
G
 
K
V
 
H
M
 
M
P
 
N
K
 
A
G
 
D
A
 
T
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
F
N
 
N
K
 
K
G
 
G
D
 
E
S
 
T
A
 
A
M
 
M
M
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
G
P
 
P
W
|
W
A
 
A
W
 
W
S
 
S
N
 
N
I
 
I
E
 
D
K
 
T
S
 
S
G
 
A
I
 
V
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
I
 
L
P
 
P
A
 
T
I
 
F
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
S
K
 
K
P
 
P
F
 
F
V
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
G
L
 
I
N
 
N
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
P
N
 
N
K
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
V
 
D
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
K
A
 
S
Y
 
Y
M
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
A
A
 
A
T
 
T
F
 
M
E
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
M
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
I
M
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
W
|
W
S
 
Y
S
 
A
M
 
V
A
x
R
A
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
I
N
 
N
I
 
A
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
D
 
T
V
 
V
D
 
D

Query Sequence

>GFF849 FitnessBrowser__psRCH2:GFF849
MNKKFWCIATVGLAATFSLPLPALAAIEEGKLVVWINGDKGYKGLAEVGKKFTAETGIPV
EVAHPDSATDKFQQAAATGNGPDIFIWAHDRIGEWAKSGLLTPVTPSADTKSGIADFSWQ
AVTYDNKLWGYPISVETIGLIYNKALVDTPPKTFDDVMALNEKLAAQGKRAILWDYNNTY
FTWPLLSAKGGYVFEHADGGYDVKSTGVNNAGAKAGAQVLRDLIDKGVMPKGADYSVAEA
AFNKGDSAMMISGPWAWSNIEKSGIDFGVAPIPAIDGEPGKPFVGVAAALLNAASPNKDL
AVEFLENYLLQVEGLKTVNADVPLGAVANTAYMEELSANPHIKATFENAQMGEPMPNVPE
MGAFWSSMAAALTNITSGRQDVDAALDDAAKRITR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory