SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_1581 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_1581 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P21543 Beta/alpha-amylase; EC 3.2.1.2; EC 3.2.1.1 from Paenibacillus polymyxa (Bacillus polymyxa) (see paper)
28% identity, 94% coverage: 23:589/604 of query aligns to 737:1186/1196 of P21543

query
sites
P21543
P
 
P
A
 
T
E
 
S
L
 
L
R
 
N
A
 
T
R
 
D
A
 
W
A
 
S
E
 
K
T
 
-
E
 
Q
V
 
S
L
 
I
Y
 
Y
F
 
F
L
 
I
L
 
M
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
S
N
 
N
G
 
G
D
 
D
P
 
P
S
 
S
N
 
N
D
 
D
R
 
N
-
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
F
R
 
N
G
 
S
D
 
N
R
 
N
L
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
F
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
S
H
 
D
K
 
Q
G
 
R
F
 
K
F
 
W
H
 
H
G
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
F
K
 
Q
G
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
Q
 
K
S
 
N
L
 
M
G
 
G
A
 
F
S
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
L
 
I
G
 
T
P
 
P
I
 
V
Y
 
T
K
 
M
N
 
Q
K
 
K
P
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
E
 
S
T
 
E
A
 
Y
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
W
 
H
I
 
T
T
 
Y
D
 
D
F
 
F
T
 
Y
R
 
A
V
 
V
D
 
D
P
 
G
H
 
H
F
 
L
G
 
G
T
 
T
N
 
M
D
 
D
E
 
K
M
 
L
K
 
Q
A
 
E
F
 
L
V
 
V
D
 
R
A
 
K
A
 
A
H
 
H
A
 
D
R
 
K
G
 
N
I
 
I
K
 
A
V
 
V
Y
 
M
L
 
V
D
 
D
I
 
V
I
 
V
T
 
V
N
 
N
H
 
H
T
 
T
A
 
G
D
 
D
V
 
F
I
 
Q
Q
 
P
Y
 
G
R
 
N
E
 
G
C
 
F
P
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
P
C
 
F
D
 
D
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
K
A
 
A
D
 
D
Y
 
W
P
 
-
Y
 
Y
Q
 
H
R
 
H
K
 
N
G
 
G
G
 
D
V
 
I
K
 
T
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
D
G
 
G
V
 
D
Q
 
Y
T
 
N
P
 
S
E
 
N
N
 
N
F
 
Q
A
 
W
K
 
K
L
 
I
S
 
E
D
 
N
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
K
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
I
 
-
H
 
-
Y
 
-
H
 
-
N
 
-
R
 
-
G
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
-
F
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
T
 
-
M
 
-
G
 
G
D
 
D
F
 
V
V
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
D
 
D
L
 
L
M
 
N
T
 
H
E
 
E
S
 
N
P
 
P
R
 
A
V
 
T
L
 
A
Q
 
N
G
 
E
F
 
L
I
 
K
D
 
N
I
 
W
Y
 
I
G
 
K
A
 
W
W
 
L
I
 
L
D
 
N
Q
 
E
F
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
F
 
L
R
 
R
I
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
V
R
 
K
H
 
H
V
 
V
N
 
P
P
 
K
E
 
G
F
 
F
W
 
L
Q
 
K
G
 
D
F
 
F
S
 
D
K
 
Q
A
 
A
M
 
A
I
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
N
 
N
F
 
T
H
 
F
I
 
T
F
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
F
N
 
-
E
 
H
G
 
G
D
 
D
V
 
P
G
 
A
D
 
Y
L
 
V
A
 
G
L
 
D
H
 
Y
T
 
T
R
 
R
V
 
Y
H
 
-
Q
 
-
L
 
L
P
 
D
S
 
A
V
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
P
F
 
M
R
 
Y
A
 
Y
A
 
T
V
 
I
Q
 
K
H
 
D
T
 
V
V
 
F
A
 
G
G
 
H
E
 
D
K
 
Q
G
 
S
P
 
M
D
 
R
M
 
K
L
 
I
A
 
K
A
 
D
M
 
R
F
 
Y
D
 
S
R
 
D
D
 
D
A
 
R
L
 
Y
Y
 
Y
E
 
R
G
 
D
G
 
A
A
 
Q
E
 
T
A
 
N
A
 
G
L
 
V
R
 
-
L
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
 
H
D
 
D
H
 
V
G
 
K
R
 
R
F
 
F
S
 
L
T
 
N
D
 
D
V
 
A
R
 
S
K
 
G
A
 
K
F
 
-
P
 
P
K
 
G
A
 
A
S
 
N
D
 
Y
D
 
D
E
 
K
V
 
-
L
 
W
A
 
P
R
 
Q
V
 
L
K
 
K
L
 
A
A
 
A
H
 
L
A
 
G
M
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
I
P
 
P
T
 
I
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Q
G
 
G
D
 
T
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
F
 
Y
V
 
-
S
 
S
D
 
G
G
 
G
N
 
D
D
 
D
Q
 
P
D
 
A
A
 
N
R
 
R
E
 
E
D
 
N
M
 
M
F
 
-
P
 
-
S
 
-
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
N
F
 
F
D
 
N
T
 
A
G
 
N
H
 
H
P
 
D
L
 
L
Y
 
Y
M
 
Q
E
 
Y
I
 
I
S
 
A
K
 
K
L
 
L
S
 
N
A
 
Y
I
 
V
R
 
R
K
 
N
A
 
N
T
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
R
 
N
G
 
G
R
 
S
Q
 
Q
V
 
R
T
 
E
R
 
K
A
 
W
Y
 
V
D
 
D
E
 
D
K
 
S
P
 
F
G
 
Y
L
 
S
F
 
F
A
 
Q
V
 
R
S
 
S
R
 
K
F
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
N
G
 
G
A
 
D
E
 
E
V
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
F
F
 
I
N
 
N
T
 
N
S
 
S
A
 
W
A
 
N
P
 
S
I
 
Q
T
 
T
R
 
R
Q
 
T
V
 
I
E
 
G
V
 
N
G
 
F
V
 
D
S
 
N
S
 
L
T
 
S
A
 
N
F
 
G
A
 
T
P
 
R
L
 
L
V
 
T
G
 
N
Q
 
Q
C
 
L
A
 
S
A
 
N
S
 
D
A
 
S
S
 
V
A
 
Q
-
 
I
-
 
N
P
 
N
G
 
G
S
 
S
V
 
I
T
 
T
V
 
V
T
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6wniA Crystal structure of clda, the first cyclomaltodextrin glucanotransferase with a three-domain abc distribution
29% identity, 88% coverage: 30:563/604 of query aligns to 1:447/494 of 6wniA

query
sites
6wniA
A
 
A
A
 
P
E
 
K
T
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
V
L
 
M
P
 
V
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
Y
N
|
N
G
 
G
D
|
D
P
 
P
S
 
S
N
|
N
D
|
D
R
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
D
D
 
P
R
 
E
L
 
V
T
 
S
T
 
K
G
 
G
-
 
M
F
 
F
D
 
D
P
 
P
A
 
T
H
 
H
K
 
T
G
 
N
F
 
W
-
 
R
-
 
M
F
 
Y
H
 
W
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
L
I
 
T
R
 
E
R
 
K
L
 
I
D
 
P
Y
 
Y
I
 
I
Q
 
K
S
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
L
 
I
G
 
S
P
 
P
I
 
V
Y
 
V
K
x
D
N
|
N
-
 
I
-
x
N
K
 
K
P
 
P
V
 
A
Q
 
V
G
 
Y
G
 
N
P
 
-
G
 
G
Q
 
E
E
 
I
T
 
N
A
 
A
G
 
P
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
R
V
 
V
D
x
E
P
x
E
H
 
H
F
 
F
G
 
G
T
 
T
N
 
W
D
 
E
E
 
D
M
 
F
K
 
D
A
 
N
F
 
F
V
 
V
D
 
K
A
 
V
A
 
A
H
 
H
A
 
E
R
 
N
G
 
G
I
 
I
K
 
K
V
 
V
Y
 
I
L
 
L
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
 
H
T
 
T
A
 
-
D
 
-
V
 
-
I
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
S
R
 
P
A
 
A
D
 
D
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
E
I
 
E
N
 
N
P
 
P
G
 
D
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
A
Q
 
L
T
 
Y
P
 
D
E
 
D
N
 
-
F
 
-
A
 
G
K
 
K
L
 
L
S
 
-
D
 
-
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
K
 
-
V
 
L
P
 
G
A
 
T
W
 
Y
L
 
S
N
 
N
D
 
D
P
 
S
I
 
L
H
 
K
-
 
L
Y
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
N
G
 
G
N
 
S
T
 
I
T
 
S
F
 
N
R
 
W
N
 
N
E
 
N
S
 
L
S
 
K
T
 
E
M
 
L
G
x
Q
D
 
D
-
 
K
-
 
N
F
 
L
V
 
F
G
 
D
L
 
L
D
 
A
D
|
D
L
 
L
M
 
D
T
 
Q
E
 
S
S
 
N
P
 
P
R
 
I
V
 
V
L
 
D
Q
 
K
G
 
Y
F
 
L
I
 
K
D
 
D
I
 
S
Y
 
I
G
 
K
A
 
L
W
 
W
I
 
F
D
 
N
Q
 
H
F
 
-
G
 
E
I
 
I
D
 
D
G
 
G
F
 
V
R
|
R
I
 
L
D
|
D
T
 
A
A
 
A
R
 
K
H
|
H
V
 
M
N
 
P
P
 
M
E
 
E
F
 
W
W
 
V
Q
 
K
G
 
S
F
 
F
S
 
A
K
 
N
A
 
T
M
 
I
I
 
Y
E
 
S
R
 
I
A
 
K
K
 
K
A
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
N
 
D
F
 
V
H
 
L
I
 
L
F
 
F
G
 
G
E
|
E
V
 
W
A
 
M
N
 
L
E
 
S
G
 
G
D
 
P
V
 
T
G
 
D
D
 
P
L
 
L
A
 
Y
L
 
G
H
 
Y
T
 
N
R
 
I
V
 
Q
H
 
F
Q
 
A
L
 
N
P
 
T
-
 
T
-
 
G
-
 
F
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
M
F
 
L
R
 
N
A
 
G
A
 
A
V
 
I
Q
 
R
H
 
D
T
 
V
V
 
F
A
 
G
G
 
K
E
 
G
K
 
Y
G
 
G
P
 
F
D
 
E
M
 
R
L
 
L
A
 
N
-
 
D
A
 
T
M
 
L
F
 
E
D
 
D
R
 
T
D
 
N
A
 
K
L
 
D
Y
 
Y
E
 
E
G
 
N
G
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
P
L
 
Y
R
 
K
L
 
L
P
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
P
R
 
R
F
 
F
S
 
L
T
 
S
D
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
L
S
 
N
D
 
N
D
 
D
E
 
K
V
 
-
L
 
-
A
 
D
R
 
K
V
 
L
K
 
H
L
 
E
A
 
A
H
 
I
A
 
A
M
 
F
L
 
I
L
 
M
L
 
T
L
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
I
P
 
P
T
 
V
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
T
E
 
E
Q
 
Q
G
 
Y
F
 
L
V
 
H
S
 
N
D
 
D
-
 
T
-
 
N
-
 
G
G
 
G
N
 
N
D
 
D
Q
 
P
D
 
Y
A
 
N
R
 
R
E
 
P
D
 
M
M
 
M
F
 
-
P
 
-
S
 
-
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
E
N
 
K
F
 
F
D
 
D
T
 
E
G
 
S
H
 
T
P
 
K
L
 
A
Y
 
Y
M
 
T
E
 
L
I
 
I
S
 
K
K
 
E
L
 
L
S
 
S
A
 
R
I
 
L
R
 
R
K
 
Q
A
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
R
 
Y
G
 
G
R
 
T
Q
 
T
V
 
T
T
 
A
R
 
R
A
 
Y
Y
 
V
D
 
S
E
 
D
K
 
D
P
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
V
 
V
S
 
Y
R
 
I
F
 
Y
D
 
E
P
 
R
A
 
Q
S
 
Y
G
 
G
A
 
K
E
 
D
-
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
I
N
 
N
T
 
K
S
 
G
A
 
E
A
 
K
P
 
T
I
 
T
T
 
V
R
 
K
Q
 
T
V
 
V
E
 
K
V
 
T
G
 
S
V
 
L

6saoA Structural and functional characterisation of three novel fungal amylases with enhanced stability and ph tolerance (see paper)
25% identity, 94% coverage: 21:589/604 of query aligns to 1:427/438 of 6saoA

query
sites
6saoA
A
 
A
A
 
A
P
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
W
R
 
K
A
 
S
R
 
R
A
 
S
A
 
-
E
 
-
T
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
L
L
 
V
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
G
N
 
R
G
 
S
D
 
D
P
 
G
S
 
S
N
 
T
D
 
S
R
 
A
G
 
C
G
 
G
L
 
D
R
 
L
G
 
S
D
 
N
R
 
-
L
 
-
T
 
-
T
 
-
G
 
-
F
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
-
F
 
Y
H
 
C
G
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
Y
K
 
K
G
 
G
L
 
I
I
 
Q
R
 
N
R
 
Q
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
Q
 
A
S
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
F
S
 
D
A
 
A
I
 
I
W
 
W
L
 
I
G
 
S
P
 
P
I
 
I
Y
 
-
K
 
-
N
 
-
K
 
-
P
 
-
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
P
G
 
E
Q
 
N
E
 
T
T
 
D
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
H
|
H
G
 
G
Y
|
Y
W
|
W
I
 
A
T
 
K
D
 
D
F
 
F
T
 
E
R
 
K
V
 
L
D
 
N
P
 
T
H
 
N
F
 
F
G
 
G
T
 
S
N
 
A
D
 
D
E
 
D
M
 
L
K
 
K
A
 
A
F
 
L
V
 
V
D
 
T
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
G
R
 
K
G
 
G
I
 
M
K
 
Y
V
 
V
Y
 
M
L
 
L
D
 
D
I
 
V
I
 
V
T
 
A
N
|
N
H
|
H
T
 
A
A
 
G
D
 
-
V
 
-
I
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
P
K
 
A
S
 
S
A
 
G
C
 
G
D
 
D
Y
 
Y
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
S
N
 
G
F
 
F
A
 
T
K
 
F
L
 
S
S
 
S
D
 
A
P
 
S
N
 
N
Y
 
Y
A
 
H
Y
 
P
T
 
Q
T
 
C
V
 
T
V
 
I
P
 
D
E
 
Y
A
 
D
E
 
N
R
 
Q
T
 
T
V
 
S
K
 
V
V
x
E
P
 
Q
A
 
C
W
 
W
L
 
V
N
x
A
D
 
D
P
 
D
I
 
-
H
 
-
Y
 
-
H
 
-
N
 
-
R
 
-
G
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
-
F
 
-
R
 
-
N
 
-
E
 
-
S
 
-
S
 
-
T
 
-
M
 
-
G
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
L
D
 
P
D
|
D
L
 
I
M
 
N
T
 
T
E
 
E
S
 
D
P
 
D
R
 
T
V
 
I
L
 
V
Q
 
S
G
 
K
F
 
L
I
 
H
D
 
S
I
 
I
Y
 
V
G
 
S
A
 
D
W
 
W
I
 
V
D
 
T
Q
 
T
F
 
Y
G
 
D
I
 
F
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
 
R
I
 
I
D
|
D
T
|
T
A
 
V
R
x
K
H
|
H
V
 
I
N
 
R
P
 
K
E
 
D
F
 
F
W
 
W
Q
 
S
G
 
G
F
 
Y
S
 
E
K
 
E
A
 
A
M
 
A
I
 
G
E
 
V
R
 
F
A
 
A
K
 
T
A
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
N
 
-
F
 
-
H
 
-
I
 
-
F
 
-
G
 
G
E
|
E
V
 
V
A
x
F
N
 
-
E
x
D
G
|
G
D
 
D
V
 
A
G
 
A
D
 
Y
L
 
V
A
 
G
L
 
P
H
 
Y
T
 
Q
R
 
-
V
 
-
H
 
D
Q
 
Q
L
 
L
P
 
S
S
 
S
V
 
L
L
 
I
D
 
N
F
 
Y
G
 
P
F
 
L
R
 
Y
A
x
Y
A
 
A
V
 
I
Q
 
R
H
 
D
T
 
V
V
 
F
A
 
S
G
 
A
E
 
G
K
 
S
G
 
G
P
 
F
D
 
S
M
 
R
L
 
I
A
 
S
A
 
D
M
 
M
F
 
L
D
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
S
L
 
T
Y
 
I
E
 
K
G
 
S
G
 
N
A
 
F
E
 
K
A
 
D
A
 
P
L
 
S
R
 
V
L
 
L
P
 
T
T
 
T
F
 
F
I
 
V
S
 
D
N
 
N
H
x
Q
D
|
D
H
 
N
G
 
A
R
 
R
F
 
F
S
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
F
 
L
P
 
S
K
 
V
A
 
K
S
 
S
D
 
D
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
M
A
 
S
R
 
L
V
 
Y
K
 
K
L
 
N
A
 
A
H
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
T
L
 
I
L
 
L
L
 
T
R
 
E
G
 
G
V
 
I
P
 
P
T
 
V
I
 
V
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
T
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
V
 
-
S
 
K
D
 
G
G
 
G
N
 
D
D
|
D
Q
 
P
D
 
K
A
 
N
R
|
R
E
 
E
D
 
V
M
 
L
F
 
W
P
 
T
S
 
-
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
S
N
 
N
F
 
Y
D
 
D
T
 
T
G
 
S
H
 
S
P
 
D
L
 
L
Y
 
Y
-
 
K
-
 
F
M
 
I
E
 
K
I
 
I
S
 
V
K
 
N
L
 
N
S
 
D
A
 
V
I
 
R
R
 
Q
K
 
K
A
 
S
T
 
D
P
 
K
A
 
T
L
 
V
S
 
T
R
 
L
G
 
D
R
 
V
Q
 
D
V
 
V
-
 
G
-
 
T
-
 
N
T
 
T
R
 
Y
A
 
A
Y
 
F
D
 
T
E
 
H
K
 
G
P
 
K
G
 
N
L
 
L
F
 
I
A
 
V
V
 
V
S
 
N
R
 
N
F
 
Y
D
 
G
P
 
S
A
 
G
S
 
S
G
 
T
A
 
E
E
 
S
V
 
V
L
 
T
V
 
V
A
 
K
F
 
V
N
 
G
T
 
D
S
 
S
A
 
V
A
 
A
P
 
D
I
 
G
T
 
T
R
 
K
Q
 
L
V
 
V
E
 
D
V
 
A
G
 
-
V
 
-
S
 
-
S
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
V
G
 
S
Q
 
N
C
 
I
A
 
T
A
 
A
S
 
T
A
 
V
S
 
S
A
 
G
P
 
-
G
 
G
S
 
S
V
 
I
T
 
T
V
 
F
T
 
S
L
 
L

P43379 Cyclomaltodextrin glucanotransferase; Cyclodextrin-glycosyltransferase; CGTase; EC 2.4.1.19 from Niallia circulans (Bacillus circulans) (see 3 papers)
28% identity, 86% coverage: 3:522/604 of query aligns to 10:439/713 of P43379

query
sites
P43379
S
x
A
L
|
L
A
|
A
F
x
L
A
x
G
L
|
L
T
x
S
L
|
L
L
x
T
A
x
F
G
|
G
T
x
L
V
x
F
A
x
S
S
x
P
A
|
A
Q
|
Q
T
x
A
A
 
A
A
 
P
P
 
D
A
 
T
E
 
S
L
 
V
R
 
S
A
 
N
R
 
K
A
 
Q
A
 
N
-
 
F
E
 
S
T
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
I
L
 
F
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
S
N
 
D
G
 
G
D
 
N
P
 
P
S
 
A
N
 
N
D
 
N
R
 
P
G
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
F
D
 
D
R
 
G
L
 
T
T
x
C
T
 
T
G
 
N
F
 
L
D
 
R
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
L
F
 
Y
H
x
C
G
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
G
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
T
S
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
L
 
I
G
 
S
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
K
 
N
N
 
I
K
 
Y
P
 
S
V
 
I
Q
 
I
G
 
N
G
 
Y
P
 
S
G
 
G
Q
 
V
E
 
N
T
 
N
A
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
A
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
N
 
I
D
 
A
E
 
D
M
 
F
K
 
Q
A
 
N
F
 
L
V
 
I
D
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
G
 
N
I
 
I
K
 
K
V
 
V
Y
 
I
L
 
I
D
 
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
 
N
H
 
H
T
 
T
A
 
S
D
 
-
V
 
-
I
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
P
K
 
A
S
 
S
A
 
S
C
 
D
D
 
Q
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
P
 
P
G
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
T
K
 
L
V
 
L
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
T
I
 
Q
H
 
N
-
 
L
Y
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
N
G
 
G
N
 
G
T
 
T
T
 
D
F
 
F
R
 
S
-
 
T
N
 
T
E
 
E
S
 
N
S
 
G
T
 
I
M
 
Y
G
 
K
D
 
N
F
 
L
V
 
Y
G
 
D
L
 
L
D
 
A
D
 
D
L
 
L
M
 
N
T
 
H
E
 
N
S
 
N
P
 
S
R
 
T
V
 
V
L
 
D
Q
 
V
G
 
Y
F
 
L
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
I
G
 
K
A
 
M
W
 
W
I
 
L
D
 
D
Q
 
-
F
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
 
R
I
 
M
D
|
D
T
 
A
A
 
V
R
 
K
H
 
H
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
F
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
K
F
 
S
S
 
F
K
 
M
A
 
A
M
 
A
I
 
V
E
 
N
R
 
N
A
 
Y
K
 
K
A
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
P
N
 
V
F
 
F
H
 
-
I
 
T
F
 
F
G
 
G
E
|
E
V
 
W
A
 
F
N
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
L
G
 
G
D
 
V
L
 
N
A
 
E
L
 
V
H
 
S
T
 
P
R
 
E
V
 
N
H
 
H
Q
 
K
L
 
F
P
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
M
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
R
 
A
A
 
Q
A
 
K
V
 
V
Q
 
R
H
 
Q
T
 
V
V
 
F
A
 
R
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
N
L
 
T
A
 
D
A
 
N
M
 
M
F
 
Y
D
 
G
R
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
M
Y
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
S
A
 
A
E
 
A
A
 
D
A
 
Y
L
 
A
R
 
Q
L
 
V
P
 
D
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
 
H
D
|
D
H
 
M
G
 
E
R
 
R
F
 
F
S
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
H
A
 
A
S
 
S
D
 
N
D
 
A
E
 
N
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
R
V
 
R
K
 
K
L
 
L
A
 
E
H
 
Q
A
 
A
M
 
L
L
 
A
L
 
F
L
 
T
L
 
L
-
 
T
-
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
T
E
 
E
Q
 
Q
G
 
-
F
 
Y
V
 
M
S
 
S
D
 
G
G
 
G
N
 
T
D
 
D
Q
 
P
D
 
D
A
 
N
R
 
R
E
 
A
D
 
R
M
 
I
F
 
-
P
 
P
S
 
S
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
F
 
F
D
 
S
T
 
T
G
 
S
H
 
T
P
 
T
L
 
A
Y
 
Y
M
 
Q
E
 
V
I
 
I
S
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
C
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
S
Q
 
T
V
 
Q
T
 
E
R
 
R

Sites not aligning to the query:

9cgtA Structure of cyclodextrin glycosyltransferase complexed with a thio- maltopentaose (see paper)
26% identity, 83% coverage: 24:522/604 of query aligns to 5:412/684 of 9cgtA

query
sites
9cgtA
A
 
A
E
 
V
L
 
T
R
 
N
A
 
K
R
 
Q
A
 
S
A
 
F
E
 
S
T
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
L
N
x
D
G
 
G
D
x
N
P
 
P
S
 
S
N
|
N
D
x
N
R
 
P
G
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
Y
D
 
D
R
 
A
L
 
T
T
 
C
T
 
S
G
 
N
F
 
L
D
x
K
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
L
F
 
Y
H
 
C
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
N
Y
 
Y
I
 
F
Q
 
S
S
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
L
W
 
W
L
 
I
G
 
S
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
K
 
N
N
 
I
K
 
F
P
 
A
V
 
T
Q
 
I
G
 
N
G
x
Y
P
 
S
G
 
G
Q
 
V
E
 
T
T
 
N
A
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
|
Y
W
|
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
Y
F
 
F
G
 
G
T
 
T
N
 
M
D
 
A
E
 
D
M
 
F
K
 
Q
A
 
N
F
 
L
V
 
I
D
 
T
A
 
T
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
K
V
 
I
Y
 
V
L
 
I
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
 
H
T
 
T
A
 
S
D
 
P
V
 
A
I
 
M
Q
 
E
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
T
N
 
D
P
 
T
G
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
T
K
 
L
V
 
V
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
T
I
 
N
H
 
G
Y
 
Y
-
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
N
G
 
G
N
 
G
T
 
S
T
 
D
F
 
F
R
 
S
N
 
S
-
 
L
E
 
E
S
 
N
S
 
G
T
x
I
M
 
Y
G
 
K
D
 
N
F
 
L
V
 
Y
G
x
D
L
 
L
D
 
A
D
|
D
L
 
F
M
 
N
T
 
H
E
 
N
S
 
N
P
 
A
R
 
T
V
 
I
L
 
D
Q
 
K
G
 
Y
F
 
F
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
I
G
 
K
A
 
L
W
 
W
I
 
L
D
 
D
Q
 
-
F
 
M
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
|
R
I
 
V
D
|
D
T
 
A
A
 
V
R
 
K
H
|
H
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
L
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
K
F
 
S
S
 
W
K
 
M
A
 
S
M
 
S
I
 
I
E
 
Y
R
 
A
A
 
H
K
 
K
A
 
P
R
 
V
G
 
F
I
 
T
P
 
F
N
 
G
F
x
A
H
 
W
I
x
F
F
 
L
G
 
G
E
 
S
V
 
A
A
 
A
N
 
S
E
 
D
G
 
A
D
 
D
V
 
N
G
 
T
D
 
D
L
 
F
A
 
A
L
 
N
H
 
K
T
 
S
R
 
G
V
 
M
H
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
R
 
N
A
 
S
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
H
 
N
T
 
V
V
 
F
A
 
R
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
N
L
 
T
A
 
S
A
 
N
M
 
M
F
 
Y
D
 
A
R
 
L
D
 
D
A
 
S
L
 
M
Y
 
I
E
 
N
G
 
S
G
 
T
A
 
A
E
 
T
A
 
D
A
 
Y
L
 
N
R
 
Q
L
 
V
P
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
D
R
 
R
F
 
F
S
 
K
T
 
T
D
 
S
V
 
A
R
 
V
K
 
N
A
 
N
F
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
R
R
 
R
V
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
A
H
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
T
E
 
E
Q
 
Q
G
 
Y
F
 
L
V
 
T
S
 
G
D
 
N
G
 
G
N
 
-
D
 
D
Q
 
P
D
 
D
A
 
N
R
|
R
E
 
A
D
 
K
M
 
M
F
 
-
P
 
P
S
 
S
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
F
 
F
D
 
S
T
 
K
G
 
S
H
 
T
P
 
T
L
 
A
Y
 
F
M
 
N
E
 
V
I
 
I
S
 
S
K
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
S
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
S
Q
 
T
V
 
Q
T
 
Q
R
 
R

8cgtA Structure of cyclodextrin glycosyltransferase complexed with a thio- maltohexaose (see paper)
26% identity, 83% coverage: 24:522/604 of query aligns to 5:412/684 of 8cgtA

query
sites
8cgtA
A
 
A
E
 
V
L
 
T
R
 
N
A
 
K
R
 
Q
A
 
S
A
 
F
E
 
S
T
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
L
N
x
D
G
 
G
D
x
N
P
 
P
S
 
S
N
|
N
D
x
N
R
 
P
G
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
Y
D
 
D
R
 
A
L
 
T
T
 
C
T
 
S
G
 
N
F
 
L
D
x
K
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
L
F
 
Y
H
 
C
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
N
Y
 
Y
I
 
F
Q
 
S
S
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
L
W
 
W
L
 
I
G
 
S
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
K
 
N
N
 
I
K
 
F
P
 
A
V
 
T
Q
 
I
G
 
N
G
x
Y
P
 
S
G
 
G
Q
 
V
E
 
T
T
x
N
A
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
|
Y
W
|
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
Y
F
 
F
G
 
G
T
 
T
N
 
M
D
 
A
E
 
D
M
 
F
K
 
Q
A
 
N
F
 
L
V
 
I
D
 
T
A
 
T
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
K
V
 
I
Y
 
V
L
 
I
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
 
H
T
 
T
A
 
S
D
 
P
V
 
A
I
 
M
Q
 
E
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
T
N
 
D
P
 
T
G
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
T
K
 
L
V
 
V
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
T
I
 
N
H
 
G
Y
 
Y
-
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
N
G
 
G
N
 
G
T
 
S
T
 
D
F
 
F
R
 
S
N
 
S
-
 
L
E
 
E
S
 
N
S
 
G
T
x
I
M
 
Y
G
 
K
D
 
N
F
 
L
V
 
Y
G
x
D
L
|
L
D
 
A
D
|
D
L
 
F
M
 
N
T
 
H
E
 
N
S
 
N
P
 
A
R
 
T
V
 
I
L
 
D
Q
 
K
G
 
Y
F
 
F
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
I
G
 
K
A
 
L
W
 
W
I
 
L
D
 
D
Q
 
-
F
 
M
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
|
R
I
 
V
D
|
D
T
 
A
A
 
V
R
 
K
H
|
H
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
L
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
K
F
 
S
S
 
W
K
 
M
A
 
S
M
 
S
I
 
I
E
 
Y
R
 
A
A
 
H
K
 
K
A
 
P
R
 
V
G
 
F
I
 
T
P
 
F
N
 
G
F
x
A
H
 
W
I
x
F
F
 
L
G
 
G
E
 
S
V
 
A
A
 
A
N
 
S
E
 
D
G
 
A
D
 
D
V
 
N
G
 
T
D
 
D
L
 
F
A
 
A
L
 
N
H
 
K
T
 
S
R
 
G
V
 
M
H
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
R
 
N
A
 
S
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
H
 
N
T
 
V
V
 
F
A
 
R
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
N
L
 
T
A
 
S
A
 
N
M
 
M
F
 
Y
D
 
A
R
 
L
D
 
D
A
 
S
L
 
M
Y
 
I
E
 
N
G
 
S
G
 
T
A
 
A
E
 
T
A
 
D
A
 
Y
L
 
N
R
 
Q
L
 
V
P
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
D
R
 
R
F
 
F
S
 
K
T
 
T
D
 
S
V
 
A
R
 
V
K
 
N
A
 
N
F
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
R
R
 
R
V
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
A
H
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
T
E
 
E
Q
 
Q
G
 
Y
F
 
L
V
 
T
S
 
G
D
 
N
G
 
G
N
 
-
D
|
D
Q
 
P
D
 
D
A
 
N
R
|
R
E
 
A
D
 
K
M
 
M
F
 
-
P
 
P
S
 
S
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
F
 
F
D
 
S
T
 
K
G
 
S
H
 
T
P
 
T
L
 
A
Y
 
F
M
 
N
E
 
V
I
 
I
S
 
S
K
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
S
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
S
Q
 
T
V
 
Q
T
 
Q
R
 
R

1cgtA Structure of cyclodextrin glycosyltransferase refined at 2.0 angstroms resolution (see paper)
26% identity, 83% coverage: 24:522/604 of query aligns to 5:412/684 of 1cgtA

query
sites
1cgtA
A
 
A
E
 
V
L
 
T
R
 
N
A
 
K
R
 
Q
A
 
S
A
 
F
E
 
S
T
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
L
N
x
D
G
 
G
D
x
N
P
 
P
S
 
S
N
|
N
D
x
N
R
 
P
G
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
Y
D
 
D
R
 
A
L
 
T
T
 
C
T
 
S
G
 
N
F
 
L
D
 
K
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
L
F
 
Y
H
 
C
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
N
Y
 
Y
I
 
F
Q
 
S
S
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
L
W
 
W
L
 
I
G
 
S
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
K
 
N
N
 
I
K
 
F
P
 
A
V
 
T
Q
 
I
G
 
N
G
 
Y
P
 
S
G
 
G
Q
 
V
E
 
T
T
 
N
A
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
Y
F
 
F
G
 
G
T
 
T
N
 
M
D
 
A
E
 
D
M
 
F
K
 
Q
A
 
N
F
 
L
V
 
I
D
 
T
A
 
T
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
K
V
 
I
Y
 
V
L
 
I
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
 
H
T
 
T
A
 
S
D
 
P
V
 
A
I
 
M
Q
 
E
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
T
N
 
D
P
 
T
G
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
T
K
 
L
V
 
V
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
T
I
 
N
H
 
G
Y
 
Y
-
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
N
G
 
G
N
 
G
T
 
S
T
 
D
F
 
F
R
 
S
N
 
S
-
 
L
E
 
E
S
 
N
S
 
G
T
x
I
M
 
Y
G
 
K
D
 
N
F
 
L
V
 
Y
G
 
D
L
 
L
D
 
A
D
|
D
L
 
F
M
 
N
T
 
H
E
 
N
S
 
N
P
 
A
R
 
T
V
 
I
L
 
D
Q
 
K
G
 
Y
F
 
F
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
I
G
 
K
A
 
L
W
 
W
I
 
L
D
 
D
Q
 
-
F
 
M
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
|
R
I
 
V
D
|
D
T
 
A
A
 
V
R
 
K
H
|
H
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
L
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
K
F
 
S
S
 
W
K
 
M
A
 
S
M
 
S
I
 
I
E
 
Y
R
 
A
A
 
H
K
 
K
A
 
P
R
 
V
G
 
F
I
 
T
P
 
F
N
 
G
F
x
E
H
 
W
I
 
F
F
 
L
G
 
G
E
 
S
V
 
A
A
 
A
N
 
S
E
 
D
G
 
A
D
 
D
V
 
N
G
 
T
D
 
D
L
 
F
A
 
A
L
 
N
H
 
K
T
 
S
R
 
G
V
 
M
H
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
R
 
N
A
 
S
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
H
 
N
T
 
V
V
 
F
A
 
R
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
N
L
 
T
A
 
S
A
 
N
M
 
M
F
 
Y
D
 
A
R
 
L
D
 
D
A
 
S
L
 
M
Y
 
I
E
 
N
G
 
S
G
 
T
A
 
A
E
 
T
A
 
D
A
 
Y
L
 
N
R
 
Q
L
 
V
P
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
D
R
 
R
F
 
F
S
 
K
T
 
T
D
 
S
V
 
A
R
 
V
K
 
N
A
 
N
F
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
R
R
 
R
V
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
A
H
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
T
E
 
E
Q
 
Q
G
 
Y
F
 
L
V
 
T
S
 
G
D
 
N
G
 
G
N
 
-
D
 
D
Q
 
P
D
 
D
A
 
N
R
 
R
E
 
A
D
 
K
M
 
M
F
 
-
P
 
P
S
 
S
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
F
 
F
D
 
S
T
 
K
G
 
S
H
 
T
P
 
T
L
 
A
Y
 
F
M
 
N
E
 
V
I
 
I
S
 
S
K
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
S
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
S
Q
 
T
V
 
Q
T
 
Q
R
 
R

6cgtA Hoxa complex of cyclodextrin glycosyltransferase mutant (see paper)
26% identity, 83% coverage: 24:522/604 of query aligns to 5:412/684 of 6cgtA

query
sites
6cgtA
A
 
A
E
 
V
L
 
T
R
 
N
A
 
K
R
 
Q
A
 
S
A
 
F
E
 
S
T
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
L
N
x
D
G
 
G
D
x
N
P
 
P
S
 
S
N
|
N
D
x
N
R
 
P
G
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
Y
D
 
D
R
 
A
L
 
T
T
 
C
T
 
S
G
 
N
F
 
L
D
 
K
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
L
F
 
Y
H
 
C
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
N
Y
 
Y
I
 
F
Q
 
S
S
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
L
W
 
W
L
 
I
G
 
S
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
K
 
N
N
 
I
K
 
F
P
 
A
V
 
T
Q
 
I
G
 
N
G
x
Y
P
 
S
G
 
G
Q
 
V
E
 
T
T
 
N
A
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
|
Y
W
|
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
Y
F
 
F
G
 
G
T
 
T
N
 
M
D
 
A
E
 
D
M
 
F
K
 
Q
A
 
N
F
 
L
V
 
I
D
 
T
A
 
T
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
K
V
 
I
Y
 
V
L
 
I
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
|
H
T
 
T
A
 
S
D
 
P
V
 
A
I
 
M
Q
 
E
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
T
N
 
D
P
 
T
G
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
T
K
 
L
V
 
V
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
T
I
 
N
H
 
G
Y
 
Y
-
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
N
G
 
G
N
 
G
T
 
S
T
 
D
F
 
F
R
 
S
N
 
S
-
 
L
E
 
E
S
 
N
S
 
G
T
x
I
M
 
Y
G
 
K
D
 
N
F
 
T
V
x
Y
G
 
D
L
 
L
D
 
A
D
|
D
L
 
F
M
 
N
T
 
H
E
 
N
S
 
N
P
 
A
R
 
T
V
 
I
L
 
D
Q
 
K
G
 
Y
F
 
F
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
I
G
 
K
A
 
L
W
 
W
I
 
L
D
 
D
Q
 
-
F
 
M
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
|
R
I
 
V
D
|
D
T
x
A
A
 
V
R
x
K
H
|
H
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
L
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
K
F
 
S
S
 
W
K
 
M
A
 
S
M
 
S
I
 
I
E
 
Y
R
 
A
A
 
H
K
 
K
A
 
P
R
 
V
G
 
F
I
 
T
P
 
F
N
 
G
F
x
E
H
 
W
I
x
F
F
 
L
G
 
G
E
 
S
V
 
A
A
 
A
N
 
S
E
 
D
G
 
A
D
 
D
V
 
N
G
 
T
D
 
D
L
 
F
A
 
A
L
 
N
H
 
K
T
 
S
R
 
G
V
 
M
H
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
R
 
N
A
 
S
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
H
 
N
T
 
V
V
 
F
A
 
R
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
N
L
 
T
A
 
S
A
 
N
M
 
M
F
 
Y
D
 
A
R
 
L
D
 
D
A
 
S
L
 
M
Y
 
I
E
 
N
G
 
S
G
 
T
A
 
A
E
 
T
A
 
D
A
 
Y
L
 
N
R
 
Q
L
 
V
P
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
D
R
 
R
F
 
F
S
 
K
T
 
T
D
 
S
V
 
A
R
 
V
K
 
N
A
 
N
F
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
R
R
 
R
V
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
A
H
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
T
E
 
E
Q
 
Q
G
 
Y
F
 
L
V
 
T
S
 
G
D
 
N
G
 
G
N
 
-
D
|
D
Q
 
P
D
 
D
A
 
N
R
|
R
E
 
A
D
 
K
M
 
M
F
 
-
P
 
P
S
 
S
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
F
 
F
D
 
S
T
 
K
G
 
S
H
 
T
P
 
T
L
 
A
Y
 
F
M
 
N
E
 
V
I
 
I
S
 
S
K
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
S
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
S
Q
 
T
V
 
Q
T
 
Q
R
 
R

1ukqA Crystal structure of cyclodextrin glucanotransferase complexed with a pseudo-maltotetraose derived from acarbose (see paper)
28% identity, 81% coverage: 32:522/604 of query aligns to 13:412/686 of 1ukqA

query
sites
1ukqA
E
 
S
T
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
I
L
 
F
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
S
N
x
D
G
 
G
D
x
N
P
 
P
S
 
A
N
|
N
D
x
N
R
 
P
G
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
F
D
 
D
R
 
G
L
 
S
T
 
C
T
 
T
G
 
N
F
 
L
D
 
R
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
L
F
 
Y
H
 
C
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
G
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
T
S
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
I
S
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
L
 
I
G
 
S
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
K
 
N
N
 
I
K
 
Y
P
 
S
V
 
V
Q
 
I
G
 
N
G
 
Y
P
 
S
G
 
G
Q
 
V
E
 
N
T
 
N
A
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
|
Y
W
|
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
A
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
N
 
M
D
 
Q
E
 
D
M
 
F
K
 
K
A
 
N
F
 
L
V
 
I
D
 
D
A
 
T
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
H
G
 
N
I
 
I
K
 
K
V
 
V
Y
 
I
L
 
I
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
|
H
T
 
T
A
 
S
D
 
-
V
 
-
I
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
P
K
 
A
S
 
S
A
 
S
C
 
D
D
 
D
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
P
 
P
G
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
N
K
 
L
V
 
L
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
T
I
 
Q
H
 
N
-
 
L
Y
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
Y
G
 
G
N
 
G
T
 
T
T
 
D
F
 
F
R
 
S
N
 
T
-
 
I
E
 
E
S
 
N
S
 
G
T
x
I
M
 
Y
G
 
K
D
 
N
F
 
L
V
 
Y
G
 
D
L
 
L
D
 
A
D
|
D
L
 
L
M
 
N
T
 
H
E
 
N
S
 
N
P
 
S
R
 
S
V
 
V
L
 
D
Q
 
V
G
 
Y
F
 
L
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
I
G
 
K
A
 
M
W
 
W
I
 
L
D
 
D
Q
 
-
F
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
|
R
I
 
V
D
|
D
T
 
A
A
 
V
R
 
K
H
|
H
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
F
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
K
F
 
S
S
 
F
K
 
M
A
 
A
M
 
T
I
 
I
E
 
N
R
 
N
A
 
Y
K
 
K
A
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
P
N
 
V
F
 
F
H
 
-
I
 
T
F
 
F
G
 
G
E
|
E
V
 
W
A
x
F
N
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
L
G
 
G
D
 
V
L
 
N
A
 
E
L
 
I
H
 
S
T
 
P
R
 
E
V
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
F
P
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
M
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
R
 
A
A
 
Q
A
 
K
V
 
A
Q
 
R
H
 
Q
T
 
V
V
 
F
A
 
R
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
N
L
 
T
A
 
D
A
 
N
M
 
M
F
 
Y
D
 
G
R
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
M
Y
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
S
A
 
E
E
 
V
A
 
D
A
 
Y
L
 
A
R
 
Q
L
 
V
P
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
E
R
 
R
F
 
F
S
 
H
T
 
T
-
 
S
-
 
N
-
 
G
D
 
D
V
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
A
H
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
S
E
 
E
Q
 
Q
G
 
-
F
 
Y
V
 
M
S
 
S
D
 
G
G
 
G
N
 
N
D
|
D
Q
 
P
D
 
D
A
 
N
R
|
R
E
 
A
D
 
R
M
 
L
F
 
-
P
 
P
S
 
S
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
F
 
F
D
 
S
T
 
T
G
 
T
H
 
T
P
 
T
L
 
A
Y
 
Y
M
 
Q
E
 
V
I
 
I
S
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
S
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
S
Q
 
T
V
 
H
T
 
E
R
 
R

1i75A Crystal structure of cyclodextrin glucanotransferase from alkalophilic bacillus sp.#1011 complexed with 1-deoxynojirimycin (see paper)
28% identity, 81% coverage: 32:522/604 of query aligns to 13:412/686 of 1i75A

query
sites
1i75A
E
 
S
T
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
I
L
 
F
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
S
N
x
D
G
 
G
D
x
N
P
 
P
S
 
A
N
|
N
D
x
N
R
 
P
G
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
F
D
 
D
R
 
G
L
 
S
T
 
C
T
 
T
G
 
N
F
 
L
D
 
R
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
L
F
 
Y
H
 
C
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
G
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
T
S
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
I
S
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
L
 
I
G
 
S
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
K
 
N
N
 
I
K
 
Y
P
 
S
V
 
V
Q
 
I
G
 
N
G
 
Y
P
 
S
G
 
G
Q
 
V
E
 
N
T
 
N
A
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
|
Y
W
 
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
A
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
N
 
M
D
 
Q
E
 
D
M
 
F
K
 
K
A
 
N
F
 
L
V
 
I
D
 
D
A
 
T
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
H
G
 
N
I
 
I
K
 
K
V
 
V
Y
 
I
L
 
I
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
 
H
T
 
T
A
 
S
D
 
-
V
 
-
I
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
P
K
 
A
S
 
S
A
 
S
C
 
D
D
 
D
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
P
 
P
G
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
N
K
 
L
V
 
L
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
T
I
 
Q
H
 
N
-
 
L
Y
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
Y
G
 
G
N
 
G
T
 
T
T
 
D
F
 
F
R
 
S
N
 
T
-
 
I
E
 
E
S
 
N
S
 
G
T
x
I
M
 
Y
G
 
K
D
 
N
F
x
L
V
 
Y
G
 
D
L
 
L
D
 
A
D
|
D
L
 
L
M
 
N
T
 
H
E
 
N
S
 
N
P
 
S
R
 
S
V
 
V
L
 
D
Q
 
V
G
 
Y
F
 
L
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
I
G
 
K
A
 
M
W
 
W
I
 
L
D
 
D
Q
 
-
F
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
|
R
I
 
V
D
|
D
T
 
A
A
 
V
R
 
K
H
|
H
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
F
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
K
F
 
S
S
 
F
K
 
M
A
 
A
M
 
T
I
 
I
E
 
N
R
 
N
A
 
Y
K
 
K
A
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
P
N
 
V
F
 
F
H
 
-
I
 
T
F
 
F
G
 
G
E
|
E
V
 
W
A
 
F
N
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
L
G
 
G
D
 
V
L
 
N
A
 
E
L
 
I
H
 
S
T
 
P
R
 
E
V
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
F
P
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
M
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
R
 
A
A
 
Q
A
 
K
V
 
A
Q
 
R
H
 
Q
T
 
V
V
 
F
A
 
R
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
N
L
 
T
A
 
D
A
 
N
M
 
M
F
 
Y
D
 
G
R
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
M
Y
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
S
A
 
E
E
 
V
A
 
D
A
 
Y
L
 
A
R
 
Q
L
 
V
P
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
E
R
 
R
F
 
F
S
 
H
T
 
T
-
 
S
-
 
N
-
 
G
D
 
D
V
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
A
H
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
S
E
 
E
Q
 
Q
G
 
-
F
 
Y
V
 
M
S
 
S
D
 
G
G
 
G
N
 
N
D
 
D
Q
 
P
D
 
D
A
 
N
R
 
R
E
 
A
D
 
R
M
 
L
F
 
-
P
 
P
S
 
S
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
F
 
F
D
 
S
T
 
T
G
 
T
H
 
T
P
 
T
L
 
A
Y
 
Y
M
 
Q
E
 
V
I
 
I
S
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
S
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
S
Q
 
T
V
 
H
T
 
E
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1cygA Cyclodextrin glucanotransferase (E.C.2.4.1.19) (cgtase)
28% identity, 86% coverage: 33:553/604 of query aligns to 11:435/680 of 1cygA

query
sites
1cygA
T
 
S
E
 
D
V
 
V
L
 
V
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
I
L
 
V
P
 
V
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
V
N
x
D
G
 
G
D
x
N
P
x
T
S
 
S
N
|
N
D
x
N
R
 
P
G
 
S
G
 
G
L
 
A
R
 
L
G
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
F
T
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
C
D
 
T
P
 
N
A
 
L
H
 
R
K
 
K
G
 
-
F
 
-
F
 
Y
H
 
C
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
G
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
T
S
 
D
L
 
M
G
 
G
A
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
L
 
I
G
 
S
P
 
Q
I
 
P
Y
 
V
K
 
E
N
 
N
K
 
V
P
 
F
V
 
S
Q
 
V
G
 
M
G
 
N
P
 
D
G
 
A
Q
 
S
E
 
G
T
 
S
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
P
D
 
N
P
 
P
H
 
F
F
 
F
G
 
G
T
 
T
N
 
L
D
 
S
E
 
D
M
 
F
K
 
Q
A
 
R
F
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
K
V
 
V
Y
 
I
L
 
I
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
 
H
T
 
T
A
 
S
D
 
-
V
 
-
I
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
P
K
 
A
S
 
S
A
 
E
C
 
T
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
N
P
 
P
G
 
S
F
 
Y
A
 
M
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
T
K
 
L
V
 
L
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
A
-
 
N
I
 
M
H
 
Y
Y
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
N
G
 
G
N
 
G
T
 
T
T
 
T
F
 
F
R
 
S
N
 
S
-
 
L
E
 
E
S
 
D
S
 
G
T
x
I
M
 
Y
G
 
R
D
 
N
F
 
L
V
 
F
G
 
D
L
 
L
D
 
A
D
|
D
L
 
L
M
 
N
T
 
H
E
 
Q
S
 
N
P
 
P
R
 
V
V
 
I
L
 
D
Q
 
R
G
 
Y
F
 
L
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
V
G
 
K
A
 
M
W
 
W
I
 
I
D
 
D
Q
 
-
F
 
M
G
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
|
R
I
 
M
D
|
D
T
 
A
A
 
V
R
 
K
H
|
H
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
F
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
-
F
 
-
S
 
K
K
 
S
A
 
L
M
 
M
I
 
D
E
 
E
R
 
I
A
 
D
K
 
N
A
 
Y
R
 
R
G
 
P
I
 
V
P
 
F
N
 
T
F
 
F
H
 
G
I
x
E
F
 
W
G
 
F
E
 
L
V
 
S
A
 
E
N
 
N
E
 
E
G
 
V
D
 
D
V
 
A
G
 
N
D
 
N
L
 
H
A
 
Y
L
 
F
H
 
A
T
 
N
R
 
E
V
 
S
H
 
G
Q
 
M
L
 
-
P
 
-
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
L
R
 
R
A
 
Q
A
 
V
V
 
L
Q
 
R
H
 
N
T
 
N
V
 
S
A
 
D
G
 
N
E
 
W
K
 
Y
G
 
G
P
 
F
D
 
N
M
 
Q
L
 
M
A
 
I
A
 
Q
M
 
-
F
 
-
D
 
D
R
 
T
D
 
A
A
 
S
L
 
A
Y
 
Y
E
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
D
A
 
E
A
 
V
L
 
L
R
 
D
L
 
Q
P
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
D
R
 
R
F
 
F
S
 
M
T
 
I
D
 
D
V
 
-
R
 
-
K
 
G
A
 
G
F
 
D
P
 
P
K
 
R
A
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
V
 
V
K
 
D
L
 
M
A
 
A
H
 
L
A
 
A
M
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
N
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
T
E
 
E
Q
 
Q
G
 
Y
F
 
M
V
 
T
S
 
G
D
 
N
G
 
G
N
 
-
D
 
D
Q
 
P
D
 
N
A
 
N
R
 
R
E
 
K
D
 
M
M
 
M
F
 
-
P
 
-
S
 
-
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
S
N
 
S
F
 
F
D
 
N
T
 
K
G
 
N
H
 
T
P
 
R
L
 
A
Y
 
Y
M
 
Q
E
 
V
I
 
I
S
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
S
A
 
S
I
 
L
R
 
R
K
 
R
A
 
N
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
D
Q
 
T
V
 
E
T
 
Q
R
 
R
A
 
W
Y
 
I
D
 
N
E
 
G
K
 
D
P
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
V
 
V
S
 
Y
R
 
V
F
 
Y
D
 
E
P
 
R
A
 
Q
S
 
F
G
 
G
A
 
K
E
 
D
-
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
V
N
 
N
T
 
R
S
 
S
A
 
S
A
 
S

1uksA Crystal structure of f183l/f259l mutant cyclodextrin glucanotransferase complexed with a pseudo-maltotetraose derived from acarbose (see paper)
28% identity, 81% coverage: 32:522/604 of query aligns to 13:412/686 of 1uksA

query
sites
1uksA
E
 
S
T
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
I
L
 
F
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
S
N
x
D
G
 
G
D
x
N
P
 
P
S
 
A
N
|
N
D
x
N
R
 
P
G
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
F
D
 
D
R
 
G
L
 
S
T
 
C
T
 
T
G
 
N
F
 
L
D
 
R
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
L
F
 
Y
H
 
C
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
G
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
T
S
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
I
S
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
L
 
I
G
 
S
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
K
 
N
N
 
I
K
 
Y
P
 
S
V
 
V
Q
 
I
G
 
N
G
 
Y
P
 
S
G
 
G
Q
 
V
E
 
N
T
x
N
A
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
W
|
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
A
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
N
 
M
D
 
Q
E
 
D
M
 
F
K
 
K
A
 
N
F
 
L
V
 
I
D
 
D
A
 
T
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
H
G
 
N
I
 
I
K
 
K
V
 
V
Y
 
I
L
 
I
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
 
H
T
 
T
A
 
S
D
 
-
V
 
-
I
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
P
K
 
A
S
 
S
A
 
S
C
 
D
D
 
D
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
P
 
P
G
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
N
K
 
L
V
 
L
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
T
I
 
Q
H
 
N
-
 
L
Y
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
Y
G
 
G
N
 
G
T
 
T
T
 
D
F
 
L
R
 
S
N
 
T
-
 
I
E
 
E
S
 
N
S
 
G
T
x
I
M
 
Y
G
 
K
D
 
N
F
 
L
V
x
Y
G
x
D
L
|
L
D
 
A
D
|
D
L
 
L
M
 
N
T
 
H
E
 
N
S
 
N
P
 
S
R
 
S
V
 
V
L
 
D
Q
 
V
G
 
Y
F
 
L
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
I
G
 
K
A
 
M
W
 
W
I
 
L
D
 
D
Q
 
-
F
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
|
R
I
 
V
D
|
D
T
x
A
A
 
V
R
x
K
H
|
H
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
F
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
K
F
 
S
S
 
F
K
 
M
A
 
A
M
 
T
I
 
I
E
 
N
R
 
N
A
 
Y
K
 
K
A
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
P
N
 
V
F
 
F
H
 
-
I
 
T
F
 
F
G
 
G
E
|
E
V
 
W
A
x
L
N
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
L
G
 
G
D
 
V
L
 
N
A
 
E
L
 
I
H
 
S
T
 
P
R
 
E
V
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
F
P
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
M
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
R
 
A
A
 
Q
A
 
K
V
 
A
Q
 
R
H
 
Q
T
 
V
V
 
F
A
 
R
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
N
L
 
T
A
 
D
A
 
N
M
 
M
F
 
Y
D
 
G
R
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
M
Y
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
S
A
 
E
E
 
V
A
 
D
A
 
Y
L
 
A
R
 
Q
L
 
V
P
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
E
R
 
R
F
 
F
S
 
H
T
 
T
-
 
S
-
 
N
-
 
G
D
 
D
V
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
A
H
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
S
E
 
E
Q
 
Q
G
 
-
F
 
Y
V
 
M
S
 
S
D
 
G
G
 
G
N
 
N
D
 
D
Q
 
P
D
 
D
A
 
N
R
 
R
E
 
A
D
 
R
M
 
L
F
 
-
P
 
P
S
 
S
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
F
 
F
D
 
S
T
 
T
G
 
T
H
 
T
P
 
T
L
 
A
Y
 
Y
M
 
Q
E
 
V
I
 
I
S
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
S
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
S
Q
 
T
V
 
H
T
 
E
R
 
R

5cgtA Maltotriose complex of preconditioned cyclodextrin glycosyltransferase mutant (see paper)
26% identity, 83% coverage: 24:522/604 of query aligns to 5:412/684 of 5cgtA

query
sites
5cgtA
A
 
A
E
 
V
L
 
T
R
 
N
A
 
K
R
 
Q
A
 
S
A
 
F
E
 
S
T
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
L
N
x
D
G
 
G
D
x
N
P
 
P
S
 
S
N
|
N
D
x
N
R
 
P
G
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
Y
D
 
D
R
 
A
L
 
T
T
 
C
T
 
S
G
 
N
F
 
L
D
 
K
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
L
F
 
Y
H
 
C
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
N
Y
 
Y
I
 
F
Q
 
S
S
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
L
W
 
W
L
 
I
G
 
S
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
K
 
N
N
 
I
K
 
F
P
 
A
V
 
T
Q
 
I
G
 
N
G
 
Y
P
 
S
G
 
G
Q
 
V
E
 
T
T
 
N
A
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
|
Y
W
|
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
Y
F
 
F
G
 
G
T
 
T
N
 
M
D
 
A
E
 
D
M
 
F
K
 
Q
A
 
N
F
 
L
V
 
I
D
 
T
A
 
T
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
K
V
 
I
Y
 
V
L
 
I
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
|
H
T
 
T
A
 
S
D
 
P
V
 
A
I
 
M
Q
 
E
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
T
N
 
D
P
 
T
G
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
T
K
 
L
V
 
V
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
T
I
 
N
H
 
G
Y
 
Y
-
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
N
G
 
G
N
 
G
T
 
S
T
 
D
F
 
F
R
 
S
N
 
S
-
 
L
E
 
E
S
 
N
S
 
G
T
x
I
M
 
Y
G
 
K
D
 
N
F
 
L
V
x
Y
G
 
D
L
 
L
D
 
A
D
|
D
L
 
F
M
 
N
T
 
H
E
 
N
S
 
N
P
 
A
R
 
T
V
 
I
L
 
D
Q
 
K
G
 
Y
F
 
F
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
I
G
 
K
A
 
L
W
 
W
I
 
L
D
 
D
Q
 
-
F
 
M
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
|
R
I
 
V
D
x
A
T
 
A
A
 
V
R
 
K
H
|
H
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
L
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
K
F
 
S
S
 
W
K
 
M
A
 
S
M
 
S
I
 
I
E
 
Y
R
 
A
A
 
H
K
 
K
A
 
P
R
 
V
G
 
F
I
 
T
P
 
F
N
 
G
F
x
E
H
 
W
I
 
F
F
 
L
G
 
G
E
 
S
V
 
A
A
 
A
N
 
S
E
 
D
G
 
A
D
 
D
V
 
N
G
 
T
D
 
D
L
 
F
A
 
A
L
 
N
H
 
K
T
 
S
R
 
G
V
 
M
H
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
R
 
N
A
 
S
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
H
 
N
T
 
V
V
 
F
A
 
R
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
N
L
 
T
A
 
S
A
 
N
M
 
M
F
 
Y
D
 
A
R
 
L
D
 
D
A
 
S
L
 
M
Y
 
I
E
 
N
G
 
S
G
 
T
A
 
A
E
 
T
A
 
D
A
 
Y
L
 
N
R
 
Q
L
 
V
P
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
D
R
 
R
F
 
F
S
 
K
T
 
T
D
 
S
V
 
A
R
 
V
K
 
N
A
 
N
F
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
R
R
 
R
V
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
A
H
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
T
E
 
E
Q
 
Q
G
 
Y
F
 
L
V
 
T
S
 
G
D
 
N
G
 
G
N
 
-
D
|
D
Q
 
P
D
 
D
A
 
N
R
|
R
E
 
A
D
 
K
M
 
M
F
 
-
P
 
P
S
 
S
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
F
 
F
D
 
S
T
 
K
G
 
S
H
 
T
P
 
T
L
 
A
Y
 
F
M
 
N
E
 
V
I
 
I
S
 
S
K
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
S
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
S
Q
 
T
V
 
Q
T
 
Q
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1cguA Catalytic center of cyclodextrin glycosyltransferase derived from x- ray structure analysis combined with site-directed mutagenesis (see paper)
26% identity, 83% coverage: 24:522/604 of query aligns to 5:412/684 of 1cguA

query
sites
1cguA
A
 
A
E
 
V
L
 
T
R
 
N
A
 
K
R
 
Q
A
 
S
A
 
F
E
 
S
T
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
V
L
 
F
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
L
N
x
D
G
 
G
D
x
N
P
 
P
S
 
S
N
|
N
D
x
N
R
 
P
G
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
Y
D
 
D
R
 
A
L
 
T
T
 
C
T
 
S
G
 
N
F
 
L
D
 
K
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
L
F
 
Y
H
 
C
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
N
Y
 
Y
I
 
F
Q
 
S
S
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
L
W
 
W
L
 
I
G
 
S
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
K
 
N
N
 
I
K
 
F
P
 
A
V
 
T
Q
 
I
G
 
N
G
 
Y
P
 
S
G
 
G
Q
 
V
E
 
T
T
 
N
A
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
|
Y
W
|
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
Y
F
 
F
G
 
G
T
 
T
N
 
M
D
 
A
E
 
D
M
 
F
K
 
Q
A
 
N
F
 
L
V
 
I
D
 
T
A
 
T
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
K
V
 
I
Y
 
V
L
 
I
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
|
H
T
 
T
A
 
S
D
 
P
V
 
A
I
 
M
Q
 
E
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
T
N
 
D
P
 
T
G
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
T
K
 
L
V
 
V
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
T
I
 
N
H
 
G
Y
 
Y
-
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
N
G
 
G
N
 
G
T
 
S
T
 
D
F
 
F
R
 
S
N
 
S
-
 
L
E
 
E
S
 
N
S
 
G
T
x
I
M
 
Y
G
 
K
D
 
N
F
 
L
V
 
Y
G
 
D
L
 
L
D
 
A
D
|
D
L
 
F
M
 
N
T
 
H
E
 
N
S
 
N
P
 
A
R
 
T
V
 
I
L
 
D
Q
 
K
G
 
Y
F
 
F
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
I
G
 
K
A
 
L
W
 
W
I
 
L
D
 
D
Q
 
-
F
 
M
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
|
R
I
 
V
D
x
A
T
 
A
A
 
V
R
 
K
H
|
H
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
L
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
K
F
 
S
S
 
W
K
 
M
A
 
S
M
 
S
I
 
I
E
 
Y
R
 
A
A
 
H
K
 
K
A
 
P
R
 
V
G
 
F
I
 
T
P
 
F
N
 
G
F
x
E
H
 
W
I
 
F
F
 
L
G
 
G
E
 
S
V
 
A
A
 
A
N
 
S
E
 
D
G
 
A
D
 
D
V
 
N
G
 
T
D
 
D
L
 
F
A
 
A
L
 
N
H
 
K
T
 
S
R
 
G
V
 
M
H
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
R
 
N
A
 
S
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
H
 
N
T
 
V
V
 
F
A
 
R
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
N
L
 
T
A
 
S
A
 
N
M
 
M
F
 
Y
D
 
A
R
 
L
D
 
D
A
 
S
L
 
M
Y
 
I
E
 
N
G
 
S
G
 
T
A
 
A
E
 
T
A
 
D
A
 
Y
L
 
N
R
 
Q
L
 
V
P
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
D
R
 
R
F
 
F
S
 
K
T
 
T
D
 
S
V
 
A
R
 
V
K
 
N
A
 
N
F
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
R
R
 
R
V
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
A
H
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
T
E
 
E
Q
 
Q
G
 
Y
F
 
L
V
 
T
S
 
G
D
 
N
G
 
G
N
 
-
D
|
D
Q
 
P
D
 
D
A
 
N
R
|
R
E
 
A
D
 
K
M
 
M
F
 
-
P
 
P
S
 
S
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
F
 
F
D
 
S
T
 
K
G
 
S
H
 
T
P
 
T
L
 
A
Y
 
F
M
 
N
E
 
V
I
 
I
S
 
S
K
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
S
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
S
Q
 
T
V
 
Q
T
 
Q
R
 
R

1dedA Crystal structure of alkalophilic asparagine 233-replaced cyclodextrin glucanotransferase complexed with an inhibitor, acarbose, at 2.0 a resolution (see paper)
28% identity, 81% coverage: 32:522/604 of query aligns to 13:412/686 of 1dedA

query
sites
1dedA
E
 
S
T
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
I
L
 
F
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
S
N
x
D
G
 
G
D
x
N
P
 
P
S
 
A
N
|
N
D
x
N
R
 
P
G
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
F
D
 
D
R
 
G
L
 
S
T
 
C
T
 
T
G
 
N
F
 
L
D
 
R
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
L
F
 
Y
H
 
C
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
G
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
T
S
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
I
S
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
L
 
I
G
 
S
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
K
 
N
N
 
I
K
 
Y
P
 
S
V
 
V
Q
 
I
G
 
N
G
 
Y
P
 
S
G
 
G
Q
 
V
E
 
N
T
 
N
A
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
|
H
G
 
G
Y
|
Y
W
|
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
A
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
N
 
M
D
 
Q
E
 
D
M
 
F
K
 
K
A
 
N
F
 
L
V
 
I
D
 
D
A
 
T
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
H
G
 
N
I
 
I
K
 
K
V
 
V
Y
 
I
L
 
I
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
 
H
T
 
T
A
 
S
D
 
-
V
 
-
I
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
P
K
 
A
S
 
S
A
 
S
C
 
D
D
 
D
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
P
 
P
G
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
N
K
 
L
V
 
L
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
T
I
 
Q
H
 
N
-
 
L
Y
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
Y
G
 
G
N
 
G
T
 
T
T
 
D
F
 
F
R
 
S
N
 
T
-
 
I
E
 
E
S
 
N
S
 
G
T
x
I
M
 
Y
G
 
K
D
 
N
F
x
L
V
x
Y
G
 
D
L
|
L
D
 
A
D
|
D
L
 
L
M
 
N
T
 
H
E
 
N
S
 
N
P
 
S
R
 
S
V
 
V
L
 
D
Q
 
V
G
 
Y
F
 
L
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
I
G
 
K
A
 
M
W
 
W
I
 
L
D
 
D
Q
 
-
F
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
|
R
I
 
V
D
|
D
T
 
A
A
 
V
R
 
K
H
x
N
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
F
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
K
F
 
S
S
 
F
K
 
M
A
 
A
M
 
T
I
 
I
E
 
N
R
 
N
A
 
Y
K
 
K
A
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
P
N
 
V
F
 
F
H
 
-
I
 
T
F
 
F
G
 
G
E
|
E
V
 
W
A
 
F
N
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
L
G
 
G
D
 
V
L
 
N
A
 
E
L
 
I
H
 
S
T
 
P
R
 
E
V
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
F
P
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
M
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
R
 
A
A
 
Q
A
 
K
V
 
A
Q
 
R
H
 
Q
T
 
V
V
 
F
A
 
R
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
N
L
 
T
A
 
D
A
 
N
M
 
M
F
 
Y
D
 
G
R
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
M
Y
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
S
A
 
E
E
 
V
A
 
D
A
 
Y
L
 
A
R
 
Q
L
 
V
P
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
E
R
 
R
F
 
F
S
 
H
T
 
T
-
 
S
-
 
N
-
 
G
D
 
D
V
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
A
H
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
S
E
 
E
Q
 
Q
G
 
-
F
 
Y
V
 
M
S
 
S
D
 
G
G
 
G
N
 
N
D
|
D
Q
 
P
D
 
D
A
 
N
R
|
R
E
 
A
D
 
R
M
 
L
F
 
-
P
 
P
S
 
S
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
F
 
F
D
 
S
T
 
T
G
 
T
H
 
T
P
 
T
L
 
A
Y
 
Y
M
 
Q
E
 
V
I
 
I
S
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
S
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
S
Q
 
T
V
 
H
T
 
E
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1d7fA Crystal structure of asparagine 233-replaced cyclodextrin glucanotransferase from alkalophilic bacillus sp. 1011 determined at 1.9 a resolution (see paper)
28% identity, 81% coverage: 32:522/604 of query aligns to 13:412/686 of 1d7fA

query
sites
1d7fA
E
 
S
T
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
I
L
 
F
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
S
N
x
D
G
 
G
D
x
N
P
 
P
S
 
A
N
|
N
D
x
N
R
 
P
G
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
F
D
 
D
R
 
G
L
 
S
T
 
C
T
 
T
G
 
N
F
 
L
D
 
R
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
L
F
 
Y
H
 
C
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
G
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
T
S
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
I
S
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
L
 
I
G
 
S
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
K
 
N
N
 
I
K
 
Y
P
 
S
V
 
V
Q
 
I
G
 
N
G
 
Y
P
 
S
G
 
G
Q
 
V
E
 
N
T
 
N
A
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
W
 
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
A
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
N
 
M
D
 
Q
E
 
D
M
 
F
K
 
K
A
 
N
F
 
L
V
 
I
D
 
D
A
 
T
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
H
G
 
N
I
 
I
K
 
K
V
 
V
Y
 
I
L
 
I
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
 
H
T
 
T
A
 
S
D
 
-
V
 
-
I
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
P
K
 
A
S
 
S
A
 
S
C
 
D
D
 
D
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
P
 
P
G
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
N
K
 
L
V
 
L
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
T
I
 
Q
H
 
N
-
 
L
Y
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
Y
G
 
G
N
 
G
T
 
T
T
 
D
F
 
F
R
 
S
N
 
T
-
 
I
E
 
E
S
 
N
S
 
G
T
x
I
M
 
Y
G
 
K
D
 
N
F
 
L
V
 
Y
G
 
D
L
 
L
D
 
A
D
|
D
L
 
L
M
 
N
T
 
H
E
 
N
S
 
N
P
 
S
R
 
S
V
 
V
L
 
D
Q
 
V
G
 
Y
F
 
L
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
I
G
 
K
A
 
M
W
 
W
I
 
L
D
 
D
Q
 
-
F
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
|
R
I
 
V
D
|
D
T
 
A
A
 
V
R
 
K
H
x
N
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
F
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
K
F
 
S
S
 
F
K
 
M
A
 
A
M
 
T
I
 
I
E
 
N
R
 
N
A
 
Y
K
 
K
A
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
P
N
 
V
F
 
F
H
 
-
I
 
T
F
 
F
G
 
G
E
|
E
V
 
W
A
 
F
N
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
L
G
 
G
D
 
V
L
 
N
A
 
E
L
 
I
H
 
S
T
 
P
R
 
E
V
 
Y
H
 
H
Q
 
Q
L
 
F
P
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
M
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
R
 
A
A
 
Q
A
 
K
V
 
A
Q
 
R
H
 
Q
T
 
V
V
 
F
A
 
R
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
N
L
 
T
A
 
D
A
 
N
M
 
M
F
 
Y
D
 
G
R
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
M
Y
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
S
A
 
E
E
 
V
A
 
D
A
 
Y
L
 
A
R
 
Q
L
 
V
P
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
E
R
 
R
F
 
F
S
 
H
T
 
T
-
 
S
-
 
N
-
 
G
D
 
D
V
 
R
R
 
R
K
 
K
A
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
L
K
 
E
L
 
Q
A
 
A
H
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
T
L
 
L
L
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
S
E
 
E
Q
 
Q
G
 
-
F
 
Y
V
 
M
S
 
S
D
 
G
G
 
G
N
 
N
D
 
D
Q
 
P
D
 
D
A
 
N
R
 
R
E
 
A
D
 
R
M
 
L
F
 
-
P
 
P
S
 
S
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
F
 
F
D
 
S
T
 
T
G
 
T
H
 
T
P
 
T
L
 
A
Y
 
Y
M
 
Q
E
 
V
I
 
I
S
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
S
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
S
Q
 
T
V
 
H
T
 
E
R
 
R

P25718 Periplasmic alpha-amylase; 1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase; EC 3.2.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
28% identity, 85% coverage: 10:521/604 of query aligns to 170:650/676 of P25718

query
sites
P25718
L
 
L
L
 
L
A
 
L
G
 
L
T
 
E
V
 
R
A
 
A
S
 
E
A
 
T
Q
 
D
T
 
T
A
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
F
E
 
D
L
 
W
R
 
H
A
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
N
E
 
A
V
 
T
L
 
V
Y
 
Y
F
 
F
L
 
V
L
 
L
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
E
N
 
N
G
 
G
D
 
D
P
 
P
S
 
S
N
 
N
D
 
D
R
 
Q
G
 
S
-
 
Y
G
 
G
L
 
R
R
 
H
G
 
K
D
 
D
R
 
G
L
 
M
T
 
-
T
 
-
G
 
-
F
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
A
H
 
E
K
 
I
G
 
G
F
 
T
F
 
F
H
 
H
G
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
T
R
 
N
R
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
N
A
 
A
I
 
L
W
 
W
L
 
I
G
 
S
P
 
A
I
 
P
Y
 
F
K
 
E
N
 
Q
K
 
-
P
 
-
V
 
I
Q
 
H
G
 
G
G
 
W
P
 
V
G
 
G
Q
 
G
E
 
G
T
 
T
A
 
K
G
 
G
-
 
D
-
 
F
-
 
P
-
 
H
-
 
Y
-
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
W
 
Y
I
 
T
T
 
Q
D
 
D
F
 
W
T
 
T
R
 
N
V
 
L
D
 
D
P
 
A
H
 
N
F
 
M
G
 
G
T
 
N
N
 
E
D
 
A
E
 
D
M
 
L
K
 
R
A
 
T
F
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
Q
R
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
I
Y
 
L
L
 
F
D
 
D
I
 
V
I
 
V
T
 
M
N
 
N
H
 
H
T
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
M
I
 
Q
Q
 
E
Y
 
Y
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
-
K
 
Q
S
 
F
A
 
G
C
 
A
D
 
L
Y
 
Y
R
 
L
S
 
S
R
 
G
A
 
D
D
 
E
Y
 
-
P
 
-
Y
 
V
Q
 
K
R
 
K
K
 
S
G
 
L
G
 
G
V
 
E
K
 
R
G
 
W
A
 
S
A
 
D
I
 
W
N
 
K
P
 
P
G
 
A
F
 
-
A
 
A
G
 
G
D
 
Q
G
 
T
V
 
W
Q
 
H
T
 
S
P
 
F
E
 
N
N
 
D
F
 
Y
A
 
I
K
 
N
L
 
F
S
 
S
D
 
D
-
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
W
-
 
D
-
 
K
-
 
W
-
 
W
-
 
G
P
 
K
N
 
N
Y
 
W
A
 
I
Y
 
R
T
 
T
T
 
D
V
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
Y
-
 
D
V
 
N
P
 
P
E
 
G
A
 
F
E
 
D
R
 
D
T
 
L
V
 
T
K
 
M
V
 
S
P
 
L
A
 
A
W
 
F
L
 
L
N
 
P
D
 
D
P
 
-
I
 
-
H
 
-
Y
 
-
H
 
-
N
 
-
R
 
-
G
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
-
F
 
I
R
 
K
N
 
T
E
 
E
S
 
S
S
 
T
T
 
T
M
 
A
G
 
S
D
 
G
F
 
L
-
 
P
V
 
V
G
 
F
L
 
Y
D
 
K
D
 
N
L
 
K
M
 
M
T
 
D
E
 
T
S
 
H
P
 
A
R
 
K
V
 
A
L
 
I
Q
 
D
G
 
G
F
 
Y
I
 
T
-
 
P
-
 
R
D
 
D
I
 
Y
Y
 
L
G
 
T
A
 
H
W
 
W
I
 
L
D
 
S
Q
 
Q
-
 
W
-
 
V
-
 
R
-
 
D
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
F
 
F
R
 
R
I
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
K
H
 
H
V
 
V
N
 
E
P
 
L
E
 
P
F
 
A
W
 
W
Q
 
Q
G
 
Q
F
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
E
-
 
A
S
 
S
K
 
A
A
 
A
M
 
L
I
 
R
E
 
E
R
 
W
A
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
N
G
 
-
I
 
-
P
 
P
N
 
D
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
K
-
 
P
F
 
F
H
 
W
I
 
M
F
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
A
A
 
W
N
 
G
E
 
H
G
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
G
D
 
V
L
 
M
A
 
Q
L
 
S
H
 
D
T
 
Y
R
 
Y
V
 
R
H
 
H
Q
 
G
L
 
F
P
 
D
S
 
A
V
 
M
L
 
I
D
 
N
F
 
F
G
 
D
F
 
Y
R
 
Q
A
 
E
A
 
Q
V
 
A
Q
 
A
H
 
K
T
 
A
V
 
V
A
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
x
C
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
M
 
M
F
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
D
A
 
T
L
 
T
Y
 
W
E
 
Q
G
 
Q
G
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
K
-
 
L
-
 
Q
A
 
G
L
 
F
R
 
N
L
 
V
P
 
L
T
 
S
F
 
Y
I
 
L
S
 
S
N
 
S
H
 
H
D
 
D
H
 
T
G
 
R
R
 
L
F
 
F
S
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
R
K
 
E
A
 
G
F
 
G
P
 
D
K
 
K
A
 
A
S
 
A
D
 
E
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
-
M
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
A
R
 
P
G
 
G
V
 
A
P
 
V
T
 
Q
I
 
I
Y
 
F
S
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
Q
 
S
G
 
S
-
 
R
-
 
P
F
 
F
V
 
G
S
 
P
D
 
T
G
 
G
N
 
S
D
 
D
-
 
P
-
 
L
Q
 
Q
D
 
G
A
 
T
R
 
R
E
 
S
D
 
D
M
 
M
F
 
N
P
 
W
S
 
Q
K
 
D
V
 
V
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
S
A
 
G
D
 
K
S
 
S
N
 
A
F
 
A
D
 
S
T
 
V
G
 
A
H
 
H
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
M
 
-
E
 
-
I
 
W
S
 
Q
K
 
K
L
 
I
S
 
S
A
 
Q
I
 
F
R
 
R
K
 
A
A
 
R
T
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
G
R
 
A
G
 
G
R
 
K
Q
 
Q
V
 
T
T
 
T

Sites not aligning to the query:

8im8A Crystal structure of periplasmic alpha-amylase (mals) from e.Coli (see paper)
28% identity, 85% coverage: 10:521/604 of query aligns to 51:531/557 of 8im8A

query
sites
8im8A
L
 
L
L
 
L
A
 
L
G
 
L
T
 
E
V
 
R
A
 
A
S
 
E
A
 
T
Q
 
D
T
 
T
A
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
F
E
 
D
L
 
W
R
 
H
A
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
N
E
 
A
V
 
T
L
 
V
Y
 
Y
F
 
F
L
 
V
L
 
L
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
E
N
|
N
G
 
G
D
|
D
P
 
P
S
 
S
N
|
N
D
|
D
R
 
Q
G
 
S
-
 
Y
G
 
G
L
 
R
R
 
H
G
 
K
D
 
D
R
 
G
L
 
M
T
 
-
T
 
-
G
 
-
F
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
A
H
 
E
K
 
I
G
 
G
F
 
T
F
 
F
H
 
H
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
L
K
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
T
R
 
N
R
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
N
A
 
A
I
 
L
W
 
W
L
 
I
G
 
S
P
 
A
I
 
P
Y
 
F
K
 
E
N
 
Q
K
 
-
P
 
-
V
 
I
Q
 
H
G
 
G
G
 
W
P
 
V
G
 
G
Q
 
G
E
 
G
T
 
T
A
 
K
G
 
G
-
 
D
-
 
F
-
 
P
-
 
H
-
 
Y
-
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
W
 
Y
I
 
T
T
 
Q
D
 
D
F
 
W
T
 
T
R
 
N
V
 
L
D
 
D
P
 
A
H
 
N
F
 
M
G
 
G
T
 
N
N
 
E
D
 
A
E
 
D
M
 
L
K
 
R
A
 
T
F
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
S
A
 
A
H
 
H
A
 
Q
R
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
I
Y
 
L
L
 
F
D
 
D
I
 
V
I
 
V
T
 
M
N
|
N
H
 
H
T
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
M
I
 
Q
Q
 
E
Y
 
Y
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
-
K
 
Q
S
 
F
A
 
G
C
 
A
D
 
L
Y
 
Y
R
 
L
S
 
S
R
 
G
A
 
D
D
 
E
Y
 
-
P
 
-
Y
 
V
Q
 
K
R
 
K
K
 
S
G
 
L
G
 
G
V
 
E
K
 
R
G
 
W
A
 
S
A
 
D
I
 
W
N
 
K
P
 
P
G
 
A
F
 
-
A
 
A
G
 
G
D
 
Q
G
 
T
V
 
W
Q
 
H
T
 
S
P
 
F
E
 
N
N
 
D
F
 
Y
A
 
I
K
 
N
L
 
F
S
 
S
D
 
D
-
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
W
-
 
D
-
 
K
-
 
W
-
 
W
-
 
G
P
 
K
N
 
N
Y
 
W
A
 
I
Y
 
R
T
 
T
T
 
D
V
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
Y
-
 
D
V
 
N
P
 
P
E
 
G
A
 
F
E
 
D
R
 
D
T
x
L
V
 
T
K
 
M
V
 
S
P
 
L
A
 
A
W
 
F
L
 
L
N
 
P
D
|
D
P
 
-
I
 
-
H
 
-
Y
 
-
H
 
-
N
 
-
R
 
-
G
 
-
N
 
-
T
 
-
T
 
-
F
 
I
R
 
K
N
 
T
E
 
E
S
 
S
S
 
T
T
 
T
M
 
A
G
 
S
D
 
G
F
 
L
-
 
P
V
 
V
G
 
F
L
 
Y
D
 
K
D
 
N
L
 
K
M
 
M
T
 
D
E
 
T
S
 
H
P
 
A
R
 
K
V
 
A
L
 
I
Q
 
D
G
 
G
F
 
Y
I
 
T
-
 
P
-
 
R
D
 
D
I
 
Y
Y
 
L
G
 
T
A
 
H
W
 
W
I
 
L
D
 
S
Q
 
Q
-
 
W
-
 
V
-
 
R
-
 
D
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
F
 
F
R
 
R
I
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
K
H
|
H
V
 
V
N
 
E
P
 
L
E
 
P
F
 
A
W
 
W
Q
 
Q
G
 
Q
F
 
L
-
 
K
-
 
T
-
 
E
-
 
A
S
 
S
K
 
A
A
 
A
M
 
L
I
 
R
E
 
E
R
 
W
A
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
N
G
 
-
I
 
-
P
 
P
N
 
D
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
K
-
 
P
F
 
F
H
 
W
I
 
M
F
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
A
A
 
W
N
 
G
E
 
H
G
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
G
D
 
V
L
 
M
A
 
Q
L
 
S
H
 
D
T
 
Y
R
 
Y
V
 
R
H
 
H
Q
 
G
L
 
F
P
 
D
S
 
A
V
 
M
L
 
I
D
 
N
F
 
F
G
 
D
F
 
Y
R
 
Q
A
 
E
A
 
Q
V
 
A
Q
 
A
H
 
K
T
 
A
V
 
V
A
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
C
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
M
 
M
F
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
D
A
 
T
L
 
T
Y
 
W
E
 
Q
G
 
Q
G
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
K
-
 
L
-
 
Q
A
 
G
L
 
F
R
 
N
L
 
V
P
 
L
T
 
S
F
 
Y
I
 
L
S
 
S
N
 
S
H
 
H
D
 
D
H
 
T
G
 
R
R
 
L
F
 
F
S
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
R
K
 
E
A
 
G
F
 
G
P
 
D
K
 
K
A
 
A
S
 
A
D
 
E
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
-
M
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
A
R
 
P
G
 
G
V
 
A
P
 
V
T
 
Q
I
 
I
Y
 
F
S
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
Q
 
S
G
 
S
-
 
R
-
 
P
F
 
F
V
 
G
S
 
P
D
 
T
G
 
G
N
 
S
D
 
D
-
 
P
-
 
L
Q
 
Q
D
 
G
A
 
T
R
 
R
E
 
S
D
 
D
M
 
M
F
 
N
P
 
W
S
 
Q
K
 
D
V
 
V
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
S
A
 
G
D
 
K
S
 
S
N
 
A
F
 
A
D
 
S
T
 
V
G
 
A
H
 
H
P
 
-
L
 
-
Y
 
-
M
 
-
E
 
-
I
 
W
S
 
Q
K
 
K
L
 
I
S
 
S
A
 
Q
I
 
F
R
 
R
K
 
A
A
 
R
T
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
G
R
 
A
G
 
G
R
 
K
Q
 
Q
V
 
T
T
 
T

1dtuA Bacillus circulans strain 251 cyclodextrin glycosyltransferase: a mutant y89d/s146p complexed to an hexasaccharide inhibitor (see paper)
28% identity, 81% coverage: 32:522/604 of query aligns to 13:412/686 of 1dtuA

query
sites
1dtuA
E
 
S
T
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
I
L
 
F
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
S
N
x
D
G
 
G
D
x
N
P
 
P
S
 
A
N
|
N
D
x
N
R
 
P
G
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
F
D
 
D
R
 
G
L
 
T
T
 
C
T
 
T
G
 
N
F
 
L
D
 
R
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
L
F
 
Y
H
 
C
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
G
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
T
S
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
L
 
I
G
 
S
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
K
 
N
N
 
I
K
 
Y
P
 
S
V
 
I
Q
 
I
G
 
N
G
 
D
P
 
S
G
 
G
Q
 
V
E
 
N
T
 
N
A
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
|
Y
W
|
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
A
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
N
 
I
D
 
A
E
 
D
M
 
F
K
 
Q
A
 
N
F
 
L
V
 
I
D
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
G
 
N
I
 
I
K
 
K
V
 
V
Y
 
I
L
 
I
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
|
H
T
 
T
A
 
S
D
 
-
V
 
-
I
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
P
K
 
A
S
 
S
A
 
-
C
 
-
D
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
P
Y
 
D
Q
 
Q
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
P
 
P
G
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
T
K
 
L
V
 
L
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
T
I
 
Q
H
 
N
-
 
L
Y
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
N
G
 
G
N
 
G
T
 
T
T
 
D
F
 
F
R
 
S
-
 
T
N
 
T
E
 
E
S
 
N
S
 
G
T
x
I
M
 
Y
G
 
K
D
 
N
F
 
L
V
 
Y
G
 
D
L
 
L
D
 
A
D
|
D
L
 
L
M
 
N
T
 
H
E
 
N
S
 
N
P
 
S
R
 
T
V
 
V
L
 
D
Q
 
V
G
 
Y
F
 
L
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
I
G
 
K
A
 
M
W
 
W
I
 
L
D
 
D
Q
 
-
F
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
|
R
I
 
M
D
|
D
T
x
A
A
 
V
R
x
K
H
|
H
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
F
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
K
F
 
S
S
 
F
K
 
M
A
 
A
M
 
A
I
 
V
E
 
N
R
 
N
A
 
Y
K
 
K
A
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
P
N
 
V
F
 
F
H
 
-
I
 
T
F
 
F
G
 
G
E
|
E
V
 
W
A
x
F
N
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
L
G
 
G
D
 
V
L
 
N
A
 
E
L
 
V
H
 
S
T
 
P
R
 
E
V
 
N
H
 
H
Q
 
K
L
 
F
P
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
M
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
R
 
A
A
 
Q
A
 
K
V
 
V
Q
 
R
H
 
Q
T
 
V
V
 
F
A
 
R
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
N
L
 
T
A
 
D
A
 
N
M
 
M
F
 
Y
D
 
G
R
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
M
Y
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
S
A
 
A
E
 
A
A
 
D
A
 
Y
L
 
A
R
 
Q
L
 
V
P
 
D
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
E
R
 
R
F
 
F
S
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
H
A
 
A
S
 
S
D
 
N
D
 
A
E
 
N
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
R
V
 
R
K
 
K
L
 
L
A
 
E
H
 
Q
A
 
A
M
 
L
L
 
A
L
 
F
L
 
T
L
 
L
-
 
T
-
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
T
E
 
E
Q
 
Q
G
 
-
F
 
Y
V
 
M
S
 
S
D
 
G
G
 
G
N
 
T
D
|
D
Q
 
P
D
 
D
A
 
N
R
|
R
E
 
A
D
 
R
M
 
I
F
 
-
P
 
P
S
 
S
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
F
 
F
D
 
S
T
 
T
G
 
S
H
 
T
P
 
T
L
 
A
Y
 
Y
M
 
Q
E
 
V
I
 
I
S
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
C
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
S
Q
 
T
V
 
Q
T
x
E
R
|
R

Sites not aligning to the query:

2cxgA Cyclodextrin glycosyltransferase complexed to the inhibitor acarbose (see paper)
28% identity, 81% coverage: 32:522/604 of query aligns to 13:412/686 of 2cxgA

query
sites
2cxgA
E
 
S
T
 
T
E
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
F
 
Q
L
 
I
L
 
F
P
 
T
D
 
D
R
 
R
F
 
F
E
 
S
N
x
D
G
 
G
D
x
N
P
 
P
S
 
A
N
|
N
D
x
N
R
 
P
G
 
T
G
 
G
L
 
A
R
 
A
G
 
F
D
 
D
R
 
G
L
 
T
T
 
C
T
 
T
G
 
N
F
 
L
D
 
R
P
 
-
A
 
-
H
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
L
F
 
Y
H
 
C
G
|
G
G
 
G
D
|
D
L
 
W
K
 
Q
G
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
N
R
 
K
L
 
I
D
 
N
-
 
D
-
 
G
Y
 
Y
I
 
L
Q
 
T
S
 
G
L
 
M
G
 
G
A
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
L
 
I
G
 
S
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
Y
 
E
K
 
N
N
 
I
K
 
Y
P
 
S
V
 
I
Q
 
I
G
 
N
G
 
Y
P
 
S
G
 
G
Q
 
V
E
 
N
T
 
N
A
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
Y
|
Y
W
|
W
I
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
K
R
 
K
V
 
T
D
 
N
P
 
P
H
 
A
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
N
 
I
D
 
A
E
 
D
M
 
F
K
 
Q
A
 
N
F
 
L
V
 
I
D
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
R
 
K
G
 
N
I
 
I
K
 
K
V
 
V
Y
 
I
L
 
I
D
|
D
I
 
F
I
 
A
T
 
P
N
|
N
H
|
H
T
 
T
A
 
S
D
 
-
V
 
-
I
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
C
 
-
P
 
P
K
 
A
S
 
S
A
 
S
C
 
D
D
 
Q
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
P
 
P
G
 
S
F
 
F
A
 
A
G
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
R
L
 
L
S
 
Y
D
 
D
P
 
-
N
 
-
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
N
T
 
G
V
 
T
K
 
L
V
 
L
P
 
G
A
 
G
W
 
Y
L
 
T
N
 
N
D
 
D
P
 
T
I
 
Q
H
 
N
-
 
L
Y
 
F
H
 
H
N
 
H
R
 
N
G
 
G
N
 
G
T
 
T
T
 
D
F
 
F
R
 
S
-
 
T
N
 
T
E
 
E
S
 
N
S
 
G
T
x
I
M
 
Y
G
 
K
D
 
N
F
 
L
V
 
Y
G
 
D
L
|
L
D
 
A
D
|
D
L
 
L
M
 
N
T
 
H
E
 
N
S
 
N
P
 
S
R
 
T
V
 
V
L
 
D
Q
 
V
G
 
Y
F
 
L
I
 
K
D
 
D
I
 
A
Y
 
I
G
 
K
A
 
M
W
 
W
I
 
L
D
 
D
Q
 
-
F
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
G
F
 
I
R
|
R
I
 
M
D
|
D
T
x
A
A
 
V
R
x
K
H
|
H
V
 
M
N
 
-
P
 
P
E
 
F
F
 
G
W
 
W
Q
 
Q
G
 
K
F
 
S
S
 
F
K
 
M
A
 
A
M
 
A
I
 
V
E
 
N
R
 
N
A
 
Y
K
 
K
A
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
P
N
 
V
F
 
F
H
 
-
I
 
T
F
 
F
G
 
G
E
|
E
V
 
W
A
x
F
N
 
-
E
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
L
G
 
G
D
 
V
L
 
N
A
 
E
L
 
V
H
 
S
T
 
P
R
 
E
V
 
N
H
 
H
Q
 
K
L
 
F
P
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
M
S
 
S
V
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
R
F
 
F
R
 
A
A
 
Q
A
 
K
V
 
V
Q
 
R
H
 
Q
T
 
V
V
 
F
A
 
R
G
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
D
M
 
N
L
 
T
A
 
D
A
 
N
M
 
M
F
 
Y
D
 
G
R
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
M
Y
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
S
A
 
A
E
 
A
A
 
D
A
 
Y
L
 
A
R
 
Q
L
 
V
P
 
D
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
F
 
F
I
 
I
S
 
D
N
 
N
H
|
H
D
|
D
H
 
M
G
 
E
R
 
R
F
 
F
S
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
H
A
 
A
S
 
S
D
 
N
D
 
A
E
 
N
V
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
R
V
 
R
K
 
K
L
 
L
A
 
E
H
 
Q
A
 
A
M
 
L
L
 
A
L
 
F
L
 
T
L
 
L
-
 
T
-
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
S
 
Y
G
 
G
D
 
T
E
 
E
Q
 
Q
G
 
-
F
 
Y
V
 
M
S
 
S
D
 
G
G
 
G
N
 
T
D
|
D
Q
 
P
D
 
D
A
 
N
R
|
R
E
 
A
D
 
R
M
 
I
F
 
-
P
 
P
S
 
S
K
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
N
 
-
D
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
N
 
-
F
 
F
D
 
S
T
 
T
G
 
S
H
 
T
P
 
T
L
 
A
Y
 
Y
M
 
Q
E
 
V
I
 
I
S
 
Q
K
 
K
L
 
L
S
 
A
A
 
P
I
 
L
R
 
R
K
 
K
A
 
C
T
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
Y
G
 
G
R
 
S
Q
 
T
V
 
Q
T
x
E
R
|
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Ga0059261_1581 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_1581
MRSLAFALTLLAGTVASAQTAAPAELRARAAETEVLYFLLPDRFENGDPSNDRGGLRGDR
LTTGFDPAHKGFFHGGDLKGLIRRLDYIQSLGASAIWLGPIYKNKPVQGGPGQETAGYHG
YWITDFTRVDPHFGTNDEMKAFVDAAHARGIKVYLDIITNHTADVIQYRECPKSACDYRS
RADYPYQRKGGVKGAAINPGFAGDGVQTPENFAKLSDPNYAYTTVVPEAERTVKVPAWLN
DPIHYHNRGNTTFRNESSTMGDFVGLDDLMTESPRVLQGFIDIYGAWIDQFGIDGFRIDT
ARHVNPEFWQGFSKAMIERAKARGIPNFHIFGEVANEGDVGDLALHTRVHQLPSVLDFGF
RAAVQHTVAGEKGPDMLAAMFDRDALYEGGAEAALRLPTFISNHDHGRFSTDVRKAFPKA
SDDEVLARVKLAHAMLLLLRGVPTIYSGDEQGFVSDGNDQDAREDMFPSKVAIYNDNRLL
GTDKTTADSNFDTGHPLYMEISKLSAIRKATPALSRGRQVTRAYDEKPGLFAVSRFDPAS
GAEVLVAFNTSAAPITRQVEVGVSSTAFAPLVGQCAASASAPGSVTVTLPAFGYVACVAA
GGAK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory