SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ga0059261_1586 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_1586 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6cgqA Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and plp- ala (see paper)
34% identity, 69% coverage: 129:456/475 of query aligns to 3:312/339 of 6cgqA

query
sites
6cgqA
L
 
I
W
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
K
E
 
E
L
 
F
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
T
R
 
D
T
 
Q
E
 
T
N
 
P
I
 
A
V
 
L
S
 
T
L
 
L
G
 
H
E
 
E
I
 
G
A
 
N
T
 
T
P
 
P
I
 
L
V
 
I
P
 
H
L
 
L
N
 
P
K
 
K
V
 
L
A
 
S
A
 
E
G
 
Q
A
 
L
G
 
G
A
 
I
S
 
E
T
 
-
L
 
L
L
 
H
V
 
V
K
 
K
D
 
T
E
 
E
S
 
G
R
 
V
L
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
M
V
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
V
S
 
A
M
 
K
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
E
G
 
G
V
 
N
T
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
M
M
 
C
P
 
A
T
 
S
N
x
T
G
 
G
N
|
N
A
 
T
G
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
G
 
N
I
 
M
E
 
K
A
 
C
V
 
I
I
 
V
F
 
I
C
 
I
P
 
P
D
 
N
D
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
-
N
 
K
V
 
L
R
 
A
E
 
Q
I
 
A
A
 
V
A
 
M
Q
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
E
V
 
I
Y
 
I
R
 
A
V
 
I
N
 
D
G
 
G
L
 
N
I
 
F
D
 
D
D
 
D
C
 
A
G
 
L
K
 
K
L
 
I
V
 
V
G
 
R
A
 
S
G
 
I
K
 
C
E
 
E
A
 
K
N
 
S
G
 
P
W
 
I
F
 
A
D
 
L
L
 
V
S
 
N
T
 
S
L
 
V
K
 
N
E
 
-
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
T
 
T
M
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
V
A
 
C
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
E
L
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
A
Y
 
I
P
 
P
T
x
V
G
|
G
G
x
N
G
x
A
T
x
G
G
x
N
L
 
I
I
 
S
G
 
A
M
 
Y
W
 
W
K
 
K
A
 
G
F
 
F
E
 
K
E
 
E
L
 
Y
E
 
H
A
 
E
L
 
K
G
 
N
W
 
-
I
 
-
G
 
G
S
 
T
K
 
S
R
 
L
P
 
P
R
 
K
M
 
M
V
 
R
A
 
G
V
 
F
Q
x
E
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
x
S
A
 
A
P
 
A
M
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
-
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
N
T
 
E
R
 
V
W
 
I
E
 
E
D
 
N
A
 
P
H
 
E
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
T
G
x
A
I
 
I
R
 
R
V
 
I
P
 
G
Q
 
N
A
 
P
V
 
A
G
 
S
D
 
W
F
 
D
L
 
K
I
 
A
L
 
V
D
 
K
A
 
A
V
 
A
R
 
E
A
 
E
S
 
S
N
 
N
G
 
G
F
 
K
A
 
I
M
 
D
A
 
E
V
 
V
S
 
T
D
 
D
S
 
D
A
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
H
A
 
A
V
 
Y
D
 
Q
D
 
L
A
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
E
D
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
F
L
 
A
C
x
E
P
 
P
E
 
G
G
 
S
G
 
C
A
 
A
T
 
S
L
 
I
A
 
A
A
 
G
W
 
V
R
 
L
K
 
K
A
 
Q
L
 
V
V
 
K
D
 
S
G
 
G
L
 
E
I
 
I
A
 
P
P
 
K
D
 
G
D
 
S
R
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
A
F
 
V
N
 
L
C
x
T
A
x
G
T
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Y
 
D
P
 
P

6cgqB Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and plp- ala (see paper)
34% identity, 69% coverage: 129:456/475 of query aligns to 5:320/345 of 6cgqB

query
sites
6cgqB
L
 
I
W
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
K
E
 
E
L
 
F
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
T
R
 
D
T
 
Q
E
 
T
N
 
P
I
 
A
V
 
L
S
 
T
L
 
L
G
 
H
E
 
E
I
 
G
A
 
N
T
 
T
P
 
P
I
 
L
V
 
I
P
 
H
L
 
L
N
 
P
K
 
K
V
 
L
A
 
S
A
 
E
G
 
Q
A
 
L
G
 
G
A
 
I
S
 
E
T
 
-
L
 
L
L
 
H
V
 
V
K
 
K
D
 
T
E
 
E
S
 
G
R
 
V
L
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
M
V
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
V
S
 
A
M
 
K
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
E
G
 
G
V
 
N
T
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
M
M
 
C
P
 
A
T
x
S
N
x
T
G
 
G
N
|
N
A
x
T
G
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
G
 
N
I
 
M
E
 
K
A
 
C
V
 
I
I
 
V
F
 
I
C
 
I
P
 
P
D
 
N
D
 
G
T
 
K
P
 
I
E
 
A
I
 
F
-
 
G
N
 
K
V
 
L
R
 
A
E
 
Q
I
 
A
A
 
V
A
 
M
Q
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
E
V
 
I
Y
 
I
R
 
A
V
 
I
N
 
D
G
 
G
L
 
N
I
 
F
D
 
D
D
 
D
C
 
A
G
 
L
K
 
K
L
 
I
V
 
V
G
 
R
A
 
S
G
 
I
K
 
C
E
 
E
A
 
K
N
 
S
G
 
P
W
 
I
F
 
A
D
 
L
L
 
V
S
x
N
T
x
S
L
 
V
K
 
N
E
 
-
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
T
 
T
M
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
V
A
 
C
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
E
L
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
A
Y
 
I
P
 
P
T
x
V
G
|
G
G
x
N
G
x
A
T
 
G
G
x
N
L
 
I
I
 
S
G
 
A
M
 
Y
W
 
W
K
 
K
A
 
G
F
 
F
E
 
K
E
 
E
L
 
Y
E
 
H
A
 
E
L
 
K
G
 
N
W
 
-
I
 
-
G
 
G
S
 
T
K
 
S
R
 
L
P
 
P
R
 
K
M
 
M
V
 
R
A
 
G
V
 
F
Q
x
E
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
x
S
A
 
A
P
 
A
M
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
-
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
N
T
 
E
R
 
V
W
 
I
E
 
E
D
 
N
A
 
P
H
 
E
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
T
G
x
A
I
|
I
R
 
R
V
 
I
P
 
G
Q
 
N
A
 
P
V
 
A
G
 
S
D
 
W
F
 
D
L
 
K
I
 
A
L
 
V
D
 
K
A
 
A
V
 
A
R
 
E
A
 
E
S
 
S
N
 
N
G
 
G
F
 
K
A
 
I
M
 
D
A
 
E
V
 
V
S
 
T
D
 
D
S
 
D
A
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
H
A
 
A
V
 
Y
D
 
Q
D
 
L
A
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
E
D
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
F
L
 
A
C
x
E
P
 
P
E
 
G
G
 
S
G
 
C
A
 
A
T
 
S
L
 
I
A
 
A
A
 
G
W
 
V
R
 
L
K
 
K
A
 
Q
L
 
V
V
 
K
D
 
S
G
 
G
L
 
E
I
 
I
A
 
P
P
 
K
D
 
G
D
 
S
R
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
A
F
 
V
N
 
L
C
x
T
A
 
G
T
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Y
 
D
P
 
P

6nmxA Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and appa (see paper)
34% identity, 69% coverage: 129:456/475 of query aligns to 7:322/350 of 6nmxA

query
sites
6nmxA
L
 
I
W
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
K
E
 
E
L
 
F
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
T
R
 
D
T
 
Q
E
 
T
N
 
P
I
 
A
V
 
L
S
 
T
L
 
L
G
 
H
E
 
E
I
 
G
A
 
N
T
 
T
P
 
P
I
 
L
V
 
I
P
 
H
L
 
L
N
 
P
K
 
K
V
 
L
A
 
S
A
 
E
G
 
Q
A
 
L
G
 
G
A
 
I
S
 
E
T
 
-
L
 
L
L
 
H
V
 
V
K
 
K
D
 
T
E
 
E
S
 
G
R
 
V
L
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
M
V
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
V
S
 
A
M
 
K
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
E
G
 
G
V
 
N
T
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
M
M
 
C
P
 
A
T
x
S
N
x
T
G
 
G
N
|
N
A
x
T
G
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
G
 
N
I
 
M
E
 
K
A
 
C
V
 
I
I
 
V
F
 
I
C
 
I
P
 
P
D
 
N
D
 
G
T
 
K
P
 
I
E
 
A
I
 
F
-
 
G
N
 
K
V
 
L
R
 
A
E
 
Q
I
 
A
A
 
V
A
 
M
Q
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
E
V
 
I
Y
 
I
R
 
A
V
 
I
N
 
D
G
 
G
L
 
N
I
x
F
D
 
D
D
 
D
C
 
A
G
 
L
K
 
K
L
 
I
V
 
V
G
 
R
A
 
S
G
 
I
K
 
C
E
 
E
A
 
K
N
 
S
G
 
P
W
 
I
F
 
A
D
 
L
L
 
V
S
x
N
T
x
S
L
 
V
K
 
N
E
 
-
P
 
P
Y
 
Y
R
|
R
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
T
 
T
M
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
V
A
 
C
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
E
L
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
V
I
 
L
F
 
A
Y
 
I
P
 
P
T
x
V
G
|
G
G
x
N
G
x
A
T
x
G
G
x
N
L
 
I
I
 
S
G
 
A
M
 
Y
W
 
W
K
 
K
A
 
G
F
 
F
E
 
K
E
 
E
L
 
Y
E
 
H
A
 
E
L
 
K
G
 
N
W
 
-
I
 
-
G
 
G
S
 
T
K
 
S
R
 
L
P
 
P
R
 
K
M
 
M
V
 
R
A
 
G
V
 
F
Q
x
E
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
x
S
A
 
A
P
 
A
M
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
-
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
N
T
 
E
R
 
V
W
 
I
E
 
E
D
 
N
A
 
P
H
 
E
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
T
G
x
A
I
|
I
R
 
R
V
 
I
P
 
G
Q
 
N
A
 
P
V
 
A
G
 
S
D
 
W
F
 
D
L
 
K
I
 
A
L
 
V
D
 
K
A
 
A
V
 
A
R
 
E
A
 
E
S
 
S
N
 
N
G
 
G
F
 
K
A
 
I
M
 
D
A
 
E
V
 
V
S
 
T
D
 
D
S
 
D
A
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
H
A
 
A
V
 
Y
D
 
Q
D
 
L
A
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
E
D
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
F
L
 
A
C
x
E
P
 
P
E
 
G
G
 
S
G
 
C
A
 
A
T
 
S
L
 
I
A
 
A
A
 
G
W
 
V
R
 
L
K
 
K
A
 
Q
L
 
V
V
 
K
D
 
S
G
 
G
L
 
E
I
 
I
A
 
P
P
 
K
D
 
G
D
 
S
R
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
A
F
 
V
N
 
L
C
x
T
A
 
G
T
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Y
 
D
P
 
P

1uimA Crystal structure of threonine synthase from thermus thermophilus hb8, orthorhombic crystal form (see paper)
35% identity, 70% coverage: 124:456/475 of query aligns to 1:324/350 of 1uimA

query
sites
1uimA
L
 
M
R
 
R
P
 
P
A
 
P
D
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
E
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
S
R
 
E
T
 
K
E
 
T
N
 
P
I
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
G
 
L
E
 
E
I
 
G
A
 
S
T
 
T
P
 
P
I
 
L
V
 
I
P
 
P
L
 
L
N
 
K
-
 
G
K
 
P
V
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
R
A
 
K
G
 
K
A
 
G
S
 
I
T
 
R
L
 
L
L
 
Y
V
 
A
K
 
K
D
 
Y
E
 
E
S
 
G
R
 
L
L
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
M
V
 
T
M
 
L
A
 
A
I
 
V
S
 
S
M
 
K
A
 
A
K
 
V
E
 
E
L
 
G
G
 
G
V
 
A
T
 
Q
T
 
A
I
 
V
A
 
A
M
 
C
P
 
A
T
 
S
N
x
T
G
 
G
N
|
N
A
 
T
G
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
L
A
 
A
V
 
I
I
 
V
F
 
V
C
 
L
P
 
P
D
 
A
D
 
G
T
 
Y
P
 
V
E
 
A
I
 
L
-
 
G
N
 
K
V
 
V
R
 
A
E
 
Q
I
 
S
A
 
L
A
 
V
Q
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
I
Y
 
V
R
 
Q
V
 
V
N
 
E
G
 
G
L
 
N
I
 
F
D
 
D
D
 
D
C
 
A
G
 
L
K
 
R
L
 
L
V
 
T
G
 
Q
A
 
K
G
 
L
K
 
T
E
 
E
A
 
A
N
 
-
G
 
-
W
 
-
F
 
F
D
 
P
L
 
V
S
 
A
T
 
L
L
 
V
K
 
N
-
 
S
-
 
V
E
 
N
P
 
P
Y
 
H
R
 
R
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
T
 
T
M
 
L
G
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
V
A
 
V
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
D
L
 
A
P
 
P
D
 
H
V
 
Y
I
 
H
F
 
A
Y
 
L
P
 
P
T
 
V
G
|
G
G
x
N
G
x
A
T
x
G
G
x
N
L
 
I
I
 
T
G
 
A
M
 
H
W
 
W
K
 
M
A
 
G
F
 
Y
E
 
K
E
 
A
L
 
Y
E
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
K
I
 
-
G
 
A
S
 
K
K
 
R
R
 
L
P
|
P
R
 
R
M
 
M
V
 
L
A
x
G
V
 
F
Q
|
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
V
R
 
L
A
 
G
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
R
H
 
P
A
 
V
T
 
E
R
 
R
W
 
P
E
 
E
D
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
x
A
I
 
I
R
 
R
V
 
I
P
 
G
Q
 
N
A
 
P
V
 
A
G
 
S
D
 
W
F
 
Q
L
 
G
I
 
A
L
 
V
D
 
R
A
 
A
V
 
K
R
 
E
A
 
E
S
 
S
N
 
G
G
 
G
F
 
V
A
 
I
M
 
E
A
 
A
V
 
V
S
 
T
D
 
D
S
 
E
A
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
F
A
 
A
V
 
Y
D
 
R
D
 
Y
A
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
E
D
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
F
L
 
C
C
x
E
P
 
P
E
 
A
G
 
S
G
 
A
A
 
A
T
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
G
W
 
V
R
 
F
K
 
K
A
 
L
L
 
L
V
 
R
D
 
E
G
 
G
L
 
R
I
 
L
A
 
E
P
 
P
D
 
E
D
 
S
R
 
T
A
 
V
V
 
V
L
 
L
F
 
T
N
 
L
C
x
T
A
x
G
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Y
 
D
P
 
P

3aexA Catalytic intermediate analogue of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
35% identity, 70% coverage: 124:456/475 of query aligns to 1:324/351 of 3aexA

query
sites
3aexA
L
 
M
R
 
R
P
 
P
A
 
P
D
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
E
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
S
R
 
E
T
 
K
E
 
T
N
 
P
I
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
G
 
L
E
 
E
I
 
G
A
 
S
T
 
T
P
 
P
I
 
L
V
 
I
P
 
P
L
 
L
N
 
K
-
 
G
K
 
P
V
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
R
A
 
K
G
 
K
A
 
G
S
 
I
T
 
R
L
 
L
L
 
Y
V
 
A
K
 
K
D
 
Y
E
 
E
S
 
G
R
 
L
L
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
M
V
 
T
M
 
L
A
 
A
I
 
V
S
 
S
M
 
K
A
 
A
K
 
V
E
 
E
L
 
G
G
 
G
V
 
A
T
 
Q
T
 
A
I
 
V
A
 
A
M
 
C
P
 
A
T
x
S
N
x
T
G
 
G
N
|
N
A
x
T
G
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
L
A
 
A
V
 
I
I
 
V
F
 
V
C
 
L
P
 
P
D
 
A
D
 
G
T
 
Y
P
 
V
E
 
A
I
 
L
-
 
G
N
 
K
V
 
V
R
 
A
E
 
Q
I
 
S
A
 
L
A
 
V
Q
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
I
Y
 
V
R
 
Q
V
 
V
N
 
E
G
 
G
L
 
N
I
 
F
D
 
D
D
 
D
C
 
A
G
 
L
K
 
R
L
 
L
V
 
T
G
 
Q
A
 
K
G
 
L
K
 
T
E
 
E
A
 
A
N
 
-
G
 
-
W
 
-
F
 
F
D
 
P
L
 
V
S
 
A
T
 
L
L
 
V
K
x
N
-
x
S
-
 
V
E
 
N
P
 
P
Y
 
H
R
|
R
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
T
 
T
M
 
L
G
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
V
A
 
V
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
D
L
 
A
P
 
P
D
 
H
V
 
Y
I
 
H
F
 
A
Y
 
L
P
 
P
T
x
V
G
|
G
G
x
N
G
x
A
T
x
G
G
x
N
L
 
I
I
 
T
G
 
A
M
 
H
W
 
W
K
 
M
A
 
G
F
 
Y
E
 
K
E
 
A
L
 
Y
E
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
K
I
 
-
G
 
A
S
 
K
K
 
R
R
 
L
P
|
P
R
 
R
M
 
M
V
 
L
A
x
G
V
 
F
Q
|
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
V
R
 
L
A
 
G
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
R
H
 
P
A
 
V
T
 
E
R
 
R
W
 
P
E
 
E
D
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
x
A
I
|
I
R
 
R
V
 
I
P
 
G
Q
 
N
A
 
P
V
 
A
G
 
S
D
 
W
F
 
Q
L
 
G
I
 
A
L
 
V
D
 
R
A
 
A
V
 
K
R
 
E
A
 
E
S
 
S
N
 
G
G
 
G
F
 
V
A
 
I
M
 
E
A
 
A
V
 
V
S
 
T
D
 
D
S
 
E
A
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
F
A
 
A
V
 
Y
D
 
R
D
 
Y
A
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
E
D
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
F
L
 
C
C
x
E
P
 
P
E
 
A
G
 
S
G
 
A
A
 
A
T
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
G
W
 
V
R
 
F
K
 
K
A
 
L
L
 
L
V
 
R
D
 
E
G
 
G
L
 
R
I
 
L
A
 
E
P
 
P
D
 
E
D
 
S
R
 
T
A
 
V
V
 
V
L
 
L
F
 
T
N
 
L
C
x
T
A
 
G
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Y
 
D
P
 
P

1v7cA Crystal structure of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 in complex with a substrate analogue (see paper)
35% identity, 70% coverage: 124:456/475 of query aligns to 1:324/351 of 1v7cA

query
sites
1v7cA
L
 
M
R
 
R
P
 
P
A
 
P
D
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
E
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
S
R
 
E
T
 
K
E
 
T
N
 
P
I
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
G
 
L
E
 
E
I
 
G
A
 
S
T
 
T
P
 
P
I
 
L
V
 
I
P
 
P
L
 
L
N
 
K
-
 
G
K
 
P
V
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
R
A
 
K
G
 
K
A
 
G
S
 
I
T
 
R
L
 
L
L
 
Y
V
 
A
K
 
K
D
 
Y
E
 
E
S
 
G
R
 
L
L
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
M
V
 
T
M
 
L
A
 
A
I
 
V
S
 
S
M
 
K
A
 
A
K
 
V
E
 
E
L
 
G
G
 
G
V
 
A
T
 
Q
T
 
A
I
 
V
A
 
A
M
 
C
P
 
A
T
x
S
N
x
T
G
 
G
N
|
N
A
x
T
G
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
L
A
 
A
V
 
I
I
 
V
F
 
V
C
 
L
P
 
P
D
 
A
D
 
G
T
 
Y
P
 
V
E
 
A
I
 
L
-
 
G
N
 
K
V
 
V
R
 
A
E
 
Q
I
 
S
A
 
L
A
 
V
Q
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
I
Y
 
V
R
 
Q
V
 
V
N
 
E
G
 
G
L
 
N
I
x
F
D
 
D
D
 
D
C
 
A
G
 
L
K
 
R
L
 
L
V
 
T
G
 
Q
A
 
K
G
 
L
K
 
T
E
 
E
A
 
A
N
 
-
G
 
-
W
 
-
F
 
F
D
 
P
L
 
V
S
 
A
T
 
L
L
 
V
K
x
N
-
x
S
-
 
V
E
 
N
P
 
P
Y
 
H
R
|
R
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
T
 
T
M
 
L
G
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
V
A
 
V
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
D
L
 
A
P
 
P
D
 
H
V
 
Y
I
 
H
F
 
A
Y
 
L
P
 
P
T
x
V
G
|
G
G
x
N
G
x
A
T
x
G
G
x
N
L
 
I
I
 
T
G
 
A
M
 
H
W
 
W
K
 
M
A
 
G
F
 
Y
E
 
K
E
 
A
L
 
Y
E
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
K
I
 
-
G
 
A
S
 
K
K
 
R
R
 
L
P
|
P
R
 
R
M
 
M
V
 
L
A
x
G
V
 
F
Q
|
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
V
R
 
L
A
 
G
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
R
H
 
P
A
 
V
T
 
E
R
 
R
W
 
P
E
 
E
D
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
x
A
I
|
I
R
 
R
V
 
I
P
 
G
Q
 
N
A
 
P
V
 
A
G
 
S
D
 
W
F
 
Q
L
 
G
I
 
A
L
 
V
D
 
R
A
 
A
V
 
K
R
 
E
A
 
E
S
 
S
N
 
G
G
 
G
F
 
V
A
 
I
M
 
E
A
 
A
V
 
V
S
 
T
D
 
D
S
 
E
A
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
F
A
 
A
V
 
Y
D
 
R
D
 
Y
A
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
E
D
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
F
L
 
C
C
x
E
P
 
P
E
 
A
G
 
S
G
 
A
A
 
A
T
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
G
W
 
V
R
 
F
K
 
K
A
 
L
L
 
L
V
 
R
D
 
E
G
 
G
L
 
R
I
 
L
A
 
E
P
 
P
D
 
E
D
 
S
R
 
T
A
 
V
V
 
V
L
 
L
F
 
T
N
 
L
C
x
T
A
 
G
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Y
 
D
P
 
P

3aeyA Apo form of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
35% identity, 70% coverage: 125:456/475 of query aligns to 1:323/350 of 3aeyA

query
sites
3aeyA
R
 
R
P
 
P
A
 
P
D
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
E
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
S
R
 
E
T
 
K
E
 
T
N
 
P
I
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
L
G
 
L
E
 
E
I
 
G
A
 
S
T
 
T
P
 
P
I
 
L
V
 
I
P
 
P
L
 
L
N
 
K
-
 
G
K
 
P
V
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
R
A
 
K
G
 
K
A
 
G
S
 
I
T
 
R
L
 
L
L
 
Y
V
 
A
K
 
K
D
 
Y
E
 
E
S
 
G
R
 
L
L
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
M
V
 
T
M
 
L
A
 
A
I
 
V
S
 
S
M
 
K
A
 
A
K
 
V
E
 
E
L
 
G
G
 
G
V
 
A
T
 
Q
T
 
A
I
 
V
A
 
A
M
 
C
P
 
A
T
 
S
N
x
T
G
|
G
N
|
N
A
x
T
G
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
L
A
 
A
V
 
I
I
 
V
F
 
V
C
 
L
P
 
P
D
 
A
D
 
G
T
 
Y
P
 
V
E
 
A
I
 
L
-
 
G
N
 
K
V
 
V
R
 
A
E
 
Q
I
 
S
A
 
L
A
 
V
Q
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
I
Y
 
V
R
 
Q
V
 
V
N
 
E
G
 
G
L
 
N
I
 
F
D
 
D
D
 
D
C
 
A
G
 
L
K
 
R
L
 
L
V
 
T
G
 
Q
A
 
K
G
 
L
K
 
T
E
 
E
A
 
A
N
 
-
G
 
-
W
 
-
F
 
F
D
 
P
L
 
V
S
 
A
T
 
L
L
 
V
K
 
N
-
x
S
-
 
V
E
 
N
P
 
P
Y
 
H
R
|
R
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
T
 
T
M
 
L
G
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
V
A
 
V
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
D
L
 
A
P
 
P
D
 
H
V
 
Y
I
 
H
F
 
A
Y
 
L
P
 
P
T
 
V
G
 
G
G
x
N
G
 
A
T
 
G
G
 
N
L
 
I
I
 
T
G
 
A
M
 
H
W
 
W
K
 
M
A
 
G
F
 
Y
E
 
K
E
 
A
L
 
Y
E
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
K
I
 
-
G
 
A
S
 
K
K
 
R
R
 
L
P
|
P
R
 
R
M
 
M
V
 
L
A
x
G
V
 
F
Q
|
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
V
R
 
L
A
 
G
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
R
|
R
H
 
P
A
x
V
T
x
E
R
|
R
W
 
P
E
 
E
D
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
x
A
I
 
I
R
 
R
V
 
I
P
 
G
Q
 
N
A
 
P
V
 
A
G
 
S
D
 
W
F
 
Q
L
 
G
I
 
A
L
 
V
D
 
R
A
 
A
V
 
K
R
 
E
A
 
E
S
 
S
N
 
G
G
 
G
F
 
V
A
 
I
M
 
E
A
 
A
V
 
V
S
 
T
D
 
D
S
 
E
A
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
F
A
 
A
V
 
Y
D
 
R
D
 
Y
A
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
E
D
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
F
L
 
C
C
 
E
P
 
P
E
 
A
G
 
S
G
 
A
A
 
A
T
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
G
W
 
V
R
 
F
K
 
K
A
 
L
L
 
L
V
 
R
D
 
E
G
 
G
L
 
R
I
 
L
A
 
E
P
 
P
D
 
E
D
 
S
R
 
T
A
 
V
V
 
V
L
 
L
F
 
T
N
 
L
C
x
T
A
 
G
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Y
 
D
P
 
P

P9WG59 Threonine synthase; TS; EC 4.2.3.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
34% identity, 70% coverage: 126:456/475 of query aligns to 13:333/360 of P9WG59

query
sites
P9WG59
P
 
P
A
 
G
D
 
V
L
 
I
W
 
A
R
 
A
Y
 
Y
R
 
R
E
 
D
L
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
G
R
 
D
T
 
D
E
 
W
N
 
T
I
 
P
V
 
V
S
 
T
L
 
L
G
 
L
E
 
E
I
 
G
A
 
G
T
 
T
P
 
P
I
 
L
V
 
I
P
 
A
L
 
A
N
 
T
K
 
N
V
 
L
A
 
S
A
 
K
G
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
C
S
 
-
T
 
T
L
 
I
L
 
H
V
 
L
K
 
K
D
 
V
E
 
E
S
 
G
R
 
L
L
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
M
V
 
T
M
 
M
A
 
A
I
 
V
S
 
T
M
 
D
A
 
A
K
 
L
E
 
A
L
 
H
G
 
G
V
 
Q
T
 
R
T
 
A
I
 
V
A
 
L
M
 
C
P
 
A
T
 
S
N
 
T
G
 
G
N
|
N
A
 
T
G
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
T
A
 
C
V
 
A
I
 
V
F
 
L
C
 
I
P
 
P
D
 
Q
D
 
G
T
 
K
P
 
I
E
 
A
I
 
M
-
 
G
N
 
K
V
 
L
R
 
A
E
 
Q
I
 
A
A
 
V
A
 
M
Q
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
Y
 
I
R
 
Q
V
 
I
N
 
D
G
 
G
L
 
N
I
 
F
D
 
D
D
 
D
C
 
C
G
 
L
K
 
E
L
 
L
V
 
-
G
 
-
A
 
A
G
 
R
K
|
K
E
 
M
A
 
A
N
 
A
G
 
D
W
 
F
F
 
P
D
 
T
L
 
I
S
 
S
T
 
L
L
 
V
K
 
N
-
 
S
-
 
V
E
 
N
P
 
P
Y
 
V
R
 
R
I
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
T
 
T
M
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
I
A
 
V
E
 
D
Q
 
V
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
T
L
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
V
I
 
H
F
 
A
Y
 
L
P
 
P
T
 
V
G
|
G
G
x
N
G
x
A
T
x
G
G
x
N
L
 
I
I
 
T
G
 
A
M
 
Y
W
 
W
K
 
K
A
 
G
F
 
Y
E
 
T
E
 
E
L
 
Y
E
 
H
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
L
I
 
I
G
 
-
S
 
D
K
 
K
R
 
L
P
 
P
R
 
R
M
 
M
V
 
L
A
 
G
V
 
T
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
V
R
 
L
A
 
-
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
G
E
 
E
R
 
-
H
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
P
W
 
V
E
 
S
D
 
H
A
 
P
H
 
E
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
T
G
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
I
P
 
G
Q
 
S
A
 
P
V
 
A
G
 
S
D
 
W
F
 
T
L
 
S
I
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
Q
R
 
Q
A
 
Q
S
 
S
N
 
K
G
 
G
F
 
R
A
 
F
M
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
S
D
 
D
S
 
E
A
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
A
A
 
A
V
 
Y
D
 
H
D
 
L
A
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
V
D
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
F
L
 
V
C
 
E
P
 
P
E
 
A
G
 
S
G
 
A
A
 
A
T
 
S
L
 
I
A
 
A
A
 
G
W
 
L
R
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
D
D
 
D
G
 
G
L
 
W
I
 
V
A
 
A
P
 
R
D
 
G
D
 
S
R
 
T
A
 
V
V
 
V
L
 
C
F
 
T
N
 
V
C
x
T
A
 
G
T
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Y
 
D
P
 
P

2d1fA Structure of mycobacterium tuberculosis threonine synthase (see paper)
34% identity, 70% coverage: 126:456/475 of query aligns to 4:324/349 of 2d1fA

query
sites
2d1fA
P
 
P
A
 
G
D
 
V
L
 
I
W
 
A
R
 
A
Y
 
Y
R
 
R
E
 
D
L
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
G
R
 
D
T
 
D
E
 
W
N
 
T
I
 
P
V
 
V
S
 
T
L
 
L
G
 
L
E
 
E
I
 
G
A
 
G
T
 
T
P
 
P
I
 
L
V
 
I
P
 
A
L
 
A
N
 
T
K
 
N
V
 
L
A
 
S
A
 
K
G
 
Q
A
 
T
G
 
G
A
 
C
S
 
-
T
 
T
L
 
I
L
 
H
V
 
L
K
 
K
D
 
V
E
 
E
S
 
G
R
 
L
L
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
M
V
 
T
M
 
M
A
 
A
I
 
V
S
 
T
M
 
D
A
 
A
K
 
L
E
 
A
L
 
H
G
 
G
V
 
Q
T
 
R
T
 
A
I
 
V
A
 
L
M
 
C
P
 
A
T
 
S
N
x
T
G
 
G
N
|
N
A
 
T
G
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
T
A
 
C
V
 
A
I
 
V
F
 
L
C
 
I
P
 
P
D
 
Q
D
 
G
T
 
K
P
 
I
E
 
A
I
 
M
-
 
G
N
 
K
V
 
L
R
 
A
E
 
Q
I
 
A
A
 
V
A
 
M
Q
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
Y
 
I
R
 
Q
V
 
I
N
 
D
G
 
G
L
 
N
I
 
F
D
 
D
D
 
D
C
 
C
G
 
L
K
 
E
L
 
L
V
 
-
G
 
-
A
 
A
G
 
R
K
 
K
E
 
M
A
 
A
N
 
A
G
 
D
W
 
F
F
 
P
D
 
T
L
 
I
S
 
S
T
 
L
L
 
V
K
 
N
-
 
S
-
 
V
E
 
N
P
 
P
Y
 
V
R
 
R
I
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
T
 
T
M
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
I
A
 
V
E
 
D
Q
 
V
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
T
L
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
V
I
 
H
F
 
A
Y
 
L
P
 
P
T
x
V
G
|
G
G
x
N
G
x
A
T
x
G
G
x
N
L
 
I
I
 
T
G
 
A
M
 
Y
W
 
W
K
 
K
A
 
G
F
 
Y
E
 
T
E
 
E
L
 
Y
E
 
H
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
L
I
 
I
G
 
-
S
x
D
K
 
K
R
 
L
P
 
P
R
|
R
M
 
M
V
x
L
A
 
G
V
 
T
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
V
R
 
L
A
 
-
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
G
E
 
E
R
 
P
H
 
V
A
 
S
T
 
-
R
 
-
W
 
-
E
 
-
D
 
H
A
 
P
H
 
E
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
T
G
x
A
I
 
I
R
 
R
V
 
I
P
 
G
Q
 
S
A
 
P
V
 
A
G
 
S
D
 
W
F
 
T
L
 
S
I
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
Q
R
 
Q
A
 
Q
S
 
S
N
 
K
G
 
G
F
 
R
A
 
F
M
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
S
D
 
D
S
 
E
A
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
A
A
 
A
V
 
Y
D
 
H
D
 
L
A
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
V
D
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
F
L
 
V
C
 
E
P
 
P
E
 
A
G
 
S
G
 
A
A
 
A
T
 
S
L
 
I
A
 
A
A
 
G
W
 
L
R
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
D
D
 
D
G
 
G
L
 
W
I
 
V
A
 
A
P
 
R
D
 
G
D
 
S
R
 
T
A
 
V
V
 
V
L
 
C
F
 
T
N
 
V
C
x
T
A
 
G
T
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Y
 
D
P
 
P

Q9S7B5 Threonine synthase 1, chloroplastic; Protein METHIONINE OVER-ACCUMULATOR 2; EC 4.2.3.1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
26% identity, 98% coverage: 3:468/475 of query aligns to 12:487/526 of Q9S7B5

query
sites
Q9S7B5
A
 
S
R
 
S
M
 
L
A
 
N
P
 
P
D
 
K
A
 
Q
K
 
D
A
 
P
L
 
I
R
 
R
R
 
R
M
 
H
R
 
R
-
 
S
-
 
T
-
 
S
L
 
L
K
 
L
A
 
R
E
 
H
R
 
R
G
 
P
I
 
V
L
 
V
V
 
I
S
 
S
L
 
C
S
 
T
G
 
A
W
 
D
R
 
G
Q
 
N
R
 
N
S
 
I
T
 
K
R
 
A
P
 
P
I
 
I
N
 
E
D
 
T
K
 
A
G
 
-
W
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
-
H
 
-
V
 
V
R
 
K
P
 
P
L
 
P
D
 
H
R
 
R
D
 
T
G
 
E
D
 
D
A
 
N
P
 
I
Y
 
R
V
 
D
I
 
E
A
 
A
M
 
R
R
 
R
N
 
N
D
 
R
D
 
S
N
 
N
-
 
A
L
 
V
S
 
N
A
 
P
A
 
F
R
 
S
P
 
A
T
 
K
F
 
Y
V
 
V
T
 
P
H
 
F
L
 
N
E
 
A
C
 
A
S
 
P
M
 
G
T
 
S
G
 
T
E
 
E
R
 
S
Y
 
Y
D
 
S
A
 
L
D
 
D
T
 
E
L
 
I
H
 
V
G
 
Y
L
 
R
S
 
S
R
 
R
T
 
S
G
 
G
R
 
G
P
 
L
L
 
L
L
 
D
V
 
V
R
 
E
Y
 
H
D
 
D
L
 
M
D
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
K
-
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
W
-
 
R
-
 
D
A
 
L
A
 
F
V
 
D
S
 
S
P
 
R
A
 
V
D
 
G
L
 
K
A
 
S
L
 
T
R
 
W
P
 
P
-
 
Y
-
 
G
A
 
S
D
 
G
L
 
V
W
 
W
R
 
S
Y
 
K
R
 
K
E
 
E
-
 
W
L
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
E
R
 
I
R
 
D
T
 
D
E
 
D
N
 
D
I
 
I
V
 
V
S
 
S
L
 
A
G
 
F
E
 
E
I
 
G
A
 
N
T
 
S
P
x
N
I
x
L
V
 
F
P
 
W
L
 
A
N
 
E
K
 
R
V
 
F
A
 
G
A
x
K
G
 
Q
A
 
F
-
 
L
G
 
G
A
 
M
S
x
N
T
 
D
L
 
L
L
 
W
V
 
V
K
 
K
D
 
H
E
 
C
S
 
G
R
 
I
L
 
S
P
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
A
 
D
R
x
L
G
 
G
L
 
M
V
 
T
M
 
V
A
 
L
I
 
V
S
 
S
M
 
Q
A
 
V
K
 
N
E
 
R
L
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
R
G
 
P
V
 
V
T
 
V
T
 
G
I
 
V
A
 
G
M
 
C
P
 
A
T
 
S
N
 
T
G
 
G
N
 
D
A
 
T
G
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
S
A
 
A
Y
 
Y
A
 
C
A
 
A
Q
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
P
A
 
S
V
 
I
I
 
V
F
 
F
C
 
L
P
 
P
D
 
A
D
 
N
T
 
K
P
 
I
E
 
S
I
 
M
-
 
A
N
 
Q
V
 
L
R
 
V
E
 
Q
I
 
P
A
 
I
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
F
V
 
V
Y
 
L
R
 
S
V
 
I
N
 
D
G
 
T
L
 
D
I
 
F
D
 
D
D
 
G
C
 
C
G
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
I
G
 
R
A
 
E
G
 
I
K
 
T
E
 
A
A
 
E
N
 
L
G
 
P
W
 
I
F
 
Y
D
 
L
L
 
A
S
 
N
T
 
S
L
 
L
K
 
N
E
 
S
P
 
-
Y
 
L
R
 
R
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
T
 
T
M
 
A
G
 
A
L
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
F
G
 
D
W
 
W
E
 
Q
L
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
W
I
 
V
F
 
I
Y
 
V
P
 
P
T
 
G
G
 
G
G
 
N
G
 
L
T
 
G
G
 
N
L
 
I
I
 
Y
G
 
A
M
 
F
W
 
Y
K
 
K
A
 
G
F
 
F
E
 
K
E
 
M
L
 
C
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
L
I
 
V
G
 
-
S
 
D
K
 
R
R
 
I
P
 
P
R
 
R
M
 
M
V
 
V
A
 
C
V
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
N
C
 
A
A
 
N
P
 
P
M
 
L
V
 
Y
R
 
L
A
 
H
W
 
Y
Q
 
K
G
 
S
G
 
G
E
 
W
R
 
K
H
 
D
A
 
F
T
 
K
R
 
P
W
 
M
E
 
T
D
 
A
A
 
S
H
 
T
T
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
S
G
 
A
I
 
I
R
 
Q
V
 
I
P
 
G
Q
 
D
A
 
P
V
 
V
G
 
S
D
 
I
F
 
D
L
 
R
I
 
A
L
 
V
D
 
Y
A
 
A
V
 
L
R
 
K
A
 
K
S
 
C
N
 
N
G
 
G
F
 
I
A
 
V
M
 
E
A
 
E
V
 
A
S
 
T
D
 
E
S
 
E
A
 
E
I
 
L
L
 
M
E
 
D
A
 
A
V
 
M
D
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
D
R
 
S
L
 
T
D
 
-
G
 
G
L
 
M
L
 
F
L
 
I
C
 
C
P
 
P
E
 
H
G
 
T
G
 
G
A
 
V
T
 
A
L
 
L
A
 
T
A
 
A
W
 
L
R
 
F
K
 
K
A
 
L
L
 
R
V
 
N
D
 
Q
G
 
G
L
 
V
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
T
D
 
D
R
 
R
A
 
T
V
 
V
L
 
V
F
 
V
N
 
S
C
 
T
A
 
A
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Y
 
F
P
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
T
Q
 
Q
S
 
S
R
 
K
T
 
-
L
 
I
D
 
D
R
 
Y
H
 
H
G
 
S

2c2bA Crystallographic structure of arabidopsis thaliana threonine synthase complexed with pyridoxal phosphate and s-adenosylmethionine (see paper)
27% identity, 81% coverage: 85:467/475 of query aligns to 17:411/444 of 2c2bA

query
sites
2c2bA
T
 
S
G
 
T
E
 
E
R
 
S
Y
 
Y
D
 
S
A
 
L
D
 
D
T
 
E
L
 
I
H
 
V
G
 
Y
L
 
R
S
 
S
R
 
R
T
 
S
G
 
G
R
 
G
P
 
L
L
 
L
L
 
D
V
 
V
R
 
E
Y
 
H
D
 
D
L
 
M
D
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
K
-
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
W
-
 
R
-
 
D
A
 
L
A
 
F
V
 
D
S
 
S
P
 
R
A
 
V
D
 
G
L
 
K
A
x
S
L
x
T
R
x
W
P
|
P
-
 
Y
-
x
G
A
 
S
D
 
G
L
 
V
W
 
W
R
 
S
Y
 
K
R
 
K
E
 
E
-
 
W
L
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
E
R
 
I
R
 
D
T
 
D
E
 
D
N
 
D
I
 
I
V
 
V
S
|
S
L
 
A
G
x
F
E
 
E
I
 
G
A
 
N
T
 
S
P
x
N
I
x
L
V
 
F
P
x
W
L
 
A
N
 
E
K
 
R
V
 
F
A
 
G
A
 
K
G
 
Q
A
 
F
-
 
L
G
 
G
A
 
M
S
 
N
T
 
D
L
 
L
L
x
W
V
 
V
K
 
K
D
 
H
E
 
C
S
 
G
R
 
I
L
 
S
P
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
A
 
D
R
 
L
G
 
G
L
 
M
V
 
T
M
 
V
A
 
L
I
 
V
S
 
S
M
 
Q
A
 
V
K
 
N
E
 
R
L
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
R
G
 
P
V
 
V
T
 
V
T
 
G
I
 
V
A
 
G
M
 
C
P
 
A
T
 
S
N
 
T
G
 
G
N
x
D
A
 
T
G
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
S
A
 
A
Y
 
Y
A
 
C
A
 
A
Q
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
P
A
 
S
V
 
I
I
 
V
F
 
F
C
 
L
P
 
P
D
 
A
D
 
N
T
 
K
P
 
I
E
 
S
I
 
M
-
 
A
N
 
Q
V
 
L
R
 
V
E
 
Q
I
 
P
A
 
I
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
F
V
 
V
Y
 
L
R
 
S
V
 
I
N
 
D
G
 
T
L
 
D
I
 
F
D
 
D
D
 
G
C
 
C
G
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
I
G
 
R
A
 
E
G
 
I
K
 
T
E
 
A
A
 
E
N
 
L
G
 
P
W
 
I
F
 
Y
D
 
L
L
 
A
S
 
N
T
 
S
L
 
L
K
 
N
E
 
S
P
 
-
Y
 
L
R
 
R
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
T
 
T
M
 
A
G
 
A
L
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
L
E
 
Q
Q
|
Q
L
x
F
G
 
D
W
 
W
E
 
Q
L
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
W
I
 
V
F
 
I
Y
 
V
P
 
P
T
x
G
G
|
G
G
x
N
G
x
L
T
x
G
G
x
N
L
 
I
I
 
Y
G
 
A
M
 
F
W
 
Y
K
 
K
A
 
G
F
 
F
E
 
K
E
 
M
L
 
C
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
L
I
 
V
G
 
-
S
 
D
K
 
R
R
 
I
P
 
P
R
 
R
M
 
M
V
 
V
A
 
C
V
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
N
C
 
A
A
 
N
P
 
P
M
 
L
V
 
Y
R
 
L
A
 
H
W
 
Y
Q
 
K
G
 
S
G
 
G
E
 
W
R
 
K
H
 
D
A
 
F
T
 
K
R
 
P
W
 
M
E
 
T
D
 
A
A
 
S
H
 
T
T
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
S
G
x
A
I
 
I
R
 
Q
V
 
I
P
 
G
Q
 
D
A
 
P
V
 
V
G
 
S
D
 
I
F
 
D
L
 
R
I
 
A
L
 
V
D
 
Y
A
 
A
V
 
L
R
 
K
A
 
K
S
 
C
N
 
N
G
 
G
F
 
I
A
 
V
M
 
E
A
 
E
V
 
A
S
 
T
D
 
E
S
 
E
A
 
E
I
 
L
L
 
M
E
 
D
A
 
A
V
 
M
D
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
D
R
 
S
L
 
T
D
 
-
G
 
G
L
 
M
L
 
F
L
 
I
C
 
C
P
 
P
E
x
H
G
 
T
G
 
G
A
 
V
T
 
A
L
 
L
A
 
T
A
 
A
W
 
L
R
 
F
K
 
K
A
 
L
L
 
R
V
 
N
D
 
Q
G
 
G
L
 
V
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
T
D
 
D
R
 
R
A
 
T
V
 
V
L
 
V
F
 
V
N
 
S
C
x
T
A
 
A
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Y
 
F
P
 
T
M
 
-
P
 
-
D
 
-
Q
 
Q
S
 
S
R
 
K
T
 
-
L
 
I
D
 
D
R
 
Y
H
 
H

2zsjA Crystal structure of threonine synthase from aquifex aeolicus vf5
34% identity, 69% coverage: 131:456/475 of query aligns to 8:324/350 of 2zsjA

query
sites
2zsjA
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
K
E
 
K
L
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
V
R
 
D
R
 
E
T
 
N
E
 
T
N
 
P
I
 
I
V
 
V
S
 
T
L
 
L
G
 
Y
E
 
E
I
 
G
A
 
N
T
 
T
P
 
P
I
 
L
V
 
I
P
 
E
L
 
A
N
 
D
K
 
N
V
 
L
A
 
A
A
 
R
G
 
A
A
 
I
G
 
G
-
 
F
A
 
K
S
 
G
T
 
K
L
 
I
L
 
Y
V
 
L
K
 
K
D
 
Y
E
 
E
S
 
G
R
 
L
L
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
M
V
 
T
M
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
M
 
K
A
 
A
K
 
V
E
 
E
L
 
A
G
 
G
V
 
K
T
 
R
T
 
A
I
 
V
A
 
I
M
 
C
P
 
A
T
 
S
N
x
T
G
 
G
N
|
N
A
 
T
G
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
L
E
 
R
A
 
A
V
 
Y
I
 
V
F
 
L
C
 
L
P
 
P
D
 
K
D
 
G
T
 
A
P
 
V
E
 
A
I
 
I
-
 
G
N
 
K
V
 
L
R
 
S
E
 
Q
I
 
A
A
 
M
A
 
I
Q
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
Y
 
L
R
 
A
V
 
I
N
 
Q
G
 
G
L
 
T
I
 
F
D
 
D
D
 
D
C
 
A
G
 
L
K
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
R
A
 
K
G
 
I
K
 
G
E
 
E
A
 
-
N
 
N
G
 
F
W
 
P
F
 
V
D
 
E
L
 
I
S
 
V
T
 
N
L
 
S
K
 
V
E
 
N
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
T
 
T
M
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
I
A
 
C
E
 
D
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
E
L
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
Y
I
 
H
F
 
F
Y
 
I
P
 
P
T
x
V
G
|
G
G
x
N
G
x
A
T
x
G
G
x
N
L
 
I
I
 
T
G
 
A
M
 
Y
W
 
W
K
 
K
A
 
G
F
 
F
E
 
K
E
 
I
L
 
Y
E
 
Y
A
 
E
L
 
E
G
 
G
W
 
K
I
 
I
G
 
-
S
 
T
K
 
K
R
 
L
P
 
P
R
 
R
M
 
M
V
 
M
A
 
G
V
 
W
Q
|
Q
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
x
A
A
 
A
P
 
P
M
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
G
W
 
Y
Q
 
P
G
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
W
 
I
E
 
K
D
 
N
A
 
P
H
 
Q
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
T
G
x
A
I
 
I
R
 
K
V
 
I
P
 
G
Q
 
N
A
 
P
V
 
Y
G
 
S
D
 
W
F
 
K
L
 
S
I
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
A
V
 
A
R
 
Q
A
 
E
S
 
S
N
 
G
G
 
G
F
 
K
A
 
I
M
 
D
A
 
A
V
 
V
S
 
S
D
 
D
S
 
S
A
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
Y
A
 
A
V
 
Y
D
 
K
D
 
L
A
 
I
A
 
A
R
 
S
L
 
T
D
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
F
L
 
C
C
 
E
P
 
P
E
 
A
G
 
S
G
 
A
A
 
A
T
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
G
W
 
L
R
 
I
K
 
K
A
 
L
L
 
V
V
 
R
D
 
E
G
 
G
L
 
F
I
 
F
A
 
K
P
 
G
D
 
G
D
 
E
R
 
V
A
 
V
V
 
T
L
 
C
F
 
T
N
 
L
C
x
T
A
x
G
T
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Y
 
D
P
 
P

A0R220 Threonine synthase; TS; EC 4.2.3.1 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
31% identity, 70% coverage: 126:456/475 of query aligns to 13:333/360 of A0R220

query
sites
A0R220
P
 
P
A
 
G
D
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
A
Y
 
Y
R
 
R
E
 
D
L
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
I
R
 
G
R
 
D
T
 
D
E
 
W
N
 
T
I
 
T
V
 
V
S
 
T
L
 
L
G
 
L
E
 
E
I
 
G
A
 
G
T
 
T
P
 
P
I
 
L
V
 
I
P
 
H
L
 
A
N
 
K
K
 
R
V
 
I
A
 
S
A
 
E
G
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
C
S
 
-
T
 
T
L
 
V
L
 
H
V
 
L
K
 
K
D
 
V
E
 
E
S
 
G
R
 
L
L
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
M
V
 
T
M
 
V
A
 
A
I
 
V
S
 
T
M
 
E
A
 
S
K
 
L
E
 
A
L
 
R
G
 
G
V
 
Q
T
 
Q
T
 
A
I
 
V
A
 
L
M
 
C
P
 
A
T
 
S
N
 
T
G
 
G
N
 
N
A
 
T
G
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
T
A
 
C
V
 
A
I
 
V
F
 
L
C
 
I
P
 
P
D
 
Q
D
 
G
T
 
K
P
 
I
E
 
A
I
 
M
-
 
G
N
 
K
V
 
L
R
 
A
E
 
Q
I
 
A
A
 
V
A
 
M
Q
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
I
Y
 
I
R
 
Q
V
 
V
N
 
D
G
 
G
L
 
N
I
 
F
D
 
D
D
 
D
C
 
C
G
 
L
K
 
E
L
 
L
V
 
A
G
 
R
A
x
K
G
 
L
K
 
T
E
 
A
A
 
D
N
 
F
G
 
P
W
 
T
F
 
I
D
 
A
L
 
L
S
 
V
T
 
N
L
 
S
K
 
V
E
 
N
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
T
 
T
M
 
A
G
 
A
L
 
F
E
 
E
L
 
I
A
 
V
E
 
D
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
-
E
 
T
L
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
V
I
 
H
F
 
A
Y
 
L
P
 
P
T
 
V
G
 
G
G
 
N
G
 
A
T
 
G
G
 
N
L
 
I
I
 
T
G
 
A
M
 
Y
W
 
W
K
 
K
A
 
G
F
 
Y
E
 
S
E
 
E
L
 
Y
E
 
H
A
 
R
L
 
D
G
 
G
W
 
-
I
 
V
G
 
S
S
 
D
K
 
R
R
 
L
P
 
P
R
 
R
M
 
M
V
 
L
A
 
G
V
 
T
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
C
 
A
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
V
R
 
T
A
 
-
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
G
T
 
A
R
 
P
W
 
V
E
 
K
D
 
D
A
 
P
H
 
E
T
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
T
G
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
I
P
 
G
Q
 
S
A
 
P
V
 
A
G
 
S
D
 
W
F
 
N
L
 
S
I
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
Q
R
 
Q
A
 
Q
S
 
S
N
 
D
G
 
G
F
 
R
A
 
F
M
 
L
A
 
A
V
 
A
S
 
T
D
 
D
S
 
E
A
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
A
A
 
A
V
 
Y
D
 
H
D
 
L
A
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
T
D
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
F
L
 
V
C
 
E
P
 
P
E
 
A
G
 
S
G
 
A
A
 
A
T
 
S
L
 
I
A
 
A
A
 
G
W
 
L
R
 
L
K
 
K
A
 
S
L
 
V
V
 
E
D
 
D
G
 
G
L
 
W
I
 
V
A
 
K
P
 
R
D
 
G
D
 
S
R
 
T
A
 
V
V
 
V
L
 
C
F
 
T
N
 
V
C
 
T
A
 
G
T
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Y
 
D
P
 
P

2c2gA Crystal structure of threonine synthase from arabidopsis thaliana in complex with its cofactor pyridoxal phosphate (see paper)
27% identity, 81% coverage: 85:467/475 of query aligns to 35:413/448 of 2c2gA

query
sites
2c2gA
T
 
S
G
 
T
E
 
E
R
 
S
Y
 
Y
D
 
S
A
 
L
D
 
D
T
 
E
L
 
I
H
 
V
G
 
Y
L
 
R
S
 
S
R
 
R
T
 
S
G
 
G
R
 
G
P
 
L
L
 
L
L
 
D
V
 
V
R
 
E
Y
 
H
D
 
D
L
 
M
D
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
K
-
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
W
-
 
R
-
 
D
A
 
L
A
 
F
V
 
D
S
 
S
P
 
R
A
 
V
D
 
G
L
 
K
A
 
S
L
 
T
R
 
W
P
 
P
-
 
Y
-
 
G
A
 
S
D
 
G
L
 
V
W
 
W
R
 
S
Y
 
K
R
 
K
E
 
E
-
 
W
L
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
E
R
 
I
R
 
D
T
 
D
E
 
D
N
 
D
I
 
I
V
 
V
S
 
S
L
 
A
G
 
F
E
 
E
I
 
G
A
 
N
T
 
S
P
 
N
I
 
L
V
 
F
P
 
W
L
 
A
N
 
E
K
 
R
V
 
F
A
 
G
A
 
K
G
 
Q
A
 
F
-
 
L
G
 
G
A
 
M
S
 
N
T
 
D
L
 
L
L
 
W
V
 
V
K
 
K
D
 
H
E
 
C
S
 
G
R
 
I
L
 
S
P
 
H
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
A
 
D
R
 
L
G
 
G
L
 
M
V
 
T
M
 
V
A
 
L
I
 
V
S
 
S
M
 
Q
A
 
V
K
 
N
E
 
R
L
 
L
-
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
R
G
 
P
V
 
V
T
 
V
T
 
G
I
 
V
A
 
G
M
 
C
P
 
A
T
x
S
N
 
T
G
 
G
N
 
D
A
x
T
G
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
S
A
 
A
Y
 
Y
A
 
C
A
 
A
Q
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
P
A
 
S
V
 
I
I
 
V
F
 
F
C
 
L
P
 
P
D
 
A
D
 
N
T
 
K
P
 
I
E
 
S
I
 
M
-
 
A
N
 
Q
V
 
L
R
 
V
E
 
Q
I
 
P
A
 
I
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
F
V
 
V
Y
 
L
R
 
S
V
 
I
N
 
D
G
 
T
L
 
D
I
 
F
D
 
D
D
 
G
C
 
C
G
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
I
G
 
R
A
 
E
G
 
I
K
 
T
E
 
A
A
 
E
N
 
L
G
 
P
W
 
I
F
 
Y
D
 
L
L
 
A
S
 
N
T
x
S
L
 
L
K
 
N
E
 
S
P
 
-
Y
 
L
R
|
R
I
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
K
 
K
T
 
T
M
 
A
G
 
A
L
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
F
G
 
D
W
 
W
E
 
Q
L
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
W
I
 
V
F
 
I
Y
 
V
P
 
P
T
 
G
G
 
G
G
x
N
G
 
L
T
 
G
G
 
N
L
 
I
I
 
Y
G
 
A
M
 
F
W
 
Y
K
 
K
A
 
G
F
 
F
E
 
K
E
 
M
L
 
C
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
L
I
 
V
G
 
-
S
 
D
K
 
R
R
 
I
P
 
P
R
 
R
M
 
M
V
 
V
A
 
C
V
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
N
C
 
A
A
 
N
P
 
P
M
 
L
V
 
Y
R
 
L
A
 
H
W
 
Y
Q
 
K
G
 
S
G
 
G
E
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
W
 
W
E
 
K
D
 
D
A
 
F
H
 
K
T
 
P
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
V
R
 
S
V
 
I
P
 
D
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
G
 
Y
D
 
-
F
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
A
V
 
L
R
 
K
A
 
K
S
 
C
N
 
N
G
 
G
F
 
I
A
 
V
M
 
E
A
 
E
V
 
A
S
 
T
D
 
E
S
 
E
A
 
E
I
 
L
L
 
M
E
 
D
A
 
A
V
 
M
D
 
A
D
 
Q
A
 
A
A
 
D
R
 
S
L
 
T
D
 
-
G
 
G
L
 
M
L
 
F
L
 
I
C
 
C
P
 
P
E
 
H
G
 
T
G
 
G
A
 
V
T
 
A
L
 
L
A
 
T
A
 
A
W
 
L
R
 
F
K
 
K
A
 
L
L
 
R
V
 
N
D
 
Q
G
 
G
L
 
V
I
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
T
D
 
D
R
 
R
A
 
T
V
 
V
L
 
V
F
 
V
N
 
S
C
 
T
A
 
A
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
Y
 
F
P
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
T
Q
 
Q
S
 
S
R
 
K
T
 
-
L
 
I
D
 
D
R
 
Y
H
 
H

Q8VBT2 L-serine dehydratase/L-threonine deaminase; SDH; L-serine deaminase; L-threonine dehydratase; TDH; EC 4.3.1.17; EC 4.3.1.19 from Mus musculus (Mouse)
32% identity, 31% coverage: 149:297/475 of query aligns to 8:156/327 of Q8VBT2

query
sites
Q8VBT2
E
 
H
I
 
V
A
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
L
V
 
R
P
 
D
L
 
S
N
 
M
K
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
K
G
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
T
S
 
S
T
 
V
L
 
F
L
 
L
V
 
K
K
 
M
D
 
D
E
 
S
S
 
S
R
 
Q
L
 
-
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
G
M
 
H
A
 
L
I
 
C
S
 
K
M
 
M
A
 
K
K
 
A
E
 
K
L
 
Q
G
 
G
V
 
C
T
 
R
T
 
H
I
 
F
A
 
V
M
 
C
P
 
S
T
 
S
N
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
M
A
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
Y
Y
 
A
A
 
A
A
 
R
Q
 
R
A
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
P
A
 
A
V
 
T
I
 
I
F
 
V
C
 
V
P
 
P
D
 
N
D
 
T
T
 
T
P
 
P
E
 
A
I
 
L
N
 
T
V
 
I
R
 
E
E
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
N
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
Y
 
E
R
 
V
V
 
V
N
 
G
G
 
E
L
 
M
I
 
L
D
 
D
D
 
E
C
 
A
G
 
I
K
 
Q
L
 
V
V
 
A
G
 
K
A
 
A
G
 
L
K
 
E
E
 
K
A
 
N
N
 
N
-
 
P
G
 
G
W
 
W
F
 
V
D
 
Y
L
 
I
S
 
S
T
 
P
L
 
F
K
 
D
E
 
D
P
 
P
Y
 
L
R
 
I
I
 
W
E
 
E
G
 
G
K
 
H
K
 
T
T
 
S
M
 
L
G
 
V
L
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
E
Q
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1pwhA Rat liver l-serine dehydratase- complex with pyridoxyl-(o-methyl- serine)-5-monophosphate (see paper)
33% identity, 31% coverage: 149:297/475 of query aligns to 8:156/327 of 1pwhA

query
sites
1pwhA
E
 
H
I
 
V
A
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
S
V
 
M
P
 
A
L
 
L
N
 
S
K
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
T
S
 
S
T
 
V
L
 
F
L
 
L
V
 
K
K
 
M
D
 
D
E
 
S
S
 
S
R
 
Q
L
 
-
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
G
M
 
H
A
 
L
I
 
C
S
 
K
M
 
M
A
 
K
K
 
A
E
 
K
L
 
Q
G
 
G
V
 
C
T
 
K
T
 
H
I
 
F
A
 
V
M
 
C
P
 
S
T
x
S
N
x
A
G
 
G
N
|
N
A
|
A
G
 
G
A
 
M
A
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
Y
Y
 
A
A
 
A
A
 
R
Q
 
R
A
 
L
G
 
G
I
 
L
E
 
P
A
 
A
V
 
T
I
 
I
F
 
V
C
 
V
P
 
P
D
 
S
D
 
T
T
 
T
P
 
P
E
 
A
I
 
L
N
 
T
V
 
I
R
 
E
E
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
N
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
Y
 
E
R
 
V
V
 
V
N
 
G
G
 
E
L
 
M
I
 
L
D
 
D
D
 
E
C
 
A
G
 
I
K
 
Q
L
 
L
V
 
A
G
 
K
A
 
A
G
 
L
K
 
E
E
 
K
A
 
N
N
 
N
-
 
P
G
 
G
W
 
W
F
 
V
D
 
Y
L
 
I
S
 
S
T
 
P
L
x
F
K
 
D
E
 
D
P
 
P
Y
 
L
R
 
I
I
 
W
E
 
E
G
 
G
K
 
H
K
 
T
T
 
S
M
 
L
G
 
V
L
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
E
Q
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P20132 L-serine dehydratase/L-threonine deaminase; SDH; L-serine deaminase; L-threonine dehydratase; TDH; EC 4.3.1.17; EC 4.3.1.19 from Homo sapiens (Human) (see paper)
34% identity, 33% coverage: 149:305/475 of query aligns to 8:163/328 of P20132

query
sites
P20132
E
 
H
I
 
V
A
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
R
P
 
D
L
 
S
N
 
M
K
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
K
G
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
T
S
 
S
T
 
V
L
 
Y
L
 
L
V
 
K
K
 
M
D
 
D
E
 
S
S
 
A
R
 
Q
L
 
-
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
G
M
 
H
A
 
F
I
 
C
S
 
K
M
 
R
A
 
W
K
 
A
E
 
K
L
 
Q
G
 
G
V
 
C
T
 
A
T
 
H
I
 
F
A
 
V
M
 
C
P
 
S
T
 
S
N
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Y
Y
 
A
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
A
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
P
A
 
A
V
 
T
I
 
I
F
 
V
C
 
V
P
 
P
D
 
S
D
 
T
T
 
T
P
 
P
E
 
A
I
 
L
N
 
T
V
 
I
R
 
E
E
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
N
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
Y
 
K
R
 
V
V
 
V
N
 
G
G
 
E
L
 
L
I
 
L
D
 
D
D
 
E
C
 
A
G
 
F
K
 
E
L
 
L
V
 
A
G
 
K
A
 
A
G
 
L
K
 
A
E
 
K
A
 
N
N
 
N
-
 
P
G
 
G
W
 
W
F
 
V
D
 
Y
L
 
I
S
 
P
T
 
P
L
 
F
K
 
D
E
 
D
P
 
P
Y
 
L
R
 
I
I
 
W
E
 
E
G
 
G
K
 
H
K
 
A
T
 
S
M
 
I
G
 
V
L
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
E
Q
 
T
L
 
L
G
 
-
W
 
W
E
 
E
L
 
K
P
 
P
D
 
G
V
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1p5jA Crystal structure analysis of human serine dehydratase (see paper)
33% identity, 33% coverage: 149:305/475 of query aligns to 5:160/319 of 1p5jA

query
sites
1p5jA
E
 
H
I
 
V
A
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
R
P
 
D
L
 
S
N
 
M
K
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
K
G
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
T
S
 
S
T
 
V
L
 
Y
L
 
L
V
 
K
K
 
M
D
 
D
E
 
S
S
 
A
R
 
Q
L
 
-
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
G
M
 
H
A
 
F
I
 
C
S
 
K
M
 
R
A
 
W
K
 
A
E
 
K
L
 
Q
G
 
G
V
 
C
T
 
A
T
 
H
I
 
F
A
 
V
M
 
C
P
 
S
T
 
S
N
x
A
G
 
G
N
|
N
A
 
A
G
 
G
A
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Y
Y
 
A
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
A
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
P
A
 
A
V
 
T
I
 
I
F
 
V
C
 
V
P
 
P
D
 
G
D
 
T
T
 
T
P
 
P
E
 
A
I
 
L
N
 
T
V
 
I
R
 
E
E
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
N
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
C
Y
 
K
R
 
V
V
 
V
N
 
G
G
 
E
L
 
L
I
 
L
D
 
D
D
 
E
C
 
A
G
 
F
K
 
E
L
 
L
V
 
A
G
 
K
A
 
A
G
 
L
K
 
A
E
 
K
A
 
N
N
 
N
-
 
P
G
 
G
W
 
W
F
 
V
D
 
Y
L
 
I
S
 
P
T
 
P
L
 
F
K
 
D
E
 
D
P
 
P
Y
 
L
R
 
I
I
 
W
E
 
E
G
 
G
K
 
H
K
 
A
T
 
S
M
 
I
G
 
V
L
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
E
Q
 
T
L
 
L
G
 
-
W
 
W
E
 
E
L
 
K
P
 
P
D
 
G
V
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

P09367 L-serine dehydratase/L-threonine deaminase; SDH; L-serine deaminase; L-threonine dehydratase; TDH; EC 4.3.1.17; EC 4.3.1.19 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
27% identity, 31% coverage: 149:297/475 of query aligns to 8:192/363 of P09367

query
sites
P09367
E
 
H
I
 
V
A
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
L
V
 
R
P
 
D
L
 
S
N
 
M
K
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
K
G
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
T
S
 
S
T
 
V
L
 
F
L
 
L
V
 
K
K
 
M
D
 
D
E
 
S
S
 
S
R
 
Q
L
 
-
P
 
P
T
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
A
 
I
R
 
R
G
 
G
L
 
I
V
 
G
M
 
H
A
 
L
I
 
C
S
 
K
M
 
M
A
 
K
K
 
A
E
 
K
L
 
Q
G
 
G
V
 
C
T
 
K
T
 
H
I
 
F
A
 
V
-
 
C
-
 
S
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
Q
-
 
I
-
 
W
-
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
M
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
S
-
 
H
-
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
-
 
P
-
 
H
-
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
M
 
L
P
 
P
-
 
D
-
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
P
-
 
L
T
 
T
N
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
M
A
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
Y
Y
 
A
A
 
A
A
 
R
Q
 
R
A
 
L
G
 
G
I
 
L
E
 
P
A
 
A
V
 
T
I
 
I
F
 
V
C
 
V
P
 
P
D
 
S
D
 
T
T
 
T
P
 
P
E
 
A
I
 
L
N
 
T
V
 
I
R
 
E
E
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
N
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
Y
 
E
R
 
V
V
 
V
N
 
G
G
 
E
L
 
M
I
 
L
D
 
D
D
 
E
C
 
A
G
 
I
K
 
Q
L
 
L
V
 
A
G
 
K
A
 
A
G
 
L
K
 
E
E
 
K
A
 
N
N
 
N
-
 
P
G
 
G
W
 
W
F
 
V
D
 
Y
L
 
I
S
 
S
T
 
P
L
 
F
K
 
D
E
 
D
P
 
P
Y
 
L
R
 
I
I
 
W
E
 
E
G
 
G
K
 
H
K
 
T
T
 
S
M
 
L
G
 
V
L
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
E
Q
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2j9yB Tryptophan synthase q114n mutant in complex with compound ii (see paper)
23% identity, 59% coverage: 152:433/475 of query aligns to 56:361/393 of 2j9yB

query
sites
2j9yB
T
 
T
P
 
A
I
 
L
V
 
T
P
 
K
L
 
C
N
 
Q
K
 
N
V
 
I
A
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
-
A
 
R
S
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
Y
V
 
L
K
 
K
D
 
R
E
 
E
S
 
D
R
 
L
L
 
L
P
 
H
T
 
G
G
 
G
S
 
A
F
x
H
K
|
K
A
 
T
R
 
N
G
 
Q
L
 
V
V
 
L
M
 
G
A
 
Q
I
 
A
S
 
L
M
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
R
L
 
M
G
 
G
V
 
K
T
 
S
T
 
E
I
 
I
A
 
I
M
 
A
P
 
E
T
|
T
N
x
G
-
x
A
G
|
G
N
|
N
A
x
H
G
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
L
Y
 
A
A
 
S
A
 
A
Q
 
L
A
 
L
G
 
G
I
 
L
E
 
K
A
 
C
V
 
R
I
 
I
F
 
Y
C
 
M
P
 
G
D
 
A
D
 
K
T
 
D
P
 
V
E
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
S
I
 
P
N
 
N
V
 
V
R
 
F
E
 
R
I
 
M
A
 
R
A
 
L
Q
 
M
G
 
G
A
 
A
R
 
E
V
 
V
Y
 
I
R
 
P
V
 
V
N
 
H
G
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
T
L
 
L
I
 
K
D
 
D
D
 
A
C
 
C
G
 
N
K
 
E
L
 
A
V
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
W
-
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
Y
K
 
E
E
 
T
A
 
A
N
 
H
G
 
Y
W
 
M
F
 
L
D
 
G
L
x
T
S
 
A
T
 
A
L
 
G
K
 
P
E
 
H
P
 
P
Y
 
Y
R
 
P
I
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
R
E
 
E
G
 
F
K
 
Q
K
 
R
T
 
M
M
 
I
G
 
G
L
 
E
E
 
E
L
 
T
A
 
K
E
 
A
Q
 
Q
L
 
I
-
 
L
-
 
D
-
 
K
G
 
E
W
 
G
E
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
A
I
 
V
F
 
I
Y
 
A
P
 
C
T
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
T
x
S
G
x
N
L
 
A
I
 
I
G
 
G
M
 
M
W
 
F
K
 
A
A
 
D
F
 
F
E
 
I
E
 
N
L
 
D
E
 
T
A
 
S
L
 
V
G
 
G
W
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
V
K
 
E
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
H
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
A
-
x
P
-
 
L
R
 
K
P
 
H
R
 
G
M
 
R
V
 
V
A
 
G
V
 
I
Q
 
Y
A
 
F
E
 
G
G
 
M
C
 
K
A
 
A
P
 
P
M
 
M
V
 
M
R
 
Q
A
 
T
W
 
A
Q
 
D
G
 
G
G
 
-
E
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
Q
W
 
I
E
 
E
D
 
E
A
 
S
H
 
Y
T
 
S
L
 
I
A
 
S
A
 
A
G
|
G
I
 
L
R
 
D
V
x
F
P
 
P
Q
x
S
A
x
V
V
 
G
G
 
P
D
 
Q
F
 
H
L
 
A
I
 
Y
L
 
L
D
 
N
A
 
S
V
 
I
R
 
G
A
 
R
S
 
A
N
 
D
G
 
-
F
 
-
A
 
Y
M
 
V
A
 
S
V
 
I
S
 
T
D
 
D
S
 
D
A
 
E
I
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
F
D
 
K
D
 
T
A
 
L
A
 
C
R
 
R
L
 
H
D
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
I
L
 
P
C
 
A
P
 
L
E
|
E
G
 
S
G
 
S
A
 
H
T
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
H
W
 
A
R
 
L
K
 
K
A
 
M
L
 
M

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Ga0059261_1586 FitnessBrowser__Korea:Ga0059261_1586
VAARMAPDAKALRRMRLKAERGILVSLSGWRQRSTRPINDKGWRRLHVRPLDRDGDAPYV
IAMRNDDNLSAARPTFVTHLECSMTGERYDADTLHGLSRTGRPLLVRYDLDAIRAAVSPA
DLALRPADLWRYRELLPVRRTENIVSLGEIATPIVPLNKVAAGAGASTLLVKDESRLPTG
SFKARGLVMAISMAKELGVTTIAMPTNGNAGAAAAAYAAQAGIEAVIFCPDDTPEINVRE
IAAQGARVYRVNGLIDDCGKLVGAGKEANGWFDLSTLKEPYRIEGKKTMGLELAEQLGWE
LPDVIFYPTGGGTGLIGMWKAFEELEALGWIGSKRPRMVAVQAEGCAPMVRAWQGGERHA
TRWEDAHTLAAGIRVPQAVGDFLILDAVRASNGFAMAVSDSAILEAVDDAARLDGLLLCP
EGGATLAAWRKALVDGLIAPDDRAVLFNCATGLKYPMPDQSRTLDRHGPIDFTAL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory