SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing H281DRAFT_03826 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_03826 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3rfvA Crystal structure of uronate dehydrogenase from agrobacterium tumefaciens complexed with nadh and product (see paper)
51% identity, 91% coverage: 16:272/283 of query aligns to 2:258/265 of 3rfvA

query
sites
3rfvA
F
 
M
R
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
N
x
Q
L
|
L
G
 
G
R
 
R
Q
 
V
L
 
M
R
 
R
G
 
E
V
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
P
W
 
M
A
 
A
D
 
E
V
 
I
V
 
L
R
 
R
V
 
L
T
 
A
D
|
D
I
x
L
A
 
S
S
 
P
L
 
L
G
 
D
E
 
P
P
 
A
A
 
G
P
 
P
H
 
N
E
 
E
E
 
E
A
 
C
S
 
V
V
 
Q
V
 
C
D
|
D
L
|
L
A
 
A
D
 
D
R
 
A
E
 
N
A
 
A
V
 
V
M
 
N
Q
 
A
L
 
M
V
 
V
E
 
A
G
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
V
H
 
H
L
|
L
G
|
G
G
|
G
I
 
I
S
|
S
I
 
V
D
 
E
A
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
E
D
 
Q
L
 
I
L
 
L
G
 
Q
A
 
G
N
 
N
I
 
I
A
 
I
G
 
G
T
 
L
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
A
H
 
H
G
 
G
V
 
Q
K
 
P
R
 
R
I
 
I
A
 
V
F
 
F
A
|
A
S
 
S
S
|
S
N
|
N
H
|
H
V
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
Y
H
 
Y
P
 
P
V
 
Q
T
 
T
E
 
E
V
 
R
L
 
L
D
 
G
A
 
P
D
 
D
A
 
V
P
 
P
Q
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
T
 
G
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
T
 
S
K
|
K
C
 
C
F
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
N
L
 
L
S
 
A
R
 
R
Y
 
M
Y
 
Y
Y
 
F
D
 
D
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
Q
E
 
E
T
 
T
V
 
A
C
 
L
M
 
V
R
 
R
I
|
I
G
 
G
S
|
S
S
x
C
F
 
T
D
 
P
E
 
E
P
 
P
K
 
N
N
 
N
S
 
Y
R
|
R
M
 
M
L
 
L
V
 
S
T
 
T
Y
 
W
L
 
F
S
 
S
Y
 
H
R
 
D
D
 
D
F
 
F
I
 
V
E
 
S
L
 
L
V
 
I
R
 
E
C
 
A
S
 
V
L
 
F
F
 
R
T
 
A
N
 
P
R
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
C
V
 
P
V
 
V
V
 
V
Y
 
W
G
 
G
A
 
A
S
 
S
D
 
A
N
 
N
P
 
D
V
 
A
K
 
G
W
 
W
W
 
W
D
 
D
N
 
N
T
 
S
K
 
H
V
 
L
S
 
G
F
 
F
L
 
L
G
 
G
F
 
W
N
 
K
P
 
P
R
 
K
D
 
D
S
 
N
S
 
A
A
 
E
P
 
A
F
 
F
A
 
R
A
 
R
R
 
H
F
 
I
P
 
T
A
 
E
T
 
T
A
 
T
P
 
P
D
 
P
A
 
P
S
 
D
R
 
P
D
 
N
D
 
D
P
 
A
A
 
L
Q
 
V
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
T
F
|
F
V
 
V

Q7CRQ0 Uronate dehydrogenase; D-galacturonate dehydrogenase; D-glucuronate dehydrogenase; Hexuronate dehydrogenase; EC 1.1.1.203 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
51% identity, 91% coverage: 16:272/283 of query aligns to 1:257/265 of Q7CRQ0

query
sites
Q7CRQ0
F
 
M
R
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
Q
 
V
L
 
M
R
 
R
G
 
E
V
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
P
W
 
M
A
 
A
D
 
E
V
 
I
V
 
L
R
 
R
V
 
L
T
 
A
D
 
D
I
 
L
A
 
S
S
 
P
L
 
L
G
 
D
E
 
P
P
 
A
A
 
G
P
 
P
H
 
N
E
 
E
E
 
E
A
 
C
S
 
V
V
 
Q
V
 
C
D
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
A
E
 
N
A
 
A
V
 
V
M
 
N
Q
 
A
L
 
M
V
 
V
E
 
A
G
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
V
H
 
H
L
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
V
D
 
E
A
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
E
D
 
Q
L
 
I
L
 
L
G
 
Q
A
 
G
N
 
N
I
 
I
A
 
I
G
 
G
T
 
L
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
A
H
 
H
G
 
G
V
 
Q
K
 
P
R
 
R
I
 
I
A
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
 
S
N
 
N
H
 
H
V
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
Y
H
 
Y
P
 
P
V
 
Q
T
 
T
E
 
E
V
 
R
L
 
L
D
 
G
A
 
P
D
 
D
A
 
V
P
 
P
Q
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
T
 
G
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
T
 
S
K
 
K
C
 
C
F
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
N
L
 
L
S
 
A
R
 
R
Y
 
M
Y
 
Y
Y
 
F
D
 
D
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
Q
E
 
E
T
 
T
V
 
A
C
 
L
M
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
S
S
 
C
F
 
T
D
 
P
E
 
E
P
 
P
K
 
N
N
 
N
S
 
Y
R
 
R
M
 
M
L
 
L
V
 
S
T
 
T
Y
 
W
L
 
F
S
 
S
Y
 
H
R
 
D
D
 
D
F
 
F
I
 
V
E
 
S
L
 
L
V
 
I
R
 
E
C
 
A
S
 
V
L
 
F
F
 
R
T
 
A
N
 
P
R
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
C
V
 
P
V
 
V
V
 
V
Y
 
W
G
 
G
A
 
A
S
 
S
D
 
A
N
 
N
P
 
D
V
 
A
K
 
G
W
 
W
W
 
W
D
 
D
N
 
N
T
 
S
K
 
H
V
 
L
S
 
G
F
 
F
L
 
L
G
 
G
F
 
W
N
 
K
P
 
P
R
 
K
D
 
D
S
 
N
S
 
A
A
 
E
P
 
A
F
 
F
A
 
R
A
 
R
R
 
H
F
 
I
P
 
T
A
 
E
T
 
T
A
 
T
P
 
P
D
 
P
A
 
P
S
 
D
R
 
P
D
 
N
D
 
D
P
 
A
A
 
L
Q
 
V
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
T
F
 
F
V
 
V

3rfxA Crystal structure of uronate dehydrogenase from agrobacterium tumefaciens, y136a mutant complexed with NAD (see paper)
51% identity, 91% coverage: 16:272/283 of query aligns to 2:258/265 of 3rfxA

query
sites
3rfxA
F
 
M
R
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
N
x
Q
L
|
L
G
 
G
R
 
R
Q
 
V
L
 
M
R
 
R
G
 
E
V
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
P
W
 
M
A
 
A
D
 
E
V
 
I
V
 
L
R
 
R
V
 
L
T
 
A
D
|
D
I
x
L
A
 
S
S
 
P
L
 
L
G
 
D
E
 
P
P
 
A
A
 
G
P
 
P
H
 
N
E
 
E
E
 
E
A
 
C
S
 
V
V
 
Q
V
 
C
D
|
D
L
|
L
A
 
A
D
 
D
R
 
A
E
 
N
A
 
A
V
 
V
M
 
N
Q
 
A
L
 
M
V
 
V
E
 
A
G
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
G
I
 
I
V
 
V
H
 
H
L
 
L
G
 
G
G
|
G
I
 
I
S
|
S
I
 
V
D
 
E
A
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
E
D
 
Q
L
 
I
L
 
L
G
 
Q
A
 
G
N
 
N
I
 
I
A
 
I
G
 
G
T
 
L
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
A
H
 
H
G
 
G
V
 
Q
K
 
P
R
 
R
I
 
I
A
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
 
S
N
 
N
H
 
H
V
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
Y
H
 
Y
P
 
P
V
 
Q
T
 
T
E
 
E
V
 
R
L
 
L
D
 
G
A
 
P
D
 
D
A
 
V
P
 
P
Q
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
T
 
G
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
S
K
 
K
C
 
C
F
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
N
L
 
L
S
 
A
R
 
R
Y
 
M
Y
 
Y
Y
 
F
D
 
D
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
Q
E
 
E
T
 
T
V
 
A
C
 
L
M
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
S
S
 
C
F
 
T
D
 
P
E
 
E
P
 
P
K
 
N
N
 
N
S
 
Y
R
 
R
M
 
M
L
 
L
V
 
S
T
 
T
Y
 
W
L
 
F
S
 
S
Y
 
H
R
 
D
D
 
D
F
 
F
I
 
V
E
 
S
L
 
L
V
 
I
R
 
E
C
 
A
S
 
V
L
 
F
F
 
R
T
 
A
N
 
P
R
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
C
V
 
P
V
 
V
V
 
V
Y
 
W
G
 
G
A
 
A
S
 
S
D
 
A
N
 
N
P
 
D
V
 
A
K
 
G
W
 
W
W
 
W
D
 
D
N
 
N
T
 
S
K
 
H
V
 
L
S
 
G
F
 
F
L
 
L
G
 
G
F
 
W
N
 
K
P
 
P
R
 
K
D
 
D
S
 
N
S
 
A
A
 
E
P
 
A
F
 
F
A
 
R
A
 
R
R
 
H
F
 
I
P
 
T
A
 
E
T
 
T
A
 
T
P
 
P
D
 
P
A
 
P
S
 
D
R
 
P
D
 
N
D
 
D
P
 
A
A
 
L
Q
 
V
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
T
F
 
F
V
 
V

4id9B Crystal structure of a short-chain dehydrogenase/reductase superfamily protein from agrobacterium tumefaciens (target efi-506441) with bound NAD, monoclinic form 1
36% identity, 58% coverage: 19:181/283 of query aligns to 3:165/328 of 4id9B

query
sites
4id9B
L
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
G
|
G
N
x
R
L
x
V
G
 
G
R
 
R
Q
 
A
L
 
V
R
 
V
G
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
R
Q
 
T
W
 
Q
A
 
G
D
 
R
V
 
T
V
 
V
R
 
R
V
 
G
T
 
F
D
|
D
I
x
L
A
 
R
S
 
P
L
 
S
G
 
G
E
 
T
P
 
G
A
 
G
P
 
-
H
 
-
E
 
-
E
 
E
A
 
E
S
 
V
V
 
V
V
 
G
D
x
S
L
|
L
A
 
E
D
 
D
R
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
M
 
S
Q
 
D
L
 
A
V
 
I
E
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
L
H
 
H
L
|
L
G
 
G
G
x
A
I
 
F
S
 
M
I
 
S
D
 
W
A
 
A
P
 
P
F
 
A
D
 
D
D
 
R
-
 
D
-
 
R
L
 
M
L
 
F
G
 
A
A
x
V
N
 
N
I
 
V
A
 
E
G
 
G
T
 
T
Y
 
R
N
 
R
L
 
L
Y
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
S
K
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
R
I
 
F
A
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
|
S
N
 
G
H
 
E
V
 
V
I
 
Y
-
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
R
-
 
P
G
 
E
F
 
F
H
 
L
P
 
P
V
 
V
T
 
T
E
 
E
V
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
H
P
 
P
Q
 
L
R
 
C
P
 
P
D
 
N
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
L
T
 
T
K
|
K
C
 
L
F
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
E
L
 
L
S
 
V
R
 
R
Y
 
F
Y
 
H
Y
 
Q
D
 
R
R
 
S
F
 
G
G
 
A
I
 
M
E
 
E
T
 
T
V
 
V
C
 
I
M
 
L
R
 
R
I
x
F
G
x
S
S
x
H
S
x
T
F
 
Q
D
 
D

4id9A Crystal structure of a short-chain dehydrogenase/reductase superfamily protein from agrobacterium tumefaciens (target efi-506441) with bound NAD, monoclinic form 1
36% identity, 58% coverage: 19:181/283 of query aligns to 2:164/321 of 4id9A

query
sites
4id9A
L
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
G
|
G
N
x
R
L
x
V
G
 
G
R
 
R
Q
 
A
L
 
V
R
 
V
G
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
R
Q
 
T
W
 
Q
A
 
G
D
 
R
V
 
T
V
 
V
R
 
R
V
 
G
T
 
F
D
|
D
I
x
L
A
x
R
S
 
P
L
 
S
G
 
G
E
 
T
P
 
G
A
 
G
P
 
-
H
 
-
E
 
-
E
 
E
A
 
E
S
 
V
V
 
V
V
 
G
D
x
S
L
|
L
A
 
E
D
 
D
R
 
G
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
M
 
S
Q
 
D
L
 
A
V
 
I
E
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
S
A
 
A
I
 
V
V
 
L
H
 
H
L
|
L
G
 
G
G
x
A
I
 
F
S
 
M
I
 
S
D
 
W
A
 
A
P
 
P
F
 
A
D
 
D
D
 
R
-
 
D
-
 
R
L
 
M
L
 
F
G
 
A
A
x
V
N
 
N
I
 
V
A
 
E
G
 
G
T
 
T
Y
 
R
N
 
R
L
 
L
Y
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
S
K
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
R
I
 
F
A
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
|
S
N
 
G
H
 
E
V
 
V
I
 
Y
-
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
R
-
 
P
G
 
E
F
 
F
H
 
L
P
 
P
V
 
V
T
 
T
E
 
E
V
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
H
P
 
P
Q
 
L
R
 
C
P
 
P
D
 
N
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
L
T
 
T
K
|
K
C
 
L
F
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
E
L
 
L
S
 
V
R
 
R
Y
 
F
Y
 
H
Y
 
Q
D
 
R
R
 
S
F
 
G
G
 
A
I
 
M
E
 
E
T
 
T
V
 
V
C
 
I
M
 
L
R
 
R
I
x
F
G
 
S
S
x
H
S
x
T
F
 
Q
D
 
D

Sites not aligning to the query:

3a4vA Crystal structure of pyruvate bound l-threonine dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
28% identity, 82% coverage: 19:251/283 of query aligns to 2:255/311 of 3a4vA

query
sites
3a4vA
L
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
S
G
|
G
N
x
Q
L
x
I
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
V
G
 
P
V
 
Y
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
W
 
K
A
 
Y
D
 
G
V
 
K
V
 
K
R
 
N
V
 
V
T
 
I
D
 
A
I
 
S
A
x
D
S
x
I
L
 
V
G
 
Q
E
 
R
P
 
D
A
 
T
P
 
G
H
 
G
E
 
I
E
 
K
A
 
F
S
 
I
V
 
T
V
x
L
D
|
D
L
x
V
A
 
S
D
 
N
R
 
R
E
 
D
A
 
E
V
 
I
M
 
D
Q
 
R
L
 
A
V
 
V
E
 
E
-
 
K
-
 
Y
G
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
F
H
 
H
L
|
L
G
x
A
G
|
G
I
 
I
-
x
L
S
|
S
I
 
A
D
 
K
A
 
G
P
 
E
F
 
K
D
 
D
D
 
P
L
 
A
L
 
L
G
 
A
-
 
Y
-
 
K
A
 
V
N
 
N
I
 
M
A
 
N
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
Y
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
K
 
Q
H
 
H
G
 
R
V
 
V
K
 
E
R
 
K
I
 
V
A
 
V
F
 
I
A
x
P
S
|
S
S
x
T
N
 
I
H
 
G
V
 
V
I
 
F
G
 
G
F
 
P
H
 
E
P
 
T
V
 
P
T
 
K
E
 
N
V
 
K
L
 
V
D
 
P
A
 
S
D
 
I
A
 
T
P
 
I
Q
 
T
R
 
R
P
 
P
D
 
R
T
 
T
L
 
M
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
T
 
T
K
|
K
C
 
I
F
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
L
L
 
L
S
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
E
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
L
E
 
D
T
 
V
V
 
R
C
 
S
M
 
L
R
 
R
-
x
Y
-
 
P
-
 
G
I
|
I
G
 
I
S
 
S
S
 
Y
F
 
K
D
 
A
E
 
E
P
 
P
K
 
T
-
 
A
-
 
G
N
x
T
S
x
T
R
 
D
M
 
Y
L
 
A
V
 
V
T
 
E
Y
 
I
L
 
F
S
 
Y
Y
 
Y
R
 
A
D
 
V
F
 
K
I
 
R
E
 
E
L
 
K
V
 
Y
R
 
K
C
 
C
S
 
Y
L
 
L
F
 
A
T
 
P
N
 
N
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
M
-
 
Y
-
 
M
-
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
K
G
 
A
H
 
L
V
 
V
V
 
D
V
 
L
Y
 
Y
G
 
E
A
 
A
S
 
D
D
 
R
N
 
D
P
 
K
V
 
L
K
 
V
W
 
L
W
 
R
D
 
N
N
 
G
T
 
Y
K
 
N
V
 
V
S
 
T
F
 
A
L
 
Y
G
 
T
F
 
F
N
 
T
P
 
P
R
 
S
D
 
E
S
 
L
S
 
Y
A
 
S
P
 
K
F
 
I
A
 
K
A
 
E
R
 
R
F
 
I
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3a1nA Crystal structure of l-threonine dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
28% identity, 82% coverage: 19:251/283 of query aligns to 2:255/315 of 3a1nA

query
sites
3a1nA
L
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
S
G
|
G
N
x
Q
L
x
I
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
V
G
 
P
V
 
Y
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
W
 
K
A
 
Y
D
 
G
V
 
K
V
 
K
R
 
N
V
 
V
T
 
I
D
 
A
I
 
S
A
x
D
S
x
I
L
 
V
G
 
Q
E
 
R
P
 
D
A
 
T
P
 
G
H
 
G
E
 
I
E
 
K
A
 
F
S
 
I
V
 
T
V
x
L
D
|
D
L
 
V
A
 
S
D
 
N
R
 
R
E
 
D
A
 
E
V
 
I
M
 
D
Q
 
R
L
 
A
V
 
V
E
 
E
-
 
K
-
 
Y
G
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
F
H
 
H
L
|
L
G
x
A
G
|
G
I
 
I
-
x
L
S
 
S
I
 
A
D
 
K
A
 
G
P
 
E
F
 
K
D
 
D
D
 
P
L
 
A
L
 
L
G
 
A
-
 
Y
-
 
K
A
 
V
N
 
N
I
 
M
A
 
N
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
Y
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
K
 
Q
H
 
H
G
 
R
V
 
V
K
 
E
R
 
K
I
 
V
A
 
V
F
 
I
A
 
P
S
|
S
S
x
T
N
 
I
H
 
G
V
 
V
I
 
F
G
 
G
F
 
P
H
 
E
P
 
T
V
 
P
T
 
K
E
 
N
V
 
K
L
 
V
D
 
P
A
 
S
D
 
I
A
 
T
P
 
I
Q
 
T
R
 
R
P
 
P
D
 
R
T
 
T
L
 
M
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
T
 
T
K
|
K
C
 
I
F
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
L
L
 
L
S
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
E
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
L
E
 
D
T
 
V
V
 
R
C
 
S
M
 
L
R
 
R
-
x
Y
-
 
P
-
 
G
I
 
I
G
 
I
S
 
S
S
 
Y
F
 
K
D
 
A
E
 
E
P
 
P
K
 
T
-
 
A
-
 
G
N
 
T
S
 
T
R
 
D
M
 
Y
L
 
A
V
 
V
T
 
E
Y
 
I
L
 
F
S
 
Y
Y
 
Y
R
 
A
D
 
V
F
 
K
I
 
R
E
 
E
L
 
K
V
 
Y
R
 
K
C
 
C
S
 
Y
L
 
L
F
 
A
T
 
P
N
 
N
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
M
-
 
Y
-
 
M
-
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
K
G
 
A
H
 
L
V
 
V
V
 
D
V
 
L
Y
 
Y
G
 
E
A
 
A
S
 
D
D
 
R
N
 
D
P
 
K
V
 
L
K
 
V
W
 
L
W
 
R
D
 
N
N
 
G
T
 
Y
K
 
N
V
 
V
S
 
T
F
 
A
L
 
Y
G
 
T
F
 
F
N
 
T
P
 
P
R
 
S
D
 
E
S
 
L
S
 
Y
A
 
S
P
 
K
F
 
I
A
 
K
A
 
E
R
 
R
F
 
I
P
 
P

3ajrA Crystal structure of l-3-hydroxynorvaline bound l-threonine dehydrogenase (y137f) from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
28% identity, 82% coverage: 19:251/283 of query aligns to 2:255/314 of 3ajrA

query
sites
3ajrA
L
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
S
G
|
G
N
x
Q
L
x
I
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
V
G
 
P
V
 
Y
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
W
 
K
A
 
Y
D
 
G
V
 
K
V
 
K
R
 
N
V
 
V
T
 
I
D
 
A
I
 
S
A
x
D
S
x
I
L
 
V
G
 
Q
E
 
R
P
 
D
A
 
T
P
 
G
H
 
G
E
 
I
E
 
K
A
 
F
S
 
I
V
 
T
V
x
L
D
|
D
L
x
V
A
 
S
D
 
N
R
 
R
E
 
D
A
 
E
V
 
I
M
 
D
Q
 
R
L
 
A
V
 
V
E
 
E
-
 
K
-
 
Y
G
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
F
H
 
H
L
|
L
G
x
A
G
|
G
I
 
I
-
x
L
S
|
S
I
 
A
D
 
K
A
 
G
P
 
E
F
 
K
D
 
D
D
 
P
L
 
A
L
 
L
G
 
A
-
 
Y
-
 
K
A
 
V
N
 
N
I
 
M
A
 
N
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
Y
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
K
 
Q
H
 
H
G
 
R
V
 
V
K
 
E
R
 
K
I
 
V
A
 
V
F
 
I
A
x
P
S
|
S
S
x
T
N
x
I
H
 
G
V
 
V
I
 
F
G
 
G
F
 
P
H
 
E
P
 
T
V
 
P
T
 
K
E
 
N
V
 
K
L
 
V
D
 
P
A
 
S
D
 
I
A
 
T
P
 
I
Q
 
T
R
 
R
P
 
P
D
 
R
T
 
T
L
 
M
Y
x
F
G
 
G
V
 
V
T
 
T
K
|
K
C
 
I
F
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
L
L
 
L
S
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
E
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
L
E
 
D
T
 
V
V
 
R
C
 
S
M
 
L
R
 
R
-
x
Y
-
 
P
-
 
G
I
|
I
G
 
I
S
 
S
S
 
Y
F
 
K
D
 
A
E
 
E
P
 
P
K
 
T
-
 
A
-
x
G
N
x
T
S
x
T
R
 
D
M
 
Y
L
 
A
V
 
V
T
 
E
Y
 
I
L
 
F
S
 
Y
Y
 
Y
R
 
A
D
 
V
F
 
K
I
 
R
E
 
E
L
 
K
V
 
Y
R
 
K
C
 
C
S
 
Y
L
 
L
F
 
A
T
 
P
N
 
N
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
M
-
 
Y
-
 
M
-
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
K
G
 
A
H
 
L
V
 
V
V
 
D
V
 
L
Y
 
Y
G
 
E
A
 
A
S
 
D
D
 
R
N
 
D
P
 
K
V
 
L
K
 
V
W
 
L
W
 
R
D
 
N
N
 
G
T
 
Y
K
 
N
V
 
V
S
 
T
F
 
A
L
 
Y
G
 
T
F
 
F
N
 
T
P
 
P
R
 
S
D
 
E
S
 
L
S
 
Y
A
 
S
P
 
K
F
 
I
A
 
K
A
 
E
R
 
R
F
 
I
P
 
P

3a9wA Crystal structure of l-threonine bound l-threonine dehydrogenase (y137f) from hyperthermophilic archaeon thermoplasma volcanium (see paper)
28% identity, 82% coverage: 19:251/283 of query aligns to 2:255/315 of 3a9wA

query
sites
3a9wA
L
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
x
S
G
|
G
N
x
Q
L
x
I
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
V
G
 
P
V
 
Y
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
W
 
K
A
 
Y
D
 
G
V
 
K
V
 
K
R
 
N
V
 
V
T
 
I
D
 
A
I
 
S
A
x
D
S
x
I
L
 
V
G
 
Q
E
 
R
P
 
D
A
 
T
P
 
G
H
 
G
E
 
I
E
 
K
A
 
F
S
 
I
V
 
T
V
x
L
D
|
D
L
x
V
A
 
S
D
 
N
R
 
R
E
 
D
A
 
E
V
 
I
M
 
D
Q
 
R
L
 
A
V
 
V
E
 
E
-
 
K
-
 
Y
G
 
S
V
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
F
H
 
H
L
|
L
G
x
A
G
 
G
I
 
I
-
x
L
S
|
S
I
 
A
D
 
K
A
 
G
P
 
E
F
 
K
D
 
D
D
 
P
L
 
A
L
 
L
G
 
A
-
 
Y
-
 
K
A
x
V
N
 
N
I
 
M
A
 
N
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
L
 
I
Y
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
K
 
Q
H
 
H
G
 
R
V
 
V
K
 
E
R
 
K
I
 
V
A
 
V
F
 
I
A
x
P
S
|
S
S
x
T
N
 
I
H
 
G
V
 
V
I
 
F
G
 
G
F
 
P
H
 
E
P
 
T
V
 
P
T
 
K
E
 
N
V
 
K
L
 
V
D
 
P
A
 
S
D
 
I
A
 
T
P
 
I
Q
 
T
R
 
R
P
 
P
D
 
R
T
 
T
L
 
M
Y
x
F
G
 
G
V
 
V
T
 
T
K
|
K
C
 
I
F
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
L
L
 
L
S
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
E
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
L
E
 
D
T
 
V
V
 
R
C
 
S
M
 
L
R
 
R
-
x
Y
-
 
P
-
 
G
I
|
I
G
 
I
S
 
S
S
 
Y
F
 
K
D
 
A
E
 
E
P
 
P
K
 
T
-
 
A
-
x
G
N
x
T
S
x
T
R
 
D
M
 
Y
L
 
A
V
 
V
T
 
E
Y
 
I
L
 
F
S
 
Y
Y
 
Y
R
 
A
D
 
V
F
 
K
I
 
R
E
 
E
L
 
K
V
 
Y
R
 
K
C
 
C
S
 
Y
L
 
L
F
 
A
T
 
P
N
 
N
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
M
-
 
Y
-
 
M
-
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
K
G
 
A
H
 
L
V
 
V
V
 
D
V
 
L
Y
 
Y
G
 
E
A
 
A
S
 
D
D
 
R
N
 
D
P
 
K
V
 
L
K
 
V
W
 
L
W
 
R
D
 
N
N
 
G
T
 
Y
K
 
N
V
 
V
S
 
T
F
 
A
L
 
Y
G
 
T
F
 
F
N
 
T
P
 
P
R
 
S
D
 
E
S
 
L
S
 
Y
A
 
S
P
 
K
F
 
I
A
 
K
A
 
E
R
 
R
F
 
I
P
 
P

7cgvA Full consensus l-threonine 3-dehydrogenase, fctdh-iiym (NAD+ bound form) (see paper)
30% identity, 56% coverage: 17:175/283 of query aligns to 1:165/310 of 7cgvA

query
sites
7cgvA
R
 
K
R
 
R
L
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
I
G
|
G
A
 
A
A
 
N
G
|
G
N
x
Q
L
x
I
G
 
G
R
 
S
Q
 
E
L
 
L
R
 
V
G
 
P
V
 
A
L
 
L
A
 
R
Q
 
K
-
 
R
-
 
Y
W
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
N
V
 
V
R
 
I
V
 
A
T
 
S
D
|
D
I
|
I
-
x
R
-
 
P
A
 
P
S
 
N
L
 
L
G
 
Y
E
 
E
P
 
A
A
 
G
P
 
P
H
 
F
E
 
E
E
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
Y
V
x
L
D
|
D
L
x
V
A
 
L
D
 
D
R
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
L
M
 
A
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
E
 
K
G
 
K
-
 
Y
-
 
K
V
 
I
D
 
T
A
 
Q
I
 
I
V
 
Y
H
 
H
L
 
L
G
x
A
G
x
A
I
 
L
-
x
L
-
 
S
-
 
A
S
 
T
I
 
G
D
 
E
A
 
K
P
 
N
F
 
P
D
 
Q
D
 
K
L
 
A
L
 
W
G
 
D
A
 
L
N
 
N
I
 
M
A
 
D
G
 
G
T
 
L
Y
 
L
N
 
N
L
 
V
Y
 
L
E
 
E
A
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
E
H
 
R
G
 
G
V
 
P
K
 
L
R
 
K
I
 
V
A
 
F
F
 
W
A
x
P
S
 
S
S
|
S
N
 
I
H
 
A
V
 
A
I
 
F
G
 
G
F
 
P
H
 
N
P
 
T
V
 
P
T
 
K
E
 
D
V
 
N
L
 
T
D
 
P
A
 
Q
D
 
D
A
 
T
P
 
I
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
D
 
T
T
 
T
L
 
I
Y
|
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
S
K
|
K
C
 
V
F
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
S
 
C
R
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
Y
 
H
D
 
T
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
V
V
 
R
C
 
S
M
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6jygD Crystal structure of l-threonine dehydrogenase from phytophthora infestans (see paper)
33% identity, 54% coverage: 18:170/283 of query aligns to 2:157/307 of 6jygD

query
sites
6jygD
R
 
R
L
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
T
G
|
G
N
x
Q
L
x
I
G
 
G
R
 
M
Q
 
E
L
 
L
R
 
V
G
 
P
V
 
Y
L
 
M
A
 
R
Q
 
Q
W
 
L
-
 
F
-
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
T
V
 
I
R
 
V
V
 
N
T
 
S
D
|
D
I
|
I
A
x
K
S
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
A
 
A
P
 
P
H
 
G
E
 
R
E
 
D
A
 
G
S
 
N
V
 
F
V
 
V
-
 
Y
-
 
C
D
|
D
L
x
V
A
 
Q
D
 
D
R
 
R
E
 
D
A
 
S
V
 
M
M
 
A
Q
 
R
L
 
I
V
 
V
-
 
T
-
 
E
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
T
I
 
I
V
 
V
H
 
H
L
x
M
G
x
A
G
x
S
I
 
L
S
x
L
I
x
S
-
 
A
-
 
V
-
 
G
D
 
E
A
 
A
P
 
N
F
 
P
D
 
S
D
 
L
L
 
A
L
 
L
G
 
S
A
x
V
N
 
N
I
 
T
A
 
R
G
 
G
T
 
I
Y
 
Q
N
 
N
L
 
V
Y
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
K
K
 
Q
H
 
Y
G
 
Q
V
 
L
K
 
R
R
 
-
I
 
-
A
 
V
F
 
F
A
 
A
S
x
P
S
|
S
N
x
T
H
 
I
V
 
A
I
 
V
G
 
-
F
 
F
H
 
G
P
 
P
V
 
S
T
 
T
-
 
P
-
 
Q
-
 
D
E
 
E
V
 
T
L
 
P
D
 
D
A
 
T
D
 
T
A
 
I
P
 
-
Q
 
M
R
 
R
P
 
P
D
 
T
T
 
T
L
 
M
Y
|
Y
G
 
G
V
 
L
T
 
T
K
|
K
C
 
V
F
 
H
G
 
V
E
 
E
A
 
L
L
 
L
S
 
G
R
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
N
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
D

Sites not aligning to the query:

5u4qB 1.5 angstrom resolution crystal structure of NAD-dependent epimerase from klebsiella pneumoniae in complex with NAD.
29% identity, 58% coverage: 18:180/283 of query aligns to 3:181/304 of 5u4qB

query
sites
5u4qB
R
 
K
L
 
F
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
N
x
F
L
x
I
G
 
G
R
 
F
Q
 
H
L
 
I
-
 
A
R
 
Q
G
 
R
V
 
L
L
 
L
A
 
N
Q
 
E
W
 
G
A
 
H
D
 
N
V
 
V
V
 
V
R
 
G
V
 
I
T
x
D
D
x
N
I
 
M
A
x
N
S
 
D
-
 
Y
-
x
Y
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
L
-
x
K
-
 
Q
-
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
D
-
 
R
L
 
L
G
 
A
E
 
Y
P
 
P
A
 
A
P
 
F
H
 
H
E
 
F
E
 
Q
A
 
Q
S
 
-
V
 
-
V
 
L
D
|
D
L
|
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
E
 
E
A
 
G
V
 
M
M
 
A
Q
 
K
L
 
L
-
 
F
-
 
A
V
 
T
E
 
E
G
 
Q
V
 
F
D
 
D
A
 
R
I
 
V
V
 
I
H
 
H
L
|
L
G
x
A
-
x
A
-
 
Q
-
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
R
I
 
L
D
 
E
A
 
N
P
 
P
F
 
Y
D
 
A
D
 
-
L
 
Y
L
 
A
G
 
D
A
 
A
N
 
N
I
 
L
A
 
M
G
 
G
T
 
Y
Y
 
L
N
 
N
L
 
I
Y
 
L
E
 
E
A
 
G
A
 
C
R
 
R
K
 
H
H
 
T
G
 
K
V
 
V
K
 
K
R
 
H
I
 
L
A
 
V
F
 
Y
A
|
A
S
 
S
S
 
S
N
 
S
H
 
S
V
 
V
I
 
Y
G
 
G
F
 
L
H
 
N
P
 
R
V
 
K
T
 
M
E
 
P
V
 
F
L
 
S
D
 
T
A
 
E
D
 
D
A
 
S
P
 
V
Q
 
D
R
 
H
P
 
P
D
 
V
T
 
S
L
 
L
Y
|
Y
G
 
A
V
 
A
T
 
T
K
|
K
C
 
K
F
 
A
G
 
N
E
 
E
A
 
L
L
 
M
S
 
A
R
 
H
Y
 
T
Y
 
Y
Y
 
S
D
 
H
R
 
L
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
E
 
P
T
 
T
V
 
T
C
 
G
M
 
L
R
 
R
I
x
F
G
 
F
S
 
T
S
x
V
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

5u4qA 1.5 angstrom resolution crystal structure of NAD-dependent epimerase from klebsiella pneumoniae in complex with NAD.
28% identity, 58% coverage: 18:180/283 of query aligns to 3:176/321 of 5u4qA

query
sites
5u4qA
R
 
K
L
 
F
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
N
x
F
L
x
I
G
 
G
R
 
F
Q
 
H
L
 
I
-
 
A
R
 
Q
G
 
R
V
 
L
L
 
L
A
 
N
Q
 
E
W
 
G
A
 
H
D
 
N
V
 
V
V
 
V
R
 
G
V
 
I
T
x
D
D
x
N
I
 
M
A
x
N
S
 
D
-
 
Y
-
x
Y
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
L
-
x
K
-
 
Q
-
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
D
-
 
R
L
 
L
G
 
A
E
 
Y
P
 
P
A
 
A
P
 
F
H
 
H
E
 
F
E
 
Q
A
 
Q
S
 
-
V
 
-
V
 
L
D
|
D
L
|
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
E
 
E
A
 
G
V
 
M
M
 
A
Q
 
K
L
 
L
-
 
F
-
 
A
V
 
T
E
 
E
G
 
Q
V
 
F
D
 
D
A
 
R
I
 
V
V
 
I
H
 
H
L
|
L
G
x
A
G
x
A
I
 
Q
S
 
A
I
 
N
D
 
P
A
 
Y
P
 
A
F
 
Y
D
 
A
D
 
D
L
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
A
N
 
N
I
 
L
A
 
M
G
 
G
T
 
Y
Y
 
L
N
 
N
L
 
I
Y
 
L
E
 
E
A
 
G
A
 
C
R
 
R
K
 
H
H
 
T
G
 
K
V
 
V
K
 
K
R
 
H
I
 
L
A
 
V
F
 
Y
A
|
A
S
 
S
S
 
S
N
 
S
H
 
S
V
 
V
I
 
Y
G
 
G
F
 
L
H
 
N
P
 
R
V
 
K
T
 
M
E
 
P
V
 
F
L
 
S
D
 
T
A
 
E
D
 
D
A
 
S
P
 
V
Q
 
D
R
 
H
P
 
P
D
 
V
T
 
S
L
 
L
Y
|
Y
G
 
A
V
 
A
T
 
T
K
|
K
C
 
K
F
 
A
G
 
N
E
 
E
A
 
L
L
 
M
S
 
A
R
 
H
Y
 
T
Y
 
Y
Y
 
S
D
 
H
R
 
L
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
E
 
P
T
 
T
V
 
T
C
 
G
M
 
L
R
 
R
I
x
F
G
x
F
S
x
T
S
x
V
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

3eheA Crystal structure of udp-glucose 4 epimerase (gale-1) from archaeoglobus fulgidus
30% identity, 57% coverage: 19:178/283 of query aligns to 2:164/290 of 3eheA

query
sites
3eheA
L
 
I
L
 
V
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
N
x
F
L
x
I
G
 
G
R
 
S
Q
 
H
L
 
V
R
 
V
G
 
D
V
 
K
L
 
L
A
 
S
Q
 
E
W
 
S
A
 
N
D
 
E
V
 
I
V
 
V
R
 
V
V
 
I
T
x
D
D
x
N
I
x
L
A
x
S
S
|
S
L
x
G
G
 
N
E
 
E
P
 
E
A
 
F
P
 
V
H
 
N
E
 
E
E
 
A
A
 
A
S
 
R
V
 
L
V
 
V
-
 
K
-
 
A
D
|
D
L
|
L
A
 
A
D
 
-
R
 
A
E
 
D
A
 
D
V
 
I
M
 
K
Q
 
D
L
 
Y
V
 
L
E
 
K
G
 
G
V
 
A
D
 
E
A
 
E
I
 
V
V
 
W
H
 
H
L
x
I
G
x
A
G
x
A
I
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
R
S
 
G
I
 
A
D
 
E
A
 
N
P
 
P
F
 
-
D
 
D
D
 
E
L
 
I
L
 
Y
G
 
R
A
 
N
N
 
N
I
 
V
A
 
L
G
 
A
T
 
T
Y
 
Y
N
 
R
L
 
L
Y
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
M
R
 
R
K
 
K
H
 
A
G
 
G
V
 
V
K
 
S
R
 
R
I
 
I
A
 
V
F
 
F
A
x
T
S
 
S
S
x
T
N
x
S
H
x
T
V
 
V
I
 
Y
G
 
G
F
 
E
H
 
A
P
 
K
V
 
V
T
 
I
E
 
P
V
 
T
L
 
P
D
 
E
A
 
-
D
 
D
A
 
Y
P
 
P
Q
 
T
R
 
H
P
 
P
D
 
I
T
 
S
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
V
 
A
T
 
S
K
|
K
C
 
L
F
 
A
G
 
C
E
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
I
R
 
E
Y
 
S
Y
 
Y
Y
 
C
D
 
H
R
 
T
F
 
F
G
 
D
I
 
M
E
 
Q
T
 
A
V
 
W
C
 
I
M
 
Y
R
 
R
I
x
F
G
x
A
S
x
N

Sites not aligning to the query:

6wjaA Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-galnac (see paper)
31% identity, 58% coverage: 18:180/283 of query aligns to 2:174/307 of 6wjaA

query
sites
6wjaA
R
 
R
L
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
N
x
F
L
x
I
G
 
G
R
 
S
Q
 
H
L
 
L
R
 
V
G
 
D
V
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
A
W
 
K
A
 
G
D
 
Y
V
 
A
V
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
L
D
|
D
I
x
D
A
 
L
S
|
S
L
x
T
G
|
G
E
 
K
P
 
V
A
 
G
-
 
N
-
 
L
P
 
P
H
 
M
E
 
G
E
 
D
A
 
A
S
 
G
V
 
L
V
 
E
D
 
L
L
 
L
A
 
V
D
 
G
R
 
D
E
x
A
A
 
A
V
 
D
M
 
A
Q
 
A
L
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
A
V
 
V
E
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
V
H
 
H
L
|
L
G
x
A
G
x
A
I
 
V
-
 
A
S
 
S
I
x
V
D
 
Q
A
 
A
P
 
S
F
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
P
L
 
V
G
 
A
-
 
T
-
 
H
-
 
Q
A
x
S
N
 
N
I
 
F
A
 
I
G
 
A
T
 
T
Y
 
L
N
 
R
L
 
L
Y
 
C
E
 
E
A
 
A
A
 
M
R
 
T
K
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
I
K
 
R
R
 
R
I
 
V
A
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
x
A
N
x
A
H
x
A
V
 
V
I
 
Y
G
 
G
F
 
N
H
 
N
P
 
G
V
 
E
T
 
G
E
 
T
V
 
P
L
 
I
D
 
A
A
 
E
D
 
D
A
 
T
P
 
P
Q
 
K
R
 
S
P
 
P
D
 
L
T
 
T
L
 
P
Y
x
F
G
 
A
V
 
A
T
 
D
K
|
K
C
 
L
F
 
A
G
 
S
E
 
E
A
 
Y
L
 
Y
S
 
L
R
 
D
Y
 
F
Y
 
Y
Y
 
R
D
 
R
R
 
Q
F
 
H
G
 
G
I
 
L
E
 
E
T
 
P
V
 
V
C
 
I
M
 
L
R
 
R
I
x
F
G
x
F
S
x
N
S
x
I
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6wj9B Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-glcnac (see paper)
31% identity, 58% coverage: 18:180/283 of query aligns to 3:175/308 of 6wj9B

query
sites
6wj9B
R
 
R
L
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
N
x
F
L
x
I
G
 
G
R
 
S
Q
 
H
L
 
L
R
 
V
G
 
D
V
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
A
W
 
K
A
 
G
D
 
Y
V
 
A
V
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
L
D
|
D
I
x
D
A
 
L
S
|
S
L
x
T
G
|
G
E
 
K
P
 
V
A
 
G
-
 
N
-
 
L
P
 
P
H
 
M
E
 
G
E
 
D
A
 
A
S
 
G
V
 
L
V
 
E
D
 
L
L
 
L
A
 
V
D
 
G
R
x
D
E
x
A
A
 
A
V
 
D
M
 
A
Q
 
A
L
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
A
V
 
V
E
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
V
H
 
H
L
|
L
G
x
A
G
x
A
I
 
V
-
 
A
S
 
S
I
x
V
D
 
Q
A
 
A
P
 
S
F
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
P
L
 
V
G
 
A
-
 
T
-
 
H
-
 
Q
A
x
S
N
 
N
I
 
F
A
 
I
G
 
A
T
 
T
Y
 
L
N
 
R
L
 
L
Y
 
C
E
 
E
A
 
A
A
 
M
R
 
T
K
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
I
K
 
R
R
 
R
I
 
V
A
 
V
F
 
F
A
|
A
S
 
S
S
x
A
N
x
A
H
x
A
V
 
V
I
 
Y
G
 
G
F
 
N
H
 
N
P
 
G
V
 
E
T
 
G
E
 
T
V
 
P
L
 
I
D
 
A
A
 
E
D
 
D
A
 
T
P
 
P
Q
 
K
R
 
S
P
 
P
D
 
L
T
 
T
L
 
P
Y
x
F
G
 
A
V
 
A
T
 
D
K
|
K
C
 
L
F
 
A
G
 
S
E
 
E
A
 
Y
L
 
Y
S
 
L
R
 
D
Y
 
F
Y
 
Y
Y
 
R
D
 
R
R
 
Q
F
 
H
G
 
G
I
 
L
E
 
E
T
 
P
V
 
V
C
 
I
M
 
L
R
 
R
I
x
F
G
x
F
S
x
N
S
x
I
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2c59A Gdp-mannose-3', 5' -epimerase (arabidopsis thaliana), with gdp-alpha- d-mannose and gdp-beta-l-galactose bound in the active site. (see paper)
29% identity, 57% coverage: 18:177/283 of query aligns to 18:188/364 of 2c59A

query
sites
2c59A
R
 
K
L
 
I
L
 
S
L
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
|
G
N
x
F
L
x
I
G
 
A
R
 
S
Q
 
H
L
 
I
R
 
A
G
 
R
V
 
R
L
 
L
A
 
K
Q
 
H
W
 
E
A
 
G
D
 
H
V
 
Y
V
 
V
R
 
I
V
 
A
T
 
S
D
|
D
I
x
W
A
x
K
S
 
K
-
 
N
-
 
E
-
 
H
L
 
M
G
 
T
E
 
E
P
 
D
A
 
M
P
 
F
H
 
C
E
 
D
E
 
E
A
 
F
S
 
H
V
 
L
V
 
V
D
|
D
L
|
L
A
 
R
D
 
V
R
 
M
E
 
E
A
 
N
V
 
C
M
 
L
Q
 
K
L
 
V
V
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
H
I
 
V
V
 
F
H
 
N
L
|
L
-
 
A
-
x
A
-
 
D
-
x
M
G
|
G
G
|
G
I
x
M
S
 
G
-
 
F
I
|
I
D
 
Q
A
 
S
P
 
N
F
 
H
D
 
S
D
 
V
L
 
I
L
 
M
G
 
Y
A
 
N
N
 
N
I
 
T
A
 
M
G
x
I
T
 
S
Y
 
F
N
 
N
L
 
M
Y
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
I
H
 
N
G
 
G
V
 
I
K
 
K
R
 
R
I
 
F
A
 
F
F
 
Y
A
|
A
S
 
S
S
|
S
N
x
A
H
x
C
V
 
I
I
 
Y
G
 
P
F
 
E
H
 
F
P
 
K
V
 
Q
T
 
L
E
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
S
V
 
L
L
 
K
D
 
E
A
 
S
D
 
D
A
 
A
-
 
W
P
 
P
Q
 
A
R
 
E
P
 
P
D
 
Q
T
 
D
L
 
A
Y
|
Y
G
 
G
V
 
L
T
 
E
K
|
K
C
 
L
F
 
A
G
 
T
E
 
E
A
 
E
L
 
L
S
 
C
R
 
K
Y
 
H
Y
 
Y
Y
 
N
D
 
K
R
 
D
F
 
F
G
 
G
I
 
I
E
 
E
T
 
C
V
 
-
C
 
-
M
 
-
R
 
R
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q93VR3 GDP-mannose 3,5-epimerase; GDP-Man 3,5-epimerase; EC 5.1.3.18 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
29% identity, 57% coverage: 18:177/283 of query aligns to 29:199/377 of Q93VR3

query
sites
Q93VR3
R
 
K
L
 
I
L
 
S
L
 
I
T
 
T
G
|
G
A
|
A
A
x
G
G
|
G
N
x
F
L
x
I
G
x
A
R
x
S
Q
x
H
L
x
I
R
x
A
G
x
R
V
x
R
L
|
L
A
x
K
Q
x
H
W
x
E
A
x
G
D
x
H
V
x
Y
V
|
V
R
x
I
V
x
A
T
x
S
D
|
D
I
x
W
A
x
K
S
 
K
-
 
N
-
 
E
-
 
H
L
 
M
G
 
T
E
 
E
P
 
D
A
 
M
P
 
F
H
 
C
E
 
D
E
 
E
A
 
F
S
 
H
V
 
L
V
 
V
D
|
D
L
 
L
A
 
R
D
 
V
R
 
M
E
 
E
A
 
N
V
 
C
M
 
L
Q
 
K
L
 
V
V
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
H
I
 
V
V
 
F
H
 
N
L
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
M
G
 
G
G
 
G
I
 
M
S
 
G
-
 
F
I
 
I
D
 
Q
A
 
S
P
 
N
F
 
H
D
 
S
D
 
V
L
 
I
L
 
M
G
 
Y
A
 
N
N
 
N
I
 
T
A
 
M
G
 
I
T
 
S
Y
 
F
N
 
N
L
 
M
Y
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
I
H
 
N
G
 
G
V
 
I
K
 
K
R
 
R
I
 
F
A
 
F
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
S
 
S
N
 
A
H
x
C
V
 
I
I
 
Y
G
 
P
F
 
E
H
 
F
P
 
K
V
 
Q
T
 
L
E
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
S
V
 
L
L
 
K
D
 
E
A
 
S
D
 
D
A
 
A
-
 
W
P
 
P
Q
 
A
R
 
E
P
 
P
D
 
Q
T
 
D
L
 
A
Y
|
Y
G
 
G
V
 
L
T
 
E
K
|
K
C
 
L
F
 
A
G
 
T
E
 
E
A
 
E
L
 
L
S
 
C
R
 
K
Y
 
H
Y
 
Y
Y
 
N
D
 
K
R
 
D
F
 
F
G
 
G
I
 
I
E
 
E
T
 
C
V
 
-
C
 
-
M
 
-
R
 
R
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5z75A Artificial l-threonine 3-dehydrogenase designed by ancestral sequence reconstruction. (see paper)
25% identity, 56% coverage: 18:175/283 of query aligns to 4:166/306 of 5z75A

query
sites
5z75A
R
 
K
L
 
I
L
 
L
L
 
V
T
 
I
G
|
G
A
 
A
A
x
C
G
|
G
N
x
Q
L
x
I
G
 
G
R
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
T
G
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
R
Q
 
E
W
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
I
V
 
Y
R
 
G
V
 
N
T
 
E
D
 
N
I
 
V
A
 
V
S
 
A
L
 
S
G
x
D
E
x
I
P
 
R
A
 
E
P
 
P
H
 
N
E
 
E
E
 
E
A
 
S
-
 
G
-
 
P
-
 
F
S
 
E
V
 
K
V
x
L
D
 
D
L
x
V
A
 
M
D
 
D
R
 
K
E
 
E
A
 
R
V
 
L
M
 
E
Q
 
E
L
 
I
V
 
V
E
 
E
G
 
K
-
 
H
-
 
K
V
 
I
D
 
T
A
 
Q
I
 
V
V
 
Y
H
 
H
L
|
L
G
x
A
G
 
A
I
 
I
S
x
L
I
 
S
D
 
A
A
 
T
P
 
G
F
 
E
D
 
K
D
 
N
L
 
P
L
 
L
G
 
F
A
 
A
-
 
W
-
 
D
-
 
L
N
 
N
I
 
M
A
 
N
G
 
S
T
 
L
Y
 
L
N
 
N
L
 
V
Y
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
E
H
 
G
G
 
K
V
 
I
K
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
F
F
 
W
A
x
P
S
 
S
S
|
S
N
 
I
H
 
A
V
 
V
I
 
F
G
 
G
F
 
P
H
 
T
P
 
T
V
 
P
T
 
K
E
 
E
V
 
N
L
 
T
D
 
P
A
 
Q
D
 
H
A
 
T
P
 
V
Q
 
M
R
 
D
P
 
P
D
 
S
T
 
T
L
 
V
Y
|
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
S
K
|
K
C
 
L
F
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
R
L
 
W
S
 
C
R
 
E
Y
 
Y
Y
 
Y
Y
 
H
D
 
E
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
I
 
V
E
 
D
T
 
V
V
 
R
C
 
S
M
 
I
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3aw9A Structure of udp-galactose 4-epimerase mutant
29% identity, 56% coverage: 18:175/283 of query aligns to 2:157/304 of 3aw9A

query
sites
3aw9A
R
 
R
L
 
I
L
 
V
L
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
N
x
F
L
x
I
G
 
G
R
 
S
Q
 
H
L
 
L
R
 
V
G
 
D
V
 
K
L
 
L
A
 
V
Q
 
E
W
 
L
A
 
G
D
 
Y
V
 
E
V
 
V
R
 
V
V
 
V
T
 
V
D
|
D
I
|
I
A
 
V
S
 
Q
L
 
R
G
 
-
E
 
D
P
 
T
A
 
G
P
 
G
H
 
S
E
 
A
E
 
E
A
 
L
S
 
H
V
 
V
V
x
R
D
|
D
L
|
L
A
 
K
D
 
D
R
 
Y
E
 
S
A
 
W
V
 
G
M
 
A
Q
 
G
L
 
-
V
 
I
E
 
K
G
 
G
V
 
-
D
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
F
H
 
H
L
x
F
G
x
A
G
x
A
-
 
N
-
x
P
-
 
E
I
x
V
S
 
R
I
 
T
D
 
T
A
 
E
P
 
P
F
 
I
D
 
V
D
 
H
L
 
F
L
 
-
G
 
N
A
x
E
N
 
N
I
 
V
A
 
V
G
 
A
T
 
T
Y
 
F
N
 
N
L
 
V
Y
 
L
E
 
E
A
 
W
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
H
 
T
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
T
I
 
V
A
 
V
F
 
F
A
|
A
S
|
S
S
|
S
N
x
S
H
x
T
V
 
V
I
 
Y
G
 
G
F
 
D
H
 
A
P
 
D
V
 
V
T
 
I
E
 
P
V
 
T
L
 
P
D
 
E
A
 
-
D
 
E
A
 
E
P
 
P
Q
 
Y
R
 
K
P
 
P
D
 
I
T
 
S
L
 
V
Y
|
Y
G
 
G
V
 
A
T
 
A
K
|
K
C
 
A
F
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
V
L
 
M
S
 
C
R
 
A
Y
 
T
Y
 
Y
Y
 
A
D
 
R
R
 
L
F
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
R
T
 
C
V
 
L
C
 
A
M
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>H281DRAFT_03826 FitnessBrowser__Burk376:H281DRAFT_03826
MSQTMTQPDAAPRKPFRRLLLTGAAGNLGRQLRGVLAQWADVVRVTDIASLGEPAPHEEA
SVVDLADREAVMQLVEGVDAIVHLGGISIDAPFDDLLGANIAGTYNLYEAARKHGVKRIA
FASSNHVIGFHPVTEVLDADAPQRPDTLYGVTKCFGEALSRYYYDRFGIETVCMRIGSSF
DEPKNSRMLVTYLSYRDFIELVRCSLFTNRVGHVVVYGASDNPVKWWDNTKVSFLGFNPR
DSSAPFAARFPATAPDASRDDPAQRFQGGPFVLGEPLERENSR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory