SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS02180 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS02180 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4wjmA Crystal structure of fructokinase from brucella abortus 2308 with bound amppnp
30% identity, 92% coverage: 11:286/301 of query aligns to 12:304/312 of 4wjmA

query
sites
4wjmA
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
I
D
 
D
F
 
M
I
 
L
R
 
P
Q
 
R
P
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
G
-
 
G
D
 
E
E
 
T
Q
 
A
W
 
F
R
 
Q
A
 
P
I
 
F
P
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
S
C
 
V
W
 
F
N
 
N
V
 
T
A
 
A
R
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
T
G
 
G
Y
 
F
A
 
F
G
 
S
S
 
G
V
 
I
S
 
S
T
 
S
D
 
D
V
 
F
F
 
F
G
 
G
A
 
D
E
 
V
L
 
L
Y
 
R
A
 
D
L
 
T
T
 
L
Q
 
A
A
 
R
A
 
S
G
 
N
L
 
V
D
 
D
M
 
Y
R
 
S
F
 
F
T
 
A
Q
 
A
Q
 
I
Y
 
S
A
 
N
K
 
R
A
 
P
P
 
T
L
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
F
V
 
V
T
 
R
S
 
L
T
 
V
T
 
D
-
 
G
P
 
Q
P
 
A
D
 
R
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
I
 
Y
G
 
D
D
 
E
D
 
N
S
 
T
A
 
A
D
 
G
L
 
R
H
 
M
F
 
L
D
 
S
P
 
R
Q
 
N
R
 
D
L
 
M
P
 
P
A
 
-
G
 
-
W
 
Y
L
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
T
-
 
I
Q
 
S
V
 
A
L
 
M
H
 
L
F
 
F
G
 
G
C
 
C
I
 
I
S
 
S
L
 
L
T
 
I
R
 
S
E
 
E
P
 
P
L
 
C
A
 
G
S
 
S
R
 
V
L
 
Y
-
 
E
L
 
T
Q
 
L
I
 
L
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
P
R
 
-
R
 
-
N
 
N
K
 
R
K
 
V
I
 
M
A
 
F
F
 
L
D
 
D
P
 
P
N
 
N
W
 
I
R
 
R
K
 
A
L
 
N
M
 
L
D
 
I
S
 
T
-
 
V
-
 
R
P
 
K
S
 
T
Y
 
H
R
 
L
L
 
T
L
 
R
F
 
M
Q
 
K
Q
 
R
L
 
M
L
 
I
S
 
A
L
 
L
S
 
A
H
 
D
Y
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
E
 
D
R
 
W
L
 
F
F
 
G
-
 
E
P
 
K
G
 
G
D
 
S
T
 
H
N
 
D
A
 
E
L
 
I
A
 
A
T
 
A
L
 
E
-
 
W
Q
 
L
S
 
K
L
 
L
A
 
G
P
 
P
Q
 
K
A
 
L
E
 
-
I
 
V
L
 
V
Y
 
I
T
|
T
L
 
K
G
|
G
A
|
A
K
 
H
G
|
G
M
 
A
Q
 
V
W
 
A
I
 
Y
K
 
T
G
 
N
E
 
H
Q
 
A
V
 
T
I
 
V
D
 
P
Q
 
V
P
 
P
A
 
G
Y
 
V
R
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
A
 
T
S
x
V
M
 
N
G
 
A
G
 
G
W
 
I
I
 
L
A
 
A
S
 
S
-
 
L
-
 
H
-
 
S
-
 
Q
Q
 
G
L
 
L
R
 
L
Q
 
T
P
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
L
A
 
A
-
 
N
-
 
L
-
 
S
-
 
E
-
 
D
Q
 
Q
V
 
I
H
 
H
L
 
S
Q
 
A
C
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
G
-
x
V
-
 
R
G
 
A
A
|
A
A
 
A
I
 
V
A
 
T
A
 
V
S
 
S
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A

3gbuA Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with atp
26% identity, 93% coverage: 10:289/301 of query aligns to 5:286/302 of 3gbuA

query
sites
3gbuA
F
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
T
 
I
D
 
D
F
 
L
I
 
I
R
 
S
Q
 
V
P
 
E
D
 
E
E
 
G
Q
 
D
W
 
L
R
 
K
A
 
D
I
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
K
-
 
H
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
P
W
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
V
A
 
G
A
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
K
T
 
S
G
 
S
Y
 
L
A
 
I
G
 
S
S
 
K
V
 
V
S
 
G
T
 
N
D
 
D
V
 
P
F
 
F
G
 
G
A
 
E
E
 
Y
L
 
L
Y
 
I
A
 
E
L
 
E
T
 
L
Q
 
S
A
 
K
A
 
E
G
 
N
L
 
V
D
 
D
M
 
T
R
 
R
-
 
G
F
 
I
T
 
V
Q
 
K
Q
 
D
Y
 
E
A
 
K
K
 
K
A
 
H
P
 
T
L
 
G
L
 
I
A
 
V
M
 
F
V
 
V
T
 
Q
S
 
L
T
 
K
T
 
G
P
 
A
P
 
S
D
 
P
Y
 
S
F
 
F
F
 
L
I
 
L
G
 
Y
D
 
D
D
 
D
S
 
V
A
 
A
D
 
Y
L
 
F
H
 
N
F
 
M
D
 
T
P
 
L
Q
 
N
R
 
D
L
 
I
P
 
N
A
 
W
G
 
D
W
 
I
L
 
V
D
 
E
D
 
E
A
 
A
Q
 
K
V
 
I
L
 
V
H
 
N
F
 
F
G
 
G
C
 
S
I
 
V
S
 
I
L
 
L
T
 
A
R
 
R
E
 
N
P
 
P
L
 
S
A
 
R
S
 
E
R
 
T
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
I
 
V
A
 
I
Q
 
K
E
 
K
A
 
I
A
 
-
R
 
K
R
 
G
N
 
S
K
 
S
K
 
L
I
 
I
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
W
 
L
R
 
R
-
 
L
-
 
D
-
 
L
-
 
W
K
 
R
L
 
G
M
 
Q
D
 
E
S
 
E
P
 
E
S
 
M
Y
 
I
R
 
K
L
 
V
L
 
L
F
 
-
Q
 
E
Q
 
E
L
 
S
L
 
I
S
 
K
L
 
L
S
 
A
H
 
D
Y
 
I
V
 
V
K
|
K
V
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
V
E
 
L
R
 
Y
L
 
L
F
 
E
P
 
N
G
 
-
D
 
-
T
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
Q
 
Q
S
 
G
L
 
V
A
 
E
P
 
V
Q
 
K
A
 
G
E
 
S
I
 
M
L
 
L
-
 
T
-
 
A
Y
 
I
T
|
T
L
 
L
G
|
G
A
 
P
K
 
K
G
 
G
M
 
F
Q
 
R
W
 
L
I
 
I
K
 
K
G
 
N
E
 
E
Q
 
T
V
 
V
I
 
V
D
 
D
Q
 
V
P
 
P
A
 
S
Y
 
Y
R
 
N
V
|
V
E
 
N
V
x
P
I
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
S
 
F
M
 
M
G
 
A
G
 
A
W
 
L
I
 
L
A
 
V
S
 
G
Q
 
I
L
 
L
R
 
K
Q
 
L
P
 
K
D
 
G
A
 
L
P
 
D
A
 
L
Q
 
L
V
 
K
H
 
L
L
 
G
Q
 
K
C
 
F
A
 
A
A
 
N
A
 
L
G
 
V
A
|
A
A
 
A
I
 
L
A
 
S
A
 
T
S
 
Q
K
 
K
A
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
W
A
 
S
A
 
T

3ih0A Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with amp-pnp
26% identity, 93% coverage: 10:288/301 of query aligns to 6:286/304 of 3ih0A

query
sites
3ih0A
F
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
T
 
I
D
 
D
F
 
L
I
 
I
R
 
S
Q
 
V
P
 
E
D
 
E
E
 
G
Q
 
D
W
 
L
R
 
K
A
 
D
I
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
K
-
 
H
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
P
W
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
V
A
 
G
A
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
K
T
 
S
G
 
S
Y
 
L
A
 
I
G
 
S
S
 
K
V
 
V
S
 
G
T
 
N
D
 
D
V
 
P
F
 
F
G
 
G
A
 
E
E
 
Y
L
 
L
Y
 
I
A
 
E
L
 
E
T
 
L
Q
 
S
A
 
K
A
 
E
G
 
N
L
 
V
D
 
D
M
 
T
R
 
R
-
 
G
F
 
I
T
 
V
Q
 
K
Q
 
D
Y
 
E
A
 
K
K
 
K
A
 
H
P
 
T
L
 
G
L
 
I
A
 
V
M
 
F
V
 
V
T
 
Q
S
 
L
T
 
K
T
 
G
P
 
A
P
 
S
D
 
P
Y
 
S
F
 
F
F
 
L
I
 
L
G
 
Y
D
 
D
D
 
D
S
 
V
A
 
A
D
 
Y
L
 
F
H
 
N
F
 
M
D
 
T
P
 
L
Q
 
N
R
 
D
L
 
I
P
 
N
A
 
W
G
 
D
W
 
I
L
 
V
D
 
E
D
 
E
A
 
A
Q
 
K
V
 
I
L
 
V
H
 
N
F
 
F
G
 
G
C
 
S
I
 
V
S
 
I
L
 
L
T
 
A
R
 
R
E
 
N
P
 
P
L
 
S
A
 
R
S
 
E
R
 
T
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
I
 
V
A
 
I
Q
 
K
E
 
K
A
 
I
A
 
-
R
 
K
R
 
G
N
 
S
K
 
S
K
 
L
I
 
I
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
W
 
L
R
 
R
-
 
L
-
 
D
-
 
L
-
 
W
K
 
R
L
 
G
M
 
Q
D
 
E
S
 
E
P
 
E
S
 
M
Y
 
I
R
 
K
L
 
V
L
 
L
F
 
-
Q
 
E
Q
 
E
L
 
S
L
 
I
S
 
K
L
 
L
S
 
A
H
 
D
Y
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
A
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
V
E
 
L
R
 
Y
L
 
L
F
 
E
P
 
N
G
 
-
D
 
-
T
 
-
N
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
Q
 
Q
S
 
G
L
 
V
A
 
E
P
 
V
Q
 
K
A
 
G
E
 
S
I
 
M
L
 
L
-
 
T
-
 
A
Y
 
I
T
|
T
L
 
L
G
|
G
A
 
P
K
 
K
G
 
G
M
 
F
Q
 
R
W
 
L
I
 
I
K
 
K
G
 
N
E
 
E
Q
 
T
V
 
V
I
 
V
D
 
D
Q
 
V
P
 
P
A
 
S
Y
 
Y
R
 
N
V
|
V
E
 
N
V
 
P
I
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
S
 
F
M
 
M
G
 
A
G
 
A
W
 
L
I
 
L
A
 
V
S
 
G
Q
 
I
L
 
L
R
 
K
Q
 
L
P
 
K
D
 
G
A
 
L
P
 
D
A
 
L
Q
 
L
V
 
K
H
 
L
L
 
G
Q
 
K
C
 
F
A
 
A
A
 
N
A
 
L
G
 
V
A
|
A
A
 
A
I
 
L
A
 
S
A
 
T
S
 
Q
K
 
K
A
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
W
A
 
S

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
29% identity, 84% coverage: 9:260/301 of query aligns to 9:264/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
V
 
V
F
 
I
G
 
G
E
 
D
A
 
A
L
 
S
T
 
V
D
|
D
F
 
L
I
 
V
R
 
P
Q
 
E
P
 
K
D
 
Q
E
 
N
Q
 
S
W
 
Y
R
 
L
A
 
K
I
 
C
P
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
C
 
S
W
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
R
 
V
A
 
C
A
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
G
P
 
E
T
 
C
G
 
G
Y
 
F
A
 
I
G
 
G
S
 
C
V
 
L
S
 
G
T
 
D
D
 
D
V
 
D
F
 
A
G
 
G
A
 
R
E
 
F
L
 
L
Y
 
R
A
 
Q
L
 
V
T
 
F
Q
 
Q
A
 
D
A
 
N
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
V
R
 
T
F
 
F
T
 
L
Q
 
R
-
 
L
-
 
D
-
 
A
Q
 
D
Y
 
L
A
 
T
K
 
S
A
 
A
P
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
V
M
 
N
V
 
L
T
 
T
S
 
A
T
 
D
T
 
G
P
 
E
P
 
R
D
 
S
Y
 
F
F
 
T
F
x
Y
I
 
L
G
 
V
D
 
H
D
 
P
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
T
H
 
Y
F
 
V
D
 
S
P
 
P
Q
 
Q
R
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
P
G
 
-
W
 
-
L
 
F
D
 
R
D
 
Q
A
 
Y
Q
 
E
V
 
W
L
 
F
H
 
Y
F
 
F
G
 
S
C
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
D
E
 
R
P
 
P
L
 
A
A
 
R
S
 
E
R
 
A
L
 
C
L
 
L
Q
 
E
I
 
G
A
 
A
Q
 
R
E
 
R
A
 
M
A
 
R
R
 
E
R
 
A
N
 
G
K
 
G
K
 
Y
I
 
V
A
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
W
 
L
R
|
R
K
 
S
L
 
K
M
 
M
-
 
W
-
 
G
D
 
N
S
 
T
P
 
D
S
 
E
Y
 
I
R
 
P
L
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
A
Q
 
R
L
 
S
L
x
A
S
x
A
L
 
L
S
x
A
H
 
S
Y
 
I
V
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
E
 
C
R
 
Q
L
 
L
F
 
S
P
 
G
G
 
A
D
 
S
-
 
H
-
 
W
T
 
Q
N
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
Y
T
 
Y
L
 
L
Q
 
R
S
 
D
L
 
L
A
x
G
P
 
C
Q
 
D
A
 
T
E
 
T
I
 
I
L
 
I
Y
 
-
T
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
M
 
A
Q
 
L
W
 
L
I
 
I
K
 
T
G
 
A
E
 
E
Q
 
G
V
 
E
I
 
F
D
 
H
Q
 
F
P
 
P
A
 
A
Y
 
P
R
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
I
 
V
D
|
D
T
 
T
V
x
T
G
 
G
C
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
S
 
F
M
 
V
G
 
G
G
 
G
W
 
L
I
 
L
A
 
F
S
 
T
Q
 
L
L
 
S
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1tz3A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase complexed with aminoimidazole riboside (see paper)
29% identity, 84% coverage: 9:260/301 of query aligns to 5:253/299 of 1tz3A

query
sites
1tz3A
V
 
V
F
 
I
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
x
S
T
 
V
D
|
D
F
 
L
I
 
V
R
 
P
Q
 
E
P
 
K
D
 
Q
E
 
N
Q
 
S
W
 
Y
R
 
L
A
 
K
I
x
C
P
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
C
 
S
W
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
R
 
V
A
 
C
A
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
G
P
 
E
T
 
C
G
 
G
Y
 
F
A
 
I
G
 
G
S
 
C
V
 
L
S
 
G
T
 
D
D
 
D
V
 
D
F
 
A
G
 
G
A
 
R
E
 
F
L
 
L
Y
 
R
A
 
Q
L
 
V
T
 
F
Q
 
Q
A
 
D
A
 
N
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
V
R
 
T
F
 
F
T
 
L
Q
 
R
Q
 
L
Y
 
D
A
 
A
K
 
D
A
 
L
P
 
T
L
 
S
L
 
A
A
 
V
M
x
L
V
 
I
T
 
V
S
 
N
T
 
S
T
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
Y
x
F
F
 
T
F
x
Y
I
 
L
G
 
V
D
 
H
D
 
P
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
T
H
 
Y
F
 
V
D
 
S
P
 
P
Q
 
Q
R
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
P
G
 
-
W
 
-
L
 
F
D
 
R
D
 
Q
A
 
Y
Q
 
E
V
 
W
L
 
F
H
 
Y
F
 
F
G
 
S
C
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
D
E
 
R
P
 
P
L
 
A
A
 
R
S
 
E
R
 
A
L
 
C
L
 
L
Q
 
E
I
 
G
A
 
A
Q
 
R
E
 
R
A
 
M
A
 
R
R
 
E
R
 
A
N
 
G
K
 
G
K
 
Y
I
 
V
A
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
V
N
 
N
W
 
L
R
|
R
K
 
S
L
 
K
M
|
M
-
 
W
-
 
G
D
 
N
S
 
T
P
 
D
S
 
E
Y
 
I
R
 
P
L
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
A
Q
 
R
L
 
S
L
 
A
S
 
A
L
 
L
S
 
A
H
 
S
Y
 
I
V
 
C
K
 
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
E
 
C
R
 
Q
L
 
L
F
 
S
P
 
G
G
 
A
D
 
S
-
 
H
-
 
W
T
 
Q
N
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
Y
T
 
Y
L
 
L
Q
 
R
S
 
D
L
 
L
A
 
G
P
 
C
Q
 
D
A
 
T
E
 
T
I
 
I
L
 
I
Y
 
-
T
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
M
 
A
Q
 
L
W
 
L
I
 
I
K
 
T
G
 
A
E
 
E
Q
 
G
V
 
E
I
 
F
D
 
H
Q
 
F
P
 
P
A
 
A
Y
 
P
R
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
S
 
F
M
 
V
G
 
G
G
 
G
W
 
L
I
 
L
A
 
F
S
 
T
Q
 
L
L
 
S
R
 
R

1tz6A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase from salmonella enterica complexed with aminoimidazole riboside and atp analog (see paper)
29% identity, 84% coverage: 9:260/301 of query aligns to 5:253/297 of 1tz6A

query
sites
1tz6A
V
 
V
F
 
I
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
S
T
 
V
D
|
D
F
 
L
I
 
V
R
 
P
Q
 
E
P
 
K
D
 
Q
E
 
N
Q
 
S
W
 
Y
R
 
L
A
 
K
I
x
C
P
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
C
 
S
W
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
R
 
V
A
 
C
A
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
G
P
 
E
T
 
C
G
 
G
Y
 
F
A
 
I
G
 
G
S
 
C
V
 
L
S
 
G
T
 
D
D
 
D
V
 
D
F
 
A
G
 
G
A
 
R
E
 
F
L
 
L
Y
 
R
A
 
Q
L
 
V
T
 
F
Q
 
Q
A
 
D
A
 
N
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
V
R
 
T
F
 
F
T
 
L
Q
 
R
Q
 
L
Y
 
D
A
 
A
K
 
D
A
 
L
P
 
T
L
 
S
L
 
A
A
 
V
M
 
L
V
 
I
T
 
V
S
 
N
T
 
S
T
 
-
P
 
-
P
 
-
D
 
-
Y
x
F
F
 
T
F
x
Y
I
 
L
G
 
V
D
 
H
D
 
P
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
T
H
 
Y
F
 
V
D
 
S
P
 
P
Q
 
Q
R
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
P
G
 
-
W
 
-
L
 
F
D
 
R
D
 
Q
A
 
Y
Q
 
E
V
 
W
L
 
F
H
 
Y
F
 
F
G
 
S
C
 
S
I
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
D
E
 
R
P
 
P
L
 
A
A
 
R
S
 
E
R
 
A
L
 
C
L
 
L
Q
 
E
I
 
G
A
 
A
Q
 
R
E
 
R
A
 
M
A
 
R
R
 
E
R
 
A
N
 
G
K
 
G
K
 
Y
I
 
V
A
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
V
N
|
N
W
 
L
R
|
R
K
 
S
L
 
K
M
|
M
-
 
W
-
 
G
D
 
N
S
 
T
P
 
D
S
 
E
Y
 
I
R
 
P
L
 
E
L
 
L
F
 
I
Q
 
A
Q
 
R
L
 
S
L
 
A
S
 
A
L
 
L
S
 
A
H
 
S
Y
 
I
V
 
C
K
|
K
V
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
x
E
L
 
L
E
 
C
R
 
Q
L
 
L
F
 
S
P
 
G
G
 
A
D
 
S
-
 
H
-
 
W
T
 
Q
N
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
Y
T
 
Y
L
 
L
Q
 
R
S
 
D
L
 
L
A
 
G
P
 
C
Q
 
D
A
 
T
E
 
T
I
 
I
L
 
I
Y
 
-
T
x
S
L
 
L
G
|
G
A
|
A
K
 
D
G
|
G
M
 
A
Q
 
L
W
 
L
I
 
I
K
 
T
G
 
A
E
 
E
Q
 
G
V
 
E
I
 
F
D
 
H
Q
 
F
P
 
P
A
 
A
Y
 
P
R
 
R
V
 
V
E
 
D
V
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
S
x
F
M
 
V
G
 
G
G
 
G
W
 
L
I
 
L
A
 
F
S
 
T
Q
 
L
L
 
S
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
31% identity, 88% coverage: 30:293/301 of query aligns to 33:295/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
E
W
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
K
T
 
V
G
 
G
Y
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
E
D
 
D
V
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
M
L
 
V
Y
 
E
A
 
E
L
 
R
T
 
L
Q
 
R
A
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
L
R
 
-
F
 
-
T
 
-
Q
 
T
Q
 
H
Y
 
F
A
 
R
K
 
R
A
 
A
P
 
P
-
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
G
M
 
L
V
 
Y
T
 
L
S
 
R
T
 
E
T
 
Y
P
 
L
P
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
D
 
R
Y
 
V
F
 
F
F
 
Y
I
 
Y
G
 
R
D
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
A
D
 
G
L
 
S
H
 
A
F
 
L
D
 
A
P
 
P
Q
 
G
R
 
A
L
 
F
P
 
D
A
 
P
G
 
D
W
 
Y
L
 
L
D
 
E
D
 
G
A
 
V
Q
 
R
V
 
F
L
 
L
H
 
H
F
 
L
G
 
S
C
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
P
T
 
A
R
 
L
E
 
S
P
 
P
L
 
E
A
 
A
S
 
R
R
 
A
L
 
F
-
 
S
L
 
L
Q
 
W
I
 
A
A
 
M
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
K
R
 
R
R
 
R
N
 
G
K
 
V
K
 
R
I
 
V
A
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
W
 
Y
R
 
R
K
 
Q
L
 
T
M
 
L
D
 
W
S
 
S
P
 
P
S
 
E
Y
 
E
-
 
A
R
 
R
L
 
G
L
 
F
F
 
L
Q
 
E
Q
 
R
L
 
A
L
 
L
S
 
P
L
 
G
S
 
V
H
 
D
Y
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
E
 
E
R
 
L
L
 
L
F
 
F
P
 
G
G
 
R
D
 
V
T
 
E
N
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
R
T
 
A
L
 
L
Q
 
S
S
 
-
L
 
-
A
 
A
P
 
P
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
I
 
V
L
 
V
Y
 
L
T
x
K
L
 
R
G
|
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
M
 
A
-
 
W
Q
 
A
W
 
F
I
 
V
K
 
D
G
 
G
E
 
R
Q
 
R
V
 
V
I
 
-
D
 
E
Q
 
G
P
 
S
A
|
A
Y
x
F
R
 
A
V
|
V
E
 
E
V
 
A
I
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
S
 
F
M
 
A
G
 
A
G
 
G
W
 
Y
I
 
L
A
 
A
S
 
G
Q
 
A
L
 
V
R
 
W
Q
 
-
P
 
-
D
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
V
Q
 
E
V
 
E
H
 
R
L
 
L
Q
 
R
C
 
L
A
 
A
A
x
N
-
 
L
A
 
L
G
 
G
A
|
A
A
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
R
A
 
G
G
 
D
A
 
H
Y
 
E
A
 
G
A
 
A
T
 
P
W
 
Y
D
 
R
E
 
E

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
31% identity, 88% coverage: 30:293/301 of query aligns to 33:295/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
G
 
G
G
|
G
A
|
A
C
x
E
W
x
V
N
|
N
V
 
V
A
 
A
R
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
K
T
 
V
G
 
G
Y
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
E
D
 
D
V
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
M
L
 
V
Y
 
E
A
 
E
L
 
R
T
 
L
Q
 
R
A
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
L
R
 
-
F
 
-
T
 
-
Q
 
T
Q
 
H
Y
 
F
A
 
R
K
 
R
A
 
A
P
 
P
-
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
G
M
 
L
V
 
Y
T
 
L
S
 
R
T
 
E
T
 
Y
P
 
L
P
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
D
 
R
Y
 
V
F
 
F
F
x
Y
I
x
Y
G
x
R
D
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
A
D
 
G
L
 
S
H
 
A
F
 
L
D
 
A
P
 
P
Q
 
G
R
 
A
L
 
F
P
 
D
A
 
P
G
 
D
W
 
Y
L
 
L
D
 
E
D
 
G
A
 
V
Q
 
R
V
 
F
L
 
L
H
 
H
F
 
L
G
 
S
C
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
P
T
 
A
R
 
L
E
 
S
P
 
P
L
 
E
A
 
A
S
 
R
R
 
A
L
 
F
-
 
S
L
 
L
Q
 
W
I
 
A
A
 
M
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
K
R
 
R
R
 
R
N
 
G
K
 
V
K
 
R
I
 
V
A
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
W
 
Y
R
|
R
K
 
Q
L
 
T
M
 
L
D
 
W
S
 
S
P
 
P
S
 
E
Y
 
E
-
 
A
R
 
R
L
 
G
L
 
F
F
 
L
Q
 
E
Q
 
R
L
 
A
L
 
L
S
 
P
L
 
G
S
 
V
H
 
D
Y
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
|
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
E
 
E
R
 
L
L
 
L
F
 
F
P
 
G
G
 
R
D
 
V
T
 
E
N
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
R
T
 
A
L
 
L
Q
 
S
S
 
-
L
 
-
A
 
A
P
 
P
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
I
 
V
L
 
V
Y
 
L
T
x
K
L
x
R
G
|
G
A
|
A
K
|
K
G
|
G
M
x
A
-
 
W
Q
 
A
W
 
F
I
 
V
K
 
D
G
 
G
E
 
R
Q
 
R
V
 
V
I
 
-
D
 
E
Q
 
G
P
 
S
A
 
A
Y
 
F
R
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
A
I
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
S
 
F
M
 
A
G
 
A
G
 
G
W
 
Y
I
 
L
A
 
A
S
 
G
Q
 
A
L
 
V
R
 
W
Q
 
-
P
 
-
D
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
V
Q
 
E
V
 
E
H
 
R
L
 
L
Q
 
R
C
 
L
A
 
A
A
x
N
-
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
R
A
 
G
G
x
D
A
 
H
Y
 
E
A
 
G
A
 
A
T
 
P
W
 
Y
D
 
R
E
 
E

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
31% identity, 88% coverage: 30:293/301 of query aligns to 33:295/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
G
 
G
G
|
G
A
|
A
C
 
E
W
 
V
N
|
N
V
 
V
A
 
A
R
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
K
T
 
V
G
 
G
Y
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
E
D
 
D
V
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
M
L
 
V
Y
 
E
A
 
E
L
 
R
T
 
L
Q
 
R
A
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
L
R
 
-
F
 
-
T
 
-
Q
 
T
Q
 
H
Y
 
F
A
 
R
K
 
R
A
 
A
P
 
P
-
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
G
M
 
L
V
x
Y
T
 
L
S
 
R
T
 
E
T
 
Y
P
 
L
P
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
D
 
R
Y
 
V
F
 
F
F
 
Y
I
 
Y
G
x
R
D
 
K
D
 
G
S
 
S
A
 
A
D
 
G
L
 
S
H
 
A
F
 
L
D
 
A
P
 
P
Q
 
G
R
 
A
L
 
F
P
 
D
A
 
P
G
 
D
W
 
Y
L
 
L
D
 
E
D
 
G
A
 
V
Q
 
R
V
 
F
L
 
L
H
 
H
F
 
L
G
 
S
C
 
G
I
 
I
S
 
T
L
 
P
T
 
A
R
 
L
E
 
S
P
 
P
L
 
E
A
 
A
S
 
R
R
 
A
L
 
F
-
 
S
L
 
L
Q
 
W
I
 
A
A
 
M
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
K
R
 
R
R
 
R
N
 
G
K
 
V
K
 
R
I
 
V
A
 
S
F
 
L
D
 
D
P
 
V
N
 
N
W
 
Y
R
|
R
K
 
Q
L
 
T
M
 
L
D
 
W
S
 
S
P
 
P
S
 
E
Y
 
E
-
 
A
R
 
R
L
 
G
L
 
F
F
 
L
Q
 
E
Q
 
R
L
 
A
L
 
L
S
 
P
L
 
G
S
 
V
H
 
D
Y
 
L
V
 
L
K
 
F
V
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
E
 
E
R
 
L
L
 
L
F
 
F
P
 
G
G
 
R
D
 
V
T
 
E
N
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
R
T
 
A
L
 
L
Q
 
S
S
 
-
L
 
-
A
 
A
P
 
P
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
I
 
V
L
 
V
Y
 
L
T
x
K
L
 
R
G
|
G
A
|
A
K
 
K
G
 
G
M
 
A
-
 
W
Q
 
A
W
 
F
I
 
V
K
 
D
G
 
G
E
 
R
Q
 
R
V
 
V
I
 
-
D
 
E
Q
 
G
P
 
S
A
 
A
Y
 
F
R
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
A
I
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
S
 
F
M
 
A
G
 
A
G
 
G
W
 
Y
I
 
L
A
 
A
S
 
G
Q
 
A
L
 
V
R
 
W
Q
 
-
P
 
-
D
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
V
Q
 
E
V
 
E
H
 
R
L
 
L
Q
 
R
C
 
L
A
 
A
A
x
N
-
 
L
A
 
L
G
 
G
A
|
A
A
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
R
A
 
G
G
x
D
A
 
H
Y
 
E
A
 
G
A
 
A
T
 
P
W
 
Y
D
 
R
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3lkiB Crystal structure of fructokinase with bound atp from xylella fastidiosa
30% identity, 97% coverage: 8:298/301 of query aligns to 6:317/322 of 3lkiB

query
sites
3lkiB
V
 
L
V
 
C
F
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
I
D
 
D
F
 
M
I
 
L
R
 
A
Q
 
Q
P
 
P
-
 
L
D
 
P
E
 
R
Q
 
A
W
 
F
R
 
L
A
 
Q
I
 
C
P
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
P
W
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
G
P
 
A
T
 
V
G
 
Q
Y
 
F
A
 
V
G
 
G
S
 
M
V
 
L
S
 
G
T
 
S
D
 
D
V
 
M
F
 
F
G
 
G
A
 
D
E
 
F
L
 
L
Y
 
F
A
 
D
L
 
S
T
 
F
Q
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
-
 
V
-
 
T
D
 
D
M
 
G
R
 
I
F
 
V
T
 
R
Q
 
T
Q
 
S
Y
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
T
P
 
A
L
 
-
L
 
L
A
 
A
M
 
F
V
 
V
T
 
A
S
 
L
T
 
D
T
 
G
P
 
E
P
 
R
D
 
S
Y
 
F
F
 
S
F
 
F
I
 
Y
G
 
R
D
 
P
D
 
P
S
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
L
H
 
L
F
 
F
D
 
R
P
 
V
Q
 
E
R
 
H
L
 
F
P
 
Q
A
 
D
G
 
A
W
 
S
L
 
F
D
 
S
D
 
D
A
 
A
Q
 
L
V
 
I
L
 
F
H
 
H
F
 
A
G
 
C
C
 
S
I
 
N
S
 
S
L
 
M
T
 
T
R
 
D
E
 
A
P
 
D
L
 
I
A
 
A
S
 
E
R
 
V
L
 
T
L
 
F
Q
 
E
I
 
G
A
 
M
Q
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
Q
R
 
A
R
 
A
N
 
G
K
 
A
K
 
I
I
 
V
A
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
L
N
 
N
W
 
F
R
 
R
K
 
P
L
 
M
M
 
L
-
 
W
-
 
P
-
 
N
-
 
G
D
 
E
S
 
N
P
 
P
S
 
A
Y
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
W
F
 
-
Q
 
-
Q
 
K
L
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
L
S
 
A
H
 
D
Y
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
L
S
 
S
D
 
S
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
D
R
 
Y
L
 
L
-
 
A
-
 
N
-
 
T
F
 
L
P
 
A
G
 
A
D
 
D
T
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
-
T
 
-
L
 
I
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
L
-
 
W
A
 
Q
P
 
G
Q
 
R
A
 
A
E
 
Q
I
 
L
L
 
L
Y
 
L
T
 
V
L
x
T
G
x
D
A
 
A
K
 
A
G
 
G
-
 
P
M
 
V
Q
 
H
W
 
W
I
 
Y
K
 
T
G
 
R
E
 
T
Q
 
A
V
 
G
I
 
G
D
 
E
Q
 
V
P
 
P
A
x
T
Y
 
F
R
 
R
V
 
V
E
 
Q
V
 
V
I
 
Q
D
 
D
T
 
S
V
 
N
G
x
A
C
x
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
S
x
F
M
 
V
G
 
G
G
 
G
W
 
M
I
 
L
A
 
Y
S
 
T
Q
 
F
L
 
A
R
 
Q
Q
 
Q
P
 
F
D
 
D
A
 
D
P
 
A
A
 
A
Q
 
A
V
 
L
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
C
-
 
H
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
S
-
 
I
-
 
V
-
 
S
H
 
T
L
 
L
Q
 
R
C
 
F
A
 
A
A
|
A
A
 
A
G
 
V
A
 
G
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
V
S
 
T
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
A
 
A
-
 
M
-
 
P
T
 
M
W
 
L
D
 
S
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
A
 
S
L
 
L
I
 
I

3iq0B Crystal structure of a putative ribokinase ii in complex with atp and mg+2 from e.Coli
26% identity, 93% coverage: 12:290/301 of query aligns to 13:295/308 of 3iq0B

query
sites
3iq0B
E
 
E
A
 
I
L
 
M
T
 
A
D
 
S
F
 
K
I
 
I
R
 
G
Q
 
Q
P
 
P
D
 
F
E
 
D
Q
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
I
W
 
W
R
 
N
A
 
G
-
 
P
I
 
Y
P
 
P
G
 
S
G
 
G
A
 
A
C
 
P
W
 
A
N
 
I
V
 
F
A
 
I
R
 
D
A
 
Q
A
 
V
A
 
T
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
T
 
C
G
 
G
Y
 
I
A
 
I
G
 
S
S
 
C
V
 
V
S
 
G
T
 
N
D
 
D
V
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
D
E
 
I
L
 
N
Y
 
I
A
 
H
L
 
R
T
 
L
Q
 
A
A
 
A
A
 
D
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
I
R
 
R
F
 
G
T
 
I
Q
 
S
Q
 
V
Y
 
L
A
 
P
K
 
L
A
 
E
P
 
A
L
 
T
L
 
G
A
 
S
M
 
A
V
 
F
T
 
V
S
 
T
T
 
Y
T
 
G
P
 
D
P
 
R
D
 
D
Y
 
F
F
 
I
F
 
F
I
 
N
G
 
I
D
 
K
D
 
N
S
 
A
A
 
A
D
 
C
L
 
G
H
 
K
F
 
L
D
 
S
P
 
A
Q
 
Q
R
 
H
L
 
V
P
 
D
A
 
E
G
 
N
W
 
I
L
 
L
D
 
K
D
 
D
A
 
C
Q
 
T
V
 
H
L
 
F
H
 
H
F
 
I
G
 
M
C
 
G
I
 
S
S
 
S
L
 
L
T
 
F
R
 
S
E
 
F
P
 
H
L
 
M
A
 
V
S
 
D
R
 
A
L
 
V
L
 
K
Q
 
K
I
 
A
A
 
V
Q
 
T
E
 
I
A
 
V
A
 
K
R
 
A
R
 
N
N
 
G
K
 
G
K
 
V
I
 
I
A
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
W
 
I
R
 
R
K
 
K
-
 
E
L
 
M
M
 
L
D
 
D
S
 
I
P
 
P
S
 
E
Y
 
M
R
 
R
L
 
D
L
 
A
F
 
L
Q
 
H
Q
 
F
L
 
V
L
 
L
S
 
E
L
 
L
S
 
T
H
 
D
Y
 
I
V
 
Y
K
 
M
V
 
P
S
|
S
D
 
E
E
 
G
D
 
E
L
 
V
E
 
L
R
 
L
L
 
L
F
 
S
P
 
P
G
 
H
D
 
S
T
 
T
N
 
P
A
 
E
L
 
R
A
 
A
T
 
I
L
 
A
Q
 
G
S
 
F
L
 
L
A
 
E
P
 
E
Q
 
G
A
 
V
-
 
K
E
 
E
I
 
V
L
 
I
Y
 
V
T
x
K
L
 
R
G
|
G
A
 
N
K
 
Q
G
 
G
M
 
A
Q
 
S
W
 
Y
I
 
Y
K
 
S
G
 
A
E
 
N
Q
 
E
V
 
Q
I
 
F
D
 
H
Q
 
V
P
 
E
A
 
S
Y
 
Y
R
 
P
V
 
V
E
 
E
V
x
E
I
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
T
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
A
 
C
S
x
F
M
 
G
G
 
G
G
 
A
W
 
W
I
 
I
A
 
A
S
 
C
Q
 
-
L
 
-
R
 
R
Q
 
Q
P
 
L
D
 
G
A
 
F
P
 
D
A
 
A
Q
 
H
V
 
R
H
 
A
L
 
L
Q
 
Q
C
 
Y
A
 
A
A
x
N
A
 
A
G
 
C
A
x
G
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
V
S
 
T
K
 
R
A
 
R
G
 
G
A
 
P
Y
 
M
A
 
E
A
 
G
T
 
T

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
27% identity, 81% coverage: 11:255/301 of query aligns to 8:256/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
V
T
 
V
D
|
D
F
 
L
I
 
I
R
 
P
Q
 
D
P
 
G
D
 
Q
E
 
Q
Q
 
H
W
 
Y
R
 
L
A
 
K
I
 
C
P
 
P
G
 
G
G
|
G
A
|
A
C
 
P
W
 
A
N
|
N
V
 
V
A
 
A
R
 
V
A
 
A
A
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
V
 
G
P
 
R
T
 
S
G
 
A
Y
 
F
A
 
F
G
 
G
S
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
N
D
 
D
V
 
P
F
 
F
G
 
G
A
 
R
E
 
F
L
 
M
Y
 
Q
A
 
Q
L
 
T
T
 
L
Q
 
T
A
 
D
A
 
E
G
 
Q
L
 
V
D
 
D
-
 
C
-
 
Q
-
 
H
M
 
L
R
 
H
F
 
F
T
 
D
Q
 
P
Q
 
V
Y
 
H
A
 
R
K
 
T
A
 
S
P
 
T
L
 
V
L
 
V
A
 
V
M
 
D
V
 
L
T
 
D
S
 
E
T
x
H
T
 
G
P
 
E
P
 
R
D
 
S
Y
x
F
F
 
T
F
|
F
I
 
M
G
 
V
D
 
K
D
 
P
S
 
S
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
H
 
F
F
 
L
D
 
Q
P
 
L
Q
 
S
R
 
D
L
 
I
P
 
P
A
 
S
G
 
-
W
 
-
L
 
F
D
 
Q
D
 
K
A
 
G
Q
 
E
V
 
W
L
 
L
H
 
H
F
 
V
G
 
C
C
 
S
I
 
I
S
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
N
E
 
Q
P
 
P
L
 
S
A
 
R
S
 
S
R
 
S
L
 
T
L
 
F
Q
 
A
I
 
A
A
 
I
Q
 
A
E
 
Q
A
 
M
A
 
K
R
 
E
R
 
V
N
 
G
K
 
G
K
 
Y
I
 
V
A
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
W
 
L
R
|
R
K
 
E
L
 
E
M
 
V
D
 
W
S
 
S
P
 
E
S
 
P
Y
 
Q
R
 
E
L
 
L
-
 
Q
-
 
A
L
 
T
F
 
V
Q
 
M
Q
 
R
L
 
A
L
 
V
S
 
G
L
 
L
S
 
A
H
 
D
Y
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
Q
R
 
F
L
 
L
F
 
-
P
 
T
G
 
G
D
 
T
T
 
Q
N
 
S
A
 
I
L
 
E
A
 
E
T
 
G
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
L
 
I
A
 
A
-
 
D
-
 
F
P
 
Q
Q
 
I
A
 
P
E
 
L
I
 
V
L
 
V
Y
 
V
T
|
T
L
 
L
G
|
G
A
|
A
K
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
L
M
 
V
Q
 
A
W
 
T
I
 
P
K
 
N
G
 
S
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
I
I
 
V
D
 
S
Q
 
G
P
 
K
A
|
A
Y
 
-
R
 
-
V
|
V
E
 
K
V
 
P
I
 
I
D
 
D
T
|
T
V
 
T
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
S
x
F
M
 
V
G
 
G
G
 
G
W
 
L
I
 
L

Sites not aligning to the query:

5yggA Crystal structure of fructokinase double-mutant (t261c-h108c) from vibrio cholerae o395 in fructose, adp and potassium ion bound form (see paper)
27% identity, 81% coverage: 11:255/301 of query aligns to 12:260/310 of 5yggA

query
sites
5yggA
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
V
T
 
V
D
|
D
F
 
L
I
 
I
R
 
P
Q
 
D
P
 
G
D
 
Q
E
 
Q
Q
 
H
W
 
Y
R
 
L
A
 
K
I
 
C
P
 
P
G
 
G
G
|
G
A
|
A
C
 
P
W
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
V
A
 
A
A
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
S
V
 
G
P
 
R
T
 
S
G
 
A
Y
 
F
A
 
F
G
 
G
S
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
N
D
 
D
V
 
P
F
 
F
G
 
G
A
 
R
E
 
F
L
 
M
Y
 
Q
A
 
Q
L
 
T
T
 
L
Q
 
T
A
 
D
A
 
E
G
 
Q
L
 
V
D
 
D
-
 
C
-
 
Q
-
 
H
M
 
L
R
 
H
F
 
F
T
 
D
Q
 
P
Q
 
V
Y
 
H
A
 
R
K
 
T
A
 
S
P
 
T
L
 
V
L
 
V
A
 
V
M
 
D
V
 
L
T
 
D
S
 
E
T
 
C
T
 
G
P
 
E
P
 
R
D
 
S
Y
x
F
F
 
T
F
|
F
I
 
M
G
 
V
D
 
K
D
 
P
S
 
S
A
 
A
D
 
D
L
 
Q
H
 
F
F
 
L
D
 
Q
P
 
L
Q
 
S
R
 
D
L
 
I
P
 
P
A
 
S
G
 
-
W
 
-
L
 
F
D
 
Q
D
 
K
A
 
G
Q
 
E
V
 
W
L
 
L
H
 
H
F
 
V
G
 
C
C
 
S
I
 
I
S
 
A
L
 
L
T
 
A
R
 
N
E
 
Q
P
 
P
L
 
S
A
 
R
S
 
S
R
 
S
L
 
T
L
 
F
Q
 
A
I
 
A
A
 
I
Q
 
A
E
 
Q
A
 
M
A
 
K
R
 
E
R
 
V
N
 
G
K
 
G
K
 
Y
I
 
V
A
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
W
 
L
R
|
R
K
 
E
L
 
E
M
 
V
D
 
W
S
 
S
P
 
E
S
 
P
Y
 
Q
R
 
E
L
 
L
-
 
Q
-
 
A
L
 
T
F
 
V
Q
 
M
Q
 
R
L
 
A
L
 
V
S
 
G
L
 
L
S
 
A
H
 
D
Y
 
V
V
 
V
K
|
K
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
Q
R
 
F
L
 
L
F
 
-
P
 
T
G
 
G
D
 
T
T
 
Q
N
 
S
A
 
I
L
 
E
A
 
E
T
 
G
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
L
 
I
A
 
A
-
 
D
-
 
F
P
 
Q
Q
 
I
A
 
P
E
 
L
I
 
V
L
 
V
Y
 
V
T
|
T
L
 
L
G
|
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
L
M
 
V
Q
 
A
W
 
T
I
 
P
K
 
N
G
 
S
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
I
I
 
V
D
 
S
Q
 
G
P
 
K
A
|
A
Y
 
-
R
 
-
V
|
V
E
 
K
V
 
P
I
 
I
D
 
D
T
 
C
V
 
T
G
 
G
C
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
S
x
F
M
 
V
G
 
G
G
 
G
W
 
L
I
 
L

Sites not aligning to the query:

7fcaD Pfkb(mycobacterium marinum) (see paper)
28% identity, 93% coverage: 8:286/301 of query aligns to 5:282/282 of 7fcaD

query
sites
7fcaD
V
 
L
V
 
V
F
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
I
D
 
D
F
 
I
I
 
V
R
 
D
Q
 
G
P
 
P
D
 
D
E
 
P
Q
 
A
W
 
E
R
 
Y
A
 
V
I
 
-
P
 
-
G
 
G
G
 
G
A
 
S
C
 
P
W
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
V
A
 
G
A
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
R
P
 
D
T
 
V
G
 
D
Y
 
L
A
 
L
G
 
T
S
 
H
V
 
I
S
 
G
T
x
R
D
 
D
V
 
A
F
 
R
G
 
G
A
 
R
E
 
R
L
 
I
Y
 
A
A
 
E
L
 
Y
T
 
I
Q
 
E
A
 
S
A
 
S
G
 
G
L
 
V
D
 
Q
M
 
L
R
 
V
F
x
S
T
x
G
Q
 
S
Q
 
Q
Y
 
T
A
 
A
K
 
D
A
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
R
V
 
T
T
 
P
S
 
T
T
 
A
T
 
T
P
 
A
P
 
R
D
 
T
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
I
 
-
G
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
D
L
 
L
H
 
E
F
 
W
D
 
Q
P
 
I
Q
 
P
R
 
D
L
 
T
P
 
P
A
 
P
G
 
-
W
 
-
L
 
V
D
 
A
D
 
P
A
 
P
Q
 
L
V
 
L
L
 
V
H
 
H
F
 
T
G
 
G
C
 
S
I
 
I
S
 
A
L
 
A
T
 
A
R
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
G
L
 
C
L
 
L
Q
 
A
I
 
V
A
 
A
Q
 
A
-
 
L
-
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
Y
R
 
R
R
 
A
N
 
A
K
 
A
K
 
T
I
 
V
A
 
S
F
 
F
D
 
D
P
 
P
N
 
N
W
 
V
R
 
R
K
 
P
L
 
S
M
 
L
-
 
S
-
 
A
D
 
D
S
 
P
P
 
D
S
 
L
Y
 
T
R
 
R
L
 
R
L
 
R
F
 
I
Q
 
Q
Q
 
R
L
 
L
L
 
V
S
 
E
L
 
R
S
 
S
H
 
D
Y
 
I
V
 
I
K
 
K
V
 
A
S
 
S
D
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
L
E
 
H
R
 
W
L
 
I
F
 
D
P
 
P
G
 
T
D
 
Q
T
 
P
N
 
P
A
 
E
L
 
Q
A
 
T
T
 
A
L
 
R
Q
 
A
S
 
W
L
 
L
A
 
A
P
 
C
Q
 
G
A
 
P
E
 
A
I
 
I
L
 
V
-
 
A
Y
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
D
K
 
Q
G
 
G
M
 
A
Q
 
V
W
 
A
I
 
F
K
 
C
G
 
A
E
 
A
Q
 
G
V
 
P
I
 
A
D
 
S
Q
 
V
P
 
P
A
 
A
Y
 
Q
R
 
-
V
 
-
E
 
P
V
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
G
C
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
S
 
F
M
 
M
G
 
A
G
 
G
W
 
L
I
 
L
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
W
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
R
A
 
R
S
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
P
 
I
D
 
G
A
 
V
P
 
S
A
 
A
Q
 
L
V
 
T
H
 
S
-
 
A
L
 
L
Q
 
E
C
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
T
A
 
V
S
 
A
K
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A

7aghA Crystal structure of sf kinase yihv from e. Coli in complex with amppnp-mg (see paper)
25% identity, 89% coverage: 24:292/301 of query aligns to 32:284/295 of 7aghA

query
sites
7aghA
Q
 
N
W
 
Y
R
 
T
A
 
E
I
 
V
P
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
P
C
 
A
W
 
A
N
 
T
V
 
A
A
 
A
R
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
Q
T
 
V
G
 
D
Y
 
F
A
 
I
G
 
G
S
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
D
D
 
D
V
 
D
F
 
T
G
 
G
A
 
N
E
 
S
L
 
L
Y
 
L
A
 
A
L
 
E
T
 
L
Q
 
E
A
 
S
A
 
W
G
 
G
L
 
V
D
 
N
M
 
T
R
 
R
F
 
Y
T
 
T
Q
 
K
Q
 
R
Y
 
Y
A
 
N
K
 
Q
A
 
A
P
 
K
L
 
S
L
 
S
-
 
Q
A
 
S
M
 
A
V
 
I
T
 
M
S
 
V
T
 
D
T
 
T
P
 
K
P
 
G
D
 
E
Y
x
R
F
 
I
F
 
I
I
 
I
G
 
N
D
 
Y
D
 
P
S
 
S
A
 
P
D
 
D
L
 
L
H
 
L
F
 
P
D
 
D
P
 
A
Q
 
E
R
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
W
L
 
L
D
 
E
D
 
E
A
 
I
Q
 
D
V
 
F
L
 
S
H
 
Q
F
 
W
G
 
D
C
 
V
I
 
V
S
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
A
Q
 
D
I
 
V
A
 
R
-
 
W
Q
 
H
E
 
D
A
 
G
A
 
A
R
 
K
R
 
K
N
 
A
K
 
F
K
 
T
I
 
L
A
 
A
F
 
R
D
 
Q
P
 
A
N
 
G
W
 
V
R
 
M
K
 
T
L
 
V
M
 
L
D
 
D
S
 
G
P
 
D
S
 
I
Y
 
T
R
 
P
L
 
Q
L
 
D
F
 
I
Q
 
S
Q
 
E
L
 
L
L
 
V
S
 
A
L
 
L
S
 
S
H
 
D
Y
 
H
V
 
A
K
 
A
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
P
D
 
G
L
 
L
E
 
A
R
 
R
L
 
L
-
 
T
-
 
G
F
 
V
P
 
K
G
 
E
D
 
M
T
 
A
N
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
K
T
 
Q
L
 
A
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
A
 
T
P
 
-
Q
 
N
A
 
G
E
 
H
I
 
V
L
 
Y
Y
 
V
T
|
T
L
 
Q
G
|
G
A
 
S
K
 
A
G
|
G
M
 
C
Q
 
D
W
 
W
I
 
L
K
 
E
G
 
G
E
 
R
Q
 
Q
V
 
-
I
 
-
D
 
H
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
R
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
C
x
A
G
|
G
D
 
D
A
 
V
S
 
F
M
 
H
G
 
G
G
 
A
W
 
L
I
 
A
A
 
V
S
 
A
Q
 
L
L
 
A
R
 
T
Q
 
S
P
 
G
D
 
D
A
 
L
P
 
A
A
 
E
Q
 
S
V
 
V
H
 
R
L
 
F
Q
 
-
C
 
-
A
 
A
A
x
S
A
 
G
G
 
V
A
|
A
A
 
A
I
 
L
A
 
K
A
 
C
S
 
T
K
 
R
A
 
P
G
 
G
A
 
G
Y
 
R
A
 
A
A
 
G
T
 
I
W
 
P
D
 
D

8cqxA Ribokinase from t.Sp mutant a92g
27% identity, 92% coverage: 23:298/301 of query aligns to 29:298/300 of 8cqxA

query
sites
8cqxA
E
 
E
Q
 
D
W
 
Y
R
 
Q
A
 
T
I
 
H
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
K
C
 
G
W
 
A
N
 
N
V
 
Q
A
 
A
R
 
V
A
 
A
A
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
G
P
 
K
T
 
V
G
 
R
Y
 
M
A
 
L
G
 
G
S
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
E
D
 
D
V
 
P
F
 
F
G
 
G
A
 
Q
E
 
A
L
 
L
Y
 
K
A
 
S
L
 
G
T
 
L
Q
 
A
A
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
V
R
 
A
F
 
W
T
 
-
Q
 
-
Q
 
-
Y
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
V
V
 
L
T
 
E
S
 
T
T
 
P
T
 
G
P
 
P
P
 
S
D
 
G
Y
 
T
F
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
L
D
 
V
D
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
-
 
N
-
 
Q
-
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
P
S
 
G
A
 
A
D
 
N
L
 
A
H
 
R
F
 
L
D
 
V
P
 
P
Q
 
E
R
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
A
G
 
T
W
 
A
L
 
F
D
 
Q
D
 
G
A
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
H
 
-
F
 
V
G
 
G
C
 
V
I
 
V
S
 
L
L
 
L
T
 
Q
R
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
L
Q
 
E
I
 
I
A
 
P
Q
 
L
E
 
E
A
 
T
A
 
V
R
 
V
R
 
R
N
 
A
K
 
A
K
 
A
I
 
L
A
 
G
F
 
R
D
 
K
P
 
A
N
 
G
W
 
A
R
 
R
K
 
I
L
 
L
M
 
L
D
 
N
S
 
A
P
 
A
S
 
P
Y
 
A
R
 
H
L
 
A
L
 
L
F
 
P
Q
 
S
Q
 
E
L
 
I
L
 
L
S
 
Q
L
 
S
S
 
V
H
 
D
Y
 
L
V
 
L
K
 
L
V
 
V
S
x
N
D
 
E
E
 
V
D
 
E
L
 
A
E
 
A
R
 
Q
L
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
P
-
 
P
-
 
R
F
 
T
P
 
P
G
 
E
D
 
E
T
 
A
N
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
R
-
 
Q
L
 
L
Q
 
R
S
 
G
L
 
R
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
E
 
Q
I
 
V
L
 
V
Y
 
L
T
|
T
L
 
L
G
|
G
A
|
A
K
 
Q
G
|
G
M
 
A
Q
 
V
W
 
W
I
 
-
K
 
S
G
 
G
E
 
T
Q
 
E
V
 
E
I
 
S
D
 
H
Q
 
F
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
R
 
P
V
 
V
E
 
R
V
 
A
I
 
V
D
|
D
T
 
T
V
x
T
G
 
A
C
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
S
 
-
M
x
F
G
 
A
G
 
G
W
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
L
Q
 
G
L
 
L
R
 
A
Q
 
E
P
 
G
D
 
Q
A
 
N
P
 
-
A
 
M
Q
 
R
V
 
A
H
 
A
L
 
L
Q
 
R
C
 
F
A
 
A
A
x
N
A
 
A
G
 
A
A
x
G
A
|
A
I
 
L
A
|
A
A
x
T
S
 
T
K
 
R
A
 
P
G
 
G
A
 
A
Y
 
Q
A
 
P
A
x
S
T
 
L
-
 
P
-
 
F
W
 
R
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
L

7ag6A Crystal structure of sf kinase yihv from e. Coli in complex with sulfofructose (sf), adp-mg (see paper)
24% identity, 89% coverage: 24:292/301 of query aligns to 32:286/302 of 7ag6A

query
sites
7ag6A
Q
 
N
W
 
Y
R
 
T
A
 
E
I
 
V
P
 
G
G
 
G
G
|
G
A
x
P
C
 
A
W
 
A
N
 
T
V
 
A
A
 
A
R
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
Q
T
 
V
G
 
D
Y
 
F
A
 
I
G
 
G
S
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
D
D
 
D
V
 
D
F
 
T
G
 
G
A
 
N
E
 
S
L
 
L
Y
 
L
A
 
A
L
 
E
T
 
L
Q
 
E
A
 
S
A
 
W
G
 
G
L
 
V
D
 
N
M
 
T
R
 
R
F
 
Y
T
 
T
Q
 
K
Q
 
R
Y
 
Y
A
 
N
K
 
Q
A
 
A
P
 
K
L
 
S
L
 
S
-
 
Q
A
x
S
M
 
A
V
 
I
T
 
M
S
 
V
T
 
D
T
 
T
P
 
K
P
 
G
D
 
E
Y
 
R
F
 
I
F
 
I
I
 
I
G
x
N
D
 
Y
D
 
P
S
 
S
A
 
P
D
 
D
L
 
L
H
 
L
F
 
P
D
 
D
P
 
A
Q
 
E
R
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
W
L
 
L
D
 
E
D
 
E
A
 
I
Q
 
D
V
 
F
L
 
S
H
 
Q
F
 
W
G
 
D
C
 
V
I
 
V
S
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
A
Q
 
D
I
 
V
A
x
R
-
 
W
Q
 
H
E
 
D
A
 
G
A
 
A
R
 
K
R
 
K
N
 
A
K
 
F
K
 
T
I
 
L
A
 
A
F
 
R
D
 
Q
P
 
A
N
 
G
W
 
V
R
 
M
K
 
T
L
 
V
M
 
L
D
 
D
S
 
G
P
 
D
S
 
I
Y
 
T
R
 
P
L
 
Q
L
 
D
F
 
I
Q
 
S
Q
 
E
L
 
L
L
 
V
S
 
A
L
 
L
S
 
S
H
 
D
Y
 
H
V
 
A
K
 
A
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
P
D
 
G
L
 
L
E
 
A
R
 
R
L
 
L
-
 
T
-
 
G
F
 
V
P
 
K
G
 
E
D
 
M
T
 
A
N
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
K
T
 
Q
L
 
A
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
A
 
T
P
 
-
Q
 
N
A
 
G
E
 
H
I
 
V
L
 
Y
Y
 
V
T
|
T
L
 
Q
G
|
G
A
 
S
K
 
A
G
|
G
M
 
C
Q
 
D
W
 
W
I
 
L
K
 
E
G
 
N
E
 
G
Q
 
G
V
 
R
I
 
Q
D
 
H
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
R
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
 
G
C
x
A
G
|
G
D
|
D
A
 
V
S
 
F
M
 
H
G
 
G
G
 
A
W
 
L
I
 
A
A
 
V
S
 
A
Q
 
L
L
 
A
R
 
T
Q
 
S
P
 
G
D
 
D
A
 
L
P
 
A
A
 
E
Q
 
S
V
 
V
H
 
R
L
 
F
Q
 
-
C
 
-
A
 
A
A
x
S
A
 
G
G
 
V
A
|
A
A
 
A
I
 
L
A
 
K
A
x
C
S
 
T
K
 
R
A
 
P
G
 
G
A
 
G
Y
 
R
A
 
A
A
 
G
T
 
I
W
 
P
D
 
D

Sites not aligning to the query:

7agkA Crystal structure of e. Coli sf kinase (yihv) in complex with product sulfofructose phosphate (sfp) (see paper)
24% identity, 89% coverage: 24:292/301 of query aligns to 32:286/298 of 7agkA

query
sites
7agkA
Q
 
N
W
 
Y
R
 
T
A
 
E
I
 
V
P
 
G
G
 
G
G
|
G
A
x
P
C
 
A
W
 
A
N
 
T
V
 
A
A
 
A
R
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
Q
T
 
V
G
 
D
Y
 
F
A
 
I
G
 
G
S
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
D
D
 
D
V
 
D
F
 
T
G
 
G
A
 
N
E
 
S
L
 
L
Y
 
L
A
 
A
L
 
E
T
 
L
Q
 
E
A
 
S
A
 
W
G
 
G
L
 
V
D
 
N
M
 
T
R
 
R
F
 
Y
T
 
T
Q
 
K
Q
 
R
Y
 
Y
A
 
N
K
 
Q
A
 
A
P
 
K
L
 
S
L
 
S
-
 
Q
A
x
S
M
 
A
V
 
I
T
 
M
S
 
V
T
 
D
T
 
T
P
 
K
P
 
G
D
 
E
Y
 
R
F
 
I
F
 
I
I
 
I
G
x
N
D
 
Y
D
 
P
S
 
S
A
 
P
D
 
D
L
 
L
H
 
L
F
 
P
D
 
D
P
 
A
Q
 
E
R
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
W
L
 
L
D
 
E
D
 
E
A
 
I
Q
 
D
V
 
F
L
 
S
H
 
Q
F
 
W
G
 
D
C
 
V
I
 
V
S
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
A
Q
 
D
I
 
V
A
x
R
-
 
W
Q
 
H
E
 
D
A
 
G
A
 
A
R
 
K
R
 
K
N
 
A
K
 
F
K
 
T
I
 
L
A
 
A
F
 
R
D
 
Q
P
 
A
N
 
G
W
 
V
R
 
M
K
 
T
L
 
V
M
 
L
D
 
D
S
 
G
P
 
D
S
 
I
Y
 
T
R
 
P
L
 
Q
L
 
D
F
 
I
Q
 
S
Q
 
E
L
 
L
L
 
V
S
 
A
L
 
L
S
 
S
H
 
D
Y
 
H
V
 
A
K
 
A
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
P
D
 
G
L
 
L
E
 
A
R
 
R
L
 
L
-
 
T
-
 
G
F
 
V
P
 
K
G
 
E
D
 
M
T
 
A
N
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
K
T
 
Q
L
 
A
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
A
 
T
P
 
-
Q
 
N
A
 
G
E
 
H
I
 
V
L
 
Y
Y
 
V
T
 
T
L
 
Q
G
 
G
A
 
S
K
 
A
G
 
G
M
 
C
Q
 
D
W
 
W
I
 
L
K
 
E
G
 
N
E
 
G
Q
 
G
V
 
R
I
 
Q
D
 
H
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
R
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
 
G
C
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
V
S
 
F
M
 
H
G
 
G
G
 
A
W
 
L
I
 
A
A
 
V
S
 
A
Q
 
L
L
 
A
R
 
T
Q
 
S
P
 
G
D
 
D
A
 
L
P
 
A
A
 
E
Q
 
S
V
 
V
H
 
R
L
 
F
Q
 
-
C
 
-
A
 
A
A
 
S
A
 
G
G
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
K
A
 
C
S
 
T
K
 
R
A
 
P
G
 
G
A
 
G
Y
 
R
A
 
A
A
 
G
T
 
I
W
 
P
D
 
D

Sites not aligning to the query:

P32143 Sulfofructose kinase; SF kinase; EC 2.7.1.184 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
24% identity, 89% coverage: 24:292/301 of query aligns to 32:286/298 of P32143

query
sites
P32143
Q
 
N
W
 
Y
R
 
T
A
 
E
I
 
V
P
 
G
G
 
G
G
|
G
A
 
P
C
 
A
W
 
A
N
 
T
V
 
A
A
 
A
R
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
Q
T
 
V
G
 
D
Y
 
F
A
 
I
G
 
G
S
 
R
V
 
V
S
 
G
T
 
D
D
 
D
V
 
D
F
 
T
G
 
G
A
 
N
E
 
S
L
 
L
Y
 
L
A
 
A
L
 
E
T
 
L
Q
 
E
A
 
S
A
 
W
G
 
G
L
 
V
D
 
N
M
 
T
R
 
R
F
 
Y
T
 
T
Q
 
K
Q
 
R
Y
 
Y
A
 
N
K
 
Q
A
 
A
P
 
K
L
 
S
L
 
S
-
 
Q
A
x
S
M
 
A
V
 
I
T
 
M
S
 
V
T
 
D
T
 
T
P
 
K
P
 
G
D
 
E
Y
 
R
F
 
I
F
 
I
I
 
I
G
 
N
D
 
Y
D
 
P
S
 
S
A
 
P
D
 
D
L
 
L
H
 
L
F
 
P
D
 
D
P
 
A
Q
 
E
R
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
W
L
 
L
D
 
E
D
 
E
A
 
I
Q
 
D
V
 
F
L
 
S
H
 
Q
F
 
W
G
 
D
C
 
V
I
 
V
S
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
A
Q
 
D
I
 
V
A
x
R
-
 
W
Q
 
H
E
 
D
A
 
G
A
 
A
R
 
K
R
 
K
N
 
A
K
 
F
K
 
T
I
 
L
A
 
A
F
 
R
D
 
Q
P
 
A
N
 
G
W
 
V
R
 
M
K
 
T
L
 
V
M
 
L
D
 
D
S
 
G
P
 
D
S
 
I
Y
 
T
R
 
P
L
 
Q
L
 
D
F
 
I
Q
 
S
Q
 
E
L
 
L
L
 
V
S
 
A
L
 
L
S
 
S
H
 
D
Y
 
H
V
 
A
K
 
A
V
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
P
D
 
G
L
 
L
E
 
A
R
 
R
L
 
L
-
 
T
-
 
G
F
 
V
P
 
K
G
 
E
D
 
M
T
 
A
N
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
K
T
 
Q
L
 
A
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
A
 
T
P
 
-
Q
 
N
A
 
G
E
 
H
I
 
V
L
 
Y
Y
 
V
T
 
T
L
 
Q
G
 
G
A
 
S
K
 
A
G
 
G
M
 
C
Q
 
D
W
 
W
I
 
L
K
 
E
G
 
N
E
 
G
Q
 
G
V
 
R
I
 
Q
D
 
H
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
R
 
K
V
 
V
E
 
D
V
 
V
I
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
 
G
C
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
V
S
 
F
M
 
H
G
 
G
G
 
A
W
 
L
I
 
A
A
 
V
S
 
A
Q
 
L
L
 
A
R
 
T
Q
 
S
P
 
G
D
 
D
A
 
L
P
 
A
A
 
E
Q
 
S
V
 
V
H
 
R
L
 
F
Q
 
-
C
 
-
A
 
A
A
 
S
A
 
G
G
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
K
A
 
C
S
 
T
K
 
R
A
 
P
G
 
G
A
 
G
Y
 
R
A
 
A
A
 
G
T
 
I
W
 
P
D
 
D

Sites not aligning to the query:

6a8cA Ribokinase from leishmania donovani with adp (see paper)
26% identity, 75% coverage: 30:255/301 of query aligns to 50:283/327 of 6a8cA

query
sites
6a8cA
G
|
G
G
|
G
A
 
K
C
 
G
W
 
A
N
|
N
V
 
Q
A
 
A
R
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
A
P
 
K
T
 
V
G
 
A
Y
 
M
A
 
V
G
 
S
S
 
M
V
 
V
S
 
G
T
 
T
D
 
D
V
 
G
F
 
D
G
 
G
A
 
S
E
 
D
L
 
Y
Y
 
I
A
 
K
L
 
E
T
 
L
Q
 
E
A
 
R
A
 
N
G
 
G
L
 
V
D
 
D
M
 
T
R
 
A
F
 
Y
T
 
M
Q
 
F
Q
 
R
Y
 
T
A
 
G
K
 
K
A
 
S
P
 
S
L
 
T
-
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
I
-
 
L
T
 
V
S
 
D
T
 
T
T
 
K
P
 
S
P
 
S
D
 
N
Y
 
N
F
 
E
F
 
I
I
 
V
G
 
I
D
 
C
D
 
P
S
 
N
A
 
A
D
 
T
L
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
T
P
 
P
Q
 
E
R
 
L
L
 
L
P
 
R
A
 
A
G
 
Q
W
 
T
L
 
N
D
 
N
D
 
Y
A
 
E
Q
 
R
V
 
I
L
 
L
H
 
H
F
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
Y
C
 
L
I
 
I
S
 
C
L
 
Q
T
 
N
R
 
E
E
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
P
S
 
T
R
 
T
L
 
L
L
 
D
Q
 
T
I
 
I
A
 
-
Q
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
H
R
 
S
R
 
R
N
 
G
K
 
V
K
 
Y
I
 
T
A
 
V
F
 
F
D
 
N
-
 
S
-
 
A
-
 
P
-
 
A
P
 
P
N
 
K
W
 
P
R
 
A
K
 
E
L
 
V
M
 
E
D
 
Q
S
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
F
-
 
L
P
 
P
S
 
Y
Y
 
V
R
 
S
L
 
L
L
 
F
F
 
C
Q
 
P
Q
 
N
L
 
E
L
 
V
S
 
E
L
 
A
S
 
T
H
 
L
Y
 
I
V
 
T
K
 
G
V
 
V
S
 
K
D
 
V
E
 
T
D
 
D
L
 
T
E
 
E
R
 
S
L
 
A
F
 
F
P
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
-
N
 
S
A
 
A
L
 
I
A
 
K
T
 
A
L
 
L
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
L
A
 
G
P
 
V
Q
 
R
A
 
-
E
 
D
I
 
V
L
 
V
Y
 
I
T
 
T
L
 
L
G
|
G
A
|
A
K
 
A
G
 
G
M
 
F
Q
 
V
W
 
L
I
 
S
K
 
E
-
 
N
G
 
G
E
 
A
Q
 
E
V
 
P
I
 
V
D
 
H
Q
 
V
P
 
T
A
 
G
Y
 
K
R
 
H
V
 
V
E
 
K
V
 
A
I
 
V
D
 
D
T
|
T
V
 
T
G
 
G
C
x
A
G
|
G
D
 
D
A
 
C
S
 
F
M
 
V
G
 
G
G
 
S
W
 
M
I
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>HSERO_RS02180 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS02180
MTQSAAFVVFGEALTDFIRQPDEQWRAIPGGACWNVARAAARLGVPTGYAGSVSTDVFGA
ELYALTQAAGLDMRFTQQYAKAPLLAMVTSTTPPDYFFIGDDSADLHFDPQRLPAGWLDD
AQVLHFGCISLTREPLASRLLQIAQEAARRNKKIAFDPNWRKLMDSPSYRLLFQQLLSLS
HYVKVSDEDLERLFPGDTNALATLQSLAPQAEILYTLGAKGMQWIKGEQVIDQPAYRVEV
IDTVGCGDASMGGWIASQLRQPDAPAQVHLQCAAAGAAIAASKAGAYAATWDEVQALIAH
A

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory