SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS02375 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS02375 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4zrnA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (tm0509) with udp-glucose from hyperthermophilic eubacterium thermotoga maritima (see paper)
26% identity, 100% coverage: 1:320/320 of query aligns to 1:307/309 of 4zrnA

query
sites
4zrnA
M
 
M
H
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
R
 
S
A
 
H
L
 
V
L
 
V
S
 
D
R
 
K
L
 
L
D
 
I
S
 
E
E
 
N
G
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
V
-
 
V
-
x
D
-
x
N
-
 
L
-
x
S
-
x
S
-
x
G
-
 
K
-
 
V
Q
 
E
H
 
N
L
 
L
L
 
N
R
 
R
G
 
N
A
 
A
F
 
L
R
 
F
P
 
-
S
 
Y
S
 
E
E
 
Q
T
x
S
V
x
I
M
 
E
D
 
D
R
 
E
E
 
E
R
 
M
I
 
M
E
 
E
R
 
R
T
 
I
V
 
F
I
 
-
S
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
D
 
-
W
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
S
L
 
L
H
 
H
N
 
R
I
 
P
E
 
E
A
 
Y
V
 
V
V
 
F
H
 
H
C
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
Q
V
 
A
H
 
S
V
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
S
M
 
V
N
 
R
E
 
E
T
 
P
A
 
A
G
 
R
D
 
D
P
 
A
L
 
-
A
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
K
I
x
T
N
 
N
L
 
I
E
 
I
G
 
G
S
 
S
L
 
L
A
 
V
L
 
L
A
 
L
R
 
E
Q
 
K
A
 
S
Q
 
I
Q
 
K
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
R
 
K
F
 
F
I
 
I
F
 
F
L
x
S
S
|
S
S
x
T
I
 
G
-
x
G
K
x
A
V
 
I
N
 
Y
G
 
G
E
 
E
Q
 
N
T
 
V
S
 
K
L
 
V
G
 
-
R
 
F
P
 
P
F
 
T
T
 
P
A
 
E
D
 
T
D
 
E
K
 
I
P
 
P
A
 
H
P
 
P
T
 
I
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
A
K
|
K
M
 
Y
E
 
S
A
 
T
E
 
E
Q
 
M
A
 
Y
L
 
L
L
 
E
E
 
F
L
 
F
G
 
A
R
 
R
T
 
E
G
 
Y
K
 
G
M
 
L
Q
 
K
V
 
Y
V
 
T
I
 
V
I
 
L
R
 
R
P
x
Y
V
 
A
L
x
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
-
 
R
-
 
Q
-
 
D
-
 
P
-
x
Y
-
 
G
-
 
E
-
 
A
G
|
G
V
|
V
K
 
V
A
 
A
N
 
I
F
 
F
L
 
T
S
 
E
M
 
R
M
 
M
R
 
L
W
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
R
G
 
G
M
 
E
P
 
E
L
 
V
P
x
H
L
 
I
G
x
F
G
 
G
I
 
D
T
 
G
H
 
E
N
x
Y
R
 
V
R
|
R
S
 
D
L
 
Y
V
 
V
A
 
Y
L
 
V
D
 
D
N
 
D
L
 
V
V
 
V
D
 
R
L
 
-
I
 
-
T
 
A
V
 
N
C
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
M
P
 
E
A
 
K
A
 
G
A
 
D
G
 
N
Q
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
N
A
 
I
S
 
G
D
 
T
G
 
G
E
 
R
D
 
G
L
 
T
S
 
T
T
x
V
T
 
N
G
 
Q
M
 
L
L
 
F
Q
 
K
R
 
L
L
 
L
G
 
K
R
 
E
-
 
I
-
 
T
A
 
G
L
 
Y
D
 
D
K
 
K
S
 
E
P
 
P
T
 
V
L
 
Y
L
 
K
P
 
P
V
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
W
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
G
 
P
K
x
R
K
 
K
G
 
G
I
x
D
A
 
V
Q
 
R
R
 
K
L
 
S
C
 
I
G
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
V
 
L
D
 
D
I
 
Y
S
 
T
K
 
K
N
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
K
L
 
L
G
 
G
W
 
W
S
 
E
P
 
P
P
 
K
I
 
V
T
 
S
V
 
L
D
 
E
A
 
E
A
 
G
F
 
L
R
 
K
K
 
L
T
 
T
V
 
V
D
 
E
A
 
Y
Y
 
F
R
 
R
R
 
K
A
 
T

6bwlA X-ray structure of pal from bacillus thuringiensis (see paper)
24% identity, 98% coverage: 1:313/320 of query aligns to 1:305/313 of 6bwlA

query
sites
6bwlA
M
 
M
H
 
K
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
W
L
 
V
L
 
V
S
 
K
R
 
R
L
 
L
-
 
L
-
 
Q
D
 
D
S
 
K
E
 
H
G
 
E
Q
 
V
H
 
W
L
 
I
L
 
L
R
x
D
G
x
N
A
x
L
F
 
A
R
x
N
P
x
S
S
 
T
S
 
T
E
 
A
T
 
N
V
 
I
M
 
T
D
 
E
-
 
F
-
 
A
R
 
H
E
 
D
R
 
L
I
 
N
E
 
L
R
 
K
T
 
Q
V
 
C
I
 
I
S
 
Q
G
 
G
L
x
D
D
x
I
P
 
K
E
 
D
T
 
K
D
 
K
W
 
L
S
 
V
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
N
H
 
N
N
 
S
I
 
F
E
 
D
A
 
L
V
 
C
V
 
Y
H
 
H
C
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
S
V
x
I
H
 
N
V
 
V
M
 
Q
N
 
-
E
 
D
T
 
S
A
 
I
G
 
D
D
 
D
P
 
A
L
 
R
A
 
A
E
 
T
F
 
F
R
 
E
R
 
N
I
 
D
N
 
T
L
 
I
E
 
-
G
 
G
S
 
T
L
 
F
A
 
N
L
 
L
A
 
L
R
 
E
Q
 
Q
A
 
C
Q
 
L
Q
 
N
A
 
Y
G
 
D
V
 
V
Q
 
-
R
 
K
F
 
M
I
 
V
F
 
F
L
x
M
S
 
S
S
x
T
I
x
C
K
x
M
V
 
V
N
 
Y
G
 
D
E
 
K
Q
 
A
T
 
T
S
 
N
L
 
I
G
 
-
R
 
Q
P
 
G
F
 
I
T
 
S
A
 
E
D
 
L
D
 
D
K
 
P
P
 
I
A
 
K
P
 
P
T
 
A
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
A
I
 
G
S
 
S
K
|
K
M
 
I
E
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
N
A
 
M
L
 
V
L
 
L
E
 
S
L
 
Y
G
 
Y
R
 
Y
T
 
A
G
 
Y
K
 
K
M
 
L
Q
 
P
V
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
I
R
 
R
P
 
P
V
 
F
L
x
N
V
x
T
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
-
 
F
-
 
Q
-
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
G
G
|
G
V
|
V
K
 
V
A
 
A
N
 
I
F
 
F
L
 
I
S
 
N
M
 
-
M
 
-
R
 
N
W
 
K
L
 
L
D
 
D
K
 
-
G
 
N
M
 
V
P
 
P
L
 
L
P
x
N
L
x
I
G
x
Y
G
 
G
I
 
D
T
 
G
H
 
K
N
x
Q
R
 
T
R
|
R
S
 
D
L
 
L
V
 
L
A
 
Y
L
 
V
D
 
E
N
 
D
L
 
C
V
 
A
D
 
D
L
 
F
I
 
V
T
 
V
V
 
A
C
 
A
L
 
G
A
 
Y
H
 
S
P
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
N
G
 
G
Q
 
H
V
 
I
F
 
I
L
 
N
A
 
A
S
 
G
D
 
T
G
 
G
E
 
Q
D
 
D
L
 
I
S
 
S
T
 
-
T
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
L
x
I
D
 
N
K
 
K
S
 
L
P
 
A
T
 
E
L
 
L
L
 
I
P
 
S
V
 
G
P
 
N
A
 
K
S
 
V
W
 
S
L
 
I
T
 
Q
L
 
H
A
 
V
A
 
T
R
 
H
L
 
I
M
 
H
G
 
P
K
 
Q
K
 
S
G
x
E
I
 
I
A
 
Q
Q
 
K
R
 
L
L
 
L
C
 
C
G
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
V
 
-
D
 
N
I
 
Y
S
 
E
K
 
K
N
 
A
R
 
K
E
 
T
L
 
I
L
 
L
G
 
N
W
 
W
S
 
E
P
 
P
P
 
K
I
 
V
T
 
S
V
 
L
D
 
E
A
 
D
A
 
G
F
 
V
R
 
I
K
 
K
T
 
T

4id9B Crystal structure of a short-chain dehydrogenase/reductase superfamily protein from agrobacterium tumefaciens (target efi-506441) with bound NAD, monoclinic form 1
28% identity, 72% coverage: 3:232/320 of query aligns to 3:251/328 of 4id9B

query
sites
4id9B
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
S
 
A
G
|
G
F
x
R
V
|
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
V
S
 
A
R
 
A
L
 
L
D
 
R
S
 
T
E
 
Q
G
 
G
Q
 
R
H
 
T
L
 
V
L
 
R
R
 
G
G
 
F
A
x
D
F
x
L
R
 
R
P
 
P
S
 
S
S
 
G
E
 
T
T
 
G
V
 
G
M
 
E
D
 
E
R
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
V
I
 
V
S
 
G
G
x
S
L
|
L
D
 
E
P
 
D
E
 
G
T
 
Q
D
 
A
W
 
L
S
 
S
A
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
M
N
 
G
I
 
V
E
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
L
H
 
H
C
x
L
A
 
G
A
|
A
R
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
F
M
 
M
N
 
S
E
 
W
T
 
A
A
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
R
L
 
D
A
 
R
E
 
M
F
 
F
R
 
A
R
 
-
I
x
V
N
 
N
L
 
V
E
 
E
G
 
G
S
 
T
L
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
L
R
 
D
Q
 
A
A
 
A
Q
 
S
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
R
 
R
F
 
F
I
 
V
F
 
F
L
 
A
S
 
S
S
|
S
I
 
G
K
 
E
V
 
V
N
 
Y
G
 
P
E
 
E
Q
 
N
T
 
R
S
 
P
L
 
E
G
 
F
R
 
L
P
 
P
F
 
V
T
 
T
A
 
E
D
 
D
D
 
H
K
 
P
P
 
L
A
 
C
P
 
P
T
 
N
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
G
I
 
L
S
 
T
K
|
K
M
 
L
E
 
L
A
 
G
E
 
E
Q
 
E
A
 
L
L
 
V
L
 
R
E
 
F
L
 
H
G
 
Q
R
 
R
T
 
S
G
 
G
K
 
A
M
 
M
Q
 
E
V
 
T
V
 
V
I
 
I
I
 
L
R
 
R
-
x
F
-
x
S
-
x
H
-
x
T
-
 
Q
-
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
F
-
 
S
-
 
G
P
 
P
V
 
R
L
 
F
V
 
F
Y
 
L
G
 
R
P
 
P
G
 
R
V
 
I
-
 
H
-
 
Q
K
 
Q
A
 
Q
N
 
N
F
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
I
L
 
A
S
 
E
M
 
L
M
 
L
R
 
Q
W
 
S
L
 
R
D
 
D
K
 
I
G
 
G
M
 
E
P
 
P
L
 
S
P
 
H
L
 
I
G
 
L
G
 
A
I
 
R
T
 
N
H
 
E
N
 
N
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
F
R
 
R
R
 
M
S
 
H
L
 
I
V
 
T
A
 
D
L
 
T
D
 
R
N
 
D
L
 
M
V
 
V
D
 
A
L
 
G
I
 
I
T
 
L
V
 
L
C
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
H
P
 
P
A
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
 
G
V
 
T
F
 
F

4id9A Crystal structure of a short-chain dehydrogenase/reductase superfamily protein from agrobacterium tumefaciens (target efi-506441) with bound NAD, monoclinic form 1
28% identity, 72% coverage: 3:232/320 of query aligns to 2:250/321 of 4id9A

query
sites
4id9A
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
S
 
A
G
|
G
F
x
R
V
|
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
V
S
 
A
R
 
A
L
 
L
D
 
R
S
 
T
E
 
Q
G
 
G
Q
 
R
H
 
T
L
 
V
L
 
R
R
 
G
G
 
F
A
x
D
F
x
L
R
|
R
P
 
P
S
 
S
S
 
G
E
 
T
T
 
G
V
 
G
M
 
E
D
 
E
R
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
V
I
 
V
S
 
G
G
x
S
L
|
L
D
 
E
P
 
D
E
 
G
T
 
Q
D
 
A
W
 
L
S
 
S
A
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
M
N
 
G
I
 
V
E
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
L
H
 
H
C
x
L
A
 
G
A
|
A
R
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
F
M
 
M
N
 
S
E
 
W
T
 
A
A
 
P
G
 
A
D
 
D
P
 
R
L
 
D
A
 
R
E
 
M
F
 
F
R
 
A
R
 
-
I
x
V
N
 
N
L
 
V
E
 
E
G
 
G
S
 
T
L
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
L
R
 
D
Q
 
A
A
 
A
Q
 
S
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
R
 
R
F
 
F
I
 
V
F
 
F
L
 
A
S
 
S
S
|
S
I
 
G
K
 
E
V
 
V
N
 
Y
G
 
P
E
 
E
Q
 
N
T
 
R
S
 
P
L
 
E
G
 
F
R
 
L
P
 
P
F
 
V
T
 
T
A
 
E
D
 
D
D
 
H
K
 
P
P
 
L
A
 
C
P
 
P
T
 
N
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
G
I
 
L
S
 
T
K
|
K
M
 
L
E
 
L
A
 
G
E
 
E
Q
 
E
A
 
L
L
 
V
L
 
R
E
 
F
L
 
H
G
 
Q
R
 
R
T
 
S
G
 
G
K
 
A
M
 
M
Q
 
E
V
 
T
V
 
V
I
 
I
I
 
L
R
 
R
-
x
F
-
 
S
-
x
H
-
x
T
-
 
Q
-
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
F
-
 
S
-
 
G
P
 
P
V
 
R
L
 
F
V
 
F
Y
 
L
G
 
R
P
 
P
G
 
R
V
 
I
-
 
H
-
 
Q
K
 
Q
A
 
Q
N
 
N
F
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
I
L
 
A
S
 
E
M
 
L
M
 
L
R
 
Q
W
 
S
L
 
R
D
 
D
K
 
I
G
 
G
M
 
E
P
 
P
L
 
S
P
 
H
L
 
I
G
 
L
G
 
A
I
 
R
T
 
N
H
 
E
N
 
N
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
F
R
 
R
R
 
M
S
 
H
L
 
I
V
 
T
A
 
D
L
 
T
D
 
R
N
 
D
L
 
M
V
 
V
D
 
A
L
 
G
I
 
I
T
 
L
V
 
L
C
 
A
L
 
L
A
 
D
H
 
H
P
 
P
A
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
 
G
V
 
T
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6kv9A Moee5 in complex with udp-glucuronic acid and NAD (see paper)
31% identity, 67% coverage: 3:215/320 of query aligns to 3:208/299 of 6kv9A

query
sites
6kv9A
I
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
R
 
S
A
 
H
L
 
L
L
 
V
S
 
T
R
 
E
L
 
L
D
 
R
S
 
N
E
 
S
G
 
G
Q
 
R
H
 
N
L
 
V
L
 
V
R
 
A
G
 
V
A
x
D
F
x
R
R
|
R
P
 
P
S
 
L
S
 
P
E
 
D
T
 
T
V
 
G
M
 
S
D
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
I
 
I
S
 
R
G
 
G
L
x
D
D
x
L
P
 
N
E
 
S
T
 
L
D
 
N
W
 
L
S
 
V
A
 
D
A
 
C
L
 
L
H
 
K
N
 
N
I
 
I
E
 
S
A
 
T
V
 
V
V
 
F
H
 
H
C
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
L
V
x
P
H
 
G
V
 
V
M
x
R
N
 
P
E
 
S
T
 
W
A
 
T
G
 
Q
D
 
F
P
 
P
L
 
-
A
 
-
E
 
E
F
 
Y
R
 
L
R
 
R
I
x
C
N
 
N
L
 
V
E
 
L
G
 
A
S
 
T
L
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
Q
 
A
A
 
C
Q
 
V
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
V
Q
 
E
R
 
R
F
 
V
I
 
V
F
 
V
L
x
A
S
|
S
S
|
S
I
x
S
K
x
S
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
G
Q
 
A
T
 
D
S
 
G
L
 
V
G
 
-
R
 
-
P
 
-
F
 
M
T
 
S
A
 
E
D
 
D
D
 
D
K
 
L
P
 
P
A
 
R
P
 
P
T
 
L
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
M
 
L
E
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
A
 
L
L
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
F
G
 
A
R
 
A
T
 
R
G
 
G
-
 
D
-
 
A
K
 
E
M
 
L
Q
 
S
V
 
V
V
 
G
I
 
A
I
 
L
R
 
R
P
x
F
V
 
F
L
x
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
Q
K
x
R
A
 
P
N
 
D
-
x
M
F
|
F
L
 
I
S
 
S
-
x
R
M
 
L
M
 
I
R
 
R
W
 
A
L
 
T
D
 
L
K
 
R
G
 
G
M
 
E
P
 
P
L
 
V
P
x
E
L
x
I
G
x
Y
G
 
G
I
 
D
T
 
G
H
 
T
N
x
Q
R
 
L
R
|
R
S
 
D
L
 
F
V
 
T
A
 
H
L
 
V
D
 
S
N
 
D
L
 
V
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Q9LPG6 Trifunctional UDP-glucose 4,6-dehydratase/UDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 3,5-epimerase/UDP-4-keto-L-rhamnose-reductase RHM2; NDP-rhamnose synthase; Protein MUCILAGE-MODIFIED 4; Protein RHAMNOSE BIOSYNTHESIS 2; Rhamnose biosynthetic enzyme 2; AtRHM2; UDP-L-rhamnose synthase MUM4; EC 4.2.1.76; EC 1.1.1.-; EC 5.1.3.- from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
27% identity, 72% coverage: 2:232/320 of query aligns to 10:250/667 of Q9LPG6

query
sites
Q9LPG6
H
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
G
|
G
F
 
F
V
 
I
G
 
A
R
 
S
A
 
H
L
 
V
L
 
A
S
 
N
R
 
R
L
 
L
D
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
I
R
 
R
G
 
N
A
 
Y
F
 
-
R
 
-
P
 
P
S
 
D
S
 
Y
E
x
K
T
 
I
V
 
V
M
 
V
D
 
L
R
 
D
E
 
K
R
 
L
I
 
D
E
 
Y
R
 
C
T
 
S
V
 
D
I
 
L
S
 
K
G
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
S
-
 
F
-
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
N
-
 
F
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
D
-
 
L
T
 
V
D
 
N
W
 
Y
S
 
L
A
 
L
A
 
I
L
 
T
H
 
E
N
 
N
I
 
I
E
 
D
A
 
T
V
 
I
V
 
M
H
 
H
C
 
F
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
V
 
T
H
 
H
V
 
V
M
x
D
N
 
N
E
 
-
T
 
S
A
 
F
G
 
G
D
 
N
P
 
S
L
 
F
A
 
-
E
 
E
F
 
F
R
 
T
R
 
K
I
 
N
N
 
N
L
 
I
E
 
Y
G
 
G
S
 
T
L
 
H
A
 
V
L
 
L
A
 
L
R
 
E
Q
 
A
A
 
C
Q
 
K
Q
 
V
A
 
T
G
 
G
-
 
Q
V
 
I
Q
 
R
R
 
R
F
 
F
I
 
I
F
 
H
L
 
V
S
 
S
S
 
T
I
 
D
K
 
E
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
E
-
 
T
-
 
D
-
 
E
Q
 
D
T
 
A
S
 
A
L
 
V
G
 
G
R
 
N
P
 
H
F
 
E
T
 
A
A
 
S
D
 
-
D
 
-
K
 
Q
P
 
L
A
 
L
P
 
P
T
 
T
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
G
 
S
I
 
A
S
 
T
K
|
K
M
 
A
E
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
M
A
 
L
L
 
V
L
 
M
E
 
A
L
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
S
G
 
Y
K
 
G
M
 
L
Q
 
P
V
 
V
V
 
I
I
 
T
I
 
T
R
 
R
P
 
G
V
 
N
L
 
N
V
 
V
Y
 
Y
G
|
G
P
 
P
G
 
N
V
 
Q
-
 
F
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
M
-
 
I
-
 
P
K
 
K
A
 
F
N
 
I
F
 
L
L
 
L
S
 
A
M
 
M
M
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
S
G
 
G
M
 
K
P
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
I
G
 
H
G
 
G
I
 
D
T
 
G
H
 
S
N
 
N
R
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
Y
V
 
L
A
 
Y
L
 
C
D
 
E
N
 
D
L
 
V
V
 
A
D
 
E
L
 
A
I
 
F
T
 
E
V
 
V
C
 
V
L
 
L
A
 
-
H
 
H
P
 
K
A
 
G
A
 
E
A
 
I
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

Q9FX01 3beta-hydroxysteroid-dehydrogenase/decarboxylase isoform 1; At3BETAHSD/D1; 4alpha-carboxysterol-C3-dehydrogenase/C4-decarboxylase isoform 1-1; Reticulon-like protein B24; AtRTNLB24; Sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase 1, decarboxylating; EC 1.1.1.418 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
25% identity, 98% coverage: 4:317/320 of query aligns to 13:358/439 of Q9FX01

query
sites
Q9FX01
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
S
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
G
 
A
R
 
R
A
 
H
L
 
L
L
 
V
S
 
E
R
 
M
L
 
L
D
 
V
S
 
R
E
 
Y
G
 
Q
Q
 
M
H
 
F
L
 
H
L
 
V
R
 
R
G
 
I
A
 
A
-
x
D
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
I
-
 
V
F
 
L
R
 
N
P
 
P
S
 
H
S
 
E
E
 
E
T
 
T
V
 
G
M
 
I
D
 
L
R
 
G
E
 
E
R
 
A
I
 
I
E
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
R
-
 
V
R
 
Q
T
 
Y
V
 
V
I
 
S
S
 
A
G
x
D
L
 
L
D
 
R
P
 
N
E
 
K
T
 
T
D
 
Q
W
 
V
S
 
V
A
 
K
A
 
G
L
 
F
H
 
Q
N
 
G
I
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
F
H
 
H
C
 
M
A
 
A
A
 
A
R
 
P
V
 
D
H
 
S
V
 
S
M
 
I
N
 
N
E
 
N
T
 
H
A
 
Q
G
 
L
D
 
Q
P
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
Y
R
 
S
I
 
V
N
 
N
L
 
V
E
 
Q
G
 
G
S
 
T
L
 
T
A
 
N
L
 
V
A
 
I
R
 
D
Q
 
A
A
 
C
Q
 
I
Q
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
R
 
R
F
 
L
I
 
I
F
 
Y
L
x
T
S
 
S
S
|
S
I
 
P
K
x
S
V
 
V
-
 
V
-
 
F
N
 
D
G
 
G
E
 
V
Q
 
H
T
 
G
S
 
T
L
 
L
G
 
N
R
 
A
P
 
D
F
 
E
T
 
S
A
 
L
D
 
P
D
 
Y
K
 
P
P
 
P
A
 
K
P
 
H
T
 
N
D
 
D
P
 
S
Y
|
Y
G
 
S
I
 
A
S
 
T
K
|
K
M
 
A
E
 
E
A
 
G
E
 
E
Q
 
A
A
 
L
L
 
I
L
 
L
E
 
K
L
 
A
-
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
S
G
 
G
K
 
-
M
 
L
Q
 
L
V
 
T
V
 
C
I
 
C
I
 
I
R
 
R
P
 
P
V
 
S
L
 
S
V
 
I
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
D
K
 
K
A
 
L
N
 
M
F
 
V
L
 
P
S
 
S
M
 
L
M
 
V
R
 
T
W
 
A
L
 
A
D
 
R
K
 
A
G
 
G
M
 
K
P
 
S
L
 
K
P
 
F
L
 
I
G
 
I
G
 
G
I
 
D
T
 
G
H
 
S
N
 
N
R
 
F
R
 
Y
S
 
D
L
 
F
V
 
T
A
 
Y
L
 
V
D
 
E
N
 
N
L
 
V
V
 
V
D
 
H
L
 
A
I
 
-
T
 
H
V
 
V
C
 
C
L
 
A
A
 
E
H
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
C
P
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
F
 
Y
L
 
F
A
 
I
S
 
T
D
 
N
G
 
M
E
 
E
D
 
P
L
 
I
S
 
K
-
 
F
-
 
W
-
 
E
-
 
F
T
 
M
T
 
S
G
 
Q
M
 
L
L
 
L
Q
 
E
R
 
G
L
 
L
G
 
G
-
 
Y
-
 
E
R
 
R
A
 
P
L
 
S
D
 
I
K
 
K
S
 
I
P
 
P
T
 
A
L
 
S
L
 
L
P
 
M
V
 
M
P
 
P
A
 
I
S
 
A
W
 
Y
L
 
L
T
 
V
-
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
Y
R
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
G
K
 
P
K
 
Y
G
 
G
I
 
M
-
 
K
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
S
-
x
R
A
 
V
Q
 
R
R
 
L
L
 
L
C
 
S
G
 
C
S
 
N
L
x
R
Q
 
T
V
 
F
D
 
D
I
 
S
S
 
S
K
 
K
N
 
A
R
 
K
E
 
D
L
 
R
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
S
 
S
P
 
P
P
 
V
I
 
V
T
 
P
V
 
L
D
 
Q
A
 
E
A
 
G
F
 
I
R
 
K
K
 
R
T
 
T
V
 
I
D
 
D
A
 
S
Y
 
F

6kvcA Moee5 in complex with udp-glucose and NAD (see paper)
29% identity, 67% coverage: 3:215/320 of query aligns to 3:207/299 of 6kvcA

query
sites
6kvcA
I
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
R
 
S
A
 
H
L
 
L
L
 
V
S
 
T
R
 
E
L
 
L
D
 
R
S
 
N
E
 
S
G
 
G
Q
 
R
H
 
N
L
 
V
L
 
V
R
 
A
G
 
V
A
x
D
F
x
R
R
|
R
P
 
P
S
 
L
S
 
P
E
 
T
T
 
G
V
 
S
M
 
L
D
 
R
R
 
E
E
 
I
R
 
R
I
 
G
E
x
D
R
x
L
T
 
N
V
 
S
I
 
L
S
 
N
G
 
L
L
 
V
D
 
D
P
 
-
E
 
-
T
 
-
D
 
-
W
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
C
L
 
L
H
 
K
N
 
N
I
 
I
E
 
S
A
 
T
V
 
V
V
 
F
H
 
H
C
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
L
V
x
P
H
 
G
V
 
V
M
x
R
N
 
P
E
 
S
T
 
W
A
 
T
G
 
Q
D
 
F
P
 
P
L
 
-
A
 
-
E
 
E
F
 
Y
R
 
L
R
 
R
I
 
C
N
 
N
L
 
V
E
 
L
G
 
A
S
 
T
L
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
M
R
 
E
Q
 
A
A
 
C
Q
 
V
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
V
Q
 
E
R
 
R
F
 
V
I
 
V
F
 
V
L
x
A
S
 
S
S
|
S
I
x
S
K
x
S
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
G
Q
 
A
T
 
D
S
 
G
L
 
V
G
 
-
R
 
-
P
 
-
F
 
M
T
 
S
A
 
E
D
 
D
D
 
D
K
 
L
P
 
P
A
 
R
P
 
P
T
 
L
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
M
 
L
E
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
A
 
L
L
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
F
G
 
A
R
 
A
T
 
R
G
 
G
-
 
D
-
 
A
K
 
E
M
 
L
Q
 
S
V
 
V
V
 
G
I
 
A
I
 
L
R
 
R
P
x
F
V
 
F
L
x
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
Q
K
x
R
A
 
P
N
 
D
-
x
M
F
|
F
L
 
I
S
 
S
-
x
R
M
 
L
M
 
I
R
 
R
W
 
A
L
 
T
D
 
L
K
 
R
G
 
G
M
 
E
P
 
P
L
 
V
P
x
E
L
x
I
G
x
Y
G
 
G
I
 
D
T
 
G
H
 
T
N
x
Q
R
 
L
R
|
R
S
 
D
L
 
F
V
 
T
A
 
H
L
 
V
D
 
S
N
 
D
L
 
V
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6x3bA Structure of rmd from pseudomonas aeruginosa complexed with NADPH
26% identity, 98% coverage: 3:317/320 of query aligns to 8:296/300 of 6x3bA

query
sites
6x3bA
I
 
L
L
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
L
S
|
S
G
|
G
F
|
F
V
|
V
G
 
G
R
 
K
A
 
H
L
 
L
L
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
Q
H
 
A
L
 
Y
L
 
L
R
 
A
G
 
A
A
 
A
F
 
H
R
 
T
P
 
P
S
 
W
S
 
A
E
 
L
T
 
L
V
 
P
M
 
V
D
 
P
R
 
H
-
 
R
-
 
Y
E
x
D
R
x
L
I
 
L
E
 
E
R
 
P
T
 
D
V
 
S
I
 
L
S
 
G
G
 
D
L
 
L
D
 
W
P
 
P
E
 
E
T
 
L
D
 
P
W
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
N
 
-
I
 
-
E
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
I
H
 
H
C
x
L
A
|
A
A
x
G
R
 
Q
V
x
T
H
 
Y
V
 
V
M
 
-
N
 
P
E
 
E
T
 
A
A
 
F
G
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
-
A
 
A
E
 
R
F
 
T
R
 
L
R
 
Q
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
 
L
G
 
G
S
 
T
L
 
L
A
 
N
L
 
L
A
 
L
R
 
Q
Q
 
A
A
 
L
Q
 
K
Q
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
F
Q
 
S
-
 
G
R
 
T
F
 
F
I
 
L
F
 
Y
L
 
I
S
 
S
S
|
S
I
x
G
K
x
D
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
Q
Q
 
V
T
 
A
S
 
E
L
 
A
G
 
A
R
 
L
P
 
P
F
 
I
T
 
H
A
 
E
D
 
E
D
 
L
K
 
I
P
 
P
A
 
H
P
 
P
T
 
R
D
 
N
P
 
P
Y
|
Y
G
 
A
I
 
V
S
 
S
K
|
K
M
 
L
E
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
S
A
 
L
L
 
C
L
 
L
E
 
Q
L
 
W
G
 
G
R
 
I
T
 
T
G
 
E
K
 
G
M
 
W
Q
 
R
V
 
V
V
 
L
I
 
V
I
 
A
R
 
R
P
 
P
V
 
F
L
 
N
V
x
H
Y
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
x
Q
K
 
K
A
 
D
N
 
S
F
 
F
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
Q
L
 
I
S
 
A
M
 
R
M
 
M
R
 
K
W
 
Q
L
 
G
D
 
L
K
 
Q
G
 
A
M
 
N
P
 
R
L
 
L
P
 
E
L
 
V
G
 
G
G
 
D
I
 
I
T
 
D
H
 
V
N
 
S
R
 
R
R
 
D
S
 
F
L
 
L
V
 
D
A
 
V
L
 
Q
D
 
D
N
 
V
L
 
L
V
 
S
D
 
A
L
 
Y
I
 
L
T
 
R
V
 
L
C
 
-
L
 
L
A
 
S
H
 
H
P
 
-
A
 
G
A
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
V
 
V
F
 
Y
L
 
N
A
 
V
S
 
C
D
 
S
G
 
G
E
 
Q
D
 
E
L
 
Q
S
 
K
T
 
I
T
 
R
G
 
E
M
 
L
L
 
I
Q
 
E
R
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
D
K
 
I
S
 
A
P
 
Q
T
 
V
L
 
E
L
 
L
P
 
E
V
 
I
P
 
-
A
 
-
S
 
-
W
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
V
M
 
Q
G
 
D
K
 
R
K
 
R
G
 
A
I
 
E
A
 
Q
Q
 
R
R
 
R
L
 
V
C
 
R
G
 
G
S
 
S
L
 
H
Q
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
A
K
 
R
N
 
L
R
 
H
E
 
D
L
 
A
L
 
T
G
 
G
W
 
W
S
 
K
P
 
P
P
 
E
I
 
I
T
 
T
V
 
I
D
 
K
A
 
Q
A
 
S
F
 
L
R
 
R
K
 
A
T
 
I
V
 
L
D
 
S
A
 
D
Y
 
W

6x3bB Structure of rmd from pseudomonas aeruginosa complexed with NADPH
26% identity, 98% coverage: 3:317/320 of query aligns to 4:293/297 of 6x3bB

query
sites
6x3bB
I
 
L
L
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
L
S
|
S
G
|
G
F
|
F
V
|
V
G
 
G
R
 
K
A
 
H
L
 
L
L
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
Q
H
 
A
L
 
Y
L
 
L
R
 
A
G
 
A
A
 
A
F
 
H
R
 
T
P
 
P
S
 
W
S
 
A
E
 
L
T
 
L
V
 
P
M
 
V
D
 
P
R
 
H
-
 
R
-
 
Y
E
x
D
R
x
L
I
 
L
E
 
E
R
 
P
T
 
D
V
 
S
I
 
L
S
 
G
G
 
D
L
 
L
D
 
W
P
 
P
E
 
E
T
 
L
D
 
P
W
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
N
 
-
I
 
-
E
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
I
H
 
H
C
x
L
A
|
A
A
x
G
R
 
Q
V
x
T
H
 
Y
V
 
V
M
 
-
N
 
P
E
 
E
T
 
A
A
 
F
G
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
-
A
 
A
E
 
R
F
 
T
R
 
L
R
 
Q
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
 
L
G
 
G
S
 
T
L
 
L
A
 
N
L
 
L
A
 
L
R
 
Q
Q
 
A
A
 
L
Q
 
K
Q
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
F
Q
 
S
-
 
G
R
 
T
F
 
F
I
 
L
F
 
Y
L
x
I
S
 
S
S
|
S
I
x
G
K
x
D
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
Q
Q
 
V
T
 
A
S
 
E
L
 
A
G
 
A
R
 
L
P
 
P
F
 
I
T
 
H
A
 
E
D
 
E
D
 
L
K
 
I
P
 
P
A
 
H
P
 
P
T
 
R
D
 
N
P
 
P
Y
|
Y
G
 
A
I
 
V
S
 
S
K
|
K
M
 
L
E
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
S
A
 
L
L
 
C
L
 
L
E
 
Q
L
 
W
G
 
G
R
 
I
T
 
T
G
 
E
K
 
G
M
 
W
Q
 
R
V
 
V
V
 
L
I
 
V
I
 
A
R
 
R
P
 
P
V
 
F
L
 
N
V
x
H
Y
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
x
Q
K
 
K
A
 
D
N
 
S
F
 
F
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
Q
L
 
I
S
 
A
M
 
R
M
 
M
R
 
K
W
 
Q
L
 
G
D
 
L
K
 
Q
G
 
A
M
 
N
P
 
R
L
 
L
P
 
E
L
 
V
G
 
G
G
 
D
I
 
I
T
 
D
H
 
V
N
 
S
R
|
R
R
 
D
S
 
F
L
 
L
V
 
D
A
 
V
L
 
Q
D
 
D
N
 
V
L
 
L
V
 
S
D
 
A
L
 
Y
I
 
L
T
 
R
V
 
L
C
 
-
L
 
L
A
 
S
H
 
H
P
 
-
A
 
G
A
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
V
 
V
F
 
Y
L
 
N
A
 
V
S
 
C
D
 
S
G
 
G
E
 
Q
D
 
E
L
 
Q
S
 
K
T
 
I
T
 
R
G
 
E
M
 
L
L
 
I
Q
 
E
R
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
D
K
 
I
S
 
A
P
 
Q
T
 
V
L
 
E
L
 
L
P
 
E
V
 
I
P
 
V
A
 
Q
S
 
D
W
 
M
L
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
G
 
-
K
 
R
K
 
R
G
 
A
I
 
E
A
 
Q
Q
 
R
R
 
R
L
 
V
C
 
R
G
 
G
S
 
S
L
 
H
Q
 
-
V
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
A
K
 
R
N
 
L
R
 
H
E
 
D
L
 
A
L
 
T
G
 
G
W
 
W
S
 
K
P
 
P
P
 
E
I
 
I
T
 
T
V
 
I
D
 
K
A
 
Q
A
 
S
F
 
L
R
 
R
K
 
A
T
 
I
V
 
L
D
 
S
A
 
D
Y
 
W

Q9SYM5 Trifunctional UDP-glucose 4,6-dehydratase/UDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 3,5-epimerase/UDP-4-keto-L-rhamnose-reductase RHM1; Protein REPRESSOR OF LRX1 1; Rhamnose biosynthetic enzyme 1; AtRHM1; EC 4.2.1.76; EC 1.1.1.-; EC 5.1.3.- from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 3 papers)
24% identity, 99% coverage: 2:317/320 of query aligns to 8:319/669 of Q9SYM5

query
sites
Q9SYM5
H
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
I
G
 
A
R
 
S
A
 
H
L
 
V
L
 
A
S
 
N
R
 
R
L
 
L
D
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
I
R
 
R
G
 
S
A
 
Y
F
 
-
R
 
-
P
 
P
S
 
D
S
 
Y
E
 
K
T
 
I
V
 
V
M
 
V
D
 
L
R
 
D
E
 
K
R
 
L
I
 
D
E
 
Y
R
 
C
T
 
S
V
 
N
I
 
L
S
 
K
G
 
N
L
 
L
D
 
N
P
 
P
E
 
S
T
 
K
D
 
H
W
 
S
-
 
P
-
 
N
-
 
F
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
D
L
 
L
H
 
V
N
 
N
-
 
H
-
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
E
-
 
G
I
 
I
E
 
D
A
 
T
V
 
I
V
 
M
H
 
H
C
 
F
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
V
 
T
H
 
H
V
 
V
M
 
D
N
 
N
E
 
-
T
 
S
A
 
F
G
 
G
D
 
N
P
 
S
L
 
F
A
 
-
E
 
E
F
 
F
R
 
T
R
 
K
I
 
N
N
 
N
L
 
I
E
 
Y
G
 
G
S
 
T
L
 
H
A
 
V
L
 
L
A
 
L
R
 
E
Q
 
A
A
 
C
Q
 
K
Q
 
V
A
 
T
G
 
G
-
 
Q
V
 
I
Q
 
R
R
 
R
F
 
F
I
 
I
F
 
H
L
 
V
S
 
S
S
 
T
I
 
D
K
 
E
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
E
-
 
T
-
 
D
Q
 
E
T
 
D
S
 
A
L
 
L
G
 
V
R
 
G
P
 
N
F
 
H
T
 
E
A
 
A
D
 
S
D
 
-
K
 
Q
P
 
L
A
 
L
P
 
P
T
 
T
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
G
 
S
I
 
A
S
 
T
K
 
K
M
 
A
E
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
M
A
 
L
L
 
V
L
 
M
E
 
A
L
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
S
G
 
Y
K
 
G
M
 
L
Q
 
P
V
 
V
V
 
I
I
 
T
I
 
T
R
 
R
P
 
G
V
 
N
L
 
N
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
N
-
 
Q
-
 
F
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
L
V
 
I
K
 
P
A
 
K
N
 
F
F
 
I
L
 
L
S
 
L
M
 
A
M
 
M
R
 
R
W
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
G
M
 
Q
P
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
I
G
 
H
G
 
G
I
 
D
T
 
G
H
 
S
N
 
N
R
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
Y
V
 
L
A
 
Y
L
 
C
D
 
E
N
 
D
L
 
V
V
 
A
D
 
E
L
 
A
I
 
F
T
 
E
V
 
V
C
 
V
L
 
L
A
 
-
H
 
H
P
 
K
A
 
G
A
 
E
A
 
V
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
F
 
Y
L
 
N
A
 
I
S
 
G
D
 
T
G
 
K
E
 
K
D
 
E
L
 
R
S
 
R
T
 
V
T
 
N
G
 
D
M
 
V
L
 
A
Q
 
K
R
 
D
L
 
I
G
 
C
R
 
K
A
 
L
L
 
F
D
 
N
K
 
M
S
 
D
P
 
P
T
 
E
L
 
-
L
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
W
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
A
G
 
N
K
 
I
K
 
K
G
 
F
I
 
V
A
 
D
Q
 
N
R
|
R
L
 
P
C
 
F
G
 
N
S
 
D
L
 
Q
Q
 
R
V
 
Y
D
 
F
I
 
L
S
 
D
K
 
D
N
 
Q
R
 
K
-
 
L
E
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
G
W
 
W
S
 
S
P
 
E
P
 
R
I
 
T
T
 
T
V
 
W
D
 
E
A
 
E
A
 
G
F
 
L
R
 
K
K
 
K
T
 
T
V
 
M
D
 
D
A
 
W
Y
 
Y

6zllA Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase from bacillus cereus in complex with udp-galacturonic acid and NAD (see paper)
23% identity, 100% coverage: 1:319/320 of query aligns to 1:312/321 of 6zllA

query
sites
6zllA
M
 
M
H
 
K
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
R
 
S
A
 
H
L
 
L
L
 
C
S
 
Q
R
 
A
L
 
L
D
 
L
S
 
K
E
 
N
G
 
S
Q
 
A
H
 
Y
L
 
H
L
 
V
R
 
V
G
 
G
A
 
I
F
x
D
R
x
H
-
x
F
-
x
I
-
 
G
-
 
P
-
 
T
P
 
P
S
 
A
S
 
T
E
 
L
T
x
K
V
 
T
M
 
G
D
 
N
R
 
I
E
 
Q
R
 
S
I
 
L
E
 
E
R
 
L
T
 
N
V
 
S
I
 
R
S
 
F
G
 
Q
L
 
F
D
 
I
P
 
R
E
 
E
-
x
D
-
x
I
-
 
L
-
 
N
T
 
T
D
 
D
W
 
L
S
 
S
A
 
K
A
 
L
L
 
L
H
 
Q
N
 
D
I
 
I
E
 
D
A
 
V
V
 
V
V
 
Y
H
 
H
C
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
-
V
 
I
H
x
P
V
 
G
M
x
V
N
x
R
E
 
T
T
 
S
A
 
W
G
 
G
D
 
K
P
 
D
L
 
F
A
 
Q
E
 
P
F
 
Y
R
 
V
R
 
T
I
 
N
N
 
N
L
 
I
E
 
M
G
 
V
S
 
T
L
 
Q
A
 
Q
L
 
L
A
 
L
R
 
E
Q
 
A
A
 
C
Q
 
K
Q
 
H
A
 
I
G
 
K
V
 
L
Q
 
D
R
 
K
F
 
F
I
 
I
F
 
H
L
x
I
S
 
S
S
x
T
I
x
S
K
x
S
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
T
 
S
S
 
G
L
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
A
F
 
V
T
 
S
A
 
E
D
 
D
D
 
L
K
 
L
P
 
P
A
 
I
P
 
P
T
 
L
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
M
 
L
E
 
S
A
 
G
E
 
E
Q
 
H
A
 
L
L
 
C
L
 
H
E
 
V
L
 
Y
G
 
H
R
 
K
T
 
N
G
 
F
K
 
H
M
 
I
Q
 
P
V
 
I
V
 
V
I
 
I
I
 
L
R
 
R
P
x
Y
V
 
F
L
x
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
R
V
 
Q
K
x
R
A
 
P
N
 
D
-
x
M
-
x
A
F
 
F
L
 
H
S
x
R
M
 
L
M
 
I
R
 
K
W
 
Q
L
 
M
D
 
L
K
 
E
G
 
D
M
 
K
P
 
P
L
 
L
P
x
T
L
 
I
G
x
F
G
 
G
I
 
D
T
 
G
H
 
T
N
x
Q
R
 
T
R
|
R
S
 
D
L
 
F
V
 
T
A
 
Y
L
 
I
D
 
D
N
 
D
L
 
C
V
 
I
D
 
R
L
 
G
I
 
T
T
 
V
V
 
A
C
 
A
L
 
L
-
 
E
A
 
T
H
 
K
P
 
K
A
 
N
A
 
I
A
 
I
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
F
 
I
L
 
N
A
 
I
S
 
G
D
 
G
G
 
K
E
 
E
D
 
Q
L
 
A
S
 
S
T
x
I
T
 
L
G
 
D
M
 
I
L
 
I
Q
 
S
R
 
M
L
 
L
G
 
E
R
 
K
A
 
I
L
 
S
D
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
A
T
 
T
-
 
K
-
 
N
-
 
F
L
 
L
L
 
K
P
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
G
-
x
E
-
 
P
-
 
K
-
 
Q
S
 
T
W
 
W
L
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
C
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
V
 
A
D
 
D
I
 
I
S
 
S
K
 
K
N
 
A
R
 
S
E
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
Q
W
 
Y
S
 
S
P
 
P
P
 
T
I
 
V
T
 
S
V
 
L
D
 
S
A
 
D
A
 
G
F
 
L
R
 
E
K
 
A
T
 
E
V
 
Y
D
 
D
A
 
Y
Y
 
I
R
 
K
R
 
Q

6zldA Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase from bacillus cereus in complex with udp-glucuronic acid and NAD (see paper)
23% identity, 100% coverage: 1:319/320 of query aligns to 1:312/314 of 6zldA

query
sites
6zldA
M
 
M
H
 
K
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
R
 
S
A
 
H
L
 
L
L
 
C
S
 
Q
R
 
A
L
 
L
D
 
L
S
 
K
E
 
N
G
 
S
Q
 
A
H
 
Y
L
 
H
L
 
V
R
 
V
G
 
G
A
 
I
F
x
D
R
x
H
-
x
F
-
x
I
-
 
G
-
 
P
-
 
T
P
 
P
S
 
A
S
 
T
E
 
L
T
x
K
V
 
T
M
 
G
D
 
N
R
 
I
E
 
Q
R
 
S
I
 
L
E
 
E
R
 
L
T
 
N
V
 
S
I
 
R
S
 
F
G
 
Q
L
 
F
D
 
I
P
 
R
E
 
E
-
x
D
-
x
I
-
 
L
-
 
N
T
 
T
D
 
D
W
 
L
S
 
S
A
 
K
A
 
L
L
 
L
H
 
Q
N
 
D
I
 
I
E
 
D
A
 
V
V
 
V
V
 
Y
H
 
H
C
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
-
V
 
I
H
x
P
V
 
G
M
 
V
N
x
R
E
 
T
T
 
S
A
 
W
G
 
G
D
 
K
P
 
D
L
 
F
A
 
Q
E
 
P
F
 
Y
R
 
V
R
 
T
I
 
N
N
 
N
L
 
I
E
 
M
G
 
V
S
 
T
L
 
Q
A
 
Q
L
 
L
A
 
L
R
 
E
Q
 
A
A
 
C
Q
 
K
Q
 
H
A
 
I
G
 
K
V
 
L
Q
 
D
R
 
K
F
 
F
I
 
I
F
 
H
L
x
I
S
 
S
S
x
T
I
x
S
K
x
S
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
T
 
S
S
 
G
L
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
A
F
 
V
T
 
S
A
 
E
D
 
D
D
 
L
K
 
L
P
 
P
A
 
I
P
 
P
T
 
L
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
M
 
L
E
 
S
A
 
G
E
 
E
Q
 
H
A
 
L
L
 
C
L
 
H
E
 
V
L
 
Y
G
 
H
R
 
K
T
 
N
G
 
F
K
 
H
M
 
I
Q
 
P
V
 
I
V
 
V
I
 
I
I
 
L
R
 
R
P
x
Y
V
x
F
L
x
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
R
V
 
Q
K
x
R
A
 
P
N
 
D
-
x
M
-
x
A
F
 
F
L
 
H
S
x
R
M
 
L
M
 
I
R
 
K
W
 
Q
L
 
M
D
 
L
K
 
E
G
 
D
M
 
K
P
 
P
L
 
L
P
x
T
L
 
I
G
x
F
G
 
G
I
 
D
T
 
G
H
 
T
N
x
Q
R
 
T
R
|
R
S
 
D
L
 
F
V
 
T
A
 
Y
L
 
I
D
 
D
N
 
D
L
 
C
V
 
I
D
 
R
L
 
G
I
 
T
T
 
V
V
 
A
C
 
A
L
 
L
-
 
E
A
 
T
H
 
K
P
 
K
A
 
N
A
 
I
A
 
I
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
F
 
I
L
 
N
A
 
I
S
 
G
D
 
G
G
 
K
E
 
E
D
 
Q
L
 
A
S
 
S
T
x
I
T
 
L
G
 
D
M
 
I
L
 
I
Q
 
S
R
 
M
L
 
L
G
 
E
R
 
K
A
 
I
L
 
S
D
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
A
T
 
T
-
 
K
-
 
N
-
 
F
L
 
L
L
 
K
P
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
G
-
x
E
-
 
P
-
 
K
-
 
Q
S
 
T
W
 
W
L
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
C
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
-
V
 
A
D
 
D
I
 
I
S
 
S
K
 
K
N
 
A
R
 
S
E
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
Q
W
 
Y
S
 
S
P
 
P
P
 
T
I
 
V
T
 
S
V
 
L
D
 
S
A
 
D
A
 
G
F
 
L
R
 
E
K
 
A
T
 
E
V
 
Y
D
 
D
A
 
Y
Y
 
I
R
 
K
R
 
Q

6zl6A Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase from bacillus cereus in complex with udp and NAD (see paper)
23% identity, 100% coverage: 1:319/320 of query aligns to 1:312/314 of 6zl6A

query
sites
6zl6A
M
 
M
H
 
K
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
R
 
S
A
 
H
L
 
L
L
 
C
S
 
Q
R
 
A
L
 
L
D
 
L
S
 
K
E
 
N
G
 
S
Q
 
A
H
 
Y
L
 
H
L
 
V
R
 
V
G
 
G
A
 
I
F
x
D
R
x
H
-
x
F
-
x
I
-
 
G
-
 
P
-
 
T
P
 
P
S
 
A
S
 
T
E
 
L
T
x
K
V
 
T
M
 
G
D
 
N
R
 
I
E
 
Q
R
 
S
I
 
L
E
 
E
R
 
L
T
 
N
V
 
S
I
 
R
S
 
F
G
 
Q
L
 
F
D
 
I
P
 
R
E
 
E
-
x
D
-
x
I
-
 
L
-
 
N
T
 
T
D
 
D
W
 
L
S
 
S
A
 
K
A
 
L
L
 
L
H
 
Q
N
 
D
I
 
I
E
 
D
A
 
V
V
 
V
V
 
Y
H
 
H
C
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
-
V
 
I
H
 
P
V
 
G
M
 
V
N
 
R
E
 
T
T
 
S
A
 
W
G
 
G
D
 
K
P
 
D
L
 
F
A
 
Q
E
 
P
F
 
Y
R
 
V
R
 
T
I
 
N
N
 
N
L
 
I
E
 
M
G
 
V
S
 
T
L
 
Q
A
 
Q
L
 
L
A
 
L
R
 
E
Q
 
A
A
 
C
Q
 
K
Q
 
H
A
 
I
G
 
K
V
 
L
Q
 
D
R
 
K
F
 
F
I
 
I
F
 
H
L
x
I
S
 
S
S
x
T
I
x
S
K
x
S
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
T
 
S
S
 
G
L
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
A
F
 
V
T
 
S
A
 
E
D
 
D
D
 
L
K
 
L
P
 
P
A
 
I
P
 
P
T
 
L
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
M
 
L
E
 
S
A
 
G
E
 
E
Q
 
H
A
 
L
L
 
C
L
 
H
E
 
V
L
 
Y
G
 
H
R
 
K
T
 
N
G
 
F
K
 
H
M
 
I
Q
 
P
V
 
I
V
 
V
I
 
I
I
 
L
R
 
R
P
x
Y
V
 
F
L
x
T
V
|
V
Y
 
Y
G