SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS05260 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS05260 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4rxtA Crystal structure of carbohydrate transporter solute binding protein arad_9553 from agrobacterium radiobacter, target efi-511541, in complex with d-arabinose
36% identity, 91% coverage: 26:310/312 of query aligns to 4:294/295 of 4rxtA

query
sites
4rxtA
E
 
E
A
 
V
Y
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
I
I
 
I
S
 
V
K
|
K
G
 
D
F
 
T
Q
 
T
H
 
S
Q
 
F
F
x
Y
W
 
W
Q
 
Q
A
 
I
V
 
V
K
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
R
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
Y
 
L
K
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
V
T
 
P
F
 
E
E
 
L
G
 
G
P
 
A
E
 
Q
T
 
A
E
|
E
A
 
T
M
 
D
V
 
V
D
 
N
K
 
G
Q
 
Q
I
 
I
D
 
S
M
 
I
L
 
L
S
 
E
A
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
G
K
 
K
P
 
P
Q
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
V
F
 
I
A
 
S
A
 
P
L
 
T
D
 
E
S
 
F
K
 
K
A
 
A
A
 
L
I
 
G
P
 
K
L
 
P
L
 
V
K
 
D
K
 
E
A
 
A
Q
 
-
A
 
A
A
 
K
K
 
S
I
 
V
P
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
G
F
 
I
D
|
D
S
 
S
G
 
G
V
 
A
D
 
D
S
 
S
D
 
K
I
 
A
P
 
F
V
 
K
T
 
S
T
 
F
A
 
L
T
 
T
T
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
T
A
 
Q
A
 
G
A
 
G
A
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
G
M
 
L
A
 
A
E
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
K
-
 
A
L
 
M
V
 
T
G
 
G
K
 
K
E
 
E
-
 
E
G
 
G
E
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
I
V
 
I
A
 
T
H
 
N
D
 
T
Q
 
P
T
 
G
S
 
A
R
 
G
T
x
S
G
 
L
V
 
E
D
 
Q
R
|
R
R
 
R
D
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
E
 
D
R
 
Q
I
 
V
K
 
K
S
 
T
A
 
K
Y
 
Y
P
 
P
K
 
G
I
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
V
S
 
A
V
 
D
Q
 
K
Y
 
Y
G
 
A
A
 
D
G
 
G
D
 
Q
Q
 
A
L
 
T
K
 
T
S
 
G
T
 
L
E
 
N
V
 
I
T
 
M
K
 
T
S
 
D
I
 
L
L
 
I
Q
 
T
A
 
A
Y
 
N
P
 
P
K
 
K
I
 
I
K
 
V
G
 
G
I
 
V
F
 
F
G
 
A
T
 
S
N
|
N
E
 
L
G
 
I
S
 
M
A
 
A
I
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
G
N
 
Q
G
 
A
V
 
I
K
 
A
E
 
E
M
 
N
K
 
K
-
 
L
-
 
S
R
 
D
K
 
K
I
 
V
I
 
K
I
 
V
I
 
I
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
S
 
S
G
 
D
K
 
D
Q
 
K
Q
 
T
K
 
L
D
 
G
A
 
F
I
 
L
R
 
K
E
 
S
G
 
G
I
 
A
M
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
L
I
 
V
T
 
V
Q
|
Q
N
 
D
P
 
P
V
 
Y
G
 
R
I
 
M
G
 
G
Y
 
Y
K
 
D
T
 
G
V
 
I
E
 
K
A
 
T
A
 
A
V
 
L
K
 
A
A
 
V
I
 
S
K
 
K
G
 
G
E
 
E
K
 
K
L
 
V
P
 
E
K
 
A
V
 
N
I
 
V
D
 
D
T
 
T
G
 
G
F
 
A
Y
 
N
W
 
L
Y
 
V
D
 
T
K
 
K
S
 
A
N
 
N
I
 
M
D
 
S
D
 
D
A
 
P
K
 
K
I
 
I
A
 
E
A
 
A
V
 
L
L
 
I

4wutA Crystal structure of an abc transporter solute binding protein (ipr025997) from agrobacterium vitis (avi_5133, target efi-511220) with bound d-fucose
35% identity, 91% coverage: 29:311/312 of query aligns to 3:290/290 of 4wutA

query
sites
4wutA
I
 
I
P
 
A
L
 
V
I
 
I
S
 
V
K
|
K
G
 
T
F
 
V
Q
 
N
H
 
S
Q
 
T
F
 
F
W
|
W
Q
 
Q
A
 
N
V
 
V
K
 
Q
A
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
D
Q
 
A
A
 
A
-
 
I
G
 
G
K
 
K
D
 
Q
Y
 
K
K
 
A
V
 
H
K
 
T
V
 
I
T
 
T
F
 
F
E
 
Q
G
 
G
P
 
P
E
 
A
T
 
A
E
|
E
A
 
S
M
 
A
V
 
I
D
 
A
K
 
D
Q
 
Q
I
 
V
D
 
N
M
 
M
L
 
V
S
 
E
A
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
N
K
 
R
K
 
K
P
 
V
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
P
L
 
S
D
 
D
S
 
P
K
 
D
A
 
A
A
 
L
I
 
V
P
 
P
L
 
A
L
 
V
K
 
K
K
 
K
A
 
A
Q
 
W
A
 
E
A
 
A
K
 
R
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
I
F
 
I
D
|
D
S
 
S
G
 
M
V
 
L
D
 
S
S
 
K
D
 
D
I
 
A
P
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
Y
V
 
Q
T
 
A
T
 
F
A
 
L
T
 
A
T
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
K
K
 
A
M
 
M
A
 
I
E
 
Q
L
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
T
E
 
E
G
 
G
E
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
S
H
 
Y
D
 
V
Q
 
A
T
 
G
S
 
A
R
 
G
T
 
S
G
 
E
V
 
I
D
 
G
R
|
R
R
 
V
D
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
T
E
 
D
R
 
Y
I
 
I
K
|
K
S
 
-
A
 
A
Y
 
N
P
x
S
K
 
K
I
 
L
K
 
Q
V
 
I
V
 
V
S
 
G
V
 
P
Q
 
Y
Y
 
Y
G
 
S
A
 
Q
G
 
S
D
 
Q
Q
 
M
L
 
A
K
 
T
S
 
A
T
 
L
E
x
N
V
 
Q
T
 
T
K
 
T
S
x
D
I
 
V
L
 
L
Q
 
A
A
 
A
Y
 
N
P
 
A
K
 
D
I
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
F
 
F
G
 
G
T
 
A
N
|
N
E
 
E
G
 
P
S
 
T
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
M
V
 
G
N
 
R
G
 
A
V
 
I
K
 
K
E
 
Q
M
 
A
K
 
G
R
 
K
-
 
A
-
 
G
K
 
K
I
 
L
I
 
V
I
 
A
I
 
I
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
S
 
G
G
 
N
K
 
Q
Q
 
D
Q
 
L
K
 
Q
D
 
E
A
 
F
I
 
V
R
 
K
E
 
D
G
 
G
I
 
T
M
 
L
A
 
E
G
 
A
A
 
T
I
 
V
T
 
V
Q
|
Q
N
 
G
P
 
S
V
 
Y
G
 
Q
I
 
M
G
 
G
Y
 
E
K
 
K
T
 
G
V
 
V
E
 
D
A
 
T
A
 
L
V
 
L
K
 
K
A
 
L
I
 
L
K
 
S
G
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
V
P
 
E
K
 
K
V
 
F
I
 
I
D
 
D
T
 
T
G
 
G
F
 
V
Y
 
V
W
 
V
Y
 
V
D
 
T
K
 
K
S
 
Q
N
 
N
I
 
I
D
 
D
D
 
K
A
 
P
K
 
E
I
 
A
A
 
K
A
 
N
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y

2ioyA Crystal structure of thermoanaerobacter tengcongensis ribose binding protein (see paper)
30% identity, 88% coverage: 29:301/312 of query aligns to 3:273/274 of 2ioyA

query
sites
2ioyA
I
 
I
P
 
G
L
 
L
I
 
V
S
 
I
K
 
S
G
 
T
F
 
L
Q
 
N
H
x
N
Q
 
P
F
|
F
W
x
F
Q
 
V
A
 
T
V
 
L
K
 
K
A
 
N
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Q
 
E
A
 
K
G
 
A
K
 
K
D
 
E
Y
 
L
K
 
G
V
 
Y
K
 
K
V
 
I
T
 
I
F
 
V
E
 
E
G
 
D
P
 
S
E
 
Q
T
 
N
E
 
D
A
 
S
M
 
-
V
 
-
D
 
S
K
 
K
Q
 
E
I
 
L
D
 
S
M
 
N
L
 
V
S
 
E
A
 
D
A
 
L
L
 
I
A
 
Q
K
 
Q
K
 
K
P
 
V
Q
 
D
A
 
V
I
 
L
G
 
L
F
 
I
A
 
N
A
 
P
L
 
V
D
 
D
S
 
S
K
 
D
A
 
A
A
 
V
I
 
V
P
 
T
L
 
A
L
 
I
K
 
K
K
 
E
A
 
A
Q
 
N
A
 
S
A
 
K
K
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
T
F
 
I
D
|
D
S
x
R
G
 
S
V
 
A
D
 
N
S
 
G
D
 
G
I
 
D
P
 
V
V
 
V
T
 
C
T
 
H
A
 
I
T
 
A
T
 
S
D
 
D
N
 
N
R
 
V
A
 
K
A
 
G
A
 
G
A
 
E
L
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
E
K
 
F
M
 
I
A
 
A
E
 
K
L
 
A
V
 
L
G
 
K
K
 
G
E
 
K
G
 
G
E
 
N
V
 
V
A
 
V
V
 
E
V
 
L
A
 
E
H
 
G
D
 
I
Q
 
P
T
 
G
S
 
A
R
 
S
T
x
A
G
 
A
V
 
R
D
 
D
R
|
R
R
 
G
D
 
K
G
 
G
F
 
F
L
 
D
E
 
E
R
 
A
I
 
I
K
 
-
S
 
A
A
 
K
Y
 
Y
P
 
P
K
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
A
V
 
K
Q
 
Q
Y
 
A
G
 
A
A
 
D
G
x
F
D
 
D
Q
 
R
L
 
S
K
 
K
S
 
G
T
 
L
E
 
S
V
 
V
T
 
M
K
 
E
S
 
N
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Q
P
 
P
K
 
K
I
 
I
K
 
D
G
 
A
I
 
V
F
 
F
G
 
A
T
 
Q
N
|
N
E
 
D
G
 
E
S
 
M
A
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
A
V
 
I
N
 
K
G
 
A
V
 
I
K
 
E
E
 
A
M
 
A
K
 
N
R
 
R
K
 
Q
-
 
G
I
 
I
I
 
I
I
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
S
 
G
G
 
T
K
 
E
Q
 
D
Q
 
A
K
 
L
D
 
K
A
 
A
I
 
I
R
 
K
E
 
E
G
 
G
I
 
K
M
 
M
A
 
A
G
 
A
A
 
T
I
 
I
T
 
A
Q
|
Q
N
 
Q
P
 
P
V
 
A
G
 
L
I
 
M
G
 
G
Y
 
S
K
 
L
T
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
M
A
 
A
V
 
D
K
 
K
A
 
Y
I
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
K
 
K
L
 
I
P
 
P
K
 
N
V
 
F
I
 
I
D
 
P
T
 
A
G
 
E
F
 
L
Y
 
K
W
 
L
Y
 
I
D
 
T
K
 
K
S
 
E
N
 
N
I
 
V

5dkvA Crystal structure of an abc transporter solute binding protein from agrobacterium vitis(avis_5339, target efi-511225) bound with alpha-d- tagatopyranose
30% identity, 77% coverage: 73:311/312 of query aligns to 52:301/303 of 5dkvA

query
sites
5dkvA
Q
 
Q
I
 
V
D
 
P
M
 
V
L
 
L
S
 
D
A
 
A
A
 
V
L
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
K
P
 
P
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
L
F
 
I
A
 
A
A
 
P
L
 
T
D
 
D
S
 
T
K
 
T
A
 
Q
A
 
L
I
 
V
P
 
Q
L
 
P
L
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
A
Q
 
A
A
 
D
A
 
A
K
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
M
V
 
I
A
 
T
F
 
V
D
|
D
S
 
T
G
 
F
V
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
Y
-
 
Q
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
G
D
 
D
S
 
G
D
 
D
I
 
F
P
 
P
V
 
L
T
 
S
T
 
Y
A
 
I
T
 
A
T
 
S
D
 
D
N
 
N
R
 
V
A
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
R
K
 
S
M
 
L
A
 
A
E
 
L
L
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
D
E
 
K
G
 
G
E
 
K
V
 
V
A
 
Y
V
 
V
V
 
S
A
 
N
H
 
V
D
 
K
Q
 
P
T
 
G
S
 
V
R
 
S
T
|
T
G
 
T
V
 
D
D
 
Q
R
|
R
R
 
E
D
 
Q
G
 
G
F
 
F
L
 
K
E
 
S
R
 
E
I
 
M
K
 
-
S
 
A
A
 
K
Y
 
H
P
 
P
K
 
G
I
 
I
K
 
T
V
 
V
V
 
L
S
 
E
V
 
T
Q
 
Q
Y
 
F
G
 
N
A
 
D
G
 
N
D
 
D
Q
 
A
L
 
N
K
 
K
S
 
A
T
 
A
E
 
S
V
 
Q
T
 
L
K
 
Q
S
 
A
I
 
V
L
 
Y
Q
 
A
A
 
R
Y
 
N
P
 
P
K
 
D
I
 
L
K
 
A
G
 
G
I
 
V
F
 
F
G
 
G
T
 
A
N
|
N
E
x
L
G
 
F
S
 
S
A
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
S
V
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
K
 
Q
E
 
Q
M
 
A
K
 
G
R
 
Q
K
 
S
-
 
G
-
 
T
I
 
I
I
 
K
I
 
V
I
 
V
G
 
A
Y
 
F
D
|
D
S
 
A
G
 
P
K
 
G
Q
 
S
Q
 
V
K
 
V
D
 
D
A
 
N
I
 
L
R
 
K
E
 
S
G
 
G
I
 
L
M
 
I
A
 
D
G
 
F
A
 
A
I
 
I
T
 
A
Q
|
Q
N
 
H
P
 
P
V
 
A
G
 
E
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
K
 
Y
T
 
G
V
 
V
E
 
I
A
 
S
A
 
A
V
 
Y
K
 
A
A
 
H
I
 
L
K
 
T
G
 
G
E
 
Q
K
 
S
L
 
I
P
 
P
K
 
T
V
 
K
I
 
I
D
 
G
T
 
T
G
 
G
F
 
F
Y
 
T
W
 
V
Y
 
I
D
 
N
K
 
K
S
 
S
N
 
N
I
 
V
D
 
T
D
 
D
A
 
P
K
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
R
V
 
F
L
 
I
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

5dteB Crystal structure of an abc transporter periplasmic solute binding protein (ipr025997) from actinobacillus succinogenes 130z(asuc_0081, target efi-511065) with bound d-allose
29% identity, 83% coverage: 29:286/312 of query aligns to 5:269/287 of 5dteB

query
sites
5dteB
I
 
I
P
 
A
L
 
L
I
 
L
S
 
M
K
|
K
G
 
T
F
 
L
Q
 
S
H
x
N
Q
 
E
F
x
Y
W
 
F
Q
 
I
A
 
S
V
 
M
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Q
 
E
A
 
T
G
 
A
K
 
K
D
 
Q
Y
 
K
K
 
D
V
 
I
K
 
D
V
 
L
T
 
I
F
 
V
E
 
Q
G
 
V
P
 
A
E
 
E
T
 
K
E
 
E
A
 
D
M
 
S
V
 
T
D
 
E
K
 
Q
Q
 
L
I
 
V
D
 
G
M
 
L
L
 
V
S
 
E
A
 
N
A
 
M
L
 
I
A
 
A
K
 
K
K
 
K
P
 
V
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
I
F
 
V
A
 
T
A
 
P
L
 
N
D
 
D
S
 
S
K
 
I
A
 
A
A
 
F
I
 
I
P
 
P
L
 
A
L
 
F
K
 
Q
K
 
K
A
 
A
Q
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
D
F
 
L
D
|
D
S
 
V
G
 
R
V
 
L
D
 
D
S
 
A
D
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
I
 
L
P
 
K
V
 
F
T
 
N
T
 
Y
A
 
V
T
 
G
T
 
V
D
 
D
N
 
N
R
 
F
A
 
N
A
 
G
A
 
G
A
 
Y
L
 
L
A
 
E
A
 
A
D
 
K
K
 
N
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
E
 
K
G
 
G
E
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
L
A
 
E
H
 
G
D
 
I
Q
 
P
T
 
G
S
 
V
R
 
D
T
x
N
G
 
G
V
 
E
D
 
Q
R
|
R
R
 
K
D
 
G
G
 
G
F
 
A
L
 
L
E
 
K
R
 
A
I
 
F
K
 
-
S
 
A
A
 
E
Y
 
Y
P
 
P
K
 
D
I
 
I
K
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
A
V
 
S
Q
 
Q
Y
 
S
G
 
A
A
 
N
G
x
W
D
 
E
Q
 
T
L
 
E
K
 
Q
S
 
A
T
 
L
E
 
N
V
 
V
T
 
T
K
 
T
S
 
N
I
 
I
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
Y
 
N
P
 
P
K
 
N
I
 
I
K
 
N
G
 
G
I
 
I
F
 
F
G
 
A
T
 
A
N
 
N
E
 
D
G
 
N
S
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
A
V
 
V
N
 
T
G
 
A
V
 
V
K
 
E
E
 
N
-
 
A
-
 
G
M
 
L
K
 
A
R
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
L
I
 
V
I
 
S
G
 
G
Y
 
Y
D
|
D
S
 
G
G
 
I
K
 
P
Q
 
L
Q
 
A
K
 
I
D
 
E
A
 
Y
I
 
V
R
 
K
E
 
Q
G
 
G
I
 
K
M
 
M
A
 
Q
G
 
N
A
 
T
I
 
I
T
 
D
Q
|
Q
N
 
L
P
 
P
V
 
K
G
 
K
I
 
Q
G
 
V
Y
 
A
K
 
I
T
 
A
V
 
I
E
 
E
A
 
H
A
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
Q
I
 
I
K
 
N
G
 
K
E
 
Q
K
 
E
L
 
I
P
 
P

6gt9A Crystal structure of ganp, a glucose-galactose binding protein from geobacillus stearothermophilus, in complex with galactose
27% identity, 86% coverage: 25:291/312 of query aligns to 4:271/283 of 6gt9A

query
sites
6gt9A
Q
 
K
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
-
 
H
I
 
F
P
 
V
L
 
L
I
 
V
S
 
P
K
x
E
G
 
E
F
 
L
Q
 
D
H
x
N
Q
 
D
F
x
Y
W
|
W
Q
 
R
A
 
L
V
 
V
K
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
K
Q
 
A
A
 
A
G
 
A
K
 
K
D
 
E
Y
 
L
K
 
G
V
 
V
K
 
D
V
 
L
T
 
E
F
 
Y
E
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
R
T
 
-
E
 
Q
A
 
A
M
 
N
V
 
I
D
 
D
K
 
E
Q
 
H
I
 
L
D
 
R
M
 
I
L
 
L
S
 
K
A
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
A
K
 
A
K
 
K
P
 
V
Q
 
D
A
 
G
I
 
I
G
 
I
F
 
T
A
 
Q
A
 
G
L
 
L
D
 
T
S
 
E
K
 
A
A
 
E
A
 
F
I
 
V
P
 
P
L
 
V
L
 
I
K
 
N
K
 
E
A
 
I
Q
 
T
A
 
D
A
 
K
K
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
T
F
 
I
D
|
D
S
 
T
G
 
D
V
 
A
D
 
P
S
 
T
D
 
S
I
 
R
P
 
R
V
 
V
T
 
A
T
 
Y
A
 
V
T
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
Y
A
 
Y
A
 
A
A
 
G
A
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
R
K
 
A
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
D
V
 
T
G
 
K
K
 
G
E
 
K
G
 
A
E
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
A
 
T
H
 
G
D
 
S
Q
 
L
T
 
T
S
 
A
R
 
A
T
x
H
G
 
Q
V
 
Q
D
 
L
R
|
R
R
 
V
D
 
R
G
 
G
F
 
F
L
 
E
E
 
D
R
 
A
I
 
V
K
 
R
S
 
Q
A
 
E
Y
 
-
P
 
K
K
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
A
V
 
I
Q
 
E
Y
 
E
G
 
S
A
 
H
G
x
I
D
 
T
Q
 
R
L
 
V
K
 
Q
S
 
A
T
 
A
E
 
E
V
 
K
T
 
A
K
 
Y
S
 
T
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
A
 
K
Y
 
H
P
 
P
K
 
D
I
 
V
K
 
N
G
 
A
I
 
F
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
N
x
S
E
x
A
G
 
L
S
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
A
N
 
K
G
 
V
V
 
V
K
 
E
E
 
Q
M
 
F
K
 
H
R
 
R
-
 
E
-
 
Q
K
 
K
I
 
T
I
 
Y
I
 
I
I
 
I
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
S
 
T
G
 
L
K
 
P
Q
 
E
Q
 
T
K
 
I
D
 
R
A
 
Y
I
 
L
R
 
Q
E
 
K
G
 
G
I
 
T
M
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
T
I
 
V
T
 
V
Q
|
Q
N
 
E
P
 
P
V
 
Y
G
 
E
I
 
M
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
T
 
A
V
 
V
E
 
K
A
 
M
A
 
M
V
 
A
K
 
E
A
 
I
I
 
V
K
 
A
G
 
G
E
 
K
K
 
D
L
 
V
P
 
P
K
 
V
V
 
V
I
 
T
D
 
N
T
 
T

7e7mC Crystal structure analysis of the streptococcus agalactiae ribose binding protein rbsb
28% identity, 85% coverage: 37:302/312 of query aligns to 19:280/284 of 7e7mC

query
sites
7e7mC
Q
 
N
H
x
N
Q
 
P
F
x
Y
W
x
F
Q
 
V
A
 
A
V
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
A
 
I
D
 
D
Q
 
K
A
 
Y
G
 
A
K
 
S
D
 
N
Y
 
K
K
 
K
V
 
I
K
 
S
V
 
I
T
 
K
F
 
V
E
 
A
G
 
D
P
 
A
E
 
Q
T
 
D
E
 
D
A
 
A
M
 
A
V
 
-
D
 
-
K
 
R
Q
 
Q
I
 
A
D
 
D
M
 
D
L
 
V
S
 
Q
A
 
N
A
 
F
L
 
I
A
 
S
K
 
Q
K
 
N
P
 
V
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
L
F
 
I
A
 
N
A
 
P
L
 
V
D
 
D
S
 
S
K
 
K
A
 
A
A
 
I
I
 
V
P
 
T
L
 
A
L
 
I
K
 
K
K
 
S
A
 
A
Q
 
N
A
 
N
A
 
A
K
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
L
F
 
M
D
|
D
S
x
R
G
 
G
V
 
S
D
 
E
S
 
G
D
 
G
I
 
K
P
 
V
V
 
L
T
 
T
T
 
T
A
 
V
T
 
A
T
 
S
D
 
D
N
 
N
R
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
K
L
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
Y
M
 
A
A
 
V
E
 
K
L
 
K
V
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
K
G
 
A
E
 
K
V
 
A
A
 
F
V
 
E
V
 
L
A
 
S
H
 
G
D
 
V
Q
 
P
T
 
G
S
 
A
R
 
S
T
 
A
G
 
T
V
 
V
D
 
D
R
|
R
R
 
G
D
 
K
G
 
G
F
 
F
L
 
H
E
 
S
R
 
V
I
 
A
K
 
K
S
 
S
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
K
 
K
I
 
L
K
 
D
V
 
M
V
 
L
S
 
S
V
 
S
Q
 
Q
Y
 
S
G
 
A
A
 
N
G
x
F
D
 
D
Q
 
R
L
 
A
K
 
K
S
 
A
T
 
L
E
 
N
V
 
T
T
 
T
K
 
Q
S
 
N
I
 
M
L
 
I
Q
 
Q
A
 
G
Y
 
H
P
 
K
K
 
D
I
 
V
K
 
Q
G
 
I
I
 
I
F
 
F
G
 
A
T
 
Q
N
|
N
E
 
D
G
 
E
S
 
M
A
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
A
V
 
A
N
 
Q
G
 
A
V
 
V
K
 
K
E
 
S
M
 
A
K
 
G
-
 
L
R
 
Q
K
 
N
I
 
V
I
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
G
Y
 
I
D
|
D
S
 
G
G
 
Q
K
 
P
Q
 
D
Q
 
A
K
 
H
D
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
K
E
 
K
G
 
G
I
 
D
M
 
I
A
 
S
G
 
A
A
 
T
I
 
I
T
 
A
Q
|
Q
N
 
Q
P
 
P
V
 
A
G
 
K
I
 
M
G
 
G
Y
 
E
K
 
I
T
 
A
V
 
I
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
V
 
I
K
 
D
A
 
Y
I
 
Y
K
 
K
G
 
G
E
 
K
K
 
K
L
 
V
P
 
E
K
 
K
V
 
E
I
 
T
D
 
I
T
 
S
G
 
P
F
 
I
Y
 
Y
W
 
L
Y
 
V
D
 
T
K
 
K
S
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
E

6guqA Crystal structure of ganp, a glucose-galactose binding protein from geobacillus stearothermophilus, in complex with glucose
27% identity, 84% coverage: 31:291/312 of query aligns to 6:266/278 of 6guqA

query
sites
6guqA
L
 
L
I
 
V
S
 
P
K
x
E
G
 
E
F
 
L
Q
 
D
H
x
N
Q
 
D
F
x
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
L
V
 
V
K
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
K
Q
 
A
A
 
A
G
 
A
K
 
K
D
 
E
Y
 
L
K
 
G
V
 
V
K
 
D
V
 
L
T
 
E
F
 
Y
E
 
I
G
 
G
P
 
P
E
 
R
T
 
-
E
 
Q
A
 
A
M
 
N
V
 
I
D
 
D
K
 
E
Q
 
H
I
 
L
D
 
R
M
 
I
L
 
L
S
 
K
A
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
A
K
 
A
K
 
K
P
 
V
Q
 
D
A
 
G
I
 
I
G
 
I
F
 
T
A
 
Q
A
 
G
L
 
L
D
 
T
S
 
E
K
 
A
A
 
E
A
 
F
I
 
V
P
 
P
L
 
V
L
 
I
K
 
N
K
 
E
A
 
I
Q
 
T
A
 
D
A
 
K
K
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
T
F
 
I
D
|
D
S
 
T
G
 
D
V
 
A
D
 
P
S
 
T
D
 
S
I
 
R
P
 
R
V
 
V
T
 
A
T
 
Y
A
 
V
T
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
Y
A
 
Y
A
 
A
A
 
G
A
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
R
K
 
A
M
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
D
V
 
T
G
 
K
K
 
G
E
 
K
G
 
A
E
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
A
 
T
H
 
G
D
 
S
Q
 
L
T
 
T
S
 
A
R
 
A
T
x
H
G
 
Q
V
 
Q
D
 
L
R
|
R
R
 
V
D
 
R
G
 
G
F
 
F
L
 
E
E
 
D
R
 
A
I
 
V
K
 
R
S
 
Q
A
 
E
Y
 
-
P
 
K
K
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
A
V
 
I
Q
 
E
Y
 
E
G
 
S
A
 
H
G
x
I
D
 
T
Q
 
R
L
 
V
K
 
Q
S
 
A
T
 
A
E
 
E
V
 
K
T
 
A
K
 
Y
S
 
T
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
A
 
K
Y
 
H
P
 
P
K
 
D
I
 
V
K
 
N
G
 
A
I
 
F
F
 
Y
G
 
G
T
 
T
N
x
S
E
x
A
G
 
L
S
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
A
N
 
K
G
 
V
V
 
V
K
 
E
E
 
Q
M
 
F
K
 
H
R
 
R
-
 
E
-
 
Q
K
 
K
I
 
T
I
 
Y
I
 
I
I
 
I
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
S
 
T
G
 
L
K
 
P
Q
 
E
Q
 
T
K
 
I
D
 
R
A
 
Y
I
 
L
R
 
Q
E
 
K
G
 
G
I
 
T
M
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
T
I
 
V
T
 
V
Q
|
Q
N
 
E
P
 
P
V
 
Y
G
 
E
I
 
M
G
 
G
Y
 
Y
K
 
K
T
 
A
V
 
V
E
 
K
A
 
M
A
 
M
V
 
A
K
 
E
A
 
I
I
 
V
K
 
A
G
 
G
E
 
K
K
 
D
L
 
V
P
 
P
K
 
V
V
 
V
I
 
T
D
 
N
T
 
T

3ksmA Crystal structure of abc-type sugar transport system, periplasmic component from hahella chejuensis
25% identity, 84% coverage: 31:292/312 of query aligns to 5:270/276 of 3ksmA

query
sites
3ksmA
L
 
L
I
 
V
S
 
L
K
|
K
G
 
G
F
 
D
Q
 
S
H
 
N
Q
 
A
F
x
Y
W
 
W
Q
 
R
A
 
Q
V
 
V
K
 
Y
A
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
Q
 
K
A
 
A
G
 
A
K
 
D
D
 
E
Y
 
A
K
 
G
V
 
V
K
 
T
V
 
L
T
 
L
F
 
H
E
 
R
G
 
S
P
 
T
E
 
K
T
 
D
E
 
D
A
 
G
M
 
D
V
 
I
D
 
A
K
 
G
Q
 
Q
I
 
I
D
 
Q
M
 
I
L
 
L
S
 
S
A
 
Y
A
 
H
L
 
L
A
 
S
K
 
Q
-
 
A
K
 
P
P
 
P
Q
 
D
A
 
A
I
 
L
G
 
I
F
 
L
A
 
A
A
 
P
L
 
N
D
 
S
S
 
A
K
 
E
A
 
D
A
 
L
I
 
T
P
 
P
L
 
S
L
 
V
K
 
A
K
 
Q
A
 
Y
Q
 
R
A
 
A
A
 
R
K
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
L
A
 
V
F
 
V
D
|
D
S
 
S
G
 
D
V
 
L
D
 
A
S
 
G
D
 
D
I
 
A
P
 
H
V
 
Q
T
 
G
T
 
L
A
 
V
T
 
A
T
 
T
D
 
D
N
 
N
-
 
Y
-
 
A
R
 
A
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
R
A
 
A
D
 
L
K
 
L
M
 
A
A
 
T
E
 
L
L
 
D
V
 
L
G
 
S
K
 
K
E
 
E
G
 
R
E
 
N
V
 
I
A
 
A
V
 
L
V
 
L
A
 
R
H
x
L
D
 
R
Q
 
A
T
 
G
S
x
N
R
 
A
T
x
S
G
 
T
V
 
D
D
 
Q
R
|
R
R
 
E
D
 
Q
G
 
G
F
 
F
L
 
L
E
 
D
R
 
V
I
 
L
K
 
R
S
 
K
A
 
-
Y
 
H
P
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
R
V
 
I
V
 
I
S
 
A
V
 
A
Q
 
P
Y
 
Y
G
 
A
A
 
G
G
 
D
D
 
D
Q
 
R
L
 
G
K
 
A
S
 
A
T
 
R
E
 
S
V
 
E
T
 
M
K
 
L
S
 
R
I
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
Y
 
T
P
 
P
K
 
T
I
 
I
K
 
D
G
 
G
I
 
L
F
 
F
G
 
T
T
 
P
N
|
N
E
 
E
G
 
S
S
 
T
A
 
T
I
 
I
G
 
G
V
 
A
V
 
L
N
 
V
G
 
A
V
 
I
K
 
R
E
 
Q
-
 
S
-
 
G
M
 
M
K
 
S
R
 
K
K
 
Q
I
 
F
I
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
Y
 
F
D
|
D
S
 
Q
G
 
T
K
 
E
Q
 
E
Q
 
L
K
 
E
D
 
A
A
 
A
I
 
M
R
 
Y
E
 
A
G
 
G
I
 
E
M
 
I
A
 
S
G
 
N
A
 
L
I
 
V
T
 
V
Q
|
Q
N
 
N
P
 
P
V
 
E
G
 
Y
I
 
M
G
 
G
Y
 
Y
K
 
L
T
 
A
V
 
V
E
 
Q
A
 
R
A
 
A
V
 
L
K
 
D
A
 
L
I
 
V
K
 
R
G
 
G
E
 
K
K
 
P
L
 
I
P
 
P
K
 
A
V
 
F
I
 
T
D
 
D
T
 
T
G
 
G

5hqjA Crystal structure of abc transporter solute binding protein b1g1h7 from burkholderia graminis c4d1m, target efi-511179, in complex with d-arabinose
28% identity, 88% coverage: 27:301/312 of query aligns to 10:284/289 of 5hqjA

query
sites
5hqjA
A
 
A
Y
 
V
I
 
I
P
 
P
L
x
K
I
 
V
S
 
A
K
 
V
G
 
P
F
|
F
Q
 
F
H
 
D
Q
 
D
F
 
C
W
 
N
Q
 
K
A
 
G
V
 
A
K
 
K
A
 
T
G
 
A
A
 
A
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
K
 
V
D
 
K
Y
 
Y
K
 
Q
V
 
W
K
 
V
V
 
V
T
 
-
F
 
-
E
 
-
G
 
-
P
 
P
E
 
Q
T
 
N
E
 
-
A
 
T
M
 
Q
V
 
G
D
 
S
K
 
T
Q
 
Q
I
 
V
D
 
Q
M
 
I
L
 
I
S
 
E
A
 
D
A
 
L
L
 
I
A
 
S
K
 
R
K
 
H
P
 
V
Q
 
D
A
 
G
I
 
I
G
 
A
F
 
I
A
 
S
A
 
V
L
 
N
D
 
E
S
 
P
K
 
K
A
 
S
A
 
V
I
 
E
P
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
K
 
R
A
 
A
Q
 
E
A
 
Q
A
 
S
K
 
G
I
 
I
P
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
T
F
 
Y
D
|
D
S
 
S
G
 
-
V
 
-
D
 
-
S
 
-
D
 
D
I
 
S
P
 
P
V
 
K
T
 
S
T
 
G
A
 
R
T
 
S
-
 
M
-
 
Y
-
 
I
-
 
G
T
 
T
D
 
N
N
 
N
R
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
T
A
 
M
A
 
A
D
 
E
K
 
T
M
 
M
A
 
G
E
 
K
L
 
A
V
 
L
G
 
N
K
 
G
E
 
Q
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
A
 
T
H
 
G
D
 
-
Q
 
Q
T
 
L
S
 
G
R
 
A
T
 
V
G
x
N
V
 
L
D
 
N
R
 
E
R
|
R
D
 
I
G
 
A
F
 
G
L
 
I
E
 
K
R
 
K
I
 
G
K
 
L
S
 
A
A
 
K
Y
 
Y
P
 
P
K
 
G
I
 
I
K
 
K
V
 
V
V
 
V
S
 
E
V
 
T
Q
 
Q
Y
 
G
G
 
T
A
 
D
G
 
D
D
 
D
Q
 
L
L
 
A
K
 
R
S
 
G
T
 
V
E
 
S
V
 
V
T
 
V
K
 
E
S
 
T
I
 
T
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
Y
 
H
P
 
P
K
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
F
 
F
G
 
G
T
 
V
N
x
S
E
x
Q
-
 
V
-
 
G
G
 
G
S
 
P
A
 
A
I
 
V
G
 
A
V
 
K
V
 
V
N
 
L
G
 
N
V
 
T
K
 
R
E
 
E
-
 
F
-
 
G
-
 
A
M
 
M
K
 
K
R
 
G
K
 
K
I
 
L
I
 
E
I
 
V
I
 
L
G
 
A
Y
 
F
D
|
D
S
 
D
G
 
L
K
 
P
Q
 
D
Q
 
T
K
 
L
D
 
K
A
 
G
I
 
L
R
 
K
E
 
D
G
 
G
I
 
Y
M
 
I
A
 
Q
G
 
G
A
 
I
I
 
M
T
 
V
Q
|
Q
N
 
R
P
 
P
V
 
V
G
 
T
I
 
M
G
 
G
Y
 
S
K
 
L
T
 
A
V
 
V
E
 
D
A
 
H
A
 
L
V
 
V
K
 
A
A
 
Q
I
 
I
K
 
Q
G
 
G
-
 
Q
E
 
E
K
 
G
L
 
Q
P
 
P
K
 
K
V
 
D
I
 
I
D
 
D
T
 
T
G
 
G
F
 
V
Y
 
T
W
 
V
Y
 
V
D
 
T
K
 
K
S
 
D
N
 
N
I
 
M

2h3hA Crystal structure of the liganded form of thermotoga maritima glucose binding protein (see paper)
29% identity, 76% coverage: 38:273/312 of query aligns to 12:246/313 of 2h3hA

query
sites
2h3hA
H
 
H
Q
 
P
F
 
Y
W
 
W
Q
 
S
A
 
Q
V
 
V
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
K
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
A
Y
 
L
K
 
G
V
 
V
K
 
D
V
 
T
T
 
K
F
 
F
E
 
F
G
 
V
P
 
P
E
 
Q
T
 
K
E
 
E
A
 
D
M
 
-
V
 
I
D
 
N
K
 
A
Q
 
Q
I
 
L
D
 
Q
M
 
M
L
 
L
S
 
E
A
 
S
A
 
F
L
 
I
A
 
A
K
 
E
K
 
G
P
 
V
Q
 
N
A
 
G
I
 
I
G
 
A
F
 
I
A
 
A
A
 
P
L
 
S
D
 
D
S
 
P
K
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
I
P
 
P
L
 
T
L
 
I
K
 
K
K
 
K
A
 
A
Q
 
L
A
 
E
A
 
M
K
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
T
F
 
L
D
|
D
S
 
T
G
 
D
V
 
S
D
 
P
S
 
D
D
 
S
I
 
G
P
 
R
V
 
Y
T
 
V
T
 
Y
A
 
I
T
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
Y
A
 
Q
A
 
A
A
 
G
A
 
Y
L
 
T
A
 
A
A
 
G
D
 
L
K
 
I
M
 
M
A
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
L
G
 
G
K
 
G
E
 
K
G
 
G
E
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
V
 
G
A
 
T
H
 
G
D
 
S
Q
 
L
T
 
T
S
 
A
R
 
M
T
x
N
G
 
S
V
 
L
D
 
Q
R
|
R
R
 
I
D
 
Q
G
 
G
F
 
F
L
 
K
E
 
D
R
 
A
I
 
I
K
 
K
S
 
D
A
 
S
Y
 
-
P
 
-
K
 
E
I
 
I
K
 
E
V
 
I
V
 
V
S
 
D
V
 
I
Q
 
L
Y
 
N
G
 
D
A
 
E
G
x
E
D
 
D
Q
 
G
L
 
A
K
 
R
S
 
A
T
 
V
E
 
S
V
 
L
T
 
A
K
 
E
S
 
A
I
 
A
L
 
L
Q
 
N
A
 
A
Y
 
H
P
 
P
K
 
D
I
 
L
K
 
D
G
 
A
I
 
F
F
 
F
G
 
G
-
 
V
-
x
Y
-
x
A
-
 
Y
T
 
N
N
 
G
E
 
P
G
 
A
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
G
 
V
V
 
V
V
 
K
N
 
N
G
 
A
V
 
G
K
 
K
E
 
V
M
 
G
K
 
K
R
 
V
K
 
K
I
 
I
I
 
V
I
 
C
I
 
-
G
 
-
Y
 
F
D
|
D
S
 
T
G
 
T
K
 
P
Q
 
D
Q
 
I
K
 
L
D
 
Q
A
 
Y
I
 
V
R
 
K
E
 
E
G
 
G
I
 
V
M
 
I
A
 
Q
G
 
A
A
 
T
I
 
M
T
 
G
Q
|
Q
N
 
R
P
 
P
V
 
Y
G
 
M
I
 
M
G
 
G
Y
 
Y
K
 
L
T
 
S
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3c6qC Apo and ligand-bound form of a thermophilic glucose/xylose binding protein
28% identity, 76% coverage: 38:273/312 of query aligns to 12:246/305 of 3c6qC

query
sites
3c6qC
H
 
H
Q
 
P
F
 
Y
W
|
W
Q
 
S
A
 
Q
V
 
V
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
V
D
 
K
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
A
Y
 
L
K
 
G
V
 
V
K
 
D
V
 
T
T
 
K
F
 
F
E
 
F
G
 
V
P
 
P
E
 
Q
T
 
-
E
 
K
A
 
C
M
 
D
V
 
I
D
 
N
K
 
A
Q
 
Q
I
 
L
D
 
Q
M
 
M
L
 
L
S
 
E
A
 
S
A
 
F
L
 
I
A
 
A
K
 
E
K
 
G
P
 
V
Q
 
N
A
 
G
I
 
I
G
 
A
F
 
I
A
 
A
A
 
P
L
 
S
D
 
D
S
 
P
K
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
I
P
 
P
L
 
T
L
 
I
K
 
K
K
 
K
A
 
A
Q
 
L
A
 
E
A
 
M
K
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
T
F
 
L
D
|
D
S
 
T
G
 
D
V
 
S
D
 
P
S
 
D
D
 
S
I
 
G
P
 
R
V
 
Y
T
 
V
T
 
Y
A
 
I
T
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
Y
A
 
Q
A
 
A
A
 
G
A
 
Y
L
 
T
A
 
A
A
 
G
D
 
L
K
 
I
M
 
M
A
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
L
G
 
G
K
 
G
E
 
K
G
 
G
E
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
V
 
G
A
 
T
H
 
G
D
 
S
Q
 
L
T
 
T
S
 
A
R
 
M
T
x
N
G
 
S
V
 
L
D
 
Q
R
|
R
R
 
I
D
 
Q
G
 
G
F
 
F
L
 
K
E
 
D
R
 
A
I
 
I
K
 
K
S
 
D
A
 
S
Y
 
-
P
 
-
K
 
E
I
 
I
K
 
E
V
 
I
V
 
V
S
 
D
V
 
I
Q
 
L
Y
 
N
G
 
D
A
 
C
G
x
E
D
 
D
Q
 
G
L
 
A
K
 
R
S
 
A
T
 
V
E
 
S
V
 
L
T
 
A
K
 
E
S
 
A
I
 
A
L
 
L
Q
 
N
A
 
A
Y
 
H
P
 
P
K
 
D
I
 
L
K
 
D
G
 
A
I
 
F
F
 
F
G
 
G
-
 
V
-
x
Y
-
x
A
-
 
Y
T
 
N
N
 
G
E
 
P
G
 
A
S
 
Q
A
 
A
I
 
L
G
 
V
V
 
V
V
 
K
N
 
N
G
 
A
V
 
G
K
 
K
E
 
V
M
 
G
K
 
K
R
 
V
K
 
K
I
 
I
I
 
V
I
 
C
I
 
-
G
 
-
Y
 
F
D
|
D
S
 
T
G
 
T
K
 
P
Q
 
D
Q
 
I
K
 
L
D
 
Q
A
 
Y
I
 
V
R
 
K
E
 
E
G
 
G
I
 
V
M
 
I
A
 
Q
G
 
A
A
 
T
I
 
M
T
 
G
Q
|
Q
N
 
R
P
 
P
V
 
Y
G
 
M
I
 
M
G
 
G
Y
 
Y
K
 
L
T
 
S
V
 
V

Sites not aligning to the query:

8wlbA X-ray structure of enterobacter cloacae allose-binding protein in complex with d-psicose (see paper)
28% identity, 82% coverage: 31:286/312 of query aligns to 6:271/288 of 8wlbA

query
sites
8wlbA
L
 
V
I
 
V
S
 
L
K
|
K
G
 
T
F
 
L
Q
 
S
H
x
N
Q
 
P
F
|
F
W
|
W
Q
 
V
A
 
D
V
 
M
K
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
I
D
 
E
Q
 
D
A
 
E
G
 
A
K
 
K
D
 
T
Y
 
L
K
 
G
V
 
V
K
 
S
V
 
V
T
 
D
F
 
I
E
 
F
G
 
A
P
 
S
E
 
P
T
 
S
E
 
E
A
 
G
M
 
D
V
 
F
D
 
Q
K
 
S
Q
 
Q
I
 
L
D
 
Q
M
 
L
L
 
F
S
 
E
A
 
D
A
 
L
L
 
S
A
 
N
K
 
K
K
 
K
P
 
Y
Q
 
K
A
 
G
I
 
I
G
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
P
L
 
L
D
 
S
S
 
S
K
 
V
A
 
N
A
 
L
I
 
V
P
 
M
L
 
P
L
 
V
K
 
A
K
 
R
A
 
A
Q
 
W
A
 
Q
A
 
K
K
 
G
I
 
L
P
 
Y
V
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
L
D
|
D
S
x
E
G
 
K
V
 
I
D
 
D
S
 
M
D
 
D
I
 
N
P
 
L
V
 
K
T
 
K
T
 
A
A
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
K
A
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
F
M
 
I
A
 
I
E
 
N
L
 
K
V
 
L
G
 
G
K
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
A
 
E
H
 
G
D
 
K
Q
 
A
T
 
G
S
 
N
R
 
A
T
x
S
G
 
G
V
 
E
D
 
A
R
|
R
R
 
R
D
 
N
G
 
G
F
 
A
L
 
T
E
 
E
R
 
A
I
 
F
K
 
K
S
 
K
A
 
A
Y
 
N
P
 
-
K
 
Q
I
 
I
K
 
K
V
 
L
V
 
V
S
 
A
V
 
S
Q
 
Q
Y
 
P
G
 
A
A
 
D
G
 
W
D
 
D
Q
 
R
L
 
I
K
 
K
S
 
A
T
 
L
E
 
D
V
 
V
T
 
A
K
 
T
S
 
N
I
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
R
Y
 
N
P
 
P
K
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
A
I
 
F
F
 
Y
G
 
C
T
 
A
N
|
N
E
 
D
G
 
T
S
 
M
A
 
A
I
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
A
N
 
Q
G
 
A
V
 
V
K
 
A
E
 
N
M
 
A
K
 
G
R
 
K
-
 
I
-
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
L
I
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
T
D
|
D
S
 
G
G
 
I
K
 
P
Q
 
E
Q
 
A
K
 
R
D
 
K
A
 
M
I
 
V
R
 
E
E
 
A
G
 
G
I
 
Q
M
 
M
A
 
T
G
 
A
A
 
T
I
 
V
T
 
A
Q
|
Q
N
 
N
P
 
P
V
 
A
G
 
D
I
 
I
G
 
G
Y
 
A
K
 
T
T
 
G
V
 
L
E
 
K
A
 
L
A
 
M
V
 
V
K
 
D
A
 
A
I
 
A
K
 
K
-
 
T
G
 
G
E
 
K
K
 
V
L
 
I
P
 
P

8wl9A X-ray structure of enterobacter cloacae allose-binding protein in complex with d-ribose (see paper)
28% identity, 82% coverage: 31:286/312 of query aligns to 6:271/288 of 8wl9A

query
sites
8wl9A
L
 
V
I
 
V
S
 
L
K
 
K
G
 
T
F
 
L
Q
 
S
H
x
N
Q
 
P
F
|
F
W
 
W
Q
 
V
A
 
D
V
 
M
K
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
I
D
 
E
Q
 
D
A
 
E
G
 
A
K
 
K
D
 
T
Y
 
L
K
 
G
V
 
V
K
 
S
V
 
V
T
 
D
F
 
I
E
 
F
G
 
A
P
 
S
E
 
P
T
 
S
E
 
E
A
 
G
M
 
D
V
 
F
D
 
Q
K
 
S
Q
 
Q
I
 
L
D
 
Q
M
 
L
L
 
F
S
 
E
A
 
D
A
 
L
L
 
S
A
 
N
K
 
K
K
 
K
P
 
Y
Q
 
K
A
 
G
I
 
I
G
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
P
L
 
L
D
 
S
S
 
S
K
 
V
A
 
N
A
 
L
I
 
V
P
 
M
L
 
P
L
 
V
K
 
A
K
 
R
A
 
A
Q
 
W
A
 
Q
A
 
K
K
 
G
I
 
L
P
 
Y
V
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
L
D
|
D
S
 
E
G
 
K
V
 
I
D
 
D
S
 
M
D
 
D
I
 
N
P
 
L
V
 
K
T
 
K
T
 
A
A
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
F
-
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
K
A
 
G
A
 
A
D
 
D
K
 
F
M
 
I
A
 
I
E
 
N
L
 
K
V
 
L
G
 
G
K
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
A
 
E
H
 
G
D
 
K
Q
 
A
T
 
G
S
 
N
R
 
A
T
 
S
G
 
G
V
 
E
D
 
A
R
|
R
R
 
R
D
 
N
G
 
G
F
 
A
L
 
T
E
 
E
R
 
A
I
 
F
K
 
K
S
 
K
A
 
A
Y
 
N
P
 
-
K
 
Q
I
 
I
K
 
K
V
 
L
V
 
V
S
 
A
V
 
S
Q
 
Q
Y
 
P
G
 
A
A
 
D
G
x
W
D
 
D
Q
 
R
L
 
I
K
 
K
S
 
A
T
 
L
E
 
D
V
 
V
T
 
A
K
 
T
S
 
N
I
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
R
Y
 
N
P
 
P
K
 
N
I
 
L
K
 
K
G
 
A
I
 
F
F
 
Y
G
 
C
T
 
A
N
|
N
E
 
D
G
 
T
S
 
M
A
 
A
I
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
A
N
 
Q
G
 
A
V
 
V
K
 
A
E
 
N
M
 
A
K
 
G
R
 
K
-
 
I
-
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
L
I
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
T
D
|
D
S
 
G
G
 
I
K
 
P
Q
 
E
Q
 
A
K
 
R
D
 
K
A
 
M
I
 
V
R
 
E
E
 
A
G
 
G
I
 
Q
M
 
M
A
 
T
G
 
A
A
 
T
I
 
V
T
 
A
Q
|
Q
N
 
N
P
 
P
V
 
A
G
 
D
I
 
I
G
 
G
Y
 
A
K
 
T
T
 
G
V
 
L
E
 
K
A
 
L
A
 
M
V
 
V
K
 
D
A
 
A
I
 
A
K
 
K
-
 
T
G
 
G
E
 
K
K
 
V
L
 
I
P
 
P

5xssA Xylfii molecule (see paper)
29% identity, 82% coverage: 29:283/312 of query aligns to 6:260/274 of 5xssA

query
sites
5xssA
I
 
I
P
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
K
x
H
G
 
I
F
 
K
Q
 
T
H
 
N
Q
 
P
F
 
Y
W
|
W
Q
 
L
A
 
D
V
 
I
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
E
Q
 
R
A
 
A
G
 
A
K
 
K
D
 
E
Y
 
R
K
 
G
V
 
A
K
 
V
V
 
V
T
 
E
F
 
F
E
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
T
T
 
T
E
 
A
A
 
S
M
 
T
V
 
E
D
 
D
-
 
G
-
 
L
K
 
K
Q
 
L
I
 
F
D
 
D
M
 
M
L
 
-
S
 
-
A
 
A
A
 
T
L
 
S
A
 
A
K
 
K
K
 
V
P
 
S
Q
 
G
A
 
I
I
 
I
G
 
T
F
 
Y
A
 
V
A
 
Q
L
 
E
D
 
E
S
 
G
K
 
Q
A
 
Y
A
 
K
I
 
-
P
 
K
L
 
K
L
 
I
K
 
N
K
 
S
A
 
A
Q
 
M
A
 
E
A
 
K
K
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
A
 
T
F
 
I
D
|
D
S
 
S
G
 
D
V
 
E
D
 
E
S
 
D
D
 
S
I
 
N
P
 
R
V
 
I
T
 
A
T
 
Y
A
 
V
T
 
G
T
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
V
A
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
L
 
V
A
 
A
A
 
G
D
 
K
K
 
E
M
 
M
A
 
V
E
 
K
L
 
Q
V
 
I
G
 
G
K
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
V
A
 
M
H
 
G
D
 
G
Q
 
K
T
 
N
S
 
V
R
 
K
T
 
N
G
 
Q
V
 
K
D
 
E
R
|
R
R
 
V
D
 
E
G
 
G
F
 
F
L
 
T
E
 
Q
R
 
Y
I
 
I
K
 
K
S
 
S
A
 
N
Y
 
-
P
 
S
K
 
N
I
 
L
K
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
D
V
 
T
Q
 
D
Y
 
S
G
 
S
A
 
D
G
 
A
D
 
M
Q
 
L
L
 
L
K
 
E
S
 
A
T
 
E
E
 
I
V
 
I
T
 
T
K
 
R
S
 
K
I
 
I
L
 
L
Q
 
N
A
 
R
Y
 
N
P
 
D
K
 
N
I
 
I
K
 
N
G
 
A
I
 
L
F
 
F
G
 
C
T
 
T
N
x
S
E
x
A
G
 
L
S
 
D
A
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
A
V
 
A
N
 
R
G
 
A
V
 
V
K
 
K
E
 
D
M
 
L
-
 
N
-
 
Y
K
 
K
R
 
D
K
 
R
I
 
V
I
 
K
I
 
I
I
 
I
G
 
C
Y
 
F
D
|
D
S
 
D
G
 
L
K
 
D
Q
 
D
Q
 
T
K
 
L
D
 
S
A
 
N
I
 
I
R
 
R
E
 
N
G
 
G
I
 
L
M
 
V
A
 
S
G
 
A
A
 
T
I
 
I
T
 
V
Q
|
Q
N
 
K
P
 
S
V
 
N
G
 
E
I
 
M
G
 
G
Y
 
Y
K
 
R
T
 
A
V
 
V
E
 
N
A
 
I
A
 
I
V
 
M
K
 
D
A
 
K
I
 
I
K
 
E
G
 
G
E
 
K

1rpjA Crystal structure of d-allose binding protein from escherichia coli (see paper)
29% identity, 83% coverage: 31:289/312 of query aligns to 6:270/288 of 1rpjA

query
sites
1rpjA
L
 
V
I
 
V
S
 
L
K
|
K
G
 
T
F
 
L
Q
 
S
H
x
N
Q
 
P
F
|
F
W
 
W
Q
 
V
A
 
D
V
 
M
K
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
I
D
 
E
Q
 
D
A
 
E
G
 
A
K
 
K
D
 
T
Y
 
L
K
 
G
V
 
V
K
 
S
V
 
V
T
 
D
F
 
I
E
 
F
G
 
A
P
 
S
E
 
P
T
 
S
E
|
E
A
 
G
M
 
D
V
 
F
D
 
Q
K
 
S
Q
 
Q
I
 
L
D
 
Q
M
 
L
L
 
F
S
 
E
A
 
D
A
 
L
L
 
S
A
 
N
K
 
K
K
 
N
P
 
Y
Q
 
K
A
 
G
I
 
I
G
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
P
L
 
L
D
 
S
S
 
S
K
 
V
A
 
N
A
 
L
I
 
V
P
 
M
L
 
P
L
 
V
K
 
A
K
 
R
A
 
A
Q
 
W
A
 
K
A
 
K
K
 
G
I
 
I
P
 
Y
V
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
L
D
|
D
S
 
E
G
 
K
V
 
I
D
 
D
S
 
M
D
 
D
I
 
N
P
 
L
V
 
K
T
 
K
T
 
A
A
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
F
-
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
K
A
 
G
A
 
A
D
 
S
K
 
F
M
 
I
A
 
I
E
 
D
L
 
K
V
 
L
G
 
G
K
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
A
 
E
H
 
G
D
 
K
Q
 
A
T
 
G
S
 
N
R
 
A
T
x
S
G
 
G
V
 
E
D
 
A
R
|
R
R
 
R
D
 
N
G
 
G
F
 
A
L
 
T
E
 
E
R
 
A
I
 
F
K
 
K
S
 
K
A
 
A
Y
 
-
P
 
S
K
 
Q
I
 
I
K
 
K
V
 
L
V
 
V
S
 
A
V
 
S
Q
 
Q
Y
 
P
G
 
A
A
 
D
G
x
W
D
 
D
Q
 
R
L
 
I
K
 
K
S
 
A
T
 
L
E
 
D
V
 
V
T
 
A
K
 
T
S
 
N
I
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
R
Y
 
N
P
 
P
K
 
N
I
 
I
K
 
K
G
 
A
I
 
I
F
 
Y
G
 
C
T
 
A
N
|
N
E
 
D
G
 
T
S
 
M
A
 
A
I
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
A
N
 
Q
G
 
A
V
 
V
K
 
A
E
 
N
M
 
A
K
 
G
R
 
K
-
 
T
-
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
L
I
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
T
D
|
D
S
 
G
G
 
I
K
 
P
Q
 
E
Q
 
A
K
 
R
D
 
K
A
 
M
I
 
V
R
 
E
E
 
A
G
 
G
I
 
Q
M
 
M
A
 
T
G
 
A
A
 
T
I
 
V
T
 
A
Q
|
Q
N
 
N
P
 
P
V
 
A
G
 
D
I
 
I
G
 
G
Y
 
A
K
 
T
T
 
G
V
 
L
E
 
K
A
 
L
A
 
M
V
 
V
K
 
D
A
 
A
I
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
K
L
 
S
P
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
I

1gudA Hinge-bending motion of d-allose binding protein from escherichia coli: three open conformations (see paper)
29% identity, 83% coverage: 31:289/312 of query aligns to 6:270/288 of 1gudA

query
sites
1gudA
L
 
V
I
 
V
S
 
L
K
 
K
G
 
T
F
 
L
Q
 
S
H
 
N
Q
 
P
F
 
F
W
 
W
Q
 
V
A
 
D
V
 
M
K
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
I
D
 
E
Q
 
D
A
 
E
G
 
A
K
 
K
D
 
T
Y
 
L
K
 
G
V
 
V
K
 
S
V
 
V
T
x
D
F
 
I
E
 
F
G
 
A
P
 
S
E
 
P
T
 
S
E
 
E
A
 
G
M
 
D
V
 
F
D
 
Q
K
 
S
Q
 
Q
I
 
L
D
 
Q
M
 
L
L
 
F
S
 
E
A
 
D
A
 
L
L
 
S
A
 
N
K
 
K
K
 
N
P
 
Y
Q
 
K
A
 
G
I
 
I
G
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
P
L
 
L
D
 
S
S
 
S
K
 
V
A
 
N
A
 
L
I
 
V
P
 
M
L
 
P
L
 
V
K
 
A
K
 
R
A
 
A
Q
 
W
A
 
K
A
 
K
K
 
G
I
 
I
P
 
Y
V
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
L
D
 
D
S
 
E
G
 
K
V
 
I
D
 
D
S
 
M
D
 
D
I
 
N
P
 
L
V
 
K
T
 
K
T
 
A
A
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
F
-
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
D
N
 
N
R
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
K
A
 
G
A
 
A
D
 
S
K
 
F
M
 
I
A
 
I
E
 
D
L
 
K
V
 
L
G
 
G
K
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
A
 
E
H
 
G
D
 
K
Q
 
A
T
 
G
S
 
N
R
 
A
T
 
S
G
 
G
V
 
E
D
 
A
R
 
R
R
 
R
D
 
N
G
 
G
F
 
A
L
 
T
E
 
E
R
 
A
I
 
F
K
 
K
S
 
K
A
 
A
Y
 
-
P
 
S
K
 
Q
I
 
I
K
 
K
V
 
L
V
 
V
S
 
A
V
 
S
Q
 
Q
Y
 
P
G
 
A
A
 
D
G
 
W
D
 
D
Q
 
R
L
 
I
K
 
K
S
 
A
T
 
L
E
 
D
V
 
V
T
 
A
K
 
T
S
 
N
I
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
R
Y
 
N
P
 
P
K
 
N
I
 
I
K
 
K
G
 
A
I
 
I
F
 
Y
G
 
C
T
 
A
N
 
N
E
 
D
G
 
T
S
 
M
A
 
A
I
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
A
N
 
Q
G
 
A
V
 
V
K
 
A
E
 
N
M
 
A
K
 
G
R
 
K
-
 
T
-
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
L
I
 
V
I
 
V
G
 
G
Y
 
T
D
 
D