SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS20635 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS20635 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2eiwA Crystal analysis of delta1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophilus with bound l-proline
27% identity, 49% coverage: 197:469/561 of query aligns to 172:439/516 of 2eiwA

query
sites
2eiwA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
A
C
 
P
C
 
W
T
x
N
F
|
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
 
I
S
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
N
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
 
P
H
 
A
P
 
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
I
 
K
T
 
V
V
 
F
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
D
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
A
 
L
A
 
P
H
 
G
D
 
V
A
 
G
S
 
E
D
 
E
T
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
-
R
 
-
T
 
Y
L
 
L
A
 
V
L
 
E
R
 
H
H
 
P
E
 
R
I
 
I
G
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
L
A
 
E
N
 
V
G
 
G
D
 
L
W
 
K
L
 
I
E
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
R
 
G
Q
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
W
-
 
F
A
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
 
T
S
 
G
G
 
G
I
 
K
N
 
N
Q
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
T
 
T
D
 
A
N
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
L
M
 
A
V
 
A
Q
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
x
S
T
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
I
 
L
P
 
T
R
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
Q
L
 
G
S
 
A
F
 
Y
V
 
E
E
 
P
V
 
V
S
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
V
 
L
Q
 
K
A
 
R
V
 
A
A
 
E
H
 
R
L
 
L
T
 
S
T
 
V
D
 
G
S
 
P
A
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
A
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
S
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
K
G
 
N
K
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
L
 
V
L
 
L
E
 
G
S
 
G
T
 
K
A
 
R
L
 
L
V
 
E
-
 
G
H
 
E
P
 
G
Q
 
Y
F
 
F
P
 
I
G
 
A
A
 
P
R
 
T
V
 
V
R
 
F
T
 
T
P
 
E
L
 
V
V
 
P
M
 
P
L
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
I
I
 
A
T
 
Q
E
 
E
E
|
E
Y
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
I
 
V
V
 
I
P
 
R
V
 
V
D
 
K
D
 
D
T
 
F
A
 
A
T
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
E
L
 
V
A
 
A
Q
 
N

Sites not aligning to the query:

2j5nA 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophirus with bound inhibitor glycine and NAD.
27% identity, 49% coverage: 197:469/561 of query aligns to 172:439/516 of 2j5nA

query
sites
2j5nA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
I
|
I
G
x
A
C
x
P
C
x
W
T
x
N
F
 
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
S
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
N
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
 
P
H
 
A
P
x
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
I
 
K
T
 
V
V
 
F
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
D
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
A
 
L
A
 
P
H
 
G
D
 
V
A
x
G
S
 
E
D
 
E
T
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
-
R
 
-
T
 
Y
L
 
L
A
 
V
L
 
E
R
 
H
H
 
P
E
 
R
I
 
I
G
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
S
 
L
A
 
E
N
x
V
G
 
G
D
 
L
W
 
K
L
 
I
E
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
R
 
G
Q
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
W
-
 
F
A
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
x
T
S
 
G
G
 
G
I
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
T
 
T
D
 
A
N
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
L
M
 
A
V
 
A
Q
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
x
S
T
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
I
 
L
P
 
T
R
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
Q
L
 
G
S
 
A
F
 
Y
V
 
E
E
 
P
V
 
V
S
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
V
 
L
Q
 
K
A
 
R
V
 
A
A
 
E
H
 
R
L
 
L
T
 
S
T
 
V
D
 
G
S
 
P
A
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
A
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
S
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
K
G
 
N
K
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
L
 
V
L
 
L
E
 
G
S
 
G
T
 
K
A
 
R
L
 
L
V
 
E
-
 
G
H
 
E
P
 
G
Q
 
Y
F
 
F
P
 
I
G
 
A
A
 
P
R
 
T
V
 
V
R
 
F
T
 
T
P
 
E
L
 
V
V
 
P
M
 
P
L
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
I
I
 
A
T
 
Q
E
 
E
E
|
E
Y
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
I
 
V
V
 
I
P
 
R
V
 
V
D
 
K
D
 
D
T
 
F
A
 
A
T
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
E
L
 
V
A
 
A
Q
 
N

Sites not aligning to the query:

2ej6A Crystal analysis of delta1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophilus with bound d-proline
27% identity, 49% coverage: 197:469/561 of query aligns to 172:439/516 of 2ej6A

query
sites
2ej6A
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
A
C
 
P
C
 
W
T
x
N
F
|
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
 
I
S
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
N
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
 
P
H
 
A
P
 
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
I
 
K
T
 
V
V
 
F
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
D
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
A
 
L
A
 
P
H
 
G
D
 
V
A
 
G
S
 
E
D
 
E
T
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
-
R
 
-
T
 
Y
L
 
L
A
 
V
L
 
E
R
 
H
H
 
P
E
 
R
I
 
I
G
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
L
A
 
E
N
 
V
G
 
G
D
 
L
W
 
K
L
 
I
E
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
R
 
G
Q
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
W
-
 
F
A
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
 
T
S
 
G
G
 
G
I
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
T
 
T
D
 
A
N
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
L
M
 
A
V
 
A
Q
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
x
S
T
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
I
 
L
P
 
T
R
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
Q
L
 
G
S
 
A
F
 
Y
V
 
E
E
 
P
V
 
V
S
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
V
 
L
Q
 
K
A
 
R
V
 
A
A
 
E
H
 
R
L
 
L
T
 
S
T
 
V
D
 
G
S
 
P
A
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
A
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
S
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
K
G
 
N
K
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
L
 
V
L
 
L
E
 
G
S
 
G
T
 
K
A
 
R
L
 
L
V
 
E
-
 
G
H
 
E
P
 
G
Q
 
Y
F
 
F
P
 
I
G
 
A
A
 
P
R
 
T
V
 
V
R
 
F
T
 
T
P
 
E
L
 
V
V
 
P
M
 
P
L
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
I
I
 
A
T
 
Q
E
 
E
E
|
E
Y
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
I
 
V
V
 
I
P
 
R
V
 
V
D
 
K
D
 
D
T
 
F
A
 
A
T
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
E
L
 
V
A
 
A
Q
 
N

Sites not aligning to the query:

2eitA Crystal analysis of delta1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophilus with bound l-alanine and NAD
27% identity, 49% coverage: 197:469/561 of query aligns to 172:439/516 of 2eitA

query
sites
2eitA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
I
|
I
G
x
A
C
 
P
C
x
W
T
x
N
F
 
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
S
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
N
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
 
P
H
 
A
P
x
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
I
 
K
T
 
V
V
 
F
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
D
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
A
 
L
A
 
P
H
 
G
D
 
V
A
x
G
S
x
E
D
 
E
T
 
V
G
|
G
L
 
A
A
 
-
R
 
-
T
 
Y
L
 
L
A
 
V
L
 
E
R
 
H
H
 
P
E
 
R
I
 
I
G
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
S
 
L
A
 
E
N
x
V
G
 
G
D
 
L
W
 
K
L
 
I
E
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
R
 
G
Q
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
W
-
 
F
A
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
 
T
S
x
G
G
 
G
I
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
T
 
T
D
 
A
N
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
L
M
 
A
V
 
A
Q
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
x
S
T
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
I
 
L
P
 
T
R
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
Q
L
 
G
S
 
A
F
 
Y
V
 
E
E
 
P
V
 
V
S
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
V
 
L
Q
 
K
A
 
R
V
 
A
A
 
E
H
 
R
L
 
L
T
 
S
T
 
V
D
 
G
S
 
P
A
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
A
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
S
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
K
G
 
N
K
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
L
 
V
L
 
L
E
 
G
S
 
G
T
 
K
A
 
R
L
 
L
V
 
E
-
 
G
H
 
E
P
 
G
Q
 
Y
F
 
F
P
 
I
G
 
A
A
 
P
R
 
T
V
 
V
R
 
F
T
 
T
P
 
E
L
 
V
V
 
P
M
 
P
L
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
I
I
 
A
T
 
Q
E
 
E
E
|
E
Y
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
I
 
V
V
 
I
P
 
R
V
 
V
D
 
K
D
 
D
T
 
F
A
 
A
T
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
E
L
 
V
A
 
A
Q
 
N

Sites not aligning to the query:

2eiiA Crystal analysis of delta1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus thermophilus with bound l-valine and NAD.
27% identity, 49% coverage: 197:469/561 of query aligns to 172:439/516 of 2eiiA

query
sites
2eiiA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
I
|
I
G
x
A
C
x
P
C
x
W
T
x
N
F
|
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
S
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
N
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
 
P
H
 
A
P
x
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
I
 
K
T
 
V
V
 
F
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
D
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
A
 
L
A
 
P
H
 
G
D
 
V
A
x
G
S
x
E
D
 
E
T
 
V
G
|
G
L
 
A
A
 
-
R
 
-
T
 
Y
L
 
L
A
 
V
L
 
E
R
 
H
H
 
P
E
 
R
I
 
I
G
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
S
 
L
A
 
E
N
x
V
G
 
G
D
 
L
W
 
K
L
 
I
E
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
R
 
G
Q
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
W
-
 
F
A
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
x
T
S
 
G
G
 
G
I
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
T
 
T
D
 
A
N
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
L
M
 
A
V
 
A
Q
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
x
S
T
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
I
 
L
P
 
T
R
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
Q
L
 
G
S
 
A
F
 
Y
V
 
E
E
 
P
V
 
V
S
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
V
 
L
Q
 
K
A
 
R
V
 
A
A
 
E
H
 
R
L
 
L
T
 
S
T
 
V
D
 
G
S
 
P
A
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
A
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
S
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
K
G
 
N
K
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
L
 
V
L
 
L
E
 
G
S
 
G
T
 
K
A
 
R
L
 
L
V
 
E
-
 
G
H
 
E
P
 
G
Q
 
Y
F
 
F
P
 
I
G
 
A
A
 
P
R
 
T
V
 
V
R
 
F
T
 
T
P
 
E
L
 
V
V
 
P
M
 
P
L
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
I
I
 
A
T
 
Q
E
 
E
E
|
E
Y
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
I
 
V
V
 
I
P
 
R
V
 
V
D
 
K
D
 
D
T
 
F
A
 
A
T
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
E
L
 
V
A
 
A
Q
 
N

Sites not aligning to the query:

2ehuA Crystal analysis of 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus with bound NAD and inhibitor l-serine
27% identity, 49% coverage: 197:469/561 of query aligns to 172:439/516 of 2ehuA

query
sites
2ehuA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
I
|
I
G
x
A
C
x
P
C
x
W
T
x
N
F
|
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
S
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
N
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
 
P
H
 
A
P
x
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
I
 
K
T
 
V
V
 
F
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
D
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
A
 
L
A
 
P
H
 
G
D
 
V
A
x
G
S
 
E
D
 
E
T
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
-
R
 
-
T
 
Y
L
 
L
A
 
V
L
 
E
R
 
H
H
 
P
E
 
R
I
 
I
G
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
S
 
L
A
 
E
N
x
V
G
 
G
D
 
L
W
 
K
L
 
I
E
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
R
 
G
Q
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
W
-
 
F
A
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
x
T
S
 
G
G
 
G
I
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
T
 
T
D
 
A
N
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
L
M
 
A
V
 
A
Q
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
x
S
T
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
I
 
L
P
 
T
R
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
Q
L
 
G
S
 
A
F
 
Y
V
 
E
E
 
P
V
 
V
S
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
V
 
L
Q
 
K
A
 
R
V
 
A
A
 
E
H
 
R
L
 
L
T
 
S
T
 
V
D
 
G
S
 
P
A
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
A
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
S
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
K
G
 
N
K
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
L
 
V
L
 
L
E
 
G
S
 
G
T
 
K
A
 
R
L
 
L
V
 
E
-
 
G
H
 
E
P
 
G
Q
 
Y
F
 
F
P
 
I
G
 
A
A
 
P
R
 
T
V
 
V
R
 
F
T
 
T
P
 
E
L
 
V
V
 
P
M
 
P
L
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
I
I
 
A
T
 
Q
E
 
E
E
|
E
Y
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
I
 
V
V
 
I
P
 
R
V
 
V
D
 
K
D
 
D
T
 
F
A
 
A
T
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
E
L
 
V
A
 
A
Q
 
N

Sites not aligning to the query:

2ehqA Crystal analysis of 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus with bound NADP (see paper)
27% identity, 49% coverage: 197:469/561 of query aligns to 172:439/516 of 2ehqA

query
sites
2ehqA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
I
|
I
G
x
A
C
x
P
C
x
W
T
x
N
F
 
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
S
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
N
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
 
P
H
x
A
P
x
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
I
 
K
T
 
V
V
 
F
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
D
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
A
 
L
A
 
P
H
 
G
D
x
V
A
x
G
S
x
E
D
 
E
T
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
-
R
 
-
T
 
Y
L
 
L
A
 
V
L
 
E
R
 
H
H
 
P
E
 
R
I
 
I
G
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
S
 
L
A
 
E
N
x
V
G
 
G
D
 
L
W
 
K
L
 
I
E
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
R
 
G
Q
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
W
-
 
F
A
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
x
T
S
 
G
G
 
G
I
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
T
 
T
D
 
A
N
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
L
M
 
A
V
 
A
Q
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
 
S
T
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
I
 
L
P
 
T
R
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
Q
L
 
G
S
 
A
F
 
Y
V
 
E
E
 
P
V
 
V
S
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
V
 
L
Q
 
K
A
 
R
V
 
A
A
 
E
H
 
R
L
 
L
T
 
S
T
 
V
D
 
G
S
 
P
A
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
A
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
S
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
K
G
 
N
K
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
L
 
V
L
 
L
E
 
G
S
 
G
T
 
K
A
 
R
L
 
L
V
 
E
-
 
G
H
 
E
P
 
G
Q
 
Y
F
 
F
P
 
I
G
 
A
A
 
P
R
 
T
V
 
V
R
 
F
T
 
T
P
 
E
L
 
V
V
 
P
M
 
P
L
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
I
I
 
A
T
 
Q
E
 
E
E
|
E
Y
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
I
 
V
V
 
I
P
 
R
V
 
V
D
 
K
D
 
D
T
 
F
A
 
A
T
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
E
L
 
V
A
 
A
Q
 
N

Sites not aligning to the query:

2bhqA Crystal analysis of 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus with bound product glutamate. (see paper)
27% identity, 49% coverage: 197:469/561 of query aligns to 172:439/516 of 2bhqA

query
sites
2bhqA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
A
C
 
P
C
 
W
T
x
N
F
|
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
S
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
N
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
 
P
H
 
A
P
 
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
I
 
K
T
 
V
V
 
F
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
D
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
A
 
L
A
 
P
H
 
G
D
 
V
A
 
G
S
 
E
D
 
E
T
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
-
R
 
-
T
 
Y
L
 
L
A
 
V
L
 
E
R
 
H
H
 
P
E
 
R
I
 
I
G
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
L
A
 
E
N
 
V
G
 
G
D
 
L
W
 
K
L
 
I
E
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
R
 
G
Q
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
W
-
 
F
A
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
 
T
S
 
G
G
 
G
I
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
T
 
T
D
 
A
N
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
L
M
 
A
V
 
A
Q
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
x
K
C
|
C
T
x
S
T
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
I
 
L
P
 
T
R
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
Q
L
 
G
S
 
A
F
 
Y
V
 
E
E
 
P
V
 
V
S
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
V
 
L
Q
 
K
A
 
R
V
 
A
A
 
E
H
 
R
L
 
L
T
 
S
T
 
V
D
 
G
S
 
P
A
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
A
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
S
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
K
G
 
N
K
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
L
 
V
L
 
L
E
 
G
S
 
G
T
 
K
A
 
R
L
 
L
V
 
E
-
 
G
H
 
E
P
 
G
Q
 
Y
F
 
F
P
 
I
G
 
A
A
 
P
R
 
T
V
 
V
R
 
F
T
 
T
P
 
E
L
 
V
V
 
P
M
 
P
L
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
I
I
 
A
T
 
Q
E
 
E
E
|
E
Y
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
I
 
V
V
 
I
P
 
R
V
 
V
D
 
K
D
 
D
T
 
F
A
 
A
T
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
E
L
 
V
A
 
A
Q
 
N

Sites not aligning to the query:

2bhpA Crystal analysis of 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase from thermus with bound NAD. (see paper)
27% identity, 49% coverage: 197:469/561 of query aligns to 172:439/516 of 2bhpA

query
sites
2bhpA
V
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
I
|
I
G
x
A
C
x
P
C
x
W
T
x
N
F
 
F
P
 
P
T
 
V
W
 
A
N
x
I
S
 
F
Y
 
T
P
 
G
G
 
M
L
 
I
F
 
V
A
 
G
N
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
T
V
 
V
I
 
I
V
 
A
K
|
K
P
 
P
H
 
A
P
x
E
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
V
P
 
V
L
 
G
A
 
A
I
 
K
T
 
V
V
 
F
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
D
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
N
L
 
F
A
 
L
A
 
P
H
 
G
D
 
V
A
x
G
S
x
E
D
 
E
T
 
V
G
 
G
L
 
A
A
 
-
R
 
-
T
 
Y
L
 
L
A
 
V
L
 
E
R
 
H
H
 
P
E
 
R
I
 
I
G
 
R
L
 
F
I
 
I
D
 
N
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
S
 
L
A
 
E
N
x
V
G
 
G
D
 
L
W
 
K
L
 
I
E
 
Y
E
 
E
R
 
A
A
 
A
R
 
G
Q
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
-
 
W
-
 
F
A
 
K
R
 
R
V
 
A
L
 
Y
T
 
V
E
|
E
K
x
T
S
 
G
G
 
G
I
 
K
N
 
D
Q
 
A
I
 
I
I
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
E
T
 
T
D
 
A
N
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
L
M
 
A
V
 
A
Q
 
E
N
 
G
I
 
V
A
 
V
L
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
Y
L
 
G
Y
 
F
S
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
M
 
K
C
|
C
T
 
S
T
 
A
P
 
A
Q
 
S
N
 
R
I
 
L
Y
 
I
I
 
L
P
 
T
R
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
Q
L
 
G
S
 
A
F
 
Y
V
 
E
E
 
P
V
 
V
S
 
L
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
V
 
L
Q
 
K
A
 
R
V
 
A
A
 
E
H
 
R
L
 
L
T
 
S
T
 
V
D
 
G
S
 
P
A
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
N
E
 
P
L
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
Q
N
 
E
E
 
R
A
 
K
V
 
V
L
 
L
Q
 
S
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
I
A
 
G
R
 
K
G
 
N
K
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
L
 
V
L
 
L
E
 
G
S
 
G
T
 
K
A
 
R
L
 
L
V
 
E
-
 
G
H
 
E
P
 
G
Q
 
Y
F
 
F
P
 
I
G
 
A
A
 
P
R
 
T
V
 
V
R
 
F
T
 
T
P
 
E
L
 
V
V
 
P
M
 
P
L
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
I
I
 
A
T
 
Q
E
 
E
E
|
E
Y
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
L
F
 
S
I
 
V
V
 
I
P
 
R
V
 
V
D
 
K
D
 
D
T
 
F
A
 
A
T
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
E
L
 
V
A
 
A
Q
 
N

Sites not aligning to the query:

8vr1A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (ctp bound)
25% identity, 69% coverage: 90:476/561 of query aligns to 43:412/488 of 8vr1A

query
sites
8vr1A
D
 
D
L
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
A
L
 
V
P
 
K
S
 
S
M
 
A
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
Q
Q
 
K
V
 
V
W
 
W
A
 
A
G
 
A
V
 
M
A
 
S
L
 
A
E
 
M
I
 
A
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
I
N
 
L
A
 
R
R
 
K
S
 
A
F
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
L
H
 
R
A
 
E
V
 
R
Q
 
N
H
 
D
T
 
E
T
 
L
G
 
A
Q
 
R
A
 
L
F
 
E
T
 
T
M
 
L
A
 
-
F
 
-
Q
 
D
A
 
T
G
 
G
G
 
K
P
 
P
H
 
L
A
 
S
Q
 
E
D
 
T
R
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
D
A
 
I
I
 
V
A
 
T
C
 
G
A
 
A
W
 
-
Q
 
D
Q
 
V
L
 
L
Q
 
E
-
 
Y
-
 
Y
-
 
A
-
 
G
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
L
A
 
E
R
 
G
W
 
S
E
 
Q
K
 
I
P
 
P
Q
 
L
G
 
R
K
 
D
H
 
S
A
 
S
P
 
F
L
 
V
V
 
Y
M
 
T
R
 
R
K
 
R
T
 
E
W
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
V
L
 
A
V
 
G
I
 
I
G
 
G
C
 
A
C
x
W
T
 
N
F
 
Y
P
 
P
T
 
I
-
 
Q
-
 
I
-
 
A
-
 
L
W
 
W
N
 
K
S
 
S
Y
 
A
P
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
A
 
A
T
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
I
 
I
V
 
F
K
 
K
P
 
P
H
 
S
P
 
E
G
 
-
A
 
-
I
 
V
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
-
I
 
-
T
 
T
V
 
A
Q
 
L
V
 
K
A
 
L
R
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
Y
A
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
L
A
 
P
P
 
D
D
 
G
V
 
V
V
 
F
T
 
N
L
 
V
A
 
L
A
 
P
H
 
G
D
 
I
A
 
G
S
 
A
D
 
E
T
 
T
G
 
G
L
 
-
A
 
-
R
 
Q
T
 
Y
L
 
L
A
 
T
L
 
E
R
 
H
H
 
P
E
 
D
I
 
I
G
 
A
L
 
K
I
 
I
D
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
S
 
V
A
|
A
N
x
S
G
 
G
D
 
K
W
 
K
L
 
V
E
 
M
E
 
A
R
 
N
A
 
S
R
 
A
Q
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
K
R
 
E
V
 
V
L
 
T
T
 
M
E
 
E
K
 
L
S
 
G
G
 
G
I
 
K
N
 
S
Q
 
P
I
 
L
I
 
I
I
 
I
D
 
A
S
 
E
T
 
D
D
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
-
G
 
D
M
 
L
V
 
A
Q
 
A
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
M
S
 
M
L
 
A
A
 
N
L
 
F
Y
 
Y
S
 
S
-
 
S
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
C
 
C
T
 
T
T
 
N
P
 
G
Q
 
T
N
 
R
I
 
V
Y
 
F
I
 
V
P
 
P
R
 
A
D
 
K
G
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
S
 
F
F
 
K
V
 
A
E
 
E
V
 
F
S
 
E
Q
 
H
A
 
K
I
 
I
V
 
L
Q
 
E
A
 
R
V
 
V
A
 
G
H
 
R
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
D
L
 
L
T
 
F
T
 
A
D
 
D
S
 
D
A
 
T
K
 
N
A
 
F
V
 
G
E
 
P
L
 
L
L
 
V
G
 
S
A
 
F
I
 
P
Q
 
H
N
 
R
E
 
Q
A
 
N
V
 
V
L
 
L
Q
 
R
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
S
A
 
G
R
 
K
G
 
S
K
 
E
G
 
G
-
 
A
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
C
E
 
G
S
 
G
T
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
K
H
 
G
P
 
E
Q
 
G
F
 
F
P
 
D
G
 
N
A
 
G
R
 
A
V
 
W
R
 
V
T
 
A
P
 
P
L
 
T
V
 
V
M
 
F
L
 
T
A
 
D
R
 
C
R
 
T
N
 
D
E
 
D
A
 
M
-
 
T
-
 
I
I
 
V
T
 
R
E
 
E
E
|
E
Y
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
M
F
 
S
I
 
I
V
 
L
P
 
S
V
 
Y
D
 
D
D
 
D
T
 
E
A
 
A
T
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
Q
 
N
R
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
T
D
 
E
Q
 
Y
G
 
G

8vr0A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (gmp bound)
25% identity, 69% coverage: 90:476/561 of query aligns to 43:412/488 of 8vr0A

query
sites
8vr0A
D
 
D
L
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
A
L
 
V
P
 
K
S
 
S
M
 
A
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
Q
Q
 
K
V
 
V
W
 
W
A
 
A
G
 
A
V
 
M
A
 
S
L
 
A
E
 
M
I
 
A
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
I
N
 
L
A
 
R
R
 
K
S
 
A
F
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
L
H
 
R
A
 
E
V
 
R
Q
 
N
H
 
D
T
 
E
T
 
L
G
 
A
Q
 
R
A
 
L
F
 
E
T
 
T
M
 
L
A
 
-
F
 
-
Q
 
D
A
 
T
G
 
G
G
 
K
P
 
P
H
 
L
A
 
S
Q
 
E
D
 
T
R
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
D
A
 
I
I
 
V
A
 
T
C
 
G
A
 
A
W
 
-
Q
 
D
Q
 
V
L
 
L
Q
 
E
-
 
Y
-
 
Y
-
 
A
-
 
G
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
L
A
 
E
R
 
G
W
 
S
E
 
Q
K
 
I
P
 
P
Q
 
L
G
 
R
K
 
D
H
 
S
A
 
S
P
 
F
L
 
V
V
 
Y
M
 
T
R
 
R
K
 
R
T
 
E
W
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
V
L
 
A
V
 
G
I
 
I
G
 
G
C
 
A
C
x
W
T
 
N
F
 
Y
P
 
P
T
 
I
-
 
Q
-
 
I
-
 
A
-
 
L
W
 
W
N
 
K
S
 
S
Y
 
A
P
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
A
 
A
T
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
I
 
I
V
 
F
K
 
K
P
 
P
H
 
S
P
 
E
G
 
-
A
 
-
I
 
V
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
-
I
 
-
T
 
T
V
 
A
Q
 
L
V
 
K
A
 
L
R
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
Y
A
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
L
A
 
P
P
 
D
D
 
G
V
 
V
V
 
F
T
 
N
L
 
V
A
 
L
A
 
P
H
 
G
D
 
I
A
 
G
S
 
A
D
 
E
T
 
T
G
 
G
L
 
-
A
 
-
R
 
Q
T
 
Y
L
 
L
A
 
T
L
 
E
R
 
H
H
 
P
E
 
D
I
 
I
G
 
A
L
 
K
I
 
I
D
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
S
 
V
A
 
A
N
 
S
G
 
G
D
 
K
W
 
K
L
 
V
E
 
M
E
 
A
R
 
N
A
 
S
R
 
A
Q
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
K
R
 
E
V
 
V
L
 
T
T
 
M
E
 
E
K
 
L
S
 
G
G
 
G
I
 
K
N
 
S
Q
 
P
I
 
L
I
 
I
I
 
I
D
 
A
S
 
E
T
 
D
D
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
-
G
 
D
M
 
L
V
 
A
Q
 
A
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
M
S
 
M
L
 
A
A
 
N
L
 
F
Y
 
Y
S
 
S
-
 
S
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
C
 
C
T
 
T
T
 
N
P
 
G
Q
 
T
N
 
R
I
 
V
Y
 
F
I
 
V
P
 
P
R
 
A
D
 
K
G
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
S
 
F
F
 
K
V
 
A
E
 
E
V
 
F
S
 
E
Q
 
H
A
 
K
I
 
I
V
 
L
Q
 
E
A
 
R
V
 
V
A
 
G
H
 
R
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
D
L
 
L
T
 
F
T
 
A
D
 
D
S
 
D
A
 
T
K
 
N
A
 
F
V
 
G
E
 
P
L
 
L
L
 
V
G
 
S
A
 
F
I
 
P
Q
x
H
N
 
R
E
 
Q
A
 
N
V
 
V
L
 
L
Q
 
R
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
S
A
 
G
R
 
K
G
 
S
K
 
E
G
 
G
-
 
A
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
C
E
 
G
S
 
G
T
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
K
H
 
G
P
 
E
Q
 
G
F
 
F
P
 
D
G
 
N
A
 
G
R
 
A
V
 
W
R
 
V
T
 
A
P
 
P
L
 
T
V
 
V
M
 
F
L
 
T
A
 
D
R
 
C
R
 
T
N
 
D
E
 
D
A
 
M
-
 
T
-
 
I
I
 
V
T
 
R
E
 
E
E
|
E
Y
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
M
F
 
S
I
 
I
V
 
L
P
 
S
V
 
Y
D
 
D
D
 
D
T
 
E
A
 
A
T
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
Q
 
N
R
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
T
D
 
E
Q
 
Y
G
 
G

8vqzA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (cmp bound)
25% identity, 69% coverage: 90:476/561 of query aligns to 43:412/488 of 8vqzA

query
sites
8vqzA
D
 
D
L
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
A
L
 
V
P
 
K
S
 
S
M
 
A
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
Q
Q
 
K
V
 
V
W
 
W
A
 
A
G
 
A
V
 
M
A
 
S
L
 
A
E
 
M
I
 
A
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
I
N
 
L
A
 
R
R
 
K
S
 
A
F
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
L
H
 
R
A
 
E
V
 
R
Q
 
N
H
 
D
T
 
E
T
 
L
G
 
A
Q
 
R
A
 
L
F
 
E
T
 
T
M
 
L
A
 
-
F
 
-
Q
 
D
A
 
T
G
 
G
G
 
K
P
 
P
H
 
L
A
 
S
Q
 
E
D
 
T
R
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
D
A
 
I
I
 
V
A
 
T
C
 
G
A
 
A
W
 
-
Q
 
D
Q
 
V
L
 
L
Q
 
E
-
 
Y
-
 
Y
-
 
A
-
 
G
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
L
A
 
E
R
 
G
W
 
S
E
 
Q
K
 
I
P
 
P
Q
 
L
G
 
R
K
 
D
H
 
S
A
 
S
P
 
F
L
 
V
V
 
Y
M
 
T
R
 
R
K
 
R
T
 
E
W
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
V
L
 
A
V
 
G
I
 
I
G
 
G
C
 
A
C
x
W
T
 
N
F
 
Y
P
 
P
T
 
I
-
 
Q
-
 
I
-
 
A
-
 
L
W
 
W
N
 
K
S
 
S
Y
 
A
P
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
A
 
A
T
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
I
 
I
V
 
F
K
 
K
P
 
P
H
 
S
P
 
E
G
 
-
A
 
-
I
 
V
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
-
I
 
-
T
 
T
V
 
A
Q
 
L
V
 
K
A
 
L
R
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
Y
A
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
L
A
 
P
P
 
D
D
 
G
V
 
V
V
 
F
T
 
N
L
 
V
A
 
L
A
 
P
H
 
G
D
 
I
A
 
G
S
 
A
D
 
E
T
 
T
G
 
G
L
 
-
A
 
-
R
 
Q
T
 
Y
L
 
L
A
 
T
L
 
E
R
 
H
H
 
P
E
 
D
I
 
I
G
 
A
L
 
K
I
 
I
D
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
S
 
V
A
 
A
N
 
S
G
 
G
D
 
K
W
 
K
L
 
V
E
 
M
E
 
A
R
 
N
A
 
S
R
 
A
Q
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
K
R
 
E
V
 
V
L
 
T
T
 
M
E
 
E
K
 
L
S
 
G
G
 
G
I
 
K
N
 
S
Q
 
P
I
 
L
I
 
I
I
 
I
D
 
A
S
 
E
T
 
D
D
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
-
G
 
D
M
 
L
V
 
A
Q
 
A
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
M
S
 
M
L
 
A
A
 
N
L
 
F
Y
 
Y
S
 
S
-
 
S
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
C
 
C
T
 
T
T
 
N
P
 
G
Q
 
T
N
 
R
I
 
V
Y
 
F
I
 
V
P
 
P
R
 
A
D
 
K
G
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
S
 
F
F
 
K
V
 
A
E
 
E
V
 
F
S
 
E
Q
 
H
A
 
K
I
 
I
V
 
L
Q
 
E
A
 
R
V
 
V
A
 
G
H
 
R
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
D
L
 
L
T
 
F
T
 
A
D
 
D
S
 
D
A
 
T
K
 
N
A
 
F
V
 
G
E
 
P
L
 
L
L
 
V
G
 
S
A
 
F
I
 
P
Q
x
H
N
 
R
E
 
Q
A
x
N
V
 
V
L
 
L
Q
 
R
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
S
A
 
G
R
 
K
G
 
S
K
 
E
G
 
G
-
 
A
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
C
E
 
G
S
 
G
T
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
K
H
 
G
P
 
E
Q
 
G
F
 
F
P
 
D
G
 
N
A
 
G
R
 
A
V
 
W
R
 
V
T
 
A
P
 
P
L
 
T
V
 
V
M
 
F
L
 
T
A
 
D
R
 
C
R
 
T
N
 
D
E
 
D
A
 
M
-
 
T
-
 
I
I
 
V
T
 
R
E
 
E
E
|
E
Y
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
M
F
 
S
I
 
I
V
 
L
P
 
S
V
 
Y
D
 
D
D
 
D
T
 
E
A
 
A
T
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
Q
 
N
R
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
T
D
 
E
Q
 
Y
G
 
G

8vqwC Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (coa bound)
25% identity, 69% coverage: 90:476/561 of query aligns to 43:412/488 of 8vqwC

query
sites
8vqwC
D
 
D
L
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
A
L
 
V
P
 
K
S
 
S
M
 
A
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
Q
Q
 
K
V
 
V
W
 
W
A
 
A
G
 
A
V
 
M
A
 
S
L
 
A
E
 
M
I
 
A
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
I
N
 
L
A
 
R
R
 
K
S
 
A
F
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
L
H
 
R
A
 
E
V
 
R
Q
 
N
H
 
D
T
 
E
T
 
L
G
 
A
Q
 
R
A
 
L
F
 
E
T
 
T
M
 
L
A
 
-
F
 
-
Q
 
D
A
 
T
G
 
G
G
 
K
P
 
P
H
 
L
A
 
S
Q
 
E
D
 
T
R
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
D
A
 
I
I
 
V
A
 
T
C
 
G
A
 
A
W
 
-
Q
 
D
Q
 
V
L
 
L
Q
 
E
-
 
Y
-
 
Y
-
 
A
-
 
G
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
L
A
 
E
R
 
G
W
 
S
E
 
Q
K
 
I
P
 
P
Q
 
L
G
 
R
K
 
D
H
 
S
A
 
S
P
 
F
L
 
V
V
 
Y
M
 
T
R
 
R
K
 
R
T
 
E
W
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
V
L
 
A
V
 
G
I
|
I
G
 
G
C
 
A
C
x
W
T
 
N
F
 
Y
P
 
P
T
 
I
-
 
Q
-
 
I
-
 
A
-
 
L
W
 
W
N
 
K
S
 
S
Y
 
A
P
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
A
 
A
T
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
I
 
I
V
 
F
K
|
K
P
 
P
H
x
S
P
x
E
G
 
-
A
 
-
I
 
V
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
-
I
 
-
T
 
T
V
 
A
Q
 
L
V
 
K
A
 
L
R
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
Y
A
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
L
A
 
P
P
 
D
D
 
G
V
 
V
V
 
F
T
 
N
L
 
V
A
 
L
A
 
P
H
 
G
D
 
I
A
x
G
S
 
A
D
 
E
T
 
T
G
|
G
L
 
-
A
 
-
R
 
Q
T
 
Y
L
 
L
A
 
T
L
 
E
R
 
H
H
 
P
E
 
D
I
 
I
G
 
A
L
 
K
I
 
I
D
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
S
 
V
A
 
A
N
x
S
G
 
G
D
 
K
W
 
K
L
 
V
E
 
M
E
 
A
R
 
N
A
 
S
R
 
A
Q
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
K
R
 
E
V
 
V
L
 
T
T
 
M
E
 
E
K
 
L
S
 
G
G
 
G
I
 
K
N
 
S
Q
 
P
I
 
L
I
 
I
I
 
I
D
 
A
S
 
E
T
 
D
D
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
-
G
 
D
M
 
L
V
 
A
Q
 
A
N
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
M
S
 
M
L
 
A
A
 
N
L
 
F
Y
 
Y
S
 
S
-
 
S
G
 
G
Q
 
Q
M
 
V
C
 
C
T
 
T
T
 
N
P
 
G
Q
 
T
N
 
R
I
 
V
Y
 
F
I
 
V
P
 
P
R
 
A
D
 
K
G
 
-
V
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
S
 
F
F
 
K
V
 
A
E
 
E
V
 
F
S
 
E
Q
 
H
A
 
K
I
 
I
V
 
L
Q
 
E
A
 
R
V
 
V
A
 
G
H
 
R
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
D
L
 
L
T
 
F
T
 
A
D
 
D
S
 
D
A
 
T
K
 
N
A
 
F
V
 
G
E
 
P
L
 
L
L
 
V
G
 
S
A
 
F
I
 
P
Q
x
H
N
 
R
E
 
Q
A
 
N
V
 
V
L
 
L
Q
 
R
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
L
 
S
A
 
G
R
 
K
G
 
S
K
 
E
G
 
G
-
 
A
Q
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
C
E
 
G
S
 
G
T
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
K
H
 
G
P
 
E
Q
 
G
F
 
F
P
 
D
G
 
N
A
 
G
R
 
A
V
 
W
R
 
V
T
 
A
P
 
P
L
 
T
V
 
V
M
 
F
L
 
T
A
 
D
R
 
C
R
 
T
N
 
D
E
 
D
A
 
M
-
 
T
-
 
I
I
 
V
T
 
R
E
 
E
E
 
E
Y
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
I
 
V
S
 
M
F
 
S
I
 
I
V
 
L
P
 
S
V
 
Y
D
 
D
D
 
D
T
 
E
A
 
A
T
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
R
L
 
R
A
 
A
Q
 
N
R
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
T
D
 
E
Q
 
Y
G
 
G

8vj3A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (fad bound)
25% identity, 69% coverage: 90:476/561 of query aligns to 43:412/488 of 8vj3A

query
sites
8vj3A
D
 
D
L
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
A
L
 
V
P
 
K
S
 
S
M
 
A
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
W
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
Q
Q
 
K
V
 
V
W
 
W
A
 
A
G
 
A
V
 
M
A
 
S
L
 
A
E
 
M
I
 
A
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
I
N
 
L
A
 
R
R
 
K
S
 
A
F
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
L
H
 
R
A
 
E
V
 
R
Q
 
N
H
 
D
T
 
E
T
 
L
G
 
A
Q
 
R
A
 
L
F
 
E
T
 
T
M
 
L
A
 
-
F
 
-
Q
 
D
A
 
T
G
 
G
G
 
K
P
 
P
H
 
L
A
 
S
Q
 
E
D
 
T
R
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
D
A
 
I
I
 
V
A
 
T
C
 
G
A
 
A
W
 
-
Q
 
D
Q
 
V
L
 
L
Q
 
E
-
 
Y
-
 
Y
-
 
A
-
 
G
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
L
A
 
E
R
 
G
W
 
S
E
 
Q
K
 
I
P
 
P
Q
 
L
G
 
R
K
 
D
H
 
S
A
 
S
P
 
F
L
 
V
V
 
Y
M
 
T
R
 
R
K
 
R
T
 
E
W
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
V
L
 
A
V
 
G
I
|
I
G
|
G
C
 
A
C
x
W
T
 
N
F
 
Y
P
 
P
T
 
I
-
 
Q
-
 
I
-
 
A
-
 
L
W
 
W
N
 
K
S
 
S
Y
 
A
P
 
P
G
 
A
L
 
L
F
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
A
 
A
T
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
M
I
 
I
V
 
F
K
|
K
P
 
P
H
x
S
P
x
E
G
 
-
A
 
-
I
 
V
L
 
T
P
 
P
L
 
L
A
 
-
I
 
-
T
 
T
V
 
A
Q
 
L
V
 
K
A
 
L
R
 
A
E
 
E
V
 
I
L
 
Y
A
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
F
 
L
A
 
P
P
 
D
D
 
G
V
 
V
V
 
F
T
 
N
L
 
V
A
 
L
A
 
P
H
 
G
D
 
I
A
x
G
S
 
A
D
 
E
T
 
T
G
|
G
L
 
-
A
 
-
R
 
Q
T
 
Y
L
 
L
A
 
T
L
 
E
R
 
H
H
 
P
E
 
D
I
 
I
G
 
A
L
 
K
I
 
I
D
 
S
F
|
F