SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_0956 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_0956 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

3fg2P Crystal structure of ferredoxin reductase for the cyp199a2 system from rhodopseudomonas palustris (see paper)
28% identity, 65% coverage: 7:285/428 of query aligns to 4:275/404 of 3fg2P

query
sites
3fg2P
V
 
V
L
 
L
V
 
I
V
 
A
G
|
G
A
 
A
G
|
G
P
x
H
A
|
A
G
 
G
L
 
F
A
 
Q
A
 
V
A
 
A
G
 
V
T
 
S
-
 
L
-
 
R
A
 
Q
A
 
A
A
 
K
H
 
Y
G
 
P
A
 
G
R
 
R
V
 
I
G
 
A
L
 
L
L
 
I
D
 
N
A
x
D
Q
x
E
-
 
K
-
 
H
-
 
L
-
 
P
-
 
Y
-
 
Q
-
x
R
P
|
P
R
 
P
A
 
L
G
x
S
G
x
K
Q
 
A
V
 
Y
W
 
L
R
 
K
H
 
S
D
 
G
V
 
G
R
 
D
K
 
P
N
 
N
A
 
S
P
 
L
R
 
M
A
 
F
A
 
R
R
 
P
E
 
E
A
 
K
I
 
F
A
 
F
A
 
Q
L
 
D
H
 
Q
G
 
A
V
 
I
T
 
E
L
 
L
L
 
I
A
 
S
Q
 
D
H
x
R
S
x
M
V
 
V
I
 
S
A
 
I
S
 
D
E
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
-
L
 
-
R
 
R
V
 
K
E
 
L
I
 
L
P
 
L
Q
 
A
G
 
S
S
 
G
T
 
T
L
 
A
L
 
I
T
 
E
Y
 
Y
G
 
G
A
 
H
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
N
L
 
R
L
 
M
L
 
L
P
 
D
F
 
V
P
 
P
G
 
N
W
 
A
T
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
D
V
 
V
S
 
L
G
 
Y
A
 
L
G
x
R
G
 
T
L
 
L
Q
 
D
-
 
E
-
 
S
A
 
E
L
 
V
T
 
L
K
 
R
Q
 
Q
G
 
R
W
 
M
P
 
P
V
 
-
A
 
D
G
 
K
K
 
K
R
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
F
L
x
I
L
 
G
L
 
L
A
 
E
A
 
F
A
 
A
A
 
A
T
 
T
L
 
A
R
 
R
A
 
A
H
 
K
G
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
R
-
 
V
-
 
M
A
 
A
K
 
R
L
 
V
V
 
V
G
 
T
I
 
P
H
 
E
E
 
I
Q
 
S
A
 
S
S
 
Y
A
 
F
E
 
H
S
 
D
V
 
R
H
 
H
A
 
S
F
 
G
A
 
A
R
 
G
Q
 
I
L
 
R
L
 
M
H
 
H
W
 
Y
P
 
G
A
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
T
Q
 
E
A
 
I
A
 
A
L
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
Y
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
Q
 
-
A
 
A
H
 
E
G
 
G
E
 
D
D
 
R
A
 
V
L
 
T
R
 
G
L
 
V
V
 
V
E
 
L
I
 
S
D
 
D
G
 
G
A
 
-
H
 
-
G
 
-
T
 
-
S
 
N
L
 
T
V
 
L
D
 
P
C
 
C
D
 
D
L
 
L
L
 
V
A
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
I
P
 
P
N
 
N
V
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
Q
 
A
L
 
A
L
 
A
G
 
G
C
 
L
A
 
P
L
 
T
D
 
A
H
 
A
G
 
G
H
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
H
 
-
V
 
I
Q
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
Q
L
 
Q
L
 
L
R
 
L
T
 
T
S
 
S
V
 
D
P
 
P
A
 
H
I
 
I
L
 
S
A
 
A
A
 
I
G
 
G
E
x
D

Sites not aligning to the query:

6rvhA Nadh-dependent coenzyme a disulfide reductase soaked with menadione (see paper)
30% identity, 52% coverage: 64:287/428 of query aligns to 71:283/443 of 6rvhA

query
sites
6rvhA
H
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
L
L
 
V
L
 
H
A
 
T
Q
 
R
H
 
H
S
 
E
V
|
V
I
 
V
A
 
-
S
 
D
E
 
V
D
 
D
G
 
Y
A
 
E
L
 
L
R
 
R
V
 
T
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
H
E
 
D
I
 
H
P
 
A
Q
 
E
G
 
G
S
 
R
T
 
T
L
 
F
L
 
Q
T
 
D
-
 
R
Y
 
F
G
 
D
A
 
H
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
R
 
R
E
 
P
L
 
S
L
 
L
L
 
P
P
 
P
F
 
I
P
 
P
G
 
G
W
 
T
T
 
E
L
 
Q
P
 
E
G
 
G
V
 
V
-
 
Y
-
 
T
-
 
L
-
x
R
-
 
T
-
 
M
-
 
E
S
 
D
G
 
G
A
 
E
G
 
R
G
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
P
K
 
Q
Q
 
-
G
 
-
W
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
A
V
 
A
V
 
I
A
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
x
Y
L
 
I
L
 
G
L
 
L
A
x
E
A
 
A
A
 
A
A
 
E
T
 
A
L
 
F
R
 
R
A
 
K
H
 
R
G
 
G
A
 
L
K
 
Q
L
 
V
V
 
T
G
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
L
V
 
L
H
 
E
A
 
A
F
 
K
A
 
D
R
 
R
Q
 
P
L
 
L
L
 
P
H
 
H
W
 
W
P
 
D
A
 
P
R
 
E
A
 
V
T
 
-
Q
 
-
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
K
A
 
E
K
 
E
L
 
L
A
 
E
-
 
R
-
 
H
G
 
G
V
 
V
P
 
E
Y
 
V
R
 
W
F
 
T
G
 
G
S
 
V
V
 
K
V
 
V
R
 
E
Q
 
A
A
 
F
H
 
R
G
 
G
E
 
M
D
 
G
A
 
R
L
 
V
R
 
E
L
 
A
V
 
V
E
 
E
I
 
T
D
 
S
G
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
T
 
E
S
 
G
L
 
V
V
 
V
D
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
A
 
L
V
 
L
G
 
A
Y
 
T
G
 
G
L
 
I
V
 
R
P
 
P
N
 
N
V
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
A
L
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
G
H
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
P
H
 
T
P
 
G
H
 
A
V
 
I
Q
 
A
V
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
R
L
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
N
V
 
L
P
 
E
A
 
G
I
 
V
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
E
x
D
A
 
V
C
 
A

Sites not aligning to the query:

6rvbA Nadh-dependent coenzyme a disulfide reductase soaked with nadh (see paper)
30% identity, 52% coverage: 64:287/428 of query aligns to 71:283/443 of 6rvbA

query
sites
6rvbA
H
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
L
L
 
V
L
 
H
A
 
T
Q
 
R
H
 
H
S
x
E
V
|
V
I
 
V
A
 
-
S
 
D
E
 
V
D
 
D
G
 
Y
A
 
E
L
 
L
R
 
R
V
 
T
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
H
E
 
D
I
 
H
P
 
A
Q
 
E
G
 
G
S
 
R
T
 
T
L
 
F
L
 
Q
T
 
D
-
 
R
Y
 
F
G
 
D
A
 
H
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
R
 
R
E
 
P
L
 
S
L
 
L
L
 
P
P
 
P
F
 
I
P
 
P
G
 
G
W
 
T
T
 
E
L
 
Q
P
 
E
G
 
G
V
 
V
-
 
Y
-
 
T
-
x
L
-
x
R
-
 
T
-
 
M
-
 
E
S
 
D
G
 
G
A
 
E
G
 
R
G
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
P
K
 
Q
Q
 
-
G
 
-
W
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
A
V
 
A
V
 
I
A
 
L
G
|
G
S
 
A
G
|
G
P
x
Y
L
x
I
L
 
G
L
 
L
A
x
E
A
 
A
A
 
A
A
 
E
T
 
A
L
 
F
R
 
R
A
 
K
H
 
R
G
 
G
A
 
L
K
 
Q
L
 
V
V
 
T
G
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
L
V
 
L
H
x
E
A
|
A
F
 
K
A
 
D
R
 
R
Q
 
P
L
 
L
L
 
P
H
 
H
W
 
W
P
 
D
A
 
P
R
 
E
A
 
V
T
 
-
Q
 
-
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
K
A
 
E
K
 
E
L
 
L
A
 
E
-
 
R
-
 
H
G
 
G
V
 
V
P
 
E
Y
 
V
R
 
W
F
 
T
G
 
G
S
 
V
V
 
K
V
 
V
R
 
E
Q
 
A
A
 
F
H
 
R
G
 
G
E
 
M
D
 
G
A
 
R
L
 
V
R
 
E
L
 
A
V
 
V
E
 
E
I
 
T
D
 
S
G
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
T
 
E
S
 
G
L
 
V
V
 
V
D
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
A
 
L
V
 
L
G
x
A
Y
x
T
G
|
G
L
 
I
V
 
R
P
 
P
N
 
N
V
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
A
L
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
G
H
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
P
H
 
T
P
 
G
H
 
A
V
 
I
Q
 
A
V
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
R
L
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
N
V
 
L
P
 
E
A
 
G
I
 
V
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
E
x
D
A
 
V
C
 
A

Sites not aligning to the query:

6ruzA Nadh-dependent coenzyme a disulfide reductase (see paper)
30% identity, 52% coverage: 64:287/428 of query aligns to 71:283/443 of 6ruzA

query
sites
6ruzA
H
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
L
L
 
V
L
 
H
A
 
T
Q
 
R
H
 
H
S
x
E
V
|
V
I
 
V
A
 
-
S
 
D
E
 
V
D
 
D
G
 
Y
A
 
E
L
 
L
R
 
R
V
 
T
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
H
E
 
D
I
 
H
P
 
A
Q
 
E
G
 
G
S
 
R
T
 
T
L
 
F
L
 
Q
T
 
D
-
 
R
Y
 
F
G
 
D
A
 
H
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
|
A
R
 
R
E
 
P
L
 
S
L
 
L
L
 
P
P
 
P
F
 
I
P
 
P
G
 
G
W
 
T
T
 
E
L
 
Q
P
 
E
G
 
G
V
 
V
-
 
Y
-
 
T
-
x
L
-
x
R
-
 
T
-
 
M
-
 
E
S
 
D
G
 
G
A
 
E
G
 
R
G
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
P
K
 
Q
Q
 
-
G
 
-
W
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
A
V
 
A
V
 
I
A
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
x
Y
L
 
I
L
 
G
L
 
L
A
x
E
A
 
A
A
 
A
A
 
E
T
 
A
L
 
F
R
 
R
A
 
K
H
 
R
G
 
G
A
 
L
K
 
Q
L
 
V
V
 
T
G
 
-
I
 
-
H
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
L
V
 
L
H
 
E
A
 
A
F
 
K
A
 
D
R
 
R
Q
 
P
L
 
L
L
 
P
H
 
H
W
 
W
P
 
D
A
 
P
R
 
E
A
 
V
T
 
-
Q
 
-
A
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
K
A
 
E
K
 
E
L
 
L
A
 
E
-
 
R
-
 
H
G
 
G
V
 
V
P
 
E
Y
 
V
R
 
W
F
 
T
G
 
G
S
 
V
V
 
K
V
 
V
R
 
E
Q
 
A
A
 
F
H
 
R
G
 
G
E
 
M
D
 
G
A
 
R
L
 
V
R
 
E
L
 
A
V
 
V
E
 
E
I
 
T
D
 
S
G
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
T
 
E
S
 
G
L
 
V
V
 
V
D
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
A
 
L
V
 
L
G
 
A
Y
 
T
G
 
G
L
 
I
V
 
R
P
 
P
N
 
N
V
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
A
L
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
G
H
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
P
H
 
T
P
 
G
H
 
A
V
 
I
Q
 
A
V
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
R
L
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
N
V
 
L
P
 
E
A
 
G
I
 
V
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
E
x
D
A
 
V
C
 
A

Sites not aligning to the query:

3f8dA Structure of sulfolobus solfataricus thioredoxin reductase mutant c147a (see paper)
21% identity, 66% coverage: 3:285/428 of query aligns to 5:276/308 of 3f8dA

query
sites
3f8dA
E
 
E
R
 
K
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
I
V
|
V
G
|
G
A
x
L
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
A
L
 
Y
A
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
L
T
 
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
R
H
 
Y
G
 
M
A
 
L
R
 
K
V
 
T
G
 
L
L
 
V
L
 
I
D
x
G
A
x
E
Q
x
T
P
 
P
R
 
-
A
 
-
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
 
L
W
 
T
R
x
E
H
x
A
D
 
G
V
 
I
R
x
V
K
 
D
N
x
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
I
-
 
E
-
 
I
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
D
A
 
M
P
 
I
R
 
K
A
 
V
A
 
F
R
 
N
E
 
K
A
 
H
I
 
I
A
 
E
A
 
K
L
 
Y
H
 
E
G
 
V
V
 
P
T
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
D
Q
x
I
H
x
V
S
 
E
V
 
K
I
 
I
A
 
E
S
 
N
E
 
R
D
 
E
G
 
F
A
 
V
L
 
V
R
 
K
V
 
T
E
 
K
I
 
-
P
 
R
Q
 
K
G
 
G
S
 
E
T
 
-
L
 
-
L
 
F
T
 
K
Y
 
A
G
 
D
A
 
S
L
 
V
V
 
I
L
 
L
A
x
G
T
x
I
G
|
G
A
 
V
R
 
K
E
 
R
L
 
R
L
 
K
L
 
L
P
 
G
F
 
V
P
 
P
G
 
G
W
 
E
T
 
Q
L
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
E
G
 
F
A
 
A
G
 
G
-
 
R
G
 
G
L
 
I
Q
 
S
A
 
Y
L
x
C
T
 
S
K
 
V
Q
x
A
G
x
D
W
 
A
P
 
P
V
 
L
A
 
F
G
 
K
K
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
-
 
A
V
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
G
P
 
D
L
 
S
L
 
A
L
 
L
A
 
E
A
 
G
A
 
A
A
 
E
T
 
I
L
 
L
R
 
S
A
 
S
H
 
Y
G
 
S
A
 
T
K
 
K
L
 
V
V
 
Y
G
 
L
I
 
I
H
 
H
E
 
R
Q
 
R
A
 
D
S
 
T
A
 
F
E
 
K
S
 
A
V
 
Q
H
 
P
A
 
I
F
 
Y
A
 
V
R
 
E
Q
 
T
L
 
V
L
 
K
H
 
K
W
 
K
P
 
P
A
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
N
V
 
V
P
 
E
Y
 
F
R
 
V
F
 
L
G
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
K
Q
 
E
A
 
I
H
 
K
G
 
G
E
 
D
D
 
K
A
 
V
L
 
V
R
 
K
L
 
Q
V
 
V
E
 
V
I
 
V
D
 
E
G
 
N
A
 
L
H
 
K
G
 
T
T
 
G
S
 
E
L
 
I
V
 
K
D
 
E
C
 
L
D
 
N
L
 
V
-
 
N
-
 
G
L
 
V
A
 
F
V
 
I
G
 
E
Y
 
I
G
 
G
L
 
F
V
 
D
P
 
P
N
 
P
V
 
T
E
 
D
L
 
F
A
 
A
Q
 
K
L
 
S
L
 
N
G
 
G
C
 
I
A
 
E
L
 
T
D
 
D
H
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
T
H
 
N
P
 
G
H
 
Y
V
 
I
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
W
L
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
G
I
 
V
L
 
F
A
 
A
A
 
A
G
|
G
E
x
D

Sites not aligning to the query:

6tukB Crystal structure of fdr9 (see paper)
30% identity, 52% coverage: 93:314/428 of query aligns to 93:282/393 of 6tukB

query
sites
6tukB
L
 
L
T
 
S
Y
 
Y
G
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
R
 
S
E
 
P
L
 
I
L
 
R
L
 
L
P
 
P
F
 
G
P
 
P
G
 
G
-
 
R
-
 
Q
W
 
F
T
 
T
L
x
V
P
x
R
G
 
T
V
 
V
S
 
E
G
 
D
A
 
A
G
 
A
G
 
Q
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
E
T
 
L
K
 
K
Q
 
-
G
 
-
W
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
P
G
 
G
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
L
A
 
V
G
 
G
S
 
A
G
 
S
P
 
W
L
 
I
L
 
S
L
 
A
A
 
E
A
 
V
A
 
A
A
 
T
T
 
A
L
 
A
R
 
L
A
 
R
H
 
R
G
 
G
A
 
C
K
 
S
L
 
V
V
 
T
G
 
C
I
 
I
H
 
E
E
 
A
Q
 
G
A
 
P
S
 
A
A
 
P
E
 
L
S
 
S
V
 
A
H
 
A
A
 
L
F
 
G
A
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
G
R
 
Q
Q
 
R
L
 
F
L
 
L
H
 
P
W
 
W
P
 
W
A
 
S
R
 
E
A
 
V
T
 
D
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
L
R
 
R
A
 
L
K
 
D
L
 
-
A
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
A
Y
 
E
R
 
V
F
 
T
G
 
E
S
 
T
V
 
G
V
 
V
R
 
Q
Q
 
L
A
 
A
H
 
N
G
 
G
E
 
E
D
 
Q
A
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
D
C
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
V
A
 
V
V
 
T
G
 
G
Y
 
I
G
 
G
L
 
V
V
 
R
P
 
P
N
 
A
V
 
V
E
 
D
L
 
W
A
 
L
Q
 
S
L
 
G
L
 
S
G
 
G
C
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
D
H
 
T
G
 
G
H
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
H
 
-
V
 
V
Q
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
H
L
 
L
R
 
R
T
 
T
S
 
S
V
 
L
P
 
P
A
 
G
I
 
I
L
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
E
x
D
A
 
V
C
 
A
G
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
V
R
 
R
I
 
W
E
 
S
G
 
P
A
 
R
I
 
W
A
 
N
G
 
T
H
 
R
M
 
I
A
 
R
A
 
V
G
 
E
H
|
H
Q
x
W
D
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4jnaA Crystal structure of the deph complex with dimethyl-fk228 (see paper)
29% identity, 70% coverage: 5:303/428 of query aligns to 5:286/296 of 4jnaA

query
sites
4jnaA
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
G
G
x
S
P
x
H
A
|
A
G
 
G
L
 
Q
A
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
L
T
 
Q
A
 
I
A
 
A
A
 
R
H
 
A
G
 
R
A
 
R
R
 
R
V
 
V
G
 
L
L
 
V
L
x
I
D
|
D
A
|
A
-
 
G
-
x
A
-
 
R
Q
x
R
P
x
N
R
 
R
A
 
F
G
 
A
G
 
S
Q
 
Q
V
 
-
W
 
-
R
x
S
H
|
H
D
 
G
V
 
V
R
 
I
K
 
G
N
 
Q
A
 
D
P
 
G
R
 
R
A
 
S
A
 
P
R
 
-
E
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
D
H
 
G
G
 
K
V
 
A
T
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
Y
H
 
P
S
 
N
V
 
A
I
 
Q
A
 
W
S
 
R
E
 
E
D
 
D
G
x
S
A
x
V
L
 
V
R
 
R
V
 
A
E
 
E
I
 
R
P
 
S
Q
 
D
-
 
A
G
 
G
S
 
Y
T
 
T
L
 
L
L
 
I
T
 
C
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
H
Y
 
Y
G
 
R
A
 
A
-
 
C
-
 
Q
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
x
F
G
 
G
A
 
V
R
 
V
E
 
D
L
 
E
L
 
L
L
 
P
P
 
E
F
 
L
P
 
E
G
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
R
W
 
W
T
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
G
A
 
E
G
 
S
G
 
V
L
 
F
Q
 
H
A
x
C
L
 
P
T
 
Y
K
x
C
Q
x
H
G
 
G
W
 
Y
P
 
E
V
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
G
R
 
R
V
 
I
V
 
G
V
 
V
A
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
S
L
 
Y
A
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
M
T
 
L
L
 
M
R
 
P
A
 
E
H
 
W
G
 
G
A
 
Q
K
 
T
L
 
V
V
 
-
G
 
-
I
 
F
H
 
L
E
 
T
Q
 
D
A
 
A
S
 
S
A
 
F
E
 
E
S
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
W
 
-
P
 
P
A
 
D
R
 
E
A
 
E
T
 
Q
Q
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
A
R
 
R
A
 
R
K
 
G
L
 
V
A
 
E
G
 
I
V
 
V
P
 
R
Y
 
D
R
 
R
F
 
I
G
 
A
S
 
R
V
 
I
V
 
V
R
 
D
Q
 
R
A
 
A
H
 
T
G
 
V
E
 
E
D
 
L
A
 
A
L
 
D
-
 
G
R
 
R
L
 
R
V
 
I
E
 
A
I
 
F
D
 
D
G
 
G
A
 
L
H
 
F
G
 
T
T
 
M
S
 
N
L
 
R
V
 
M
D
 
R
C
 
L
D
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
N
 
S
V
 
S
E
 
P
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
L
 
Q
L
 
L
G
 
G
C
 
C
A
 
A
L
 
I
D
 
E
H
 
E
G
 
G
H
 
P
P
 
L
H
 
G
P
 
P
H
 
Y
V
 
V
Q
 
R
V
 
T
D
 
D
E
 
D
L
 
A
L
 
M
R
 
E
T
 
T
S
 
S
V
 
T
P
 
P
A
 
G
I
 
V
L
 
F
A
 
A
A
 
C
G
|
G
E
x
D
A
 
I
C
 
T
G
x
H
I
x
R
G
|
G
G
|
G
-
x
T
L
x
V
A
 
A
V
 
L
A
 
A
R
 
I
I
 
G
E
 
N
G
 
G
A
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4jn9A Crystal structure of the deph (see paper)
29% identity, 70% coverage: 5:303/428 of query aligns to 8:289/299 of 4jn9A

query
sites
4jn9A
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
V
V
 
I
G
|
G
A
 
G
G
x
S
P
 
H
A
|
A
G
 
G
L
 
Q
A
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
L
T
 
Q
A
 
I
A
 
A
A
 
R
H
 
A
G
 
R
A
 
R
R
 
R
V
 
V
G
 
L
L
 
V
L
x
I
D
|
D
A
|
A
-
 
G
-
x
A
-
 
R
Q
x
R
P
 
N
R
 
R
A
 
F
G
 
A
G
 
S
Q
 
Q
V
 
-
W
 
-
R
x
S
H
|
H
D
 
G
V
|
V
R
 
I
K
 
G
N
x
Q
A
 
D
P
 
G
R
 
R
A
 
S
A
 
P
R
 
-
E
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
D
H
 
G
G
 
K
V
 
A
T
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
Y
H
 
P
S
 
N
V
 
A
I
 
Q
A
 
W
S
 
R
E
 
E
D
 
D
G
x
S
A
x
V
L
 
V
R
 
R
V
 
A
E
 
E
I
 
R
P
 
S
Q
 
D
-
 
A
G
 
G
S
 
Y
T
 
T
L
 
L
L
 
I
T
 
C
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
H
Y
 
Y
G
 
R
A
 
A
-
 
C
-
 
Q
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
x
F
G
 
G
A
 
V
R
 
V
E
 
D
L
 
E
L
 
L
L
 
P
P
 
E
F
 
L
P
 
E
G
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
R
W
 
W
T
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
G
A
 
E
G
 
S
G
 
V
L
 
F
Q
 
H
A
 
C
L
 
P
T
 
Y
K
x
C
Q
x
H
G
 
G
W
 
Y
P
 
E
V
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
G
R
 
R
V
 
I
V
 
G
V
 
V
A
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
S
L
 
Y
A
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
M
T
 
L
L
 
M
R
 
P
A
 
E
H
 
W
G
 
G
A
 
Q
K
 
T
L
 
V
V
 
-
G
 
-
I
 
F
H
 
L
E
 
T
Q
 
D
A
 
A
S
 
S
A
 
F
E
 
E
S
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
W
 
-
P
 
P
A
 
D
R
 
E
A
 
E
T
 
Q
Q
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
A
R
 
R
A
 
R
K
 
G
L
 
V
A
 
E
G
 
I
V
 
V
P
 
R
Y
 
D
R
 
R
F
 
I
G
 
A
S
 
R
V
 
I
V
 
V
R
 
D
Q
 
R
A
 
A
H
 
T
G
 
V
E
 
E
D
 
L
A
 
A
L
 
D
-
 
G
R
 
R
L
 
R
V
 
I
E
 
A
I
 
F
D
 
D
G
 
G
A
 
-
H
 
-
G
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
-
C
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
F
V
 
T
G
 
M
Y
 
N
G
 
R
L
 
M
V
 
R
P
 
L
N
 
S
V
 
S
E
 
P
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
L
 
Q
L
 
L
G
 
G
C
 
C
A
 
A
L
 
I
D
 
E
H
 
E
G
 
G
H
 
P
P
 
L
H
 
G
P
 
P
H
 
Y
V
 
V
Q
 
R
V
 
T
D
 
D
E
 
D
L
 
A
L
 
M
R
 
E
T
 
T
S
 
S
V
 
T
P
 
P
A
 
G
I
 
V
L
 
F
A
 
A
A
 
C
G
|
G
E
x
D
A
 
I
C
 
T
G
 
H
I
 
R
G
 
G
G
|
G
-
x
T
L
x
V
A
 
A
V
 
L
A
 
A
R
 
I
I
 
G
E
 
N
G
 
G
A
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
G

P16640 Putidaredoxin reductase CamA; Pdr; Putidaredoxin--NAD(+) reductase; EC 1.18.1.5 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 2 papers)
30% identity, 45% coverage: 93:285/428 of query aligns to 101:284/422 of P16640

query
sites
P16640
L
 
L
T
 
D
Y
 
Y
G
 
D
A
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
G
R
 
R
E
 
P
L
 
R
L
 
P
L
 
L
P
 
P
F
 
V
P
 
A
G
 
S
W
 
G
T
 
A
L
 
V
P
 
G
G
 
K
V
 
A
S
 
N
G
 
N
A
 
F
G
 
R
G
 
Y
L
 
L
Q
x
R
A
 
T
L
 
L
T
 
E
K
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
C
-
 
I
Q
 
R
G
 
R
W
 
Q
P
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
D
K
 
N
R
 
R
V
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
G
P
 
Y
L
 
I
L
 
G
L
 
L
A
 
E
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
-
 
A
L
 
I
R
 
K
A
 
A
H
 
N
G
 
M
-
 
H
A
 
V
K
 
T
L
 
L
V
 
L
G
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
R
I
 
V
H
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
V
S
 
T
A
 
A
E
 
P
S
 
P
V
 
V
H
 
S
A
 
A
F
 
F
A
 
Y
R
 
E
Q
 
H
L
 
L
L
 
-
H
 
-
W
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
H
K
 
R
L
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
D
Y
 
I
R
 
R
F
 
T
G
 
G
S
 
T
-
 
Q
V
 
V
V
 
C
R
 
G
Q
 
F
A
 
E
H
 
M
G
 
S
E
 
T
D
 
D
A
 
Q
L
 
Q
R
 
K
L
 
V
V
 
T
E
 
A
I
 
V
D
 
L
G
 
C
A
 
E
H
 
D
G
 
G
T
 
T
S
 
R
L
 
L
V
 
-
D
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
A
 
I
V
 
A
G
 
G
Y
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
P
N
 
N
V
 
C
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
L
 
A
L
 
A
G
 
G
C
 
L
A
 
Q
L
 
V
D
 
D
H
 
N
G
 
G
H
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
H
 
-
V
 
I
Q
 
V
V
 
I
D
 
N
E
 
E
L
 
H
L
 
M
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
V
 
D
P
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
M
A
 
A
A
 
V
G
 
G
E
x
D

Sites not aligning to the query:

1q1wA Crystal structure of putidaredoxin reductase from pseudomonas putida (see paper)
30% identity, 45% coverage: 93:285/428 of query aligns to 100:283/422 of 1q1wA

query
sites
1q1wA
L
 
L
T
 
D
Y
 
Y
G
 
D
A
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
 
G
R
 
R
E
 
P
L
 
R
L
 
P
L
 
L
P
 
P
F
 
V
P
 
A
G
 
S
W
 
G
T
 
A
L
 
V
P
 
G
G
 
K
V
 
A
S
 
N
G
 
N
A
 
F
G
 
R
G
 
Y
L
 
L
Q
x
R
A
 
T
L
 
L
T
 
E
K
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
C
-
 
I
Q
 
R
G
 
R
W
 
Q
P
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
D
K
 
N
R
 
R
V
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
G
P
 
Y
L
x
I
L
 
G
L
 
L
A
 
E
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
T
-
 
A
L
 
I
R
 
K
A
 
A
H
 
N
G
 
M
-
 
H
A
 
V
K
 
T
L
 
L
V
 
L
G
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
R
I
 
V
H
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
V
S
 
T
A
 
A
E
 
P
S
 
P
V
 
V
H
 
S
A
 
A
F
 
F
A
 
Y
R
 
E
Q
 
H
L
 
L
L
 
-
H
 
-
W
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
H
K
 
R
L
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
D
Y
 
I
R
 
R
F
 
T
G
 
G
S
 
T
-
 
Q
V
 
V
V
 
C
R
 
G
Q
 
F
A
 
E
H
 
M
G
 
S
E
 
T
D
 
D
A
 
Q
L
 
Q
R
 
K
L
 
V
V
 
T
E
 
A
I
 
V
D
 
L
G
 
C
A
 
E
H
 
D
G
 
G
T
 
T
S
 
R
L
 
L
V
 
-
D
 
P
C
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
V
A
 
I
V
 
A
G
 
G
Y
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
P
N
 
N
V
 
C
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
S
L
 
A
L
 
A
G
 
G
C
 
L
A
 
Q
L
 
V
D
 
D
H
 
N
G
 
G
H
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
H
 
-
V
 
I
Q
 
V
V
 
I
D
 
N
E
 
E
L
 
H
L
 
M
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
V
 
D
P
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
M
A
 
A
A
 
V
G
 
G
E
x
D

Sites not aligning to the query:

2zbwB Crystal structure of thioredoxin reductase-like protein from thermus thermophilus hb8
23% identity, 67% coverage: 6:291/428 of query aligns to 6:292/334 of 2zbwB

query
sites
2zbwB
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
V
|
V
G
|
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
A
x
T
G
 
G
L
 
L
A
 
F
A
 
A
A
 
G
G
 
F
T
 
Y
A
 
V
A
 
G
A
 
M
H
 
R
G
 
G
A
 
L
R
 
S
V
 
F
G
 
R
L
 
F
L
x
V
D
|
D
A
x
P
Q
 
L
P
 
P
R
 
E
A
x
P
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
V
x
L
-
 
T
-
 
A
-
x
L
-
x
Y
-
 
P
-
 
E
-
 
K
W
 
Y
R
x
I
H
 
Y
D
|
D
V
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
F
-
 
P
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
R
 
A
K
 
K
N
 
D
A
 
L
P
 
V
R
 
K
A
 
G
A
 
L
R
 
V
E
 
E
A
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
P
L
 
F
H
 
N
G
 
P
V
 
V
T
 
Y
L
 
S
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
H
x
R
S
x
A
V
 
E
I
 
T
A
 
L
S
 
E
E
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
D
L
 
L
-
 
F
R
 
K
V
 
V
E
 
T
I
 
T
P
 
S
Q
 
Q
G
 
G
S
 
N
T
 
A
L
 
-
L
 
Y
T
 
T
Y
 
A
G
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
I
L
 
I
A
|
A
T
x
A
G
|
G
A
 
V
R
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
F
 
-
P
 
-
G
|
G
W
x
A
T
x
F
L
 
E
P
 
P
G
 
R
V
 
R
S
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
P
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
A
 
E
L
 
F
T
 
E
K
 
G
Q
 
R
G
 
G
W
 
V
P
 
Y
V
 
Y
A
 
A
-
 
V
-
x
K
-
x
S
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
F
-
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
V
 
L
V
 
I
A
 
V
G
 
G
S
 
G
G
 
G
P
 
D
L
 
S
L
 
A
L
 
V
A
 
D
A
 
W
A
 
A
A
 
L
T
 
N
L
 
L
R
 
L
A
 
D
H
 
T
G
 
A
A
 
R
K
 
R
L
 
I
V
 
T
G
 
L
I
 
I
H
 
H
E
 
R
Q
 
R
A
 
P
S
 
Q
A
 
F
E
 
R
S
 
A
V
 
H
H
 
E
A
 
A
F
 
S
A
 
V
R
 
K
Q
 
E
L
 
L
L
 
M
H
 
-
W
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
K
A
 
A
T
 
H
Q
 
E
A
 
E
A
 
G
L
 
R
L
 
L
R
 
E
A
 
V
K
 
L
L
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
R
 
E
F
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
L
R
 
R
Q
 
R
A
 
V
H
 
E
G
 
G
E
 
D
D
 
E
A
 
R
L
 
V
R
 
R
-
 
W
-
 
A
L
 
V
V
 
V
E
 
F
I
 
H
D
 
N
G
 
Q
A
 
T
H
 
Q
G
 
E
T
 
E
S
 
L
L
 
A
V
 
L
D
 
E
C
 
V
D
 
D
L
 
A
L
 
V
A
 
L
V
 
I
G
 
L
Y
 
A
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
P
 
T
N
 
K
V
 
L
E
 
G
L
 
P
A
 
L
Q
 
A
L
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
E
H
 
K
G
 
N
H
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
H
 
K
V
 
I
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
E
 
T
L
 
T
L
 
M
R
 
A
T
 
T
S
 
S
V
 
I
P
 
P
A
 
G
I
 
V
L
 
Y
A
 
A
A
 
C
G
 
G
E
x
D
A
 
I
C
 
V
G
 
T
I
 
Y
G
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q5SL28 Ferredoxin--NADP reductase; FNR; Fd-NADP(+) reductase; EC 1.18.1.2 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8)
23% identity, 67% coverage: 6:291/428 of query aligns to 7:293/335 of Q5SL28

query
sites
Q5SL28
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
x
T
G
 
G
L
 
L
A
 
F
A
 
A
A
 
G
G
 
F
T
 
Y
A
 
V
A
 
G
A
 
M
H
 
R
G
 
G
A
 
L
R
 
S
V
 
F
G
 
R
L
 
F
L
 
V
D
|
D
A
 
P
Q
 
L
P
 
P
R
 
E
A
 
P
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
V
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
L
-
x
Y
-
 
P
-
 
E
-
 
K
W
 
Y
R
 
I
H
 
Y
D
 
D
V
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
F
-
 
P
-
 
K
-
 
V
-
 
Y
R
 
A
K
 
K
N
 
D
A
 
L
P
 
V
R
 
K
A
 
G
A
 
L
R
 
V
E
 
E
A
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
P
L
 
F
H
 
N
G
 
P
V
 
V
T
 
Y
L
 
S
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
H
 
R
S
x
A
V
 
E
I
 
T
A
 
L
S
 
E
E
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
D
L
 
L
-
 
F
R
 
K
V
 
V
E
 
T
I
 
T
P
 
S
Q
 
Q
G
 
G
S
 
N
T
 
A
L
 
-
L
 
Y
T
 
T
Y
 
A
G
 
K
A
 
A
L
 
V
V
 
I
L
 
I
A
 
A
T
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
G
W
 
A
T
x
F
L
 
E
P
 
P
G
 
R
V
 
R
S
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
P
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
A
 
E
L
 
F
T
 
E
K
 
G
Q
 
R
G
 
G
W
 
V
P
 
Y
V
 
Y
A
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
E
-
 
F
-
 
Q
G
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
V
V
 
L
V
 
I
A
 
V
G
 
G
S
 
G
G
 
G
P
 
D
L
 
S
L
 
A
L
 
V
A
 
D
A
 
W
A
 
A
A
 
L
T
 
N
L
 
L
R
 
L
A
 
D
H
 
T
G
 
A
A
 
R
K
 
R
L
 
I
V
 
T
G
 
L
I
 
I
H
 
H
E
 
R
Q
 
R
A
 
P
S
 
Q
A
 
F
E
 
R
S
 
A
V
 
H
H
 
E
A
 
A
F
 
S
A
 
V
R
 
K
Q
 
E
L
 
L
L
 
M
H
 
-
W
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
K
A
 
A
T
 
H
Q
 
E
A
 
E
A
 
G
L
 
R
L
 
L
R
 
E
A
 
V
K
 
L
L
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
R
 
E
F
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
L
R
 
R
Q
 
R
A
 
V
H
 
E
G
 
G
E
 
D
D
 
E
A
 
R
L
 
V
R
 
R
-
 
W
-
 
A
L
 
V
V
 
V
E
 
F
I
 
H
D
 
N
G
 
Q
A
 
T
H
 
Q
G
 
E
T
 
E
S
 
L
L
 
A
V
 
L
D
 
E
C
 
V
D
 
D
L
 
A
L
 
V
A
 
L
V
 
I
G
 
L
Y
 
A
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
P
 
T
N
 
K
V
 
L
E
 
G
L
 
P
A
 
L
Q
 
A
L
 
N
L
 
W
G
 
G
C
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
E
H
 
K
G
 
N
H
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
H
 
K
V
 
I
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
E
 
T
L
 
T
L
 
M
R
 
A
T
 
T
S
 
S
V
 
I
P
 
P
A
 
G
I
 
V
L
 
Y
A
 
A
A
 
C
G
 
G
E
x
D
A
 
I
C
 
V
G
 
T
I
 
Y
G
 
P
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6pfzA Structure of a NAD-dependent persulfide reductase from a. Fulgidus (see paper)
27% identity, 53% coverage: 93:318/428 of query aligns to 107:327/541 of 6pfzA

query
sites
6pfzA
L
 
L
T
 
N
Y
 
Y
G
 
D
A
 
Y
L
 
L
V
 
V
L
 
I
A
|
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
R
 
R
E
 
P
L
 
A
L
 
K
L
 
P
P
 
P
F
 
I
P
 
E
G
 
G
W
 
I
T
 
E
L
 
A
P
 
E
G
 
G
V
 
V
S
 
V
G
 
T
A
x
L
G
 
T
G
 
S
L
 
A
Q
 
E
A
 
E
L
 
A
T
 
E
K
 
K
-
 
I
-
 
I
Q
 
E
G
 
M
W
 
W
P
 
E
V
 
E
A
 
G
G
 
A
K
 
E
R
 
K
V
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
I
L
 
G
L
 
L
A
 
E
A
 
S
A
 
A
A
 
E
T
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
N
H
 
L
G
 
D
A
 
M
K
 
E
L
 
V
V
 
T
G
 
V
I
 
I
H
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
E
S
 
M
V
 
M
H
 
D
A
 
R
F
 
V
A
 
A
R
 
P
Q
 
A
L
 
M
L
 
L
H
 
D
W
 
R
P
 
E
A
 
M
R
 
A
A
 
V
T
 
L
Q
 
V
A
 
E
A
 
N
L
 
H
L
 
L
R
 
R
A
 
E
K
 
K
L
 
G
A
 
V
G
 
N
V
 
V
-
 
V
-
 
T
P
 
S
Y
 
T
R
 
R
F
 
V
G
 
E
S
 
K
V
 
I
V
 
V
R
 
S
Q
 
Q
A
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
D
D
 
D
A
 
K
L
 
V
R
 
R
L
 
A
V
 
V
E
 
I
I
 
A
D
 
N
G
 
G
A
 
K
H
 
E
G
 
Y
T
 
P
S
 
A
L
 
-
V
 
-
D
 
-
C
 
-
D
 
D
L
 
V
L
 
V
A
 
V
V
 
V
G
 
A
Y
 
T
G
 
G
L
 
I
V
 
K
P
 
P
N
 
N
V
 
S
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
L
 
K
L
 
A
G
 
G
C
 
L
A
 
K
L
 
I
D
 
G
H
 
E
G
 
T
H
 
G
P
 
A
H
 
-
P
 
-
H
 
-
V
 
I
Q
 
W
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
Y
L
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
S
V
 
D
P
 
E
A
 
S
I
 
I
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
G
|
G
E
x
D
-
 
C
-
 
V
-
 
E
-
 
T
A
 
T
C
 
C
G
 
L
I
 
V
G
 
T
G
 
G
L
 
K
A
 
K
-
 
I
-
 
I
-
 
A
-
x
P
-
x
F
-
x
G
-
x
D
V
 
V
A
 
A
R
 
N
I
 
K
E
 
Q
G
 
G
A
x
R
I
 
V
A
 
I
G
 
G
H
 
E
M
 
N
A
 
I
A
 
T
G
 
G
H
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
F
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>N515DRAFT_0956 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_0956
MTERYDVLVVGAGPAGLAAAGTAAAHGARVGLLDAQPRAGGQVWRHDVRKNAPRAAREAI
AALHGVTLLAQHSVIASEDGALRVEIPQGSTLLTYGALVLATGARELLLPFPGWTLPGVS
GAGGLQALTKQGWPVAGKRVVVAGSGPLLLAAAATLRAHGAKLVGIHEQASAESVHAFAR
QLLHWPARATQAALLRAKLAGVPYRFGSVVRQAHGEDALRLVEIDGAHGTSLVDCDLLAV
GYGLVPNVELAQLLGCALDHGHPHPHVQVDELLRTSVPAILAAGEACGIGGLAVARIEGA
IAGHMAAGHQDDARALLPERDRARRFGALLARHFAPGARVHALATPQTLICRCEDVPLGA
LDGYADARDAKLATRCGMGACQGRICGTALAELGRFPRGAGRPPLFPARLATLAGLALSS
SDASRSST

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory