SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_3778 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_3778 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q8TDX5 2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase; Picolinate carboxylase; EC 4.1.1.45 from Homo sapiens (Human) (see paper)
50% identity, 99% coverage: 2:334/337 of query aligns to 1:335/336 of Q8TDX5

query
sites
Q8TDX5
L
 
M
K
 
K
I
 
I
D
 
D
T
 
I
H
|
H
A
 
S
H
|
H
V
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
K
D
 
E
W
 
W
P
 
P
N
 
D
L
 
L
A
 
K
A
 
K
K
 
R
F
 
F
D
 
G
D
 
Y
L
 
G
R
 
G
F
 
W
P
 
V
V
 
Q
M
 
L
T
 
Q
H
 
H
H
 
H
D
 
S
-
 
K
G
 
G
K
 
E
H
 
A
R
 
K
I
 
L
Y
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
V
F
 
F
R
 
R
E
 
V
V
 
V
W
 
R
E
 
E
S
 
N
A
 
C
F
 
W
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
H
 
V
R
 
R
I
 
I
D
 
R
D
 
E
Y
 
M
A
 
D
R
 
Q
F
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
V
 
A
V
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
W
 
W
A
 
A
P
 
K
G
 
P
Y
 
E
Q
 
D
A
 
T
L
 
L
E
 
N
L
 
L
H
 
C
R
 
Q
H
 
L
L
 
L
N
 
N
D
 
N
H
 
D
V
 
L
A
 
A
G
 
S
L
 
T
C
 
V
R
 
V
D
 
S
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
H
 
R
Y
 
F
A
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
G
T
 
T
V
 
L
P
 
P
L
 
M
Q
 
Q
S
 
A
P
 
P
D
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
M
E
 
E
R
 
R
C
 
C
I
 
V
D
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
F
H
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
T
H
 
H
C
 
V
N
 
N
D
 
E
W
 
W
N
 
D
L
 
L
D
 
N
A
 
A
P
 
Q
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
F
 
V
F
 
Y
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
E
D
 
R
L
 
L
G
 
K
A
 
C
A
 
S
V
 
L
M
 
F
V
 
V
H
|
H
P
 
P
W
 
W
D
 
D
M
 
M
M
 
Q
G
 
M
A
 
D
A
 
G
S
 
R
M
 
M
P
 
A
K
 
K
Y
 
Y
W
 
W
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Q
 
T
S
 
T
R
 
I
A
 
A
G
 
I
C
 
C
C
 
S
L
 
M
V
 
I
F
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
F
E
 
E
R
 
K
L
 
F
P
 
P
R
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
V
M
 
C
L
 
F
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
F
 
F
P
 
P
W
 
F
S
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
S
H
 
H
G
 
G
F
 
F
R
 
S
M
 
M
R
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
L
V
 
C
A
 
A
T
 
Q
D
 
D
N
 
N
P
 
P
R
 
M
N
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
K
 
G
R
 
S
L
 
F
Y
 
Y
F
 
T
D
 
D
S
 
A
C
 
L
V
 
V
H
 
H
D
 
D
P
 
P
Q
 
L
A
 
S
L
 
L
R
 
K
Y
 
L
L
 
L
L
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
K
E
 
D
R
 
K
V
 
V
M
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
P
 
P
L
 
L
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
H
 
E
P
 
P
G
 
G
S
 
K
G
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
S
L
 
M
-
 
E
G
 
E
L
 
F
E
 
D
E
 
E
A
 
E
A
 
T
R
 
K
A
 
N
R
 
K
L
 
L
F
 
K
H
 
A
G
 
G
T
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
A
W
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
E
L
 
R
Y
 
K
R
 
Q
F
 
F

4ofcA 2.0 angstroms x-ray crystal structure of human 2-amino-3- carboxymuconate-6-semialdehye decarboxylase (see paper)
50% identity, 99% coverage: 2:334/337 of query aligns to 1:335/335 of 4ofcA

query
sites
4ofcA
L
 
M
K
 
K
I
 
I
D
 
D
T
 
I
H
|
H
A
 
S
H
|
H
V
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
K
D
 
E
W
 
W
P
 
P
N
 
D
L
 
L
A
 
K
A
 
K
K
 
R
F
 
F
D
 
G
D
 
Y
L
 
G
R
 
G
F
 
W
P
 
V
V
 
Q
M
 
L
T
 
Q
H
 
H
H
 
H
D
 
S
-
 
K
G
 
G
K
 
E
H
 
A
R
 
K
I
 
L
Y
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
V
F
 
F
R
 
R
E
 
V
V
 
V
W
 
R
E
 
E
S
 
N
A
 
C
F
 
W
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
H
 
V
R
 
R
I
 
I
D
 
R
D
 
E
Y
 
M
A
 
D
R
 
Q
F
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
V
 
A
V
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
W
 
W
A
 
A
P
 
K
G
 
P
Y
 
E
Q
 
D
A
 
T
L
 
L
E
 
N
L
 
L
H
 
C
R
 
Q
H
 
L
L
 
L
N
 
N
D
 
N
H
 
D
V
 
L
A
 
A
G
 
S
L
 
T
C
 
V
R
 
V
D
 
S
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
H
 
R
Y
 
F
A
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
G
T
 
T
V
 
L
P
 
P
L
 
M
Q
 
Q
S
 
A
P
 
P
D
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
M
E
 
E
R
 
R
C
 
C
I
 
V
D
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
F
H
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
T
H
 
H
C
 
V
N
 
N
D
 
E
W
 
W
N
 
D
L
 
L
D
 
N
A
 
A
P
 
Q
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
F
 
V
F
 
Y
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
E
D
 
R
L
 
L
G
 
K
A
 
C
A
 
S
V
 
L
M
 
F
V
 
V
H
|
H
P
 
P
W
 
W
D
 
D
M
 
M
M
 
Q
G
 
M
A
 
D
A
 
G
S
 
R
M
 
M
P
 
A
K
 
K
Y
 
Y
W
 
W
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Q
 
T
S
 
T
R
 
I
A
 
A
G
 
I
C
 
C
C
 
S
L
 
M
V
 
I
F
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
F
E
 
E
R
 
K
L
 
F
P
 
P
R
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
V
M
 
C
L
 
F
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
F
 
F
P
 
P
W
 
F
S
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
S
H
 
H
G
 
G
F
 
F
R
 
S
M
 
M
R
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
L
V
 
C
A
 
A
T
 
Q
D
 
D
N
 
N
P
 
P
R
 
M
N
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
K
 
G
R
 
S
L
 
F
Y
 
Y
F
 
T
D
 
D
S
 
A
C
 
L
V
 
V
H
 
H
D
 
D
P
 
P
Q
 
L
A
 
S
L
 
L
R
 
K
Y
 
L
L
 
L
L
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
K
E
 
D
R
 
K
V
 
V
M
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
P
 
P
L
 
L
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
H
 
E
P
 
P
G
 
G
S
 
K
G
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
S
L
 
M
-
 
E
G
 
E
L
 
F
E
 
D
E
 
E
A
 
E
A
 
T
R
 
K
A
 
N
R
 
K
L
 
L
F
 
K
H
 
A
G
 
G
T
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
A
W
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
E
L
 
R
Y
 
K
R
 
Q
F
 
F

7pwyA Structure of human dimeric acmsd in complex with the inhibitor tes- 1025 (see paper)
51% identity, 99% coverage: 3:334/337 of query aligns to 1:334/334 of 7pwyA

query
sites
7pwyA
K
 
K
I
 
I
D
 
D
T
 
I
H
|
H
A
 
S
H
|
H
V
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
K
D
 
E
W
 
W
P
 
P
N
 
D
L
 
L
A
 
K
A
 
K
K
 
R
F
 
F
D
 
G
D
 
Y
L
 
G
R
 
G
F
 
W
P
 
V
V
 
Q
M
 
L
T
 
Q
H
 
H
H
 
H
D
 
S
-
 
K
G
 
G
K
 
E
H
 
A
R
 
K
I
 
L
Y
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
V
F
|
F
R
|
R
E
 
V
V
 
V
W
 
R
E
 
E
S
 
N
A
 
C
F
 
W
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
H
 
V
R
 
R
I
 
I
D
 
R
D
 
E
Y
 
M
A
 
D
R
 
Q
F
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
V
 
A
V
 
L
S
 
S
T
 
T
V
|
V
P
|
P
V
|
V
L
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
W
 
W
A
 
A
P
 
K
G
 
P
Y
 
E
Q
 
D
A
 
T
L
 
L
E
 
N
L
 
L
H
 
C
R
 
Q
H
 
L
L
 
L
N
 
N
D
 
N
H
 
D
V
 
L
A
 
A
G
 
S
L
 
T
C
 
V
R
 
V
D
 
S
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
H
 
R
Y
 
F
A
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
G
T
 
T
V
 
L
P
 
P
L
 
M
Q
 
Q
S
 
A
P
 
P
D
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
M
E
 
E
R
 
R
C
 
C
I
 
V
D
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
F
H
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
T
H
 
H
C
 
V
N
 
N
D
 
E
W
 
W
N
 
D
L
 
L
D
 
N
A
 
A
P
 
Q
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
F
 
V
F
 
Y
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
E
D
 
R
L
 
L
G
 
K
A
 
C
A
 
S
V
 
L
M
 
F
V
 
V
H
|
H
P
 
P
W
|
W
D
 
D
M
 
M
M
 
Q
G
x
M
A
 
D
A
 
G
S
 
R
M
 
M
P
 
A
K
 
K
Y
 
Y
W
 
W
L
 
L
P
 
P
W
|
W
L
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Q
 
T
S
 
T
R
 
I
A
 
A
G
 
I
C
 
C
C
 
S
L
 
M
V
 
I
F
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
F
E
 
E
R
 
K
L
 
F
P
 
P
R
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
V
M
 
C
L
 
F
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
F
 
F
P
 
P
W
 
F
S
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
S
H
 
H
G
 
G
F
 
F
R
 
S
M
 
M
R
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
L
V
 
C
A
 
A
T
 
Q
D
 
D
N
 
N
P
 
P
R
 
M
N
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
K
 
G
R
 
S
L
 
F
Y
 
Y
F
 
T
D
 
D
S
 
A
C
 
L
V
 
V
H
 
H
D
 
D
P
 
P
Q
 
L
A
 
S
L
 
L
R
 
K
Y
 
L
L
 
L
L
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
K
E
 
D
R
 
K
V
 
V
M
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
|
F
P
 
P
L
 
L
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
H
 
E
P
 
P
G
 
G
S
 
K
G
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
S
L
 
M
-
 
E
G
 
E
L
 
F
E
 
D
E
 
E
A
 
E
A
 
T
R
 
K
A
 
N
R
 
K
L
 
L
F
 
K
H
 
A
G
 
G
T
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
A
W
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
E
L
 
R
Y
 
K
R
 
Q
F
 
F

4ih3A 2.5 angstroms x-ray crystal structure of of human 2-amino-3- carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase in complex with dipicolinic acid (see paper)
51% identity, 97% coverage: 2:329/337 of query aligns to 1:330/332 of 4ih3A

query
sites
4ih3A
L
 
M
K
 
K
I
 
I
D
 
D
T
 
I
H
|
H
A
 
S
H
|
H
V
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
K
D
 
E
W
 
W
P
 
P
N
 
D
L
 
L
A
 
K
A
 
K
K
 
R
F
 
F
D
 
G
D
 
Y
L
 
G
R
 
G
F
 
W
P
 
V
V
 
Q
M
 
L
T
 
Q
H
 
H
H
 
H
D
 
S
-
 
K
G
 
G
K
 
E
H
 
A
R
 
K
I
 
L
Y
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
V
F
 
F
R
|
R
E
 
V
V
 
V
W
 
R
E
 
E
S
 
N
A
 
C
F
 
W
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
H
 
V
R
 
R
I
 
I
D
 
R
D
 
E
Y
 
M
A
 
D
R
 
Q
F
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
V
 
A
V
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
V
P
|
P
V
 
V
L
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
W
 
W
A
 
A
P
 
K
G
 
P
Y
 
E
Q
 
D
A
 
T
L
 
L
E
 
N
L
 
L
H
 
C
R
 
Q
H
 
L
L
 
L
N
 
N
D
 
N
H
 
D
V
 
L
A
 
A
G
 
S
L
 
T
C
 
V
R
 
V
D
 
S
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
H
 
R
Y
 
F
A
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
G
T
 
T
V
 
L
P
 
P
L
 
M
Q
 
Q
S
 
A
P
 
P
D
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
M
E
 
E
R
 
R
C
 
C
I
 
V
D
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
F
H
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
T
H
 
H
C
 
V
N
 
N
D
 
E
W
 
W
N
 
D
L
 
L
D
 
N
A
 
A
P
 
Q
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
F
 
V
F
 
Y
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
E
D
 
R
L
 
L
G
 
K
A
 
C
A
 
S
V
 
L
M
 
F
V
 
V
H
|
H
P
 
P
W
 
W
D
 
D
M
 
M
M
 
Q
G
 
M
A
 
D
A
 
G
S
 
R
M
 
M
P
 
A
K
 
K
Y
 
Y
W
 
W
L
 
L
P
 
P
W
|
W
L
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Q
 
T
S
 
T
R
 
I
A
 
A
G
 
I
C
 
C
C
 
S
L
 
M
V
 
I
F
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
F
E
 
E
R
 
K
L
 
F
P
 
P
R
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
V
M
 
C
L
 
F
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
F
 
F
P
 
P
W
 
F
S
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
S
H
 
H
G
 
G
F
 
F
R
 
S
M
 
M
R
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
L
V
 
C
A
 
A
T
 
Q
D
 
D
N
 
N
P
 
P
R
 
M
N
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
K
 
G
R
 
S
L
 
F
Y
 
Y
F
 
T
D
 
D
S
 
A
C
 
L
V
 
V
H
 
H
D
 
D
P
 
P
Q
 
L
A
 
S
L
 
L
R
 
K
Y
 
L
L
 
L
L
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
K
E
 
D
R
 
K
V
 
V
M
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
P
 
P
L
|
L
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
H
 
E
P
 
P
G
 
G
S
 
K
G
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
S
L
 
M
-
 
E
G
 
E
L
 
F
E
 
D
E
 
E
A
 
E
A
 
T
R
 
K
A
 
N
R
 
K
L
 
L
F
 
K
H
 
A
G
 
G
T
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
A
W
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L

2wm1A The crystal structure of human alpha-amino-beta-carboxymuconate- epsilon-semialdehyde decarboxylase in complex with 1,3- dihydroxyacetonephosphate suggests a regulatory link between NAD synthesis and glycolysis (see paper)
51% identity, 97% coverage: 2:329/337 of query aligns to 1:330/332 of 2wm1A

query
sites
2wm1A
L
 
M
K
 
K
I
 
I
D
 
D
T
 
I
H
|
H
A
 
S
H
|
H
V
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
K
D
 
E
W
 
W
P
 
P
N
 
D
L
 
L
A
 
K
A
 
K
K
 
R
F
 
F
D
 
G
D
 
Y
L
 
G
R
 
G
F
 
W
P
 
V
V
 
Q
M
 
L
T
 
Q
H
 
H
H
 
H
D
 
S
-
 
K
G
 
G
K
 
E
H
 
A
R
 
K
I
 
L
Y
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
K
F
 
V
F
 
F
R
|
R
E
 
V
V
 
V
W
 
R
E
 
E
S
 
N
A
 
C
F
 
W
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
H
 
V
R
 
R
I
 
I
D
 
R
D
 
E
Y
 
M
A
 
D
R
 
Q
F
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
V
 
A
V
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
V
P
|
P
V
 
V
L
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
W
 
W
A
 
A
P
 
K
G
 
P
Y
 
E
Q
 
D
A
 
T
L
 
L
E
 
N
L
 
L
H
 
C
R
 
Q
H
 
L
L
 
L
N
 
N
D
 
N
H
 
D
V
 
L
A
 
A
G
 
S
L
 
T
C
 
V
R
 
V
D
 
S
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
H
 
R
Y
 
F
A
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
G
T
 
T
V
 
L
P
 
P
L
 
M
Q
 
Q
S
 
A
P
 
P
D
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
M
E
 
E
R
 
R
C
 
C
I
 
V
D
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
F
H
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
T
H
 
H
C
 
V
N
 
N
D
 
E
W
 
W
N
 
D
L
 
L
D
 
N
A
 
A
P
 
Q
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
F
 
V
F
 
Y
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
E
D
 
R
L
 
L
G
 
K
A
 
C
A
 
S
V
 
L
M
 
F
V
 
V
H
|
H
P
 
P
W
 
W
D
 
D
M
 
M
M
 
Q
G
 
M
A
 
D
A
 
G
S
 
R
M
 
M
P
 
A
K
 
K
Y
 
Y
W
 
W
L
 
L
P
 
P
W
|
W
L
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Q
 
T
S
 
T
R
 
I
A
 
A
G
 
I
C
 
C
C
 
S
L
 
M
V
 
I
F
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
F
E
 
E
R
 
K
L
 
F
P
 
P
R
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
V
M
 
C
L
 
F
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
F
 
F
P
 
P
W
 
F
S
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
S
H
 
H
G
 
G
F
 
F
R
 
S
M
 
M
R
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
L
V
 
C
A
 
A
T
 
Q
D
 
D
N
 
N
P
 
P
R
 
M
N
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
K
 
G
R
 
S
L
 
F
Y
 
Y
F
 
T
D
 
D
S
 
A
C
 
L
V
 
V
H
 
H
D
 
D
P
 
P
Q
 
L
A
 
S
L
 
L
R
 
K
Y
 
L
L
 
L
L
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
K
E
 
D
R
 
K
V
 
V
M
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
|
F
P
 
P
L
|
L
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
H
 
E
P
 
P
G
 
G
S
 
K
G
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
S
L
 
M
-
 
E
G
 
E
L
 
F
E
 
D
E
 
E
A
 
E
A
 
T
R
 
K
A
 
N
R
 
K
L
 
L
F
 
K
H
 
A
G
 
G
T
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
A
W
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L

7pwyC Structure of human dimeric acmsd in complex with the inhibitor tes- 1025 (see paper)
47% identity, 97% coverage: 3:329/337 of query aligns to 1:300/301 of 7pwyC

query
sites
7pwyC
K
 
K
I
 
I
D
 
D
T
 
I
H
|
H
A
 
S
H
|
H
V
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
K
D
 
E
W
 
W
P
 
P
N
 
D
L
 
L
A
 
K
A
 
K
K
 
R
F
 
F
D
 
G
D
 
-
L
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
-
V
 
-
M
 
-
T
 
-
H
 
-
H
 
Y
D
 
G
G
 
G
K
 
W
H
 
V
R
 
Q
I
 
L
Y
 
Q
-
 
A
K
 
K
D
 
L
G
 
L
K
 
K
F
 
V
F
 
F
R
 
R
E
 
V
V
 
V
W
 
R
E
 
E
S
 
N
A
 
C
F
 
W
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
H
 
V
R
 
R
I
 
I
D
 
R
D
 
E
Y
 
M
A
 
D
R
 
Q
F
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
V
 
A
V
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
M
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
W
 
W
A
 
A
P
 
K
G
 
P
Y
 
E
Q
 
D
A
 
T
L
 
L
E
 
N
L
 
L
H
 
C
R
 
Q
H
 
L
L
 
L
N
 
N
D
 
N
H
 
D
V
 
L
A
 
A
G
 
S
L
 
T
C
 
V
R
 
V
D
 
S
Y
 
Y
P
 
P
R
 
R
H
 
R
Y
 
F
A
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
G
T
 
T
V
 
L
P
 
P
L
 
M
Q
 
Q
S
 
A
P
 
P
D
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
M
E
 
E
R
 
R
C
 
C
I
 
V
D
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
F
H
 
P
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
T
H
 
H
C
 
V
N
 
N
D
 
E
W
 
W
N
 
D
L
 
L
D
 
N
A
 
A
P
 
Q
E
 
E
L
 
L
F
 
F
P
 
P
F
 
V
F
 
Y
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
E
D
 
R
L
 
L
G
 
K
A
 
C
A
 
S
V
 
L
M
 
F
V
 
V
H
|
H
P
 
P
W
 
W
D
 
D
M
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
M
 
-
P
 
-
K
 
K
Y
 
Y
W
 
W
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Q
 
T
S
 
T
R
 
I
A
 
A
G
 
I
C
 
C
C
 
S
L
 
M
V
 
I
F
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
F
E
 
E
R
 
K
L
 
F
P
 
P
R
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
V
M
 
C
L
 
F
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
F
 
F
P
 
P
W
 
F
S
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
S
H
 
H
G
 
G
F
 
F
R
 
-
M
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
S
N
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
K
Y
 
Y
L
 
L
K
 
G
R
 
S
L
 
F
Y
 
Y
F
 
T
D
 
D
S
 
A
C
 
L
V
 
V
H
 
H
D
 
D
P
 
P
Q
 
L
A
 
S
L
 
L
R
 
K
Y
 
L
L
 
L
L
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
K
E
 
D
R
 
K
V
 
V
M
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
P
 
P
L
 
L
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
H
 
E
P
 
P
G
 
G
S
 
K
G
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
S
L
 
M
-
 
E
G
 
E
L
 
F
E
 
D
E
 
E
A
 
E
A
 
T
R
 
K
A
 
N
R
 
K
L
 
L
F
 
K
H
 
A
G
 
G
T
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
A
W
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L

7k13C Acmsd in complex with diflunisal derivative 14 (see paper)
39% identity, 97% coverage: 3:329/337 of query aligns to 3:330/331 of 7k13C

query
sites
7k13C
K
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
M
H
|
H
A
 
S
H
|
H
V
 
F
L
 
F
P
 
P
R
 
R
D
 
I
W
 
S
P
 
E
N
 
Q
L
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
F
 
F
D
 
D
D
 
A
L
 
N
R
 
H
F
 
A
P
 
P
-
 
W
-
 
L
V
 
Q
M
 
V
T
 
S
H
 
A
H
 
K
D
 
G
G
 
D
K
 
T
H
 
G
R
 
S
I
 
I
Y
 
M
K
 
M
D
 
G
G
 
K
K
 
N
F
 
N
F
 
F
R
|
R
E
x
P
V
 
V
W
 
Y
E
 
Q
S
 
A
A
 
L
F
 
W
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
H
 
F
R
 
R
I
 
I
D
 
E
D
 
E
Y
 
M
A
 
D
R
 
A
F
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
D
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
V
 
T
S
 
C
T
 
A
V
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
M
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
W
 
T
A
 
W
P
 
E
G
 
A
Y
 
N
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
Q
L
 
W
H
 
A
R
 
E
H
 
R
L
 
M
N
 
N
D
 
D
H
 
F
V
 
A
A
 
L
G
 
E
L
 
F
C
 
A
R
 
A
D
 
H
Y
 
N
P
 
P
R
 
Q
H
 
R
Y
 
I
A
 
K
G
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
S
 
D
P
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
C
R
 
K
E
 
E
L
 
A
E
 
S
R
 
R
C
 
A
I
 
V
D
 
-
E
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
H
H
 
L
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
N
H
 
H
C
 
L
N
 
G
D
 
D
W
 
K
N
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
D
P
 
A
E
 
T
L
 
L
F
 
E
P
 
A
F
 
F
F
 
L
E
 
T
A
 
H
A
 
C
A
 
A
D
 
N
L
 
E
G
 
D
A
 
I
A
 
P
V
 
I
M
 
L
V
 
V
H
|
H
P
 
P
W
 
W
D
 
D
M
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
G
A
 
Q
S
 
R
M
 
M
P
 
K
K
 
K
Y
 
W
W
x
M
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
V
 
V
G
 
A
M
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Q
 
T
S
 
Q
R
 
L
A
 
A
G
 
I
C
 
L
C
 
S
L
 
L
V
 
I
F
 
L
G
 
S
G
 
G
V
 
A
L
 
F
E
 
E
R
 
R
L
 
I
P
 
P
R
 
K
-
 
S
L
 
L
R
 
K
V
 
I
M
 
C
L
 
F
A
 
G
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
F
P
 
A
W
 
F
S
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
E
 
D
H
 
N
G
 
A
F
 
W
R
 
R
M
 
H
R
 
R
P
 
-
D
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
R
T
 
E
D
 
D
N
 
C
P
 
P
R
 
R
N
 
P
P
 
P
R
 
S
E
 
E
Y
 
Y
L
 
V
K
 
D
R
 
R
L
 
F
Y
 
F
F
 
V
D
 
D
S
 
S
C
 
A
V
 
V
H
 
F
D
 
N
P
 
P
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
V
D
 
S
V
 
V
T
 
M
G
 
G
V
 
E
E
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
G
T
 
S
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
P
 
P
L
 
L
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
H
 
K
P
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
L
I
 
V
E
 
L
A
 
S
L
 
S
G
 
N
L
 
L
E
 
G
E
 
E
A
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
D
R
 
K
L
 
I
F
 
I
H
 
S
G
 
G
T
 
N
A
 
A
L
 
S
E
 
K
W
 
F
L
 
F
G
 
N
L
 
I

7k12A Acmsd in complex with diflunisal (see paper)
39% identity, 97% coverage: 3:329/337 of query aligns to 3:330/331 of 7k12A

query
sites
7k12A
K
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
M
H
|
H
A
 
S
H
|
H
V
 
F
L
 
F
P
 
P
R
 
R
D
 
I
W
 
S
P
 
E
N
 
Q
L
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
F
 
F
D
 
D
D
 
A
L
 
N
R
 
H
F
 
A
P
 
P
-
 
W
-
 
L
V
 
Q
M
 
V
T
 
S
H
 
A
H
 
K
D
 
G
G
 
D
K
 
T
H
 
G
R
 
S
I
 
I
Y
 
M
K
 
M
D
 
G
G
 
K
K
 
N
F
 
N
F
|
F
R
|
R
E
 
P
V
 
V
W
 
Y
E
 
Q
S
 
A
A
 
L
F
 
W
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
H
 
F
R
 
R
I
 
I
D
 
E
D
 
E
Y
 
M
A
 
D
R
 
A
F
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
D
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
V
 
T
S
 
C
T
 
A
V
 
T
P
 
P
V
|
V
L
 
M
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
W
 
T
A
 
W
P
 
E
G
 
A
Y
 
N
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
Q
L
 
W
H
 
A
R
 
E
H
 
R
L
 
M
N
 
N
D
 
D
H
 
F
V
 
A
A
 
L
G
 
E
L
 
F
C
 
A
R
 
A
D
 
H
Y
 
N
P
 
P
R
 
Q
H
 
R
Y
 
I
A
 
K
G
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
S
 
D
P
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
C
R
 
K
E
 
E
L
 
A
E
 
S
R
 
R
C
 
A
I
 
V
D
 
-
E
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
H
H
 
L
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
N
H
 
H
C
 
L
N
 
G
D
 
D
W
 
K
N
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
D
P
 
A
E
 
T
L
 
L
F
 
E
P
 
A
F
 
F
F
 
L
E
 
T
A
 
H
A
 
C
A
 
A
D
 
N
L
 
E
G
 
D
A
 
I
A
 
P
V
 
I
M
 
L
V
 
V
H
|
H
P
 
P
W
 
W
D
 
D
M
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
G
A
 
Q
S
 
R
M
 
M
P
 
K
K
 
K
Y
 
W
W
x
M
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
V
 
V
G
 
A
M
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Q
 
T
S
 
Q
R
 
L
A
 
A
G
 
I
C
 
L
C
 
S
L
 
L
V
 
I
F
 
L
G
 
S
G
 
G
V
 
A
L
 
F
E
 
E
R
 
R
L
 
I
P
 
P
R
 
K
-
 
S
L
 
L
R
 
K
V
 
I
M
 
C
L
 
F
A
 
G
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
F
P
 
A
W
 
F
S
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
E
 
D
H
 
N
G
 
A
F
 
W
R
 
R
M
 
H
R
 
R
P
 
-
D
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
R
T
 
E
D
 
D
N
 
C
P
 
P
R
 
R
N
 
P
P
 
P
R
 
S
E
 
E
Y
 
Y
L
 
V
K
 
D
R
 
R
L
 
F
Y
 
F
F
 
V
D
 
D
S
 
S
C
 
A
V
 
V
H
 
F
D
 
N
P
 
P
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
V
D
 
S
V
 
V
T
 
M
G
 
G
V
 
E
E
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
G
T
 
S
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
|
F
P
|
P
L
|
L
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
H
 
K
P
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
L
I
 
V
E
 
L
A
 
S
L
 
S
G
 
N
L
 
L
E
 
G
E
 
E
A
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
D
R
 
K
L
 
I
F
 
I
H
 
S
G
 
G
T
 
N
A
 
A
L
 
S
E
 
K
W
 
F
L
 
F
G
 
N
L
 
I

2hbvA Crystal structure of alpha-amino-beta-carboxymuconate-epsilon- semialdehyde-decarboxylase (acmsd) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 3:329/337 of query aligns to 3:330/331 of 2hbvA

query
sites
2hbvA
K
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
M
H
|
H
A
 
S
H
|
H
V
 
F
L
 
F
P
 
P
R
 
R
D
 
I
W
 
S
P
 
E
N
 
Q
L
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
F
 
F
D
 
D
D
 
A
L
 
N
R
 
H
F
 
A
P
 
P
-
 
W
-
 
L
V
 
Q
M
 
V
T
 
S
H
 
A
H
 
K
D
 
G
G
 
D
K
 
T
H
 
G
R
 
S
I
 
I
Y
 
M
K
 
M
D
 
G
G
 
K
K
 
N
F
 
N
F
 
F
R
 
R
E
 
P
V
 
V
W
 
Y
E
 
Q
S
 
A
A
 
L
F
 
W
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
H
 
F
R
 
R
I
 
I
D
 
E
D
 
E
Y
 
M
A
 
D
R
 
A
F
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
D
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
V
 
T
S
 
C
T
 
A
V
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
M
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
W
 
T
A
 
W
P
 
E
G
 
A
Y
 
N
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
Q
L
 
W
H
 
A
R
 
E
H
 
R
L
 
M
N
 
N
D
 
D
H
 
F
V
 
A
A
 
L
G
 
E
L
 
F
C
 
A
R
 
A
D
 
H
Y
 
N
P
 
P
R
 
Q
H
 
R
Y
 
I
A
 
K
G
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
S
 
D
P
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
C
R
 
K
E
 
E
L
 
A
E
 
S
R
 
R
C
 
A
I
 
V
D
 
-
E
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
H
H
 
L
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
N
H
 
H
C
 
L
N
 
G
D
 
D
W
 
K
N
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
D
P
 
A
E
 
T
L
 
L
F
 
E
P
 
A
F
 
F
F
 
L
E
 
T
A
 
H
A
 
C
A
 
A
D
 
N
L
 
E
G
 
D
A
 
I
A
 
P
V
 
I
M
 
L
V
 
V
H
|
H
P
 
P
W
 
W
D
 
D
M
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
G
A
 
Q
S
 
R
M
 
M
P
 
K
K
 
K
Y
 
W
W
 
M
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
V
 
V
G
 
A
M
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Q
 
T
S
 
Q
R
 
L
A
 
A
G
 
I
C
 
L
C
 
S
L
 
L
V
 
I
F
 
L
G
 
S
G
 
G
V
 
A
L
 
F
E
 
E
R
 
R
L
 
I
P
 
P
R
 
K
-
 
S
L
 
L
R
 
K
V
 
I
M
 
C
L
 
F
A
 
G
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
F
P
 
A
W
 
F
S
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
E
 
D
H
 
N
G
 
A
F
 
W
R
 
R
M
 
H
R
 
R
P
 
-
D
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
R
T
 
E
D
 
D
N
 
C
P
 
P
R
 
R
N
 
P
P
 
P
R
 
S
E
 
E
Y
 
Y
L
 
V
K
 
D
R
 
R
L
 
F
Y
 
F
F
 
V
D
 
D
S
 
S
C
 
A
V
 
V
H
 
F
D
 
N
P
 
P
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
V
D
 
S
V
 
V
T
 
M
G
 
G
V
 
E
E
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
G
T
 
S
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
P
 
P
L
 
L
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
H
 
K
P
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
L
I
 
V
E
 
L
A
 
S
L
 
S
G
 
N
L
 
L
E
 
G
E
 
E
A
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
D
R
 
K
L
 
I
F
 
I
H
 
S
G
 
G
T
 
N
A
 
A
L
 
S
E
 
K
W
 
F
L
 
F
G
 
N
L
 
I

4ergA Evidence for a dual role of an active site histidine in alpha-amino- beta-carboxymuconate-epsilon-semialdehyde decarboxylase (see paper)
38% identity, 97% coverage: 3:329/337 of query aligns to 3:330/332 of 4ergA

query
sites
4ergA
K
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
M
H
|
H
A
 
S
H
|
H
V
 
F
L
 
F
P
 
P
R
 
R
D
 
I
W
 
S
P
 
E
N
 
Q
L
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
F
 
F
D
 
D
D
 
A
L
 
N
R
 
H
F
 
A
P
 
P
-
 
W
-
 
L
V
 
Q
M
 
V
T
 
S
H
 
A
H
 
K
D
 
G
G
 
D
K
 
T
H
 
G
R
 
S
I
 
I
Y
 
M
K
 
M
D
 
G
G
 
K
K
 
N
F
 
N
F
 
F
R
 
R
E
 
P
V
 
V
W
 
Y
E
 
Q
S
 
A
A
 
L
F
 
W
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
H
 
F
R
 
R
I
 
I
D
 
E
D
 
E
Y
 
M
A
 
D
R
 
A
F
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
D
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
V
 
T
S
 
C
T
 
A
V
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
M
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
W
 
T
A
 
W
P
 
E
G
 
A
Y
 
N
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
Q
L
 
W
H
 
A
R
 
E
H
 
R
L
 
M
N
 
N
D
 
D
H
 
F
V
 
A
A
 
L
G
 
E
L
 
F
C
 
A
R
 
A
D
 
H
Y
 
N
P
 
P
R
 
Q
H
 
R
Y
 
I
A
 
K
G
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
S
 
D
P
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
C
R
 
K
E
 
E
L
 
A
E
 
S
R
 
R
C
 
A
I
 
V
D
 
-
E
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
H
H
 
L
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
N
H
 
H
C
 
L
N
 
G
D
 
D
W
 
K
N
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
D
P
 
A
E
 
T
L
 
L
F
 
E
P
 
A
F
 
F
F
 
L
E
 
T
A
 
H
A
 
C
A
 
A
D
 
N
L
 
E
G
 
D
A
 
I
A
 
P
V
 
I
M
 
L
V
 
V
H
|
H
P
 
P
W
 
W
D
 
D
M
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
G
A
 
Q
S
 
R
M
 
M
P
 
K
K
 
K
Y
 
W
W
 
M
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
V
 
V
G
 
A
M
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Q
 
T
S
 
Q
R
 
L
A
 
A
G
 
I
C
 
L
C
 
S
L
 
L
V
 
I
F
 
L
G
 
S
G
 
G
V
 
A
L
 
F
E
 
E
R
 
R
L
 
I
P
 
P
R
 
K
-
 
S
L
 
L
R
 
K
V
 
I
M
 
C
L
 
F
A
 
G
H
x
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
F
P
 
A
W
 
F
S
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
E
 
D
H
 
N
G
 
A
F
 
W
R
 
R
M
 
H
R
 
R
P
 
-
D
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
R
T
 
E
D
 
D
N
 
C
P
 
P
R
 
R
N
 
P
P
 
P
R
 
S
E
 
E
Y
 
Y
L
 
V
K
 
D
R
 
R
L
 
F
Y
 
F
F
 
V
D
 
D
S
 
S
C
 
A
V
 
V
H
 
F
D
 
N
P
 
P
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
V
D
 
S
V
 
V
T
 
M
G
 
G
V
 
E
E
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
G
T
 
S
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
P
 
P
L
 
L
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
H
 
K
P
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
L
I
 
V
E
 
L
A
 
S
L
 
S
G
 
N
L
 
L
E
 
G
E
 
E
A
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
D
R
 
K
L
 
I
F
 
I
H
 
S
G
 
G
T
 
N
A
 
A
L
 
S
E
 
K
W
 
F
L
 
F
G
 
N
L
 
I

4eraA Evidence for a dual role of an active site histidine in alpha-amino- beta-carboxymuconate-epsilon-semialdehyde decarboxylase (see paper)
38% identity, 97% coverage: 3:329/337 of query aligns to 3:330/332 of 4eraA

query
sites
4eraA
K
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
M
H
|
H
A
 
S
H
|
H
V
 
F
L
 
F
P
 
P
R
 
R
D
 
I
W
 
S
P
 
E
N
 
Q
L
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
F
 
F
D
 
D
D
 
A
L
 
N
R
 
H
F
 
A
P
 
P
-
 
W
-
 
L
V
 
Q
M
 
V
T
 
S
H
 
A
H
 
K
D
 
G
G
 
D
K
 
T
H
 
G
R
 
S
I
 
I
Y
 
M
K
 
M
D
 
G
G
 
K
K
 
N
F
 
N
F
 
F
R
 
R
E
 
P
V
 
V
W
 
Y
E
 
Q
S
 
A
A
 
L
F
 
W
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
H
 
F
R
 
R
I
 
I
D
 
E
D
 
E
Y
 
M
A
 
D
R
 
A
F
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
D
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
V
 
T
S
 
C
T
 
A
V
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
M
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
W
 
T
A
 
W
P
 
E
G
 
A
Y
 
N
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
Q
L
 
W
H
 
A
R
 
E
H
 
R
L
 
M
N
 
N
D
 
D
H
 
F
V
 
A
A
 
L
G
 
E
L
 
F
C
 
A
R
 
A
D
 
H
Y
 
N
P
 
P
R
 
Q
H
 
R
Y
 
I
A
 
K
G
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
S
 
D
P
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
C
R
 
K
E
 
E
L
 
A
E
 
S
R
 
R
C
 
A
I
 
V
D
 
-
E
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
H
H
 
L
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
N
H
 
H
C
 
L
N
 
G
D
 
D
W
 
K
N
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
D
P
 
A
E
 
T
L
 
L
F
 
E
P
 
A
F
 
F
F
 
L
E
 
T
A
 
H
A
 
C
A
 
A
D
 
N
L
 
E
G
 
D
A
 
I
A
 
P
V
 
I
M
 
L
V
 
V
H
|
H
P
 
P
W
 
W
D
 
D
M
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
G
A
 
Q
S
 
R
M
 
M
P
 
K
K
 
K
Y
 
W
W
 
M
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
V
 
V
G
 
A
M
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
Q
 
T
S
 
Q
R
 
L
A
 
A
G
 
I
C
 
L
C
 
S
L
 
L
V
 
I
F
 
L
G
 
S
G
 
G
V
 
A
L
 
F
E
 
E
R
 
R
L
 
I
P
 
P
R
 
K
-
 
S
L
 
L
R
 
K
V
 
I
M
 
C
L
 
F
A
 
G
H
x
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
F
P
 
A
W
 
F
S
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
E
 
D
H
 
N
G
 
A
F
 
W
R
 
R
M
 
H
R
 
R
P
 
-
D
 
D
L
 
I
V
 
V
A
 
R
T
 
E
D
 
D
N
 
C
P
 
P
R
 
R
N
 
P
P
 
P
R
 
S
E
 
E
Y
 
Y
L
 
V
K
 
D
R
 
R
L
 
F
Y
 
F
F
 
V
D
 
D
S
 
S
C
 
A
V
 
V
H
 
F
D
 
N
P
 
P
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
E
Y
 
L
L
 
L
L
 
V
D
 
S
V
 
V
T
 
M
G
 
G
V
 
E
E
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
G
T
 
S
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
P
 
P
L
 
L
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
H
 
K
P
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
L
I
 
V
E
 
L
A
 
S
L
 
S
G
 
N
L
 
L
E
 
G
E
 
E
A
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
D
R
 
K
L
 
I
F
 
I
H
 
S
G
 
G
T
 
N
A
 
A
L
 
S
E
 
K
W
 
F
L
 
F
G
 
N
L
 
I

4ni8A Crystal structure of 5-carboxyvanillate decarboxylase ligw from sphingomonas paucimobilis complexed with mn and 5-methoxyisophtalic acid
33% identity, 64% coverage: 79:294/337 of query aligns to 73:300/335 of 4ni8A

query
sites
4ni8A
L
 
L
F
 
L
S
 
S
Y
 
L
W
 
T
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
V
Q
 
Q
A
 
M
L
 
F
E
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
T
-
 
R
L
 
L
H
 
A
R
 
R
H
 
I
L
 
A
N
 
N
D
 
D
H
 
L
V
 
M
A
 
A
G
 
Q
L
 
T
C
 
V
R
 
A
D
 
A
Y
 
N
P
 
P
R
 
T
H
 
R
Y
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
G
T
 
T
V
 
F
P
 
A
L
 
P
Q
 
Q
S
 
D
P
 
P
D
 
A
L
 
S
A
 
A
I
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
E
 
E
R
 
R
C
 
V
I
 
A
D
 
T
E
 
Q
L
 
L
G
 
R
L
 
L
H
 
N
G
 
G
V
 
L
Q
 
V
V
 
I
G
 
N
S
 
S
H
 
H
C
 
T
N
 
N
D
 
D
W
 
L
N
 
Y
L
 
Y
D
 
D
A
 
D
P
 
P
E
 
F
L
 
F
F
 
H
P
 
P
F
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
E
D
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
L
M
 
Y
V
 
I
H
|
H
P
 
P
W
 
R
-
 
A
-
 
P
D
 
S
M
 
K
M
 
Q
G
 
I
A
 
D
A
 
R
S
 
A
M
 
F
P
 
R
K
 
D
Y
 
Y
W
 
G
L
 
M
P
 
N
W
 
S
L
x
A
V
 
I
-
 
W
G
 
G
M
x
Y
P
 
G
A
 
I
E
 
E
Q
 
T
S
 
S
R
 
T
A
 
N
G
 
A
C
 
V
C
 
R
L
 
M
V
 
I
F
 
L
G
 
S
G
 
G
V
 
L
L
 
F
E
 
D
R
 
R
L
 
F
P
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
K
V
 
I
M
 
V
L
 
L
A
 
G
H
|
H
G
 
M
G
 
G
G
 
E
S
 
A
F
 
I
P
 
P
W
 
F
S
 
W
I
 
L
G
 
W
R
 
R
I
 
L
E
 
D
-
 
Y
-
 
M
H
 
H
G
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
T
F
 
F
R
 
G
M
 
G
R
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
L
V
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
K
R
 
L
N
 
K
P
 
P
R
 
S
E
 
E
Y
 
Y
L
 
F
K
 
R
R
 
R
L
 
N
Y
 
F
-
 
A
-
 
I
F
 
T
D
 
T
S
 
S
C
 
G
V
 
V
H
 
E
D
 
S
P
 
H
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
L
 
S
L
 
I
D
 
E
V
 
V
T
 
L
G
 
G
V
 
P
E
 
E
R
 
N
V
 
V
M
 
M
L
 
W
G
 
A
T
 
I
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
x
Y

Sites not aligning to the query:

4ng3A Crystal structure of 5-carboxyvanillate decarboxylase from sphingomonas paucimobilis complexed with 4-hydroxy-3-methoxy-5- nitrobenzoic acid
33% identity, 64% coverage: 79:294/337 of query aligns to 73:300/335 of 4ng3A

query
sites
4ng3A
L
 
L
F
 
L
S
 
S
Y
 
L
W
 
T
A
|
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
V
Q
 
Q
A
 
M
L
 
F
E
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
T
-
 
R
L
 
L
H
 
A
R
 
R
H
 
I
L
 
A
N
 
N
D
 
D
H
 
L
V
 
M
A
 
A
G
 
Q
L
 
T
C
 
V
R
 
A
D
 
A
Y
 
N
P
 
P
R
 
T
H
 
R
Y
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
G
T
 
T
V
 
F
P
 
A
L
 
P
Q
 
Q
S
 
D
P
 
P
D
 
A
L
 
S
A
 
A
I
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
E
 
E
R
 
R
C
 
V
I
 
A
D
 
T
E
 
Q
L
 
L
G
 
R
L
 
L
H
 
N
G
 
G
V
 
L
Q
 
V
V
 
I
G
 
N
S
 
S
H
 
H
C
 
T
N
 
N
D
 
D
W
 
L
N
 
Y
L
 
Y
D
 
D
A
 
D
P
 
P
E
 
F
L
 
F
F
 
H
P
 
P
F
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
E
D
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
L
M
 
Y
V
 
I
H
|
H
P
 
P
W
 
R
-
 
A
-
 
P
D
 
S
M
 
K
M
 
Q
G
 
I
A
 
D
A
 
R
S
 
A
M
 
F
P
 
R
K
 
D
Y
 
Y
W
 
G
L
 
M
P
 
N
W
 
S
L
 
A
V
 
I
-
 
W
G
 
G
M
 
Y
P
 
G
A
 
I
E
 
E
Q
 
T
S
 
S
R
 
T
A
 
N
G
 
A
C
 
V
C
 
R
L
 
M
V
 
I
F
 
L
G
 
S
G
 
G
V
 
L
L
 
F
E
 
D
R
 
R
L
 
F
P
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
K
V
 
I
M
 
V
L
 
L
A
 
G
H
|
H
G
 
M
G
 
G
G
 
E
S
 
A
F
 
I
P
 
P
W
 
F
S
 
W
I
 
L
G
 
W
R
 
R
I
 
L
E
 
D
-
 
Y
-
 
M
H
 
H
G
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
T
F
 
F
R
 
G
M
 
G
R
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
L
V
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
K
R
 
L
N
 
K
P
 
P
R
 
S
E
 
E
Y
 
Y
L
 
F
K
 
R
R
 
R
L
 
N
Y
 
F
-
 
A
-
 
I
F
 
T
D
 
T
S
 
S
C
 
G
V
 
V
H
 
E
D
 
S
P
 
H
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
L
 
S
L
 
I
D
 
E
V
 
V
T
 
L
G
 
G
V
 
P
E
 
E
R
 
N
V
 
V
M
 
M
L
 
W
G
 
A
T
 
I
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
x
Y

Sites not aligning to the query:

4l6dA Crystal structure of 5-carboxyvanillate decarboxylase from sphingomonas paucimobilis complexed with vanillic acid
33% identity, 64% coverage: 79:294/337 of query aligns to 73:300/335 of 4l6dA

query
sites
4l6dA
L
 
L
F
 
L
S
 
S
Y
 
L
W
 
T
A
|
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
V
Q
 
Q
A
 
M
L
 
F
E
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
T
-
x
R
L
 
L
H
 
A
R
|
R
H
 
I
L
 
A
N
 
N
D
 
D
H
 
L
V
 
M
A
 
A
G
 
Q
L
 
T
C
 
V
R
 
A
D
 
A
Y
 
N
P
 
P
R
 
T
H
 
R
Y
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
G
T
 
T
V
 
F
P
 
A
L
 
P
Q
 
Q
S
 
D
P
 
P
D
 
A
L
 
S
A
 
A
I
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
E
 
E
R
 
R
C
 
V
I
 
A
D
 
T
E
 
Q
L
 
L
G
 
R
L
 
L
H
 
N
G
 
G
V
 
L
Q
 
V
V
 
I
G
 
N
S
 
S
H
 
H
C
 
T
N
 
N
D
 
D
W
 
L
N
 
Y
L
 
Y
D
 
D
A
 
D
P
 
P
E
 
F
L
 
F
F
 
H
P
 
P
F
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
E
D
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
L
M
 
Y
V
 
I
H
|
H
P
 
P
W
 
R
-
 
A
-
 
P
D
 
S
M
 
K
M
 
Q
G
 
I
A
 
D
A
 
R
S
 
A
M
 
F
P
 
R
K
 
D
Y
 
Y
W
 
G
L
 
M
P
 
N
W
 
S
L
 
A
V
 
I
-
 
W
G
 
G
M
 
Y
P
 
G
A
 
I
E
 
E
Q
 
T
S
 
S
R
 
T
A
 
N
G
 
A
C
 
V
C
 
R
L
 
M
V
 
I
F
 
L
G
 
S
G
 
G
V
 
L
L
 
F
E
 
D
R
 
R
L
 
F
P
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
K
V
 
I
M
 
V
L
 
L
A
 
G
H
 
H
G
 
M
G
 
G
G
 
E
S
 
A
F
 
I
P
 
P
W
 
F
S
 
W
I
x
L
G
x
W
R
 
R
I
 
L
E
x
D
-
 
Y
-
 
M
H
 
H
G
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
T
F
 
F
R
 
G
M
 
G
R
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
L
V
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
K
R
 
L
N
 
K
P
 
P
R
 
S
E
 
E
Y
 
Y
L
 
F
K
 
R
R
 
R
L
 
N
Y
 
F
-
 
A
-
 
I
F
 
T
D
 
T
S
 
S
C
 
G
V
 
V
H
 
E
D
 
S
P
 
H
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
L
 
S
L
 
I
D
 
E
V
 
V
T
 
L
G
 
G
V
 
P
E
 
E
R
 
N
V
 
V
M
 
M
L
 
W
G
 
A
T
 
I
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
x
Y

Sites not aligning to the query:

4icmA Crystal structure of 5-carboxyvanillate decarboxylase ligw from sphingomonas paucimobilis
33% identity, 64% coverage: 79:294/337 of query aligns to 73:300/335 of 4icmA

query
sites
4icmA
L
 
L
F
 
L
S
 
S
Y
 
L
W
 
T
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
V
Q
 
Q
A
 
M
L
 
F
E
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
T
-
 
R
L
 
L
H
 
A
R
 
R
H
 
I
L
 
A
N
 
N
D
 
D
H
 
L
V
 
M
A
 
A
G
 
Q
L
 
T
C
 
V
R
 
A
D
 
A
Y
 
N
P
 
P
R
 
T
H
 
R
Y
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
G
T
 
T
V
 
F
P
 
A
L
 
P
Q
 
Q
S
 
D
P
 
P
D
 
A
L
 
S
A
 
A
I
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
E
 
E
R
 
R
C
 
V
I
 
A
D
 
T
E
 
Q
L
 
L
G
 
R
L
 
L
H
 
N
G
 
G
V
 
L
Q
 
V
V
 
I
G
 
N
S
 
S
H
 
H
C
 
T
N
 
N
D
 
D
W
 
L
N
 
Y
L
 
Y
D
 
D
A
 
D
P
 
P
E
 
F
L
 
F
F
 
H
P
 
P
F
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
E
D
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
L
M
 
Y
V
 
I
H
|
H
P
 
P
W
 
R
-
 
A
-
 
P
D
 
S
M
 
K
M
 
Q
G
 
I
A
 
D
A
 
R
S
 
A
M
 
F
P
 
R
K
 
D
Y
 
Y
W
 
G
L
 
M
P
 
N
W
 
S
L
 
A
V
 
I
-
 
W
G
 
G
M
 
Y
P
 
G
A
 
I
E
 
E
Q
 
T
S
 
S
R
 
T
A
 
N
G
 
A
C
 
V
C
 
R
L
 
M
V
 
I
F
 
L
G
 
S
G
 
G
V
 
L
L
 
F
E
 
D
R
 
R
L
 
F
P
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
K
V
 
I
M
 
V
L
 
L
A
 
G
H
 
H
G
 
M
G
 
G
G
 
E
S
 
A
F
 
I
P
 
P
W
 
F
S
 
W
I
 
L
G
 
W
R
 
R
I
 
L
E
 
D
-
 
Y
-
 
M
H
 
H
G
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
T
F
 
F
R
 
G
M
 
G
R
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
L
V
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
K
R
 
L
N
 
K
P
 
P
R
 
S
E
 
E
Y
 
Y
L
 
F
K
 
R
R
 
R
L
 
N
Y
 
F
-
 
A
-
 
I
F
 
T
D
 
T
S
 
S
C
 
G
V
 
V
H
 
E
D
 
S
P
 
H
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
L
 
S
L
 
I
D
 
E
V
 
V
T
 
L
G
 
G
V
 
P
E
 
E
R
 
N
V
 
V
M
 
M
L
 
W
G
 
A
T
 
I
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

Q12BV1 Gamma-resorcylate decarboxylase; Gamma-RSD; 2,6-dihydroxybenzoate decarboxylase; 2,6-DHBD; EC 4.1.1.103 from Polaromonas sp. (strain JS666 / ATCC BAA-500) (see paper)
27% identity, 76% coverage: 67:323/337 of query aligns to 51:318/326 of Q12BV1

query
sites
Q12BV1
G
 
G
V
 
I
A
 
E
V
 
T
Q
 
M
V
 
I
V
 
L
S
 
S
T
 
L
V
 
N
P
 
A
V
 
P
L
 
A
F
 
V
S
 
Q
Y
 
A
W
 
I
A
 
A
P
 
D
G
 
S
Y
 
T
Q
 
R
A
 
A
L
 
N
E
 
E
L
 
T
H
 
A
R
 
R
H
 
R
L
 
A
N
 
N
D
 
D
H
 
F
V
 
L
A
 
A
G
 
E
L
 
Q
C
 
V
R
 
A
D
 
K
Y
 
Q
P
 
P
R
 
T
H
 
R
Y
 
F
A
 
R
G
 
G
I
 
F
A
 
A
T
 
A
V
 
L
P
 
P
L
 
M
Q
 
Q
S
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
C
 
C
I
 
V
D
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
F
H
 
V
G
 
G
V
 
A
Q
 
L
V
 
V
G
 
N
S
 
G
H
 
F
C
 
S
N
 
Q
D
 
D
W
 
N
N
 
R
-
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
Y
L
 
Y
D
 
D
A
 
M
P
 
A
E
 
Q
L
 
Y
F
 
W
P
 
P
F
 
F
F
 
W
E
 
E
A
 
T
A
 
V
A
 
Q
D
 
A
L
 
L
G
 
D
A
 
V
A
 
P
V
 
F
M
 
Y
V
 
L
H
|
H
P
 
P
W
 
R
D
 
N
M
 
P
M
 
L
G
 
P
A
 
S
A
 
D
S
 
A
M
 
R
P
 
I
K
 
Y
Y
 
D
W
 
G
L
 
H
P
 
A
W
 
W
L
 
L
V
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
T
-
 
W
-
 
A
M
 
F
P
 
G
A
 
Q
E
 
E
Q
 
T
S
 
A
R
 
V
A
 
H
G
 
A
C
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
M
F
 
G
G
 
S
G
 
G
V
 
L
L
 
F
E
 
D
R
 
K
L
 
Y
P
 
P
R
 
A
L
 
L
R
 
K
V
 
I
M
 
I
L
 
L
A
 
G
H
 
H
G
 
M
G
 
G
G
 
E
S
 
G
F
 
L
P
 
P
W
 
Y
S
 
S
I
 
M
G
 
W
R
 
R
I
 
I
E
 
D
H
 
H
G
 
-
F
 
-
R
 
-
M
 
-
R
 
R
P
 
N
D
 
A
L
 
W
V
 
I
A
 
K
T
 
T
D
 
-
N
 
T
P
 
P
R
 
K
N
 
Y
P
 
P
R
 
A
E
 
K
Y
 
R
L
 
K
K
 
I
R
 
V
L
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
N
S
 
E
C
 
N
V
 
F
H
 
Y
D
 
L
P
 
T
Q
 
T
A
 
S
-
 
G
-
 
N
-
 
F
-
 
R
L
 
T
R
 
Q
Y
 
T
L
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
A
-
 
I
-
 
L
-
 
E
T
 
I
G
 
G
V
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
I
M
 
L
L
 
F
G
 
S
T
 
T
D
|
D
Y
 
W
P
 
P
F
 
F
P
 
E
L
 
-
G
 
N
E
 
I
Q
 
D
H
 
H
P
 
A
G
 
A
S
 
D
G
 
W
I
 
F
E
 
E
A
 
N
L
 
T
G
 
S
L
 
I
E
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
D
R
 
R
A
 
K
R
 
K
L
 
I
F
 
G
H
 
W
G
 
G
T
 
N
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4hk5D Crystal structure of cordyceps militaris idcase in apo form (see paper)
28% identity, 68% coverage: 67:294/337 of query aligns to 84:322/380 of 4hk5D

query
sites
4hk5D
G
 
G
V
 
I
A
 
R
V
 
V
Q
 
S
V
 
V
V
 
I
S
 
S
T
 
L
V
 
A
P
 
N
V
 
P
L
 
W
F
 
F
S
 
D
Y
 
F
W
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
D
Y
 
-
Q
 
E
A
 
A
L
 
P
E
 
G
L
 
I
H
 
A
R
 
D
H
 
A
L
 
V
N
 
N
D
 
A
H
 
E
V
 
F
A
 
S
G
 
D
L
 
M
C
 
C
R
 
A
D
 
Q
Y
 
H
P
 
V
R
 
G
H
 
R
Y
 
L
A
 
F
G
 
F
I
 
F
A
 
A
T
 
A
V
 
L
P
 
P
L
 
L
Q
 
S
S
 
A
P
 
P
D
 
V
L
 
D
A
 
A
I
 
V
R
 
K
-
 
A
E
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
R
C
 
V
I
 
K
D
 
N
E
 
L
L
 
K
G
 
Y
L
 
C
H
 
R
G
 
G
V
 
I
Q
 
I
V
 
L
G
 
G
S
 
T
H
 
S
C
 
G
N
 
L
D
 
G
W
 
K
N
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
L
F
 
L
P
 
P
F
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
A
G
 
K
A
 
L
A
 
L
V
 
V
M
 
F
V
 
L
H
|
H
P
 
P
-
 
H
W
 
Y
D
 
G
M
 
L
M
 
P
G
 
N
A
 
E
A
 
V
S
 
Y
M
 
G
P
 
P
K
 
R
-
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
Y
-
 
G
Y
 
H
W
 
V
L
 
L
P
 
P
W
 
L
L
 
A
V
 
L
G
 
G
M
 
F
P
 
P
A
 
M
E
 
E
Q
 
T
S
 
T
R
 
I
A
 
A
G
 
V
C
 
A
C
 
R
L
 
M
V
 
Y
F
 
M
G
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
F
E
 
D
R
 
H
L
 
V
P
 
R
R
 
N
L
 
L
R
 
Q
V
 
M
M
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
H
G
 
S
G
 
G
G
 
G
S
 
T
F
 
L
P
 
P
W
 
F
S
 
L
I
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
E
H
 
S
G
 
C
F
 
I
R
 
V
M
 
H
R
 
D
P
 
G
D
 
H
L
 
L
V
 
V
A
 
K
T
 
T
D
 
G
N
 
K
P
 
V
R
 
P
N
 
K
P
 
D
R
 
R
E
 
R
Y
 
T
L
 
I
-
 
W
-
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
K
K
 
E
R
 
Q
L
 
I
Y
 
Y
F
 
L
D
 
D
S
 
A
C
 
V
V
 
I
H
 
Y
D
 
S
P
 
E
Q
 
V
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
Y
 
A
L
 
A
L
 
I
D
 
A
V
 
S
T
 
S
G
 
G
V
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
L
M
 
M
L
 
F
G
 
G
T
 
T
D
|
D
Y
 
H
P
 
P
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4qroA Crystal structure of dihydroxybenzoic acid decarbboxylase bpro_2061 (target efi-500288) from polaromonas sp. Js666 with bound manganese and an inhibitor, 2-nitroresorcinol
27% identity, 76% coverage: 67:323/337 of query aligns to 51:318/332 of 4qroA

query
sites
4qroA
G
 
G
V
 
I
A
 
E
V
 
T
Q
 
M
V
 
I
V
 
L
S
 
S
T
 
L
V
 
N
P
 
A
V
 
P
L
 
A
F
 
V
S
 
Q
Y
 
A
W
 
I
A
 
A
P
 
D
G
 
S
Y
 
T
Q
 
R
A
 
A
L
 
N
E
 
E
L
 
T
H
 
A
R
 
R
H
 
R
L
 
A
N
 
N
D
 
D
H
 
F
V
 
L
A
 
A
G
 
E
L
 
Q
C
 
V
R
 
A
D
 
K
Y
 
Q
P
 
P
R
 
T
H
 
R
Y
 
F
A
 
R
G
 
G
I
 
F
A
 
A
T
 
A
V
 
L
P
 
P
L
 
M
Q
 
Q
S
 
D
P
 
P
D
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
C
 
C
I
 
V
D
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
F
H
 
V
G
 
G
V
 
A
Q
 
L
V
 
V
G
 
N
S
 
G
H
 
F
C
 
S
N
 
Q
D
 
D
W
 
N
N
 
R
-
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
Y
L
 
Y
D
 
D
A
 
M
P
 
A
E
 
Q
L
 
Y
F
 
W
P
 
P
F
 
F
F
 
W
E
 
E
A
 
T
A
 
V
A
 
Q
D
 
A
L
 
L
G
 
D
A
 
V
A
 
P
V
 
F
M
 
Y
V
 
L
H
|
H
P
 
P
W
 
R
D
 
N
M
 
P
M
 
L
G
 
P
A
 
S
A
 
D
S
 
A
M
 
R
P
 
I
K
 
Y
Y
 
D
W
 
G
L
 
H
P
 
A
W
 
W
L
 
L
V
 
L
G
 
G
-
x
P
-
 
T
-
 
W
-
 
A
M
x
F
P
 
G
A
 
Q
E
 
E
Q
 
T
S
 
A
R
 
V
A
 
H
G
 
A
C
 
L
C
 
R
L
 
L
V
 
M
F
 
G
G
 
S
G
 
G
V
 
L
L
 
F
E
 
D
R
 
K
L
 
Y
P
 
P
R
 
A
L
 
L
R
 
K
V
 
I
M
 
I
L
 
L
A
 
G
H
|
H
G
 
M
G
 
G
G
 
E
S
 
G
F
 
L
P
 
P
W
 
Y
S
 
S
I
 
M
G
 
W
R
 
R
I
 
I
E
 
D
H
 
H
G
 
-
F
 
-
R
 
-
M
 
-
R
 
R
P
 
N
D
 
A
L
 
W
V
 
I
A
 
K
T
 
T
D
 
-
N
 
T
P
 
P
R
 
K
N
 
Y
P
 
P
R
 
A
E
 
K
Y
 
R
L
 
K
K
 
I
R
 
V
L
 
D
Y
 
Y
F
 
F
D
 
N
S
 
E
C
 
N
V
 
F
H
 
Y
D
 
L
P
 
T
Q
 
T
A
 
S
-
 
G
-
 
N
-
 
F
-
 
R
L
 
T
R
 
Q
Y
 
T
L
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
A
-
 
I
-
 
L
-
 
E
T
 
I
G
 
G
V
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
I
M
 
L
L
 
F
G
 
S
T
 
T
D
|
D
Y
 
W
P
 
P
F
|
F
P
 
E
L
 
-
G
 
N
E
 
I
Q
 
D
H
 
H
P
 
A
G
 
A
S
 
D
G
 
W
I
 
F
E
 
E
A
 
N
L
 
T
G
 
S
L
 
I
E
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
D
R
 
R
A
 
K
R
 
K
L
 
I
F
 
G
H
 
W
G
 
G
T
 
N
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4hk7A Crystal structure of cordyceps militaris idcase in complex with uracil (see paper)
28% identity, 68% coverage: 67:294/337 of query aligns to 83:321/379 of 4hk7A

query
sites
4hk7A
G
 
G
V
 
I
A
 
R
V
 
V
Q
 
S
V
 
V
V
 
I
S
 
S
T
 
L
V
 
A
P
x
N
V
 
P
L
 
W
F
 
F
S
 
D
Y
 
F
W
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
D
Y
 
-
Q
 
E
A
 
A
L
 
P
E
 
G
L
 
I
H
 
A
R
 
D
H
 
A
L
 
V
N
 
N
D
 
A
H
 
E
V
 
F
A
 
S
G
 
D
L
 
M
C
 
C
R
 
A
D
 
Q
Y
 
H
P
 
V
R
 
G
H
 
R
Y
 
L
A
 
F
G
 
F
I
 
F
A
 
A
T
 
A
V
 
L
P
 
P
L
 
L
Q
 
S
S
 
A
P
 
P
D
 
V
L
 
D
A
 
A
I
 
V
R
 
K
-
 
A
E
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
R
C
 
V
I
 
K
D
 
N
E
 
L
L
 
K
G
 
Y
L
 
C
H
 
R
G
 
G
V
 
I
Q
 
I
V
 
L
G
 
G
S
 
T
H
 
S
C
 
G
N
 
L
D
 
G
W
 
K
N
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
L
F
 
L
P
 
P
F
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
A
G
 
K
A
 
L
A
 
L
V
 
V
M
 
F
V
 
L
H
|
H
P
 
P
-
 
H
W
 
Y
D
 
G
M
 
L
M
 
P
G
 
N
A
 
E
A
 
V
S
 
Y
M
 
G
P
 
P
K
 
R
-
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
Y
-
 
G
Y
 
H
W
 
V
L
 
L
P
 
P
W
 
L
L
 
A
V
 
L
G
 
G
M
x
F
P
 
P
A
 
M
E
 
E
Q
 
T
S
 
T
R
 
I
A
 
A
G
 
V
C
 
A
C
 
R
L
 
M
V
 
Y
F
 
M
G
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
F
E
 
D
R
 
H
L
 
V
P
 
R
R
 
N
L
 
L
R
 
Q
V
 
M
M
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
H
G
 
S
G
 
G
G
 
G
S
 
T
F
 
L
P
 
P
W
 
F
S
 
L
I
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
E
H
 
S
G
 
C
F
 
I
R
 
V
M
 
H
R
 
D
P
 
G
D
 
H
L
 
L
V
 
V
A
 
K
T
 
T
D
 
G
N
 
K
P
 
V
R
 
P
N
 
K
P
 
D
R
 
R
E
 
R
Y
 
T
L
 
I
-
 
W
-
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
K
K
 
E
R
 
Q
L
 
I
Y
 
Y
F
 
L
D
 
D
S
 
A
C
 
V
V
 
I
H
 
Y
D
 
S
P
 
E
Q
 
V
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
Y
 
A
L
 
A
L
 
I
D
 
A
V
 
S
T
 
S
G
 
G
V
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
L
M
 
M
L
 
F
G
 
G
T
 
T
D
|
D
Y
 
H
P
 
P
F
|
F

Sites not aligning to the query:

4hk6A Crystal structure of cordyceps militaris idcase in complex with 5- nitro-uracil (see paper)
28% identity, 68% coverage: 67:294/337 of query aligns to 83:321/369 of 4hk6A

query
sites
4hk6A
G
 
G
V
 
I
A
 
R
V
 
V
Q
 
S
V
 
V
V
 
I
S
 
S
T
 
L
V
 
A
P
x
N
V
 
P
L
 
W
F
 
F
S
 
D
Y
 
F
W
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
D
Y
 
-
Q
 
E
A
 
A
L
 
P
E
 
G
L
 
I
H
 
A
R
 
D
H
 
A
L
 
V
N
 
N
D
 
A
H
 
E
V
 
F
A
 
S
G
 
D
L
 
M
C
 
C
R
 
A
D
 
Q
Y
 
H
P
 
V
R
 
G
H
 
R
Y
 
L
A
 
F
G
 
F
I
 
F
A
 
A
T
 
A
V
 
L
P
 
P
L
 
L
Q
 
S
S
 
A
P
 
P
D
 
V
L
 
D
A
 
A
I
 
V
R
 
K
-
 
A
E
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
R
C
 
V
I
 
K
D
 
N
E
 
L
L
 
K
G
 
Y
L
 
C
H
 
R
G
 
G
V
 
I
Q
 
I
V
 
L
G
 
G
S
 
T
H
 
S
C
 
G
N
 
L
D
 
G
W
 
K
N
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
D
P
 
P
E
 
H
L
 
L
F
 
L
P
 
P
F
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
A
G
 
K
A
 
L
A
 
L
V
 
V
M
 
F
V
 
L
H
|
H
P
 
P
-
 
H
W
 
Y
D
 
G
M
 
L
M
 
P
G
 
N
A
 
E
A
 
V
S
 
Y
M
 
G
P
 
P
K
 
R
-
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
Y
-
 
G
Y
 
H
W
 
V
L
 
L
P
 
P
W
x
L
L
 
A
V
 
L
G
 
G
M
x
F
P
 
P
A
 
M
E
 
E
Q
 
T
S
 
T
R
 
I
A
 
A
G
 
V
C
 
A
C
 
R
L
 
M
V
 
Y
F
 
M
G
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
F
E
 
D
R
 
H
L
 
V
P
 
R
R
 
N
L
 
L
R
 
Q
V
 
M
M
 
L
L
 
L
A
 
A
H
|
H
G
 
S
G
 
G
G
 
G
S
 
T
F
 
L
P
 
P
W
 
F
S
 
L
I
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
E
H
 
S
G
 
C
F
 
I
R
 
V
M
 
H
R
 
D
P
 
G
D
 
H
L
 
L
V
 
V
A
 
K
T
 
T
D
 
G
N
 
K
P
 
V
R
 
P
N
 
K
P
 
D
R
 
R
E
 
R
Y
 
T
L
 
I
-
 
W
-
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
K
K
 
E
R
 
Q
L
 
I
Y
 
Y
F
 
L
D
 
D
S
 
A
C
 
V
V
 
I
H
 
Y
D
 
S
P
 
E
Q
 
V
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
Y
 
A
L
 
A
L
 
I
D
 
A
V
 
S
T
 
S
G
 
G
V
 
A
E
 
D
R
 
R
V
 
L
M
 
M
L
 
F
G
 
G
T
 
T
D
|
D
Y
 
H
P
 
P
F
|
F

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>N515DRAFT_3778 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_3778
MLKIDTHAHVLPRDWPNLAAKFDDLRFPVMTHHDGKHRIYKDGKFFREVWESAFDPQHRI
DDYARFGVAVQVVSTVPVLFSYWAPGYQALELHRHLNDHVAGLCRDYPRHYAGIATVPLQ
SPDLAIRELERCIDELGLHGVQVGSHCNDWNLDAPELFPFFEAAADLGAAVMVHPWDMMG
AASMPKYWLPWLVGMPAEQSRAGCCLVFGGVLERLPRLRVMLAHGGGSFPWSIGRIEHGF
RMRPDLVATDNPRNPREYLKRLYFDSCVHDPQALRYLLDVTGVERVMLGTDYPFPLGEQH
PGSGIEALGLEEAARARLFHGTALEWLGLPLYRFASD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory