SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_4364 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_4364 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 17 hits to proteins with known functional sites (download)

O81852 Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase 2, chloroplastic; AK-HD 2; AK-HSDH 2; Beta-aspartyl phosphate homoserine 2; EC 2.7.2.4; EC 1.1.1.3 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
39% identity, 94% coverage: 23:361/362 of query aligns to 559:908/916 of O81852

query
sites
O81852
A
 
A
I
 
M
V
 
G
L
 
I
F
 
V
G
 
G
T
 
P
G
 
G
V
 
L
V
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
D
L
 
Q
L
 
L
N
 
R
T
 
D
P
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
Q
-
 
E
-
 
F
-
 
N
-
 
I
S
 
D
L
 
L
R
 
R
L
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
I
A
 
T
N
 
G
S
 
S
R
 
K
R
 
K
Q
 
M
Q
 
L
T
 
L
S
 
S
A
 
D
E
 
I
Q
 
G
L
 
I
A
 
D
D
 
L
R
 
S
A
 
R
L
 
W
R
 
R
E
 
E
K
 
L
L
 
L
K
 
N
S
 
E
H
 
K
G
 
G
D
 
T
P
 
E
R
 
A
D
 
D
-
 
L
D
 
D
A
 
K
T
 
F
L
 
T
L
 
Q
R
 
Q
A
 
V
L
 
H
D
 
G
T
 
N
S
 
H
G
 
F
A
 
I
A
 
P
V
 
N
K
 
S
V
 
V
I
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
C
T
 
T
A
 
A
N
 
D
A
 
S
N
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
S
R
 
R
H
 
Y
A
 
Y
D
 
D
W
 
W
L
 
L
A
 
R
R
 
K
G
 
G
Y
 
I
H
 
H
V
 
V
V
 
I
T
 
T
A
 
P
N
 
N
K
 
K
A
 
K
L
 
A
A
 
N
G
 
S
G
 
G
E
 
P
L
 
L
P
 
D
G
 
Q
W
 
Y
R
 
L
A
 
K
L
 
L
Q
 
R
A
 
D
A
 
L
V
 
Q
A
 
R
Q
 
K
G
 
S
-
 
Y
G
 
T
R
 
H
Y
 
Y
G
 
F
D
 
Y
A
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
L
 
I
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
G
L
 
L
R
 
L
A
 
E
C
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
K
L
 
I
L
 
L
T
 
R
L
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
C
S
 
S
G
 
G
S
 
T
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
N
 
N
Q
 
N
Y
 
F
D
 
V
G
 
G
S
 
D
Q
 
R
P
 
S
F
 
F
S
 
S
G
 
E
L
 
V
L
 
V
R
 
T
E
 
E
A
 
A
R
 
K
K
 
N
L
 
A
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
E
 
E
P
 
P
D
 
D
P
 
P
R
 
R
S
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
E
 
T
D
 
D
V
 
V
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
V
L
 
I
I
 
I
I
 
L
A
 
A
R
 
R
N
 
E
A
 
S
G
 
G
F
 
L
A
 
K
L
 
L
G
 
D
T
 
L
D
 
A
E
 
D
V
 
L
E
 
P
V
 
I
E
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
P
L
 
L
R
 
K
-
 
G
S
 
C
V
 
T
D
 
S
T
 
V
D
 
E
S
 
E
F
 
F
L
 
M
A
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
P
E
 
Q
L
 
Y
D
 
D
E
 
G
P
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
K
R
 
E
H
 
R
A
 
L
E
 
D
A
 
A
K
 
E
A
 
N
R
 
S
G
 
G
G
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
R
F
 
Y
L
 
V
A
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
D
R
 
A
L
 
V
N
 
N
Q
 
Q
R
 
K
G
 
G
K
 
T
A
 
-
R
 
-
V
 
V
G
 
E
L
 
L
V
 
R
E
 
R
V
 
Y
P
 
K
A
 
K
T
 
E
H
 
H
P
 
P
A
 
F
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
T
 
S
D
 
D
N
 
N
Q
 
I
F
 
I
A
 
A
L
 
F
T
 
T
T
 
T
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
H
 
K
S
 
D
Q
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
I
I
 
V
Q
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
A
E
 
Q
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Q
 
G
A
 
G
L
 
I
L
 
F
G
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
L
A
 
R
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P31116 Homoserine dehydrogenase; HDH; EC 1.1.1.3 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
38% identity, 93% coverage: 24:361/362 of query aligns to 8:355/359 of P31116

query
sites
P31116
I
 
V
V
 
A
L
 
V
F
x
I
G
|
G
T
x
A
G
|
G
V
|
V
V
|
V
G
|
G
G
x
S
A
 
A
L
 
F
L
 
L
-
 
D
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
N
 
A
T
 
M
P
 
K
A
 
S
A
 
T
A
 
I
S
 
T
L
 
Y
R
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
L
A
 
L
A
 
A
N
 
E
S
 
A
R
 
E
R
 
R
Q
 
S
Q
 
L
T
 
I
S
 
S
A
 
K
E
 
D
Q
 
F
L
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
G
A
 
S
D
 
D
-
 
W
R
 
K
A
 
A
L
 
A
R
 
L
E
 
A
K
 
A
L
 
S
K
 
T
S
 
T
H
 
K
G
 
T
D
 
L
P
 
P
R
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
I
R
 
A
A
 
H
L
 
L
D
 
K
T
 
T
S
 
S
G
 
P
A
 
K
A
 
P
V
 
V
K
 
-
V
 
I
I
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
N
T
|
T
A
 
S
N
 
S
A
 
A
N
 
Y
L
 
I
A
 
A
A
 
G
R
 
F
H
 
Y
A
 
T
D
 
K
W
 
F
L
 
V
A
 
E
R
 
N
G
 
G
Y
 
I
H
 
S
V
 
I
V
 
A
T
 
T
A
 
P
N
 
N
K
|
K
A
 
K
L
 
A
A
 
F
G
 
S
G
 
S
E
 
D
L
 
L
P
 
A
G
 
T
W
 
W
R
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
A
 
S
A
 
N
V
 
K
A
 
P
Q
 
T
G
 
N
G
 
G
R
 
F
Y
 
V
G
 
Y
D
 
H
A
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
L
 
I
S
 
S
T
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
I
R
 
I
A
 
Q
C
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
E
L
 
V
L
 
E
T
 
K
L
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
F
S
 
S
G
 
G
S
 
T
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
L
 
I
F
 
F
N
 
N
Q
 
E
Y
 
F
D
 
S
G
 
T
S
 
S
Q
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
D
-
 
V
P
 
K
F
 
F
S
 
S
G
 
D
L
 
V
L
 
V
R
 
K
E
 
V
A
 
A
R
 
K
K
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
|
E
P
 
P
D
 
D
P
 
P
R
 
R
S
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
N
G
 
G
E
 
L
D
|
D
V
 
V
A
 
A
R
 
R
K
|
K
L
 
V
L
 
T
I
 
I
I
 
V
A
 
G
R
 
R
N
 
I
A
 
S
G
 
G
F
 
V
A
 
E
L
 
V
G
 
E
T
 
S
-
 
P
D
 
T
E
 
S
V
 
F
E
 
P
V
 
V
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
K
A
 
P
L
 
L
R
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
K
T
 
S
-
 
A
D
 
D
S
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
S
E
 
D
L
 
Y
D
 
D
E
 
K
P
 
D
L
 
L
A
 
T
R
 
Q
R
 
L
H
 
K
A
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
A
A
 
T
R
 
E
G
 
N
G
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
I
A
 
G
R
 
K
L
 
V
N
 
D
Q
 
V
R
 
A
G
 
T
K
 
K
A
 
S
-
 
V
R
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
E
E
 
K
V
 
Y
P
 
D
A
 
Y
T
 
S
H
 
H
P
 
P
A
 
F
A
 
A
R
 
S
L
 
L
Y
 
K
G
 
G
T
 
S
D
 
D
N
 
N
Q
 
V
F
 
I
A
 
S
L
 
I
T
 
K
T
 
T
T
 
K
R
 
R
Y
 
Y
H
 
-
S
 
T
Q
 
N
P
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
P
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
A
E
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Q
 
A
A
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
A
 
K
L
 
I

1tveA Homoserine dehydrogenase in complex with 4-(4-hydroxy-3- isopropylphenylthio)-2-isopropylphenol (see paper)
38% identity, 93% coverage: 24:361/362 of query aligns to 7:354/358 of 1tveA

query
sites
1tveA
I
 
V
V
 
A
L
 
V
F
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
L
-
 
D
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
N
 
A
T
 
M
P
 
K
A
 
S
A
 
T
A
 
I
S
 
T
L
 
Y
R
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
L
A
 
L
A
 
A
N
 
E
S
 
A
R
 
E
R
 
R
Q
 
S
Q
 
L
T
 
I
S
 
S
A
 
K
E
 
D
Q
 
F
L
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
G
A
 
S
D
 
D
-
 
W
R
 
K
A
 
A
L
 
A
R
 
L
E
 
A
K
 
A
L
 
S
K
 
T
S
 
T
H
 
K
G
 
T
D
 
L
P
 
P
R
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
I
R
 
A
A
 
H
L
 
L
D
 
K
T
 
T
S
 
S
G
 
P
A
 
K
A
 
P
V
 
V
K
 
-
V
 
I
I
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
N
T
 
T
A
x
S
N
 
S
A
 
A
N
 
Y
L
 
I
A
 
A
A
 
G
R
 
F
H
 
Y
A
 
T
D
 
K
W
 
F
L
 
V
A
 
E
R
 
N
G
 
G
Y
 
I
H
 
S
V
 
I
V
 
A
T
 
T
A
 
P
N
 
N
K
|
K
A
 
K
L
 
A
A
 
F
G
 
S
G
 
S
E
 
D
L
 
L
P
 
A
G
 
T
W
 
W
R
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
A
 
S
A
 
N
V
 
K
A
 
P
Q
 
T
G
 
N
G
 
G
R
 
F
Y
 
V
G
 
Y
D
 
H
A
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
L
 
I
S
 
S
T
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
I
R
 
I
A
 
Q
C
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
E
L
 
V
L
 
E
T
 
K
L
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
F
S
 
S
G
 
G
S
x
T
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
L
 
I
F
 
F
N
 
N
Q
 
E
Y
 
F
D
 
S
G
 
T
S
 
S
Q
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
D
-
 
V
P
 
K
F
 
F
S
 
S
G
 
D
L
 
V
L
 
V
R
 
K
E
 
V
A
 
A
R
 
K
K
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
D
 
D
P
 
P
R
 
R
S
 
D
D
|
D
L
 
L
S
 
N
G
 
G
E
 
L
D
|
D
V
 
V
A
 
A
R
 
R
K
|
K
L
 
V
L
 
T
I
 
I
I
 
V
A
 
G
R
 
R
N
 
I
A
 
S
G
 
G
F
 
V
A
 
E
L
 
V
G
 
E
T
 
S
-
 
P
D
 
T
E
 
S
V
 
F
E
 
P
V
 
V
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
K
A
 
P
L
 
L
R
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
K
T
 
S
-
 
A
D
 
D
S
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
S
E
 
D
L
 
Y
D
 
D
E
 
K
P
 
D
L
 
L
A
 
T
R
 
Q
R
 
L
H
 
K
A
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
A
A
 
T
R
 
E
G
 
N
G
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
I
A
 
G
R
 
K
L
 
V
N
 
D
Q
 
V
R
 
A
G
 
T
K
 
K
A
 
S
-
 
V
R
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
E
E
 
K
V
 
Y
P
 
D
A
 
Y
T
 
S
H
 
H
P
 
P
A
 
F
A
 
A
R
 
S
L
 
L
Y
 
K
G
 
G
T
 
S
D
 
D
N
 
N
Q
 
V
F
 
I
A
 
S
L
 
I
T
 
K
T
 
T
T
 
K
R
 
R
Y
 
Y
H
 
-
S
 
T
Q
 
N
P
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
P
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
A
E
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Q
 
A
A
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
A
 
K
L
 
I

1q7gA Homoserine dehydrogenase in complex with suicide inhibitor complex NAD-5-hydroxy-4-oxonorvaline (see paper)
38% identity, 93% coverage: 24:361/362 of query aligns to 7:354/358 of 1q7gA

query
sites
1q7gA
I
 
V
V
 
A
L
 
V
F
 
I
G
 
G
T
 
A
G
|
G
V
|
V
V
|
V
G
 
G
G
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
L
-
 
D
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
N
 
A
T
 
M
P
 
K
A
 
S
A
 
T
A
 
I
S
 
T
L
 
Y
R
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
L
A
 
L
A
 
A
N
x
E
S
 
A
R
 
E
R
 
R
Q
 
S
Q
 
L
T
 
I
S
 
S
A
 
K
E
 
D
Q
 
F
L
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
G
A
 
S
D
 
D
-
 
W
R
 
K
A
 
A
L
 
A
R
 
L
E
 
A
K
 
A
L
 
S
K
 
T
S
 
T
H
 
K
G
 
T
D
 
L
P
 
P
R
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
I
R
 
A
A
 
H
L
 
L
D
 
K
T
 
T
S
 
S
G
 
P
A
 
K
A
 
P
V
 
V
K
 
-
V
 
I
I
 
L
I
 
V
D
 
D
A
x
N
T
|
T
A
x
S
N
 
S
A
 
A
N
 
Y
L
x
I
A
 
A
A
 
G
R
 
F
H
 
Y
A
 
T
D
 
K
W
 
F
L
 
V
A
 
E
R
 
N
G
 
G
Y
 
I
H
 
S
V
 
I
V
 
A
T
 
T
A
x
P
N
 
N
K
|
K
A
 
K
L
 
A
A
 
F
G
 
S
G
 
S
E
 
D
L
 
L
P
 
A
G
 
T
W
 
W
R
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
A
 
S
A
 
N
V
 
K
A
 
P
Q
 
T
G
 
N
G
 
G
R
 
F
Y
 
V
G
 
Y
D
 
H
A
 
E
A
|
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
L
 
I
S
 
S
T
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
I
R
 
I
A
 
Q
C
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
E
L
 
V
L
 
E
T
 
K
L
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
F
S
|
S
G
 
G
S
 
T
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
L
 
I
F
 
F
N
 
N
Q
 
E
Y
 
F
D
 
S
G
 
T
S
 
S
Q
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
D
-
 
V
P
 
K
F
 
F
S
 
S
G
 
D
L
 
V
L
 
V
R
 
K
E
 
V
A
 
A
R
 
K
K
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
D
 
D
P
 
P
R
 
R
S
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
N
G
 
G
E
 
L
D
|
D
V
 
V
A
 
A
R
 
R
K
|
K
L
 
V
L
 
T
I
 
I
I
 
V
A
 
G
R
 
R
N
 
I
A
 
S
G
 
G
F
 
V
A
 
E
L
 
V
G
 
E
T
 
S
-
 
P
D
 
T
E
 
S
V
 
F
E
 
P
V
 
V
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
K
A
 
P
L
 
L
R
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
K
T
 
S
-
 
A
D
 
D
S
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
S
E
 
D
L
 
Y
D
 
D
E
 
K
P
 
D
L
 
L
A
 
T
R
 
Q
R
 
L
H
 
K
A
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
A
A
 
T
R
 
E
G
 
N
G
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
I
A
 
G
R
 
K
L
 
V
N
 
D
Q
 
V
R
 
A
G
 
T
K
 
K
A
 
S
-
 
V
R
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
E
E
 
K
V
 
Y
P
 
D
A
 
Y
T
 
S
H
 
H
P
 
P
A
 
F
A
 
A
R
 
S
L
 
L
Y
 
K
G
 
G
T
 
S
D
 
D
N
 
N
Q
 
V
F
 
I
A
 
S
L
 
I
T
 
K
T
 
T
T
 
K
R
 
R
Y
 
Y
H
 
-
S
 
T
Q
 
N
P
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
P
 
A
G
 
G
A
|
A
G
 
G
P
 
A
E
 
A
V
 
V
T
|
T
A
 
A
Q
 
A
A
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
A
 
K
L
 
I

1ebuD Homoserine dehydrogenase complex with NAD analogue and l-homoserine (see paper)
38% identity, 93% coverage: 24:361/362 of query aligns to 7:354/358 of 1ebuD

query
sites
1ebuD
I
 
V
V
 
A
L
 
V
F
 
I
G
|
G
T
x
A
G
|
G
V
|
V
V
|
V
G
 
G
G
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
L
-
 
D
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
N
 
A
T
 
M
P
 
K
A
 
S
A
 
T
A
 
I
S
 
T
L
 
Y
R
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
L
A
 
L
A
 
A
N
x
E
S
x
A
R
 
E
R
 
R
Q
 
S
Q
 
L
T
 
I
S
 
S
A
 
K
E
 
D
Q
 
F
L
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
G
A
 
S
D
 
D
-
 
W
R
 
K
A
 
A
L
 
A
R
 
L
E
 
A
K
 
A
L
 
S
K
 
T
S
 
T
H
 
K
G
 
T
D
 
L
P
 
P
R
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
I
R
 
A
A
 
H
L
 
L
D
 
K
T
 
T
S
 
S
G
 
P
A
 
K
A
 
P
V
 
V
K
 
-
V
 
I
I
 
L
I
 
V
D
 
D
A
x
N
T
 
T
A
x
S
N
 
S
A
 
A
N
 
Y
L
 
I
A
 
A
A
 
G
R
 
F
H
 
Y
A
 
T
D
 
K
W
 
F
L
 
V
A
 
E
R
 
N
G
 
G
Y
 
I
H
 
S
V
 
I
V
 
A
T
 
T
A
 
P
N
 
N
K
|
K
A
 
K
L
 
A
A
 
F
G
 
S
G
 
S
E
 
D
L
 
L
P
 
A
G
 
T
W
 
W
R
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
A
 
S
A
 
N
V
 
K
A
 
P
Q
 
T
G
 
N
G
 
G
R
 
F
Y
 
V
G
 
Y
D
 
H
A
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
L
 
I
S
 
S
T
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
I
R
 
I
A
 
Q
C
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
E
L
 
V
L
 
E
T
 
K
L
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
F
S
 
S
G
 
G
S
 
T
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
L
 
I
F
 
F
N
 
N
Q
 
E
Y
 
F
D
 
S
G
 
T
S
 
S
Q
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
D
-
 
V
P
 
K
F
 
F
S
 
S
G
 
D
L
 
V
L
 
V
R
 
K
E
 
V
A
 
A
R
 
K
K
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
D
 
D
P
 
P
R
 
R
S
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
N
G
 
G
E
 
L
D
|
D
V
 
V
A
 
A
R
 
R
K
|
K
L
 
V
L
 
T
I
 
I
I
 
V
A
 
G
R
 
R
N
 
I
A
 
S
G
 
G
F
 
V
A
 
E
L
 
V
G
 
E
T
 
S
-
 
P
D
 
T
E
 
S
V
 
F
E
 
P
V
 
V
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
K
A
 
P
L
 
L
R
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
K
T
 
S
-
 
A
D
 
D
S
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
S
E
 
D
L
 
Y
D
 
D
E
 
K
P
 
D
L
 
L
A
 
T
R
 
Q
R
 
L
H
 
K
A
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
A
A
 
T
R
 
E
G
 
N
G
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
I
A
 
G
R
 
K
L
 
V
N
 
D
Q
 
V
R
 
A
G
 
T
K
 
K
A
 
S
-
 
V
R
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
E
E
 
K
V
 
Y
P
 
D
A
 
Y
T
 
S
H
 
H
P
 
P
A
 
F
A
 
A
R
 
S
L
 
L
Y
 
K
G
 
G
T
 
S
D
 
D
N
 
N
Q
 
V
F
 
I
A
 
S
L
 
I
T
 
K
T
 
T
T
 
K
R
 
R
Y
 
Y
H
 
-
S
 
T
Q
 
N
P
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
P
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
A
E
 
A
V
 
V
T
|
T
A
 
A
Q
 
A
A
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
A
 
K
L
 
I

1ebfA Homoserine dehydrogenase from s. Cerevisiae complex with NAD+ (see paper)
38% identity, 93% coverage: 24:361/362 of query aligns to 7:354/358 of 1ebfA

query
sites
1ebfA
I
 
V
V
 
A
L
 
V
F
x
I
G
 
G
T
x
A
G
|
G
V
|
V
V
|
V
G
 
G
G
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
L
-
 
D
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
N
 
A
T
 
M
P
 
K
A
 
S
A
 
T
A
 
I
S
 
T
L
 
Y
R
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
L
A
 
L
A
 
A
N
x
E
S
x
A
R
 
E
R
 
R
Q
 
S
Q
 
L
T
 
I
S
 
S
A
 
K
E
 
D
Q
 
F
L
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
G
A
 
S
D
 
D
-
 
W
R
 
K
A
 
A
L
 
A
R
 
L
E
 
A
K
 
A
L
 
S
K
 
T
S
 
T
H
 
K
G
 
T
D
 
L
P
 
P
R
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
I
R
 
A
A
 
H
L
 
L
D
 
K
T
 
T
S
 
S
G
 
P
A
 
K
A
 
P
V
 
V
K
 
-
V
 
I
I
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
N
T
|
T
A
x
S
N
 
S
A
 
A
N
 
Y
L
 
I
A
 
A
A
 
G
R
 
F
H
 
Y
A
 
T
D
 
K
W
 
F
L
 
V
A
 
E
R
 
N
G
 
G
Y
 
I
H
 
S
V
 
I
V
 
A
T
 
T
A
x
P
N
 
N
K
 
K
A
 
K
L
 
A
A
 
F
G
 
S
G
 
S
E
 
D
L
 
L
P
 
A
G
 
T
W
 
W
R
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
A
 
S
A
 
N
V
 
K
A
 
P
Q
 
T
G
 
N
G
 
G
R
 
F
Y
 
V
G
 
Y
D
 
H
A
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
L
 
I
S
 
S
T
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
I
R
 
I
A
 
Q
C
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
E
L
 
V
L
 
E
T
 
K
L
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
F
S
 
S
G
 
G
S
 
T
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
L
 
I
F
 
F
N
 
N
Q
 
E
Y
 
F
D
 
S
G
 
T
S
 
S
Q
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
D
-
 
V
P
 
K
F
 
F
S
 
S
G
 
D
L
 
V
L
 
V
R
 
K
E
 
V
A
 
A
R
 
K
K
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
D
 
D
P
 
P
R
 
R
S
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
N
G
 
G
E
 
L
D
|
D
V
 
V
A
 
A
R
 
R
K
|
K
L
 
V
L
 
T
I
 
I
I
 
V
A
 
G
R
 
R
N
 
I
A
 
S
G
 
G
F
 
V
A
 
E
L
 
V
G
 
E
T
 
S
-
 
P
D
 
T
E
 
S
V
 
F
E
 
P
V
 
V
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
K
A
 
P
L
 
L
R
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
K
T
 
S
-
 
A
D
 
D
S
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
S
E
 
D
L
 
Y
D
 
D
E
 
K
P
 
D
L
 
L
A
 
T
R
 
Q
R
 
L
H
 
K
A
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
A
A
 
T
R
 
E
G
 
N
G
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
I
A
 
G
R
 
K
L
 
V
N
 
D
Q
 
V
R
 
A
G
 
T
K
 
K
A
 
S
-
 
V
R
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
E
E
 
K
V
 
Y
P
 
D
A
 
Y
T
 
S
H
 
H
P
 
P
A
 
F
A
 
A
R
 
S
L
 
L
Y
 
K
G
 
G
T
 
S
D
 
D
N
 
N
Q
 
V
F
 
I
A
 
S
L
 
I
T
 
K
T
 
T
T
 
K
R
 
R
Y
 
Y
H
 
-
S
 
T
Q
 
N
P
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
P
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
A
E
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Q
 
A
A
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
A
 
K
L
 
I

O94671 Probable homoserine dehydrogenase; HDH; EC 1.1.1.3 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
34% identity, 95% coverage: 17:361/362 of query aligns to 3:364/376 of O94671

query
sites
O94671
A
 
A
A
 
S
A
 
R
S
 
T
G
 
N
T
 
V
A
 
N
I
 
V
V
 
A
L
 
I
F
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
N
V
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
N
L
 
Q
L
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
N
-
 
E
-
 
N
-
 
A
N
 
S
T
 
T
P
 
N
A
 
G
A
 
T
A
 
T
S
 
S
L
 
F
R
 
N
L
 
V
V
 
V
G
 
A
A
 
I
A
 
S
N
 
S
S
 
M
R
 
E
R
 
G
Q
 
H
Q
 
Y
T
 
V
S
 
S
A
 
K
E
 
D
-
 
Y
Q
 
Q
L
 
P
A
 
I
D
 
N
R
 
L
A
 
S
L
 
E
R
 
W
E
 
K
K
 
N
L
 
L
K
 
T
S
 
S
H
 
Q
G
 
N
D
 
Q
P
 
G
R
 
A
D
 
Y
D
 
S
A
 
L
T
 
D
L
 
A
L
 
L
R
 
V
A
 
D
L
 
F
D
 
L
T
 
A
S
 
K
G
 
S
A
 
P
A
 
L
V
 
P
K
 
A
V
 
I
I
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
N
T
 
T
A
 
A
N
 
S
A
 
E
N
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
Q
R
 
S
H
 
Y
A
 
P
D
 
K
W
 
F
L
 
L
A
 
S
R
 
K
G
 
K
Y
 
I
H
 
N
V
 
I
V
 
A
T
 
T
A
 
P
N
 
N
K
 
K
-
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
S
G
 
A
G
 
S
E
 
N
L
 
D
P
 
V
G
 
Y
W
 
Q
R
 
N
A
 
I
L
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
S
V
 
K
A
 
E
Q
 
S
G
 
G
G
 
A
R
 
L
Y
 
L
G
 
M
D
 
H
A
 
E
A
 
A
T
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
L
 
I
S
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
K
R
 
E
L
 
L
R
 
I
A
 
A
C
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
E
L
 
I
L
 
I
T
 
K
L
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
F
S
 
S
G
 
G
S
 
T
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
L
 
I
F
 
F
N
 
N
Q
 
V
Y
 
W
D
 
S
-
 
P
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
K
G
 
G
S
 
T
Q
 
A
P
x
S
F
 
F
S
 
S
G
 
D
L
 
I
L
 
V
R
 
K
E
 
I
A
 
A
R
 
K
K
 
Q
L
 
N
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
P
 
P
D
 
D
P
 
P
R
 
R
S
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
N
G
 
G
E
 
M
D
 
D
V
 
V
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
V
L
 
T
I
 
I
I
 
L
A
 
S
R
 
R
N
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
V
A
 
H
L
 
V
G
 
E
T
 
S
-
 
A
D
 
S
E
 
S
V
 
F
E
 
P
V
 
V
E
 
K
S
 
S
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
P
L
 
L
R
 
K
S
 
S
-
 
A
V
 
V
D
 
N
T
 
A
D
 
E
S
 
E
F
 
F
L
 
L
A
 
A
R
 
G
L
 
L
E
 
P
E
 
N
L
 
F
D
 
D
E
 
S
P
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
S
R
 
M
H
 
R
A
 
E
E
 
E
A
 
A
K
 
E
A
 
K
R
 
E
G
 
G
G
 
K
V
 
V
L
 
V
R
 
R
F
 
F
L
 
V
A
 
G
R
 
E
L
 
A
N
 
D
Q
 
V
R
 
A
G
 
N
K
 
K
A
 
T
R
 
T
-
 
L
V
 
V
G
 
K
L
 
L
V
 
E
E
 
K
V
 
Y
P
 
D
A
 
A
T
 
S
H
 
H
P
 
P
A
 
F
A
 
A
R
 
N
L
 
L
Y
 
Q
G
 
S
T
 
S
D
 
D
N
 
N
Q
 
I
F
 
I
A
 
S
L
 
F
T
 
T
T
 
T
T
 
K
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
S
 
T
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
Q
 
I
G
 
G
P
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
A
E
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Q
 
A
A
 
G
L
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
M
L
 
I
A
 
K
L
 
I

6a0sA Homoserine dehydrogenase from thermus thermophilus hb8 complexed with hse and NADPH (see paper)
29% identity, 83% coverage: 24:322/362 of query aligns to 6:270/331 of 6a0sA

query
sites
6a0sA
I
 
I
V
 
A
L
 
L
F
 
L
G
 
G
T
x
G
G
|
G
V
x
T
V
|
V
G
 
G
G
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
Y
K
 
N
L
 
L
L
 
V
N
 
L
T
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
E
R
 
R
R
 
A
Q
 
E
Q
 
E
T
 
L
S
 
S
A
 
A
E
 
F
Q
 
G
L
 
V
A
 
V
D
 
P
R
 
R
A
 
F
L
 
L
-
 
G
-
 
V
-
x
L
-
x
V
R
|
R
E
x
D
K
 
P
L
 
R
K
|
K
S
 
P
H
x
R
G
 
A
D
 
I
P
 
P
R
 
Q
D
 
E
D
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
E
D
 
P
T
 
F
S
 
D
G
 
L
A
 
L
A
 
E
V
 
A
K
 
D
V
 
L
I
 
V
I
 
V
D
 
E
A
|
A
T
x
M
A
 
G
N
 
G
A
 
V
N
 
E
L
 
A
A
 
P
A
 
L
R
 
R
H
 
L
A
 
V
-
 
L
D
 
P
W
 
A
L
 
L
A
 
E
R
 
A
G
 
G
Y
 
I
H
 
P
V
 
L
V
 
I
T
 
T
A
|
A
N
 
N
K
|
K
A
 
A
L
 
L
A
 
L
G
 
A
G
 
E
E
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
A
W
 
W
R
 
E
A
 
S
L
 
L
Q
 
R
A
 
P
A
 
F
V
 
A
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
G
 
L
R
 
I
Y
 
Y
G
 
H
D
 
E
A
 
A
A
 
-
T
 
S
V
 
V
G
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
T
P
 
P
V
 
A
L
 
L
S
 
S
T
 
F
L
 
L
R
 
E
R
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
-
C
 
-
G
 
G
D
 
S
A
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
E
L
 
L
E
 
H
G
 
G
V
 
I
F
 
L
S
x
N
G
|
G
S
x
T
L
 
T
S
 
L
Y
 
Y
L
 
I
F
 
L
N
 
Q
Q
 
E
Y
 
M
D
 
E
G
 
K
S
 
G
Q
 
R
P
 
T
F
 
Y
S
 
A
G
 
E
L
 
A
L
 
L
R
 
L
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
K
 
R
L
 
L
G
|
G
Y
|
Y
T
 
A
E
|
E
P
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
T
S
 
L
D
|
D
L
 
V
S
 
E
G
 
G
E
 
I
D
|
D
V
 
A
A
 
A
R
 
H
K
|
K
L
 
L
L
 
T
I
 
L
I
 
L
A
 
A
R
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
V
N
 
D
A
 
P
G
 
G
F
 
F
A
 
P
L
 
F
G
 
A
T
 
E
D
 
V
E
 
E
V
 
A
E
 
Q
-
 
G
V
 
I
E
 
A
S
 
R
L
 
L
V
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
V
L
 
L
R
 
Q
S
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
-
S
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
-
E
 
K
A
 
A
K
 
E
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
E
V
 
R
L
 
V
R
 
R
F
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
S
L
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
E
N
 
G
Q
 
G
R
 
R
G
 
W
K
 
R
A
 
A
R
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
P
V
 
R
E
 
R
V
 
L
P
 
P
A
 
Q
T
 
D
H
 
H
P
 
P
A
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
A
Y
 
R
G
 
G
T
 
N

Sites not aligning to the query:

2ejwA Homoserine dehydrogenase from thermus thermophilus hb8
29% identity, 83% coverage: 24:322/362 of query aligns to 6:270/331 of 2ejwA

query
sites
2ejwA
I
 
I
V
 
A
L
 
L
F
 
L
G
 
G
T
 
G
G
 
G
V
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
Y
K
 
N
L
 
L
L
 
V
N
 
L
T
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
E
R
 
R
R
 
A
Q
 
E
Q
 
E
T
 
L
S
 
S
A
 
A
E
 
F
Q
 
G
L
 
V
A
 
V
D
 
P
R
 
R
A
 
F
L
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
V
R
 
R
E
 
D
K
 
P
L
 
R
K
 
K
S
 
P
H
 
R
G
 
A
D
 
I
P
 
P
R
 
Q
D
 
E
D
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
E
D
 
P
T
 
F
S
 
D
G
 
L
A
 
L
A
 
E
V
 
A
K
 
D
V
 
L
I
 
V
I
 
V
D
 
E
A
 
A
T
 
M
A
 
G
N
 
G
A
 
V
N
 
E
L
 
A
A
 
P
A
 
L
R
 
R
H
 
L
A
 
V
-
 
L
D
 
P
W
 
A
L
 
L
A
 
E
R
 
A
G
 
G
Y
 
I
H
 
P
V
 
L
V
 
I
T
 
T
A
 
A
N
 
N
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
L
G
 
A
G
 
E
E
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
A
W
 
W
R
 
E
A
 
S
L
 
L
Q
 
R
A
 
P
A
 
F
V
 
A
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
G
 
L
R
 
I
Y
 
Y
G
 
H
D
x
E
A
 
A
A
 
-
T
 
S
V
|
V
G
x
M
A
|
A
G
 
G
L
x
T
P
 
P
V
 
A
L
 
L
S
 
S
T
 
F
L
 
L
R
 
E
R
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
-
C
 
-
G
 
G
D
 
S
A
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
E
L
 
L
E
 
H
G
 
G
V
 
I
F
 
L
S
 
N
G
 
G
S
 
T
L
 
T
S
 
L
Y
 
Y
L
 
I
F
 
L
N
 
Q
Q
 
E
Y
 
M
D
 
E
G
 
K
S
 
G
Q
 
R
P
 
T
F
 
Y
S
 
A
G
 
E
L
 
A
L
 
L
R
 
L
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
K
 
R
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
E
 
E
P
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
T
S
 
L
D
 
D
L
 
V
S
 
E
G
 
G
E
 
I
D
|
D
V
 
A
A
 
A
R
 
H
K
|
K
L
 
L
L
 
T
I
 
L
I
 
L
A
 
A
R
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
V
N
 
D
A
 
P
G
 
G
F
 
F
A
 
P
L
 
F
G
 
A
T
 
E
D
 
V
E
 
E
V
 
A
E
 
Q
-
 
G
V
 
I
E
 
A
S
 
R
L
 
L
V
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
V
L
 
L
R
 
Q
S
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
-
S
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
-
E
 
K
A
 
A
K
 
E
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
E
V
 
R
L
 
V
R
 
R
F
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
S
L
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
E
N
 
G
Q
 
G
R
 
R
G
 
W
K
 
R
A
 
A
R
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
P
V
 
R
E
 
R
V
 
L
P
 
P
A
 
Q
T
 
D
H
 
H
P
 
P
A
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
A
Y
 
R
G
 
G
T
 
N

6a0tB Homoserine dehydrogenase k99a mutant from thermus thermophilus hb8 complexed with hse and NADP+ (see paper)
29% identity, 83% coverage: 24:322/362 of query aligns to 6:270/332 of 6a0tB

query
sites
6a0tB
I
 
I
V
 
A
L
 
L
F
 
L
G
|
G
T
x
G
G
|
G
V
x
T
V
|
V
G
 
G
G
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
Y
K
 
N
L
 
L
L
 
V
N
 
L
T
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
E
R
 
R
R
 
A
Q
 
E
Q
 
E
T
 
L
S
 
S
A
 
A
E
 
F
Q
 
G
L
 
V
A
 
V
D
 
P
R
 
R
A
 
F
L
 
L
-
 
G
-
 
V
-
x
L
-
x
V
R
|
R
E
x
D
K
 
P
L
 
R
K
|
K
S
 
P
H
x
R
G
 
A
D
 
I
P
 
P
R
 
Q
D
 
E
D
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
E
D
 
P
T
 
F
S
 
D
G
 
L
A
 
L
A
 
E
V
 
A
K
 
D
V
 
L
I
 
V
I
 
V
D
 
E
A
|
A
T
x
M
A
x
G
N
 
G
A
 
V
N
 
E
L
 
A
A
 
P
A
 
L
R
 
R
H
 
L
A
 
V
-
 
L
D
 
P
W
 
A
L
 
L
A
 
E
R
 
A
G
 
G
Y
 
I
H
 
P
V
 
L
V
 
I
T
 
T
A
|
A
N
|
N
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
L
G
 
A
G
 
E
E
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
A
W
 
W
R
 
E
A
 
S
L
 
L
Q
 
R
A
 
P
A
 
F
V
 
A
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
G
 
L
R
 
I
Y
 
Y
G
 
H
D
 
E
A
 
A
A
 
-
T
 
S
V
 
V
G
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
T
P
 
P
V
 
A
L
 
L
S
 
S
T
 
F
L
 
L
R
 
E
R
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
-
C
 
-
G
 
G
D
 
S
A
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
E
L
 
L
E
 
H
G
 
G
V
 
I
F
 
L
S
x
N
G
|
G
S
x
T
L
 
T
S
 
L
Y
 
Y
L
 
I
F
 
L
N
 
Q
Q
 
E
Y
 
M
D
 
E
G
 
K
S
 
G
Q
 
R
P
 
T
F
 
Y
S
 
A
G
 
E
L
 
A
L
 
L
R
 
L
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
K
 
R
L
 
L
G
|
G
Y
|
Y
T
 
A
E
|
E
P
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
T
S
 
L
D
|
D
L
 
V
S
 
E
G
 
G
E
 
I
D
|
D
V
 
A
A
 
A
R
 
H
K
|
K
L
 
L
L
 
T
I
 
L
I
 
L
A
 
A
R
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
V
N
 
D
A
 
P
G
 
G
F
 
F
A
 
P
L
 
F
G
 
A
T
 
E
D
 
V
E
 
E
V
 
A
E
 
Q
-
 
G
V
 
I
E
 
A
S
 
R
L
 
L
V
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
V
L
 
L
R
 
Q
S
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
-
S
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
-
E
 
K
A
 
A
K
 
E
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
E
V
 
R
L
 
V
R
 
R
F
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
S
L
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
E
N
 
G
Q
 
G
R
 
R
G
 
W
K
 
R
A
 
A
R
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
P
V
 
R
E
 
R
V
 
L
P
 
P
A
 
Q
T
 
D
H
 
H
P
 
P
A
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
A
Y
 
R
G
 
G
T
 
N

Sites not aligning to the query:

5x9dA Crystal structure of homoserine dehydrogenase in complex with l- cysteine and NAD (see paper)
24% identity, 93% coverage: 24:361/362 of query aligns to 3:297/302 of 5x9dA

query
sites
5x9dA
I
 
L
V
 
L
L
 
L
F
|
F
G
|
G
T
x
Y
G
|
G
V
x
N
V
|
V
G
 
G
G
 
K
A
 
A
L
 
F
L
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
L
N
 
H
T
 
E
P
 
K
A
 
R
A
 
S
A
 
P
S
 
E
L
 
L
R
 
N
-
 
D
-
 
V
L
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
G
A
 
I
N
 
V
S
x
T
R
|
R
R
 
R
Q
 
-
Q
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
G
E
 
I
Q
 
M
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
R
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
K
S
 
E
H
 
D
G
 
F
D
 
T
P
 
P
R
 
D
D
 
L
D
 
E
A
 
G
T
 
D
L
 
V
L
 
F
R
 
K
A
 
A
L
 
F
D
 
E
T
 
K
S
 
-
G
 
-
A
 
I
A
 
K
V
 
P
K
 
D
V
 
I
I
 
I
I
 
V
D
 
D
-
x
V
A
x
S
T
x
S
A
 
A
N
 
N
A
 
Y
N
 
N
L
 
N
A
 
G
-
 
E
-
x
P
-
 
S
-
 
L
A
 
S
R
 
L
H
 
Y
A
 
K
D
 
E
W
 
A
L
 
I
A
 
K
R
 
D
G
 
G
Y
 
V
H
 
N
V
 
I
V
 
I
T
 
T
A
x
T
N
|
N
K
|
K
A
 
A
-
 
P
-
 
L
-
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
F
G
 
N
E
 
E
L
 
I
P
 
-
G
 
-
W
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
F
Q
 
S
A
 
L
A
 
A
V
 
R
A
 
S
Q
 
K
G
 
G
G
 
V
R
 
K
Y
 
I
G
 
G
D
 
F
A
 
Q
A
x
G
T
 
T
V
 
V
G
 
M
A
x
S
G
 
G
L
 
T
P
 
P
V
 
S
L
 
I
S
 
N
T
 
L
L
 
Y
R
 
R
R
 
V
L
 
L
R
 
-
A
 
-
C
 
P
G
 
G
D
 
S
A
 
R
L
 
V
L
 
I
T
 
K
L
 
I
E
 
R
G
 
G
V
 
I
F
 
L
S
x
N
G
|
G
S
x
T
L
 
T
S
 
N
Y
 
F
L
 
I
F
 
L
N
 
T
Q
 
L
Y
 
M
D
 
N
G
 
K
S
 
G
Q
 
V
P
 
S
F
 
F
S
 
E
G
 
E
L
 
A
L
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
K
 
R
L
 
R
G
 
G
Y
|
Y
T
x
A
E
|
E
P
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
T
S
 
L
D
|
D
L
 
I
S
 
N
G
 
G
E
 
F
D
|
D
V
 
A
A
 
A
R
 
A
K
|
K
L
 
I
L
 
T
I
 
I
I
 
L
A
 
A
R
 
N
N
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
M
L
 
I
G
 
G
T
 
-
D
 
N
E
 
S
V
 
V
E
 
T
V
 
I
E
 
K
S
 
D
L
 
V
V
 
K
P
 
F
E
 
E
A
 
G
L
 
I
R
 
N
S
 
R
V
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
-
S
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
D
P
 
P
L
 
K
A
 
N
R
 
E
R
 
K
H
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
I
R
 
K
F
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
Y
L
 
A
N
 
D
Q
 
E
R
 
K
G
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
E
V
 
V
G
 
W
L
 
V
V
 
K
E
 
P
V
 
L
P
 
P
A
 
I
T
 
S
H
 
Q
-
 
D
P
 
P
A
 
L
A
 
Y
R
 
N
L
 
V
Y
 
D
G
 
G
T
 
V
D
 
E
N
 
N
Q
 
A
F
 
L
A
 
E
L
 
I
T
 
T
T
 
T
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
H
 
D
S
 
I
Q
 
Q
P
 
S
L
 
I
V
 
L
I
 
I
Q
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
|
A
G
|
G
P
 
P
E
 
V
V
 
N
T
x
A
A
 
A
Q
 
Y
A
 
G
L
 
A
L
 
L
G
 
S
D
 
D
V
 
L
L
 
I
A
 
L
L
 
L

7f4cA The crystal structure of the immature holo-enzyme of homoserine dehydrogenase complexed with NADP and 1,4-butandiol from the hyperthermophilic archaeon sulfurisphaera tokodaii. (see paper)
24% identity, 93% coverage: 24:361/362 of query aligns to 3:295/300 of 7f4cA

query
sites
7f4cA
I
 
L
V
 
L
L
 
L
F
|
F
G
|
G
T
x
Y
G
|
G
V
x
N
V
|
V
G
 
G
G
 
K
A
 
A
L
 
F
L
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
L
N
 
H
T
 
E
P
 
K
A
 
R
A
 
S
A
 
P
S
 
E
L
 
L
R
 
N
-
 
D
-
 
V
L
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
G
A
 
I
N
 
V
S
x
T
R
|
R
R
|
R
Q
 
-
Q
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
G
E
 
I
Q
 
M
L
 
L
A
 
Q
D
 
D
R
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
K
S
 
E
H
 
D
G
 
F
D
 
T
P
 
P
R
 
D
D
 
L
D
 
E
A
 
G
T
 
D
L
 
V
L
 
F
R
 
K
A
 
A
L
 
F
D
 
E
T
 
K
S
 
-
G
 
-
A
 
I
A
 
K
V
 
P
K
 
D
V
 
I
I
 
I
I
 
V
D
 
D
-
x
V
A
x
S
T
x
S
A
 
A
N
 
N
A
 
Y
N
 
N
L
 
N
A
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
S
-
 
L
A
 
S
R
 
L
H
 
Y
A
 
K
D
 
E
W
 
A
L
 
I
A
 
K
R
 
D
G
 
G
Y
 
V
H
 
N
V
 
I
V
 
I
T
 
T
A
x
T
N
 
N
K
|
K
A
 
A
-
 
P
-
 
L
-
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
F
G
 
N
E
 
E
L
 
I
P
 
-
G
 
-
W
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
F
Q
 
S
A
 
L
A
 
A
V
 
R
A
 
S
Q
 
K
G
 
G
G
 
V
R
 
K
Y
 
I
G
 
G
D
 
F
A
 
Q
A
x
G
T
 
T
V
 
V
G
 
M
A
x
S
G
 
G
L
 
T
P
 
P
V
 
S
L
 
I
S
 
N
T
 
L
L
 
Y
R
 
R
R
 
V
L
 
L
R
 
-
A
 
-
C
 
P
G
 
G
D
 
S
A
 
R
L
 
V
L
 
I
T
 
K
L
 
I
E
 
R
G
 
G
V
 
I
F
 
L
S
 
N
G
 
G
S
 
T
L
 
T
S
 
N
Y
 
F
L
 
I
F
 
L
N
 
T
Q
 
L
Y
 
M
D
 
N
G
 
K
S
 
G
Q
 
V
P
 
S
F
 
F
S
 
E
G
 
E
L
 
A
L
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
A
R
 
Q
K
 
R
L
 
R
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
E
|
E
P
 
E
D
 
D
P
 
P
R
 
T
S
 
L
D
 
D
L
 
I
S
 
N
G
 
G
E
 
F
D
 
D
V
 
A
A
 
A
R
 
A
K
 
K
L
 
I
L
 
T
I
 
I
I
 
L
A
 
A
R
 
N
N
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
F
A
 
M
L
 
I
G
 
G
T
 
-
D
 
N
E
 
S
V
 
V
E
 
T
V
 
I
E
 
K
S
 
D
L
 
V
V
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
-
S
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
K
L
 
F
E
 
E
E
 
G
L
 
I
D
 
N
E
 
R
P
 
D
L
 
L
A
 
K
R
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
I
R
 
K
F
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
Y
L
 
A
N
 
D
Q
 
E
R
 
K
G
 
-
K
 
E
A
 
V
R
 
W
V
 
V
G
 
K
L
 
P
V
 
L
E
 
P
V
 
I
P
 
S
A
 
Q
T
 
D
H
 
D
P
 
P
A
 
L
A
 
Y
R
 
N
L
 
V
Y
 
D
G
 
G
T
 
V
D
 
E
N
 
N
Q
 
A
F
 
L
A
 
E
L
 
I
T
 
T
T
 
T
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
H
 
D
S
 
I
Q
 
Q
P
 
S
L
 
I
V
 
L
I
 
I
Q
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
 
P
E
 
V
V
 
N
T
x
A
A
 
A
Q
 
Y
A
 
G
L
 
A
L
 
L
G
 
S
D
 
D
V
 
L
L
 
I
A
 
L
L
 
L

6dzsA Mycobacterial homoserine dehydrogenase thra in complex with NADP
33% identity, 67% coverage: 118:359/362 of query aligns to 93:319/431 of 6dzsA

query
sites
6dzsA
L
 
L
A
 
E
R
 
Q
G
 
G
Y
 
K
H
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
A
|
A
N
 
N
K
|
K
A
 
A
L
 
L
-
 
M
-
 
S
-
 
V
A
 
S
G
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
L
P
 
-
G
 
-
W
 
-
R
 
-
A
 
A
L
 
Q
Q
 
A
A
 
A
A
 
E
V
 
A
A
 
A
Q
 
H
G
 
V
G
 
D
R
 
L
Y
 
Y
G
 
F
D
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
-
L
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
S
 
R
T
 
P
L
 
L
R
 
T
R
 
Q
L
 
S
R
 
L
A
 
A
C
 
-
G
 
G
D
 
D
A
 
T
L
 
V
L
 
T
T
 
R
L
 
V
E
 
A
G
 
G
V
 
I
F
 
V
S
 
N
G
 
G
S
 
T
L
 
T
S
 
N
Y
 
Y
L
 
I
F
 
L
N
 
S
Q
 
A
Y
 
M
D
 
D
G
 
S
S
 
T
-
 
G
Q
 
A
P
 
D
F
 
Y
S
 
G
G
 
D
L
 
A
L
 
L
R
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
S
K
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
E
 
E
P
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
T
S
 
A
D
 
D
L
 
V
S
 
E
G
 
G
E
 
Y
D
 
D
V
 
A
A
 
A
R
 
A
K
 
K
L
 
A
L
 
A
I
 
I
I
 
L
A
 
A
R
 
S
N
 
I
A
 
A
G
 
F
F
 
H
A
 
T
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
E
 
R
V
 
V
E
 
T
V
 
A
E
 
D
S
 
D
L
 
V
V
 
Y
P
 
R
E
 
E
A
 
G
L
 
I
R
 
T
S
 
K
V
 
V
D
 
T
T
 
A
D
 
A
S
 
D
F
 
F
L
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
-
A
 
A
E
 
S
A
 
A
K
 
R
A
 
A
R
 
L
G
 
G
G
 
C
V
 
T
L
 
I
R
 
K
F
 
L
L
 
L
A
 
A
-
 
I
-
 
C
-
 
E
R
 
R
L
 
L
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
D
-
 
G
N
 
H
Q
 
Q
R
 
S
G
 
V
K
 
S
A
 
A
R
 
R
V
 
V
G
 
Y
L
 
P
V
 
A
E
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
L
T
 
T
H
 
H
P
 
P
A
 
L
A
 
A
R
 
A
L
 
V
Y
 
N
G
 
G
T
 
A
D
 
F
N
 
N
Q
 
-
F
 
-
A
 
A
L
 
V
T
 
V
T
 
V
T
 
E
R
 
A
Y
 
E
H
 
A
S
 
A
Q
 
G
P
 
R
L
 
L
V
 
M
I
 
F
Q
 
Y
G
 
G
P
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
 
G
E
 
A
V
 
P
T
|
T
A
 
A
Q
 
S
A
 
A
L
 
V
L
 
M
G
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3ingA Crystal structure of homoserine dehydrogenase (np_394635.1) from thermoplasma acidophilum at 1.95 a resolution
26% identity, 59% coverage: 24:236/362 of query aligns to 5:218/319 of 3ingA

query
sites
3ingA
I
 
I
V
 
I
L
 
L
F
 
M
G
|
G
T
|
T
G
|
G
V
x
N
V
|
V
G
 
G
G
 
L
A
 
N
L
 
V
L
 
L
K
 
R
L
 
I
L
 
I
N
 
D
T
 
A
P
 
S
A
 
N
A
 
R
-
 
R
-
 
R
A
 
F
S
 
S
L
 
I
R
 
K
L
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
V
A
 
S
N
x
D
S
|
S
R
 
R
R
 
-
Q
 
S
Q
 
Y
T
 
A
S
 
S
A
 
G
E
 
R
Q
 
N
L
 
L
A
 
D
D
 
I
R
 
S
A
 
S
L
 
I
R
 
I
E
 
S
K
 
N
L
x
K
K
 
E
S
 
K
H
 
T
G
 
G
D
 
R
P
 
I
R
 
S
D
 
D
D
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
R
A
 
A
L
 
F
-
 
S
-
 
G
-
 
P
-
 
E
D
 
D
T
 
L
S
 
M
G
 
G
A
 
E
A
 
A
V
 
A
K
 
D
V
 
L
I
 
L
I
 
V
D
 
D
A
x
C
T
|
T
A
x
P
N
 
A
A
 
S
N
 
R
L
 
D
A
 
G
A
 
V
R
 
R
H
 
E
A
 
Y