SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_1071 FitnessBrowser__Putida:PP_1071 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2ia4B Crystal structure of novel amino acid binding protein from shigella flexneri
59% identity, 92% coverage: 19:300/306 of query aligns to 1:276/278 of 2ia4B

query
sites
2ia4B
A
 
A
S
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
A
A
 
G
E
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
S
T
 
T
L
 
L
K
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
A
E
 
K
S
 
N
G
 
G
T
 
V
I
 
I
T
 
V
L
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
D
 
E
S
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
D
G
 
N
K
 
Q
P
 
Q
E
 
K
P
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
H
 
Q
D
 
D
I
 
Y
Q
 
S
L
 
N
A
 
A
V
 
I
V
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
K
K
 
K
Q
 
K
L
 
L
G
 
N
T
 
K
-
 
P
D
 
D
I
 
L
K
 
Q
V
 
V
R
 
K
Y
 
L
N
 
I
L
 
P
V
 
I
T
 
T
S
|
S
Q
 
Q
T
 
N
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
|
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
V
 
V
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
A
G
 
A
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
T
I
 
I
F
 
F
E
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
-
K
 
K
D
 
G
G
 
G
Q
 
D
P
 
-
A
 
-
Y
 
I
K
 
K
D
 
D
F
 
F
P
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
R
 
V
I
 
L
L
 
L
K
 
N
A
 
K
M
 
L
N
 
N
A
 
E
D
 
E
K
 
Q
Q
 
K
M
 
M
K
 
N
M
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
G
 
G
E
 
D
A
 
S
F
 
F
N
 
R
M
 
T
L
 
L
E
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
M
 
M
M
|
M
D
|
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
A
R
 
K
K
 
K
P
 
P
A
 
D
D
 
N
W
 
W
V
 
D
I
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
Y
 
Q
E
 
E
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
M
 
M
V
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
D
D
 
D
A
 
P
A
 
Q
F
 
F
K
 
K
K
 
K
A
 
L
V
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
T
I
 
I
V
 
A
A
 
Q
Y
 
V
F
 
Q
K
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
A
N
 
E
K
 
K
S
 
W
Y
 
F
E
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
M
 
K
Q
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
K
G
 
N
L
 
L
N
 
N
L
 
M
N
 
N
F
 
F
Q
 
E
M
 
L
S
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
M
K
 
K
K
 
A
L
 
L
I
 
F
A
 
K
E
 
E
P
 
P
T
 
N
D
 
D
K
 
K
A
 
A

2vhaA Debp (see paper)
60% identity, 89% coverage: 30:300/306 of query aligns to 7:275/276 of 2vhaA

query
sites
2vhaA
T
 
T
L
 
L
K
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
A
E
 
K
S
 
N
G
 
G
T
 
V
I
 
I
T
 
V
L
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
D
 
E
S
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
D
G
 
N
K
 
Q
P
 
Q
E
 
K
P
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
H
 
Q
D
 
D
I
 
Y
Q
 
S
L
 
N
A
 
A
V
 
I
V
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
K
K
 
K
Q
 
K
L
 
L
G
 
N
T
 
K
-
 
P
D
 
D
I
 
L
K
 
Q
V
 
V
R
 
K
Y
 
L
N
 
I
L
 
P
V
 
I
T
 
T
S
|
S
Q
 
Q
T
 
N
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
|
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
V
 
V
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
A
G
 
A
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
T
I
 
I
F
 
F
E
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
-
K
 
K
D
 
G
G
 
G
Q
 
D
P
 
-
A
 
-
Y
 
I
K
 
K
D
 
D
F
 
F
P
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
R
 
V
I
 
L
L
 
L
K
 
N
A
 
K
M
 
L
N
 
N
A
 
E
D
 
E
K
 
Q
Q
 
K
M
 
M
K
 
N
M
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
G
 
G
E
 
D
A
 
S
F
 
F
N
 
R
M
 
T
L
 
L
E
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
M
 
M
M
|
M
D
|
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
A
R
 
K
K
 
K
P
 
P
A
 
D
D
 
N
W
 
W
V
 
D
I
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
Y
 
Q
E
 
E
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
M
 
M
V
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
D
D
 
D
A
 
P
A
 
Q
F
 
F
K
 
K
K
 
K
A
 
L
V
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
T
I
 
I
V
 
A
A
 
Q
Y
 
V
F
 
Q
K
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
A
N
 
E
K
 
K
S
 
W
Y
 
F
E
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
M
 
K
Q
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
K
G
 
N
L
 
L
N
 
N
L
 
M
N
 
N
F
 
F
Q
 
E
M
 
L
S
 
S
E
 
D
E
 
E
L
 
M
K
 
K
K
 
A
L
 
L
I
 
F
A
 
K
E
 
E
P
 
P
T
 
N
D
 
D
K
 
K
A
 
A

8ovoA X-ray structure of the sf-iglusnfr-s72a in complex with l-aspartate
59% identity, 80% coverage: 30:274/306 of query aligns to 5:247/503 of 8ovoA

query
sites
8ovoA
T
 
T
L
 
L
K
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
A
E
 
K
S
 
N
G
 
G
T
 
V
I
 
I
T
 
V
L
 
V
G
 
G
H
 
H
R
|
R
D
 
E
S
 
S
S
 
S
I
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
D
G
 
N
K
 
Q
P
 
Q
E
 
K
P
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
H
 
Q
D
 
D
I
 
Y
Q
 
S
L
 
N
A
 
A
V
 
I
V
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
K
K
 
K
Q
 
K
L
 
L
G
 
N
T
 
K
-
 
P
D
 
D
I
 
L
K
 
Q
V
 
V
R
 
K
Y
 
L
N
 
I
L
 
P
V
 
I
T
 
T
S
 
A
Q
 
Q
T
 
N
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
F
D
 
D
L
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
 
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
V
 
V
E
 
E
R
|
R
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
A
G
 
A
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
T
I
 
I
F
 
F
E
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
-
K
 
K
D
 
G
G
 
G
Q
 
D
P
 
-
A
 
-
Y
 
I
K
 
K
D
 
D
F
 
F
P
 
A
D
 
N
L
 
L
A
 
K
G
 
D
K
 
K
N
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
T
A
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
R
 
V
I
 
L
L
 
L
K
 
N
A
 
K
M
 
L
N
 
N
A
 
E
D
 
E
K
 
Q
Q
 
K
M
 
M
K
 
N
M
 
M
N
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
G
 
G
E
 
D
A
 
S
F
 
F
N
 
R
M
 
T
L
 
L
E
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
M
 
M
M
 
M
D
|
D
D
 
D
A
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
M
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
A
R
 
K
K
 
K
P
 
P
A
 
D
D
 
N
W
 
W
V
 
E
I
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
Q
 
Q
S
 
S
Y
 
Q
E
 
E
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
M
 
M
V
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
D
D
 
D
A
 
P
A
 
Q
F
 
F
K
 
K
K
 
K
A
 
L
V
 
M
D
 
D
D
 
D
A
 
T
I
 
I
V
 
A
A
 
Q
Y
 
V
F
 
Q
K
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
A
N
 
E
K
 
K
S
 
W
Y
 
F
E
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
M
 
K
Q
 
N
P
 
P
I
 
I

4zv1A An ancestral arginine-binding protein bound to arginine (see paper)
34% identity, 76% coverage: 38:270/306 of query aligns to 4:225/226 of 4zv1A

query
sites
4zv1A
G
 
G
T
 
T
I
 
L
T
 
R
L
 
V
G
 
G
H
 
T
R
x
E
D
 
A
S
 
T
S
x
F
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
F
L
 
K
A
 
D
G
 
E
K
 
N
P
 
G
E
 
K
P
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
-
H
 
-
D
 
D
I
 
I
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
V
 
-
V
 
-
D
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
A
K
 
K
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
-
D
 
-
I
 
V
K
 
K
V
 
V
R
 
E
Y
 
F
N
 
K
L
 
P
V
 
M
T
 
D
S
x
F
Q
 
D
T
 
G
R
 
I
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
V
 
E
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
G
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
P
I
 
Y
F
 
F
E
 
E
V
 
A
G
 
G
T
 
Q
R
 
A
L
 
I
L
 
V
T
 
-
K
 
-
V
 
V
K
 
K
D
 
K
G
 
G
Q
 
N
P
 
D
A
 
S
Y
 
I
K
 
K
D
 
S
F
 
L
P
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
K
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
x
Q
A
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
S
 
S
E
 
E
R
 
Q
I
 
H
L
 
V
K
 
K
A
 
K
M
 
V
N
 
A
A
 
K
D
 
D
K
 
A
Q
 
G
M
 
V
K
 
K
M
 
V
N
 
K
V
 
K
I
 
F
S
 
D
A
 
-
K
 
-
D
 
N
H
 
F
G
 
S
E
 
E
A
 
A
F
 
F
N
 
Q
M
 
E
L
 
L
E
 
K
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
V
M
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
-
A
 
A
G
 
L
E
 
A
M
 
Y
A
 
V
K
 
K
A
 
Q
R
 
N
K
 
P
P
 
N
A
 
A
D
 
G
W
 
V
V
 
K
I
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
E
P
 
T
Q
 
F
S
 
S
Y
 
G
E
 
E
I
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
D
 
G
D
 
N
A
 
S
A
 
E
F
 
L
K
 
L
K
 
E
A
 
K
V
 
I
D
 
N
D
 
K
A
 
A
I
 
L
V
 
E
A
 
E
Y
 
M
F
 
K
K
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
Y
N
 
D
K
 
K
S
 
I
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

4zv2A An ancestral arginine-binding protein bound to glutamine (see paper)
34% identity, 76% coverage: 38:270/306 of query aligns to 4:223/225 of 4zv2A

query
sites
4zv2A
G
 
G
T
 
T
I
 
L
T
 
R
L
 
V
G
 
G
H
 
T
R
x
E
D
 
A
S
 
T
S
x
F
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
F
L
 
K
A
 
D
G
 
E
K
 
N
P
 
G
E
 
K
P
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
-
H
 
-
D
 
D
I
 
I
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
V
 
-
V
 
-
D
 
K
A
 
A
L
 
I
K
 
A
K
 
K
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
-
D
 
-
I
 
V
K
 
K
V
 
V
R
 
E
Y
 
F
N
 
K
L
 
P
V
 
M
T
 
D
S
x
F
Q
 
D
T
 
G
R
 
I
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
V
C
 
I
G
 
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
V
 
E
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
G
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
P
I
 
Y
F
 
F
E
 
E
V
 
A
G
 
G
T
 
Q
R
 
A
L
 
I
L
 
V
T
 
-
K
 
-
V
 
V
K
 
K
D
 
K
G
 
G
Q
 
N
P
 
D
A
 
S
Y
 
I
K
 
K
D
 
S
F
 
L
P
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
K
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
 
Q
A
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
S
 
S
E
 
E
R
 
Q
I
 
H
L
 
V
K
 
K
A
 
K
M
 
V
N
 
A
A
 
A
D
 
G
K
 
V
Q
 
K
M
 
V
K
 
K
M
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
S
 
K
A
 
F
K
 
D
D
 
N
H
 
F
G
 
S
E
 
E
A
 
A
F
 
F
N
 
Q
M
 
E
L
 
L
E
 
K
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
V
M
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
-
A
 
A
G
 
L
E
 
A
M
 
Y
A
 
V
K
 
K
A
 
Q
R
 
N
K
 
P
P
 
N
A
 
A
D
 
G
W
 
V
V
 
K
I
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
E
P
 
T
Q
 
F
S
 
S
Y
 
G
E
 
E
I
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
D
 
G
D
 
N
A
 
S
A
 
E
F
 
L
K
 
L
K
 
E
A
 
K
V
 
I
D
 
N
D
 
K
A
 
A
I
 
L
V
 
E
A
 
E
Y
 
M
F
 
K
K
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
Y
N
 
D
K
 
K
S
 
I
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

5eyfB Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
32% identity, 78% coverage: 31:270/306 of query aligns to 6:234/243 of 5eyfB

query
sites
5eyfB
L
 
L
K
 
E
K
 
R
I
 
S
K
 
K
E
 
S
S
 
T
G
 
N
T
 
E
I
 
I
T
 
I
L
 
W
G
 
G
H
 
V
R
 
K
D
 
Y
S
 
D
S
 
T
I
 
R
P
 
L
F
 
F
S
 
G
Y
 
M
L
 
M
A
 
D
G
 
I
K
 
E
P
 
S
E
 
R
P
 
T
V
 
V
-
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
V
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
L
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
T
D
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
K
K
 
K
Q
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
D
D
 
N
I
 
G
K
 
K
V
 
T
R
 
E
Y
 
F
N
 
V
L
 
E
V
 
V
T
 
T
S
|
S
Q
 
K
T
 
T
R
|
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
T
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
A
E
 
I
C
 
I
G
 
A
S
x
T
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
V
 
D
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
G
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
V
I
 
Y
F
 
F
E
 
D
V
 
A
G
 
G
T
 
Q
R
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
-
K
 
-
V
 
V
K
 
K
D
 
K
G
 
G
Q
 
S
P
 
Q
A
 
-
Y
 
I
K
 
K
D
 
S
F
 
V
P
 
D
D
 
D
L
 
L
-
 
N
A
 
A
G
 
S
K
 
T
N
 
T
V
 
V
V
 
L
T
 
A
T
 
V
A
 
K
G
 
G
T
x
S
T
|
T
S
 
S
E
 
A
R
 
A
I
 
N
L
 
I
K
 
R
A
 
Q
M
 
H
N
 
A
A
 
P
D
 
D
K
 
A
Q
 
K
M
 
-
K
 
-
M
 
-
N
 
-
V
 
I
I
 
L
S
 
E
A
 
L
K
 
E
D
 
N
H
x
Y
G
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
F
N
 
T
M
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
A
 
G
V
 
D
A
 
A
F
 
M
M
 
T
M
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
I
L
 
L
A
 
L
G
 
G
E
 
-
M
 
-
A
 
-
K
 
I
A
 
A
R
 
D
K
 
E
P
 
N
A
 
P
D
 
E
W
 
Y
V
 
E
I
 
L
T
 
V
G
 
G
T
 
G
P
 
T
Q
 
F
S
 
T
Y
 
N
E
 
E
I
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
I
R
 
N
K
 
K
D
 
G
D
 
Q
A
 
E
A
 
N
F
 
F
K
 
L
K
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
N
D
 
Q
A
 
A
I
 
L
V
 
E
A
 
E
Y
 
M
F
 
H
K
 
A
S
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
Y
N
 
D
K
 
K
S
 
I
Y
 
Y
E
 
Q
K
 
K
W
 
W
F
 
F

5t0wA Crystal structure of the ancestral amino acid-binding protein anccdt- 1, a precursor of cyclohexadienyl dehydratase
33% identity, 79% coverage: 30:270/306 of query aligns to 2:228/229 of 5t0wA

query
sites
5t0wA
T
 
T
L
 
L
K
 
D
K
 
E
I
 
I
K
 
M
E
 
K
S
 
R
G
 
G
T
 
T
I
 
L
T
 
R
L
 
V
G
 
G
H
 
T
R
x
D
D
 
A
S
 
D
S
x
Y
I
 
K
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
L
 
K
A
 
D
G
 
K
K
 
N
P
 
G
E
 
Q
P
 
Y
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
-
H
 
-
D
 
D
I
 
I
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
V
 
-
V
 
-
D
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
K
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
T
 
-
D
 
-
I
 
V
K
 
K
V
 
V
R
 
E
Y
 
F
N
 
V
L
 
P
V
 
T
T
 
T
S
x
W
Q
 
D
T
 
G
R
 
I
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
T
G
 
G
T
 
K
V
 
F
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
M
G
x
S
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
V
 
P
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
K
V
 
V
G
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
P
I
 
Y
F
 
M
E
 
T
V
 
A
G
 
G
T
 
Q
R
 
T
L
 
I
L
 
L
T
 
V
K
 
K
V
 
-
K
 
K
D
 
D
G
 
N
Q
 
A
P
 
D
A
 
K
Y
 
I
K
 
K
D
 
S
F
 
F
P
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
N
G
 
K
K
 
P
N
 
D
V
 
V
-
 
K
-
 
V
V
 
A
T
 
V
T
x
Q
A
 
L
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
R
 
Q
I
 
A
L
 
A
K
 
K
A
 
E
M
 
F
N
 
L
A
 
P
D
 
-
K
 
-
Q
 
-
M
 
-
K
 
K
M
 
A
N
 
K
V
 
I
I
 
R
S
 
T
A
 
F
K
 
E
D
 
N
H
 
N
G
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
F
N
 
Q
M
 
E
L
 
V
E
 
V
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
D
A
 
A
F
 
-
M
 
M
M
 
V
D
 
T
D
|
D
A
 
S
L
 
P
L
 
V
A
 
A
G
 
A
E
 
Y
M
 
Y
A
 
A
K
 
K
A
 
L
R
 
A
K
 
V
P
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
V
 
V
I
 
V
T
 
V
G
 
D
T
 
E
P
 
P
Q
 
F
S
 
T
Y
 
H
E
 
E
I
 
P
Y
 
L
G
 
G
C
 
F
M
 
A
V
 
I
R
 
R
K
 
K
D
 
G
D
 
D
A
 
P
A
 
E
F
 
L
K
 
L
K
 
N
A
 
W
V
 
V
D
 
N
D
 
N
A
 
W
I
 
L
V
 
K
A
 
Q
Y
 
M
F
 
K
K
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
Y
N
 
D
K
 
K
S
 
L
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

6svfA Crystal structure of the p235gk mutant of argbp from t. Maritima (see paper)
28% identity, 79% coverage: 31:272/306 of query aligns to 3:229/229 of 6svfA

query
sites
6svfA
L
 
I
K
 
D
K
 
E
I
 
I
K
 
K
E
 
S
S
 
R
G
 
G
T
 
Y
I
 
L
T
 
L
L
 
V
G
 
G
H
 
L
R
 
S
D
 
A
S
 
D
S
x
F
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
L
 
V
A
 
D
G
 
E
K
 
N
P
 
G
E
 
N
P
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
-
H
 
-
D
 
D
I
 
V
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
V
 
-
V
 
-
D
 
K
A
 
E
L
 
I
K
 
A
K
 
R
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
V
D
 
E
I
 
L
K
 
K
V
 
I
R
 
V
Y
 
D
N
 
-
L
 
-
V
 
M
T
 
T
S
x
F
Q
 
D
T
 
G
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
S
V
 
L
Q
 
L
N
 
T
G
 
K
T
 
K
V
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
I
C
 
I
G
x
S
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
V
 
E
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
V
V
 
V
G
 
A
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
P
I
 
Y
F
 
F
E
 
D
V
 
A
G
 
G
T
 
Q
R
 
V
L
 
I
L
 
V
T
 
V
K
 
R
V
 
-
K
 
K
D
 
D
G
 
S
Q
 
D
P
 
F
A
 
R
Y
 
P
K
 
K
D
 
T
F
 
Y
P
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
V
G
 
G
K
 
K
N
 
T
V
 
V
V
 
A
T
 
V
T
x
Q
A
 
I
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
G
E
 
D
R
 
-
I
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
-
M
 
I
N
 
E
A
 
V
D
 
S
K
 
K
Q
 
Y
M
 
D
K
 
G
M
 
I
N
 
K
V
 
V
I
 
V
S
 
R
A
 
F
K
 
D
D
 
K
H
 
F
G
 
T
E
 
D
A
 
A
F
 
F
N
 
L
M
 
E
L
 
L
E
 
K
S
 
R
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
D
A
 
A
F
 
V
M
 
V
M
 
L
D
|
D
D
 
S
A
 
A
L
 
T
L
 
A
A
 
R
G
 
A
E
 
F
M
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
N
R
 
-
K
 
-
P
 
-
A
 
P
D
 
D
W
 
L
V
 
V
I
 
I
T
 
S
G
 
S
T
 
G
P
 
V
Q
 
L
S
 
S
Y
 
S
E
 
E
I
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
D
 
E
D
 
D
A
 
T
A
 
D
F
 
L
K
 
L
K
 
E
A
 
F
V
 
I
D
 
N
D
 
S
A
 
V
I
 
L
V
 
R
A
 
E
Y
 
L
F
 
K
K
 
K
S
 
S
G
 
G
E
 
K
V
 
Y
N
 
D
K
 
V
S
 
L
Y
 
I
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F
M
 
S
Q
 
E

2yjpA Crystal structure of the solute receptors for l-cysteine of neisseria gonorrhoeae (see paper)
28% identity, 78% coverage: 30:268/306 of query aligns to 3:229/247 of 2yjpA

query
sites
2yjpA
T
 
T
L
 
V
K
 
A
K
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
S
 
K
G
 
G
T
 
V
I
 
I
T
 
R
L
 
I
G
 
G
H
 
V
R
x
F
D
 
G
S
 
D
S
x
K
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
L
 
V
A
 
D
G
 
A
K
 
N
P
 
G
E
 
K
P
 
N
V
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
-
H
 
-
D
 
D
I
 
V
Q
 
E
L
 
I
A
 
A
V
 
K
V
 
-
D
 
D
A
 
L
L
 
A
K
 
K
K
 
D
Q
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
S
D
 
P
I
 
D
K
 
K
V
 
V
R
 
E
Y
 
F
N
 
V
L
 
L
V
 
T
T
x
E
S
 
A
Q
 
A
T
 
N
R
|
R
I
 
V
P
 
E
L
 
Y
V
 
V
Q
 
R
N
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
I
C
 
L
G
 
A
S
x
N
T
x
F
T
|
T
N
 
Q
N
 
T
V
 
P
E
 
E
R
|
R
Q
 
A
Q
 
E
Q
 
A
V
 
V
G
 
D
F
 
F
S
 
A
V
 
D
G
 
P
I
 
Y
F
 
M
E
 
K
V
 
V
G
 
A
T
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
L
T
 
G
K
 
V
V
 
V
K
 
S
D
 
P
G
 
K
Q
 
N
P
 
K
A
 
P
Y
 
I
K
 
T
D
 
D
F
 
M
P
 
A
D
 
Q
L
 
L
A
 
K
G
 
D
K
 
Q
N
 
T
V
 
L
V
 
L
T
 
V
T
 
N
A
 
K
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
A
E
 
D
R
 
-
I
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
A
M
 
F
N
 
F
A
 
T
D
 
K
K
 
S
Q
x
H
M
 
P
K
x
E
M
 
V
N
 
K
V
 
L
I
 
L
S
 
K
A
 
F
K
x
D
D
 
Q
H
 
N
G
 
T
E
 
E
A
 
T
F
 
F
N
 
D
M
 
A
L
 
L
E
 
K
S
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
G
V
 
V
A
 
A
F
 
L
M
 
A
M
x
H
D
|
D
D
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
W
A
 
A
K
 
W
A
 
A
R
 
K
K
 
E
P
 
N
A
 
P
D
 
N
W
 
F
-
 
E
V
 
V
I
 
A
T
 
I
G
 
G
T
 
N
P
 
L
Q
 
G
S
 
P
Y
 
A
E
 
E
I
 
F
Y
 
I
G
 
A
C
 
P
M
 
A
V
 
V
R
 
Q
K
 
K
D
 
G
D
 
N
A
 
A
A
 
D
F
 
L
K
 
L
K
 
N
A
 
W
V
 
V
D
 
N
D
 
G
A
 
E
I
 
I
V
 
A
A
 
A
Y
 
M
F
 
K
K
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
R
V
 
L
N
 
K
K
 
A
S
 
A
Y
 
Y
E
 
E
K
 
K

2v25A Structure of the campylobacter jejuni antigen peb1a, an aspartate and glutamate receptor with bound aspartate (see paper)
28% identity, 79% coverage: 29:269/306 of query aligns to 1:229/231 of 2v25A

query
sites
2v25A
G
 
G
T
 
K
L
 
L
K
 
E
K
 
S
I
 
I
K
 
K
E
 
S
S
 
K
G
 
G
T
 
Q
I
 
L
T
 
I
L
 
V
G
 
G
H
 
V
R
x
K
D
 
N
S
 
D
S
 
V
I
 
P
P
 
H
F
 
Y
S
 
A
Y
 
L
L
 
L
A
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
D
E
 
Q
P
 
A
V
 
T
G
 
G
Y
 
E
S
 
I
H
 
K
D
 
G
I
 
F
Q
 
E
L
 
V
A
 
D
V
 
V
V
 
A
D
 
K
A
 
L
L
 
L
K
 
A
K
 
K
Q
 
S
-
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
D
D
 
D
I
 
K
K
 
K
V
 
I
R
 
K
Y
 
L
N
 
V
L
 
A
V
 
V
T
 
N
S
 
A
Q
 
K
T
 
T
R
|
R
I
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
D
N
 
N
G
 
G
T
 
S
V
 
V
D
 
D
L
 
A
E
 
V
C
 
I
G
 
A
S
x
T
T
 
F
T
|
T
N
 
I
N
 
T
V
 
P
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
R
Q
 
I
V
 
Y
G
 
N
F
 
F
S
 
S
V
 
E
G
 
P
I
 
Y
F
 
Y
E
 
Q
V
 
D
G
 
A
T
 
I
R
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
V
K
 
L
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
K
Q
 
E
P
 
K
A
 
K
Y
 
Y
K
 
K
D
 
S
F
 
L
P
 
A
D
 
D
L
 
M
A
 
K
G
 
G
K
 
A
N
 
N
V
 
I
-
 
G
V
 
V
T
 
A
T
 
Q
A
 
A
G
x
A
T
|
T
T
 
T
S
 
K
E
 
K
R
 
A
I
 
I
L
 
G
K
 
E
A
 
A
M
 
A
N
 
-
A
 
-
D
 
-
K
 
K
Q
 
K
M
 
I
K
 
G
M
 
I
N
 
D
V
 
V
I
 
K
S
 
F
A
 
S
K
 
E
-
 
F
-
 
P
D
 
D
H
x
Y
G
 
P
E
 
S
A
 
I
F
 
K
N
 
A
M
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
G
 
K
R
 
R
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
F
M
 
S
M
 
V
D
|
D
D
 
K
A
 
S
L
x
I
L
 
L
A
 
L
G
 
G
E
 
Y
M
 
V
A
 
D
K
 
D
A
 
K
R
 
S
K
 
E
P
 
I
A
 
-
D
 
-
W
 
-
V
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
L
P
 
P
Q
 
D
S
 
S
Y
 
F
E
 
E
-
 
P
-
 
Q
I
 
S
Y
 
Y
G
 
G
C
 
I
M
 
V
V
 
T
R
 
K
K
 
K
D
 
D
D
 
D
A
 
P
A
 
A
F
 
F
K
 
A
K
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
D
 
D
A
 
F
I
 
V
V
 
K
A
 
E
Y
 
H
F
 
-
K
 
-
S
 
K
G
 
N
E
 
E
V
 
I
N
 
D
K
 
A
S
 
L
Y
 
A
E
 
K
K
 
K
W
 
W

4ymxA Crystal structure of the substrate binding protein of an amino acid abc transporter (see paper)
27% identity, 77% coverage: 38:272/306 of query aligns to 1:224/224 of 4ymxA

query
sites
4ymxA
G
 
G
T
 
V
I
 
I
T
 
V
L
 
M
G
 
G
H
 
T
R
x
S
D
 
A
S
x
D
S
x
F
I
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
L
 
H
-
 
K
-
 
V
-
 
E
A
 
G
G
 
G
K
 
K
P
 
D
E
 
E
P
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
I
D
 
D
I
 
I
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
A
D
 
N
A
 
A
L
 
I
K
 
A
K
 
K
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
-
D
 
-
I
 
V
K
 
K
V
 
L
R
 
E
Y
 
I
N
 
K
L
 
D
V
 
M
T
 
D
S
x
F
Q
 
K
T
 
G
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
A
G
 
G
T
 
R
V
 
V
D
 
D
L
 
M
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
P
N
 
T
V
 
A
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
S
V
 
V
G
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
L
I
 
Y
F
 
Y
E
 
D
V
 
-
G
 
-
T
 
S
R
 
R
L
 
Q
L
 
V
T
 
V
K
 
V
V
 
V
K
 
K
D
 
N
G
 
D
Q
 
S
P
 
P
A
 
I
Y
 
S
K
 
K
D
 
-
F
 
F
P
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
V
K
 
K
N
 
T
V
 
I
V
 
A
T
 
V
T
x
Q
A
 
I
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
E
R
 
E
I
 
A
L
 
A
K
 
K
A
 
K
M
 
I
N
 
P
A
 
N
D
 
V
K
 
K
Q
 
L
M
 
K
K
 
Q
M
 
L
N
 
N
V
 
R
I
 
V
S
 
S
A
 
-
K
 
-
D
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
D
A
 
E
F
 
F
N
 
M
M
 
D
L
 
L
E
 
Q
S
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
C
V
 
D
A
 
A
F
 
I
M
 
V
M
 
V
D
x
E
D
 
D
A
 
T
L
 
V
L
 
A
A
 
K
G
 
A
E
 
Y
M
 
L
A
 
K
K
 
E
A
 
Y
R
 
K
K
 
D
P
 
M
A
 
K
D
 
I
W
 
L
V
 
Y
I
 
M
T
 
D
G
 
E
T
 
I
P
 
N
Q
 
N
S
 
V
Y
 
E
E
 
N
I
 
G
Y
 
S
G
 
A
C
 
V
M
 
A
V
 
V
R
 
A
K
 
K
D
 
G
D
 
N
A
 
K
A
 
S
F
 
L
K
 
L
K
 
D
A
 
V
V
 
V
D
 
N
D
 
E
A
 
V
I
 
I
V
 
K
A
 
E
Y
 
L
F
 
K
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
Y
N
 
D
K
 
K
S
 
L
Y
 
V
E
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
M
 
K
Q
 
Q

4z9nB Abc transporter / periplasmic binding protein from brucella ovis with glutathione bound
26% identity, 72% coverage: 30:249/306 of query aligns to 7:224/324 of 4z9nB

query
sites
4z9nB
T
 
T
L
 
L
K
 
S
K
 
D
I
 
V
K
 
K
E
 
A
S
 
K
G
 
G
T
 
F
I
 
L
T
 
Q
L
 
C
G
 
G
H
 
V
R
x
N
D
x
T
S
 
G
S
 
L
I
 
L
P
 
G
F
 
F
S
 
A
Y
 
S
L
 
P
A
 
N
G
 
D
K
 
K
P
 
G
E
 
E
P
 
W
V
 
S
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
V
D
 
D
I
 
Y
Q
 
C
L
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
A
D
 
S
A
 
A
L
 
I
K
 
-
K
 
-
Q
 
-
L
 
F
G
 
G
T
 
D
D
 
P
I
 
T
K
 
K
V
 
V
R
 
K
Y
 
F
N
 
T
L
 
P
V
 
L
T
x
N
S
x
A
Q
 
K
T
 
E
R
|
R
I
 
F
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
V
E
 
L
C
 
I
G
x
R
S
x
N
T
|
T
T
|
T
N
 
W
N
 
T
V
 
I
E
 
S
R
|
R
Q
 
D
Q
 
T
Q
 
S
V
 
L
G
 
G
F
 
L
S
 
D
V
 
F
-
 
A
G
 
G
I
 
I
-
 
N
-
 
Y
-
 
Y
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
F
 
F
E
 
M
V
 
I
G
 
N
T
 
S
R
 
K
L
 
K
L
 
L
T
 
A
K
 
G
V
 
I
K
 
N
D
 
S
G
 
A
Q
 
L
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
D
 
Q
L
 
L
A
 
S
G
 
G
K
 
A
N
 
S
V
 
I
V
 
C
T
 
V
T
x
Q
A
 
A
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
T
E
 
E
R
 
L
I
 
N
L
 
M
K
 
A
A
 
D
M
 
Y
N
 
F
A
 
R
D
 
A
K
 
N
Q
 
K
M
 
M
K
 
E
M
 
Y
N
 
N
V
 
P
I
 
V
S
 
V
A
 
F
K
 
E
D
 
K
H
x
I
G
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
N
N
 
A
M
 
A
L
 
Y
E
 
D
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
C
V
 
D
A
 
A
F
 
Y
M
 
T
M
x
T
D
|
D
D
 
Q
A
 
S
L
 
S
L
 
L
A
 
Y
G
 
G
E
 
V
M
 
R
A
 
L
K
 
A
A
 
L
R
 
A
K
 
N
P
 
P
A
 
D
D
 
D
W
 
H
V
 
V
I
 
I
T
 
L
G
 
P
T
 
E
P
 
I
Q
 
I
S
 
S
Y
 
K
E
 
E
I
 
P
Y
 
F
G
 
G
C
 
L
M
 
T
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
D
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
R
F
 
W
K
 
A
K
 
D
A
 
V
V
 
V

4h5fA Crystal structure of an amino acid abc transporter substrate-binding protein from streptococcus pneumoniae canada mdr_19a bound to l- arginine, form 1
25% identity, 73% coverage: 31:253/306 of query aligns to 4:218/240 of 4h5fA

query
sites
4h5fA
L
 
V
K
 
E
K
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
Q
S
 
K
G
 
G
T
 
K
I
 
L
T
 
V
L
 
V
G
 
A
H
 
T
R
x
S
D
 
P
S
x
D
S
x
Y
I
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
-
 
Q
-
 
S
-
 
L
L
 
V
A
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
N
E
 
Q
P
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
A
S
 
D
H
 
I
D
 
D
I
 
M
Q
 
A
L
 
Q
A
 
A
V
 
I
V
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
K
 
G
K
 
V
Q
 
K
L
 
L
G
 
E
T
 
I
D
 
L
I
 
S
K
 
M
V
 
S
R
x
F
Y
 
D
N
 
N
L
 
V
V
 
L
T
 
T
S
 
S
Q
 
-
T
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
L
Q
 
Q
N
 
T
G
 
G
T
 
K
V
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
A
C
 
V
G
x
A
S
x
G
T
x
I
T
x
S
N
 
A
N
 
T
V
 
D
E
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
E
Q
 
V
V
 
F
G
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
I
G
 
P
I
 
Y
F
 
Y
E
 
E
V
 
N
G
 
K
T
 
I
R
 
S
L
 
F
L
 
L
T
 
V
K
 
H
V
 
K
K
 
A
D
 
D
G
 
V
Q
 
E
P
 
K
A
 
-
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
F
 
L
P
 
T
D
 
S
L
 
L
A
 
E
G
 
S
K
 
A
N
 
N
V
 
I
V
 
A
T
 
A
T
x
Q
A
 
K
G
 
G
T
|
T
T
 
V
S
 
P
E
 
E
R
 
S
I
 
M
L
 
V
K
 
K
A
 
-
M
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
E
K
 
Q
Q
 
L
M
 
P
K
 
K
M
 
A
N
 
Q
V
 
L
I
 
T
S
 
S
A
 
L
K
 
T
D
 
N
H
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
F
 
V
N
 
N
M
 
E
L
 
L
E
 
Q
S
 
A
G
 
G
R
 
K
A
 
I
V
 
D
A
 
A
F
 
V
M
 
H
M
 
M
D
|
D
D
 
E
A
 
P
L
 
V
L
 
A
A
 
L
G
 
S
E
 
Y
M
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
N
R
 
A
K
 
G
P
 
L
A
 
A
D
 
V
W
 
A
V
 
T
I
 
V
T
 
S
G
 
L
T
 
K
P
 
M
Q
 
K
S
 
D
Y
 
G
E
 
D
I
 
A
Y
 
N
G
 
A
C
 
V
M
 
A
V
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
N
D
 
S
A
 
D
A
 
D
F
 
L
K
 
K
K
 
E
A
 
V
V
 
V
D
 
D
D
 
K
A
 
V
I
 
I

6h20A Glnh bound to asn, mycobacterium tuberculosis (see paper)
24% identity, 83% coverage: 22:276/306 of query aligns to 35:281/287 of 6h20A

query
sites
6h20A
A
 
A
M
 
T
A
 
K
E
 
A
E
 
E
L
 
A
T
 
D
G
 
A
T
 
A
L
 
V
K
 
A
K
 
D
I
 
I
K
 
R
E
 
A
S
 
R
G
 
G
T
 
R
I
 
L
T
 
I
L
 
V
G
 
G
H
 
L
R
 
D
D
 
I
S
 
G
S
 
S
I
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
-
 
R
-
 
D
-
 
P
L
 
I
A
 
T
G
 
G
K
 
-
P
 
-
E
 
E
P
 
I
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
V
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
L
 
G
A
 
E
V
 
V
V
 
A
D
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
R
K
 
D
Q
 
I
L
 
F
G
 
G
T
 
V
D
 
P
I
 
S
K
 
H
V
 
V
R
 
E
Y
 
Y
N
 
R
L
 
I
V
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
T
 
E
R
|
R
I
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
V
 
C
E
 
E
R
|
R
Q
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
G
 
N
F
 
F
S
 
S
V
 
T
G
 
V
I
 
Y
F
 
L
E
 
D
V
 
A
G
 
N
T
 
Q
R
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
-
A
 
A
Y
 
P
K
 
R
D
 
D
F
 
S
P
 
P
-
 
I
-
 
T
-
 
K
-
 
V
-
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
L
R
 
R
I
 
R
L
 
I
K
 
R
A
 
E
M
 
I
N
 
A
A
 
P
D
 
P
K
 
P
Q
 
V
M
 
-
K
 
-
M
 
-
N
 
-
V
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
G
 
A
E
 
D
A
 
C
F
 
L
N
 
V
M
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
V
 
D
A
 
A
F
 
V
M
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
L
M
 
V
A
 
E
K
 
E
A
 
D
R
 
P
K
 
Y
P
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
L
V
 
H
I
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
P
P
 
D
Q
 
M
S
 
A
Y
 
D
E
 
Q
I
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
V
M
 
G
V
 
I
R
 
N
K
 
L
D
 
D
D
 
N
A
 
T
A
 
G
F
 
L
K
 
V
K
 
R
A
 
F
V
 
V
D
 
N
D
 
G
A
 
T
I
 
L
V
 
E
A
 
R
Y
 
I
F
 
R
K
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
W
N
 
N
K
 
T
S
 
L
Y
 
Y
E
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
M
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

6h1uA Glnh bound to asp, mycobacterium tuberculosis (see paper)
24% identity, 83% coverage: 22:276/306 of query aligns to 35:281/287 of 6h1uA

query
sites
6h1uA
A
 
A
M
 
T
A
 
K
E
 
A
E
 
E
L
 
A
T
 
D
G
 
A
T
 
A
L
 
V
K
 
A
K
 
D
I
 
I
K
 
R
E
 
A
S
 
R
G
 
G
T
 
R
I
 
L
T
 
I
L
 
V
G
 
G
H
 
L
R
 
D
D
 
I
S
 
G
S
 
S
I
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
-
 
R
-
 
D
-
 
P
L
 
I
A
 
T
G
 
G
K
 
-
P
 
-
E
 
E
P
 
I
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
V
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
L
 
G
A
 
E
V
 
V
V
 
A
D
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
R
K
 
D
Q
 
I
L
 
F
G
 
G
T
 
V
D
 
P
I
 
S
K
 
H
V
 
V
R
 
E
Y
 
Y
N
 
R
L
 
I
V
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
T
 
E
R
|
R
I
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
V
 
C
E
 
E
R
|
R
Q
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
G
 
N
F
 
F
S
 
S
V
 
T
G
 
V
I
 
Y
F
 
L
E
 
D
V
 
A
G
 
N
T
 
Q
R
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
-
A
 
A
Y
 
P
K
 
R
D
 
D
F
 
S
P
 
P
-
 
I
-
 
T
-
 
K
-
 
V
-
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
L
R
 
R
I
 
R
L
 
I
K
 
R
A
 
E
M
 
I
N
 
A
A
 
P
D
 
P
K
 
P
Q
 
V
M
 
-
K
 
-
M
 
-
N
 
-
V
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
G
 
A
E
 
D
A
 
C
F
 
L
N
 
V
M
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
V
 
D
A
 
A
F
 
V
M
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
x
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
L
M
 
V
A
 
E
K
 
E
A
 
D
R
 
P
K
 
Y
P
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
L
V
 
H
I
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
P
P
 
D
Q
 
M
S
 
A
Y
 
D
E
 
Q
I
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
V
M
 
G
V
 
I
R
 
N
K
 
L
D
 
D
D
 
N
A
 
T
A
 
G
F
 
L
K
 
V
K
 
R
A
 
F
V
 
V
D
 
N
D
 
G
A
 
T
I
 
L
V
 
E
A
 
R
Y
 
I
F
 
R
K
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
W
N
 
N
K
 
T
S
 
L
Y
 
Y
E
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
M
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

2y7iA Structural basis for high arginine specificity in salmonella typhimurium periplasmic binding protein stm4351. (see paper)
25% identity, 76% coverage: 39:270/306 of query aligns to 7:227/228 of 2y7iA

query
sites
2y7iA
T
 
T
I
 
L
T
x
H
L
 
F
G
 
G
H
 
T
R
 
S
D
 
A
S
 
T
S
x
Y
I
 
A
P
 
P
F
 
Y
S
x
E
Y
 
F
L
 
V
A
x
D
G
 
A
K
x
D
P
 
N
E
 
K
P
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
I
D
 
D
I
 
V
Q
 
A
L
 
N
A
 
A
V
 
V
V
 
C
D
 
K
A
 
E
L
 
M
K
 
Q
K
 
A
Q
 
E
L
 
C
G
 
S
T
 
-
D
 
-
I
 
-
K
 
-
V
 
-
R
 
-
Y
 
F
N
 
T
L
 
N
V
 
Q
T
 
S
S
x
F
Q
x
D
T
 
S
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
S
V
 
L
Q
 
R
N
 
F
G
 
K
T
 
K
V
 
F
D
|
D
L
 
A
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
x
G
T
 
M
T
x
D
N
 
M
N
 
T
V
 
P
E
 
K
R
|
R
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
G
 
S
F
 
F
S
 
S
V
 
Q
G
 
P
I
 
Y
F
 
Y
E
 
E
V
 
-
G
 
G
T
 
L
R
 
S
L
 
A
L
 
V
T
 
V
K
 
V
V
 
T
K
 
R
D
 
K
G
 
G
Q
 
-
P
 
-
A
 
A
Y
 
Y
K
 
H
D
 
T
F
 
F
P
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
K
V
 
V
V
 
G
T
 
L
T
x
E
A
 
N
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
H
E
 
Q
R
 
R
I
 
Y
L
 
L
K
 
Q
A
 
-
M
 
-
N
 
-
A
 
-
D
 
D
K
 
K
Q
 
Q
M
 
Q
K
 
A
M
 
I
N
 
T
V
 
P
I
 
V
S
 
A
A
 
Y
K
x
D
D
 
S
H
 
Y
G
 
L
E
 
N
A
 
A
F
 
F
N
 
T
M
 
D
L
 
L
E
 
K
S
 
N
G
 
N
R
 
R
A
 
L
V
 
E
A
 
G
F
 
V
M
 
F
M
 
G
D
|
D
D
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
I
A
 
G
G
 
K
E
 
W
M
 
L
A
 
-
K
 
-
A
 
-
R
 
K
K
 
N
P
 
N
A
 
P
D
 
D
W
 
Y
V
 
A
I
 
I
T
 
M
G
 
D
T
 
E
P
 
R
Q
 
A
S
 
S
Y
 
D
E
 
P
I
 
D
Y
 
Y
-
 
Y
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
G
 
G
C
 
I
M
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
K
D
 
D
D
 
N
A
 
D
A
 
A
F
 
L
K
 
L
K
 
Q
A
 
E
V
 
I
D
 
N
D
 
A
A
 
A
I
 
L
V
 
D
A
 
K
Y
 
V
F
 
K
K
 
A
S
 
S
G
 
P
E
 
E
V
 
Y
N
 
A
K
 
Q
S
 
M
Y
 
Q
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

6h2tA Glnh bound to glu, mycobacterium tuberculosis (see paper)
24% identity, 83% coverage: 22:276/306 of query aligns to 36:282/288 of 6h2tA

query
sites
6h2tA
A
 
A
M
 
T
A
 
K
E
 
A
E
 
E
L
 
A
T
 
D
G
 
A
T
 
A
L
 
V
K
 
A
K
 
D
I
 
I
K
 
R
E
 
A
S
 
R
G
 
G
T
 
R
I
 
L
T
 
I
L
 
V
G
 
G
H
 
L
R
 
D
D
 
I
S
 
G
S
 
S
I
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
-
 
R
-
 
D
-
 
P
L
 
I
A
 
T
G
 
G
K
 
-
P
 
-
E
 
E
P
 
I
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
V
D
 
D
I
 
I
Q
 
A
L
 
G
A
 
E
V
 
V
V
 
A
D
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
R
K
 
D
Q
 
I
L
 
F
G
 
G
T
 
V
D
 
P
I
 
S
K
 
H
V
 
V
R
 
E
Y
 
Y
N
 
R
L
 
I
V
 
L
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
T
 
E
R
|
R
I
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
V
 
C
E
 
E
R
|
R
Q
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
G
 
N
F
 
F
S
 
S
V
 
T
G
 
V
I
 
Y
F
 
L
E
 
D
V
 
A
G
 
N
T
 
Q
R
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
-
A
 
A
Y
 
P
K
 
R
D
 
D
F
 
S
P
 
P
-
 
I
-
 
T
-
 
K
-
 
V
-
 
S
D
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
V
V
 
C
T
 
V
T
 
A
A
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
E
 
L
R
 
R
I
 
R
L
 
I
K
 
R
A
 
E
M
 
I
N
 
A
A
 
P
D
 
P
K
 
P
Q
 
V
M
 
-
K
 
-
M
 
-
N
 
-
V
 
I
I
 
V
S
 
S
A
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
G
 
A
E
 
D
A
 
C
F
 
L
N
 
V
M
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
V
 
D
A
 
A
F
 
V
M
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
A
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
L
M
 
V
A
 
E
K
 
E
A
 
D
R
 
P
K
 
Y
P
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
L
V
 
H
I
 
I
T
 
V
G
 
G
T
 
P
P
 
D
Q
 
M
S
 
A
Y
 
D
E
 
Q
I
 
P
Y
 
Y
G
 
G
C
 
V
M
 
G
V
 
I
R
 
N
K
 
L
D
 
D
D
 
N
A
 
T
A
 
G
F
 
L
K
 
V
K
 
R
A
 
F
V
 
V
D
 
N
D
 
G
A
 
T
I
 
L
V
 
E
A
 
R
Y
 
I
F
 
R
K
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
W
N
 
N
K
 
T
S
 
L
Y
 
Y
E
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
M
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
Q
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

P02911 Lysine/arginine/ornithine-binding periplasmic protein; LAO-binding protein from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 4 papers)
23% identity, 76% coverage: 39:270/306 of query aligns to 27:253/260 of P02911

query
sites
P02911
T
 
T
I
 
V
T
 
R
L
 
I
G
 
G
H
 
T
R
x
D
D
 
T
S
 
T
S
x
Y
I
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
S
L
 
K
A
 
D
G
 
A
K
 
K
P
 
G
E
 
E
P
 
F
V
 
I
G
 
G
Y
 
F
S
x
D
H
 
I
D
 
D
I
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
L
K
 
G
K
 
N
Q
 
E
L
 
M
G
x
C
T
 
K
D
 
R
I
 
M
K
 
Q
V
 
V
R
 
K
Y
x
C
N
 
T
L
 
W
V
 
V
T
 
A
S
 
S
Q
 
D
-
x
F
-
 
D
T
 
A
R
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
S
V
 
L
Q
 
K
N
 
A
G
 
K
T
 
K
V
 
I
D
 
D
L
 
A
E
 
I
C
 
I
G
x
S
S
|
S
T
 
L
T
x
S
N
 
I
N
 
T
V
 
D
E
 
K
R
|
R
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
I
G
 
A
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
K
I
 
L
F
 
Y
E
 
A
V
 
A
G
 
D
T
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
I
T
 
-
K
 
-
V
 
A
K
 
A
D
 
K
G
 
G
Q
 
S
P
 
P
A
 
I
Y
 
Q
K
 
P
D
 
T
F
 
L
P
 
E
D
 
S
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
H
V
 
V
V
 
G
T
 
V
T
x
L
A
 
Q
G
 
G
T
 
S
T
|
T
S
 
Q
E
 
E
R
 
A
I
 
Y
L
 
-
K
 
-
A
 
A
M
 
N
N
 
D
A
 
N
D
 
W
K
 
R
Q
 
T
M
 
K
K
 
G
M
 
V
N
 
D
V
 
V
I
 
V
S
 
A
A
 
Y
K
 
A
D
 
N
H
 
Q
G
 
D
E
 
L
A
 
I
F
 
Y
N
 
S
M
 
D
L
 
L
E
 
T
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
V
 
D
A
 
A
F
 
A
M
 
L
M
 
Q
D
|
D
D
 
E
A
 
V
L
 
A
L
 
A
A
 
S
G
 
E
E
 
G
M
 
F
A
 
L
K
 
K
A
 
Q
R
 
P
K
 
A
P
 
G
A
 
K
D
 
E
W
 
Y
V
 
A
I
 
F
T
 
A
G
 
G
T
 
P
P
 
S
Q
 
V
S
 
K
Y
 
D
E
 
K
I
 
K
Y
 
Y
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
T
G
 
G
C
 
V
M
 
G
V
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
D
D
 
D
A
 
T
A
 
E
F
 
L
K
 
K
K
 
A
A
 
A
V
 
F
D
 
D
D
 
K
A
 
A
I
 
L
V
 
T
A
 
E
Y
 
L
F
 
R
K
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
Y
N
 
D
K
 
K
S
 
M
Y
 
A
E
 
K
K
 
K
W
 
Y
F
 
F

5l9oB Crystal structure of agrobacterium tumefaciens c58 strain pbp soca in complex with glucopine (see paper)
24% identity, 77% coverage: 39:275/306 of query aligns to 12:236/243 of 5l9oB

query
sites
5l9oB
T
 
T
I
 
I
T
 
S
L
 
V
G
 
G
H
 
T
R
 
M
D
 
G
S
 
D
S
 
A
I
 
K
P
 
P
F
 
Y
S
 
A
Y
 
F
L
 
T
A
 
T
G
 
A
K
 
D
P
 
G
E
x
N
P
x
F
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
I
D
 
E
I
 
L
Q
 
F
L
 
L
A
 
N
V
 
V
V
 
A
D
 
G
A
 
R
L
 
L
-
 
G
-
 
F
K
 
K
K
 
K
Q
 
E
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
I
 
-
K
 
Q
V
 
V
R
 
V
Y
 
F
N
 
T
L
 
G
V
 
Q
T
 
E
S
x
F
Q
 
S
T
 
A
R
 
L
I
 
M
P
 
P
L
 
S
V
 
V
Q
 
A
N
 
N
G
 
G
T
 
R
V
 
F
D
 
D
L
 
V
E
 
A
C
 
A
G
x
A
S
x
A
T
 
I
T
x
G
N
 
T
N
 
T
V
 
A
E
 
K
R
|
R
Q
 
K
Q
 
E
Q
 
T
V
 
V
G
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
G
I
 
Y
F
 
L
E
x
A
V
x
G
G
 
F
T
 
L
R
 
S
L
 
V
L
 
L
T
 
T
K
 
S
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
E
P
 
A
A
 
G
Y
 
I
K
 
T
D
 
D
F
 
A
P
 
A
D
 
G
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
L
V
 
G
T
 
V
T
 
V
A
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
L
|
L
K
x
Q
A
 
E
M
 
I
N
 
Y
A
 
A
D
 
E
K
 
K
Q
 
N
M
 
F
K
 
A
-
 
G
M
 
T
N
 
D
V
 
L
I
 
V
S
 
K
A
 
F
K
 
P
D
 
D
H
 
N
G
 
N
E
 
S
A
 
A
F
 
V
N
 
S
M
 
A
L
 
L
E
 
N
S
 
N
G
 
G
R
 
T
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
H
M
 
F
M
 
L
D
|
D
D
 
-
A
 
-
L
 
F
L
 
E
A
 
A
G
 
A
E
 
K
M
 
D
A
 
Y
K
 
S
A
 
A
R
 
R
K
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
L
W
 
K
V
 
I
I
 
A
T
 
V
G
 
N
T
 
I
P
 
P
Q
x
S
S
 
F
Y
 
D
E
x
A
I
 
P
Y
 
A
G
 
G
C
 
F
M
 
V
V
 
I
R
 
R
K
 
K
D
 
G
D
 
N
A
 
D
A
 
A
F
 
L
K
 
R
K
 
N
A
 
A
V
 
L
D
 
D
D
 
K
A
 
G
I
 
L
V
 
K
A
 
E
Y
 
A
F
 
M
K
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
W
N
 
K
K
 
K
S
 
L
Y
 
H
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F
-
 
P
M
 
G
Q
 
T
P
 
P
I
 
M
P
 
P

5l9oA Crystal structure of agrobacterium tumefaciens c58 strain pbp soca in complex with glucopine (see paper)
24% identity, 77% coverage: 39:275/306 of query aligns to 11:235/241 of 5l9oA

query
sites
5l9oA
T
 
T
I
 
I
T
 
S
L
 
V
G
 
G
H
 
T
R
 
M
D
 
G
S
 
D
S
 
A
I
 
K
P
 
P
F
 
Y
S
 
A
Y
 
F
L
 
T
A
 
T
G
 
A
K
 
D
P
 
G
E
 
N
P
 
F
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
S
 
D
H
 
I
D
 
E
I
 
L
Q
 
F
L
 
L
A
 
N
V
 
V
V
 
A
D
 
G
A
 
R
L
 
L
-
 
G
-
 
F
K
 
K
K
 
K
Q
 
E
L
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
I
 
-
K
 
Q
V
 
V
R
 
V
Y
 
F
N
 
T
L
 
G
V
 
Q
T
 
E
S
x
F
Q
 
S
T
 
A
R
 
L
I
 
M
P
 
P
L
 
S
V
 
V
Q
 
A
N
 
N
G
 
G
T
 
R
V
 
F
D
 
D
L
 
V
E
 
A
C
 
A
G
x
A
S
x
A
T
 
I
T
x
G
N
 
T
N
 
T
V
 
A
E
 
K
R
|
R
Q
 
K
Q
 
E
Q
 
T
V
 
V
G
 
D
F
 
F
S
 
S
V
 
D
G
 
G
I
 
Y
F
 
L
E
x
A
V
x
G
G
 
F
T
 
L
R
 
S
L
 
V
L
 
L
T
 
T
K
 
S
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
Q
 
E
P
 
A
A
 
G
Y
 
I
K
 
T
D
 
D
F
 
A
P
 
A
D
 
G
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
R
V
 
L
V
 
G
T
 
V
T
 
V
A
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
L
|
L
K
x
Q
A
 
E
M
 
I
N
 
Y
A
 
A
D
 
E
K
 
K
Q
 
N
M
 
F
K
 
A
-
 
G
M
 
T
N
 
D
V
 
L
I
 
V
S
 
K
A
 
F
K
 
P
D
 
D
H
 
N
G
 
N
E
 
S
A
 
A
F
 
V
N
 
S
M
 
A
L
 
L
E
 
N
S
 
N
G
 
G
R
 
T
A
 
V
V
 
D
A
 
A
F
 
H
M
 
F
M
 
L
D
|
D
D
 
-
A
 
-
L
 
F
L
 
E
A
 
A
G
 
A
E
 
K
M
 
D
A
 
Y
K
 
S
A
 
A
R
 
R
K
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
L
W
 
K
V
 
I
I
 
A
T
 
V
G
 
N
T
 
I
P
 
P
Q
x
S
S
 
F
Y
 
D
E
x
A
I
 
P
Y
 
A
G
 
G
C
 
F
M
 
V
V
 
I
R
 
R
K
 
K
D
 
G
D
 
N
A
 
D
A
 
A
F
 
L
K
 
R
K
 
N
A
 
A
V
 
L
D
 
D
D
 
K
A
 
G
I
 
L
V
 
K
A
 
E
Y
 
A
F
 
M
K
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
W
N
 
K
K
 
K
S
 
L
Y
 
H
E
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F
-
 
P
M
 
G
Q
 
T
P
 
P
I
 
M
P
 
P

Query Sequence

>PP_1071 FitnessBrowser__Putida:PP_1071
MMRIVRQLLGAAIAAAVIASPAMAEELTGTLKKIKESGTITLGHRDSSIPFSYLAGKPEP
VGYSHDIQLAVVDALKKQLGTDIKVRYNLVTSQTRIPLVQNGTVDLECGSTTNNVERQQQ
VGFSVGIFEVGTRLLTKVKDGQPAYKDFPDLAGKNVVTTAGTTSERILKAMNADKQMKMN
VISAKDHGEAFNMLESGRAVAFMMDDALLAGEMAKARKPADWVITGTPQSYEIYGCMVRK
DDAAFKKAVDDAIVAYFKSGEVNKSYEKWFMQPIPPKGLNLNFQMSEELKKLIAEPTDKA
ADEKKS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory