SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_1256 FitnessBrowser__Putida:PP_1256 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1eyyA Crystal structure of the NADP+ dependent aldehyde dehydrogenase from vibrio harveyi. (see paper)
49% identity, 96% coverage: 19:522/525 of query aligns to 3:502/504 of 1eyyA

query
sites
1eyyA
D
 
N
A
 
V
I
 
F
R
 
Y
A
 
A
I
 
T
D
 
N
P
 
A
T
 
F
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
T
 
A
L
 
L
E
 
P
P
 
L
A
 
A
Y
 
F
L
 
P
G
 
V
G
 
H
T
 
T
G
 
E
E
 
V
H
 
E
V
 
V
A
 
N
Q
 
Q
A
 
A
C
 
A
A
 
T
L
 
A
A
 
A
W
 
A
A
 
K
A
 
V
F
 
A
D
 
R
A
 
D
Y
 
F
R
 
R
E
 
R
T
 
L
S
 
N
L
 
N
E
 
S
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
E
 
S
F
 
L
L
 
L
E
 
R
A
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
S
Q
 
E
I
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
R
G
 
S
D
 
D
A
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
H
I
 
L
E
 
E
T
 
T
G
 
A
L
 
L
P
 
P
K
 
E
A
 
V
R
 
R
I
 
L
Q
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
I
G
 
A
R
 
R
T
 
T
C
 
A
T
 
N
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
T
 
L
F
 
F
A
 
A
R
 
D
T
 
V
V
 
V
R
 
N
A
 
S
G
 
G
E
 
S
W
 
Y
L
 
H
D
 
Q
V
 
A
R
 
I
I
 
L
D
 
D
S
 
T
A
 
P
L
 
N
P
 
P
E
 
T
R
 
R
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
K
A
 
P
D
 
D
L
 
I
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
Q
 
Q
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
A
S
|
S
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
S
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
T
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
V
K
|
K
A
 
G
H
|
H
S
x
T
A
 
A
H
 
H
P
 
P
G
 
G
T
 
T
S
 
S
E
 
Q
L
 
I
V
 
V
G
 
A
Q
 
E
A
 
C
V
 
I
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
K
 
K
Q
 
Q
C
 
E
G
 
Q
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
V
 
I
F
 
F
S
 
T
L
 
L
L
 
L
Y
 
Q
G
 
G
S
 
N
G
 
Q
R
|
R
E
 
A
V
 
L
G
 
G
I
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
G
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
R
 
V
S
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
F
Q
 
N
A
 
L
A
 
A
Q
 
H
A
 
E
R
 
R
P
 
P
E
 
E
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
F
Y
 
Y
A
 
G
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
A
I
 
I
N
 
N
P
 
P
V
 
T
F
 
F
L
 
I
F
 
F
D
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
Q
 
R
A
 
A
R
 
K
A
 
A
E
 
D
A
 
-
L
 
L
A
 
A
Q
 
D
G
 
Q
F
 
F
V
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
M
T
 
T
Q
 
M
G
 
G
A
 
C
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
C
|
C
T
 
T
N
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
V
V
 
V
I
 
F
A
 
A
R
 
L
Q
 
N
G
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
T
Q
 
Q
R
 
A
F
 
F
I
 
I
T
 
E
A
 
T
A
 
A
A
 
Q
G
 
S
Y
 
L
V
 
I
Q
 
R
Q
 
Q
G
 
Q
A
 
S
A
 
P
Q
 
S
T
 
T
M
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
I
F
 
R
S
 
D
A
 
S
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
G
 
Q
I
 
V
A
 
V
A
 
S
L
 
R
A
 
G
D
 
S
N
 
D
P
 
D
H
 
G
A
 
I
Q
 
D
A
 
V
I
 
T
T
 
F
S
 
S
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
Q
G
 
A
P
 
E
N
 
S
Q
 
P
C
 
C
Q
 
V
A
 
A
Q
 
S
-
 
A
L
 
L
F
 
F
V
 
V
T
 
T
Q
 
S
A
 
S
E
 
E
A
 
N
F
 
W
L
 
R
A
 
K
D
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
W
Q
 
E
A
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
A
 
P
A
 
Q
S
 
S
L
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
V
C
 
C
T
 
E
D
 
N
D
 
V
E
 
A
Q
 
D
V
 
M
R
 
L
Q
 
S
V
 
L
A
 
S
E
 
E
H
 
M
L
 
L
E
 
A
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
T
 
T
L
 
I
Q
 
H
L
 
A
D
 
T
E
 
E
A
 
E
D
 
D
I
 
Y
D
 
P
S
 
Q
A
 
V
R
 
S
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
P
 
P
T
 
R
L
 
L
E
 
E
R
 
E
K
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
L
 
V
V
 
F
N
 
N
G
 
G
W
 
W
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
E
V
 
V
C
 
G
D
 
Y
A
 
A
M
 
M
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
A
 
A
T
 
S
S
 
T
D
 
H
A
 
S
R
 
A
T
 
S
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
I
L
 
H
R
 
R
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
V
 
V
C
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
D
 
A
V
 
L
P
 
P
D
 
E
A
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
Q
 
D
A
 
S
L
 
L
K
 
K
H
 
A
G
 
E
N
 
N
P
 
P
L
 
L
Q
 
E
L
 
I
R
 
A
R
 
R
L
 
A
L
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
K

5u0mA Fatty aldehyde dehydrogenase from marinobacter aquaeolei vt8 and cofactor complex (see paper)
29% identity, 61% coverage: 3:320/525 of query aligns to 2:298/488 of 5u0mA

query
sites
5u0mA
L
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
V
L
 
Y
I
 
I
G
 
D
Q
 
G
R
 
L
P
 
W
V
 
L
T
 
P
G
 
G
S
 
H
R
 
G
D
 
A
A
 
P
I
 
F
R
 
E
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
P
 
P
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
V
E
 
W
P
 
D
A
 
G
Y
 
N
L
 
-
G
 
A
G
 
A
T
 
S
G
 
L
E
 
E
H
 
D
V
 
V
A
 
D
Q
 
A
A
 
A
C
 
V
A
 
R
L
 
E
A
 
A
W
 
R
A
 
K
A
 
A
F
 
F
D
 
L
A
 
A
Y
 
W
R
 
R
E
 
R
T
 
K
S
 
S
L
 
L
E
 
A
Q
 
E
R
 
R
A
 
Q
E
 
A
F
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
F
A
 
G
T
 
E
Q
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
N
G
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
H
R
 
Q
A
 
I
V
 
G
I
 
L
E
 
E
T
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
L
Q
 
W
G
 
E
E
 
S
R
 
R
G
 
T
R
 
E
T
 
V
C
 
A
T
 
A
Q
 
M
L
 
M
R
 
G
T
 
K
F
 
I
A
 
P
R
 
I
T
 
S
V
 
V
R
 
K
A
 
A
G
 
Y
E
 
N
W
 
E
L
 
R
D
 
T
V
 
G
R
 
H
I
 
T
D
 
E
S
 
S
A
 
D
L
 
V
P
 
A
E
 
G
R
 
G
Q
 
H
P
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
A
D
 
V
L
 
L
R
 
R
Q
 
H
R
 
R
Q
 
-
V
 
-
A
 
P
L
 
H
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
|
F
G
 
G
A
 
P
S
x
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
-
A
 
-
F
 
G
S
 
H
V
 
L
A
 
P
G
 
N
G
 
G
D
 
H
T
 
I
A
 
V
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
F
K
|
K
A
 
P
H
x
S
S
x
E
A
 
L
H
 
T
P
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
T
A
 
V
Q
 
R
A
 
L
V
 
W
K
 
E
Q
 
K
C
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
I
S
 
N
L
 
L
L
 
V
Y
 
Q
G
 
G
S
 
-
G
 
G
R
 
S
E
 
D
V
 
T
G
|
G
I
 
K
A
 
C
L
 
L
V
 
A
S
 
R
D
 
H
P
 
S
R
 
L
I
 
I
K
 
D
A
 
G
V
 
L
G
 
F
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
R
 
S
S
 
T
G
x
V
G
 
G
M
 
H
A
 
L
L
 
L
C
 
H
Q
 
E
A
 
Q
A
 
F
Q
 
G
A
 
G
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
P
 
K
I
 
I
P
 
-
V
 
L
Y
 
A
A
 
L
E
|
E
M
|
M
S
x
G
S
 
G
I
 
N
N
 
N
P
 
P
V
 
L
F
 
I
L
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
D
F
 
L
D
 
D
A
 
G
A
 
A
L
 
V
Q
 
H
A
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
Q
 
S
G
 
A
F
 
F
V
 
L
A
 
S
S
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
R
C
|
C
T
 
T
N
 
C
P
 
A
G
 
R
L
 
R
V
 
L
I
 
L
A
 
V
R
 
P
Q
 
K
G
 
G
P
 
K
A
 
K
L
 
G
Q
 
D
R
 
E
F
 
F
I
 
L

Sites not aligning to the query:

5u0lA X-ray crystal structure of fatty aldehyde dehydrogenase enzymes from marinobacter aquaeolei vt8 complexed with a substrate (see paper)
29% identity, 61% coverage: 3:320/525 of query aligns to 2:298/488 of 5u0lA

query
sites
5u0lA
L
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
V
L
 
Y
I
 
I
G
 
D
Q
 
G
R
 
L
P
 
W
V
 
L
T
 
P
G
 
G
S
 
H
R
 
G
D
 
A
A
 
P
I
 
F
R
 
E
A
 
S
I
 
V
D
 
Q
P
 
P
T
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
T
 
T
L
 
V
E
 
W
P
 
D
A
 
G
Y
 
N
L
 
-
G
 
A
G
 
A
T
 
S
G
 
L
E
 
E
H
 
D
V
 
V
A
 
D
Q
 
A
A
 
A
C
 
V
A
 
R
L
 
E
A
 
A
W
 
R
A
 
K
A
 
A
F
 
F
D
 
L
A
 
A
Y
 
W
R
 
R
E
 
R
T
 
K
S
 
S
L
 
L
E
 
A
Q
 
E
R
 
R
A
 
Q
E
 
A
F
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
F
A
 
G
T
 
E
Q
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
N
G
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
H
R
 
Q
A
 
I
V
 
G
I
 
L
E
 
E
T
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
L
Q
 
W
G
 
E
E
 
S
R
 
R
G
 
T
R
 
E
T
 
V
C
 
A
T
 
A
Q
 
M
L
 
M
R
 
G
T
x
K
F
 
I
A
 
P
R
 
I
T
 
S
V
 
V
R
 
K
A
 
A
G
 
Y
E
 
N
W
 
E
L
 
R
D
 
T
V
 
G
R
 
H
I
 
T
D
 
E
S
 
S
A
 
D
L
 
V
P
 
A
E
 
G
R
 
G
Q
 
H
P
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
A
D
 
V
L
 
L
R
 
R
Q
 
H
R
 
R
Q
 
-
V
 
-
A
 
P
L
 
H
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
S
 
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
-
A
 
-
F
 
G
S
x
H
V
x
L
A
 
P
G
 
N
G
|
G
D
x
H
T
 
I
A
 
V
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
F
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
A
 
L
H
 
T
P
 
P
G
 
G
T
 
V
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
T
A
 
V
Q
 
R
A
 
L
V
 
W
K
 
E
Q
 
K
C
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
I
S
 
N
L
 
L
L
 
V
Y
 
Q
G
 
G
S
 
-
G
 
G
R
 
S
E
 
D
V
 
T
G
 
G
I
 
K
A
 
C
L
 
L
V
 
A
S
 
R
D
 
H
P
 
S
R
 
L
I
 
I
K
 
D
A
 
G
V
 
L
G
 
F
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
R
 
S
S
 
T
G
 
V
G
 
G
M
 
H
A
 
L
L
 
L
C
 
H
Q
 
E
A
 
Q
A
 
F
Q
 
G
A
 
G
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
P
 
K
I
 
I
P
 
-
V
 
L
Y
 
A
A
 
L
E
|
E
M
 
M
S
 
G
S
 
G
I
 
N
N
 
N
P
 
P
V
 
L
F
 
I
L
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
D
F
 
L
D
 
D
A
 
G
A
 
A
L
 
V
Q
 
H
A
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
Q
 
S
G
 
A
F
 
F
V
 
L
A
 
S
S
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
R
C
|
C
T
 
T
N
 
C
P
 
A
G
 
R
L
 
R
V
 
L
I
 
L
A
 
V
R
 
P
Q
 
K
G
 
G
P
 
K
A
 
K
L
 
G
Q
 
D
R
 
E
F
 
F
I
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9HTJ1 NAD/NADP-dependent betaine aldehyde dehydrogenase; BADH; EC 1.2.1.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 2 papers)
28% identity, 81% coverage: 6:431/525 of query aligns to 8:402/490 of Q9HTJ1

query
sites
Q9HTJ1
N
 
K
L
 
L
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
Q
 
G
R
 
R
P
 
Y
V
 
V
T
 
E
G
 
A
S
 
S
R
 
S
D
 
G
A
 
A
-
 
T
I
 
F
R
 
E
A
 
T
I
 
I
D
 
N
P
 
P
T
 
A
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
A
P
 
K
A
 
V
Y
 
Q
L
 
R
G
 
A
G
 
-
T
 
S
G
 
R
E
 
E
H
 
D
V
 
V
A
 
E
Q
 
R
A
 
A
C
 
V
A
 
Q
L
 
S
A
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
W
 
W
A
 
A
A
 
A
F
 
M
D
 
T
A
 
A
Y
 
M
R
 
-
E
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
E
 
R
F
 
I
L
 
L
E
 
R
A
 
R
I
 
A
A
 
V
T
 
D
Q
 
I
I
 
L
E
 
R
A
 
E
L
 
R
G
 
N
D
 
D
A
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
A
R
 
L
A
 
E
V
 
T
I
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
A
R
 
E
I
 
T
Q
 
R
G
 
S
E
 
V
R
 
D
G
 
I
R
 
V
T
 
T
C
 
G
T
 
A
Q
 
D
-
 
V
L
 
L
R
 
E
T
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
G
T
 
L
V
 
V
R
 
P
A
 
A
G
 
I
E
 
E
W
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
G
E
 
E
R
 
Q
Q
 
I
P
 
P
L
 
L
P
 
R
R
 
E
A
 
T
D
 
S
-
 
F
L
 
V
R
 
Y
Q
 
T
R
 
R
Q
 
R
V
 
E
A
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
G
F
 
I
G
|
G
A
|
A
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
V
A
 
-
F
 
-
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
G
 
L
G
 
W
D
x
K
T
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
A
V
 
M
V
 
I
V
 
F
K
|
K
A
x
P
H
x
S
S
x
E
A
 
V
H
 
T
P
 
P
G
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
L
V
 
T
G
 
A
Q
 
L
A
 
K
V
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
I
V
 
Y
K
 
T
Q
 
E
C
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
E
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
G
|
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
I
 
Q
A
 
W
L
 
L
V
 
T
S
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
K
V
 
I
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
x
G
R
x
T
S
|
S
G
x
T
G
 
G
M
 
K
A
 
K
L
 
V
C
 
M
Q
 
A
A
 
S
A
 
A
Q
 
S
A
 
S
R
 
S
P
 
S
E
 
L
P
 
K
I
 
-
P
 
E
V
 
V
Y
 
T
A
 
M
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
L
F
 
I
L
 
I
F
 
F
-
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
D
L
 
L
Q
 
D
A
 
R
R
 
A
A
 
A
E
 
D
-
 
I
A
 
A
L
 
V
A
 
M
Q
 
A
G
 
N
F
 
F
V
 
F
A
 
S
S
 
S
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
N
P
 
G
G
 
T
L
 
R
V
 
V
-
 
F
I
 
I
A
 
H
R
 
R
Q
 
S
G
 
Q
P
 
Q
A
 
A
L
 
-
Q
 
-
R
 
R
F
 
F
I
 
E
T
 
A
A
 
K
A
 
V
A
 
L
G
 
E
Y
 
R
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
R
G
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
M
 
-
L
 
I
T
 
R
P
 
L
G
 
G
I
 
D
F
 
P
S
 
Q
A
 
D
Y
 
E
Q
 
N
A
 
T
G
 
N
I
 
F
A
 
G
A
 
P
L
 
L
A
 
V
D
 
S
N
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
M
Q
 
E
A
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
I
 
I
T
 
E
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
G
 
Q
Q
 
K
G
 
A
P
 
R
N
 
L
Q
 
L
C
 
C
Q
 
G
A
 
G
Q
 
E
L
 
R
F
 
-
V
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
V
A
 
T
D
 
D
P
 
G
A
 
A
L
 
F
Q
 
G
A
 
K
E
 
G
V
 
A
F
 
Y
G
 
V
A
 
A
A
 
P
S
 
T
L
 
V
V
 
F
V
 
T
A
 
D
C
 
C
T
 
R
D
 
D
D
 
D
E
 
M
Q
 
T
V
 
I
R
 
-
Q
 
-
V
 
V
A
 
R
E
 
E
H
x
E
L
 
I
E
 
F
G
 
G
Q
 
P
L
 
V
T
 
M
A
 
S
T
 
I
L
 
L
Q
 
V
L
 
Y
D
 
D
E
 
D
A
 
E
D
 
D

Sites not aligning to the query:

5ek6A Thermostable aldehyde dehydrogenase from pyrobaculum sp. 1860 complexed with NADP and isobutyraldehyde (see paper)
26% identity, 82% coverage: 2:431/525 of query aligns to 12:412/482 of 5ek6A

query
sites
5ek6A
P
 
P
L
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
F
L
 
Q
I
 
V
G
 
K
Q
 
T
R
 
S
P
 
P
V
 
V
T
 
D
G
 
G
S
 
S
R
 
K
D
 
I
A
 
A
I
 
E
R
 
V
A
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
P
T
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
R
T
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
E
H
 
D
V
 
A
A
 
R
Q
 
E
A
 
A
C
 
I
A
 
D
L
 
S
A
 
A
W
 
F
A
 
E
A
 
A
F
 
L
D
 
K
A
 
A
Y
 
W
R
 
A
E
 
N
T
 
I
S
 
P
L
 
A
E
 
I
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
E
 
E
F
 
Y
L
 
L
E
 
Y
A
 
K
I
 
M
A
 
L
T
 
E
Q
 
V
I
 
F
E
 
R
A
 
Q
L
 
M
G
 
K
D
 
E
A
 
D
L
 
F
I
 
M
D
 
K
R
 
I
A
 
L
V
 
T
I
 
V
E
 
E
T
 
G
G
 
G
L
 
G
P
 
T
K
 
Y
A
 
R
R
 
K
I
 
V
Q
 
W
G
 
G
E
 
E
R
 
V
G
 
V
R
 
F
T
 
T
C
 
E
T
 
R
Q
 
L
L
 
I
R
 
Q
T
 
N
F
 
A
A
 
A
R
 
E
T
 
L
V
 
A
R
 
R
A
 
H
G
 
Y
E
 
Q
W
 
G
L
 
R
D
 
V
V
 
L
R
 
Q
I
 
S
D
 
D
S
 
S
A
 
E
L
 
S
P
 
T
E
 
I
R
 
S
Q
 
V
P
 
V
L
 
F
P
 
K
R
 
R
A
 
S
D
 
K
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
V
F
x
I
G
x
T
A
 
P
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
S
F
x
I
S
 
S
V
 
M
A
x
K
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
I
A
 
A
S
 
H
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
V
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
Y
K
|
K
A
 
P
H
x
A
S
|
S
A
 
D
H
 
T
P
 
P
G
 
V
T
 
T
S
 
G
E
 
W
L
 
L
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
A
 
M
V
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
C
 
-
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
L
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
S
x
P
G
|
G
R
 
P
E
 
V
V
 
V
G
|
G
I
 
E
A
 
E
L
 
I
V
 
V
S
 
T
D
 
H
P
 
K
R
 
R
I
 
V
K
 
A
A
 
H
V
 
V
G
 
T
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
x
E
R
 
S
S
 
S
G
x
T
G
 
G
M
 
R
A
 
E
L
x
I
C
 
-
Q
 
-
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
R
 
A
P
 
G
E
 
T
P
 
L
I
 
K
P
 
T
V
 
V
Y
 
T
A
 
L
E
|
E
M
x
L
S
 
G
S
 
G
I
 
S
N
 
D
P
 
P
V
 
L
F
 
I
L
 
I
F
 
L
D
 
D
A
 
D
A
 
V
L
 
D
Q
 
V
A
 
D
R
 
Y
A
 
A
E
 
A
A
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
F
 
V
V
 
F
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
F
Q
 
H
G
 
-
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
F
 
I
C
|
C
T
 
T
N
 
S
P
 
A
G
 
K
L
 
R
V
 
I
I
 
I
A
 
V
R
 
H
Q
 
K
G
 
A
P
 
V
A
 
A
L
 
-
Q
 
D
R
 
K
F
 
F
I
 
I
T
 
E
A
 
R
A
 
Y
A
 
V
G
 
H
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
K
-
 
M
-
 
L
-
 
R
-
 
I
-
 
D
-
 
D
-
 
P
Q
 
R
G
 
K
A
 
D
A
 
E
Q
 
K
T
 
V
M
 
D
L
 
L
T
 
G
P
 
P
G
 
L
I
 
I
F
 
N
S
 
E
A
 
R
Y
 
Q
Q
 
V
A
 
A
G
 
L
I
 
M
A
 
K
A
 
E
L
 
F
A
 
V
D
 
D
N
 
D
P
 
A
H
 
V
A
 
S
Q
 
R
A
 
G
-
 
G
-
 
R
I
 
L
T
 
L
S
 
I
G
 
G
Q
 
G
A
 
R
G
 
S
Q
 
W
G
 
G
P
 
-
N
 
N
Q
 
F
C
 
F
Q
 
E
A
 
P
Q
 
A
L
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
D
Q
 
V
A
 
D
E
 
R
A
 
N
F
 
F
L
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
R
A
 
I
L
 
M
Q
 
R
A
 
E
E
|
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
A
 
V
S
 
R
L
 
P
V
 
I
V
 
V
A
 
V
C
 
V
T
 
E
D
 
N
D
 
D
E
 
D
Q
 
Q
V
 
A
R
 
V
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
N
H
 
D
L
 
T
E
 
D
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
S
A
 
G
T
 
A
L
 
V
Q
 
L
L
 
T
D
 
N
E
 
N
A
 
V
D
 
N

Sites not aligning to the query:

4h73A Thermostable aldehyde dehydrogenase from pyrobaculum sp. Complexed with NADP+
26% identity, 82% coverage: 2:431/525 of query aligns to 12:412/482 of 4h73A

query
sites
4h73A
P
 
P
L
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
F
L
 
Q
I
 
V
G
 
K
Q
 
T
R
 
S
P
 
P
V
 
V
T
 
D
G
 
G
S
 
S
R
 
K
D
 
I
A
 
A
I
 
E
R
 
V
A
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
P
T
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
R
T
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
E
H
 
D
V
 
A
A
 
R
Q
 
E
A
 
A
C
 
I
A
 
D
L
 
S
A
 
A
W
 
F
A
 
E
A
 
A
F
 
L
D
 
K
A
 
A
Y
 
W
R
 
A
E
 
N
T
 
I
S
 
P
L
 
A
E
 
I
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
E
 
E
F
 
Y
L
 
L
E
 
Y
A
 
K
I
 
M
A
 
L
T
 
E
Q
 
V
I
 
F
E
 
R
A
 
Q
L
 
M
G
 
K
D
 
E
A
 
D
L
 
F
I
 
M
D
 
K
R
 
I
A
 
L
V
 
T
I
 
V
E
 
E
T
 
G
G
 
G
L
 
G
P
 
T
K
 
Y
A
 
R
R
 
K
I
 
V
Q
 
W
G
 
G
E
 
E
R
 
V
G
 
V
R
 
F
T
 
T
C
 
E
T
 
R
Q
 
L
L
 
I
R
 
Q
T
 
N
F
 
A
A
 
A
R
 
E
T
 
L
V
 
A
R
 
R
A
 
H
G
 
Y
E
 
Q
W
 
G
L
 
R
D
 
V
V
 
L
R
 
Q
I
 
S
D
 
D
S
 
S
A
 
E
L
 
S
P
 
T
E
 
I
R
 
S
Q
 
V
P
 
V
L
 
F
P
 
K
R
 
R
A
 
S
D
 
K
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
V
F
x
I
G
x
T
A
x
P
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
S
F
 
I
S
 
S
V
 
M
A
 
K
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
I
A
 
A
S
 
H
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
V
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
Y
K
|
K
A
 
P
H
x
A
S
|
S
A
 
D
H
 
T
P
 
P
G
 
V
T
 
T
S
 
G
E
 
W
L
 
L
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
A
 
M
V
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
C
 
-
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
L
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
S
 
P
G
|
G
R
 
P
E
 
V
V
 
V
G
|
G
I
 
E
A
 
E
L
 
I
V
 
V
S
 
T
D
 
H
P
 
K
R
 
R
I
 
V
K
 
A
A
 
H
V
 
V
G
 
T
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
x
E
R
 
S
S
 
S
G
x
T
G
 
G
M
 
R
A
 
E
L
 
I
C
 
-
Q
 
-
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
R
 
A
P
 
G
E
 
T
P
 
L
I
 
K
P
 
T
V
 
V
Y
 
T
A
 
L
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
S
N
 
D
P
 
P
V
 
L
F
 
I
L
 
I
F
 
L
D
 
D
A
 
D
A
 
V
L
 
D
Q
 
V
A
 
D
R
 
Y
A
 
A
E
 
A
A
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
F
 
V
V
 
F
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
F
Q
 
H
G
 
-
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
F
 
I
C
|
C
T
 
T
N
 
S
P
 
A
G
 
K
L
 
R
V
 
I
I
 
I
A
 
V
R
 
H
Q
 
K
G
 
A
P
 
V
A
 
A
L
 
-
Q
 
D
R
 
K
F
 
F
I
 
I
T
 
E
A
 
R
A
 
Y
A
 
V
G
 
H
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
K
-
 
M
-
 
L
-
 
R
-
 
I
-
 
D
-
 
D
-
 
P
Q
 
R
G
 
K
A
 
D
A
 
E
Q
 
K
T
 
V
M
 
D
L
 
L
T
 
G
P
 
P
G
 
L
I
 
I
F
 
N
S
 
E
A
 
R
Y
 
Q
Q
 
V
A
 
A
G
 
L
I
 
M
A
 
K
A
 
E
L
 
F
A
 
V
D
 
D
N
 
D
P
 
A
H
 
V
A
 
S
Q
 
R
A
 
G
-
 
G
-
 
R
I
 
L
T
 
L
S
 
I
G
 
G
Q
 
G
A
 
R
G
 
S
Q
 
W
G
 
G
P
 
-
N
 
N
Q
 
F
C
 
F
Q
 
E
A
 
P
Q
 
A
L
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
D
Q
 
V
A
 
D
E
 
R
A
 
N
F
 
F
L
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
R
A
 
I
L
 
M
Q
 
R
A
 
E
E
|
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
A
 
V
S
 
R
L
 
P
V
 
I
V
 
V
A
 
V
C
 
V
T
 
E
D
 
N
D
 
D
E
 
D
Q
 
Q
V
 
A
R
 
V
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
N
H
 
D
L
 
T
E
 
D
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
S
A
 
G
T
 
A
L
 
V
Q
 
L
L
 
T
D
 
N
E
 
N
A
 
V
D
 
N

Sites not aligning to the query:

4cazA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa in complex with nadh
28% identity, 81% coverage: 6:431/525 of query aligns to 7:401/489 of 4cazA

query
sites
4cazA
N
 
K
L
 
L
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
Q
 
G
R
 
R
P
 
Y
V
 
V
T
 
E
G
 
A
S
 
S
R
 
S
D
 
G
A
 
A
-
 
T
I
 
F
R
 
E
A
 
T
I
 
I
D
 
N
P
 
P
T
 
A
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
A
P
 
K
A
 
V
Y
 
Q
L
 
R
G
 
A
G
 
-
T
 
S
G
 
R
E
 
E
H
 
D
V
 
V
A
 
E
Q
 
R
A
 
A
C
 
V
A
 
Q
L
 
S
A
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
W
 
W
A
 
A
A
 
A
F
 
M
D
 
T
A
 
A
Y
 
M
R
 
-
E
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
E
 
R
F
 
I
L
 
L
E
 
R
A
 
R
I
 
A
A
 
V
T
 
D
Q
 
I
I
 
L
E
 
R
A
 
E
L
 
R
G
 
N
D
 
D
A
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
A
R
 
L
A
 
E
V
 
T
I
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
A
R
 
E
I
 
T
Q
 
R
G
 
S
E
 
V
R
 
D
G
 
I
R
 
V
T
 
T
C
 
G
T
 
A
Q
 
D
-
 
V
L
 
L
R
 
E
T
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
G
T
 
L
V
 
V
R
 
P
A
 
A
G
 
I
E
 
E
W
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
G
E
 
E
R
 
Q
Q
 
I
P
 
P
L
 
L
P
 
R
R
 
E
A
 
T
D
 
S
-
 
F
L
 
V
R
 
Y
Q
 
T
R
 
R
Q
 
R
V
 
E
A
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
G
F
x
I
G
|
G
A
 
A
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
V
A
 
-
F
 
-
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
G
 
L
G
 
W
D
 
K
T
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
A
V
 
M
V
 
I
V
 
F
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
x
E
A
 
V
H
 
T
P
 
P
G
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
L
V
 
T
G
 
A
Q
 
L
A
 
K
V
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
I
V
 
Y
K
 
T
Q
 
E
C
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
E
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
G
|
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
|
G
I
 
Q
A
 
W
L
 
L
V
 
T
S
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
K
V
 
I
G
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
x
G
R
 
T
S
 
S
G
x
T
G
 
G
M
 
K
A
 
K
L
x
V
C
 
M
Q
 
A
A
 
S
A
 
A
Q
 
S
A
 
S
R
 
S
P
 
S
E
 
L
P
 
K
I
 
-
P
 
E
V
 
V
Y
 
T
A
 
M
E
|
E
M
x
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
L
F
 
I
L
 
I
F
 
F
-
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
D
L
 
L
Q
 
D
A
 
R
R
 
A
A
 
A
E
 
D
-
 
I
A
 
A
L
 
V
A
 
M
Q
 
A
G
 
N
F
 
F
V
 
F
A
 
S
S
 
S
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
N
P
 
G
G
 
T
L
 
R
V
 
V
-
 
F
I
 
I
A
 
H
R
 
R
Q
 
S
G
 
Q
P
 
Q
A
 
A
L
 
-
Q
 
-
R
 
R
F
 
F
I
 
E
T
 
A
A
 
K
A
 
V
A
 
L
G
 
E
Y
 
R
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
R
G
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
M
 
-
L
 
I
T
 
R
P
 
L
G
 
G
I
 
D
F
 
P
S
 
Q
A
 
D
Y
 
E
Q
 
N
A
 
T
G
 
N
I
 
F
A
 
G
A
 
P
L
 
L
A
 
V
D
 
S
N
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
M
Q
 
E
A
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
I
 
I
T
 
E
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
G
 
Q
Q
 
K
G
 
A
P
 
R
N
 
L
Q
 
L
C
 
C
Q
 
G
A
 
G
Q
 
E
L
 
R
F
 
-
V
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
V
A
 
T
D
 
D
P
 
G
A
 
A
L
 
F
Q
 
G
A
 
K
E
 
G
V
 
A
F
 
Y
G
 
V
A
 
A
A
 
P
S
 
T
L
 
V
V
 
F
V
 
T
A
 
D
C
 
C
T
 
R
D
 
D
D
 
D
E
 
M
Q
 
T
V
 
I
R
 
-
Q
 
-
V
 
V
A
 
R
E
 
E
H
x
E
L
 
I
E
x
F
G
 
G
Q
 
P
L
 
V
T
 
M
A
 
S
T
 
I
L
 
L
Q
 
V
L
 
Y
D
 
D
E
 
D
A
 
E
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2woxA Betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa with NAD(p) h-catalytic thiol adduct. (see paper)
28% identity, 81% coverage: 6:431/525 of query aligns to 7:401/489 of 2woxA

query
sites
2woxA
N
 
K
L
 
L
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
Q
 
G
R
 
R
P
 
Y
V
 
V
T
 
E
G
 
A
S
 
S
R
 
S
D
 
G
A
 
A
-
 
T
I
 
F
R
 
E
A
 
T
I
 
I
D
 
N
P
 
P
T
 
A
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
A
P
 
K
A
 
V
Y
 
Q
L
 
R
G
 
A
G
 
-
T
 
S
G
 
R
E
 
E
H
 
D
V
 
V
A
 
E
Q
 
R
A
 
A
C
 
V
A
 
Q
L
 
S
A
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
W
 
W
A
 
A
A
 
A
F
 
M
D
 
T
A
 
A
Y
 
M
R
 
-
E
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
E
 
R
F
 
I
L
 
L
E
 
R
A
 
R
I
 
A
A
 
V
T
 
D
Q
 
I
I
 
L
E
 
R
A
 
E
L
 
R
G
 
N
D
 
D
A
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
A
R
 
L
A
 
E
V
 
T
I
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
A
R
 
E
I
 
T
Q
 
R
G
 
S
E
 
V
R
 
D
G
 
I
R
 
V
T
 
T
C
 
G
T
 
A
Q
 
D
-
 
V
L
 
L
R
 
E
T
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
G
T
 
L
V
 
V
R
 
P
A
 
A
G
 
I
E
 
E
W
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
G
E
 
E
R
 
Q
Q
 
I
P
 
P
L
 
L
P
 
R
R
 
E
A
 
T
D
 
S
-
 
F
L
 
V
R
 
Y
Q
 
T
R
 
R
Q
 
R
V
 
E
A
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
G
F
x
I
G
|
G
A
 
A
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
V
A
 
-
F
 
-
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
G
 
L
G
 
W
D
 
K
T
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
A
V
 
M
V
 
I
V
 
F
K
|
K
A
 
P
H
x
S
S
x
E
A
 
V
H
 
T
P
 
P
G
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
L
V
 
T
G
 
A
Q
 
L
A
 
K
V
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
I
V
 
Y
K
 
T
Q
 
E
C
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
E
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
G
|
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
|
G
I
 
Q
A
 
W
L
 
L
V
 
T
S
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
K
V
 
I
G
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
x
G
R
 
T
S
 
S
G
x
T
G
 
G
M
 
K
A
 
K
L
x
V
C
 
M
Q
 
A
A
 
S
A
 
A
Q
 
S
A
 
S
R
 
S
P
 
S
E
 
L
P
 
K
I
 
-
P
 
E
V
 
V
Y
 
T
A
 
M
E
|
E
M
x
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
L
F
 
I
L
 
I
F
 
F
-
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
D
L
 
L
Q
 
D
A
 
R
R
 
A
A
 
A
E
 
D
-
 
I
A
 
A
L
 
V
A
 
M
Q
 
A
G
 
N
F
 
F
V
 
F
A
 
S
S
 
S
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
N
P
 
G
G
 
T
L
 
R
V
 
V
-
 
F
I
 
I
A
 
H
R
 
R
Q
 
S
G
 
Q
P
 
Q
A
 
A
L
 
-
Q
 
-
R
 
R
F
 
F
I
 
E
T
 
A
A
 
K
A
 
V
A
 
L
G
 
E
Y
 
R
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
R
G
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
M
 
-
L
 
I
T
 
R
P
 
L
G
 
G
I
 
D
F
 
P
S
 
Q
A
 
D
Y
 
E
Q
 
N
A
 
T
G
 
N
I
 
F
A
 
G
A
 
P
L
 
L
A
 
V
D
 
S
N
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
M
Q
 
E
A
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
I
 
I
T
 
E
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
G
 
Q
Q
 
K
G
 
A
P
 
R
N
 
L
Q
 
L
C
 
C
Q
 
G
A
 
G
Q
 
E
L
 
R
F
 
-
V
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
V
A
 
T
D
 
D
P
 
G
A
 
A
L
 
F
Q
 
G
A
 
K
E
 
G
V
 
A
F
 
Y
G
 
V
A
 
A
A
 
P
S
 
T
L
 
V
V
 
F
V
 
T
A
 
D
C
 
C
T
 
R
D
 
D
D
 
D
E
 
M
Q
 
T
V
 
I
R
 
-
Q
 
-
V
 
V
A
 
R
E
 
E
H
x
E
L
 
I
E
x
F
G
 
G
Q
 
P
L
 
V
T
 
M
A
 
S
T
 
I
L
 
L
Q
 
V
L
 
Y
D
 
D
E
 
D
A
 
E
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2wmeA Crystallographic structure of betaine aldehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa (see paper)
28% identity, 81% coverage: 6:431/525 of query aligns to 7:401/489 of 2wmeA

query
sites
2wmeA
N
 
K
L
 
L
L
 
Y
I
 
I
G
 
G
Q
 
G
R
 
R
P
 
Y
V
 
V
T
 
E
G
 
A
S
 
S
R
 
S
D
 
G
A
 
A
-
 
T
I
 
F
R
 
E
A
 
T
I
 
I
D
 
N
P
 
P
T
 
A
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
A
P
 
K
A
 
V
Y
 
Q
L
 
R
G
 
A
G
 
-
T
 
S
G
 
R
E
 
E
H
 
D
V
 
V
A
 
E
Q
 
R
A
 
A
C
 
V
A
 
Q
L
 
S
A
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
V
W
 
W
A
 
A
A
 
A
F
 
M
D
 
T
A
 
A
Y
 
M
R
 
-
E
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
E
 
R
F
 
I
L
 
L
E
 
R
A
 
R
I
 
A
A
 
V
T
 
D
Q
 
I
I
 
L
E
 
R
A
 
E
L
 
R
G
 
N
D
 
D
A
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
A
R
 
L
A
 
E
V
 
T
I
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
A
R
 
E
I
 
T
Q
 
R
G
 
S
E
 
V
R
 
D
G
 
I
R
 
V
T
 
T
C
 
G
T
 
A
Q
 
D
-
 
V
L
 
L
R
 
E
T
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
G
T
 
L
V
 
V
R
 
P
A
 
A
G
 
I
E
 
E
W
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
G
E
 
E
R
 
Q
Q
 
I
P
 
P
L
 
L
P
 
R
R
 
E
A
 
T
D
 
S
-
 
F
L
 
V
R
 
Y
Q
 
T
R
 
R
Q
 
R
V
 
E
A
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
G
F
 
I
G
|
G
A
 
A
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
V
A
 
-
F
 
-
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
G
 
L
G
 
W
D
 
K
T
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
A
V
 
M
V
 
I
V
 
F
K
|
K
A
 
P
H
x
S
S
x
E
A
 
V
H
 
T
P
 
P
G
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
L
V
 
T
G
 
A
Q
 
L
A
 
K
V
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
I
V
 
Y
K
 
T
Q
 
E
C
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
E
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
V
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
G
|
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
|
G
I
 
Q
A
 
W
L
 
L
V
 
T
S
 
E
D
 
H
P
 
P
R
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
K
V
 
I
G
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
R
 
T
S
 
S
G
x
T
G
 
G
M
 
K
A
 
K
L
x
V
C
 
M
Q
 
A
A
 
S
A
 
A
Q
 
S
A
 
S
R
 
S
P
 
S
E
 
L
P
 
K
I
 
-
P
 
E
V
 
V
Y
 
T
A
 
M
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
L
F
 
I
L
 
I
F
 
F
-
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
D
L
 
L
Q
 
D
A
 
R
R
 
A
A
 
A
E
 
D
-
 
I
A
 
A
L
 
V
A
 
M
Q
 
A
G
 
N
F
 
F
V
 
F
A
 
S
S
 
S
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
N
P
 
G
G
 
T
L
 
R
V
 
V
-
 
F
I
 
I
A
 
H
R
 
R
Q
 
S
G
 
Q
P
 
Q
A
 
A
L
 
-
Q
 
-
R
 
R
F
 
F
I
 
E
T
 
A
A
 
K
A
 
V
A
 
L
G
 
E
Y
 
R
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
R
G
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
M
 
-
L
 
I
T
 
R
P
 
L
G
 
G
I
 
D
F
 
P
S
 
Q
A
 
D
Y
 
E
Q
 
N
A
 
T
G
 
N
I
 
F
A
 
G
A
 
P
L
 
L
A
 
V
D
 
S
N
 
F
P
 
P
H
 
H
A
 
M
Q
 
E
A
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
I
 
I
T
 
E
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
G
 
Q
Q
 
K
G
 
A
P
 
R
N
 
L
Q
 
L
C
 
C
Q
 
G
A
 
G
Q
 
E
L
 
R
F
 
-
V
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
V
A
 
T
D
 
D
P
 
G
A
 
A
L
 
F
Q
 
G
A
 
K
E
 
G
V
 
A
F
 
Y
G
 
V
A
 
A
A
 
P
S
 
T
L
 
V
V
 
F
V
 
T
A
 
D
C
 
C
T
 
R
D
 
D
D
 
D
E
 
M
Q
 
T
V
 
I
R
 
-
Q
 
-
V
 
V
A
 
R
E
 
E
H
x
E
L
 
I
E
 
F
G
 
G
Q
 
P
L
 
V
T
 
M
A
 
S
T
 
I
L
 
L
Q
 
V
L
 
Y
D
 
D
E
 
D
A
 
E
D
 
D

Sites not aligning to the query:

5ekcE Thermostable aldehyde dehydrogenase from pyrobaculum sp.1860 complexed with NADP+
26% identity, 82% coverage: 2:431/525 of query aligns to 19:419/490 of 5ekcE

query
sites
5ekcE
P
 
P
L
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
F
L
 
Q
I
 
V
G
 
K
Q
 
T
R
 
S
P
 
P
V
 
V
T
 
D
G
 
G
S
 
S
R
 
K
D
 
I
A
 
A
I
 
E
R
 
V
A
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
P
T
 
R
T
 
S
G
 
G
Q
 
R
T
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
E
H
 
D
V
 
A
A
 
R
Q
 
E
A
 
A
C
 
I
A
 
D
L
 
S
A
 
A
W
 
F
A
 
E
A
 
A
F
 
L
D
 
K
A
 
A
Y
 
W
R
 
A
E
 
N
T
 
I
S
 
P
L
 
A
E
 
I
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
E
 
E
F
 
Y
L
 
L
E
 
Y
A
 
K
I
 
M
A
 
L
T
 
E
Q
 
V
I
 
F
E
 
R
A
 
Q
L
 
M
G
 
K
D
 
E
A
 
D
L
 
F
I
 
M
D
 
K
R
 
I
A
 
L
V
 
T
I
 
V
E
 
E
T
 
G
G
 
G
L
 
G
P
 
T
K
 
Y
A
 
R
R
 
K
I
 
V
Q
 
W
G
 
G
E
 
E
R
 
V
G
 
V
R
 
F
T
 
T
C
 
E
T
 
R
Q
 
L
L
 
I
R
 
Q
T
 
N
F
 
A
A
 
A
R
 
E
T
 
L
V
 
A
R
 
R
A
 
H
G
 
Y
E
 
Q
W
 
G
L
 
R
D
 
V
V
 
L
R
 
Q
I
 
S
D
 
D
S
 
S
A
 
E
L
 
S
P
 
T
E
 
I
R
 
S
Q
 
V
P
 
V
L
 
F
P
 
K
R
 
R
A
 
S
D
 
K
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
V
F
x
I
G
x
T
A
x
P
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
S
F
 
I
S
 
S
V
 
M
A
 
K
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
I
A
 
A
S
 
H
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
V
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
Y
K
|
K
A
 
P
H
 
A
S
|
S
A
 
D
H
 
T
P
 
P
G
 
V
T
 
T
S
 
G
E
 
W
L
 
L
V
 
I
G
 
A
Q
 
Q
A
 
M
V
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
C
 
-
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
L
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
S
 
P
G
|
G
R
 
P
E
 
V
V
 
V
G
|
G
I
 
E
A
 
E
L
 
I
V
 
V
S
 
T
D
 
H
P
 
K
R
 
R
I
 
V
K
 
A
A
 
H
V
 
V
G
 
T
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
x
E
R
 
S
S
 
S
G
x
T
G
 
G
M
 
R
A
 
E
L
 
I
C
 
-
Q
 
-
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
R
 
A
P
 
G
E
 
T
P
 
L
I
 
K
P
 
T
V
 
V
Y
 
T
A
 
L
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
S
N
 
D
P
 
P
V
 
L
F
 
I
L
 
I
F
 
L
D
 
D
A
 
D
A
 
V
L
 
D
Q
 
V
A
 
D
R
 
Y
A
 
A
E
 
A
A
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
F
 
V
V
 
F
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
F
Q
 
H
G
 
-
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
F
 
I
C
|
C
T
 
T
N
 
S
P
 
A
G
 
K
L
 
R
V
 
I
I
 
I
A
 
V
R
 
H
Q
 
K
G
 
A
P
 
V
A
 
A
L
 
-
Q
 
D
R
 
K
F
 
F
I
 
I
T
 
E
A
 
R
A
 
Y
A
 
V
G
 
H
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
K
-
 
M
-
 
L
-
 
R
-
 
I
-
 
D
-
 
D
-
 
P
Q
 
R
G
 
K
A
 
D
A
 
E
Q
 
K
T
 
V
M
 
D
L
 
L
T
 
G
P
 
P
G
 
L
I
 
I
F
x
N
S
 
E
A
x
R
Y
x
Q
Q
 
V
A
 
A
G
 
L
I
 
M
A
 
K
A
 
E
L
 
F
A
 
V
D
 
D
N
 
D
P
 
A
H
 
V
A
 
S
Q
 
R
A
 
G
-
 
G
-
 
R
I
 
L
T
 
L
S
 
I
G
 
G
Q
 
G
A
 
R
G
 
S
Q
 
W
G
 
G
P
 
-
N
 
N
Q
 
F
C
 
F
Q
 
E
A
 
P
Q
 
A
L
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
D
Q
 
V
A
 
D
E
 
R
A
 
N
F
 
F
L
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
R
A
 
I
L
 
M
Q
 
R
A
 
E
E
|
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
A
 
V
S
 
R
L
 
P
V
 
I
V
 
V
A
 
V
C
 
V
T
 
E
D
 
N
D
 
D
E
 
D
Q
 
Q
V
 
A
R
 
V
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
N
H
 
D
L
 
T
E
 
D
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
S
A
 
G
T
 
A
L
 
V
Q
 
L
L
 
T
D
 
N
E
 
N
A
 
V
D
 
N

Sites not aligning to the query:

3ju8A Crystal structure of succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa.
30% identity, 59% coverage: 3:313/525 of query aligns to 2:290/486 of 3ju8A

query
sites
3ju8A
L
 
M
T
 
S
G
 
T
N
 
H
L
 
Y
L
 
I
I
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
W
P
 
-
V
 
L
T
 
A
G
 
G
S
 
Q
R
 
G
D
 
E
A
 
T
I
 
L
R
 
E
A
 
S
I
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
V
T
 
-
G
 
G
Q
 
Q
T
 
G
L
 
V
E
 
V
P
 
W
A
 
S
Y
 
G
L
 
R
G
 
G
G
 
A
T
 
D
G
 
A
E
 
T
H
 
Q
V
 
V
A
 
D
Q
 
A
A
 
A
C
 
V
A
 
C
L
 
A
A
 
A
W
 
R
A
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
P
A
 
A
Y
 
W
R
 
A
E
 
R
T
 
R
S
 
P
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
R
 
R
A
 
I
E
 
E
F
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
R
I
 
F
A
 
A
T
 
A
Q
 
T
I
 
L
E
 
K
A
 
S
L
 
R
G
 
A
D
 
D
A
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
R
R
 
V
A
 
I
V
 
G
I
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
L
 
K
P
 
P
-
 
L
-
 
W
-
 
E
-
 
S
K
 
A
A
 
T
R
 
E
I
 
V
Q
 
T
G
 
S
E
 
M
R
 
V
G
 
N
R
 
K
T
 
V
C
 
A
T
 
I
Q
 
S
L
 
V
R
 
Q
T
 
A
F
 
F
A
 
R
R
 
E
T
 
-
V
 
-
R
 
R
A
 
T
G
 
G
E
 
E
W
 
-
L
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
K
R
 
S
Q
 
G
P
 
P
L
 
L
P
 
A
R
 
D
A
 
A
D
 
T
L
 
A
R
 
V
Q
 
L
R
 
R
Q
 
H
V
 
K
A
 
P
L
 
H
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
|
G
A
 
P
S
x
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
-
A
 
-
F
 
G
S
 
H
V
x
L
A
 
P
G
 
N
G
 
G
D
 
H
T
 
I
A
 
V
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
C
V
 
V
V
 
V
V
 
F
K
|
K
A
 
P
H
x
S
S
 
E
A
 
L
H
 
T
P
 
P
G
 
K
T
 
V
S
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
G
 
L
Q
 
K
A
 
A
V
 
W
A
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
C
 
-
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
L
S
 
N
L
 
L
L
 
V
Y
 
Q
G
 
G
S
 
-
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
A
S
 
A
D
 
H
P
 
R
R
 
G
I
 
L
K
 
D
A
 
G
V
 
L
G
 
F
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
R
 
S
S
 
R
G
x
T
G
 
G
M
 
N
A
 
L
L
 
L
C
 
H
Q
 
S
A
 
Q
A
 
F
Q
 
G
A
 
G
R
 
Q
P
 
P
E
 
Q
P
 
K
I
 
I
P
 
-
V
 
L
Y
 
A
A
 
L
E
|
E
M
|
M
S
x
G
S
 
G
I
 
N
N
 
N
P
 
P
V
 
L
F
 
V
L
 
V
F
 
E
D
 
E
A
 
V
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
A
R
 
D
A
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
A
A
 
V
Q
 
Y
G
 
T
F
 
I
V
 
I
A
 
Q
S
 
S
L
 
A
T
 
F
Q
 
I
G
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
R
C
|
C
T
 
T
N
 
C
P
 
A
G
 
R
L
 
R
V
 
L
I
 
L
A
 
V
R
 
P
Q
 
Q
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P77674 Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase; ABALDH; 1-pyrroline dehydrogenase; 4-aminobutanal dehydrogenase; 5-aminopentanal dehydrogenase; EC 1.2.1.19; EC 1.2.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
28% identity, 88% coverage: 6:468/525 of query aligns to 4:446/474 of P77674

query
sites
P77674
N
 
K
L
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
N
Q
 
G
R
 
E
P
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
S
 
E
R
 
G
D
 
E
A
 
K
I
 
Q
R
 
P
A
 
V
I
 
Y
D
 
N
P
 
P
T
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
D
T
 
V
L
 
L
-
 
L
E
 
E
P
 
I
A
 
A
Y
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
A
T
 
S
G
 
A
E
 
E
H
 
Q
V
 
V
A
 
D
Q
 
A
A
 
A
C
 
V
A
 
R
L
 
A
A
 
A
W
 
D
A
 
A
A
 
A
F
 
F
D
 
A
A
 
E
Y
 
W
R
 
G
E
 
Q
T
 
T
S
 
T
L
 
P
E
 
K
Q
 
V
R
 
R
A
 
A
E
 
E
F
 
C
L
 
L
E
 
L
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
D
Q
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
E
L
 
N
G
 
G
D
 
Q
A
 
V
L
 
F
I
 
A
D
 
E
R
 
L
A
 
E
V
 
S
I
 
R
E
 
N
T
 
C
G
 
G
L
 
K
P
 
P
-
 
L
K
 
H
A
 
S
R
 
A
I
 
F
Q
 
N
G
 
D
E
 
E
R
 
I
G
 
P
R
 
A
T
 
I
C
 
V
T
 
D
Q
 
V
L
 
F
R
 
R
T
 
F
F
 
F
A
 
A
R
 
G
T
 
A
V
 
A
R
 
R
-
 
C
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
L
-
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
W
 
Y
L
 
L
D
 
E
V
 
G
R
 
H
I
 
-
D
 
-
S
 
T
A
 
S
L
 
M
P
 
I
E
 
R
R
 
R
Q
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
S
F
 
I
G
x
A
A
x
P
S
x
W
N
 
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
M
F
 
-
S
 
-
V
 
M
A
 
A
G
 
A
G
 
W
D
 
K
T
 
L
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
C
V
 
V
V
 
V
V
 
L
K
|
K
A
x
P
H
x
S
S
x
E
A
 
I
H
 
T
P
 
P
G
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
L
V
 
T
G
 
A
Q
 
L
A
 
K
V
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
L
V
 
A
K
 
K
Q
 
D
C
 
I
G
 
-
L
 
F
P
 
P
E
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
I
S
 
N
L
 
I
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
S
 
R
G
 
G
R
 
K
E
 
T
V
 
V
G
 
G
I
x
D
A
 
P
L
 
L
V
 
T
S
 
G
D
 
H
P
 
P
R
 
K
I
 
V
K
 
R
A
 
M
V
 
V
G
 
S
F
 
L
T
 
T
G
 
G
S
|
S
R
x
I
S
x
A
G
x
T
G
 
G
M
 
E
A
 
H
L
 
I
C
 
I
Q
 
S
A
 
H
A
 
T
Q
 
A
A
 
S
R
 
S
P
 
I
E
 
K
P
 
-
I
 
-
P
 
R
V
 
T
Y
 
H
A
 
M
E
 
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
A
P
 
P
V
 
V
F
 
I
L
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
D
A
 
A
R
 
D
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
E
G
 
G
F
 
V
V
 
R
A
 
T
S
 
F
L
 
G
T
 
Y
Q
 
Y
G
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
D
C
|
C
T
 
T
N
 
A
P
 
A
G
 
C
L
 
R
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
R
 
Q
Q
 
K
G
 
G
-
 
I
-
 
Y
P
 
D
A
 
T
L
 
L
Q
 
V
R
 
E
F
 
K
I
 
L
T
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
Y
 
T
V
 
L
Q
 
K
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
D
A
 
E
Q
 
S
T
 
T
M
 
E
L
 
L
T
 
G
P
 
P
G
 
L
I
 
S
F
 
S
S
 
L
A
 
A
Y
 
H
Q
 
L
A
 
E
G
 
R
I
 
V
A
 
G
A
 
K
L
 
A
A
 
V
D
 
E
N
 
E
P
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
G
H
 
H
A
 
I
Q
 
K
A
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
K
G
 
R
Q
 
K
G
 
G
P
 
N
N
 
G
Q
 
Y
C
 
Y
Q
 
Y
A
 
A
Q
 
P
L
 
T
F
 
L
V
 
L
T
 
-
Q
 
-
A
 
A
E
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
Q
A
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
I
L
 
V
Q
 
Q
A
 
K
E
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
A
 
V
S
 
V
L
 
S
V
 
V
V
 
T
A
 
P
C
 
F
T
 
D
D
 
N
D
 
E
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
V
Q
 
N
V
 
W
A
 
A
E
 
N
H
 
D
L
 
S
E
 
Q
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
S
T
 
S
L
 
V
Q
 
W
L
 
T
D
 
K
E
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
D
S
 
V
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
H
L
 
R
P
 
V
T
 
S
L
 
A
E
 
R
R
 
L
K
 
Q
A
 
Y
G
 
G
R
 
C
I
 
T
L
 
W
V
 
V
N
 
N
G
 
-
W
 
-
P
 
-
T
 
T
G
 
H
V
 
F
E
 
M
V
 
L
C
 
V
D
 
S
A
 
E
M
 
M
V
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G

1wndA Escherichia coli ydcw gene product is a medium-chain aldehyde dehydrogenase as determined by kinetics and crystal structure (see paper)
28% identity, 88% coverage: 6:468/525 of query aligns to 4:446/474 of 1wndA

query
sites
1wndA
N
 
K
L
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
N
Q
 
G
R
 
E
P
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
S
 
E
R
 
G
D
 
E
A
 
K
I
 
Q
R
 
P
A
 
V
I
 
Y
D
 
N
P
 
P
T
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
D
T
 
V
L
 
L
-
 
L
E
 
E
P
 
I
A
 
A
Y
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
A
T
 
S
G
 
A
E
 
E
H
 
Q
V
 
V
A
 
D
Q
 
A
A
 
A
C
 
V
A
 
R
L
 
A
A
 
A
W
 
D
A
 
A
A
 
A
F
 
F
D
 
A
A
 
E
Y
 
W
R
 
G
E
 
Q
T
 
T
S
 
T
L
 
P
E
 
K
Q
 
V
R
 
R
A
 
A
E
 
E
F
 
C
L
 
L
E
 
L
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
D
Q
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
E
L
 
N
G
 
G
D
 
Q
A
 
V
L
 
F
I
 
A
D
 
E
R
 
L
A
 
E
V
 
S
I
 
R
E
 
N
T
 
C
G
 
G
L
 
K
P
 
P
-
 
L
K
 
H
A
 
S
R
 
A
I
 
F
Q
 
N
G
 
D
E
 
E
R
 
I
G
 
P
R
 
A
T
 
I
C
 
V
T
 
D
Q
 
V
L
 
F
R
 
R
T
 
F
F
 
F
A
 
A
R
 
G
T
 
A
V
 
A
R
 
R
-
 
C
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
L
-
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
W
 
Y
L
 
L
D
 
E
V
 
G
R
 
H
I
 
-
D
 
-
S
 
T
A
 
S
L
 
M
P
 
I
E
 
R
R
 
R
Q
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
S
F
 
I
G
 
A
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
M
F
 
-
S
 
-
V
 
M
A
 
A
G
 
A
G
 
W
D
 
K
T
 
L
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
C
V
 
V
V
 
V
V
 
L
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
A
 
I
H
 
T
P
 
P
G
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
L
V
 
T
G
 
A
Q
 
L
A
 
K
V
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
L
V
 
A
K
 
K
Q
 
D
C
 
I
G
 
-
L
 
F
P
 
P
E
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
V
S
 
N
L
 
I
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
S
 
R
G
 
G
R
 
K
E
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
D
A
 
P
L
 
L
V
 
T
S
 
G
D
 
H
P
 
P
R
 
K
I
 
V
K
 
R
A
 
M
V
 
V
G
 
S
F
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
S
R
 
I
S
 
A
G
 
T
G
 
G
M
 
E
A
 
H
L
 
I
C
 
I
Q
 
S
A
 
H
A
 
T
Q
 
A
A
 
S
R
 
S
P
 
I
E
 
K
P
 
-
I
 
-
P
 
R
V
 
T
Y
 
H
A
 
M
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
x
G
I
x
K
N
x
A
P
 
P
V
 
V
F
 
I
L
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
D
A
 
A
R
 
D
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
E
G
 
G
F
 
V
V
 
R
A
 
T
S
 
F
L
 
G
T
 
Y
Q
 
Y
G
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
D
C
|
C
T
 
T
N
 
A
P
 
A
G
 
C
L
 
R
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
R
 
Q
Q
 
K
G
 
G
-
 
I
-
 
Y
P
 
D
A
 
T
L
 
L
Q
 
V
R
 
E
F
 
K
I
 
L
T
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
Y
 
T
V
 
L
Q
 
K
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
D
A
 
E
Q
 
S
T
 
T
M
 
E
L
 
L
T
 
G
P
 
P
G
 
L
I
 
S
F
 
S
S
 
L
A
 
A
Y
 
H
Q
 
L
A
 
E
G
 
R
I
 
V
A
 
G
A
 
K
L
 
A
A
 
V
D
 
E
N
 
E
P
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
G
H
 
H
A
 
I
Q
 
K
A
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
K
G
 
R
Q
 
K
G
 
G
P
 
N
N
 
G
Q
 
Y
C
 
Y
Q
 
Y
A
 
A
Q
 
P
L
 
T
F
 
L
V
 
L
T
 
-
Q
 
-
A
 
A
E
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
Q
A
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
I
L
 
V
Q
 
Q
A
 
K
E
|
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
A
 
V
S
 
V
L
 
S
V
 
V
V
 
T
A
 
P
C
 
F
T
 
D
D
 
N
D
 
E
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
V
Q
 
N
V
 
W
A
 
A
E
 
N
H
 
D
L
 
S
E
 
Q
G
 
Y
Q
x
G
L
|
L
T
x
A
A
 
S
T
 
S
L
 
V
Q
 
W
L
 
T
D
 
K
E
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
D
S
 
V
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
H
L
 
R
P
 
V
T
 
S
L
 
A
E
 
R
R
 
L
K
 
Q
A
x
Y
G
 
G
R
 
C
I
 
T
L
 
W
V
 
V
N
 
N
G
 
-
W
 
-
P
 
-
T
 
T
G
 
H
V
 
F
E
 
M
V
 
L
C
 
V
D
 
S
A
 
E
M
 
M
V
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1wnbB Escherichia coli ydcw gene product is a medium-chain aldehyde dehydrogenase (complexed with nadh and betaine aldehyde) (see paper)
28% identity, 88% coverage: 6:468/525 of query aligns to 4:446/474 of 1wnbB

query
sites
1wnbB
N
 
K
L
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
N
Q
 
G
R
 
E
P
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
S
 
E
R
 
G
D
 
E
A
 
K
I
 
Q
R
 
P
A
 
V
I
 
Y
D
 
N
P
 
P
T
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
D
T
 
V
L
 
L
-
 
L
E
 
E
P
 
I
A
 
A
Y
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
A
T
 
S
G
 
A
E
 
E
H
 
Q
V
 
V
A
 
D
Q
 
A
A
 
A
C
 
V
A
 
R
L
 
A
A
 
A
W
 
D
A
 
A
A
 
A
F
 
F
D
 
A
A
 
E
Y
 
W
R
 
G
E
 
Q
T
 
T
S
 
T
L
 
P
E
 
K
Q
 
V
R
 
R
A
 
A
E
 
E
F
 
C
L
 
L
E
 
L
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
D
Q
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
E
L
 
N
G
 
G
D
 
Q
A
 
V
L
 
F
I
 
A
D
 
E
R
 
L
A
 
E
V
 
S
I
 
R
E
 
N
T
 
C
G
 
G
L
 
K
P
 
P
-
 
L
K
 
H
A
 
S
R
 
A
I
 
F
Q
 
N
G
 
D
E
 
E
R
 
I
G
 
P
R
 
A
T
 
I
C
 
V
T
 
D
Q
 
V
L
 
F
R
 
R
T
 
F
F
 
F
A
 
A
R
 
G
T
 
A
V
 
A
R
 
R
-
 
C
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
L
-
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
W
 
Y
L
 
L
D
 
E
V
 
G
R
 
H
I
 
-
D
 
-
S
 
T
A
 
S
L
 
M
P
 
I
E
 
R
R
 
R
Q
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
S
F
x
I
G
x
A
A
 
P
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
M
F
 
-
S
 
-
V
 
M
A
 
A
G
 
A
G
 
W
D
 
K
T
 
L
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
C
V
 
V
V
 
V
V
 
L
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
A
 
I
H
 
T
P
 
P
G
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
L
V
 
T
G
 
A
Q
 
L
A
 
K
V
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
L
V
 
A
K
 
K
Q
 
D
C
 
I
G
 
-
L
 
F
P
 
P
E
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
V
S
 
N
L
 
I
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
S
 
R
G
|
G
R
 
K
E
 
T
V
 
V
G
|
G
I
x
D
A
 
P
L
 
L
V
 
T
S
 
G
D
 
H
P
 
P
R
 
K
I
 
V
K
 
R
A
 
M
V
 
V
G
 
S
F
 
L
T
|
T
G
|
G
S
|
S
R
 
I
S
 
A
G
x
T
G
 
G
M
 
E
A
x
H
L
 
I
C
 
I
Q
 
S
A
 
H
A
 
T
Q
 
A
A
 
S
R
 
S
P
 
I
E
 
K
P
 
-
I
 
-
P
 
R
V
 
T
Y
 
H
A
 
M
E
|
E
M
 
L
S
x
G
S
 
G
I
 
K
N
 
A
P
 
P
V
 
V
F
 
I
L
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
D
A
 
A
R
 
D
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
E
G
 
G
F
 
V
V
 
R
A
 
T
S
 
F
L
 
G
T
 
Y
Q
 
Y
G
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
x
D
C
|
C
T
 
T
N
 
A
P
 
A
G
 
C
L
 
R
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
R
 
Q
Q
 
K
G
 
G
-
 
I
-
 
Y
P
 
D
A
 
T
L
 
L
Q
 
V
R
 
E
F
 
K
I
 
L
T
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
Y
 
T
V
 
L
Q
 
K
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
D
A
 
E
Q
 
S
T
 
T
M
 
E
L
 
L
T
 
G
P
 
P
G
 
L
I
 
S
F
 
S
S
 
L
A
 
A
Y
 
H
Q
 
L
A
 
E
G
 
R
I
 
V
A
 
G
A
 
K
L
 
A
A
 
V
D
 
E
N
 
E
P
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
G
H
 
H
A
 
I
Q
 
K
A
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
K
G
 
R
Q
 
K
G
 
G
P
 
N
N
 
G
Q
 
Y
C
 
Y
Q
 
Y
A
 
A
Q
 
P
L
 
T
F
 
L
V
 
L
T
 
-
Q
 
-
A
 
A
E
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
Q
A
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
I
L
 
V
Q
 
Q
A
 
K
E
|
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
A
 
V
S
 
V
L
 
S
V
 
V
V
 
T
A
 
P
C
 
F
T
 
D
D
 
N
D
 
E
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
V
Q
 
N
V
 
W
A
 
A
E
 
N
H
 
D
L
 
S
E
 
Q
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
S
T
 
S
L
 
V
Q
 
W
L
 
T
D
 
K
E
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
D
S
 
V
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
H
L
 
R
P
 
V
T
 
S
L
 
A
E
 
R
R
 
L
K
 
Q
A
 
Y
G
 
G
R
 
C
I
 
T
L
 
W
V
 
V
N
 
N
G
 
-
W
 
-
P
 
-
T
 
T
G
 
H
V
x
F
E
 
M
V
x
L
C
 
V
D
 
S
A
 
E
M
 
M
V
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1wnbA Escherichia coli ydcw gene product is a medium-chain aldehyde dehydrogenase (complexed with nadh and betaine aldehyde) (see paper)
28% identity, 88% coverage: 6:468/525 of query aligns to 4:446/474 of 1wnbA

query
sites
1wnbA
N
 
K
L
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
N
Q
 
G
R
 
E
P
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
S
 
E
R
 
G
D
 
E
A
 
K
I
 
Q
R
 
P
A
 
V
I
 
Y
D
 
N
P
 
P
T
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
D
T
 
V
L
 
L
-
 
L
E
 
E
P
 
I
A
 
A
Y
 
E
L
 
-
G
 
-
G
 
A
T
 
S
G
 
A
E
 
E
H
 
Q
V
 
V
A
 
D
Q
 
A
A
 
A
C
 
V
A
 
R
L
 
A
A
 
A
W
 
D
A
 
A
A
 
A
F
 
F
D
 
A
A
 
E
Y
 
W
R
 
G
E
 
Q
T
 
T
S
 
T
L
 
P
E
 
K
Q
 
V
R
 
R
A
 
A
E
 
E
F
 
C
L
 
L
E
 
L
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
D
Q
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
E
L
 
N
G
 
G
D
 
Q
A
 
V
L
 
F
I
 
A
D
 
E
R
 
L
A
 
E
V
 
S
I
 
R
E
 
N
T
 
C
G
 
G
L
 
K
P
 
P
-
 
L
K
 
H
A
 
S
R
 
A
I
 
F
Q
 
N
G
 
D
E
 
E
R
 
I
G
 
P
R
 
A
T
 
I
C
 
V
T
 
D
Q
 
V
L
 
F
R
 
R
T
 
F
F
 
F
A
 
A
R
 
G
T
 
A
V
 
A
R
 
R
-
 
C
-
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
L
-
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
W
 
Y
L
 
L
D
 
E
V
 
G
R
 
H
I
 
-
D
 
-
S
 
T
A
 
S
L
 
M
P
 
I
E
 
R
R
 
R
Q
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
S
F
x
I
G
x
A
A
 
P
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
M
F
 
-
S
 
-
V
 
M
A
 
A
G
 
A
G
 
W
D
 
K
T
 
L
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
C
V
 
V
V
 
V
V
 
L
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
A
 
I
H
 
T
P
 
P
G
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
L
V
 
T
G
 
A
Q
 
L
A
 
K
V
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
L
V
 
A
K
 
K
Q
 
D
C
 
I
G
 
-
L
 
F
P
 
P
E
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
V
S
 
N
L
 
I
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
S
 
R
G
|
G
R
 
K
E
 
T
V
 
V
G
|
G
I
x
D
A
 
P
L
 
L
V
 
T
S
 
G
D
 
H
P
 
P
R
 
K
I
 
V
K
 
R
A
 
M
V
 
V
G
 
S
F
 
L
T
 
T
G
|
G
S
|
S
R
 
I
S
 
A
G
x
T
G
 
G
M
 
E
A
x
H
L
 
I
C
 
I
Q
 
S
A
 
H
A
 
T
Q
 
A
A
 
S
R
 
S
P
 
I
E
 
K
P
 
-
I
 
-
P
 
R
V
 
T
Y
 
H
A
 
M
E
|
E
M
 
L
S
x
G
S
 
G
I
 
K
N
 
A
P
 
P
V
 
V
F
 
I
L
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
D
A
 
A
R
 
D
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
E
G
 
G
F
 
V
V
 
R
A
 
T
S
 
F
L
 
G
T
 
Y
Q
 
Y
G
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
D
C
|
C
T
 
T
N
 
A
P
 
A
G
 
C
L
 
R
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
R
 
Q
Q
 
K
G
 
G
-
 
I
-
 
Y
P
 
D
A
 
T
L
 
L
Q
 
V
R
 
E
F
 
K
I
 
L
T
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
Y
 
T
V
 
L
Q
 
K
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
D
A
 
E
Q
 
S
T
 
T
M
 
E
L
 
L
T
 
G
P
 
P
G
 
L
I
 
S
F
 
S
S
 
L
A
 
A
Y
 
H
Q
 
L
A
 
E
G
 
R
I
 
V
A
 
G
A
 
K
L
 
A
A
 
V
D
 
E
N
 
E
P
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
G
H
 
H
A
 
I
Q
 
K
A
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
K
G
 
R
Q
 
K
G
 
G
P
 
N
N
 
G
Q
 
Y
C
 
Y
Q
 
Y
A
 
A
Q
 
P
L
 
T
F
 
L
V
 
L
T
 
-
Q
 
-
A
 
A
E
 
G
A
 
A
F
 
L
L
 
Q
A
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
I
L
 
V
Q
 
Q
A
 
K
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
A
 
P
A
 
V
S
 
V
L
 
S
V
 
V
V
 
T
A
 
P
C
 
F
T
 
D
D
 
N
D
 
E
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
R
 
V
Q
 
N
V
 
W
A
 
A
E
 
N
H
 
D
L
 
S
E
 
Q
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
S
T
 
S
L
 
V
Q
 
W
L
 
T
D
 
K
E
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
D
 
D
S
 
V
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
H
L
 
R
P
 
V
T
 
S
L
 
A
E
 
R
R
 
L
K
 
Q
A
 
Y
G
 
G
R
 
C
I
 
T
L
 
W
V
 
V
N
 
N
G
 
-
W
 
-
P
 
-
T
 
T
G
 
H
V
 
F
E
 
M
V
 
L
C
 
V
D
 
S
A
 
E
M
 
M
V
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q84LK3 Betaine aldehyde dehydrogenase 2; OsBADH2; EC 1.2.1.8 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see paper)
25% identity, 74% coverage: 66:452/525 of query aligns to 74:448/503 of Q84LK3

query
sites
Q84LK3
R
 
R
A
 
A
E
 
K
F
 
Y
L
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
T
 
A
Q
 
K
I
 
I
E
 
I
A
 
E
L
 
R
G
 
K
D
 
S
A
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
R
R
 
L
A
 
E
V
 
T
I
 
L
E
 
D
T
 
C
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
L
A
 
D
R
 
E
I
 
A
Q
 
A
G
 
W
E
 
D
R
 
M
G
 
D
R
 
D
T
 
V
C
 
A
T
 
G
Q
 
C
L
 
F
R
 
E
T
 
Y
F
 
F
A
 
A
R
 
D
T
 
L
V
 
A
R
 
E
A
 
S
G
 
-
E
 
-
W
 
-
L
 
L
D
 
D
V
 
K
R
 
R
I
 
Q
D
 
N
S
 
A
A
 
-
L
 
-
P
 
P
E
 
V
R
 
S
Q
 
L
P
 
P
L
 
M
P
 
E
R
 
N
A
 
F
D
 
K
L
 
C
R
 
Y
Q
 
L
R
 
R
Q
 
K
V
 
E
A
 
P
L
 
I
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
L
F
 
I
G
 
T
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
 
-
S
 
-
V
 
M
A
 
A
G
 
T
G
x
W
D
 
K
T
 
V
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
T
V
 
A
V
 
V
V
 
L
K
 
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
A
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
L
S
 
A
E
 
S
L
 
V
V
 
T
G
 
C
Q
 
L
A
 
E
V
 
L
A
 
A
Q
 
D
A
 
V
V
 
C
K
 
K
Q
 
E
C
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
L
S
 
N
L
 
I
L
 
V
Y
 
T
G
 
G
S
 
L
G
 
G
R
 
S
E
 
E
V
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
P
L
 
L
V
 
S
S
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
G
I
 
V
K
 
D
A
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
R
 
Y
S
 
E
G
 
T
G
 
G
M
 
K
A
 
K
L
 
I
C
 
-
Q
 
-
A
 
M
A
 
A
Q
 
S
A
 
A
R
 
A
P
 
P
E
 
M
P
 
V
I
 
K
P
 
P
V
 
V
Y
 
S
A
 
L
E
 
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
I
F
 
V
L
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
D
A
 
V
R
 
D
A
 
V
E
 
E
A
 
K
L
 
A
A
 
V
Q
 
E
G
 
W
F
 
T
V
 
L
A
 
F
S
 
G
L
 
C
T
 
F
Q
 
W
G
 
T
A
 
N
G
 
G
Q
 
Q
F
 
I
C
 
C
T
 
S
N
 
A
P
 
T
G
 
S
L
 
R
V
 
L
I
 
I
A
 
L
R
 
H
Q
 
K
G
 
K
P
 
I
A
 
A
-
 
K
-
 
E
L
 
F
Q
 
Q
R
 
E
F
 
R
I
 
M
T
 
V
A
 
A
A
 
W
A
 
A
G
 
K
Y
 
N
V
 
I
Q
 
K
Q
 
V
G
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
L
A
 
E
A
 
E
Q
 
G
T
 
C
M
 
R
L
 
L
T
 
G
P
 
P
G
 
V
I
 
V
F
 
S
S
 
E
A
 
G
Y
 
Q
Q
 
Y
A
 
E
G
 
K
I
 
I
A
 
K
A
 
Q
L
 
F
A
 
V
D
 
S
N
 
T
P
 
A
H
 
K
A
 
S
Q
 
Q
A
 
G
I
 
A
T
 
T
S
 
I
G
 
L
Q
 
T
A
 
G
G
 
G
Q
 
V
G
 
R
P
 
P
N
 
K
Q
 
H
C
 
L
Q
 
E
A
 
K
Q
 
G
L
 
F
F
 
Y
V
 
I
T
 
E
Q
 
P
A
 
T
E
 
I
A
 
I
F
 
T
L
 
D
A
 
V
D
 
D
P
 
T
A
 
S
L
 
M
Q
 
Q
-
 
I
-
 
W
-
 
R
A
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
A
 
V
S
 
L
L
 
C
V
 
V
V
 
K
A
 
E
C
 
F
T
 
S
D
 
T
D
 
E
E
 
E
Q
 
E
V
 
A
R
 
I
Q
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
N
H
 
D
L
 
T
E
 
H
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
G
T
 
A
L
 
V
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
L
D
 
S
I
 
G
D
 
D
S
 
R
A
 
E
R
 
R
A
 
C
L
 
Q
L
 
R
P
 
L
T
 
T
L
 
E
E
 
E
R
 
I
K
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
I
I
 
I
L
 
W
V
 
V
N
 
N

P17202 Aminoaldehyde dehydrogenase BADH; 4-trimethylammoniobutyraldehyde dehydrogenase BADH; Aminobutyraldehyde dehydrogenase BADH; Betaine aldehyde dehydrogenase; SoBADH; EC 1.2.1.-; EC 1.2.1.47; EC 1.2.1.19; EC 1.2.1.8 from Spinacia oleracea (Spinach) (see 3 papers)
24% identity, 84% coverage: 11:452/525 of query aligns to 17:445/497 of P17202

query
sites
P17202
Q
 
R
R
 
E
P
 
P
V
 
I
T
 
K
G
 
K
S
 
N
R
 
R
D
 
-
A
 
-
I
 
I
R
 
P
A
 
V
I
|
I
D
 
N
P
 
P
T
 
S
T
 
T
G
 
E
Q
 
E
T
 
I
L
 
I
E
 
G
-
 
D
-
 
I
P
 
P
A
 
A
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
A
T
 
T
G
 
A
E
 
E
H
 
D
V
 
V
A
 
E
Q
 
V
A
 
A
C
 
V
A
 
V
L
 
A
A
 
A
W
 
R
A
 
R
A
 
A
F
 
F
-
 
R
-
 
R
D
 
N
A
 
N
Y
 
W
R
 
S
E
 
A
T
 
T
S
 
S
L
 
G
E
 
A
Q
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
T
F
 
Y
L
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
T
 
A
Q
 
K
I
 
I
E
 
T
A
 
E
L
 
K
G
 
K
D
 
D
A
 
H
L
 
F
I
 
V
D
 
K
R
 
L
A
 
E
V
 
T
I
 
I
E
x
D
T
 
S
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
F
A
 
D
R
 
E
I
 
A
Q
 
V
G
 
L
E
 
D
R
 
I
G
 
D
R
 
D
T
 
V
C
 
A
T
 
S
Q
 
C
L
 
F
R
 
E
T
 
Y
F
 
F
A
 
A
R
 
G
T
 
Q
V
 
A
R
 
E
A
 
A
G
 
-
E
 
-
W
 
-
L
 
L
D
 
D
V
 
G
R
 
K
I
 
-
D
 
-
S
 
Q
A
 
K
L
 
A
P
 
P
E
 
V
R
 
T
Q
 
L
P
 
P
L
 
M
P
 
E
R
 
R
A
 
F
D
 
K
L
 
S
R
 
H
Q
 
V
R
 
L
Q
 
R
V
 
Q
A
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
L
F
 
I
G
x
S
A
x
P
S
x
W
N
 
N
F
x
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
 
-
S
 
-
V
 
M
A
 
A
G
 
T
G
x
W
D
 
K
T
 
I
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
T
V
 
A
V
 
V
V
 
L
K
|
K
A
x
P
H
x
S
S
x
E
A
x
L
H
 
A
P
 
S
G
 
V
T
 
T
S
 
C
E
 
L
L
 
E
V
 
F
G
 
G
Q
 
E
A
 
V
V
 
C
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
N
Q
 
E
C
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
P
G
 
G
V
 
V
F
 
L
S
 
N
L
 
I
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
L
G
 
G
R
 
P
E
 
D
V
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
P
L
 
L
V
 
V
S
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
D
I
 
V
K
 
D
A
 
K
V
 
I
G
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
R
x
S
-
x
A
S
x
T
G
 
G
G
 
S
M
 
K
A
 
V
L
 
M
C
 
A
Q
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
R
x
V
P
 
K
E
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
P
V
 
V
Y
 
T
A
 
L
E
 
E
M
x
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
I
F
 
V
L
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
D
A
 
V
R
 
D
A
 
I
E
 
D
A
 
K
L
 
V
A
 
V
Q
 
E
G
 
W
F
 
T
V
 
I
A
 
F
S
 
G
L
 
C
T
 
F
Q
x
W
G
 
T
A
 
N
G
 
G
Q
 
Q
F
 
I
C
 
C
T
 
S
N
 
A
P
 
T
G
 
S
L
 
R
V
 
L
I
 
L
A
 
V
R
 
H
Q
 
E
G
 
S
P
 
I
A
 
A
L
 
A
Q
 
E
R
 
-
F
 
F
I
 
V
T
 
D
A
 
K
A
 
L
A
 
V
G
 
K
Y
 
W
V
 
T
Q
 
K
Q
 
N
G
 
I
A
 
K
A
 
I
Q
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
G
T
 
C
M
 
R
L
 
L
T
 
G
P
 
P
G
 
V
I
 
I
F
 
S
S
 
K
A
 
G
Y
 
Q
Q
 
Y
A
 
D
G
 
K
I
 
I
A
 
M
A
 
K
L
 
F
A
 
I
D
 
S
N
 
T
P
 
A
H
 
K
A
 
S
Q
 
E
A
 
G
I
 
A
T
 
T
S
 
I
G
 
L
Q
 
Y
A
 
G
G
 
G
Q
 
S
G
 
R
P
 
P
N
 
E
Q
 
H
C
 
L
Q
 
K
A
 
K
Q
 
G
L
 
Y
F
 
Y
V
 
I
T
 
E
Q
 
P
A
 
T
E
 
I
A
 
V
F
 
T
L
 
D
A
 
I
D
 
S
P
 
T
A
 
S
L
 
M
Q
 
Q
-
 
I
-
 
W
-
 
K
A
 
E
E
|
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
P
A
 
V
S
 
L
L
 
C
V
 
V
V
 
K
A
 
T
C
 
F
T
 
S
D
 
S
D
 
E
E
 
D
Q
 
E
V
 
A
R
 
I
Q
 
A
V
 
L
A
 
A
E
 
N
H
 
D
L
 
T
E
 
E
G
 
Y
Q
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
A
L
 
V
Q
 
F
L
 
S
D
 
N
E
 
-
A
 
-
D
 
D
I
 
L
D
 
E
S
 
R
A
 
C
R
 
E
A
 
R
L
 
I
L
 
T
P
 
K
T
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
-
K
 
-
A
 
V
G
 
G
R
x
A
I
 
V
L
 
W
V
 
V
N
 
N

Sites not aligning to the query:

4v37A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase from spinach showing a thiohemiacetal with 3-aminopropionaldehyde
30% identity, 51% coverage: 11:276/525 of query aligns to 15:266/495 of 4v37A

query
sites
4v37A
Q
 
R
R
 
E
P
 
P
V
 
I
T
 
K
G
 
K
S
 
N
R
 
R
D
 
-
A
 
-
I
 
I
R
 
P
A
 
V
I
 
I
D
 
N
P
 
P
T
 
S
T
 
T
G
 
E
Q
 
E
T
 
I
L
 
I
E
 
G
-
 
D
-
 
I
P
 
P
A
 
A
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
A
T
 
T
G
 
A
E
 
E
H
 
D
V
 
V
A
 
E
Q
 
V
A
 
A
C
 
V
A
 
V
L
 
A
A
 
A
W
 
R
A
 
R
A
 
A
F
 
F
-
 
R
-
 
R
D
 
N
A
 
N
Y
 
W
R
 
S
E
 
A
T
 
T
S
 
S
L
 
G
E
 
A
Q
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
T
F
 
Y
L
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
T
 
A
Q
 
K
I
 
I
E
 
T
A
 
E
L
 
K
G
 
K
D
 
D
A
 
H
L
 
F
I
 
V
D
 
K
R
 
L
A
 
E
V
 
T
I
 
I
E
 
D
T
 
S
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
F
A
 
D
R
 
E
I
 
A
Q
 
V
G
 
L
E
 
D
R
 
I
G
 
D
R
 
D
T
 
V
C
 
A
T
 
S
Q
 
C
L
 
F
R
 
E
T
 
Y
F
 
F
A
 
A
R
 
G
T
 
Q
V
 
A
R
 
E
A
 
A
G
 
-
E
 
-
W
 
-
L
 
L
D
 
D
V
 
G
R
 
K
I
 
-
D
 
-
S
 
Q
A
 
K
L
 
A
P
 
P
E
 
V
R
 
T
Q
 
L
P
 
P
L
 
M
P
 
E
R
 
R
A
 
F
D
 
K
L
 
S
R
 
H
Q
 
V
R
 
L
Q
 
R
V
 
Q
A
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
L
F
x
I
G
x
S
A
x
P
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
 
-
S
 
-
V
x
M
A
 
A
G
 
T
G
 
W
D
 
K
T
 
I
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
T
V
 
A
V
 
V
V
 
L
K
|
K
A
 
P
H
x
S
S
x
E
A
 
L
H
 
A
P
 
S
G
 
V
T
 
T
S
 
C
E
 
L
L
 
E
V
 
F
G
 
G
Q
 
E
A
 
V
V
 
C
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
N
Q
 
E
C
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
P
G
 
G
V
 
V
F
 
L
S
 
N
L
 
I
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
L
G
|
G
R
 
P
E
 
D
V
 
A
G
|
G
I
x
A
A
 
P
L
 
L
V
 
V
S
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
D
I
 
V
K
 
D
A
 
K
V
 
I
G
 
A
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
R
 
S
-
 
A
S
x
T
G
 
G
G
 
S
M
 
K
A
 
V
L
 
M
C
 
A
Q
 
S
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
R
 
V
P
 
K
E
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
P
V
 
V
Y
 
T
A
 
L
E
|
E
M
x
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
I
F
 
V
L
 
V
F
 
F
D
 
E

Sites not aligning to the query:

5ur2B Crystal structure of proline utilization a (puta) from bdellovibrio bacteriovorus inactivated by n-propargylglycine (see paper)
25% identity, 94% coverage: 1:494/525 of query aligns to 469:945/959 of 5ur2B

query
sites
5ur2B
M
 
L
P
 
P
L
 
V
T
 
N
G
 
V
N
 
N
L
 
I
L
 
V
I
 
I
G
 
N
Q
 
N
R
 
K
P
 
E
V
 
L
T
 
Q
G
 
S
S
 
G
R
 
K
D
 
I
A
 
F
I
 
D
R
 
R
A
 
-
I
 
V
D
 
N
P
 
P
T
 
S
T
 
Q
G
 
S
Q
 
D
T
 
Q
L
 
I
E
 
V
P
 
G
A
 
K
Y
 
I
L
 
Q
G
 
M
G
 
A
T
 
T
G
 
T
E
 
E
H
 
Q
V
 
A
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
C
 
M
A
 
Q
L
 
A
A
 
A
W
 
Q
A
 
T
A
 
A
F
 
Y
D
 
K
A
 
T
Y
 
W
R
 
K
E
 
N
T
 
V
S
 
P
L
 
C
E
 
E
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
A
F
 
L
L
 
V
E
 
D
A
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
D
Q
 
I
I
 
M
E
 
T
A
 
R
L
 
D
G
 
R
D
 
F
A
 
K
L
 
L
I
 
I
D
 
A
R
 
T
A
 
Q
V
 
V
I
 
L
E
 
E
T
 
V
G
 
G
L
 
K
P
 
P
K
 
W
A
 
A
R
 
E
I
 
A
Q
 
D
G
 
G
E
 
D
R
 
I
G
 
G
R
 
E
T
 
A
C
 
I
T
 
D
Q
 
F
L
 
C
R
 
R
T
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
H
V
 
M
R
 
R
A
 
E
G
 
L
E
 
Q
W
 
-
L
 
K
D
 
P
V
 
L
R
 
R
I
 
V
D
 
-
S
 
G
A
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
E
Q
 
-
P
 
-
L
 
L
P
 
S
R
 
H
A
 
Y
D
 
I
L
 
Y
R
 
K
Q
 
S
R
 
R
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
P
 
V
V
 
T
A
 
A
V
 
V
F
 
I
G
 
A
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
I
S
 
-
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
M
D
 
V
T
 
T
A
 
A
S
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
-
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
M
K
|
K
A
 
P
H
 
A
S
 
E
A
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
Q
S
 
S
E
 
T
L
 
V
V
 
V
G
 
A
Q
 
W
A
 
G
V
 
L
A
 
M
Q
 
K
A
 
M
V
 
I
K
 
Q
Q
 
E
C
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
I
S
 
N
L
 
F
L
 
L
Y
 
P
G
 
G
S
 
Y
G
 
G
R
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
I
 
E
A
 
Y
L
 
I
V
 
V
S
 
N
D
 
H
P
 
K
R
 
Y
I
 
T
K
 
T
A
 
T
V
 
I
G
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
R
 
K
S
 
A
G
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
H
L
 
I
C
 
M
-
 
N
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
V
A
 
V
R
 
Q
P
 
P
E
 
G
P
 
Q
I
 
Q
P
 
H
V
 
V
-
 
K
-
 
R
-
 
C
Y
 
I
A
 
I
E
|
E
M
 
M
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
N
P
 
A
V
 
V
F
 
I
L
 
I
F
 
D
D
 
N
A
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
D
A
 
A
R
 
D
A
 
L
E
 
D
A
 
E
L
 
A
A
 
V
Q
 
D
G
 
G
F
 
V
V
 
I
A
 
Y
S
 
S
L
 
A
T
 
F
Q
 
G
G
 
F
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
F
 
K
C
|
C
T
 
S
N
 
A
P
 
A
G
 
S
L
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
V
R
 
L
Q
 
D
G
 
-
P
 
E
A
 
V
L
 
Y
Q
 
D
R
 
R
F
 
F
I
 
V
T
 
D
A
 
R
A
 
L
A
 
V
G
 
E
Y
 
T
V
 
A
Q
 
K
Q
 
S
G
 
I
A
 
E
A
 
I
Q
 
H
T
 
P
M
 
A
L
 
E
T
 
N
P
 
P
G
 
K
I
 
A
F
 
Y
-
 
M
-
 
G
-
 
P
-
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
K
S
 
E
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
D
-
 
R
-
 
I
A
 
L
G
 
G
I
 
T
A
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
A
D
 
E
N
 
K
P
 
N
H
 
H
A
 
K
Q
 
L
A
 
L
I
 
F
T
 
K
S
 
G
G
 
S
Q
 
V
A
 
P
G
 
G
Q
 
G
G
 
G
P
 
-
N
 
-
Q
 
-
C
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
F
 
-
V
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
F
L
 
F
A
 
A
D
 
P
P
 
P
A
 
T
L
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
|
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
A
 
P
A
 
V
S
 
V
L
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
R
C
 
A
T
 
K
D
 
N
D
 
L
E
 
D
Q
 
Q
V
 
A
R
 
L
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
N
H
 
S
L
 
T
E
 
E
G
 
Y
Q
 
A
L
 
L
T
 
T
-
 
G
A
 
G
T
 
V
L
 
F
Q
 
S
L
 
R
D
 
S
E
 
P
A
 
A
D
 
N
I
 
I
D
 
N
S
 
R
A
 
V
R
 
K
A
 
E
L
 
-
L
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
E
R
 
L
K
 
E
A
 
V
G
 
G
R
 
N
I
 
L
L
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
R
W
 
G
P
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
-
E
 
-
V
 
-
C
 
-
D
 
-
A
 
A
M
 
M
V
 
V
H
 
D
G
 
R
G
 
H
P
 
P
F
 
F
P
 
G
-
 
G
-
 
F
A
 
K
T
 
M
S
 
S
D
 
G
A
 
I
R
 
G
T
 
S
T
 
K
S
x
T
V
 
G
G
 
G
T
 
P
A
 
D
A
 
Y
I
 
L
L
 
K
R
 
Q
F
 
Y
L
 
M
R
 
E
P
 
P
V
 
A
C
 
C

Sites not aligning to the query:

4u3wA X-ray crystal structure of 2-aminomuconate 6-semialdehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
30% identity, 50% coverage: 58:322/525 of query aligns to 56:305/485 of 4u3wA

query
sites
4u3wA
Y
 
W
R
 
R
E
 
D
T
 
T
S
 
T
L
 
P
E
 
A
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
A
F
 
W
L
 
L
E
 
H
A
 
K
I
 
I
A
 
A
T
 
D
Q
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
R
G
 
F
D
 
D
A
 
E
L
 
F
I
 
V
D
 
A
R
 
A
A
 
E
V
 
V
I
 
A
E
 
D
T
 
T
G
 
G
L
 
R
P
 
P
K
 
V
A
 
A
R
 
Q
I
 
A
Q
 
R
G
 
T
-
 
L
E
 
D
R
 
I
G
 
A
R
 
R
T
 
G
C
 
I
T
 
A
Q
 
N
L
 
F
R
 
R
T
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
D
T
 
L
V
 
V
R
 
R
-
 
T
-
 
A
A
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
Y
L
 
F
D
 
E
V
 
T
R
 
H
I
 
A
D
 
A
S
 
D
A
 
G
L
 
S
P
 
E
E
 
L
R
 
I
Q
 
N
P
 
Y
L
 
V
P
 
T
R
 
R
A
 
K
D
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
I
A
 
G
V
 
I
F
 
I
G
 
S
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
 
L
S
 
F
V
 
T
A
 
-
G
 
-
G
 
W
D
 
K
T
 
V
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
M
G
 
G
C
 
N
P
 
C
V
 
V
V
 
V
V
 
A
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
A
 
E
H
 
T
P
 
P
G
 
S
T
 
S
S
 
A
E
 
T
L
 
L
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
V
V
 
M
K
 
H
Q
 
D
C
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
P
G
 
G
V
 
V
F
 
F
S
 
N
L
 
L
L
 
I
Y
 
H
G
 
G
S
 
H
G
 
G
R
 
Q
E
 
N
-
 
A
V
 
A
G
 
G
I
 
E
A
 
F
L
 
L
V
 
T
S
 
R
D
 
H
P
 
P
R
 
D
I
 
I
K
 
S
A
 
A
V
 
I
G
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
G
-
 
E
S
 
S
R
 
R
S
 
T
G
 
G
G
 
S
M
 
T
A
 
I
L
 
M
C
 
K
Q
 
A
A
 
V
A
 
A
Q
 
D
A
 
G
R
 
V
P
 
K
E
 
E
P
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
V
Y
 
S
A
 
F
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
N
P
 
A
V
 
A
F
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
V
A
 
V
A
 
F
L
 
A
Q
 
D
A
 
A
R
 
D
A
 
F
E
 
D
A
 
A
L
 
A
A
 
V
Q
 
A
G
 
G
F
 
V
V
 
L
A
 
R
S
 
S
L
 
S
T
 
F
Q
 
T
G
 
N
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
L
N
 
C
P
 
S
G
 
E
L
 
R
V
 
V
I
 
Y
A
 
V
R
 
E
Q
 
R
G
 
-
P
 
P
A
 
I
L
 
F
Q
 
E
R
 
R
F
 
F
I
 
V
T
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>PP_1256 FitnessBrowser__Putida:PP_1256
MPLTGNLLIGQRPVTGSRDAIRAIDPTTGQTLEPAYLGGTGEHVAQACALAWAAFDAYRE
TSLEQRAEFLEAIATQIEALGDALIDRAVIETGLPKARIQGERGRTCTQLRTFARTVRAG
EWLDVRIDSALPERQPLPRADLRQRQVALGPVAVFGASNFPLAFSVAGGDTASALAAGCP
VVVKAHSAHPGTSELVGQAVAQAVKQCGLPEGVFSLLYGSGREVGIALVSDPRIKAVGFT
GSRSGGMALCQAAQARPEPIPVYAEMSSINPVFLFDAALQARAEALAQGFVASLTQGAGQ
FCTNPGLVIARQGPALQRFITAAAGYVQQGAAQTMLTPGIFSAYQAGIAALADNPHAQAI
TSGQAGQGPNQCQAQLFVTQAEAFLADPALQAEVFGAASLVVACTDDEQVRQVAEHLEGQ
LTATLQLDEADIDSARALLPTLERKAGRILVNGWPTGVEVCDAMVHGGPFPATSDARTTS
VGTAAILRFLRPVCYQDVPDALLPQALKHGNPLQLRRLLDGKRED

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory