SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_2784 FitnessBrowser__Putida:PP_2784 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3sjuA Hedamycin polyketide ketoreductase bound to NADPH (see paper)
35% identity, 97% coverage: 5:251/254 of query aligns to 1:253/255 of 3sjuA

query
sites
3sjuA
R
 
Q
T
 
T
I
 
A
V
 
F
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
V
A
x
S
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
R
S
 
T
F
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
G
E
 
I
H
 
A
L
 
V
L
 
Y
I
 
G
L
 
C
L
x
A
D
 
-
R
|
R
D
|
D
L
 
A
A
 
K
T
 
N
L
 
V
Q
 
S
G
 
A
W
 
A
V
 
V
T
 
-
E
 
D
G
 
G
E
 
L
F
 
R
A
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
H
R
 
D
I
 
V
E
 
D
T
 
G
H
 
S
Q
 
S
A
x
C
N
x
D
I
x
V
A
x
T
D
 
S
L
 
T
A
 
D
S
 
E
L
 
V
Q
 
H
L
 
A
L
 
A
F
 
V
K
 
A
G
 
A
L
 
A
A
 
V
D
 
E
R
 
R
V
 
F
G
 
G
F
 
P
V
 
I
D
 
G
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
|
S
A
|
A
G
|
G
V
 
R
C
 
N
D
 
G
E
 
G
N
 
G
E
 
E
P
 
T
E
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
D
N
 
D
-
 
A
-
 
L
W
 
W
H
 
A
K
 
D
V
 
V
I
 
L
S
 
D
I
x
T
N
 
N
L
 
L
N
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
Y
 
R
V
 
V
T
 
T
S
 
R
L
 
E
C
 
V
L
 
L
P
 
R
L
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
R
M
 
E
A
 
A
D
 
G
G
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
I
S
x
A
S
|
S
I
 
T
L
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
G
 
G
K
 
V
V
 
M
R
 
Y
N
 
A
T
 
A
A
 
P
Y
|
Y
C
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
V
A
 
G
L
 
F
D
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
K
R
 
T
R
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
C
P
|
P
A
x
G
W
x
Y
I
x
V
D
 
E
T
|
T
P
 
P
M
|
M
L
 
A
Q
 
E
G
 
R
E
 
V
L
 
R
A
 
E
A
 
G
Q
x
Y
A
 
A
R
 
R
I
 
H
A
 
W
G
 
G
I
 
V
T
 
T
H
 
E
E
 
Q
Q
 
E
I
 
V
L
 
H
R
 
E
N
 
R
A
 
F
K
 
N
K
 
A
K
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
F
 
Y
I
 
S
Q
 
T
G
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
G
M
 
L
V
 
V
R
 
G
Y
 
Y
L
 
L
A
 
V
S
 
T
P
 
D
Q
 
A
A
 
A
S
 
A
G
 
S
V
 
I
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
M
 
N
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G

1xr3A Actinorhodin polyketide ketoreductase with NADP and the inhibitor isoniazid bound (see paper)
35% identity, 96% coverage: 8:251/254 of query aligns to 5:254/256 of 1xr3A

query
sites
1xr3A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
A
x
T
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
R
S
 
R
F
 
L
A
 
G
A
 
K
Q
 
E
A
 
G
E
 
L
H
 
R
L
 
V
L
 
F
I
 
V
L
 
C
L
x
A
D
 
-
R
|
R
D
x
G
L
 
E
A
 
E
T
 
G
L
 
L
Q
 
R
G
 
T
W
 
T
V
 
L
T
 
K
E
 
E
-
 
L
G
 
R
E
 
E
F
 
A
A
 
G
A
 
V
R
 
E
I
 
A
E
 
D
T
 
G
H
 
R
Q
 
T
A
x
C
N
x
D
I
x
V
A
 
R
D
 
S
L
 
V
A
 
P
S
 
E
L
 
I
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
A
G
 
A
L
 
V
A
 
V
D
 
E
R
 
R
V
 
Y
G
 
G
F
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
V
 
R
C
 
P
D
 
G
E
 
G
N
 
G
E
 
A
P
 
T
E
 
A
D
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
D
-
 
E
-
 
L
W
 
W
H
 
L
K
 
D
V
 
V
I
 
V
S
 
E
I
 
T
N
|
N
L
 
L
N
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
Y
 
R
V
 
V
T
 
T
S
 
K
L
 
Q
C
 
V
L
 
L
P
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
L
 
L
M
 
E
A
 
R
D
 
G
G
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
I
S
x
A
S
|
S
I
x
T
L
x
G
G
 
G
R
 
K
A
x
Q
G
 
G
K
x
V
V
 
V
R
 
H
N
 
A
T
 
A
A
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
R
 
T
R
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
C
P
|
P
A
x
G
W
x
F
I
x
V
D
 
E
T
|
T
P
|
P
M
 
M
L
 
A
Q
 
A
G
 
S
E
 
V
L
 
R
A
 
E
A
 
H
Q
x
Y
A
 
S
R
 
D
I
 
I
A
 
W
G
 
E
I
 
V
T
 
S
H
 
T
E
 
E
Q
 
E
I
 
A
L
 
F
R
 
D
N
 
R
A
 
I
K
 
T
K
 
A
K
 
R
L
 
V
P
 
P
L
 
I
R
 
G
R
 
R
F
 
Y
I
 
V
Q
 
Q
G
 
P
D
 
S
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
M
 
M
V
 
V
R
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
I
S
 
G
P
 
P
Q
 
G
A
 
A
S
 
A
G
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
M
 
N
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
A
x
L
G
 
G

2rh4B Actinorhodin ketoreductase, actkr, with NADPH and inhibitor emodin (see paper)
35% identity, 96% coverage: 8:251/254 of query aligns to 17:266/268 of 2rh4B

query
sites
2rh4B
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
A
x
T
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
R
S
 
R
F
 
L
A
 
G
A
 
K
Q
 
E
A
 
G
E
 
L
H
 
R
L
 
V
L
 
F
I
 
V
L
 
C
L
x
A
D
 
-
R
|
R
D
x
G
L
 
E
A
 
E
T
 
G
L
 
L
Q
 
R
G
 
T
W
 
T
V
 
L
T
 
K
E
 
E
-
 
L
G
 
R
E
 
E
F
 
A
A
 
G
A
 
V
R
 
E
I
 
A
E
 
D
T
 
G
H
 
R
Q
 
T
A
x
C
N
x
D
I
x
V
A
 
R
D
 
S
L
 
V
A
 
P
S
 
E
L
 
I
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
A
G
 
A
L
 
V
A
 
V
D
 
E
R
 
R
V
 
Y
G
 
G
F
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
V
 
R
C
 
P
D
 
G
E
 
G
N
 
G
E
 
A
P
 
T
E
 
A
D
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
D
-
 
E
-
 
L
W
 
W
H
 
L
K
 
D
V
 
V
I
 
V
S
 
E
I
 
T
N
|
N
L
 
L
N
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
Y
 
R
V
 
V
T
 
T
S
 
K
L
 
Q
C
 
V
L
 
L
P
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
L
 
L
M
 
E
A
 
R
D
 
G
G
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
I
S
x
A
S
|
S
I
 
T
L
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
G
 
G
K
 
V
V
 
V
R
 
H
N
 
A
T
 
A
A
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
R
 
T
R
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
C
P
|
P
A
x
G
W
x
F
I
x
V
D
 
E
T
|
T
P
|
P
M
|
M
L
 
A
Q
 
A
G
 
S
E
 
V
L
 
R
A
 
E
A
 
H
Q
x
Y
A
 
S
R
 
D
I
 
I
A
 
W
G
 
E
I
 
V
T
 
S
H
 
T
E
 
E
Q
 
E
I
 
A
L
 
F
R
 
D
N
 
R
A
 
I
K
 
T
K
 
A
K
 
R
L
 
V
P
 
P
L
 
I
R
 
G
R
 
R
F
 
Y
I
 
V
Q
 
Q
G
 
P
D
 
S
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
M
 
M
V
 
V
R
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
I
S
 
G
P
 
P
Q
 
G
A
 
A
S
 
A
G
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
M
 
N
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G

2rh4A Actinorhodin ketoreductase, actkr, with NADPH and inhibitor emodin (see paper)
35% identity, 96% coverage: 8:251/254 of query aligns to 6:255/257 of 2rh4A

query
sites
2rh4A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
A
x
T
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
R
S
 
R
F
 
L
A
 
G
A
 
K
Q
 
E
A
 
G
E
 
L
H
 
R
L
 
V
L
 
F
I
 
V
L
 
C
L
x
A
D
 
-
R
|
R
D
x
G
L
 
E
A
 
E
T
 
G
L
 
L
Q
 
R
G
 
T
W
 
T
V
 
L
T
 
K
E
 
E
-
 
L
G
 
R
E
 
E
F
 
A
A
 
G
A
 
V
R
 
E
I
 
A
E
 
D
T
 
G
H
 
R
Q
 
T
A
x
C
N
x
D
I
x
V
A
 
R
D
 
S
L
 
V
A
 
P
S
 
E
L
 
I
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
A
G
 
A
L
 
V
A
 
V
D
 
E
R
 
R
V
 
Y
G
 
G
F
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
V
 
R
C
 
P
D
 
G
E
 
G
N
 
G
E
 
A
P
 
T
E
 
A
D
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
D
-
 
E
-
 
L
W
 
W
H
 
L
K
 
D
V
 
V
I
 
V
S
 
E
I
 
T
N
|
N
L
 
L
N
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
Y
 
R
V
 
V
T
 
T
S
 
K
L
 
Q
C
 
V
L
 
L
P
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
L
 
L
M
 
E
A
 
R
D
 
G
G
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
I
S
x
A
S
|
S
I
x
T
L
x
G
G
 
G
R
 
K
A
x
Q
G
 
G
K
x
V
V
 
V
R
 
H
N
 
A
T
 
A
A
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
R
 
T
R
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
C
P
|
P
A
x
G
W
x
F
I
x
V
D
 
E
T
|
T
P
|
P
M
|
M
L
 
A
Q
 
A
G
 
S
E
 
V
L
 
R
A
 
E
A
 
H
Q
x
Y
A
 
S
R
 
D
I
 
I
A
 
W
G
 
E
I
 
V
T
 
S
H
 
T
E
 
E
Q
 
E
I
 
A
L
 
F
R
 
D
N
 
R
A
 
I
K
 
T
K
 
A
K
 
R
L
 
V
P
 
P
L
 
I
R
 
G
R
 
R
F
 
Y
I
 
V
Q
 
Q
G
 
P
D
 
S
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
M
 
M
V
 
V
R
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
I
S
 
G
P
 
P
Q
 
G
A
 
A
S
 
A
G
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
M
 
N
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
A
x
L
G
 
G

P16544 Putative ketoacyl reductase; EC 1.3.1.- from Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145) (see 2 papers)
35% identity, 96% coverage: 8:251/254 of query aligns to 10:259/261 of P16544

query
sites
P16544
V
 
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
A
x
T
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
x
L
A
x
E
V
x
I
A
|
A
E
x
R
S
x
R
F
x
L
A
x
G
A
x
K
Q
x
E
A
x
G
E
x
L
H
x
R
L
x
V
L
x
F
I
x
V
L
x
C
L
x
A
D
 
-
R
|
R
D
x
G
L
 
E
A
 
E
T
 
G
L
 
L
Q
 
R
G
 
T
W
 
T
V
 
L
T
 
K
E
 
E
-
 
L
G
 
R
E
 
E
F
 
A
A
 
G
A
 
V
R
 
E
I
 
A
E
 
D
T
 
G
H
 
R
Q
 
T
A
 
C
N
x
D
I
 
V
A
 
R
D
 
S
L
 
V
A
 
P
S
 
E
L
 
I
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
A
G
 
A
L
 
V
A
 
V
D
 
E
R
 
R
V
 
Y
G
 
G
F
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
R
C
 
P
D
 
G
E
 
G
N
 
G
E
 
A
P
 
T
E
 
A
D
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
D
-
 
E
-
 
L
W
 
W
H
 
L
K
 
D
V
 
V
I
 
V
S
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
N
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
Y
 
R
V
 
V
T
 
T
S
 
K
L
 
Q
C
 
V
L
 
L
P
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
L
 
L
M
 
E
A
 
R
D
 
G
G
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
T
L
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
G
 
G
K
 
V
V
 
V
R
 
H
N
 
A
T
 
A
A
 
P
Y
 
Y
C
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
R
 
T
R
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
C
P
 
P
A
 
G
W
 
F
I
 
V
D
 
E
T
 
T
P
 
P
M
 
M
L
 
A
Q
 
A
G
 
S
E
 
V
L
 
R
A
 
E
A
 
H
Q
 
Y
A
 
S
R
 
D
I
 
I
A
 
W
G
 
E
I
 
V
T
 
S
H
 
T
E
 
E
Q
 
E
I
 
A
L
 
F
R
 
D
N
 
R
A
 
I
K
 
T
K
 
A
K
 
R
L
 
V
P
 
P
L
 
I
R
 
G
R
 
R
F
 
Y
I
 
V
Q
 
Q
G
 
P
D
 
S
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
M
 
M
V
 
V
R
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
I
S
 
G
P
 
P
Q
 
G
A
 
A
S
 
A
G
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
M
 
N
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G

1w4zA Structure of actinorhodin polyketide (actiii) reductase (see paper)
35% identity, 96% coverage: 8:251/254 of query aligns to 8:257/259 of 1w4zA

query
sites
1w4zA
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
A
x
T
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
R
S
 
R
F
 
L
A
 
G
A
 
K
Q
 
E
A
 
G
E
 
L
H
 
R
L
 
V
L
 
F
I
 
V
L
 
C
L
x
A
D
 
-
R
|
R
D
x
G
L
 
E
A
 
E
T
 
G
L
 
L
Q
 
R
G
 
T
W
 
T
V
 
L
T
 
K
E
 
E
-
 
L
G
 
R
E
 
E
F
 
A
A
 
G
A
 
V
R
 
E
I
 
A
E
 
D
T
 
G
H
 
R
Q
 
T
A
x
C
N
x
D
I
x
V
A
 
R
D
 
S
L
 
V
A
 
P
S
 
E
L
 
I
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
F
 
V
K
 
A
G
 
A
L
 
V
A
 
V
D
 
E
R
 
R
V
 
Y
G
 
G
F
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
V
 
R
C
 
P
D
 
G
E
 
G
N
 
G
E
 
A
P
 
T
E
 
A
D
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
D
-
 
E
-
 
L
W
 
W
H
 
L
K
 
D
V
 
V
I
 
V
S
 
E
I
 
T
N
|
N
L
 
L
N
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
Y
 
R
V
 
V
T
 
T
S
 
K
L
 
Q
C
 
V
L
 
L
P
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
L
 
L
M
 
E
A
 
R
D
 
G
G
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
I
S
x
A
S
|
S
I
 
T
L
 
G
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
G
 
G
K
 
V
V
 
V
R
 
H
N
 
A
T
 
A
A
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
R
 
T
R
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
C
P
|
P
A
x
G
W
x
F
I
x
V
D
 
E
T
|
T
P
|
P
M
|
M
L
 
A
Q
 
A
G
 
S
E
 
V
L
 
R
A
 
E
A
 
H
Q
x
Y
A
 
S
R
 
D
I
 
I
A
 
W
G
 
E
I
 
V
T
 
S
H
 
T
E
 
E
Q
 
E
I
 
A
L
 
F
R
 
D
N
 
R
A
 
I
K
 
T
K
 
A
K
 
R
L
 
V
P
 
P
L
 
I
R
 
G
R
 
R
F
 
Y
I
 
V
Q
 
Q
G
 
P
D
 
S
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
M
 
M
V
 
V
R
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
I
S
 
G
P
 
P
Q
 
G
A
 
A
S
 
A
G
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
M
 
N
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
A
 
L
G
 
G

5b4tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and a substrate d-3- hydroxybutyrate (see paper)
31% identity, 98% coverage: 1:249/254 of query aligns to 1:256/260 of 5b4tA

query
sites
5b4tA
M
 
M
S
 
L
Q
 
K
L
 
G
R
 
K
T
 
K
I
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
M
A
 
A
E
 
T
S
 
E
F
 
L
A
 
A
A
 
K
Q
 
A
A
 
G
E
 
A
H
 
D
L
 
V
L
 
V
I
 
I
L
x
N
-
x
G
-
x
F
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
E
-
 
D
L
 
I
D
 
E
R
 
R
D
 
E
L
 
R
A
 
S
T
 
T
L
 
L
Q
 
-
G
 
-
W
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
E
G
 
S
E
 
K
F
 
F
A
 
G
A
 
V
R
 
K
I
 
A
E
 
Y
T
 
Y
H
 
L
Q
 
N
A
|
A
N
x
D
I
x
L
A
 
S
D
 
D
L
 
A
A
 
Q
S
 
A
L
 
T
Q
 
R
L
 
D
L
 
F
F
 
I
K
 
A
G
 
K
L
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
A
V
 
L
G
 
G
F
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
C
x
Q
D
 
H
E
 
T
N
 
A
E
 
P
P
 
I
E
 
E
D
 
E
L
 
F
-
 
P
-
 
V
D
 
D
N
 
K
W
 
W
H
 
N
K
 
A
V
 
I
I
 
I
S
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
N
 
S
G
 
A
T
 
V
F
 
F
Y
 
H
V
 
G
T
 
T
S
 
A
L
 
A
C
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
M
A
 
Q
D
 
K
G
 
Q
G
 
G
-
 
W
-
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
I
S
x
A
S
|
S
I
 
A
L
x
H
G
 
G
R
 
L
A
 
V
G
 
A
K
 
S
V
 
V
R
 
N
N
x
K
T
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
N
A
 
A
P
 
G
R
 
K
R
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
C
P
|
P
A
x
G
W
|
W
I
x
V
D
 
R
T
|
T
P
|
P
M
x
L
L
x
V
Q
 
E
G
 
K
E
x
Q
L
 
I
A
 
E
A
 
A
Q
x
I
A
 
S
R
 
Q
I
 
Q
A
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
D
H
 
I
E
 
E
Q
 
A
I
 
A
L
 
A
R
 
R
N
 
E
-
 
L
A
 
L
K
 
A
K
 
E
K
 
K
L
 
Q
P
 
P
L
 
S
R
 
L
R
 
Q
F
 
F
I
 
V
Q
 
T
G
 
P
D
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
G
M
 
A
V
 
A
R
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
P
 
A
Q
 
A
A
 
A
S
 
D
G
 
Q
V
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
T
S
 
T
L
 
L
M
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3w8dA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and an inhibitor methylmalonate
31% identity, 98% coverage: 1:249/254 of query aligns to 1:256/260 of 3w8dA

query
sites
3w8dA
M
 
M
S
 
L
Q
 
K
L
 
G
R
 
K
T
 
K
I
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
M
A
 
A
E
 
T
S
 
E
F
 
L
A
 
A
A
 
K
Q
 
A
A
 
G
E
 
A
H
 
D
L
 
V
L
 
V
I
 
I
L
x
N
-
x
G
-
x
F
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
E
-
 
D
L
 
I
D
 
E
R
 
R
D
 
E
L
 
R
A
 
S
T
 
T
L
 
L
Q
 
-
G
 
-
W
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
E
G
 
S
E
 
K
F
 
F
A
 
G
A
 
V
R
 
K
I
 
A
E
 
Y
T
 
Y
H
 
L
Q
 
N
A
|
A
N
x
D
I
x
L
A
 
S
D
 
D
L
 
A
A
 
Q
S
 
A
L
 
T
Q
 
R
L
 
D
L
 
F
F
 
I
K
 
A
G
 
K
L
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
A
V
 
L
G
 
G
F
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
C
x
Q
D
 
H
E
 
T
N
 
A
E
 
P
P
 
I
E
 
E
D
 
E
L
 
F
-
 
P
-
 
V
D
 
D
N
 
K
W
 
W
H
 
N
K
 
A
V
 
I
I
 
I
S
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
N
 
S
G
 
A
T
 
V
F
 
F
Y
 
H
V
 
G
T
 
T
S
 
A
L
 
A
C
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
M
A
 
Q
D
 
K
G
 
Q
G
 
G
-
 
W
-
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
I
S
x
A
S
|
S
I
 
A
L
x
H
G
 
G
R
 
L
A
 
V
G
 
A
K
 
S
V
 
V
R
 
N
N
x
K
T
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
N
A
 
A
P
 
G
R
 
K
R
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
C
P
|
P
A
x
G
W
|
W
I
x
V
D
 
R
T
|
T
P
|
P
M
x
L
L
x
V
Q
 
E
G
 
K
E
x
Q
L
 
I
A
 
E
A
 
A
Q
x
I
A
 
S
R
 
Q
I
 
Q
A
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
D
H
 
I
E
 
E
Q
 
A
I
 
A
L
 
A
R
 
R
N
 
E
-
 
L
A
 
L
K
 
A
K
 
E
K
 
K
L
 
Q
P
 
P
L
 
S
R
 
L
R
 
Q
F
 
F
I
 
V
Q
 
T
G
 
P
D
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
G
M
 
A
V
 
A
R
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
P
 
A
Q
 
A
A
 
A
S
 
D
G
 
Q
V
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
T
S
 
T
L
 
L
M
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3vdrA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase, prepared in the presence of the substrate d-3-hydroxybutyrate and NAD(+) (see paper)
31% identity, 98% coverage: 1:249/254 of query aligns to 1:256/260 of 3vdrA

query
sites
3vdrA
M
 
M
S
 
L
Q
 
K
L
 
G
R
 
K
T
 
K
I
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
M
A
 
A
E
 
T
S
 
E
F
 
L
A
 
A
A
 
K
Q
 
A
A
 
G
E
 
A
H
 
D
L
 
V
L
 
V
I
 
I
L
 
N
-
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
E
-
 
D
L
 
I
D
 
E
R
 
R
D
 
E
L
 
R
A
 
S
T
 
T
L
 
L
Q
 
-
G
 
-
W
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
E
G
 
S
E
 
K
F
 
F
A
 
G
A
 
V
R
 
K
I
 
A
E
 
Y
T
 
Y
H
 
L
Q
 
N
A
 
A
N
x
D
I
x
L
A
 
S
D
 
D
L
 
A
A
 
Q
S
 
A
L
 
T
Q
 
R
L
 
D
L
 
F
F
 
I
K
 
A
G
 
K
L
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
A
V
 
L
G
 
G
F
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
C
x
Q
D
 
H
E
 
T
N
 
A
E
 
P
P
 
I
E
 
E
D
 
E
L
 
F
-
 
P
-
 
V
D
 
D
N
 
K
W
 
W
H
 
N
K
 
A
V
 
I
I
 
I
S
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
N
 
S
G
 
A
T
 
V
F
 
F
Y
 
H
V
 
G
T
 
T
S
 
A
L
 
A
C
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
M
A
 
Q
D
 
K
G
 
Q
G
 
G
-
 
W
-
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
I
S
x
A
S
|
S
I
 
A
L
x
H
G
 
G
R
 
L
A
 
V
G
 
A
K
 
S
V
 
V
R
 
N
N
x
K
T
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
N
A
 
A
P
 
G
R
 
K
R
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
C
P
|
P
A
x
G
W
|
W
I
x
V
D
 
R
T
|
T
P
 
P
M
x
L
L
x
V
Q
 
E
G
 
K
E
x
Q
L
 
I
A
 
E
A
 
A
Q
x
I
A
 
S
R
 
Q
I
 
Q
A
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
D
H
 
I
E
 
E
Q
 
A
I
 
A
L
 
A
R
 
R
N
 
E
-
 
L
A
 
L
K
 
A
K
 
E
K
 
K
L
 
Q
P
 
P
L
 
S
R
 
L
R
 
Q
F
 
F
I
 
V
Q
 
T
G
 
P
D
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
G
M
 
A
V
 
A
R
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
P
 
A
Q
 
A
A
 
A
S
 
D
G
 
Q
V
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
T
S
 
T
L
 
L
M
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3vdqA Crystal structure of alcaligenes faecalis d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase in complex with NAD(+) and acetate (see paper)
31% identity, 98% coverage: 1:249/254 of query aligns to 1:256/260 of 3vdqA

query
sites
3vdqA
M
 
M
S
 
L
Q
 
K
L
 
G
R
 
K
T
 
K
I
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
V
 
M
A
 
A
E
 
T
S
 
E
F
 
L
A
 
A
A
 
K
Q
 
A
A
 
G
E
 
A
H
 
D
L
 
V
L
 
V
I
 
I
L
x
N
-
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
E
-
 
D
L
 
I
D
 
E
R
 
R
D
 
E
L
 
R
A
 
S
T
 
T
L
 
L
Q
 
-
G
 
-
W
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
E
G
 
S
E
 
K
F
 
F
A
 
G
A
 
V
R
 
K
I
 
A
E
 
Y
T
 
Y
H
 
L
Q
 
N
A
|
A
N
x
D
I
x
L
A
x
S
D
 
D
L
 
A
A
 
Q
S
 
A
L
 
T
Q
 
R
L
 
D
L
 
F
F
 
I
K
 
A
G
 
K
L
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
A
V
 
L
G
 
G
F
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
C
x
Q
D
 
H
E
 
T
N
 
A
E
 
P
P
 
I
E
 
E
D
 
E
L
 
F
-
 
P
-
 
V
D
 
D
N
 
K
W
 
W
H
 
N
K
 
A
V
 
I
I
 
I
S
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
N
 
S
G
 
A
T
 
V
F
 
F
Y
 
H
V
 
G
T
 
T
S
 
A
L
 
A
C
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
M
A
 
Q
D
 
K
G
 
Q
G
 
G
-
 
W
-
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
I
S
x
A
S
|
S
I
 
A
L
x
H
G
 
G
R
 
L
A
 
V
G
 
A
K
 
S
V
 
V
R
 
N
N
x
K
T
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
N
A
 
A
P
 
G
R
 
K
R
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
C
P
|
P
A
x
G
W
|
W
I
x
V
D
 
R
T
|
T
P
|
P
M
x
L
L
x
V
Q
 
E
G
 
K
E
x
Q
L
 
I
A
 
E
A
 
A
Q
x
I
A
 
S
R
 
Q
I
 
Q
A
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
D
H
 
I
E
 
E
Q
 
A
I
 
A
L
 
A
R
 
R
N
 
E
-
 
L
A
 
L
K
 
A
K
 
E
K
 
K
L
 
Q
P
 
P
L
 
S
R
 
L
R
 
Q
F
 
F
I
 
V
Q
 
T
G
 
P
D
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
G
M
 
A
V
 
A
R
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
P
 
A
Q
 
A
A
 
A
S
 
D
G
 
Q
V
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
T
S
 
T
L
 
L
M
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5t5qC Crystal structure of short-chain dehydrogenase/reductase sdr:glucose/ribitol dehydrogenase from brucella melitensis
34% identity, 96% coverage: 5:249/254 of query aligns to 8:241/245 of 5t5qC

query
sites
5t5qC
R
 
R
T
 
T
I
 
L
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
x
N
N
x
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
E
S
 
L
F
 
F
A
 
H
A
 
A
Q
 
S
A
 
G
E
 
A
H
 
N
L
 
L
L
 
-
I
 
V
L
 
L
L
 
T
D
|
D
R
x
L
D
|
D
L
 
R
A
 
E
T
 
G
L
 
L
Q
 
D
G
 
A
W
 
F
V
 
A
T
 
A
E
 
S
G
 
L
E
 
G
F
 
S
A
 
P
A
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
A
T
 
T
H
 
I
Q
 
K
A
|
A
N
x
D
I
x
A
A
 
S
D
 
S
L
 
A
A
 
D
S
 
D
L
 
A
Q
 
E
L
 
K
L
 
T
F
 
V
K
 
A
G
 
L
L
 
A
A
 
M
D
 
E
R
 
R
V
 
F
G
 
G
F
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
P
S
|
S
A
|
A
G
|
G
V
x
I
C
 
Y
D
 
Q
E
 
A
N
 
K
-
 
P
-
 
F
-
 
A
E
 
E
P
 
M
E
 
S
D
 
D
L
 
A
D
 
D
N
 
-
W
 
W
H
 
H
K
 
R
V
 
T
I
 
I
S
 
S
I
|
I
N
 
N
L
 
L
N
 
D
G
 
G
T
 
V
F
 
F
Y
 
Y
V
 
L
T
 
C
S
 
K
L
 
R
C
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
A
M
 
L
A
 
K
D
 
E
G
 
D
G
 
S
R
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
T
M
x
L
S
x
A
S
|
S
I
 
L
L
 
A
G
 
A
R
 
Y
A
 
R
G
 
G
K
 
A
V
 
Y
R
 
V
N
|
N
T
 
A
A
 
H
Y
|
Y
C
 
G
A
 
A
S
 
T
K
|
K
H
 
G
G
 
A
I
 
M
I
 
V
G
 
S
M
 
M
T
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
R
D
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
-
R
 
K
I
 
T
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
V
L
 
S
P
|
P
A
x
G
W
 
I
I
|
I
D
 
E
T
|
T
P
 
P
M
|
M
L
 
T
Q
 
S
G
 
E
E
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
T
Q
 
R
A
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
-
T
 
-
H
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
L
 
M
R
 
D
N
 
E
A
 
T
K
 
M
K
 
T
K
 
Q
L
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
K
R
 
R
F
 
L
I
 
G
Q
 
K
G
 
P
D
 
S
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
S
M
 
V
V
 
I
R
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
F
V
 
V
T
 
T
A
 
G
Q
 
E
S
 
T
L
 
I
M
 
Q
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
33% identity, 97% coverage: 3:249/254 of query aligns to 6:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
Q
 
Q
L
 
D
R
 
K
T
 
V
I
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
|
A
N
|
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
V
 
A
A
 
A
E
 
R
S
 
V
F
 
F
A
 
M
A
 
K
Q
 
E
A
 
G
E
 
A
H
 
K
L
 
V
L
 
V
I
 
I
L
 
A
L
 
-
D
|
D
R
x
F
D
x
N
L
 
E
A
 
A
T
 
A
L
 
G
Q
 
K
G
 
E
W
 
A
V
 
V
T
 
E
E
 
A
G
 
N
E
 
P
F
 
G
A
 
V
A
 
V
R
 
F
I
 
I
E
 
-
T
 
-
H
 
-
Q
 
R
A
x
V
N
x
D
I
x
V
A
 
S
D
 
D
L
 
R
A
 
E
S
 
S
L
 
V
Q
 
H
L
 
R
L
 
L
F
 
V
K
 
E
G
 
N
L
 
V
A
 
A
D
 
E
R
 
R
V
 
F
G
 
G
F
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
C
x
T
D
 
R
E
x
D
N
 
S
-
 
M
-
 
L
E
 
S
P
x
K
E
 
M
D
 
T
L
 
V
D
 
D
N
 
Q
W
 
F
H
 
Q
K
 
Q
V
 
V
I
 
I
S
 
N
I
x
V
N
|
N
L
 
L
N
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
Y
 
H
V
 
C
T
 
T
S
 
Q
L
 
A
C
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
Y
M
 
M
A
 
A
D
 
E
-
 
Q
-
 
G
G
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
T
S
|
S
S
|
S
I
 
V
L
x
T
G
 
G
R
 
T
A
 
Y
G
 
G
K
x
N
V
|
V
R
x
G
N
x
Q
T
 
T
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
M
T
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
W
A
 
A
L
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
R
 
K
R
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
A
P
|
P
A
x
G
W
x
F
I
x
T
D
 
E
T
|
T
P
x
A
M
|
M
L
x
V
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
A
R
 
E
I
 
V
A
 
P
G
 
-
I
 
-
T
 
-
H
 
-
E
 
E
Q
 
K
I
 
V
L
 
I
R
 
E
N
x
K
A
 
M
K
 
K
K
 
A
K
 
Q
L
 
V
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
R
F
 
L
I
 
G
Q
 
K
G
 
P
D
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
M
 
A
V
 
Y
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
H
Q
 
E
A
 
S
S
 
D
G
 
Y
V
 
V
T
 
N
A
 
G
Q
 
H
S
 
V
L
 
L
M
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
34% identity, 97% coverage: 3:249/254 of query aligns to 4:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
Q
 
Q
L
 
G
R
 
K
T
 
V
I
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
N
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
I
S
 
N
F
 
L
A
 
A
A
 
K
Q
 
E
A
 
G
E
 
A
H
 
N
L
 
I
L
 
F
I
 
F
L
x
N
L
x
Y
D
x
N
-
x
G
R
x
S
D
 
P
L
 
E
A
 
A
T
 
A
L
 
E
Q
 
E
G
 
T
W
 
A
V
 
K
T
 
L
E
 
V
G
 
A
E
 
E
F
 
H
A
 
G
A
 
V
R
 
E
I
 
V
E
 
E
T
 
A
H
 
M
Q
 
K
A
|
A
N
|
N
I
x
V
A
 
A
D
 
I
L
 
A
A
 
E
S
 
D
L
 
V
Q
 
D
L
 
A
L
 
F
F
 
F
K
 
K
G
 
Q
L
 
A
A
 
I
D
 
E
R
 
R
V
 
F
G
 
G
F
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
C
 
T
D
 
R
E
 
D
N
 
N
E
 
L
P
 
L
E
 
M
D
 
R
L
 
M
-
 
K
-
 
E
D
 
D
N
 
E
W
 
W
H
 
D
K
 
D
V
 
V
I
 
I
S
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
L
N
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
Y
 
L
V
 
C
T
 
T
S
 
K
L
 
A
C
 
V
L
 
S
P
 
R
L
 
T
M
 
M
A
 
M
D
 
K
-
 
Q
-
 
R
G
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
M
S
x
A
S
|
S
I
 
V
L
 
V
G
 
G
R
 
L
A
 
I
G
 
G
K
 
N
V
 
A
R
 
G
N
x
Q
T
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
H
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
T
L
 
T
A
 
A
L
 
R
D
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
R
R
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
A
P
|
P
A
x
G
W
 
F
I
|
I
D
 
T
T
|
T
P
 
D
M
 
M
L
 
T
Q
 
D
G
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
K
I
 
L
A
 
D
G
 
E
I
 
K
T
 
T
H
 
K
E
 
E
Q
 
A
I
 
M
L
 
L
R
 
-
N
 
-
A
 
-
K
 
-
K
 
A
K
 
Q
L
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
A
F
 
Y
I
 
G
Q
 
T
G
 
T
D
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
M
 
A
V
 
V
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
Q
 
A
A
 
S
S
 
K
G
 
Y
V
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
M
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2ztlA Closed conformation of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase complexed with NAD+ and l-3-hydroxybutyrate (see paper)
31% identity, 98% coverage: 1:249/254 of query aligns to 1:256/260 of 2ztlA

query
sites
2ztlA
M
 
M
S
 
L
Q
 
K
L
 
G
R
 
K
T
 
V
I
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
N
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
G
V
 
I
A
 
A
E
 
T
S
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
G
E
 
A
H
 
D
L
 
I
L
 
V
I
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
L
Q
x
N
G
|
G
W
x
F
V
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
G
E
 
D
F
 
-
A
 
A
A
 
A
R
 
E
I
 
I
E
 
E
T
 
K
H
 
V
Q
 
R
A
 
A
N
 
G
I
 
L
A
 
A
D
 
A
L
 
Q
A
 
H
S
 
G
L
 
V
Q
 
K
L
 
V
L
 
L
F
 
Y
-
 
D
-
 
G
-
x
A
-
x
D
-
x
L
-
 
S
-
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
V
K
 
R
G
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
D
-
 
N
-
 
A
-
 
V
-
 
R
R
 
Q
V
 
M
G
 
G
F
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
S
x
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
C
x
Q
D
 
H
E
 
T
N
 
A
E
 
L
P
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
F
-
 
P
-
 
T
D
 
E
N
 
K
W
 
W
H
 
D
K
 
A
V
 
I
I
 
L
S
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
N
 
S
G
 
A
T
 
V
F
 
F
Y
 
H
V
 
G
T
 
T
S
 
A
L
 
A
C
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
H
M
 
M
A
 
K
D
 
K
G
 
Q
G
 
G
-
 
F
-
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
I
S
x
A
S
|
S
I
 
A
L
x
H
G
 
G
R
 
L
A
 
V
G
 
A
K
 
S
V
 
A
R
 
N
N
x
K
T
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
T
A
 
A
P
 
G
R
 
Q
R
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
C
P
|
P
A
x
G
W
|
W
I
x
V
D
 
R
T
|
T
P
|
P
M
x
L
L
x
V
Q
 
E
G
 
K
E
x
Q
L
 
I
A
 
S
A
 
A
Q
x
L
A
 
A
R
 
E
I
 
K
A
 
N
G
 
G
I
 
V
T
 
D
H
 
Q
E
 
E
Q
 
T
I
 
A
L
 
A
R
 
R
N
 
E
-
 
L
A
 
L
K
 
S
K
 
E
K
 
K
L
 
Q
P
 
P
L
 
S
R
 
L
R
 
Q
F
 
F
I
 
V
Q
 
T
G
 
P
D
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
G
M
 
T
V
 
A
R
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
Q
 
A
A
 
A
S
 
A
G
 
Q
V
 
I
T
 
T
A
 
G
Q
 
T
S
 
T
L
 
V
M
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1wmbA Crystal structure of NAD dependent d-3-hydroxybutylate dehydrogenase (see paper)
31% identity, 98% coverage: 1:249/254 of query aligns to 1:256/260 of 1wmbA

query
sites
1wmbA
M
 
M
S
 
L
Q
 
K
L
 
G
R
 
K
T
 
V
I
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
T
N
 
S
G
|