SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_3786 FitnessBrowser__Putida:PP_3786 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6l1nA Substrate bound bacf structure from bacillus subtillis (see paper)
29% identity, 87% coverage: 23:372/402 of query aligns to 21:369/393 of 6l1nA

query
sites
6l1nA
F
 
F
K
 
Q
W
 
K
V
 
V
R
 
K
T
 
E
L
 
M
K
 
K
S
 
T
S
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
G
Q
 
A
P
 
H
L
 
I
L
 
I
D
 
N
F
 
L
G
 
G
V
 
Q
A
 
G
D
 
N
A
 
P
F
 
D
I
 
L
P
 
P
P
 
T
A
 
P
D
 
P
E
 
H
L
 
I
S
 
V
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
R
S
 
E
L
 
A
A
 
S
T
 
L
R
 
N
R
 
P
E
 
S
L
 
F
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
V
 
G
-
 
P
-
 
F
-
 
R
-
 
G
Y
 
Y
H
 
P
H
 
F
S
 
L
A
 
K
Y
 
E
E
 
A
A
 
I
A
 
A
C
 
A
L
 
F
R
 
Y
H
 
K
A
 
R
T
 
E
Q
 
Y
G
 
G
M
 
V
D
 
T
A
 
I
P
 
N
P
 
P
A
 
E
L
 
T
A
 
E
V
 
V
L
 
A
P
 
L
T
 
F
S
 
G
G
 
G
A
x
G
K
 
K
S
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
Y
L
 
V
L
 
L
C
 
T
L
 
Q
A
 
C
L
 
L
I
 
L
D
 
N
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
I
I
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
P
T
 
N
P
 
P
A
 
G
Y
|
Y
P
 
P
I
 
E
F
 
Y
S
 
L
T
 
S
I
 
G
A
 
I
R
 
T
R
 
M
M
 
A
G
 
R
A
 
A
T
 
E
V
 
L
V
 
Y
H
 
E
L
 
M
P
 
P
L
 
L
L
 
Y
E
 
E
E
 
E
N
 
N
D
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
D
 
D
L
 
F
H
 
E
Q
 
K
L
 
I
S
 
D
P
 
P
E
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
E
R
 
K
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
M
I
 
F
V
 
L
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
A
V
 
V
A
 
A
S
 
D
Q
 
A
Q
 
A
E
 
F
C
 
Y
D
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
A
A
 
A
I
 
F
C
 
A
R
 
K
D
 
E
H
 
H
D
 
N
I
 
I
L
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
H
D
|
D
A
 
F
A
 
A
Y
|
Y
S
 
G
D
 
A
L
 
F
L
 
E
P
 
F
A
 
D
E
 
Q
R
 
K
P
 
P
R
 
-
G
 
A
R
 
S
F
 
F
L
 
L
Y
 
E
S
 
A
E
 
E
G
 
D
A
 
A
S
 
K
S
 
T
H
 
V
C
 
G
I
 
A
E
 
E
V
 
L
H
 
Y
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
 
K
S
 
T
L
 
F
Q
 
N
I
 
M
P
 
A
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
M
G
 
A
F
 
F
I
 
A
L
 
V
A
 
G
A
 
N
P
 
E
A
 
K
I
 
I
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
L
 
V
G
 
N
K
 
E
L
 
F
S
 
Q
L
 
D
L
 
H
H
 
V
E
 
F
S
 
V
G
 
G
Q
 
M
P
 
F
R
 
G
I
 
G
L
 
L
L
 
Q
D
 
Q
A
 
A
V
 
A
T
 
S
C
 
A
I
 
A
L
 
L
D
 
S
-
 
G
D
 
D
R
 
P
G
 
E
F
 
H
A
 
T
E
 
E
R
 
S
L
 
L
C
 
K
Q
 
R
C
 
I
I
 
Y
A
 
K
Q
 
E
R
 
R
R
 
I
A
 
D
V
 
F
M
 
F
V
 
T
D
 
A
I
 
L
L
 
C
Q
 
E
A
 
K
H
 
E
-
 
L
G
 
G
L
 
W
E
 
K
V
 
M
L
 
E
N
 
K
A
 
P
D
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
F
x
Y
V
 
V
Y
 
W
V
 
A
R
 
E
C
 
I
P
 
P
A
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
N
 
-
G
 
-
R
 
N
T
 
T
F
 
F
A
 
E
T
 
T
A
 
S
R
 
H
D
 
Q
F
 
F
S
 
S
Q
 
D
Y
 
Y
L
 
L
A
 
L
T
 
E
E
 
H
L
 
A
G
 
H
I
 
V
L
 
V
T
 
V
I
 
T
P
 
P
Y
 
G
Q
 
E
V
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
S
A
 
N
G
 
G
R
 
K
H
 
R
Q
 
H
V
 
V
R
|
R
F
 
I
S
 
S
V
 
M

Sites not aligning to the query:

6l1lB Apo-bacf structure from bacillus subtillis (see paper)
28% identity, 87% coverage: 23:372/402 of query aligns to 21:370/393 of 6l1lB

query
sites
6l1lB
F
 
F
K
 
Q
W
 
K
V
 
V
R
 
K
T
 
E
L
 
M
K
 
E
S
 
K
S
 
T
T
 
-
A
 
-
G
 
G
Q
 
A
P
 
H
L
 
I
L
 
I
D
 
N
F
 
L
G
 
G
V
 
Q
A
 
G
D
 
N
A
 
P
F
 
D
I
 
L
P
 
P
P
 
T
A
 
P
D
 
P
E
 
H
L
 
I
S
 
V
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
R
S
 
E
L
 
A
A
 
S
T
 
L
R
 
N
R
 
P
E
 
S
L
 
F
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
V
 
G
-
 
P
-
 
F
-
 
R
-
 
G
Y
 
Y
H
 
P
H
 
F
S
 
L
A
 
K
Y
 
E
E
 
A
A
 
I
A
 
A
C
 
A
L
 
F
R
 
Y
H
 
K
A
 
R
T
 
E
Q
 
Y
G
 
G
M
 
V
D
 
T
A
 
I
P
 
N
P
 
P
A
 
E
L
 
T
A
 
E
V
 
V
L
 
A
P
 
L
T
 
F
S
 
G
G
 
G
A
x
G
K
|
K
S
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
Y
L
 
V
L
 
L
C
 
T
L
 
Q
A
 
C
L
 
L
I
 
L
D
 
N
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
I
I
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
P
T
 
N
P
 
P
A
 
G
Y
|
Y
P
 
P
I
 
E
F
 
Y
S
 
L
T
 
S
I
 
G
A
 
I
R
 
T
R
 
M
M
 
A
G
 
R
A
 
A
T
 
E
V
 
L
V
 
Y
H
 
E
L
 
M
P
 
P
L
 
L
L
 
Y
E
 
E
E
 
E
N
 
N
D
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
D
 
D
L
 
F
H
 
E
Q
 
K
L
 
I
S
 
D
P
 
P
E
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
E
R
 
K
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
M
I
 
F
V
 
L
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
A
V
 
V
A
 
A
S
 
D
Q
 
A
Q
 
A
E
 
F
C
 
Y
D
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
A
A
 
A
I
 
F
C
 
A
R
 
K
D
 
E
H
 
H
D
 
N
I
 
I
L
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
H
D
|
D
A
 
F
A
 
A
Y
|
Y
S
 
G
D
 
A
L
 
F
L
 
E
P
 
F
A
 
D
E
 
Q
R
 
K
P
 
P
R
 
-
G
 
A
R
 
S
F
 
F
L
 
L
Y
 
E
S
 
A
E
 
E
G
 
D
A
 
A
S
 
K
S
 
T
H
 
V
C
 
G
I
 
A
E
 
E
V
 
L
H
 
Y
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
 
K
S
 
T
L
 
F
Q
 
N
I
 
M
P
 
A
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
M
G
 
A
F
 
F
I
 
A
L
 
V
A
 
G
A
 
N
P
 
E
A
 
K
I
 
I
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
L
 
V
G
 
N
K
 
E
L
 
F
S
 
Q
L
 
D
L
 
H
H
 
V
E
 
F
S
 
V
G
 
G
Q
 
M
P
 
F
R
 
G
I
 
G
L
 
L
L
 
Q
D
 
Q
A
 
A
V
 
A
T
 
S
C
 
A
I
 
A
L
 
L
D
 
S
-
 
G
D
 
D
R
 
P
G
 
E
F
 
H
A
 
T
E
 
E
R
 
S
L
 
L
C
 
K
Q
 
R
C
 
I
I
 
Y
A
 
K
Q
 
E
R
 
R
R
 
I
A
 
D
V
 
F
M
 
F
V
 
T
D
 
A
I
 
L
L
 
C
Q
 
E
A
 
K
H
 
E
-
 
L
G
 
G
L
 
W
E
 
K
V
 
M
L
 
E
N
 
K
A
 
P
D
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
F
 
Y
V
 
V
Y
 
W
V
 
A
R
 
E
C
 
I
P
 
P
A
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
N
 
-
G
 
-
R
 
N
T
 
T
F
 
F
A
 
E
T
 
T
A
 
S
R
 
H
D
 
Q
F
 
F
S
 
S
Q
 
D
Y
 
Y
L
 
L
A
 
L
T
 
E
E
 
H
L
 
A
G
 
H
I
 
V
L
 
V
T
 
V
I
 
T
P
 
P
Y
 
G
Q
 
E
V
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
S
A
 
N
G
 
G
R
 
K
H
 
R
Q
 
H
V
 
V
R
 
R
F
 
I
S
 
S
V
 
M

6l1oB Product bound bacf structure from bacillus subtillis (see paper)
28% identity, 87% coverage: 23:372/402 of query aligns to 21:370/392 of 6l1oB

query
sites
6l1oB
F
 
F
K
 
Q
W
 
K
V
 
V
R
 
K
T
 
E
L
 
M
K
 
E
S
 
K
S
 
T
T
 
-
A
 
-
G
 
G
Q
 
A
P
 
H
L
 
I
L
 
I
D
 
N
F
 
L
G
 
G
V
x
Q
A
x
G
D
 
N
A
 
P
F
 
D
I
 
L
P
 
P
P
 
T
A
 
P
D
 
P
E
 
H
L
 
I
S
 
V
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
R
S
 
E
L
 
A
A
 
S
T
 
L
R
 
N
R
 
P
E
 
S
L
 
F
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
V
 
G
-
 
P
-
 
F
-
 
R
-
 
G
Y
 
Y
H
 
P
H
 
F
S
 
L
A
 
K
Y
 
E
E
 
A
A
 
I
A
 
A
C
 
A
L
 
F
R
 
Y
H
 
K
A
 
R
T
 
E
Q
 
Y
G
 
G
M
 
V
D
 
T
A
 
I
P
 
N
P
 
P
A
 
E
L
 
T
A
 
E
V
 
V
L
 
A
P
 
L
T
 
F
S
 
G
G
 
G
A
x
G
K
|
K
S
 
A
A
 
G
L
 
L
N
 
Y
L
 
V
L
 
L
C
 
T
L
 
Q
A
 
C
L
 
L
I
 
L
D
 
N
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
I
I
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
P
T
 
N
P
 
P
A
 
G
Y
|
Y
P
 
P
I
x
E
F
 
Y
S
 
L
T
 
S
I
 
G
A
 
I
R
 
T
R
 
M
M
 
A
G
 
R
A
 
A
T
 
E
V
 
L
V
 
Y
H
 
E
L
 
M
P
 
P
L
 
L
L
 
Y
E
 
E
E
 
E
N
 
N
D
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
D
 
D
L
 
F
H
 
E
Q
 
K
L
 
I
S
 
D
P
 
P
E
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
E
R
 
K
A
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
M
I
 
F
V
 
L
N
|
N
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
A
V
 
V
A
 
A
S
 
D
Q
 
A
Q
 
A
E
 
F
C
 
Y
D
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
A
A
 
A
I
 
F
C
 
A
R
 
K
D
 
E
H
 
H
D
 
N
I
 
I
L
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
H
D
|
D
A
 
F
A
 
A
Y
|
Y
S
 
G
D
 
A
L
 
F
L
 
E
P
 
F
A
 
D
E
 
Q
R
 
K
P
 
P
R
 
-
G
 
A
R
 
S
F
 
F
L
 
L
Y
 
E
S
 
A
E
 
E
G
 
D
A
 
A
S
 
K
S
 
T
H
 
V
C
 
G
I
 
A
E
 
E
V
 
L
H
 
Y
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
|
K
S
 
T
L
 
F
Q
 
N
I
 
M
P
 
A
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
M
G
 
A
F
 
F
I
 
A
L
 
V
A
 
G
A
 
N
P
 
E
A
 
K
I
 
I
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
L
 
V
G
 
N
K
 
E
L
 
F
S
 
Q
L
 
D
L
 
H
H
 
V
E
 
F
S
 
V
G
 
G
Q
 
M
P
 
F
R
 
G
I
 
G
L
 
L
L
 
Q
D
 
Q
A
 
A
V
 
A
T
 
S
C
 
A
I
 
A
L
 
L
D
 
S
-
 
G
D
 
D
R
 
P
G
 
E
F
 
H
A
 
T
E
 
E
R
 
S
L
 
L
C
 
K
Q
 
R
C
 
I
I
 
Y
A
 
K
Q
 
E
R
 
R
R
 
I
A
 
D
V
 
F
M
 
F
V
 
T
D
 
A
I
 
L
L
 
C
Q
 
E
A
 
K
H
 
E
-
 
L
G
 
G
L
 
W
E
 
K
V
 
M
L
 
E
N
 
K
A
 
P
D
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
F
x
Y
V
 
V
Y
 
W
V
 
A
R
 
E
C
 
I
P
 
P
A
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
N
 
-
G
 
-
R
 
N
T
 
T
F
 
F
A
 
E
T
 
T
A
 
S
R
 
H
D
 
Q
F
 
F
S
 
S
Q
 
D
Y
 
Y
L
 
L
A
 
L
T
 
E
E
 
H
L
 
A
G
 
H
I
 
V
L
 
V
T
 
V
I
 
T
P
 
P
Y
 
G
Q
 
E
V
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
S
A
 
N
G
 
G
R
 
K
H
 
R
Q
 
H
V
 
V
R
|
R
F
 
I
S
 
S
V
 
M

Sites not aligning to the query:

2x5dD Crystal structure of a probable aminotransferase from pseudomonas aeruginosa (see paper)
25% identity, 89% coverage: 35:393/402 of query aligns to 16:372/380 of 2x5dD

query
sites
2x5dD
G
 
G
Q
 
E
P
 
D
L
 
I
L
 
I
D
 
D
F
 
L
G
 
S
V
 
M
A
 
G
D
 
N
A
 
P
F
 
D
I
 
G
P
 
P
P
 
T
A
 
P
D
 
P
E
 
H
L
 
I
S
 
V
Q
 
E
A
 
K
L
 
L
S
 
C
S
 
T
L
 
V
A
 
A
T
 
Q
R
 
R
R
 
E
E
 
D
L
 
T
H
 
H
G
 
G
Y
 
Y
V
 
-
Y
 
-
H
 
-
H
 
S
S
 
T
A
 
S
Y
 
R
E
 
G
A
 
I
A
 
P
C
 
R
L
 
L
R
 
R
H
 
R
A
 
A
T
 
I
Q
 
S
-
 
H
-
 
W
-
 
Y
-
 
R
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
G
 
D
M
 
V
D
 
Q
A
 
I
P
 
D
P
 
P
A
 
E
L
 
S
A
 
E
V
 
A
L
 
I
P
 
V
T
 
T
S
 
I
G
|
G
A
x
S
K
|
K
S
 
E
A
 
G
L
 
L
N
 
A
L
 
H
L
 
L
C
 
M
L
 
L
A
 
A
L
 
T
I
 
L
D
 
D
T
 
H
G
 
G
D
 
D
V
 
T
I
 
I
L
 
L
A
 
V
T
 
P
T
 
N
P
 
P
A
 
S
Y
|
Y
P
 
P
I
 
I
F
 
H
S
 
I
T
 
Y
I
 
G
A
 
A
R
 
V
R
 
I
M
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
V
 
V
V
 
R
H
 
S
L
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
V
E
 
P
E
 
G
N
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
F
P
 
N
D
 
E
L
 
L
H
 
E
Q
 
R
L
 
A
S
 
I
P
 
R
E
 
E
V
 
S
L
 
I
A
 
P
R
 
K
A
 
P
K
 
R
L
 
M
L
 
M
I
 
I
V
 
L
N
 
G
Y
 
F
P
 
P
N
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
A
K
 
Q
V
 
C
A
 
V
S
 
E
Q
 
L
Q
 
D
E
 
F
C
 
F
D
 
E
R
 
R
L
 
V
L
 
V
A
 
A
I
 
L
C
 
A
R
 
K
D
 
Q
H
 
Y
D
 
D
I
 
V
L
 
M
L
 
V
I
 
V
N
 
H
D
|
D
A
 
L
A
|
A
Y
|
Y
S
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
V
P
 
Y
A
 
D
E
 
G
R
 
W
P
 
K
R
 
A
G
 
P
R
 
S
F
 
I
L
 
M
Y
 
Q
S
 
V
E
 
P
G
 
G
A
 
A
S
 
K
S
 
D
H
 
I
C
 
A
I
 
V
E
 
E
V
 
F
H
 
F
S
x
T
F
 
L
S
|
S
K
|
K
S
 
S
L
 
Y
Q
 
N
I
 
M
P
 
A
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
I
G
 
G
F
 
F
I
 
M
L
 
V
A
 
G
A
 
N
P
 
P
A
 
E
I
 
L
I
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
R
L
 
I
S
 
K
L
 
S
L
 
Y
H
 
H
E
 
D
S
 
Y
G
 
G
Q
 
T
-
 
F
P
 
T
R
 
P
I
 
L
L
 
Q
L
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
A
C
 
A
I
 
L
L
 
E
D
 
G
D
 
D
R
 
Q
G
 
Q
F
 
C
A
 
V
E
 
R
R
 
D
L
 
I
C
 
A
Q
 
R
C
 
Q
I
 
Y
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
A
 
D
V
 
V
M
 
L
V
 
V
D
 
K
I
 
G
L
 
L
Q
 
R
A
 
E
H
 
A
G
 
G
L
 
W
E
 
M
V
 
V
L
 
E
N
 
N
A
 
P
D
 
K
G
 
A
T
 
S
F
 
M
F
 
Y
V
 
V
Y
 
W
V
 
A
R
 
K
C
 
I
P
 
P
A
 
E
A
 
P
V
 
Y
S
 
A
N
 
H
G
 
L
R
 
G
T
 
S
F
 
L
A
 
E
T
 
F
A
 
A
R
 
K
D
 
K
F
 
L
S
 
L
Q
 
Q
Y
 
D
L
 
A
A
 
K
T
 
V
E
 
S
L
 
V
G
 
S
I
 
-
L
 
P
T
 
G
I
 
I
P
 
G
Y
 
F
Q
 
G
V
 
D
A
 
Y
G
 
G
R
 
D
H
 
D
Q
 
H
V
 
V
R
 
R
F
 
F
S
 
A
V
 
L
A
 
I
F
 
-
C
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
E
V
 
N
F
 
R
N
 
D
R
 
R
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
V
S
 
R
N
 
G
V
 
I
Q
 
K

P14909 Aspartate aminotransferase; AspAT; Transaminase A; EC 2.6.1.1 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see 3 papers)
25% identity, 86% coverage: 32:378/402 of query aligns to 31:383/402 of P14909

query
sites
P14909
S
 
K
T
 
T
A
 
K
G
 
K
Q
 
I
P
 
K
L
 
I
L
 
I
D
 
D
F
 
F
G
 
G
V
 
I
A
 
G
D
 
Q
A
 
P
F
 
D
I
 
L
P
 
P
P
 
T
A
 
F
D
 
K
E
 
R
L
 
I
S
 
R
Q
 
D
A
 
A
L
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
A
T
 
K
R
 
E
R
 
A
E
 
L
L
 
D
H
 
Q
G
 
G
Y
 
F
V
 
T
Y
 
F
H
 
Y
H
 
T
S
 
S
A
 
A
Y
 
F
E
 
G
A
 
I
A
 
D
C
 
E
L
 
L
R
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
A
-
 
Q
-
 
Y
-
 
L
H
 
N
A
 
T
T
 
R
Q
 
Y
G
 
G
M
 
T
D
 
D
A
 
V
P
 
K
P
 
K
A
 
E
L
 
-
A
 
E
V
 
V
L
 
I
P
 
V
T
 
T
S
 
P
G
 
G
A
 
A
K
 
K
S
 
P
A
 
A
L
 
L
N
 
F
L
 
L
L
 
V
C
 
F
L
 
I
A
 
L
L
 
Y
I
 
I
D
 
N
T
 
P
G
 
S
D
 
D
V
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
L
T
 
P
T
 
D
P
 
P
A
 
S
Y
 
F
P
 
Y
I
 
S
F
 
Y
S
 
A
T
 
E
I
 
V
A
 
V
R
 
K
R
 
L
M
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
K
V
 
P
V
 
I
H
 
Y
-
 
A
-
 
N
L
 
L
P
 
K
L
 
W
L
 
S
E
 
R
E
 
E
N
 
E
D
 
G
F
 
F
L
 
S
P
 
I
D
 
D
L
 
V
H
 
D
Q
 
D
L
 
L
S
 
Q
P
 
S
E
 
K
V
 
I
L
 
S
A
 
K
R
 
R
A
 
T
K
 
K
L
 
M
L
 
I
I
 
V
V
 
F
N
 
N
Y
 
N
P
 
P
N
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
T
V
 
L
A
 
F
S
 
S
Q
 
P
Q
 
N
E
 
D
C
 
V
D
 
K
R
 
K
L
 
I
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
S
R
 
R
D
 
D
H
 
N
D
x
K
I
 
I
L
 
I
L
 
L
I
 
L
N
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
I
Y
 
Y
S
 
D
D
 
N
L
 
F
L
 
V
P
 
Y
A
 
E
E
 
G
R
 
K
P
 
M
R
 
R
G
 
S
R
 
T
F
 
-
L
 
L
Y
 
E
S
 
D
E
 
S
G
 
D
A
 
W
S
 
R
S
 
D
H
 
F
C
 
L
I
 
I
E
 
Y
V
 
V
H
 
N
S
 
G
F
 
F
S
 
S
K
 
K
S
 
T
L
 
F
Q
 
S
I
 
M
P
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
R
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
K
P
 
R
A
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
Q
A
 
K
L
 
M
G
 
G
K
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
A
L
 
N
H
 
V
E
 
Y
S
 
T
G
 
A
Q
 
P
P
 
T
R
 
S
I
 
F
L
 
V
L
 
Q
D
 
K
A
 
A
V
 
A
T
 
V
C
 
K
I
 
A
L
 
F
D
 
D
D
 
T
R
 
F
G
 
D
F
 
E
A
 
V
E
 
N
R
 
Q
L
 
M
C
 
V
Q
 
S
C
 
L
I
 
F
A
 
K
Q
 
K
R
 
R
R
 
R
A
 
D
V
 
V
M
 
M
V
 
Y
D
 
D
I
 
E
L
 
L
-
 
T
Q
 
K
A
 
V
H
 
K
G
 
G
L
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
S
N
 
K
A
 
P
D
 
N
G
 
G
T
 
A
F
 
F
F
 
Y
V
 
M
Y
 
F
V
 
P
R
 
N
C
 
V
P
 
S
A
 
K
A
 
I
V
 
L
S
 
K
N
 
T
G
 
-
R
 
-
T
 
S
F
 
G
A
 
F
T
 
D
A
 
V
R
 
K
D
 
S
F
 
L
S
 
A
Q
 
I
Y
 
K
L
 
L
A
 
I
T
 
E
E
 
E
L
 
K
G
 
G
I
 
V
L
 
V
T
 
T
I
 
I
P
 
P
Y
 
G
Q
 
E
V
 
V
-
 
F
-
 
P
-
 
L
-
 
N
A
 
I
G
 
G
R
 
K
H
 
E
Q
 
F
V
 
L
R
 
R
F
 
L
S
 
S
V
 
F
A
 
A
F
 
V
C
 
N
G
 
E
E
 
E
A
 
V

Sites not aligning to the query:

1gdeA Crystal structure of pyrococcus protein a-1 e-form (see paper)
25% identity, 78% coverage: 87:399/402 of query aligns to 79:385/388 of 1gdeA

query
sites
1gdeA
Q
 
N
G
 
G
M
 
I
D
 
E
A
 
A
P
 
D
P
 
P
A
 
K
L
 
T
A
 
E
V
 
I
L
 
M
P
 
V
T
 
L
S
 
L
G
|
G
A
|
A
K
x
N
S
 
Q
A
 
A
L
 
F
N
 
L
L
 
M
L
 
G
C
 
L
L
 
S
A
 
A
L
 
F
I
 
L
D
 
K
T
 
D
G
 
G
D
 
E
V
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
I
T
 
P
T
 
T
P
 
P
A
 
A
Y
x
F
P
 
V
I
 
S
F
 
Y
S
 
A
T
 
P
I
 
A
A
 
V
R
 
I
R
 
L
M
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
K
V
 
P
V
 
V
H
 
E
L
 
V
P
 
P
L
 
T
L
 
Y
E
 
E
E
 
E
N
 
D
D
 
E
F
 
F
L
 
R
P
 
L
D
 
N
L
 
V
H
 
D
Q
 
E
L
 
L
S
 
K
P
 
K
E
 
Y
V
 
V
L
 
T
A
 
D
R
 
K
A
 
T
K
 
R
L
 
A
L
 
L
I
 
I
V
 
I
N
|
N
Y
 
S
P
 
P
N
 
C
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
A
V
 
V
A
 
L
S
 
T
Q
 
K
Q
 
K
E
 
D
C
 
L
D
 
E
R
 
E
L
 
I
L
 
A
A
 
D
I
 
F
C
 
V
R
 
V
D
 
E
H
 
H
D
 
D
I
 
L
L
 
I
L
 
V
I
 
I
N
 
S
D
|
D
A
 
E
A
 
V
Y
|
Y
S
 
E
D
 
H
L
 
F
L
 
I
P
 
Y
A
 
D
E
 
D
R
 
A
P
 
R
R
 
H
G
 
Y
R
 
S
F
 
I
L
 
A
Y
 
S
S
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
M
S
 
F
S
 
E
H
 
R
C
 
T
I
 
I
E
 
T
V
 
V
H
 
N
S
 
G
F
 
F
S
|
S
K
|
K
S
 
T
L
 
F
Q
 
A
I
 
M
P
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
V
L
 
A
A
 
A
A
 
P
P
 
S
A
 
W
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
R
L
 
M
G
 
V
K
 
K
L
 
F
S
 
Q
L
 
-
L
 
M
H
 
Y
E
 
N
S
 
A
G
 
T
Q
 
C
P
 
P
R
 
V
I
 
T
L
 
F
L
 
I
D
 
Q
-
 
Y
-
 
A
A
 
A
V
 
A
T
 
K
C
 
A
I
 
L
L
 
K
D
 
D
D
 
E
R
 
R
G
 
S
F
 
W
-
 
K
-
 
A
A
 
V
E
 
E
R
 
E
L
 
M
C
 
R
Q
 
K
C
 
E
I
 
Y
A
 
D
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
K
V
 
L
M
 
V
V
 
W
D
 
K
I
 
R
L
 
L
Q
 
N
A
 
E
H
 
M
G
 
G
L
 
L
E
 
P
V
 
T
L
 
V
N
 
K
A
 
P
D
 
K
G
 
G
T
 
A
F
 
F
F
 
Y
V
 
I
Y
 
F
V
 
P
R
 
R
C
 
I
P
 
R
A
 
D
A
 
-
V
 
-
S
 
-
N
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
T
F
 
G
A
 
L
T
 
T
A
 
S
R
 
K
D
 
K
F
 
F
S
 
S
Q
 
E
Y
 
L
L
 
M
A
 
L
T
 
K
E
 
E
L
 
A
G
 
R
I
 
V
L
 
A
T
 
V
I
 
V
P
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
A
Y
 
F
Q
 
G
V
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
E
H
 
G
Q
 
Y
V
 
V
R
|
R
F
 
I
S
 
S
V
 
Y
A
 
A
F
 
-
C
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
T
V
 
A
F
 
Y
N
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
E
Q
 
E
Q
 
A
L
 
M
S
 
D
N
 
R
V
 
M
Q
 
E
F
 
R
S
 
V
L
 
L
A
 
K
E
 
E
R
 
R

1gd9A Crystall structure of pyrococcus protein-a1 (see paper)
25% identity, 78% coverage: 87:399/402 of query aligns to 79:385/388 of 1gd9A

query
sites
1gd9A
Q
 
N
G
 
G
M
 
I
D
 
E
A
 
A
P
 
D
P
 
P
A
 
K
L
 
T
A
 
E
V
 
I
L
 
M
P
 
V
T
 
L
S
 
L
G
|
G
A
|
A
K
x
N
S
 
Q
A
 
A
L
 
F
N
 
L
L
 
M
L
 
G
C
 
L
L
 
S
A
 
A
L
 
F
I
 
L
D
 
K
T
 
D
G
 
G
D
 
E
V
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
I
T
 
P
T
 
T
P
 
P
A
 
A
Y
x
F
P
 
V
I
 
S
F
 
Y
S
 
A
T
 
P
I
 
A
A
 
V
R
 
I
R
 
L
M
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
K
V
 
P
V
 
V
H
 
E
L
 
V
P
 
P
L
 
T
L
 
Y
E
 
E
E
 
E
N
 
D
D
 
E
F
 
F
L
 
R
P
 
L
D
 
N
L
 
V
H
 
D
Q
 
E
L
 
L
S
 
K
P
 
K
E
 
Y
V
 
V
L
 
T
A
 
D
R
 
K
A
 
T
K
 
R
L
 
A
L
 
L
I
 
I
V
 
I
N
 
N
Y
 
S
P
 
P
N
 
C
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
A
V
 
V
A
 
L
S
 
T
Q
 
K
Q
 
K
E
 
D
C
 
L
D
 
E
R
 
E
L
 
I
L
 
A
A
 
D
I
 
F
C
 
V
R
 
V
D
 
E
H
 
H
D
 
D
I
 
L
L
 
I
L
 
V
I
 
I
N
 
S
D
|
D
A
 
E
A
x
V
Y
|
Y
S
 
E
D
 
H
L
 
F
L
 
I
P
 
Y
A
 
D
E
 
D
R
 
A
P
 
R
R
 
H
G
 
Y
R
 
S
F
 
I
L
 
A
Y
 
S
S
 
L
E
 
D
G
 
G
A
 
M
S
 
F
S
 
E
H
 
R
C
 
T
I
 
I
E
 
T
V
 
V
H
 
N
S
 
G
F
 
F
S
|
S
K
|
K
S
 
T
L
 
F
Q
 
A
I
 
M
P
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
V
L
 
A
A
 
A
A
 
P
P
 
S
A
 
W
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
R
L
 
M
G
 
V
K
 
K
L
 
F
S
 
Q
L
 
-
L
 
M
H
 
Y
E
 
N
S
 
A
G
 
T
Q
 
C
P
 
P
R
 
V
I
 
T
L
 
F
L
 
I
D
 
Q
-
 
Y
-
 
A
A
 
A
V
 
A
T
 
K
C
 
A
I
 
L
L
 
K
D
 
D
D
 
E
R
 
R
G
 
S
F
 
W
-
 
K
-
 
A
A
 
V
E
 
E
R
 
E
L
 
M
C
 
R
Q
 
K
C
 
E
I
 
Y
A
 
D
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
K
V
 
L
M
 
V
V
 
W
D
 
K
I
 
R
L
 
L
Q
 
N
A
 
E
H
 
M
G
 
G
L
 
L
E
 
P
V
 
T
L
 
V
N
 
K
A
 
P
D
 
K
G
 
G
T
 
A
F
 
F
F
 
Y
V
 
I
Y
 
F
V
 
P
R
 
R
C
 
I
P
 
R
A
 
D
A
 
-
V
 
-
S
 
-
N
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
T
F
 
G
A
 
L
T
 
T
A
 
S
R
 
K
D
 
K
F
 
F
S
 
S
Q
 
E
Y
 
L
L
 
M
A
 
L
T
 
K
E
 
E
L
 
A
G
 
R
I
 
V
L
 
A
T
 
V
I
 
V
P
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
A
Y
 
F
Q
 
G
V
 
K
A
 
A
G
 
G
R
 
E
H
 
G
Q
 
Y
V
 
V
R
 
R
F
 
I
S
 
S
V
 
Y
A
 
A
F
 
-
C
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
T
V
 
A
F
 
Y
N
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
E
Q
 
E
Q
 
A
L
 
M
S
 
D
N
 
R
V
 
M
Q
 
E
F
 
R
S
 
V
L
 
L
A
 
K
E
 
E
R
 
R

Q56232 Aspartate/prephenate aminotransferase; AspAT / PAT; Transaminase A; EC 2.6.1.1; EC 2.6.1.78 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see 3 papers)
29% identity, 59% coverage: 87:325/402 of query aligns to 85:323/385 of Q56232

query
sites
Q56232
Q
 
N
G
 
G
M
 
L
D
 
S
A
 
V
P
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
E
A
 
T
V
 
I
L
 
V
P
 
-
T
 
T
S
 
V
G
 
G
A
 
G
K
 
K
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
F
L
 
N
L
 
L
C
 
F
L
 
Q
A
 
A
L
 
I
I
 
L
D
 
D
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
V
T
 
L
T
 
S
P
 
P
A
 
Y
Y
 
W
P
 
V
I
 
S
F
 
Y
S
 
P
T
 
E
I
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
F
M
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
V
V
 
V
V
 
V
H
 
E
L
 
V
P
 
E
L
 
T
L
 
L
E
 
P
E
 
E
N
 
E
D
 
G
F
 
F
L
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
P
H
 
E
Q
 
R
L
 
V
S
 
R
P
 
R
E
 
A
V
 
I
L
 
T
A
 
P
R
 
R
A
 
T
K
 
K
L
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
N
 
N
Y
 
S
P
 
P
N
 
N
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
A
V
 
V
A
 
Y
S
 
P
Q
 
K
Q
 
E
E
 
V
C
 
L
D
 
E
R
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
R
I
 
L
C
 
A
R
 
V
D
 
E
H
 
H
D
 
D
I
 
F
L
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
I
Y
 
Y
S
 
E
D
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
Y
A
 
E
E
 
G
R
 
E
P
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
H
F
 
F
L
 
S
Y
 
P
S
 
G
E
 
R
G
 
V
A
 
A
S
 
P
S
 
E
H
 
H
C
 
T
I
 
L
E
 
T
V
 
V
H
 
N
S
 
G
F
 
A
S
 
A
K
|
K
S
 
A
L
 
F
Q
 
A
I
 
M
P
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
R
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
I
 
A
L
 
C
A
 
G
A
 
P
P
 
K
A
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
M
G
 
A
K
 
S
L
 
V
S
 
S
L
 
S
L
 
Q
H
 
S
E
 
T
S
 
T
G
 
S
Q
 
P
P
 
D
R
 
T
I
 
I
-
 
A
-
 
Q
-
 
W
-
 
A
L
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
L
T
 
T
C
 
N
I
 
Q
L
 
E
D
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
R
 
M
L
 
A
C
 
R
Q
 
E
C
 
A
I
 
Y
A
 
R
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
D
V
 
L
M
 
L
V
 
L
D
 
E
I
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
H
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
V
 
A
L
 
V
N
 
R
A
 
P
D
 
S
G
 
G
T
 
A
F
 
F
F
 
Y
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1bkgA Aspartate aminotransferase from thermus thermophilus with maleate (see paper)
29% identity, 59% coverage: 87:325/402 of query aligns to 85:323/382 of 1bkgA

query
sites
1bkgA
Q
 
N
G
 
G
M
 
L
D
 
S
A
 
V
P
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
E
A
 
T
V
 
I
L
 
V
P
 
-
T
 
T
S
 
V
G
|
G
A
x
G
K
|
K
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
F
L
 
N
L
 
L
C
 
F
L
 
Q
A
 
A
L
 
I
I
 
L
D
 
D
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
V
T
 
L
T
 
S
P
 
P
A
 
Y
Y
x
W
P
 
V
I
 
S
F
 
Y
S
 
P
T
 
E
I
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
F
M
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
V
V
 
V
V
 
V
H
 
E
L
 
V
P
 
E
L
 
T
L
 
L
E
 
P
E
 
E
N
 
E
D
 
G
F
 
F
L
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
P
H
 
E
Q
 
R
L
 
V
S
 
R
P
 
R
E
 
A
V
 
I
L
 
T
A
 
P
R
 
R
A
 
T
K
 
K
L
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
N
|
N
Y
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
A
V
 
V
A
 
Y
S
 
P
Q
 
K
Q
 
E
E
 
V
C
 
L
D
 
E
R
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
R
I
 
L
C
 
A
R
 
V
D
 
E
H
 
H
D
 
D
I
 
F
L
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
S
D
|
D
A
 
E
A
x
I
Y
|
Y
S
 
E
D
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
Y
A
 
E
E
 
G
R
 
E
P
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
H
F
 
F
L
 
S
Y
 
P
S
 
G
E
 
R
G
 
V
A
 
A
S
 
P
S
 
E
H
 
H
C
 
T
I
 
L
E
 
T
V
 
V
H
 
N
S
 
G
F
 
A
S
 
A
K
|
K
S
 
A
L
 
F
Q
 
A
I
 
M
P
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
I
 
A
L
 
C
A
 
G
A
 
P
P
 
K
A
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
M
G
 
A
K
 
S
L
 
V
S
 
S
L
 
S
L
 
Q
H
 
S
E
 
T
S
 
T
G
 
S
Q
 
P
P
 
D
R
 
T
I
 
I
-
 
A
-
 
Q
-
 
W
-
 
A
L
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
L
T
 
T
C
 
N
I
 
Q
L
 
E
D
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
R
 
M
L
 
A
C
 
R
Q
 
E
C
 
A
I
 
Y
A
 
R
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
D
V
 
L
M
 
L
V
 
L
D
 
E
I
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
H
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
V
 
A
L
 
V
N
 
R
A
 
P
D
 
S
G
 
G
T
 
A
F
 
F
F
 
Y
V
 
V

1bjwA Aspartate aminotransferase from thermus thermophilus (see paper)
29% identity, 59% coverage: 87:325/402 of query aligns to 85:323/382 of 1bjwA

query
sites
1bjwA
Q
 
N
G
 
G
M
 
L
D
 
S
A
 
V
P
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
E
A
 
T
V
 
I
L
 
V
P
 
-
T
 
T
S
 
V
G
 
G
A
 
G
K
 
K
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
F
L
 
N
L
 
L
C
 
F
L
 
Q
A
 
A
L
 
I
I
 
L
D
 
D
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
V
T
 
L
T
 
S
P
 
P
A
 
Y
Y
x
W
P
 
V
I
 
S
F
 
Y
S
 
P
T
 
E
I
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
F
M
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
V
V
 
V
V
 
V
H
 
E
L
 
V
P
 
E
L
 
T
L
 
L
E
 
P
E
 
E
N
 
E
D
 
G
F
 
F
L
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
P
H
 
E
Q
 
R
L
 
V
S
 
R
P
 
R
E
 
A
V
 
I
L
 
T
A
 
P
R
 
R
A
 
T
K
 
K
L
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
N
 
N
Y
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
A
V
 
V
A
 
Y
S
 
P
Q
 
K
Q
 
E
E
 
V
C
 
L
D
 
E
R
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
R
I
 
L
C
 
A
R
 
V
D
 
E
H
 
H
D
 
D
I
 
F
L
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
S
D
|
D
A
 
E
A
x
I
Y
 
Y
S
 
E
D
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
Y
A
 
E
E
 
G
R
 
E
P
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
H
F
 
F
L
 
S
Y
 
P
S
 
G
E
 
R
G
 
V
A
 
A
S
 
P
S
 
E
H
 
H
C
 
T
I
 
L
E
 
T
V
 
V
H
 
N
S
 
G
F
 
A
S
 
A
K
|
K
S
 
A
L
 
F
Q
 
A
I
 
M
P
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
R
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
I
 
A
L
 
C
A
 
G
A
 
P
P
 
K
A
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
M
G
 
A
K
 
S
L
 
V
S
 
S
L
 
S
L
 
Q
H
 
S
E
 
T
S
 
T
G
 
S
Q
 
P
P
 
D
R
 
T
I
 
I
-
 
A
-
 
Q
-
 
W
-
 
A
L
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
L
T
 
T
C
 
N
I
 
Q
L
 
E
D
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
R
 
M
L
 
A
C
 
R
Q
 
E
C
 
A
I
 
Y
A
 
R
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
D
V
 
L
M
 
L
V
 
L
D
 
E
I
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
H
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
V
 
A
L
 
V
N
 
R
A
 
P
D
 
S
G
 
G
T
 
A
F
 
F
F
 
Y
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1b5oA Thermus thermophilus aspartate aminotransferase single mutant 1 (see paper)
28% identity, 59% coverage: 87:325/402 of query aligns to 85:323/382 of 1b5oA

query
sites
1b5oA
Q
 
N
G
 
G
M
 
L
D
 
S
A
 
V
P
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
E
A
 
T
V
 
I
L
 
V
P
 
T
T
 
V
S
x
G
G
|
G
A
x
S
K
 
Q
S
 
A
A
 
L
L
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
C
 
Q
L
 
-
A
 
A
L
 
I
I
 
L
D
 
D
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
V
T
 
L
T
 
S
P
 
P
A
 
Y
Y
x
W
P
 
V
I
 
S
F
 
Y
S
 
P
T
 
E
I
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
F
M
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
V
V
 
V
V
 
V
H
 
E
L
 
V
P
 
E
L
 
T
L
 
L
E
 
P
E
 
E
N
 
E
D
 
G
F
 
F
L
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
P
H
 
E
Q
 
R
L
 
V
S
 
R
P
 
R
E
 
A
V
 
I
L
 
T
A
 
P
R
 
R
A
 
T
K
 
K
L
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
N
 
N
Y
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
A
V
 
V
A
 
Y
S
 
P
Q
 
K
Q
 
E
E
 
V
C
 
L
D
 
E
R
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
R
I
 
L
C
 
A
R
 
V
D
 
E
H
 
H
D
 
D
I
 
F
L
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
S
D
|
D
A
 
E
A
x
I
Y
|
Y
S
 
E
D
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
Y
A
 
E
E
 
G
R
 
E
P
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
H
F
 
F
L
 
S
Y
 
P
S
 
G
E
 
R
G
 
V
A
 
A
S
 
P
S
 
E
H
 
H
C
 
T
I
 
L
E
 
T
V
 
V
H
 
N
S
 
G
F
 
A
S
x
A
K
|
K
S
 
A
L
 
F
Q
 
A
I
 
M
P
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
I
 
A
L
 
C
A
 
G
A
 
P
P
 
K
A
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
M
G
 
A
K
 
S
L
 
V
S
 
S
L
 
S
L
 
Q
H
 
S
E
 
T
S
 
T
G
 
S
Q
 
P
P
 
D
R
 
T
I
 
I
-
 
A
-
 
Q
-
 
W
-
 
A
L
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
L
T
 
T
C
 
N
I
 
Q
L
 
E
D
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
R
 
M
L
 
A
C
 
R
Q
 
E
C
 
A
I
 
Y
A
 
R
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
D
V
 
L
M
 
L
V
 
L
D
 
E
I
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
H
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
V
 
A
L
 
V
N
 
R
A
 
P
D
 
S
G
 
G
T
 
A
F
 
F
F
 
Y
V
 
V

1gc4A Thermus thermophilus aspartate aminotransferase tetra mutant 2 complexed with aspartate (see paper)
28% identity, 59% coverage: 87:325/402 of query aligns to 85:323/382 of 1gc4A

query
sites
1gc4A
Q
 
N
G
 
G
M
 
L
D
 
S
A
 
V
P
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
E
A
 
T
V
 
I
L
 
V
P
 
T
T
 
V
S
x
G
G
|
G
A
x
S
K
 
Q
S
 
A
A
 
L
L
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
C
 
Q
L
 
-
A
 
A
L
 
I
I
 
L
D
 
D
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
V
T
 
L
T
 
S
P
 
P
A
 
Y
Y
x
W
P
 
V
I
 
S
F
 
Y
S
 
P
T
 
E
I
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
F
M
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
V
V
 
V
V
 
V
H
 
E
L
 
V
P
 
E
L
 
T
L
 
L
E
 
P
E
 
E
N
 
E
D
 
G
F
 
F
L
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
P
H
 
E
Q
 
R
L
 
V
S
 
R
P
 
R
E
 
A
V
 
I
L
 
T
A
 
P
R
 
R
A
 
T
K
 
K
L
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
N
 
N
Y
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
A
V
 
V
A
 
Y
S
 
P
Q
 
K
Q
 
E
E
 
V
C
 
L
D
 
E
R
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
R
I
 
L
C
 
A
R
 
V
D
 
E
H
 
H
D
 
D
I
 
F
L
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
S
D
|
D
A
 
E
A
 
I
Y
|
Y
S
 
E
D
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
Y
A
 
E
E
 
G
R
 
E
P
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
H
F
 
F
L
 
S
Y
 
P
S
 
G
E
 
R
G
 
V
A
 
A
S
 
P
S
 
E
H
 
H
C
 
T
I
 
L
E
 
T
V
 
V
H
 
N
S
 
G
F
 
A
S
 
A
K
 
K
S
 
A
L
 
F
Q
 
A
I
 
M
P
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
I
 
A
L
 
C
A
 
G
A
 
P
P
 
K
A
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
M
G
 
A
K
 
S
L
 
V
S
 
S
L
x
R
L
 
Q
H
 
S
E
 
T
S
 
T
G
 
S
Q
 
P
P
 
D
R
 
T
I
 
I
-
 
A
-
 
Q
-
 
W
-
 
A
L
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
L
T
 
T
C
 
N
I
 
Q
L
 
E
D
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
R
 
M
L
 
A
C
 
R
Q
 
E
C
 
A
I
 
Y
A
 
R
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
D
V
 
L
M
 
L
V
 
L
D
 
E
I
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
H
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
V
 
A
L
 
V
N
 
R
A
 
P
D
 
S
G
 
G
T
 
A
F
 
F
F
x
Y
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1gc3A Thermus thermophilus aspartate aminotransferase tetra mutant 2 complexed with tryptophan (see paper)
28% identity, 59% coverage: 87:325/402 of query aligns to 85:323/382 of 1gc3A

query
sites
1gc3A
Q
 
N
G
 
G
M
 
L
D
 
S
A
 
V
P
 
T
P
 
P
A
 
E
L
 
E
A
 
T
V
 
I
L
 
V
P
 
T
T
 
V
S
 
G
G
|
G
A
x
S
K
 
Q
S
 
A
A
 
L
L
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
C
 
Q
L
 
-
A
 
A
L
 
I
I
 
L
D
 
D
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
V
T
 
L
T
 
S
P
 
P
A
 
Y
Y
x
W
P
 
V
I
 
S
F
 
Y
S
 
P
T
 
E
I
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
F
M
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
V
V
 
V
V
 
V
H
 
E
L
 
V
P
 
E
L
 
T
L
 
L
E
 
P
E
 
E
N
 
E
D
 
G
F
 
F
L
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
P
H
 
E
Q
 
R
L
 
V
S
 
R
P
 
R
E
 
A
V
 
I
L
 
T
A
 
P
R
 
R
A
 
T
K
 
K
L
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
V
N
 
N
Y
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
A
V
 
V
A
 
Y
S
 
P
Q
 
K
Q
 
E
E
 
V
C
 
L
D
 
E
R
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
R
I
 
L
C
 
A
R
 
V
D
 
E
H
 
H
D
 
D
I
 
F
L
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
S
D
|
D
A
 
E
A
 
I
Y
|
Y
S
 
E
D
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
Y
A
 
E
E
 
G
R
 
E
P
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
H
F
 
F
L
 
S
Y
 
P
S
 
G
E
 
R
G
 
V
A
 
A
S
 
P
S
 
E
H
 
H
C
 
T
I
 
L
E
 
T
V
 
V
H
 
N
S
 
G
F
 
A
S
 
A
K
|
K
S
 
A
L
 
F
Q
 
A
I
 
M
P
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
I
 
A
L
 
C
A
 
G
A
 
P
P
 
K
A
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
M
G
 
A
K
 
S
L
 
V
S
 
S
L
 
R
L
 
Q
H
 
S
E
 
T
S
 
T
G
 
S
Q
 
P
P
 
D
R
 
T
I
 
I
-
 
A
-
 
Q
-
 
W
-
 
A
L
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
L
T
 
T
C
 
N
I
 
Q
L
 
E
D
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
R
 
M
L
 
A
C
 
R
Q
 
E
C
 
A
I
 
Y
A
 
R
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
D
V
 
L
M
 
L
V
 
L
D
 
E
I
 
G
L
 
L
Q
 
T
A
 
A
H
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
K
V
 
A
L
 
V
N
 
R
A
 
P
D
 
S
G
 
G
T
 
A
F
 
F
F
x
Y
V
 
V

Sites not aligning to the query:

2o1bA Structure of aminotransferase from staphylococcus aureus
26% identity, 84% coverage: 37:373/402 of query aligns to 20:355/376 of 2o1bA

query
sites
2o1bA
P
 
P
L
 
L
L
 
I
D
 
N
F
 
M
-
 
A
-
 
V
G
 
G
V
 
I
A
 
P
D
 
D
A
 
G
F
 
P
I
 
T
P
 
P
P
 
Q
A
 
G
-
 
I
-
 
I
D
 
D
E
 
H
L
 
F
S
 
Q
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
T
S
 
I
L
 
P
A
 
E
T
 
N
R
 
Q
R
 
K
E
 
-
L
 
-
H
 
Y
G
 
G
Y
 
A
V
 
F
Y
 
H
H
 
G
H
 
K
S
 
E
A
 
A
Y
 
F
E
 
K
A
 
Q
A
 
A
C
 
I
L
 
V
-
 
D
-
 
F
-
 
Y
-
 
Q
R
 
R
H
 
Q
A
 
Y
T
 
N
Q
 
V
G
 
T
M
 
L
D
 
D
A
 
K
P
 
E
P
 
D
A
 
E
L
 
V
A
 
C
V
 
I
L
 
L
P
 
-
T
 
-
S
 
Y
G
 
G
A
x
T
K
|
K
S
 
N
A
 
G
L
 
L
N
 
V
L
 
A
L
 
V
C
 
P
L
 
T
A
 
C
L
 
V
I
 
I
D
 
N
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
Y
I
 
V
L
 
L
A
 
L
T
 
P
T
 
D
P
 
P
A
 
G
Y
|
Y
P
 
T
I
 
D
F
 
Y
S
 
-
T
 
-
I
 
L
A
 
A
R
 
G
R
 
V
M
 
L
G
 
L
A
 
A
T
 
D
V
 
G
V
 
K
H
 
P
L
 
V
P
 
P
L
 
L
-
 
N
L
 
L
E
 
E
E
 
P
N
 
P
D
 
H
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
D
 
D
L
 
W
H
 
S
Q
 
K
L
 
V
S
 
D
P
 
S
E
 
Q
V
 
I
L
 
I
A
 
D
R
 
K
A
 
T
K
 
K
L
 
L
L
 
I
I
 
Y
V
 
L
N
 
T
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
S
V
 
T
A
 
A
S
 
T
Q
 
K
Q
 
E
E
 
V
C
 
F
D
 
D
R
 
E
L
 
A
L
 
I
A
 
A
I
 
K
C
 
F
R
 
K
D
 
G
H
 
T
D
 
D
I
 
T
L
 
K
L
 
I
I
 
V
N
 
H
D
|
D
A
 
F
A
|
A
Y
|
Y
S
 
G
D
 
A
L
 
F
-
 
G
L
 
F
P
 
D
A
 
A
E
 
K
R
 
N
P
 
P
R
 
-
G
 
-
R
 
S
F
 
I
L
 
L
Y
 
A
S
 
S
E
 
E
G
 
N
A
 
G
S
 
K
S
 
D
H
 
V
C
 
A
I
 
I
E
 
E
V
 
I
H
 
Y
S
|
S
F
 
L
S
|
S
K
|
K
S
 
G
L
 
Y
Q
 
N
I
 
M
P
 
S
G
 
G
W
 
F
R
|
R
L
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
A
L
 
V
A
 
G
A
 
N
P
 
K
A
 
D
I
 
M
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
K
K
 
K
L
 
Y
S
 
Q
L
 
T
L
 
H
H
 
T
E
 
N
S
 
A
G
 
G
Q
 
M
P
 
F
R
 
G
I
 
A
L
 
L
L
 
Q
D
 
D
A
 
A
V
 
A
T
 
I
C
 
Y
I
 
A
L
 
L
D
 
N
D
 
H
-
 
Y
R
 
D
G
 
D
F
 
F
A
 
L
E
 
E
R
 
E
L
 
Q
C
 
S
Q
 
N
C
 
V
I
 
F
A
 
K
Q
 
T
R
 
R
R
 
R
A
 
D
V
 
R
M
 
F
V
 
E
D
 
A
I
 
M
L
 
L
Q
 
A
A
 
K
H
 
A
G
 
D
L
 
L
E
 
P
V
 
F
L
 
V
N
 
H
A
 
A
D
 
K
G
 
G
T
 
G
F
 
I
F
 
Y
V
 
V
Y
 
W
V
 
L
R
 
E
C
 
T
P
 
P
A
 
P
A
 
G
V
 
Y
S
 
D
N
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
F
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
S
R
 
E
D
 
Q
F
 
F
S
 
E
Q
 
Q
Y
 
F
L
 
L
A
 
V
T
 
Q
E
 
E
L
 
K
G
 
S
I
 
I
L
 
L
T
 
V
I
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
K
P
 
P
Y
 
F
Q
 
G
V
 
E
A
 
N
G
 
G
R
 
N
H
 
R
Q
 
Y
V
 
V
R
 
R
F
 
I
S
 
S
V
 
L
A
 
A

1v2fA Crystal structure of t.Th hb8 glutamine aminotransferase complex with 3-phenylpropionate (see paper)
31% identity, 59% coverage: 96:331/402 of query aligns to 80:316/368 of 1v2fA

query
sites
1v2fA
A
 
S
V
 
V
L
 
V
P
 
V
T
 
T
S
 
S
G
|
G
A
|
A
K
x
T
S
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
Y
L
 
V
L
 
L
C
 
L
L
 
Q
A
 
S
L
 
L
I
 
V
D
 
G
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
I
 
V
L
 
V
A
 
V
T
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
F
Y
x
F
P
 
D
I
 
V
F
 
Y
S
 
L
T
 
P
I
 
D
A
 
A
R
 
F
R
 
L
M
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
-
 
A
-
 
R
V
 
L
V
 
V
H
 
R
L
 
L
P
 
D
L
 
L
L
 
T
E
 
P
E
 
E
N
 
G
D
 
-
F
 
F
L
 
R
P
 
L
D
 
D
L
 
L
H
 
S
Q
 
A
L
 
L
S
 
E
P
 
K
E
 
A
V
 
L
L
 
T
A
 
P
R
 
R
A
 
T
K
 
R
L
 
A
L
 
L
I
 
L
V
 
L
N
 
N
Y
 
T
P
 
P
N
 
M
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
L
V
 
V
A
 
F
S
 
G
Q
 
E
Q
 
R
E
 
E
C
 
L
D
 
E
R
 
A
L
 
I
L
 
A
A
 
R
I
 
L
C
x
A
R
 
R
D
x
A
H
 
H
D
 
D
I
 
L
L
 
F
L
 
L
I
 
I
N
 
S
D
|
D
A
 
E
A
x
V
Y
|
Y
S
 
D
D
 
E
L
 
L
L
 
Y
P
 
Y
A
 
G
E
 
E
R
 
R
P
 
P
R
 
R
G
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
R
Y
 
L
S
 
R
E
 
E
G
 
F
A
 
A
S
 
P
S
 
E
H
 
R
C
 
T
I
 
F
E
 
T
V
 
V
H
 
G
S
|
S
F
 
A
S
 
G
K
|
K
S
 
R
L
 
L
Q
 
E
I
 
A
P
 
T
G
 
G
W
 
Y
R
|
R
L
 
V
G
 
G
F
 
W
I
 
I
L
 
V
A
 
G
A
 
P
P
 
K
A
 
E
I
 
F
I
 
M
E
 
P
A
 
R
L
 
L
G
 
A
K
 
G
L
 
M
S
 
R
L
 
Q
L
 
W
H
 
T
E
 
S
S
x
F
G
 
S
Q
 
A
P
 
P
R
 
T
I
 
P
L
 
L
L
 
Q
D
 
A
A
 
G
V
 
V
T
 
A
C
 
E
I
 
A
L
 
L
D
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
R
D
 
R
R
 
E
G
 
G
F
 
F
A
 
Y
E
 
E
R
 
A
L
 
L
C
 
R
Q
 
E
C
 
G
I
 
Y
A
 
R
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
D
V
 
L
M
 
L
V
 
A
D
 
G
I
 
G
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
H
 
M
G
 
G
L
 
L
E
 
R
V
 
V
L
 
Y
N
 
V
A
 
P
D
 
E
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
F
 
F
V
 
L
Y
 
M
V
 
A
R
 
E
C
 
L
P
 
P
A
 
G

Sites not aligning to the query:

1v2eA Crystal structure of t.Th hb8 glutamine aminotransferase complex with a-keto-g-methylthiobutyrate (see paper)
31% identity, 59% coverage: 96:331/402 of query aligns to 80:316/368 of 1v2eA

query
sites
1v2eA
A
 
S
V
 
V
L
 
V
P
 
V
T
 
T
S
 
S
G
|
G
A
|
A
K
x
T
S
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
Y
L
 
V
L
 
L
C
 
L
L
 
Q
A
 
S
L
 
L
I
 
V
D
 
G
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
I
 
V
L
 
V
A
 
V
T
 
L
T
 
E
P
 
P
A
 
F
Y
x
F
P
 
D
I
 
V
F
 
Y
S
 
L
T
 
P
I
 
D
A
 
A
R
 
F
R
 
L
M
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
-
 
A
-
 
R
V
 
L
V
 
V
H
 
R
L
 
L
P
 
D
L
 
L
L
 
T
E
 
P
E
 
E
N
 
G
D
 
-
F
 
F
L
 
R
P
 
L
D
 
D
L
 
L
H
 
S
Q
 
A
L
 
L
S
 
E
P
 
K
E
 
A
V
 
L
L
 
T
A
 
P
R
 
R
A
 
T
K
 
R
L
 
A
L
 
L
I
 
L
V
 
L
N
 
N
Y
 
T
P
 
P
N
 
M
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
L
V
 
V
A
 
F
S
 
G
Q
 
E
Q
 
R
E
 
E
C
 
L
D
 
E
R
 
A
L
 
I
L
 
A
A
 
R
I
 
L
C
x
A
R
 
R
D
x
A
H
 
H
D
 
D
I
 
L
L
 
F
L
 
L
I
 
I
N
 
S
D
|
D
A
 
E
A
x
V
Y
|
Y
S
 
D
D
 
E
L
 
L
L
 
Y
P
 
Y
A
 
G
E
 
E
R
 
R
P
 
P
R
 
R
G
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
R
Y
 
L
S
 
R
E
 
E
G
 
F
A
 
A
S
 
P
S
 
E
H
 
R
C
 
T
I
 
F
E
 
T
V
 
V
H
 
G
S
|
S
F
 
A
S
 
G
K
|
K
S
 
R
L
 
L
Q
 
E
I
 
A
P
 
T
G
 
G
W
 
Y
R
|
R
L
 
V
G
 
G
F
 
W
I
 
I
L
 
V
A
 
G
A
 
P
P
 
K
A
 
E
I
 
F
I
 
M
E
 
P
A
 
R
L
 
L
G
 
A
K
 
G
L
 
M
S
 
R
L
 
Q
L
 
W
H
 
T
E
 
S
S
 
F
G
 
S
Q
 
A
P
 
P
R
 
T
I
 
P
L
 
L
L
 
Q
D
 
A
A
 
G
V
 
V
T
 
A
C
 
E
I
 
A
L
 
L
D
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
R
D
 
R
R
 
E
G
 
G
F
 
F
A
 
Y
E
 
E
R
 
A
L
 
L
C
 
R
Q
 
E
C
 
G
I
 
Y
A
 
R
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
D
V
 
L
M
 
L
V
 
A
D
 
G
I
 
G
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
H
 
M
G
 
G
L
 
L
E
 
R
V
 
V
L
 
Y
N
 
V
A
 
P
D
 
E
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
F
|
F
V
 
L
Y
 
M
V
 
A
R
 
E
C
 
L
P
 
P
A
 
G

Sites not aligning to the query:

1o4sB Crystal structure of aspartate aminotransferase (tm1255) from thermotoga maritima at 1.90 a resolution (see paper)
24% identity, 58% coverage: 97:329/402 of query aligns to 100:329/384 of 1o4sB

query
sites
1o4sB
V
 
V
L
 
V
P
 
V
T
 
T
S
 
N
G
|
G
A
|
A
K
|
K
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
F
L
 
N
L
 
A
C
 
F
L
 
M
A
 
A
L
 
L
I
 
L
D
 
D
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
V
T
 
F
T
 
S
P
 
P
A
 
V
Y
x
W
P
 
V
I
 
S
F
 
Y
S
 
I
T
 
P
I
 
Q
A
 
I
R
 
I
R
 
L
M
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
T
V
 
V
V
 
N
H
 
V
L
 
V
P
 
E
L
 
T
L
 
F
E
 
M
E
 
S
N
 
K
D
 
N
F
 
F
L
 
Q
P
 
P
D
 
S
L
 
L
H
 
E
Q
 
E
L
 
V
S
 
E
P
 
G
E
 
L
V
 
L
L
 
V
A
 
G
R
 
K
A
 
T
K
 
K
L
 
A
L
 
V
I
 
L
V
 
I
N
 
N
Y
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
K
 
V
V
 
V
A
 
Y
S
 
R
Q
 
R
Q
 
E
E
 
F
C
 
L
D
 
E
R
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
R
I
 
L
C
 
A
R
 
K
D
 
K
H
 
R
D
 
N
I
 
F
L
 
Y
L
 
I
I
 
I
N
 
S
D
|
D
A
 
E
A
x
V
Y
|
Y
S
 
D
D
 
S
L
 
L
L
 
V
P
 
Y
A
 
T
E
 
D
R
 
E
P
 
F
R
 
T
G
 
S
R
 
I
F
 
L
L
 
D
Y
 
V
S
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
F
S
 
-
S
 
D
H
 
R
C
 
I
I
 
V
E
 
Y
V
 
I
H
 
N
S
 
G
F
 
F
S
|
S
K
|
K
S
 
S
L
 
H
Q
 
S
I
 
M
P
 
T
G
 
G
W
 
W
R
|
R
L
 
V
G
 
G
F
 
Y
I
 
L
L
 
I
A
 
S
A
 
S
P
 
E
A
 
K
I
 
V
I
 
A
E
 
T
A
 
A
L
 
V
G
 
S
K
 
K
L
 
I
-
 
Q
-
 
S
-
 
H
-
 
T
-
 
T
S
 
S
L
 
C
L
 
I
H
 
N
E
 
T
S
 
V
G
 
A
Q
 
Q
P
 
-
R
 
-
I
 
-
L
 
-
L
 
Y
D
 
A
A
 
A
V
 
L
T
 
K
C
 
A
I
 
L
L
 
E
D
 
V
D
 
D
R
 
N
G
 
S
F
 
Y
A
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
M
C
 
V
Q
 
Q
C
 
T
I
 
F
A
 
K
Q
 
E
R
 
R
R
 
K
A
 
N
V
 
F
M
 
V
V
 
V
D
 
E
I
 
R
L
 
L
Q
 
K
A
 
K
H
 
M
G
 
G
L
 
V
E
 
K
V
 
F
L
 
V
N
 
E
A
 
P
D
 
E
G
 
G
T
 
A
F
 
F
F
 
Y
V
 
L
Y
 
F
V
 
F
R
 
K
C
 
V

5verA Mouse kynurenine aminotransferase iii, re-refinement of the PDB structure 3e2z (see paper)
24% identity, 75% coverage: 25:325/402 of query aligns to 13:333/410 of 5verA

query
sites
5verA
W
 
W
V
 
V
R
 
E
T
 
F
L
 
T
K
 
K
S
 
L
S
 
A
T
 
-
A
 
A
G
 
D
Q
 
P
P
 
S
L
 
V
L
 
V
D
 
N
F
 
L
G
 
G
V
 
Q
A
 
G
D
 
F
A
 
P
F
 
D
I
 
I
P
 
S
P
 
P
A
 
P
D
 
S
E
 
Y
L
 
V
S
 
K
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
S
 
S
S
 
K
L
 
A
A
 
A
T
 
F
R
 
I
R
 
D
E
 
N
L
 
M
H
 
N
G
 
Q
Y
 
Y
V
 
T
-
 
R
-
 
G
Y
 
F
H
 
G
H
 
H
S
 
P
A
 
A
Y
 
L
E
 
V
A
 
K
A
 
A
-
 
L
-
 
S
C
 
C
L
 
L
R
 
Y
H
 
G
A
 
K
T
 
I
Q
 
Y
G
 
Q
M
 
R
D
 
Q
A
 
I
P
 
D
P
 
P
A
 
N
L
 
E
A
 
E
V
 
I
L
 
L
P
 
V
T
 
A
S
 
V
G
|
G
A
|
A
K
x
Y
S
 
G
A
 
S
L
 
L
N
 
F
L
 
N
L
 
S
C
 
I
L
 
Q
A
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
I
T
 
M
T
 
V
P
 
P
A
 
F
Y
|
Y
P
 
D
I
 
C
F
 
Y
S
 
E
T
 
P
I
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
M
M
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
V
V
 
P
V
 
V
H
 
F
L
 
I
P
 
P
L
 
L
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
D
-
 
G
-
 
M
-
 
K
L
 
W
E
 
T
E
 
S
N
 
S
D
 
D
F
 
W
L
 
T
P
 
F
D
 
D
L
 
P
H
 
R
Q
 
E
L
 
L
S
 
E
P
 
S
E
 
K
V
 
F
L
 
S
A
 
S
R
 
K
A
 
T
K
 
K
L
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
L
N
|
N
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
N
|
N
P
 
P
T
 
L
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
Y
S
 
T
Q
 
R
Q
 
Q
E
 
E
C
 
L
D
 
Q
R
 
V
L
 
I
L
 
A
A
 
D
I
 
L
C
 
C
R
 
V
D
 
K
H
 
H
D
 
D
I
 
T
L
 
L
L
 
C
I
 
I
N
 
S
D
|
D
A
 
E
A
x
V
Y
|
Y
S
 
E
D
 
W
L
 
L
L
 
V
P
 
Y
A
 
T
E
 
G
R
 
H
P
 
T
R
 
H
G
 
V
R
 
K
F
 
I
L
 
A
Y
 
T
S
 
L
E
 
P
G
 
G
A
 
M
S
 
W
S
 
E
H
 
R
C
 
T
I
 
I
E
 
T
V
 
I
H
 
G
S
|
S
F
 
A
S
 
G
K
|
K
S
 
T
L
 
F
Q
 
S
I
 
V
P
 
T
G
 
G
W
 
W
R
x
K
L
 
L
G
 
G
F
 
W
I
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
P
P
 
A
A
 
H
I
 
L
I
 
I
E
 
K
A
 
H
L
 
L
G
 
Q
K
 
T
L
 
V
-
 
Q
-
 
Q
-
 
N
-
 
S
-
 
F
-
 
Y
-
 
T
-
 
C
-
 
A
S
 
T
L
 
P
L
 
L
H
 
Q
E
 
A
S
 
A
G
 
L
Q
 
A
P
 
E
R
 
A
I
 
F
L
 
W
L
 
I
D
 
D
A
 
-
V
 
I
T
 
K
C
 
R
I
 
M
L
 
D
D
 
D
D
 
P
R
 
E
G
 
C
F
 
Y
A
 
F
E
 
N
R
 
S
L
 
L
C
 
P
Q
 
K
C
 
E
I
 
L
A
 
E
Q
 
V
R
 
K
R
 
R
A
 
D
V
 
R
M
 
M
V
 
V
D
 
R
I
 
L
L
 
L
Q
 
N
A
 
S
H
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
K
V
 
P
L
 
I
N
 
V
A
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
G
F
 
Y
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

5vepA Mouse kynurenine aminotransferase iii, re-refinement of the PDB structure 3e2f (see paper)
24% identity, 75% coverage: 25:325/402 of query aligns to 13:333/410 of 5vepA

query
sites
5vepA
W
 
W
V
 
V
R
 
E
T
 
F
L
 
T
K
 
K
S
 
L
S
 
A
T
 
-
A
 
A
G
 
D
Q
 
P
P
 
S
L
 
V
L
 
V
D
 
N
F
 
L
G
 
G
V
 
Q
A
 
G
D
 
F
A
 
P
F
 
D
I
 
I
P
 
S
P
 
P
A
 
P
D
 
S
E
 
Y
L
 
V
S
 
K
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
S
 
S
S
 
K
L
 
A
A
 
A
T
 
F
R
 
I
R
 
D
E
 
N
L
 
M
H
 
N
G
 
Q
Y
 
Y
V
 
T
-
 
R
-
 
G
Y
 
F
H
 
G
H
 
H
S
 
P
A
 
A
Y
 
L
E
 
V
A
 
K
A
 
A
-
 
L
-
 
S
C
 
C
L
 
L
R
 
Y
H
 
G
A
 
K
T
 
I
Q
 
Y
G
 
Q
M
 
R
D
 
Q
A
 
I
P
 
D
P
 
P
A
 
N
L
 
E
A
 
E
V
 
I
L
 
L
P
 
V
T
 
A
S
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
Y
S
 
G
A
 
S
L
 
L
N
 
F
L
 
N
L
 
S
C
 
I
L
 
Q
A
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
I
T
 
M
T
 
V
P
 
P
A
 
F
Y
|
Y
P
 
D
I
 
C
F
 
Y
S
 
E
T
 
P
I
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
M
M
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
V
V
 
P
V
 
V
H
 
F
L
 
I
P
 
P
L
 
L
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
D
-
 
G
-
 
M
-
 
K
L
 
W
E
 
T
E
 
S
N
 
S
D
 
D
F
 
W
L
 
T
P
 
F
D
 
D
L
 
P
H
 
R
Q
 
E
L
 
L
S
 
E
P
 
S
E
 
K
V
 
F
L
 
S
A
 
S
R
 
K
A
 
T
K
 
K
L
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
L
N
 
N
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
L
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
Y
S
 
T
Q
 
R
Q
 
Q
E
 
E
C
 
L
D
 
Q
R
 
V
L
 
I
L
 
A
A
 
D
I
 
L
C
 
C
R
 
V
D
 
K
H
|
H
D
|
D
I
 
T
L
 
L
L
 
C
I
 
I
N
 
S
D
|
D
A
 
E
A
x
V
Y
 
Y
S
 
E
D
 
W
L
 
L
L
 
V
P
 
Y
A
 
T
E
 
G
R
 
H
P
 
T
R
 
H
G
 
V
R
 
K
F
 
I
L
 
A
Y
 
T
S
 
L
E
 
P
G
 
G
A
 
M
S
 
W
S
 
E
H
 
R
C
 
T
I
 
I
E
 
T
V
 
I
H
 
G
S
 
S
F
 
A
S
 
G
K
|
K
S
 
T
L
 
F
Q
 
S
I
 
V
P
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
K
L
 
L
G
 
G
F
 
W
I
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
P
P
 
A
A
 
H
I
 
L
I
 
I
E
 
K
A
 
H
L
 
L
G
 
Q
K
 
T
L
 
V
-
 
Q
-
 
Q
-
 
N
-
 
S
-
 
F
-
 
Y
-
 
T
-
 
C
-
 
A
S
 
T
L
 
P
L
 
L
H
 
Q
E
 
A
S
 
A
G
 
L
Q
 
A
P
 
E
R
 
A
I
 
F
L
 
W
L
 
I
D
 
D
A
 
-
V
 
I
T
 
K
C
 
R
I
 
M
L
 
D
D
 
D
D
 
P
R
 
E
G
 
C
F
 
Y
A
 
F
E
 
N
R
 
S
L
 
L
C
 
P
Q
 
K
C
 
E
I
 
L
A
 
E
Q
 
V
R
 
K
R
 
R
A
 
D
V
 
R
M
 
M
V
 
V
D
 
R
I
 
L
L
 
L
Q
 
N
A
 
S
H
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
K
V
 
P
L
 
I
N
 
V
A
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
G
F
 
Y
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3e2zA Crystal structure of mouse kynurenine aminotransferase iii in complex with kynurenine (see paper)
24% identity, 75% coverage: 25:325/402 of query aligns to 13:333/410 of 3e2zA

query
sites
3e2zA
W
|
W
V
 
V
R
 
E
T
 
F
L
 
T
K
 
K
S
 
L
S
 
A
T
 
-
A
 
A
G
 
D
Q
 
P
P
 
S
L
 
V
L
 
V
D
 
N
F
 
L
G
 
G
V
 
Q
A
x
G
D
 
F
A
 
P
F
 
D
I
 
I
P
 
S
P
 
P
A
 
P
D
 
S
E
 
Y
L
 
V
S
 
K
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
S
 
S
S
 
K
L
 
A
A
 
A
T
 
F
R
 
I
R
 
D
E
 
N
L
 
M
H
 
N
G
 
Q
Y
|
Y
V
 
T
-
 
R
-
 
G
Y
 
F
H
 
G
H
 
H
S
 
P
A
 
A
Y
 
L
E
 
V
A
 
K
A
 
A
-
 
L
-
 
S
C
 
C
L
 
L
R
 
Y
H
 
G
A
 
K
T
 
I
Q
 
Y
G
 
Q
M
 
R
D
 
Q
A
 
I
P
 
D
P
 
P
A
 
N
L
 
E
A
 
E
V
 
I
L
 
L
P
 
V
T
 
A
S
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
Y
S
 
G
A
 
S
L
 
L
N
 
F
L
 
N
L
 
S
C
 
I
L
 
Q
A
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
T
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
I
T
 
M
T
 
V
P
 
P
A
 
F
Y
|
Y
P
 
D
I
 
C
F
 
Y
S
 
E
T
 
P
I
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
M
M
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
V
V
 
P
V
 
V
H
 
F
L
 
I
P
 
P
L
 
L
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
D
-
 
G
-
 
M
-
 
K
L
 
W
E
 
T
E
 
S
N
 
S
D
 
D
F
 
W
L
 
T
P
 
F
D
 
D
L
 
P
H
 
R
Q
 
E
L
 
L
S
 
E
P
 
S
E
 
K
V
 
F
L
 
S
A
 
S
R
 
K
A
 
T
K
 
K
L
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
L
N
 
N
Y
 
T
P
 
P
N
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
L
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
Y
S
 
T
Q
 
R
Q
 
Q
E
 
E
C
 
L
D
 
Q
R
 
V
L
 
I
L
 
A
A
 
D
I
 
L
C
 
C
R
 
V
D
 
K
H
 
H
D
 
D
I
 
T
L
 
L
L
 
C
I
 
I
N
 
S
D
|
D
A
 
E
A
x
V
Y
 
Y
S
 
E
D
 
W
L
 
L
L
 
V
P
 
Y
A
 
T
E
 
G
R
 
H
P
 
T
R
 
H
G
 
V
R
 
K
F
 
I
L
 
A
Y
 
T
S
 
L
E
 
P
G
 
G
A
 
M
S
 
W
S
 
E
H
 
R
C
 
T
I
 
I
E
 
T
V
 
I
H
 
G
S
 
S
F
 
A
S
 
G
K
|
K
S
 
T
L
 
F
Q
 
S
I
 
V
P
 
T
G
 
G
W
 
W
R
 
K
L
 
L
G
 
G
F
 
W
I
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
P
P
 
A
A
 
H
I
 
L
I
 
I
E
 
K
A
 
H
L
 
L
G
 
Q
K
 
T
L
 
V
-
 
Q
-
 
Q
-
 
N
-
 
S
-
 
F
-
x
Y
-
 
T
-
 
C
-
 
A
S
 
T
L
 
P
L
 
L
H
 
Q
E
 
A
S
 
A
G
 
L
Q
 
A
P
 
E
R
 
A
I
 
F
L
 
W
L
 
I
D
 
D
A
 
-
V
 
I
T
 
K
C
 
R
I
 
M
L
 
D
D
 
D
D
 
P
R
 
E
G
 
C
F
 
Y
A
 
F
E
 
N
R
 
S
L
 
L
C
 
P
Q
 
K
C
 
E
I
 
L
A
 
E
Q
 
V
R
 
K
R
 
R
A
 
D
V
 
R
M
 
M
V
 
V
D
 
R
I
 
L
L
 
L
Q
 
N
A
 
S
H
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
K
V
 
P
L
 
I
N
 
V
A
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
G
F
 
Y
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>PP_3786 FitnessBrowser__Putida:PP_3786
MQATVFNTFFRETSLAPDSDDFFKWVRTLKSSTAGQPLLDFGVADAFIPPADELSQALSS
LATRRELHGYVYHHSAYEAACLRHATQGMDAPPALAVLPTSGAKSALNLLCLALIDTGDV
ILATTPAYPIFSTIARRMGATVVHLPLLEENDFLPDLHQLSPEVLARAKLLIVNYPNNPT
GKVASQQECDRLLAICRDHDILLINDAAYSDLLPAERPRGRFLYSEGASSHCIEVHSFSK
SLQIPGWRLGFILAAPAIIEALGKLSLLHESGQPRILLDAVTCILDDRGFAERLCQCIAQ
RRAVMVDILQAHGLEVLNADGTFFVYVRCPAAVSNGRTFATARDFSQYLATELGILTIPY
QVAGRHQVRFSVAFCGEAETVFNRLRQQLSNVQFSLAERVSA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory