SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_4790 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_4790 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3bptA Crystal structure of human beta-hydroxyisobutyryl-coa hydrolase in complex with quercetin
36% identity, 98% coverage: 7:354/356 of query aligns to 6:351/362 of 3bptA

query
sites
3bptA
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
L
E
 
G
V
 
K
R
 
K
N
 
G
H
 
C
I
 
T
G
 
G
H
 
V
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
K
G
x
F
L
|
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
N
M
 
M
V
 
I
R
 
R
S
 
Q
L
 
I
Q
 
Y
Q
 
P
Q
 
Q
L
 
L
D
 
K
A
 
K
W
 
W
A
 
E
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
V
 
T
H
 
F
A
 
L
V
 
I
V
 
I
L
 
I
R
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
|
A
G
|
G
G
|
G
D
 
D
I
|
I
R
 
R
S
 
V
L
 
I
Y
 
S
D
 
E
S
 
A
F
 
E
K
 
K
S
 
A
G
 
K
D
 
Q
T
 
K
L
 
I
H
 
A
E
x
P
D
 
V
F
 
F
F
|
F
V
x
R
E
 
E
E
|
E
Y
 
Y
A
 
M
L
 
L
D
 
N
L
 
N
A
 
A
I
 
V
H
 
G
H
 
S
Y
 
C
R
 
Q
K
 
K
P
 
P
V
 
Y
L
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
I
D
 
H
G
 
G
F
 
I
V
 
T
L
 
M
G
|
G
G
|
G
G
 
G
M
 
V
G
|
G
L
 
L
V
 
S
Q
 
V
G
 
H
A
 
G
D
 
Q
L
 
F
R
 
R
V
 
V
V
 
A
T
 
T
E
 
E
R
 
K
S
 
C
R
 
L
L
 
F
A
 
A
M
 
M
P
|
P
E
|
E
V
 
T
A
 
A
I
|
I
G
 
G
Y
x
L
F
 
F
P
 
P
D
|
D
V
|
V
G
 
G
G
 
G
S
 
G
H
 
Y
F
 
F
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
L
P
 
Q
G
 
G
E
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
Y
Y
 
F
L
 
L
G
 
A
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
F
Q
 
R
I
 
L
R
 
K
A
 
G
A
 
R
D
 
D
A
 
V
L
 
Y
Y
 
R
C
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
D
 
T
W
 
H
Y
 
F
L
 
V
E
 
D
S
 
S
N
 
E
K
 
K
L
 
L
G
 
A
T
 
M
L
 
L
D
 
E
E
 
E
Q
 
D
L
 
L
D
 
L
Q
 
A
L
 
L
Q
 
K
W
 
-
H
 
-
E
 
-
T
 
S
P
 
P
L
 
S
K
 
K
D
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
V
L
 
L
Q
 
E
G
 
N
L
 
Y
L
 
H
A
 
T
K
 
E
L
 
S
A
 
K
V
 
I
Q
 
D
Q
 
R
L
 
D
P
 
K
A
 
S
A
 
F
P
 
I
L
 
L
A
 
E
A
 
E
L
 
H
R
 
M
P
 
D
A
 
K
I
 
I
D
 
N
H
 
S
F
 
C
F
 
F
A
 
S
L
 
A
P
 
N
D
 
T
V
 
V
P
 
E
S
 
E
M
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
N
L
 
L
R
 
Q
A
 
-
V
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
Q
D
 
D
S
 
G
H
 
S
E
 
S
W
 
F
A
 
A
T
 
L
A
 
E
T
 
Q
A
 
L
D
 
K
L
 
V
L
 
I
E
 
N
S
 
K
R
 
M
S
 
S
P
 
P
L
 
T
A
 
S
M
 
L
G
 
K
V
 
I
T
 
T
L
 
L
E
 
R
M
 
Q
L
 
L
R
 
M
R
 
E
G
 
G
R
 
S
H
 
S
L
 
K
S
 
T
L
 
L
E
 
Q
Q
 
E
C
 
V
F
 
L
A
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
Y
H
 
R
L
 
L
D
 
S
R
 
Q
Q
 
A
W
 
C
F
 
M
E
 
R
R
 
G
G
 
H
D
 
D
L
 
F
I
 
H
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
A
L
x
V
L
|
L
I
 
I
D
 
D
K
 
K
D
 
D
K
 
Q
N
 
S
P
 
P
R
 
K
W
 
W
S
 
K
P
 
P
P
 
A
T
 
D
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
L
 
V
D
 
T
A
 
E
G
 
E
H
 
D
V
 
L
A
 
N
S
 
N
F
 
H
F
 
F
T
 
K
G
 
S
F
 
L
D
 
G
P
 
S
S
 
S

4hdtA Crystal structure of a carnitinyl-coa dehydratase from mycobacterium thermoresistibile (see paper)
38% identity, 98% coverage: 5:353/356 of query aligns to 1:333/340 of 4hdtA

query
sites
4hdtA
Q
 
N
N
 
E
E
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
V
E
 
N
V
 
V
R
 
E
N
 
G
H
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
K
G
 
A
L
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
L
T
 
T
L
x
H
D
 
G
M
 
M
V
 
V
R
 
T
S
 
T
L
 
M
Q
 
A
Q
 
E
Q
 
R
L
 
L
D
 
A
A
 
A
W
 
W
A
x
E
Q
 
N
D
 
D
P
 
D
Q
 
S
V
 
V
H
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
L
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
|
E
K
 
R
A
 
G
F
 
L
C
 
C
A
 
A
G
 
G
G
|
G
D
 
D
I
 
V
R
 
V
S
 
A
L
x
I
Y
 
Y
D
 
H
S
 
S
F
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
D
D
 
G
T
 
A
L
x
E
H
 
A
E
 
R
D
 
R
F
 
F
F
x
W
V
 
F
E
 
D
E
 
E
Y
|
Y
A
 
R
L
 
L
D
 
N
L
 
A
A
x
H
I
 
I
H
 
G
H
 
R
Y
 
Y
R
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
Y
L
 
V
A
 
S
L
 
I
M
 
M
D
 
D
G
 
G
F
 
I
V
 
V
L
 
M
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
V
G
|
G
L
 
V
V
 
G
Q
 
A
G
 
H
A
 
G
D
 
N
L
 
V
R
 
R
V
 
V
V
 
V
T
 
T
E
 
D
R
 
T
S
 
T
R
 
K
L
 
M
A
 
A
M
 
M
P
 
P
E
|
E
V
 
V
A
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
F
F
 
I
P
|
P
D
|
D
V
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
T
H
 
Y
F
 
L
L
 
L
P
 
S
R
 
R
V
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
L
Y
 
H
L
 
A
G
 
A
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
A
Q
 
P
I
 
F
R
 
S
A
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
Y
 
V
C
 
M
G
 
G
L
 
F
A
 
A
D
 
D
W
 
H
Y
 
Y
L
 
V
E
 
P
S
x
H
N
 
D
K
 
K
L
 
I
G
 
D
T
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
Q
 
E
W
 
F
H
 
T
E
 
R
T
 
A
P
 
V
L
 
I
K
 
A
D
 
D
L
 
-
Q
 
-
G
 
G
L
 
V
L
 
D
A
 
A
K
 
A
L
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
H
V
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
P
P
 
P
A
 
A
A
 
S
P
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
E
L
 
Q
R
 
R
P
 
S
A
 
W
I
 
I
D
 
D
H
 
E
F
 
C
F
 
Y
A
 
T
L
 
G
P
 
D
D
 
T
V
 
V
P
 
A
S
 
D
M
 
I
V
 
I
E
 
A
Q
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
H
T
 
D
V
 
A
A
 
P
D
 
A
S
 
A
H
 
G
E
 
E
W
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
E
 
A
S
 
T
R
 
R
S
 
S
P
 
P
L
 
I
A
 
A
M
 
L
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
E
 
E
M
 
S
L
 
V
R
 
R
R
 
R
G
 
A
R
 
A
H
 
K
L
 
L
-
 
Q
S
 
S
L
 
L
E
 
E
Q
 
D
C
 
T
F
 
L
A
x
R
L
 
Q
E
 
E
L
 
Y
H
 
R
L
 
V
D
 
S
R
 
C
Q
 
A
W
 
S
F
 
L
E
 
K
R
 
S
G
 
H
D
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
R
A
 
A
L
 
Q
L
 
L
I
 
V
D
 
-
K
 
-
D
 
-
K
 
-
N
 
N
P
 
P
R
 
K
W
 
W
S
 
R
P
 
P
P
 
A
T
 
T
L
 
L
Q
 
A
A
 
E
L
 
V
D
 
T
A
 
E
G
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
E
S
 
A
F
 
Y
F
 
F
T
 
A
G
 
P
F
 
V
D
 
D
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q9LKJ1 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase 1; CoA-thioester hydrolase CHY1; EC 3.1.2.-; EC 3.1.2.4 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
34% identity, 97% coverage: 3:348/356 of query aligns to 6:353/378 of Q9LKJ1

query
sites
Q9LKJ1
A
 
A
T
 
S
Q
 
Q
N
 
S
E
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
V
E
 
E
V
 
E
R
 
K
N
 
S
H
 
S
I
 
V
G
 
R
H
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
K
G
 
Q
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
S
L
 
F
D
 
H
M
 
M
V
 
I
R
 
S
S
 
R
L
 
L
Q
 
L
Q
 
Q
Q
 
L
L
 
F
D
 
L
A
 
A
W
 
F
A
 
E
Q
 
E
D
 
D
P
 
P
Q
 
S
V
 
V
H
 
K
A
 
L
V
 
V
V
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
G
A
 
H
G
 
G
E
 
-
K
 
R
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
 
G
G
|
G
D
 
D
I
 
V
R
 
A
S
 
A
L
 
V
Y
 
V
D
 
R
S
 
D
F
 
I
K
 
N
S
 
Q
G
 
G
D
 
N
-
 
W
T
 
R
L
 
L
H
 
G
E
 
A
D
 
N
F
 
Y
F
 
F
V
 
S
E
 
S
E
 
E
Y
 
Y
A
 
M
L
 
L
D
 
N
L
 
Y
A
 
V
I
 
M
H
 
A
H
 
T
Y
 
Y
R
 
S
K
 
K
P
 
A
V
 
Q
L
 
V
A
 
S
L
 
I
M
 
L
D
 
N
G
 
G
F
 
I
V
 
V
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
S
Q
 
V
G
 
H
A
 
G
D
 
R
L
 
F
R
 
R
V
 
I
V
 
A
T
 
T
E
 
E
R
 
N
S
 
T
R
 
V
L
 
F
A
 
A
M
 
M
P
 
P
E
|
E
V
 
T
A
 
A
I
 
L
G
 
G
Y
 
L
F
 
F
P
 
P
D
|
D
V
 
V
G
 
G
G
 
A
S
 
S
H
 
Y
F
 
F
L
 
L
P
 
S
R
 
R
V
 
L
P
 
P
G
 
G
E
 
F
L
 
F
G
 
G
I
 
E
Y
 
Y
L
 
V
G
 
G
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
A
Q
 
R
I
 
L
R
 
D
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
M
L
 
L
Y
 
A
C
 
C
G
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
T
W
 
H
Y
 
F
L
 
V
E
 
P
S
 
S
N
 
T
K
 
R
L
 
L
G
 
T
T
 
A
L
 
L
D
 
E
E
 
A
Q
 
D
L
 
L
D
 
C
Q
 
R
L
 
I
Q
 
N
W
 
S
H
 
N
E
 
D
T
 
P
P
 
T
L
 
F
K
 
A
D
 
S
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
T
L
 
I
A
 
L
K
 
D
L
 
A
A
 
Y
V
 
T
Q
 
Q
Q
 
H
L
 
P
P
 
R
A
 
L
A
 
K
P
 
Q
L
 
Q
A
 
S
A
 
A
L
 
Y
R
 
R
-
 
R
-
 
L
P
 
D
A
 
V
I
 
I
D
 
D
H
 
R
F
 
C
F
 
F
A
 
S
L
 
R
P
 
R
D
 
T
V
 
V
P
 
E
S
 
E
M
 
I
V
 
I
E
 
S
Q
 
A
L
 
L
R
 
E
A
 
R
V
 
E
T
 
A
V
 
T
A
 
Q
D
 
E
S
 
A
H
 
D
E
 
G
W
 
W
A
 
I
T
 
S
A
 
A
T
 
T
A
 
I
D
 
Q
L
 
A
L
 
L
E
 
K
S
 
K
R
 
G
S
 
S
P
 
P
L
 
A
A
 
S
M
 
L
G
 
K
V
 
I
T
 
S
L
 
L
E
 
R
M
 
S
L
 
I
R
 
R
R
 
E
G
 
G
R
 
R
H
 
L
L
 
Q
S
 
G
L
 
V
E
 
G
Q
 
Q
C
 
C
F
 
L
A
 
I
L
 
R
E
 
E
-
 
Y
-
 
R
-
 
M
-
 
V
L
 
C
H
 
H
L
 
V
D
 
M
R
 
K
Q
 
G
W
 
E
F
 
I
E
 
S
R
 
K
G
 
-
D
 
D
L
 
F
I
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
C
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
L
I
 
V
D
 
D
K
 
K
D
 
D
K
 
K
N
 
N
P
 
P
R
 
K
W
 
W
S
 
E
P
 
P
P
 
R
T
 
R
L
 
L
Q
 
E
A
 
D
L
 
M
D
 
K
A
 
D
G
 
S
H
 
M
V
 
V
A
 
E
S
 
Q
F
 
Y
F
 
F

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
35% identity, 49% coverage: 8:182/356 of query aligns to 6:178/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
V
 
I
L
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
K
R
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
N
N
 
N
H
 
T
I
 
V
G
 
G
H
 
L
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
G
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
C
L
 
D
D
 
G
M
 
L
V
 
I
R
 
D
S
 
E
L
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
I
W
 
F
A
 
E
Q
 
E
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
H
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
-
G
 
G
E
 
D
K
|
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
 
G
G
x
A
D
|
D
I
|
I
R
x
K
-
 
E
-
x
M
-
 
Q
-
 
N
-
 
L
S
 
S
L
 
F
Y
 
Q
D
 
D
S
 
C
F
 
Y
K
x
S
S
 
S
G
 
K
D
 
F
T
x
L
L
 
K
H
 
H
E
 
W
D
 
D
F
 
H
F
 
L
V
 
T
E
 
Q
E
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
H
 
-
H
 
-
Y
 
V
R
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
A
M
 
V
D
 
N
G
 
G
F
x
Y
V
 
A
L
x
F
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
C
G
x
E
L
 
L
V
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
L
 
I
R
 
I
V
 
Y
V
 
A
T
 
G
E
 
E
R
 
K
S
 
A
R
 
Q
L
 
F
A
 
A
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
A
 
L
I
 
I
G
 
G
Y
x
T
F
 
I
P
|
P
D
x
G
V
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
H
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
V
 
A
P
 
V
G
 
G
E
 
K
-
 
S
L
 
L
G
 
A
I
 
M
Y
 
E
L
 
M
G
 
V
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
D
Q
 
R
I
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
K
Y
 
Q
C
 
A
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P14604 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial; mECH; mECH1; Enoyl-CoA hydratase 1; ECHS1; Short-chain enoyl-CoA hydratase; SCEH; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8 from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
35% identity, 47% coverage: 14:182/356 of query aligns to 45:208/290 of P14604

query
sites
P14604
N
 
S
H
 
S
I
 
V
G
 
G
H
 
L
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
K
G
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
C
L
 
N
D
 
G
M
 
L
V
 
I
R
 
E
S
 
E
L
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
T
W
 
F
A
 
E
Q
 
E
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
H
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
-
G
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
A
D
 
D
I
 
I
-
 
K
-
 
E
-
 
M
-
 
Q
-
 
N
R
 
R
S
 
T
L
 
F
Y
 
Q
D
 
D
S
 
C
F
 
Y
K
 
S
S
 
G
G
 
K
D
 
F
T
 
L
L
 
S
H
 
H
E
 
W
D
 
D
F
 
H
F
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
I
H
 
T
H
 
R
Y
 
I
R
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
A
M
 
V
D
 
N
G
 
G
F
 
Y
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
C
G
x
E
L
 
L
V
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
L
 
I
R
 
I
V
 
Y
V
 
A
T
 
G
E
 
E
R
 
K
S
 
A
R
 
Q
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
 
P
E
|
E
V
 
I
A
 
L
I
 
L
G
 
G
Y
 
T
F
 
I
P
 
P
D
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
H
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
V
 
A
P
 
V
G
 
G
E
 
K
-
 
S
L
 
L
G
 
A
I
 
M
Y
 
E
L
 
M
G
 
V
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
D
Q
 
R
I
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
K
Y
 
Q
C
 
A
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
35% identity, 48% coverage: 13:182/356 of query aligns to 12:176/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
R
 
N
N
 
S
H
 
S
I
 
V
G
 
G
H
 
L
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
G
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
C
L
 
N
D
 
G
M
 
L
V
 
I
R
 
E
S
 
E
L
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
T
W
 
F
A
 
E
Q
 
E
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
H
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
-
G
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
I
|
I
-
x
K
-
 
E
-
x
M
-
 
Q
-
 
N
R
 
R
S
 
T
L
 
F
Y
 
Q
D
 
D
S
 
C
F
 
Y
K
x
S
S
 
G
G
 
K
D
 
F
T
x
L
L
 
S
H
 
H
E
x
W
D
 
D
F
 
H
F
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
I
H
 
T
H
 
R
Y
 
I
R
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
A
M
 
V
D
 
N
G
 
G
F
x
Y
V
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
M
 
C
G
x
E
L
 
L
V
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
L
 
I
R
 
I
V
 
Y
V
 
A
T
 
G
E
 
E
R
 
K
S
 
A
R
 
Q
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
A
 
L
I
x
L
G
 
G
Y
x
T
F
 
I
P
|
P
D
x
G
V
x
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
H
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
V
 
A
P
 
V
G
 
G
E
 
K
-
 
S
L
 
L
G
 
A
I
 
M
Y
 
E
L
 
M
G
 
V
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
D
Q
x
R
I
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
K
Y
 
Q
C
 
A
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
35% identity, 48% coverage: 13:182/356 of query aligns to 14:178/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
R
 
N
N
 
S
H
 
S
I
 
V
G
 
G
H
 
L
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
G
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
C
L
 
N
D
 
G
M
 
L
V
 
I
R
 
E
S
 
E
L
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
T
W
 
F
A
 
E
Q
 
E
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
H
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
-
G
 
G
E
 
E
K
|
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
I
|
I
-
x
K
-
 
E
-
x
M
-
 
Q
-
 
N
R
 
R
S
 
T
L
 
F
Y
 
Q
D
 
D
S
 
C
F
 
Y
K
x
S
S
 
G
G
 
K
D
 
F
T
x
L
L
 
S
H
 
H
E
 
W
D
 
D
F
 
H
F
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
I
H
 
T
H
 
R
Y
 
I
R
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
A
M
 
V
D
 
N
G
 
G
F
x
Y
V
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
M
 
C
G
x
E
L
 
L
V
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
L
 
I
R
 
I
V
 
Y
V
 
A
T
 
G
E
 
E
R
 
K
S
 
A
R
 
Q
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
A
 
L
I
x
L
G
 
G
Y
x
T
F
 
I
P
|
P
D
x
G
V
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
H
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
V
 
A
P
 
V
G
 
G
E
 
K
-
 
S
L
 
L
G
 
A
I
 
M
Y
 
E
L
 
M
G
 
V
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
D
Q
 
R
I
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
K
Y
 
Q
C
 
A
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
35% identity, 48% coverage: 13:182/356 of query aligns to 13:172/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
R
 
N
N
 
S
H
 
S
I
 
V
G
 
G
H
 
L
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
G
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
C
L
 
N
D
 
G
M
 
L
V
 
I
R
 
E
S
 
E
L
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
T
W
 
F
A
 
E
Q
 
E
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
H
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
-
G
 
G
E
 
E
K
|
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
I
|
I
R
x
K
S
 
E
L
x
M
Y
 
Q
D
 
N
S
 
R
F
 
T
K
 
F
S
 
Q
G
 
D
D
 
C
T
 
Y
L
x
S
H
 
H
E
 
W
D
 
D
F
 
H
F
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
I
H
 
T
H
 
R
Y
 
I
R
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
A
M
 
V
D
 
N
G
 
G
F
x
Y
V
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
M
 
C
G
x
E
L
 
L
V
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
L
 
I
R
 
I
V
 
Y
V
 
A
T
 
G
E
 
E
R
 
K
S
 
A
R
 
Q
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
A
 
L
I
x
L
G
 
G
Y
x
T
F
 
I
P
|
P
D
x
G
V
x
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
H
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
V
 
A
P
 
V
G
 
G
E
 
K
-
 
S
L
 
L
G
 
A
I
 
M
Y
 
E
L
 
M
G
 
V
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
D
Q
 
R
I
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
K
Y
 
Q
C
 
A
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
35% identity, 48% coverage: 13:182/356 of query aligns to 14:176/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
R
 
N
N
 
S
H
 
S
I
 
V
G
 
G
H
 
L
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
K
G
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
C
L
 
N
D
 
G
M
 
L
V
 
I
R
 
E
S
 
E
L
 
L
Q
 
N
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
T
W
 
F
A
 
E
Q
 
E
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
H
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
-
G
 
G
E
 
E
K
|
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
I
|
I
R
x
K
S
 
E
L
x
M
Y
 
Q
D
 
N
S
 
R
F
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
T
H
 
F
E
 
Q
D
 
D
F
 
C
F
 
Y
V
x
S
E
 
G
E
x
L
Y
 
S
A
 
H
L
x
W
D
 
D
L
 
-
A
 
H
I
 
I
H
 
T
H
 
R
Y
 
I
R
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
A
M
 
V
D
 
N
G
 
G
F
x
Y
V
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
M
 
C
G
x
E
L
 
L
V
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
L
 
I
R
 
I
V
 
Y
V
 
A
T
 
G
E
 
E
R
 
K
S
 
A
R
 
Q
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
A
 
L
I
x
L
G
 
G
Y
x
T
F
 
I
P
|
P
D
x
G
V
x
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
H
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
V
 
A
P
 
V
G
 
G
E
 
K
-
 
S
L
 
L
G
 
A
I
 
M
Y
 
E
L
 
M
G
 
V
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
D
Q
 
R
I
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
Q
D
 
D
A
 
A
L
 
K
Y
 
Q
C
 
A
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
26% identity, 74% coverage: 19:280/356 of query aligns to 17:258/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
x
D
G
x
K
L
|
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
N
L
 
A
D
 
K
M
 
L
V
 
L
R
 
E
S
 
E
L
 
L
Q
 
D
Q
 
R
Q
 
A
L
 
V
D
 
S
A
 
Q
W
 
A
A
 
E
Q
 
S
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
H
 
R
A
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
K
G
 
G
E
 
-
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
|
A
G
|
G
G
x
A
D
|
D
I
|
I
R
 
-
S
 
T
L
 
Q
Y
x
F
D
 
N
S
 
Q
F
 
L
K
 
T
S
 
P
G
 
A
D
 
E
T
 
A
L
 
W
H
 
K
E
 
-
D
 
-
F
 
F
F
x
S
V
 
K
E
 
K
E
 
G
Y
x
R
A
 
E
L
 
I
D
 
M
L
 
D
A
 
K
I
 
I
H
 
E
H
 
A
Y
 
L
R
 
S
K
 
K
P
 
P
V
 
T
L
 
I
A
 
A
L
 
M
M
 
I
D
 
N
G
 
G
F
 
Y
V
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
G
x
E
L
 
L
V
 
A
Q
 
L
G
 
A
A
 
C
D
 
D
L
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
A
T
 
A
E
 
E
R
 
E
S
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
G
M
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
I
A
 
N
I
 
L
G
 
G
Y
x
I
F
 
Y
P
|
P
D
x
G
V
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
T
H
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
V
 
V
P
 
I
G
 
G
E
 
K
-
 
G
L
 
R
G
 
A
I
 
L
Y
 
E
L
 
M
G
 
M
V
 
M
S
 
T
G
 
G
V
 
D
Q
x
R
I
 
I
R
 
P
A
 
G
A
 
K
D
 
D
A
 
A
L
 
E
Y
 
K
C
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
N
W
 
R
Y
 
V
L
 
V
E
 
-
S
 
-
N
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
Q
 
-
W
 
-
H
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
P
L
 
L
K
 
A
D
 
N
L
 
L
Q
 
E
G
 
Q
L
 
E
L
 
T
A
 
R
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
E
Q
 
K
Q
 
I
L
 
A
P
 
K
A
 
K
A
 
S
P
 
P
-
 
I
-
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
L
L
 
I
R
 
K
P
 
E
A
 
V
I
 
V
D
 
N
H
 
R
F
 
G
F
 
L
A
 
D
L
 
S
P
 
P
D
 
L
V
 
L
P
 
S
S
 
G
M
 
L
-
x
A
V
 
L
E
 
E
Q
 
S
L
 
V
R
 
G
A
 
W
V
 
G
T
 
V
V
 
V
A
x
F
D
 
S
S
 
T
H
 
E
E
 
D
W
 
K
A
 
K
T
 
E
A
 
G
T
 
V
A
 
S
D
 
A
L
x
F
L
 
L
E
 
E
S
x
K
R
 
R
S
 
E
P
 
P
L
 
T
A
 
F
M
 
K
G
 
G

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
29% identity, 62% coverage: 4:224/356 of query aligns to 1:210/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
T
 
T
Q
 
Y
N
 
E
E
 
T
V
 
I
L
 
L
A
 
V
E
 
E
V
 
R
R
 
D
N
 
Q
H
 
R
I
 
V
G
 
G
H
 
I
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
G
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
N
-
 
S
-
 
Q
-
 
V
L
 
M
D
 
N
M
 
E
V
 
V
R
 
T
S
 
S
L
 
A
Q
 
A
Q
 
T
Q
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
-
W
 
-
A
 
-
Q
 
D
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
V
 
I
H
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
E
 
-
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
I
 
I
R
 
K
S
 
E
L
x
M
Y
 
A
D
 
D
S
 
-
F
 
L
K
 
T
S
 
F
G
 
A
D
 
D
T
 
A
L
 
F
H
x
T
E
 
A
D
 
D
F
 
F
F
|
F
V
 
A
E
 
T
E
 
W
Y
 
G
A
 
K
L
 
L
D
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
H
 
A
H
 
A
Y
 
V
R
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
L
 
I
A
 
A
L
 
A
M
 
V
D
 
A
G
 
G
F
 
Y
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
C
G
x
E
L
 
L
V
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
L
 
V
R
 
L
V
 
I
V
 
A
T
 
A
E
 
D
R
 
T
S
 
A
R
 
K
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
A
 
K
I
 
L
G
 
G
Y
x
V
F
 
L
P
|
P
D
x
G
V
 
M
G
 
G
G
 
G
S
 
S
H
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
V
 
A
P
 
I
G
 
G
E
 
K
L
 
A
-
 
K
G
 
A
I
 
M
Y
 
D
L
 
L
G
 
I
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
R
Q
 
T
I
 
M
R
 
D
A
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
E
Y
x
R
C
x
S
G
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
S
W
 
R
Y
 
V
L
 
V
E
 
P
S
 
A
N
 
D
K
 
D
L
 
L
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
L
D
 
T
Q
 
E
L
 
A
Q
 
R
W
 
A
H
 
T
E
 
A
T
 
T
P
 
T
L
 
I
K
 
S
D
 
Q
L
 
M
Q
 
S
G
 
A
L
 
S
L
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
M
A
 
A
V
 
K
Q
 
E
Q
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3q0jA Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
29% identity, 62% coverage: 4:224/356 of query aligns to 2:211/255 of 3q0jA

query
sites
3q0jA
T
 
T
Q
 
Y
N
 
E
E
 
T
V
 
I
L
 
L
A
 
V
E
 
E
V
 
R
R
 
D
N
 
Q
H
 
R
I
 
V
G
 
G
H
 
I
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
G
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
N
-
 
S
-
 
Q
-
 
V
L
 
M
D
 
N
M
 
E
V
 
V
R
 
T
S
 
S
L
 
A
Q
 
A
Q
 
T
Q
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
-
W
 
-
A
 
-
Q
 
D
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
V
 
I
H
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
E
 
-
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
I
 
I
R
 
K
S
 
E
L
x
M
Y
 
A
D
 
D
S
 
-
F
 
L
K
 
T
S
 
F
G
 
A
D
 
D
T
 
A
L
 
F
H
x
T
E
 
A
D
 
D
F
 
F
F
|
F
V
 
A
E
 
T
E
 
W
Y
 
G
A
 
K
L
 
L
D
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
H
 
A
H
 
A
Y
 
V
R
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
L
 
I
A
 
A
L
 
A
M
 
V
D
 
A
G
 
G
F
 
Y
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
C
G
x
E
L
 
L
V
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
L
 
V
R
 
L
V
 
I
V
 
A
T
 
A
E
 
D
R
 
T
S
 
A
R
 
K
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
A
 
K
I
 
L
G
 
G
Y
x
V
F
 
L
P
|
P
D
x
G
V
 
M
G
 
G
G
 
G
S
 
S
H
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
V
 
A
P
 
I
G
 
G
E
 
K
L
 
A
-
 
K
G
 
A
I
 
M
Y
 
D
L
 
L
G
 
I
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
R
Q
 
T
I
 
M
R
 
D
A
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
E
Y
 
R
C
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
S
W
 
R
Y
 
V
L
 
V
E
 
P
S
 
A
N
 
D
K
 
D
L
 
L
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
L
D
 
T
Q
 
E
L
 
A
Q
 
R
W
 
A
H
 
T
E
 
A
T
 
T
P
 
T
L
 
I
K
 
S
D
 
Q
L
 
M
Q
 
S
G
 
A
L
 
S
L
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
M
A
 
A
V
 
K
Q
 
E
Q
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
29% identity, 62% coverage: 4:224/356 of query aligns to 2:211/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
T
 
T
Q
 
Y
N
 
E
E
 
T
V
 
I
L
 
L
A
 
V
E
 
E
V
 
R
R
 
D
N
 
Q
H
 
R
I
 
V
G
 
G
H
 
I
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
G
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
I
 
L
T
 
N
-
 
S
-
 
Q
-
 
V
L
 
M
D
 
N
M
 
E
V
 
V
R
 
T
S
 
S
L
 
A
Q
 
A
Q
 
T
Q
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
-
W
 
-
A
 
-
Q
 
D
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
V
 
I
H
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
E
 
-
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
 
G
G
x
A
D
|
D
I
|
I
R
x
K
S
 
E
L
x
M
Y
 
A
D
 
D
S
 
-
F
 
L
K
 
T
S
 
F
G
 
A
D
 
D
T
 
A
L
 
F
H
x
T
E
 
A
D
 
D
F
 
F
F
|
F
V
 
A
E
 
T
E
 
W
Y
 
G
A
 
K
L
 
L
D
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
H
 
A
H
 
A
Y
 
V
R
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
L
 
I
A
 
A
L
 
A
M
 
V
D
 
A
G
 
G
F
x
Y
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
C
G
x
E
L
 
L
V
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
L
 
V
R
 
L
V
 
I
V
 
A
T
 
A
E
 
D
R
 
T
S
 
A
R
 
K
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
A
 
K
I
x
L
G
 
G
Y
x
V
F
 
L
P
|
P
D
x
G
V
 
M
G
 
G
G
 
G
S
 
S
H
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
V
 
A
P
 
I
G
 
G
E
 
K
L
 
A
-
 
K
G
 
A
I
 
M
Y
 
D
L
 
L
G
 
I
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
R
Q
 
T
I
 
M
R
 
D
A
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
E
Y
 
R
C
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
S
W
 
R
Y
 
V
L
 
V
E
 
P
S
 
A
N
 
D
K
 
D
L
 
L
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
L
D
 
T
Q
 
E
L
 
A
Q
 
R
W
 
A
H
 
T
E
 
A
T
 
T
P
 
T
L
 
I
K
 
S
D
 
Q
L
 
M
Q
 
S
G
 
A
L
 
S
L
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
M
A
 
A
V
 
K
Q
 
E
Q
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
28% identity, 62% coverage: 4:224/356 of query aligns to 1:206/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
T
 
T
Q
 
Y
N
 
E
E
 
T
V
 
I
L
 
L
A
 
V
E
 
E
V
 
R
R
 
D
N
 
Q
H
 
R
I
 
V
G
 
G
H
 
I
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
G
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
N
-
 
S
-
 
Q
-
 
V
L
 
M
D
 
N
M
 
E
V
 
V
R
 
T
S
 
S
L
 
A
Q
 
A
Q
 
T
Q
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
-
W
 
-
A
 
-
Q
 
D
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
V
 
I
H
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
E
 
-
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
I
 
I
R
 
K
S
 
E
L
x
M
Y
 
F
D
 
-
S
 
-
F
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
A
D
 
D
T
 
A
L
 
F
H
x
T
E
 
A
D
 
D
F
 
F
F
|
F
V
 
A
E
 
T
E
 
W
Y
 
G
A
 
K
L
 
L
D
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
H
 
A
H
 
A
Y
 
V
R
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
L
 
I
A
 
A
L
 
A
M
 
V
D
 
A
G
 
G
F
 
Y
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
C
G
x
E
L
 
L
V
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
D
 
D
L
 
V
R
 
L
V
 
I
V
 
A
T
 
A
E
 
D
R
 
T
S
 
A
R
 
K
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
V
 
I
A
 
K
I
 
L
G
 
G
Y
x
V
F
 
L
P
|
P
D
x
G
V
 
M
G
 
G
G
 
G
S
 
S
H
 
Q
F
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
V
 
A
P
 
I
G
 
G
E
 
K
L
 
A
-
 
K
G
 
A
I
 
M
Y
 
D
L
 
L
G
 
I
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
R
Q
 
T
I
 
M
R
 
D
A
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
E
Y
 
R
C
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
S
W
 
R
Y
 
V
L
 
V
E
 
P
S
 
A
N
 
D
K
 
D
L
 
L
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
L
D
 
T
Q
 
E
L
 
A
Q
 
R
W
 
A
H
 
T
E
 
A
T
 
T
P
 
T
L
 
I
K
 
S
D
 
Q
L
 
M
Q
 
S
G
 
A
L
 
S
L
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
M
A
 
A
V
 
K
Q
 
E
Q
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

O53561 Enoyl-CoA hydratase EchA19; EC 4.2.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
32% identity, 49% coverage: 7:182/356 of query aligns to 9:184/266 of O53561

query
sites
O53561
E
 
D
V
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
E
V
 
R
R
 
R
N
 
G
H
 
H
I
 
T
G
 
L
H
 
I
L
 
V
T
 
T
L
 
M
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
A
G
 
A
L
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
S
L
 
T
D
 
E
M
 
M
V
 
M
R
 
R
S
 
I
L
 
M
Q
 
V
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
W
D
 
D
A
 
R
W
 
V
A
 
D
Q
 
N
D
 
D
P
 
P
Q
 
D
V
 
I
H
 
R
A
 
C
V
 
C
V
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
-
K
 
G
A
 
Y
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
M
D
 
D
I
 
L
R
 
K
S
 
A
L
 
A
Y
 
T
-
 
Q
-
 
K
-
 
P
-
 
P
-
 
G
D
 
D
S
 
S
F
 
F
K
 
K
S
 
D
G
 
G
D
 
-
T
 
-
L
 
-
H
 
-
E
 
-
D
 
S
F
 
Y
F
 
G
V
 
P
E
 
S
E
 
R
Y
 
I
A
 
D
L
 
A
D
 
L
L
 
L
A
 
K
I
 
G
H
 
R
H
 
R
Y
 
L
R
 
T
K
 
K
P
 
P
V
 
L
L
 
I
A
 
A
L
 
A
M
 
V
D
 
E
G
 
G
F
 
P
V
 
A
L
 
I
G
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
T
G
 
E
L
 
I
V
 
L
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
D
 
D
L
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
A
T
 
G
E
 
E
R
 
S
S
 
A
R
x
K
L
x
F
A
x
G
M
x
I
P
x
S
E
|
E
V
x
A
A
x
K
I
 
W
G
 
S
Y
 
L
F
 
Y
P
 
P
D
 
-
V
 
M
G
 
G
G
 
G
S
 
S
-
 
A
-
 
V
H
 
R
F
 
L
L
 
V
P
 
R
R
 
Q
V
 
I
P
 
P
G
 
Y
E
 
T
L
 
L
G
 
A
I
 
C
Y
 
D
L
 
L
G
 
L
V
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
R
Q
 
H
I
 
I
R
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
K
Y
 
E
C
 
M
G
 
G
L
 
L

1wdmA Fatty acid beta-oxidation multienzyme complex from pseudomonas fragi, form i (native3) (see paper)
31% identity, 47% coverage: 27:193/356 of query aligns to 32:195/707 of 1wdmA

query
sites
1wdmA
L
 
F
N
 
N
A
 
R
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
N
M
 
-
V
 
-
R
 
-
S
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
V
D
 
D
A
 
A
W
 
I
A
 
K
Q
 
A
D
 
D
P
 
A
Q
 
S
V
 
V
H
 
K
A
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
V
R
 
-
G
 
S
A
 
S
G
 
G
E
 
K
K
 
D
A
 
V
F
 
F
C
 
I
A
 
V
G
 
G
G
x
A
D
 
D
I
 
I
R
 
T
S
 
E
L
 
F
Y
 
V
D
 
E
S
 
N
F
 
F
K
 
K
S
 
L
G
 
P
D
 
D
T
 
A
L
 
E
H
 
L
E
 
I
D
 
A
F
 
G
F
x
N
V
 
L
E
 
E
E
 
A
Y
x
N
A
 
K
L
 
I
D
 
F
L
 
S
A
 
D
I
 
F
H
 
E
H
 
D
Y
 
L
R
 
N
K
 
V
P
 
P
V
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
M
 
I
D
 
N
G
 
G
F
 
I
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
G
x
E
L
 
M
V
 
C
Q
 
L
G
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
F
R
 
R
V
 
V
V
 
M
T
 
A
E
 
D
R
 
S
S
 
A
R
 
K
L
 
I
A
 
G
M
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
A
x
K
I
 
L
G
 
G
Y
 
I
F
 
Y
P
|
P
D
x
G
V
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
T
H
 
V
F
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
L
P
 
I
G
 
G
-
 
V
E
 
D
L
 
N
G
 
A
I
 
V
Y
 
E
L
 
W
G
 
I
V
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
K
Q
 
E
I
 
N
R
 
R
A
 
A
A
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
K
C
 
V
G
 
S
L
 
A
A
 
V
D
 
D
W
 
A
Y
 
V
L
 
V
E
 
T
S
 
A
N
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1wdlA Fatty acid beta-oxidation multienzyme complex from pseudomonas fragi, form ii (native4) (see paper)
31% identity, 47% coverage: 27:193/356 of query aligns to 32:195/715 of 1wdlA

query
sites
1wdlA
L
 
F
N
 
N
A
 
R
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
N
M
 
-
V
 
-
R
 
-
S
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
V
D
 
D
A
 
A
W
 
I
A
 
K
Q
 
A
D
 
D
P
 
A
Q
 
S
V
 
V
H
 
K
A
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
V
R
 
-
G
 
S
A
 
S
G
 
G
E
 
K
K
 
D
A
 
V
F
 
F
C
 
I
A
 
V
G
 
G
G
x
A
D
 
D
I
 
I
R
 
T
S
 
E
L
 
F
Y
 
V
D
 
E
S
 
N
F
 
F
K
 
K
S
 
L
G
 
P
D
 
D
T
 
A
L
 
E
H
 
L
E
 
I
D
 
A
F
 
G
F
x
N
V
 
L
E
 
E
E
 
A
Y
x
N
A
 
K
L
 
I
D
 
F
L
 
S
A
 
D
I
 
F
H
 
E
H
 
D
Y
 
L
R
 
N
K
 
V
P
 
P
V
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
M
 
I
D
 
N
G
 
G
F
 
I
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
G
x
E
L
 
M
V
 
C
Q
 
L
G
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
F
R
 
R
V
 
V
V
 
M
T
 
A
E
 
D
R
 
S
S
 
A
R
 
K
L
 
I
A
 
G
M
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
A
 
K
I
 
L
G
 
G
Y
 
I
F
 
Y
P
|
P
D
x
G
V
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
T
H
 
V
F
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
L
P
 
I
G
 
G
-
 
V
E
 
D
L
 
N
G
 
A
I
 
V
Y
 
E
L
 
W
G
 
I
V
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
K
Q
 
E
I
 
N
R
 
R
A
 
A
A
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
K
C
 
V
G
 
S
L
 
A
A
 
V
D
 
D
W
 
A
Y
 
V
L
 
V
E
 
T
S
 
A
N
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P28793 Fatty acid oxidation complex subunit alpha; EC 4.2.1.17; EC 5.1.2.3; EC 5.3.3.8; EC 1.1.1.35 from Pseudomonas fragi (see paper)
31% identity, 47% coverage: 27:193/356 of query aligns to 32:195/715 of P28793

query
sites
P28793
L
 
F
N
 
N
A
 
R
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
N
M
 
-
V
 
-
R
 
-
S
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
V
D
 
D
A
 
A
W
 
I
A
 
K
Q
 
A
D
 
D
P
 
A
Q
 
S
V
 
V
H
 
K
A
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
V
R
 
-
G
 
S
A
 
S
G
 
G
E
 
K
K
 
D
A
 
V
F
 
F
C
 
I
A
 
V
G
 
G
G
 
A
D
 
D
I
 
I
R
 
T
S
 
E
L
 
F
Y
 
V
D
 
E
S
 
N
F
 
F
K
 
K
S
 
L
G
 
P
D
 
D
T
 
A
L
 
E
H
 
L
E
 
I
D
 
A
F
 
G
F
 
N
V
 
L
E
 
E
E
 
A
Y
 
N
A
 
K
L
 
I
D
 
F
L
 
S
A
 
D
I
 
F
H
 
E
H
 
D
Y
 
L
R
 
N
K
 
V
P
 
P
V
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
M
 
I
D
 
N
G
 
G
F
 
I
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
L
G
 
E
L
 
M
V
 
C
Q
 
L
G
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
F
R
 
R
V
 
V
V
 
M
T
 
A
E
 
D
R
 
S
S
 
A
R
 
K
L
 
I
A
 
G
M
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
K
I
 
L
G
 
G
Y
 
I
F
 
Y
P
 
P
D
 
G
V
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
T
H
 
V
F
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
R
V
 
L
P
 
I
G
 
G
-
 
V
E
 
D
L
 
N
G
 
A
I
 
V
Y
 
E
L
 
W
G
 
I
V
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
K
Q
 
E
I
 
N
R
 
R
A
 
A
A
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
L
Y
 
K
C
 
V
G
 
S
L
 
A
A
 
V
D
 
D
W
 
A
Y
 
V
L
 
V
E
 
T
S
 
A
N
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5wydA Structural of pseudomonas aeruginosa dspi (see paper)
27% identity, 52% coverage: 6:191/356 of query aligns to 9:191/262 of 5wydA

query
sites
5wydA
N
 
H
E
 
K
V
 
L
L
 
T
A
 
V
E
 
E
V
 
K
R
 
H
N
 
G
H
 
H
I
 
T
G
 
A
H
 
L
L
 
I
T
 
T
L
 
I
N
 
N
R
 
H
P
 
P
A
 
P
G
 
A
L
 
-
N
 
N
A
 
T
I
 
W
T
 
D
L
 
R
D
 
D
M
 
S
V
 
L
R
 
I
S
 
G
L
 
L
Q
 
R
Q
 
Q
Q
 
L
L
 
I
D
 
E
A
 
H
W
 
L
A
 
N
Q
 
R
D
 
D
P
 
D
Q
 
D
V
 
I
H
 
Y
A
 
A
V
 
L
V
 
V
L
 
V
R
 
T
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
E
 
P
K
|
K
A
 
F
F
 
F
C
 
S
A
 
A
G
 
G
G
x
A
D
 
D
I
 
L
R
 
N
S
 
M
L
x
F
Y
 
A
D
 
D
S
 
G
F
 
D
K
 
K
S
 
A
G
 
R
D
 
A
T
 
R
L
 
E
H
 
M
E
 
A
D
 
R
F
 
R
F
 
F
V
 
G
E
 
E
E
 
A
Y
 
F
A
 
E
L
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
A
I
 
L
H
 
R
H
 
D
Y
 
F
R
 
R
K
 
G
P
 
V
V
 
S
L
 
I
A
 
A
L
 
A
M
 
I
D
 
N
G
 
G
F
 
Y
V
 
A
L
 
M
G
 
G
G
|
G
G
 
G
M
 
L
G
x
E
L
 
C
V
 
A
Q
 
L
G
 
A
A
 
C
D
 
D
L
 
I
R
 
R
V
 
I
V
 
A
T
 
E
E
 
R
R
 
Q
S
 
A
R
 
Q
L
 
M
A
 
A
M
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
A
A
 
A
I
 
V
G
 
G