SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_562 Histidine transporter, periplasmic histidine-binding protein to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 6 hits to proteins with known functional sites (download)

7yleA Rndmpx in complex with dmsp (see paper)
27% identity, 88% coverage: 31:325/337 of query aligns to 5:286/299 of 7yleA

query
sites
7yleA
I
 
V
H
 
S
F
 
I
G
 
T
D
 
E
I
 
M
T
 
N
W
|
W
E
 
A
S
 
S
G
 
A
S
 
S
L
 
V
I
 
V
T
 
T
E
 
T
I
 
V
L
 
A
R
 
T
L
 
F
I
 
L
V
 
M
E
 
E
K
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
C
P
 
A
T
 
V
D
 
T
T
 
V
L
 
V
P
 
P
G
 
S
S
 
S
T
|
T
V
 
V
S
 
P
L
 
A
E
 
V
A
 
T
A
 
S
L
 
V
A
 
S
K
 
E
N
 
T
-
 
G
D
 
E
I
 
P
Q
 
D
V
 
I
I
 
L
G
 
T
E
 
E
E
 
L
W
|
W
A
 
L
G
 
S
R
 
S
S
 
L
P
 
P
A
 
N
W
 
Y
V
 
A
K
 
K
A
 
L
A
 
E
S
 
A
E
 
Q
G
 
G
K
 
T
V
 
V
F
 
R
G
 
T
L
 
L
G
 
T
D
 
E
T
 
V
V
 
L
K
 
S
-
 
D
G
 
G
A
 
G
T
 
Q
E
|
E
G
 
G
W
 
W
W
 
W
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
Y
 
Y
V
 
L
I
 
A
K
 
E
G
 
A
D
 
H
P
 
P
E
 
E
R
 
-
G
 
-
I
 
-
K
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
V
A
 
T
R
 
T
Y
 
I
K
 
E
D
 
G
V
 
I
F
 
L
R
 
A
D
 
N
P
 
P
E
 
-
D
 
D
P
 
L
S
 
V
R
 
G
G
 
G
R
 
R
F
 
F
L
 
H
N
 
R
S
 
S
P
 
P
T
 
D
G
 
G
W
|
W
T
x
A
S
x
A
E
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
D
S
 
S
Q
 
S
K
 
L
L
 
A
K
 
K
A
 
A
Y
 
W
D
 
D
L
 
L
T
 
E
A
 
G
S
 
N
Y
 
G
V
 
I
N
 
E
-
 
V
F
 
F
R
 
A
T
 
H
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
A
A
 
T
E
 
S
V
 
I
A
 
A
S
 
A
S
 
A
I
 
Y
R
 
A
R
 
D
G
 
R
K
 
E
P
 
P
V
 
W
L
 
F
F
 
G
Y
|
Y
Y
 
Y
W
|
W
S
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
S
L
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
K
F
 
F
K
 
P
L
 
M
V
 
V
K
 
M
L
 
V
E
 
D
E
 
L
P
 
G
P
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
A
Q
 
D
A
 
I
W
 
H
K
 
A
T
 
C
L
 
N
A
 
S
D
 
K
A
 
A
N
 
D
N
 
C
P
 
A
N
 
N
P
 
V
K
 
G
G
 
K
T
 
S
R
 
P
S
 
Y
M
 
P
P
 
R
A
 
A
S
 
R
L
 
V
A
 
I
I
 
T
G
 
A
V
 
V
S
 
T
A
 
P
P
 
G
F
 
F
K
 
A
A
 
E
Q
 
E
Y
 
N
P
 
P
D
 
E
L
 
I
V
 
I
A
 
E
F
 
M
F
 
L
E
 
S
K
 
N
V
 
L
D
 
S
L
 
F
P
 
T
I
 
N
D
 
D
L
 
Q
L
 
M
N
 
G
Q
 
A
T
 
I
L
 
L
G
 
A
Q
 
W
M
 
Q
S
 
E
E
 
E
K
 
N
R
 
G
Q
 
A
P
 
S
P
 
S
R
 
E
Q
 
E
V
 
A
A
 
A
E
 
V
A
 
W
F
 
F
L
 
L
R
 
S
D
 
N
Q
 
N
P
 
S
Q
 
D
V
 
I
W
 
W
K
 
A
A
 
G
W
 
W
V
 
V

4xz6A Tmox in complex with tmao (see paper)
24% identity, 88% coverage: 30:327/337 of query aligns to 9:291/291 of 4xz6A

query
sites
4xz6A
P
 
P
I
 
I
H
 
H
F
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
T
 
N
W
|
W
E
 
S
S
 
S
G
 
Q
S
 
I
L
 
V
I
 
M
T
 
S
E
 
N
I
 
V
L
 
V
R
 
G
L
 
Q
I
 
I
V
 
F
E
 
E
K
 
E
G
 
-
Y
 
M
G
 
G
Y
 
V
P
 
A
T
 
V
D
 
E
T
 
F
L
 
V
P
 
T
G
 
T
S
 
D
T
 
S
V
 
Q
S
 
A
L
 
V
E
 
Y
A
 
E
A
 
S
L
 
V
A
 
R
K
 
L
N
 
G
D
 
D
I
 
V
Q
 
T
V
 
L
I
 
E
G
 
L
E
 
E
E
 
V
W
|
W
A
 
E
G
 
G
R
 
A
S
x
F
P
 
G
A
 
A
W
 
S
V
 
F
K
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
L
E
 
E
-
 
K
G
 
G
K
 
G
V
 
I
F
 
V
G
 
D
L
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
H
V
 
D
K
 
A
G
 
V
A
 
T
T
 
R
E
|
E
G
 
D
W
 
W
W
 
W
V
 
Y
P
 
P
E
 
M
Y
 
W
V
 
T
I
 
-
K
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
R
 
K
G
 
D
I
 
A
K
 
C
P
 
P
L
 
G
A
 
L
P
 
P
E
 
D
L
 
W
K
 
K
S
 
A
V
 
L
A
 
N
D
 
D
L
 
C
A
 
A
R
 
A
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
V
 
V
F
 
F
R
 
A
D
 
T
P
 
A
E
 
E
D
 
T
P
 
G
S
 
D
R
 
K
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
L
 
L
N
 
D
S
 
G
P
 
P
T
 
V
G
 
D
W
|
W
T
 
L
S
 
K
E
 
H
I
 
-
V
 
-
N
 
G
S
 
K
Q
 
E
K
 
R
L
 
V
K
 
E
A
 
A
Y
 
L
D
 
G
L
 
M
T
 
N
A
 
F
S
 
E
Y
 
V
V
 
I
N
 
N
F
 
-
R
 
-
T
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
W
A
 
A
E
 
E
V
 
I
A
 
G
S
 
A
S
 
A
I
 
E
R
 
A
R
 
D
G
 
K
K
 
R
P
 
P
V
 
V
L
 
V
F
 
V
Y
x
F
Y
 
N
W
|
W
S
 
T
P
 
P
T
 
N
P
 
F
L
 
A
L
 
E
G
 
A
R
 
V
F
 
W
K
 
P
L
 
G
V
 
E
K
 
F
L
 
V
E
 
E
E
 
F
P
 
P
P
 
E
F
 
W
D
 
V
A
 
D
Q
 
G
A
 
C
W
 
D
K
 
K
T
 
D
L
x
P
A
 
A
D
x
V
A
 
G
N
 
P
N
|
N
P
 
P
N
 
D
P
x
A
K
 
L
G
 
Y
T
x
D
R
 
C
S
 
G
M
 
N
P
 
P
A
 
A
S
 
T
L
 
G
A
 
Y
I
 
L
G
 
K
V
 
K
S
 
A
A
 
A
-
 
W
-
 
E
P
 
G
F
 
M
K
 
E
A
 
A
Q
 
K
Y
 
W
P
 
P
D
 
D
L
 
A
V
 
Y
A
 
A
F
 
V
F
 
L
E
 
T
K
 
R
V
 
I
D
 
S
L
 
F
P
 
T
I
 
N
D
 
P
L
 
Q
L
 
I
N
 
A
Q
 
E
T
 
M
L
 
A
G
 
K
Q
 
L
M
 
V
S
 
D
E
 
V
K
 
D
R
 
E
Q
 
M
P
 
E
P
 
P
R
 
D
Q
 
E
V
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
W
L
 
L
R
 
E
D
 
A
Q
 
N
P
 
E
Q
 
D
V
 
V
W
 
W
K
 
R
A
 
P
W
 
W
V
 
L
P
 
D
G
 
G

2rinA Abc-transporter choline binding protein in complex with acetylcholine (see paper)
23% identity, 91% coverage: 26:332/337 of query aligns to 1:273/288 of 2rinA

query
sites
2rinA
E
 
E
K
 
S
T
 
C
T
 
G
P
 
T
I
 
V
H
 
R
F
 
F
G
 
S
D
 
D
I
 
V
T
 
G
W
|
W
E
 
T
S
x
D
G
 
I
S
 
T
L
 
A
I
 
T
T
 
T
E
 
A
I
 
T
L
 
A
R
 
T
L
 
T
I
 
I
V
 
L
E
 
E
K
 
-
G
 
A
Y
 
L
G
 
G
Y
 
Y
P
 
E
T
 
T
D
 
D
T
 
V
L
 
K
P
 
V
G
 
L
S
 
S
T
 
V
V
 
P
S
 
V
L
 
T
E
 
Y
A
 
T
A
 
S
L
 
L
A
 
K
K
 
N
N
 
K
D
 
D
I
 
I
Q
 
D
V
 
V
I
 
F
G
 
L
E
 
G
E
 
N
W
|
W
A
 
M
G
 
P
R
 
T
S
 
M
P
 
E
A
 
A
W
 
D
V
 
I
K
 
A
A
 
P
A
 
Y
S
 
R
E
 
E
G
 
D
K
 
K
V
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
S
V
 
V
K
 
E
G
 
T
A
 
V
T
 
R
E
 
E
G
 
N
W
 
L
W
 
A
V
 
G
P
 
A
E
 
K
Y
|
Y
V
 
T
I
 
L
K
 
A
G
 
T
D
 
N
P
 
A
E
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
K
 
K
P
 
G
L
 
A
A
 
E
P
 
L
E
 
G
L
 
I
K
 
K
S
 
D
V
 
F
A
 
K
D
 
D
L
 
I
A
 
A
R
 
A
Y
 
H
K
 
K
D
 
D
V
 
E
F
 
L
R
 
D
D
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
G
R
 
K
F
 
I
L
 
Y
N
 
G
S
x
I
P
 
E
T
 
P
G
 
G
W
x
N
T
x
D
S
x
G
E
 
N
-
 
R
-
 
L
I
 
I
V
 
I
N
 
D
S
 
M
Q
 
V
K
 
E
L
 
K
K
 
G
A
 
T
Y
 
F
D
 
D
L
 
L
T
 
K
A
 
G
S
 
F
Y
 
E
V
 
V
N
 
V
F
 
E
R
 
S
T
 
S
G
 
E
S
 
Q
G
 
G
A
 
-
A
 
-
L
 
M
D
 
L
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
S
 
R
S
 
A
I
 
E
R
 
K
R
 
S
G
 
G
K
 
D
P
 
P
V
 
I
L
 
V
F
 
F
Y
 
L
Y
 
G
W
|
W
S
 
E
P
 
P
T
 
H
P
 
P
L
 
M
L
 
N
G
 
A
R
 
N
F
 
F
K
 
K
L
 
L
V
 
T
K
 
Y
L
 
L
E
 
S
E
 
G
P
 
G
P
 
D
F
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
V
N
 
F
N
 
G
P
 
P
N
 
N
P
 
Y
K
 
G
G
 
G
T
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
P
 
-
A
 
A
S
 
T
L
 
V
A
 
H
I
 
T
G
 
N
V
 
V
S
 
R
A
 
A
P
 
G
F
 
Y
K
 
T
A
 
T
Q
 
E
Y
 
C
P
 
P
D
 
N
L
 
V
V
 
D
A
 
K
F
 
L
F
 
L
E
 
Q
K
 
N
V
 
L
D
 
S
L
 
F
P
 
S
I
 
L
D
 
Q
L
 
M
L
 
E
N
 
N
Q
 
E
T
 
I
L
 
M
G
 
G
Q
 
K
M
 
I
S
 
L
E
 
N
K
 
D
R
 
G
Q
 
E
P
 
D
P
 
P
R
 
E
Q
 
K
V
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
R
 
K
D
 
D
Q
 
N
P
 
P
Q
 
Q
V
 
S
W
 
I
K
 
E
A
 
P
W
 
W
V
 
L
P
 
S
G
 
G
E
 
-
V
 
V
A
 
A
T
 
T
K
 
K

2regA Abc-transporter choline binding protein in complex with choline (see paper)
23% identity, 91% coverage: 26:332/337 of query aligns to 3:275/290 of 2regA

query
sites
2regA
E
 
E
K
 
S
T
 
C
T
 
G
P
 
T
I
 
V
H
 
R
F
 
F
G
 
S
D
 
D
I
 
V
T
 
G
W
|
W
E
 
T
S
x
D
G
 
I
S
 
T
L
 
A
I
 
T
T
 
T
E
 
A
I
 
T
L
 
A
R
 
T
L
 
T
I
 
I
V
 
L
E
 
E
K
 
-
G
 
A
Y
 
L
G
 
G
Y
 
Y
P
 
E
T
 
T
D
 
D
T
 
V
L
 
K
P
 
V
G
 
L
S
 
S
T
 
V
V
 
P
S
 
V
L
 
T
E
 
Y
A
 
T
A
 
S
L
 
L
A
 
K
K
 
N
N
 
K
D
 
D
I
 
I
Q
 
D
V
 
V
I
 
F
G
 
L
E
 
G
E
 
N
W
|
W
A
 
M
G
 
P
R
 
T
S
 
M
P
 
E
A
 
A
W
 
D
V
 
I
K
 
A
A
 
P
A
 
Y
S
 
R
E
 
E
G
 
D
K
 
K
V
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
S
V
 
V
K
 
E
G
 
T
A
 
V
T
 
R
E
 
E
G
 
N
W
 
L
W
 
A
V
 
G
P
 
A
E
 
K
Y
|
Y
V
 
T
I
 
L
K
 
A
G
 
T
D
 
N
P
 
A
E
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
K
 
K
P
 
G
L
 
A
A
 
E
P
 
L
E
 
G
L
 
I
K
 
K
S
 
D
V
 
F
A
 
K
D
 
D
L
 
I
A
 
A
R
 
A
Y
 
H
K
 
K
D
 
D
V
 
E
F
 
L
R
 
D
D
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
G
R
 
K
F
 
I
L
 
Y
N
 
G
S
 
I
P
 
E
T
 
P
G
 
G
W
x
N
T
x
D
S
 
G
E
 
N
-
 
R
-
 
L
I
 
I
V
 
I
N
 
D
S
 
M
Q
 
V
K
 
E
L
 
K
K
 
G
A
 
T
Y
 
F
D
 
D
L
 
L
T
 
K
A
 
G
S
 
F
Y
 
E
V
 
V
N
 
V
F
 
E
R
 
S
T
 
S
G
 
E
S
 
Q
G
 
G
A
 
-
A
 
-
L
 
M
D
 
L
A
 
A
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
S
 
R
S
 
A
I
 
E
R
 
K
R
 
S
G
 
G
K
 
D
P
 
P
V
 
I
L
 
V
F
 
F
Y
 
L
Y
 
G
W
|
W
S
 
E
P
 
P
T
 
H
P
 
P
L
 
M
L
 
N
G
 
A
R
 
N
F
 
F
K
 
K
L
 
L
V
 
T
K
 
Y
L
 
L
E
 
S
E
 
G
P
 
G
P
 
D
F
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
W
 
-
K
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
V
N
 
F
N
 
G
P
 
P
N
 
N
P
 
Y
K
 
G
G
 
G
T
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
P
 
-
A
 
A
S
 
T
L
 
V
A
 
H
I
 
T
G
 
N
V
 
V
S
 
R
A
 
A
P
 
G
F
 
Y
K
 
T
A
 
T
Q
 
E
Y
 
C
P
 
P
D
 
N
L
 
V
V
 
D
A
 
K
F
 
L
F
 
L
E
 
Q
K
 
N
V
 
L
D
 
S
L
 
F
P
 
S
I
 
L
D
 
Q
L
 
M
L
 
E
N
 
N
Q
 
E
T
 
I
L
 
M
G
 
G
Q
 
K
M
 
I
S
 
L
E
 
N
K
 
D
R
 
G
Q
 
E
P
 
D
P
 
P
R
 
E
Q
 
K
V
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
R
 
K
D
 
D
Q
 
N
P
 
P
Q
 
Q
V
 
S
W
 
I
K
 
E
A
 
P
W
 
W
V
 
L
P
 
S
G
 
G
E
 
-
V
 
V
A
 
A
T
 
T
K
 
K

P0AFM2 Glycine betaine/proline betaine-binding periplasmic protein; GBBP from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
22% identity, 70% coverage: 96:332/337 of query aligns to 97:329/330 of P0AFM2

query
sites
P0AFM2
A
 
A
A
 
G
S
 
G
E
 
D
G
 
K
K
 
K
V
 
F
F
 
Y
G
 
R
L
 
E
G
 
G
D
 
V
T
 
F
V
 
V
K
 
N
G
 
G
A
 
A
T
 
A
E
 
Q
G
 
G
W
 
Y
W
 
L
V
 
I
P
 
D
E
 
-
Y
 
-
V
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
K
 
K
P
 
K
L
 
T
A
 
A
P
 
D
E
 
Q
L
 
Y
K
 
K
S
 
-
V
 
I
A
 
T
D
 
N
L
 
I
A
 
A
R
 
Q
Y
 
L
K
 
K
D
 
D
-
 
P
-
 
K
-
 
I
-
 
A
V
 
K
F
 
L
R
 
F
D
 
D
P
 
T
E
 
N
D
 
G
P
 
D
S
 
G
R
 
K
G
 
A
R
 
D
F
 
L
L
 
T
N
 
G
S
x
C
P
 
N
T
 
P
G
 
G
W
|
W
T
x
G
S
x
C
E
 
E
I
 
G
V
 
A
N
 
I
S
 
N
Q
 
H
K
 
Q
L
 
L
K
 
A
A
 
A
Y
 
Y
D
 
E
L
 
L
T
 
T
A
 
N
S
 
T
Y
 
-
V
 
V
N
 
T
F
 
H
R
 
N
T
 
Q
G
 
G
S
 
N
G
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
M
A
 
A
E
 
D
V
 
T
A
 
I
S
 
S
S
 
R
I
 
Y
R
 
K
R
 
E
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
F
F
 
Y
Y
 
Y
Y
 
T
W
 
W
S
 
T
P
 
P
T
 
Y
P
 
W
L
 
V
L
 
S
G
 
N
R
 
E
F
 
L
-
 
K
-
 
P
-
 
G
K
 
K
L
 
D
V
 
V
K
 
V
L
 
W
E
 
L
E
 
Q
P
 
V
P
 
P
F
 
F
D
 
S
A
 
A
Q
 
L
A
 
P
W
 
G
K
 
D
T
 
K
L
 
N
A
 
A
D
 
D
A
 
T
N
 
K
N
 
L
P
 
P
N
 
N
P
 
G
K
 
A
G
 
N
T
 
Y
R
 
G
S
 
F
M
 
P
P
 
V
A
 
S
S
 
T
L
 
M
A
 
H
I
 
I
G
 
V
V
 
A
S
 
N
A
 
K
P
 
A
F
 
W
K
 
A
A
 
E
Q
 
K
Y
 
N
P
 
P
D
 
A
L
 
A
V
 
A
A
 
K
F
 
L
F
 
F
E
 
A
K
 
I
V
 
M
D
 
Q
L
 
L
P
 
P
I
 
V
D
 
A
L
 
D
L
 
I
N
 
N
Q
 
A
T
 
Q
L
 
N
G
 
A
Q
 
I
M
 
M
S
 
H
E
 
D
K
 
G
R
 
K
Q
 
A
P
 
S
P
 
E
R
 
G
Q
 
D
V
 
I
-
 
Q
-
 
G
-
 
H
A
 
V
E
 
D
A
 
G
F
 
W
L
 
I
R
 
K
D
 
A
Q
 
H
P
 
Q
Q
 
Q
V
 
Q
W
 
F
K
 
D
A
 
G
W
 
W
V
 
V
P
 
N
G
 
E
E
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
A
K
 
Q

Sites not aligning to the query:

1r9qA Structure analysis of prox in complex with proline betaine (see paper)
22% identity, 70% coverage: 96:332/337 of query aligns to 76:308/309 of 1r9qA

query
sites
1r9qA
A
 
A
A
 
G
S
 
G
E
 
D
G
 
K
K
 
K
V
 
F
F
 
Y
G
 
R
L
 
E
G
 
G
D
 
V
T
 
F
V
 
V
K
 
N
G
 
G
A
 
A
T
 
A
E
 
Q
G
 
G
W
 
Y
W
 
L
V
 
I
P
 
D
E
 
-
Y
 
-
V
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
K
 
K
P
 
K
L
 
T
A
 
A
P
 
D
E
 
Q
L
 
Y
K
 
K
S
 
-
V
 
I
A
 
T
D
 
N
L
 
I
A
 
A
R
 
Q
Y
 
L
K
 
K
D
 
D
-
 
P
-
 
K
-
 
I
-
 
A
V
 
K
F
 
L
R
 
F
D
 
D
P
 
T
E
 
N
D
 
G
P
 
D
S
 
G
R
 
K
G
 
A
R
 
D
F
 
L
L
 
T
N
 
G
S
 
C
P
 
N
T
 
P
G
 
G
W
|
W
T
x
G
S
x
C
E
 
E
I
 
G
V
 
A
N
 
I
S
 
N
Q
 
H
K
 
Q
L
 
L
K
 
A
A
 
A
Y
 
Y
D
 
E
L
 
L
T
 
T
A
 
N
S
 
T
Y
 
-
V
 
V
N
 
T
F
 
H
R
 
N
T
 
Q
G
 
G
S
 
N
G
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
M
A
 
A
E
 
D
V
 
T
A
 
I
S
 
S
S
 
R
I
 
Y
R
 
K
R
 
E
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
F
F
 
Y
Y
|
Y
Y
 
T
W
|
W
S
 
T
P
 
P
T
 
Y
P
 
W
L
 
V
L
 
S
G
 
N
R
 
E
F
 
L
-
 
K
-
 
P
-
 
G
K
 
K
L
 
D
V
 
V
K
 
V
L
 
W
E
 
L
E
 
Q
P
 
V
P
 
P
F
 
F
D
 
S
A
 
A
Q
 
L
A
 
P
W
 
G
K
 
D
T
 
K
L
 
N
A
 
A
D
 
D
A
 
T
N
 
K
N
 
L
P
 
P
N
 
N
P
 
G
K
 
A
G
 
N
T
 
Y
R
 
G
S
 
F
M
 
P
P
 
V
A
 
S
S
 
T
L
 
M
A
 
H
I
 
I
G
 
V
V
 
A
S
 
N
A
 
K
P
 
A
F
 
W
K
 
A
A
 
E
Q
 
K
Y
 
N
P
 
P
D
 
A
L
 
A
V
 
A
A
 
K
F
 
L
F
 
F
E
 
A
K
 
I
V
 
M
D
 
Q
L
 
L
P
 
P
I
 
V
D
 
A
L
 
D
L
 
I
N
 
N
Q
 
A
T
 
Q
L
 
N
G
 
A
Q
 
I
M
 
M
S
 
H
E
 
D
K
 
G
R
 
K
Q
 
A
P
 
S
P
 
E
R
 
G
Q
 
D
V
 
I
-
 
Q
-
 
G
-
 
H
A
 
V
E
 
D
A
 
G
F
 
W
L
 
I
R
 
K
D
 
A
Q
 
H
P
 
Q
Q
 
Q
V
 
Q
W
 
F
K
 
D
A
 
G
W
 
W
V
 
V
P
 
N
G
 
E
E
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
A
K
 
Q

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Pf1N1B4_562 Histidine transporter, periplasmic histidine-binding protein
MRSIKTLLGSSLLALSLVAGHVPAAEKTTPIHFGDITWESGSLITEILRLIVEKGYGYPT
DTLPGSTVSLEAALAKNDIQVIGEEWAGRSPAWVKAASEGKVFGLGDTVKGATEGWWVPE
YVIKGDPERGIKPLAPELKSVADLARYKDVFRDPEDPSRGRFLNSPTGWTSEIVNSQKLK
AYDLTASYVNFRTGSGAALDAEVASSIRRGKPVLFYYWSPTPLLGRFKLVKLEEPPFDAQ
AWKTLADANNPNPKGTRSMPASLAIGVSAPFKAQYPDLVAFFEKVDLPIDLLNQTLGQMS
EKRQPPRQVAEAFLRDQPQVWKAWVPGEVATKVSESL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory