SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_2530 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_2530 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2zi8A Crystal structure of the hsac extradiol dioxygenase from m. Tuberculosis in complex with 3,4-dihydroxy-9,10-seconandrost-1,3, 5(10)-triene-9,17-dione (dhsa) (see paper)
44% identity, 99% coverage: 1:296/298 of query aligns to 1:297/299 of 2zi8A

query
sites
2zi8A
M
 
M
D
 
S
I
 
I
R
 
R
G
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
L
T
 
R
L
 
I
L
 
E
S
 
A
S
 
T
D
 
D
L
 
M
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
H
 
E
Y
 
Y
A
 
G
S
 
L
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
M
 
V
V
 
E
I
 
G
G
 
K
S
 
G
D
 
A
D
 
P
D
 
E
A
 
G
H
 
A
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
M
 
M
D
 
D
E
 
D
R
 
F
H
 
P
Y
 
A
R
 
R
I
 
L
L
 
V
V
 
V
Q
 
V
K
 
P
N
 
G
V
 
E
E
 
H
N
 
D
G
 
R
F
 
L
G
 
L
A
 
E
C
 
A
G
 
G
W
 
W
E
 
E
V
 
C
A
 
A
G
 
N
K
 
A
A
 
E
A
 
G
L
 
L
E
 
Q
Q
 
E
A
 
I
V
 
R
S
 
N
E
 
R
L
 
L
Q
 
D
Q
 
L
A
 
E
D
 
G
V
 
T
Q
 
P
V
 
Y
T
 
K
R
 
E
G
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
L
E
 
A
L
 
D
R
 
R
K
 
R
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
I
H
 
R
F
 
F
S
 
A
D
 
D
P
 
P
D
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
C
H
 
L
E
 
E
I
 
V
F
 
F
W
 
H
G
 
G
P
 
T
L
 
A
Q
 
L
D
 
E
F
 
H
A
 
R
R
 
R
F
 
V
V
 
V
S
 
S
P
 
P
V
 
Y
G
 
G
V
 
H
K
 
R
G
 
-
F
 
F
V
 
V
T
 
T
N
 
G
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
M
 
M
G
 
G
H
|
H
V
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
S
A
 
T
P
 
R
A
 
D
F
 
D
E
 
A
R
 
E
C
 
A
R
 
L
D
 
H
F
 
F
Y
 
Y
E
 
R
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
R
L
 
L
S
 
R
D
 
D
L
 
S
M
 
M
K
 
R
V
 
L
-
 
P
-
 
P
R
 
Q
F
 
M
T
 
V
P
 
G
D
 
R
P
 
P
A
 
A
E
 
D
-
 
G
P
 
P
Q
 
P
K
 
A
R
 
W
I
 
L
H
 
R
F
|
F
L
 
F
H
 
G
C
 
C
N
 
N
N
 
P
G
 
-
R
 
R
H
 
H
H
|
H
S
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
F
F
 
L
E
 
P
C
 
M
P
 
P
M
 
T
P
 
S
H
 
S
G
 
G
C
 
I
V
|
V
H
|
H
M
 
L
M
 
M
V
 
V
E
 
E
V
 
V
N
 
E
A
 
Q
L
 
A
D
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
G
R
 
L
A
 
C
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
H
 
L
A
 
R
N
 
R
G
 
K
V
 
V
K
 
P
L
 
M
S
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
H
|
H
T
 
V
N
|
N
D
 
D
Q
 
L
M
 
M
I
 
L
S
 
S
F
 
F
Y
|
Y
I
 
M
K
 
K
T
 
T
P
 
P
S
 
G
G
 
G
F
 
F
D
 
D
L
 
I
E
|
E
Y
 
F
G
 
G
C
 
C
D
 
E
G
 
G
L
 
R
V
 
Q
V
 
V
D
 
D
W
 
D
D
 
R
R
 
D
H
 
W
T
 
I
P
 
A
F
 
R
E
 
E
S
 
S
T
 
T
V
 
A
V
|
V
S
 
S
H
 
L
W
 
W
G
 
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
S
 
T
V
 
V
G
 
G

P9WNW7 Iron-dependent extradiol dioxygenase; EC 1.13.11.25 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
44% identity, 99% coverage: 1:296/298 of query aligns to 1:297/300 of P9WNW7

query
sites
P9WNW7
M
 
M
D
 
S
I
 
I
R
 
R
G
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
L
T
 
R
L
 
I
L
 
E
S
 
A
S
 
T
D
 
D
L
 
M
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
H
 
E
Y
 
Y
A
 
G
S
 
L
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
M
 
V
V
 
E
I
 
G
G
 
K
S
 
G
D
 
A
D
 
P
D
 
E
A
 
G
H
 
A
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
M
 
M
D
 
D
E
 
D
R
 
F
H
 
P
Y
 
A
R
 
R
I
 
L
L
 
V
V
 
V
Q
 
V
K
 
P
N
 
G
V
 
E
E
 
H
N
 
D
G
 
R
F
 
L
G
 
L
A
 
E
C
 
A
G
 
G
W
 
W
E
 
E
V
 
C
A
 
A
G
 
N
K
 
A
A
 
E
A
 
G
L
 
L
E
 
Q
Q
 
E
A
 
I
V
 
R
S
 
N
E
 
R
L
 
L
Q
 
D
Q
 
L
A
 
E
D
 
G
V
 
T
Q
 
P
V
 
Y
T
 
K
R
 
E
G
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
L
E
 
A
L
 
D
R
 
R
K
 
R
V
 
V
Q
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
I
H
 
R
F
 
F
S
 
A
D
 
D
P
 
P
D
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
C
H
 
L
E
 
E
I
 
V
F
 
F
W
 
H
G
 
G
P
 
T
L
 
A
Q
 
L
D
 
E
F
 
H
A
 
R
R
 
R
F
 
V
V
 
V
S
 
S
P
 
P
V
 
Y
G
 
G
V
 
H
K
 
R
G
 
-
F
 
F
V
 
V
T
 
T
N
 
G
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
M
 
M
G
 
G
H
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
S
A
 
T
P
 
R
A
 
D
F
 
D
E
 
A
R
 
E
C
 
A
R
 
L
D
 
H
F
 
F
Y
 
Y
E
 
R
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
R
L
 
L
S
 
R
D
 
D
L
 
S
M
 
M
K
 
R
V
 
L
-
 
P
-
 
P
R
 
Q
F
 
M
T
 
V
P
 
G
D
 
R
P
 
P
A
 
A
E
 
D
-
 
G
P
 
P
Q
 
P
K
 
A
R
 
W
I
 
L
H
 
R
F
 
F
L
 
F
H
 
G
C
 
C
N
 
N
N
 
P
G
 
-
R
 
R
H
 
H
H
|
H
S
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
F
F
 
L
E
 
P
C
 
M
P
 
P
M
 
T
P
 
S
H
 
S
G
 
G
C
 
I
V
 
V
H
|
H
M
 
L
M
 
M
V
 
V
E
 
E
V
 
V
N
 
E
A
 
Q
L
 
A
D
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
G
R
 
L
A
 
C
L
 
L
D
 
D
R
 
R
V
 
A
H
 
L
A
 
R
N
 
R
G
 
K
V
 
V
K
 
P
L
 
M
S
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
H
 
H
T
 
V
N
 
N
D
|
D
Q
 
L
M
 
M
I
 
L
S
 
S
F
 
F
Y
|
Y
I
 
M
K
 
K
T
 
T
P
 
P
S
 
G
G
 
G
F
 
F
D
 
D
L
 
I
E
 
E
Y
 
F
G
 
G
C
 
C
D
 
E
G
 
G
L
 
R
V
 
Q
V
 
V
D
 
D
W
 
D
D
 
R
R
 
D
H
 
W
T
 
I
P
 
A
F
 
R
E
 
E
S
 
S
T
 
T
V
 
A
V
 
V
S
 
S
H
 
L
W
 
W
G
 
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
S
 
T
V
 
V
G
 
G

1lkdA Crystal structure of 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase (dhbd) complexed with 2',6'-dicl dihydroxybiphenyl (dhb) (see paper)
43% identity, 97% coverage: 3:291/298 of query aligns to 2:284/287 of 1lkdA

query
sites
1lkdA
I
 
I
R
 
R
G
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
M
T
 
G
L
 
F
L
 
A
S
 
V
S
 
S
D
 
D
L
 
V
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
H
 
S
Y
 
F
A
 
L
S
 
T
Q
 
Q
V
 
K
L
 
L
G
 
G
M
 
L
M
 
M
V
 
E
I
 
A
G
 
G
S
 
T
D
 
T
D
 
D
D
 
N
A
 
G
H
 
D
L
 
L
Y
 
F
L
 
-
K
 
R
M
 
I
D
 
D
E
 
S
R
 
R
H
 
A
Y
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
A
V
 
V
Q
 
Q
K
 
Q
N
 
G
V
 
E
E
 
V
N
 
D
G
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
F
C
 
A
G
 
G
W
 
Y
E
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
D
K
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
M
V
 
A
S
 
D
E
 
K
L
 
L
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
V
 
I
Q
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
T
G
 
G
T
 
D
A
 
A
A
 
S
E
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
R
R
 
R
K
 
G
V
 
V
Q
 
T
E
 
G
L
 
L
V
 
I
H
 
T
F
 
F
S
 
A
D
 
D
P
 
P
D
 
F
G
 
G
N
 
L
R
 
P
H
 
L
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
W
 
Y
G
 
G
P
 
A
L
 
S
Q
 
E
D
 
V
F
 
F
A
 
E
R
 
K
-
 
P
F
 
F
V
 
L
S
 
P
P
 
G
V
 
A
G
 
A
V
 
V
K
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
L
T
 
T
N
 
G
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
F
V
|
V
L
 
R
P
 
C
A
 
V
P
 
P
A
 
D
F
 
S
E
 
D
R
 
K
C
 
A
R
 
L
D
 
A
F
 
F
Y
 
Y
E
 
T
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
x
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
V
M
 
I
K
 
D
V
x
M
R
 
K
F
 
M
T
 
G
P
 
P
D
 
D
P
 
V
A
 
T
E
 
V
P
 
P
Q
 
A
K
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
Y
F
|
F
L
 
L
H
|
H
C
 
C
N
 
N
N
 
E
G
 
-
R
 
R
H
 
H
H
|
H
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
F
 
A
E
 
A
C
x
F
P
 
P
M
x
L
P
|
P
H
x
K
G
 
R
C
 
I
V
 
H
H
|
H
M
 
F
M
 
M
V
 
L
E
 
E
V
 
V
N
 
A
A
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
G
R
 
F
A
 
A
L
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
V
H
 
D
A
 
A
N
 
D
G
 
G
V
 
L
K
 
-
L
 
I
S
 
T
A
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
H
|
H
T
 
T
N
|
N
D
 
D
Q
 
H
M
 
M
I
 
V
S
 
S
F
 
F
Y
|
Y
I
 
A
K
 
S
T
 
T
P
 
P
S
|
S
G
|
G
F
 
V
D
x
E
L
 
V
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
W
 
W
D
 
S
R
 
A
H
 
R
T
 
T
P
 
V
F
 
D
E
 
R
S
 
S
T
 
W
V
 
V
V
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
H
-
 
D
-
 
S
-
x
P
S
 
S
H
 
M
W
 
W
G
 
G
H
 
H

1lgtA Crystal structure of 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase (dhbd) complexed with 2'-cl dihydroxybiphenyl (dhb) (see paper)
43% identity, 97% coverage: 3:291/298 of query aligns to 2:284/287 of 1lgtA

query
sites
1lgtA
I
 
I
R
 
R
G
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
M
T
 
G
L
 
F
L
 
A
S
 
V
S
 
S
D
 
D
L
 
V
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
H
 
S
Y
 
F
A
 
L
S
 
T
Q
 
Q
V
 
K
L
 
L
G
 
G
M
 
L
M
 
M
V
 
E
I
 
A
G
 
G
S
 
T
D
 
T
D
 
D
D
 
N
A
 
G
H
 
D
L
 
L
Y
 
F
L
 
-
K
 
R
M
 
I
D
 
D
E
 
S
R
 
R
H
 
A
Y
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
A
V
 
V
Q
 
Q
K
 
Q
N
 
G
V
 
E
E
 
V
N
 
D
G
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
F
C
 
A
G
 
G
W
 
Y
E
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
D
K
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
M
V
 
A
S
 
D
E
 
K
L
 
L
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
V
 
I
Q
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
T
G
 
G
T
 
D
A
 
A
A
 
S
E
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
R
R
 
R
K
 
G
V
 
V
Q
 
T
E
 
G
L
 
L
V
 
I
H
 
T
F
 
F
S
 
A
D
 
D
P
 
P
D
 
F
G
 
G
N
 
L
R
 
P
H
 
L
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
W
 
Y
G
 
G
P
 
A
L
 
S
Q
 
E
D
 
V
F
 
F
A
 
E
R
 
K
-
 
P
F
 
F
V
 
L
S
 
P
P
 
G
V
 
A
G
 
A
V
 
V
K
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
L
T
 
T
N
 
G
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
F
V
|
V
L
 
R
P
 
C
A
 
V
P
 
P
A
 
D
F
 
S
E
 
D
R
 
K
C
 
A
R
 
L
D
 
A
F
 
F
Y
 
Y
E
 
T
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
x
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
V
M
 
I
K
 
D
V
x
M
R
 
K
F
 
M
T
 
G
P
 
P
D
 
D
P
 
V
A
 
T
E
 
V
P
 
P
Q
 
A
K
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
Y
F
|
F
L
 
L
H
|
H
C
 
C
N
 
N
N
 
E
G
 
-
R
 
R
H
 
H
H
|
H
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
F
 
A
E
 
A
C
x
F
P
 
P
M
x
L
P
|
P
H
x
K
G
 
R
C
 
I
V
 
H
H
|
H
M
 
F
M
 
M
V
 
L
E
 
E
V
 
V
N
 
A
A
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
G
R
 
F
A
 
A
L
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
V
H
 
D
A
 
A
N
 
D
G
 
G
V
 
L
K
 
-
L
 
I
S
 
T
A
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
H
|
H
T
 
T
N
|
N
D
 
D
Q
 
H
M
 
M
I
 
V
S
 
S
F
 
F
Y
|
Y
I
 
A
K
 
S
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
|
G
F
 
V
D
x
E
L
 
V
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
W
 
W
D
 
S
R
 
A
H
 
R
T
 
T
P
 
V
F
 
D
E
 
R
S
 
S
T
 
W
V
 
V
V
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
H
-
 
D
-
 
S
-
 
P
S
 
S
H
 
M
W
 
W
G
 
G
H
 
H

1hanA Crystal structure of the biphenyl-cleaving extradiol dioxygenase from a pcb-degrading pseudomonad (see paper)
43% identity, 97% coverage: 3:291/298 of query aligns to 2:284/287 of 1hanA

query
sites
1hanA
I
 
I
R
 
R
G
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
M
T
 
G
L
 
F
L
 
A
S
 
V
S
 
S
D
 
D
L
 
V
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
H
 
S
Y
 
F
A
 
L
S
 
T
Q
 
Q
V
 
K
L
 
L
G
 
G
M
 
L
M
 
M
V
 
E
I
 
A
G
 
G
S
 
T
D
 
T
D
 
D
D
 
N
A
 
G
H
 
D
L
 
L
Y
 
F
L
 
-
K
 
R
M
 
I
D
 
D
E
 
S
R
 
R
H
 
A
Y
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
A
V
 
V
Q
 
Q
K
 
Q
N
 
G
V
 
E
E
 
V
N
 
D
G
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
F
C
 
A
G
 
G
W
 
Y
E
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
D
K
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
M
V
 
A
S
 
D
E
 
K
L
 
L
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
V
 
I
Q
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
T
G
 
G
T
 
D
A
 
A
A
 
S
E
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
R
R
 
R
K
 
G
V
 
V
Q
 
T
E
 
G
L
 
L
V
 
I
H
 
T
F
 
F
S
 
A
D
 
D
P
 
P
D
 
F
G
 
G
N
 
L
R
 
P
H
 
L
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
W
 
Y
G
 
G
P
 
A
L
 
S
Q
 
E
D
 
V
F
 
F
A
 
E
R
 
K
-
 
P
F
 
F
V
 
L
S
 
P
P
 
G
V
 
A
G
 
A
V
 
V
K
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
L
T
 
T
N
 
G
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
F
V
 
V
L
 
R
P
 
C
A
 
V
P
 
P
A
 
D
F
 
S
E
 
D
R
 
K
C
 
A
R
 
L
D
 
A
F
 
F
Y
 
Y
E
 
T
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
x
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
V
M
 
I
K
 
D
V
 
M
R
 
K
F
 
M
T
 
G
P
 
P
D
 
D
P
 
V
A
 
T
E
 
V
P
 
P
Q
 
A
K
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
Y
F
 
F
L
 
L
H
|
H
C
 
C
N
 
N
N
 
E
G
 
-
R
 
R
H
 
H
H
 
H
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
F
 
A
E
 
A
C
 
F
P
 
P
M
 
L
P
 
P
H
 
K
G
 
R
C
 
I
V
 
H
H
|
H
M
 
F
M
 
M
V
 
L
E
 
E
V
 
V
N
 
A
A
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
G
R
 
F
A
 
A
L
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
V
H
 
D
A
 
A
N
 
D
G
 
G
V
 
L
K
 
-
L
 
I
S
 
T
A
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
H
 
H
T
 
T
N
 
N
D
 
D
Q
 
H
M
 
M
I
 
V
S
 
S
F
 
F
Y
 
Y
I
 
A
K
 
S
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
F
 
V
D
 
E
L
 
V
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
W
 
W
D
 
S
R
 
A
H
 
R
T
 
T
P
 
V
F
 
D
E
 
R
S
 
S
T
 
W
V
 
V
V
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
H
-
 
D
-
 
S
-
 
P
S
 
S
H
 
M
W
 
W
G
 
G
H
 
H

Sites not aligning to the query:

1knfA Crystal structure of 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase complexed with 3-methyl catechol under anaerobic condition (see paper)
43% identity, 97% coverage: 3:291/298 of query aligns to 2:284/288 of 1knfA

query
sites
1knfA
I
 
I
R
 
R
G
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
M
T
 
G
L
 
F
L
 
A
S
 
V
S
 
S
D
 
D
L
 
V
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
H
 
S
Y
 
F
A
 
L
S
 
T
Q
 
Q
V
 
K
L
 
L
G
 
G
M
 
L
M
 
M
V
 
E
I
 
A
G
 
G
S
 
T
D
 
T
D
 
D
D
 
N
A
 
G
H
 
D
L
 
L
Y
 
F
L
 
-
K
 
R
M
 
I
D
 
D
E
 
S
R
 
R
H
 
A
Y
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
A
V
 
V
Q
 
Q
K
 
Q
N
 
G
V
 
E
E
 
V
N
 
D
G
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
F
C
 
A
G
 
G
W
 
Y
E
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
D
K
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
M
V
 
A
S
 
D
E
 
K
L
 
L
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
V
 
I
Q
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
T
G
 
G
T
 
D
A
 
A
A
 
S
E
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
R
R
 
R
K
 
G
V
 
V
Q
 
T
E
 
G
L
 
L
V
 
I
H
 
T
F
 
F
S
 
A
D
 
D
P
 
P
D
 
F
G
 
G
N
 
L
R
 
P
H
 
L
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
W
 
Y
G
 
G
P
 
A
L
 
S
Q
 
E
D
 
V
F
 
F
A
 
E
R
 
K
-
 
P
F
 
F
V
 
L
S
 
P
P
 
G
V
 
A
G
 
A
V
 
V
K
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
L
T
 
T
N
 
G
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
F
V
 
V
L
 
R
P
 
C
A
 
V
P
 
P
A
 
D
F
 
S
E
 
D
R
 
K
C
 
A
R
 
L
D
 
A
F
 
F
Y
 
Y
E
 
T
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
x
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
V
M
 
I
K
 
D
V
 
M
R
 
K
F
 
M
T
 
G
P
 
P
D
 
D
P
 
V
A
 
T
E
 
V
P
 
P
Q
 
A
K
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
Y
F
|
F
L
 
L
H
|
H
C
 
C
N
 
N
N
 
E
G
 
-
R
 
R
H
 
H
H
 
H
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
F
 
A
E
 
A
C
 
F
P
 
P
M
 
L
P
 
P
H
 
K
G
 
R
C
 
I
V
 
H
H
|
H
M
 
F
M
 
M
V
 
L
E
 
E
V
 
V
N
 
A
A
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
G
R
 
F
A
 
A
L
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
V
H
 
D
A
 
A
N
 
D
G
 
G
V
 
L
K
 
-
L
 
I
S
 
T
A
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
H
|
H
T
 
T
N
|
N
D
 
D
Q
 
H
M
 
M
I
 
V
S
 
S
F
 
F
Y
|
Y
I
 
A
K
 
S
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
F
 
V
D
 
E
L
 
V
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
W
 
W
D
 
S
R
 
A
H
 
R
T
 
T
P
 
V
F
 
D
E
 
R
S
 
S
T
 
W
V
 
V
V
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
H
-
 
D
-
 
S
-
 
P
S
 
S
H
 
M
W
 
W
G
 
G
H
 
H

1kndA Crystal structure of 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase complexed with catechol under anaerobic condition (see paper)
43% identity, 97% coverage: 3:291/298 of query aligns to 2:284/288 of 1kndA

query
sites
1kndA
I
 
I
R
 
R
G
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
M
T
 
G
L
 
F
L
 
A
S
 
V
S
 
S
D
 
D
L
 
V
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
H
 
S
Y
 
F
A
 
L
S
 
T
Q
 
Q
V
 
K
L
 
L
G
 
G
M
 
L
M
 
M
V
 
E
I
 
A
G
 
G
S
 
T
D
 
T
D
 
D
D
 
N
A
 
G
H
 
D
L
 
L
Y
 
F
L
 
-
K
 
R
M
 
I
D
 
D
E
 
S
R
 
R
H
 
A
Y
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
A
V
 
V
Q
 
Q
K
 
Q
N
 
G
V
 
E
E
 
V
N
 
D
G
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
F
C
 
A
G
 
G
W
 
Y
E
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
D
K
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
M
V
 
A
S
 
D
E
 
K
L
 
L
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
V
 
I
Q
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
T
G
 
G
T
 
D
A
 
A
A
 
S
E
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
R
R
 
R
K
 
G
V
 
V
Q
 
T
E
 
G
L
 
L
V
 
I
H
 
T
F
 
F
S
 
A
D
 
D
P
 
P
D
 
F
G
 
G
N
 
L
R
 
P
H
 
L
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
W
 
Y
G
 
G
P
 
A
L
 
S
Q
 
E
D
 
V
F
 
F
A
 
E
R
 
K
-
 
P
F
 
F
V
 
L
S
 
P
P
 
G
V
 
A
G
 
A
V
 
V
K
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
L
T
 
T
N
 
G
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
F
V
 
V
L
 
R
P
 
C
A
 
V
P
 
P
A
 
D
F
 
S
E
 
D
R
 
K
C
 
A
R
 
L
D
 
A
F
 
F
Y
 
Y
E
 
T
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
x
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
V
M
 
I
K
 
D
V
 
M
R
 
K
F
 
M
T
 
G
P
 
P
D
 
D
P
 
V
A
 
T
E
 
V
P
 
P
Q
 
A
K
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
Y
F
|
F
L
 
L
H
|
H
C
 
C
N
 
N
N
 
E
G
 
-
R
 
R
H
 
H
H
|
H
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
F
 
A
E
 
A
C
 
F
P
 
P
M
 
L
P
 
P
H
 
K
G
 
R
C
 
I
V
 
H
H
|
H
M
 
F
M
 
M
V
 
L
E
 
E
V
 
V
N
 
A
A
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
G
R
 
F
A
 
A
L
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
V
H
 
D
A
 
A
N
 
D
G
 
G
V
 
L
K
 
-
L
 
I
S
 
T
A
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
H
|
H
T
 
T
N
|
N
D
 
D
Q
 
H
M
 
M
I
 
V
S
 
S
F
 
F
Y
|
Y
I
 
A
K
 
S
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
F
 
V
D
 
E
L
 
V
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
W
 
W
D
 
S
R
 
A
H
 
R
T
 
T
P
 
V
F
 
D
E
 
R
S
 
S
T
 
W
V
 
V
V
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
H
-
 
D
-
 
S
-
 
P
S
 
S
H
 
M
W
 
W
G
 
G
H
 
H

1kmyA Crystal structure of 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase complexed with 2,3-dihydroxybiphenyl under anaerobic condition (see paper)
43% identity, 97% coverage: 3:291/298 of query aligns to 2:284/288 of 1kmyA

query
sites
1kmyA
I
 
I
R
 
R
G
 
S
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
M
T
 
G
L
 
F
L
 
A
S
 
V
S
 
S
D
 
D
L
 
V
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
H
 
S
Y
 
F
A
 
L
S
 
T
Q
 
Q
V
 
K
L
 
L
G
 
G
M
 
L
M
 
M
V
 
E
I
 
A
G
 
G
S
 
T
D
 
T
D
 
D
D
 
N
A
 
G
H
 
D
L
 
L
Y
 
F
L
 
-
K
 
R
M
 
I
D
 
D
E
 
S
R
 
R
H
 
A
Y
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
A
V
 
V
Q
 
Q
K
 
Q
N
 
G
V
 
E
E
 
V
N
 
D
G
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
F
C
 
A
G
 
G
W
 
Y
E
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
D
K
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
M
V
 
A
S
 
D
E
 
K
L
 
L
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
V
 
I
Q
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
T
G
 
G
T
 
D
A
 
A
A
 
S
E
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
R
R
 
R
K
 
G
V
 
V
Q
 
T
E
 
G
L
 
L
V
 
I
H
 
T
F
 
F
S
 
A
D
 
D
P
 
P
D
 
F
G
 
G
N
 
L
R
 
P
H
 
L
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
W
 
Y
G
 
G
P
 
A
L
 
S
Q
 
E
D
 
V
F
 
F
A
 
E
R
 
K
-
 
P
F
 
F
V
 
L
S
 
P
P
 
G
V
 
A
G
 
A
V
 
V
K
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
L
T
 
T
N
 
G
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
F
V
 
V
L
 
R
P
 
C
A
 
V
P
 
P
A
 
D
F
 
S
E
 
D
R
 
K
C
 
A
R
 
L
D
 
A
F
 
F
Y
 
Y
E
 
T
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
V
M
 
I
K
 
D
V
 
M
R
 
K
F
 
M
T
 
G
P
 
P
D
 
D
P
 
V
A
 
T
E
 
V
P
 
P
Q
 
A
K
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
Y
F
|
F
L
 
L
H
 
H
C
 
C
N
 
N
N
 
E
G
 
-
R
 
R
H
 
H
H
|
H
S
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
F
 
A
E
 
A
C
 
F
P
 
P
M
 
L
P
 
P
H
 
K
G
 
R
C
 
I
V
 
H
H
|
H
M
 
F
M
 
M
V
 
L
E
 
E
V
 
V
N
 
A
A
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
G
R
 
F
A
 
A
L
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
V
H
 
D
A
 
A
N
 
D
G
 
G
V
 
L
K
 
-
L
 
I
S
 
T
A
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
H
|
H
T
 
T
N
|
N
D
 
D
Q
 
H
M
 
M
I
 
V
S
 
S
F
 
F
Y
|
Y
I
 
A
K
 
S
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
F
 
V
D
 
E
L
 
V
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
W
 
W
D
 
S
R
 
A
H
 
R
T
 
T
P
 
V
F
 
D
E
 
R
S
 
S
T
 
W
V
 
V
V
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
H
-
 
D
-
 
S
-
 
P
S
 
S
H
 
M
W
 
W
G
 
G
H
 
H

1eirA 2,3-dihydroxybiphenyl-1,2-dioxygenase (see paper)
40% identity, 97% coverage: 3:291/298 of query aligns to 2:285/289 of 1eirA

query
sites
1eirA
I
 
I
R
 
E
G
 
R
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
L
T
 
G
L
 
F
L
 
A
S
 
V
S
 
K
D
 
D
L
 
V
A
 
P
Q
 
A
W
 
W
R
 
D
H
 
H
Y
 
F
A
 
L
S
 
T
Q
 
K
V
 
S
L
 
V
G
 
G
M
 
L
M
 
M
V
 
A
I
 
A
G
 
G
S
 
S
D
 
A
D
 
G
D
 
D
A
 
A
H
 
A
L
 
L
Y
 
Y
L
 
-
K
 
R
M
 
A
D
 
D
E
 
Q
R
 
R
H
 
A
Y
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
A
V
 
V
Q
 
Q
K
 
P
N
 
G
V
 
E
E
 
L
N
 
D
G
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
Y
C
 
A
G
 
G
W
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
D
G
 
D
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
M
V
 
A
S
 
D
E
 
K
L
 
L
Q
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
V
 
V
Q
 
A
V
 
F
T
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
D
A
 
E
A
 
A
E
 
L
A
 
M
E
 
Q
L
 
Q
R
 
R
K
 
K
V
 
V
Q
 
M
E
 
G
L
 
L
V
 
L
H
 
C
F
 
L
S
 
Q
D
 
D
P
 
P
D
 
F
G
 
G
N
 
L
R
 
P
H
 
L
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
W
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
A
Q
 
E
D
 
I
F
 
F
A
 
H
R
 
E
-
 
P
F
 
F
V
 
L
S
 
P
P
 
S
V
 
A
G
 
P
V
 
V
K
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
N
 
G
E
 
D
L
 
Q
G
 
G
M
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
F
V
 
V
L
 
R
P
 
C
A
 
V
P
 
P
A
 
D
F
 
T
E
 
A
R
 
K
C
 
A
R
 
M
D
 
A
F
 
F
Y
 
Y
E
 
T
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
V
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
I
M
 
I
K
 
D
V
 
I
R
 
Q
F
 
M
T
 
G
P
 
P
D
 
E
P
 
T
A
 
S
E
 
V
P
 
P
Q
 
A
K
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
H
F
|
F
L
 
L
H
 
H
C
 
C
N
 
-
N
 
N
G
 
G
R
 
R
H
 
H
H
|
H
S
 
T
L
 
I
A
 
A
I
 
L
F
 
A
E
 
A
C
x
F
P
 
P
M
 
I
P
 
P
H
 
K
G
 
R
C
 
I
V
 
H
H
|
H
M
 
F
M
 
M
V
 
L
E
 
Q
V
 
A
N
 
N
A
 
T
L
 
I
D
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
L
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
L
H
 
D
A
 
A
N
 
A
G
 
G
V
 
-
K
 
R
L
 
I
S
 
T
A
 
S
T
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
H
|
H
T
 
T
N
|
N
D
 
D
Q
 
Q
M
 
T
I
 
L
S
 
S
F
 
F
Y
|
Y
I
 
A
K
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
P
-
 
M
F
 
I
D
 
E
L
 
V
E
|
E
Y
 
F
G
 
G
C
 
W
D
 
G
G
 
P
L
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
D
W
 
-
D
 
S
R
 
S
H
 
W
T
 
T
P
 
V
F
 
A
E
 
R
S
 
H
T
 
S
V
 
R
V
x
T
S
 
A
H
 
M
W
 
W
G
 
G
H
 
H

1eilA 2,3-dihydroxybiphenyl-1,2-dioxygenase (see paper)
40% identity, 97% coverage: 3:291/298 of query aligns to 2:285/289 of 1eilA

query
sites
1eilA
I
 
I
R
 
E
G
 
R
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
L
T
 
G
L
 
F
L
 
A
S
 
V
S
 
K
D
 
D
L
 
V
A
 
P
Q
 
A
W
 
W
R
 
D
H
 
H
Y
 
F
A
 
L
S
 
T
Q
 
K
V
 
S
L
 
V
G
 
G
M
 
L
M
 
M
V
 
A
I
 
A
G
 
G
S
 
S
D
 
A
D
 
G
D
 
D
A
 
A
H
 
A
L
 
L
Y
 
Y
L
 
-
K
 
R
M
 
A
D
 
D
E
 
Q
R
 
R
H
 
A
Y
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
A
V
 
V
Q
 
Q
K
 
P
N
 
G
V
 
E
E
 
L
N
 
D
G
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
Y
C
 
A
G
 
G
W
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
D
G
 
D
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
M
V
 
A
S
 
D
E
 
K
L
 
L
Q
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
V
 
V
Q
 
A
V
 
F
T
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
D
A
 
E
A
 
A
E
 
L
A
 
M
E
 
Q
L
 
Q
R
 
R
K
 
K
V
 
V
Q
 
M
E
 
G
L
 
L
V
 
L
H
 
C
F
 
L
S
 
Q
D
 
D
P
 
P
D
 
F
G
 
G
N
 
L
R
 
P
H
 
L
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
W
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
A
Q
 
E
D
 
I
F
 
F
A
 
H
R
 
E
-
 
P
F
 
F
V
 
L
S
 
P
P
 
S
V
 
A
G
 
P
V
 
V
K
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
N
 
G
E
 
D
L
 
Q
G
 
G
M
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
F
V
 
V
L
 
R
P
 
C
A
 
V
P
 
P
A
 
D
F
 
T
E
 
A
R
 
K
C
 
A
R
 
M
D
 
A
F
 
F
Y
 
Y
E
 
T
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
V
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
I
M
 
I
K
 
D
V
 
I
R
 
Q
F
 
M
T
 
G
P
 
P
D
 
E
P
 
T
A
 
S
E
 
V
P
 
P
Q
 
A
K
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
H
F
 
F
L
 
L
H
 
H
C
 
C
N
 
-
N
 
N
G
 
G
R
 
R
H
 
H
H
 
H
S
 
T
L
 
I
A
 
A
I
 
L
F
 
A
E
 
A
C
 
F
P
 
P
M
 
I
P
 
P
H
 
K
G
 
R
C
 
I
V
 
H
H
|
H
M
 
F
M
 
M
V
 
L
E
 
Q
V
 
A
N
 
N
A
 
T
L
 
I
D
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
L
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
L
H
 
D
A
 
A
N
 
A
G
 
G
V
 
-
K
 
R
L
 
I
S
 
T
A
 
S
T
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
H
 
H
T
 
T
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
M
 
T
I
 
L
S
 
S
F
 
F
Y
 
Y
I
 
A
K
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
P
-
 
M
F
 
I
D
 
E
L
 
V
E
|
E
Y
 
F
G
 
G
C
 
W
D
 
G
G
 
P
L
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
D
W
 
-
D
 
S
R
 
S
H
 
W
T
 
T
P
 
V
F
 
A
E
 
R
S
 
H
T
 
S
V
 
R
V
 
T
S
 
A
H
 
M
W
 
W
G
 
G
H
 
H

1kw8B Crystal structure of bphc-2,3-dihydroxybiphenyl-no complex (see paper)
40% identity, 97% coverage: 3:291/298 of query aligns to 2:285/288 of 1kw8B

query
sites
1kw8B
I
 
I
R
 
E
G
 
R
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
L
T
 
G
L
 
F
L
 
A
S
 
V
S
 
K
D
 
D
L
 
V
A
 
P
Q
 
A
W
 
W
R
 
D
H
 
H
Y
 
F
A
 
L
S
 
T
Q
 
K
V
 
S
L
 
V
G
 
G
M
 
L
M
 
M
V
 
A
I
 
A
G
 
G
S
 
S
D
 
A
D
 
G
D
 
D
A
 
A
H
 
A
L
 
L
Y
 
Y
L
 
-
K
 
R
M
 
A
D
 
D
E
 
Q
R
 
R
H
 
A
Y
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
A
V
 
V
Q
 
Q
K
 
P
N
 
G
V
 
E
E
 
L
N
 
D
G
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
Y
C
 
A
G
 
G
W
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
D
G
 
D
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
M
V
 
A
S
 
D
E
 
K
L
 
L
Q
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
V
 
V
Q
 
A
V
 
F
T
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
D
A
 
E
A
 
A
E
 
L
A
 
M
E
 
Q
L
 
Q
R
 
R
K
 
K
V
 
V
Q
 
M
E
 
G
L
 
L
V
 
L
H
 
C
F
 
L
S
 
Q
D
 
D
P
 
P
D
 
F
G
 
G
N
 
L
R
 
P
H
 
L
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
W
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
A
Q
 
E
D
 
I
F
 
F
A
 
H
R
 
E
-
 
P
F
 
F
V
 
L
S
 
P
P
 
S
V
 
A
G
 
P
V
 
V
K
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
N
 
G
E
 
D
L
 
Q
G
 
G
M
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
F
V
|
V
L
 
R
P
 
C
A
 
V
P
 
P
A
 
D
F
 
T
E
 
A
R
 
K
C
 
A
R
 
M
D
 
A
F
 
F
Y
 
Y
E
 
T
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
V
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
I
M
 
I
K
 
D
V
 
I
R
 
Q
F
 
M
T
 
G
P
 
P
D
 
E
P
 
T
A
 
S
E
 
V
P
 
P
Q
 
A
K
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
H
F
|
F
L
 
L
H
 
H
C
 
C
N
 
-
N
 
N
G
 
G
R
 
R
H
 
H
H
|
H
S
 
T
L
 
I
A
 
A
I
 
L
F
 
A
E
 
A
C
x
F
P
 
P
M
 
I
P
 
P
H
 
K
G
 
R
C
 
I
V
x
H
H
|
H
M
 
F
M
 
M
V
 
L
E
 
Q
V
 
A
N
 
N
A
 
T
L
 
I
D
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
L
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
L
H
 
D
A
 
A
N
 
A
G
 
G
V
 
-
K
 
R
L
 
I
S
 
T
A
 
S
T
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
H
|
H
T
 
T
N
|
N
D
 
D
Q
 
Q
M
 
T
I
 
L
S
 
S
F
 
F
Y
|
Y
I
 
A
K
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
P
-
 
M
F
 
I
D
 
E
L
 
V
E
|
E
Y
 
F
G
 
G
C
 
W
D
 
G
G
 
P
L
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
D
W
 
-
D
 
S
R
 
S
H
 
W
T
 
T
P
 
V
F
 
A
E
 
R
S
 
H
T
 
S
V
 
R
V
x
T
S
 
A
H
 
M
W
 
W
G
 
G
H
 
H

1kw3B Crystal structure of 2,3-dihydroxybiphenyal dioxygenase (bphc) at 1.45 a resolution (see paper)
40% identity, 97% coverage: 3:291/298 of query aligns to 2:285/288 of 1kw3B

query
sites
1kw3B
I
 
I
R
 
E
G
 
R
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
L
T
 
G
L
 
F
L
 
A
S
 
V
S
 
K
D
 
D
L
 
V
A
 
P
Q
 
A
W
 
W
R
 
D
H
 
H
Y
 
F
A
 
L
S
 
T
Q
 
K
V
 
S
L
 
V
G
 
G
M
 
L
M
 
M
V
 
A
I
 
A
G
 
G
S
 
S
D
 
A
D
 
G
D
 
D
A
 
A
H
 
A
L
 
L
Y
 
Y
L
 
-
K
 
R
M
 
A
D
 
D
E
 
Q
R
 
R
H
 
A
Y
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
A
V
 
V
Q
 
Q
K
 
P
N
 
G
V
 
E
E
 
L
N
 
D
G
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
Y
C
 
A
G
 
G
W
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
D
G
 
D
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
M
V
 
A
S
 
D
E
 
K
L
 
L
Q
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
G
V
 
V
Q
 
A
V
 
F
T
 
T
R
 
R
G
 
G
T
 
D
A
 
E
A
 
A
E
 
L
A
 
M
E
 
Q
L
 
Q
R
 
R
K
 
K
V
 
V
Q
 
M
E
 
G
L
 
L
V
 
L
H
 
C
F
 
L
S
 
Q
D
 
D
P
 
P
D
 
F
G
 
G
N
 
L
R
 
P
H
 
L
E
 
E
I
 
I
F
 
Y
W
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
A
Q
 
E
D
 
I
F
 
F
A
 
H
R
 
E
-
 
P
F
 
F
V
 
L
S
 
P
P
 
S
V
 
A
G
 
P
V
 
V
K
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
V
T
 
T
N
 
G
E
 
D
L
 
Q
G
 
G
M
 
I
G
 
G
H
|
H
V
 
F
V
 
V
L
 
R
P
 
C
A
 
V
P
 
P
A
 
D
F
 
T
E
 
A
R
 
K
C
 
A
R
 
M
D
 
A
F
 
F
Y
 
Y
E
 
T
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
V
L
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
I
M
 
I
K
 
D
V
 
I
R
 
Q
F
 
M
T
 
G
P
 
P
D
 
E
P
 
T
A
 
S
E
 
V
P
 
P
Q
 
A
K
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
H
F
 
F
L
 
L
H
 
H
C
 
C
N
 
-
N
 
N
G
 
G
R
 
R
H
 
H
H
 
H
S
 
T
L
 
I
A
 
A
I
 
L
F
 
A
E
 
A
C
 
F
P
 
P
M
 
I
P
 
P
H
 
K
G
 
R
C
 
I
V
 
H
H
|
H
M
 
F
M
 
M
V
 
L
E
 
Q
V
 
A
N
 
N
A
 
T
L
 
I
D
 
D
E
 
D
V
 
V
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
L
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
L
H
 
D
A
 
A
N
 
A
G
 
G
V
 
-
K
 
R
L
 
I
S
 
T
A
 
S
T
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
H
 
H
T
 
T
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
M
 
T
I
 
L
S
 
S
F
 
F
Y
 
Y
I
 
A
K
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
P
-
 
M
F
 
I
D
 
E
L
 
V
E
|
E
Y
 
F
G
 
G
C
 
W
D
 
G
G
 
P
L
 
R
V
 
T
V
 
V
D
 
D
W
 
-
D
 
S
R
 
S
H
 
W
T
 
T
P
 
V
F
 
A
E
 
R
S
 
H
T
 
S
V
 
R
V
 
T
S
 
A
H
 
M
W
 
W
G
 
G
H
 
H

6l3wA Crystal structure of bphc, a halotolerant catechol dioxygenase (see paper)
37% identity, 97% coverage: 3:291/298 of query aligns to 4:283/298 of 6l3wA

query
sites
6l3wA
I
 
I
R
 
R
G
 
S
L
 
M
G
 
A
Y
 
Y
V
 
L
T
 
G
L
 
L
L
 
V
S
 
T
S
 
P
D
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
W
 
W
R
 
R
H
 
N
Y
 
F
A
 
G
S
 
S
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
L
M
 
Q
V
 
L
I
 
I
G
 
Q
S
 
L
D
 
I
D
 
E
D
 
D
A
 
G
H
 
A
L
 
A
Y
 
R
L
 
F
K
 
R
M
 
M
D
 
D
E
 
E
R
 
A
H
 
D
Y
 
C
R
 
R
I
 
L
L
 
W
V
 
V
Q
 
H
K
 
P
N
 
G
V
 
E
E
 
K
N
 
N
G
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
Y
C
 
I
G
 
G
W
 
W
E
 
Q
V
 
L
A
 
T
G
 
G
K
 
E
A
 
K
A
 
E
L
 
A
E
 
R
Q
 
E
A
 
L
V
 
G
S
 
D
E
 
V
L
 
I
Q
 
A
Q
 
A
A
 
A
D
 
G
V
 
P
Q
 
V
V
 
I
T
 
T
R
 
R
G
 
A
T
 
T
A
 
P
A
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
A
L
 
E
R
 
R
K
 
C
V
 
V
Q
 
A
E
 
G
L
 
Y
V
 
Y
H
 
W
F
 
F
S
 
I
D
 
D
P
 
P
D
 
V
G
 
G
N
 
F
R
 
R
H
 
H
E
 
E
I
 
L
F
 
S
W
 
W
G
 
G
P
 
Q
L
 
Y
Q
 
V
D
 
T
F
 
P
A
 
N
R
 
S
F
 
F
V
 
Q
S
 
P
P
 
G
V
 
W
G
 
P
V
 
M
K
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
K
T
 
T
N
 
G
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
I
V
 
V
L
 
L
P
 
L
A
 
V
P
 
P
A
 
D
F
 
L
E
 
P
R
 
V
C
 
A
R
 
D
D
 
K
F
 
F
Y
 
Y
E
 
R
Q
 
E
V
 
V
L
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
H
L
 
Q
S
 
S
D
 
D
L
 
C
M
 
I
K
 
R
V
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
D
P
 
G
Q
 
S
K
 
R
R
 
A
I
 
L
H
 
H
F
 
F
L
 
Y
H
 
H
C
 
C
N
 
-
N
 
N
G
 
G
R
 
R
H
 
H
H
|
H
S
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
I
-
 
G
F
 
S
E
 
P
C
 
G
P
 
P
M
 
G
P
 
V
H
 
R
G
 
G
C
 
A
V
 
H
H
|
H
M
 
I
M
 
M
V
 
L
E
 
E
V
 
V
N
 
N
A
 
S
L
 
I
D
 
H
E
 
D
V
 
V
G
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
V
D
 
D
R
 
R
V
 
C
H
 
E
A
 
L
N
 
L
G
 
D
V
 
V
K
 
P
L
 
V
S
 
S
A
 
K
T
 
S
L
 
I
G
 
G
Q
 
C
H
 
H
T
 
T
N
 
N
D
 
D
Q
 
R
M
 
M
I
 
V
S
 
S
F
 
T
Y
 
Y
I
 
I
K
 
F
T
 
S
P
 
P
S
 
S
G
 
V
F
 
L
D
 
R
L
 
V
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
C
 
F
D
 
G
G
 
G
L
 
V
V
 
E
V
 
I
D
 
D
W
 
-
D
 
D
R
 
L
H
 
W
T
 
E
P
 
P
F
 
K
E
 
T
S
 
Y
T
 
S
V
 
R
V
 
T
S
 
S
H
 
I
W
 
W
G
 
G
H
 
H

2wl9A Crystal structure of catechol 2,3-dioxygenase (see paper)
34% identity, 88% coverage: 6:267/298 of query aligns to 7:265/300 of 2wl9A

query
sites
2wl9A
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
L
T
 
G
L
 
L
L
 
S
S
 
V
S
 
S
D
 
N
L
 
L
A
 
D
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
H
 
D
Y
 
Y
A
 
A
S
 
A
Q
 
G
V
 
I
L
 
M
G
 
G
M
 
M
M
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
D
S
 
D
D
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
D
H
 
R
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
M
 
M
D
 
D
E
 
R
R
 
W
H
 
H
Y
 
H
R
 
R
I
 
I
L
 
V
V
 
L
Q
 
H
K
 
A
N
 
D
V
 
G
E
 
S
N
 
D
G
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
Y
C
 
I
G
 
G
W
 
W
E
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
P
A
 
V
A
 
E
L
 
L
E
 
D
Q
 
E
A
 
L
V
 
A
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
Q
 
K
Q
 
N
A
 
A
D
 
G
V
 
I
Q
 
P
V
 
F
T
 
E
R
 
V
G
 
A
T
 
S
A
 
D
A
 
A
E
 
D
A
 
A
E
 
A
L
 
E
R
 
R
K
 
R
V
 
V
Q
 
L
E
 
G
L
 
L
V
 
V
H
 
K
F
 
L
S
 
H
D
 
D
P
|
P
D
 
G
G
 
G
N
 
N
R
 
P
H
 
T
E
 
E
I
 
I
F
 
F
W
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
Q
Q
 
V
D
 
D
F
 
T
A
 
S
R
 
S
F
 
P
V
 
F
S
 
H
P
 
P
-
 
G
-
 
R
V
 
P
G
 
M
V
 
F
K
 
G
G
 
K
F
 
F
V
 
V
T
 
T
N
 
E
E
 
G
L
 
Q
G
 
G
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
I
V
 
I
L
 
I
P
 
R
A
 
E
P
x
D
A
 
D
F
 
V
E
 
E
R
 
E
C
 
A
R
 
T
D
 
R
F
 
F
Y
 
Y
E
 
R
Q
 
L
V
 
L
L
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
G
L
 
L
S
 
E
D
 
G
L
 
A
M
 
V
K
 
E
V
 
Y
R
 
K
F
 
F
T
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
A
E
 
L
P
 
P
Q
 
N
K
 
G
R
 
A
I
 
V
H
 
G
-
 
T
-
 
P
-
 
V
F
 
F
L
 
M
H
 
H
C
 
C
N
 
N
N
 
D
G
 
-
R
 
R
H
 
H
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
F
F
 
G
E
 
V
C
 
G
P
 
P
M
 
M
P
 
D
H
 
K
G
 
R
C
 
I
V
 
N
H
|
H
M
 
L
M
 
M
V
 
I
E
 
E
V
 
Y
N
 
T
A
 
H
L
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
L
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
L
 
H
D
 
D
R
 
L
V
 
V
H
 
R
A
 
Q
N
 
Q
G
 
K
V
 
I
K
 
D
L
 
V
S
 
T
A
 
L
T
 
Q
L
 
I
G
 
G
Q
 
K
H
 
H
T
 
S
N
 
N
D
 
D
Q
 
E
M
 
A
I
 
L
S
 
T
F
 
F
Y
|
Y
I
 
C
K
 
A
T
 
N
P
 
P
S
 
S
G
 
G
F
 
W
D
 
L
L
 
W
E
|
E
Y
 
P
G
 
G

2wl3A Crystal structure of catechol 2,3-dioxygenase (see paper)
34% identity, 88% coverage: 6:267/298 of query aligns to 6:264/287 of 2wl3A

query
sites
2wl3A
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
L
T
 
G
L
 
L
L
 
S
S
 
V
S
 
S
D
 
N
L
 
L
A
 
D
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
H
 
D
Y
 
Y
A
 
A
S
 
A
Q
 
G
V
 
I
L
 
M
G
 
G
M
 
M
M
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
D
S
 
D
D
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
D
H
 
R
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
M
 
M
D
 
D
E
 
R
R
 
W
H
 
H
Y
 
H
R
 
R
I
 
I
L
 
V
V
 
L
Q
 
H
K
 
A
N
 
D
V
 
G
E
 
S
N
 
D
G
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
Y
C
 
I
G
 
G
W
 
W
E
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
P
A
 
V
A
 
E
L
 
L
E
 
D
Q
 
E
A
 
L
V
 
A
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
Q
 
K
Q
 
N
A
 
A
D
 
G
V
 
I
Q
 
P
V
 
F
T
 
E
R
 
V
G
 
A
T
 
S
A
 
D
A
 
A
E
 
D
A
 
A
E
 
A
L
 
E
R
 
R
K
 
R
V
 
V
Q
 
L
E
 
G
L
 
L
V
 
V
H
 
K
F
 
L
S
 
H
D
 
D
P
|
P
D
 
G
G
 
G
N
 
N
R
 
P
H
 
T
E
 
E
I
 
I
F
 
F
W
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
Q
Q
 
V
D
 
D
F
 
T
A
 
S
R
 
S
F
 
P
V
 
F
S
 
H
P
 
P
-
 
G
-
 
R
V
 
P
G
 
M
V
 
F
K
 
G
G
 
K
F
 
F
V
 
V
T
 
T
N
 
E
E
 
G
L
 
Q
G
 
G
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
I
V
 
I
L
 
I
P
 
R
A
 
E
P
x
D
A
 
D
F
 
V
E
 
E
R
 
E
C
 
A
R
 
T
D
 
R
F
 
F
Y
 
Y
E
 
R
Q
 
L
V
 
L
L
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
G
L
 
L
S
 
E
D
 
G
L
 
A
M
 
V
K
 
E
V
 
Y
R
 
K
F
 
F
T
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
A
E
 
L
P
 
P
Q
 
N
K
 
G
R
 
A
I
 
V
H
 
G
-
 
T
-
 
P
-
 
V
F
 
F
L
 
M
H
 
H
C
 
C
N
 
N
N
 
D
G
 
-
R
 
R
H
 
H
H
 
H
S
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
F
F
 
G
E
 
V
C
 
G
P
 
P
M
 
M
P
 
D
H
 
K
G
 
R
C
 
I
V
 
N
H
|
H
M
 
L
M
 
M
V
 
I
E
 
E
V
 
Y
N
 
T
A
 
H
L
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
L
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
L
 
H
D
 
D
R
 
L
V
 
V
H
 
R
A
 
Q
N
 
Q
G
 
K
V
 
I
K
 
D
L
 
V
S
 
T
A
 
L
T
 
Q
L
 
I
G
 
G
Q
 
K
H
 
H
T
 
S
N
 
N
D
 
D
Q
 
E
M
 
A
I
 
L
S
 
T
F
 
F
Y
|
Y
I
 
C
K
 
A
T
 
N
P
 
P
S
 
S
G
 
G
F
 
W
D
 
L
L
 
W
E
|
E
Y
 
P
G
 
G

2wl9B Crystal structure of catechol 2,3-dioxygenase (see paper)
34% identity, 88% coverage: 6:267/298 of query aligns to 6:259/293 of 2wl9B

query
sites
2wl9B
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
L
T
 
G
L
 
L
L
 
S
S
 
V
S
 
S
D
 
N
L
 
L
A
 
D
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
H
 
D
Y
 
Y
A
 
A
S
 
A
Q
 
G
V
 
I
L
 
M
G
 
G
M
 
M
M
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
D
S
 
D
D
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
D
H
 
R
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
K
 
R
M
 
M
D
 
D
E
 
R
R
 
W
H
 
H
Y
 
H
R
 
R
I
 
I
L
 
V
V
 
L
Q
 
H
K
 
A
N
 
D
V
 
G
E
 
S
N
 
D
G
 
D
F
 
L
G
 
A
A
 
Y
C
 
I
G
 
G
W
 
W
E
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
G
K
 
P
A
 
V
A
 
E
L
 
L
E
 
D
Q
 
E
A
 
L
V
 
A
S
 
E
E
 
Q
L
 
L
Q
 
K
Q
 
N
A
 
A
D
 
G
V
 
I
Q
 
P
V
 
F
T
 
E
R
 
V
G
 
A
T
 
S
A
 
D
A
 
A
E
 
D
A
 
A
E
 
A
L
 
E
R
 
R
K
 
R
V
 
V
Q
 
L
E
 
G
L
 
L
V
 
V
H
 
K
F
 
L
S
 
H
D
 
D
P
 
P
D
 
G
G
 
G
N
 
N
R
 
P
H
 
T
E
 
E
I
 
I
F
 
F
W
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
Q
Q
 
V
D
 
D
F
 
T
A
 
S
R
 
S
F
 
P
V
 
F
S
 
H
P
 
P
-
 
G
-
 
R
V
 
P
G
 
M
V
 
F
K
 
G
G
 
K
F
 
F
V
 
V
T
 
T
N
 
E
E
 
G
L
 
Q
G
 
G
M
 
L
G
 
G
H
|
H
V
 
I
V
 
I
L
 
I
P
 
R
A
 
E
P
 
D
A
 
D
F
 
V
E
 
E
R
 
E
C
 
A
R
 
T
D
 
R
F
 
F
Y
 
Y
E
 
R
Q
 
L
V
 
L
L