SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PfGW456L13_3001 FitnessBrowser__pseudo13_GW456_L13:PfGW456L13_3001 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6vpbB A novel membrane-bound 6-phosphogluconate dehydrogenase from the acetic acid bacteria gluconacetobacter diazotrophicus (gd6pgd) (see paper)
65% identity, 97% coverage: 1:317/326 of query aligns to 1:324/324 of 6vpbB

query
sites
6vpbB
M
 
M
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
G
 
G
N
 
N
I
 
I
A
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
L
M
 
S
L
 
R
N
 
H
G
 
G
H
 
H
T
 
D
T
 
V
V
 
V
V
 
L
Y
 
F
D
 
D
R
 
R
N
 
D
T
 
A
A
 
A
F
 
T
V
 
V
E
 
S
A
 
K
L
 
V
A
 
S
-
 
E
-
 
R
T
 
I
E
 
E
G
 
G
S
 
G
T
 
R
G
 
G
V
 
V
-
 
A
-
 
A
T
 
T
D
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
D
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
K
L
 
L
-
 
T
A
 
A
R
 
K
P
 
R
R
 
K
A
 
I
V
 
V
W
 
W
V
 
V
M
 
M
L
 
L
P
 
P
A
 
C
G
 
G
A
 
E
P
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
N
T
 
A
I
 
V
D
 
Q
T
 
E
L
 
L
S
 
Y
T
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
G
A
 
K
G
 
D
D
 
D
T
 
I
I
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
T
F
 
Y
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
D
 
D
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
A
T
 
Q
L
 
L
S
 
A
E
 
D
K
 
K
G
 
G
L
 
I
H
 
H
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
W
 
W
G
 
G
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
C
 
C
M
 
M
M
 
M
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
D
 
T
A
 
K
E
 
D
T
 
S
V
 
T
K
 
D
R
 
H
L
 
I
D
 
D
P
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
D
T
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
K
G
 
G
D
 
D
I
 
V
P
 
A
R
 
P
T
 
T
K
 
P
D
 
D
R
 
R
K
 
G
S
 
K
D
 
P
-
 
G
-
 
L
D
 
D
D
 
P
R
 
R
A
 
A
E
 
E
R
 
K
G
 
G
Y
 
Y
I
 
L
H
 
H
A
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
H
 
H
F
 
F
V
 
V
K
 
K
M
 
M
I
 
V
H
 
H
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
M
 
M
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
E
G
 
G
F
 
F
D
 
D
I
 
I
L
 
M
K
 
K
T
 
S
K
 
K
N
 
N
S
 
S
E
 
P
S
 
K
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
D
 
D
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
D
 
D
L
 
L
N
 
N
V
 
M
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
W
 
W
R
 
R
R
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
S
 
S
S
 
S
W
 
W
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
A
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
K
D
 
N
P
 
A
K
 
S
L
 
L
D
 
S
G
 
E
F
 
F
S
 
T
G
 
G
S
 
E
V
 
V
A
 
A
D
|
D
S
|
S
G
 
G
E
 
E
G
|
G
Q
x
R
W
 
W
T
 
T
I
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
M
 
I
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
P
 
P
V
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
I
S
 
T
N
 
A
S
 
S
L
 
L
F
 
F
S
 
T
R
 
R
Y
 
F
R
 
R
S
 
S
R
 
R
G
 
T
Q
 
G
G
 
N
T
 
N
F
 
Y
G
 
A
D
 
E
K
 
K
I
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Q
 
M
R
 
R
F
 
F
G
 
G
F
 
F

2w90B Geobacillus stearothermophilus 6-phosphogluconate dehydrogenase with bound 6- phosphogluconate (see paper)
34% identity, 91% coverage: 2:299/326 of query aligns to 7:292/471 of 2w90B

query
sites
2w90B
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
R
 
V
M
 
M
G
 
G
G
 
K
N
 
N
I
 
L
A
 
A
R
 
L
R
 
N
L
 
I
M
 
E
L
 
S
N
 
K
G
 
G
H
 
Y
T
 
S
T
 
V
V
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
R
 
R
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
K
N
 
T
T
 
D
A
 
E
F
 
F
V
 
L
E
 
Q
A
 
E
L
 
A
A
 
K
T
 
G
E
 
K
G
 
N
S
 
I
T
 
V
G
 
G
V
 
T
T
 
Y
D
 
S
L
 
I
P
 
E
A
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
N
G
 
A
L
 
L
A
 
E
R
 
K
P
 
P
R
 
R
A
 
K
V
 
I
W
 
L
V
 
L
M
 
M
L
 
V
P
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
T
 
T
E
 
D
E
 
A
T
 
T
I
 
I
D
 
E
T
 
Q
L
 
L
S
 
K
T
 
P
L
 
H
L
 
L
D
 
E
A
 
K
G
 
G
D
 
D
T
 
I
I
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
T
F
 
Y
Y
 
F
K
 
K
D
 
D
D
 
T
I
 
Q
R
 
R
R
 
R
A
 
N
K
 
K
T
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
E
K
 
L
G
 
G
L
 
I
H
 
H
Y
 
F
I
 
I
D
 
G
V
 
T
G
 
G
T
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
E
W
 
E
G
 
G
L
 
A
E
 
L
R
 
K
G
 
G
Y
 
P
C
 
S
M
 
I
M
 
M
I
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
A
 
K
E
 
E
T
 
A
V
 
H
K
 
E
R
 
L
L
 
V
D
 
R
P
 
P
L
 
I
F
 
F
A
 
E
T
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
K
L
 
V
G
 
D
D
 
G
I
 
E
P
 
P
R
 
C
T
 
T
K
 
-
D
 
-
R
 
-
K
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
T
H
 
Y
A
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
D
G
 
G
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
Y
V
 
V
K
 
K
M
 
M
I
 
V
H
 
H
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
M
 
D
M
 
M
Q
 
Q
A
 
L
F
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
A
F
 
Y
D
 
F
I
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
Q
 
H
R
 
V
F
 
L
D
 
G
L
 
M
N
 
D
V
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
L
A
 
H
E
 
E
V
 
V
-
 
F
-
 
A
-
 
D
W
 
W
R
 
N
R
 
K
G
 
G
S
 
E
V
 
-
V
 
L
S
 
N
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
I
T
 
T
A
 
A
D
 
D
A
 
I
L
 
F
A
 
T
S
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
G
D
 
K
P
 
P
K
 
L
L
 
V
D
 
D
G
 
V
F
 
I
S
 
L
G
 
D
S
 
K
V
 
A
A
 
G
D
 
Q
S
 
K
G
 
G
E
 
T
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
T
 
T
I
 
S
E
 
Q
A
 
N
A
 
A
M
 
L
E
 
D
Q
 
L
A
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
L
P
 
P
V
 
I
L
 
I
S
 
T
N
 
E
S
 
S
L
 
V
F
 
F
S
 
A
R
 
R
Y
 
F
R
 
L
S
 
S

Sites not aligning to the query:

8i4qA Crystal structure of 6-phosphogluconate dehydrogenase from corynebacterium glutamicum (see paper)
33% identity, 95% coverage: 2:311/326 of query aligns to 4:309/479 of 8i4qA

query
sites
8i4qA
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
A
R
 
V
M
|
M
G
 
G
G
 
S
N
 
N
I
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
N
L
 
F
M
 
A
L
 
R
N
 
N
G
 
G
H
 
N
T
 
T
T
 
V
V
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
x
N
R
|
R
N
x
S
T
 
T
A
 
D
F
x
K
V
 
T
E
 
D
A
 
K
L
 
L
-
 
I
A
 
A
T
 
D
E
 
H
G
 
G
S
 
S
T
 
E
G
 
G
-
 
N
-
 
F
-
 
I
-
 
P
V
 
S
T
 
A
D
 
T
L
 
V
P
 
E
A
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
A
W
 
I
V
 
I
M
|
M
L
x
V
P
x
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
N
P
x
A
T
 
T
E
 
D
E
 
A
T
 
V
I
 
I
D
 
N
T
 
Q
L
 
L
S
 
A
T
 
D
L
 
A
L
 
M
D
 
D
A
 
E
G
 
G
D
 
D
T
 
I
I
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
|
N
T
 
A
F
 
L
Y
 
Y
K
 
T
D
 
D
D
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
E
K
 
K
T
 
E
L
 
I
S
 
S
E
 
A
K
 
R
G
 
G
L
 
L
H
 
H
Y
 
F
I
 
V
D
 
G
V
 
A
G
 
G
T
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
E
W
 
E
G
 
G
L
 
A
E
 
L
R
 
N
G
 
G
Y
 
P
C
 
S
M
 
I
M
 
M
I
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
P
A
 
A
E
 
K
T
 
S
V
 
Y
K
 
E
R
 
S
L
 
L
D
 
G
P
 
P
L
 
L
F
 
L
A
 
E
T
 
S
L
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
N
L
 
V
G
 
D
D
 
G
I
 
T
P
 
P
R
 
C
T
 
V
K
 
T
D
 
-
R
 
-
K
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
H
 
H
A
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
D
G
 
G
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
F
V
 
V
K
 
K
M
 
M
I
 
V
H
 
H
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
G
 
A
M
 
D
M
 
M
Q
 
Q
A
 
V
F
 
I
A
 
G
E
 
E
G
 
A
F
 
Y
D
 
H
I
 
L
L
 
L
K
 
R
T
 
Y
K
 
A
N
 
A
S
 
G
E
 
-
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
M
N
 
Q
V
 
P
A
 
A
D
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
V
W
 
F
R
 
K
R
 
E
G
 
W
S
 
N
V
 
A
-
 
G
-
 
D
V
 
L
S
 
D
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
I
T
 
T
A
 
A
D
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
S
S
 
Q
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
G
D
 
K
P
 
P
K
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
V
F
 
I
S
 
V
G
 
D
S
 
A
V
 
A
A
 
G
D
 
Q
S
 
K
G
 
G
E
 
T
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
T
 
T
I
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
L
E
 
D
Q
 
L
A
 
G
V
 
I
P
 
A
V
 
T
P
 
T
V
 
G
L
 
I
S
 
G
N
 
E
S
 
A
L
 
V
F
 
F
S
 
A
R
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
S
Y
 
Q
R
 
R
S
 
A
R
 
A
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
N
F
 
L
G
 
P
D
 
A
K
 
G
I
 
V
L
 
L
S
 
T

P96789 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating; EC 1.1.1.44 from Lactococcus lactis subsp. cremoris (strain MG1363) (see paper)
33% identity, 98% coverage: 2:319/326 of query aligns to 5:314/472 of P96789

query
sites
P96789
Q
 
N
L
 
F
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
|
G
L
x
M
G
x
A
R
x
V
M
|
M
G
|
G
G
 
K
N
 
N
I
 
L
A
 
A
R
 
L
R
 
N
L
 
V
M
 
E
L
 
S
N
 
R
G
 
G
H
 
Y
T
 
T
T
 
V
V
 
A
V
 
I
Y
 
Y
D
x
N
R
|
R
N
x
T
T
 
T
A
 
S
F
 
K
V
 
T
E
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
Y
T
 
K
E
 
E
G
 
H
S
 
Q
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
L
T
 
V
G
 
F
V
 
T
T
 
K
D
 
T
L
 
L
P
 
E
A
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
I
W
 
M
V
 
L
M
 
M
L
x
V
P
x
Q
A
|
A
G
 
G
A
 
A
P
 
A
T
 
T
E
 
D
E
 
A
T
 
T
I
 
I
D
 
K
T
 
S
L
 
L
S
 
L
T
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
D
 
D
T
 
I
I
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
|
N
T
 
T
F
 
H
Y
 
F
K
 
P
D
 
D
D
 
T
I
 
M
R
 
R
R
 
R
A
 
N
K
 
A
T
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
D
K
 
S
G
 
G
L
 
I
H
 
N
Y
 
F
I
 
I
D
 
G
V
 
T
G
 
G
T
 
V
S
|
S
G
|
G
G
|
G
V
 
E
W
 
K
G
 
G
L
 
A
E
 
L
R
 
L
G
 
G
Y
 
P
C
 
S
M
 
M
M
 
M
I
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
A
 
K
E
 
E
T
 
A
V
 
Y
K
 
D
R
 
L
L
 
V
D
 
A
P
 
P
L
 
I
F
 
F
A
 
E
T
 
Q
L
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
K
K
 
A
S
 
P
D
 
Q
D
 
D
D
 
G
R
 
K
A
 
P
E
 
C
R
 
V
G
 
A
Y
 
Y
I
 
M
H
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
A
A
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
Y
V
 
V
K
|
K
M
 
M
I
 
V
H
|
H
N
|
N
G
 
G
I
 
I
E
|
E
Y
|
Y
G
 
G
M
 
D
M
 
M
Q
 
Q
A
 
L
F
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
S
F
 
Y
D
 
D
I
 
L
L
 
L
K
 
K
-
 
R
-
 
I
-
 
L
-
 
G
T
 
L
K
 
S
N
 
N
S
 
A
E
 
E
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
-
V
 
I
A
 
Q
D
 
A
I
 
I
A
 
F
E
 
E
V
 
E
W
 
W
R
 
N
R
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
-
V
 
L
S
 
D
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
I
T
 
T
A
 
K
D
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
K
S
 
R
D
 
K
P
 
D
K
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
I
L
 
V
D
 
D
G
 
K
F
 
I
S
 
L
G
 
D
S
 
K
V
 
A
A
 
G
D
 
N
S
x
K
G
 
G
E
 
T
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
T
 
T
I
 
S
E
 
E
A
 
S
A
 
A
M
 
L
E
 
D
Q
 
L
A
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
I
S
 
T
N
 
E
S
 
S
L
 
V
F
 
F
S
 
A
R
|
R
Y
 
Y
R
 
I
S
 
S
-
 
T
-
 
Y
R
 
K
G
 
D
Q
 
E
G
 
R
T
 
V
F
 
K
G
 
A
D
 
S
K
 
K
I
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
G
Q
 
P
R
 
A
F
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2iz1B 6pdh complexed with pex inhibitor synchrotron data (see paper)
33% identity, 98% coverage: 2:319/326 of query aligns to 7:316/471 of 2iz1B

query
sites
2iz1B
Q
 
N
L
 
F
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
G
 
A
R
 
V
M
 
M
G
 
G
G
 
K
N
 
N
I
 
L
A
 
A
R
 
L
R
 
N
L
 
V
M
 
E
L
 
S
N
 
R
G
 
G
H
 
Y
T
 
T
T
 
V
V
 
A
V
 
I
Y
 
Y
D
x
N
R
|
R
N
x
T
T
 
T
A
 
S
F
x
K
V
 
T
E
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
F
T
 
K
E
 
E
G
 
H
S
 
Q
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
L
T
 
V
G
 
F
V
 
T
T
 
K
D
 
T
L
 
L
P
 
E
A
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
I
W
 
M
V
 
L
M
 
M
L
x
V
P
x
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
x
A
T
 
T
E
 
D
E
 
A
T
 
T
I
 
I
D
 
K
T
 
S
L
 
L
S
 
L
T
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
D
 
D
T
 
I
I
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
T
F
 
H
Y
 
F
K
 
P
D
 
D
D
 
T
I
 
M
R
 
R
R
 
R
A
 
N
K
 
A
T
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
D
K
 
S
G
 
G
L
 
I
H
 
N
Y
 
F
I
 
I
D
 
G
V
 
T
G
 
G
T
 
V
S
|
S
G
 
G
G
 
G
V
 
E
W
 
K
G
 
G
L
 
A
E
 
L
R
 
L
G
 
G
Y
 
P
C
 
S
M
 
M
M
 
M
I
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
A
 
K
E
 
E
T
 
A
V
 
Y
K
 
D
R
 
L
L
 
V
D
 
A
P
 
P
L
 
I
F
 
F
A
 
E
T
 
Q
L
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
K
K
 
A
S
 
P
D
 
Q
D
 
D
D
 
G
R
 
K
A
 
P
E
 
C
R
 
V
G
 
A
Y
 
Y
I
 
M
H
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
A
A
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
Y
V
 
V
K
|
K
M
 
M
I
 
V
H
|
H
N
|
N
G
 
G
I
 
I
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
M
 
D
M
 
M
Q
 
Q
A
 
L
F
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
S
F
 
Y
D
 
D
I
 
L
L
 
L
K
 
K
-
 
R
-
 
I
-
 
L
-
 
G
T
 
L
K
 
S
N
 
N
S
 
A
E
 
E
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
-
V
 
I
A
 
Q
D
 
A
I
 
I
A
 
F
E
 
E
V
 
E
W
 
W
R
 
N
R
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
-
V
 
L
S
 
D
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
I
T
 
T
A
 
K
D
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
K
S
 
R
D
 
K
P
 
D
K
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
I
L
 
V
D
 
D
G
 
K
F
 
I
S
 
L
G
 
D
S
 
K
V
 
A
A
 
G
D
 
N
S
 
K
G
 
G
E
 
T
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
T
 
T
I
 
S
E
 
E
A
 
S
A
 
A
M
 
L
E
 
D
Q
 
L
A
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
I
S
 
T
N
 
E
S
 
S
L
 
V
F
 
F
S
 
A
R
 
R
Y
 
Y
R
 
I
S
 
S
-
 
T
-
 
Y
R
 
K
G
 
D
Q
 
E
G
 
R
T
 
V
F
 
K
G
 
A
D
 
S
K
 
K
I
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
G
Q
 
P
R
 
A
F
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2iypB Product rup (see paper)
33% identity, 98% coverage: 2:319/326 of query aligns to 6:315/470 of 2iypB

query
sites
2iypB
Q
 
N
L
 
F
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
G
 
A
R
 
V
M
 
M
G
 
G
G
 
K
N
 
N
I
 
L
A
 
A
R
 
L
R
 
N
L
 
V
M
 
E
L
 
S
N
 
R
G
 
G
H
 
Y
T
 
T
T
 
V
V
 
A
V
 
I
Y
 
Y
D
x
N
R
|
R
N
x
T
T
 
T
A
 
S
F
 
K
V
 
T
E
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
F
T
 
K
E
 
E
G
 
H
S
 
Q
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
L
T
 
V
G
 
F
V
 
T
T
 
K
D
 
T
L
 
L
P
 
E
A
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
I
W
 
M
V
 
L
M
 
M
L
x
V
P
x
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
x
A
T
 
T
E
 
D
E
 
A
T
 
T
I
 
I
D
 
K
T
 
S
L
 
L
S
 
L
T
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
D
 
D
T
 
I
I
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
T
F
 
H
Y
 
F
K
 
P
D
 
D
D
 
T
I
 
M
R
 
R
R
 
R
A
 
N
K
 
A
T
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
D
K
 
S
G
 
G
L
 
I
H
 
N
Y
 
F
I
 
I
D
 
G
V
 
T
G
 
G
T
 
V
S
|
S
G
 
G
G
 
G
V
 
E
W
 
K
G
 
G
L
 
A
E
 
L
R
 
L
G
 
G
Y
 
P
C
 
S
M
 
M
M
 
M
I
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
A
 
K
E
 
E
T
 
A
V
 
Y
K
 
D
R
 
L
L
 
V
D
 
A
P
 
P
L
 
I
F
 
F
A
 
E
T
 
Q
L
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
K
K
 
A
S
 
P
D
 
Q
D
 
D
D
 
G
R
 
K
A
 
P
E
 
C
R
 
V
G
 
A
Y
 
Y
I
 
M
H
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
A
A
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
Y
V
 
V
K
|
K
M
 
M
I
 
V
H
|
H
N
|
N
G
 
G
I
 
I
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
M
 
D
M
 
M
Q
 
Q
A
 
L
F
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
S
F
 
Y
D
 
D
I
 
L
L
 
L
K
 
K
-
 
R
-
 
I
-
 
L
-
 
G
T
 
L
K
 
S
N
 
N
S
 
A
E
 
E
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
-
V
 
I
A
 
Q
D
 
A
I
 
I
A
 
F
E
 
E
V
 
E
W
 
W
R
 
N
R
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
-
V
 
L
S
 
D
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
I
T
 
T
A
 
K
D
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
K
S
 
R
D
 
K
P
 
D
K
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
I
L
 
V
D
 
D
G
 
K
F
 
I
S
 
L
G
 
D
S
 
K
V
 
A
A
 
G
D
 
N
S
 
K
G
 
G
E
 
T
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
T
 
T
I
 
S
E
 
E
A
 
S
A
 
A
M
 
L
E
 
D
Q
 
L
A
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
I
S
 
T
N
 
E
S
 
S
L
 
V
F
 
F
S
 
A
R
 
R
Y
 
Y
R
 
I
S
 
S
-
 
T
-
 
Y
R
 
K
G
 
D
Q
 
E
G
 
R
T
 
V
F
 
K
G
 
A
D
 
S
K
 
K
I
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
G
Q
 
P
R
 
A
F
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2iypA Product rup (see paper)
33% identity, 98% coverage: 2:319/326 of query aligns to 5:314/469 of 2iypA

query
sites
2iypA
Q
 
N
L
 
F
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
|
G
L
 
M
G
 
A
R
 
V
M
|
M
G
 
G
G
 
K
N
 
N
I
 
L
A
 
A
R
 
L
R
 
N
L
 
V
M
 
E
L
 
S
N
 
R
G
 
G
H
 
Y
T
 
T
T
 
V
V
 
A
V
 
I
Y
 
Y
D
x
N
R
|
R
N
x
T
T
 
T
A
 
S
F
x
K
V
 
T
E
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
F
T
 
K
E
 
E
G
 
H
S
 
Q
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
L
T
 
V
G
 
F
V
 
T
T
 
K
D
 
T
L
 
L
P
 
E
A
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
I
W
 
M
V
 
L
M
|
M
L
x
V
P
x
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
x
A
T
 
T
E
 
D
E
 
A
T
 
T
I
 
I
D
 
K
T
 
S
L
 
L
S
 
L
T
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
D
 
D
T
 
I
I
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
|
G
N
|
N
T
 
T
F
 
H
Y
 
F
K
 
P
D
 
D
D
 
T
I
 
M
R
 
R
R
 
R
A
 
N
K
 
A
T
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
D
K
 
S
G
 
G
L
 
I
H
 
N
Y
 
F
I
 
I
D
 
G
V
 
T
G
 
G
T
x
V
S
|
S
G
 
G
G
 
G
V
 
E
W
 
K
G
 
G
L
 
A
E
 
L
R
 
L
G
 
G
Y
 
P
C
 
S
M
 
M
M
 
M
I
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
A
 
K
E
 
E
T
 
A
V
 
Y
K
 
D
R
 
L
L
 
V
D
 
A
P
 
P
L
 
I
F
 
F
A
 
E
T
 
Q
L
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
K
K
 
A
S
 
P
D
 
Q
D
 
D
D
 
G
R
 
K
A
 
P
E
 
C
R
 
V
G
 
A
Y
 
Y
I
 
M
H
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
A
A
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
Y
V
 
V
K
|
K
M
 
M
I
 
V
H
|
H
N
|
N
G
 
G
I
 
I
E
|
E
Y
|
Y
G
 
G
M
 
D
M
 
M
Q
 
Q
A
 
L
F
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
S
F
 
Y
D
 
D
I
 
L
L
 
L
K
 
K
-
 
R
-
 
I
-
 
L
-
 
G
T
 
L
K
 
S
N
 
N
S
 
A
E
 
E
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
-
V
 
I
A
 
Q
D
 
A
I
 
I
A
 
F
E
 
E
V
 
E
W
 
W
R
 
N
R
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
-
V
 
L
S
 
D
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
I
T
 
T
A
 
K
D
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
K
S
 
R
D
 
K
P
 
D
K
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
I
L
 
V
D
 
D
G
 
K
F
 
I
S
 
L
G
 
D
S
 
K
V
 
A
A
 
G
D
 
N
S
x
K
G
 
G
E
 
T
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
T
 
T
I
 
S
E
 
E
A
 
S
A
 
A
M
 
L
E
 
D
Q
 
L
A
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
I
S
 
T
N
 
E
S
 
S
L
 
V
F
 
F
S
 
A
R
 
R
Y
 
Y
R
 
I
S
 
S
-
 
T
-
 
Y
R
 
K
G
 
D
Q
 
E
G
 
R
T
 
V
F
 
K
G
 
A
D
 
S
K
 
K
I
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
G
Q
 
P
R
 
A
F
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
S
G
 
G

2iyoA Structural characterization of a bacterial 6pdh reveals aspects of specificity, mechanism and mode of inhibition (see paper)
33% identity, 98% coverage: 2:319/326 of query aligns to 5:314/470 of 2iyoA

query
sites
2iyoA
Q
 
N
L
 
F
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
G
 
A
R
 
V
M
 
M
G
 
G
G
 
K
N
 
N
I
 
L
A
 
A
R
 
L
R
 
N
L
 
V
M
 
E
L
 
S
N
 
R
G
 
G
H
 
Y
T
 
T
T
 
V
V
 
A
V
 
I
Y
 
Y
D
 
N
R
 
R
N
 
T
T
 
T
A
 
S
F
 
K
V
 
T
E
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
F
T
 
K
E
 
E
G
 
H
S
 
Q
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
L
T
 
V
G
 
F
V
 
T
T
 
K
D
 
T
L
 
L
P
 
E
A
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
I
W
 
M
V
 
L
M
 
M
L
 
V
P
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
A
T
 
T
E
 
D
E
 
A
T
 
T
I
 
I
D
 
K
T
 
S
L
 
L
S
 
L
T
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
D
 
D
T
 
I
I
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
|
N
T
 
T
F
 
H
Y
 
F
K
 
P
D
 
D
D
 
T
I
 
M
R
 
R
R
 
R
A
 
N
K
 
A
T
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
D
K
 
S
G
 
G
L
 
I
H
 
N
Y
 
F
I
 
I
D
 
G
V
 
T
G
 
G
T
 
V
S
|
S
G
|
G
G
 
G
V
 
E
W
 
K
G
 
G
L
 
A
E
 
L
R
 
L
G
 
G
Y
 
P
C
 
S
M
 
M
M
 
M
I
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
A
 
K
E
 
E
T
 
A
V
 
Y
K
 
D
R
 
L
L
 
V
D
 
A
P
 
P
L
 
I
F
 
F
A
 
E
T
 
Q
L
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
K
K
 
A
S
 
P
D
 
Q
D
 
D
D
 
G
R
 
K
A
 
P
E
 
C
R
 
V
G
 
A
Y
 
Y
I
 
M
H
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
A
A
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
Y
V
 
V
K
|
K
M
 
M
I
 
V
H
|
H
N
|
N
G
 
G
I
 
I
E
|
E
Y
|
Y
G
 
G
M
 
D
M
 
M
Q
 
Q
A
 
L
F
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
S
F
 
Y
D
 
D
I
 
L
L
 
L
K
 
K
-
 
R
-
 
I
-
 
L
-
 
G
T
 
L
K
 
S
N
 
N
S
 
A
E
 
E
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
-
V
 
I
A
 
Q
D
 
A
I
 
I
A
 
F
E
 
E
V
 
E
W
 
W
R
 
N
R
 
E
G
 
G
S
 
E
V
 
-
V
 
L
S
 
D
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
I
T
 
T
A
 
K
D
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
K
S
 
R
D
 
K
P
 
D
K
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
I
L
 
V
D
 
D
G
 
K
F
 
I
S
 
L
G
 
D
S
 
K
V
 
A
A
 
G
D
 
N
S
x
K
G
 
G
E
 
T
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
T
 
T
I
 
S
E
 
E
A
 
S
A
 
A
M
 
L
E
 
D
Q
 
L
A
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
I
S
 
T
N
 
E
S
 
S
L
 
V
F
 
F
S
 
A
R
 
R
Y
 
Y
R
 
I
S
 
S
-
 
T
-
 
Y
R
 
K
G
 
D
Q
 
E
G
 
R
T
 
V
F
 
K
G
 
A
D
 
S
K
 
K
I
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
G
Q
 
P
R
 
A
F
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2zydA Dimeric 6-phosphogluconate dehydrogenase complexed with glucose (see paper)
33% identity, 95% coverage: 2:311/326 of query aligns to 3:302/464 of 2zydA

query
sites
2zydA
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
G
 
A
R
 
V
M
 
M
G
 
G
G
 
R
N
 
N
I
 
L
A
 
A
R
 
L
R
 
N
L
 
I
M
 
E
L
 
S
N
 
R
G
 
G
H
 
Y
T
 
T
T
 
V
V
 
S
V
 
I
Y
 
F
D
 
N
R
 
R
N
 
S
T
 
R
A
 
E
F
 
K
V
 
T
E
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
I
T
 
A
E
 
E
G
 
-
S
 
N
T
 
P
G
 
G
V
 
K
T
 
K
D
 
L
L
 
V
P
 
P
-
 
Y
-
 
Y
-
 
T
-
 
V
-
 
K
A
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
E
G
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
I
W
 
L
V
 
L
M
 
M
L
 
V
P
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
G
T
 
T
E
 
D
E
 
A
T
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
S
L
 
L
S
 
K
T
 
P
L
 
Y
L
 
L
D
 
D
A
 
K
G
 
G
D
 
D
T
 
I
I
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
T
F
 
F
Y
 
F
K
 
Q
D
 
D
D
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
N
K
 
R
T
 
E
L
 
L
S
 
S
E
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
F
H
 
N
Y
 
F
I
 
I
D
 
G
V
 
T
G
 
G
T
 
V
S
|
S
G
 
G
G
 
G
V
 
E
W
 
E
G
 
G
L
 
A
E
 
L
R
 
K
G
 
G
Y
 
P
C
 
S
M
 
I
M
 
M
I
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
A
 
K
E
 
E
T
 
A
V
 
Y
K
 
E
R
 
L
L
 
V
D
 
A
P
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
T
T
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
V
L
 
A
G
 
E
D
 
D
I
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
K
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
G
E
 
E
R
 
P
G
 
C
Y
 
V
I
 
T
H
 
Y
A
 
I
G
 
G
P
 
A
A
 
D
G
 
G
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
Y
V
 
V
K
|
K
M
 
M
I
 
V
H
|
H
N
|
N
G
 
G
I
 
I
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
M
 
D
M
 
M
Q
 
Q
A
 
L
F
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
A
F
 
Y
D
 
S
I
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
G
K
 
G
N
 
-
S
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
L
D
 
N
L
 
L
N
 
T
V
 
N
A
 
E
D
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
Q
V
 
T
-
 
F
-
 
T
-
 
E
W
 
W
R
 
N
R
 
N
G
 
G
S
 
E
V
 
-
V
 
L
S
 
S
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
I
T
 
T
A
 
K
D
 
D
A
 
I
L
 
F
A
 
T
S
 
K
D
 
K
P
 
D
K
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
Y
-
 
L
L
 
V
D
 
D
G
 
V
F
 
I
S
 
L
G
 
D
S
 
E
V
 
A
A
 
A
D
 
N
S
 
K
G
 
G
E
 
T
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
T
 
T
I
 
S
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
M
 
L
E
 
D
Q
 
L
A
 
G
V
 
E
P
 
P
V
 
L
P
 
S
V
 
L
L
 
I
S
 
T
N
 
E
S
 
S
L
 
V
F
 
F
S
 
A
R
 
R
Y
 
Y
R
 
I
S
 
S
-
 
S
-
 
L
R
 
K
G
 
D
Q
 
Q
G
 
R
T
 
V
F
 
A
G
 
A
D
 
S
K
 
K
I
 
V
L
 
L
S
 
S

Sites not aligning to the query:

3fwnB Dimeric 6-phosphogluconate dehydrogenase complexed with 6- phosphogluconate and 2'-monophosphoadenosine-5'-diphosphate (see paper)
33% identity, 95% coverage: 2:311/326 of query aligns to 4:303/467 of 3fwnB

query
sites
3fwnB
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
G
 
A
R
 
V
M
 
M
G
 
G
G
 
R
N
 
N
I
 
L
A
 
A
R
 
L
R
 
N
L
 
I
M
 
E
L
 
S
N
 
R
G
 
G
H
 
Y
T
 
T
T
 
V
V
 
S
V
 
I
Y
 
F
D
x
N
R
|
R
N
x
S
T
 
R
A
 
E
F
x
K
V
 
T
E
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
I
T
 
A
E
 
E
G
 
-
S
 
N
T
 
P
G
 
G
V
 
K
T
 
K
D
 
L
L
 
V
P
 
P
-
 
Y
-
 
Y
-
 
T
-
 
V
-
 
K
A
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
E
G
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
I
W
 
L
V
 
L
M
 
M
L
x
V
P
x
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
x
G
T
 
T
E
 
D
E
 
A
T
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
S
L
 
L
S
 
K
T
 
P
L
 
Y
L
 
L
D
 
D
A
 
K
G
 
G
D
 
D
T
 
I
I
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
T
F
 
F
Y
 
F
K
 
Q
D
 
D
D
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
N
K
 
R
T
 
E
L
 
L
S
 
S
E
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
F
H
 
N
Y
 
F
I
 
I
D
 
G
V
 
T
G
 
G
T
 
V
S
|
S
G
|
G
G
 
G
V
 
E
W
 
E
G
 
G
L
 
A
E
 
L
R
 
K
G
 
G
Y
 
P
C
 
S
M
 
I
M
 
M
I
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
A
 
K
E
 
E
T
 
A
V
 
Y
K
 
E
R
 
L
L
 
V
D
 
A
P
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
T
T
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
V
L
 
A
G
 
E
D
 
D
I
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
K
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
G
E
 
E
R
 
P
G
 
C
Y
 
V
I
 
T
H
 
Y
A
 
I
G
 
G
P
 
A
A
 
D
G
 
G
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
Y
V
 
V
K
|
K
M
 
M
I
 
V
H
|
H
N
|
N
G
 
G
I
 
I
E
|
E
Y
|
Y
G
 
G
M
 
D
M
 
M
Q
 
Q
A
 
L
F
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
A
F
 
Y
D
 
S
I
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
G
K
 
G
N
 
-
S
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
L
D
 
N
L
 
L
N
 
T
V
 
N
A
 
E
D
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
Q
V
 
T
-
 
F
-
 
T
-
 
E
W
 
W
R
 
N
R
 
N
G
 
G
S
 
E
V
 
-
V
 
L
S
 
S
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
I
T
 
T
A
 
K
D
 
D
A
 
I
L
 
F
A
 
T
S
 
K
D
 
K
P
 
D
K
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
Y
-
 
L
L
 
V
D
 
D
G
 
V
F
 
I
S
 
L
G
 
D
S
 
E
V
 
A
A
 
A
D
 
N
S
x
K
G
 
G
E
 
T
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
T
 
T
I
 
S
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
M
 
L
E
 
D
Q
 
L
A
 
G
V
 
E
P
 
P
V
 
L
P
 
S
V
 
L
L
 
I
S
 
T
N
 
E
S
 
S
L
 
V
F
 
F
S
 
A
R
 
R
Y
 
Y
R
 
I
S
 
S
-
 
S
-
 
L
R
 
K
G
 
D
Q
 
Q
G
 
R
T
 
V
F
 
A
G
 
A
D
 
S
K
 
K
I
 
V
L
 
L
S
 
S

Sites not aligning to the query:

3fwnA Dimeric 6-phosphogluconate dehydrogenase complexed with 6- phosphogluconate and 2'-monophosphoadenosine-5'-diphosphate (see paper)
33% identity, 95% coverage: 2:311/326 of query aligns to 4:303/467 of 3fwnA

query
sites
3fwnA
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
G
 
A
R
 
V
M
 
M
G
 
G
G
 
R
N
 
N
I
 
L
A
 
A
R
 
L
R
 
N
L
 
I
M
 
E
L
 
S
N
 
R
G
 
G
H
 
Y
T
 
T
T
 
V
V
 
S
V
 
I
Y
 
F
D
 
N
R
 
R
N
 
S
T
 
R
A
 
E
F
 
K
V
 
T
E
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
I
T
 
A
E
 
E
G
 
-
S
 
N
T
 
P
G
 
G
V
 
K
T
 
K
D
 
L
L
 
V
P
 
P
-
 
Y
-
 
Y
-
 
T
-
 
V
-
 
K
A
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
E
G
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
I
W
 
L
V
 
L
M
 
M
L
 
V
P
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
G
T
 
T
E
 
D
E
 
A
T
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
S
L
 
L
S
 
K
T
 
P
L
 
Y
L
 
L
D
 
D
A
 
K
G
 
G
D
 
D
T
 
I
I
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
T
F
 
F
Y
 
F
K
 
Q
D
 
D
D
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
N
K
 
R
T
 
E
L
 
L
S
 
S
E
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
F
H
 
N
Y
 
F
I
 
I
D
 
G
V
 
T
G
 
G
T
 
V
S
|
S
G
 
G
G
 
G
V
 
E
W
 
E
G
 
G
L
 
A
E
 
L
R
 
K
G
 
G
Y
 
P
C
 
S
M
 
I
M
 
M
I
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
A
 
K
E
 
E
T
 
A
V
 
Y
K
 
E
R
 
L
L
 
V
D
 
A
P
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
T
T
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
V
L
 
A
G
 
E
D
 
D
I
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
K
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
G
E
 
E
R
 
P
G
 
C
Y
 
V
I
 
T
H
 
Y
A
 
I
G
 
G
P
 
A
A
 
D
G
 
G
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
Y
V
 
V
K
|
K
M
 
M
I
 
V
H
|
H
N
|
N
G
 
G
I
 
I
E
|
E
Y
|
Y
G
 
G
M
 
D
M
 
M
Q
 
Q
A
 
L
F
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
A
F
 
Y
D
 
S
I
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
G
K
 
G
N
 
-
S
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
L
D
 
N
L
 
L
N
 
T
V
 
N
A
 
E
D
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
Q
V
 
T
-
 
F
-
 
T
-
 
E
W
 
W
R
 
N
R
 
N
G
 
G
S
 
E
V
 
-
V
 
L
S
 
S
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
I
T
 
T
A
 
K
D
 
D
A
 
I
L
 
F
A
 
T
S
 
K
D
 
K
P
 
D
K
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
Y
-
 
L
L
 
V
D
 
D
G
 
V
F
 
I
S
 
L
G
 
D
S
 
E
V
 
A
A
 
A
D
x
N
S
x
K
G
 
G
E
 
T
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
T
 
T
I
 
S
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
M
 
L
E
 
D
Q
 
L
A
 
G
V
 
E
P
 
P
V
 
L
P
 
S
V
 
L
L
 
I
S
 
T
N
 
E
S
 
S
L
 
V
F
 
F
S
 
A
R
 
R
Y
 
Y
R
 
I
S
 
S
-
 
S
-
 
L
R
 
K
G
 
D
Q
 
Q
G
 
R
T
 
V
F
 
A
G
 
A
D
 
S
K
 
K
I
 
V
L
 
L
S
 
S

Sites not aligning to the query:

P00350 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating; EC 1.1.1.44 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 95% coverage: 2:311/326 of query aligns to 5:304/468 of P00350

query
sites
P00350
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
G
 
A
R
 
V
M
 
M
G
 
G
G
 
R
N
 
N
I
 
L
A
 
A
R
 
L
R
 
N
L
 
I
M
 
E
L
 
S
N
 
R
G
 
G
H
 
Y
T
 
T
T
 
V
V
 
S
V
 
I
Y
 
F
D
 
N
R
 
R
N
 
S
T
 
R
A
 
E
F
 
K
V
 
T
E
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
I
T
 
A
E
 
E
G
 
-
S
 
N
T
 
P
G
 
G
V
 
K
T
 
K
D
 
L
L
 
V
P
 
P
-
 
Y
-
 
Y
-
 
T
-
 
V
-
 
K
A
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
E
G
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
R
V
 
I
W
 
L
V
 
L
M
 
M
L
 
V
P
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
G
T
 
T
E
 
D
E
 
A
T
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
S
L
 
L
S
 
K
T
 
P
L
 
Y
L
 
L
D
 
D
A
 
K
G
 
G
D
 
D
T
 
I
I
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
T
F
 
F
Y
 
F
K
 
Q
D
 
D
D
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
N
K
 
R
T
 
E
L
 
L
S
 
S
E
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
F
H
 
N
Y
 
F
I
 
I
D
 
G
V
 
T
G
 
G
T
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
E
W
 
E
G
 
G
L
 
A
E
 
L
R
 
K
G
 
G
Y
 
P
C
 
S
M
 
I
M
 
M
I
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
A
 
K
E
 
E
T
 
A
V
 
Y
K
 
E
R
 
L
L
 
V
D
 
A
P
 
P
L
 
I
F
 
L
A
 
T
T
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
V
L
 
A
G
 
E
D
 
D
I
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
K
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
G
E
 
E
R
 
P
G
 
C
Y
 
V
I
 
T
H
 
Y
A
 
I
G
 
G
P
 
A
A
 
D
G
 
G
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
Y
V
 
V
K
|
K
M
 
M
I
 
V
H
 
H
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
|
E
Y
 
Y
G
 
G
M
 
D
M
 
M
Q
 
Q
A
 
L
F
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
A
F
 
Y
D
 
S
I
 
L
L
 
L
K
 
K
T
 
G
K
 
G
N
 
-
S
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
L
D
 
N
L
 
L
N
 
T
V
 
N
A
 
E
D
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
Q
V
 
T
-
 
F
-
 
T
-
 
E
W
 
W
R
 
N
R
 
N
G
 
G
S
 
E
V
 
-
V
 
L
S
 
S
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
I
T
 
T
A
 
K
D
 
D
A
 
I
L
 
F
A
 
T
S
 
K
D
 
K
P
 
D
K
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
Y
-
 
L
L
 
V
D
 
D
G
 
V
F
 
I
S
 
L
G
 
D
S
 
E
V
 
A
A
 
A
D
 
N
S
 
K
G
 
G
E
 
T
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
T
 
T
I
 
S
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
M
 
L
E
 
D
Q
 
L
A
 
G
V
 
E
P
 
P
V
 
L
P
 
S
V
 
L
L
 
I
S
 
T
N
 
E
S
 
S
L
 
V
F
 
F
S
 
A
R
 
R
Y
 
Y
R
 
I
S
 
S
-
 
S
-
 
L
R
 
K
G
 
D
Q
 
Q
G
 
R
T
 
V
F
 
A
G
 
A
D
 
S
K
 
K
I
 
V
L
 
L
S
 
S

7cb2A The 6-phosphogluconate dehydrogenase (NADP-bound) from staphylococcus aureus
33% identity, 91% coverage: 2:299/326 of query aligns to 4:289/466 of 7cb2A

query
sites
7cb2A
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
R
 
V
M
 
M
G
 
G
G
 
K
N
 
N
I
 
L
A
 
A
R
 
W
R
 
N
L
 
I
M
 
E
L
 
S
N
 
R
G
 
G
H
 
Y
T
 
S
T
 
V
V
 
S
V
 
V
Y
 
F
D
x
N
R
|
R
N
x
S
T
 
S
A
 
E
F
x
K
V
 
T
E
 
D
A
 
-
L
 
L
A
 
M
T
 
V
E
 
E
G
 
E
S
 
S
T
 
K
G
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
I
-
 
H
-
 
P
V
 
T
T
 
Y
D
 
S
L
 
L
P
 
E
A
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
N
G
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
P
 
P
R
 
R
A
 
K
V
 
I
W
 
L
V
 
L
M
 
M
L
 
V
P
x
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
K
P
x
A
T
 
T
E
 
D
E
 
A
T
 
T
I
 
I
D
 
D
T
 
S
L
 
L
S
 
L
T
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
I
I
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
T
F
 
N
Y
 
Y
K
 
Q
D
 
D
D
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
N
K
 
K
T
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
Q
K
 
S
G
 
A
L
 
I
H
 
N
Y
 
F
I
 
I
D
 
G
V
 
M
G
 
G
T
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
E
W
 
I
G
 
G
L
 
A
E
 
L
R
 
T
G
 
G
Y
 
P
C
 
S
M
 
L
M
 
M
I
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
A
 
E
E
 
E
T
 
A
V
 
Y
K
 
N
R
 
K
L
 
V
D
 
A
P
 
D
L
 
I
F
 
L
A
 
D
T
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
K
 
K
S
 
A
D
 
K
D
 
D
D
 
G
R
 
A
A
 
S
E
 
C
R
 
V
G
 
T
Y
 
Y
I
 
I
H
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
P
A
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
Y
V
 
V
K
 
K
M
 
M
I
 
V
H
 
H
N
 
N
G
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
Y
G
 
A
M
 
D
M
 
M
Q
 
Q
A
 
L
F
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
S
F
 
Y
D
 
A
I
 
M
L
 
M
K
 
K
T
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
Q
 
E
R
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
M
N
 
S
V
 
H
A
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
V
 
T
-
 
F
-
 
K
-
 
D
W
 
W
R
 
N
R
 
A
G
 
G
S
 
E
V
 
-
V
 
L
S
 
E
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
I
T
 
T
A
 
G
D
 
D
A
 
I
L
 
F
A
 
M
S
 
K
-
 
L
D
 
D
P
 
E
K
 
N
L
 
K
D
 
E
G
 
A
F
 
L
S
 
V
G
 
E
S
 
K
V
 
I
A
 
L
D
 
D
S
 
T
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
G
 
G
E
 
T
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
T
 
T
I
 
S
E
 
I
A
 
N
A
 
A
M
 
L
E
 
E
Q
 
L
A
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
L
P
 
T
V
 
I
L
 
I
S
 
T
N
 
E
S
 
S
L
 
V
F
 
F
S
 
A
R
 
R
Y
 
F
R
 
I
S
 
S

7cb5B The 6-phosphogluconate dehydrogenase from staphylococcus aureus (6- phosphogluconate bound) (see paper)
33% identity, 91% coverage: 2:299/326 of query aligns to 4:289/467 of 7cb5B

query
sites
7cb5B
Q
 
Q
L
 
I
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
R
 
V
M
 
M
G
 
G
G
 
K
N
 
N
I
 
L
A
 
A
R
 
W
R
 
N
L
 
I
M
 
E
L
 
S
N
 
R
G
 
G
H
 
Y
T
 
S
T
 
V
V
 
S
V
 
V
Y
 
F
D
 
N
R
 
R
N
 
S
T
 
S
A
 
E
F
 
K
V
 
T
E
 
D
A
 
-
L
 
L
A
 
M
T
 
V
E
 
E
G
 
E
S
 
S
T
 
K
G
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
I
-
 
H
-
 
P
V
 
T
T
 
Y
D
 
S
L
 
L
P
 
E
A
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
N
G
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
P
 
P
R
 
R
A
 
K
V
 
I
W
 
L
V
 
L
M
 
M
L
 
V
P
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
K
P
 
A
T
 
T
E
 
D
E
 
A
T
 
T
I
 
I
D
 
D
T
 
S
L
 
L
S
 
L
T
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
I
I
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
T
F
 
N
Y
 
Y
K
 
Q
D
 
D
D
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
N
K
 
K
T
 
A
L
 
L
S
 
A
E
 
Q
K
 
S
G
 
A
L
 
I
H
 
N
Y
 
F
I
 
I
D
 
G
V
 
M
G
 
G
T
 
V
S
|
S
G
 
G
G
 
G
V
 
E
W
 
I
G
 
G
L
 
A
E
 
L
R
 
T
G
 
G
Y
 
P
C
 
S
M
 
L
M
 
M
I
 
P
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
A
 
E
E
 
E
T
 
A
V
 
Y
K
 
N
R
 
K
L
 
V
D
 
A
P
 
D
L
 
I
F
 
L
A
 
D
T
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
A
G
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
K
 
K
S
 
A
D
 
K
D
 
D
D
 
G
R
 
A
A
 
S
E
 
C
R
 
V
G
 
T
Y
 
Y
I
 
I
H
 
-
A
 
-
G
 
G
P
 
P
A
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
Y
V
 
V
K
|
K
M
 
M
I
 
V
H
 
H
N
|
N
G
 
G
I
 
I
E
|
E
Y
|
Y
G
 
A
M
 
D
M
 
M
Q
 
Q
A
 
L
F
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
S
F
 
Y
D
 
A
I
 
M
L
 
M
K
 
K
T
 
-
K
 
-
N
 
-
S
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
-
Q
 
E
R
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
M
N
 
S
V
 
H
A
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
Q
V
 
T
-
 
F
-
 
K
-
 
D
W
 
W
R
 
N
R
 
A
G
 
G
S
 
E
V
 
-
V
 
L
S
 
E
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
E
L
 
I
T
 
T
A
 
G
D
 
D
A
 
I
L
 
F
A
 
M
S
 
K
-
 
L
D
 
D
P
 
E
K
 
N
L
 
K
D
 
E
G
 
A
F
 
L
S
 
V
G
 
E
S
 
K
V
 
I
A
 
L
D
 
D
S
 
T
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
x
K
G
 
G
E
 
T
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
T
 
T
I
 
S
E
 
I
A
 
N
A
 
A
M
 
L
E
 
E
Q
 
L
A
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
L
P
 
T
V
 
I
L
 
I
S
 
T
N
 
E
S
 
S
L
 
V
F
 
F
S
 
A
R
 
R
Y
 
F
R
 
I
S
 
S

Sites not aligning to the query:

P78812 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating; EC 1.1.1.44 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
35% identity, 91% coverage: 3:299/326 of query aligns to 9:294/492 of P78812

query
sites
P78812
L
 
F
G
 
G
I
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
A
R
 
V
M
 
M
G
 
G
G
 
Q
N
 
N
I
 
L
A
 
I
R
 
L
R
 
N
L
 
G
M
 
A
L
 
D
N
 
K
G
 
G
H
 
F
T
 
T
T
 
V
V
 
C
V
 
C
Y
 
Y
D
 
N
R
 
R
N
 
T
T
 
T
A
 
S
F
 
R
V
 
V
-
 
D
E
 
E
A
 
F
L
 
L
A
 
A
T
 
N
E
 
E
G
 
A
S
 
K
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
I
T
 
V
G
 
G
V
 
A
T
 
H
D
 
S