SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS02235 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS02235 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
42% identity, 97% coverage: 3:303/311 of query aligns to 2:298/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
Q
 
K
V
 
V
C
 
L
I
 
V
S
 
A
E
 
A
F
 
P
M
 
L
D
 
H
A
 
E
D
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
Q
V
 
V
L
 
L
-
 
K
D
 
D
A
 
A
C
 
G
V
 
L
R
 
E
L
 
V
R
 
I
Y
 
Y
E
 
E
P
 
E
G
 
-
W
 
Y
V
 
P
D
 
D
Q
 
E
R
 
-
D
 
D
A
 
R
L
 
L
L
 
V
G
 
E
A
 
L
L
 
V
A
 
K
Q
 
D
T
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
R
 
K
T
 
P
Q
 
K
V
 
V
D
 
T
T
 
R
E
 
R
L
 
V
L
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
A
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
V
K
 
E
S
 
A
C
 
A
E
 
K
A
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
E
V
 
V
I
 
V
P
 
N
A
 
A
T
 
P
G
 
A
A
 
A
N
x
S
A
 
S
R
 
R
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
A
V
 
V
T
 
G
T
 
L
A
 
M
L
 
F
M
 
S
L
 
V
L
 
A
R
 
R
G
 
K
A
 
I
Y
 
A
Q
 
F
S
 
A
D
 
D
A
 
R
A
 
K
M
 
M
V
 
R
A
 
E
G
 
G
K
 
V
W
 
W
P
 
A
R
 
K
A
 
-
R
 
K
L
 
E
S
 
A
E
 
M
G
 
G
R
 
I
E
 
E
A
 
L
L
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
|
G
F
|
F
G
|
G
D
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
L
 
Q
T
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
I
A
 
A
Q
 
N
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
Q
 
N
V
 
I
V
 
L
A
 
L
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
 
-
L
 
Y
P
 
P
G
 
N
D
 
E
H
 
E
P
 
R
V
 
A
W
 
K
R
 
E
D
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
-
E
 
K
P
 
F
M
 
V
K
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
K
S
 
E
A
 
S
D
 
D
A
 
V
V
 
V
S
 
T
L
 
I
H
 
H
V
|
V
P
|
P
L
 
L
V
 
V
P
 
E
A
 
S
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
K
G
 
L
M
 
M
K
 
K
R
 
K
G
 
T
A
 
A
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
T
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
H
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
W
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
L
G
 
P
A
 
K
G
 
D
G
 
H
I
 
P
L
 
L
A
 
T
H
 
K
A
 
F
P
 
D
N
 
N
L
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
G
 
A
V
 
S
S
 
T
F
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
V
 
E
R
 
R
V
 
A
S
 
G
M
 
V
M
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
K
V
 
V

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
41% identity, 98% coverage: 4:307/311 of query aligns to 5:302/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
V
 
V
C
 
L
I
 
I
S
 
A
E
 
D
F
 
K
M
 
L
D
 
A
A
 
P
D
 
S
A
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
A
L
 
L
D
 
G
A
 
D
C
 
Q
V
 
V
R
 
E
L
 
V
R
 
R
Y
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
W
V
 
V
D
 
D
-
 
G
-
 
P
Q
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
P
Q
 
E
T
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
T
V
 
V
D
 
D
T
 
A
E
 
E
L
 
V
L
 
L
D
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
A
R
|
R
L
 
A
G
 
G
V
|
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
V
K
 
D
S
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
N
A
 
A
T
 
P
G
 
T
A
 
S
N
|
N
A
 
I
R
 
H
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
V
 
A
V
 
L
T
 
A
T
 
L
A
 
L
L
 
L
M
 
A
L
 
A
L
 
S
R
 
R
G
 
Q
A
 
I
Y
 
P
Q
 
A
S
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
S
M
 
L
V
 
R
A
 
E
G
 
H
K
 
T
W
 
W
P
 
K
R
 
R
A
 
S
R
 
S
L
 
F
S
 
S
E
 
-
G
 
G
R
 
T
E
 
E
A
 
I
L
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
L
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
L
G
 
G
D
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
T
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
R
A
 
I
Q
 
A
A
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
A
Q
 
Y
V
 
V
V
 
V
A
 
A
H
 
Y
D
 
D
P
 
P
A
 
Y
L
 
V
P
 
S
G
 
P
D
 
A
H
 
R
P
 
A
V
 
A
W
 
-
R
 
-
D
 
Q
T
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
P
 
L
M
 
L
K
 
S
L
 
L
E
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
R
A
 
A
D
 
D
A
 
F
V
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
V
 
L
P
 
P
L
 
K
V
 
T
P
 
P
A
 
E
T
 
T
R
 
A
H
 
G
L
 
L
I
 
I
N
 
D
A
 
K
E
 
E
R
 
A
L
 
L
R
 
A
G
 
K
M
 
T
K
 
K
R
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
T
E
 
G
G
 
G
L
 
H
L
 
V
A
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
A
A
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
G
 
T
A
 
D
G
 
S
G
 
P
I
 
L
L
 
F
A
 
E
H
 
L
A
 
A
P
 
-
N
 
Q
L
 
V
V
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
 
G
G
x
A
V
 
S
S
 
T
F
 
A
E
 
E
A
 
A
N
x
Q
V
 
D
R
 
R
V
 
A
S
 
G
M
 
T
M
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
S
V
 
V
K
 
R
N
 
L
A
 
A
L
 
L

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
41% identity, 98% coverage: 4:307/311 of query aligns to 4:301/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
V
 
V
C
 
L
I
 
I
S
 
A
E
 
D
F
 
K
M
 
L
D
 
A
A
 
P
D
 
S
A
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
A
L
 
L
D
 
G
A
 
D
C
 
Q
V
 
V
R
 
E
L
 
V
R
 
R
Y
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
W
V
 
V
D
 
D
-
 
G
-
 
P
Q
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
P
Q
 
E
T
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
T
V
 
V
D
 
D
T
 
A
E
 
E
L
 
V
L
 
L
D
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
A
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
V
K
 
D
S
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
L
V
 
V
I
 
V
P
 
N
A
 
A
T
 
P
G
 
T
A
 
S
N
|
N
A
 
I
R
 
H
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
H
V
 
A
V
 
L
T
 
A
T
 
L
A
 
L
L
 
L
M
 
A
L
 
A
L
 
S
R
 
R
G
 
Q
A
 
I
Y
 
P
Q
 
A
S
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
S
M
 
L
V
 
R
A
 
E
G
 
H
K
 
T
W
 
W
P
 
K
R
 
R
A
 
S
R
 
S
L
 
F
S
 
S
E
 
-
G
 
G
R
 
T
E
 
E
A
 
I
L
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
L
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
L
G
 
G
D
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
T
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
R
A
 
I
Q
 
A
A
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
A
Q
 
Y
V
 
V
V
 
V
A
 
A
H
 
Y
D
 
D
P
 
P
A
 
Y
L
 
V
P
 
S
G
 
P
D
 
A
H
 
R
P
 
A
V
 
A
W
 
-
R
 
-
D
 
Q
T
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
P
 
L
M
 
L
K
 
S
L
 
L
E
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
R
A
 
A
D
 
D
A
 
F
V
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
V
 
L
P
 
P
L
 
K
V
 
T
P
 
P
A
 
E
T
 
T
R
 
A
H
 
G
L
 
L
I
 
I
N
 
D
A
 
K
E
 
E
R
 
A
L
 
L
R
 
A
G
 
K
M
 
T
K
 
K
R
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
H
 
T
E
 
G
G
 
G
L
 
H
L
 
V
A
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
A
A
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
G
 
T
A
 
D
G
 
S
G
 
P
I
 
L
L
 
F
A
 
E
H
 
L
A
 
A
P
 
-
N
 
Q
L
 
V
V
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
V
 
S
S
 
T
F
 
A
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
V
 
D
R
 
R
V
 
A
S
 
G
M
 
T
M
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
S
V
 
V
K
 
R
N
 
L
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
37% identity, 91% coverage: 18:300/311 of query aligns to 9:294/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
L
 
L
D
 
D
A
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
L
 
K
R
 
I
Y
 
L
E
 
Q
P
 
D
G
 
G
W
 
G
V
 
L
D
 
Q
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
N
-
 
L
Q
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
Q
 
D
T
 
C
D
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
V
 
V
D
 
T
T
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
K
 
E
S
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
P
 
N
A
 
T
T
 
P
G
 
N
A
 
G
N
|
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
V
 
C
T
 
G
T
 
M
A
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
A
 
I
Y
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
V
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
K
L
 
F
S
 
M
E
 
-
G
 
G
R
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
D
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
L
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
R
A
 
M
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
x
I
L
 
I
P
 
S
G
 
P
D
 
E
H
 
-
P
 
-
V
 
V
W
 
S
R
 
A
D
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
P
 
Q
M
 
L
K
 
P
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
S
 
L
A
 
C
D
 
D
A
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
V
 
L
P
 
P
A
 
S
T
|
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
R
 
A
G
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
P
G
 
R
A
 
D
G
 
R
G
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
A
 
E
P
 
-
N
 
N
L
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
x
G
G
 
A
V
 
S
S
 
T
F
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
V
 
S
R
 
R
V
 
C
S
 
G
M
 
E
M
 
E
I
 
I
A
 
A

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
37% identity, 91% coverage: 18:300/311 of query aligns to 11:296/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
L
 
L
D
 
D
A
 
P
C
|
C
V
 
C
R
 
R
L
x
K
R
x
I
Y
 
L
E
 
Q
P
 
D
G
 
G
W
 
G
V
 
L
D
 
Q
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
N
-
 
L
Q
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
Q
 
D
T
 
C
D
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
V
 
V
D
 
T
T
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
K
 
E
S
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
P
 
N
A
 
T
T
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
V
 
C
T
 
G
T
 
M
A
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
A
 
I
Y
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
V
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
K
L
 
F
S
 
M
E
 
-
G
 
G
R
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
|
G
F
 
L
G
 
G
D
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
L
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
R
A
 
M
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
x
I
L
 
I
P
 
S
G
 
P
D
 
E
H
 
-
P
 
-
V
 
V
W
 
S
R
 
A
D
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
P
 
Q
M
 
L
K
 
P
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
S
 
L
A
 
C
D
 
D
A
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
V
 
L
P
 
P
A
 
S
T
|
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
R
 
A
G
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
P
G
 
R
A
 
D
G
 
R
G
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
A
 
E
P
 
-
N
 
N
L
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
x
G
G
 
A
V
 
S
S
 
T
F
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
V
 
S
R
 
R
V
 
C
S
 
G
M
x
E
M
 
E
I
 
I
A
 
A

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
37% identity, 91% coverage: 18:300/311 of query aligns to 10:295/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
L
 
L
D
 
D
A
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
L
 
K
R
 
I
Y
 
L
E
 
Q
P
 
D
G
 
G
W
 
G
V
 
L
D
 
Q
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
N
-
 
L
Q
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
Q
 
D
T
 
C
D
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
V
 
V
D
 
T
T
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
K
 
E
S
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
P
 
N
A
 
T
T
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
V
 
C
T
 
G
T
 
M
A
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
A
 
I
Y
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
V
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
K
L
 
F
S
 
M
E
 
-
G
 
G
R
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
D
x
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
R
A
 
M
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
H
 
Y
D
|
D
P
|
P
A
x
I
L
x
I
P
 
S
G
 
P
D
 
E
H
 
-
P
 
-
V
 
V
W
 
S
R
 
A
D
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
P
 
Q
M
 
L
K
 
P
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
S
 
L
A
 
C
D
 
D
A
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
 
P
L
 
L
V
x
L
P
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
R
 
A
G
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
P
G
 
R
A
 
D
G
 
R
G
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
A
 
E
P
 
-
N
 
N
L
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
V
 
S
S
 
T
F
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
V
 
S
R
 
R
V
 
C
S
 
G
M
 
E
M
 
E
I
 
I
A
 
A

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
37% identity, 91% coverage: 18:300/311 of query aligns to 11:296/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
L
 
L
D
 
D
A
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
L
 
K
R
 
I
Y
 
L
E
 
Q
P
 
D
G
 
G
W
 
G
V
 
L
D
 
Q
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
N
-
 
L
Q
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
Q
 
D
T
 
C
D
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
V
 
V
D
 
T
T
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
K
 
E
S
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
P
 
N
A
 
T
T
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
V
 
C
T
 
G
T
 
M
A
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
A
 
I
Y
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
V
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
K
L
 
F
S
 
M
E
 
-
G
 
G
R
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
D
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
R
A
 
M
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
 
I
L
 
I
P
 
S
G
 
P
D
 
E
H
 
-
P
 
-
V
 
V
W
 
S
R
 
A
D
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
P
 
Q
M
 
L
K
 
P
L
|
L
E
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
S
 
L
A
 
C
D
 
D
A
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
V
 
L
P
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
R
 
A
G
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
P
G
 
R
A
 
D
G
 
R
G
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
A
 
E
P
 
-
N
 
N
L
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
V
 
S
S
 
T
F
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
V
 
S
R
 
R
V
 
C
S
 
G
M
 
E
M
 
E
I
 
I
A
 
A

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
37% identity, 91% coverage: 18:300/311 of query aligns to 10:295/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
L
 
L
D
 
D
A
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
L
 
K
R
 
I
Y
 
L
E
 
Q
P
 
D
G
 
G
W
 
G
V
 
L
D
 
Q
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
N
-
 
L
Q
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
Q
 
D
T
 
C
D
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
V
 
V
D
 
T
T
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
K
 
E
S
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
P
 
N
A
 
T
T
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
V
 
C
T
 
G
T
 
M
A
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
A
 
I
Y
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
V
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
K
L
 
F
S
 
M
E
 
-
G
 
G
R
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
x
L
G
|
G
F
x
L
G
|
G
D
x
R
I
|
I
G
|
G
R
 
R
L
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
R
A
 
M
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
H
 
Y
D
|
D
P
 
P
A
 
I
L
 
I
P
 
S
G
 
P
D
 
E
H
 
-
P
 
-
V
 
V
W
 
S
R
 
A
D
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
P
 
Q
M
 
L
K
 
P
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
S
 
L
A
 
C
D
 
D
A
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
V
 
L
P
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
R
 
A
G
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
P
G
 
R
A
 
D
G
 
R
G
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
A
 
E
P
 
-
N
 
N
L
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
V
 
S
S
 
T
F
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
V
 
S
R
 
R
V
 
C
S
 
G
M
 
E
M
 
E
I
 
I
A
 
A

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
37% identity, 91% coverage: 18:300/311 of query aligns to 7:292/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
L
 
L
D
 
D
A
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
L
 
K
R
 
I
Y
 
L
E
 
Q
P
 
D
G
 
G
W
 
G
V
 
L
D
 
Q
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
N
-
 
L
Q
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
Q
 
D
T
 
C
D
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
V
 
V
D
 
T
T
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
K
 
E
S
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
P
 
N
A
 
T
T
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
V
 
C
T
 
G
T
 
M
A
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
A
 
I
Y
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
V
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
K
L
 
F
S
 
M
E
 
-
G
 
G
R
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
D
 
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
L
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
R
A
 
M
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
x
I
L
x
I
P
 
S
G
 
P
D
 
E
H
 
-
P
 
-
V
 
V
W
 
S
R
 
A
D
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
P
 
Q
M
 
L
K
 
P
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
S
 
L
A
 
C
D
 
D
A
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
 
P
L
 
L
V
 
L
P
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
R
 
A
G
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
P
G
 
R
A
 
D
G
 
R
G
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
A
 
E
P
 
-
N
 
N
L
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
V
 
S
S
 
T
F
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
V
 
S
R
 
R
V
 
C
S
 
G
M
 
E
M
 
E
I
 
I
A
 
A

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
37% identity, 91% coverage: 18:300/311 of query aligns to 10:295/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
L
 
L
D
 
D
A
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
L
 
K
R
 
I
Y
 
L
E
 
Q
P
 
D
G
 
G
W
 
G
V
 
L
D
 
Q
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
N
-
 
L
Q
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
Q
 
D
T
 
C
D
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
V
 
V
D
 
T
T
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
K
 
E
S
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
P
 
N
A
 
T
T
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
V
 
C
T
 
G
T
 
M
A
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
A
 
I
Y
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
V
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
K
L
 
F
S
 
M
E
 
-
G
 
G
R
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
D
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
R
A
 
M
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
x
I
L
x
I
P
 
S
G
 
P
D
 
E
H
 
-
P
 
-
V
 
V
W
 
S
R
 
A
D
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
P
 
Q
M
 
L
K
 
P
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
S
 
L
A
 
C
D
 
D
A
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
V
 
L
P
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
R
 
A
G
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
P
G
 
R
A
 
D
G
 
R
G
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
A
 
E
P
 
-
N
 
N
L
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
V
 
S
S
 
T
F
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
V
 
S
R
 
R
V
 
C
S
 
G
M
 
E
M
 
E
I
 
I
A
 
A

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
37% identity, 91% coverage: 18:300/311 of query aligns to 9:294/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
L
 
L
D
 
D
A
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
L
 
K
R
 
I
Y
 
L
E
 
Q
P
 
D
G
 
G
W
 
G
V
 
L
D
 
Q
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
N
-
 
L
Q
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
Q
 
D
T
 
C
D
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
V
 
V
D
 
T
T
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
K
 
E
S
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
P
 
N
A
 
T
T
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
V
 
C
T
 
G
T
 
M
A
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
A
 
I
Y
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
V
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
K
L
 
F
S
 
M
E
 
-
G
 
G
R
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
x
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
D
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
R
A
 
M
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
x
I
L
x
I
P
 
S
G
 
P
D
 
E
H
 
-
P
 
-
V
 
V
W
 
S
R
 
A
D
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
P
 
Q
M
 
L
K
 
P
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
S
 
L
A
 
C
D
 
D
A
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
V
 
L
P
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
R
 
A
G
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
P
G
 
R
A
 
D
G
 
R
G
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
A
 
E
P
 
-
N
 
N
L
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
V
 
S
S
 
T
F
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
V
 
S
R
 
R
V
 
C
S
 
G
M
 
E
M
 
E
I
 
I
A
 
A

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
37% identity, 91% coverage: 18:300/311 of query aligns to 10:295/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
L
 
L
D
 
D
A
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
L
 
K
R
 
I
Y
 
L
E
 
Q
P
 
D
G
 
G
W
 
G
V
 
L
D
 
Q
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
N
-
 
L
Q
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
Q
 
D
T
 
C
D
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
V
 
V
D
 
T
T
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
K
 
E
S
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
P
 
N
A
 
T
T
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
V
 
C
T
 
G
T
 
M
A
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
A
 
I
Y
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
V
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
K
L
 
F
S
 
M
E
 
-
G
 
G
R
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
x
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
D
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
R
A
 
M
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
 
I
L
x
I
P
 
S
G
 
P
D
 
E
H
 
-
P
 
-
V
 
V
W
 
S
R
 
A
D
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
P
 
Q
M
 
L
K
 
P
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
S
 
L
A
 
C
D
 
D
A
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
V
 
L
P
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
R
 
A
G
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
P
G
 
R
A
 
D
G
 
R
G
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
A
 
E
P
 
-
N
 
N
L
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
V
 
S
S
 
T
F
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
V
 
S
R
 
R
V
 
C
S
 
G
M
 
E
M
 
E
I
 
I
A
 
A

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
37% identity, 91% coverage: 18:300/311 of query aligns to 15:300/533 of O43175

query
sites
O43175
L
 
L
D
 
D
A
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
L
 
K
R
 
I
Y
 
L
E
 
Q
P
 
D
G
 
G
W
 
G
V
 
L
D
 
Q
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
N
-
 
L
Q
 
S
R
 
K
D
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
Q
 
D
T
 
C
D
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
R
 
A
T
 
T
Q
 
K
V
 
V
D
 
T
T
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
K
 
E
S
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
P
 
N
A
 
T
T
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
V
 
C
T
 
G
T
 
M
A
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
A
 
I
Y
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
V
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
P
 
E
R
|
R
A
 
K
R
 
K
L
 
F
S
 
M
E
 
-
G
 
G
R
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
D
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
L
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
R
A
 
M
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
H
 
Y
D
|
D
P
 
P
A
 
I
L
 
I
P
 
S
G
 
P
D
 
E
H
 
-
P
 
-
V
 
V
W
 
S
R
 
A
D
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
P
 
Q
M
 
L
K
 
P
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
S
 
L
A
 
C
D
 
D
A
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
 
P
L
 
L
V
 
L
P
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
R
 
A
G
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
E
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
P
G
 
R
A
 
D
G
 
R
G
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
A
 
E
P
 
-
N
 
N
L
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
x
L
A
x
G
G
x
A
V
 
S
S
 
T
F
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
V
 
S
R
 
R
V
 
C
S
 
G
M
 
E
M
 
E
I
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
37% identity, 91% coverage: 18:300/311 of query aligns to 9:286/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
L
 
L
D
 
D
A
 
P
C
 
C
V
 
C
R
 
R
L
 
K
R
 
I
Y
 
L
E
 
Q
P
 
D
G
 
G
W
 
G
-
 
L
-
 
Q
-
 
V
V
 
V
D
 
E
Q
 
K
R
 
Q
D
 
N
A
 
L
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
Q
 
D
T
 
C
D
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
R
 
A
T
 
A
Q
 
D
V
 
V
D
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
K
 
E
S
 
A
C
 
A
E
 
T
A
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
L
V
 
V
I
 
M
P
 
N
A
 
T
T
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
V
 
C
T
 
G
T
 
M
A
 
I
L
 
M
M
 
C
L
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
A
 
I
Y
 
P
Q
 
Q
S
 
A
D
 
T
A
 
A
A
 
S
M
 
M
V
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
P
 
E
R
 
R
A
 
K
R
 
K
L
 
F
S
 
M
E
 
-
G
 
G
R
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
D
x
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
R
A
 
M
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
 
I
L
x
I
P
 
S
G
 
P
D
 
E
H
 
-
P
 
-
V
 
V
W
 
S
R
 
A
D
 
S
T
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
P
 
Q
M
 
L
K
 
P
L
|
L
E
 
E
A
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
S
 
L
A
 
C
D
 
D
A
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
V
 
L
P
 
P
A
x
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
E
 
N
R
 
T
L
 
F
R
 
A
G
 
Q
M
 
C
K
 
K
R
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
Q
E
 
S
G
 
G
L
 
Q
L
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
P
G
 
R
A
 
D
G
 
R
G
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
D
H
 
H
A
 
E
P
 
-
N
 
N
L
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
V
 
S
S
 
T
F
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
V
 
S
R
 
R
V
 
C
S
 
G
M
 
E
M
 
E
I
 
I
A
 
A

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
37% identity, 89% coverage: 34:311/311 of query aligns to 36:313/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
R
 
R
D
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
E
A
 
K
L
 
V
A
 
K
Q
 
D
T
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
T
R
x
M
N
x
L
R
 
S
T
 
E
Q
 
R
V
 
I
D
 
D
T
 
Q
E
 
E
L
 
V
L
 
F
D
 
E
A
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
A
R
 
N
L
x
Y
G
x
A
V
|
V
G
|
G
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
V
K
 
E
S
 
E
C
 
A
E
 
T
A
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
Y
V
 
V
I
 
T
P
 
N
A
 
T
T
 
P
G
 
D
A
 
V
N
x
L
A
 
T
R
 
N
S
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
Y
 
H
V
 
A
V
 
F
T
 
A
T
 
L
A
 
L
L
 
L
M
 
A
L
 
T
L
 
A
R
 
R
G
 
H
A
 
V
Y
 
V
Q
 
K
S
 
G
D
 
D
A
 
K
A
 
F
M
 
V
V
 
R
A
 
S
G
 
G
K
 
E
W
 
W
P
 
K
R
 
R
A
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
R
 
K
L
 
W
S
 
F
E
 
L
G
 
G
R
 
Y
E
 
E
A
 
L
L
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
|
F
G
|
G
D
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
L
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
R
A
 
A
Q
 
K
A
 
G
L
 
F
G
 
N
M
 
M
Q
 
R
V
 
I
V
 
L
A
 
Y
H
 
Y
D
x
S
P
x
R
A
 
T
L
 
R
P
 
K
G
 
S
D
 
Q
H
 
A
P
 
E
V
 
-
W
 
-
R
 
K
D
 
E
T
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
E
P
 
Y
M
 
R
K
 
P
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
K
S
 
E
A
 
S
D
 
D
A
 
F
V
 
V
S
 
I
L
 
L
H
x
A
V
|
V
P
|
P
L
 
L
V
 
T
P
 
K
A
 
E
T
|
T
R
 
M
H
 
Y
L
 
M
I
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
K
G
 
L
M
 
M
K
 
K
R
 
P
G
 
T
A
 
A
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
T
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
L
H
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
W
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
G
 
Y
A
 
N
G
 
E
G
 
E
I
 
L
L
 
F
A
 
S
H
 
-
A
 
L
P
 
D
N
 
N
L
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
G
 
S
V
 
A
S
 
T
F
 
F
E
 
E
A
 
A
N
 
R
V
 
E
R
 
A
V
 
M
S
 
A
M
 
E
M
 
L
I
 
V
A
 
A
D
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
R
N
 
N
A
 
L
L
 
I
G
 
A
V
 
F
Q
 
K
R
 
R

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
39% identity, 87% coverage: 34:305/311 of query aligns to 35:312/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
R
 
R
D
 
E
A
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
E
A
 
K
L
 
V
A
 
K
Q
 
D
T
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
T
R
 
M
N
 
L
R
 
S
T
 
E
Q
 
K
V
 
I
D
 
D
T
 
R
E
 
E
L
 
V
L
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
A
R
 
N
L
 
Y
G
 
A
V
|
V
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
I
K
 
E
S
 
E
C
 
A
E
 
T
A
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
Y
V
 
V
I
 
T
P
 
N
A
 
T
T
 
P
G
 
D
A
 
V
N
x
L
A
 
T
R
 
D
S
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
Y
 
L
V
 
A
V
 
W
T
 
A
T
 
L
A
 
L
L
 
L
M
 
A
L
 
A
L
 
A
R
 
R
G
 
H
A
 
V
Y
 
V
Q
 
K
S
 
G
D
 
D
A
 
K
A
 
F
M
 
V
V
 
R
A
 
S
G
 
G
K
 
E
W
 
W
P
 
K
R
 
R
-
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
A
 
P
R
 
K
L
 
M
S
 
F
E
 
L
G
 
G
R
 
Y
E
 
D
A
 
V
L
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
V
G
|
G
F
|
F
G
|
G
D
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
L
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
K
L
 
R
A
 
A
Q
 
K
A
 
G
L
 
F
G
 
G
M
 
M
Q
 
R
V
 
I
V
 
L
A
 
Y
H
 
-
D
 
-
P
 
T
A
|
A
L
x
R
P
x
S
G
 
R
D
x
K
H
 
P
P
 
E
V
 
A
W
 
E
R
 
K
D
 
E
T
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
E
P
 
F
M
 
K
K
 
P
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
R
S
 
E
A
 
S
D
 
D
A
 
F
V
 
V
S
 
V
L
 
L
H
 
A
V
|
V
P
|
P
L
 
L
V
 
T
P
 
K
A
x
E
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
M
I
 
I
N
 
N
A
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
R
G
 
L
M
 
M
K
 
K
R
 
P
G
 
T
A
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
T
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
L
H
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
W
L
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
G
 
Y
A
 
D
G
 
E
G
 
E
I
 
L
L
 
F
A
 
A
H
 
-
A
 
L
P
 
D
N
 
N
L
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
G
 
S
V
 
A
S
 
T
F
 
F
E
 
G
A
 
A
N
 
R
V
 
E
R
 
G
V
 
M
S
 
A
M
 
E
M
 
L
I
 
V
A
 
A
D
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
I
A
 
A
V
 
F
K
 
K
N
 
N

P87228 Putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
35% identity, 87% coverage: 34:303/311 of query aligns to 88:364/466 of P87228

query
sites
P87228
R
 
E
D
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
V
G
 
E
A
 
K
L
 
I
A
 
K
Q
 
G
T
 
V
D
 
H
A
 
A
L
 
I
I
 
G
V
 
I
R
 
R
N
 
S
R
 
K
T
 
T
Q
 
R
V
 
L
D
 
T
T
 
R
E
 
R
L
 
V
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
A
P
 
D
A
 
S
L
 
L
R
 
I
V
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
C
L
 
F
G
 
C
V
 
I
G
 
G
L
 
T
D
 
N
N
 
Q
I
 
V
D
 
D
V
 
L
K
 
D
S
 
F
C
 
A
E
 
A
A
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
A
V
 
V
I
 
F
P
 
N
A
 
S
T
 
P
G
 
Y
A
 
A
N
 
N
A
 
S
R
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
V
V
 
I
T
 
G
T
 
Y
A
 
I
L
 
I
M
 
S
L
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
A
 
V
Y
 
G
Q
 
D
S
 
R
D
 
S
A
 
L
A
 
E
M
 
L
V
 
H
A
 
R
G
 
G
K
 
E
W
 
W
P
 
-
R
 
-
A
 
N
R
 
K
L
 
V
S
 
S
E
 
S
G
 
G
-
 
C
R
 
W
E
 
E
A
 
I
L
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
D
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
S
L
 
Q
T
 
L
A
 
S
R
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
L
 
M
G
 
G
M
 
L
Q
 
H
V
 
V
V
 
V
A
 
Y
H
 
Y
D
 
D
-
 
I
-
 
L
P
 
P
A
 
I
L
 
M
P
 
P
G
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
V
 
-
W
 
-
R
 
L
D
 
G
T
 
S
G
 
A
V
 
K
E
 
Q
P
 
L
M
 
S
K
 
S
L
 
L
E
 
P
A
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
H
S
 
R
A
 
A
D
 
D
A
 
F
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
H
V
 
V
P
 
P
L
 
A
V
x
S
P
 
P
A
 
E
T
 
T
R
 
K
H
 
N
L
 
M
I
 
I
N
 
S
A
 
S
E
 
K
R
 
E
L
 
F
R
 
A
G
 
A
M
 
M
K
 
K
R
 
E
G
 
G
A
 
S
V
 
Y
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
 
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
G
 
T
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
I
T
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
D
A
 
A
L
 
S
H
 
K
E
 
S
G
 
G
L
 
K
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
E
 
P
A
 
S
E
 
E
P
 
P
L
 
A
G
 
G
A
 
N
G
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
W
-
 
T
G
 
S
I
 
E
L
 
L
A
 
T
H
 
H
A
 
C
P
 
K
N
 
N
L
 
I
V
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
H
I
 
I
A
 
G
G
 
G
V
 
S
S
 
T
F
 
E
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
V
 
Y
R
 
N
V
 
I
S
 
G
M
 
I
M
 
E
I
 
V
A
 
S
D
 
E
A
 
A
V
 
L

Sites not aligning to the query:

8atiA Human ctbp2(31-364) in complex with rai2 peptide(315-322)
40% identity, 80% coverage: 58:307/311 of query aligns to 58:313/330 of 8atiA

query
sites
8atiA
E
 
E
L
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
K
A
 
F
P
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
V
R
 
R
L
 
I
G
 
G
V
x
S
G
 
G
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
A
C
 
A
E
 
G
A
 
E
R
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
A
V
 
V
I
 
C
P
 
N
A
 
I
T
 
P
G
 
S
A
 
A
N
 
A
A
 
V
R
 
E
S
 
E
V
x
T
A
 
A
E
 
D
Y
 
S
V
 
T
V
 
I
T
 
C
T
 
H
A
 
I
L
 
L
M
 
N
L
 
L
L
 
Y
R
 
R
G
 
R
A
 
N
Y
 
T
Q
 
W
S
 
L
D
 
Y
A
 
Q
A
 
A
M
 
L
V
 
R
A
 
E
G
 
G
K
 
T
W
 
R
P
 
V
R
 
Q
A
 
S
R
 
-
L
 
V
S
 
E
E
 
Q
G
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
V
L
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
I
-
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
|
G
F
 
F
G
|
G
D
x
R
I
x
T
G
 
G
R
 
Q
L
 
A
T
 
V
A
 
A
R
 
V
L
 
R
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
F
Q
 
S
V
 
V
V
 
I
A
 
F
H
 
Y
D
|
D
P
|
P
A
x
Y
L
 
L
P
 
Q
G
 
D
D
 
G
H
 
-
P
 
-
V
 
I
W
 
E
R
 
R
D
 
S
T
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
P
 
R
M
 
V
-
 
Y
K
 
T
L
 
L
E
 
Q
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
Y
S
 
Q
A
 
S
D
 
D
A
 
C
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
V
x
C
P
x
N
L
 
L
V
 
N
P
 
E
A
 
H
T
 
N
R
 
H
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
D
E
 
F
R
 
T
L
 
I
R
 
K
G
 
Q
M
 
M
K
 
R
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
V
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
H
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
R
L
 
I
A
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
H
E
 
E
A
 
S
E
 
E
P
 
P
L
 
F
G
 
S
-
 
F
A
 
A
G
 
Q
G
 
G
I
 
P
L
 
L
A
 
K
H
 
D
A
 
A
P
 
P
N
 
N
L
 
L
V
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
T
A
|
A
G
x
W
V
 
Y
S
 
S
F
 
E
E
 
Q
A
 
A
N
 
S
V
 
L
R
 
E
V
 
M
S
 
R
M
 
E
M
 
A
I
 
A
A
 
A
D
 
T
A
 
E
V
 
I
K
 
R
N
 
R
A
 
A
L
 
I

Sites not aligning to the query:

4lcjA Ctbp2 in complex with substrate mtob (see paper)
40% identity, 80% coverage: 58:307/311 of query aligns to 58:313/330 of 4lcjA

query
sites
4lcjA
E
 
E
L
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
K
A
 
F
P
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
V
R
 
R
L
x
I
G
|
G
V
x
S
G
|
G
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
A
C
 
A
E
 
G
A
 
E
R
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
A
V
 
V
I
 
C
P
 
N
A
 
I
T
 
P
G
 
S
A
 
A
N
x
A
A
 
V
R
 
E
S
 
E
V
x
T
A
 
A
E
 
D
Y
 
S
V
 
T
V
 
I
T
 
C
T
 
H
A
 
I
L
 
L
M
 
N
L
 
L
L
 
Y
R
 
R
G
 
R
A
 
N
Y
 
T
Q
 
W
S
 
L
D
 
Y
A
 
Q
A
 
A
M
 
L
V
 
R
A
 
E
G
 
G
K
 
T
W
 
R
P
 
V
R
 
Q
A
 
S
R
 
-
L
 
V
S
 
E
E
 
Q
G
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
V
L
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
I
-
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
|
I
G
|
G
F
 
F
G
|
G
D
x
R
I
x
T
G
 
G
R
 
Q
L
 
A
T
 
V
A
 
A
R
 
V
L
 
R
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
F
Q
 
S
V
 
V
V
 
I
A
 
F
H
 
Y
D
|
D
P
 
P
A
x
Y
L
 
L
P
 
Q
G
 
D
D
 
G
H
 
-
P
 
-
V
 
I
W
 
E
R
 
R
D
 
S
T
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
P
 
R
M
 
V
-
 
Y
K
 
T
L
 
L
E
 
Q
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
Y
S
 
Q
A
 
S
D
 
D
A
 
C
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
V
x
C
P
x
N
L
 
L
V
x
N
P
 
E
A
 
H
T
x
N
R
 
H
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
D
E
 
F
R
 
T
L
 
I
R
 
K
G
 
Q
M
 
M
K
 
R
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
V
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
A
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
H
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
R
L
 
I
A
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
H
E
 
E
A
 
S
E
|
E
P
 
P
L
 
F
G
 
S
-
 
F
A
 
A
G
 
Q
G
 
G
I
 
P
L
 
L
A
 
K
H
 
D
A
 
A
P
 
P
N
 
N
L
 
L
V
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
T
A
 
A
G
x
W
V
 
Y
S
 
S
F
 
E
E
 
Q
A
 
A
N
 
S
V
 
L
R
 
E
V
 
M
S
 
R
M
 
E
M
 
A
I
 
A
A
 
A
D
 
T
A
 
E
V
 
I
K
 
R
N
 
R
A
 
A
L
 
I

Sites not aligning to the query:

6v89A Human ctbp1 (28-375) in complex with amp (see paper)
39% identity, 80% coverage: 58:307/311 of query aligns to 59:314/332 of 6v89A

query
sites
6v89A
E
 
E
L
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
K
A
 
F
P
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
I
V
 
I
G
 
V
R
 
R
L
 
I
G
 
G
V
 
S
G
 
G
L
 
F
D
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
D
V
 
I
K
 
K
S
 
S
C
 
A
E
 
G
A
 
D
R
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
A
V
 
V
I
 
C
P
 
N
A
 
V
T
 
P
G
 
A
A
 
A
N
 
S
A
 
V
R
 
E
S
 
E
V
 
T
A
 
A
E
 
D
Y
 
S
V
 
T
V
 
L
T
 
C
T
 
H
A
 
I
L
 
L
M
 
N
L
 
L
L
 
Y
R
 
R
G
 
R
A
 
A
Y
 
T
Q
 
W
S
 
L
D
 
H
A
 
Q
A
 
A
M
 
L
V
 
R
A
 
E
G
 
G
K
 
T
W
 
R
P
 
V
R
 
Q
A
 
S
R
 
-
L
 
V
S
 
E
E
 
Q
G
 
I
R
 
R
E
 
E
A
 
V
L
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
I
-
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
|
G
F
 
L
G
|
G
D
x
R
I
 
V
G
 
G
R
 
Q
L
 
A
T
 
V
A
 
A
R
 
L
L
 
R
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
F
Q
 
N
V
 
V
V
 
L
A
 
F
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
A
x
Y
L
 
L
P
 
S
G
 
D
D
 
G
H
 
-
P
 
-
V
 
V
W
 
E
R
 
R
D
 
A
T
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
P
 
R
M
 
V
K
 
S
-
 
T
L
 
L
E
 
Q
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
F
S
 
H
A
 
S
D
 
D
A
 
C
V
 
V
S
 
T
L
 
L
H
 
H
V
x
C
P
 
G
L
 
L
V
 
N
P
 
E
A
 
H
T
x
N
R
 
H
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
D
E
 
F
R
 
T
L
 
V
R
 
K
G
 
Q
M
 
M
K
 
R
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
V
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
H
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
R
L
 
I
A
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
H
E
 
E
A
 
S
E
 
E
P
 
P
L
 
F
G
 
S
-
 
F
A
 
S
G
 
Q
G
 
G
I
 
P
L
 
L
A
 
K
H
 
D
A
 
A
P
 
P
N
 
N
L
 
L
V
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
H
 
H
I
 
A
A
 
A
G
 
W
V
 
Y
S
 
S
F
 
E
E
 
Q
A
 
A
N
 
S
V
 
I
R
 
E
V
 
M
S
 
R
M
 
E
M
 
E
I
 
A
A
 
A
D
 
R
A
 
E
V
 
I
K
 
R
N
 
R
A
 
A
L
 
I

Query Sequence

>RR42_RS02235 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS02235
MKQVCISEFMDADAVAVLDACVRLRYEPGWVDQRDALLGALAQTDALIVRNRTQVDTELL
DAAPALRVVGRLGVGLDNIDVKSCEARGIRVIPATGANARSVAEYVVTTALMLLRGAYQS
DAAMVAGKWPRARLSEGREALGKTLGLIGFGDIGRLTARLAQALGMQVVAHDPALPGDHP
VWRDTGVEPMKLEALLASADAVSLHVPLVPATRHLINAERLRGMKRGAVLVNTARGGVVD
ETALAAALHEGLLAGAALDVFEAEPLGAGGILAHAPNLVLTPHIAGVSFEANVRVSMMIA
DAVKNALGVQR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory