SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS27870 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS27870 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P9WNH5 4,5:9,10-diseco-3-hydroxy-5,9,17-trioxoandrosta-1(10),2-diene-4-oate hydrolase; 2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase; HOPDA hydrolase; Meta-cleavage product hydrolase; MCP hydrolase; EC 3.7.1.17; EC 3.7.1.8 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
31% identity, 89% coverage: 25:285/294 of query aligns to 24:289/291 of P9WNH5

query
sites
P9WNH5
I
 
L
R
 
K
T
 
L
R
 
H
Y
 
Y
L
 
H
H
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
V
S
 
G
G
 
N
K
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
L
H
 
H
G
 
G
V
 
G
G
 
G
G
 
P
H
 
G
A
 
A
E
 
A
A
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
N
Y
 
F
V
 
S
R
 
R
N
 
N
L
 
I
Q
 
A
S
 
V
H
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
H
V
 
V
W
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
Q
I
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
W
 
H
T
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
A
 
A
G
 
E
G
 
H
R
 
G
E
 
Q
I
 
F
S
 
N
D
 
R
Y
 
Y
V
 
A
D
 
A
H
 
M
V
 
A
I
 
L
R
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
F
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
P
F
 
L
S
 
V
G
 
G
E
 
N
S
|
S
L
 
L
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
F
A
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
V
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
L
Q
 
S
A
 
I
D
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
A
P
 
P
V
 
D
V
 
P
M
 
T
E
 
E
R
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
R
L
 
L
S
 
S
M
 
K
R
 
F
A
 
S
V
 
V
E
 
A
E
 
-
P
 
P
G
 
T
W
 
R
D
 
E
F
 
N
I
 
L
K
 
E
A
 
A
R
 
F
V
 
L
Q
 
R
W
 
V
L
 
M
M
 
V
A
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
N
K
 
L
A
 
I
F
 
T
D
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
D
T
 
Q
R
 
R
Q
 
F
A
 
A
I
 
L
Y
 
A
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
G
 
E
M
 
S
V
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
G
 
A
-
 
M
-
 
G
-
 
K
N
 
S
M
 
F
V
 
A
L
 
G
Q
 
A
D
 
D
M
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
G
I
 
M
L
 
M
R
 
W
A
 
R
E
 
E
H
 
V
Y
 
Y
G
 
-
R
 
R
I
 
L
K
 
R
A
 
Q
P
 
P
T
 
V
L
 
L
V
 
L
L
 
I
W
 
W
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
 
D
P
 
R
T
 
V
A
 
N
D
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
G
G
 
A
R
 
L
R
 
V
I
 
A
A
 
L
T
 
K
M
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
Q
C
 
C
G
 
G
H
 
H
W
 
W
P
 
V
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
F
D
 
D
T
 
E
F
 
F
N
 
N
R
 
K
I
 
L
H
 
T
L
 
I
N
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
G
G
 
G

7zm4A Crystal structure of hsad from mycobacterium tuberculosis in complex with cyclipostin-like inhibitor cyc31 (see paper)
31% identity, 89% coverage: 25:285/294 of query aligns to 18:283/284 of 7zm4A

query
sites
7zm4A
I
 
L
R
 
K
T
 
L
R
 
H
Y
 
Y
L
 
H
H
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
V
S
 
G
G
 
N
K
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
L
H
 
H
G
|
G
V
x
G
G
 
G
G
 
P
H
 
G
A
 
A
E
 
A
A
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
N
Y
 
F
V
 
S
R
 
R
N
 
N
L
 
I
Q
 
A
S
 
V
H
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
H
V
 
V
W
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
Q
I
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
W
 
H
T
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
A
 
A
G
 
E
G
 
H
R
 
G
E
 
Q
I
 
F
S
 
N
D
 
R
Y
 
Y
V
 
A
D
 
A
H
 
M
V
 
A
I
 
L
R
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
F
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
P
F
 
L
S
 
V
G
 
G
E
 
N
S
|
S
L
|
L
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
F
A
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
V
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
L
Q
 
S
A
 
I
D
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
A
P
 
P
V
 
D
V
 
P
M
 
T
E
 
E
R
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
R
L
 
L
S
 
S
M
 
K
R
 
F
A
x
S
V
 
V
E
 
A
E
 
-
P
 
P
G
 
T
W
 
R
D
 
E
F
 
N
I
 
L
K
 
E
A
 
A
R
 
F
V
 
L
Q
 
R
W
 
V
L
 
M
M
 
V
A
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
N
K
 
L
A
 
I
F
 
T
D
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
D
T
 
Q
R
 
R
Q
 
F
A
 
A
I
 
L
Y
 
A
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
G
 
E
M
 
S
V
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
G
 
A
-
 
M
-
 
G
-
 
K
N
 
S
M
 
F
V
 
A
L
 
G
Q
 
A
D
 
D
M
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
G
I
 
M
L
 
M
R
 
W
A
 
R
E
 
E
H
 
V
Y
 
Y
G
 
-
R
 
R
I
 
L
K
 
R
A
 
Q
P
 
P
T
 
V
L
 
L
V
 
L
L
 
I
W
 
W
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
 
D
P
 
R
T
 
V
A
 
N
D
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
G
G
 
A
R
 
L
R
 
V
I
 
A
A
 
L
T
 
K
M
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
Q
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
 
W
P
 
V
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
F
D
 
D
T
 
E
F
 
F
N
 
N
R
 
K
I
 
L
H
 
T
L
 
I
N
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
G
G
 
G

7zm3A Crystal structure of hsad from mycobacterium tuberculosis in complex with cyclipostin-like inhibitor cyc17 (see paper)
31% identity, 89% coverage: 25:285/294 of query aligns to 18:283/284 of 7zm3A

query
sites
7zm3A
I
 
L
R
 
K
T
 
L
R
 
H
Y
 
Y
L
 
H
H
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
V
S
 
G
G
 
N
K
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
L
H
 
H
G
 
G
V
x
G
G
 
G
G
 
P
H
 
G
A
 
A
E
 
A
A
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
N
Y
 
F
V
 
S
R
 
R
N
 
N
L
 
I
Q
 
A
S
 
V
H
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
H
V
 
V
W
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
Q
I
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
W
 
H
T
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
A
 
A
G
 
E
G
 
H
R
 
G
E
 
Q
I
 
F
S
 
N
D
 
R
Y
 
Y
V
 
A
D
 
A
H
 
M
V
 
A
I
 
L
R
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
F
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
P
F
 
L
S
 
V
G
 
G
E
 
N
S
|
S
L
|
L
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
F
A
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
V
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
L
Q
 
S
A
 
I
D
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
A
P
 
P
V
 
D
V
 
P
M
 
T
E
 
E
R
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
R
L
 
L
S
 
S
M
 
K
R
 
F
A
 
S
V
 
V
E
 
A
E
 
-
P
 
P
G
 
T
W
 
R
D
 
E
F
 
N
I
 
L
K
 
E
A
 
A
R
 
F
V
 
L
Q
 
R
W
 
V
L
 
M
M
 
V
A
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
N
K
 
L
A
 
I
F
 
T
D
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
D
T
 
Q
R
 
R
Q
 
F
A
 
A
I
 
L
Y
 
A
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
G
 
E
M
 
S
V
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
G
 
A
-
 
M
-
 
G
-
 
K
N
 
S
M
 
F
V
 
A
L
 
G
Q
 
A
D
 
D
M
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
G
I
 
M
L
 
M
R
 
W
A
 
R
E
 
E
H
 
V
Y
 
Y
G
 
-
R
 
R
I
 
L
K
 
R
A
 
Q
P
 
P
T
 
V
L
 
L
V
 
L
L
 
I
W
 
W
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
 
D
P
 
R
T
 
V
A
 
N
D
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
G
G
 
A
R
 
L
R
 
V
I
 
A
A
 
L
T
 
K
M
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
Q
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
 
W
P
 
V
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
F
D
 
D
T
 
E
F
 
F
N
 
N
R
 
K
I
 
L
H
 
T
L
 
I
N
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
G
G
 
G

7zm2A Crystal structure of hsad from mycobacterium tuberculosis in complex with cyclophostin-like inhibitor cyc8b (see paper)
31% identity, 89% coverage: 25:285/294 of query aligns to 18:283/284 of 7zm2A

query
sites
7zm2A
I
 
L
R
 
K
T
 
L
R
 
H
Y
 
Y
L
 
H
H
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
V
S
 
G
G
 
N
K
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
L
H
 
H
G
 
G
V
x
G
G
 
G
G
 
P
H
 
G
A
 
A
E
 
A
A
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
N
Y
 
F
V
 
S
R
 
R
N
 
N
L
 
I
Q
 
A
S
 
V
H
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
H
V
 
V
W
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
Q
I
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
W
 
H
T
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
A
 
A
G
 
E
G
 
H
R
 
G
E
 
Q
I
 
F
S
 
N
D
 
R
Y
 
Y
V
 
A
D
 
A
H
 
M
V
 
A
I
 
L
R
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
F
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
P
F
 
L
S
 
V
G
 
G
E
 
N
S
|
S
L
|
L
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
F
A
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
V
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
L
Q
 
S
A
 
I
D
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
A
P
 
P
V
 
D
V
 
P
M
 
T
E
 
E
R
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
R
L
 
L
S
 
S
M
 
K
R
 
F
A
 
S
V
 
V
E
 
A
E
 
-
P
 
P
G
 
T
W
 
R
D
 
E
F
 
N
I
 
L
K
 
E
A
 
A
R
 
F
V
 
L
Q
 
R
W
 
V
L
 
M
M
 
V
A
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
N
K
 
L
A
 
I
F
 
T
D
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
D
T
 
Q
R
 
R
Q
 
F
A
 
A
I
 
L
Y
 
A
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
G
 
E
M
 
S
V
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
G
 
A
-
 
M
-
 
G
-
 
K
N
 
S
M
 
F
V
 
A
L
 
G
Q
 
A
D
 
D
M
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
G
I
 
M
L
 
M
R
 
W
A
 
R
E
 
E
H
 
V
Y
 
Y
G
 
-
R
 
R
I
 
L
K
 
R
A
 
Q
P
 
P
T
 
V
L
 
L
V
 
L
L
 
I
W
 
W
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
 
D
P
 
R
T
 
V
A
 
N
D
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
G
G
 
A
R
 
L
R
 
V
I
 
A
A
 
L
T
 
K
M
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
Q
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
 
W
P
 
V
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
F
D
 
D
T
 
E
F
 
F
N
 
N
R
 
K
I
 
L
H
 
T
L
 
I
N
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
G
G
 
G

7zm1A Crystal structure of hsad from mycobacterium tuberculosis in complex with cyclophostin-like inhibitor cyc7b (see paper)
31% identity, 89% coverage: 25:285/294 of query aligns to 18:283/284 of 7zm1A

query
sites
7zm1A
I
 
L
R
 
K
T
 
L
R
 
H
Y
 
Y
L
 
H
H
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
V
S
 
G
G
 
N
K
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
L
H
 
H
G
|
G
V
x
G
G
 
G
G
 
P
H
 
G
A
 
A
E
 
A
A
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
N
Y
 
F
V
 
S
R
 
R
N
 
N
L
 
I
Q
 
A
S
 
V
H
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
H
V
 
V
W
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
Q
I
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
W
 
H
T
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
A
 
A
G
 
E
G
 
H
R
 
G
E
 
Q
I
 
F
S
 
N
D
 
R
Y
 
Y
V
 
A
D
 
A
H
 
M
V
 
A
I
 
L
R
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
F
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
P
F
 
L
S
 
V
G
 
G
E
 
N
S
|
S
L
|
L
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
F
A
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
V
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
 
G
A
 
P
G
|
G
G
 
G
S
 
L
Q
 
S
A
 
I
D
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
A
P
 
P
V
 
D
V
 
P
M
 
T
E
 
E
R
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
R
L
 
L
S
 
S
M
 
K
R
 
F
A
x
S
V
 
V
E
 
A
E
 
-
P
 
P
G
 
T
W
 
R
D
 
E
F
 
N
I
 
L
K
 
E
A
 
A
R
 
F
V
 
L
Q
 
R
W
 
V
L
 
M
M
 
V
A
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
N
K
 
L
A
 
I
F
 
T
D
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
D
T
 
Q
R
 
R
Q
 
F
A
 
A
I
 
L
Y
 
A
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
G
 
E
M
 
S
V
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
G
 
A
-
 
M
-
 
G
-
 
K
N
 
S
M
x
F
V
 
A
L
 
G
Q
 
A
D
 
D
M
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
G
I
 
M
L
 
M
R
 
W
A
 
R
E
 
E
H
 
V
Y
 
Y
G
 
-
R
 
R
I
 
L
K
 
R
A
 
Q
P
 
P
T
 
V
L
 
L
V
 
L
L
 
I
W
 
W
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
 
D
P
 
R
T
 
V
A
 
N
D
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
G
G
 
A
R
 
L
R
 
V
I
 
A
A
 
L
T
 
K
M
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
Q
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
 
W
P
 
V
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
F
D
 
D
T
 
E
F
 
F
N
 
N
R
 
K
I
 
L
H
 
T
L
 
I
N
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
G
G
 
G

5jzsB Hsad bound to 3,5-dichloro-4-hydroxybenzoic acid (see paper)
31% identity, 89% coverage: 25:285/294 of query aligns to 18:283/284 of 5jzsB

query
sites
5jzsB
I
 
L
R
 
K
T
 
L
R
 
H
Y
 
Y
L
 
H
H
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
V
S
 
G
G
 
N
K
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
L
H
 
H
G
 
G
V
x
G
G
|
G
G
 
P
H
x
G
A
 
A
E
 
A
A
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
N
Y
 
F
V
 
S
R
 
R
N
 
N
L
 
I
Q
 
A
S
 
V
H
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
H
V
 
V
W
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
Q
I
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
W
 
H
T
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
A
 
A
G
 
E
G
 
H
R
 
G
E
 
Q
I
 
F
S
 
N
D
 
R
Y
 
Y
V
 
A
D
 
A
H
 
M
V
 
A
I
 
L
R
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
F
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
P
F
 
L
S
 
V
G
 
G
E
x
N
S
|
S
L
|
L
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
F
A
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
V
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
L
Q
 
S
A
 
I
D
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
A
P
 
P
V
 
D
V
 
P
M
 
T
E
 
E
R
x
G
L
x
V
K
 
K
T
 
R
L
|
L
S
 
S
M
 
K
R
 
F
A
 
S
V
 
V
E
 
A
E
 
-
P
 
P
G
 
T
W
 
R
D
 
E
F
 
N
I
 
L
K
 
E
A
 
A
R
 
F
V
 
L
Q
 
R
W
 
V
L
 
M
M
 
V
A
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
N
K
 
L
A
 
I
F
 
T
D
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
D
T
 
Q
R
|
R
Q
 
F
A
 
A
I
 
L
Y
 
A
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
G
 
E
M
 
S
V
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
G
 
A
-
 
M
-
 
G
-
 
K
N
 
S
M
 
F
V
 
A
L
 
G
Q
 
A
D
 
D
M
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
G
I
 
M
L
 
M
R
 
W
A
 
R
E
 
E
H
 
V
Y
 
Y
G
 
-
R
 
R
I
 
L
K
 
R
A
 
Q
P
 
P
T
 
V
L
 
L
V
 
L
L
 
I
W
 
W
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
|
D
P
 
R
T
x
V
A
 
N
D
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
G
G
 
A
R
 
L
R
 
V
I
 
A
A
 
L
T
 
K
M
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
Q
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
|
W
P
 
V
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
F
D
 
D
T
 
E
F
 
F
N
 
N
R
 
K
I
 
L
H
 
T
L
 
I
N
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
G
G
 
G

5jz9A Crystal structure of hsad bound to 3,5-dichloro-4- hydroxybenzenesulphonic acid (see paper)
31% identity, 89% coverage: 25:285/294 of query aligns to 18:283/284 of 5jz9A

query
sites
5jz9A
I
 
L
R
 
K
T
 
L
R
 
H
Y
 
Y
L
 
H
H
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
V
S
 
G
G
 
N
K
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
L
H
 
H
G
|
G
V
x
G
G
|
G
G
 
P
H
x
G
A
 
A
E
 
A
A
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
N
Y
 
F
V
 
S
R
 
R
N
 
N
L
 
I
Q
 
A
S
 
V
H
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
H
V
 
V
W
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
Q
I
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
W
 
H
T
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
A
 
A
G
 
E
G
 
H
R
 
G
E
 
Q
I
 
F
S
 
N
D
 
R
Y
 
Y
V
 
A
D
 
A
H
 
M
V
 
A
I
 
L
R
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
F
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
P
F
 
L
S
 
V
G
 
G
E
x
N
S
|
S
L
|
L
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
F
A
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
V
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
L
Q
 
S
A
 
I
D
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
A
P
 
P
V
 
D
V
 
P
M
 
T
E
 
E
R
x
G
L
 
V
K
 
K
T
 
R
L
|
L
S
 
S
M
 
K
R
 
F
A
 
S
V
 
V
E
 
A
E
 
-
P
 
P
G
 
T
W
 
R
D
 
E
F
 
N
I
 
L
K
 
E
A
 
A
R
x
F
V
 
L
Q
 
R
W
 
V
L
x
M
M
 
V
A
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
N
K
 
L
A
 
I
F
 
T
D
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
D
T
 
Q
R
|
R
Q
 
F
A
 
A
I
 
L
Y
 
A
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
G
 
E
M
 
S
V
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
G
 
A
-
 
M
-
 
G
-
 
K
N
 
S
M
 
F
V
 
A
L
 
G
Q
 
A
D
 
D
M
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
G
I
 
M
L
 
M
R
 
W
A
 
R
E
 
E
H
 
V
Y
 
Y
G
 
-
R
 
R
I
 
L
K
 
R
A
 
Q
P
 
P
T
 
V
L
 
L
V
 
L
L
 
I
W
 
W
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
|
D
P
 
R
T
x
V
A
 
N
D
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
G
G
 
A
R
 
L
R
 
V
I
 
A
A
 
L
T
 
K
M
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
Q
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
|
W
P
 
V
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
F
D
 
D
T
 
E
F
 
F
N
 
N
R
 
K
I
 
L
H
 
T
L
 
I
N
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
G
G
 
G

5jzbA Crystal structure of hsad bound to 3,5-dichlorobenzene sulphonamide (see paper)
31% identity, 88% coverage: 25:283/294 of query aligns to 18:281/282 of 5jzbA

query
sites
5jzbA
I
 
L
R
 
K
T
 
L
R
 
H
Y
 
Y
L
 
H
H
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
V
S
 
G
G
 
N
K
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
L
H
 
H
G
 
G
V
x
G
G
|
G
G
 
P
H
x
G
A
 
A
E
 
A
A
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
N
Y
 
F
V
 
S
R
 
R
N
 
N
L
 
I
Q
 
A
S
 
V
H
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
H
V
 
V
W
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
Q
I
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
W
 
H
T
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
A
 
A
G
 
E
G
 
H
R
 
G
E
 
Q
I
 
F
S
 
N
D
 
R
Y
 
Y
V
 
A
D
 
A
H
 
M
V
 
A
I
 
L
R
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
F
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
P
F
 
L
S
 
V
G
 
G
E
x
N
S
|
S
L
|
L
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
F
A
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
V
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
 
G
A
 
P
G
|
G
G
 
G
S
 
L
Q
 
S
A
 
I
D
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
A
P
 
P
V
 
D
V
 
P
M
 
T
E
 
E
R
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
R
L
|
L
S
 
S
M
 
K
R
 
F
A
 
S
V
 
V
E
 
A
E
 
-
P
 
P
G
 
T
W
 
R
D
 
E
F
 
N
I
 
L
K
 
E
A
 
A
R
 
F
V
 
L
Q
 
R
W
 
V
L
 
M
M
 
V
A
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
N
K
 
L
A
 
I
F
 
T
D
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
D
T
 
Q
R
|
R
Q
 
F
A
 
A
I
 
L
Y
 
A
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
G
 
E
M
 
S
V
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
G
 
A
-
 
M
-
 
G
-
 
K
N
 
S
M
 
F
V
 
A
L
 
G
Q
 
A
D
 
D
M
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
G
I
 
M
L
 
M
R
 
W
A
 
R
E
 
E
H
 
V
Y
 
Y
G
 
-
R
 
R
I
 
L
K
 
R
A
 
Q
P
 
P
T
 
V
L
 
L
V
 
L
L
 
I
W
 
W
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
|
D
P
 
R
T
 
V
A
x
N
D
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
G
G
 
A
R
 
L
R
 
V
I
 
A
A
 
L
T
 
K
M
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
Q
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
|
W
P
 
V
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
F
D
 
D
T
 
E
F
 
F
N
 
N
R
 
K
I
 
L
H
 
T
L
 
I
N
 
E
F
 
F
L
 
L

2wugA Crystal structure of s114a mutant of hsad from mycobacterium tuberculosis in complex with hopda (see paper)
31% identity, 89% coverage: 25:285/294 of query aligns to 18:283/283 of 2wugA

query
sites
2wugA
I
 
L
R
 
K
T
 
L
R
 
H
Y
 
Y
L
 
H
H
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
V
S
 
G
G
 
N
K
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
L
H
 
H
G
|
G
V
x
G
G
|
G
G
 
P
H
x
G
A
 
A
E
 
A
A
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
N
Y
 
F
V
 
S
R
 
R
N
 
N
L
 
I
Q
 
A
S
 
V
H
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
H
V
 
V
W
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
Q
I
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
W
 
H
T
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
A
 
A
G
 
E
G
 
H
R
 
G
E
 
Q
I
 
F
S
 
N
D
 
R
Y
 
Y
V
 
A
D
 
A
H
 
M
V
 
A
I
 
L
R
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
F
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
P
F
 
L
S
 
V
G
 
G
E
x
N
S
x
A
L
|
L
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
F
A
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
V
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
L
Q
 
S
A
 
I
D
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
A
P
 
P
V
 
D
V
 
P
M
 
T
E
 
E
R
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
R
L
 
L
S
 
S
M
 
K
R
 
F
A
 
S
V
 
V
E
 
A
E
 
-
P
 
P
G
 
T
W
 
R
D
 
E
F
 
N
I
 
L
K
 
E
A
 
A
R
 
F
V
 
L
Q
 
R
W
 
V
L
 
M
M
 
V
A
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
N
K
 
L
A
 
I
F
 
T
D
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
D
T
 
Q
R
|
R
Q
 
F
A
 
A
I
 
L
Y
 
A
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
G
 
E
M
 
S
V
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
G
 
A
-
x
M
-
 
G
-
 
K
N
 
S
M
 
F
V
 
A
L
 
G
Q
 
A
D
 
D
M
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
G
I
 
M
L
 
M
R
 
W
A
 
R
E
 
E
H
 
V
Y
 
Y
G
 
-
R
 
R
I
 
L
K
 
R
A
 
Q
P
 
P
T
 
V
L
 
L
V
 
L
L
 
I
W
 
W
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
|
D
P
 
R
T
 
V
A
 
N
D
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
G
G
 
A
R
 
L
R
 
V
I
 
A
A
 
L
T
 
K
M
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
Q
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
|
W
P
 
V
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
F
D
 
D
T
 
E
F
 
F
N
 
N
R
 
K
I
 
L
H
 
T
L
 
I
N
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
G
G
 
G

2wufB Crystal structure of s114a mutant of hsad from mycobacterium tuberculosis in complex with 4,9dsha (see paper)
31% identity, 88% coverage: 25:283/294 of query aligns to 18:281/282 of 2wufB

query
sites
2wufB
I
 
L
R
 
K
T
 
L
R
 
H
Y
 
Y
L
 
H
H
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
V
S
 
G
G
 
N
K
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
L
H
 
H
G
|
G
V
x
G
G
|
G
G
 
P
H
x
G
A
 
A
E
 
A
A
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
N
Y
 
F
V
 
S
R
 
R
N
 
N
L
 
I
Q
 
A
S
 
V
H
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
H
V
 
V
W
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
Q
I
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
W
 
H
T
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
A
 
A
G
 
E
G
 
H
R
 
G
E
 
Q
I
 
F
S
 
N
D
 
R
Y
 
Y
V
 
A
D
 
A
H
 
M
V
 
A
I
 
L
R
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
F
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
P
F
 
L
S
 
V
G
 
G
E
x
N
S
x
A
L
|
L
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
F
A
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
V
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
L
Q
 
S
A
 
I
D
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
A
P
 
P
V
 
D
V
 
P
M
 
T
E
 
E
R
 
G
L
 
V
K
 
K
T
 
R
L
|
L
S
 
S
M
 
K
R
 
F
A
 
S
V
 
V
E
 
A
E
 
-
P
 
P
G
 
T
W
 
R
D
 
E
F
 
N
I
 
L
K
 
E
A
 
A
R
 
F
V
 
L
Q
 
R
W
 
V
L
 
M
M
 
V
A
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
N
K
 
L
A
 
I
F
 
T
D
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
D
T
 
Q
R
|
R
Q
 
F
A
 
A
I
 
L
Y
 
A
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
G
 
E
M
 
S
V
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
G
 
A
-
 
M
-
 
G
-
 
K
N
 
S
M
x
F
V
 
A
L
 
G
Q
 
A
D
 
D
M
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
G
I
 
M
L
 
M
R
 
W
A
 
R
E
 
E
H
 
V
Y
 
Y
G
 
-
R
 
R
I
 
L
K
 
R
A
 
Q
P
 
P
T
 
V
L
 
L
V
 
L
L
 
I
W
 
W
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
|
D
P
 
R
T
 
V
A
 
N
D
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
G
G
 
A
R
 
L
R
 
V
I
 
A
A
 
L
T
 
K
M
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
Q
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
|
W
P
 
V
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
F
D
 
D
T
 
E
F
 
F
N
 
N
R
 
K
I
 
L
H
 
T
L
 
I
N
 
E
F
 
F
L
 
L

2wueB Crystal structure of s114a mutant of hsad from mycobacterium tuberculosis in complex with hopoda (see paper)
31% identity, 88% coverage: 25:283/294 of query aligns to 18:281/282 of 2wueB

query
sites
2wueB
I
 
L
R
 
K
T
 
L
R
 
H
Y
 
Y
L
 
H
H
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
V
S
 
G
G
 
N
K
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
L
H
 
H
G
|
G
V
x
G
G
|
G
G
 
P
H
x
G
A
 
A
E
 
A
A
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
N
Y
 
F
V
 
S
R
 
R
N
 
N
L
 
I
Q
 
A
S
 
V
H
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
H
V
 
V
W
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
M
 
Q
I
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
W
 
H
T
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
A
 
A
G
 
E
G
 
H
R
 
G
E
 
Q
I
 
F
S
 
N
D
 
R
Y
 
Y
V
 
A
D
 
A
H
 
M
V
 
A
I
 
L
R
 
K
-
 
G
V
 
L
M
 
F
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
V
A
 
P
F
 
L
S
 
V
G
 
G
E
x
N
S
x
A
L
|
L
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
F
A
 
A
I
 
L
D
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
V
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
L
Q
 
S
A
 
I
D
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
A
P
 
P
V
 
D
V
 
P
M
 
T
E
 
E
R
 
G
L
x
V
K
 
K
T
 
R
L
|
L
S
 
S
M
 
K
R
 
F
A
 
S
V
 
V
E
 
A
E
 
-
P
 
P
G
 
T
W
 
R
D
 
E
F
 
N
I
 
L
K
 
E
A
 
A
R
 
F
V
 
L
Q
 
R
W
 
V
L
 
M
M
 
V
A
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
N
K
 
L
A
 
I
F
 
T
D
 
P
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
D
T
 
Q
R
|
R
Q
 
F
A
 
A
I
 
L
Y
 
A
A
 
S
Q
 
T
P
 
P
G
 
E
M
 
S
V
 
L
E
 
T
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
G
 
A
-
x
M
-
 
G
-
 
K
N
 
S
M
x
F
V
 
A
L
 
G
Q
 
A
D
 
D
M
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
N
 
G
I
 
M
L
 
M
R
 
W
A
 
R
E
 
E
H
 
V
Y
 
Y
G
 
-
R
 
R
I
 
L
K
 
R
A
 
Q
P
 
P
T
 
V
L
 
L
V
 
L
L
 
I
W
 
W
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
|
D
P
 
R
T
x
V
A
 
N
D
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
G
G
 
A
R
 
L
R
 
V
I
 
A
A
 
L
T
 
K
M
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
Q
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
|
W
P
 
V
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
D
 
K
A
 
F
D
 
D
T
 
E
F
 
F
N
 
N
R
 
K
I
 
L
H
 
T
L
 
I
N
 
E
F
 
F
L
 
L

2d0dA Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) a129v mutant (see paper)
31% identity, 89% coverage: 22:283/294 of query aligns to 10:268/271 of 2d0dA

query
sites
2d0dA
A
 
A
K
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
L
T
 
T
R
 
N
Y
 
Y
L
 
-
H
 
H
A
 
D
G
 
V
S
 
G
S
 
E
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
L
L
 
I
H
 
H
G
 
G
V
x
S
G
|
G
G
 
P
H
x
G
A
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
R
 
N
-
 
W
-
 
R
-
 
L
N
 
T
L
 
I
Q
 
P
S
 
A
H
 
L
A
 
S
E
 
K
H
 
F
F
 
Y
D
 
R
V
 
V
W
 
I
A
 
A
I
 
P
D
 
D
M
 
M
I
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
W
 
F
T
 
T
D
 
D
K
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
N
G
 
Y
R
 
N
E
 
Y
I
 
S
S
 
K
D
 
D
-
 
S
Y
 
W
V
 
V
D
 
D
H
 
H
V
 
I
I
 
I
R
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
T
 
A
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
H
F
 
I
S
 
V
G
 
G
E
x
N
S
|
S
L
x
F
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
I
R
 
A
L
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
R
H
 
Y
P
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
x
G
A
 
A
G
 
V
G
 
G
S
 
T
Q
 
R
A
 
F
D
 
D
P
 
-
V
 
-
V
 
-
M
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
V
T
 
T
L
 
E
S
 
G
M
 
L
R
 
N
A
 
A
V
|
V
-
 
W
-
 
G
E
 
Y
E
 
T
P
 
P
G
 
S
W
 
I
D
 
E
F
 
N
I
 
M
K
 
R
A
 
N
R
 
L
V
 
L
Q
 
D
W
 
I
L
 
F
M
 
A
A
 
Y
D
 
D
K
 
R
A
 
S
K
 
L
A
 
V
F
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
L
I
 
A
A
 
R
T
 
L
R
|
R
Q
 
Y
A
 
E
I
 
A
Y
 
S
A
 
I
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
M
 
F
V
 
Q
E
 
E
A
 
S
Q
x
F
R
 
S
G
 
S
N
 
M
M
 
F
V
 
P
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
M
 
-
E
 
E
T
 
P
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
N
 
W
I
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
A
L
 
S
R
 
S
A
 
D
E
 
E
H
 
D
Y
 
I
G
 
K
R
 
T
I
 
L
K
 
P
A
 
N
P
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
I
W
 
H
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
|
D
P
 
Q
T
 
V
A
 
V
D
 
P
V
 
L
S
 
S
E
 
S
G
 
S
R
 
L
R
 
R
I
 
L
A
 
G
T
 
E
M
 
L
I
 
I
P
 
D
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
R
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
|
W
P
 
T
Q
 
Q
F
 
I
E
 
E
D
 
Q
A
 
T
D
 
D
T
 
R
F
 
F
N
 
N
R
 
R
I
 
L
H
 
V
L
 
V
N
 
E
F
 
F
L
 
F

1iunB Meta-cleavage product hydrolase from pseudomonas fluorescens ip01 (cumd) s103a mutant hexagonal (see paper)
30% identity, 91% coverage: 22:290/294 of query aligns to 11:276/276 of 1iunB

query
sites
1iunB
A
 
A
K
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
L
T
 
T
R
 
N
Y
 
Y
L
 
-
H
 
H
A
 
D
G
 
V
S
 
G
S
 
E
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
L
L
 
I
H
 
H
G
 
G
V
x
S
G
|
G
G
 
P
H
x
G
A
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
R
 
N
-
 
W
-
 
R
-
 
L
N
 
T
L
 
I
Q
 
P
S
 
A
H
 
L
A
 
S
E
 
K
H
 
F
F
 
Y
D
 
R
V
 
V
W
 
I
A
 
A
I
 
P
D
 
D
M
 
M
I
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
W
 
F
T
 
T
D
 
D
K
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
N
G
 
Y
R
 
N
E
 
Y
I
 
S
S
 
K
D
 
D
-
 
S
Y
 
W
V
 
V
D
 
D
H
 
H
V
 
I
I
 
I
R
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
T
 
A
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
H
F
 
I
S
 
V
G
 
G
E
x
N
S
x
A
L
x
F
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
I
R
 
A
L
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
R
H
 
Y
P
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
x
G
A
 
A
G
 
A
G
 
G
S
 
T
Q
 
R
A
 
F
D
 
D
P
 
-
V
 
-
V
 
-
M
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
V
T
 
T
L
 
E
S
 
G
M
 
L
R
 
N
A
 
A
V
|
V
-
 
W
-
 
G
E
 
Y
E
 
T
P
 
P
G
 
S
W
 
I
D
 
E
F
 
N
I
 
M
K
 
R
A
 
N
R
 
L
V
 
L
Q
 
D
W
 
I
L
 
F
M
 
A
A
 
Y
D
 
D
K
 
R
A
 
S
K
 
L
A
 
V
F
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
L
I
 
A
A
 
R
T
 
L
R
|
R
Q
 
Y
A
 
E
I
 
A
Y
 
S
A
 
I
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
M
 
F
V
 
Q
E
 
E
A
 
S
Q
x
F
R
 
S
G
 
S
N
 
M
M
 
F
V
 
P
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
M
 
-
E
 
E
T
 
P
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
N
 
W
I
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
A
L
 
S
R
 
S
A
 
D
E
 
E
H
 
D
Y
 
I
G
 
K
R
 
T
I
 
L
K
 
P
A
 
N
P
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
I
W
 
H
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
|
D
P
 
Q
T
 
V
A
 
V
D
 
P
V
 
L
S
 
S
E
 
S
G
 
S
R
 
L
R
 
R
I
 
L
A
 
G
T
 
E
M
 
L
I
 
I
P
 
D
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
x
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
R
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
|
W
P
 
T
Q
 
Q
F
 
I
E
 
E
D
 
Q
A
 
T
D
 
D
T
x
R
F
 
F
N
 
N
R
 
R
I
 
L
H
 
V
L
 
V
N
 
E
F
 
F
L
 
F
L
 
N
G
 
E
N
 
A
A
 
N
V
 
T
P
 
P
E
 
K

1ukaA Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) complexed with (s)-2-methylbutyrate (see paper)
31% identity, 89% coverage: 22:283/294 of query aligns to 10:268/271 of 1ukaA

query
sites
1ukaA
A
 
A
K
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
L
T
 
T
R
 
N
Y
 
Y
L
 
-
H
 
H
A
 
D
G
 
V
S
 
G
S
 
E
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
L
L
 
I
H
 
H
G
 
G
V
x
S
G
|
G
G
 
P
H
x
G
A
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
R
 
N
-
 
W
-
 
R
-
 
L
N
 
T
L
 
I
Q
 
P
S
 
A
H
 
L
A
 
S
E
 
K
H
 
F
F
 
Y
D
 
R
V
 
V
W
 
I
A
 
A
I
 
P
D
 
D
M
 
M
I
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
W
 
F
T
 
T
D
 
D
K
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
N
G
 
Y
R
 
N
E
 
Y
I
 
S
S
 
K
D
 
D
-
 
S
Y
 
W
V
 
V
D
 
D
H
 
H
V
 
I
I
 
I
R
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
T
 
A
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
H
F
 
I
S
 
V
G
 
G
E
x
N
S
x
A
L
x
F
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
I
R
 
A
L
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
R
H
 
Y
P
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
x
G
A
 
A
G
 
A
G
 
G
S
 
T
Q
 
R
A
 
F
D
 
D
P
 
-
V
 
-
V
 
-
M
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
V
T
 
T
L
 
E
S
 
G
M
 
L
R
 
N
A
 
A
V
|
V
-
x
W
-
 
G
E
 
Y
E
 
T
P
 
P
G
 
S
W
 
I
D
 
E
F
 
N
I
 
M
K
 
R
A
 
N
R
 
L
V
 
L
Q
 
D
W
 
I
L
 
F
M
 
A
A
 
Y
D
 
D
K
 
R
A
 
S
K
 
L
A
 
V
F
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
L
I
 
A
A
 
R
T
 
L
R
|
R
Q
 
Y
A
 
E
I
 
A
Y
 
S
A
 
I
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
M
 
F
V
 
Q
E
 
E
A
 
S
Q
x
F
R
 
S
G
 
S
N
 
M
M
 
F
V
 
P
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
M
 
-
E
 
E
T
 
P
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
N
 
W
I
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
A
L
 
S
R
 
S
A
 
D
E
 
E
H
 
D
Y
 
I
G
 
K
R
 
T
I
 
L
K
 
P
A
 
N
P
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
I
W
 
H
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
|
D
P
 
Q
T
x
V
A
 
V
D
 
P
V
 
L
S
 
S
E
 
S
G
 
S
R
 
L
R
 
R
I
 
L
A
 
G
T
 
E
M
 
L
I
 
I
P
 
D
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
R
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
|
W
P
 
T
Q
 
Q
F
 
I
E
 
E
D
 
Q
A
 
T
D
 
D
T
 
R
F
 
F
N
 
N
R
 
R
I
 
L
H
 
V
L
 
V
N
 
E
F
 
F
L
 
F

1uk9A Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) complexed with isovalerate (see paper)
31% identity, 89% coverage: 22:283/294 of query aligns to 10:268/271 of 1uk9A

query
sites
1uk9A
A
 
A
K
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
L
T
 
T
R
 
N
Y
 
Y
L
 
-
H
 
H
A
 
D
G
 
V
S
 
G
S
 
E
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
L
L
 
I
H
 
H
G
 
G
V
x
S
G
|
G
G
 
P
H
x
G
A
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
R
 
N
-
 
W
-
 
R
-
 
L
N
 
T
L
 
I
Q
 
P
S
 
A
H
 
L
A
 
S
E
 
K
H
 
F
F
 
Y
D
 
R
V
 
V
W
 
I
A
 
A
I
 
P
D
 
D
M
 
M
I
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
W
 
F
T
 
T
D
 
D
K
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
N
G
 
Y
R
 
N
E
 
Y
I
 
S
S
 
K
D
 
D
-
 
S
Y
 
W
V
 
V
D
 
D
H
 
H
V
 
I
I
 
I
R
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
T
 
A
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
H
F
 
I
S
 
V
G
 
G
E
x
N
S
x
A
L
x
F
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
I
R
 
A
L
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
R
H
 
Y
P
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
x
G
A
 
A
G
 
A
G
 
G
S
 
T
Q
 
R
A
 
F
D
 
D
P
 
-
V
 
-
V
 
-
M
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
V
T
 
T
L
 
E
S
 
G
M
 
L
R
 
N
A
 
A
V
|
V
-
x
W
-
 
G
E
 
Y
E
 
T
P
 
P
G
 
S
W
 
I
D
 
E
F
 
N
I
 
M
K
 
R
A
 
N
R
 
L
V
 
L
Q
 
D
W
 
I
L
 
F
M
 
A
A
 
Y
D
 
D
K
 
R
A
 
S
K
 
L
A
 
V
F
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
L
I
 
A
A
 
R
T
 
L
R
|
R
Q
 
Y
A
 
E
I
 
A
Y
 
S
A
 
I
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
M
 
F
V
 
Q
E
 
E
A
 
S
Q
x
F
R
 
S
G
 
S
N
 
M
M
 
F
V
 
P
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
M
 
-
E
 
E
T
 
P
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
N
 
W
I
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
A
L
 
S
R
 
S
A
 
D
E
 
E
H
 
D
Y
 
I
G
 
K
R
 
T
I
 
L
K
 
P
A
 
N
P
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
I
W
 
H
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
|
D
P
 
Q
T
 
V
A
 
V
D
 
P
V
 
L
S
 
S
E
 
S
G
 
S
R
 
L
R
 
R
I
 
L
A
 
G
T
 
E
M
 
L
I
 
I
P
 
D
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
R
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
|
W
P
 
T
Q
 
Q
F
 
I
E
 
E
D
 
Q
A
 
T
D
 
D
T
 
R
F
 
F
N
 
N
R
 
R
I
 
L
H
 
V
L
 
V
N
 
E
F
 
F
L
 
F

1uk8A Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) complexed with n-valerate (see paper)
31% identity, 89% coverage: 22:283/294 of query aligns to 10:268/271 of 1uk8A

query
sites
1uk8A
A
 
A
K
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
L
T
 
T
R
 
N
Y
 
Y
L
 
-
H
 
H
A
 
D
G
 
V
S
 
G
S
 
E
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
L
L
 
I
H
 
H
G
 
G
V
x
S
G
|
G
G
 
P
H
x
G
A
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
R
 
N
-
 
W
-
 
R
-
 
L
N
 
T
L
 
I
Q
 
P
S
 
A
H
 
L
A
 
S
E
 
K
H
 
F
F
 
Y
D
 
R
V
 
V
W
 
I
A
 
A
I
 
P
D
 
D
M
 
M
I
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
W
 
F
T
 
T
D
 
D
K
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
N
G
 
Y
R
 
N
E
 
Y
I
 
S
S
 
K
D
 
D
-
 
S
Y
 
W
V
 
V
D
 
D
H
 
H
V
 
I
I
 
I
R
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
T
 
A
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
H
F
 
I
S
 
V
G
 
G
E
x
N
S
x
A
L
x
F
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
I
R
 
A
L
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
R
H
 
Y
P
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
x
G
A
 
A
G
 
A
G
 
G
S
 
T
Q
 
R
A
 
F
D
 
D
P
 
-
V
 
-
V
 
-
M
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
V
T
 
T
L
 
E
S
 
G
M
x
L
R
 
N
A
 
A
V
|
V
-
x
W
-
 
G
E
 
Y
E
 
T
P
 
P
G
 
S
W
 
I
D
 
E
F
 
N
I
 
M
K
 
R
A
 
N
R
 
L
V
 
L
Q
 
D
W
 
I
L
 
F
M
 
A
A
 
Y
D
 
D
K
 
R
A
 
S
K
 
L
A
 
V
F
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
L
I
 
A
A
 
R
T
 
L
R
|
R
Q
 
Y
A
 
E
I
 
A
Y
 
S
A
 
I
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
M
 
F
V
 
Q
E
 
E
A
 
S
Q
x
F
R
 
S
G
 
S
N
 
M
M
 
F
V
 
P
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
M
 
-
E
 
E
T
 
P
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
N
 
W
I
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
A
L
 
S
R
 
S
A
 
D
E
 
E
H
 
D
Y
 
I
G
 
K
R
 
T
I
 
L
K
 
P
A
 
N
P
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
I
W
 
H
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
|
D
P
 
Q
T
 
V
A
 
V
D
 
P
V
 
L
S
 
S
E
 
S
G
 
S
R
x
L
R
 
R
I
 
L
A
x
G
T
x
E
M
 
L
I
 
I
P
 
D
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
R
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
|
W
P
 
T
Q
 
Q
F
 
I
E
 
E
D
 
Q
A
 
T
D
 
D
T
 
R
F
 
F
N
 
N
R
 
R
I
 
L
H
 
V
L
 
V
N
 
E
F
 
F
L
 
F

1uk7A Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) complexed with n-butyrate (see paper)
31% identity, 89% coverage: 22:283/294 of query aligns to 10:268/271 of 1uk7A

query
sites
1uk7A
A
 
A
K
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
L
T
 
T
R
 
N
Y
 
Y
L
 
-
H
 
H
A
 
D
G
 
V
S
 
G
S
 
E
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
L
L
 
I
H
 
H
G
 
G
V
x
S
G
|
G
G
 
P
H
x
G
A
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
A
R
 
N
-
 
W
-
 
R
-
 
L
N
 
T
L
 
I
Q
 
P
S
 
A
H
 
L
A
 
S
E
 
K
H
 
F
F
 
Y
D
 
R
V
 
V
W
 
I
A
 
A
I
 
P
D
 
D
M
 
M
I
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
W
 
F
T
 
T
D
 
D
K
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
N
G
 
Y
R
 
N
E
 
Y
I
 
S
S
 
K
D
 
D
-
 
S
Y
 
W
V
 
V
D
 
D
H
 
H
V
 
I
I
 
I
R
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
T
 
A
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
H
F
 
I
S
 
V
G
 
G
E
x
N
S
x
A
L
x
F
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
I
R
 
A
L
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
R
H
 
Y
P
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
x
G
A
 
A
G
 
A
G
 
G
S
 
T
Q
 
R
A
 
F
D
 
D
P
 
-
V
 
-
V
 
-
M
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
V
T
 
T
L
 
E
S
 
G
M
x
L
R
 
N
A
 
A
V
|
V
-
 
W
-
 
G
E
 
Y
E
 
T
P
 
P
G
 
S
W
 
I
D
 
E
F
 
N
I
 
M
K
 
R
A
 
N
R
 
L
V
 
L
Q
 
D
W
 
I
L
 
F
M
 
A
A
 
Y
D
 
D
K
 
R
A
 
S
K
 
L
A
 
V
F
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
L
I
 
A
A
 
R
T
 
L
R
|
R
Q
 
Y
A
 
E
I
 
A
Y
 
S
A
 
I
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
M
 
F
V
 
Q
E
 
E
A
 
S
Q
x
F
R
 
S
G
 
S
N
 
M
M
 
F
V
 
P
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
M
 
-
E
 
E
T
 
P
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
N
 
W
I
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
A
L
 
S
R
 
S
A
 
D
E
 
E
H
 
D
Y
 
I
G
 
K
R
 
T
I
 
L
K
 
P
A
 
N
P
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
I
W
 
H
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
|
D
P
 
Q
T
 
V
A
 
V
D
 
P
V
 
L
S
 
S
E
 
S
G
 
S
R
 
L
R
 
R
I
 
L
A
 
G
T
 
E
M
 
L
I
 
I
P
 
D
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
R
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
|
W
P
 
T
Q
 
Q
F
 
I
E
 
E
D
 
Q
A
 
T
D
 
D
T
 
R
F
 
F
N
 
N
R
 
R
I
 
L
H
 
V
L
 
V
N
 
E
F
 
F
L
 
F

1iupA Meta-cleavage product hydrolase from pseudomonas fluorescens ip01 (cumd) s103a mutant complexed with isobutyrates (see paper)
31% identity, 89% coverage: 22:283/294 of query aligns to 10:268/271 of 1iupA

query
sites
1iupA
A
 
A
K
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
L
T
 
T
R
 
N
Y
 
Y
L
 
-
H
 
H
A
 
D
G
 
V
S
 
G
S
 
E
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
-
L
 
V
I
 
I
L
 
L
L
 
I
H
 
H
G
 
G
V
x
S
G
|
G
G
 
P
H
x
G
A
 
V
E
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
x
A
R
x
N
-
 
W
-
 
R
-
 
L
N
 
T
L
 
I
Q
 
P
S
 
A
H
 
L
A
 
S
E
 
K
H
 
F
F
 
Y
D
 
R
V
 
V
W
 
I
A
 
A
I
 
P
D
 
D
M
 
M
I
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
W
 
F
T
 
T
D
 
D
K
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
N
G
 
Y
R
 
N
E
x
Y
I
 
S
S
 
K
D
 
D
-
 
S
Y
x
W
V
 
V
D
 
D
H
 
H
V
 
I
I
 
I
R
 
G
V
 
I
M
 
M
D
 
D
T
 
A
L
 
L
G
 
E
I
 
I
A
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
H
F
 
I
S
 
V
G
 
G
E
x
N
S
x
A
L
x
F
G
 
G
G
 
G
W
 
G
V
 
L
A
 
A
A
 
I
R
 
A
L
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
R
H
 
Y
P
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
N
 
M
T
x
G
A
 
A
G
 
A
G
 
G
S
 
T
Q
 
R
A
 
F
D
 
D
P
 
-
V
 
-
V
 
-
M
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
V
T
 
T
L
 
E
S
 
G
M
x
L
R
 
N
A
 
A
V
|
V
-
x
W
-
 
G
E
 
Y
E
 
T
P
 
P
G
 
S
W
 
I
D
 
E
F
 
N
I
 
M
K
 
R
A
 
N
R
 
L
V
 
L
Q
 
D
W
 
I
L
 
F
M
 
A
A
 
Y
D
 
D
K
 
R
A
 
S
K
 
L
A
 
V
F
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
L
I
 
A
A
 
R
T
 
L
R
|
R
Q
 
Y
A
 
E
I
 
A
Y
 
S
A
 
I
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
M
 
F
V
 
Q
E
 
E
A
 
S
Q
x
F
R
 
S
G
 
S
N
x
M
M
 
F
V
 
P
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
M
 
-
E
 
E
T
 
P
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
N
x
W
I
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
A
L
 
S
R
 
S
A
 
D
E
 
E
H
 
D
Y
 
I
G
 
K
R
 
T
I
 
L
K
 
P
A
 
N
P
 
E
T
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
I
W
 
H
T
 
G
S
 
R
D
 
E
D
|
D
P
 
Q
T
x
V
A
 
V
D
 
P
V
 
L
S
 
S
E
 
S
G
 
S
R
 
L
R
 
R
I
 
L
A
 
G
T
 
E
M
 
L
I
 
I
P
 
D
G
 
R
A
 
A
L
 
Q
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
G
G
 
R
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
|
W
P
 
T
Q
 
Q
F
 
I
E
 
E
D
 
Q
A
 
T
D
 
D
T
 
R
F
 
F
N
 
N
R
 
R
I
 
L
H
 
V
L
 
V
N
 
E
F
 
F
L
 
F

2og1A Crystal structure of bphd, a c-c hydrolase from burkholderia xenovorans lb400 (see paper)
32% identity, 64% coverage: 96:283/294 of query aligns to 96:282/285 of 2og1A

query
sites
2og1A
V
 
L
M
 
M
D
 
D
T
 
A
L
 
L
G
 
D
I
 
I
A
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
H
F
 
L
S
 
V
G
 
G
E
x
N
S
|
S
L
x
M
G
 
G
G
 
G
W
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
L
R
 
N
L
 
F
A
 
A
I
 
L
D
 
E
H
 
Y
P
 
P
E
 
D
R
 
R
V
 
I
E
 
G
R
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
L
N
 
M
T
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
P
S
 
S
Q
 
M
A
 
F
D
 
A
P
 
P
V
 
M
V
 
P
M
 
M
E
 
E
R
 
G
L
 
I
K
 
K
T
 
L
L
|
L
S
 
-
M
 
F
R
 
K
A
 
L
V
 
Y
E
 
A
E
 
E
P
 
P
G
 
S
W
 
Y
D
 
E
F
 
T
I
 
L
K
 
K
A
 
Q
R
 
M
V
 
L
Q
 
Q
W
 
V
L
 
F
M
 
L
A
 
Y
D
 
D
K
 
Q
A
 
S
K
 
L
A
 
I
F
 
T
D
 
E
D
x
E
L
 
L
I
 
L
A
 
Q
T
 
G
R
|
R
-
 
W
Q
 
E
A
 
A
I
 
I
Y
 
Q
A
 
R
Q
 
Q
P
 
P
G
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
K
-
 
N
-
 
F
M
 
L
V
 
I
E
 
S
A
|
A
Q
 
Q
R
 
K
G
 
A
N
 
P
M
 
L
V
 
S
L
 
T
Q
 
W
D
 
D
M
 
V
E
 
T
T
 
A
R
 
R
Q
 
-
R
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
L
G
 
G
R
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
A
P
 
K
T
 
T
L
 
F
V
 
I
L
 
T
W
 
W
T
 
G
S
 
R
D
 
D
D
|
D
P
 
R
T
 
F
A
 
V
D
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
H
G
 
G
R
 
L
R
 
K
I
 
L
A
 
L
T
 
W
M
 
N
I
 
I
P
 
D
G
 
D
A
 
A
L
 
R
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
S
G
 
K
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
|
W
P
 
A
Q
 
Q
F
 
W
E
 
E
D
 
H
A
 
A
D
 
D
T
 
E
F
 
F
N
 
N
R
 
R
I
 
L
H
 
V
L
 
I
N
 
D
F
 
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P47229 2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase; HOPDA hydrolase; 2,6-dioxo-6-phenylhexa-3-enoate hydrolase; EC 3.7.1.8 from Paraburkholderia xenovorans (strain LB400) (see paper)
32% identity, 64% coverage: 96:283/294 of query aligns to 97:283/286 of P47229

query
sites
P47229
V
 
L
M
 
M
D
 
D
T
 
A
L
 
L
G
 
D
I
 
I
A
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
H
F
 
L
S
 
V
G
 
G
E
 
N
S
|
S
L
 
M
G
 
G
G
 
G
W
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
L
R
 
N
L
 
F
A
 
A
I
 
L
D
 
E
H
 
Y
P
 
P
E
 
D
R
 
R
V
 
I
E
 
G
R
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
L
N
 
M
T
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
P
S
 
S
Q
 
M
A
 
F
D
 
A
P
 
P
V
 
M
V
 
P
M
 
M
E
 
E
R
 
G
L
 
I
K
 
K
T
 
L
L
 
L
S
 
-
M
 
F
R
 
K
A
 
L
V
 
Y
E
 
A
E
 
E
P
 
P
G
 
S
W
 
Y
D
 
E
F
 
T
I
 
L
K
 
K
A
 
Q
R
 
M
V
 
L
Q
 
Q
W
 
V
L
 
F
M
 
L
A
 
Y
D
 
D
K
 
Q
A
 
S
K
 
L
A
 
I
F
 
T
D
 
E
D
 
E
L
 
L
I
 
L
A
 
Q
T
 
G
R
 
R
-
 
W
Q
 
E
A
 
A
I
 
I
Y
 
Q
A
 
R
Q
 
Q
P
 
P
G
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
K
-
 
N
-
 
F
M
 
L
V
 
I
E
 
S
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
G
 
A
N
 
P
M
 
L
V
 
S
L
 
T
Q
 
W
D
 
D
M
 
V
E
 
T
T
 
A
R
 
R
Q
 
-
R
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
Y
 
L
G
 
G
R
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
A
P
 
K
T
 
T
L
 
F
V
 
I
L
 
T
W
 
W
T
 
G
S
 
R
D
 
D
D
 
D
P
 
R
T
 
F
A
 
V
D
 
P
V
 
L
S
 
D
E
 
H
G
 
G
R
 
L
R
 
K
I
 
L
A
 
L
T
 
W
M
 
N
I
 
I
P
 
D
G
 
D
A
 
A
L
 
R
F
 
L
T
 
H
V
 
V
M
 
F
D
 
S
G
 
K
C
 
C
G
 
G
H
|
H
W
 
W
P
 
A
Q
 
Q
F
 
W
E
 
E
D
 
H
A
 
A
D
 
D
T
 
E
F
 
F
N
 
N
R
 
R
I
 
L
H
 
V
L
 
I
N
 
D
F
 
F
L
 
L

Query Sequence

>RR42_RS27870 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS27870
MPFQSIWGELRGVSFSQGWLDAKGIRTRYLHAGSSGKPALILLHGVGGHAEAYVRNLQSH
AEHFDVWAIDMIGHGWTDKPAGGREISDYVDHVIRVMDTLGIARAAFSGESLGGWVAARL
AIDHPERVERLVLNTAGGSQADPVVMERLKTLSMRAVEEPGWDFIKARVQWLMADKAKAF
DDLIATRQAIYAQPGMVEAQRGNMVLQDMETRQRNILRAEHYGRIKAPTLVLWTSDDPTA
DVSEGRRIATMIPGALFTVMDGCGHWPQFEDADTFNRIHLNFLLGNAVPEATTV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory