SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS29350 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS29350 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q92R43 Aquaglyceroporin AqpS from Rhizobium meliloti (strain 1021) (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
54% identity, 87% coverage: 4:213/241 of query aligns to 6:217/233 of Q92R43

query
sites
Q92R43
L
 
L
P
 
T
R
 
R
Q
 
R
I
 
C
A
 
V
G
 
A
E
 
E
V
 
A
I
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
A
V
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
I
 
I
M
 
M
A
 
A
E
 
D
R
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
A
G
 
D
N
 
D
V
 
-
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
A
N
 
N
T
 
T
L
 
I
A
 
A
T
|
T
V
 
G
G
 
A
G
 
I
L
 
L
Y
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
V
E
 
T
V
 
I
F
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
S
M
 
L
V
 
V
M
 
F
A
 
A
V
 
L
K
 
S
G
 
G
E
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
Y
 
R
A
 
D
L
 
C
A
 
A
P
 
A
Y
 
Y
I
 
V
V
 
I
A
 
A
Q
 
Q
L
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
A
G
 
G
A
 
T
W
 
A
L
 
L
A
 
A
H
 
H
A
 
L
M
 
M
F
 
F
D
 
D
V
 
L
S
 
P
I
 
P
L
 
L
Q
 
D
L
 
M
S
 
S
A
 
M
K
 
K
M
 
V
R
 
R
S
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Q
 
Q
W
 
W
I
 
L
A
 
S
E
 
E
A
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
A
A
 
F
G
 
G
L
 
L
I
 
V
L
 
A
V
 
T
I
 
I
L
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
I
R
 
R
A
 
F
P
 
H
D
 
R
G
 
E
R
 
A
A
 
V
P
 
P
A
 
W
M
 
L
V
 
V
A
 
G
S
 
L
Y
 
Y
I
 
I
G
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
W
 
W
F
 
F
T
 
T
A
 
A
S
 
S
T
 
T
S
 
S
F
 
F
A
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
A
A
x
V
A
 
A
F
 
L
G
 
A
R
 
R
M
 
S
F
 
F
S
 
T
N
 
N
S
 
T
F
 
F
A
 
S
G
 
G
I
 
I
A
 
R
P
 
P
A
 
G
S
 
D
V
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
V
L
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
C
 
V
I
 
C
G
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
L
H
 
M
T
 
R
A
 
W
L
 
L
L
 
L

I1CR68 Aquaporin-1 from Rhizopus delemar (strain RA 99-880 / ATCC MYA-4621 / FGSC 9543 / NRRL 43880) (Mucormycosis agent) (Rhizopus arrhizus var. delemar) (see paper)
30% identity, 73% coverage: 6:180/241 of query aligns to 59:261/306 of I1CR68

query
sites
I1CR68
R
 
R
Q
 
E
I
 
F
A
 
L
G
 
A
E
 
E
V
 
F
I
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
V
L
 
I
L
 
L
L
 
-
A
 
-
V
 
V
V
 
L
I
 
L
G
 
T
S
 
C
G
 
G
I
 
F
M
 
C
A
 
A
E
 
E
R
 
Q
L
 
T
A
 
L
G
 
H
G
 
I
N
 
E
V
 
E
A
 
S
V
 
K
A
 
S
L
 
W
L
 
L
A
 
T
N
 
S
T
 
S
L
 
F
A
 
G
T
 
S
V
 
-
G
 
-
G
 
G
L
 
L
Y
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
I
-
 
G
-
 
I
E
 
C
V
 
V
F
 
S
G
 
G
P
 
H
I
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
T
M
 
I
V
 
A
M
 
F
A
 
C
V
 
I
K
 
F
G
 
S
E
 
G
L
 
F
P
 
P
R
 
I
Y
 
R
A
 
K
L
 
V
A
 
P
P
 
S
Y
 
Y
I
 
I
V
 
T
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
F
L
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
A
L
 
L
A
 
L
H
 
Y
A
 
I
M
 
I
F
 
I
D
 
E
V
 
P
S
 
A
I
 
I
L
 
V
Q
 
Q
L
 
F
S
 
D
A
 
G
K
 
G
M
 
Q
R
 
R
S
 
Y
-
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
S
-
 
T
-
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
F
-
 
G
-
 
T
-
 
Y
-
 
P
-
 
P
-
 
L
-
 
Y
-
 
V
G
 
G
P
 
I
G
 
G
Q
 
S
W
 
A
I
 
I
A
 
A
-
 
S
E
 
E
A
 
I
V
 
M
A
 
G
T
 
T
A
 
A
G
 
M
L
 
L
I
 
L
L
 
L
V
 
V
I
 
I
L
 
M
-
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
H
-
 
P
-
 
N
-
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
Y
R
 
K
A
 
S
P
 
A
D
 
Q
G
 
G
R
 
A
A
 
M
P
 
I
A
 
A
M
 
L
V
 
G
A
 
I
S
 
T
Y
 
T
I
 
I
G
 
S
A
 
L
A
 
C
Y
 
I
W
 
G
F
 
Y
T
 
T
A
 
S
S
 
G
T
 
F
S
 
S
F
 
L
A
 
-
N
 
N
P
 
P
A
 
A
A
 
R
A
 
D
F
 
F
G
 
G
-
 
P
R
 
R
M
 
L
F
 
F
S
 
T

Sites not aligning to the query:

3nkaA Crystal structure of aqpz h174g,t183f (see paper)
31% identity, 60% coverage: 6:150/241 of query aligns to 5:161/230 of 3nkaA

query
sites
3nkaA
R
 
R
Q
 
K
I
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
E
V
 
C
I
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
F
L
 
W
L
 
L
L
 
V
A
 
F
V
 
G
V
 
G
I
 
C
G
 
G
S
 
S
G
x
A
I
 
V
M
 
L
A
 
A
E
 
A
R
 
G
L
 
F
A
 
P
G
 
E
G
 
L
N
 
G
V
 
I
A
 
G
V
 
F
A
 
A
L
 
G
L
x
V
A
 
A
N
 
L
T
 
A
L
 
F
A
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
G
L
 
L
Y
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
T
E
 
M
V
 
A
F
 
F
-
 
A
-
 
V
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
T
M
 
I
V
 
G
M
 
L
A
 
W
V
 
A
K
 
G
G
 
G
E
 
R
L
 
F
P
 
P
R
 
A
Y
 
K
A
 
E
L
 
V
A
 
V
P
 
G
Y
 
Y
I
 
V
V
 
I
A
 
A
Q
 
Q
L
 
V
A
 
V
G
 
G
A
 
G
V
 
I
L
 
V
G
 
A
A
 
A
W
 
A
L
 
L
A
 
L
H
 
Y
A
 
L
M
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
A
S
 
A
I
 
A
L
 
S
Q
 
G
L
 
F
S
 
A
A
 
S
K
 
N
-
 
G
-
 
Y
M
 
G
R
 
E
S
 
H
G
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
G
W
 
Y
-
 
S
-
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
L
I
 
V
A
 
V
E
 
E
A
 
L
V
 
V
A
 
L
T
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
F
I
 
L
L
 
L
V
 
V
I
 
I
L
 
H
R
 
G
A
 
A
P
 
T
D
 
D
G
 
K
R
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P60844 Aquaporin Z; Bacterial nodulin-like intrinsic protein; Water channel AqpZ from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
31% identity, 60% coverage: 6:150/241 of query aligns to 3:159/231 of P60844

query
sites
P60844
R
 
R
Q
 
K
I
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
E
V
x
C
I
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
F
L
 
W
L
 
L
L
 
V
A
 
F
V
 
G
V
 
G
I
x
C
G
 
G
S
 
S
G
 
A
I
 
V
M
 
L
A
 
A
E
 
A
R
 
G
L
 
F
A
 
P
G
 
E
G
 
L
N
 
G
V
 
I
A
 
G
V
 
F
A
 
A
L
 
G
L
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
A
L
 
F
A
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
G
L
 
L
Y
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
T
E
 
M
V
 
A
F
 
F
-
 
A
-
 
V
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
T
M
 
I
V
 
G
M
 
L
A
 
W
V
 
A
K
 
G
G
 
G
E
 
R
L
 
F
P
 
P
R
 
A
Y
 
K
A
 
E
L
 
V
A
 
V
P
 
G
Y
 
Y
I
 
V
V
 
I
A
 
A
Q
 
Q
L
 
V
A
 
V
G
 
G
A
 
G
V
 
I
L
 
V
G
 
A
A
 
A
W
 
A
L
 
L
A
 
L
H
 
Y
A
 
L
M
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
A
S
 
A
I
 
A
L
 
S
Q
 
G
L
 
F
S
 
A
A
 
S
K
 
N
-
 
G
-
 
Y
M
 
G
R
 
E
S
 
H
G
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
G
W
 
Y
-
 
S
-
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
L
I
 
V
A
 
V
E
 
E
A
 
L
V
 
V
A
 
L
T
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
F
I
 
L
L
 
L
V
 
V
I
 
I
L
 
H
R
 
G
A
 
A
P
 
T
D
 
D
G
 
K
R
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q6Z2T3 Aquaporin NIP2-1; Low silicon protein 1; NOD26-like intrinsic protein 2-1; OsNIP2;1; Silicon influx transporter LSI1 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see paper)
30% identity, 76% coverage: 4:186/241 of query aligns to 47:236/298 of Q6Z2T3

query
sites
Q6Z2T3
L
 
L
P
 
L
R
 
K
Q
 
K
I
 
V
A
 
V
G
 
S
E
 
E
V
 
V
I
 
V
G
 
A
T
 
T
A
 
F
L
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
F
V
 
M
V
 
T
I
 
C
G
 
G
S
 
A
-
 
A
G
 
G
I
 
I
M
 
S
A
 
G
E
 
S
R
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
-
G
 
-
N
 
-
V
 
-
A
 
R
V
 
I
A
 
S
L
 
Q
L
 
L
A
 
G
N
 
Q
T
 
S
L
 
I
A
 
A
T
 
-
V
 
-
G
 
G
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
V
 
V
L
 
T
I
 
V
E
 
M
V
 
I
F
 
Y
-
 
A
-
 
V
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
T
M
 
L
V
 
A
M
 
F
A
 
A
V
 
V
K
 
F
G
 
R
E
 
H
L
 
F
P
 
P
R
 
W
Y
 
I
A
 
Q
L
 
V
A
 
P
P
 
F
Y
 
Y
I
 
W
V
 
A
A
|
A
Q
 
Q
L
 
F
A
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
C
G
 
A
A
 
S
W
 
F
L
 
V
A
 
L
H
 
K
A
 
A
M
 
V
F
 
I
D
 
H
-
 
P
V
 
V
S
 
D
I
 
V
L
 
I
Q
 
G
L
 
T
S
 
T
A
 
T
K
 
P
M
 
V
R
 
-
S
 
-
G
 
G
P
 
P
G
 
-
Q
 
H
W
 
W
-
 
H
-
 
S
-
 
L
I
 
V
A
 
V
E
 
E
A
 
V
V
 
I
A
 
V
T
 
T
A
 
F
G
 
N
L
 
M
I
 
M
L
 
F
V
 
V
I
 
T
L
 
L
R
 
A
-
 
V
A
 
A
P
 
T
D
 
D
G
 
T
R
 
R
A
 
A
P
 
V
A
 
G
M
 
E
V
 
L
A
 
A
S
 
G
Y
 
L
-
 
A
I
 
V
G
 
G
A
 
S
A
 
A
Y
 
V
W
 
C
F
 
I
T
 
T
A
 
S
-
 
I
-
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
I
S
 
S
T
 
G
S
 
G
F
 
S
A
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
A
A
 
R
A
 
T
F
 
L
G
 
G
-
 
P
R
 
A
M
 
L
F
 
A
S
 
S
N
 
N
S
 
K
F
 
F
A
 
D
G
 
G
I
 
L

P37451 Propanediol uptake facilitator PduF from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
33% identity, 44% coverage: 4:109/241 of query aligns to 5:107/264 of P37451

query
sites
P37451
L
 
L
P
 
K
R
 
A
Q
 
Q
I
 
C
A
 
G
G
 
A
E
 
E
V
 
F
I
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
G
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
F
V
 
F
V
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
C
G
 
-
I
 
L
M
 
S
A
 
A
E
 
L
R
 
K
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
A
N
 
S
V
 
L
A
 
G
V
 
L
A
 
W
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
T
 
E
L
 
I
A
 
C
T
 
I
V
 
I
G
 
W
G
 
G
L
 
L
Y
 
G
V
 
I
L
 
S
I
 
L
E
 
A
V
 
V
F
 
Y
-
 
L
-
 
T
G
 
A
P
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
L
N
|
N
P
|
P
A
|
A
V
 
V
S
 
T
M
 
I
V
 
A
M
 
L
A
 
W
V
 
L
K
 
F
G
 
A
E
 
C
L
 
F
P
 
P
R
 
K
Y
 
Q
A
 
K
L
 
V
A
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
I
V
 
I
A
 
A
Q
 
Q
L
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
F
L
 
G
G
 
G
A
 
A
W
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
Y
A
 
V
M
 
L
F
 
Y
D
 
S

Sites not aligning to the query:

P08995 Nodulin-26; N-26 from Glycine max (Soybean) (Glycine hispida) (see paper)
35% identity, 40% coverage: 52:148/241 of query aligns to 81:180/271 of P08995

query
sites
P08995
L
 
L
Y
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
V
E
 
Y
V
 
T
F
 
V
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
T
M
 
I
V
 
A
M
 
F
A
 
A
V
 
S
K
 
T
G
 
R
E
 
R
L
 
F
P
 
P
R
 
L
Y
 
I
A
 
Q
L
 
V
A
 
P
P
 
A
Y
 
Y
I
 
V
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
S
V
 
I
L
 
L
G
 
A
A
 
S
W
 
G
L
 
T
A
 
L
H
 
R
A
 
L
M
 
L
F
 
F
D
 
M
V
 
G
S
 
N
I
 
H
L
 
D
Q
 
Q
L
 
F
S
 
S
A
 
G
K
 
T
M
 
V
R
 
P
S
 
N
G
 
G
P
 
T
G
 
N
-
 
L
-
 
Q
Q
 
A
W
 
F
I
 
V
A
 
F
E
 
E
A
 
F
V
 
I
A
 
M
T
 
T
A
 
F
G
 
F
L
 
L
I
 
M
L
 
F
V
 
V
I
 
I
L
 
C
-
 
G
R
 
V
A
 
A
P
 
T
D
 
D
G
 
N
R
 
R
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2o9eA Crystal structure of aqpz mutant t183c complexed with mercury (see paper)
31% identity, 60% coverage: 6:150/241 of query aligns to 5:161/232 of 2o9eA

query
sites
2o9eA
R
 
R
Q
 
K
I
 
L
A
 
A
G
 
A
E
 
E
V
 
S
I
 
F
G
 
G
T
 
T
A
 
F
L
 
W
L
 
L
L
 
V
A
 
F
V
 
G
V
 
G
I
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
A
I
 
V
M
 
L
A
 
A
E
 
A
R
 
G
L
 
F
A
 
P
G
 
E
G
 
L
N
 
G
V
 
I
A
 
G
V
 
F
A
 
A
L
 
G
L
 
V
A
 
A
N
 
L
T
 
A
L
 
F
A
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
G
L
 
L
Y
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
T
E
 
M
V
 
A
F
 
F
-
 
A
-
 
V
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
T
M
 
I
V
 
G
M
 
L
A
 
W
V
 
A
K
 
G
G
 
G
E
 
R
L
 
F
P
 
P
R
 
A
Y
 
K
A
 
E
L
 
V
A
 
V
P
 
G
Y
 
Y
I
 
V
V
 
I
A
 
A
Q
 
Q
L
 
V
A
 
V
G
 
G
A
 
G
V
 
I
L
 
V
G
 
A
A
 
A
W
 
A
L
 
L
A
 
L
H
 
Y
A
 
L
M
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
A
S
 
A
I
 
A
L
 
S
Q
 
G
L
 
F
S
 
A
A
 
S
K
 
N
-
 
G
-
 
Y
M
 
G
R
 
E
S
 
H
G
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
G
W
 
Y
-
 
S
-
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
L
I
 
V
A
 
V
E
|
E
A
 
L
V
 
V
A
 
L
T
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
F
I
 
L
L
 
L
V
 
V
I
 
I
L
 
H
R
 
G
A
 
A
P
 
T
D
 
D
G
 
K
R
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

O94778 Aquaporin-8; AQP-8 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
40% identity, 40% coverage: 11:107/241 of query aligns to 41:131/261 of O94778

query
sites
O94778
E
 
E
V
 
L
I
 
L
G
 
G
T
 
S
A
 
A
L
 
L
L
x
F
L
 
-
A
 
-
V
 
I
V
 
F
I
 
I
G
 
G
S
x
C
G
 
L
I
 
S
M
 
V
A
 
I
E
 
E
R
 
N
L
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
G
V
 
T
A
 
D
V
 
T
A
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
N
 
P
T
 
A
L
 
L
A
 
A
T
x
H
V
 
G
G
 
L
G
 
A
L
 
L
Y
 
G
V
 
L
L
 
V
I
 
I
E
 
A
V
 
T
F
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
S
M
 
L
V
 
A
M
 
A
A
 
M
V
 
L
K
 
I
G
 
G
E
 
G
L
 
L
P
 
N
R
 
L
Y
 
V
A
 
M
L
 
L
A
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
W
V
 
V
A
 
S
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
G
V
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
W
 
A
L
 
L
A
 
A
H
 
K
A
 
A
M
 
V

Sites not aligning to the query:

B1VB61 Propanediol uptake facilitator PduF from Citrobacter freundii (see paper)
34% identity, 44% coverage: 4:108/241 of query aligns to 5:106/269 of B1VB61

query
sites
B1VB61
L
 
L
P
 
K
R
 
A
Q
 
Q
I
 
C
A
 
I
G
 
A
E
 
E
V
 
F
I
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
G
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
F
V
 
F
V
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
C
G
 
-
I
 
L
M
 
S
A
 
A
E
 
L
R
 
K
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
A
N
 
S
V
 
L
A
 
G
V
 
L
A
 
W
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
T
 
E
L
 
I
A
 
C
T
 
I
V
 
I
G
 
W
G
 
G
L
 
L
Y
 
G
V
 
I
L
 
S
I
 
L
E
 
A
V
 
V
F
 
Y
-
 
L
-
 
T
G
 
A
P
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
L
N
|
N
P
|
P
A
|
A
V
 
I
S
 
T
M
 
I
V
 
A
M
 
L
A
 
W
V
 
L
K
 
F
G
 
A
E
 
C
L
 
F
P
 
P
R
 
G
Y
 
R
A
 
K
L
 
V
A
 
L
P
 
P
Y
 
Y
I
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
L
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
F
L
 
G
G
 
G
A
 
A
W
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
Y
A
 
L
M
 
L
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

P43286 Aquaporin PIP2-1; Plasma membrane intrinsic protein 2-1; AtPIP2;1; Plasma membrane intrinsic protein 2a; PIP2a from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
35% identity, 49% coverage: 6:124/241 of query aligns to 39:157/287 of P43286

query
sites
P43286
R
 
R
Q
 
A
I
 
V
A
 
I
G
 
A
E
 
E
V
 
F
I
 
V
G
 
A
T
 
T
A
 
L
L
 
L
L
 
F
L
 
L
A
 
Y
V
 
I
-
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
T
V
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
Y
G
 
K
I
 
I
M
 
Q
A
 
S
E
 
D
R
 
T
L
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
V
V
 
D
A
 
C
-
 
G
-
 
G
V
 
V
A
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
G
N
 
I
T
 
A
L
 
W
A
 
A
T
 
F
V
 
G
G
 
G
G
 
M
L
 
I
Y
 
F
V
 
I
L
 
L
I
 
V
E
 
Y
V
 
C
F
 
T
G
 
A
P
 
G
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
T
-
 
F
-
 
G
M
 
L
V
 
F
M
 
L
A
 
A
V
 
R
K
 
K
G
 
V
E
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
R
Y
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
-
P
 
-
Y
 
Y
I
 
I
V
 
I
A
 
A
Q
 
Q
L
 
C
A
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
C
G
 
G
A
 
V
W
 
G
L
 
F
A
 
V
H
 
K
A
 
A
M
 
-
F
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
-
I
 
-
L
 
F
Q
 
Q
L
 
S
S
 
S
A
 
Y
K
 
Y
M
 
T
R
 
R
S
 
Y
G
 
G
P
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P56402 Aquaporin-2; AQP-2; ADH water channel; Aquaporin-CD; AQP-CD; Collecting duct water channel protein; WCH-CD; Water channel protein for renal collecting duct from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
32% identity, 68% coverage: 51:213/241 of query aligns to 51:223/271 of P56402

query
sites
P56402
G
 
G
L
 
I
Y
 
G
V
 
T
L
 
L
I
 
V
E
 
Q
V
 
A
F
 
L
G
 
G
P
 
H
I
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
T
M
 
V
V
 
A
M
 
C
A
 
L
V
 
V
K
 
G
G
 
C
E
 
H
L
 
V
P
 
S
R
 
F
Y
 
L
A
 
R
L
 
A
A
 
A
P
 
F
Y
 
Y
I
 
V
V
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
A
L
 
I
A
 
L
H
 
H
A
 
E
M
 
I
F
 
T
D
 
P
V
 
V
S
 
E
I
 
I
-
 
R
-
 
G
-
 
D
L
 
L
Q
 
A
L
 
V
S
 
N
A
 
A
K
 
L
M
 
H
R
 
N
S
 
N
G
 
A
P
x
T
-
 
A
G
 
G
Q
 
Q
W
 
A
I
 
V
A
 
T
-
 
V
E
 
E
A
 
L
V
 
F
A
 
L
T
 
T
A
 
M
G
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
C
I
 
I
L
 
F
R
 
A
A
 
S
P
 
T
D
 
D
G
 
E
R
 
R
-
 
R
-
 
S
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
G
A
 
S
P
 
P
A
 
A
M
 
L
V
 
S
A
 
I
S
 
G
Y
 
F
-
 
S
-
 
V
-
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
H
-
 
L
-
 
L
A
 
G
Y
 
I
W
 
Y
F
 
F
T
 
T
A
 
G
S
 
C
T
 
S
S
 
-
F
 
-
A
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
A
A
 
R
A
 
S
F
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
F
 
-
S
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
V
V
 
V
P
 
T
G
 
G
-
 
K
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
H
-
 
W
-
 
V
F
 
F
V
 
W
L
 
I
A
 
G
E
 
P
L
 
L
L
 
V
G
 
G
A
 
A
C
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
S
L
 
L
L
 
L
H
 
Y
T
 
N
A
 
Y
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4nefA X-ray structure of human aquaporin 2 (see paper)
35% identity, 40% coverage: 51:147/241 of query aligns to 50:151/239 of 4nefA

query
sites
4nefA
G
 
G
L
 
I
Y
 
G
V
 
T
L
 
L
I
 
V
E
 
Q
V
 
A
F
 
L
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
T
M
 
V
V
 
A
M
x
C
A
 
L
V
 
V
K
 
G
G
 
C
E
x
H
L
 
V
P
 
S
R
 
V
Y
 
L
A
 
R
L
 
A
A
 
A
P
 
F
Y
 
Y
I
 
V
V
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
A
L
 
L
A
 
L
H
 
H
A
 
E
M
 
I
F
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
R
-
 
G
D
 
D
V
 
L
S
 
A
I
 
V
L
 
N
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
N
K
 
S
M
 
T
R
 
T
S
 
A
G
 
G
P
 
Q
G
 
A
Q
 
V
W
 
T
I
 
V
A
 
-
E
 
E
A
 
L
V
 
F
A
 
L
T
 
T
A
 
L
G
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
C
I
 
I
L
 
F
R
 
A
A
 
S
P
 
T
D
 
D
G
 
E
R
 
R

Q96PS8 Aquaporin-10; AQP-10; Aquaglyceroporin-10; Small intestine aquaporin from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
36% identity, 39% coverage: 4:97/241 of query aligns to 20:111/301 of Q96PS8

query
sites
Q96PS8
L
 
L
P
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
C
A
 
L
G
 
A
E
|
E
V
 
F
I
 
L
G
 
G
T
 
V
A
 
F
L
 
V
L
 
L
L
 
M
A
 
-
V
 
-
V
 
L
I
 
L
G
 
T
S
 
Q
G
 
G
I
 
A
M
 
V
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
L
 
V
A
 
T
G
 
S
G
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
G
N
 
N
V
 
F
A
 
F
V
 
T
A
 
M
L
 
F
L
 
L
A
 
A
N
 
G
T
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
V
V
 
T
G
 
I
G
 
A
L
 
I
Y
 
Y
V
 
V
L
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
-
F
x
G
G
 
G
P
 
N
I
 
V
S
|
S
G
 
G
A
 
A
H
|
H
F
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
x
F
S
 
S
M
 
L
V
 
A
M
 
M
A
 
C
V
 
I
K
 
V
G
 
G
E
x
R
L
 
L
P
 
P
R
 
W
Y
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
P
P
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
L
A
 
V
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
S
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6f7hC Crystal structure of human aqp10 (see paper)
36% identity, 39% coverage: 4:97/241 of query aligns to 5:96/253 of 6f7hC

query
sites
6f7hC
L
 
L
P
 
A
R
 
R
Q
 
Q
I
 
C
A
 
L
G
 
A
E
 
E
V
 
F
I
 
L
G
 
G
T
 
V
A
 
F
L
 
V
L
 
L
L
 
M
A
 
-
V
 
-
V
 
L
I
 
L
G
 
T
S
 
Q
G
 
G
I
 
A
M
 
V
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
L
 
V
A
 
T
G
 
S
G
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
K
-
 
G
N
 
N
V
 
F
A
 
F
V
 
T
A
 
M
L
 
F
L
 
L
A
 
A
N
 
G
T
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
V
V
 
T
G
 
I
G
 
A
L
x
I
Y
 
Y
V
 
V
L
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
G
G
 
G
P
 
N
I
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
F
S
 
S
M
 
L
V
 
A
M
 
M
A
 
C
V
 
I
K
 
V
G
 
G
E
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
W
Y
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
P
P
 
I
Y
 
Y
I
 
I
V
 
L
A
 
V
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
S
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P41181 Aquaporin-2; AQP-2; ADH water channel; Aquaporin-CD; AQP-CD; Collecting duct water channel protein; WCH-CD; Water channel protein for renal collecting duct from Homo sapiens (Human) (see 12 papers)
30% identity, 68% coverage: 51:213/241 of query aligns to 51:223/271 of P41181

query
sites
P41181
G
 
G
L
 
I
Y
 
G
V
 
T
L
 
L
I
 
V
E
 
Q
V
 
A
F
 
L
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
|
G
A
 
A
H
 
H
F
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
T
M
 
V
V
 
A
M
 
C
A
 
L
V
 
V
K
x
G
G
x
C
E
 
H
L
 
V
P
 
S
R
 
V
Y
 
L
A
 
R
L
 
A
A
 
A
P
 
F
Y
 
Y
I
 
V
V
 
A
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
A
L
 
L
A
 
L
H
 
H
A
 
E
M
 
I
F
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
R
-
 
G
D
 
D
V
 
L
S
 
A
I
 
V
L
 
N
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
N
K
 
S
M
 
T
R
 
T
S
 
A
G
 
G
P
 
Q
G
 
A
Q
 
V
W
 
T
I
 
V
A
 
-
E
 
E
A
 
L
V
 
F
A
 
L
T
 
T
A
 
L
G
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
C
I
 
I
L
 
F
R
 
A
A
x
S
P
 
T
D
 
D
-
 
E
-
 
R
-
 
R
G
 
G
R
 
E
A
 
N
P
 
P
A
 
G
M
 
T
V
 
P
A
 
A
S
 
L
Y
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
F
A
 
-
Y
 
-
W
 
-
F
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
S
A
 
V
A
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
H
M
 
L
F
 
L
S
 
G
N
 
I
S
 
H
F
 
Y
A
 
T
G
 
G
-
 
C
-
 
S
-
 
M
-
 
N
-
 
P
-
 
A
-
x
R
-
 
S
I
 
L
A
|
A
P
 
P
A
 
A
S
 
V
V
|
V
P
 
T
G
 
G
-
 
K
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
H
-
 
W
-
 
V
F
 
F
V
 
W
L
 
I
A
 
G
E
 
P
L
 
L
L
 
V
G
 
G
A
 
A
C
 
I
I
 
L
G
 
G
L
x
S
L
|
L
L
 
L
H
 
Y
T
 
N
A
x
Y
L
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9SAI4 Aquaporin NIP6-1; NOD26-like intrinsic protein 6-1; AtNIP6;1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
29% identity, 46% coverage: 2:112/241 of query aligns to 76:183/305 of Q9SAI4

query
sites
Q9SAI4
I
 
V
G
 
S
L
 
L
P
 
Y
R
 
R
Q
 
K
I
 
L
A
 
G
G
 
A
E
 
E
V
 
F
I
 
V
G
 
G
T
 
T
A
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
I
A
 
F
V
 
A
V
 
G
I
 
T
G
 
A
S
 
T
G
 
A
I
 
I
M
 
V
A
 
N
E
 
Q
R
 
K
L
 
T
A
 
D
G
 
G
G
 
A
N
 
E
V
 
T
A
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
C
L
 
A
A
 
A
N
 
S
T
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
-
G
x
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
A
V
 
V
L
 
M
I
 
I
E
 
V
V
 
I
F
 
L
-
 
S
-
 
T
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
T
M
 
I
V
 
A
M
 
F
A
 
A
V
 
A
K
 
L
G
 
K
E
 
H
L
 
F
P
 
P
R
 
W
Y
 
K
A
 
H
L
 
V
A
 
P
P
 
V
Y
 
Y
I
 
I
V
 
G
A
 
A
Q
 
Q
L
 
V
A
 
M
G
 
A
A
 
S
V
 
V
L
 
S
G
 
A
A
 
A
W
 
F
L
 
A
A
 
L
H
 
K
A
 
A
M
 
V
F
 
F
D
 
E
V
 
P
S
 
T
I
 
M

Sites not aligning to the query:

P55088 Aquaporin-4; AQP-4; Mercurial-insensitive water channel; MIWC; WCH4 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
26% identity, 51% coverage: 55:176/241 of query aligns to 84:219/323 of P55088

query
sites
P55088
L
 
M
I
 
V
E
 
Q
V
 
C
F
 
F
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
T
M
 
V
V
 
A
M
 
M
A
 
V
V
 
C
K
 
T
G
 
R
E
 
K
L
 
I
P
x
S
R
 
I
Y
 
A
A
 
K
L
 
S
A
 
V
P
 
F
Y
 
Y
I
 
I
V
 
I
A
 
A
Q
 
Q
L
 
C
A
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
W
 
G
L
 
I
A
 
L
H
 
Y
A
 
L
M
 
V
F
 
T
D
 
P
V
 
P
S
 
S
I
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
T
Q
 
T
L
 
V
S
 
H
A
 
G
K
 
N
M
 
L
R
 
T
S
 
A
G
 
G
P
 
H
G
 
G
Q
 
L
W
 
-
I
 
L
A
 
V
E
 
E
A
 
L
V
 
I
A
 
I
T
 
T
A
 
F
G
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
F
V
 
T
I
 
I
L
 
F
R
 
A
A
 
S
P
 
C
D
 
D
G
 
S
R
 
K
A
 
R
P
 
T
A
 
D
M
 
V
V
 
T
A
 
G
S
 
S
Y
 
I
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
G
-
 
F
-
 
S
-
 
V
-
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
H
A
 
L
Y
 
F
W
 
A
F
 
I
T
 
N
A
 
Y
S
 
T
T
 
G
S
 
A
F
 
S
A
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
A
A
 
R
A
 
S
F
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8ct2D Local refinement of aqp1 tetramer (c1; refinement mask included d1 of protein 4.2 and ankyrin-1 ar1-5) in class 2 of erythrocyte ankyrin-1 complex (see paper)
24% identity, 93% coverage: 6:230/241 of query aligns to 10:247/247 of 8ct2D

query
sites
8ct2D
R
 
R
Q
 
A
I
 
V
A
 
V
G
 
A
E
 
E
V
 
F
I
 
L
G
 
A
T
 
T
A
 
T
L
 
L
L
 
F
L
 
V
A
 
F
V
 
I
V
 
S
I
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
A
I
 
-
M
 
L
A
 
G
E
 
F
R
 
K
L
 
Y
A
 
P
G
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
N
A
 
Q
V
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
Q
A
 
D
N
 
N
T
 
V
L
 
K
A
 
V
T
 
S
V
 
L
G
 
A
-
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
S
V
 
I
-
 
A
-
 
T
L
 
L
I
 
A
E
 
Q
V
 
S
F
 
V
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
F
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
T
M
 
L
V
 
G
M
 
L
A
 
L
V
 
L
K
 
S
G
 
C
E
 
Q
L
 
I
P
 
S
R
 
I
Y
 
F
A
 
R
L
 
A
A
 
L
P
 
M
Y
 
Y
I
 
I
V
 
I
A
 
A
Q
 
Q
L
 
C
A
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
V
G
 
A
A
 
T
W
 
A
L
 
I
A
 
L
H
 
S
A
 
G
M
 
I
F
 
T
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
N
D
 
S
V
 
L
S
 
G
I
 
R
L
 
N
Q
 
D
L
 
L
S
 
A
A
 
D
K
 
G
M
 
V
R
 
N
S
 
S
G
|
G
P
 
Q
G
 
G
Q
 
L
W
x
G
I
 
I
A
 
-
E
 
E
A
 
I
V
 
I
A
 
G
T
 
T
A
 
L
G
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
C
I
 
V
L
 
L
R
 
A
A
 
T
P
 
T
D
 
D
G
 
R
R
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
L
M
 
A
V
 
I
A
 
G
S
 
L
Y
 
S
I
 
V
G
 
A
A
 
L
A
 
G
Y
 
H
W
 
L
F
 
L
T
 
A
A
 
I
S
 
D
T
 
Y
S
 
T
F
 
G
A
 
C
-
 
G
-
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
A
 
R
A
 
S
F
 
F
G
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
V
-
 
I
-
 
T
R
 
H
M
 
N
F
 
F
S
 
S
N
 
N
S
 
H
F
 
W
A
 
I
G
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
F
V
 
W
L
 
V
A
 
G
E
 
P
L
 
F
L
 
I
G
 
G
A
 
G
C
 
A
I
 
L
G
 
A
L
 
V
L
 
L
L
 
I
H
 
Y
T
 
D
A
 
F
L
 
I
L
 
L
-
 
A
P
 
P
R
 
R
V
 
S
Q
 
S
E
 
D
Q
 
L
G
 
T
H
 
D
P
 
R
N
 
V
V
 
K
I
 
V
E
 
W
A
 
T
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q

P47863 Aquaporin-4; AQP-4; Mercurial-insensitive water channel; MIWC; WCH4 from Rattus norvegicus (Rat) (see 4 papers)
26% identity, 51% coverage: 55:176/241 of query aligns to 84:219/323 of P47863

query
sites
P47863
L
 
M
I
 
V
E
 
Q
V
 
C
F
 
F
G
 
G
P
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
F
 
I
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
V
S
 
T
M
 
V
V
 
A
M
 
M
A
 
V
V
 
C
K
 
T
G
 
R
E
 
K
L
 
I
P
 
S
R
 
I
Y
 
A
A
 
K
L
 
S
A
 
V
P
 
F
Y
 
Y
I
 
I
V
 
T
A
 
A
Q
 
Q
L
 
C
A
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
W
 
G
L
 
I
A
 
L
H
 
Y
A
 
L
M
 
V
F
 
T
D
 
P
V
 
P
S
 
S
I
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
T
Q
 
T
L
 
V
S
 
H
A
 
G
K
 
N
M
 
L
R
 
T
S
 
A
G
 
G
P
 
H
G
 
G
Q
 
L
W
 
-
I
 
L
A
 
V
E
 
E
A
 
L
V
 
I
A
 
I
T
 
T
A
 
F
G
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
F
V
 
T
I
 
I
L
 
F
R
 
A
A
 
S
P
 
C
D
 
D
G
x
S
R
 
K
A
 
R
P
 
T
A
 
D
M
 
V
V
 
T
A
 
G
S
 
S
Y
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
G
-
 
F
-
 
S
-
 
V
-
 
A
I
 
I
G
 
G
A
x
H
A
 
L
Y
 
F
W
 
A
F
 
I
T
 
N
A
 
Y
S
 
T
T
 
G
S
 
A
F
 
S
A
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
A
A
 
R
A
 
S
F
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>RR42_RS29350 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS29350
MIGLPRQIAGEVIGTALLLAVVIGSGIMAERLAGGNVAVALLANTLATVGGLYVLIEVFG
PISGAHFNPAVSMVMAVKGELPRYALAPYIVAQLAGAVLGAWLAHAMFDVSILQLSAKMR
SGPGQWIAEAVATAGLILVILRAPDGRAPAMVASYIGAAYWFTASTSFANPAAAFGRMFS
NSFAGIAPASVPGFVLAELLGACIGLLLHTALLPRVQEQGHPNVIEASGQQEDSPATGGH
I

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory