SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS31730 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS31730 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4mynA Crystal structure of trypanosoma cruzi formiminoglutamase n114h variant with mn2+2 (see paper)
33% identity, 87% coverage: 42:312/313 of query aligns to 21:291/298 of 4mynA

query
sites
4mynA
V
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
P
C
 
Y
D
 
D
A
 
E
G
 
G
V
 
C
L
 
V
R
 
R
N
 
N
H
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
K
Q
 
K
G
 
G
P
 
P
D
 
A
A
 
A
I
 
F
R
 
R
R
 
F
A
 
F
L
 
L
A
 
Q
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
N
-
 
N
-
 
L
-
 
E
-
 
L
N
 
N
V
 
V
P
 
D
A
 
A
H
 
S
G
 
H
L
 
L
P
 
-
A
 
K
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
G
 
G
N
 
D
V
 
I
I
 
T
C
 
A
E
 
S
D
 
-
D
 
-
A
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
E
A
 
A
Q
 
H
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
E
G
 
S
A
 
K
V
 
V
R
 
F
A
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
A
G
 
R
G
 
G
G
 
A
L
 
F
P
 
P
L
 
F
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
H
|
H
E
 
D
V
 
-
A
 
-
W
 
-
G
 
Q
S
 
S
W
 
A
Q
 
P
G
 
N
L
 
G
R
 
R
A
 
A
H
 
M
L
 
L
D
 
R
A
 
A
-
 
F
A
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
V
G
 
G
R
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
 
V
D
|
D
A
 
S
H
|
H
F
 
L
D
|
D
L
 
V
R
 
R
-
 
P
-
 
P
-
 
L
T
 
S
S
 
D
R
 
G
P
 
R
A
 
V
S
 
H
S
|
S
G
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
R
Q
 
Q
I
 
L
A
 
L
C
 
E
E
 
E
S
 
S
A
 
S
R
 
F
R
 
S
G
 
G
L
 
K
P
 
R
F
 
F
-
 
V
D
 
E
Y
 
F
V
 
A
C
 
C
L
 
Q
G
 
G
V
 
-
S
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
S
R
 
Q
A
 
C
D
 
G
E
 
A
L
 
L
G
 
H
V
 
A
S
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
E
 
R
D
 
D
V
 
H
D
 
Q
-
 
G
-
 
H
-
 
L
-
 
M
-
 
W
L
 
L
Q
 
S
E
 
E
R
 
V
H
 
R
L
 
K
D
 
K
A
 
G
R
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
D
R
 
A
M
 
F
A
 
G
L
 
L
A
 
T
-
 
G
E
 
K
H
 
N
V
 
T
Y
 
F
L
 
F
T
 
S
I
 
F
D
|
D
L
 
V
D
|
D
A
 
S
L
 
L
P
 
K
A
 
S
A
 
S
V
 
D
M
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
S
A
 
C
P
 
P
A
 
A
A
 
A
F
 
V
G
 
G
V
 
L
P
 
S
L
 
A
A
 
Q
V
 
E
V
 
A
E
 
F
A
 
D
L
 
M
V
 
C
G
 
F
E
 
L
V
 
A
R
 
G
R
 
K
S
 
T
G
 
P
K
 
T
L
 
V
R
 
M
V
 
M
A
 
M
D
 
D
L
 
M
A
 
S
E
|
E
Y
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
L
Y
 
V
D
 
E
R
 
-
D
 
E
H
 
Y
Q
 
R
G
 
S
A
 
P
R
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
Y
L
 
M
A
 
F
Y
 
Y
R
 
H
L
 
F
L
 
V

5cevA Arginase from bacillus caldevelox, l-lysine complex (see paper)
27% identity, 86% coverage: 43:312/313 of query aligns to 5:293/298 of 5cevA

query
sites
5cevA
V
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
V
A
 
P
C
 
M
D
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
H
 
Q
G
 
T
R
 
R
A
 
R
G
 
G
A
 
V
A
 
D
Q
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
Y
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
L
 
L
A
 
G
N
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
I
H
 
G
G
 
K
L
 
A
P
 
E
A
 
R
L
 
L
Y
 
H
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
N
 
D
V
 
S
I
 
R
C
 
L
E
 
R
D
 
N
-
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
E
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
L
 
V
D
 
Q
G
 
R
G
 
G
G
 
R
L
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
A
A
 
K
H
 
H
L
 
Y
D
 
E
A
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
L
L
 
G
I
 
V
V
 
I
N
 
W
I
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
V
R
 
N
T
 
T
S
 
A
R
 
E
P
 
T
A
 
S
S
 
P
S
|
S
G
 
G
T
 
N
-
 
I
-
x
H
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
H
-
 
P
P
 
A
F
 
L
D
 
T
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
C
 
G
E
 
Y
S
 
S
A
 
P
R
 
K
R
 
I
G
 
K
L
 
-
P
 
P
F
 
E
D
 
H
Y
 
V
V
 
V
C
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
R
R
 
S
L
 
L
A
 
D
N
 
E
T
 
G
P
 
E
A
 
K
L
 
K
F
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
E
D
 
K
E
 
G
L
 
I
G
 
K
V
 
I
S
 
Y
Y
 
T
V
 
M
E
 
H
D
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
R
-
 
L
-
 
G
Q
 
M
E
 
T
R
 
R
H
 
V
L
 
M
D
 
E
A
 
E
R
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
R
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
T
E
 
D
H
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
A
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
S
V
 
D
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
I
F
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
Y
A
 
R
V
 
E
V
 
S
E
x
H
A
 
L
L
 
A
V
 
M
G
x
E
E
 
M
V
 
L
R
 
A
R
 
E
S
 
A
G
 
Q
K
 
I
L
 
I
R
 
T
V
 
S
A
 
A
D
 
E
L
 
F
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
Y
 
L
D
 
D
R
 
E
D
 
R
H
 
N
Q
 
K
G
 
T
A
 
A
R
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
L
A
 
M
Y
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
F

4cevA Arginase from bacillus caldevelox, l-ornithine complex (see paper)
27% identity, 86% coverage: 43:312/313 of query aligns to 5:293/298 of 4cevA

query
sites
4cevA
V
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
V
A
 
P
C
 
M
D
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
H
 
Q
G
 
T
R
 
R
A
 
R
G
 
G
A
 
V
A
 
D
Q
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
Y
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
L
 
L
A
 
G
N
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
I
H
 
G
G
 
K
L
 
A
P
 
E
A
 
R
L
 
L
Y
 
H
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
N
 
D
V
 
S
I
 
R
C
 
L
E
 
R
D
 
N
-
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
E
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
L
 
V
D
 
Q
G
 
R
G
 
G
G
 
R
L
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
A
A
 
K
H
 
H
L
 
Y
D
 
E
A
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
L
L
 
G
I
 
V
V
 
I
N
 
W
I
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
V
R
 
N
T
 
T
S
 
A
R
 
E
P
 
T
A
 
S
S
 
P
S
|
S
G
 
G
T
 
N
-
 
I
-
x
H
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
H
-
 
P
P
 
A
F
 
L
D
 
T
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
C
 
G
E
 
Y
S
 
S
A
 
P
R
 
K
R
 
I
G
 
K
L
 
-
P
 
P
F
 
E
D
 
H
Y
 
V
V
 
V
C
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
R
R
 
S
L
 
L
A
x
D
N
 
E
T
 
G
P
 
E
A
 
K
L
 
K
F
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
E
D
 
K
E
 
G
L
 
I
G
 
K
V
 
I
S
 
Y
Y
 
T
V
 
M
E
 
H
D
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
R
-
 
L
-
 
G
Q
 
M
E
 
T
R
 
R
H
 
V
L
 
M
D
 
E
A
 
E
R
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
R
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
T
E
 
D
H
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
A
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
S
V
 
D
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
I
F
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
Y
A
 
R
V
 
E
V
 
S
E
x
H
A
 
L
L
 
A
V
 
M
G
x
E
E
 
M
V
 
L
R
 
A
R
 
E
S
 
A
G
 
Q
K
 
I
L
 
I
R
 
T
V
 
S
A
 
A
D
 
E
L
 
F
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
Y
 
L
D
 
D
R
 
E
D
 
R
H
 
N
Q
 
K
G
 
T
A
 
A
R
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
L
A
 
M
Y
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
F

3cevA Arginase from bacillus caldevelox, complexed with l-arginine (see paper)
27% identity, 86% coverage: 43:312/313 of query aligns to 5:293/298 of 3cevA

query
sites
3cevA
V
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
V
A
 
P
C
 
M
D
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
H
 
Q
G
 
T
R
 
R
A
 
R
G
 
G
A
 
V
A
 
D
Q
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
Y
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
L
 
L
A
 
G
N
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
I
H
 
G
G
 
K
L
 
A
P
 
E
A
 
R
L
 
L
Y
 
H
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
N
 
D
V
 
S
I
 
R
C
 
L
E
 
R
D
 
N
-
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
E
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
L
 
V
D
 
Q
G
 
R
G
 
G
G
 
R
L
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
A
A
 
K
H
 
H
L
 
Y
D
 
E
A
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
L
L
 
G
I
 
V
V
 
I
N
 
W
I
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
V
R
 
N
T
 
T
S
 
A
R
 
E
P
 
T
A
 
S
S
 
P
S
|
S
G
 
G
T
 
N
-
 
I
-
x
H
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
H
-
 
P
P
 
A
F
 
L
D
 
T
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
C
 
G
E
 
Y
S
 
S
A
 
P
R
 
K
R
 
I
G
 
K
L
 
-
P
 
P
F
 
E
D
 
H
Y
 
V
V
 
V
C
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
R
R
 
S
L
 
L
A
 
D
N
 
E
T
 
G
P
 
E
A
 
K
L
 
K
F
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
E
D
 
K
E
 
G
L
 
I
G
 
K
V
 
I
S
 
Y
Y
 
T
V
 
M
E
 
H
D
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
R
-
 
L
-
 
G
Q
 
M
E
 
T
R
 
R
H
 
V
L
 
M
D
 
E
A
 
E
R
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
R
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
T
E
 
D
H
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
A
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
S
V
 
D
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
I
F
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
Y
A
 
R
V
 
E
V
 
S
E
x
H
A
 
L
L
 
A
V
 
M
G
x
E
E
 
M
V
 
L
R
 
A
R
 
E
S
 
A
G
 
Q
K
 
I
L
 
I
R
 
T
V
 
S
A
 
A
D
 
E
L
 
F
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
Y
 
L
D
 
D
R
 
E
D
 
R
H
 
N
Q
 
K
G
 
T
A
 
A
R
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
L
A
 
M
Y
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
F

Sites not aligning to the query:

2cevB Arginase from bacillus caldevelox, native structure at ph 8.5 (see paper)
27% identity, 86% coverage: 43:312/313 of query aligns to 5:293/298 of 2cevB

query
sites
2cevB
V
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
V
A
 
P
C
 
M
D
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
H
 
Q
G
 
T
R
 
R
A
 
R
G
 
G
A
 
V
A
 
D
Q
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
Y
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
L
 
L
A
 
G
N
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
I
H
 
G
G
 
K
L
 
A
P
 
E
A
 
R
L
 
L
Y
 
H
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
N
 
D
V
 
S
I
 
R
C
 
L
E
 
R
D
 
N
-
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
E
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
L
 
V
D
 
Q
G
 
R
G
 
G
G
 
R
L
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
A
A
 
K
H
 
H
L
 
Y
D
 
E
A
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
L
L
 
G
I
 
V
V
 
I
N
 
W
I
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
V
R
 
N
T
 
T
S
 
A
R
 
E
P
 
T
A
 
S
S
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
N
-
 
I
-
x
H
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
H
-
 
P
P
 
A
F
 
L
D
 
T
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
C
 
G
E
 
Y
S
 
S
A
 
P
R
 
K
R
 
I
G
 
K
L
 
-
P
 
P
F
 
E
D
 
H
Y
 
V
V
 
V
C
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
R
R
 
S
L
 
L
A
 
D
N
 
E
T
 
G
P
 
E
A
 
K
L
 
K
F
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
E
D
 
K
E
 
G
L
 
I
G
 
K
V
 
I
S
 
Y
Y
 
T
V
 
M
E
 
H
D
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
R
-
 
L
-
 
G
Q
 
M
E
 
T
R
 
R
H
 
V
L
 
M
D
 
E
A
 
E
R
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
R
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
T
E
 
D
H
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
A
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
S
V
 
D
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
I
F
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
Y
A
 
R
V
 
E
V
 
S
E
x
H
A
 
L
L
 
A
V
 
M
G
x
E
E
 
M
V
 
L
R
 
A
R
 
E
S
 
A
G
 
Q
K
 
I
L
 
I
R
 
T
V
 
S
A
 
A
D
 
E
L
 
F
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
Y
 
L
D
 
D
R
 
E
D
 
R
H
 
N
Q
 
K
G
 
T
A
 
A
R
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
L
A
 
M
Y
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
F

1cevA Arginase from bacillus caldovelox, native structure at ph 5.6 (see paper)
27% identity, 86% coverage: 43:312/313 of query aligns to 6:294/299 of 1cevA

query
sites
1cevA
V
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
V
A
 
P
C
 
M
D
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
H
 
Q
G
 
T
R
 
R
A
 
R
G
 
G
A
 
V
A
 
D
Q
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
Y
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
L
 
L
A
 
G
N
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
I
H
 
G
G
 
K
L
 
A
P
 
E
A
 
R
L
 
L
Y
 
H
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
N
 
D
V
 
S
I
 
R
C
 
L
E
 
R
D
 
N
-
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
E
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
L
 
V
D
 
Q
G
 
R
G
 
G
G
 
R
L
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
A
A
 
K
H
 
H
L
 
Y
D
 
E
A
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
L
L
 
G
I
 
V
V
 
I
N
 
W
I
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
V
R
 
N
T
 
T
S
 
A
R
 
E
P
 
T
A
 
S
S
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
N
-
 
I
-
x
H
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
H
-
 
P
P
 
A
F
 
L
D
 
T
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
C
 
G
E
 
Y
S
 
S
A
 
P
R
 
K
R
 
I
G
 
K
L
 
-
P
 
P
F
 
E
D
 
H
Y
 
V
V
 
V
C
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
R
R
 
S
L
 
L
A
 
D
N
 
E
T
 
G
P
 
E
A
 
K
L
 
K
F
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
E
D
 
K
E
 
G
L
 
I
G
 
K
V
 
I
S
 
Y
Y
 
T
V
 
M
E
 
H
D
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
R
-
 
L
-
 
G
Q
 
M
E
 
T
R
 
R
H
 
V
L
 
M
D
 
E
A
 
E
R
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
R
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
T
E
 
D
H
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
A
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
S
V
 
D
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
I
F
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
Y
A
 
R
V
 
E
V
 
S
E
 
H
A
 
L
L
 
A
V
 
M
G
 
E
E
 
M
V
 
L
R
 
A
R
 
E
S
 
A
G
 
Q
K
 
I
L
 
I
R
 
T
V
 
S
A
 
A
D
 
E
L
 
F
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
Y
 
L
D
 
D
R
 
E
D
 
R
H
 
N
Q
 
K
G
 
T
A
 
A
R
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
L
A
 
M
Y
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
F

P53608 Arginase; EC 3.5.3.1 from Bacillus caldovelox (see paper)
27% identity, 86% coverage: 43:312/313 of query aligns to 6:294/299 of P53608

query
sites
P53608
V
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
V
A
 
P
C
 
M
D
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
H
 
Q
G
 
T
R
 
R
A
 
R
G
 
G
A
 
V
A
 
D
Q
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
Y
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
L
 
L
A
 
G
N
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
I
H
 
G
G
 
K
L
 
A
P
 
E
A
 
R
L
 
L
Y
 
H
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
N
 
D
V
 
S
I
 
R
C
 
L
E
 
R
D
 
N
-
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
E
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
V
R
 
D
A
 
Q
V
 
V
L
 
V
D
 
Q
G
 
R
G
 
G
G
 
R
L
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
V
R
 
A
A
 
K
H
 
H
L
 
Y
D
 
E
A
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
L
L
 
G
I
 
V
V
 
I
N
 
W
I
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
x
G
D
|
D
L
x
V
R
x
N
T
 
T
S
 
A
R
 
E
P
 
T
A
 
S
S
 
P
S
|
S
G
|
G
T
x
N
-
 
I
-
 
H
-
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
H
-
 
P
P
 
A
F
 
L
D
 
T
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
C
 
G
E
 
Y
S
 
S
A
 
P
R
 
K
R
 
I
G
 
K
L
 
-
P
 
P
F
 
E
D
 
H
Y
 
V
V
 
V
C
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
R
R
 
S
L
 
L
A
x
D
N
 
E
T
 
G
P
 
E
A
 
K
L
 
K
F
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
E
D
 
K
E
 
G
L
 
I
G
 
K
V
 
I
S
 
Y
Y
 
T
V
 
M
E
 
H
D
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
R
-
 
L
-
 
G
Q
 
M
E
 
T
R
 
R
H
 
V
L
 
M
D
 
E
A
 
E
R
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
R
 
K
E
 
E
R
 
R
M
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
T
E
 
D
H
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
A
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
S
V
 
D
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
x
T
P
 
P
A
 
V
A
 
I
F
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
Y
A
 
R
V
 
E
V
 
S
E
 
H
A
 
L
L
 
A
V
 
M
G
 
E
E
 
M
V
 
L
R
 
A
R
 
E
S
 
A
G
 
Q
K
 
I
L
 
I
R
 
T
V
 
S
A
 
A
D
 
E
L
 
F
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
Y
 
L
D
 
D
R
 
E
D
 
R
H
 
N
Q
 
K
G
 
T
A
 
A
R
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
A
L
 
L
A
 
M
Y
 
G
R
 
S
L
 
L
L
 
F

6dktE Crystal structure of arginase from bacillus subtilis
26% identity, 86% coverage: 43:312/313 of query aligns to 5:263/268 of 6dktE

query
sites
6dktE
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
M
A
 
P
C
 
M
D
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
H
 
Q
G
 
A
R
 
R
A
 
R
G
 
G
A
 
V
A
 
D
Q
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
L
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
H
 
H
G
 
L
L
 
I
P
 
E
A
 
R
L
 
L
Y
 
S
D
 
D
A
 
M
G
 
G
N
 
Y
V
 
T
I
 
V
C
 
-
E
 
E
D
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
I
D
 
N
A
 
S
L
 
V
E
 
L
A
 
A
A
 
G
Q
 
N
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
Q
A
 
K
V
 
V
R
 
N
A
 
K
V
 
V
L
 
I
D
 
E
G
 
E
G
 
K
G
 
K
L
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
T
R
 
A
A
 
K
H
 
H
L
 
Y
D
 
D
A
 
N
A
 
L
G
 
G
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
V
V
 
I
N
x
W
I
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
L
R
 
N
T
 
M
S
 
P
R
 
L
P
 
A
A
 
V
S
 
S
S
 
L
G
 
G
T
 
I
P
 
G
F
 
H
D
 
E
Q
 
S
I
 
L
A
 
V
C
 
N
E
 
L
S
 
E
-
 
G
-
 
Y
A
 
A
R
 
P
R
 
K
G
 
I
L
 
K
P
 
P
F
 
E
D
 
N
Y
 
V
V
 
V
C
 
I
L
 
I
G
 
G
V
 
A
S
 
R
R
 
S
L
 
L
A
 
D
N
 
E
T
 
G
P
 
E
A
 
R
L
 
K
F
 
Y
A
 
I
R
 
K
A
 
E
D
 
S
E
 
G
L
 
M
G
 
K
V
 
V
S
 
Y
Y
 
T
V
 
M
E
 
H
D
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
-
Q
 
-
E
 
R
R
 
L
H
 
G
L
 
M
D
 
T
A
 
K
R
 
V
L
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
T
R
 
L
E
 
D
R
 
Y
M
 
L
A
 
S
L
 
A
A
 
C
E
 
D
H
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
A
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
N
V
 
D
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
F
 
G
G
 
G
V
 
I
P
 
S
L
 
Y
A
 
R
V
 
E
V
 
S
E
 
H
A
 
L
L
 
A
V
 
M
G
 
E
E
 
M
V
 
L
R
 
Y
R
 
D
S
 
A
G
 
G
K
 
I
L
 
I
R
 
T
V
 
S
A
 
A
D
 
E
L
 
F
A
 
V
E
 
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
Y
 
L
D
 
D
R
 
H
D
 
K
H
 
N
Q
 
K
G
 
T
A
 
G
R
 
K
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
E
L
 
L
A
 
V
Y
 
E
R
 
S
L
 
L
L
 
L

3pzlB The crystal structure of agmatine ureohydrolase of thermoplasma volcanium
26% identity, 82% coverage: 58:313/313 of query aligns to 39:283/293 of 3pzlB

query
sites
3pzlB
R
 
R
A
 
R
G
 
G
A
 
S
A
 
K
Q
 
Y
G
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
S
I
 
I
R
 
R
R
 
G
A
 
A
L
 
Y
A
 
V
N
 
N
V
 
L
P
 
E
A
 
S
H
 
Y
G
 
E
L
 
Y
P
 
S
-
 
Y
-
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
S
A
 
G
L
 
M
Y
 
A
D
 
D
A
 
L
G
 
G
N
 
D
V
 
-
I
 
M
C
 
E
E
 
E
D
 
S
D
 
E
A
 
D
L
 
V
E
 
E
A
 
Y
A
 
V
Q
 
I
E
 
D
R
 
T
L
 
V
A
 
E
G
 
S
A
 
V
V
 
V
R
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
M
D
 
S
G
 
D
G
 
G
G
 
K
L
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
M
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
E
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
T
W
 
V
G
 
G
S
 
A
W
 
V
Q
 
R
G
 
A
L
 
L
R
 
P
A
 
K
H
 
D
L
 
V
D
 
D
A
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
L
V
 
V
N
 
I
I
 
V
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
S
D
|
D
L
 
F
R
 
R
T
 
S
S
 
S
R
 
Y
P
 
-
A
 
-
S
 
-
S
 
M
G
 
G
T
 
N
P
 
K
F
 
Y
D
 
N
Q
x
H
I
 
-
A
 
A
C
 
C
E
 
V
S
 
T
A
 
-
R
 
R
R
 
R
G
 
A
L
 
L
P
 
D
F
 
-
D
 
-
Y
 
-
V
 
-
C
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
E
S
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
T
N
 
S
-
 
I
-
 
G
-
 
I
-
 
R
-
 
S
-
 
V
T
 
S
P
 
R
A
 
E
L
 
E
F
 
F
A
 
E
R
 
D
A
 
P
D
 
D
E
 
F
L
 
R
G
 
K
V
 
V
S
 
S
Y
 
F
V
 
I
E
 
S
D
 
S
V
 
F
D
 
D
L
 
V
Q
 
K
E
 
K
R
 
N
H
 
G
L
 
I
D
 
D
A
 
K
R
 
Y
L
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
V
R
 
D
E
 
R
R
 
K
M
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
S
E
 
R
H
 
R
V
 
V
Y
 
Y
L
 
I
T
 
S
I
 
V
D
|
D
L
 
M
D
|
D
A
 
G
L
 
I
P
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
Y
M
 
A
P
 
P
G
 
A
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
L
P
 
A
L
 
D
A
 
T
V
 
D
V
 
V
E
 
R
A
 
R
L
 
L
V
 
I
G
 
E
E
 
-
V
 
-
R
 
R
R
 
L
S
 
S
G
 
Y
K
 
K
L
 
A
R
 
V
V
 
G
A
 
F
D
 
D
L
 
I
A
 
V
E
|
E
Y
 
F
N
 
S
P
 
P
S
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
-
D
 
N
H
 
G
Q
 
N
G
 
T
A
 
S
R
 
M
V
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
K
L
 
L
A
 
L
Y
 
Q
R
 
V
L
 
F
L
 
I
A
 
A

6dktA Crystal structure of arginase from bacillus subtilis
26% identity, 86% coverage: 43:312/313 of query aligns to 5:278/283 of 6dktA

query
sites
6dktA
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
M
A
 
P
C
 
M
D
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
H
 
Q
G
 
A
R
 
R
A
 
R
G
 
G
A
 
V
A
 
D
Q
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
L
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
H
 
H
G
 
L
L
 
I
P
 
E
A
 
R
L
 
L
Y
 
S
D
 
D
A
 
M
G
 
G
N
 
Y
V
 
T
I
 
V
C
 
-
E
 
E
D
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
N
-
 
L
D
 
N
A
 
S
L
 
V
E
 
L
A
 
A
A
 
G
Q
 
N
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
Q
A
 
K
V
 
V
R
 
N
A
 
K
V
 
V
L
 
I
D
 
E
G
 
E
G
 
K
G
 
K
L
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
T
R
 
A
A
 
K
H
 
H
L
 
Y
D
 
D
A
 
N
A
 
L
G
 
G
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
V
V
 
I
N
x
W
I
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
L
R
 
N
T
 
T
S
 
L
R
 
E
P
 
T
A
 
S
S
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
N
P
 
I
F
 
H
D
 
G
Q
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
G
I
 
I
A
 
G
C
 
H
E
 
E
S
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
N
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
A
 
A
R
 
P
R
 
K
G
 
I
L
 
K
P
 
P
F
 
E
D
 
N
Y
 
V
V
 
V
C
 
I
L
 
I
G
 
G
V
 
A
S
 
R
R
 
S
L
 
L
A
 
D
N
 
E
T
 
G
P
 
E
A
 
R
L
 
K
F
 
Y
A
 
I
R
 
K
A
 
E
D
 
S
E
 
G
L
 
M
G
 
K
V
 
V
S
 
Y
Y
 
T
V
 
M
E
 
H
D
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
-
Q
 
-
E
 
R
R
 
L
H
 
G
L
 
M
D
 
T
A
 
K
R
 
V
L
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
T
R
 
L
E
 
D
R
 
Y
M
 
L
A
 
S
L
 
A
A
 
C
E
 
D
H
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
A
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
N
V
 
D
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
F
 
G
G
 
G
V
 
I
P
 
S
L
 
Y
A
 
R
V
 
E
V
 
S
E
 
H
A
 
L
L
 
A
V
 
M
G
 
E
E
 
M
V
 
L
R
 
Y
R
 
D
S
 
A
G
 
G
K
 
I
L
 
I
R
 
T
V
 
S
A
 
A
D
 
E
L
 
F
A
 
V
E
 
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
Y
 
L
D
 
D
R
 
H
D
 
K
H
 
N
Q
 
K
G
 
T
A
 
G
R
 
K
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
E
L
 
L
A
 
V
Y
 
E
R
 
S
L
 
L
L
 
L

6nfpD 1.7 angstrom resolution crystal structure of arginase from bacillus subtilis subsp. Subtilis str. 168
25% identity, 86% coverage: 43:312/313 of query aligns to 8:284/289 of 6nfpD

query
sites
6nfpD
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
M
A
 
P
C
 
M
D
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
H
 
Q
G
 
A
R
 
R
A
 
R
G
 
G
A
 
V
A
 
D
Q
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
L
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
H
 
H
G
 
L
L
 
I
P
 
E
A
 
R
L
 
L
Y
 
S
D
 
D
A
 
M
G
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
I
N
 
N
V
 
E
I
 
L
C
 
K
E
 
N
D
 
L
D
 
N
A
 
S
L
 
V
E
 
L
A
 
A
A
 
G
Q
 
N
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
Q
A
 
K
V
 
V
R
 
N
A
 
K
V
 
V
L
 
I
D
 
E
G
 
E
G
 
K
G
 
K
L
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
T
R
 
A
A
 
K
H
 
H
L
 
Y
D
 
D
A
 
N
A
 
L
G
 
G
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
V
V
 
I
N
 
W
I
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
L
R
 
N
T
 
T
S
 
L
R
 
E
P
 
T
A
 
S
S
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
N
P
 
I
F
 
H
D
 
G
Q
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
G
I
 
I
A
 
G
C
 
H
E
 
E
S
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
N
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
A
 
A
R
 
P
R
 
K
G
 
I
L
 
K
P
 
P
F
 
E
D
 
N
Y
 
V
V
 
V
C
 
I
L
 
I
G
 
G
V
 
A
S
 
R
R
 
S
L
 
L
A
 
D
N
 
E
T
 
G
P
 
E
A
 
R
L
 
K
F
 
Y
A
 
I
R
 
K
A
 
E
D
 
S
E
 
G
L
 
M
G
 
K
V
 
V
S
 
Y
Y
 
T
V
 
M
E
 
H
D
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
-
Q
 
-
E
 
R
R
 
L
H
 
G
L
 
M
D
 
T
A
 
K
R
 
V
L
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
T
R
 
L
E
 
D
R
 
Y
M
 
L
A
 
S
L
 
A
A
 
C
E
 
D
H
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
A
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
N
V
 
D
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
F
 
G
G
 
G
V
 
I
P
 
S
L
x
Y
A
 
R
V
 
E
V
 
S
E
 
H
A
 
L
L
 
A
V
 
M
G
 
E
E
 
M
V
 
L
R
 
Y
R
 
D
S
 
A
G
 
G
K
 
I
L
 
I
R
 
T
V
 
S
A
 
A
D
 
E
L
 
F
A
 
V
E
 
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
Y
 
L
D
 
D
R
 
H
D
 
K
H
 
N
Q
 
K
G
 
T
A
 
G
R
 
K
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
x
E
L
 
L
A
 
V
Y
 
E
R
 
S
L
 
L
L
 
L

6nfpA 1.7 angstrom resolution crystal structure of arginase from bacillus subtilis subsp. Subtilis str. 168
25% identity, 86% coverage: 43:312/313 of query aligns to 5:287/292 of 6nfpA

query
sites
6nfpA
V
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
M
A
 
P
C
 
M
D
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
H
 
Q
G
 
A
R
 
R
A
 
R
G
 
G
A
 
V
A
 
D
Q
 
M
G
 
G
P
 
P
D
 
S
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
L
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
H
 
H
G
 
L
L
 
I
P
 
E
A
 
R
L
 
L
Y
 
S
D
 
D
A
 
M
G
 
G
N
 
Y
V
 
T
I
 
V
C
 
E
E
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
I
-
 
N
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
I
D
 
D
D
 
E
A
 
E
L
 
L
E
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
G
Q
 
N
E
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
Q
A
 
K
V
 
V
R
 
N
A
 
K
V
 
V
L
 
I
D
 
E
G
 
E
G
 
K
G
 
K
L
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
I
A
 
A
W
 
I
G
 
G
S
 
T
W
 
L
Q
 
A
G
 
G
L
 
T
R
 
A
A
 
K
H
 
H
L
 
Y
D
 
D
A
 
N
A
 
L
G
 
G
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
V
V
 
I
N
 
W
I
 
Y
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
L
R
 
N
T
 
T
S
 
L
R
 
E
P
 
T
A
 
S
S
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
N
P
 
I
F
 
H
D
 
G
Q
 
M
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
G
I
 
I
A
 
G
C
 
H
E
 
E
S
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
N
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
A
 
A
R
 
P
R
 
K
G
 
I
L
 
K
P
 
P
F
 
E
D
 
N
Y
 
V
V
 
V
C
 
I
L
 
I
G
 
G
V
 
A
S
 
R
R
 
S
L
 
L
A
 
D
N
 
E
T
 
G
P
 
E
A
 
R
L
 
K
F
 
Y
A
 
I
R
 
K
A
 
E
D
 
S
E
 
G
L
 
M
G
 
K
V
 
V
S
 
Y
Y
 
T
V
 
M
E
 
H
D
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
-
Q
 
-
E
 
R
R
 
L
H
 
G
L
 
M
D
 
T
A
 
K
R
 
V
L
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
T
R
 
L
E
 
D
R
 
Y
M
 
L
A
 
S
L
 
A
A
 
C
E
 
D
H
 
G
V
 
V
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
L
D
|
D
A
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
N
V
 
D
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
F
 
G
G
 
G
V
 
I
P
 
S
L
 
Y
A
 
R
V
 
E
V
 
S
E
 
H
A
 
L
L
 
A
V
 
M
G
 
E
E
 
M
V
 
L
R
 
Y
R
 
D
S
 
A
G
 
G
K
 
I
L
 
I
R
 
T
V
 
S
A
 
A
D
 
E
L
 
F
A
 
V
E
 
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
Y
 
L
D
 
D
R
 
H
D
 
K
H
 
N
Q
 
K
G
 
T
A
 
G
R
 
K
V
 
T
A
 
A
A
 
V
R
 
E
L
 
L
A
 
V
Y
 
E
R
 
S
L
 
L
L
 
L

1wogA Crystal structure of agmatinase reveals structural conservation and inhibition mechanism of the ureohydrolase superfamily (see paper)
29% identity, 81% coverage: 58:312/313 of query aligns to 43:295/303 of 1wogA

query
sites
1wogA
R
 
R
A
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
R
Q
 
F
G
 
A
P
 
P
D
 
R
A
 
A
I
 
L
R
 
R
R
 
E
A
 
A
-
 
S
L
 
L
A
 
R
N
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
P
H
 
F
-
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
R
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
V
A
 
T
L
 
F
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
G
N
 
D
V
 
V
I
 
I
C
 
L
E
 
P
D
 
S
D
 
L
A
 
E
L
 
P
E
 
Q
A
 
L
A
 
A
Q
 
H
E
 
D
R
 
R
L
 
I
A
 
T
G
 
E
A
 
A
V
 
A
R
 
R
A
 
Q
V
 
V
L
 
R
D
 
G
G
 
R
G
 
C
G
 
R
L
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
V
A
 
-
W
 
-
G
 
-
S
 
S
W
 
Y
Q
 
P
G
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
H
 
F
L
 
A
D
 
D
A
 
V
A
 
P
G
 
D
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
H
I
 
V
V
 
V
N
 
Q
I
 
L
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
L
D
|
D
L
 
F
R
 
T
T
 
D
S
 
T
R
 
R
-
 
N
-
 
D
-
 
T
P
 
K
A
 
W
S
 
S
S
x
N
G
x
S
T
 
S
P
 
P
F
 
F
D
 
R
Q
 
R
I
 
-
A
 
A
C
 
C
E
 
E
S
 
A
A
 
L
R
 
P
R
 
N
G
 
L
L
 
V
P
 
H
F
 
I
D
 
T
Y
 
T
V
 
V
C
 
G
L
 
L
G
 
R
V
 
G
S
 
L
R
 
R
L
 
F
A
 
D
N
 
P
T
 
E
P
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
R
E
 
G
L
 
H
G
 
T
V
 
I
S
 
I
Y
 
P
V
 
M
E
 
D
D
 
D
V
 
V
D
 
T
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
A
R
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
V
R
 
L
E
 
A
R
 
Q
M
 
L
A
 
P
L
 
R
A
 
G
E
 
Q
H
 
N
V
 
V
Y
 
Y
L
 
F
T
 
S
I
 
V
D
|
D
L
 
V
D
|
D
A
 
G
L
 
F
P
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
V
M
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
T
S
 
S
A
 
S
P
 
P
A
 
E
A
 
P
F
 
D
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
Y
A
 
A
V
 
Q
V
 
G
E
 
M
A
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
A
E
 
A
V
 
A
R
 
A
R
 
A
S
 
N
G
 
N
K
 
T
L
 
V
R
 
V
V
 
G
A
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
V
E
|
E
Y
 
L
N
 
A
P
 
P
S
 
N
Y
 
L
D
 
D
R
 
P
D
 
T
H
 
G
Q
 
R
G
 
S
A
 
E
R
 
L
V
 
L
A
 
M
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
V
Y
 
M
R
 
E
L
 
T
L
 
L

Q9I6K2 Guanidinopropionase; EC 3.5.3.17 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
28% identity, 86% coverage: 43:312/313 of query aligns to 39:307/318 of Q9I6K2

query
sites
Q9I6K2
V
 
L
V
 
I
G
 
G
F
 
V
A
 
P
C
 
W
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
T
L
 
T
R
 
N
N
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
R
Q
 
H
G
 
G
P
 
P
D
 
R
A
 
E
I
 
V
R
 
R
R
 
N
A
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
M
-
 
R
-
 
K
-
 
V
-
 
H
-
 
H
L
 
V
A
 
S
N
 
R
V
 
I
P
 
A
A
 
P
H
 
Y
G
 
D
L
 
L
P
 
V
A
 
R
L
 
V
Y
 
G
D
 
D
A
 
L
G
 
G
N
 
D
V
 
A
I
 
P
C
 
V
E
 
N
D
 
P
D
 
I
A
 
D
L
 
L
E
 
L
A
 
D
A
 
S
Q
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
I
A
 
E
G
 
G
A
 
F
V
 
Y
R
 
R
A
 
Q
V
 
V
L
 
H
D
 
A
G
 
A
G
 
G
G
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
S
L
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
L
V
 
V
A
 
T
W
 
L
G
 
P
S
 
I
W
 
F
Q
 
R
G
 
A
L
 
L
R
 
-
A
 
-
H
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
R
G
 
E
G
 
R
R
 
P
L
 
L
L
 
G
I
 
M
V
 
V
N
 
H
I
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
S
D
|
D
L
 
T
R
 
N
T
 
D
-
 
R
-
x
Y
-
 
F
-
 
G
S
 
D
R
 
N
P
 
P
A
 
Y
S
 
T
S
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
R
Q
 
R
I
 
A
A
 
I
C
 
E
E
 
E
S
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
D
P
 
P
F
 
L
D
 
R
Y
 
T
V
 
V
C
 
Q
L
 
I
G
 
G
V
 
I
S
 
R
R
 
G
L
 
S
A
 
V
N
 
Y
T
 
S
P
 
P
A
 
D
L
 
D
F
 
D
A
 
A
R
 
F
A
 
A
D
 
R
E
 
E
L
 
C
G
 
G
V
 
I
S
 
R
Y
 
V
V
 
I
E
 
H
D
 
M
V
 
E
D
 
E
L
 
F
Q
 
V
E
 
E
R
 
L
H
 
G
L
 
V
D
 
E
A
 
A
R
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
E
L
 
A
R
 
R
E
 
-
R
 
R
M
 
V
A
 
V
L
 
G
A
 
A
E
 
G
H
 
P
V
 
T
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
I
 
F
D
|
D
L
 
V
D
|
D
A
 
V
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
F
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
T
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
I
F
 
G
G
 
G
V
 
M
P
 
T
L
 
S
A
 
L
V
 
Q
V
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
V
 
V
G
 
R
E
 
G
V
 
L
R
 
-
R
 
R
S
 
G
G
 
L
K
 
D
L
 
L
R
 
V
V
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
V
A
 
V
E
 
E
Y
 
V
N
 
S
P
 
P
S
 
P
Y
 
F
D
 
D
R
 
V
D
 
G
H
 
G
Q
 
A
G
 
T
A
 
A
R
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
A
R
 
T
L
 
M
A
 
M
Y
 
F
R
 
E
L
 
L
L
 
L

3nipB Crystal structure of pseudomonas aeruginosa guanidinopropionase complexed with 1,6-diaminohexane (see paper)
28% identity, 86% coverage: 43:312/313 of query aligns to 37:305/316 of 3nipB

query
sites
3nipB
V
 
L
V
 
I
G
 
G
F
 
V
A
 
P
C
 
W
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
T
L
 
T
R
 
N
N
 
-
H
 
-
G
 
-
R
|
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
R
Q
 
H
G
 
G
P
 
P
D
 
R
A
 
E
I
 
V
R
 
R
R
 
N
A
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
M
-
 
R
-
 
K
-
 
V
-
 
H
-
 
H
L
 
V
A
 
S
N
 
R
V
 
I
P
 
A
A
 
P
H
 
Y
G
 
D
L
 
L
P
 
V
A
 
R
L
 
V
Y
 
G
D
 
D
A
 
L
G
 
G
N
 
D
V
 
A
I
 
P
C
 
V
E
 
N
D
 
P
D
 
I
A
 
D
L
 
L
E
 
L
A
 
D
A
 
S
Q
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
I
A
 
E
G
 
G
A
 
F
V
 
Y
R
 
R
A
 
Q
V
 
V
L
 
H
D
 
A
G
 
A
G
 
G
G
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
S
L
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
L
V
 
V
A
 
T
W
 
L
G
 
P
S
 
I
W
 
F
Q
 
R
G
 
A
L
 
L
R
 
-
A
 
-
H
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
R
G
 
E
G
 
R
R
 
P
L
 
L
L
 
G
I
 
M
V
 
V
N
 
H
I
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
S
D
|
D
L
 
T
R
 
N
T
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
F
-
 
G
S
 
D
R
 
N
P
 
P
A
 
Y
S
 
T
S
x
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
R
Q
 
R
I
 
A
A
 
I
C
 
E
E
 
E
S
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
D
P
 
P
F
 
L
D
 
R
Y
 
T
V
 
V
C
 
Q
L
 
I
G
 
G
V
 
I
S
 
R
R
 
G
L
 
S
A
 
V
N
 
Y
T
 
S
P
 
P
A
 
D
L
 
D
F
 
D
A
 
A
R
 
F
A
 
A
D
 
R
E
 
E
L
 
C
G
 
G
V
 
I
S
 
R
Y
 
V
V
 
I
E
 
H
D
 
M
V
 
E
D
 
E
L
 
F
Q
 
V
E
 
E
R
 
L
H
 
G
L
 
V
D
 
E
A
 
A
R
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
E
L
 
A
R
 
R
E
 
-
R
 
R
M
 
V
A
 
V
L
 
G
A
 
A
E
 
G
H
 
P
V
 
T
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
I
 
F
D
|
D
L
 
V
D
|
D
A
 
V
L
 
L
P
 
D
A
x
P
A
 
A
V
x
F
M
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
T
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
I
F
 
G
G
 
G
V
 
M
P
 
T
L
 
S
A
 
L
V
 
Q
V
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
V
 
V
G
 
R
E
 
G
V
 
L
R
 
-
R
 
R
S
 
G
G
 
L
K
 
D
L
 
L
R
 
V
V
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
V
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
S
P
 
P
S
 
P
Y
 
F
D
 
D
R
 
V
D
 
G
H
 
G
Q
x
A
G
 
T
A
 
A
R
 
L
V
|
V
A
 
G
A
 
A
R
 
T
L
 
M
A
 
M
Y
 
F
R
 
E
L
 
L
L
 
L

3niqA Crystal structure of pseudomonas aeruginosa guanidinopropionase (see paper)
28% identity, 86% coverage: 43:312/313 of query aligns to 36:304/315 of 3niqA

query
sites
3niqA
V
 
L
V
 
I
G
 
G
F
 
V
A
 
P
C
 
W
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
T
L
 
T
R
 
N
N
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
R
Q
 
H
G
 
G
P
 
P
D
 
R
A
 
E
I
 
V
R
 
R
R
 
N
A
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
M
-
 
R
-
 
K
-
 
V
-
 
H
-
 
H
L
 
V
A
 
S
N
 
R
V
 
I
P
 
A
A
 
P
H
 
Y
G
 
D
L
 
L
P
 
V
A
 
R
L
 
V
Y
 
G
D
 
D
A
 
L
G
 
G
N
 
D
V
 
A
I
 
P
C
 
V
E
 
N
D
 
P
D
 
I
A
 
D
L
 
L
E
 
L
A
 
D
A
 
S
Q
 
L
E
 
R
R
 
R
L
 
I
A
 
E
G
 
G
A
 
F
V
 
Y
R
 
R
A
 
Q
V
 
V
L
 
H
D
 
A
G
 
A
G
 
G
G
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
S
L
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
L
V
 
V
A
 
T
W
 
L
G
 
P
S
 
I
W
 
F
Q
 
R
G
 
A
L
 
L
R
 
-
A
 
-
H
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
R
G
 
E
G
 
R
R
 
P
L
 
L
L
 
G
I
 
M
V
 
V
N
 
H
I
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
S
D
|
D
L
 
T
R
 
N
T
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
F
-
 
G
S
 
D
R
 
N
P
 
P
A
 
Y
S
 
T
S
x
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
R
Q
 
R
I
 
A
A
 
I
C
 
E
E
 
E
S
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
D
P
 
P
F
 
L
D
 
R
Y
 
T
V
 
V
C
 
Q
L
 
I
G
 
G
V
 
I
S
 
R
R
 
G
L
 
S
A
 
V
N
 
Y
T
 
S
P
 
P
A
 
D
L
 
D
F
 
D
A
 
A
R
 
F
A
 
A
D
 
R
E
 
E
L
 
C
G
 
G
V
 
I
S
 
R
Y
 
V
V
 
I
E
 
H
D
 
M
V
 
E
D
 
E
L
 
F
Q
 
V
E
 
E
R
 
L
H
 
G
L
 
V
D
 
E
A
 
A
R
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
E
L
 
A
R
 
R
E
 
-
R
 
R
M
 
V
A
 
V
L
 
G
A
 
A
E
 
G
H
 
P
V
 
T
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
I
 
F
D
|
D
L
 
V
D
|
D
A
 
V
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
A
V
 
F
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
T
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
I
F
 
G
G
 
G
V
 
M
P
 
T
L
 
S
A
 
L
V
 
Q
V
 
A
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
V
 
V
G
 
R
E
 
G
V
 
L
R
 
-
R
 
R
S
 
G
G
 
L
K
 
D
L
 
L
R
 
V
V
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
V
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
S
P
 
P
S
 
P
Y
 
F
D
 
D
R
 
V
D
 
G
H
 
G
Q
 
A
G
 
T
A
 
A
R
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
A
R
 
T
L
 
M
A
 
M
Y
 
F
R
 
E
L
 
L
L
 
L

1t4tA Arginase-dinor-noha complex (see paper)
24% identity, 85% coverage: 29:293/313 of query aligns to 3:276/314 of 1t4tA

query
sites
1t4tA
V
 
I
R
 
E
A
 
I
A
 
I
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
F
P
 
S
A
 
K
G
 
G
S
 
Q
P
 
P
V
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
R
A
 
G
G
 
G
A
 
V
A
 
E
Q
 
K
G
 
G
P
 
P
D
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
R
R
 
K
A
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
T
L
 
E
A
 
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
R
A
 
D
H
 
H
G
 
G
L
 
D
P
 
L
A
 
A
L
 
F
Y
 
V
D
 
D
A
 
V
G
 
P
N
 
N
-
 
D
-
 
S
-
 
P
-
 
F
-
 
Q
V
 
I
I
 
V
C
 
K
E
 
N
D
 
P
D
 
R
A
 
S
L
 
V
E
 
G
A
 
K
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
V
V
 
V
R
 
A
A
 
E
V
 
T
L
 
Q
D
 
K
G
 
N
G
 
G
G
 
T
L
 
I
P
 
S
L
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
M
A
 
A
W
 
I
G
 
G
S
 
S
W
 
I
Q
 
S
G
 
G
-
 
H
L
 
A
R
 
R
A
 
V
H
 
H
L
 
P
D
 
D
A
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
C
I
 
V
V
 
I
N
 
W
I
 
V
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
T
D
|
D
L
 
I
R
x
N
T
 
T
S
 
P
R
 
L
P
 
T
A
 
T
S
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
N
P
 
L
F
x
H
D
 
G
Q
 
Q
-
 
P
-
 
V
-
 
A
I
 
F
A
 
L
C
 
L
E
 
K
S
 
E
A
 
L
R
 
K
R
 
G
G
 
K
L
 
F
P
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
G
F
 
F
D
 
S
Y
 
W
V
 
V
-
 
T
-
 
P
C
 
C
L
 
I
G
 
S
V
 
A
S
 
K
R
 
D
L
 
I
A
 
V
N
 
Y
T
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
V
-
x
D
P
 
P
A
 
G
L
 
E
F
 
H
A
 
Y
R
 
I
A
 
I
D
 
K
E
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
K
Y
 
Y
V
 
F
E
 
S
D
 
M
V
 
T
D
 
E
L
 
V
Q
 
D
E
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
G
R
 
K
H
 
V
L
 
M
D
 
E
A
 
E
R
 
T
L
 
F
A
 
S
A
 
Y
L
 
L
R
 
L
E
 
G
R
 
R
M
 
K
A
 
-
L
 
-
A
 
K
E
 
R
H
 
P
V
 
I
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
F
D
|
D
L
 
V
D
|
D
A
 
G
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
V
V
 
F
M
 
T
P
 
P
G
 
A
V
 
T
S
 
G
A
x
T
P
 
P
A
 
V
A
 
V
F
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
S
L
 
Y
A
 
R
V
 
E
V
 
G
E
 
L
A
 
Y
L
 
I
V
 
T
G
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
Y
R
 
K
S
 
T
G
 
G
K
 
L
L
 
L
R
 
S
V
 
G
A
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
M
E
|
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
T

2ef5A Crystal structure of the arginase from thermus thermophilus
30% identity, 86% coverage: 43:312/313 of query aligns to 5:268/273 of 2ef5A

query
sites
2ef5A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
V
A
x
P
C
 
M
D
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
-
R
 
-
N
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
A
x
D
Q
x
M
G
 
G
P
 
P
D
x
S
A
 
A
I
 
L
R
 
R
-
 
Y
-
 
A
R
 
R
A
 
L
L
 
L
A
 
E
N
 
Q
V
 
L
P
 
E
A
 
D
H
 
L
G
 
G
L
 
Y
P
 
-
A
 
T
L
 
V
Y
 
E
D
 
D
A
 
L
G
 
G
N
 
D
V
 
V
I
 
P
C
 
V
E
 
S
D
 
L
D
 
A
A
 
Y
L
 
L
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
L
A
 
V
A
 
L
Q
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
L
D
 
P
G
 
E
G
 
G
G
 
V
L
 
F
P
 
P
L
 
I
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
L
A
 
S
W
 
M
G
 
G
S
 
S
W
 
V
Q
 
A
G
 
G
L
 
-
R
 
-
A
 
-
H
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
A
D
 
R
G
 
G
G
 
R
R
 
R
L
 
V
L
 
G
I
 
V
V
 
V
N
 
W
I
 
V
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
A
D
|
D
L
 
F
R
 
N
T
 
T
S
 
P
R
 
E
P
 
T
A
 
S
S
 
S
S
 
G
-
 
N
-
 
V
-
x
H
G
 
G
T
 
M
P
 
P
F
 
L
D
 
A
Q
 
V
I
 
L
A
 
S
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
H
-
 
P
-
 
R
-
 
L
C
 
T
E
 
E
S
 
V
A
 
F
R
 
R
R
 
A
G
 
V
L
 
D
P
 
P
F
 
K
D
 
D
Y
 
V
V
 
V
C
 
L
L
 
V
G
 
G
V
 
V
S
 
R
R
 
S
L
 
L
A
 
D
N
 
P
T
 
G
P
 
E
A
 
K
L
 
R
F
 
L
A
 
L
R
 
K
A
 
E
D
 
A
E
 
G
L
 
V
G
 
R
V
 
V
S
 
Y
Y
 
T
V
 
M
E
 
H
D
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
R
H
 
L
L
 
G
D
 
V
A
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
-
 
E
-
 
E
A
 
V
L
 
L
R
 
K
E
 
H
R
 
L
M
 
Q
A
 
G
L
 
L
A
 
P
E
 
L
H
 
H
V
 
V
Y
 
-
L
 
-
T
 
S
I
 
L
D
|
D
L
 
A
D
|
D
A
 
V
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
T
V
 
L
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
S
 
G
A
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
P
F
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
Y
A
 
R
V
 
E
V
 
A
E
 
H
A
 
L
L
 
L
V
 
M
G
 
E
E
 
I
V
 
L
R
 
A
R
 
E
S
 
S
G
 
G
K
 
R
L
 
V
R
 
Q
V
 
S
A
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
N
P
 
P
S
 
I
Y
 
L
D
 
D
R
 
E
D
 
R
H
 
N
Q
 
R
G
 
T
A
 
A
R
 
E
V
 
M
A
 
L
A
 
V
R
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
L
R
 
S
L
 
L
L
 
L

3m1rD The crystal structure of formimidoylglutamase from bacillus subtilis subsp. Subtilis str. 168
21% identity, 80% coverage: 57:307/313 of query aligns to 53:308/321 of 3m1rD

query
sites
3m1rD
G
 
S
R
 
H
A
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
S
Q
 
F
G
 
A
P
 
P
D
 
G
A
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
K
N
 
H
V
 
S
P
 
S
A
 
A
H
 
Y
G
 
S
L
 
A
P
 
E
A
 
L
-
 
G
-
 
E
-
 
H
-
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
L
G
 
G
N
 
D
V
 
I
I
 
D
C
 
I
E
 
H
D
 
V
D
 
T
A
 
D
L
 
I
E
 
V
A
 
K
A
 
S
Q
 
H
E
 
H
R
 
H
L
 
I
A
 
F
G
 
Q
A
 
T
V
 
M
R
 
H
A
 
A
V
 
L
L
 
L
D
 
S
G
 
D
-
 
H
-
 
P
G
 
D
G
 
W
L
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
I
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
x
N
E
 
S
V
 
I
A
 
S
W
 
Y
G
 
S
S
 
T
W
 
I
Q
 
K
G
 
A
L
 
I
R
 
-
A
 
-
H
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
Q
D
 
T
G
 
K
G
 
G
R
 
T
L
 
T
L
 
A
I
 
V
V
 
I
N
 
Q
I
 
F
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
H
D
|
D
L
 
V
R
 
R
T
 
N
S
 
T
R
 
E
P
 
D
A
 
G
-
 
G
-
 
P
S
 
T
S
x
N
G
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
R
Q
 
R
I
 
L
A
 
L
C
 
D
E
 
E
S
 
E
A
 
I
R
 
I
R
 
E
G
 
G
L
 
Q
P
 
H
F
 
L
D
 
-
Y
 
-
V
 
I
C
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
I
S
 
R
R
 
E
L
 
F
A
 
S
N
 
N
T
 
S
P
 
Q
A
 
A
L
 
Y
F
 
E
A
 
A
R
 
Y
A
 
A
D
 
K
E
 
K
L
 
H
G
 
N
V
 
V
S
 
N
Y
 
-
V
 
I
E
 
H
D
 
T
V
 
M
D
 
D
L
 
M
-
 
I
Q
 
R
E
 
E
R
 
K
H
 
G
L
 
L
D
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
I
A
 
P
A
 
T
L
 
I
R
 
K
E
 
E
R
 
I
M
 
L
A
 
P
L
 
V
A
 
V
E
 
Q
-
 
D
-
 
K
-
 
T
-
 
D
H
 
F
V
 
I
Y
 
F
L
 
I
T
 
S
I
 
V
D
|
D
L
 
M
D
|
D
A
 
V
L
 
L
P
 
D
A
 
Q
A
 
S
V
 
H
M
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
C
S
 
P
A
 
A
P
 
I
A
 
G
A
 
P
F
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
Y
L
 
T
A
 
D
V
 
E
V
 
L
E
 
L
A
 
E
L
 
A
V
 
V
G
 
K
E
 
Y
V
 
I
R
 
A
R
 
Q
S
 
Q
G
 
P
K
 
N
L
 
V
R
 
A
V
 
G
A
 
I
D
 
E
L
 
I
A
 
V
E
|
E
Y
 
V
N
 
D
P
 
P
S
 
T
Y
 
L
D
 
D
R
 
F
D
 
R
H
 
D
Q
 
M
G
 
T
A
 
S
R
 
R
V
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
H
L
 
V

4q41A Crystal structure of schistosoma mansoni arginase in complex with l- lysine (see paper)
28% identity, 76% coverage: 54:292/313 of query aligns to 16:282/333 of 4q41A

query
sites
4q41A
R
 
R
N
 
G
H
 
Q
G
 
P
R
 
K
A
 
I
G
 
G
A
 
T
A
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
K
A
 
S
-
 
N
L
 
F
A
 
F
N
 
Q
V
 
L
P
 
V
A
 
A
H
 
E
G
 
D
L
 
G
P
 
I
A
 
Q
L
 
L
Y
 
T
D
 
D
A
 
C
G
 
G
N
 
D
V
 
I
I
 
I
-
 
P
C
 
V
E
 
E
D
 
L
D
 
N
A
 
E
L
 
A
E
 
E
A
 
D
A
 
P
Q
 
Q
E
 
R
-
 
F
-
 
G
-
 
M
-
 
K
-
 
W
-
 
S
-
 
R
-
 
S
-
 
F
-
 
S
-
 
L
-
 
T
-
 
T
-
 
L
R
 
R
L
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
R
V
 
V
R
 
E
A
 
E
V
 
L
L
 
M
D
 
K
G
 
Q
G
 
K
G
 
S
L
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
I
-
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
|
H
E
 
S
V
 
M
A
 
A
W
 
T
G
 
G
S
 
T
W
 
I
Q
 
L
G
 
G
L
 
-
R
 
-
A
 
-
H
 
H
L
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
K
G
 
P
D
 
D
G
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
C
I
 
V
V
 
L
N
 
W
I
 
I
D
|
D
A
 
A
H
|
H
F
 
G
D
|
D
L
 
I
R
x
N
T
 
T
S
 
P
R
 
L
P
 
N
A
 
S
S
 
A
S
 
S
G
 
G
T
 
N
-
 
M
-
x
H
-
 
G
-
 
M
P
 
P
F
 
L
D
 
S
Q
 
F
I
 
L
A
 
V
C
 
K
E
 
E
S
 
-
A
 
L
R
 
Q
R
 
D
G
 
Q
L
 
I
P
 
P
F
 
W
-
 
L
-
 
D
D
 
D
Y
 
F
V
 
E
-
 
G
-
 
I
-
 
K
-
 
P
C
 
C
L
 
L
G
 
N
V
 
A
S
 
S
R
 
N
L
 
I
A
 
A
N
 
Y
T
 
I
P
 
G
A
 
L
L
 
R
F
 
D
A
 
L
R
x
D
A
 
A
D
 
H
E
 
E
L
 
T
-
 
H
-
 
D
-
 
I
-
 
R
-
 
K
-
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
A
Y
 
Y
V
 
F
E
 
T
D
 
M
V
 
L
D
 
D
L
 
V
Q
 
D
E
 
R
R
 
M
H
 
G
L
 
I
D
 
E
A
 
A
-
 
V
-
 
I
R
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
L
L
 
L
R
 
A
E
 
V
R
 
N
M
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
E
E
 
K
H
 
A
V
 
I
Y
 
H
L
 
L
T
 
S
I
 
F
D
|
D
L
 
I
D
|
D
A
 
A
L
 
L
P
 
D
A
 
P
A
 
L
V
 
V
M
 
A
P
 
P
G
 
S
V
 
T
S
 
G
A
 
T
P
 
A
A
 
V
A
 
P
F
 
G
G
 
G
V
 
L
P
 
T
L
 
L
A
 
R
V
 
E
V
 
G
E
 
L
A
 
R
L
 
I
V
 
C
G
 
E
E
 
E
V
 
V
R
 
S
R
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
R
 
S
V
 
V
A
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
A
E
|
E
Y
 
L
N
 
N
P
 
P

Query Sequence

>RR42_RS31730 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS31730
MSMAMTESVWQGRSDAGERGDTRRLFHVVRAAGAPLPAGSPVVVGFACDAGVLRNHGRAG
AAQGPDAIRRALANVPAHGLPALYDAGNVICEDDALEAAQERLAGAVRAVLDGGGLPLVL
GGGHEVAWGSWQGLRAHLDAAGDGGRLLIVNIDAHFDLRTSRPASSGTPFDQIACESARR
GLPFDYVCLGVSRLANTPALFARADELGVSYVEDVDLQERHLDARLAALRERMALAEHVY
LTIDLDALPAAVMPGVSAPAAFGVPLAVVEALVGEVRRSGKLRVADLAEYNPSYDRDHQG
ARVAARLAYRLLA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory