SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing RR42_RS34985 FitnessBrowser__Cup4G11:RR42_RS34985 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2pp1A Crystal structure of l-talarate/galactarate dehydratase from salmonella typhimurium lt2 liganded with mg and l-lyxarohydroxamate (see paper)
38% identity, 93% coverage: 8:350/368 of query aligns to 28:375/395 of 2pp1A

query
sites
2pp1A
V
 
V
E
 
K
L
 
L
L
 
S
Q
 
L
V
 
A
D
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
L
R
 
A
V
 
T
P
 
P
R
 
V
S
 
S
D
|
D
A
 
A
I
 
-
Q
x
K
S
 
V
F
 
L
V
 
T
M
 
G
Q
 
R
E
 
Q
T
 
K
P
 
P
M
x
L
V
 
T
R
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
I
-
 
I
-
 
A
-
 
E
I
 
I
R
 
R
C
 
S
D
 
R
D
 
D
G
 
G
A
 
F
E
 
E
G
 
G
T
 
V
G
 
G
Y
 
F
A
 
S
Y
 
Y
T
x
S
I
x
K
G
x
R
T
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
Q
S
 
G
V
 
I
M
 
Y
A
 
A
L
 
H
L
 
A
R
 
K
D
 
E
H
 
-
L
 
I
A
 
A
P
 
D
R
 
N
L
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
N
Q
 
D
I
 
I
E
 
D
A
 
K
I
 
I
W
 
Y
R
 
T
E
 
K
L
 
L
L
 
L
F
 
W
A
 
A
T
 
G
H
 
A
A
 
S
T
 
V
S
 
G
V
 
R
G
 
S
A
 
G
I
 
M
T
 
A
S
 
V
L
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
S
A
 
P
I
 
I
D
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
W
 
M
R
 
K
C
 
A
R
 
K
R
 
R
D
 
A
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
L
 
L
W
 
A
L
 
K
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
H
Q
 
R
P
 
D
R
 
S
V
 
V
P
 
Q
V
 
C
Y
 
Y
T
 
N
T
 
T
E
 
S
G
 
G
G
 
G
W
x
F
L
 
L
H
 
H
L
 
T
D
 
P
A
 
L
D
 
D
T
 
Q
L
 
V
V
 
L
S
 
K
E
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
I
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
N
G
 
G
F
 
I
R
 
G
G
 
G
A
 
I
K
|
K
L
 
L
K
|
K
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
A
 
P
R
 
N
A
 
C
S
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
A
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
E
F
 
F
E
 
P
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
C
 
Q
F
 
W
T
 
D
A
 
R
A
 
E
E
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
M
A
 
G
P
 
R
H
 
K
Y
 
M
A
 
E
E
 
Q
L
 
F
G
 
N
I
 
L
A
 
I
W
 
W
F
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
D
A
 
A
D
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
E
G
 
G
H
 
H
V
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
A
T
 
L
S
 
D
V
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
T
G
|
G
E
|
E
S
 
M
L
 
L
Y
 
T
S
 
S
P
 
F
G
 
R
Q
 
E
F
 
H
A
 
E
E
 
Q
Y
 
L
V
 
I
R
 
L
Q
 
G
G
 
N
A
 
A
C
 
S
G
 
D
I
 
F
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
D
|
D
V
 
A
A
 
P
R
 
R
I
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
P
 
P
W
 
F
L
 
L
K
 
K
V
 
I
A
 
M
H
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
K
H
 
H
N
 
G
L
 
R
S
 
K
I
 
L
C
 
A
P
 
P
H
|
H
F
 
F
L
 
A
M
 
M
E
 
E
L
 
V
H
 
H
V
 
L
S
 
H
L
 
L
C
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
Y
P
 
P
N
 
L
A
 
E
A
 
P
W
 
W
V
 
L
E
|
E
Y
 
H
I
x
F
P
 
E
Q
x
W
L
 
L
D
 
N
E
 
P
I
 
L
A
 
F
A
 
N
S
 
E
S
 
Q
V
 
L
R
 
E
I
 
L
E
 
R
A
 
D
G
 
G
H
 
R
A
 
M
I
 
W
A
 
I
P
 
S
D
 
D
A
 
R
P
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
F

Q8ZL58 L-talarate/galactarate dehydratase; TalrD/GalrD; StTGD; EC 4.2.1.156; EC 4.2.1.42 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
38% identity, 93% coverage: 8:350/368 of query aligns to 31:378/398 of Q8ZL58

query
sites
Q8ZL58
V
 
V
E
 
K
L
 
L
L
 
S
Q
 
L
V
 
A
D
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
L
R
 
A
V
 
T
P
 
P
R
 
V
S
 
S
D
|
D
A
|
A
I
 
-
Q
x
K
S
 
V
F
 
L
V
 
T
M
 
G
Q
 
R
E
 
Q
T
 
K
P
 
P
M
 
L
V
 
T
R
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
I
-
 
I
-
 
A
-
 
E
I
 
I
R
 
R
C
 
S
D
 
R
D
 
D
G
 
G
A
 
F
E
 
E
G
 
G
T
 
V
G
 
G
Y
 
F
A
 
S
Y
 
Y
T
 
S
I
x
K
G
x
R
T
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
Q
S
 
G
V
 
I
M
 
Y
A
 
A
L
 
H
L
 
A
R
 
K
D
 
E
H
 
-
L
 
I
A
 
A
P
 
D
R
 
N
L
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
N
Q
 
D
I
 
I
E
 
D
A
 
K
I
 
I
W
 
Y
R
 
T
E
 
K
L
 
L
L
 
L
F
 
W
A
 
A
T
 
G
H
 
A
A
 
S
T
 
V
S
 
G
V
 
R
G
 
S
A
 
G
I
 
M
T
 
A
S
 
V
L
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
S
A
 
P
I
 
I
D
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
W
 
M
R
 
K
C
 
A
R
 
K
R
 
R
D
 
A
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
L
 
L
W
 
A
L
 
K
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
H
Q
 
R
P
 
D
R
 
S
V
 
V
P
 
Q
V
 
C
Y
 
Y
T
 
N
T
 
T
E
 
S
G
 
G
G
 
G
W
 
F
L
 
L
H
 
H
L
 
T
D
 
P
A
 
L
D
 
D
T
 
Q
L
 
V
V
 
L
S
 
K
E
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
I
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
N
G
 
G
F
 
I
R
 
G
G
 
G
A
 
I
K
|
K
L
 
L
K
|
K
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
A
 
P
R
 
N
A
 
C
S
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
A
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
E
F
 
F
E
 
P
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
C
 
Q
F
 
W
T
 
D
A
 
R
A
 
E
E
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
M
A
 
G
P
 
R
H
 
K
Y
 
M
A
 
E
E
 
Q
L
 
F
G
 
N
I
 
L
A
 
I
W
 
W
F
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
D
A
 
A
D
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
E
G
 
G
H
 
H
V
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
A
T
 
L
S
 
D
V
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
T
G
 
G
E
|
E
S
 
M
L
 
L
Y
 
T
S
 
S
P
 
F
G
 
R
Q
 
E
F
 
H
A
 
E
E
 
Q
Y
 
L
V
 
I
R
 
L
Q
 
G
G
 
N
A
 
A
C
 
S
G
 
D
I
 
F
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
A
A
 
P
R
 
R
I
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
P
 
P
W
 
F
L
 
L
K
 
K
V
 
I
A
 
M
H
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
K
H
 
H
N
 
G
L
 
R
S
 
K
I
 
L
C
 
A
P
 
P
H
|
H
F
 
F
L
 
A
M
 
M
E
 
E
L
 
V
H
 
H
V
 
L
S
 
H
L
 
L
C
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
Y
P
 
P
N
 
L
A
 
E
A
 
P
W
 
W
V
 
L
E
|
E
Y
 
H
I
 
F
P
 
E
Q
 
W
L
 
L
D
 
N
E
 
P
I
 
L
A
 
F
A
 
N
S
 
E
S
 
Q
V
 
L
R
 
E
I
 
L
E
 
R
A
 
D
G
 
G
H
 
R
A
 
M
I
 
W
A
 
I
P
 
S
D
 
D
A
 
R
P
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
F

2pp3A Crystal structure of l-talarate/galactarate dehydratase mutant k197a liganded with mg and l-glucarate (see paper)
38% identity, 93% coverage: 8:350/368 of query aligns to 28:375/395 of 2pp3A

query
sites
2pp3A
V
 
V
E
 
K
L
 
L
L
 
S
Q
 
L
V
 
A
D
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
L
R
 
A
V
 
T
P
 
P
R
 
V
S
 
S
D
|
D
A
 
A
I
 
-
Q
x
K
S
 
V
F
 
L
V
 
T
M
 
G
Q
 
R
E
 
Q
T
 
K
P
 
P
M
 
L
V
 
T
R
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
I
-
 
I
-
 
A
-
 
E
I
 
I
R
 
R
C
 
S
D
 
R
D
 
D
G
 
G
A
 
F
E
 
E
G
 
G
T
 
V
G
 
G
Y
 
F
A
 
S
Y
 
Y
T
x
S
I
x
K
G
x
R
T
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
Q
S
 
G
V
 
I
M
 
Y
A
 
A
L
 
H
L
 
A
R
 
K
D
 
E
H
 
-
L
 
I
A
 
A
P
 
D
R
 
N
L
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
N
Q
 
D
I
 
I
E
 
D
A
 
K
I
 
I
W
 
Y
R
 
T
E
 
K
L
 
L
L
 
L
F
 
W
A
 
A
T
 
G
H
 
A
A
 
S
T
 
V
S
 
G
V
 
R
G
 
S
A
 
G
I
 
M
T
 
A
S
 
V
L
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
S
A
 
P
I
 
I
D
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
W
 
M
R
 
K
C
 
A
R
 
K
R
 
R
D
 
A
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
L
 
L
W
 
A
L
 
K
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
A
 
H
Q
 
R
P
 
D
R
 
S
V
 
V
P
 
Q
V
 
C
Y
 
Y
T
 
N
T
|
T
E
 
S
G
 
G
G
 
G
W
x
F
L
 
L
H
 
H
L
 
T
D
 
P
A
 
L
D
 
D
T
 
Q
L
 
V
V
 
L
S
 
K
E
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
I
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
N
G
 
G
F
 
I
R
 
G
G
 
G
A
 
I
K
|
K
L
 
L
K
x
A
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
A
 
P
R
 
N
A
 
C
S
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
A
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
E
F
 
F
E
 
P
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
C
 
Q
F
 
W
T
 
D
A
 
R
A
 
E
E
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
M
A
 
G
P
 
R
H
 
K
Y
 
M
A
 
E
E
 
Q
L
 
F
G
 
N
I
 
L
A
 
I
W
 
W
F
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
D
A
 
A
D
 
Y
D
 
D
I
 
I
G
 
E
G
 
G
H
 
H
V
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
A
T
 
L
S
 
D
V
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
T
G
|
G
E
|
E
S
 
M
L
 
L
Y
 
T
S
 
S
P
 
F
G
 
R
Q
 
E
F
 
H
A
 
E
E
 
Q
Y
 
L
V
 
I
R
 
L
Q
 
G
G
 
N
A
 
A
C
 
S
G
 
D
I
 
F
V
 
V
Q
 
Q
A
 
P
D
|
D
V
 
A
A
 
P
R
 
R
I
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
S
P
 
P
W
 
F
L
 
L
K
 
K
V
 
I
A
 
M
H
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
K
H
 
H
N
 
G
L
 
R
S
 
K
I
 
L
C
 
A
P
 
P
H
|
H
F
 
F
L
 
A
M
 
M
E
 
E
L
 
V
H
 
H
V
 
L
S
 
H
L
 
L
C
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
Y
P
 
P
N
 
L
A
 
E
A
 
P
W
 
W
V
 
L
E
|
E
Y
 
H
I
x
F
P
 
E
Q
x
W
L
 
L
D
 
N
E
 
P
I
 
L
A
 
F
A
 
N
S
 
E
S
 
Q
V
 
L
R
 
E
I
 
L
E
 
R
A
 
D
G
 
G
H
 
R
A
 
M
I
 
W
A
 
I
P
 
S
D
 
D
A
 
R
P
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
F

5xd8B Crystal structure analysis of 3,6-anhydro-l-galactonate cycloisomerase (see paper)
36% identity, 98% coverage: 1:362/368 of query aligns to 1:362/367 of 5xd8B

query
sites
5xd8B
M
 
M
S
 
K
A
 
T
T
 
T
I
 
I
V
 
K
Q
 
D
V
 
I
E
 
K
L
 
T
L
 
R
Q
 
L
V
 
F
D
 
K
L
 
I
P
 
P
P
 
L
R
 
K
V
 
E
P
 
I
R
 
L
S
|
S
D
 
D
A
 
A
I
 
K
Q
 
H
-
 
G
S
 
D
F
 
H
V
 
D
M
 
H
Q
 
F
E
 
E
T
 
L
P
 
I
M
 
T
V
 
T
R
 
T
I
 
V
R
 
T
C
 
L
D
 
E
D
 
D
G
 
G
A
 
S
E
 
Q
G
 
G
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
A
 
T
Y
 
Y
T
|
T
I
 
G
G
 
G
T
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
Y
S
 
S
V
 
I
M
 
K
A
 
A
L
 
M
L
 
L
R
 
E
D
 
Y
H
 
D
L
 
I
A
 
Q
P
 
P
R
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
K
D
 
D
P
 
A
A
 
T
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
A
 
E
I
 
I
W
 
Y
R
 
D
E
 
F
L
 
M
L
 
E
F
 
W
A
 
H
T
 
I
H
 
H
A
 
Y
T
 
V
S
 
G
V
 
R
G
 
G
A
 
G
I
 
I
T
 
S
S
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
M
A
 
S
A
 
A
I
 
V
D
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
W
 
L
R
 
K
C
 
G
R
 
K
R
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
L
 
L
W
 
W
L
 
K
A
 
M
A
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
K
Q
 
N
P
 
N
R
 
T
V
 
C
P
 
K
V
 
A
Y
 
Y
T
 
C
T
 
-
E
 
-
G
|
G
G
 
G
W
 
I
-
 
D
L
 
L
H
 
Q
L
 
F
D
 
P
A
 
L
D
 
E
T
 
K
L
 
L
V
 
L
S
 
N
E
 
N
A
 
I
V
 
C
A
 
G
A
 
Y
R
 
L
E
 
E
A
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
N
G
 
A
A
 
V
K
|
K
L
 
I
K
|
K
V
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
E
R
 
N
A
 
M
S
 
Q
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
D
R
 
R
L
 
I
A
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
L
V
 
I
G
 
G
D
 
P
G
 
D
F
 
I
E
 
T
L
 
F
M
 
M
V
 
I
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Y
C
 
S
F
 
L
T
 
T
A
 
V
A
 
E
E
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
K
R
 
L
A
 
S
P
 
K
H
 
A
Y
 
V
A
 
E
E
 
Q
L
 
Y
G
 
D
I
 
I
A
 
T
W
 
W
F
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
P
 
L
A
 
P
D
 
D
D
 
D
I
 
Y
G
 
K
G
 
G
H
 
F
V
 
A
R
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
D
S
 
N
T
 
T
S
 
A
V
 
I
P
 
P
I
 
L
A
 
A
V
 
M
G
|
G
E
|
E
S
 
N
L
 
L
Y
 
H
S
 
T
P
 
I
G
 
H
Q
 
E
F
 
F
A
 
G
E
 
Y
Y
 
A
V
 
M
R
 
D
Q
 
Q
G
 
A
A
 
K
C
 
L
G
 
G
I
 
Y
V
 
C
Q
|
Q
A
 
P
D
|
D
V
 
A
A
 
S
R
 
N
I
 
C
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
G
W
 
W
L
 
L
K
 
K
V
 
A
A
 
A
H
 
D
L
 
L
A
 
I
E
 
T
A
 
E
H
 
H
N
 
N
L
 
I
S
 
P
I
 
V
C
 
C
P
 
T
H
|
H
F
x
G
L
x
M
M
 
Q
E
 
E
L
 
L
H
 
H
V
 
V
S
 
S
L
 
L
C
 
V
A
 
S
A
 
A
V
 
F
P
 
-
N
 
D
A
 
T
A
 
G
W
|
W
V
 
L
E
|
E
-
 
V
Y
 
H
I
 
S
P
 
F
Q
x
P
L
 
I
D
 
D
E
 
E
I
 
Y
A
 
T
A
 
K
S
 
R
S
 
P
V
 
L
R
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
N
G
 
F
H
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
N
A
 
E
P
 
P
G
 
G
L
 
I
G
 
G
I
 
V
E
 
E
W
 
F
D
 
D
W
 
W
A
 
D
A
 
K
I
 
I
G
 
A
R
 
Q
R
 
Y
T
 
E
V
 
V

3cb3A Crystal structure of l-talarate dehydratase from polaromonas sp. Js666 complexed with mg and l-glucarate
38% identity, 95% coverage: 2:350/368 of query aligns to 1:354/373 of 3cb3A

query
sites
3cb3A
S
 
S
A
 
D
T
 
R
I
 
I
V
 
T
Q
 
W
V
 
V
E
 
R
L
 
I
L
 
S
Q
 
S
V
 
C
D
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
L
R
 
A
V
 
T
P
 
P
R
x
I
S
 
S
D
 
D
A
 
A
I
 
-
Q
x
K
S
 
V
F
 
L
V
 
T
M
 
G
Q
 
R
E
 
Q
T
 
K
P
 
P
M
 
M
V
 
T
R
 
E
I
 
I
-
 
A
-
 
I
-
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
E
-
 
I
R
 
E
C
 
T
D
 
A
D
 
G
G
 
G
A
 
H
E
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
S
Y
 
Y
T
x
S
I
x
K
G
 
R
T
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
P
S
 
G
V
 
Q
M
 
F
A
 
A
L
 
H
L
 
A
R
 
R
D
 
E
H
 
-
L
 
I
A
 
A
P
 
P
R
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
S
Q
 
D
I
 
I
E
 
A
A
 
K
I
 
L
W
 
W
R
 
D
E
 
K
L
 
L
L
 
C
F
 
W
A
 
A
T
 
G
H
 
A
A
 
S
T
 
A
S
 
G
V
 
R
G
 
S
A
 
G
I
 
L
T
 
S
S
 
T
L
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
G
A
 
A
I
 
F
D
 
D
T
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
W
 
L
R
 
K
C
 
A
R
 
K
R
 
R
D
 
A
G
 
G
Q
 
L
P
 
S
L
 
L
W
 
A
L
 
K
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
S
A
 
Y
Q
 
R
P
 
D
R
 
S
V
 
V
P
 
R
V
 
C
Y
 
Y
T
 
N
T
|
T
E
 
S
G
 
G
G
 
G
W
 
F
L
 
L
H
 
H
L
 
T
D
 
P
A
 
I
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
V
 
M
S
 
V
E
 
N
A
 
A
V
 
S
A
 
A
A
 
S
R
 
I
E
 
E
A
 
R
G
 
G
F
 
I
R
 
G
G
 
G
A
 
I
K
|
K
L
 
L
K
|
K
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
A
 
P
R
 
D
A
 
G
S
 
A
E
 
L
D
 
D
V
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
V
A
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
K
A
 
H
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
A
F
 
V
E
 
P
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
C
 
Q
F
 
W
T
 
D
A
 
R
A
 
P
E
 
T
A
 
A
I
 
Q
R
 
R
R
 
M
A
 
C
P
 
R
H
 
I
Y
 
F
A
 
E
E
 
P
L
 
F
G
 
N
I
 
L
A
 
V
W
 
W
F
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
D
A
 
A
D
 
Y
D
 
D
I
 
H
G
 
E
G
 
G
H
 
H
V
 
A
R
 
A
L
 
L
A
|
A
A
 
L
S
 
Q
T
x
F
S
 
D
V
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
T
G
|
G
E
|
E
S
 
M
L
 
L
Y
 
T
S
 
S
P
 
A
G
 
A
Q
 
E
F
 
H
A
 
G
E
 
D
Y
 
L
V
 
I
R
 
R
Q
 
H
G
 
R
A
 
A
C
 
A
G
 
D
I
 
Y
V
 
L
Q
x
M
A
 
P
D
|
D
V
 
A
A
 
P
R
 
R
I
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
W
 
F
L
 
L
K
 
K
V
 
I
A
 
A
H
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
H
H
 
A
N
 
G
L
 
L
S
 
M
I
 
L
C
 
A
P
 
P
H
|
H
F
|
F
L
x
A
M
 
M
E
 
E
L
 
L
H
 
H
V
 
V
S
 
H
L
 
L
C
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
Y
P
 
P
N
 
R
A
 
E
A
 
P
W
 
W
V
 
V
E
|
E
Y
 
H
I
x
F
P
 
E
Q
x
W
L
 
L
D
 
E
E
 
P
I
 
L
A
 
F
A
 
N
S
 
E
S
 
R
V
 
I
R
 
E
I
 
I
E
 
R
A
 
D
G
 
G
H
 
R
A
 
M
I
 
L
A
 
V
P
 
P
D
 
T
A
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
L

2og9A Crystal structure of mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme from polaromonas sp. Js666
39% identity, 86% coverage: 35:350/368 of query aligns to 29:343/363 of 2og9A

query
sites
2og9A
M
 
F
V
 
A
R
 
E
I
 
I
R
 
E
C
 
T
D
 
A
D
 
G
G
 
G
A
 
H
E
 
Q
G
 
G
T
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
S
Y
 
Y
T
x
S
I
 
K
G
 
R
T
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
P
S
 
G
V
 
Q
M
 
F
A
 
A
L
 
H
L
 
A
R
 
R
D
 
E
H
 
-
L
 
I
A
 
A
P
 
P
R
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
S
Q
 
D
I
 
I
E
 
A
A
 
K
I
 
L
W
 
W
R
 
D
E
 
K
L
 
L
L
 
C
F
 
W
A
 
A
T
 
G
H
 
A
A
 
S
T
 
A
S
 
G
V
 
R
G
 
S
A
 
G
I
 
L
T
 
S
S
 
T
L
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
G
A
 
A
I
 
F
D
 
D
T
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
W
 
L
R
 
K
C
 
A
R
 
K
R
 
R
D
 
A
G
 
G
Q
 
L
P
 
S
L
 
L
W
 
A
L
 
K
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
S
A
 
Y
Q
 
R
P
 
D
R
 
S
V
 
V
P
 
R
V
 
C
Y
 
Y
T
 
N
T
|
T
E
 
S
G
 
G
G
 
G
W
 
F
L
 
L
H
 
H
L
 
T
D
 
P
A
 
I
D
 
D
T
 
Q
L
 
L
V
 
M
S
 
V
E
 
N
A
 
A
V
 
S
A
 
A
A
 
S
R
 
I
E
 
E
A
 
R
G
 
G
F
 
I
R
 
G
G
 
G
A
 
I
K
|
K
L
 
L
K
|
K
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
A
 
P
R
 
D
A
 
G
S
 
A
E
 
L
D
 
D
V
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
V
A
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
K
A
 
H
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
A
F
 
V
E
 
P
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
C
 
Q
F
 
W
T
 
D
A
 
R
A
 
P
E
 
T
A
 
A
I
 
Q
R
 
R
R
 
M
A
 
C
P
 
R
H
 
I
Y
 
F
A
 
E
E
 
P
L
 
F
G
 
N
I
 
L
A
 
V
W
 
W
F
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
D
A
 
A
D
 
Y
D
 
D
I
 
H
G
 
E
G
 
G
H
 
H
V
 
A
R
 
A
L
 
L
A
|
A
A
 
L
S
 
Q
T
x
F
S
 
D
V
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
T
G
|
G
E
|
E
S
 
M
L
 
L
Y
 
T
S
 
S
P
 
A
G
 
A
Q
 
E
F
 
H
A
 
G
E
 
D
Y
 
L
V
 
I
R
 
R
Q
 
H
G
 
R
A
 
A
C
 
A
G
 
D
I
 
Y
V
 
L
Q
x
M
A
 
P
D
|
D
V
 
A
A
 
P
R
 
R
I
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
W
 
F
L
 
L
K
 
K
V
 
I
A
 
A
H
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
H
H
 
A
N
 
G
L
 
L
S
 
M
I
 
L
C
 
A
P
 
P
H
|
H
F
|
F
L
x
A
M
 
M
E
 
E
L
 
L
H
 
H
V
 
V
S
 
H
L
 
L
C
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
Y
P
 
P
N
 
R
A
 
E
A
 
P
W
 
W
V
 
V
E
|
E
Y
 
H
I
 
F
P
 
E
Q
 
W
L
 
L
D
 
E
E
 
P
I
 
L
A
 
F
A
 
N
S
 
E
S
 
R
V
 
I
R
 
E
I
 
I
E
 
R
A
 
D
G
 
G
H
 
R
A
 
M
I
 
L
A
 
V
P
 
P
D
 
T
A
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
L

3ck5A Crystal structure of a racemase from streptomyces coelicolor a3(2) with bound magnesium
38% identity, 97% coverage: 6:362/368 of query aligns to 5:357/357 of 3ck5A

query
sites
3ck5A
V
 
V
Q
 
R
V
 
T
E
 
D
L
 
L
L
 
Y
Q
 
R
V
 
I
D
 
P
L
 
L
P
 
P
P
 
T
R
 
R
V
 
L
P
 
-
R
 
-
S
x
T
D
 
D
A
 
S
I
 
T
Q
 
H
S
 
G
F
 
A
V
 
M
M
 
M
Q
 
D
-
 
F
E
 
E
T
 
L
P
 
I
M
 
T
V
 
V
R
 
R
I
 
I
R
 
E
C
 
D
D
 
S
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
T
G
 
G
T
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
T
Y
 
Y
T
|
T
I
 
V
G
 
N
T
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
A
S
 
A
V
 
V
M
 
A
A
 
T
L
 
M
L
 
V
R
 
D
D
 
K
H
 
D
L
 
L
A
 
R
P
 
G
R
 
C
L
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
E
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
A
 
K
I
 
I
W
 
W
R
 
Q
E
 
S
L
 
M
L
 
W
F
 
W
A
 
R
T
 
L
H
 
H
A
 
Y
T
 
A
S
 
G
V
 
R
G
 
G
A
 
G
I
 
H
T
 
A
S
 
T
L
 
S
A
 
A
L
 
I
A
 
S
A
 
A
I
 
V
D
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
W
 
L
R
 
K
C
 
G
R
 
I
R
 
R
D
 
A
G
 
R
Q
 
T
P
 
P
L
 
L
W
 
W
L
 
K
A
 
L
A
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
Q
 
D
P
 
P
R
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
T
 
A
T
x
G
E
 
-
G
 
G
G
 
I
W
 
D
L
 
L
H
 
E
L
 
L
D
 
P
A
 
V
D
 
A
T
 
D
L
 
L
V
 
K
S
 
T
E
 
Q
A
 
A
V
 
D
A
 
R
A
 
F
R
 
L
E
 
A
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
A
A
 
I
K
|
K
L
 
M
K
|
K
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
P
R
 
D
A
 
L
S
 
K
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
D
R
 
R
L
 
V
A
 
S
A
 
A
V
 
L
R
 
R
D
 
E
A
 
H
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
S
F
 
F
E
 
P
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
M
C
 
K
F
 
W
T
 
T
A
 
V
A
 
D
E
 
G
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
A
A
 
A
P
 
R
H
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
P
L
 
F
G
 
D
I
 
L
A
 
H
W
 
W
F
x
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
P
 
I
A
 
P
D
 
D
D
 
D
I
 
L
G
 
V
G
 
G
H
 
N
V
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
V
A
 
R
S
 
E
T
 
S
S
 
G
V
 
H
P
 
T
I
|
I
A
 
A
V
 
G
G
|
G
E
|
E
S
 
N
L
 
L
Y
 
H
S
 
T
P
 
L
G
 
Y
Q
 
D
F
 
F
A
 
H
E
 
N
Y
 
A
V
 
V
R
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
S
C
 
L
G
 
T
I
 
L
V
 
P
Q
x
E
A
 
P
D
|
D
V
 
V
A
 
S
R
 
N
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
T
 
T
P
 
T
W
 
F
L
 
R
K
 
K
V
 
V
A
 
A
H
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
H
 
N
N
 
N
L
 
M
S
 
L
I
 
L
C
 
T
P
 
S
H
|
H
F
x
G
L
x
V
M
 
H
E
 
D
L
 
L
H
 
T
V
 
V
S
 
H
L
 
A
C
 
L
A
 
A
A
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
H
A
 
R
A
 
T
W
x
Y
V
 
M
E
|
E
Y
 
-
I
 
-
P
 
A
Q
 
H
L
 
L
D
 
H
E
 
A
I
 
Y
A
 
M
A
 
A
S
 
E
S
 
P
V
 
M
R
 
A
I
 
V
E
 
T
A
 
D
G
 
G
H
 
C
A
 
V
I
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
H
G
 
G
I
 
V
E
 
V
W
 
L
D
 
D
W
 
F
A
 
E
A
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
L
T
 
A
V
 
V

Q9RKF7 3,6-anhydro-alpha-L-galactonate cycloisomerase; AHGA cycloisomerase; EC 5.5.1.25 from Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145)
38% identity, 97% coverage: 6:363/368 of query aligns to 5:361/361 of Q9RKF7

query
sites
Q9RKF7
V
 
V
Q
 
R
V
 
T
E
 
D
L
 
L
L
 
Y
Q
 
R
V
 
I
D
 
P
L
 
L
P
 
P
P
 
T
R
 
R
V
 
L
P
 
-
R
 
-
S
 
T
D
 
D
A
 
S
I
 
T
Q
 
H
S
 
G
F
 
A
V
 
M
M
 
M
Q
 
D
-
 
F
E
 
E
T
 
L
P
 
I
M
 
T
V
 
V
R
 
R
I
 
I
R
 
E
C
 
D
D
 
S
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
T
G
 
G
T
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
T
Y
 
Y
T
 
T
I
 
V
G
 
N
T
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
A
S
 
A
V
 
V
M
 
A
A
 
T
L
 
M
L
 
V
R
 
D
D
 
K
H
 
D
L
 
L
A
 
R
P
 
G
R
 
C
L
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
E
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
A
 
K
I
 
I
W
 
W
R
 
Q
E
 
S
L
 
M
L
 
W
F
 
W
A
 
R
T
 
L
H
 
H
A
 
Y
T
 
A
S
 
G
V
 
R
G
 
G
A
 
G
I
 
H
T
 
A
S
 
T
L
 
S
A
 
A
L
 
I
A
 
S
A
 
A
I
 
V
D
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
W
 
L
R
 
K
C
 
G
R
 
I
R
 
R
D
 
A
G
 
R
Q
 
T
P
 
P
L
 
L
W
 
W
L
 
K
A
 
L
A
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
Q
 
D
P
 
P
R
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
T
 
A
T
 
G
E
 
-
G
 
G
G
 
I
W
 
D
L
 
L
H
 
E
L
 
L
D
 
P
A
 
V
D
 
A
T
 
D
L
 
L
V
 
K
S
 
T
E
 
Q
A
 
A
V
 
D
A
 
R
A
 
F
R
 
L
E
 
A
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
G
 
A
A
 
I
K
 
K
L
 
M
K
 
K
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
P
R
 
D
A
 
L
S
 
K
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
D
R
 
R
L
 
V
A
 
S
A
 
A
V
 
L
R
 
R
D
 
E
A
 
H
V
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
S
F
 
F
E
 
P
L
 
L
M
 
M
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
 
N
Q
 
M
C
 
K
F
 
W
T
 
T
A
 
V
A
 
D
E
 
G
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
A
A
 
A
P
 
R
H
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
P
L
 
F
G
 
D
I
 
L
A
 
H
W
 
W
F
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
T
P
 
I
A
 
P
D
 
D
D
 
D
I
 
L
G
 
V
G
 
G
H
 
N
V
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
V
A
 
R
S
 
E
T
 
S
S
 
G
V
 
H
P
 
T
I
 
I
A
 
A
V
 
G
G
 
G
E
|
E
S
 
N
L
 
L
Y
 
H
S
 
T
P
 
L
G
 
Y
Q
 
D
F
 
F
A
 
H
E
 
N
Y
 
A
V
 
V
R
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
S
C
 
L
G
 
T
I
 
L
V
 
P
Q
 
E
A
 
P
D
 
D
V
 
V
A
 
S
R
 
N
I
 
I
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
T
 
T
P
 
T
W
 
F
L
 
R
K
 
K
V
 
V
A
 
A
H
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
H
 
N
N
 
N
L
 
M
S
 
L
I
 
L
C
 
T
P
 
S
H
 
H
F
 
G
L
 
V
M
 
H
E
 
D
L
 
L
H
 
T
V
 
V
S
 
H
L
 
A
C
 
L
A
 
A
A
 
S
V
 
V
P
 
P
N
 
H
A
 
R
A
 
T
W
 
Y
V
 
M
E
 
E
-
 
A
Y
 
H
I
 
G
P
 
F
Q
 
G
L
 
L
D
 
H
E
 
A
I
 
Y
A
 
M
A
 
A
S
 
E
S
 
P
V
 
M
R
 
A
I
 
V
E
 
T
A
 
D
G
 
G
H
 
C
A
 
V
I
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
H
G
 
G
I
 
V
E
 
V
W
 
L
D
 
D
W
 
F
A
 
E
A
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
L
T
 
A
V
 
V
A
 
G

4h19A Crystal structure of an enolase (mandelate racemase subgroup, target efi-502087) from agrobacterium tumefaciens, with bound mg and d- ribonohydroxamate, ordered loop
36% identity, 94% coverage: 1:347/368 of query aligns to 1:354/372 of 4h19A

query
sites
4h19A
M
 
M
S
 
K
A
 
I
T
 
T
I
 
A
V
 
V
Q
 
E
V
 
P
E
 
F
L
 
I
L
 
L
Q
 
H
V
 
L
D
 
P
L
 
L
P
 
T
P
 
S
R
 
E
V
 
-
P
 
S
R
x
I
S
 
S
D
|
D
A
 
S
I
 
T
Q
x
H
S
 
S
F
 
I
V
 
T
M
 
H
Q
x
W
E
 
G
T
 
V
P
 
V
M
 
G
V
 
A
R
 
K
I
 
I
R
 
T
C
 
T
D
 
S
D
 
D
G
 
G
A
 
I
E
 
E
G
 
G
T
 
Y
G
 
G
Y
 
F
A
 
T
Y
 
G
T
|
T
I
x
H
G
 
A
T
 
H
G
 
L
G
 
P
S
 
S
S
 
D
-
 
R
-
 
L
V
 
I
M
 
T
A
 
S
L
 
C
L
 
I
R
 
S
D
 
D
H
 
C
L
 
Y
A
 
A
P
 
P
R
 
L
L
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
E
D
 
D
P
 
A
A
 
S
Q
 
D
I
 
H
E
 
S
A
 
R
I
 
L
W
 
W
R
 
T
E
 
K
L
 
L
L
 
A
F
 
R
A
 
Y
T
 
P
H
 
S
A
 
L
T
 
Q
S
 
W
V
 
V
G
 
G
-
 
R
-
 
A
A
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
H
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
D
T
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
W
 
I
R
 
K
C
 
A
R
 
K
R
 
K
D
 
A
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
L
 
L
W
 
W
L
 
H
A
 
Y
A
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
P
 
T
R
 
A
-
 
G
V
 
V
P
 
E
V
 
A
Y
 
Y
T
 
N
T
|
T
E
 
D
G
 
I
G
 
G
W
|
W
L
 
L
H
 
S
L
 
F
D
 
T
-
 
L
A
 
E
D
 
D
T
 
L
L
 
L
V
 
A
S
 
G
E
 
S
A
 
A
V
 
R
A
 
A
A
 
V
R
 
E
E
 
E
A
 
D
G
 
G
F
 
F
R
 
T
G
 
R
A
 
L
K
|
K
L
 
I
K
|
K
V
 
V
G
 
G
R
 
H
A
 
D
R
 
D
A
 
P
S
 
N
E
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
R
V
 
V
G
 
D
D
 
S
G
 
A
F
 
V
E
 
R
L
 
I
M
 
A
V
 
I
D
|
D
A
 
G
N
|
N
Q
 
G
C
 
K
F
 
W
T
 
D
A
 
L
A
 
P
E
 
T
A
 
C
I
 
Q
R
 
R
R
 
F
A
 
C
P
 
A
H
 
A
Y
 
A
A
 
K
E
 
D
L
 
L
G
 
D
I
 
I
A
 
Y
W
 
W
F
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
W
A
 
Y
D
 
D
D
 
D
I
 
V
G
 
T
G
 
S
H
 
H
V
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
R
S
 
N
T
 
T
S
 
S
V
 
I
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
L
G
|
G
E
|
E
S
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
S
 
T
P
 
V
G
 
D
Q
 
A
F
 
F
A
 
R
E
 
S
Y
 
F
V
 
I
R
x
D
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
C
 
V
G
 
A
I
 
Y
V
 
V
Q
|
Q
A
 
P
D
|
D
V
 
V
A
 
T
R
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
E
W
 
Y
L
 
I
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
H
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
L
A
 
A
H
|
H
N
 
R
L
 
L
S
 
P
I
 
V
C
 
V
P
 
P
H
|
H
F
x
A
-
x
G
-
 
E
L
 
M
M
 
S
E
 
Q
L
 
V
H
 
H
V
 
V
S
 
H
L
 
L
C
 
S
A
 
Y
A
 
W
V
 
H
P
 
P
N
 
A
A
 
S
A
 
T
W
 
I
V
 
L
E
|
E
Y
 
Y
I
 
I
P
 
P
Q
 
W
L
 
I
D
 
K
E
 
D
I
 
H
A
 
F
A
 
E
S
 
E
S
 
P
V
 
I
R
 
H
I
 
V
E
 
R
A
 
D
G
 
G
H
 
V
A
 
Y
I
 
K
A
 
R
P
 
P
D
 
E
A
 
Q
P
 
P
G
 
G

3op2A Crystal structure of putative mandelate racemase from bordetella bronchiseptica rb50 complexed with 2-oxoglutarate/phosphate
35% identity, 96% coverage: 1:354/368 of query aligns to 2:361/375 of 3op2A

query
sites
3op2A
M
 
L
S
 
K
A
 
I
T
 
T
I
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
A
E
 
H
L
 
A
L
 
L
Q
 
S
V
 
T
D
 
P
L
 
I
P
 
P
P
 
E
R
 
R
V
x
M
P
 
R
R
 
V
S
 
E
D
 
S
A
 
G
I
 
A
Q
 
G
S
 
L
F
 
K
V
 
L
M
 
N
Q
 
R
E
 
Q
T
 
M
P
 
I
M
 
L
V
 
V
R
 
E
I
 
V
R
 
R
C
 
T
D
 
D
D
 
E
G
 
G
A
 
V
E
 
T
G
 
G
T
 
V
G
 
G
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
S
T
 
P
G
 
S
G
|
G
S
 
P
S
 
Y
V
x
D
M
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
L
R
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
I
-
 
E
D
 
D
H
 
V
L
 
I
A
 
G
P
 
P
R
 
Q
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
N
I
 
I
E
 
N
A
 
Y
I
 
L
W
 
W
R
 
H
E
 
K
L
 
V
L
 
F
F
 
H
A
 
G
T
 
E
H
 
V
A
 
S
T
 
R
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
I
I
 
A
T
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
A
L
 
M
A
 
S
A
 
G
I
 
V
D
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
W
 
L
R
 
K
C
 
G
R
 
R
R
 
A
D
 
M
G
 
N
Q
 
Q
P
 
P
L
 
I
W
 
Y
L
 
Q
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
K
-
 
F
-
 
H
Q
 
T
P
 
R
R
 
G
V
 
V
P
 
R
V
 
A
Y
 
Y
T
 
A
T
x
S
E
 
S
G
 
I
G
 
Y
W
 
W
L
 
-
H
 
D
L
 
L
D
 
T
A
 
P
D
 
D
T
 
Q
L
 
A
V
 
A
S
 
D
E
 
E
A
 
L
V
 
A
A
 
G
A
 
W
R
 
V
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
F
 
F
R
 
T
G
 
A
A
 
A
K
|
K
L
 
L
K
|
K
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
R
 
-
A
 
P
S
 
R
E
 
K
D
 
D
V
 
A
A
 
A
R
 
N
L
 
L
A
 
R
A
 
A
V
 
M
R
 
R
D
 
Q
A
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
A
G
 
D
F
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
L
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
C
 
S
F
 
L
T
 
G
A
 
R
A
 
H
E
 
D
A
 
A
I
 
L
R
 
A
R
 
M
A
 
L
P
 
R
H
 
I
Y
 
L
A
 
D
E
 
E
L
 
A
G
 
G
I
 
C
A
 
Y
W
 
W
F
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
S
A
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
I
G
 
E
G
 
G
H
 
H
V
 
R
R
 
I
L
 
L
-
 
R
A
 
A
A
 
Q
S
 
G
T
 
T
S
 
P
V
 
V
P
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
T
G
|
G
E
|
E
S
x
N
L
 
L
Y
 
Y
S
 
T
P
 
R
G
 
N
Q
 
A
F
 
F
A
 
N
E
 
D
Y
 
Y
V
 
I
R
 
R
Q
 
N
G
 
D
A
 
A
C
 
I
G
 
D
I
 
V
V
 
L
Q
|
Q
A
 
A
D
|
D
V
 
A
A
 
S
R
 
R
I
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
E
W
 
A
L
 
L
K
 
A
V
 
I
A
 
S
H
 
A
L
 
S
A
 
A
E
 
A
A
 
S
H
 
A
N
 
H
L
 
L
S
 
A
I
 
W
C
 
N
P
 
P
H
|
H
F
x
T
L
x
F
M
 
N
E
 
D
L
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
V
-
 
A
-
 
A
H
 
N
V
 
L
S
 
H
L
 
L
C
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
S
P
 
P
N
 
H
A
 
P
A
 
A
W
 
M
V
 
F
E
|
E
Y
 
W
-
 
D
I
|
I
P
 
T
Q
x
H
L
 
N
D
 
D
-
 
L
-
 
M
-
 
T
E
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
S
S
 
Y
S
 
D
V
 
L
R
 
K
I
 
L
E
 
E
A
 
N
G
 
G
H
 
L
A
 
V
I
 
Q
A
 
P
P
 
P
D
 
Q
A
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
E
W
 
I
D
 
D
W
 
W

3ozmA Crystal structure of enolase superfamily member from bordetella bronchiseptica complexed with mg, m-xylarate and l-lyxarate
34% identity, 96% coverage: 1:354/368 of query aligns to 2:366/386 of 3ozmA

query
sites
3ozmA
M
 
L
S
 
K
A
 
I
T
 
T
I
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
A
E
 
H
L
 
A
L
 
L
Q
 
S
V
 
T
D
 
P
L
 
I
P
 
P
P
 
E
R
 
R
V
x
M
P
 
R
R
 
V
S
 
E
D
x
S
A
 
G
I
x
A
Q
 
G
S
 
L
F
x
K
V
 
L
M
 
N
Q
 
R
E
 
Q
T
 
M
P
 
I
M
 
L
V
 
V
R
 
E
I
 
V
R
 
R
C
 
T
D
 
D
D
 
E
G
 
G
A
 
V
E
 
T
G
 
G
T
 
V
G
 
G
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
S
T
 
P
G
 
S
G
|
G
S
 
P
S
 
Y
V
x
D
M
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
L
R
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
I
-
 
E
D
 
D
H
 
V
L
 
I
A
 
G
P
 
P
R
 
Q
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
N
I
 
I
E
 
N
A
 
Y
I
 
L
W
 
W
R
 
H
E
 
K
L
 
V
L
 
F
F
 
H
A
 
G
T
 
E
H
 
V
A
 
S
T
 
R
S
 
N
V
 
L
G
 
G
-
 
H
-
 
R
A
 
S
I
 
V
T
 
G
S
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
M
A
 
S
A
 
G
I
 
V
D
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
W
 
L
R
 
K
C
 
G
R
 
R
R
 
A
D
 
M
G
 
N
Q
 
Q
P
 
P
L
 
I
W
 
Y
L
 
Q
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
K
-
 
F
-
 
H
Q
 
T
P
 
R
R
 
G
V
 
V
P
 
R
V
 
A
Y
 
Y
T
 
A
T
x
S
E
 
S
G
 
I
G
x
Y
W
 
W
L
 
-
H
 
D
L
 
L
D
 
T
A
 
P
D
 
D
T
 
Q
L
 
A
V
 
A
S
 
D
E
 
E
A
 
L
V
 
A
A
 
G
A
 
W
R
 
V
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
F
 
F
R
 
T
G
 
A
A
 
A
K
|
K
L
 
L
K
|
K
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
R
 
-
A
 
P
S
 
R
E
 
K
D
 
D
V
 
A
A
 
A
R
 
N
L
 
L
A
 
R
A
 
A
V
 
M
R
 
R
D
 
Q
A
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
A
G
 
D
F
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
L
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
C
 
S
F
 
L
T
 
G
A
 
R
A
 
H
E
 
D
A
 
A
I
 
L
R
 
A
R
 
M
A
 
L
P
 
R
H
 
I
Y
 
L
A
 
D
E
 
E
L
 
A
G
 
G
I
 
C
A
 
Y
W
 
W
F
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
S
A
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
I
G
 
E
G
 
G
H
 
H
V
 
R
R
 
I
L
 
L
-
 
R
A
 
A
A
 
Q
S
 
G
T
 
T
S
 
P
V
 
V
P
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
T
G
|
G
E
|
E
S
x
N
L
 
L
Y
 
Y
S
 
T
P
 
R
G
 
N
Q
 
A
F
 
F
A
 
N
E
 
D
Y
 
Y
V
 
I
R
 
R
Q
 
N
G
 
D
A
 
A
C
 
I
G
 
D
I
 
V
V
 
L
Q
|
Q
A
 
A
D
|
D
V
 
A
A
 
S
R
 
R
I
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
E
W
 
A
L
 
L
K
 
A
V
 
I
A
 
S
H
 
A
L
 
S
A
 
A
E
 
A
A
 
S
H
 
A
N
 
H
L
 
L
S
 
A
I
 
W
C
 
N
P
 
P
H
|
H
F
x
T
L
x
F
M
 
N
E
 
D
L
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
V
-
 
A
-
 
A
H
 
N
V
 
L
S
 
H
L
 
L
C
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
S
P
 
P
N
 
H
A
 
P
A
 
A
W
 
M
V
 
F
E
|
E
Y
 
W
-
 
D
I
|
I
P
 
T
Q
x
H
L
 
N
D
 
D
-
 
L
-
 
M
-
 
T
E
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
S
S
 
Y
S
 
D
V
 
L
R
 
K
I
 
L
E
 
E
A
 
N
G
 
G
H
 
L
A
 
V
I
 
Q
A
 
P
P
 
P
D
 
Q
A
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
E
W
 
I
D
 
D
W
 
W

3ozmD Crystal structure of enolase superfamily member from bordetella bronchiseptica complexed with mg, m-xylarate and l-lyxarate
34% identity, 96% coverage: 1:354/368 of query aligns to 2:366/381 of 3ozmD

query
sites
3ozmD
M
 
L
S
 
K
A
 
I
T
 
T
I
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
A
E
 
H
L
 
A
L
 
L
Q
 
S
V
 
T
D
 
P
L
 
I
P
 
P
P
 
E
R
 
R
V
x
M
P
 
R
R
 
V
S
 
E
D
 
S
A
 
G
I
 
A
Q
 
G
S
 
L
F
 
K
V
 
L
M
 
N
Q
 
R
E
 
Q
T
 
M
P
 
I
M
 
L
V
 
V
R
 
E
I
 
V
R
 
R
C
 
T
D
 
D
D
 
E
G
 
G
A
 
V
E
 
T
G
 
G
T
 
V
G
 
G
Y
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
S
T
 
P
G
 
S
G
|
G
S
 
P
S
 
Y
V
x
D
M
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
L
R
 
K
-
 
R
-
 
A
-
 
I
-
 
E
D
 
D
H
 
V
L
 
I
A
 
G
P
 
P
R
 
Q
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
E
D
 
D
P
 
P
A
 
A
Q
 
N
I
 
I
E
 
N
A
 
Y
I
 
L
W
 
W
R
 
H
E
 
K
L
 
V
L
 
F
F
 
H
A
 
G
T
 
E
H
 
V
A
 
S
T
 
R
S
 
N
V
 
L
G
 
G
-
 
H
-
 
R
A
 
S
I
 
V
T
 
G
S
 
I
L
 
A
A
 
A
L
 
M
A
 
S
A
 
G
I
 
V
D
 
D
T
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
W
 
L
R
 
K
C
 
G
R
 
R
R
 
A
D
 
M
G
 
N
Q
 
Q
P
 
P
L
 
I
W
 
Y
L
 
Q
A
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
K
-
 
F
-
 
H
Q
 
T
P
 
R
R
 
G
V
 
V
P
 
R
V
 
A
Y
 
Y
T
 
A
T
x
S
E
 
S
G
 
I
G
 
Y
W
 
W
L
 
-
H
 
D
L
 
L
D
 
T
A
 
P
D
 
D
T
 
Q
L
 
A
V
 
A
S
 
D
E
 
E
A
 
L
V
 
A
A
 
G
A
 
W
R
 
V
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
F
 
F
R
 
T
G
 
A
A
 
A
K
|
K
L
 
L
K
|
K
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
R
 
-
A
 
P
S
 
R
E
 
K
D
 
D
V
 
A
A
 
A
R
 
N
L
 
L
A
 
R
A
 
A
V
 
M
R
 
R
D
 
Q
A
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
A
G
 
D
F
 
V
E
 
E
L
 
I
M
 
L
V
 
V
D
|
D
A
 
A
N
|
N
Q
 
Q
C
 
S
F
 
L
T
 
G
A
 
R
A
 
H
E
 
D
A
 
A
I
 
L
R
 
A
R
 
M
A
 
L
P
 
R
H
 
I
Y
 
L
A
 
D
E
 
E
L
 
A
G
 
G
I
 
C
A
 
Y
W
 
W
F
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
S
A
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
I
G
 
E
G
 
G
H
 
H
V
 
R
R
 
I
L
 
L
-
 
R
A
 
A
A
 
Q
S
 
G
T
 
T
S
 
P
V
 
V
P
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
T
G
|
G
E
|
E
S
x
N
L
 
L
Y
 
Y
S
 
T
P
 
R
G
 
N
Q
 
A
F
 
F
A
 
N
E
 
D
Y
 
Y
V
 
I
R
 
R
Q
 
N
G
 
D
A
 
A
C
 
I
G
 
D
I
 
V
V
 
L
Q
|
Q
A
 
A
D
|
D
V
 
A
A
 
S
R
 
R
I
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
E
W
 
A
L
 
L
K
 
A
V
 
I
A
 
S
H
 
A
L
 
S
A
 
A
E
 
A
A
 
S
H
 
A
N
 
H
L
 
L
S
 
A
I
 
W
C
 
N
P
 
P
H
|
H
F
x
T
L
x
F
M
 
N
E
 
D
L
 
I
-
 
I
-
 
T
-
 
V
-
 
A
-
 
A
H
 
N
V
 
L
S
 
H
L
 
L
C
 
V
A
<