SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc03138 FitnessBrowser__Smeli:SMc03138 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
31% identity, 89% coverage: 21:261/270 of query aligns to 27:286/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
L
 
L
R
 
L
Q
 
E
S
 
V
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
A
A
 
E
I
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
V
G
 
K
S
 
V
F
 
G
Y
 
F
F
 
V
G
 
G
A
 
R
V
 
V
G
 
G
R
 
E
D
 
D
S
 
E
D
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
M
V
 
V
R
 
E
R
 
E
L
 
R
L
 
L
L
 
R
A
 
A
N
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
L
D
 
T
H
 
H
L
 
F
L
 
R
A
 
R
R
 
A
D
 
P
T
 
G
N
 
F
T
 
T
A
 
G
Y
 
L
T
 
Y
D
 
L
I
 
R
D
 
E
V
 
Y
T
 
L
P
 
P
A
 
L
G
 
G
D
 
Q
-
 
G
R
 
R
I
 
V
F
 
F
V
 
Y
H
 
Y
E
 
R
D
 
K
F
 
G
G
 
S
A
 
A
C
 
G
A
 
S
G
 
A
Y
 
L
R
 
A
P
 
P
D
 
G
A
 
A
G
 
F
E
 
D
I
 
P
E
 
D
L
 
Y
L
 
L
K
 
E
T
 
G
M
 
V
D
 
R
H
 
F
V
 
L
H
 
H
I
 
L
G
 
S
W
 
G
L
 
I
D
 
T
D
 
P
G
 
A
-
 
L
G
 
S
L
 
P
L
 
E
R
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
S
 
S
A
 
L
A
 
W
-
 
A
-
 
M
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
R
-
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
R
V
 
V
S
 
S
Q
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
N
V
 
Y
N
 
R
A
 
Q
A
 
T
A
 
L
A
 
W
D
 
S
L
 
P
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
F
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
A
V
 
L
D
 
P
G
 
G
L
 
V
S
 
D
I
 
L
A
 
L
F
 
F
G
 
L
S
 
S
A
 
E
G
 
E
E
 
E
D
 
A
E
 
E
T
 
L
S
 
L
A
 
F
E
 
G
R
 
R
L
 
V
T
 
E
G
 
E
E
 
A
F
 
L
L
 
R
A
 
A
R
 
L
G
 
S
A
 
A
R
 
P
L
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
L
T
x
K
R
 
R
G
|
G
A
 
A
L
 
K
G
 
G
S
 
A
L
 
W
A
 
A
-
 
F
S
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
R
E
 
R
V
 
V
A
 
E
S
 
G
A
 
S
G
x
A
I
x
F
R
 
-
A
 
A
V
|
V
E
 
E
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
T
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
I
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
I
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
A
L
 
V
E
 
W
G
 
G
R
 
L
A
 
P
L
 
V
A
 
E
A
 
E
C
 
R
L
 
L
E
 
R
A
 
L
G
 
A
R
x
N
D
 
L
L
 
L
A
 
G
A
|
A
D
 
S
T
 
V
C
 
A
T
 
A
H
 
S
V
 
R
G
 
G

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
31% identity, 89% coverage: 21:261/270 of query aligns to 27:286/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
L
 
L
R
 
L
Q
 
E
S
 
V
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
|
G
N
x
A
A
 
E
I
 
V
N
|
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
V
G
 
K
S
 
V
F
 
G
Y
 
F
F
 
V
G
 
G
A
 
R
V
 
V
G
 
G
R
 
E
D
 
D
S
 
E
D
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
M
V
 
V
R
 
E
R
 
E
L
 
R
L
 
L
L
 
R
A
 
A
N
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
L
D
 
T
H
 
H
L
 
F
L
 
R
A
 
R
R
 
A
D
 
P
T
 
G
N
 
F
T
 
T
A
 
G
Y
 
L
T
x
Y
D
 
L
I
 
R
D
 
E
V
 
Y
T
 
L
P
 
P
A
 
L
G
 
G
D
 
Q
-
 
G
R
 
R
I
 
V
F
 
F
V
 
Y
H
 
Y
E
x
R
D
 
K
F
 
G
G
 
S
A
 
A
C
 
G
A
 
S
G
 
A
Y
 
L
R
 
A
P
 
P
D
 
G
A
 
A
G
 
F
E
 
D
I
 
P
E
 
D
L
 
Y
L
 
L
K
 
E
T
 
G
M
 
V
D
 
R
H
 
F
V
 
L
H
 
H
I
 
L
G
 
S
W
 
G
L
 
I
D
 
T
D
 
P
G
 
A
-
 
L
G
 
S
L
 
P
L
 
E
R
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
S
 
S
A
 
L
A
 
W
-
 
A
-
 
M
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
R
-
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
R
V
 
V
S
 
S
Q
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
N
V
 
Y
N
x
R
A
 
Q
A
 
T
A
 
L
A
 
W
D
 
S
L
 
P
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
F
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
A
V
 
L
D
 
P
G
 
G
L
 
V
S
 
D
I
 
L
A
 
L
F
 
F
G
 
L
S
 
S
A
 
E
G
 
E
E
 
E
D
 
A
E
 
E
T
 
L
S
 
L
A
 
F
E
 
G
R
 
R
L
 
V
T
 
E
G
 
E
E
 
A
F
 
L
L
 
R
A
 
A
R
 
L
G
 
S
A
 
A
R
 
P
L
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
L
T
x
K
R
 
R
G
|
G
A
|
A
L
 
K
G
 
G
S
 
A
L
 
W
A
 
A
-
 
F
S
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
R
E
 
R
V
 
V
A
 
E
S
 
G
A
 
S
G
 
A
I
 
F
R
 
-
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
T
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
I
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
I
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
A
L
 
V
E
 
W
G
 
G
R
 
L
A
 
P
L
 
V
A
 
E
A
 
E
C
 
R
L
 
L
E
 
R
A
 
L
G
 
A
R
x
N
D
 
L
L
 
L
A
 
G
A
|
A
D
 
S
T
 
V
C
 
A
T
 
A
H
 
S
V
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
31% identity, 89% coverage: 21:261/270 of query aligns to 27:286/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
L
 
L
R
 
L
Q
 
E
S
 
V
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
|
G
N
x
A
A
x
E
I
x
V
N
|
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
V
G
 
K
S
 
V
F
 
G
Y
 
F
F
 
V
G
 
G
A
 
R
V
 
V
G
 
G
R
 
E
D
 
D
S
 
E
D
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
M
V
 
V
R
 
E
R
 
E
L
 
R
L
 
L
L
 
R
A
 
A
N
 
E
G
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
L
D
 
T
H
 
H
L
 
F
L
 
R
A
 
R
R
 
A
D
 
P
T
 
G
N
 
F
T
 
T
A
 
G
Y
 
L
T
 
Y
D
 
L
I
 
R
D
 
E
V
 
Y
T
 
L
P
 
P
A
 
L
G
 
G
D
 
Q
-
 
G
R
 
R
I
 
V
F
 
F
V
x
Y
H
x
Y
E
x
R
D
 
K
F
 
G
G
 
S
A
 
A
C
 
G
A
 
S
G
 
A
Y
 
L
R
 
A
P
 
P
D
 
G
A
 
A
G
 
F
E
 
D
I
 
P
E
 
D
L
 
Y
L
 
L
K
 
E
T
 
G
M
 
V
D
 
R
H
 
F
V
 
L
H
 
H
I
 
L
G
 
S
W
 
G
L
 
I
D
 
T
D
 
P
G
 
A
-
 
L
G
 
S
L
 
P
L
 
E
R
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
S
 
S
A
 
L
A
 
W
-
 
A
-
 
M
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
R
-
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
R
V
 
V
S
 
S
Q
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
N
V
 
Y
N
x
R
A
 
Q
A
 
T
A
 
L
A
 
W
D
 
S
L
 
P
E
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
F
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
A
V
 
L
D
 
P
G
 
G
L
 
V
S
 
D
I
 
L
A
 
L
F
 
F
G
 
L
S
|
S
A
 
E
G
 
E
E
 
E
D
 
A
E
 
E
T
 
L
S
 
L
A
 
F
E
 
G
R
 
R
L
 
V
T
 
E
G
 
E
E
 
A
F
 
L
L
 
R
A
 
A
R
 
L
G
 
S
A
 
A
R
 
P
L
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
L
T
x
K
R
|
R
G
|
G
A
|
A
L
x
K
G
|
G
S
x
A
L
 
W
A
 
A
-
 
F
S
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
R
E
 
R
V
 
V
A
 
E
S
 
G
A
 
S
G
 
A
I
 
F
R
 
-
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
T
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
I
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
I
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
A
L
 
V
E
 
W
G
 
G
R
 
L
A
 
P
L
 
V
A
 
E
A
 
E
C
 
R
L
 
L
E
 
R
A
 
L
G
 
A
R
x
N
D
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
A
D
 
S
T
 
V
C
 
A
T
 
A
H
 
S
V
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2c49A Crystal structure of methanocaldococcus jannaschii nucleoside kinase - an archaeal member of the ribokinase family (see paper)
29% identity, 84% coverage: 18:245/270 of query aligns to 31:264/299 of 2c49A

query
sites
2c49A
R
 
Q
A
 
I
P
 
P
L
 
S
R
 
A
Q
 
R
S
 
K
Y
 
Y
V
 
Y
G
|
G
G
|
G
N
 
A
A
 
A
I
 
A
N
|
N
V
 
T
A
 
A
V
 
V
Q
 
G
L
 
I
A
 
K
R
 
K
L
 
L
G
 
G
H
 
V
G
 
N
S
 
S
F
 
E
Y
 
L
F
 
L
G
 
S
A
 
C
V
 
V
G
 
G
R
 
Y
D
 
D
S
 
F
D
 
K
G
 
N
A
 
S
Q
 
G
V
 
Y
R
 
E
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
L
 
K
A
 
N
N
 
L
G
 
D
V
 
I
N
 
N
V
 
I
D
 
S
H
 
K
L
 
L
L
 
Y
A
 
-
R
 
-
D
 
-
T
 
-
N
 
-
T
 
-
A
 
-
Y
 
Y
T
 
S
D
 
E
I
 
E
D
 
E
V
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
K
G
x
A
D
 
-
R
 
W
I
 
I
F
 
F
V
 
T
H
 
D
E
 
K
D
 
D
-
 
N
-
 
N
-
x
Q
-
 
I
-
x
T
-
 
F
-
x
F
-
 
L
F
 
W
G
 
G
A
 
A
C
 
A
A
 
K
G
 
H
Y
 
Y
R
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
N
P
 
P
D
 
P
A
 
N
G
 
F
E
 
N
I
 
T
E
 
E
L
 
I
L
 
-
K
 
-
T
 
-
M
 
-
D
 
-
H
 
-
V
 
V
H
 
H
I
 
I
G
 
A
W
 
T
L
 
G
D
 
D
D
 
P
G
 
E
G
 
F
L
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
C
A
 
A
L
 
K
S
 
K
A
 
A
A
 
Y
G
 
G
V
 
N
S
 
N
V
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
P
S
 
G
Q
|
Q
D
|
D
V
 
L
S
 
P
V
 
Q
N
 
Y
A
 
S
A
 
K
A
 
E
A
 
M
D
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
I
-
 
I
D
 
E
G
 
H
L
 
T
S
 
N
I
 
F
A
 
L
F
 
F
G
 
M
S
x
N
A
 
K
G
 
H
E
 
E
D
 
F
E
 
E
T
 
R
S
 
A
A
 
S
E
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
N
G
 
F
E
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
D
F
 
Y
L
 
L
A
 
E
R
 
R
G
 
V
A
 
D
R
 
A
L
 
L
A
 
-
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
 
K
G
|
G
A
 
S
L
 
K
G
|
G
S
 
S
-
 
V
L
 
I
A
 
Y
S
 
T
D
 
K
G
 
D
A
 
K
E
 
K
V
 
I
A
 
E
S
 
I
A
 
P
G
x
C
I
 
I
R
 
K
A
 
A
V
 
G
E
 
K
V
 
V
V
 
I
D
 
D
T
 
P
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
F
 
Y
I
 
R
A
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
S
A
 
A
R
 
Y
L
 
V
E
 
K
G
 
G
R
 
Y
A
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
C
 
C

Sites not aligning to the query:

Q57849 Nucleoside kinase; NK; ATP-dependent nucleoside monophosphokinase; Cytidine kinase; Guanosine-inosine kinase; EC 2.7.1.213; EC 2.7.1.73 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) (see paper)
29% identity, 84% coverage: 18:245/270 of query aligns to 33:266/302 of Q57849

query
sites
Q57849
R
x
Q
A
 
I
P
 
P
L
 
S
R
 
A
Q
 
R
S
 
K
Y
 
Y
V
 
Y
G
 
G
G
|
G
N
 
A
A
 
A
I
 
A
N
|
N
V
 
T
A
 
A
V
 
V
Q
 
G
L
 
I
A
 
K
R
 
K
L
 
L
G
 
G
H
 
V
G
 
N
S
 
S
F
 
E
Y
 
L
F
 
L
G
 
S
A
 
C
V
 
V
G
 
G
R
 
Y
D
 
D
S
 
F
D
 
K
G
 
N
A
 
S
Q
 
G
V
 
Y
R
 
E
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
L
 
K
A
 
N
N
 
L
G
 
D
V
 
I
N
 
N
V
 
I
D
 
S
H
 
K
L
 
L
L
 
Y
A
 
-
R
 
-
D
 
-
T
 
-
N
 
-
T
 
-
A
 
-
Y
 
Y
T
 
S
D
 
E
I
 
E
D
 
E
V
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
K
G
 
A
D
 
-
R
 
W
I
 
I
F
 
F
V
 
T
H
 
D
E
 
K
D
 
D
-
 
N
-
 
N
-
x
Q
-
 
I
-
x
T
-
x
F
-
x
F
-
 
L
F
 
W
G
 
G
A
 
A
C
 
A
A
 
K
G
 
H
Y
 
Y
R
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
N
P
 
P
D
 
P
A
 
N
G
 
F
E
 
N
I
 
T
E
 
E
L
 
I
L
 
-
K
 
-
T
 
-
M
 
-
D
 
-
H
 
-
V
 
V
H
 
H
I
 
I
G
 
A
W
 
T
L
 
G
D
 
D
D
 
P
G
 
E
G
 
F
L
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
C
A
 
A
L
 
K
S
 
K
A
 
A
A
 
Y
G
 
G
V
 
N
S
 
N
V
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
P
S
 
G
Q
|
Q
D
 
D
V
 
L
S
 
P
V
 
Q
N
 
Y
A
 
S
A
 
K
A
 
E
A
 
M
D
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
I
-
 
I
D
 
E
G
 
H
L
 
T
S
 
N
I
 
F
A
 
L
F
 
F
G
 
M
S
x
N
A
 
K
G
 
H
E
 
E
D
 
F
E
 
E
T
 
R
S
 
A
A
 
S
E
 
N
R
 
L
L
 
L
T
 
N
G
 
F
E
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
D
F
 
Y
L
 
L
A
 
E
R
 
R
G
 
V
A
 
D
R
 
A
L
 
L
A
 
-
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
G
|
G
A
x
S
L
x
K
G
|
G
S
 
S
-
 
V
L
 
I
A
 
Y
S
 
T
D
 
K
G
 
D
A
 
K
E
 
K
V
 
I
A
 
E
S
 
I
A
 
P
G
 
C
I
 
I
R
 
K
A
 
A
V
 
G
E
 
K
V
 
V
V
 
I
D
 
D
T
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
S
F
 
Y
I
 
R
A
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
S
A
 
A
R
 
Y
L
 
V
E
 
K
G
 
G
R
 
Y
A
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
C
 
C

Sites not aligning to the query:

3uboA The crystal structure of adenosine kinase from sinorhizobium meliloti
29% identity, 94% coverage: 12:264/270 of query aligns to 35:315/338 of 3uboA

query
sites
3uboA
N
 
N
C
 
L
I
 
I
D
 
N
R
 
A
Y
 
D
R
 
R
A
 
A
P
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
 
Y
S
 
S
Y
 
R
V
 
M
G
 
G
-
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
x
G
G
|
G
N
x
S
A
 
A
I
 
G
N
|
N
V
 
T
A
 
A
V
 
A
Q
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
S
L
 
L
G
 
G
H
 
G
G
 
R
S
 
A
F
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
A
 
K
V
 
V
G
 
A
R
 
D
D
 
D
S
 
Q
D
 
L
G
 
G
A
 
E
Q
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
H
L
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
N
 
H
V
 
F
D
 
Q
-
 
T
H
 
K
L
 
P
L
 
L
A
 
D
R
 
G
D
 
H
T
 
P
N
 
P
T
 
T
A
 
A
Y
 
R
T
 
S
D
 
M
I
 
I
D
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
E
R
|
R
I
 
S
F
 
-
V
x
M
H
 
N
E
x
T
D
 
Y
F
 
L
G
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
E
Y
 
L
R
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
D
G
 
V
E
 
E
I
 
D
E
 
D
L
 
V
L
 
V
K
 
A
T
 
Q
M
 
S
D
 
K
H
 
V
V
 
T
H
 
Y
I
 
F
-
x
E
G
 
G
W
x
Y
L
 
L
D
 
W
D
 
D
G
 
P
G
 
P
L
 
R
L
 
A
R
 
K
R
 
D
A
 
A
L
 
I
S
 
R
A
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
I
-
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
H
-
 
G
-
 
R
-
 
E
-
 
T
G
 
A
V
 
M
S
 
T
V
 
L
S
 
S
Q
 
D
D
 
S
V
 
F
S
 
C
V
 
V
N
 
H
A
 
R
A
 
Y
A
 
R
A
 
S
D
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
E
-
 
L
L
 
M
E
 
R
V
 
S
D
 
G
G
 
T
L
 
V
S
 
D
I
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
A
S
x
N
A
 
R
G
 
Q
E
 
E
D
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
Y
E
 
E
T
 
T
S
 
E
A
 
D
E
 
F
R
 
D
L
 
R
T
 
A
G
 
L
E
 
E
F
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
D
A
 
C
R
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
A
V
 
V
T
|
T
R
 
L
G
x
S
A
x
E
L
 
E
G
|
G
S
 
S
L
 
V
A
 
V
S
 
V
D
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
R
A
 
V
S
 
R
A
 
V
G
 
G
I
 
A
R
 
S
A
 
V
V
x
L
E
 
E
-
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
L
F
 
Y
I
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
F
A
 
G
R
 
Y
L
 
T
E
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
E
C
 
C
L
 
S
E
 
K
A
 
L
G
 
G
R
x
N
D
 
L
L
 
A
A
|
A
A
 
G
D
 
I
T
 
V
C
x
I
T
 
G
H
 
Q
V
 
I
G
 
G
G
x
P
F
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7fcaD Pfkb(mycobacterium marinum) (see paper)
30% identity, 83% coverage: 9:233/270 of query aligns to 7:237/282 of 7fcaD

query
sites
7fcaD
V
 
I
G
 
G
D
 
E
N
 
A
C
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
I
Y
 
V
R
 
D
A
 
G
P
 
P
L
 
D
R
 
P
Q
 
A
S
 
E
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
S
A
 
P
I
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
R
G
 
D
S
 
V
F
 
D
Y
 
L
F
 
L
G
 
T
A
 
H
V
 
I
G
 
G
R
|
R
D
 
D
S
 
A
D
 
R
G
 
G
A
 
R
Q
 
R
V
 
I
R
 
A
R
 
E
L
 
Y
L
 
I
L
 
E
A
 
S
N
 
S
G
 
G
V
 
V
N
 
Q
V
 
L
-
 
V
-
x
S
D
x
G
H
 
S
L
 
Q
L
 
T
A
 
A
R
 
D
D
 
R
T
 
T
N
 
P
T
 
T
A
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
R
-
 
T
-
 
Y
-
 
A
-
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
E
Y
 
W
T
 
Q
D
 
I
I
 
P
D
 
D
V
 
T
T
 
P
P
 
P
A
 
V
G
 
A
D
 
P
R
 
P
I
 
L
F
 
L
V
 
V
H
 
H
E
 
T
D
 
-
F
 
-
G
 
G
A
 
S
C
 
I
A
 
A
G
 
A
Y
 
A
R
 
R
P
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
T
 
-
M
 
-
D
 
-
H
 
-
V
 
-
H
 
E
I
 
P
G
 
G
W
 
C
L
 
L
D
 
A
D
 
V
G
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
D
R
 
A
A
 
Y
L
 
R
S
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
T
V
 
V
S
 
S
V
 
F
S
 
D
Q
 
P
D
 
N
V
 
V
S
 
R
V
 
P
N
 
S
A
 
L
A
 
S
A
 
A
-
 
D
A
 
P
D
 
D
L
 
L
E
 
T
-
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
I
-
 
Q
-
 
R
-
 
L
V
 
V
D
 
E
G
 
R
L
 
S
S
 
D
I
 
I
A
 
I
F
 
K
G
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
E
E
 
D
-
 
L
-
 
H
-
 
W
-
 
I
D
 
D
E
 
P
T
 
T
S
 
Q
A
 
P
E
 
P
R
 
E
L
 
Q
T
 
T
G
 
A
E
 
R
-
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
R
 
C
G
 
G
A
 
P
R
 
A
L
 
I
A
 
V
V
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
L
G
 
G
A
 
D
L
 
Q
G
 
G
S
 
A
L
 
V
A
 
A
S
 
F
D
 
C
G
 
A
A
 
A
E
 
G
V
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
-
G
 
-
I
 
V
R
 
P
A
 
A
V
 
Q
E
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
A
F
 
F
I
 
M
A
 
A
G
 
G
F
 
L
I
 
L

A1A6H3 Ribokinase; AtRBSK; RK; EC 2.7.1.15 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
26% identity, 91% coverage: 23:267/270 of query aligns to 101:366/379 of A1A6H3

query
sites
A1A6H3
Q
 
Q
S
 
T
Y
 
L
V
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
K
A
 
G
I
 
A
N
 
N
V
 
Q
A
 
A
V
 
A
Q
 
C
L
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
L
G
 
M
H
 
Y
G
 
P
S
 
T
F
 
Y
Y
 
F
F
 
V
G
 
G
A
 
R
V
 
L
G
 
G
R
 
E
D
 
D
S
 
A
D
 
H
G
 
G
A
 
K
Q
 
L
V
 
I
R
 
A
R
 
E
L
 
A
L
 
L
L
 
G
A
 
D
N
 
D
G
 
G
V
 
C
N
 
G
V
 
V
D
 
H
H
 
L
L
 
D
L
 
Y
A
 
V
R
 
R
D
 
S
T
 
V
N
 
N
T
 
N
A
 
E
Y
 
P
T
 
T
D
 
G
I
 
H
D
 
A
V
 
V
T
 
V
-
 
M
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
N
-
 
S
-
 
I
-
 
I
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
M
P
 
K
A
 
A
G
 
W
D
 
P
R
 
E
I
 
I
F
 
M
V
 
S
H
 
D
E
 
D
D
 
D
F
 
L
G
 
E
A
 
I
C
 
V
A
 
R
G
 
-
Y
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
N
A
 
A
G
 
G
E
 
I
I
 
V
E
 
L
L
 
L
L
 
Q
K
 
R
T
 
E
M
 
I
-
 
P
D
 
D
H
 
S
V
 
I
H
 
N
I
 
I
G
 
Q
W
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
V
R
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
V
S
 
K
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
P
V
 
V
S
 
I
Q
 
L
D
 
D
V
 
V
-
 
G
S
 
G
V
 
M
N
 
D
A
 
T
A
 
P
A
 
I
A
 
P
D
 
N
L
 
E
E
 
L
V
 
L
D
 
D
G
 
S
L
 
I
S
 
D
I
 
I
A
 
-
F
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
L
G
 
S
E
 
P
D
 
N
E
 
E
T
 
T
S
 
E
A
 
L
E
 
S
R
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
T
-
 
E
-
 
T
-
 
F
-
 
E
-
 
Q
-
 
I
-
 
S
E
 
Q
F
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
K
G
 
C
A
 
H
R
 
K
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
-
T
 
-
R
 
K
G
 
Q
A
 
V
L
 
L
G
 
V
S
 
K
L
 
L
A
 
G
S
 
S
D
 
K
G
 
G
A
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
F
-
 
I
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
-
 
K
E
 
P
V
 
I
A
 
Q
S
 
Q
A
 
S
G
 
I
I
 
I
R
 
P
A
 
A
V
 
A
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
T
F
 
F
I
 
T
A
 
A
G
 
A
F
 
F
I
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
M
L
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
S
L
 
H
A
 
E
A
 
E
C
 
C
L
 
L
E
 
R
A
 
F
G
 
A
R
 
A
D
 
-
L
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
S
T
 
L
C
 
C
T
 
V
H
 
Q
V
 
V
-
 
K
G
 
G
G
 
A
F
 
I
P
 
P
Q
 
S
E
 
M
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6ilsB Structure of arabidopsis thaliana ribokinase complexed with ribose and atp (see paper)
26% identity, 91% coverage: 23:267/270 of query aligns to 35:300/313 of 6ilsB

query
sites
6ilsB
Q
 
Q
S
 
T
Y
 
L
V
 
A
G
 
G
G
|
G
N
x
K
A
 
G
I
 
A
N
|
N
V
 
Q
A
 
A
V
 
A
Q
 
C
L
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
L
G
 
M
H
 
Y
G
 
P
S
 
T
F
 
Y
Y
 
F
F
 
V
G
 
G
A
 
R
V
 
L
G
 
G
R
 
E
D
 
D
S
 
A
D
 
H
G
 
G
A
 
K
Q
 
L
V
 
I
R
 
A
R
 
E
L
 
A
L
 
L
L
 
G
A
 
D
N
 
D
G
 
G
V
 
C
N
 
G
V
 
V
D
 
H
H
 
L
L
 
D
L
 
Y
A
 
V
R
 
R
D
 
S
T
 
V
N
 
N
T
 
N
A
 
E
Y
 
P
T
 
T
D
 
G
I
 
H
D
 
A
V
 
V
T
 
V
-
 
M
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
N
-
 
S
-
 
I
-
 
I
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
M
P
 
K
A
 
A
G
 
W
D
 
P
R
 
E
I
 
I
F
 
M
V
 
S
H
 
D
E
 
D
D
 
D
F
 
L
G
 
E
A
 
I
C
 
V
A
 
R
G
 
-
Y
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
N
A
 
A
G
 
G
E
 
I
I
 
V
E
 
L
L
 
L
L
 
Q
K
 
R
T
x
E
M
 
I
-
 
P
D
 
D
H
 
S
V
 
I
H
 
N
I
 
I
G
 
Q
W
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
V
R
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
V
S
 
K
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
P
V
 
V
S
 
I
Q
 
L
D
 
D
V
 
V
-
 
G
S
 
G
V
 
M
N
 
D
A
 
T
A
 
P
A
 
I
A
 
P
D
 
N
L
 
E
E
 
L
V
 
L
D
 
D
G
 
S
L
 
I
S
 
D
I
 
I
A
 
-
F
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
L
G
 
S
E
 
P
D
x
N
E
 
E
T
 
T
S
 
E
A
 
L
E
 
S
R
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
M
-
 
P
-
 
T
-
 
E
-
 
T
-
 
F
-
 
E
-
 
Q
-
 
I
-
 
S
E
 
Q
F
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
K
G
 
C
A
 
H
R
 
K
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
-
T
 
-
R
 
K
G
 
Q
A
 
V
L
 
L
G
 
V
S
x
K
L
 
L
A
x
G
S
 
S
D
 
K
G
 
G
A
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
F
-
 
I
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
-
 
K
E
 
P
V
 
I
A
 
Q
S
 
Q
A
 
S
G
 
I
I
|
I
R
 
P
A
|
A
V
 
A
E
 
Q
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
|
F
I
 
T
A
 
A
G
 
A
F
 
F
I
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
M
L
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
S
L
 
H
A
 
E
A
 
E
C
 
C
L
 
L
E
 
R
A
 
F
G
 
A
R
 
A
D
 
-
L
 
A
A
 
A
A
|
A
D
x
S
T
 
L
C
 
C
T
 
V
H
 
Q
V
 
V
-
 
K
G
 
G
G
 
A
F
 
I
P
 
P
Q
 
S
E
 
M
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4k8pA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with 2-ethylbenzyl alcohol
28% identity, 94% coverage: 12:264/270 of query aligns to 38:318/332 of 4k8pA

query
sites
4k8pA
N
 
N
C
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
|
A
P
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
x
Y
S
 
S
Y
 
R
V
 
M
G
 
G
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
x
G
G
|
G
N
x
S
A
 
A
I
 
G
N
|
N
V
 
T
A
 
A
V
 
A
Q
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
G
G
 
K
S
 
A
F
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
A
 
N
V
 
V
G
 
A
R
 
A
D
 
D
S
 
Q
D
 
L
G
 
G
A
 
D
Q
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
H
L
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
N
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
H
L
 
Y
L
 
Q
A
 
T
R
 
K
D
 
P
T
 
K
N
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
P
T
 
T
A
 
A
Y
x
R
T
 
S
D
 
M
I
 
I
D
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
E
R
|
R
I
 
-
F
 
S
V
x
M
H
 
N
E
x
T
D
 
Y
F
 
L
G
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
E
Y
 
L
R
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
D
G
 
V
E
 
E
I
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
V
K
 
A
T
 
D
M
 
A
D
 
K
H
 
V
V
 
T
H
 
Y
I
 
F
-
x
E
G
 
G
W
x
Y
L
 
L
D
 
W
D
 
D
G
 
P
G
 
P
L
 
R
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
A
-
 
I
L
 
L
S
 
D
A
 
C
A
 
A
G
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
G
V
 
R
S
 
E
V
 
M
N
 
S
A
 
M
A
 
T
A
 
L
A
 
S
D
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
C
-
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
L
L
 
M
E
 
R
V
 
S
D
 
G
G
 
K
L
 
V
S
 
D
I
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
-
S
 
-
A
 
A
G
 
N
E
 
R
D
 
Q
E
 
E
T
 
A
S
 
L
A
 
S
E
 
L
R
 
Y
L
 
Q
T
 
T
G
 
D
E
 
D
F
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
D
A
 
C
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
S
A
 
E
L
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
V
A
 
I
S
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
R
E
 
E
-
 
R
V
 
Y
A
 
Y
S
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
I
V
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
L
F
 
F
I
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
Y
A
 
G
R
 
Y
L
 
T
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
D
C
 
C
L
 
G
E
 
K
A
 
L
G
 
G
R
 
C
D
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
I
T
 
V
C
 
I
T
 
Q
H
 
Q
V
 
I
G
 
G
G
x
P
F
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4lc4A Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with guanosine
28% identity, 94% coverage: 12:264/270 of query aligns to 36:316/330 of 4lc4A

query
sites
4lc4A
N
 
N
C
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
 
Y
S
 
S
Y
 
R
V
 
M
G
 
G
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
x
G
G
|
G
N
x
S
A
 
A
I
 
G
N
|
N
V
 
T
A
 
A
V
 
A
Q
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
G
G
 
K
S
 
A
F
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
A
 
N
V
 
V
G
 
A
R
 
A
D
 
D
S
 
Q
D
 
L
G
 
G
A
 
D
Q
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
H
L
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
N
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
H
L
 
Y
L
 
Q
A
 
T
R
 
K
D
 
P
T
 
K
N
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
P
T
 
T
A
 
A
Y
 
R
T
 
S
D
 
M
I
 
I
D
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
E
R
|
R
I
 
-
F
 
S
V
x
M
H
 
N
E
x
T
D
 
Y
F
 
L
G
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
E
Y
 
L
R
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
D
G
 
V
E
 
E
I
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
V
K
 
A
T
 
D
M
 
A
D
 
K
H
 
V
V
 
T
H
 
Y
I
 
F
-
x
E
G
 
G
W
x
Y
L
 
L
D
 
W
D
 
D
G
 
P
G
 
P
L
 
R
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
A
-
 
I
L
 
L
S
 
D
A
 
C
A
 
A
G
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
G
V
 
R
S
 
E
V
 
M
N
 
S
A
 
M
A
 
T
A
 
L
A
 
S
D
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
C
-
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
L
L
 
M
E
 
R
V
 
S
D
 
G
G
 
K
L
 
V
S
 
D
I
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
-
S
 
-
A
 
A
G
 
N
E
 
R
D
 
Q
E
 
E
T
 
A
S
 
L
A
 
S
E
 
L
R
 
Y
L
 
Q
T
 
T
G
 
D
E
 
D
F
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
D
A
 
C
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
T
|
T
R
 
M
G
x
S
A
x
E
L
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
V
A
 
I
S
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
R
E
 
E
-
 
R
V
 
Y
A
 
Y
S
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
I
V
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
L
F
 
F
I
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
Y
A
 
G
R
 
Y
L
 
T
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
D
C
 
C
L
 
G
E
 
K
A
 
L
G
 
G
R
 
C
D
 
L
L
 
A
A
|
A
A
 
G
D
 
I
T
 
V
C
x
I
T
 
Q
H
 
Q
V
 
I
G
 
G
G
x
P
F
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4kbeA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with benzoguanamine
28% identity, 94% coverage: 12:264/270 of query aligns to 36:316/330 of 4kbeA

query
sites
4kbeA
N
 
N
C
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
 
Y
S
 
S
Y
 
R
V
 
M
G
 
G
-
x
P
-
x
A
-
x
L
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
x
G
G
|
G
N
x
S
A
 
A
I
 
G
N
|
N
V
 
T
A
 
A
V
 
A
Q
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
G
G
 
K
S
 
A
F
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
A
 
N
V
 
V
G
 
A
R
 
A
D
 
D
S
 
Q
D
 
L
G
 
G
A
 
D
Q
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
H
L
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
N
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
H
L
 
Y
L
 
Q
A
 
T
R
 
K
D
 
P
T
 
K
N
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
P
T
 
T
A
 
A
Y
 
R
T
 
S
D
 
M
I
 
I
D
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
E
R
|
R
I
 
-
F
 
S
V
x
M
H
 
N
E
x
T
D
 
Y
F
 
L
G
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
E
Y
 
L
R
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
D
G
 
V
E
 
E
I
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
V
K
 
A
T
 
D
M
 
A
D
 
K
H
 
V
V
 
T
H
 
Y
I
 
F
-
x
E
G
 
G
W
x
Y
L
 
L
D
 
W
D
 
D
G
 
P
G
 
P
L
 
R
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
A
-
 
I
L
 
L
S
 
D
A
 
C
A
 
A
G
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
G
V
 
R
S
 
E
V
 
M
N
 
S
A
 
M
A
 
T
A
 
L
A
 
S
D
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
C
-
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
L
L
 
M
E
 
R
V
 
S
D
 
G
G
 
K
L
 
V
S
 
D
I
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
-
S
 
-
A
 
A
G
 
N
E
 
R
D
 
Q
E
 
E
T
 
A
S
 
L
A
 
S
E
 
L
R
 
Y
L
 
Q
T
 
T
G
 
D
E
 
D
F
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
D
A
 
C
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
S
A
 
E
L
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
V
A
 
I
S
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
R
E
 
E
-
 
R
V
 
Y
A
 
Y
S
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
I
V
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
L
F
 
F
I
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
Y
A
 
G
R
 
Y
L
 
T
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
D
C
 
C
L
 
G
E
 
K
A
 
L
G
 
G
R
 
C
D
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
I
T
 
V
C
 
I
T
 
Q
H
 
Q
V
 
I
G
 
G
G
x
P
F
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4kanA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with 2-(2,5-dimethyl-1,3-thiazol-4-yl)acetic acid
28% identity, 94% coverage: 12:264/270 of query aligns to 36:316/330 of 4kanA

query
sites
4kanA
N
 
N
C
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
|
A
P
x
E
L
 
L
R
 
L
Q
x
Y
S
 
S
Y
 
R
V
 
M
G
 
G
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
x
G
G
|
G
N
x
S
A
 
A
I
 
G
N
|
N
V
 
T
A
 
A
V
 
A
Q
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
G
G
 
K
S
 
A
F
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
A
 
N
V
 
V
G
 
A
R
 
A
D
 
D
S
 
Q
D
 
L
G
 
G
A
 
D
Q
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
H
L
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
N
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
H
L
 
Y
L
 
Q
A
 
T
R
 
K
D
 
P
T
 
K
N
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
P
T
 
T
A
 
A
Y
x
R
T
 
S
D
x
M
I
 
I
D
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
E
R
|
R
I
 
-
F
 
S
V
x
M
H
 
N
E
x
T
D
 
Y
F
 
L
G
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
E
Y
 
L
R
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
D
G
 
V
E
 
E
I
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
V
K
 
A
T
 
D
M
 
A
D
 
K
H
 
V
V
 
T
H
 
Y
I
 
F
-
x
E
G
 
G
W
x
Y
L
 
L
D
 
W
D
 
D
G
 
P
G
 
P
L
 
R
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
A
-
 
I
L
 
L
S
 
D
A
 
C
A
 
A
G
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
G
V
 
R
S
 
E
V
 
M
N
 
S
A
 
M
A
 
T
A
 
L
A
 
S
D
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
C
-
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
L
L
 
M
E
 
R
V
 
S
D
 
G
G
 
K
L
 
V
S
 
D
I
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
-
S
 
-
A
 
A
G
x
N
E
 
R
D
 
Q
E
 
E
T
 
A
S
 
L
A
 
S
E
 
L
R
 
Y
L
 
Q
T
 
T
G
 
D
E
 
D
F
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
D
A
 
C
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
T
|
T
R
 
M
G
x
S
A
 
E
L
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
V
A
 
I
S
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
R
E
 
E
-
 
R
V
 
Y
A
 
Y
S
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
I
V
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
L
F
 
F
I
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
Y
A
 
G
R
 
Y
L
 
T
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
D
C
 
C
L
 
G
E
 
K
A
 
L
G
 
G
R
 
C
D
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
I
T
 
V
C
 
I
T
 
Q
H
 
Q
V
 
I
G
 
G
G
x
P
F
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4kalA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with quinoline-3-carboxylic acid
28% identity, 94% coverage: 12:264/270 of query aligns to 36:316/330 of 4kalA

query
sites
4kalA
N
 
N
C
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
 
Y
S
 
S
Y
 
R
V
 
M
G
 
G
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
x
G
G
|
G
N
 
S
A
 
A
I
 
G
N
|
N
V
 
T
A
 
A
V
 
A
Q
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
G
G
 
K
S
 
A
F
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
A
 
N
V
 
V
G
 
A
R
 
A
D
 
D
S
 
Q
D
 
L
G
 
G
A
 
D
Q
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
H
L
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
N
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
H
L
 
Y
L
 
Q
A
 
T
R
 
K
D
 
P
T
 
K
N
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
P
T
 
T
A
 
A
Y
 
R
T
 
S
D
 
M
I
 
I
D
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
E
R
|
R
I
 
-
F
 
S
V
x
M
H
 
N
E
x
T
D
 
Y
F
 
L
G
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
E
Y
 
L
R
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
D
G
 
V
E
 
E
I
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
V
K
 
A
T
 
D
M
 
A
D
 
K
H
 
V
V
 
T
H
 
Y
I
 
F
-
x
E
G
 
G
W
x
Y
L
 
L
D
 
W
D
 
D
G
 
P
G
 
P
L
 
R
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
A
-
 
I
L
 
L
S
 
D
A
 
C
A
 
A
G
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
G
V
 
R
S
 
E
V
 
M
N
 
S
A
 
M
A
 
T
A
 
L
A
 
S
D
 
D
-
x
S
-
x
F
-
 
C
-
 
V
-
x
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
L
L
 
M
E
 
R
V
 
S
D
 
G
G
 
K
L
 
V
S
 
D
I
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
-
S
 
-
A
 
A
G
 
N
E
 
R
D
 
Q
E
 
E
T
 
A
S
 
L
A
x
S
E
 
L
R
 
Y
L
x
Q
T
 
T
G
 
D
E
 
D
F
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
D
A
 
C
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
S
A
 
E
L
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
V
A
 
I
S
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
R
E
 
E
-
 
R
V
 
Y
A
 
Y
S
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
I
V
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
L
F
 
F
I
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
Y
A
 
G
R
 
Y
L
 
T
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
D
C
 
C
L
 
G
E
 
K
A
 
L
G
 
G
R
 
C
D
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
I
T
 
V
C
 
I
T
 
Q
H
 
Q
V
 
I
G
 
G
G
 
P
F
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4kahA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with 4-bromo-1h-pyrazole
28% identity, 94% coverage: 12:264/270 of query aligns to 36:316/330 of 4kahA

query
sites
4kahA
N
 
N
C
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
x
Y
S
 
S
Y
 
R
V
 
M
G
 
G
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
x
G
G
|
G
N
x
S
A
 
A
I
 
G
N
|
N
V
 
T
A
 
A
V
 
A
Q
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
G
G
 
K
S
 
A
F
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
A
 
N
V
 
V
G
 
A
R
 
A
D
 
D
S
 
Q
D
x
L
G
 
G
A
 
D
Q
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
H
L
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
N
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
H
L
 
Y
L
 
Q
A
 
T
R
 
K
D
 
P
T
 
K
N
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
P
T
 
T
A
 
A
Y
 
R
T
 
S
D
 
M
I
 
I
D
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
E
R
|
R
I
 
-
F
 
S
V
x
M
H
 
N
E
x
T
D
 
Y
F
 
L
G
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
E
Y
 
L
R
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
D
G
 
V
E
 
E
I
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
V
K
 
A
T
 
D
M
 
A
D
 
K
H
 
V
V
 
T
H
 
Y
I
 
F
-
x
E
G
 
G
W
x
Y
L
 
L
D
 
W
D
 
D
G
 
P
G
 
P
L
 
R
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
A
-
 
I
L
 
L
S
 
D
A
 
C
A
 
A
G
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
G
V
 
R
S
 
E
V
 
M
N
 
S
A
 
M
A
 
T
A
 
L
A
 
S
D
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
C
-
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
L
L
 
M
E
 
R
V
 
S
D
 
G
G
 
K
L
 
V
S
 
D
I
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
-
S
 
-
A
 
A
G
 
N
E
 
R
D
 
Q
E
 
E
T
 
A
S
 
L
A
 
S
E
 
L
R
 
Y
L
 
Q
T
 
T
G
 
D
E
 
D
F
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
D
A
 
C
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
S
A
 
E
L
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
V
A
 
I
S
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
R
E
 
E
-
 
R
V
 
Y
A
 
Y
S
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
I
V
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
L
F
 
F
I
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
Y
A
 
G
R
 
Y
L
 
T
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
D
C
 
C
L
 
G
E
 
K
A
 
L
G
 
G
R
 
C
D
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
I
T
 
V
C
 
I
T
 
Q
H
 
Q
V
 
I
G
 
G
G
x
P
F
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4kadA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with n1-(2.3-dihydro-1h-inden-5-yl)acetam
28% identity, 94% coverage: 12:264/270 of query aligns to 36:316/330 of 4kadA

query
sites
4kadA
N
 
N
C
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
 
Y
S
 
S
Y
 
R
V
 
M
G
 
G
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
x
G
G
|
G
N
x
S
A
 
A
I
 
G
N
|
N
V
 
T
A
 
A
V
 
A
Q
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
G
G
 
K
S
 
A
F
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
A
 
N
V
 
V
G
 
A
R
 
A
D
 
D
S
 
Q
D
 
L
G
 
G
A
 
D
Q
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
H
L
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
N
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
H
L
 
Y
L
 
Q
A
 
T
R
 
K
D
 
P
T
 
K
N
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
P
T
 
T
A
 
A
Y
 
R
T
 
S
D
 
M
I
 
I
D
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
E
R
|
R
I
 
-
F
 
S
V
x
M
H
 
N
E
x
T
D
 
Y
F
 
L
G
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
E
Y
 
L
R
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
D
G
 
V
E
 
E
I
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
V
K
 
A
T
 
D
M
 
A
D
 
K
H
 
V
V
 
T
H
 
Y
I
 
F
-
x
E
G
 
G
W
x
Y
L
 
L
D
 
W
D
 
D
G
 
P
G
 
P
L
 
R
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
A
-
 
I
L
 
L
S
 
D
A
 
C
A
 
A
G
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
G
V
 
R
S
 
E
V
 
M
N
 
S
A
 
M
A
 
T
A
 
L
A
 
S
D
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
C
-
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
L
L
 
M
E
 
R
V
 
S
D
 
G
G
 
K
L
 
V
S
 
D
I
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
-
S
 
-
A
 
A
G
 
N
E
 
R
D
 
Q
E
 
E
T
 
A
S
 
L
A
 
S
E
 
L
R
 
Y
L
 
Q
T
 
T
G
 
D
E
 
D
F
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
D
A
 
C
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
M
G
x
S
A
x
E
L
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
V
A
 
I
S
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
R
E
 
E
-
 
R
V
 
Y
A
 
Y
S
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
I
V
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
L
F
 
F
I
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
Y
A
 
G
R
 
Y
L
 
T
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
D
C
 
C
L
 
G
E
 
K
A
 
L
G
 
G
R
 
C
D
 
L
L
 
A
A
|
A
A
 
G
D
 
I
T
 
V
C
x
I
T
 
Q
H
 
Q
V
 
I
G
 
G
G
 
P
F
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4k9iA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with norharmane
28% identity, 94% coverage: 12:264/270 of query aligns to 36:316/330 of 4k9iA

query
sites
4k9iA
N
 
N
C
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
 
Y
S
 
S
Y
 
R
V
 
M
G
 
G
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
x
G
G
|
G
N
x
S
A
 
A
I
 
G
N
|
N
V
 
T
A
 
A
V
 
A
Q
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
G
G
 
K
S
 
A
F
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
A
 
N
V
 
V
G
 
A
R
 
A
D
 
D
S
 
Q
D
 
L
G
 
G
A
 
D
Q
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
H
L
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
N
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
H
L
 
Y
L
 
Q
A
 
T
R
 
K
D
 
P
T
 
K
N
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
P
T
 
T
A
 
A
Y
 
R
T
 
S
D
 
M
I
 
I
D
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
E
R
|
R
I
 
-
F
 
S
V
x
M
H
 
N
E
x
T
D
 
Y
F
 
L
G
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
E
Y
 
L
R
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
D
G
 
V
E
 
E
I
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
V
K
 
A
T
 
D
M
 
A
D
 
K
H
 
V
V
 
T
H
 
Y
I
 
F
-
x
E
G
 
G
W
x
Y
L
 
L
D
 
W
D
 
D
G
 
P
G
 
P
L
 
R
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
A
-
 
I
L
 
L
S
 
D
A
 
C
A
 
A
G
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
G
V
 
R
S
 
E
V
 
M
N
 
S
A
 
M
A
 
T
A
 
L
A
 
S
D
 
D
-
x
S
-
x
F
-
 
C
-
 
V
-
x
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
L
L
 
M
E
 
R
V
 
S
D
 
G
G
 
K
L
 
V
S
 
D
I
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
-
S
 
-
A
 
A
G
 
N
E
 
R
D
 
Q
E
 
E
T
 
A
S
 
L
A
 
S
E
 
L
R
 
Y
L
x
Q
T
 
T
G
 
D
E
 
D
F
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
D
A
 
C
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
S
A
 
E
L
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
V
A
 
I
S
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
R
E
 
E
-
 
R
V
 
Y
A
 
Y
S
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
I
V
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
L
F
 
F
I
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
Y
A
 
G
R
 
Y
L
 
T
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
D
C
 
C
L
 
G
E
 
K
A
 
L
G
 
G
R
 
C
D
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
I
T
 
V
C
 
I
T
 
Q
H
 
Q
V
 
I
G
 
G
G
 
P
F
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4k9cA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with n-(hydroxymethyl)benzamide and 4-methyl-3,4- dihydro-2h-1,4-benzoxazine-7-carboxylic acid
28% identity, 94% coverage: 12:264/270 of query aligns to 36:316/330 of 4k9cA

query
sites
4k9cA
N
 
N
C
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
x
Y
S
 
S
Y
 
R
V
 
M
G
 
G
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
x
G
G
|
G
N
x
S
A
 
A
I
 
G
N
|
N
V
 
T
A
 
A
V
 
A
Q
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
G
G
 
K
S
 
A
F
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
A
 
N
V
 
V
G
 
A
R
 
A
D
 
D
S
x
Q
D
x
L
G
 
G
A
x
D
Q
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
H
L
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
N
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
H
L
 
Y
L
 
Q
A
 
T
R
 
K
D
 
P
T
 
K
N
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
-
x
P
T
 
T
A
 
A
Y
x
R
T
 
S
D
 
M
I
 
I
D
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
E
R
|
R
I
 
-
F
 
S
V
x
M
H
 
N
E
x
T
D
 
Y
F
 
L
G
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
E
Y
 
L
R
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
D
G
 
V
E
 
E
I
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
V
K
 
A
T
 
D
M
 
A
D
 
K
H
 
V
V
 
T
H
 
Y
I
 
F
-
x
E
G
 
G
W
x
Y
L
 
L
D
 
W
D
 
D
G
 
P
G
 
P
L
 
R
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
A
-
 
I
L
 
L
S
 
D
A
 
C
A
 
A
G
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
G
V
 
R
S
 
E
V
 
M
N
 
S
A
 
M
A
 
T
A
 
L
A
 
S
D
 
D
-
x
S
-
x
F
-
 
C
-
 
V
-
x
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
L
L
 
M
E
 
R
V
 
S
D
 
G
G
 
K
L
 
V
S
 
D
I
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
-
S
 
-
A
 
A
G
 
N
E
 
R
D
 
Q
E
 
E
T
 
A
S
 
L
A
 
S
E
 
L
R
 
Y
L
x
Q
T
 
T
G
 
D
E
 
D
F
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
D
A
 
C
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
S
A
 
E
L
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
V
A
 
I
S
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
R
E
 
E
-
 
R
V
 
Y
A
 
Y
S
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
I
V
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
L
F
 
F
I
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
Y
A
 
G
R
 
Y
L
 
T
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
D
C
 
C
L
 
G
E
 
K
A
 
L
G
 
G
R
 
C
D
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
I
T
 
V
C
 
I
T
 
Q
H
 
Q
V
 
I
G
 
G
G
x
P
F
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4k93A Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with n-(hydroxymethyl)benzamide
28% identity, 94% coverage: 12:264/270 of query aligns to 36:316/330 of 4k93A

query
sites
4k93A
N
 
N
C
x
L
I
|
I
D
 
D
R
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
x
Y
S
 
S
Y
 
R
V
 
M
G
 
G
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
x
G
G
|
G
N
x
S
A
 
A
I
 
G
N
|
N
V
 
T
A
 
A
V
 
A
Q
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
G
G
 
K
S
 
A
F
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
A
 
N
V
 
V
G
 
A
R
 
A
D
 
D
S
x
Q
D
 
L
G
 
G
A
x
D
Q
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
H
L
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
N
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
H
L
 
Y
L
 
Q
A
 
T
R
 
K
D
 
P
T
 
K
N
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
P
T
 
T
A
 
A
Y
x
R
T
 
S
D
 
M
I
 
I
D
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
E
R
|
R
I
 
-
F
 
S
V
x
M
H
 
N
E
x
T
D
 
Y
F
x
L
G
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
E
Y
 
L
R
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
D
G
 
V
E
 
E
I
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
V
K
 
A
T
 
D
M
 
A
D
 
K
H
 
V
V
 
T
H
 
Y
I
 
F
-
x
E
G
 
G
W
x
Y
L
 
L
D
 
W
D
|
D
G
 
P
G
 
P
L
 
R
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
A
-
 
I
L
 
L
S
 
D
A
 
C
A
 
A
G
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
G
V
 
R
S
 
E
V
 
M
N
 
S
A
 
M
A
 
T
A
 
L
A
 
S
D
 
D
-
x
S
-
x
F
-
 
C
-
 
V
-
x
D
-
 
R
-
 
Y
-
x
R
-
 
G
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
L
L
 
M
E
 
R
V
 
S
D
 
G
G
 
K
L
 
V
S
 
D
I
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
-
S
 
-
A
 
A
G
 
N
E
 
R
D
 
Q
E
 
E
T
 
A
S
x
L
A
x
S
E
 
L
R
 
Y
L
x
Q
T
 
T
G
x
D
E
 
D
F
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
x
R
L
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
D
A
 
C
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
S
A
 
E
L
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
V
A
 
I
S
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
R
E
 
E
-
 
R
V
 
Y
A
 
Y
S
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
I
V
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
L
F
 
F
I
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
Y
A
 
G
R
 
Y
L
 
T
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
D
C
 
C
L
 
G
E
 
K
A
 
L
G
 
G
R
 
C
D
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
I
T
 
V
C
 
I
T
 
Q
H
 
Q
V
 
I
G
 
G
G
x
P
F
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4k8tA Crystal structure of probable sugar kinase protein from rhizobium etli cfn 42 complexed with ethyl 3,4-diaminobenzoate
28% identity, 94% coverage: 12:264/270 of query aligns to 36:316/330 of 4k8tA

query
sites
4k8tA
N
 
N
C
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
P
 
E
L
 
L
R
 
L
Q
 
Y
S
 
S
Y
 
R
V
 
M
G
 
G
-
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
x
G
G
|
G
N
x
S
A
 
A
I
 
G
N
|
N
V
 
T
A
 
A
V
 
A
Q
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
N
L
 
L
G
 
G
H
 
G
G
 
K
S
 
A
F
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
A
 
N
V
 
V
G
 
A
R
 
A
D
 
D
S
 
Q
D
 
L
G
 
G
A
 
D
Q
 
I
V
 
F
R
 
T
R
 
H
L
 
D
L
 
I
L
 
R
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
N
 
-
V
 
-
D
 
-
H
 
H
L
 
Y
L
 
Q
A
 
T
R
 
K
D
 
P
T
 
K
N
 
G
-
 
A
-
x
F
-
 
P
-
x
P
T
 
T
A
 
A
Y
x
R
T
 
S
D
 
M
I
 
I
D
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
E
R
|
R
I
 
-
F
 
S
V
x
M
H
 
N
E
x
T
D
x
Y
F
 
L
G
 
G
A
 
A
C
 
C
A
 
V
G
 
E
Y
 
L
R
 
G
P
 
P
D
 
E
A
 
D
G
 
V
E
 
E
I
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
V
K
 
A
T
 
D
M
 
A
D
 
K
H
 
V
V
 
T
H
 
Y
I
 
F
-
x
E
G
 
G
W
x
Y
L
 
L
D
 
W
D
 
D
G
 
P
G
 
P
L
 
R
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
A
-
 
I
L
 
L
S
 
D
A
 
C
A
 
A
G
 
R
V
 
I
S
 
A
V
 
H
S
 
Q
Q
 
H
D
 
G
V
 
R
S
 
E
V
 
M
N
 
S
A
 
M
A
 
T
A
 
L
A
 
S
D
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
C
-
 
V
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
L
L
 
M
E
 
R
V
 
S
D
 
G
G
 
K
L
 
V
S
 
D
I
 
I
A
 
V
F
 
F
G
 
-
S
 
-
A
 
A
G
 
N
E
 
R
D
 
Q
E
 
E
T
 
A
S
 
L
A
 
S
E
 
L
R
 
Y
L
 
Q
T
 
T
G
 
D
E
 
D
F
 
F
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
D
A
 
C
R
 
K
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
M
G
 
S
A
 
E
L
 
N
G
 
G
S
 
A
L
 
V
A
 
I
S
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
R
E
 
E
-
 
R
V
 
Y
A
 
Y
S
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
I
V
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
L
F
 
F
I
 
A
A
 
S
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
Y
A
 
G
R
 
Y
L
 
T
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
D
C
 
C
L
 
G
E
 
K
A
 
L
G
 
G
R
 
C
D
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
I
T
 
V
C
 
I
T
 
Q
H
 
Q
V
 
I
G
 
G
G
x
P
F
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>SMc03138 FitnessBrowser__Smeli:SMc03138
MTSFRFAAVGDNCIDRYRAPLRQSYVGGNAINVAVQLARLGHGSFYFGAVGRDSDGAQVR
RLLLANGVNVDHLLARDTNTAYTDIDVTPAGDRIFVHEDFGACAGYRPDAGEIELLKTMD
HVHIGWLDDGGLLRRALSAAGVSVSQDVSVNAAAADLEVDGLSIAFGSAGEDETSAERLT
GEFLARGARLAVVTRGALGSLASDGAEVASAGIRAVEVVDTTGAGDSFIAGFIAARLEGR
ALAACLEAGRDLAADTCTHVGGFPQEPQSI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory