SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc04123 FitnessBrowser__Smeli:SMc04123 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4uc0A Crystal structure of a purine nucleoside phosphorylase (psi-nysgrc- 029736) from agrobacterium vitis
64% identity, 99% coverage: 4:265/265 of query aligns to 2:245/247 of 4uc0A

query
sites
4uc0A
A
 
A
A
 
V
D
 
D
F
 
L
L
 
L
K
 
I
G
 
D
R
 
R
L
 
L
G
 
N
A
 
G
H
 
L
A
 
L
P
 
P
R
 
R
Y
 
I
G
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
|
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
E
V
 
V
A
 
E
E
 
N
P
 
A
L
 
V
R
 
R
I
 
I
P
 
P
Y
 
F
A
 
A
E
 
D
I
 
I
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
P
V
 
-
S
 
-
S
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
K
E
 
E
F
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
L
I
 
F
G
 
A
D
 
G
T
 
Q
P
 
P
V
 
I
A
 
I
V
 
M
L
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
V
H
|
H
Y
 
Y
Y
|
Y
E
|
E
R
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
A
K
 
A
A
 
A
M
 
M
R
 
R
V
 
L
P
 
P
I
 
I
E
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
A
R
 
S
I
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
T
N
 
T
L
 
L
I
 
I
L
 
L
T
 
T
N
 
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
S
 
S
L
 
L
R
 
R
E
 
A
D
 
D
M
 
M
P
 
P
P
 
P
G
 
G
S
 
S
V
 
V
M
 
M
R
 
Q
I
 
L
A
 
I
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
N
F
 
F
A
 
S
G
 
G
A
 
H
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
E
E
 
T
S
 
G
D
 
D
E
 
G
R
 
R
F
 
F
V
 
V
G
 
G
M
 
M
T
 
T
N
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
A
 
G
A
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
E
G
 
A
M
 
M
E
 
R
E
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
D
R
 
A
L
 
E
G
 
D
I
 
I
P
 
S
L
 
L
A
 
S
R
 
S
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
M
W
 
W
F
 
F
S
 
S
G
 
G
P
 
P
S
 
S
F
|
F
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
R
 
R
I
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
|
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
A
R
 
R
F
 
F
F
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
I
T
|
T
N
|
N
F
 
Y
A
x
G
A
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
T
G
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
H
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
K
 
-
Q
 
D
M
 
M
A
 
A
P
 
P
L
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
K
E
 
R
M
 
M
I
 
I
S
 
V
S
 
D
E
 
G
G
 
G

3odgA Crystal structure of xanthosine phosphorylase bound with xanthine from yersinia pseudotuberculosis
46% identity, 94% coverage: 17:264/265 of query aligns to 22:272/273 of 3odgA

query
sites
3odgA
P
 
P
R
 
Q
Y
 
I
G
 
A
I
 
F
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
|
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
Q
V
 
I
A
 
T
E
 
N
P
 
D
L
 
T
R
 
T
I
 
I
P
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
I
 
I
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
P
V
 
V
S
 
S
S
 
S
V
 
V
S
 
H
G
 
G
H
|
H
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
V
A
 
L
G
 
G
R
 
D
I
 
L
G
 
C
D
 
G
T
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
M
V
 
C
L
 
M
S
 
K
G
 
G
R
 
R
A
 
G
H
|
H
Y
 
F
Y
|
Y
E
|
E
R
 
G
G
 
K
D
 
G
A
 
M
K
 
S
A
 
I
M
 
M
R
 
T
V
 
N
P
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
T
L
 
F
K
 
K
R
 
L
I
 
M
G
 
G
V
 
C
E
 
E
N
 
F
L
 
L
I
 
F
L
 
C
T
 
T
N
 
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
S
 
S
L
 
L
R
 
R
E
 
P
D
 
E
M
 
V
P
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
S
V
 
V
M
 
V
R
 
M
I
 
L
A
 
K
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
N
F
 
T
A
 
M
G
 
P
A
 
G
N
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
P
E
 
N
S
 
D
D
 
D
E
 
R
-
 
F
-
 
G
-
 
P
R
 
R
F
 
F
V
 
F
G
 
S
M
 
L
T
 
A
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
A
 
K
A
 
D
L
 
L
A
 
R
I
 
A
G
 
D
M
 
M
E
 
A
E
 
K
A
 
I
A
 
A
E
 
Q
R
 
Q
L
 
L
G
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
T
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
M
 
V
W
 
S
F
 
Y
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
C
F
|
F
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
M
R
 
Q
I
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
D
A
 
V
V
 
V
G
|
G
M
|
M
S
|
S
T
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
L
L
 
S
A
 
A
R
 
A
F
 
H
F
 
C
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
A
A
 
L
S
 
T
V
 
A
V
 
I
T
|
T
N
|
N
F
 
L
A
|
A
A
 
E
G
 
G
M
 
L
T
 
S
G
 
D
S
 
V
E
 
V
L
 
L
S
 
S
H
|
H
E
 
E
E
 
Q
T
 
T
K
 
L
Q
 
K
M
 
F
A
 
A
P
 
K
L
 
V
G
 
A
G
 
S
T
 
V
R
 
N
L
 
F
A
 
T
A
 
K
I
 
L
L
 
I
K
 
E
E
 
A
M
 
F
I
 
L
S
 
K
S
 
S
E
 
K

8swuA Structure of clostridium perfringens pnp bound to transition state analog immucillin h and sulfate (see paper)
46% identity, 93% coverage: 1:246/265 of query aligns to 8:251/269 of 8swuA

query
sites
8swuA
M
 
I
T
 
K
G
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
Y
L
 
I
K
 
K
G
 
G
R
 
K
L
 
-
G
 
S
A
 
K
H
 
Y
A
 
N
P
 
P
R
 
T
Y
 
I
G
 
G
I
 
L
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
L
 
I
V
 
A
D
 
D
A
 
Q
V
 
I
A
 
E
E
 
D
P
 
A
L
 
E
R
 
Y
I
 
F
P
 
P
Y
 
Y
A
 
N
E
 
E
I
 
I
P
 
P
G
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
V
S
 
S
S
 
T
V
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
A
G
 
G
E
 
R
F
 
L
V
 
V
A
 
I
G
 
G
R
 
K
I
 
F
G
 
Q
D
 
G
T
 
K
P
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
A
L
 
M
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
F
H
 
H
Y
 
Y
Y
|
Y
E
 
E
R
 
G
G
 
Y
D
 
S
A
 
M
K
 
Q
A
 
E
M
 
V
R
 
T
V
 
C
P
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
V
L
 
M
K
 
R
R
 
L
I
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
N
 
T
L
 
L
I
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
S
 
A
L
 
V
R
 
N
E
 
K
D
 
D
M
 
Y
P
 
T
P
 
P
G
 
G
S
 
D
V
 
L
M
 
M
R
 
I
I
 
I
A
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
L
A
 
N
F
 
L
A
 
S
G
 
G
A
 
S
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
K
E
 
N
S
 
L
D
 
N
E
 
E
-
 
F
-
 
G
-
 
T
R
 
R
F
 
F
V
 
P
G
 
D
M
 
M
T
 
S
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
A
 
K
A
 
D
L
 
L
A
 
R
I
 
A
G
 
Q
M
 
V
E
 
K
E
 
D
A
 
I
A
 
A
E
 
K
R
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
I
P
 
E
L
 
V
A
 
R
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
W
 
M
F
 
F
S
 
S
G
 
G
P
 
P
S
 
T
F
x
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
|
M
S
 
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
I
A
 
A
R
 
N
F
 
H
F
 
S
G
 
G
L
 
M
K
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
V
S
 
S
V
 
C
V
 
M
T
 
T
N
|
N
F
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
L
G
 
E
S
 
Q
E
 
P
L
 
L
S
 
N
H
|
H
E
 
E
E
 
E
T
x
V
K
 
M
Q
 
E
M
 
T
A
 
S

P46354 Purine nucleoside phosphorylase 1; PNP 1; Inosine phosphorylase; Inosine-guanosine phosphorylase; Purine nucleoside phosphorylase I; PNP I; Pu-NPase I; EC 2.4.2.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
46% identity, 91% coverage: 4:245/265 of query aligns to 8:251/271 of P46354

query
sites
P46354
A
 
A
A
 
A
D
 
A
F
 
F
L
 
I
K
 
K
G
 
Q
R
 
N
L
 
L
G
 
-
A
 
P
H
 
E
A
 
S
P
 
P
R
 
K
Y
 
I
G
 
G
I
 
L
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
|
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
I
L
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
E
V
 
I
A
 
E
E
 
N
P
 
P
L
 
V
R
 
K
I
 
L
P
 
K
Y
 
Y
A
 
E
E
 
D
I
 
I
P
 
P
G
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
V
S
 
S
S
 
T
V
 
V
S
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
F
 
L
V
 
V
A
 
L
G
 
G
R
 
T
I
 
L
G
 
E
D
 
G
T
 
V
P
 
S
V
 
V
A
 
I
V
 
A
L
 
M
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
F
H
 
H
Y
 
F
Y
 
Y
E
 
E
R
 
G
G
 
Y
D
 
S
A
 
M
K
 
E
A
 
K
M
 
V
R
 
T
V
 
F
P
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
V
L
 
M
K
 
K
R
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
N
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
V
T
 
T
N
 
N
S
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
G
L
 
V
R
 
N
E
 
T
D
 
E
M
 
F
P
 
R
P
 
A
G
 
G
S
 
D
V
 
L
M
 
M
R
 
I
I
 
I
A
 
T
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
N
F
 
F
A
 
M
G
 
G
A
 
T
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
I
G
 
G
-
 
P
L
 
N
E
 
E
S
 
A
D
 
D
-
 
F
-
 
G
E
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
P
G
 
D
M
 
M
T
 
S
N
 
S
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
A
 
K
A
 
D
L
 
L
A
 
S
I
 
S
G
 
L
M
 
A
E
 
E
E
 
K
A
 
I
A
 
A
E
 
K
R
 
D
L
 
L
G
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
I
A
 
Q
R
 
K
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
T
W
 
A
F
 
V
S
 
T
G
 
G
P
 
P
S
 
S
F
 
Y
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
V
R
 
R
M
 
F
A
 
L
R
 
R
I
 
T
L
 
M
G
 
G
A
 
S
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
 
G
M
 
M
S
 
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
V
A
 
A
R
 
N
F
 
H
F
 
A
G
 
G
L
 
M
K
 
R
V
 
V
A
 
L
A
 
G
A
 
I
S
 
S
V
 
C
V
 
I
T
 
S
N
 
N
F
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
L
G
 
D
S
 
Q
E
 
P
L
 
L
S
 
S
H
 
H
E
 
D
E
 
E
T
 
V
K
 
M
Q
 
E
M
 
V

P45563 Purine nucleoside phosphorylase 2; Inosine-guanosine phosphorylase; Purine nucleoside phosphorylase II; PNP II; Xanthosine phosphorylase; EC 2.4.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
45% identity, 92% coverage: 6:248/265 of query aligns to 15:260/277 of P45563

query
sites
P45563
D
 
D
F
 
I
L
 
I
K
 
K
G
 
T
R
 
Y
L
 
K
G
 
P
A
 
D
H
 
F
A
 
T
P
 
P
R
 
R
Y
 
V
G
 
A
I
 
F
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
L
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
Q
V
 
I
A
 
E
E
 
N
P
 
A
L
 
V
R
 
A
I
 
I
P
 
S
Y
 
Y
A
 
E
E
 
K
I
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
P
V
 
V
S
 
S
S
 
T
V
 
V
S
 
H
G
 
G
H
|
H
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
V
A
 
L
G
 
G
R
 
H
I
 
L
G
 
Q
D
 
G
T
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
V
V
 
C
L
 
M
S
 
K
G
 
G
R
|
R
A
x
G
H
|
H
Y
 
F
Y
 
Y
E
 
E
R
 
G
G
 
R
D
 
G
A
 
M
K
 
T
A
 
I
M
 
M
R
 
T
V
 
D
P
 
A
I
 
I
E
 
R
T
 
T
L
 
F
K
 
K
R
 
L
I
 
L
G
 
G
V
 
C
E
 
E
N
 
L
L
 
L
I
 
F
L
 
C
T
 
T
N
 
N
S
x
A
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
R
 
R
E
 
P
D
 
E
M
 
V
P
 
G
P
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
L
M
 
V
R
 
A
I
 
L
A
 
K
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
N
F
 
T
A
 
M
G
 
P
A
 
G
N
 
T
P
 
P
L
 
M
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
N
S
 
D
D
 
D
-
 
R
-
 
F
-
 
G
E
 
E
R
 
R
F
 
F
V
 
F
G
 
S
M
 
L
T
 
A
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
E
L
 
Y
A
 
R
I
 
A
G
 
L
M
 
L
E
 
Q
E
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
K
R
 
E
L
 
E
G
 
G
I
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
T
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
M
 
V
W
 
S
F
x
Y
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
N
F
 
F
E
|
E
T
 
T
P
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
M
R
 
Q
I
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
D
A
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
M
S
|
S
T
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
H
F
 
C
G
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
V
S
 
S
V
 
A
V
 
I
T
 
T
N
|
N
F
 
M
A
 
A
A
 
E
G
 
G
M
 
L
T
 
S
G
 
D
S
 
V
E
 
K
L
 
L
S
 
S
H
 
H
E
 
A
E
 
Q
T
 
T
K
 
L
Q
 
A
M
 
A
A
 
A
P
 
E
L
 
L

1yr3A Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase ii, the product of the xapa gene (see paper)
45% identity, 92% coverage: 6:248/265 of query aligns to 11:256/273 of 1yr3A

query
sites
1yr3A
D
 
D
F
 
I
L
 
I
K
 
K
G
 
T
R
 
Y
L
 
K
G
 
P
A
 
D
H
 
F
A
 
T
P
 
P
R
 
R
Y
 
V
G
 
A
I
 
F
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
|
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
L
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
Q
V
 
I
A
 
E
E
 
N
P
 
A
L
 
V
R
 
A
I
 
I
P
 
S
Y
 
Y
A
 
E
E
 
K
I
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
P
V
 
V
S
 
S
S
 
T
V
 
V
S
 
H
G
 
G
H
|
H
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
V
A
 
L
G
 
G
R
 
H
I
 
L
G
 
Q
D
 
G
T
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
V
V
 
C
L
 
M
S
 
K
G
 
G
R
 
R
A
 
G
H
|
H
Y
 
F
Y
|
Y
E
|
E
R
 
G
G
 
R
D
 
G
A
 
M
K
 
T
A
 
I
M
 
M
R
 
T
V
 
D
P
 
A
I
 
I
E
 
R
T
 
T
L
 
F
K
 
K
R
 
L
I
 
L
G
 
G
V
 
C
E
 
E
N
 
L
L
 
L
I
 
F
L
 
C
T
 
T
N
 
N
S
x
A
A
|
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
R
 
R
E
 
P
D
 
E
M
 
V
P
 
G
P
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
L
M
 
V
R
 
A
I
 
L
A
 
K
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
N
F
 
T
A
 
M
G
 
P
A
 
G
N
 
T
P
 
P
L
 
M
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
N
S
 
D
D
 
D
-
 
R
-
 
F
-
 
G
E
 
E
R
 
R
F
 
F
V
 
F
G
 
S
M
 
L
T
 
A
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
E
L
 
Y
A
 
R
I
 
A
G
 
L
M
 
L
E
 
Q
E
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
K
R
 
E
L
 
E
G
 
G
I
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
T
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
M
 
V
W
 
S
F
 
Y
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
N
F
 
F
E
|
E
T
 
T
P
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
M
R
 
Q
I
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
D
A
 
V
V
 
V
G
|
G
M
|
M
S
|
S
T
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
H
F
 
C
G
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
V
S
 
S
V
 
A
V
 
I
T
 
T
N
|
N
F
 
M
A
|
A
A
 
E
G
 
G
M
 
L
T
 
S
G
 
D
S
 
V
E
 
K
L
 
L
S
 
S
H
|
H
E
 
A
E
 
Q
T
 
T
K
 
L
Q
 
A
M
 
A
A
 
A
P
 
E
L
 
L

1yqqA Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase ii, the product of the xapa gene (see paper)
45% identity, 92% coverage: 6:248/265 of query aligns to 11:256/273 of 1yqqA

query
sites
1yqqA
D
 
D
F
 
I
L
 
I
K
 
K
G
 
T
R
 
Y
L
 
K
G
 
P
A
 
D
H
 
F
A
 
T
P
 
P
R
 
R
Y
 
V
G
 
A
I
 
F
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
|
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
A
L
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
Q
V
 
I
A
 
E
E
 
N
P
 
A
L
 
V
R
 
A
I
 
I
P
 
S
Y
 
Y
A
 
E
E
 
K
I
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
P
V
 
V
S
 
S
S
 
T
V
 
V
S
 
H
G
 
G
H
|
H
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
V
A
 
L
G
 
G
R
 
H
I
 
L
G
 
Q
D
 
G
T
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
V
V
 
C
L
 
M
S
 
K
G
 
G
R
|
R
A
 
G
H
|
H
Y
 
F
Y
|
Y
E
|
E
R
 
G
G
 
R
D
 
G
A
 
M
K
 
T
A
 
I
M
 
M
R
 
T
V
 
D
P
 
A
I
 
I
E
 
R
T
 
T
L
 
F
K
 
K
R
 
L
I
 
L
G
 
G
V
 
C
E
 
E
N
 
L
L
 
L
I
 
F
L
 
C
T
 
T
N
|
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
S
 
S
L
 
L
R
 
R
E
 
P
D
 
E
M
 
V
P
 
G
P
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
L
M
 
V
R
 
A
I
 
L
A
 
K
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
N
F
 
T
A
 
M
G
 
P
A
 
G
N
 
T
P
 
P
L
 
M
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
N
S
 
D
D
 
D
-
 
R
-
 
F
-
 
G
E
 
E
R
 
R
F
 
F
V
 
F
G
 
S
M
 
L
T
 
A
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
E
L
 
Y
A
 
R
I
 
A
G
 
L
M
 
L
E
 
Q
E
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
K
R
 
E
L
 
E
G
 
G
I
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
T
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
M
 
V
W
 
S
F
 
Y
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
N
F
 
F
E
|
E
T
 
T
P
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
M
R
 
Q
I
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
G
D
 
D
A
 
V
V
 
V
G
|
G
M
|
M
S
|
S
T
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
S
A
 
A
R
 
R
F
 
H
F
 
C
G
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
V
S
 
S
V
 
A
V
 
I
T
|
T
N
|
N
F
 
M
A
|
A
A
 
E
G
 
G
M
 
L
T
 
S
G
 
D
S
 
V
E
 
K
L
 
L
S
 
S
H
|
H
E
 
A
E
 
Q
T
|
T
K
 
L
Q
 
A
M
 
A
A
 
A
P
 
E
L
 
L

8swtA Structure of bacteroides fragilis pnp bound to transition state analog immucillin h and sulfate (see paper)
39% identity, 98% coverage: 4:262/265 of query aligns to 17:276/278 of 8swtA

query
sites
8swtA
A
 
T
A
 
A
D
 
A
F
 
F
L
 
L
K
 
K
G
 
G
R
 
K
L
 
M
G
 
H
A
 
T
H
 
-
A
 
S
P
 
P
R
 
E
Y
 
T
G
 
A
I
 
I
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
L
V
 
A
D
 
N
A
 
E
V
 
I
A
 
T
E
 
E
P
 
K
L
 
Y
R
 
E
I
 
I
P
 
K
Y
 
Y
A
 
E
E
 
D
I
 
I
P
 
P
G
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
V
S
 
S
S
 
T
V
 
V
S
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
S
G
 
G
E
 
K
F
 
L
V
 
I
A
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
L
G
 
G
D
 
N
T
 
K
P
 
E
V
 
I
A
 
M
V
 
A
L
 
M
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
F
H
|
H
Y
 
Y
Y
|
Y
E
 
E
R
 
G
G
 
Y
D
 
S
A
 
M
K
 
K
A
 
E
M
 
V
R
 
T
V
 
F
P
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
V
L
 
M
K
 
R
R
 
E
I
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
K
N
 
T
L
 
L
I
 
F
L
 
V
T
 
S
N
 
N
S
x
A
A
x
S
G
|
G
S
 
G
L
 
T
R
 
N
E
 
P
D
 
E
M
 
F
P
 
E
P
 
I
G
 
G
S
 
D
V
 
L
M
 
M
R
 
I
I
 
I
A
 
T
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
N
F
 
Y
A
 
F
G
 
P
A
 
E
N
 
H
P
 
P
L
 
L
I
 
R
G
 
G
-
 
K
-
 
N
L
 
I
E
 
P
S
 
Y
D
 
G
E
 
P
R
 
R
F
 
F
V
 
P
G
 
D
M
 
M
T
 
S
N
 
E
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
A
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
I
I
 
R
G
 
K
M
 
A
E
 
D
E
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
A
R
 
E
L
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
K
L
 
V
A
 
Q
R
 
H
G
 
G
V
 
I
Y
 
Y
M
 
I
W
 
G
F
 
T
S
 
Q
G
 
G
P
 
P
S
 
T
F
|
F
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
x
Y
R
 
K
M
 
L
A
 
F
R
 
H
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
V
G
|
G
M
|
M
S
 
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
V
A
 
A
R
 
N
F
 
H
F
 
C
G
 
G
L
 
I
K
 
K
V
 
V
A
 
F
A
 
G
A
 
I
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
x
D
F
 
L
A
 
G
A
 
V
G
 
E
M
 
G
T
 
K
G
 
I
S
 
V
E
 
E
L
 
V
S
 
S
H
|
H
E
 
E
E
 
E
T
 
V
K
 
Q
Q
 
K
M
 
A
A
 
A
P
 
D
L
 
A
G
 
A
G
 
Q
T
 
P
R
 
K
L
 
M
A
 
T
A
 
T
I
 
I
L
 
M
K
 
R
E
 
E
M
 
L
I
 
I
S
 
N

3lbaA The crystal structure of smu.1229 from streptococcus mutans ua159 bound to hypoxanthine
45% identity, 88% coverage: 6:238/265 of query aligns to 12:237/260 of 3lbaA

query
sites
3lbaA
D
 
D
F
 
F
L
 
L
K
 
T
G
 
A
R
 
K
L
 
-
G
 
G
A
 
V
H
 
Q
A
 
K
P
 
P
R
 
E
Y
 
F
G
 
G
I
 
L
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
|
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
E
L
 
L
V
 
A
D
 
E
A
 
E
V
 
I
A
 
E
E
 
N
P
 
A
L
 
L
R
 
V
I
 
L
P
 
N
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
I
 
I
P
 
P
G
 
N
F
 
W
P
 
-
V
 
-
S
 
-
S
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
G
H
 
R
A
 
S
G
 
G
E
 
K
F
 
L
V
 
I
A
 
Y
G
 
G
R
 
E
I
 
L
G
 
A
D
 
G
T
 
R
P
 
K
V
 
V
A
 
L
V
 
A
L
 
L
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
F
H
|
H
Y
 
Y
Y
|
Y
E
|
E
R
 
G
G
 
N
D
 
S
A
 
M
K
 
E
A
 
L
M
 
V
R
 
T
V
 
F
P
 
P
I
 
I
E
 
R
T
 
I
L
 
M
K
 
K
R
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
C
E
 
Q
N
 
G
L
 
L
I
 
I
L
 
V
T
 
T
N
 
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
S
 
G
L
 
I
R
 
-
E
 
-
D
 
G
M
 
F
P
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
T
V
 
L
M
 
M
R
 
A
I
 
I
A
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
N
F
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
M
G
 
G
L
 
E
E
 
N
S
 
L
D
 
D
E
 
D
-
 
F
-
 
G
-
 
F
R
 
R
F
 
F
V
 
P
G
 
D
M
 
M
T
 
S
N
 
N
A
 
A
Y
 
Y
D
 
T
A
 
A
A
 
D
L
 
Y
A
 
R
I
 
E
G
 
V
M
 
A
E
 
H
E
 
Q
A
 
V
A
 
A
E
 
D
R
 
K
L
 
I
G
 
G
I
 
I
P
 
K
L
 
L
A
 
D
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
I
W
 
G
F
 
V
S
 
S
G
 
G
P
 
P
S
 
S
F
x
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
 
A
A
 
F
R
 
K
I
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
|
V
G
|
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
V
A
 
A
R
 
V
F
 
H
F
 
S
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
A
 
L
A
 
G
A
 
I
S
 
S
V
 
A
V
 
I
T
 
T
N
|
N
F
 
Y
A
|
A
A
 
A
G
 
G
M
 
F
T
 
Q
G
 
-
S
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
N

4m1eB Crystal structure of purine nucleoside phosphorylase i from planctomyces limnophilus dsm 3776, nysgrc target 029364.
38% identity, 92% coverage: 17:261/265 of query aligns to 22:269/273 of 4m1eB

query
sites
4m1eB
P
 
P
R
 
A
Y
 
V
G
 
G
I
 
M
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
x
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
L
 
L
V
 
A
D
 
E
A
 
Q
V
 
I
A
 
E
E
 
Q
P
 
D
L
 
I
R
 
A
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
A
 
S
E
 
D
I
 
I
P
 
P
G
 
H
F
 
F
P
 
P
V
 
T
S
 
S
S
 
T
V
 
V
S
 
K
G
 
S
H
|
H
A
 
A
G
 
G
E
 
R
F
 
L
V
 
V
A
 
C
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
R
D
 
G
T
 
I
P
 
P
V
 
I
A
 
V
V
 
A
L
 
M
S
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
F
H
|
H
Y
 
Y
Y
|
Y
E
|
E
R
 
G
G
 
Y
D
 
S
A
 
L
K
 
E
A
 
Q
M
 
V
R
 
T
V
 
F
P
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
V
L
 
M
K
 
K
R
 
A
I
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
K
N
 
T
L
 
L
I
 
L
L
 
V
T
 
T
N
 
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
S
 
G
L
 
I
R
x
N
E
 
P
D
x
Q
M
 
L
P
 
D
P
 
L
G
 
S
S
 
D
V
 
V
M
 
L
R
 
I
I
 
I
A
 
E
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
N
F
 
L
A
 
M
G
 
P
A
 
E
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
R
G
 
G
L
 
P
E
 
N
S
 
D
D
 
E
E
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
P
R
 
R
F
 
F
V
 
P
G
 
D
M
 
M
T
 
S
N
 
H
A
 
P
Y
 
Y
D
 
D
A
 
C
A
 
Q
L
 
H
A
 
M
I
 
E
G
 
V
M
 
A
E
x
R
E
 
Q
A
 
V
A
 
A
E
 
L
R
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
I
P
x
H
L
 
C
A
x
P
R
 
K
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
M
 
V
W
 
A
F
 
V
S
 
S
G
 
G
P
 
P
S
 
N
F
 
L
E
|
E
T
 
T
P
 
R
A
 
A
E
 
E
I
 
Y
R
 
R
M
 
M
A
 
L
R
 
K
I
 
L
L
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
V
V
|
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
V
F
 
H
F
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
R
V
 
V
A
 
L
A
 
G
A
 
F
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
N
x
D
F
 
L
A
x
C
A
 
L
G
 
P
M
 
D
T
 
A
G
 
L
S
 
E
E
 
P
L
 
V
S
 
E
H
x
L
E
 
N
E
 
K
T
 
I
K
 
L
Q
 
E
M
 
V
A
 
A
P
 
A
L
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
A
R
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
R
I
 
L
L
 
I
K
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
L

P9WP01 Purine nucleoside phosphorylase; PNP; Pu-NPase; Inosine phosphorylase; Inosine-guanosine phosphorylase; EC 2.4.2.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
42% identity, 98% coverage: 4:262/265 of query aligns to 15:266/268 of P9WP01

query
sites
P9WP01
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
F
 
V
L
 
I
K
 
A
G
 
D
R
 
R
L
 
T
G
 
G
A
 
I
H
 
G
A
 
E
P
 
H
R
 
D
Y
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
|
S
G
 
G
L
 
W
G
 
L
S
 
P
L
 
A
V
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
S
P
 
P
L
 
T
R
 
T
I
 
V
-
 
L
P
 
P
Y
 
Q
A
 
A
E
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
V
V
 
P
S
 
P
S
 
T
V
 
A
S
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
L
A
 
S
G
 
V
R
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
A
T
 
H
P
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
A
G
 
G
R
|
R
A
x
I
H
|
H
Y
 
A
Y
 
Y
E
 
E
R
 
G
G
 
H
D
 
D
A
 
L
K
 
R
A
 
Y
M
 
V
R
 
V
V
 
H
P
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
A
L
 
A
K
 
R
R
 
A
I
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
Q
N
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
S
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
A
D
 
D
M
 
L
P
 
Q
P
 
V
G
 
G
S
 
Q
V
 
P
M
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
L
A
 
N
F
 
L
A
 
T
G
 
A
A
 
R
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
G
E
 
E
S
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
F
V
 
V
G
 
D
M
 
L
T
 
T
N
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
S
A
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
E
 
R
E
 
E
A
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
L
 
S
G
 
D
I
 
P
P
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
W
 
G
F
 
L
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
H
F
 
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
L
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
H
E
 
E
V
 
T
I
 
I
L
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
A
F
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
E
V
 
V
A
 
L
A
 
G
A
 
V
S
 
S
V
 
L
V
 
V
T
 
T
N
|
N
F
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
P
L
 
L
S
 
S
H
 
H
E
 
A
E
 
E
T
 
V
K
 
L
Q
 
A
M
 
A
A
 
G
P
 
A
L
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
A
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
D
M
 
V
I
 
I
S
 
A

1i80A Crystal structure of m. Tuberculosis pnp in complex with iminoribitol, 9-deazahypoxanthine and phosphate ion (see paper)
42% identity, 98% coverage: 4:262/265 of query aligns to 13:264/266 of 1i80A

query
sites
1i80A
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
F
 
V
L
 
I
K
 
A
G
 
D
R
 
R
L
 
T
G
 
G
A
 
I
H
 
G
A
 
E
P
 
H
R
 
D
Y
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
G
|
G
S
|
S
G
 
G
L
 
W
G
 
L
S
 
P
L
 
A
V
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
S
P
 
P
L
 
T
R
 
T
I
 
V
-
 
L
P
 
P
Y
 
Q
A
 
A
E
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
V
V
 
P
S
 
P
S
 
T
V
 
A
S
 
A
G
 
G
H
|
H
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
L
A
 
S
G
 
V
R
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
A
T
 
H
P
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
A
G
 
G
R
|
R
A
 
I
H
|
H
Y
 
A
Y
|
Y
E
|
E
R
 
G
G
 
H
D
 
D
A
 
L
K
 
R
A
 
Y
M
 
V
R
 
V
V
 
H
P
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
A
L
 
A
K
 
R
R
 
A
I
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
Q
N
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
N
|
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
S
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
A
D
 
D
M
 
L
P
 
Q
P
 
V
G
 
G
S
 
Q
V
 
P
M
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
L
A
 
N
F
 
L
A
 
T
G
 
A
A
 
R
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
G
E
 
E
S
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
F
V
 
V
G
 
D
M
 
L
T
 
T
N
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
S
A
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
E
 
R
E
 
E
A
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
L
 
S
G
 
D
I
 
P
P
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
W
 
G
F
 
L
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
H
F
x
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
L
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
L
V
|
V
G
|
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
H
E
 
E
V
 
T
I
 
I
L
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
A
F
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
E
V
 
V
A
 
L
A
 
G
A
 
V
S
 
S
V
 
L
V
 
V
T
 
T
N
|
N
F
 
L
A
|
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
P
L
 
L
S
 
S
H
|
H
E
 
A
E
 
E
T
 
V
K
 
L
Q
 
A
M
 
A
A
 
G
P
 
A
L
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
A
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
D
M
 
V
I
 
I
S
 
A

3sczA Combining crystallographic, thermodynamic, and molecular dynamics studies of mycobacterium tuberculosis purine nucleoside phosphorylase
42% identity, 98% coverage: 4:262/265 of query aligns to 10:261/263 of 3sczA

query
sites
3sczA
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
F
 
V
L
 
I
K
 
A
G
 
D
R
 
R
L
 
T
G
 
G
A
 
I
H
 
G
A
 
E
P
 
H
R
 
D
Y
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
|
S
G
 
G
L
 
W
G
 
L
S
 
P
L
 
A
V
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
S
P
 
P
L
 
T
R
 
T
I
 
V
-
 
L
P
 
P
Y
 
Q
A
 
A
E
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
V
V
 
P
S
 
P
S
 
T
V
 
A
S
 
A
G
 
G
H
|
H
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
L
A
 
S
G
 
V
R
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
A
T
 
H
P
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
I
H
|
H
Y
 
A
Y
|
Y
E
|
E
R
 
G
G
 
H
D
 
D
A
 
L
K
 
R
A
 
Y
M
 
V
R
 
V
V
 
H
P
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
A
L
 
A
K
 
R
R
 
A
I
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
Q
N
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
S
x
A
A
 
A
G
|
G
S
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
A
D
 
D
M
 
L
P
 
Q
P
 
V
G
 
G
S
 
Q
V
 
P
M
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
L
A
 
N
F
 
L
A
 
T
G
 
A
A
 
R
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
G
E
 
E
S
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
F
V
 
V
G
 
D
M
 
L
T
 
T
N
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
S
A
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
E
 
R
E
 
E
A
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
L
 
S
G
 
D
I
 
P
P
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
W
 
G
F
 
L
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
H
F
x
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
L
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
L
V
 
V
G
|
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
H
E
 
E
V
 
T
I
 
I
L
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
A
F
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
E
V
 
V
A
 
L
A
 
G
A
 
V
S
 
S
V
 
L
V
 
V
T
 
T
N
|
N
F
 
L
A
|
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
P
L
 
L
S
 
S
H
|
H
E
 
A
E
 
E
T
 
V
K
 
L
Q
 
A
M
 
A
A
 
G
P
 
A
L
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
A
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
D
M
 
V
I
 
I
S
 
A

7zsqC Human purine nucleoside phosphorylase in complex with js-555 (see paper)
42% identity, 98% coverage: 4:262/265 of query aligns to 15:266/268 of 7zsqC

query
sites
7zsqC
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
F
 
V
L
 
I
K
 
A
G
 
D
R
 
R
L
 
T
G
 
G
A
 
I
H
 
G
A
 
E
P
 
H
R
 
D
Y
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
G
|
G
S
|
S
G
 
G
L
 
W
G
 
L
S
 
P
L
 
A
V
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
S
P
 
P
L
 
T
R
 
T
I
 
V
-
 
L
P
 
P
Y
 
Q
A
 
A
E
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
V
V
 
P
S
 
P
S
 
T
V
 
A
S
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
L
A
 
S
G
 
V
R
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
A
T
 
H
P
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
A
G
 
G
R
|
R
A
 
I
H
|
H
Y
 
A
Y
|
Y
E
 
E
R
 
G
G
 
H
D
 
D
A
 
L
K
 
R
A
 
Y
M
 
V
R
 
V
V
 
H
P
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
A
L
 
A
K
 
R
R
 
A
I
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
Q
N
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
N
|
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
S
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
A
D
 
D
M
 
L
P
 
Q
P
 
V
G
 
G
S
 
Q
V
 
P
M
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
L
A
 
N
F
 
L
A
 
T
G
 
A
A
 
R
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
G
E
 
E
S
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
F
V
 
V
G
 
D
M
 
L
T
 
T
N
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
S
A
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
E
 
R
E
 
E
A
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
L
 
S
G
 
D
I
 
P
P
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
W
 
G
F
 
L
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
H
F
x
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
L
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
L
V
|
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
H
E
 
E
V
 
T
I
 
I
L
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
A
F
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
E
V
 
V
A
 
L
A
 
G
A
 
V
S
 
S
V
 
L
V
 
V
T
 
T
N
|
N
F
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
P
L
 
L
S
 
S
H
 
H
E
 
A
E
 
E
T
 
V
K
 
L
Q
 
A
M
 
A
A
 
G
P
 
A
L
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
A
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
D
M
 
V
I
 
I
S
 
A

4nsnA Crystal structure of purine nucleoside phosphorylase from porphyromonas gingivalis atcc 33277, nysgrc target 030972, orthorhombic symmetry
40% identity, 98% coverage: 4:263/265 of query aligns to 11:272/273 of 4nsnA

query
sites
4nsnA
A
 
A
A
 
A
D
 
S
F
 
F
L
 
L
K
 
S
G
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
P
A
 
G
H
 
D
A
 
A
P
 
-
R
 
K
Y
 
T
G
 
A
I
 
I
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
|
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
E
L
 
L
V
 
A
D
 
E
A
 
K
V
 
I
A
 
E
E
 
N
P
 
K
L
 
T
R
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
A
 
N
E
 
E
I
 
I
P
 
P
G
 
H
F
 
F
P
 
A
V
 
Q
S
 
A
S
 
T
V
 
A
S
 
V
G
 
G
H
|
H
A
 
K
G
 
G
E
 
N
F
 
I
V
 
I
A
 
G
G
 
G
R
 
I
I
 
L
G
 
G
D
 
G
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
V
V
 
A
L
 
M
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
A
 
F
H
|
H
Y
 
Y
Y
|
Y
E
|
E
R
 
G
G
 
Y
D
 
S
A
 
M
K
 
D
A
 
Q
M
 
V
R
 
T
V
 
F
P
 
P
I
 
I
E
 
R
T
 
V
L
 
M
K
 
K
R
 
L
I
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
L
I
 
F
L
 
V
T
 
S
N
 
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
S
 
G
L
 
I
R
 
N
E
 
T
D
 
S
M
 
F
P
 
K
P
 
V
G
 
G
S
 
D
V
 
L
M
 
M
R
 
I
I
 
I
A
 
C
D
 
D
H
 
H
I
 
I
A
 
N
F
 
N
A
 
L
G
 
-
A
 
P
N
 
N
P
 
P
L
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
P
E
 
N
S
 
M
D
 
D
E
 
M
-
 
F
-
 
G
-
 
V
R
 
R
F
 
F
V
 
P
G
 
D
M
 
M
T
 
T
N
 
R
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
A
 
R
A
 
E
L
 
F
A
 
I
I
 
A
G
 
K
M
 
A
E
 
K
E
 
G
A
 
I
A
 
A
E
 
Q
R
 
E
L
 
L
G
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
V
A
 
K
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
V
W
 
G
F
 
L
S
 
T
G
 
G
P
 
P
S
 
S
F
x
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
x
Y
R
 
K
M
 
F
A
 
W
R
 
G
I
 
Q
L
 
V
G
 
G
A
 
G
D
 
D
A
 
A
V
 
I
G
|
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
V
A
 
A
R
 
R
F
 
H
F
 
T
G
 
G
L
 
I
K
 
R
V
 
V
A
 
F
A
 
G
A
 
M
S
 
S
V
 
V
V
 
I
T
|
T
N
|
N
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
H
F
 
F
A
 
A
A
 
D
G
 
D
M
 
F
T
 
V
G
 
N
S
 
D
E
|
E
L
 
-
S
 
-
H
 
-
E
 
Q
E
 
D
T
 
V
K
 
I
Q
 
R
M
 
A
A
 
A
P
 
N
L
 
A
G
 
A
G
 
S
T
 
E
R
 
K
L
 
M
A
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
F
K
 
A
E
 
R
M
 
L
I
 
I
S
 
A
S
 
A

7zsqB Human purine nucleoside phosphorylase in complex with js-555 (see paper)
42% identity, 98% coverage: 4:262/265 of query aligns to 9:260/261 of 7zsqB

query
sites
7zsqB
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
F
 
V
L
 
I
K
 
A
G
 
D
R
 
R
L
 
T
G
 
G
A
 
I
H
 
G
A
 
E
P
 
H
R
 
D
Y
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
|
S
G
 
G
L
 
W
G
 
L
S
 
P
L
 
A
V
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
S
P
 
P
L
 
T
R
 
T
I
 
V
-
 
L
P
 
P
Y
 
Q
A
 
A
E
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
V
V
 
P
S
 
P
S
 
T
V
 
A
S
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
L
A
 
S
G
 
V
R
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
A
T
 
H
P
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
A
G
 
G
R
|
R
A
 
I
H
|
H
Y
 
A
Y
|
Y
E
 
E
R
 
G
G
 
H
D
 
D
A
 
L
K
 
R
A
 
Y
M
 
V
R
 
V
V
 
H
P
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
A
L
 
A
K
 
R
R
 
A
I
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
Q
N
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
N
|
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
S
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
A
D
 
D
M
 
L
P
 
Q
P
 
V
G
 
G
S
 
Q
V
 
P
M
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
L
A
 
N
F
x
L
A
 
T
G
 
A
A
 
R
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
V
G
 
G
L
x
G
E
 
E
S
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
F
|
F
V
 
V
G
 
D
M
 
L
T
 
T
N
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
S
A
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
E
 
R
E
 
E
A
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
L
 
S
G
 
D
I
 
P
P
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
W
 
G
F
 
L
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
H
F
x
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
|
M
A
 
L
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
L
V
|
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
H
E
 
E
V
 
T
I
 
I
L
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
A
F
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
E
V
 
V
A
 
L
A
 
G
A
 
V
S
 
S
V
 
L
V
 
V
T
 
T
N
|
N
F
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
P
L
 
L
S
 
S
H
 
H
E
 
A
E
 
E
T
 
V
K
 
L
Q
 
A
M
 
A
A
 
G
P
 
A
L
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
A
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
D
M
 
V
I
 
I
S
 
A

8c25A Purine nucleoside phosphorylase in complex with js-375 (see paper)
42% identity, 98% coverage: 4:262/265 of query aligns to 9:260/262 of 8c25A

query
sites
8c25A
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
F
 
V
L
 
I
K
 
A
G
 
D
R
 
R
L
 
T
G
 
G
A
 
I
H
 
G
A
 
E
P
 
H
R
 
D
Y
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
G
|
G
S
|
S
G
 
G
L
 
W
G
 
L
S
 
P
L
 
A
V
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
S
P
 
P
L
 
T
R
 
T
I
 
V
-
 
L
P
 
P
Y
 
Q
A
 
A
E
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
V
V
 
P
S
 
P
S
 
T
V
 
A
S
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
L
A
 
S
G
 
V
R
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
A
T
 
H
P
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
A
G
 
G
R
|
R
A
 
I
H
|
H
Y
 
A
Y
|
Y
E
 
E
R
 
G
G
 
H
D
 
D
A
 
L
K
 
R
A
 
Y
M
 
V
R
 
V
V
 
H
P
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
A
L
 
A
K
 
R
R
 
A
I
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
Q
N
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
N
|
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
S
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
A
D
 
D
M
 
L
P
 
Q
P
 
V
G
 
G
S
 
Q
V
 
P
M
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
L
A
 
N
F
 
L
A
 
T
G
 
A
A
 
R
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
G
E
 
E
S
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
F
V
 
V
G
 
D
M
 
L
T
 
T
N
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
S
A
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
E
 
R
E
 
E
A
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
L
 
S
G
 
D
I
 
P
P
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
W
 
G
F
 
L
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
H
F
x
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
L
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
L
V
|
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
H
E
 
E
V
 
T
I
 
I
L
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
A
F
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
E
V
 
V
A
 
L
A
 
G
A
 
V
S
 
S
V
 
L
V
 
V
T
|
T
N
|
N
F
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
P
L
 
L
S
 
S
H
|
H
E
 
A
E
 
E
T
 
V
K
 
L
Q
 
A
M
 
A
A
 
G
P
 
A
L
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
A
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
D
M
 
V
I
 
I
S
 
A

7zsrA Purine nucleoside phosphorylase in complex with js-379 (see paper)
42% identity, 98% coverage: 4:262/265 of query aligns to 9:260/262 of 7zsrA

query
sites
7zsrA
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
F
 
V
L
 
I
K
 
A
G
 
D
R
 
R
L
 
T
G
 
G
A
 
I
H
 
G
A
 
E
P
 
H
R
 
D
Y
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
G
|
G
S
|
S
G
 
G
L
 
W
G
 
L
S
 
P
L
 
A
V
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
S
P
 
P
L
 
T
R
 
T
I
 
V
-
 
L
P
 
P
Y
 
Q
A
 
A
E
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
V
V
 
P
S
 
P
S
 
T
V
 
A
S
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
L
A
 
S
G
 
V
R
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
A
T
 
H
P
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
A
G
 
G
R
|
R
A
 
I
H
|
H
Y
 
A
Y
 
Y
E
 
E
R
 
G
G
 
H
D
 
D
A
 
L
K
 
R
A
 
Y
M
 
V
R
 
V
V
 
H
P
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
A
L
 
A
K
 
R
R
 
A
I
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
Q
N
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
N
|
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
S
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
A
D
 
D
M
 
L
P
 
Q
P
 
V
G
 
G
S
 
Q
V
 
P
M
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
L
A
 
N
F
 
L
A
 
T
G
 
A
A
 
R
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
G
E
 
E
S
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
F
V
 
V
G
 
D
M
 
L
T
 
T
N
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
S
A
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
E
 
R
E
 
E
A
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
L
 
S
G
 
D
I
 
P
P
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
W
 
G
F
 
L
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
H
F
x
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
L
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
L
V
|
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
H
E
 
E
V
 
T
I
 
I
L
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
A
F
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
E
V
 
V
A
 
L
A
 
G
A
 
V
S
 
S
V
 
L
V
 
V
T
|
T
N
|
N
F
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
P
L
 
L
S
 
S
H
 
H
E
 
A
E
 
E
T
 
V
K
 
L
Q
 
A
M
 
A
A
 
G
P
 
A
L
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
A
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
D
M
 
V
I
 
I
S
 
A

7zsqA Human purine nucleoside phosphorylase in complex with js-555 (see paper)
42% identity, 98% coverage: 4:262/265 of query aligns to 9:260/262 of 7zsqA

query
sites
7zsqA
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
F
 
V
L
 
I
K
 
A
G
 
D
R
 
R
L
 
T
G
 
G
A
 
I
H
 
G
A
 
E
P
 
H
R
 
D
Y
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
G
|
G
S
|
S
G
 
G
L
 
W
G
 
L
S
 
P
L
 
A
V
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
S
P
 
P
L
 
T
R
 
T
I
 
V
-
 
L
P
 
P
Y
 
Q
A
 
A
E
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
V
V
 
P
S
 
P
S
 
T
V
 
A
S
 
A
G
 
G
H
|
H
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
L
A
 
S
G
 
V
R
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
A
T
 
H
P
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
A
G
 
G
R
|
R
A
 
I
H
|
H
Y
 
A
Y
|
Y
E
 
E
R
 
G
G
 
H
D
 
D
A
 
L
K
 
R
A
 
Y
M
 
V
R
 
V
V
 
H
P
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
A
L
 
A
K
 
R
R
 
A
I
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
Q
N
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
N
|
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
S
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
A
D
 
D
M
 
L
P
 
Q
P
 
V
G
 
G
S
 
Q
V
 
P
M
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
L
A
 
N
F
 
L
A
 
T
G
 
A
A
 
R
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
G
E
 
E
S
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
F
V
 
V
G
 
D
M
 
L
T
 
T
N
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
S
A
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
E
 
R
E
 
E
A
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
L
 
S
G
 
D
I
 
P
P
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
W
 
G
F
 
L
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
H
F
x
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
L
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
L
V
|
V
G
 
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
H
E
 
E
V
 
T
I
 
I
L
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
A
F
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
E
V
 
V
A
 
L
A
 
G
A
 
V
S
 
S
V
 
L
V
 
V
T
 
T
N
|
N
F
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
P
L
 
L
S
 
S
H
|
H
E
 
A
E
 
E
T
 
V
K
 
L
Q
 
A
M
 
A
A
 
G
P
 
A
L
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
A
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
D
M
 
V
I
 
I
S
 
A

3ix2A Crystal structure of purine nucleoside phosphorylase from mycobacterium tuberculosis in complex with acyclovir (see paper)
42% identity, 98% coverage: 4:262/265 of query aligns to 9:260/262 of 3ix2A

query
sites
3ix2A
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
F
 
V
L
 
I
K
 
A
G
 
D
R
 
R
L
 
T
G
 
G
A
 
I
H
 
G
A
 
E
P
 
H
R
 
D
Y
 
V
G
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
S
G
 
G
L
 
W
G
 
L
S
 
P
L
 
A
V
 
V
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
S
P
 
P
L
 
T
R
 
T
I
 
V
-
 
L
P
 
P
Y
 
Q
A
 
A
E
 
E
I
 
L
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
V
V
 
P
S
 
P
S
 
T
V
 
A
S
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
V
 
L
A
 
S
G
 
V
R
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
A
T
 
H
P
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
I
H
 
H
Y
 
A
Y
 
Y
E
 
E
R
 
G
G
 
H
D
 
D
A
 
L
K
 
R
A
 
Y
M
 
V
R
 
V
V
 
H
P
 
P
I
 
V
E
 
R
T
 
A
L
 
A
K
 
R
R
 
A
I
 
A
G
 
G
V
 
A
E
 
Q
N
 
I
L
 
M
I
 
V
L
 
L
T
 
T
N
|
N
S
x
A
A
|
A
G
|
G
S
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
A
D
 
D
M
 
L
P
 
Q
P
 
V
G
 
G
S
 
Q
V
 
P
M
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
S
D
 
D
H
 
H
I
 
L
A
 
N
F
 
L
A
 
T
G
 
A
A
 
R
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
V
G
 
G
L
 
G
E
 
E
S
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
F
V
 
V
G
 
D
M
 
L
T
 
T
N
 
D
A
 
A
Y
 
Y
D
 
S
A
 
P
A
 
R
L
 
L
A
 
-
I
 
-
G
 
-
M
 
-
E
 
R
E
 
E
A
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
L
 
S
G
 
D
I
 
P
P
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
M
 
A
W
 
G
F
 
L
S
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
H
F
x
Y
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
L
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
L
V
|
V
G
|
G
M
|
M
S
|
S
T
 
T
V
 
V
P
 
H
E
 
E
V
 
T
I
 
I
L
 
A
A
 
A
R
 
R
F
 
A
F
 
A
G
 
G
L
 
A
K
 
E
V
 
V
A
 
L
A
 
G
A
 
V
S
 
S
V
 
L
V
 
V
T
|
T
N
|
N
F
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
E
E
 
P
L
|
L
S
 
S
H
 
H
E
 
A
E
 
E
T
x
V
K
 
L
Q
 
A
M
 
A
A
 
G
P
 
A
L
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
A
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
D
M
 
V
I
 
I
S
 
A

Query Sequence

>SMc04123 FitnessBrowser__Smeli:SMc04123
MTGAADFLKGRLGAHAPRYGIVLGSGLGSLVDAVAEPLRIPYAEIPGFPVSSVSGHAGEF
VAGRIGDTPVAVLSGRAHYYERGDAKAMRVPIETLKRIGVENLILTNSAGSLREDMPPGS
VMRIADHIAFAGANPLIGLESDERFVGMTNAYDAALAIGMEEAAERLGIPLARGVYMWFS
GPSFETPAEIRMARILGADAVGMSTVPEVILARFFGLKVAAASVVTNFAAGMTGSELSHE
ETKQMAPLGGTRLAAILKEMISSEG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory