SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc04396 FitnessBrowser__Smeli:SMc04396 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 17 hits to proteins with known functional sites (download)

4r2bA Crystal structure of sugar transporter oant_3817 from ochrobactrum anthropi, target efi-510528, with bound glucose
86% identity, 94% coverage: 24:414/414 of query aligns to 5:395/395 of 4r2bA

query
sites
4r2bA
E
 
Q
N
 
N
V
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
L
H
 
H
W
|
W
W
 
W
T
 
T
S
 
A
G
 
G
G
 
G
E
|
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
K
 
K
K
 
K
D
 
D
L
 
L
E
 
E
S
 
K
K
 
K
G
 
G
I
 
I
S
 
S
W
 
W
T
 
T
D
 
D
M
 
M
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
 
G
T
 
T
E
 
E
A
 
A
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
R
 
R
V
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
P
 
P
T
 
T
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
D
I
 
I
L
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
A
K
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
L
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
N
K
 
K
E
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
E
K
 
K
V
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
P
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
E
F
 
F
S
 
A
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
H
 
H
W
 
W
I
 
I
A
 
A
A
 
A
P
 
P
V
 
V
N
 
N
V
 
V
H
|
H
S
 
S
T
 
T
N
 
N
W
 
W
V
 
M
W
 
W
I
 
I
N
 
N
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
G
K
 
K
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
N
W
 
W
E
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
K
 
K
F
 
F
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
T
 
T
I
 
I
F
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
L
S
 
S
L
 
F
G
 
G
N
 
T
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
K
 
K
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
I
D
 
D
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
E
A
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
S
D
 
D
K
 
T
M
 
M
K
 
K
E
 
Q
A
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
M
 
M
T
 
T
K
 
K
L
 
L
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
D
 
D
N
 
N
F
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
D
 
D
W
|
W
N
 
N
L
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
A
M
 
M
V
 
V
I
 
I
E
 
E
N
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
L
 
V
K
 
K
A
 
A
K
 
G
K
 
K
V
 
K
P
 
P
G
 
G
T
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
V
C
 
C
M
 
M
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
S
 
A
V
 
I
T
 
T
F
 
F
N
 
N
S
 
S
D
|
D
Q
 
M
F
 
F
A
 
A
M
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
V
S
 
S
E
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
E
M
 
M
A
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
S
P
 
P
A
 
T
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
V
K
|
K
G
 
G
S
 
S
V
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
R
T
 
T
D
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
T
D
 
D
F
 
F
D
 
D
A
 
A
C
 
C
G
 
G
K
 
K
K
 
K
G
 
A
I
 
I
K
 
A
D
 
D
L
 
E
A
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
S
T
 
E
N
 
K
G
 
G
T
 
T
L
 
M
F
 
L
G
 
G
S
 
S
M
 
M
A
 
A
H
|
H
G
 
G
H
 
Y
A
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
V
K
 
K
N
 
N
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
R
Q
 
Q
F
 
F
N
 
N
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
N
 
S
S
 
S
E
 
E
E
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
G
A
 
A
K
 
K

5dvjA Crystal structure of galactose complexed periplasmic glucose binding protein (ppgbp) from p. Putida csv86 (see paper)
50% identity, 94% coverage: 26:414/414 of query aligns to 5:396/396 of 5dvjA

query
sites
5dvjA
V
 
V
E
 
D
V
 
V
L
 
L
H
 
H
W
|
W
W
|
W
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
V
D
 
E
V
 
T
L
 
L
K
 
K
K
 
Q
D
 
Q
L
 
I
E
 
Q
S
 
K
K
 
D
G
 
G
I
 
F
S
 
I
W
 
W
T
 
K
D
 
D
M
 
N
P
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
 
G
T
 
A
E
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
R
 
K
A
 
T
R
 
R
V
 
A
T
 
I
A
 
S
G
 
G
N
 
N
A
 
P
P
 
P
T
 
S
A
 
A
V
 
A
Q
 
Q
M
 
I
L
x
K
G
 
G
F
 
P
D
 
D
I
 
I
L
 
Q
D
 
E
W
 
W
A
 
G
K
 
A
E
 
L
G
 
G
A
 
L
L
 
L
G
 
T
N
 
E
L
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
A
E
 
N
G
 
K
W
 
W
D
 
D
K
 
D
V
 
L
V
 
L
P
 
P
A
 
R
A
 
Q
L
 
V
Q
 
A
Q
 
D
F
 
I
S
 
M
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
H
 
H
W
 
Y
I
 
V
A
 
A
A
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
N
V
 
I
H
 
H
S
 
R
T
 
V
N
 
N
W
 
W
V
 
L
W
 
W
I
 
I
N
 
N
K
 
P
A
 
Q
A
 
V
L
 
F
D
 
D
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
E
 
V
P
 
P
T
 
T
T
 
T
W
 
L
E
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
F
A
 
A
L
 
A
L
 
A
D
 
D
K
 
K
F
 
L
K
 
K
E
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
F
T
 
I
P
 
P
I
 
L
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
D
 
D
A
 
S
T
 
T
I
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
D
V
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
S
-
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
P
D
 
K
F
 
G
Y
 
Y
K
 
H
Q
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
P
 
E
A
 
K
A
 
T
L
 
L
G
 
T
G
 
G
D
 
P
K
 
Q
M
 
M
K
 
T
E
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
A
R
 
T
M
 
L
T
 
K
K
 
R
L
 
L
R
 
G
S
 
T
Y
 
Y
V
 
M
D
 
D
D
 
P
N
 
N
F
 
R
S
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
D
W
|
W
N
 
N
L
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
A
M
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
N
N
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
M
Q
 
Q
F
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
K
G
 
S
E
 
E
F
 
W
L
 
S
K
 
A
A
 
A
K
 
G
K
 
K
V
 
V
P
 
A
G
 
G
T
 
K
D
 
D
F
 
Y
V
 
Q
C
 
C
M
 
V
R
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
F
T
 
A
F
 
Y
N
 
N
S
 
I
D
|
D
Q
 
S
F
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
S
 
K
E
 
D
-
 
A
D
 
N
K
 
D
V
 
I
P
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
N
Q
 
D
M
 
L
A
 
A
S
 
K
A
 
V
I
 
A
E
 
L
S
 
E
P
 
P
A
 
E
F
 
F
Q
 
Q
S
 
T
A
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
Q
V
 
N
K
|
K
G
 
G
S
 
S
V
 
L
P
 
P
A
 
V
R
 
R
T
 
Q
D
 
D
V
 
M
P
 
D
D
 
M
T
 
S
D
 
K
F
 
F
D
 
D
A
 
A
C
 
C
G
 
T
K
 
Q
K
 
K
G
 
S
I
 
A
K
 
A
D
 
D
L
 
F
A
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
A
T
 
K
N
 
G
G
 
D
T
 
G
L
 
L
F
 
Q
G
 
P
S
 
S
M
 
M
A
 
A
H
|
H
G
 
N
H
 
M
A
 
A
N
 
T
P
 
T
A
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
Q
N
 
G
A
 
A
I
 
I
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
N
Q
 
F
F
 
L
N
 
N
G
 
D
-
 
P
E
 
Q
L
 
A
N
 
E
S
 
P
E
 
A
E
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
K
E
 
Q
L
 
L
V
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
R

5dviA High resolution crystal structure of glucose complexed periplasmic glucose binding protein (ppgbp) from p. Putida csv86 (see paper)
50% identity, 94% coverage: 26:414/414 of query aligns to 5:396/396 of 5dviA

query
sites
5dviA
V
 
V
E
 
D
V
 
V
L
 
L
H
 
H
W
|
W
W
|
W
T
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
V
D
 
E
V
 
T
L
 
L
K
 
K
K
 
Q
D
 
Q
L
 
I
E
 
Q
S
 
K
K
 
D
G
 
G
I
 
F
S
 
I
W
 
W
T
 
K
D
 
D
M
 
N
P
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
|
G
G
 
G
T
 
A
E
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
R
 
K
A
 
T
R
 
R
V
 
A
T
 
I
A
 
S
G
 
G
N
 
N
A
 
P
P
 
P
T
 
S
A
 
A
V
 
A
Q
 
Q
M
 
I
L
x
K
G
 
G
F
 
P
D
 
D
I
 
I
L
 
Q
D
 
E
W
 
W
A
 
G
K
 
A
E
 
L
G
 
G
A
 
L
L
 
L
G
 
T
N
 
E
L
 
L
D
 
D
E
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
A
E
 
N
G
 
K
W
 
W
D
 
D
K
 
D
V
 
L
V
 
L
P
 
P
A
 
R
A
 
Q
L
 
V
Q
 
A
Q
 
D
F
 
I
S
 
M
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
H
 
H
W
 
Y
I
 
V
A
 
A
A
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
N
V
 
I
H
 
H
S
 
R
T
 
V
N
 
N
W
 
W
V
 
L
W
 
W
I
 
I
N
 
N
K
 
P
A
 
Q
A
 
V
L
 
F
D
 
D
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
E
 
V
P
 
P
T
 
T
T
 
T
W
 
L
E
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
F
A
 
A
L
 
A
L
 
A
D
 
D
K
 
K
F
 
L
K
 
K
E
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
F
T
 
I
P
 
P
I
 
L
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
D
 
D
A
 
S
T
 
T
I
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
D
V
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
S
-
 
I
L
 
L
G
 
G
N
 
P
D
 
K
F
 
G
Y
 
Y
K
 
H
Q
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
P
 
E
A
 
K
A
 
T
L
 
L
G
 
T
G
 
G
D
 
P
K
 
Q
M
 
M
K
 
T
E
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
A
R
 
T
M
 
L
T
 
K
K
 
R
L
 
L
R
 
G
S
 
T
Y
 
Y
V
 
M
D
 
D
D
 
P
N
 
N
F
 
R
S
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
D
W
 
W
N
 
N
L
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
A
M
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
N
N
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
M
Q
 
Q
F
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
K
G
 
S
E
 
E
F
 
W
L
 
S
K
 
A
A
 
A
K
 
G
K
 
K
V
 
V
P
 
A
G
 
G
T
 
K
D
 
D
F
 
Y
V
 
Q
C
 
C
M
 
V
R
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
F
T
 
A
F
 
Y
N
|
N
S
 
I
D
|
D
Q
 
S
F
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
K
 
K
V
 
L
S
 
K
E
 
D
-
 
A
D
 
N
K
 
D
V
 
I
P
 
K
A
 
A
Q
 
Q
L
 
N
Q
 
D
M
 
L
A
 
A
S
 
K
A
 
V
I
 
A
E
 
L
S
 
E
P
 
P
A
 
E
F
 
F
Q
 
Q
S
 
T
A
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
Q
V
 
N
K
|
K
G
 
G
S
 
S
V
 
L
P
 
P
A
 
V
R
 
R
T
 
Q
D
 
D
V
 
M
P
 
D
D
 
M
T
 
S
D
 
K
F
 
F
D
 
D
A
 
A
C
 
C
G
 
T
K
 
Q
K
 
K
G
 
S
I
 
A
K
 
A
D
 
D
L
 
F
A
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
A
T
 
K
N
 
G
G
 
D
T
 
G
L
 
L
F
 
Q
G
 
P
S
 
S
M
 
M
A
 
A
H
|
H
G
 
N
H
 
M
A
 
A
N
 
T
P
 
T
A
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
Q
N
 
G
A
 
A
I
 
I
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
N
Q
 
F
F
 
L
N
 
N
G
 
D
-
 
P
E
 
Q
L
 
A
N
 
E
S
 
P
E
 
A
E
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
K
E
 
Q
L
 
L
V
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
R

8hqqA Crystal structure of the glucose-binding protein sar11_0769 from "candidatus pelagibacter ubique" htcc1062 bound to glucose
48% identity, 92% coverage: 23:401/414 of query aligns to 2:385/398 of 8hqqA

query
sites
8hqqA
A
 
A
E
 
P
N
 
K
V
 
A
E
 
E
V
 
V
L
 
L
H
 
H
W
|
W
W
 
W
T
 
T
S
 
G
G
 
G
G
 
G
E
|
E
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
K
V
 
V
L
 
L
K
 
Q
K
 
D
D
 
E
L
 
F
E
 
A
S
 
A
K
 
Q
G
 
N
I
 
G
S
 
V
W
 
W
T
 
L
D
 
D
M
 
M
P
 
P
V
 
V
A
 
S
G
 
G
G
 
G
G
|
G
G
 
G
T
 
D
E
 
A
A
 
A
M
 
M
T
 
Q
V
 
T
L
 
L
R
 
K
A
 
A
R
 
R
V
 
I
T
 
V
A
 
A
G
 
N
N
 
D
A
 
A
P
 
P
T
 
A
A
 
A
V
 
A
Q
 
Q
M
 
I
L
x
K
G
 
G
F
 
P
D
 
T
I
 
I
L
 
Q
D
 
E
W
 
Y
A
 
D
K
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
V
L
 
V
G
 
A
-
 
P
-
 
Y
N
 
N
L
 
I
D
 
D
E
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
K
K
 
K
E
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
D
K
 
N
V
 
L
V
 
L
P
 
S
A
 
K
A
 
Q
L
 
V
Q
 
A
Q
 
S
F
 
H
S
 
M
K
 
K
Y
 
C
D
 
D
G
 
D
H
 
G
-
 
K
-
 
A
W
 
Y
I
 
C
A
 
A
A
 
A
P
 
P
V
 
V
N
 
N
V
 
I
H
|
H
S
 
R
T
 
I
N
 
D
W
 
W
V
 
I
W
 
W
I
 
A
N
 
N
K
 
K
A
 
K
A
 
V
L
 
L
D
 
D
K
 
S
A
 
N
G
 
G
A
 
I
K
 
K
E
 
M
P
 
P
T
 
S
T
 
T
W
 
W
E
 
A
E
 
E
L
 
F
I
 
N
A
 
A
L
 
A
L
 
A
D
 
D
K
 
K
F
 
L
K
 
Q
E
 
A
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
T
 
I
P
 
P
I
 
L
A
 
A
H
 
H
G
 
G
G
 
S
Q
 
Q
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
T
 
T
I
 
V
F
 
F
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
A
L
 
L
S
 
G
L
 
V
G
 
G
-
 
G
N
 
N
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
K
 
R
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
P
 
A
A
 
A
A
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
S
K
 
T
M
 
M
K
 
T
E
 
K
A
 
V
F
 
F
D
 
D
R
 
Q
M
 
M
T
 
R
K
 
K
L
 
L
R
 
K
S
 
G
Y
 
Y
V
 
T
D
 
D
D
 
A
N
 
G
F
 
S
S
 
P
G
 
G
R
 
R
D
 
D
W
 
W
N
 
N
L
 
V
A
 
A
S
 
T
A
 
G
M
 
M
V
 
V
I
 
M
E
 
E
N
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
A
L
 
F
Q
 
Q
F
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
L
 
A
K
 
A
A
 
N
K
 
N
K
 
M
V
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
K
D
 
D
F
 
Y
V
 
I
C
 
C
M
 
A
R
 
P
F
 
T
P
 
P
G
 
S
T
 
N
Q
 
N
G
 
G
S
 
Y
V
 
L
T
 
-
F
 
Y
N
 
N
S
 
V
D
|
D
Q
 
S
F
 
F
A
 
I
M
 
F
F
 
Y
K
 
K
V
 
V
S
 
K
-
 
G
E
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
P
 
E
A
 
G
Q
 
Q
L
 
K
Q
 
L
M
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
L
I
 
M
E
 
M
S
 
G
P
 
K
A
 
N
F
 
F
Q
 
Q
S
 
K
A
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
I
V
 
Y
K
|
K
G
 
G
S
 
S
V
 
I
P
 
P
A
 
A
R
 
R
T
 
L
D
 
D
V
 
V
P
 
S
D
 
M
T
 
D
D
 
E
F
 
F
D
 
D
A
 
M
C
 
C
G
 
A
K
 
K
K
 
K
G
 
S
I
 
N
K
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
K
E
 
T
A
 
A
N
 
G
T
 
S
N
 
K
G
 
G
T
 
G
L
 
L
F
 
L
G
 
P
S
 
S
M
 
F
A
 
A
H
|
H
G
 
G
H
 
M
A
 
A
N
 
L
P
 
R
A
 
L
A
 
A
V
 
Q
K
 
K
N
 
G
A
 
A
I
 
I
Y
 
Q
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
E
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
G
 
S
E
 
N
L
 
M
N
 
S
S
 
S
E
 
S
E
 
D

2b3fA Thermus thermophilus glucose/galactose binding protein bound with galactose (see paper)
28% identity, 85% coverage: 26:378/414 of query aligns to 3:353/392 of 2b3fA

query
sites
2b3fA
V
 
L
E
 
E
V
 
I
L
 
F
H
 
S
W
|
W
W
|
W
T
 
-
S
 
A
G
 
G
G
 
D
E
|
E
A
 
G
A
 
P
A
 
A
L
 
L
D
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
I
K
 
R
D
 
L
L
 
Y
E
 
K
S
 
Q
K
 
K
-
 
Y
-
 
P
G
 
G
I
 
V
S
 
E
W
 
V
T
 
I
D
 
N
M
 
A
P
 
T
V
 
V
A
 
T
G
 
G
G
|
G
G
x
A
G
 
G
T
 
V
E
 
N
A
 
A
M
 
R
T
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
K
A
 
T
R
 
R
V
 
M
T
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
D
A
 
P
P
 
P
T
 
D
A
 
T
V
 
F
Q
 
Q
M
 
V
-
x
H
L
 
A
G
 
G
F
 
M
D
 
E
I
 
L
L
 
I
-
 
G
D
 
T
W
 
W
A
 
V
K
 
V
E
 
A
G
 
N
A
 
R
L
 
M
G
 
E
N
 
D
L
 
L
D
 
S
E
 
A
V
 
L
A
 
F
A
 
R
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
L
K
 
Q
V
 
A
V
 
F
P
 
P
A
 
K
A
 
G
L
 
L
Q
 
I
Q
 
D
F
 
L
S
 
I
K
 
S
Y
 
Y
D
 
K
G
 
G
H
 
G
W
 
I
I
 
W
A
 
S
A
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
N
V
 
I
H
 
H
S
 
R
T
 
S
N
 
N
W
 
V
V
 
M
W
 
W
I
 
Y
N
 
L
K
 
P
A
 
A
A
 
K
L
 
L
D
 
K
K
 
G
A
 
W
G
 
G
A
 
V
K
 
N
E
 
P
P
 
P
T
 
R
T
 
T
W
 
W
E
 
D
E
 
K
L
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
T
L
 
C
D
 
Q
K
 
T
F
 
L
K
 
K
E
 
Q
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
T
 
E
P
 
A
I
 
P
A
 
L
H
 
A
G
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
N
W
 
W
Q
 
T
D
 
Q
A
 
Q
T
 
H
I
 
L
F
 
W
D
 
E
A
 
S
V
 
V
V
 
A
L
 
L
S
 
A
-
 
V
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
W
N
 
N
D
 
N
F
 
L
Y
 
W
K
 
N
Q
 
G
A
 
K
F
 
L
I
 
K
D
 
F
L
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
K
A
 
A
L
 
V
G
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
M
 
-
K
 
-
E
 
R
A
 
A
F
 
W
D
 
E
R
 
V
M
 
F
T
 
G
K
 
R
L
 
V
R
 
L
S
 
D
Y
 
C
V
 
A
D
 
N
D
 
K
N
 
D
F
 
A
S
 
A
G
 
G
R
 
L
D
 
S
W
 
W
N
 
Q
L
 
Q
A
 
A
S
 
V
A
 
D
M
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
Q
N
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
A
L
 
F
Q
 
N
F
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
A
G
 
G
E
 
Y
F
 
M
L
 
T
K
 
T
A
 
T
K
 
L
K
 
K
V
 
L
-
 
K
P
 
P
G
 
G
T
 
T
D
 
D
F
 
F
V
 
A
C
 
W
M
 
A
R
 
P
F
 
S
P
 
P
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
S
 
V
V
 
F
T
 
M
F
 
M
N
 
L
S
 
S
D
|
D
Q
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
L
F
 
P
K
 
K
V
 
G
S
 
A
E
 
K
D
 
N
K
 
R
V
 
Q
P
 
N
A
 
A
Q
 
-
L
 
I
Q
 
N
M
 
W
A
 
L
S
 
R
A
 
L
I
 
V
E
 
G
S
 
S
P
 
K
A
 
E
F
 
G
Q
 
Q
S
 
D
A
 
T
F
 
S
N
 
N
V
 
P
V
 
L
K
|
K
G
 
G
S
 
S
V
 
I
P
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
L
D
 
D
V
 
S
P
 
D
D
 
P
T
 
S
D
 
K
F
 
Y
D
 
N
A
 
A
C
 
Y
G
 
G
K
 
Q
K
 
S
G
 
A
I
 
M
K
 
R
D
 
D
L
 
W
A
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
T
 
R
N
 
S
G
 
N
T
 
R
L
 
I
F
 
V
G
 
G
S
 
S
M
 
L
A
 
V
H
|
H
G
 
G
H
 
A
A
 
V
N
 
A
P
 
P

2b3bC Thermus thermophilus glucose/galactose binding protein with bound glucose (see paper)
28% identity, 85% coverage: 26:378/414 of query aligns to 3:353/392 of 2b3bC

query
sites
2b3bC
V
 
L
E
 
E
V
 
I
L
 
F
H
 
S
W
|
W
W
 
W
T
 
-
S
 
A
G
 
G
G
 
D
E
|
E
A
 
G
A
 
P
A
 
A
L
 
L
D
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
I
K
 
R
D
 
L
L
 
Y
E
 
K
S
 
Q
K
 
K
-
 
Y
-
 
P
G
 
G
I
 
V
S
 
E
W
 
V
T
 
I
D
 
N
M
 
A
P
 
T
V
 
V
A
 
T
G
 
G
G
 
G
G
x
A
G
 
G
T
 
V
E
 
N
A
 
A
M
 
R
T
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
K
A
 
T
R
 
R
V
 
M
T
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
D
A
 
P
P
 
P
T
 
D
A
 
T
V
 
F
Q
 
Q
M
 
V
-
x
H
L
 
A
G
 
G
F
 
M
D
 
E
I
 
L
L
 
I
-
 
G
D
 
T
W
 
W
A
 
V
K
 
V
E
 
A
G
 
N
A
 
R
L
 
M
G
 
E
N
 
D
L
 
L
D
 
S
E
 
A
V
 
L
A
 
F
A
 
R
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
L
K
 
Q
V
 
A
V
 
F
P
 
P
A
 
K
A
 
G
L
 
L
Q
 
I
Q
 
D
F
 
L
S
 
I
K
 
S
Y
 
Y
D
 
K
G
 
G
H
 
G
W
 
I
I
 
W
A
 
S
A
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
N
V
 
I
H
 
H
S
 
R
T
 
S
N
 
N
W
 
V
V
 
M
W
 
W
I
 
Y
N
 
L
K
 
P
A
 
A
A
 
K
L
 
L
D
 
K
K
 
G
A
 
W
G
 
G
A
 
V
K
 
N
E
 
P
P
 
P
T
 
R
T
 
T
W
 
W
E
 
D
E
 
K
L
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
T
L
 
C
D
 
Q
K
 
T
F
 
L
K
 
K
E
 
Q
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
T
 
E
P
 
A
I
 
P
A
 
L
H
 
A
G
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
N
W
 
W
Q
 
T
D
 
Q
A
 
Q
T
 
H
I
 
L
F
 
W
D
 
E
A
 
S
V
 
V
V
 
A
L
 
L
S
 
A
-
 
V
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
W
N
 
N
D
 
N
F
 
L
Y
 
W
K
 
N
Q
 
G
A
 
K
F
 
L
I
 
K
D
 
F
L
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
K
A
 
A
L
 
V
G
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
M
 
-
K
 
-
E
 
R
A
 
A
F
 
W
D
 
E
R
 
V
M
 
F
T
 
G
K
 
R
L
 
V
R
 
L
S
 
D
Y
 
C
V
 
A
D
 
N
D
 
K
N
 
D
F
 
A
S
 
A
G
 
G
R
 
L
D
 
S
W
 
W
N
 
Q
L
 
Q
A
 
A
S
 
V
A
 
D
M
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
Q
N
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
A
L
 
F
Q
 
N
F
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
A
G
 
G
E
 
Y
F
 
M
L
 
T
K
 
T
A
 
T
K
 
L
K
 
K
V
 
L
-
 
K
P
 
P
G
 
G
T
 
T
D
 
D
F
 
F
V
 
A
C
 
W
M
 
A
R
 
P
F
 
S
P
 
P
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
S
 
V
V
 
F
T
 
M
F
 
M
N
 
L
S
 
S
D
|
D
Q
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
L
F
 
P
K
 
K
V
 
G
S
 
A
E
 
K
D
 
N
K
 
R
V
 
Q
P
 
N
A
 
A
Q
 
-
L
 
I
Q
 
N
M
 
W
A
 
L
S
 
R
A
 
L
I
 
V
E
 
G
S
 
S
P
 
K
A
 
E
F
 
G
Q
 
Q
S
 
D
A
 
T
F
 
S
N
 
N
V
 
P
V
 
L
K
|
K
G
 
G
S
 
S
V
 
I
P
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
L
D
 
D
V
 
S
P
 
D
D
 
P
T
 
S
D
 
K
F
 
Y
D
 
N
A
 
A
C
 
Y
G
 
G
K
 
Q
K
 
S
G
 
A
I
 
M
K
 
R
D
 
D
L
 
W
A
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
T
 
R
N
 
S
G
 
N
T
 
R
L
 
I
F
 
V
G
 
G
S
 
S
M
 
L
A
 
V
H
|
H
G
 
G
H
 
A
A
 
V
N
 
A
P
 
P

2b3bA Thermus thermophilus glucose/galactose binding protein with bound glucose (see paper)
28% identity, 85% coverage: 26:378/414 of query aligns to 3:353/392 of 2b3bA

query
sites
2b3bA
V
 
L
E
 
E
V
 
I
L
 
F
H
 
S
W
|
W
W
|
W
T
 
-
S
 
A
G
 
G
G
 
D
E
|
E
A
 
G
A
 
P
A
 
A
L
 
L
D
 
E
V
 
A
L
 
L
K
 
I
K
 
R
D
 
L
L
 
Y
E
 
K
S
 
Q
K
 
K
-
 
Y
-
 
P
G
 
G
I
 
V
S
 
E
W
 
V
T
 
I
D
 
N
M
 
A
P
 
T
V
 
V
A
 
T
G
 
G
G
 
G
G
x
A
G
 
G
T
 
V
E
 
N
A
 
A
M
 
R
T
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
K
A
 
T
R
 
R
V
 
M
T
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
D
A
 
P
P
 
P
T
 
D
A
 
T
V
 
F
Q
 
Q
M
 
V
-
x
H
L
 
A
G
 
G
F
 
M
D
 
E
I
 
L
L
 
I
-
 
G
D
 
T
W
 
W
A
 
V
K
 
V
E
 
A
G
 
N
A
 
R
L
 
M
G
 
E
N
 
D
L
 
L
D
 
S
E
 
A
V
 
L
A
 
F
A
 
R
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
W
 
W
D
 
L
K
 
Q
V
 
A
V
 
F
P
 
P
A
 
K
A
 
G
L
 
L
Q
 
I
Q
 
D
F
 
L
S
 
I
K
 
S
Y
 
Y
D
 
K
G
 
G
H
 
G
W
 
I
I
 
W
A
 
S
A
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
N
V
 
I
H
 
H
S
 
R
T
 
S
N
 
N
W
 
V
V
 
M
W
 
W
I
 
Y
N
 
L
K
 
P
A
 
A
A
 
K
L
 
L
D
 
K
K
 
G
A
 
W
G
 
G
A
 
V
K
 
N
E
 
P
P
 
P
T
 
R
T
 
T
W
 
W
E
 
D
E
 
K
L
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
T
L
 
C
D
 
Q
K
 
T
F
 
L
K
 
K
E
 
Q
Q
 
K
G
 
G
I
 
L
T
 
E
P
 
A
I
 
P
A
 
L
H
 
A
G
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
N
W
 
W
Q
 
T
D
 
Q
A
 
Q
T
 
H
I
 
L
F
 
W
D
 
E
A
 
S
V
 
V
V
 
A
L
 
L
S
 
A
-
 
V
L
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
W
N
 
N
D
 
N
F
 
L
Y
 
W
K
 
N
Q
 
G
A
 
K
F
 
L
I
 
K
D
 
F
L
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
K
A
 
A
L
 
V
G
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
M
 
-
K
 
-
E
 
R
A
 
A
F
 
W
D
 
E
R
 
V
M
 
F
T
 
G
K
 
R
L
 
V
R
 
L
S
 
D
Y
 
C
V
 
A
D
 
N
D
 
K
N
 
D
F
 
A
S
 
A
G
 
G
R
 
L
D
 
S
W
 
W
N
 
Q
L
 
Q
A
 
A
S
 
V
A
 
D
M
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
Q
N
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
A
L
 
F
Q
 
N
F
 
I
M
 
M
G
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
K
 
A
G
 
G
E
 
Y
F
 
M
L
 
T
K
 
T
A
 
T
K
 
L
K
 
K
V
 
L
-
 
K
P
 
P
G
 
G
T
 
T
D
 
D
F
 
F
V
 
A
C
 
W
M
 
A
R
 
P
F
 
S
P
 
P
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
S
 
V
V
 
F
T
 
M
F
 
M
N
 
L
S
 
S
D
|
D
Q
 
S
F
 
F
A
 
G
M
 
L
F
 
P
K
 
K
V
 
G
S
 
A
E
 
K
D
 
N
K
 
R
V
 
Q
P
 
N
A
 
A
Q
 
-
L
 
I
Q
 
N
M
 
W
A
 
L
S
 
R
A
 
L
I
 
V
E
 
G
S
 
S
P
 
K
A
 
E
F
 
G
Q
 
Q
S
 
D
A
 
T
F
 
S
N
 
N
V
 
P
V
 
L
K
|
K
G
 
G
S
 
S
V
 
I
P
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
L
D
 
D
V
 
S
P
 
D
D
 
P
T
 
S
D
 
K
F
 
Y
D
 
N
A
 
A
C
 
Y
G
 
G
K
 
Q
K
 
S
G
 
A
I
 
M
K
 
R
D
 
D
L
 
W
A
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
T
 
R
N
 
S
G
 
N
T
 
R
L
 
I
F
 
V
G
 
G
S
 
S
M
 
L
A
 
V
H
|
H
G
 
G
H
 
A
A
 
V
N
 
A
P
 
P

3oo6A Crystal structures and biochemical characterization of the bacterial solute receptor acbh reveal an unprecedented exclusive substrate preference for b-d-galactopyranose (see paper)
28% identity, 48% coverage: 89:287/414 of query aligns to 66:260/390 of 3oo6A

query
sites
3oo6A
G
 
G
F
 
Y
D
x
R
I
 
L
L
 
Q
D
 
F
W
 
F
A
 
A
K
 
A
E
 
Q
G
 
G
A
 
L
L
 
L
G
 
T
N
 
P
L
 
I
D
 
D
E
 
D
V
 
V
A
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
W
 
W
D
 
D
K
 
K
V
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
T
V
 
F
P
 
N
A
 
D
A
 
A
L
 
A
Q
 
K
Q
 
S
F
 
L
S
 
S
K
 
K
-
 
G
Y
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
H
W
 
Y
I
 
Y
A
 
L
A
 
V
P
 
P
V
 
L
N
 
-
V
 
-
H
 
Y
S
 
N
T
x
Y
N
 
P
W
|
W
V
 
V
-
 
V
W
 
F
I
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
S
A
 
V
L
 
F
D
 
Q
K
 
S
A
 
K
G
 
G
A
 
Y
K
 
E
E
 
V
P
 
P
T
 
A
T
 
S
W
 
W
E
 
E
E
 
A
L
 
F
I
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
A
D
 
R
K
 
K
F
 
M
K
 
Q
E
 
S
Q
 
D
G
 
G
I
 
L
T
 
V
P
 
P
I
 
L
A
 
A
H
 
F
G
 
A
G
 
D
Q
 
K
P
 
D
-
 
G
W
|
W
Q
 
P
D
 
A
A
 
L
T
 
G
I
 
T
F
 
F
D
 
D
A
 
I
V
 
L
V
 
N
L
 
L
S
 
R
L
 
I
-
 
N
G
 
G
N
 
Y
D
 
D
F
 
Y
Y
 
H
K
 
I
Q
 
K
A
 
L
F
 
M
I
 
K
D
 
H
L
 
E
D
 
V
P
 
P
A
 
W
A
 
T
L
 
D
G
 
P
G
 
G
D
 
-
K
 
-
M
 
V
K
 
T
E
 
K
A
 
V
F
 
F
D
 
D
R
 
Q
M
 
W
T
 
R
K
 
E
L
 
L
R
 
A
S
 
A
Y
 
Y
V
 
Q
D
 
Q
D
 
K
N
 
G
F
 
A
S
 
N
G
 
G
R
 
R
D
 
T
W
 
W
N
 
Q
L
 
D
A
 
A
S
 
A
A
 
K
M
 
A
V
 
L
I
 
E
E
 
N
N
 
K
K
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
M
Q
 
M
F
 
F
M
 
Q
G
 
G
D
 
S
W
 
N
A
 
Q
K
 
V
G
 
A
E
 
A
F
 
N
L
 
Y
K
 
S
A
 
A
K
 
K
K
 
N
V
 
L
P
 
P
G
 
D
T
 
L
D
 
D
F
 
F
V
 
F
C
 
V
M
 
-
R
 
-
F
 
F
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7ehqA Chitin oligosaccharide binding protein (see paper)
27% identity, 53% coverage: 72:291/414 of query aligns to 55:278/406 of 7ehqA

query
sites
7ehqA
L
 
L
R
 
K
A
 
A
R
 
E
V
 
M
T
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
K
A
 
P
P
 
P
T
 
Q
A
 
I
V
 
F
Q
 
N
M
 
L
L
x
F
G
 
G
-
 
G
F
 
A
D
 
D
I
 
T
L
 
Q
D
 
N
W
 
Y
A
 
A
K
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
H
L
 
L
G
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
L
A
 
K
K
 
E
E
 
L
G
 
G
W
 
L
-
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
F
V
 
F
P
 
-
A
 
-
A
 
E
L
 
L
Q
 
R
Q
 
E
F
 
F
S
 
T
K
 
-
Y
 
V
D
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
I
I
 
Y
A
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
E
N
 
A
V
 
G
H
x
F
S
 
V
T
 
E
N
 
G
W
 
F
V
 
Y
W
 
Y
I
 
N
N
 
T
K
 
K
A
 
L
A
 
F
L
 
A
D
 
D
K
 
A
A
 
G
G
 
I
A
 
T
K
 
S
E
 
A
P
 
P
T
 
K
T
 
T
W
 
W
E
 
D
E
 
E
L
 
F
I
 
T
A
 
K
L
 
A
L
 
L
D
 
E
K
 
A
F
 
L
K
 
K
E
 
A
Q
 
K
G
 
N
I
 
I
T
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
A
H
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
S
G
 
G
Q
 
D
P
 
G
W
|
W
Q
 
A
D
 
I
A
 
N
T
 
M
I
 
L
F
 
A
D
 
N
A
 
S
V
 
L
V
 
F
L
 
V
S
 
A
L
 
T
G
 
A
N
 
G
D
 
P
F
 
E
Y
 
A
K
 
Q
Q
 
E
A
 
G
F
 
F
I
 
A
D
 
K
-
 
G
-
 
T
-
 
T
-
 
K
-
 
W
L
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
V
L
 
L
G
 
D
G
 
G
D
 
-
K
 
-
M
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
F
D
 
K
R
 
R
M
 
L
T
 
K
K
 
D
L
 
L
-
 
K
-
 
D
R
 
K
S
 
G
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
D
 
P
N
 
N
F
 
V
S
 
L
G
 
G
R
 
L
D
 
K
W
 
Y
N
 
S
L
 
E
A
 
G
S
 
Q
A
 
A
M
 
K
V
 
F
I
 
Y
E
 
T
N
 
G
K
 
Q
A
 
A
G
 
A
L
 
M
Q
 
L
F
 
F
M
 
D
G
 
G
D
 
S
W
|
W
A
 
A
K
 
T
G
 
S
E
 
A
F
 
I
L
 
L
K
 
D
A
 
K
K
 
D
K
 
K
V
 
S
P
 
T
G
 
V
T
 
K
D
 
D
F
 
N
V
 
V
-
 
G
C
 
Y
M
 
F
R
 
R
F
 
F
P
 
P
G
 
N
T
 
I
Q
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4g68A Biochemical and structural insights into xylan utilization by the thermophilic bacteriumcaldanaerobius polysaccharolyticus (see paper)
27% identity, 54% coverage: 70:291/414 of query aligns to 46:269/392 of 4g68A

query
sites
4g68A
T
 
T
V
 
K
L
 
I
R
 
K
A
 
A
R
 
A
V
 
I
T
 
A
A
 
A
G
 
N
N
 
E
A
 
A
P
 
P
T
 
D
A
 
I
V
 
F
Q
 
Q
M
 
T
L
x
W
-
 
A
-
 
G
G
 
G
F
 
F
D
 
S
I
 
-
L
 
Q
D
 
P
W
 
F
A
 
V
K
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
K
L
 
V
G
 
L
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
S
V
 
Y
A
 
L
A
 
N
K
 
D
E
 
G
G
 
T
W
 
K
D
 
D
K
 
Q
V
 
L
V
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
S
L
 
F
Q
 
D
Q
 
N
F
 
V
S
 
T
K
 
-
Y
 
Y
D
 
N
G
 
G
H
 
K
W
 
I
I
 
Y
A
 
G
A
 
I
P
 
P
V
 
F
N
 
D
V
 
Q
H
x
Q
S
 
A
T
 
S
N
 
-
W
 
V
V
 
L
W
 
Y
I
 
I
N
 
N
K
 
K
A
 
E
A
 
L
L
 
F
D
 
D
K
 
K
A
 
Y
G
 
N
A
 
V
K
 
K
E
 
V
P
 
P
T
 
T
T
 
T
W
 
F
E
 
S
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
D
L
 
A
L
 
I
D
 
K
K
 
T
F
 
F
K
 
K
E
 
S
Q
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
P
I
 
F
A
 
A
H
 
L
G
 
G
G
 
E
Q
 
K
-
 
D
P
 
E
W
|
W
Q
 
P
D
 
G
A
 
M
T
x
W
I
 
Y
F
 
Y
D
 
D
A
 
M
V
 
I
V
 
A
L
 
L
S
 
R
L
 
E
G
 
G
N
 
G
D
 
-
F
 
-
Y
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
F
 
-
I
 
V
D
 
Q
L
 
L
D
 
T
P
 
R
A
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
N
G
 
G
D
 
-
K
 
-
M
 
-
K
 
K
E
 
A
A
 
S
F
 
F
D
 
D
R
 
N
M
 
Q
-
 
A
-
 
F
-
 
T
-
 
D
-
 
A
-
 
A
T
 
Q
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
S
 
D
Y
 
M
V
 
V
-
 
N
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
F
D
 
D
D
 
S
N
 
G
F
 
F
S
 
M
G
 
G
R
 
L
D
 
T
W
x
R
N
 
D
L
 
E
A
 
A
S
 
T
A
 
A
M
 
E
V
 
F
I
 
N
E
 
Q
N
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
A
L
 
M
Q
 
Y
F
 
F
M
 
G
G
 
G
D
 
N
W
x
F
A
 
D
K
 
A
G
 
A
E
 
A
F
 
F
L
 
V
K
 
S
-
 
D
-
 
P
A
 
S
K
 
S
K
 
L
V
 
V
P
 
K
G
 
G
T
 
K
D
 
-
F
 
I
V
 
E
C
 
A
M
 
V
R
 
R
F
 
F
P
 
P
G
 
T
T
 
I
Q
 
E
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7c0kB Crystal structure of a dinucleotide-binding protein of abc transporter endogenously bound to uridylyl-3'-5'-phospho-guanosine (form ii) (see paper)
25% identity, 77% coverage: 19:337/414 of query aligns to 12:318/397 of 7c0kB

query
sites
7c0kB
A
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
K
E
 
V
N
 
V
V
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
W
H
 
H
W
 
G
W
 
F
T
 
T
S
 
G
G
 
G
G
 
A
E
 
P
A
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
E
V
 
N
L
 
L
K
 
V
K
 
V
D
x
E
L
 
F
E
 
N
S
 
K
K
x
A
G
 
Q
I
 
Q
S
 
G
W
 
R
T
 
C
D
 
V
M
 
R
P
 
P
V
 
V
A
 
P
G
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
x
Y
T
 
R
E
 
D
A
 
L
M
 
S
T
 
T
V
 
K
L
 
I
R
 
K
A
 
A
R
 
A
V
 
F
T
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
K
A
 
V
P
 
P
T
 
T
A
 
M
V
 
A
Q
 
Q
M
 
A
L
x
F
G
 
E
F
x
N
D
 
N
I
 
I
L
 
A
D
 
L
W
 
Y
A
 
L
K
 
E
E
 
A
G
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
L
N
 
P
L
 
I
D
 
E
E
 
S
V
 
L
A
 
G
A
 
V
K
 
K
-
 
L
E
 
Q
G
 
G
W
 
V
D
 
N
K
 
L
V
 
T
V
 
F
P
 
L
A
 
N
A
 
A
L
 
V
Q
 
-
Q
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
R
Y
 
F
D
 
G
G
 
G
H
 
V
W
 
V
I
 
Y
A
 
G
A
 
V
P
 
P
V
 
F
N
 
N
V
 
-
H
 
K
S
|
S
T
 
I
N
 
Q
W
 
V
V
 
L
W
 
Y
I
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
A
 
L
L
 
L
D
 
K
K
 
K
A
 
H
G
 
G
A
 
V
K
 
P
E
 
V
P
 
P
T
 
A
T
 
T
W
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
F
I
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
A
D
 
K
K
 
K
F
 
L
K
 
S
E
 
R
Q
 
A
G
 
E
I
 
G
T
 
G
P
 
P
I
 
V
A
 
-
H
 
Y
G
 
W
G
 
F
Q
 
Q
P
 
P
W
 
-
Q
 
-
D
 
D
A
 
A
T
 
S
I
 
T
F
 
F
D
 
A
A
 
Y
V
 
F
V
 
F
L
 
F
S
 
N
L
 
L
G
 
G
N
 
G
D
 
S
F
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Q
 
D
A
 
G
F
 
K
I
 
L
D
 
V
L
 
L
D
 
N
P
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
M
 
S
K
 
K
E
 
E
A
 
A
F
 
V
D
 
E
R
 
A
M
 
L
T
 
T
K
 
L
L
 
L
R
 
Q
S
 
N
Y
 
G
V
 
V
D
 
K
D
 
E
N
 
G
F
 
W
-
 
A
-
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
T
S
 
S
G
 
G
R
x
Y
-
 
I
D
x
N
W
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
S
 
S
-
 
G
-
 
P
-
 
Y
A
 
A
M
 
F
V
 
S
I
 
V
E
 
D
N
x
T
K
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
Y
Q
 
T
F
x
Y
M
 
Y
G
 
L
D
 
R
W
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
F
E
 
D
F
 
-
L
 
L
K
 
G
A
 
V
K
 
A
K
 
T
V
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
C
 
-
M
 
-
R
 
R
F
 
T
P
 
K
G
 
G
T
 
Q
Q
 
P
G
 
G
S
 
Y
V
 
G
T
 
L
F
 
V
N
x
Q
S
x
G
D
 
T
Q
 
N
F
 
L
A
 
V
M
 
V
F
 
F
K
 
R
-
 
Q
V
 
A
S
 
S
E
 
K
D
 
E
K
 
E
V
 
Q
P
 
A
A
 
V
Q
 
A
L
 
K
Q
 
D
M
 
F
A
 
L
S
 
E
A
 
F
I
 
V
E
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
R
F
 
A
Q
 
Q
S
 
A
A
 
V
F
 
F
N
 
A
V
 
T
V
 
A
K
 
T
G
 
G
S
x
Y
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7c0oB Crystal structure of a dinucleotide-binding protein (y56f) of abc transporter endogenously bound to uridylyl-3'-5'-phospho-guanosine (see paper)
25% identity, 77% coverage: 19:337/414 of query aligns to 11:317/397 of 7c0oB

query
sites
7c0oB
A
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
K
E
 
V
N
 
V
V
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
W
H
 
H
W
 
G
W
 
F
T
 
T
S
 
G
G
 
G
G
 
A
E
 
P
A
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
E
V
 
N
L
 
L
K
 
V
K
 
V
D
 
E
L
 
F
E
 
N
S
 
K
K
 
A
G
 
Q
I
 
Q
S
 
G
W
 
R
T
 
C
D
 
V
M
 
R
P
 
P
V
 
V
A
 
P
G
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
x
F
T
 
R
E
 
D
A
 
L
M
 
S
T
 
T
V
 
K
L
 
I
R
 
K
A
 
A
R
 
A
V
 
F
T
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
K
A
 
V
P
 
P
T
 
T
A
 
M
V
 
A
Q
 
Q
M
 
A
L
x
F
G
 
E
F
x
N
D
 
N
I
 
I
L
 
A
D
 
L
W
 
Y
A
 
L
K
 
E
E
 
A
G
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
L
N
 
P
L
 
I
D
 
E
E
 
S
V
 
L
A
 
G
A
 
V
K
 
K
-
 
L
E
 
Q
G
 
G
W
 
V
D
 
N
K
 
L
V
 
T
V
 
F
P
 
L
A
 
N
A
 
A
L
 
V
Q
 
-
Q
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
R
Y
 
F
D
 
G
G
 
G
H
 
V
W
 
V
I
 
Y
A
 
G
A
 
V
P
 
P
V
 
F
N
 
N
V
 
-
H
 
K
S
|
S
T
 
I
N
 
Q
W
 
V
V
 
L
W
 
Y
I
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
D
A
 
L
L
 
L
D
 
K
K
 
K
A
 
H
G
 
G
A
 
V
K
 
P
E
 
V
P
 
P
T
 
A
T
 
T
W
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
F
I
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
A
D
 
K
K
 
K
F
 
L
K
 
S
E
 
R
Q
 
A
G
 
E
I
 
G
T
 
G
P
 
P
I
 
V
A
 
-
H
 
Y
G
 
W
G
 
F
Q
 
Q
P
 
P
W
 
-
Q
 
-
D
 
D
A
 
A
T
 
S
I
 
T
F
 
F
D
 
A
A
 
Y
V
 
F
V
 
F
L
 
F
S
x
N
L
|
L
G
 
G
N
 
G
D
 
S
F
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Q
 
D
A
 
G
F
 
K
I
 
L
D
 
V
L
 
L
D
 
N
P
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
M
 
S
K
 
K
E
 
E
A
 
A
F
 
V
D
 
E
R
 
A
M
 
L
T
 
T
K
 
L
L
 
L
R
 
Q
S
 
N
Y
 
G
V
 
V
D
 
K
D
 
E
N
 
G
F
 
W
-
 
A
-
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
T
S
 
S
G
 
G
R
x
Y
-
 
I
D
x
N
W
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
S
 
S
-
 
G
-
 
P
-
 
Y
A
 
A
M
 
F
V
 
S
I
 
V
E
 
D
N
x
T
K
 
S
A
|
A
G
 
G
L
 
Y
Q
 
T
F
x
Y
M
 
Y
G
 
L
D
 
R
W
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
F
E
 
D
F
 
-
L
 
L
K
 
G
A
 
V
K
 
A
K
 
T
V
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
C
 
-
M
 
-
R
|
R
F
 
T
P
 
K
G
 
G
T
 
Q
Q
 
P
G
 
G
S
 
Y
V
 
G
T
 
L
F
 
V
N
x
Q
S
x
G
D
 
T
Q
 
N
F
 
L
A
 
V
M
 
V
F
 
F
K
 
R
-
 
Q
V
 
A
S
 
S
E
 
K
D
 
E
K
 
E
V
 
Q
P
 
A
A
 
V
Q
 
A
L
 
K
Q
 
D
M
 
F
A
 
L
S
 
E
A
 
F
I
 
V
E
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
R
F
 
A
Q
 
Q
S
 
A
A
 
V
F
 
F
N
 
A
V
 
T
V
 
A
K
 
T
G
 
G
S
x
Y
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7c0kA Crystal structure of a dinucleotide-binding protein of abc transporter endogenously bound to uridylyl-3'-5'-phospho-guanosine (form ii) (see paper)
25% identity, 77% coverage: 19:337/414 of query aligns to 11:317/396 of 7c0kA

query
sites
7c0kA
A
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
K
E
 
V
N
 
V
V
 
A
E
 
E
V
 
L
L
 
W
H
 
H
W
 
G
W
 
F
T
 
T
S
x
G
G
|
G
G
 
A
E
 
P
A
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
E
V
 
N
L
 
L
K
 
V
K
 
V
D
 
E
L
 
F
E
 
N
S
 
K
K
 
A
G
 
Q
I
 
Q
S
 
G
W
 
R
T
 
C
D
 
V
M
 
R
P
 
P
V
 
V
A
 
P
G
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
x
Y
T
x
R
E
 
D
A
 
L
M
 
S
T
 
T
V
 
K
L
 
I
R
 
K
A
 
A
R
 
A
V
 
F
T
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
K
A
 
V
P
 
P
T
 
T
A
 
M
V
 
A
Q
 
Q
M
 
A
L
x
F
G
 
E
F
x
N
D
 
N
I
 
I
L
 
A
D
 
L
W
 
Y
A
 
L
K
 
E
E
 
A
G
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
L
N
 
P
L
 
I
D
 
E
E
 
S
V
 
L
A
 
G
A
 
V
K
 
K
-
 
L
E
 
Q
G
 
G
W
 
V
D
 
N
K
 
L
V
 
T
V
 
F
P
 
L
A
 
N
A
 
A
L
 
V
Q
 
-
Q
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
R
Y
 
F
D
 
G
G
 
G
H
 
V
W
 
V
I
 
Y
A
 
G
A
 
V
P
 
P
V
 
F
N
 
N
V
 
-
H
 
K
S
|
S
T
 
I
N
 
Q
W
 
V
V
 
L
W
 
Y
I
 
Y
N
 
N
K
|
K
A
 
D
A
 
L
L
 
L
D
x
K
K
 
K
A
 
H
G
 
G
A
 
V
K
 
P
E
 
V
P
 
P
T
 
A
T
 
T
W
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
F
I
 
V
A
 
A
L
 
A
L
 
A
D
 
K
K
 
K
F
 
L
K
 
S
E
 
R
Q
 
A
G
 
E
I
 
G
T
 
G
P
 
P
I
 
V
A
 
-
H
 
Y
G
 
W
G
 
F
Q
 
Q
P
 
P
W
 
-
Q
 
-
D
 
D
A
 
A
T
 
S
I
 
T
F
 
F
D
 
A
A
 
Y
V
 
F
V
 
F
L
 
F
S
 
N
L
 
L
G
 
G
N
 
G
D
 
S
F
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Q
 
D
A
 
G
F
 
K
I
 
L
D
 
V
L
 
L
D
 
N
P
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
M
 
S
K
 
K
E
 
E
A
 
A
F
 
V
D
 
E
R
 
A
M
 
L
T
 
T
K
 
L
L
 
L
R
 
Q
S
 
N
Y
 
G
V
 
V
D
 
K
D
 
E
N
 
G
F
 
W
-
 
A
-
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
T
S
 
S
G
 
G
R
x
Y
-
 
I
D
x
N
W
 
Q
N
 
N
L
 
L
A
 
G
S
 
S
-
 
G
-
 
P
-
 
Y
A
 
A
M
 
F
V
 
S
I
 
V
E
 
D
N
x
T
K
 
S
A
|
A
G
 
G
L
 
Y
Q
 
T
F
x
Y
M
 
Y
G
 
L
D
 
R
W
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
F
E
 
D
F
 
-
L
 
L
K
 
G
A
 
V
K
 
A
K
 
T
V
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
C
 
-
M
 
-
R
 
R
F
 
T
P
 
K
G
 
G
T
 
Q
Q
 
P
G
 
G
S
 
Y
V
 
G
T
 
L
F
 
V
N
x
Q
S
x
G
D
 
T
Q
 
N
F
 
L
A
 
V
M
 
V
F
 
F
K
 
R
-
 
Q
V
 
A
S
 
S
E
 
K
D
 
E
K
 
E
V
 
Q
P
 
A
A
 
V
Q
 
A
L
 
K
Q
 
D
M
 
F
A
 
L
S
 
E
A
 
F
I
 
V
E
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
R
F
 
A
Q
 
Q
S
 
A
A
 
V
F
 
F
N
 
A
V
 
T
V
 
A
K
 
T
G
 
G
S
x
Y
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3vxcA Crystal structure of xylobiose-bxle complex from streptomyces thermoviolaceus opc-520
27% identity, 33% coverage: 128:265/414 of query aligns to 107:249/398 of 3vxcA

query
sites
3vxcA
D
 
D
G
 
G
H
 
H
W
 
E
I
 
Y
A
 
G
A
 
I
P
 
P
V
 
M
N
x
R
V
 
G
H
 
M
S
x
Q
T
 
P
N
 
V
W
 
L
V
 
L
W
 
F
I
 
Y
N
 
N
K
 
K
A
 
S
A
 
V
L
 
F
D
 
A
K
 
E
A
 
H
G
 
K
A
 
L
K
 
T
E
 
P
P
 
P
T
 
T
T
 
T
W
 
W
E
 
D
E
 
Q
L
 
L
I
 
L
A
 
D
L
 
N
L
 
V
D
 
A
K
 
K
F
 
L
K
 
K
E
 
K
Q
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
T
P
 
P
I
 
F
A
 
A
H
 
L
G
 
G
G
 
G
-
 
V
Q
 
E
P
 
I
W
|
W
Q
 
P
D
 
E
A
 
L
T
 
M
I
 
W
F
 
L
D
 
E
A
 
Y
V
 
L
V
 
V
L
 
D
S
 
R
L
 
I
G
 
G
N
 
G
D
 
P
F
 
Q
Y
 
V
K
 
F
Q
 
D
A
 
K
F
 
I
I
 
R
D
 
N
L
 
G
D
 
D
P
 
A
A
 
S
A
 
G
L
 
W
G
 
G
G
 
D
D
 
P
K
 
A
M
 
V
K
 
L
E
 
K
A
 
A
F
 
A
D
 
Q
R
 
T
M
 
V
T
 
K
K
 
Q
L
 
L
R
 
-
S
 
-
Y
 
-
V
 
V
D
 
D
D
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
K
N
 
G
F
 
F
S
 
S
G
 
S
R
 
V
D
 
S
W
 
Y
N
 
N
L
 
N
-
 
G
-
 
G
A
 
A
S
 
P
A
 
A
M
 
L
V
 
L
I
 
A
E
 
K
N
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
M
Q
 
H
F
 
L
M
 
M
G
 
G
D
 
S
W
|
W

Sites not aligning to the query:

4c1tA Structure of the xylo-oligosaccharide specific solute binding protein from bifidobacterium animalis subsp. Lactis bl-04 in complex with arabinoxylotriose (see paper)
26% identity, 53% coverage: 127:344/414 of query aligns to 105:336/396 of 4c1tA

query
sites
4c1tA
Y
 
F
D
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
V
I
 
Y
A
 
G
A
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
S
V
 
V
H
 
E
S
 
P
T
 
G
N
 
G
W
 
-
V
 
M
W
 
W
I
 
Y
N
 
S
K
 
K
A
 
D
A
 
L
L
 
F
D
 
K
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
K
 
S
E
 
D
-
 
V
P
 
P
T
 
A
T
 
T
W
 
Y
E