SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Synpcc7942_0950 FitnessBrowser__SynE:Synpcc7942_0950 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6dtqA Maltose bound t. Maritima male3 (see paper)
37% identity, 85% coverage: 58:429/438 of query aligns to 16:391/391 of 6dtqA

query
sites
6dtqA
E
 
E
A
 
V
M
 
L
Q
 
K
P
 
K
A
 
Q
I
 
L
A
 
E
R
 
M
F
 
F
T
 
H
A
 
Q
E
 
Q
H
 
Y
P
 
P
E
 
D
I
 
I
Q
 
E
L
 
V
E
 
E
L
 
I
V
 
I
A
 
P
G
 
M
P
 
P
N
 
D
D
 
S
T
 
S
S
 
T
L
 
E
V
x
R
S
 
H
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
A
 
Y
F
 
F
L
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
E
A
x
T
P
x
D
Y
 
P
D
|
D
L
 
V
V
 
L
F
 
M
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
I
W
 
W
L
 
P
P
 
A
K
 
E
F
 
F
V
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
P
W
 
F
L
 
L
L
 
E
D
 
D
L
 
L
S
 
T
-
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
D
L
 
Y
P
 
F
E
 
E
I
 
L
Q
 
-
A
 
G
E
 
E
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
T
L
 
V
N
 
M
G
 
S
S
 
V
F
 
T
Y
 
V
R
 
N
D
 
G
R
 
R
L
 
I
Y
 
V
R
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
W
N
 
F
A
 
T
A
x
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
P
 
E
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
Y
-
 
D
-
 
H
P
 
A
P
 
P
Q
 
R
T
 
T
F
 
W
T
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
V
Q
 
E
R
 
M
S
 
A
Q
 
K
Q
 
K
L
 
I
-
 
S
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
V
 
I
V
 
-
P
 
-
W
 
H
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
G
 
G
K
 
A
Q
 
R
Y
 
Y
E
 
E
G
|
G
L
 
L
V
 
V
C
 
C
N
 
D
F
 
F
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
L
 
L
A
 
W
G
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Y
 
D
W
 
V
I
 
L
D
 
D
P
 
-
Q
 
E
T
 
S
G
 
G
E
 
K
V
 
V
G
 
V
L
 
I
D
 
D
H
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
Q
W
 
F
L
 
M
H
 
V
S
 
D
T
 
L
I
 
I
-
 
Y
T
 
K
D
 
H
Q
 
K
I
 
V
S
 
T
P
 
P
A
 
E
G
 
G
V
 
V
S
 
T
T
 
T
F
 
Y
Q
 
M
E
|
E
N
 
E
E
 
D
A
 
A
L
 
R
K
 
R
L
 
I
F
 
F
E
 
Q
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
S
 
A
A
 
V
F
 
F
M
 
M
R
 
R
N
 
N
W
|
W
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
E
 
W
M
 
S
L
 
L
L
 
V
E
 
N
R
 
S
P
 
D
E
 
E
S
 
S
A
 
P
V
 
I
R
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
P
H
 
M
A
 
G
P
 
P
G
 
G
Q
 
G
T
 
R
S
 
R
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
L
G
 
G
T
x
G
W
|
W
G
 
V
V
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
N
Q
 
K
Q
 
F
T
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
E
H
x
E
P
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
K
T
 
K
A
 
L
L
 
I
L
 
K
A
 
F
L
 
L
T
 
T
D
 
S
A
 
Y
E
 
D
S
 
Q
Q
 
Q
R
 
L
L
 
Y
I
 
K
S
 
A
L
 
I
G
 
N
S
 
A
N
 
G
Y
x
Q
I
 
N
P
 
P
T
 
T
R
 
R
S
 
K
A
 
A
L
 
V
Y
 
Y
Q
 
K
D
 
D
P
 
P
E
 
K
L
 
L
L
 
K
A
 
E
R
 
A
Y
 
A
P
 
P
F
 
F
Y
 
M
A
 
V
T
 
E
L
 
L
P
 
L
P
 
G
I
 
V
L
 
F
E
 
I
S
 
N
T
 
A
V
 
L
L
 
P
R
|
R
S
 
P
P
 
R
L
 
V
P
 
A
A
 
N
Y
 
Y
D
 
T
A
 
E
L
 
V
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
I
Q
 
Q
R
 
R
H
 
Y
L
 
V
S
 
H
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
T
G
 
R
Q
 
Q
T
 
T
P
 
T
V
 
S
A
 
E
I
 
D
A
 
A
L
 
I
Q
 
K
Q
 
N
A
 
I
A
 
A
R
 
K
E
 
E
S
 
L
R
 
K
Q
 
F
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q7LYW7 Trehalose/maltose-binding protein MalE; TMBP from Thermococcus litoralis (strain ATCC 51850 / DSM 5473 / JCM 8560 / NS-C) (see paper)
33% identity, 92% coverage: 28:430/438 of query aligns to 25:447/450 of Q7LYW7

query
sites
Q7LYW7
A
 
C
L
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
G
 
Q
T
 
T
G
 
S
T
 
T
Q
 
V
R
 
T
S
 
S
A
 
T
A
 
P
A
 
T
D
 
E
S
 
T
T
 
S
V
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
K
V
 
I
L
 
V
R
 
F
A
 
A
L
 
V
L
 
G
P
 
G
A
 
A
P
 
P
F
 
N
R
x
E
-
 
I
E
 
E
A
 
Y
M
 
W
Q
 
K
P
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
E
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
K
H
 
Y
P
 
P
E
 
G
I
 
V
Q
 
T
L
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
K
A
 
R
G
 
Q
P
 
A
N
x
T
D
 
D
T
 
T
S
 
E
L
 
Q
V
x
R
S
 
R
D
 
L
L
 
D
Y
 
L
T
 
V
T
 
N
A
 
A
F
 
L
L
 
R
L
 
G
G
 
K
N
 
S
A
 
S
P
 
D
Y
 
P
D
 
D
L
 
V
V
 
F
F
 
L
L
 
M
D
|
D
V
 
V
T
 
A
W
 
W
L
 
L
P
 
G
K
 
Q
F
 
F
V
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
W
L
 
L
L
 
E
D
 
P
L
 
L
S
 
D
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
L
 
Q
P
 
K
E
 
D
I
 
N
Q
 
Y
-
 
D
-
 
L
A
 
S
E
 
V
F
 
F
L
 
F
P
 
Q
A
 
S
A
 
V
L
 
I
N
 
N
-
 
L
G
 
A
S
 
D
F
 
K
Y
 
Q
R
 
G
D
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
V
N
x
Y
A
 
I
A
x
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
Y
P
 
S
E
 
K
P
 
P
P
 
P
Q
 
E
T
 
T
F
 
W
T
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
V
Q
 
E
R
 
M
S
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
L
 
I
Q
 
Q
A
 
S
-
 
G
-
 
E
Q
 
R
G
 
E
V
 
T
V
 
N
P
 
P
-
 
N
-
 
F
W
 
W
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
|
Y
E
 
E
G
 
S
L
 
L
V
 
V
C
 
C
N
 
D
F
 
F
L
 
V
E
 
E
V
 
Y
L
 
V
A
 
Y
G
 
S
F
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
S
W
 
L
I
 
G
D
 
E
P
 
F
Q
 
K
T
 
D
G
 
G
E
 
K
V
 
W
-
 
V
-
 
P
G
 
T
L
 
L
D
 
N
H
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
N
I
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
L
D
 
Q
W
 
F
L
 
M
H
 
V
S
 
D
T
 
L
I
 
I
T
 
H
D
 
K
-
 
Y
Q
 
K
I
 
I
S
 
S
P
 
P
A
 
P
G
 
N
V
 
T
S
 
Y
T
 
T
F
 
E
Q
 
M
E
 
T
N
x
E
E
 
E
A
 
P
L
 
V
K
 
R
L
 
L
-
 
M
F
 
F
E
 
Q
T
 
Q
G
 
G
Q
 
N
S
 
A
A
 
A
F
 
F
M
 
E
R
 
R
N
 
N
W
|
W
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
E
 
W
M
 
G
L
 
L
L
 
H
E
 
N
R
 
A
P
 
D
E
 
D
S
 
S
A
 
P
V
 
V
R
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
P
H
 
H
A
 
F
P
 
P
G
 
G
Q
 
H
T
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
L
G
 
G
T
x
G
W
|
W
G
 
H
V
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
S
Q
 
K
Q
 
Y
T
 
S
E
 
D
H
 
N
P
 
K
E
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
W
T
 
E
A
 
F
L
 
V
L
 
K
A
 
F
L
 
V
T
 
E
D
 
S
A
 
Y
E
 
S
S
 
V
Q
 
Q
R
 
K
L
 
G
I
 
F
S
 
A
L
 
M
G
 
N
S
 
L
N
 
G
Y
x
W
I
 
N
P
 
P
T
 
G
R
 
R
S
 
V
A
 
D
L
 
V
Y
 
Y
Q
 
D
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
V
L
 
V
A
 
S
R
 
K
Y
 
S
P
 
P
F
 
H
Y
 
L
A
 
K
T
 
E
L
 
L
P
 
R
P
 
A
I
 
V
L
 
F
E
 
E
S
 
N
T
 
A
V
 
V
L
 
P
R
|
R
S
 
P
P
 
I
L
 
V
P
 
P
A
 
Y
Y
 
Y
D
 
P
A
 
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
E
I
 
I
L
 
I
Q
 
Q
R
 
K
H
 
Y
L
 
V
S
 
N
A
 
S
A
 
A
I
 
L
S
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
I
P
 
S
V
 
P
A
 
Q
I
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
Q
 
K
A
 
A
A
 
Q
R
 
K
E
 
E
S
 
A
R
 
E
Q
 
E
L
 
L
L
 
V
T
 
K

1eu8A Structure of trehalose maltose binding protein from thermococcus litoralis (see paper)
34% identity, 85% coverage: 58:430/438 of query aligns to 18:406/407 of 1eu8A

query
sites
1eu8A
E
 
E
A
 
Y
M
 
W
Q
 
K
P
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
E
F
 
F
T
 
E
A
 
K
E
 
K
H
 
Y
P
 
P
E
 
G
I
 
V
Q
 
T
L
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
K
A
 
R
G
 
Q
P
 
A
N
x
T
D
 
D
T
|
T
S
 
E
L
 
Q
V
x
R
S
 
R
D
 
L
L
 
D
Y
 
L
T
 
V
T
 
N
A
 
A
F
 
L
L
 
R
L
 
G
G
 
K
N
 
S
A
 
S
P
 
D
Y
 
P
D
 
D
L
 
V
V
 
F
F
 
L
L
 
M
D
|
D
V
 
V
T
 
A
W
 
W
L
 
L
P
 
G
K
 
Q
F
 
F
V
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
W
L
 
L
L
 
E
D
 
P
L
 
L
S
 
D
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
L
 
Q
P
 
K
E
 
D
I
 
N
Q
 
Y
-
 
D
-
 
L
A
 
S
E
 
V
F
 
F
L
 
F
P
 
Q
A
 
S
A
 
V
L
 
I
N
 
N
-
 
L
G
 
A
S
 
D
F
 
K
Y
 
Q
R
 
G
D
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
V
N
x
Y
A
 
I
A
x
D
V
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
Y
P
 
S
E
 
K
P
 
P
P
 
P
Q
 
E
T
 
T
F
 
W
T
 
Q
E
 
E
L
 
L
V
 
V
Q
 
E
R
 
M
S
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
L
 
I
Q
 
Q
A
 
S
-
 
G
-
 
E
Q
 
R
G
 
E
V
 
T
V
 
N
P
 
P
-
 
N
-
 
F
W
 
W
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
G
|
G
L
 
L
V
 
V
C
 
C
N
 
D
F
 
F
L
 
V
E
 
E
V
 
Y
L
 
V
A
 
Y
G
 
S
F
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
S
W
 
L
I
 
G
D
 
E
P
 
F
Q
 
K
T
 
D
G
 
G
E
 
K
V
 
W
-
 
V
-
 
P
G
 
T
L
 
L
D
 
N
H
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
N
I
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
L
D
 
Q
W
 
F
L
 
M
H
 
V
S
 
D
T
 
L
I
 
I
T
 
H
D
 
K
-
 
Y
Q
 
K
I
 
I
S
 
S
P
 
P
A
 
P
G
 
N
V
 
T
S
 
Y
T
 
T
F
 
E
Q
 
M
E
 
T
N
x
E
E
 
E
A
 
P
L
 
V
K
 
R
L
 
L
-
 
M
F
 
F
E
 
Q
T
 
Q
G
 
G
Q
 
N
S
 
A
A
 
A
F
 
F
M
 
E
R
 
R
N
 
N
W
|
W
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
E
 
W
M
 
G
L
 
L
L
 
H
E
 
N
R
 
A
P
 
D
E
 
D
S
 
S
A
 
P
V
 
V
R
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
 
P
M
 
L
V
 
P
H
 
H
A
 
F
P
 
P
G
 
G
Q
 
H
T
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
L
G
|
G
T
x
G
W
|
W
G
 
H
V
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
S
Q
 
K
Q
 
Y
T
 
S
E
 
D
H
 
N
P
 
K
E
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
W
T
 
E
A
 
F
L
 
V
L
 
K
A
 
F
L
 
V
T
 
E
D
 
S
A
 
Y
E
 
S
S
 
V
Q
 
Q
R
 
K
L
 
G
I
 
F
S
 
A
L
 
M
G
 
N
S
 
L
N
 
G
Y
 
W
I
 
N
P
 
P
T
 
G
R
 
R
S
 
V
A
 
D
L
 
V
Y
 
Y
Q
 
D
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
V
L
 
V
A
 
S
R
 
K
Y
 
S
P
 
P
F
 
H
Y
 
L
A
 
K
T
 
E
L
 
L
P
 
R
P
 
A
I
 
V
L
 
F
E
 
E
S
 
N
T
 
A
V
 
V
L
 
P
R
|
R
S
 
P
P
 
I
L
 
V
P
 
P
A
 
Y
Y
 
Y
D
 
P
A
 
Q
L
 
L
S
 
S
D
 
E
I
 
I
L
 
I
Q
 
Q
R
 
K
H
 
Y
L
 
V
S
 
N
A
 
S
A
 
A
I
 
L
S
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
I
P
 
S
V
 
P
A
 
Q
I
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
Q
 
K
A
 
A
A
 
Q
R
 
K
E
 
E
S
 
A
R
 
E
Q
 
E
L
 
L
L
 
V
T
 
K

Sites not aligning to the query:

6jaiA Crystal structure of abc transporter alpha-glycoside-binding mutant protein d118a in complex with maltose (see paper)
31% identity, 82% coverage: 75:433/438 of query aligns to 34:403/404 of 6jaiA

query
sites
6jaiA
Q
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
Y
V
 
I
A
 
D
G
 
S
P
 
P
N
 
A
D
 
D
T
|
T
S
 
N
L
 
D
V
 
R
S
 
L
D
 
A
L
 
L
Y
 
Y
T
 
Q
T
 
Q
A
 
Y
F
 
W
L
 
A
L
 
A
G
 
R
N
 
S
A
 
P
P
 
D
Y
 
V
D
 
D
L
 
V
V
 
Y
F
 
M
L
 
I
D
|
D
V
 
V
T
 
I
W
 
W
L
 
-
P
 
P
K
 
G
F
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
P
G
 
H
W
 
-
L
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
K
D
 
P
R
 
Y
V
 
L
L
 
T
P
 
E
E
 
A
I
 
E
Q
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
F
P
 
P
A
 
R
A
 
I
L
 
V
N
 
Q
G
 
N
S
 
N
F
 
T
Y
 
I
R
 
R
D
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
T
R
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
F
N
 
F
A
 
T
A
 
A
V
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
P
 
E
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
S
P
 
P
P
 
P
Q
 
R
T
 
T
F
 
W
T
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
E
Q
 
Q
R
 
M
S
 
A
Q
 
E
Q
 
R
L
 
V
-
 
M
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
R
Q
 
R
A
 
A
Q
 
G
G
 
N
V
 
R
V
 
D
P
 
F
W
 
W
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
W
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
P
Y
 
Y
E
 
E
G
|
G
L
 
L
V
 
T
C
 
C
N
 
D
F
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
W
L
 
I
A
 
Y
G
 
S
F
 
H
G
 
G
G
 
G
Y
 
G
W
 
R
I
 
I
D
 
V
P
 
E
Q
 
P
T
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
I
G
 
S
L
 
V
D
 
N
H
 
N
P
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
L
D
 
N
W
 
R
L
 
A
H
 
H
S
 
G
T
 
W
I
 
V
T
 
-
D
 
G
Q
 
R
I
 
I
S
 
A
P
 
P
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
S
 
T
T
 
S
F
 
Y
Q
 
A
E
|
E
N
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
R
K
 
N
L
 
V
F
 
W
E
 
Q
T
 
Q
G
 
G
Q
 
N
S
 
S
A
 
L
F
 
F
M
 
M
R
 
R
N
 
N
W
|
W
P
|
P
Y
|
Y
A
 
A
E
 
Y
M
 
A
L
 
L
L
 
G
E
 
Q
R
 
A
P
 
E
E
 
G
S
 
S
A
 
P
V
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
K
V
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
T
P
 
V
M
 
L
V
 
P
H
 
K
A
 
A
P
 
S
G
 
A
Q
 
D
T
 
A
-
 
P
S
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
L
G
|
G
T
x
G
W
|
W
G
 
Q
V
 
L
G
 
M
I
 
V
A
 
S
Q
 
A
Q
 
Y
T
 
S
E
 
R
H
 
Y
P
 
P
E
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
D
A
 
L
L
 
V
L
 
K
A
 
Y
L
 
L
T
 
A
D
 
S
A
 
Y
E
 
E
S
 
V
Q
 
Q
R
 
K
L
 
D
I
 
N
S
 
A
L
 
V
G
 
R
S
 
L
N
 
S
Y
x
R
I
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
R
S
 
P
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
T
D
 
D
P
 
R
E
 
D
L
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
P
 
P
F
 
W
Y
 
F
A
 
R
T
 
D
L
 
L
P
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
F
E
 
Q
S
 
N
T
 
A
V
 
V
L
 
S
R
|
R
S
 
P
P
 
S
L
 
D
P
 
V
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
R
Y
 
Y
D
 
N
A
 
Q
L
 
V
S
 
S
D
 
E
I
 
A
L
 
I
Q
 
W
R
 
T
H
 
E
L
 
V
S
 
H
A
 
S
A
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
R
T
 
K
P
 
K
V
 
G
A
 
E
I
 
Q
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
Q
 
D
A
 
L
A
 
E
R
 
A
E
 
R
S
 
I
R
 
R
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
R
S
 
H
Q
 
H
Q
 
H

Sites not aligning to the query:

6jahA Crystal structure of abc transporter alpha-glycoside-binding protein in complex with glucose (see paper)
30% identity, 82% coverage: 75:433/438 of query aligns to 34:403/404 of 6jahA

query
sites
6jahA
Q
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
Y
V
 
I
A
 
D
G
 
S
P
 
P
N
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
N
L
 
D
V
 
R
S
 
L
D
 
A
L
 
L
Y
 
Y
T
 
Q
T
 
Q
A
 
Y
F
 
W
L
 
A
L
 
A
G
 
R
N
 
S
A
 
P
P
 
D
Y
 
V
D
 
D
L
 
V
V
 
Y
F
 
M
L
 
I
D
|
D
V
 
V
T
 
I
W
 
W
L
 
-
P
 
P
K
 
G
F
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
P
G
 
H
W
 
-
L
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
K
D
 
P
R
 
Y
V
 
L
L
 
T
P
 
E
E
 
A
I
 
E
Q
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
F
P
 
P
A
 
R
A
 
I
L
 
V
N
 
Q
G
 
N
S
 
N
F
 
T
Y
 
I
R
 
R
D
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
T
R
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
F
N
 
F
A
 
T
A
x
D
V
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
P
 
E
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
S
P
 
P
P
 
P
Q
 
R
T
 
T
F
 
W
T
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
E
Q
 
Q
R
 
M
S
 
A
Q
 
E
Q
 
R
L
 
V
-
 
M
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
R
Q
 
R
A
 
A
Q
 
G
G
 
N
V
 
R
V
x
D
P
 
F
W
|
W
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
W
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
P
Y
 
Y
E
 
E
G
|
G
L
 
L
V
 
T
C
 
C
N
 
D
F
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
W
L
 
I
A
 
Y
G
 
S
F
 
H
G
 
G
G
 
G
Y
 
G
W
 
R
I
 
I
D
 
V
P
 
E
Q
 
P
T
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
I
G
 
S
L
 
V
D
 
N
H
 
N
P
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
L
D
 
N
W
 
R
L
 
A
H
 
H
S
 
G
T
 
W
I
 
V
T
 
G
D
 
-
Q
 
R
I
 
I
S
 
A
P
 
P
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
S
 
T
T
 
S
F
 
Y
Q
 
A
E
|
E
N
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
R
K
 
N
L
 
V
F
 
W
E
 
Q
T
 
Q
G
 
G
Q
 
N
S
 
S
A
 
L
F
 
F
M
 
M
R
 
R
N
 
N
W
|
W
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
E
 
Y
M
 
A
L
 
L
L
 
G
E
 
Q
R
 
A
P
 
E
E
 
G
S
 
S
A
 
P
V
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
K
V
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
T
P
 
V
M
 
L
V
 
P
H
 
K
A
 
A
P
 
S
G
 
A
Q
 
D
T
 
A
-
 
P
S
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
L
G
|
G
T
x
G
W
|
W
G
 
Q
V
 
L
G
 
M
I
 
V
A
 
S
Q
 
A
Q
 
Y
T
 
S
E
 
R
H
 
Y
P
 
P
E
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
D
A
 
L
L
 
V
L
 
K
A
 
Y
L
 
L
T
 
A
D
 
S
A
x
Y
E
|
E
S
 
V
Q
 
Q
R
x
K
L
 
D
I
 
N
S
 
A
L
 
V
G
 
R
S
 
L
N
 
S
Y
 
R
I
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
R
S
 
P
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
T
D
 
D
P
x
R
E
 
D
L
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
P
 
P
F
 
W
Y
 
F
A
 
R
T
 
D
L
 
L
P
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
F
E
 
Q
S
 
N
T
 
A
V
 
V
L
 
S
R
|
R
S
 
P
P
 
S
L
 
D
P
 
V
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
R
Y
 
Y
D
 
N
A
 
Q
L
 
V
S
 
S
D
 
E
I
 
A
L
 
I
Q
 
W
R
 
T
H
 
E
L
 
V
S
 
H
A
 
S
A
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
R
T
 
K
P
 
K
V
 
G
A
 
E
I
 
Q
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
Q
 
D
A
 
L
A
 
E
R
 
A
E
 
R
S
 
I
R
 
R
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
R
S
 
H
Q
 
H
Q
 
H

6jagA Crystal structure of abc transporter alpha-glycoside-binding protein in complex with sucrose (see paper)
30% identity, 82% coverage: 75:433/438 of query aligns to 34:403/404 of 6jagA

query
sites
6jagA
Q
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
Y
V
 
I
A
 
D
G
 
S
P
 
P
N
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
N
L
 
D
V
x
R
S
 
L
D
 
A
L
 
L
Y
 
Y
T
 
Q
T
 
Q
A
 
Y
F
 
W
L
 
A
L
 
A
G
 
R
N
 
S
A
 
P
P
 
D
Y
 
V
D
 
D
L
 
V
V
 
Y
F
 
M
L
 
I
D
|
D
V
 
V
T
 
I
W
 
W
L
 
-
P
 
P
K
 
G
F
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
P
G
 
H
W
 
-
L
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
K
D
 
P
R
 
Y
V
 
L
L
 
T
P
 
E
E
 
A
I
 
E
Q
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
F
P
 
P
A
 
R
A
 
I
L
 
V
N
 
Q
G
 
N
S
 
N
F
 
T
Y
 
I
R
 
R
D
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
T
R
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
F
N
x
F
A
 
T
A
x
D
V
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
P
 
E
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
S
P
 
P
P
 
P
Q
 
R
T
 
T
F
 
W
T
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
E
Q
 
Q
R
 
M
S
 
A
Q
 
E
Q
 
R
L
 
V
-
 
M
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
R
Q
 
R
A
 
A
Q
 
G
G
 
N
V
 
R
V
 
D
P
 
F
W
 
W
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
W
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
P
Y
 
Y
E
 
E
G
|
G
L
 
L
V
 
T
C
 
C
N
 
D
F
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
W
L
 
I
A
 
Y
G
 
S
F
 
H
G
 
G
G
 
G
Y
 
G
W
 
R
I
 
I
D
 
V
P
 
E
Q
 
P
T
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
I
G
 
S
L
 
V
D
 
N
H
 
N
P
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
L
D
 
N
W
 
R
L
 
A
H
 
H
S
 
G
T
 
W
I
 
V
T
 
G
D
 
-
Q
 
R
I
 
I
S
 
A
P
 
P
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
S
 
T
T
 
S
F
 
Y
Q
 
A
E
|
E
N
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
R
K
 
N
L
 
V
F
 
W
E
 
Q
T
 
Q
G
 
G
Q
 
N
S
 
S
A
 
L
F
 
F
M
 
M
R
 
R
N
 
N
W
|
W
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
E
 
Y
M
 
A
L
 
L
L
 
G
E
 
Q
R
 
A
P
 
E
E
 
G
S
 
S
A
 
P
V
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
K
V
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
T
P
 
V
M
 
L
V
 
P
H
 
K
A
 
A
P
 
S
G
 
A
Q
 
D
T
 
A
-
 
P
S
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
L
G
|
G
T
x
G
W
|
W
G
 
Q
V
 
L
G
 
M
I
 
V
A
 
S
Q
 
A
Q
 
Y
T
 
S
E
 
R
H
 
Y
P
 
P
E
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
D
A
 
L
L
 
V
L
 
K
A
 
Y
L
 
L
T
 
A
D
 
S
A
 
Y
E
 
E
S
 
V
Q
 
Q
R
 
K
L
 
D
I
 
N
S
 
A
L
 
V
G
 
R
S
 
L
N
 
S
Y
x
R
I
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
R
S
 
P
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
T
D
 
D
P
 
R
E
 
D
L
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
P
 
P
F
 
W
Y
 
F
A
 
R
T
 
D
L
 
L
P
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
F
E
 
Q
S
 
N
T
 
A
V
 
V
L
 
S
R
|
R
S
 
P
P
 
S
L
 
D
P
 
V
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
R
Y
 
Y
D
 
N
A
 
Q
L
 
V
S
 
S
D
 
E
I
 
A
L
 
I
Q
 
W
R
 
T
H
 
E
L
 
V
S
 
H
A
 
S
A
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
R
T
 
K
P
 
K
V
 
G
A
 
E
I
 
Q
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
Q
 
D
A
 
L
A
 
E
R
 
A
E
 
R
S
 
I
R
 
R
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
R
S
 
H
Q
 
H
Q
 
H

Sites not aligning to the query:

6jadA Crystal structure of abc transporter alpha-glycoside-binding protein in complex with palatinose (see paper)
30% identity, 82% coverage: 75:433/438 of query aligns to 34:403/404 of 6jadA

query
sites
6jadA
Q
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
Y
V
 
I
A
 
D
G
 
S
P
 
P
N
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
N
L
 
D
V
x
R
S
 
L
D
 
A
L
 
L
Y
 
Y
T
 
Q
T
 
Q
A
 
Y
F
 
W
L
 
A
L
 
A
G
 
R
N
 
S
A
 
P
P
 
D
Y
 
V
D
 
D
L
 
V
V
 
Y
F
 
M
L
 
I
D
|
D
V
 
V
T
 
I
W
 
W
L
 
-
P
 
P
K
 
G
F
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
P
G
 
H
W
 
-
L
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
K
D
 
P
R
 
Y
V
 
L
L
 
T
P
 
E
E
 
A
I
 
E
Q
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
F
P
 
P
A
 
R
A
 
I
L
 
V
N
 
Q
G
 
N
S
 
N
F
 
T
Y
 
I
R
 
R
D
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
T
R
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
F
N
x
F
A
 
T
A
x
D
V
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
P
 
E
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
S
P
 
P
P
 
P
Q
 
R
T
 
T
F
 
W
T
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
E
Q
 
Q
R
 
M
S
 
A
Q
 
E
Q
 
R
L
 
V
-
 
M
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
R
Q
 
R
A
 
A
Q
 
G
G
 
N
V
 
R
V
 
D
P
 
F
W
 
W
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
W
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
P
Y
 
Y
E
 
E
G
|
G
L
 
L
V
 
T
C
 
C
N
 
D
F
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
W
L
 
I
A
 
Y
G
 
S
F
 
H
G
 
G
G
 
G
Y
 
G
W
 
R
I
 
I
D
 
V
P
 
E
Q
 
P
T
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
I
G
 
S
L
 
V
D
 
N
H
 
N
P
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
L
D
 
N
W
 
R
L
 
A
H
 
H
S
 
G
T
 
W
I
 
V
T
 
G
D
 
-
Q
 
R
I
 
I
S
 
A
P
 
P
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
S
 
T
T
 
S
F
 
Y
Q
 
A
E
|
E
N
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
R
K
 
N
L
 
V
F
 
W
E
 
Q
T
 
Q
G
 
G
Q
 
N
S
 
S
A
 
L
F
 
F
M
 
M
R
 
R
N
 
N
W
|
W
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
E
 
Y
M
 
A
L
 
L
L
 
G
E
 
Q
R
 
A
P
 
E
E
 
G
S
 
S
A
 
P
V
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
K
V
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
T
P
 
V
M
 
L
V
 
P
H
 
K
A
 
A
P
 
S
G
 
A
Q
 
D
T
 
A
-
 
P
S
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
L
G
|
G
T
x
G
W
|
W
G
 
Q
V
 
L
G
 
M
I
 
V
A
 
S
Q
 
A
Q
 
Y
T
 
S
E
 
R
H
 
Y
P
 
P
E
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
D
A
 
L
L
 
V
L
 
K
A
 
Y
L
 
L
T
 
A
D
 
S
A
 
Y
E
 
E
S
 
V
Q
 
Q
R
 
K
L
 
D
I
 
N
S
 
A
L
 
V
G
 
R
S
 
L
N
 
S
Y
 
R
I
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
R
S
 
P
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
T
D
 
D
P
 
R
E
 
D
L
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
P
 
P
F
 
W
Y
 
F
A
 
R
T
 
D
L
 
L
P
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
F
E
 
Q
S
 
N
T
 
A
V
 
V
L
 
S
R
|
R
S
 
P
P
 
S
L
 
D
P
 
V
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
R
Y
 
Y
D
 
N
A
 
Q
L
 
V
S
 
S
D
 
E
I
 
A
L
 
I
Q
 
W
R
 
T
H
 
E
L
 
V
S
 
H
A
 
S
A
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
R
T
 
K
P
 
K
V
 
G
A
 
E
I
 
Q
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
Q
 
D
A
 
L
A
 
E
R
 
A
E
 
R
S
 
I
R
 
R
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
R
S
 
H
Q
 
H
Q
 
H

Sites not aligning to the query:

6j9yA Crystal structure of abc transporter alpha-glycoside-binding protein in complex with maltose (see paper)
30% identity, 82% coverage: 75:433/438 of query aligns to 34:403/404 of 6j9yA

query
sites
6j9yA
Q
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
Y
V
 
I
A
 
D
G
 
S
P
 
P
N
x
A
D
 
D
T
 
T
S
 
N
L
 
D
V
x
R
S
 
L
D
 
A
L
 
L
Y
 
Y
T
 
Q
T
 
Q
A
 
Y
F
 
W
L
 
A
L
 
A
G
 
R
N
 
S
A
 
P
P
 
D
Y
 
V
D
 
D
L
 
V
V
 
Y
F
 
M
L
 
I
D
|
D
V
 
V
T
 
I
W
 
W
L
 
-
P
 
P
K
 
G
F
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
P
G
 
H
W
 
-
L
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
K
D
 
P
R
 
Y
V
 
L
L
 
T
P
 
E
E
 
A
I
 
E
Q
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
F
P
 
P
A
 
R
A
 
I
L
 
V
N
 
Q
G
 
N
S
 
N
F
 
T
Y
 
I
R
 
R
D
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
T
R
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
F
N
 
F
A
 
T
A
x
D
V
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
P
 
E
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
S
P
 
P
P
 
P
Q
 
R
T
 
T
F
 
W
T
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
E
Q
 
Q
R
 
M
S
 
A
Q
 
E
Q
 
R
L
 
V
-
 
M
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
R
Q
 
R
A
 
A
Q
 
G
G
 
N
V
 
R
V
 
D
P
 
F
W
 
W
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
W
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
P
Y
 
Y
E
 
E
G
|
G
L
 
L
V
 
T
C
 
C
N
 
D
F
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
W
L
 
I
A
 
Y
G
 
S
F
 
H
G
 
G
G
 
G
Y
 
G
W
 
R
I
 
I
D
 
V
P
 
E
Q
 
P
T
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
I
G
 
S
L
 
V
D
 
N
H
 
N
P
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
L
D
 
N
W
 
R
L
 
A
H
 
H
S
 
G
T
 
W
I
 
V
T
 
G
D
 
-
Q
 
R
I
 
I
S
 
A
P
 
P
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
S
 
T
T
 
S
F
 
Y
Q
 
A
E
|
E
N
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
R
K
 
N
L
 
V
F
 
W
E
 
Q
T
 
Q
G
 
G
Q
 
N
S
 
S
A
 
L
F
 
F
M
 
M
R
 
R
N
 
N
W
|
W
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
E
 
Y
M
 
A
L
 
L
L
 
G
E
 
Q
R
 
A
P
 
E
E
 
G
S
 
S
A
 
P
V
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
K
V
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
T
P
 
V
M
 
L
V
 
P
H
 
K
A
 
A
P
 
S
G
 
A
Q
 
D
T
 
A
-
 
P
S
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
L
G
|
G
T
x
G
W
|
W
G
 
Q
V
 
L
G
 
M
I
 
V
A
 
S
Q
 
A
Q
 
Y
T
 
S
E
 
R
H
 
Y
P
 
P
E
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
D
A
 
L
L
 
V
L
 
K
A
 
Y
L
 
L
T
 
A
D
 
S
A
 
Y
E
 
E
S
 
V
Q
 
Q
R
 
K
L
 
D
I
 
N
S
 
A
L
 
V
G
 
R
S
 
L
N
 
S
Y
x
R
I
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
R
S
 
P
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
T
D
 
D
P
 
R
E
 
D
L
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
P
 
P
F
 
W
Y
 
F
A
 
R
T
 
D
L
 
L
P
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
F
E
 
Q
S
 
N
T
 
A
V
 
V
L
 
S
R
|
R
S
 
P
P
 
S
L
 
D
P
 
V
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
R
Y
 
Y
D
 
N
A
 
Q
L
 
V
S
 
S
D
 
E
I
 
A
L
 
I
Q
 
W
R
 
T
H
x
E
L
 
V
S
 
H
A
 
S
A
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
R
T
x
K
P
 
K
V
 
G
A
 
E
I
 
Q
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
Q
x
D
A
 
L
A
 
E
R
 
A
E
 
R
S
 
I
R
 
R
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
R
S
 
H
Q
 
H
Q
 
H

Sites not aligning to the query:

6jamA Crystal structure of abc transporter alpha-glycoside-binding mutant protein r356a in complex with trehalose (see paper)
30% identity, 82% coverage: 75:433/438 of query aligns to 36:405/406 of 6jamA

query
sites
6jamA
Q
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
Y
V
 
I
A
 
D
G
 
S
P
 
P
N
 
A
D
 
D
T
|
T
S
 
N
L
 
D
V
x
R
S
 
L
D
 
A
L
 
L
Y
 
Y
T
 
Q
T
 
Q
A
 
Y
F
 
W
L
 
A
L
 
A
G
 
R
N
 
S
A
 
P
P
 
D
Y
 
V
D
 
D
L
 
V
V
 
Y
F
 
M
L
 
I
D
|
D
V
 
V
T
 
I
W
 
W
L
 
-
P
 
P
K
 
G
F
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
P
G
 
H
W
 
-
L
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
K
D
 
P
R
 
Y
V
 
L
L
 
T
P
 
E
E
 
A
I
 
E
Q
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
F
P
 
P
A
 
R
A
 
I
L
 
V
N
 
Q
G
 
N
S
 
N
F
 
T
Y
 
I
R
 
R
D
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
T
R
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
F
N
x
F
A
 
T
A
x
D
V
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
P
 
E
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
S
P
 
P
P
 
P
Q
 
R
T
 
T
F
 
W
T
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
E
Q
 
Q
R
 
M
S
 
A
Q
 
E
Q
 
R
L
 
V
-
 
M
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
R
Q
 
R
A
 
A
Q
 
G
G
 
N
V
 
R
V
 
D
P
 
F
W
 
W
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
W
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
P
Y
 
Y
E
 
E
G
|
G
L
 
L
V
 
T
C
 
C
N
 
D
F
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
W
L
 
I
A
 
Y
G
 
S
F
 
H
G
 
G
G
 
G
Y
 
G
W
 
R
I
 
I
D
 
V
P
 
E
Q
 
P
T
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
I
G
 
S
L
 
V
D
 
N
H
 
N
P
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
L
D
 
N
W
 
R
L
 
A
H
 
H
S
 
G
T
 
W
I
 
V
T
 
G
D
 
-
Q
 
R
I
 
I
S
 
A
P
 
P
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
S
 
T
T
 
S
F
 
Y
Q
 
A
E
|
E
N
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
R
K
 
N
L
 
V
F
 
W
E
 
Q
T
 
Q
G
 
G
Q
 
N
S
 
S
A
 
L
F
 
F
M
 
M
R
 
R
N
 
N
W
|
W
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
E
 
Y
M
 
A
L
 
L
L
 
G
E
 
Q
R
 
A
P
 
E
E
 
G
S
 
S
A
 
P
V
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
K
V
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
T
P
 
V
M
 
L
V
 
P
H
 
K
A
 
A
P
 
S
G
 
A
Q
 
D
T
 
A
-
 
P
S
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
L
G
|
G
T
x
G
W
|
W
G
 
Q
V
 
L
G
 
M
I
 
V
A
 
S
Q
 
A
Q
 
Y
T
 
S
E
 
R
H
 
Y
P
 
P
E
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
D
A
 
L
L
 
V
L
 
K
A
 
Y
L
 
L
T
 
A
D
 
S
A
 
Y
E
 
E
S
 
V
Q
 
Q
R
 
K
L
 
D
I
 
N
S
 
A
L
 
V
G
 
R
S
 
L
N
 
S
Y
 
R
I
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
R
S
 
P
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
T
D
 
D
P
 
R
E
 
D
L
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
P
 
P
F
 
W
Y
 
F
A
 
R
T
 
D
L
 
L
P
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
F
E
 
Q
S
 
N
T
 
A
V
 
V
L
 
S
R
 
A
S
 
P
P
 
S
L
 
D
P
 
V
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
R
Y
 
Y
D
 
N
A
 
Q
L
 
V
S
 
S
D
 
E
I
 
A
L
 
I
Q
 
W
R
 
T
H
 
E
L
 
V
S
 
H
A
 
S
A
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
R
T
 
K
P
 
K
V
 
G
A
 
E
I
 
Q
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
Q
 
D
A
 
L
A
 
E
R
 
A
E
 
R
S
 
I
R
 
R
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
R
S
 
H
Q
 
H
Q
 
H

Sites not aligning to the query:

6jb0A Crystal structure of abc transporter alpha-glycoside-binding mutant protein w287a in complex with trehalose (see paper)
30% identity, 82% coverage: 75:433/438 of query aligns to 34:403/404 of 6jb0A

query
sites
6jb0A
Q
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
Y
V
 
I
A
 
D
G
 
S
P
 
P
N
 
A
D
 
D
T
|
T
S
 
N
L
 
D
V
x
R
S
 
L
D
 
A
L
 
L
Y
 
Y
T
 
Q
T
 
Q
A
 
Y
F
 
W
L
 
A
L
 
A
G
 
R
N
 
S
A
 
P
P
 
D
Y
 
V
D
 
D
L
 
V
V
 
Y
F
 
M
L
 
I
D
|
D
V
 
V
T
 
I
W
 
W
L
 
-
P
 
P
K
 
G
F
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
P
G
 
H
W
 
-
L
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
K
D
 
P
R
 
Y
V
 
L
L
 
T
P
 
E
E
 
A
I
 
E
Q
 
L
A
 
K
E
 
E
F
 
F
L
 
F
P
 
P
A
 
R
A
 
I
L
 
V
N
 
Q
G
 
N
S
 
N
F
 
T
Y
 
I
R
 
R
D
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
T
R
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
F
N
x
F
A
 
T
A
x
D
V
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
P
 
E
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
S
P
 
P
P
 
P
Q
 
R
T
 
T
F
 
W
T
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
E
Q
 
Q
R
 
M
S
 
A
Q
 
E
Q
 
R
L
 
V
-
 
M
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
R
Q
 
R
A
 
A
Q
 
G
G
 
N
V
 
R
V
 
D
P
 
F
W
 
W
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
W
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
P
Y
 
Y
E
 
E
G
|
G
L
 
L
V
 
T
C
 
C
N
 
D
F
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
W
L
 
I
A
 
Y
G
 
S
F
 
H
G
 
G
G
 
G
Y
 
G
W
 
R
I
 
I
D
 
V
P
 
E
Q
 
P
T
 
D
G
 
G
E
 
T
V
 
I
G
 
S
L
 
V
D
 
N
H
 
N
P
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
L
D
 
N
W
 
R
L
 
A
H
 
H
S
 
G
T
 
W
I
 
V
T
 
G
D
 
-
Q
 
R
I
 
I
S
 
A
P
 
P
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
S
 
T
T
 
S
F
 
Y
Q
 
A
E
|
E
N
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
R
K
 
N
L
 
V
F
 
W
E
 
Q
T
 
Q
G
 
G
Q
 
N
S
 
S
A
 
L
F
 
F
M
 
M
R
 
R
N
 
N
W
|
W
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
E
 
Y
M
 
A
L
 
L
L
 
G
E
 
Q
R
 
A
P
 
E
E
 
G
S
 
S
A
 
P
V
 
I
R
 
R
G
 
G
K
 
K
V
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
T
P
 
V
M
 
L
V
 
P
H
 
K
A
 
A
P
 
S
G
 
A
Q
 
D
T
 
A
-
 
P
S
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
L
G
|
G
T
x
G
W
 
A
G
 
Q
V
 
L
G
 
M
I
 
V
A
 
S
Q
 
A
Q
 
Y
T
 
S
E
 
R
H
 
Y
P
 
P
E
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
D
A
 
L
L
 
V
L
 
K
A
 
Y
L
 
L
T
 
A
D
 
S
A
 
Y
E
 
E
S
 
V
Q
 
Q
R
 
K
L
 
D
I
 
N
S
 
A
L
 
V
G
x
R
S
 
L
N
 
S
Y
 
R
I
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
R
S
 
P
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
T
D
 
D
P
 
R
E
 
D
L
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
N
P
 
P
F
 
W
Y
 
F
A
 
R
T
 
D
L
 
L
P
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
F
E
 
Q
S
 
N
T
 
A
V
 
V
L
 
S
R
|
R
S
 
P
P
 
S
L
 
D
P
 
V
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
R
Y
 
Y
D
 
N
A
 
Q
L
 
V
S
 
S
D
 
E
I
 
A
L
 
I
Q
 
W
R
 
T
H
 
E
L
 
V
S
 
H
A
 
S
A
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
R
T
 
K
P
 
K
V
 
G
A
 
E
I
 
Q
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
Q
 
D
A
 
L
A
 
E
R
 
A
E
 
R
S
 
I
R
 
R
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
T
 
R
S
 
H
Q
 
H
Q
 
H

Sites not aligning to the query:

7yzuA Crystal structure of the sulfoquinovosyl binding protein smof complexed with sqme (see paper)
26% identity, 84% coverage: 61:428/438 of query aligns to 16:382/382 of 7yzuA

query
sites
7yzuA
Q
 
R
P
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
Q
F
 
Y
T
 
E
A
 
A
E
 
K
H
 
T
P
 
P
E
 
G
I
 
V
Q
 
K
L
 
V
E
 
V
L
 
I
V
 
E
A
 
T
G
 
G
P
 
G
N
 
N
D
x
T
T
x
S
S
 
E
L
 
M
V
 
Q
S
 
A
D
 
Q
L
 
Y
Y
 
L
T
 
N
T
 
T
A
 
V
F
 
M
L
 
S
L
 
A
G
 
K
N
 
D
A
 
S
P
 
S
Y
 
L
D
 
D
L
 
V
V
 
L
F
 
M
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
I
W
 
R
L
 
P
P
 
A
K
 
Q
F
 
F
V
 
A
A
 
T
A
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
T
L
 
S
D
 
D
L
 
F
S
 
S
D
 
G
R
 
K
V
 
D
L
 
L
P
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
S
E
 
A
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
A
 
T
A
 
Y
L
 
A
N
 
E
G
 
A
S
 
N
F
 
T
Y
 
V
R
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
I
Y
 
V
R
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
A
N
 
F
A
 
A
A
x
D
V
 
S
G
 
M
L
 
F
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
P
 
D
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
I
-
 
K
P
 
P
P
 
P
Q
 
T
T
 
T
F
 
W
T
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
K
Q
 
E
R
 
A
S
 
S
Q
 
K
Q
 
K
L
 
V
Q
 
M
A
 
E
Q
 
G
G
 
E
V
 
K
V
 
N
P
 
P
-
 
E
-
 
L
W
 
Q
G
 
G
Y
 
L
V
 
S
W
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
A
Y
 
I
E
|
E
G
|
G
L
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
T
F
 
F
L
 
L
E
 
L
V
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
P
Y
 
Y
W
 
W
I
 
S
D
 
E
P
 
G
Q
 
K
T
 
S
-
 
L
-
 
V
G
 
G
E
 
K
V
 
L
G
 
N
L
 
F
D
 
D
H
 
N
P
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
D
A
 
S
A
 
L
D
 
K
W
 
L
L
 
W
H
 
K
S
 
S
T
 
F
I
 
V
T
 
D
D
 
D
Q
 
G
I
 
I
S
 
S
P
 
K
A
 
K
G
 
N
V
 
I
S
 
S
T
 
E
F
 
V
Q
 
A
E
x
T
N
 
D
E
 
D
A
 
T
L
 
R
K
 
K
L
 
E
F
 
F
E
 
Q
T
 
A
G
 
G
Q
 
K
S
 
V
A
 
L
F
 
F
M
 
A
R
 
V
N
 
N
W
|
W
P
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
W
M
 
T
L
 
H
L
 
F
E
 
Q
R
 
G
P
 
K
E
 
E
S
 
S
A
 
Q
V
 
V
R
 
N
G
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
 
R
M
 
L
V
 
P
H
 
A
A
 
V
P
 
K
G
 
G
Q
 
G
T
 
E
S
 
Q
A
 
T
A
 
T
T
 
C
Q
 
L
G
|
G
T
x
G
W
|
W
G
 
E
V
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
S
Q
 
A
Q
 
Y
T
 
S
E
 
K
H
 
Q
P
 
Q
E
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
K
T
 
K
A
 
L
L
 
V
L
 
E
A
 
Y
L
 
L
T
 
S
D
 
S
A
 
Q
E
 
D
S
 
V
Q
 
S
R
 
K
L
 
F
I
 
M
S
 
A
L
 
I
G
 
N
S
 
A
N
 
A
Y
 
L
I
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
Y
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
K
D
 
D
P
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
T
A
 
K
R
 
T
Y
 
I
P
 
P
F
 
W
Y
 
F
A
 
A
T
 
D
L
 
A
P
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
V
E
 
E
S
 
T
T
 
A
V
 
K
L
 
A
R
|
R
S
 
P
P
 
V
L
 
T
P
 
P
A
 
R
Y
 
Y
D
 
N
A
 
E
L
 
V
S
 
S
D
 
E
I
 
T
L
 
I
Q
 
R
R
 
T
H
 
T
L
 
V
S
 
N
A
 
G
A
 
V
I
 
L
S
 
A
G
 
G
-
 
V
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
E
A
 
D
I
 
G
A
 
A
L
 
K
Q
 
Q
Q
 
M
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
L
S
 
R
R
 
R
Q
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

A9CEY9 Sulfoquinovosyl glycerol-binding protein SmoF; SQGro-binding protein SmoF; SQ monooxygenase cluster protein F from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see 2 papers)
26% identity, 84% coverage: 61:428/438 of query aligns to 47:415/416 of A9CEY9

query
sites
A9CEY9
Q
 
R
P
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
Q
F
 
Y
T
 
E
A
 
A
E
 
K
H
 
T
P
 
P
E
 
G
I
 
V
Q
 
K
L
 
V
E
 
V
L
 
I
V
 
E
A
 
T
G
 
G
P
 
G
N
 
N
D
 
T
T
x
S
S
 
E
L
 
M
V
 
Q
S
 
A
D
 
Q
L
 
Y
Y
 
L
T
 
N
T
 
T
A
 
V
F
 
M
L
 
S
L
 
A
G
 
K
N
 
D
A
 
S
P
 
S
Y
 
L
D
 
D
L
 
V
V
 
L
F
 
M
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
I
W
 
R
L
 
P
P
 
A
K
 
Q
F
 
F
V
 
A
A
 
T
A
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
T
L
 
S
D
 
D
L
 
F
S
 
S
D
 
G
R
 
K
V
 
D
L
 
L
P
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
S
E
 
A
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
A
 
T
A
 
Y
L
 
A
N
 
E
G
 
A
S
 
N
F
 
T
Y
 
V
R
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
I
Y
 
V
R
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
A
N
 
F
A
 
A
A
x
D
V
 
S
G
 
M
L
 
F
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
P
 
D
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
I
-
 
K
P
 
P
P
 
P
Q
 
T
T
 
T
F
 
W
T
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
K
Q
 
E
R
 
A
S
 
S
Q
 
K
Q
 
K
L
 
V
Q
 
M
A
 
E
Q
 
G
G
 
E
V
 
K
V
 
N
P
 
P
-
 
E
-
 
L
W
 
Q
G
 
G
Y
 
L
V
 
S
W
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
A
Y
 
I
E
 
E
G
|
G
L
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
T
F
 
F
L
 
L
E
 
L
V
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
P
Y
 
Y
W
 
W
I
 
S
D
 
E
P
 
G
Q
 
K
T
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
N
G
 
G
E
 
K
V
 
L
G
 
N
L
 
F
D
 
D
H
 
N
P
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
D
A
 
S
A
 
L
D
 
K
W
 
L
L
 
W
H
 
K
S
 
S
T
 
F
I
 
V
T
 
D
D
 
D
Q
 
G
I
 
I
S
 
S
P
 
K
A
 
K
G
 
N
V
 
I
S
 
S
T
 
E
F
 
V
Q
 
A
E
x
T
N
 
D
E
 
D
A
 
T
L
 
R
K
 
K
L
 
E
F
 
F
E
 
Q
T
 
A
G
 
G
Q
 
K
S
 
V
A
 
L
F
 
F
M
 
A
R
 
V
N
 
N
W
 
W
P
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
W
M
 
T
L
 
H
L
 
F
E
 
Q
R
 
G
P
 
K
E
 
E
S
 
S
A
 
Q
V
 
V
R
 
N
G
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
 
R
M
 
L
V
 
P
H
 
A
A
 
V
P
 
K
G
 
G
Q
 
G
T
 
E
S
 
Q
A
 
T
A
 
T
T
 
C
Q
 
L
G
 
G
T
x
G
W
|
W
G
 
E
V
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
S
Q
 
A
Q
 
Y
T
 
S
E
 
K
H
 
Q
P
 
Q
E
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
K
T
 
K
A
 
L
L
 
V
L
 
E
A
 
Y
L
 
L
T
 
S
D
 
S
A
 
Q
E
 
D
S
 
V
Q
 
S
R
 
K
L
 
F
I
 
M
S
 
A
L
 
I
G
 
N
S
 
A
N
 
A
Y
 
L
I
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
Y
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
K
D
 
D
P
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
T
A
 
K
R
 
T
Y
 
I
P
 
P
F
 
W
Y
 
F
A
 
A
T
 
D
L
 
A
P
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
V
E
 
E
S
 
T
T
 
A
V
 
K
L
 
A
R
|
R
S
 
P
P
 
V
L
 
T
P
 
P
A
 
R
Y
 
Y
D
 
N
A
 
E
L
 
V
S
 
S
D
 
E
I
 
T
L
 
I
Q
 
R
R
 
T
H
 
T
L
 
V
S
 
N
A
 
G
A
 
V
I
 
L
S
 
A
G
 
G
-
 
V
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
E
A
 
D
I
 
G
A
 
A
L
 
K
Q
 
Q
Q
 
M
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
L
S
 
R
R
 
R
Q
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7ofyA Crystal structure of sq binding protein from agrobacterium tumefaciens in complex with sulfoquinovosyl glycerol (sqgro) (see paper)
26% identity, 84% coverage: 61:428/438 of query aligns to 19:387/389 of 7ofyA

query
sites
7ofyA
Q
 
R
P
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
Q
F
 
Y
T
 
E
A
 
A
E
 
K
H
 
T
P
 
P
E
 
G
I
 
V
Q
 
K
L
 
V
E
 
V
L
 
I
V
 
E
A
 
T
G
 
G
P
 
G
N
 
N
D
x
T
T
x
S
S
 
E
L
 
M
V
 
Q
S
 
A
D
 
Q
L
 
Y
Y
 
L
T
 
N
T
 
T
A
 
V
F
 
M
L
 
S
L
 
A
G
 
K
N
 
D
A
 
S
P
 
S
Y
 
L
D
 
D
L
 
V
V
 
L
F
 
M
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
I
W
 
R
L
 
P
P
 
A
K
 
Q
F
 
F
V
 
A
A
 
T
A
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
T
L
 
S
D
 
D
L
 
F
S
 
S
D
 
G
R
 
K
V
 
D
L
 
L
P
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
S
E
 
A
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
A
 
T
A
 
Y
L
 
A
N
 
E
G
 
A
S
 
N
F
 
T
Y
 
V
R
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
I
Y
 
V
R
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
A
N
 
F
A
 
A
A
x
D
V
 
S
G
 
M
L
 
F
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
P
 
D
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
I
-
 
K
P
 
P
P
 
P
Q
 
T
T
 
T
F
 
W
T
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
K
Q
 
E
R
 
A
S
 
S
Q
 
K
Q
 
K
L
 
V
Q
 
M
A
 
E
Q
 
G
G
 
E
V
 
K
V
 
N
P
 
P
-
 
E
-
 
L
W
 
Q
G
 
G
Y
 
L
V
 
S
W
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
A
Y
 
I
E
 
E
G
|
G
L
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
T
F
 
F
L
 
L
E
 
L
V
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
P
Y
 
Y
W
 
W
I
 
S
D
 
E
P
 
G
Q
 
K
T
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
N
G
 
G
E
 
K
V
 
L
G
 
N
L
 
F
D
 
D
H
 
N
P
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
D
A
 
S
A
 
L
D
 
K
W
 
L
L
 
W
H
 
K
S
 
S
T
 
F
I
 
V
T
 
D
D
 
D
Q
 
G
I
 
I
S
 
S
P
 
K
A
 
K
G
 
N
V
 
I
S
 
S
T
 
E
F
 
V
Q
 
A
E
x
T
N
 
D
E
 
D
A
 
T
L
 
R
K
 
K
L
 
E
F
 
F
E
 
Q
T
 
A
G
 
G
Q
 
K
S
 
V
A
 
L
F
 
F
M
 
A
R
 
V
N
 
N
W
|
W
P
 
S
Y
|
Y
A
 
A
E
 
W
M
 
T
L
 
H
L
 
F
E
 
Q
R
 
G
P
 
K
E
 
E
S
 
S
A
 
Q
V
 
V
R
 
N
G
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
 
R
M
 
L
V
 
P
H
 
A
A
 
V
P
 
K
G
 
G
Q
 
G
T
 
E
S
 
Q
A
 
T
A
 
T
T
 
C
Q
 
L
G
|
G
T
x
G
W
|
W
G
 
E
V
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
S
Q
 
A
Q
 
Y
T
 
S
E
 
K
H
 
Q
P
 
Q
E
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
K
T
 
K
A
 
L
L
 
V
L
 
E
A
 
Y
L
 
L
T
 
S
D
 
S
A
 
Q
E
 
D
S
 
V
Q
 
S
R
 
K
L
 
F
I
 
M
S
 
A
L
 
I
G
 
N
S
 
A
N
 
A
Y
 
L
I
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
Y
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
K
D
 
D
P
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
T
A
 
K
R
 
T
Y
 
I
P
 
P
F
 
W
Y
 
F
A
 
A
T
 
D
L
 
A
P
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
V
E
 
E
S
 
T
T
 
A
V
 
K
L
 
A
R
|
R
S
 
P
P
 
V
L
 
T
P
 
P
A
 
R
Y
 
Y
D
 
N
A
 
E
L
 
V
S
 
S
D
 
E
I
 
T
L
 
I
Q
 
R
R
 
T
H
 
T
L
 
V
S
 
N
A
 
G
A
 
V
I
 
L
S
 
A
G
 
G
-
 
V
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
E
A
 
D
I
 
G
A
 
A
L
 
K
Q
 
Q
Q
 
M
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
L
S
 
R
R
 
R
Q
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7yzsAAA Sulfoquinovosyl binding protein (see paper)
26% identity, 84% coverage: 61:426/438 of query aligns to 17:383/384 of 7yzsAAA

query
sites
7yzsAAA
Q
 
R
P
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
Q
F
 
Y
T
 
E
A
 
A
E
 
K
H
 
T
P
 
P
E
 
G
I
 
V
Q
 
K
L
 
V
E
 
V
L
 
I
V
 
E
A
 
T
G
 
G
P
 
G
N
 
N
D
x
T
T
x
S
S
 
E
L
 
M
V
 
Q
S
 
A
D
 
Q
L
 
Y
Y
 
L
T
 
N
T
 
T
A
 
V
F
 
M
L
 
S
L
 
A
G
 
K
N
 
D
A
 
S
P
 
S
Y
 
L
D
 
D
L
 
V
V
 
L
F
 
M
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
I
W
 
R
L
 
P
P
 
A
K
 
Q
F
 
F
V
 
A
A
 
T
A
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
T
L
 
S
D
 
D
L
 
F
S
 
S
D
 
G
R
 
K
V
 
D
L
 
L
P
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
S
E
 
A
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
A
 
T
A
 
Y
L
 
A
N
 
E
G
 
A
S
 
N
F
 
T
Y
 
V
R
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
I
Y
 
V
R
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
A
N
 
F
A
 
A
A
x
D
V
 
S
G
 
M
L
 
F
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
P
 
D
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
I
-
 
K
P
 
P
P
 
P
Q
 
T
T
 
T
F
 
W
T
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
K
Q
 
E
R
 
A
S
 
S
Q
 
K
Q
 
K
L
 
V
Q
 
M
A
 
E
Q
 
G
G
 
E
V
 
K
V
 
N
P
 
P
-
 
E
-
 
L
W
 
Q
G
 
G
Y
 
L
V
 
S
W
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
A
Y
 
I
E
|
E
G
|
G
L
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
T
F
 
F
L
 
L
E
 
L
V
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
P
Y
 
Y
W
 
W
I
 
S
D
 
E
P
 
G
Q
 
K
T
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
N
G
 
G
E
 
K
V
 
L
G
 
N
L
 
F
D
 
D
H
 
N
P
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
D
A
 
S
A
 
L
D
 
K
W
 
L
L
 
W
H
 
K
S
 
S
T
 
F
I
 
V
T
 
D
D
 
D
Q
 
G
I
 
I
S
 
S
P
 
K
A
 
K
G
 
N
V
 
I
S
 
S
T
 
E
F
 
V
Q
 
A
E
x
T
N
 
D
E
 
D
A
 
T
L
 
R
K
 
K
L
 
E
F
 
F
E
 
Q
T
 
A
G
 
G
Q
 
K
S
 
V
A
 
L
F
 
F
M
 
A
R
 
V
N
 
N
W
|
W
P
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
W
M
 
T
L
 
H
L
 
F
E
 
Q
R
 
G
P
 
K
E
 
E
S
 
S
A
 
Q
V
 
V
R
 
N
G
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
 
R
M
 
L
V
 
P
H
 
A
A
 
V
P
 
K
G
 
G
Q
 
G
T
 
E
S
 
Q
A
 
T
A
 
T
T
 
C
Q
 
L
G
|
G
T
x
G
W
|
W
G
 
E
V
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
S
Q
 
A
Q
 
Y
T
 
S
E
 
K
H
 
Q
P
 
Q
E
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
K
T
 
K
A
 
L
L
 
V
L
 
E
A
 
Y
L
 
L
T
 
S
D
 
S
A
 
Q
E
 
D
S
 
V
Q
 
S
R
 
K
L
 
F
I
 
M
S
 
A
L
 
I
G
 
N
S
 
A
N
 
A
Y
 
L
I
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
Y
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
K
D
 
D
P
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
T
A
 
K
R
 
T
Y
 
I
P
 
P
F
 
W
Y
 
F
A
 
A
T
 
D
L
 
A
P
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
V
E
 
E
S
 
T
T
 
A
V
 
K
L
 
A
R
|
R
S
 
P
P
 
V
L
 
T
P
 
P
A
 
R
Y
 
Y
D
 
N
A
 
E
L
 
V
S
 
S
D
 
E
I
 
T
L
 
I
Q
 
R
R
 
T
H
 
T
L
 
V
S
 
N
A
 
G
A
 
V
I
 
L
S
 
A
G
 
G
-
 
V
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
E
A
 
D
I
 
G
A
 
A
L
 
K
Q
 
Q
Q
 
M
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
L
S
 
R
R
 
R

Sites not aligning to the query:

7qhvAAA Sulfoquinovosyl binding protein (see paper)
26% identity, 84% coverage: 61:428/438 of query aligns to 18:385/390 of 7qhvAAA

query
sites
7qhvAAA
Q
 
R
P
 
K
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
Q
F
 
Y
T
 
E
A
 
A
E
 
K
H
 
T
P
 
P
E
 
G
I
 
V
Q
 
K
L
 
V
E
 
V
L
 
I
V
 
E
A
 
T
G
 
G
P
 
G
N
|
N
D
x
T
T
x
S
S
 
E
L
 
M
V
 
Q
S
 
A
D
 
Q
L
 
Y
Y
 
L
T
 
N
T
 
T
A
 
V
F
 
M
L
 
S
L
 
A
G
 
K
N
 
D
A
 
S
P
 
S
Y
 
L
D
 
D
L
 
V
V
 
L
F
 
M
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
I
W
 
R
L
 
P
P
 
A
K
 
Q
F
 
F
V
 
A
A
 
T
A
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
T
L
 
S
D
 
D
L
 
F
S
 
S
D
 
K
R
 
D
V
 
L
L
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
-
A
 
S
E
 
A
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
A
 
T
A
 
Y
L
 
A
N
 
E
G
 
A
S
 
N
F
 
T
Y
 
V
R
 
N
D
 
G
R
 
K
L
 
I
Y
 
V
R
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
A
N
x
F
A
 
A
A
x
D
V
 
S
G
 
M
L
 
F
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
M
 
L
P
 
D
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
I
-
 
K
P
 
P
P
 
P
Q
 
T
T
 
T
F
 
W
T
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
K
Q
 
E
R
 
A
S
 
S
Q
 
K
Q
 
K
L
 
V
Q
 
M
A
 
E
Q
 
G
G
 
E
V
 
K
V
 
N
P
 
P
-
 
E
-
 
L
W
 
Q
G
 
G
Y
 
L
V
 
S
W
 
F
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
A
Y
 
I
E
|
E
G
|
G
L
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
T
F
 
F
L
 
L
E
 
L
V
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
P
Y
 
Y
W
 
W
I
 
S
D
 
E
P
 
G
Q
 
K
T
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
N
G
 
G
E
 
K
V
 
L
G
 
N
L
 
F
D
 
D
H
 
N
P
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
D
A
 
S
A
 
L
D
 
K
W
 
L
L
 
W
H
 
K
S
 
S
T
 
F
I
 
V
T
 
D
D
 
D
Q
 
G
I
 
I
S
 
S
P
 
K
A
 
K
G
 
N
V
 
I
S
 
S
T
 
E
F
 
V
Q
x
A
E
x
T
N
x
D
E
 
D
A
 
T
L
 
R
K
 
K
L
 
E
F
 
F
E
 
Q
T
 
A
G
 
G
Q
 
K
S
 
V
A
 
L
F
 
F
M
 
A
R
 
V
N
 
N
W
|
W
P
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
W
M
 
T
L
 
H
L
 
F
E
 
Q
R
 
G
P
 
K
E
 
E
S
 
S
A
 
Q
V
 
V
R
 
N
G
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
A
P
 
R
M
 
L
V
 
P
H
 
A
A
 
V
P
 
K
G
 
G
Q
 
G
T
 
E
S
 
Q
A
 
T
A
 
T
T
 
C
Q
 
L
G
|
G
T
x
G
W
|
W
G
 
E
V
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
S
Q
 
A
Q
 
Y
T
 
S
E
 
K
H
 
Q
P
 
Q
E
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
K
T
 
K
A
 
L
L
 
V
L
 
E
A
 
Y
L
 
L
T
 
S
D
 
S
A
 
Q
E
 
D
S
 
V
Q
 
S
R
 
K
L
 
F
I
 
M
S
 
A
L
 
I
G
 
N
S
 
A
N
 
A
Y
 
L
I
 
L
P
 
P
T
 
T
R
 
Y
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
K
D
 
D
P
 
A
E
 
D
L
 
V
L
 
T
A
 
K
R
 
T
Y
 
I
P
 
P
F
 
W
Y
 
F
A
 
A
T
 
D
L
 
A
P
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
V
E
 
E
S
 
T
T
 
A
V
 
K
L
 
A
R
|
R
S
 
P
P
 
V
L
 
T
P
 
P
A
 
R
Y
 
Y
D
 
N
A
 
E
L
 
V
S
 
S
D
 
E
I
 
T
L
 
I
Q
 
R
R
 
T
H
 
T
L
 
V
S
 
N
A
 
G
A
 
V
I
 
L
S
 
A
G
 
G
-
 
V
Q
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
E
A
 
D
I
 
G
A
 
A
L
 
K
Q
 
Q
Q
 
M
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
L
S
 
R
R
 
R
Q
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

G7CES0 Trehalose-binding lipoprotein LpqY; Extracellular solute-binding protein; SugABC transporter substrate-binding protein LpqY; SugABC transporter SBP LpqY from Mycolicibacterium thermoresistibile (strain ATCC 19527 / DSM 44167 / CIP 105390 / JCM 6362 / NCTC 10409 / 316) (Mycobacterium thermoresistibile) (see paper)
31% identity, 67% coverage: 104:397/438 of query aligns to 95:434/471 of G7CES0

query
sites
G7CES0
D
 
D
L
 
V
V
 
M
F
 
A
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
V
W
 
W
L
 
T
P
 
A
K
 
E
F
 
F
V
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
A
L
 
L
D
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
E
R
 
D
-
 
P
-
 
A
V
 
G
L
 
L
P
 
A
E
 
E
I
 
A
Q
 
D
A
 
A
-
 
T
-
 
T
E
 
N
F
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
P
L
 
L
N
 
E
G
 
T
S
 
A
F
 
K
Y
 
W
R
 
N
D
 
G
R
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
A
L
 
A
P
 
P
L
 
I
N
 
T
A
 
T
A
x
N
V
 
T
G
 
Q
L
 
L
L
 
L
Y
 
W
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
A
D
 
D
L
 
L
M
 
M
P
 
D
E
 
E
P
 
P
P
 
P
Q
 
A
T
 
T
F
 
W
T
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
L
Q
 
S
R
 
E
S
 
A
Q
 
A
Q
 
R
L
 
L
Q
 
H
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
V
 
G
V
 
P
P
 
S
W
 
W
G
 
I
Y
 
A
V
 
V
W
 
-
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
|
Y
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
C
 
V
N
 
W
F
 
F
L
 
N
E
 
T
V
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
S
F
 
A
G
 
G
G
 
G
Y
 
Q
W
 
V
I
 
L
D
 
S
P
 
D
Q
 
D
T
 
G
G
 
Q
E
 
R
V
 
V
G
 
T
L
 
L
-
 
T
D
 
D
H
 
T
P
 
P
E
 
E
-
 
H
-
 
R
-
 
A
-
 
A
A
 
T
I
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
L
D
 
E
W
 
I
L
 
I
H
 
K
S
 
A
T
 
V
I
 
A
T
 
T
D
 
A
Q
 
P
I
 
G
S
 
A
P
 
D
A
 
P
G
 
S
V
 
I
S
 
T
T
 
Q
F
 
T
Q
 
D
E
|
E
N
 
N
E
 
T
A
 
A
L
 
R
K
 
L
L
 
A
F
 
L
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
Q
 
R
S
 
A
A
 
A
F
 
L
M
 
E
R
 
V
N
 
N
W
|
W
P
 
P
Y
|
Y
A
 
-
E
 
-
M
 
V
L
 
L
L
 
P
E
 
S
R
 
L
P
 
L
E
 
E
S
 
N
A
 
A
V
 
I
R
 
K
G
 
G
K
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
N
H
 
E
A
 
N
P
 
P
G
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
V
-
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
-
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
G
-
 
F
-
 
A
-
 
R
-
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
P
-
 
D
Q
 
E
T
 
P
S
 
A
A
 
R
A
 
V
T
 
T
Q
 
L
G
 
G
T
x
G
W
x
L
G
 
N
V
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
Q
 
S
Q
 
T
T
 
T
E
 
R
H
 
H
P
 
K
E
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
F
T
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
R
A
x
C
L
 
L
T
 
R
D
 
N
A
 
E
E
 
E
S
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
I
 
T
S
 
S
L
 
I
G
 
E
S
 
G
N
 
G
Y
 
L
I
 
P
P
 
A
T
 
V
R
 
R
S
 
T
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
D
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
F
L
 
Q
A
 
A
R
 
K
Y
 
Y
P
 
P
F
 
Q
Y
 
Y
A
 
E
T
 
I
L
 
I
P
 
R
P
 
D
I
 
Q
L
 
L
E
 
I
S
 
N
T
 
A
V
 
A
L
 
V
R
|
R
S
 
P
P
 
A
L
 
T
P
 
P
A
 
V
Y
 
Y
D
 
Q
A
 
A
L
 
M
S
 
S

Sites not aligning to the query:

7apeA Crystal structure of lpqy from mycobacterium thermoresistible in complex with trehalose (see paper)
31% identity, 67% coverage: 104:397/438 of query aligns to 62:401/435 of 7apeA

query
sites
7apeA
D
 
D
L
 
V
V
 
M
F
 
A
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
V
W
 
W
L
 
T
P
 
A
K
 
E
F
 
F
V
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
A
L
 
L
D
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
E
R
 
D
-
 
P
-
 
A
V
 
G
L
 
L
P
 
A
E
 
E
I
 
A
Q
 
D
A
 
A
-
 
T
-
 
T
E
 
N
F
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
P
L
 
L
N
 
E
G
 
T
S
 
A
F
 
K
Y
 
W
R
 
N
D
 
G
R
 
E
L
 
L
Y
 
Y
R
 
A
L
 
A
P
 
P
L
 
I
N
 
T
A
 
T
A
 
N
V
 
T
G
 
Q
L
 
L
L
 
L
Y
 
W
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
A
D
 
D
L
 
L
M
 
M
P
 
D
E
 
E
P
 
P
P
 
P
Q
 
A
T
 
T
F
 
W
T
 
D
E
 
E
L
 
M
V
 
L
Q
 
S
R
 
E
S
 
A
Q
 
A
Q
 
R
L
 
L
Q
 
H
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
V
 
G
V
 
P
P
 
S
W
 
W
G
 
I
Y
 
A
V
 
V
W
 
-
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
Y
 
Y
E
|
E
G
|
G
L
 
L
V
 
V
C
 
V
N
 
W
F
 
F
L
 
N
E
 
T
V
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
S
F
 
A
G
 
G
G
 
G
Y
 
Q
W
 
V
I
 
L
D
 
S
P
 
D
Q
 
D
T
 
G
G
 
Q
E
 
R
V
 
V
G
 
T
L
 
L
-
 
T
D
 
D
H
 
T
P
 
P
E
 
E
-
 
H
-
 
R
-
 
A
-
 
A
A
 
T
I
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
L
D
 
E
W
 
I
L
 
I
H
 
K
S
 
A
T
 
V
I
 
A
T
 
T
D
 
A
Q
 
P
I
 
G
S
 
A
P
 
D
A
 
P
G
 
S
V
 
I
S
 
T
T
 
Q
F
 
T
Q
 
D
E
|
E
N
 
N
E
 
T
A
 
A
L
 
R
K
 
L
L
 
A
F
 
L
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
Q
 
R
S
 
A
A
 
A
F
 
L
M
 
E
R
 
V
N
 
N
W
|
W
P
 
P
Y
|
Y
A
 
-
E
 
-
M
 
V
L
 
L
L
 
P
E
 
S
R
 
L
P
 
L
E
 
E
S
 
N
A
 
A
V
 
I
R
 
K
G
 
G
K
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
F
A
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
N
H
 
E
A
 
N
P
 
P
G
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
V
-
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
-
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
G
-
 
F
-
 
A
-
 
R
-
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
P
-
 
D
Q
 
E
T
 
P
S
 
A
A
 
R
A
 
V
T
 
T
Q
 
L
G
|
G
T
x
G
W
 
L
G
 
N
V
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
Q
 
S
Q
 
T
T
 
T
E
 
R
H
 
H
P
 
K
E
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
F
T
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
R
A
 
C
L
 
L
T
 
R
D
 
N
A
 
E
E
 
E
S
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
I
 
T
S
 
S
L
 
I
G
 
E
S
 
G
N
 
G
Y
x
L
I
 
P
P
 
A
T
 
V
R
 
R
S
 
T
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
D
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
F
L
 
Q
A
 
A
R
 
K
Y
 
Y
P
 
P
F
 
Q
Y
 
Y
A
 
E
T
 
I
L
 
I
P
 
R
P
 
D
I
 
Q
L
 
L
E
 
I
S
 
N
T
 
A
V
 
A
L
 
V
R
|
R
S
 
P
P
 
A
L
 
T
P
 
P
A
 
V
Y
 
Y
D
 
Q
A
 
A
L
 
M
S
 
S

Sites not aligning to the query:

P9WGU9 Trehalose-binding lipoprotein LpqY; SugABC transporter substrate-binding protein LpqY; SugABC transporter SBP LpqY from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
30% identity, 69% coverage: 104:405/438 of query aligns to 92:439/468 of P9WGU9

query
sites
P9WGU9
D
 
D
L
 
V
V
 
M
F
 
A
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
V
W
 
W
L
 
T
P
 
A
K
 
E
F
 
F
V
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
A
L
 
L
D
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
D
R
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
L
V
 
A
L
 
E
P
 
N
E
 
D
I
 
A
Q
 
V
A
 
A
E
 
D
F
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
P
L
 
L
N
 
A
G
 
T
S
 
A
F
 
G
Y
 
W
R
 
N
D
 
H
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
A
L
 
A
P
 
P
L
 
V
N
 
T
A
 
T
A
x
N
V
 
T
G
 
Q
L
 
L
L
 
L
Y
 
W
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
P
D
 
D
L
 
L
M
 
V
P
 
N
E
 
S
P
 
P
P
 
P
Q
 
T
T
 
D
F
 
W
T
 
N
E
 
A
L
 
M
V
 
I
Q
 
A
R
 
E
S
 
A
Q
 
A
Q
 
R
L
 
L
Q
 
H
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
E
V
 
P
P
 
S
W
 
W
G
 
I
Y
 
A
V
 
V
W
 
-
Q
 
Q
G
 
A
K
 
N
Q
 
Q
Y
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
C
 
V
N
 
W
F
 
F
L
 
N
E
 
T
V
 
L
L
 
L
A
 
V
G
 
S
F
 
A
G
 
G
G
 
G
Y
 
S
W
 
V
I
 
L
D
 
S
P
 
E
Q
 
D
T
 
G
G
 
R
E
 
H
V
 
V
G
 
T
L
 
L
-
 
T
D
 
D
H
 
T
P
 
P
-
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
A
E
 
A
A
 
T
I
 
V
A
 
S
A
 
A
A
 
L
D
 
Q
W
 
I
L
 
L
H
 
K
S
 
S
T
 
V
I
 
A
T
 
T
D
 
T
Q
 
P
I
 
G
S
 
A
P
 
D
A
 
P
G
 
S
V
 
I
S
 
T
T
 
R
F
 
T
Q
 
E
E
 
E
N
 
G
E
 
S
A
 
A
L
 
R
K
 
L
L
 
A
F
 
F
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
Q
 
K
S
 
A
A
 
A
F
 
L
M
 
E
R
 
V
N
 
N
W
|
W
P
 
P
-
x
F
-
 
V
Y
 
F
A
 
A
E
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
E
S
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
K
G
 
G
K
 
G
V
 
V
G
 
P
I
 
F
A
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
N
H
 
R
-
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
-
 
F
-
 
R
-
 
I
-
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
Q
-
 
Q
-
 
V
-
 
F
-
 
G
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
-
 
A
-
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
P
S
 
A
A
 
K
A
 
V
T
 
T
Q
 
I
G
 
G
T
x
G
W
 
L
G
 
N
V
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
Q
 
T
T
 
T
E
 
R
H
 
H
P
 
R
E
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
F
T
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
R
A
x
C
L
 
L
T
 
R
D
 
D
A
 
Q
E
 
H
S
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
Y
I
 
V
S
 
S
L
 
L
G
 
E
S
 
G
N
 
G
Y
 
L
I
 
P
P
 
A
T
 
V
R
 
R
S
 
A
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
S
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
F
L
 
Q
A
 
A
R
 
K
Y
 
Y
P
 
P
F
 
M
Y
 
H
A
 
A
T
 
I
L
 
I
P
 
R
P
 
Q
I
 
Q
L
 
L
E
 
T
S
 
D
T
 
A
V
 
A
L
 
V
R
|
R
S
 
P
P
 
A
L
 
T
P
 
P
A
 
V
Y
 
Y
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
I
I
 
R
L
 
L
Q
 
A
R
 
A
H
 
V
L
 
L
S
 
S

Sites not aligning to the query:

8jabA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis lpqy in complex with trehalose analogue yb-06
30% identity, 69% coverage: 104:405/438 of query aligns to 61:408/433 of 8jabA

query
sites
8jabA
D
 
D
L
 
V
V
 
M
F
 
A
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
V
W
 
W
L
 
T
P
 
A
K
 
E
F
 
F
V
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
A
L
 
L
D
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
D
R
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
L
V
 
A
L
 
E
P
 
N
E
 
D
I
 
A
Q
 
V
A
 
A
E
 
D
F
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
P
L
 
L
N
 
A
G
 
T
S
 
A
F
 
G
Y
 
W
R
 
N
D
 
H
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
A
L
 
A
P
 
P
L
 
V
N
 
T
A
 
T
A
x
N
V
 
T
G
 
Q
L
 
L
L
 
L
Y
 
W
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
P
D
 
D
L
 
L
M
 
V
P
 
N
E
 
S
P
 
P
P
 
P
Q
 
T
T
 
D
F
 
W
T
 
N
E
 
A
L
 
M
V
 
I
Q
 
A
R
 
E
S
 
A
Q
 
A
Q
 
R
L
 
L
Q
 
H
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
E
V
 
P
P
 
S
W
 
W
G
 
I
Y
 
A
V
 
V
W
 
-
Q
 
Q
G
 
A
K
 
N
Q
 
Q
Y
 
G
E
|
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
C
 
V
N
 
W
F
 
F
L
 
N
E
 
T
V
 
L
L
 
L
A
 
V
G
 
S
F
 
A
G
 
G
G
 
G
Y
 
S
W
 
V
I
 
L
D
 
S
P
 
E
Q
 
D
T
 
G
G
 
R
E
 
H
V
 
V
G
 
T
L
 
L
-
 
T
D
 
D
H
 
T
P
 
P
-
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
A
E
 
A
A
 
T
I
 
V
A
 
S
A
 
A
A
 
L
D
 
Q
W
 
I
L
 
L
H
 
K
S
 
S
T
 
V
I
 
A
T
 
T
D
 
T
Q
 
P
I
 
G
S
 
A
P
 
D
A
 
P
G
 
S
V
 
I
S
 
T
T
 
R
F
 
T
Q
 
E
E
 
E
N
 
G
E
 
S
A
 
A
L
 
R
K
 
L
L
 
A
F
 
F
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
Q
 
K
S
 
A
A
 
A
F
 
L
M
 
E
R
 
V
N
 
N
W
|
W
P
 
P
-
x
F
-
 
V
Y
 
F
A
 
A
E
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
E
S
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
K
G
 
G
K
 
G
V
 
V
G
 
P
I
 
F
A
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
N
H
 
R
-
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
-
 
F
-
 
R
-
 
I
-
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
Q
-
 
Q
-
 
V
-
 
F
-
 
G
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
-
 
A
-
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
P
S
 
A
A
 
K
A
 
V
T
 
T
Q
 
I
G
 
G
T
x
G
W
 
L
G
 
N
V
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
Q
 
T
T
 
T
E
 
R
H
 
H
P
 
R
E
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
F
T
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
R
A
 
C
L
 
L
T
 
R
D
 
D
A
 
Q
E
 
H
S
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
Y
I
 
V
S
 
S
L
 
L
G
 
E
S
 
G
N
 
G
Y
 
L
I
 
P
P
 
A
T
 
V
R
 
R
S
 
A
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
S
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
F
L
 
Q
A
 
A
R
 
K
Y
 
Y
P
 
P
F
 
M
Y
 
H
A
 
A
T
 
I
L
 
I
P
 
R
P
 
Q
I
 
Q
L
 
L
E
 
T
S
 
D
T
 
A
V
 
A
L
 
V
R
|
R
S
 
P
P
 
A
L
 
T
P
 
P
A
 
V
Y
 
Y
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
I
I
 
R
L
 
L
Q
 
A
R
 
A
H
 
V
L
 
L
S
 
S

Sites not aligning to the query:

8jadA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis lpqy in complex with trehalose analogue yb-17
30% identity, 69% coverage: 104:405/438 of query aligns to 61:408/434 of 8jadA

query
sites
8jadA
D
 
D
L
 
V
V
 
M
F
 
A
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
V
W
 
W
L
 
T
P
 
A
K
 
E
F
 
F
V
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
A
L
 
L
D
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
D
R
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
L
V
 
A
L
 
E
P
 
N
E
 
D
I
 
A
Q
 
V
A
 
A
E
 
D
F
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
P
L
 
L
N
 
A
G
 
T
S
 
A
F
 
G
Y
 
W
R
 
N
D
 
H
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
A
L
 
A
P
 
P
L
 
V
N
 
T
A
 
T
A
x
N
V
 
T
G
 
Q
L
 
L
L
 
L
Y
 
W
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
P
D
 
D
L
 
L
M
 
V
P
 
N
E
 
S
P
 
P
P
 
P
Q
 
T
T
 
D
F
 
W
T
 
N
E
 
A
L
 
M
V
 
I
Q
 
A
R
 
E
S
 
A
Q
 
A
Q
 
R
L
 
L
Q
 
H
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
E
V
 
P
P
 
S
W
 
W
G
 
I
Y
 
A
V
 
V
W
 
-
Q
 
Q
G
 
A
K
 
N
Q
 
Q
Y
 
G
E
|
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
C
 
V
N
 
W
F
 
F
L
 
N
E
 
T
V
 
L
L
 
L
A
 
V
G
 
S
F
 
A
G
 
G
G
 
G
Y
 
S
W
 
V
I
 
L
D
 
S
P
 
E
Q
 
D
T
 
G
G
 
R
E
 
H
V
 
V
G
 
T
L
 
L
-
 
T
D
 
D
H
 
T
P
 
P
-
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
A
E
 
A
A
 
T
I
 
V
A
 
S
A
 
A
A
 
L
D
 
Q
W
 
I
L
 
L
H
 
K
S
 
S
T
 
V
I
 
A
T
 
T
D
 
T
Q
 
P
I
 
G
S
 
A
P
 
D
A
 
P
G
 
S
V
 
I
S
 
T
T
 
R
F
 
T
Q
 
E
E
 
E
N
 
G
E
 
S
A
 
A
L
 
R
K
 
L
L
 
A
F
 
F
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
Q
 
K
S
 
A
A
 
A
F
 
L
M
 
E
R
 
V
N
 
N
W
|
W
P
 
P
-
 
F
-
 
V
Y
 
F
A
 
A
E
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
E
S
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
K
G
 
G
K
 
G
V
 
V
G
 
P
I
 
F
A
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
N
H
 
R
-
 
I
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
-
 
F
-
 
R
-
 
I
-
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
Q
-
 
Q
-
 
V
-
 
F
-
 
G
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
-
 
A
-
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
P
S
 
A
A
 
K
A
 
V
T
 
T
Q
 
I
G
|
G
T
x
G
W
 
L
G
 
N
V
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
Q
 
T
T
 
T
E
 
R
H
 
H
P
 
R
E
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
F
T
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
R
A
 
C
L
 
L
T
 
R
D
 
D
A
 
Q
E
 
H
S
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
Y
I
 
V
S
 
S
L
 
L
G
 
E
S
 
G
N
 
G
Y
 
L
I
 
P
P
 
A
T
 
V
R
 
R
S
 
A
A
 
S
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
S
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
F
L
 
Q
A
 
A
R
 
K
Y
 
Y
P
 
P
F
 
M
Y
 
H
A
 
A
T
 
I
L
 
I
P
 
R
P
 
Q
I
 
Q
L
 
L
E
 
T
S
 
D
T
 
A
V
 
A
L
 
V
R
|
R
S
 
P
P
 
A
L
 
T
P
 
P
A
 
V
Y
 
Y
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
I
I
 
R
L
 
L
Q
 
A
R
 
A
H
 
V
L
 
L
S
 
S

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Synpcc7942_0950 FitnessBrowser__SynE:Synpcc7942_0950
MPFLRCGLTRWRSLRLLPLLLTLFIVLALGGLGTGTQRSAAADSTVVLRALLPAPFREAM
QPAIARFTAEHPEIQLELVAGPNDTSLVSDLYTTAFLLGNAPYDLVFLDVTWLPKFVAAG
WLLDLSDRVLPEIQAEFLPAALNGSFYRDRLYRLPLNAAVGLLYYRQDLMPEPPQTFTEL
VQRSQQLQAQGVVPWGYVWQGKQYEGLVCNFLEVLAGFGGYWIDPQTGEVGLDHPEAIAA
ADWLHSTITDQISPAGVSTFQENEALKLFETGQSAFMRNWPYAEMLLERPESAVRGKVGI
APMVHAPGQTSAATQGTWGVGIAQQTEHPEAALTALLALTDAESQRLISLGSNYIPTRSA
LYQDPELLARYPFYATLPPILESTVLRSPLPAYDALSDILQRHLSAAISGQTPVAIALQQ
AARESRQLLTSQQGATAS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory