SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Synpcc7942_1857 FitnessBrowser__SynE:Synpcc7942_1857 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3pefA Crystal structure of gamma-hydroxybutyrate dehydrogenase from geobacter metallireducens in complex with NADP+ (see paper)
31% identity, 97% coverage: 2:281/288 of query aligns to 3:283/287 of 3pefA

query
sites
3pefA
R
 
K
C
 
F
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
T
 
L
G
|
G
L
x
I
L
x
M
G
 
G
T
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
A
E
 
K
R
 
N
L
 
L
L
 
V
T
 
K
V
 
A
G
 
G
Q
 
C
L
 
S
L
 
V
T
 
T
V
 
I
W
 
W
N
|
N
R
|
R
T
x
S
A
 
P
E
 
E
R
x
K
S
 
A
Q
 
E
P
 
E
L
 
L
V
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
I
 
R
A
 
A
P
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
C
A
 
E
L
 
V
L
 
V
A
 
E
D
 
S
C
 
C
E
 
P
V
 
V
C
 
T
L
 
F
L
 
A
L
x
M
L
|
L
S
x
A
D
|
D
A
 
P
E
 
A
A
|
A
I
 
A
A
 
E
A
x
E
T
 
V
L
 
C
L
 
F
T
 
G
E
 
K
E
 
H
S
 
G
R
 
V
S
 
L
Q
 
E
L
 
G
V
 
I
-
 
G
-
 
E
G
 
G
K
 
R
T
 
G
I
 
Y
I
 
V
Q
 
D
M
 
M
G
 
S
T
|
T
I
 
V
S
 
D
P
 
P
A
 
A
E
 
T
S
 
S
R
 
Q
A
 
R
I
 
I
A
 
G
D
 
V
Q
 
A
I
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
Y
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
|
V
L
 
S
G
|
G
S
|
S
L
 
K
P
 
K
E
 
P
A
 
A
R
 
E
N
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
I
M
 
L
V
 
A
G
 
A
A
 
G
E
 
D
P
 
R
A
 
N
V
 
L
F
 
Y
E
 
D
Q
 
E
W
 
A
R
 
M
S
 
P
L
 
G
L
 
F
C
 
E
H
 
K
L
 
M
S
 
G
P
 
K
E
 
K
P
 
I
E
 
I
W
 
H
I
 
L
G
 
G
P
 
D
I
 
V
G
 
G
T
 
K
A
 
G
A
 
A
T
 
E
L
 
M
K
|
K
L
 
L
A
 
V
L
 
V
N
|
N
Q
 
M
L
 
V
I
x
M
G
 
G
S
 
G
L
 
M
T
 
M
S
 
A
A
 
C
F
 
F
G
 
C
G
 
E
S
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
G
Q
 
E
R
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
T
E
 
D
P
 
A
F
 
I
M
x
L
A
 
D
I
 
V
L
 
I
R
x
G
Q
 
A
S
 
G
A
 
A
L
 
M
Y
 
A
A
x
N
P
 
P
T
 
M
F
 
F
D
x
A
K
 
L
K
 
K
L
 
-
S
 
G
R
 
G
L
 
L
L
 
I
S
 
R
H
 
D
Q
 
R
Y
 
N
D
 
F
N
 
A
P
 
P
N
x
A
F
|
F
P
 
P
T
 
L
T
 
K
H
|
H
L
 
M
A
 
Q
K
|
K
D
 
D
L
 
L
R
|
R
L
 
L
F
 
A
R
 
V
E
 
A
T
 
L
A
 
G
A
 
D
D
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
Q
T
 
P
T
 
L
D
 
V
A
 
A
V
 
S
E
 
A
G
 
A
V
 
A
E
 
N
S
 
E
I
 
L
V
 
F
Q
 
K
K
 
G
A
 
A
I
x
R
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
W
 
F
G
 
G
D
 
D
Q
 
E
D
 
D
Y
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
I
Y
 
F
E
 
K

3pduA Crystal structure of gamma-hydroxybutyrate dehydrogenase from geobacter sulfurreducens in complex with NADP+ (see paper)
31% identity, 97% coverage: 4:283/288 of query aligns to 5:285/287 of 3pduA

query
sites
3pduA
G
 
G
L
 
F
I
 
L
G
|
G
T
 
L
G
|
G
L
x
I
L
x
M
G
 
G
T
 
G
A
 
P
I
 
M
A
 
A
E
 
A
R
 
N
L
 
L
L
 
V
T
 
R
V
 
A
G
 
G
Q
 
F
L
 
D
L
 
V
T
 
T
V
 
V
W
 
W
N
|
N
R
|
R
T
x
N
A
 
P
E
 
A
R
 
K
S
 
C
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
R
I
 
Q
A
 
A
P
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
E
L
 
V
L
 
C
A
 
A
D
 
A
C
 
C
E
 
D
V
 
I
C
 
T
L
 
I
L
 
A
L
x
M
L
|
L
S
x
A
D
 
D
A
 
P
E
 
A
A
|
A
I
 
A
A
 
R
A
 
E
T
 
V
L
 
C
L
 
F
T
 
G
E
 
A
E
 
N
S
 
G
R
 
V
S
 
L
Q
 
E
L
 
G
V
 
I
G
 
G
-
 
G
-
 
G
K
 
R
T
 
G
I
 
Y
I
 
I
Q
 
D
M
 
M
G
 
S
T
|
T
I
 
V
S
 
D
P
 
D
A
 
E
E
 
T
S
 
S
R
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
G
D
 
A
Q
 
A
I
 
V
A
 
T
A
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
Y
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
|
V
L
 
S
G
|
G
S
x
T
L
 
K
P
 
K
E
 
P
A
 
A
R
 
E
N
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
I
M
 
L
V
 
A
G
 
A
A
 
G
E
 
D
P
 
Q
A
 
S
V
 
L
F
 
F
E
 
T
Q
 
D
W
 
A
R
 
G
S
 
P
L
 
A
L
 
F
C
 
A
H
 
A
L
 
L
S
 
G
P
 
K
E
 
K
P
 
C
E
 
L
W
 
H
I
 
L
G
 
G
P
 
E
I
 
V
G
 
G
T
 
Q
A
 
G
A
 
A
T
 
R
L
 
M
K
|
K
L
 
L
A
 
V
L
 
V
N
 
N
Q
 
M
L
 
I
I
 
M
G
 
G
S
 
Q
L
 
M
T
 
M
S
 
T
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
E
S
 
G
L
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
G
Q
 
R
R
 
N
S
 
C
G
 
G
L
 
L
A
 
D
V
 
G
E
 
G
P
 
Q
F
 
L
M
 
L
A
 
E
I
 
V
L
 
L
R
 
D
Q
 
A
S
 
G
A
 
A
L
 
M
Y
 
A
A
 
N
P
 
P
T
 
M
F
 
F
D
 
K
K
 
G
K
 
K
L
 
G
S
 
Q
R
 
M
L
 
L
L
 
L
S
 
S
H
 
G
Q
 
E
Y
 
F
D
 
P
N
 
T
P
 
-
N
x
S
F
|
F
P
|
P
T
 
L
T
 
K
H
|
H
L
 
M
A
 
Q
K
|
K
D
 
D
L
 
L
R
|
R
L
 
L
F
 
A
R
 
V
E
|
E
T
 
L
A
 
G
A
 
D
D
x
R
L
 
L
G
 
G
I
 
Q
T
 
P
T
 
L
D
 
H
A
 
G
V
 
A
E
 
A
G
 
T
V
 
A
E
 
N
S
 
E
I
 
S
V
 
F
Q
 
K
K
 
R
A
 
A
I
 
R
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
W
 
H
G
 
A
D
 
D
Q
 
E
D
 
D
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
L
 
V
Y
 
F
E
 
R
A
 
V
I
 
L

2uyyA Structure of the cytokine-like nuclear factor n-pac
29% identity, 98% coverage: 2:282/288 of query aligns to 8:289/292 of 2uyyA

query
sites
2uyyA
R
 
K
C
 
I
G
 
G
L
 
F
I
 
L
G
 
G
T
 
L
G
|
G
L
|
L
L
x
M
G
 
G
T
 
S
A
 
G
I
 
I
A
 
V
E
 
S
R
 
N
L
 
L
L
 
L
T
 
K
V
 
M
G
 
G
Q
 
H
L
 
T
L
 
V
T
 
T
V
 
V
W
 
W
N
|
N
R
|
R
T
|
T
A
 
A
E
 
E
R
 
K
S
 
C
Q
 
D
P
 
L
L
 
F
V
 
I
A
 
Q
L
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
R
I
 
L
A
 
G
P
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
E
L
 
V
L
 
V
A
 
S
D
 
T
C
 
C
E
 
D
V
 
I
C
 
T
L
 
F
L
 
A
L
 
C
L
x
V
S
|
S
D
 
D
A
 
P
E
 
K
A
|
A
I
 
A
A
 
K
A
 
D
T
 
L
L
 
V
L
 
L
T
 
G
E
 
P
E
 
S
S
 
G
R
 
V
S
 
L
Q
 
Q
L
 
G
V
 
I
-
 
R
-
 
P
G
 
G
K
 
K
T
 
C
I
 
Y
I
 
V
Q
 
D
M
 
M
G
 
S
T
|
T
I
 
V
S
 
D
P
 
A
A
 
D
E
 
T
S
 
V
R
 
T
A
 
E
I
 
L
A
 
A
D
 
Q
Q
 
V
I
 
I
A
 
V
A
 
S
A
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
Y
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
Q
P
 
Q
E
 
L
A
 
S
R
 
N
N
 
D
G
 
G
T
 
M
L
 
L
I
 
V
V
 
I
M
 
L
V
 
A
G
 
A
A
 
G
E
 
D
P
 
R
A
 
G
V
 
L
F
 
Y
E
 
E
Q
 
D
W
 
C
R
 
S
S
 
S
L
 
C
L
 
F
C
 
Q
H
 
A
L
 
M
S
 
G
P
 
K
E
 
T
P
 
S
E
 
F
W
 
F
I
 
L
G
 
G
P
 
E
I
 
V
G
 
G
T
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
K
L
 
M
K
 
M
L
 
L
A
 
I
L
 
V
N
 
N
Q
 
M
L
 
V
I
 
Q
G
 
G
S
 
S
L
 
F
T
 
M
S
 
A
A
 
T
F
 
I
G
 
A
G
 
E
S
 
G
L
 
L
A
 
T
L
 
L
L
 
A
Q
 
Q
R
 
V
S
 
T
G
 
G
L
 
Q
A
 
S
V
 
Q
E
 
Q
P
 
T
F
 
L
M
 
L
A
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
N
Q
 
Q
S
 
G
A
 
Q
L
 
L
Y
 
A
A
 
S
P
 
I
T
 
F
F
 
L
D
 
D
K
 
Q
K
 
K
L
 
C
S
 
Q
R
 
N
L
 
I
L
 
L
S
 
Q
H
 
G
Q
 
N
Y
 
F
D
 
-
N
 
K
P
 
P
N
 
D
F
|
F
P
x
Y
T
 
L
T
 
K
H
x
Y
L
 
I
A
 
Q
K
|
K
D
 
D
L
 
L
R
 
R
L
 
L
F
 
A
R
 
I
E
 
A
T
 
L
A
 
G
A
 
D
D
 
A
L
 
V
G
 
N
I
 
H
T
 
P
T
 
T
D
 
P
A
 
M
V
 
A
E
 
A
G
 
A
V
 
A
E
 
N
S
 
E
I
 
V
V
 
Y
Q
 
K
K
 
R
A
 
A
I
 
K
A
 
A
Q
 
L
G
 
D
W
 
Q
G
 
S
D
 
D
Q
 
N
D
 
D
Y
 
M
S
 
S
A
 
A
L
 
V
Y
 
Y
E
 
R
A
 
A

Q49A26 Cytokine-like nuclear factor N-PAC; NPAC; 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase-like protein; Glyoxylate reductase 1 homolog; Nuclear protein NP60; Nuclear protein of 60 kDa; Nucleosome-destabilizing factor; hNDF; Putative oxidoreductase GLYR1 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
29% identity, 98% coverage: 2:282/288 of query aligns to 269:550/553 of Q49A26

query
sites
Q49A26
R
 
K
C
 
I
G
|
G
L
x
F
I
x
L
G
|
G
T
x
L
G
|
G
L
|
L
L
x
M
G
|
G
T
x
S
A
x
G
I
|
I
A
x
V
E
x
S
R
x
N
L
 
L
L
 
L
T
 
K
V
 
M
G
 
G
Q
 
H
L
 
T
L
 
V
T
 
T
V
 
V
W
 
W
N
 
N
R
 
R
T
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
K
S
 
C
Q
 
D
P
 
L
L
 
F
V
 
I
A
 
Q
L
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
R
I
 
L
A
 
G
P
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
E
L
 
V
L
 
V
A
 
S
D
 
T
C
 
C
E
 
D
V
 
I
C
 
T
L
 
F
L
 
A
L
 
C
L
 
V
S
 
S
D
 
D
A
 
P
E
 
K
A
 
A
I
 
A
A
 
K
A
 
D
T
 
L
L
 
V
L
 
L
T
 
G
E
 
P
E
 
S
S
 
G
R
 
V
S
 
L
Q
 
Q
L
 
G
V
 
I
-
 
R
-
 
P
G
 
G
K
 
K
T
 
C
I
 
Y
I
 
V
Q
 
D
M
 
M
G
 
S
T
|
T
I
 
V
S
 
D
P
 
A
A
 
D
E
 
T
S
 
V
R
 
T
A
 
E
I
 
L
A
 
A
D
 
Q
Q
 
V
I
 
I
A
 
V
A
 
S
A
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
Y
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
Q
P
 
Q
E
 
L
A
 
S
R
 
N
N
 
D
G
 
G
T
 
M
L
 
L
I
 
V
V
 
I
M
 
L
V
 
A
G
 
A
A
 
G
E
 
D
P
 
R
A
 
G
V
 
L
F
 
Y
E
 
E
Q
 
D
W
 
C
R
 
S
S
 
S
L
 
C
L
 
F
C
 
Q
H
 
A
L
 
M
S
 
G
P
 
K
E
 
T
P
 
S
E
 
F
W
 
F
I
 
L
G
 
G
P
 
E
I
 
V
G
 
G
T
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
K
L
 
M
K
x
M
L
 
L
A
 
I
L
 
V
N
 
N
Q
 
M
L
 
V
I
 
Q
G
 
G
S
 
S
L
 
F
T
 
M
S
 
A
A
 
T
F
 
I
G
 
A
G
 
E
S
 
G
L
 
L
A
 
T
L
 
L
L
 
A
Q
 
Q
R
 
V
S
 
T
G
 
G
L
 
Q
A
 
S
V
 
Q
E
 
Q
P
 
T
F
 
L
M
 
L
A
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
N
Q
 
Q
S
 
G
A
 
Q
L
 
L
Y
 
A
A
 
S
P
 
I
T
 
F
F
 
L
D
 
D
K
 
Q
K
 
K
L
 
C
S
 
Q
R
 
N
L
 
I
L
 
L
S
 
Q
H
 
G
Q
 
N
Y
 
F
D
 
-
N
 
K
P
|
P
N
 
D
F
 
F
P
 
Y
T
 
L
T
 
K
H
 
Y
L
 
I
A
 
Q
K
|
K
D
 
D
L
 
L
R
 
R
L
 
L
F
 
A
R
 
I
E
 
A
T
 
L
A
 
G
A
 
D
D
 
A
L
 
V
G
 
N
I
 
H
T
 
P
T
 
T
D
 
P
A
 
M
V
 
A
E
 
A
G
 
A
V
 
A
E
 
N
S
 
E
I
 
V
V
 
Y
Q
 
K
K
 
R
A
 
A
I
 
K
A
 
A
Q
 
L
G
 
D
W
 
Q
G
 
S
D
 
D
Q
 
N
D
 
D
Y
 
M
S
 
S
A
 
A
L
 
V
Y
 
Y
E
 
R
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q922P9 Cytokine-like nuclear factor N-PAC; NPAC; Glyoxylate reductase 1 homolog; Nuclear protein NP60; Putative oxidoreductase GLYR1 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
29% identity, 98% coverage: 2:282/288 of query aligns to 268:543/546 of Q922P9

query
sites
Q922P9
R
 
K
C
 
I
G
 
G
L
 
F
I
 
L
G
 
G
T
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
M
G
 
G
T
 
S
A
 
G
I
 
I
A
 
V
E
 
S
R
 
N
L
 
L
L
 
L
T
 
K
V
 
M
G
 
G
Q
 
H
L
 
T
L
 
V
T
 
T
V
 
V
W
 
W
N
 
N
R
 
R
T
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
K
S
 
E
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
G
A
 
A
T
 
R
I
 
L
A
 
G
P
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
E
L
 
V
L
 
V
A
 
S
D
 
T
C
 
C
E
 
D
V
 
I
C
 
T
L
 
F
L
 
A
L
 
C
L
 
V
S
 
S
D
 
D
A
 
P
E
 
K
A
 
A
I
 
A
A
 
K
A
 
D
T
 
L
L
 
V
L
 
L
T
 
G
E
 
P
E
 
S
S
 
G
R
 
V
S
 
L
Q
 
Q
L
 
G
V
 
I
-
 
R
-
 
P
G
 
G
K
 
K
T
 
C
I
 
Y
I
 
V
Q
 
D
M
 
M
G
 
S
T
 
T
I
 
V
S
 
D
P
 
A
A
 
D
E
 
T
S
 
V
R
 
T
A
 
E
I
 
L
A
 
A
D
 
Q
Q
 
V
I
 
I
A
 
V
A
 
S
A
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
Y
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
L
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
Q
P
 
Q
E
 
L
A
 
S
R
 
N
N
 
D
G
 
G
T
 
M
L
 
L
I
 
V
V
 
I
M
 
L
V
 
A
G
 
A
A
 
G
E
 
D
P
 
R
A
 
G
V
 
L
F
 
Y
E
 
E
Q
 
D
W
 
C
R
 
S
S
 
S
L
 
C
L
 
F
C
 
Q
H
 
A
L
 
M
S
 
G
P
 
K
E
 
T
P
 
S
E
 
F
W
 
F
I
 
L
G
 
G
P
 
E
I
 
V
G
 
G
T
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
K
L
 
M
K
 
M
L
 
L
A
 
I
L
 
V
N
 
N
Q
 
M
L
 
V
I
 
Q
G
 
G
S
 
S
L
 
F
T
 
M
S
 
A
A
 
T
F
 
I
G
 
A
G
 
E
S
 
G
L
 
L
A
 
T
L
 
L
L
 
A
Q
 
Q
R
 
V
S
 
T
G
 
G
L
 
Q
A
 
S
V
 
Q
E
 
Q
P
 
T
F
 
L
M
 
L
A
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
N
Q
 
Q
S
 
G
A
 
Q
L
 
L
Y
 
A
A
 
S
P
 
I
T
 
F
F
 
L
D
 
D
K
 
Q
K
 
K
L
 
C
S
 
Q
R
 
N
L
 
I
L
 
L
S
 
Q
H
 
G
Q
 
N
Y
 
F
D
 
-
N
 
K
P
|
P
N
 
D
F
 
F
P
 
Y
T
 
L
T
 
K
H
 
Y
L
 
I
A
 
Q
K
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
R
L
 
L
F
 
A
R
 
I
E
 
A
T
 
L
A
 
G
A
 
D
D
 
A
L
 
V
G
 
N
I
 
H
T
 
P
T
 
T
D
 
P
A
 
M
V
 
A
E
 
A
G
 
A
V
 
A
E
 
N
S
 
E
I
 
V
V
 
Y
Q
 
K
K
 
R
A
 
A
I
 
K
A
 
A
Q
 
L
G
 
D
W
 
Q
G
 
S
D
 
D
Q
 
N
D
 
D
Y
 
M
S
 
S
A
 
A
L
 
V
Y
 
Y
E
 
R
A
 
A

Q8T079 Cytokine-like nuclear factor N-PAC; NPAC; Glyoxylate reductase 1 homolog; Nuclear protein NP60 homolog; Nucleosome-destabilizing factor; Putative oxidoreductase GLYR1 homolog from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see paper)
27% identity, 96% coverage: 4:280/288 of query aligns to 319:597/602 of Q8T079

query
sites
Q8T079
G
 
G
L
 
F
I
 
L
G
 
G
T
 
L
G
 
G
L
 
M
L
 
M
G
 
G
T
 
S
A
 
T
I
 
I
A
 
V
E
 
K
R
 
D
L
 
L
L
 
I
T
 
Y
V
 
T
G
 
G
Q
 
H
L
 
K
L
 
V
T
 
V
V
 
V
W
 
W
N
 
N
R
 
R
T
 
T
A
 
I
E
 
D
R
 
K
S
 
C
Q
 
Q
P
 
P
L
 
F
V
 
A
A
 
E
L
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
E
I
 
V
A
 
K
P
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
M
A
 
D
L
 
V
L
 
V
A
 
E
D
 
A
C
 
A
E
 
D
V
 
V
C
 
I
L
 
F
L
 
C
L
 
C
L
 
V
S
 
S
D
 
D
A
 
P
E
 
K
A
 
G
I
 
A
A
 
K
A
 
D
T
 
L
L
 
V
L
 
F
T
 
G
E
 
N
E
 
C
S
 
G
R
 
V
S
 
L
Q
 
Q
L
 
L
V
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
N
G
 
N
K
 
K
T
 
A
I
 
Y
I
 
V
Q
 
E
M
 
M
G
 
S
T
 
T
I
 
I
S
 
D
P
 
P
A
 
D
E
 
T
S
 
S
R
 
L
A
 
D
I
 
I
A
 
G
D
 
E
Q
 
G
I
 
I
A
 
K
A
 
Q
A
 
C
G
 
N
G
 
G
Q
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
A
 
A
P
 
Q
V
 
I
L
 
H
G
 
G
S
 
S
L
 
R
P
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
M
L
 
L
I
 
I
V
 
I
M
 
L
V
 
A
G
 
G
A
 
G
E
 
D
P
 
R
A
 
S
V
 
V
F
 
F
E
 
E
Q
 
E
W
 
C
R
 
H
S
 
S
L
 
C
L
 
F
C
 
K
H
 
T
L
 
I
S
 
A
P
 
K
E
 
N
P
 
T
E
 
F
W
 
F
I
 
L
G
 
G
P
 
N
I
 
I
G
 
G
T
 
N
A
 
A
A
 
C
T
 
K
L
 
V
K
 
N
L
 
L
A
 
I
L
 
L
N
 
Q
Q
 
T
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
V
L
 
S
T
 
L
S
 
V
A
 
G
F
 
L
G
 
A
G
 
E
S
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
A
Q
 
D
R
 
R
S
 
F
G
 
S
L
 
I
A
 
S
V
 
L
E
 
N
P
 
D
F
 
I
M
 
I
A
 
D
I
 
I
L
 
F
R
 
D
Q
 
L
S
 
T
A
 
S
L
 
M
Y
 
K
A
 
S
P
 
P
T
 
M
F
 
L
D
 
L
K
 
A
K
 
K
L
 
G
S
 
K
R
 
E
L
 
M
L
 
A
S
 
K
H
 
G
Q
 
D
Y
 
F
D
 
-
N
 
N
P
 
P
N
 
Q
F
 
Q
P
 
P
T
 
L
T
 
S
H
 
H
L
 
M
A
 
Q
K
 
R
D
 
D
L
 
L
R
 
R
L
 
L
F
 
V
R
 
L
E
 
N
T
 
M
A
 
A
A
 
E
D
 
N
L
 
L
G
 
D
I
 
Q
T
 
S
T
 
M
D
 
P
A
 
V
V
 
T
E
 
S
G
 
I
V
 
T
E
 
N
S
 
E
I
 
V
V
 
F
Q
 
K
K
 
H
A
 
T
I
 
K
A
 
R
Q
 
L
G
 
G
W
 
Y
G
 
S
D
 
E
Q
 
H
D
 
D
Y
 
S
S
 
S
A
 
A
L
 
V
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

3w6zA Crystal structure of NADP bound l-serine 3-dehydrogenase (k170m) from hyperthermophilic archaeon pyrobaculum calidifontis (see paper)
30% identity, 97% coverage: 1:279/288 of query aligns to 14:293/296 of 3w6zA

query
sites
3w6zA
M
 
M
R
 
R
C
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
T
x
L
G
|
G
L
x
I
L
x
M
G
 
G
T
 
G
A
 
P
I
 
M
A
 
A
E
 
T
R
 
H
L
 
L
L
 
L
T
 
K
V
 
A
G
 
G
Q
 
F
L
 
L
L
 
A
T
 
A
V
 
V
W
 
Y
N
|
N
R
|
R
T
|
T
A
 
R
E
 
E
R
x
K
S
 
T
Q
 
K
P
 
P
L
 
F
V
 
A
A
 
E
L
 
A
G
 
G
A
 
V
T
 
Y
I
 
V
A
 
A
P
 
E
T
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
D
L
 
L
L
 
A
A
 
K
D
 
R
C
 
V
E
 
D
V
 
V
C
 
V
L
 
I
L
 
V
L
 
M
L
x
V
S
|
S
D
 
D
A
 
A
E
 
P
A
x
D
I
 
V
A
 
E
A
x
Q
T
 
V
L
 
L
L
 
F
-
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
V
T
 
V
E
 
E
E
 
G
S
 
A
R
 
R
S
 
P
Q
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
-
K
 
-
T
 
-
I
 
V
I
 
V
Q
 
D
M
 
M
G
 
S
T
 
T
I
 
N
S
 
S
P
 
P
A
 
D
E
 
W
S
 
A
R
 
R
A
 
K
I
 
F
A
 
A
D
 
E
Q
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
Y
G
 
G
G
 
I
Q
 
E
Y
 
F
L
 
L
E
 
D
A
 
A
P
 
P
V
|
V
L
 
T
G
 
G
S
 
G
L
 
Q
P
 
K
E
 
G
A
 
A
R
 
I
N
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
T
V
 
I
M
 
M
V
 
V
G
 
G
A
 
G
E
 
K
P
 
E
A
 
E
V
 
L
F
 
F
E
 
H
Q
 
R
W
 
L
R
 
L
S
 
P
L
 
I
L
 
F
C
 
K
H
 
A
L
 
M
S
 
G
P
 
R
E
 
D
P
 
I
E
 
V
W
 
Y
I
 
M
G
 
G
P
 
P
I
 
V
G
 
G
T
 
Y
A
 
G
A
 
Q
T
 
A
L
 
M
K
 
M
L
 
L
A
 
-
L
 
V
N
 
N
Q
 
Q
L
 
V
I
 
V
G
 
V
S
 
A
L
 
L
-
 
N
T
 
T
S
 
V
A
 
A
F
 
M
G
 
V
G
 
E
S
 
G
L
 
L
A
 
K
L
 
L
L
 
A
Q
 
K
R
 
A
S
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
D
V
 
M
E
 
D
P
 
K
F
 
V
M
 
A
A
 
E
I
 
V
L
 
L
R
 
T
Q
 
R
S
 
G
A
 
A
L
 
A
Y
 
R
A
 
S
P
 
G
T
 
A
F
 
I
D
 
E
K
 
L
K
 
Y
L
 
L
S
 
P
R
 
K
L
 
L
L
 
L
S
 
K
H
 
G
Q
 
D
Y
 
L
D
 
-
N
 
S
P
 
P
N
 
G
F
|
F
P
x
K
T
 
A
T
 
E
H
|
H
L
 
L
A
 
K
K
|
K
D
 
D
L
 
L
R
 
G
L
 
Y
F
 
V
R
 
L
E
 
E
T
 
E
A
 
A
A
 
R
D
 
K
L
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
K
T
 
L
D
 
P
A
 
G
V
 
A
E
 
E
G
 
L
V
 
A
E
 
Y
S
 
E
I
 
L
V
 
Y
Q
 
R
K
 
K
A
 
M
I
 
V
A
 
E
Q
 
D
G
 
G
W
 
A
G
 
G
D
 
S
Q
 
L
D
 
G
Y
 
I
S
 
H
A
 
A
L
 
L

3ws7A The 1.18 a resolution structure of l-serine 3-dehydrogenase complexed with NADP+ and sulfate ion from the hyperthermophilic archaeon pyrobaculum calidifontis (see paper)
32% identity, 97% coverage: 1:279/288 of query aligns to 14:290/293 of 3ws7A

query
sites
3ws7A
M
 
M
R
 
R
C
 
V
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
|
G
T
x
L
G
|
G
L
x
I
L
x
M
G
 
G
T
 
G
A
 
P
I
 
M
A
 
A
E
 
T
R
 
H
L
 
L
L
 
L
T
 
K
V
 
A
G
 
G
Q
 
F
L
 
L
L
 
A
T
 
A
V
 
V
W
 
Y
N
|
N
R
|
R
T
|
T
A
 
R
E
 
E
R
x
K
S
 
T
Q
 
K
P
 
P
L
 
F
V
 
A
A
 
E
L
 
A
G
 
G
A
 
V
T
 
Y
I
 
V
A
 
A
P
 
E
T
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
D
L
 
L
L
 
A
A
 
K
D
 
R
C
 
V
E
 
D
V
 
V
C
 
V
L
 
I
L
 
V
L
x
M
L
x
V
S
|
S
D
 
D
A
 
A
E
 
P
A
x
D
I
 
V
A
 
E
A
x
Q
T
 
V
L
 
L
L
 
F
-
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
V
T
 
V
E
 
E
E
 
G
S
 
A
R
 
R
S
 
P
Q
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
-
K
 
-
T
 
-
I
 
V
I
 
V
Q
 
D
M
 
M
G
 
S
T
 
T
I
 
N
S
 
S
P
 
P
A
 
D
E
 
W
S
 
A
R
 
R
A
 
K
I
 
F
A
 
A
D
 
E
Q
 
R
I
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
Y
G
 
G
G
 
I
Q
 
E
Y
 
F
L
 
L
E
 
D
A
 
A
P
 
P
V
|
V
L
x
T
G
|
G
S
 
G
L
 
Q
P
 
K
E
 
G
A
 
A
R
 
I
N
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
I
 
T
V
 
I
M
 
M
V
 
V
G
 
G
A
 
G
E
 
K
P
 
E
A
 
E
V
 
L
F
 
F
E
 
H
Q
 
R
W
 
L
R
 
L
S
 
P
L
 
I
L
 
F
C
 
K
H
 
A
L
 
M
S
 
G
P
 
R
E
 
D
P
 
I
E
 
V
W
 
Y
I
 
M
G
 
G
P
 
P
I
 
V
G
 
G
T
 
Y
A
 
G
A
 
Q
T
 
A
L
 
M
K
|
K
L
 
L
A
 
-
L
 
V
N
 
N
Q
 
Q
L
 
V
I
 
V
G
 
V
S
 
A
L
 
L
-
 
N
T
 
T
S
 
V
A
 
A
F
 
M
G
 
V
G
 
E
S
 
G
L
 
L
A
 
K
L
 
L
L
 
A
Q
 
K
R
 
A
S
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
D
V
 
M
E
 
D
P
 
K
F
 
V
M
 
A
A
 
E
I
 
V
L
 
L
-
 
T
-
 
A
R
 
R
Q
 
S
S
 
G
A
 
A
-
 
I
-
 
E
L
 
L
Y
 
Y
A
 
L
P
 
P
T
 
-
F
 
-
D
 
-
K
 
K
K
 
L
L
 
L
S
 
K
R
 
G
L
 
D
L
 
L
S
 
S
H
 
-
Q
 
-
Y
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
P
N
 
G
F
|
F
P
x
K
T
 
A
T
 
E
H
|
H
L
 
L
A
 
K
K
|
K
D
 
D
L
 
L
R
 
G
L
 
Y
F
 
V
R
 
L
E
 
E
T
 
E
A
 
A
A
 
R
D
 
K
L
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
K
T
 
L
D
 
P
A
 
G
V
 
A
E
 
E
G
 
L
V
 
A
E
 
Y
S
 
E
I
 
L
V
 
Y
Q
 
R
K
 
K
A
 
M
I
 
V
A
 
E
Q
 
D
G
 
G
W
 
A
G
 
G
D
 
S
Q
 
L
D
 
G
Y
 
I
S
 
H
A
 
A
L
 
L

8bk1A Mutant imine reductase ir007-143 from amycolatopsis azurea, e120a, m197w, m206s, a213p, d238g, i240l
30% identity, 98% coverage: 5:286/288 of query aligns to 6:286/288 of 8bk1A

query
sites
8bk1A
L
 
L
I
 
I
G
|
G
T
x
L
G
|
G
L
x
P
L
x
M
G
 
G
T
 
Q
A
 
A
I
 
M
A
 
V
E
 
R
R
 
V
L
 
L
L
 
L
T
 
E
V
 
N
G
 
G
Q
 
H
L
 
G
L
 
V
T
 
T
V
 
V
W
 
W
N
|
N
R
|
R
T
|
T
A
 
A
E
 
S
R
|
R
S
 
A
Q
 
D
P
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
A
L
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
V
I
 
R
A
 
V
P
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
D
L
 
A
L
 
V
A
 
A
D
 
A
C
 
S
E
 
E
V
 
L
C
 
V
L
 
L
L
 
L
L
x
S
L
|
L
S
x
T
D
 
D
A
 
Y
E
 
A
A
|
A
I
 
M
A
 
Y
A
 
D
T
x
I
L
 
L
L
 
G
T
 
K
E
 
A
E
 
E
S
 
-
R
 
-
S
 
E
Q
 
A
L
 
L
V
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
I
 
I
I
 
V
Q
 
N
M
 
L
G
x
S
T
x
S
I
 
D
S
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
K
S
 
T
R
 
R
A
 
E
I
 
A
A
 
A
D
 
E
Q
 
W
I
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
A
Q
 
K
Y
 
F
L
 
I
E
 
A
A
 
G
P
 
G
V
|
V
L
 
M
G
 
-
S
 
-
L
 
V
P
|
P
E
 
A
A
 
A
R
 
L
N
 
V
G
 
G
T
 
K
-
 
D
-
 
E
L
 
A
I
 
Y
V
 
V
M
 
F
V
 
Y
G
 
S
A
 
G
E
 
P
P
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
Q
 
K
W
 
H
R
 
R
S
 
E
L
 
A
L
 
L
C
 
A
H
 
-
L
 
L
S
 
I
P
 
G
E
 
R
P
 
P
E
 
D
W
 
F
I
 
L
G
 
G
P
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
I
 
L
G
 
F
T
x
Y
A
 
Q
A
 
A
T
 
Q
L
 
L
K
 
D
L
 
I
A
 
F
L
 
L
N
 
N
Q
 
S
L
 
L
I
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
S
A
 
A
F
 
F
G
 
M
G
 
H
S
 
A
L
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
V
Q
 
R
R
 
S
S
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
P
V
 
L
E
 
E
P
 
K
F
 
F
M
 
W
A
 
P
I
 
Y
L
 
A
R
 
K
Q
 
D
S
 
N
-
 
F
-
 
E
-
 
S
-
 
M
A
 
G
L
 
F
Y
 
Y
A
 
L
P
 
E
T
 
P
F
 
A
D
 
V
K
 
E
K
 
Q
L
 
I
S
 
E
R
 
K
L
 
-
L
 
G
S
 
D
H
 
H
Q
 
P
Y
 
G
D
 
D
N
 
E
P
 
A
N
 
D
F
 
V
-
 
I
-
 
M
-
 
M
-
 
G
-
 
A
P
 
S
T
 
A
T
 
G
H
 
H
L
 
L
A
 
V
K
 
Q
D
 
A
L
 
S
R
 
R
L
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
D
L
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
D
T
 
V
D
 
A
A
 
L
V
 
P
E
 
E
G
 
A
V
 
V
E
 
K
S
 
S
I
 
H
V
 
Y
Q
 
D
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
W
 
H
G
 
G
D
 
R
Q
 
S
D
 
S
Y
 
W
S
 
T
A
 
S
L
 
L
Y
 
F
E
 
E
A
 
I
I
 
I
N
 
K
P
 
A
D
 
D

8a3xA Imine reductase from ensifer adhaerens in complex with NADP+ (see paper)
28% identity, 96% coverage: 5:281/288 of query aligns to 7:288/295 of 8a3xA

query
sites
8a3xA
L
 
V
I
 
L
G
|
G
T
 
T
G
|
G
L
x
R
L
x
M
G
 
G
T
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
V
 
A
G
 
G
Q
 
Y
L
 
R
L
 
T
T
 
V
V
 
V
W
 
W
N
|
N
R
|
R
T
|
T
A
 
S
E
 
E
R
 
K
S
 
A
Q
 
E
P
 
P
L
 
L
V
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
I
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
V
A
 
R
A
 
Q
L
 
A
L
 
I
A
 
D
D
 
A
C
 
S
E
 
G
V
 
I
C
 
V
L
 
I
L
 
V
L
x
N
L
x
V
S
|
S
D
 
D
A
 
Y
E
 
A
A
|
A
I
 
T
A
 
S
A
 
T
T
 
L
L
 
L
L
 
R
T
 
A
E
 
S
E
 
D
S
 
V
R
 
T
S
 
P
Q
 
G
L
 
L
V
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
L
I
 
I
I
 
V
Q
 
E
M
 
L
G
 
T
T
x
S
I
 
G
S
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
G
S
 
A
R
 
R
A
 
E
I
 
T
A
 
S
D
 
Q
Q
 
W
I
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
H
G
 
G
G
 
A
Q
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
D
A
 
G
P
 
A
V
x
I
L
 
L
G
 
A
S
 
T
L
 
-
P
 
P
E
 
D
-
 
F
-
 
I
-
 
G
A
 
T
R
 
D
N
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
I
I
 
L
V
 
L
M
 
S
V
 
G
G
 
A
A
 
L
E
 
E
P
 
P
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
N
-
 
E
A
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
R
Q
 
A
W
 
L
R
 
G
S
 
G
L
 
N
L
 
V
C
 
Q
H
 
H
L
 
I
S
 
G
P
 
T
E
 
E
P
 
P
E
 
G
W
 
L
I
 
A
G
 
N
P
 
A
I
 
L
G
 
-
T
 
D
A
 
S
A
 
A
T
 
V
L
 
L
K
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
W
N
 
G
Q
 
A
L
 
L
I
 
F
G
 
G
S
 
G
L
 
L
T
 
H
S
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
C
-
 
R
A
 
A
F
 
E
G
 
E
G
 
I
S
 
D
L
 
L
A
 
G
L
 
E
L
 
L
Q
 
G
R
 
R
S
 
Q
G
 
W
L
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
A
P
 
P
F
 
V
M
 
V
A
 
E
I
 
G
L
 
L
R
 
V
Q
 
A
S
 
D
A
 
L
L
 
I
Y
 
K
A
 
R
P
 
T
T
 
S
F
 
A
D
 
G
K
 
R
K
 
F
L
 
V
S
 
S
R
 
D
L
 
A
L
 
E
S
 
T
H
x
L
Q
 
S
Y
 
S
D
 
I
N
 
S
P
|
P
N
 
H
F
 
Y
P
 
G
T
 
A
T
 
F
H
 
Q
L
 
H
A
 
L
K
 
K
D
 
E
L
 
L
R
 
M
L
 
E
F
 
A
R
 
R
E
 
R
T
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
I
T
 
D
T
 
R
D
 
T
A
 
V
V
 
V
E
 
D
G
 
G
V
 
Y
E
 
D
S
 
A
I
 
I
V
 
F
Q
 
R
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
W
 
H
G
 
L
D
 
H
Q
 
D
D
 
D
Y
 
F
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
S
E
 
Q

7og3A Ired-88
25% identity, 97% coverage: 5:284/288 of query aligns to 6:287/290 of 7og3A

query
sites
7og3A
L
 
V
I
 
V
G
|
G
T
 
L
G
|
G
L
x
P
L
x
M
G
 
G
T
 
L
A
 
V
I
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
V
L
 
L
L
 
L
T
 
A
V
 
K
G
 
G
Q
 
H
L
 
P
L
 
T
T
 
T
V
 
V
W
 
W
N
|
N
R
|
R
T
|
T
A
 
P
E
 
E
R
 
R
S
 
A
Q
 
S
P
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
S
I
 
L
A
 
A
P
 
A
T
 
S
P
 
I
A
 
T
A
 
D
L
 
A
L
 
V
A
 
S
D
 
A
C
 
S
E
 
P
V
 
V
C
 
T
L
 
I
L
 
M
L
x
C
L
|
L
S
x
N
D
 
N
A
 
Y
E
 
A
A
x
T
I
 
M
A
 
Y
A
 
E
T
 
V
L
 
F
L
 
-
T
 
-
E
 
G
E
 
P
S
 
A
R
 
R
S
 
E
Q
 
A
L
 
L
V
 
R
G
 
D
K
 
R
T
 
V
I
 
L
I
 
V
Q
 
N
M
 
L
G
x
N
T
x
S
I
 
G
S
 
T
P
 
P
A
 
Q
E
 
E
S
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
V
D
 
S
Q
 
W
I
 
A
A
 
S
A
 
D
A
 
L
G
 
G
G
 
T
Q
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
D
A
 
G
P
 
A
V
x
I
L
 
M
G
 
V
S
 
P
L
x
P
P
 
P
E
 
L
A
 
V
R
 
G
N
 
R
G
 
P
T
 
D
L
 
A
I
 
V
V
 
F
M
 
L
V
 
Y
G
 
S
A
 
G
E
 
D
P
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
L
E
 
D
Q
 
E
W
 
H
R
 
R
S
 
A
L
 
T
L
 
L
C
 
A
H
 
S
L
 
L
S
 
G
P
 
-
E
 
D
P
 
P
E
 
R
W
 
F
I
 
L
G
 
G
P
 
A
I
 
D
G
 
P
T
 
T
A
 
L
A
 
A
T
 
V
L
 
L
-
 
Y
K
 
N
L
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
L
Q
 
H
L
 
M
I
 
M
G
 
Y
S
 
A
L
 
T
T
 
L
S
 
N
A
 
G
F
 
Y
G
 
L
G
 
Q
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
V
Q
 
G
R
 
S
S
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
S
V
 
A
E
 
T
P
 
E
F
 
F
M
 
A
A
 
D
I
 
I
L
 
-
R
 
-
Q
 
A
S
 
L
A
 
G
L
 
W
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
T
 
S
F
 
V
D
 
L
K
 
A
K
 
P
L
 
-
S
 
S
R
 
S
L
 
L
L
 
A
S
 
A
H
 
H
-
 
A
-
 
V
Q
 
D
Y
 
L
D
 
D
N
 
K
P
 
G
N
 
N
F
 
Y
P
 
P
T
 
G
T
 
T
-
 
L
-
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
R
H
 
M
L
 
N
A
 
V
K
 
N
D
 
A
L
 
L
R
 
E
L
 
H
F
 
I
R
 
A
E
 
R
T
 
A
A
 
A
A
 
E
D
 
E
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
T
 
H
T
 
S
D
 
E
A
 
L
V
 
P
E
 
H
G
 
L
V
 
M
E
 
R
S
 
E
I
 
V
V
 
A
Q
 
E
K
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
W
 
H
G
 
G
D
 
D
Q
 
H
D
 
N
Y
 
Y
S
 
M
A
 
S
L
 
V
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
I
 
F
N
 
K

5je8B The crystal structure of bacillus cereus 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase in complex with NAD (see paper)
25% identity, 98% coverage: 2:283/288 of query aligns to 5:289/294 of 5je8B

query
sites
5je8B
R
 
K
C
 
I
G
 
G
L
 
F
I
 
I
G
 
G
T
 
L
G
|
G
L
x
N
L
x
M
G
 
G
T
 
L
A
 
P
I
 
M
A
 
S
E
 
K
R
 
N
L
 
L
L
 
V
T
 
K
V
 
S
G
 
G
Q
 
-
L
 
-
L
 
Y
T
 
T
V
 
V
W
 
Y
-
 
G
-
 
V
-
x
D
-
x
L
N
 
N
R
 
K
T
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
A
S
 
S
Q
 
-
P
 
-
L
 
F
V
 
E
A
 
K
L
 
E
G
 
G
A
 
G
T
 
I
I
 
I
A
 
G
P
 
L
T
 
S
P
 
I
A
 
S
A
 
K
L
 
L
L
 
A
A
 
E
D
 
T
C
 
C
E
 
D
V
 
V
C
 
V
L
 
F
L
 
T
L
 
S
L
|
L
S
x
P
D
 
S
A
 
P
E
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
A
T
x
V
L
 
Y
-
 
F
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
G
L
 
L
T
 
F
E
 
E
E
 
N
S
 
G
R
 
H
S
 
S
Q
 
N
L
 
V
V
 
V
G
 
-
K
 
-
T
 
-
I
 
F
I
 
I
Q
 
D
M
 
T
G
x
S
T
 
T
I
 
V
S
 
S
P
 
P
A
 
Q
E
 
L
S
 
N
R
 
K
A
 
Q
I
 
L
A
 
E
D
 
E
Q
 
A
I
 
A
A
 
K
A
 
E
A
 
K
G
 
K
G
 
V
Q
 
D
Y
 
F
L
 
L
E
 
A
A
 
A
P
 
P
V
|
V
L
 
S
G
 
G
S
 
G
L
 
V
P
 
I
E
 
G
A
 
A
R
 
E
N
 
N
G
 
R
T
 
T
L
 
L
I
 
T
V
 
F
M
 
M
V
 
V
G
 
G
A
 
G
E
 
S
P
 
K
A
 
D
V
 
V
F
 
Y
E
 
E
Q
 
K
W
 
T
R
 
E
S
 
S
L
 
I
L
 
M
C
 
G
H
 
V
L
 
L
S
 
G
P
 
A
E
 
N
P
 
I
E
 
F
W
 
H
I
 
V
G
 
S
P
 
E
-
 
Q
I
 
I
G
 
D
T
 
S
A
 
G
A
 
T
T
 
T
L
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
I
L
 
N
N
 
N
Q
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
F
L
 
Y
T
 
T
S
 
A
A
 
G
F
 
V
G
 
S
G
 
E
S
 
A
L
 
L
A
 
T
L
 
L
L
 
A
Q
 
K
R
 
K
S
 
N
G
 
N
L
 
M
A
 
D
V
 
L
E
 
D
P
 
K
F
 
M
M
 
F
A
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
N
Q
 
V
S
 
S
A
 
Y
L
 
G
Y
 
Q
A
 
S
P
 
R
T
 
I
F
 
Y
D
 
E
K
 
R
K
 
N
L
 
Y
S
 
K
R
 
S
L
 
F
L
 
I
S
 
A
H
 
P
Q
 
E
Y
 
N
D
 
Y
N
 
E
P
 
P
N
 
G
F
 
F
P
 
T
T
 
V
T
 
N
H
 
L
L
 
L
A
 
K
K
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
G
L
 
F
F
 
A
R
 
V
E
 
D
T
 
L
A
 
A
A
 
K
D
 
E
L
 
S
G
 
E
I
 
L
T
 
H
T
 
L
D
 
P
A
 
V
V
 
S
E
 
E
G
 
M
V
 
L
E
 
L
S
 
N
I
 
V
V
 
Y
Q
 
D
K
 
E
A
 
A
I
 
S
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
W
 
Y
G
 
G
D
 
E
Q
 
N
D
 
D
Y
 
M
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
E
 
K
A
 
K
I
 
V

8ozvA Imine reductase from ajellomyces dermatitidis in complex with 2,2- difluoroacetophenone (see paper)
26% identity, 97% coverage: 5:283/288 of query aligns to 6:284/286 of 8ozvA

query
sites
8ozvA
L
 
V
I
 
F
G
|
G
T
 
L
G
|
G
L
x
A
L
x
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
Q
L
 
F
L
 
L
T
 
R
V
 
K
G
 
G
Q
 
H
L
 
K
L
 
T
T
 
T
V
 
V
W
 
W
N
|
N
R
|
R
T
|
T
A
 
P
E
 
A
R
x
K
S
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
I
 
H
A
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
I
A
 
D
A
 
S
L
 
A
L
 
A
A
 
A
D
 
A
C
 
S
E
 
S
V
 
L
C
 
L
L
 
I
L
 
I
L
x
C
L
x
Q
S
x
L
D
 
D
A
 
K
E
 
A
A
x
S
I
 
V
A
 
M
A
x
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
-
T
 
-
E
 
Q
E
 
Q
S
 
A
R
 
P
S
 
T
Q
 
A
L
 
W
V
 
A
G
 
A
K
 
K
T
 
T
I
 
I
I
 
V
Q
 
D
M
 
L
G
 
T
T
x
N
I
 
G
S
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
H
S
 
A
R
 
R
A
 
E
I
 
T
A
 
A
D
 
D
Q
 
W
I
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
H
G
 
G
G
 
A
Q
 
R
Y
 
Y
L
 
I
E
 
H
A
 
G
-
 
G
-
 
I
-
 
M
-
x
A
-
 
V
P
|
P
V
 
F
L
 
M
G
 
I
S
 
G
L
 
Q
P
 
P
E
 
D
A
 
A
R
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
M
V
 
I
M
 
L
V
 
Y
G
 
S
A
 
G
E
 
P
P
 
A
A
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
E
Q
 
G
W
 
V
R
 
K
S
 
D
L
 
T
L
 
L
C
 
S
H
 
V
L
 
L
S
 
G
P
 
T
E
 
N
P
 
T
E
 
Y
W
 
V
I
 
G
G
 
E
P
 
D
I
 
V
G
 
G
T
 
L
A
 
A
A
 
S
T
 
L
L
 
H
K
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
L
N
x
L
Q
 
S
L
 
G
I
x
M
G
 
Y
S
 
G
L
 
L
T
 
F
S
 
S
A
 
G
F
 
F
G
 
T
G
 
H
S
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
V
Q
 
Q
R
 
S
S
 
A
G
 
N
L
 
I
A
 
P
V
 
A
E
 
A
P
 
G
F
 
F
M
 
V
A
 
A
I
 
T
L
 
Q
R
 
L
Q
 
I
S
 
P
A
 
W
L
 
L
Y
 
T
A
 
A
P
 
M
T
 
T
F
 
-
D
 
-
K
 
-
K
 
Q
L
 
H
S
 
L
R
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
A
H
 
T
Q
 
Q
Y
 
V
D
 
D
N
 
E
P
 
K
N
 
D
F
 
Y
P
 
G
T
 
D
T
 
G
H
 
G
L
 
S
A
 
S
K
 
L
D
 
D
L
 
M
R
 
Q
L
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
N
F
 
I
R
 
L
E
 
E
T
 
A
A
 
S
A
 
Q
D
 
A
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
T
 
S
T
 
V
D
 
E
A
 
L
V
 
I
E
 
Q
G
 
P
V
 
I
E
 
F
S
 
K
I
 
L
V
 
I
Q
 
E
K
 
R
A
 
R
I
 
V
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
W
 
K
G
 
G
D
 
S
Q
 
E
D
 
G
Y
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
V
E
 
G
A
 
M
I
 
I

8p2jC Imine reductase from ajellomyces dermatitidis in space group c21 (see paper)
26% identity, 97% coverage: 5:283/288 of query aligns to 14:292/293 of 8p2jC

query
sites
8p2jC
L
 
V
I
 
F
G
|
G
T
 
L
G
|
G
L
x
A
L
x
M
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
Q
L
 
F
L
 
L
T
 
R
V
 
K
G
 
G
Q
 
H
L
 
K
L
 
T
T
 
T
V
 
V
W
 
W
N
|
N
R
|
R
T
|
T
A
 
P
E
 
A
R
 
K
S
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
V
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
S
I
 
H
A
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
I
A
 
D
A
 
S
L
 
A
L
 
A
A
 
A
D
 
A
C
 
S
E
 
S
V
 
L
C
 
L
L
 
I
L
 
I
L
x
C
L
x
Q
S
x
L
D
 
D
A
 
K
E
 
A
A
x
S
I
 
V
A
 
M
A
x
Q
T
 
T
L
 
L
L
 
-
T
 
-
E
 
Q
E
 
Q
S
 
A
R
 
P
S
 
T
Q
 
A
L
 
W
V
 
A
G
 
A
K
 
K
T
 
T
I
 
I
I
 
V
Q
 
D
M
 
L
G
x
T
T
x
N
I
 
G
S
 
T
P
 
P
A
 
A
E
 
H
S
 
A
R
 
R
A
 
E
I
 
T
A
 
A
D
 
D
Q
 
W
I
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
H
G
 
G
G
 
A
Q
 
R
Y
 
Y
L
 
I
E
 
H
A
 
G
-
 
G
-
 
I
-
 
M
-
x
A
-
 
V
P
|
P
V
 
F
L
 
M
G
 
I
S
 
G
L
 
Q
P
 
P
E
 
D
A
 
A
R
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
M
V
 
I
M
 
L
V
 
Y
G
 
S
A
 
G
E
 
P
P
 
A
A
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
E
Q
 
G
W
 
V
R
 
K
S
 
D
L
 
T
L
 
L
C
 
S
H
 
V
L
 
L
S
 
G
P
 
T
E
 
N
P
 
T
E
 
Y
W
 
V
I
 
G
G
 
E
P
 
D
I
 
V
G
 
G
T
 
L
A
 
A
A
 
S
T
 
L
L
 
H
K
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
L
N
 
L
Q
 
S
L
 
G
I
 
M
G
 
Y
S
 
G
L
 
L
T
 
F
S
 
S
A
 
G
F
 
F
G
 
T
G
 
H
S
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
V
Q
 
Q
R
 
S
S
 
A
G
 
N
L
 
I
A
 
P
V
 
A
E
 
A
P
 
G
F
 
F
M
 
V
A
 
A
I
 
T
L
 
Q
R
 
L
Q
 
I
S
 
P
A
 
W
L
 
L
Y
 
T
A
 
A
P
 
M
T
 
T
F
 
-
D
 
-
K
 
-
K
 
Q
L
 
H
S
 
L
R
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
A
H
 
T
Q
 
Q
Y
 
V
D
 
D
N
 
E
P
 
K
N
 
D
F
 
Y
P
 
G
T
 
D
T
 
G
H
 
G
L
x
S
A
 
S
K
 
L
D
 
D
L
x
M
R
 
Q
L
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
N
F
 
I
R
 
L
E
 
E
T
 
A
A
 
S
A
 
Q
D
 
A
L
 
Q
G
 
G
I
 
V
T
 
S
T
 
V
D
 
E
A
 
L
V
 
I
E
 
Q
G
 
P
V
 
I
E
 
F
S
 
K
I
 
L
V
 
I
Q
 
E
K
 
R
A
 
R
I
 
V
A
 
E
Q
 
E
G
 
G
W
 
K
G
 
G
D
 
S
Q
 
E
D
 
G
Y
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
V
E
 
G
A
 
M
I
 
I

6jizB Apo structure of an imine reductase at 1.76 angstrom resolution
27% identity, 97% coverage: 5:284/288 of query aligns to 6:291/293 of 6jizB

query
sites
6jizB
L
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
L
G
 
G
L
 
P
L
 
M
G
 
G
T
 
Q
A
 
A
I
 
M
A
 
V
E
 
R
R
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
G
V
 
Q
G
 
G
Q
 
H
L
 
P
L
 
V
T
 
T
V
 
V
W
 
W
N
 
N
R
 
R
T
 
T
A
 
P
E
 
S
R
 
R
S
 
A
Q
 
E
P
 
P
L
 
L
V
 
V
A
 
V
L
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
R
I
 
L
A
 
A
P
 
A
T
 
S
P
 
P
A
 
T
A
 
E
L
 
A
L
 
V
A
 
A
D
 
S
C
 
S
E
 
D
V
 
L
C
 
V
L
 
I
L
 
L
L
 
S
L
 
L
S
 
T
D
 
D
A
 
Y
E
 
Q
A
 
A
I
 
M
A
 
Y
A
 
D
T
 
I
L
 
L
L
 
S
T
 
T
E
 
A
E
 
E
S
 
-
R
 
-
S
 
S
Q
 
A
L
 
L
V
 
A
G
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
I
I
 
V
Q
 
N
M
 
L
G
 
S
T
 
S
I
 
D
S
 
D
P
 
P
A
 
D
E
 
V
S
 
T
R
 
R
A
 
E
I
 
A
A
 
A
D
 
K
Q
 
W
I
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
H
G
 
G
G
 
A
Q
 
T
Y
 
F
L
 
I
E
 
A
A
 
G
P
 
G
V
 
V
L
 
M
G
 
T
S
 
P
L
 
A
P
 
P
E
 
T
A
 
V
R
 
G
N
 
T
G
 
E
T
 
A
L
 
A
I
 
Y
V
 
V
M
 
F
V
 
Y
G
 
S
A
 
G
E
 
P
P
 
K
A
 
S
V
 
A
F
 
F
E
 
D
Q
 
A
W
 
H
R
 
E
S
 
P
L
 
V
L
 
L
C
 
R
H
 
H
L
 
I
S
 
G
P
 
-
E
 
G
P
 
P
E
 
R
W
 
F
I
 
L
G
 
G
-
 
E
P
 
D
I
 
T
G
 
G
T
 
L
A
 
A
A
 
Q
T
 
L
L
 
Y
K
 
Y
L
 
L
A
 
A
-
 
H
L
 
L
N
 
D
Q
 
V
L
 
F
I
 
L
G
 
T
S
 
T
L
 
L
T
 
A
S
 
S
A
 
V
F
 
V
G
 
H
G
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
L
-
 
V
S
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
G
L
 
V
Q
 
D
R
 
E
S
 
A
G
 
A
L
 
F
A
 
A
V
 
P
E
 
E
P
 
A
F
 
I
M
 
R
A
 
M
I
 
V
L
 
I
R
 
E
Q
 
T
S
 
G
A
 
Q
L
 
M
Y
 
L
A
 
A
P
 
A
T
 
E
F
 
A
D
 
E
K
 
T
K
 
G
L
 
L
S
 
E
R
 
-
L
 
-
L
 
L
S
 
G
H
 
R
Q
 
N
Y
 
L
D
 
A
N
 
S
P
 
G
N
 
N
F
 
H
P
 
P
T
 
-
T
 
G
H
 
E
L
 
L
A
|
A
K
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
T
A
 
A
A
 
V
D
 
M
L
x
M
G
 
G
I
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
D
A
 
H
V
 
I
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
P
E
 
E
G
 
A
V
 
V
E
 
K
S
 
S
I
 
L
V
 
Y
Q
 
D
K
 
R
A
 
T
I
 
V
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
W
 
H
G
 
G
D
 
K
Q
 
D
D
 
S
Y
 
W
S
 
T