SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011382485.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011382485.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5u4qA 1.5 angstrom resolution crystal structure of NAD-dependent epimerase from klebsiella pneumoniae in complex with NAD.
23% identity, 99% coverage: 1:315/318 of query aligns to 2:317/321 of 5u4qA

query
sites
5u4qA
M
 
M
R
 
K
V
 
F
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
N
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
Q
 
F
P
 
H
L
 
I
C
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
L
E
 
N
L
 
E
G
 
G
H
 
H
H
 
N
V
 
V
A
 
V
G
 
G
A
 
I
V
x
D
R
x
N
G
 
M
Q
x
N
P
 
D
Y
 
Y
L
x
Y
P
 
D
D
 
V
C
 
S
V
 
L
E
x
K
R
 
Q
R
 
A
P
 
R
A
 
L
G
 
D
R
 
R
L
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
A
-
 
F
-
 
H
-
 
F
-
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
x
D
V
x
L
A
 
A
D
 
D
G
 
R
N
 
E
W
 
G
S
 
M
A
 
A
A
 
K
L
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
T
E
 
E
G
 
Q
M
 
F
Q
 
D
A
 
R
V
 
V
V
 
I
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
R
 
Q
V
 
A
H
 
-
V
 
-
M
 
-
H
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
H
 
-
D
 
N
P
 
P
L
 
Y
A
 
A
E
 
-
F
 
Y
R
 
A
A
 
D
A
 
A
N
 
N
G
 
L
A
 
M
G
 
G
T
 
Y
L
 
L
R
 
N
L
 
I
A
 
L
E
 
E
Q
 
G
A
 
C
A
 
R
Q
 
H
A
 
T
G
 
K
I
 
V
G
 
K
H
 
H
L
 
L
V
 
V
F
 
Y
L
x
A
S
 
S
S
 
S
I
 
S
K
 
S
A
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
L
E
 
N
T
 
R
T
 
K
H
 
-
T
 
M
P
 
P
F
 
F
G
 
S
P
 
T
L
 
E
N
 
D
A
 
S
A
 
V
-
 
D
-
 
H
P
 
P
V
 
V
D
 
S
P
 
L
Y
|
Y
G
 
A
I
 
A
S
 
T
K
|
K
L
 
K
E
 
A
A
 
N
E
 
E
Q
 
L
G
 
M
L
 
A
A
 
H
E
 
T
I
 
Y
A
 
S
A
 
H
R
 
L
T
 
Y
G
 
G
L
 
I
A
 
P
V
 
T
T
 
T
V
 
G
L
 
L
R
 
R
P
x
F
P
x
F
L
x
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
W
V
 
G
K
x
R
G
 
P
N
 
D
F
 
M
R
 
-
A
 
A
L
 
L
I
 
F
R
 
K
L
 
F
V
 
T
N
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
L
R
 
E
G
 
G
L
 
K
P
 
S
L
 
I
P
 
D
L
 
V
G
 
Y
C
 
N
C
 
Y
T
 
G
H
 
K
N
 
M
R
 
K
R
 
R
S
 
D
L
 
F
I
 
T
G
 
Y
L
 
I
G
 
D
N
 
D
L
 
I
V
 
V
D
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
V
A
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Q
 
V
P
 
I
P
 
P
H
 
Q
P
 
A
G
 
N
Q
 
A
-
 
D
-
 
W
-
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
P
C
 
Y
R
 
R
V
 
V
F
 
Y
T
 
N
L
 
I
C
 
G
D
 
N
A
 
S
E
 
S
A
 
P
P
 
V
S
 
E
T
 
L
A
 
M
D
 
D
L
 
Y
V
 
I
R
 
T
S
 
A
L
 
L
A
 
E
R
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
M
P
 
E
A
 
A
R
 
Q
L
 
K
L
 
N
P
 
M
I
 
M
P
 
P
V
 
I
G
 
T
L
 
-
M
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
S
V
 
A
D
 
D
G
 
T
S
 
Q
A
 
P
L
 
L
A
 
Y
A
 
D
A
 
L
I
 
V
G
 
G
W
 
F
V
 
K
P
 
P
P
 
Q
E
 
T
T
 
S
L
 
V
D
 
K
E
 
D
G
 
G
L
 
V
T
 
K
A
 
N
T
 
F
A
 
V
R
 
D
W
 
W
W
 
Y
R
 
K
N
 
D

4zrnA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (tm0509) with udp-glucose from hyperthermophilic eubacterium thermotoga maritima (see paper)
24% identity, 99% coverage: 1:315/318 of query aligns to 1:306/309 of 4zrnA

query
sites
4zrnA
M
 
M
R
 
N
V
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
N
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
Q
 
S
P
 
H
L
 
V
C
 
V
R
 
D
R
 
K
L
 
L
A
 
I
E
 
E
L
 
N
G
 
G
H
 
Y
H
 
G
V
 
V
-
 
I
-
 
V
-
 
V
-
x
D
-
x
N
-
 
L
-
x
S
A
x
S
G
|
G
A
 
K
V
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
L
-
 
N
R
 
R
G
 
N
Q
 
A
P
 
L
Y
 
F
L
 
Y
P
 
E
D
 
Q
C
x
S
V
x
I
E
 
E
R
 
D
R
 
E
P
 
E
A
 
M
G
 
M
R
 
E
L
 
R
V
 
I
A
 
F
D
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
S
L
 
L
E
 
H
G
 
R
M
 
P
Q
 
E
A
 
Y
V
 
V
V
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
R
 
Q
V
 
A
H
 
S
V
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
S
M
 
V
H
 
R
D
 
E
A
 
P
S
 
A
H
 
R
D
 
D
P
 
A
L
 
-
A
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
K
A
x
T
N
 
N
G
 
I
A
 
I
G
 
G
T
 
S
L
 
L
R
 
V
L
 
L
A
 
L
E
 
E
Q
 
K
A
 
S
A
 
I
Q
 
K
A
 
Y
G
 
G
I
 
V
G
 
K
H
 
K
L
 
F
V
 
I
F
 
F
L
x
S
S
|
S
S
x
T
-
 
G
-
x
G
-
x
A
I
 
I
K
 
Y
A
 
G
N
 
E
G
 
N
E
 
V
E
 
K
T
 
V
T
 
F
H
 
P
T
 
T
P
 
P
F
 
E
G
 
T
P
 
E
L
 
I
N
 
-
A
 
P
A
 
H
P
 
P
V
 
I
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
A
K
|
K
L
 
Y
E
 
S
A
 
T
E
 
E
Q
 
M
G
 
Y
L
 
L
A
 
E
E
 
F
I
 
F
A
 
A
A
 
R
R
 
E
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
K
V
 
Y
T
 
T
V
 
V
L
 
L
R
 
R
P
x
Y
P
 
A
L
x
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
-
 
R
-
 
Q
-
 
D
-
 
P
-
x
Y
G
 
G
V
 
E
K
 
A
G
|
G
N
x
V
F
 
V
R
 
A
A
 
I
L
 
F
I
 
T
R
 
E
L
 
R
V
 
M
N
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
E
P
 
E
L
 
V
P
x
H
L
 
I
G
x
F
C
 
G
C
 
D
T
 
G
H
 
E
N
x
Y
R
 
V
R
|
R
S
 
D
L
 
Y
I
 
V
G
 
Y
L
 
V
G
 
D
N
 
D
L
 
V
V
 
V
D
 
R
A
 
A
I
 
N
R
 
L
A
 
L
V
 
A
L
 
M
D
 
E
Q
 
K
P
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
G
Q
 
D
C
 
N
R
 
E
V
 
V
F
 
F
T
 
N
L
 
I
C
 
G
D
 
T
A
 
G
E
 
R
A
 
G
P
 
T
S
 
T
T
x
V
A
 
N
D
 
Q
L
 
L
V
 
F
R
 
K
S
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
E
A
 
I
L
 
T
G
 
G
R
 
Y
P
 
D
A
 
K
R
 
E
L
 
P
L
 
V
P
 
Y
I
 
K
P
 
P
V
 
P
G
x
R
L
 
K
M
 
G
R
x
D
L
 
V
G
 
R
A
 
K
G
 
S
L
 
I
L
 
L
G
 
D
K
 
Y
G
 
T
A
 
K
A
 
A
I
 
K
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
T
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
G
W
 
W
V
 
E
P
 
P
P
 
K
E
 
V
T
 
S
L
 
L
D
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
K
A
 
L
T
 
T
A
 
V
R
 
E
W
 
Y
W
 
F
R
 
R
N
 
K

5u4qB 1.5 angstrom resolution crystal structure of NAD-dependent epimerase from klebsiella pneumoniae in complex with NAD.
25% identity, 99% coverage: 1:315/318 of query aligns to 2:301/304 of 5u4qB

query
sites
5u4qB
M
 
M
R
 
K
V
 
F
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
N
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
Q
 
F
P
 
H
L
 
I
C
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
L
E
 
N
L
 
E
G
 
G
H
 
H
H
 
N
V
 
V
A
 
V
G
 
G
A
 
I
V
x
D
R
x
N
G
 
M
Q
x
N
P
 
D
Y
 
Y
L
x
Y
P
 
D
D
 
V
C
 
S
V
 
L
E
x
K
R
 
Q
R
 
A
P
 
R
A
 
L
G
 
D
R
 
R
L
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
A
-
 
F
-
 
H
-
 
F
-
 
Q
-
 
Q
-
 
L
-
x
D
V
x
L
A
 
A
D
 
D
G
 
R
N
 
E
W
 
G
S
 
M
A
 
A
A
 
K
L
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
T
E
 
E
G
 
Q
M
 
F
Q
 
D
A
 
R
V
 
V
V
 
I
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
R
 
Q
V
 
A
H
 
G
V
 
V
M
 
R
H
 
L
D
 
E
A
 
-
S
 
-
H
 
-
D
 
N
P
 
P
L
 
Y
A
 
A
E
 
-
F
 
Y
R
 
A
A
 
D
A
 
A
N
 
N
G
 
L
A
 
M
G
 
G
T
 
Y
L
 
L
R
 
N
L
 
I
A
 
L
E
 
E
Q
 
G
A
 
C
A
 
R
Q
 
H
A
 
T
G
 
K
I
 
V
G
 
K
H
 
H
L
 
L
V
 
V
F
 
Y
L
x
A
S
 
S
S
 
S
I
 
S
K
 
S
A
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
L
E
 
N
T
 
R
T
 
K
H
 
-
T
 
M
P
 
P
F
 
F
G
 
S
P
 
T
L
 
E
N
 
D
A
 
S
A
 
V
-
 
D
-
 
H
P
 
P
V
 
V
D
 
S
P
 
L
Y
|
Y
G
 
A
I
 
A
S
 
T
K
|
K
L
 
K
E
 
A
A
 
N
E
 
E
Q
 
L
G
 
M
L
 
A
A
 
H
E
 
T
I
 
Y
A
 
S
A
 
H
R
 
L
T
 
Y
G
 
G
L
 
I
A
 
P
V
 
T
T
 
T
V
 
G
L
 
L
R
 
R
P
x
F
P
 
F
L
 
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
W
V
 
G
K
x
R
G
 
P
N
 
D
F
x
M
R
 
-
A
 
A
L
 
L
I
 
F
R
 
K
L
 
F
V
 
T
N
 
K
R
 
A
G
 
M
L
 
L
P
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
C
 
-
C
 
-
T
 
-
H
 
-
N
 
E
R
 
G
R
 
R
S
 
D
L
 
F
I
 
T
G
 
Y
L
 
I
G
 
D
N
 
D
L
 
I
V
 
V
D
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
V
A
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Q
 
V
P
 
I
P
 
P
H
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
Q
C
 
A
R
 
N
V
 
A
F
 
D
T
 
W
L
 
T
C
 
V
D
 
E
A
 
S
E
 
G
A
 
S
P
 
P
S
 
A
T
 
T
A
 
S
D
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
S
R
 
A
P
 
P
A
 
Y
R
 
R
L
 
V
L
 
Y
P
 
N
I
 
I
-
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
E
L
 
L
M
 
M
R
 
D
L
 
Y
G
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
I
A
 
T
A
 
A
I
 
L
Q
 
E
R
 
E
L
 
A
T
 
L
A
 
G
S
 
M
L
 
T
E
 
S
V
 
A
D
 
D
G
 
T
S
 
Q
A
 
P
L
 
L
A
 
Y
A
 
D
A
 
L
I
 
V
G
 
G
W
 
F
V
 
K
P
 
P
P
 
Q
E
 
T
T
 
S
L
 
V
D
 
K
E
 
D
G
 
G
L
 
V
T
 
K
A
 
N
T
 
F
A
 
V
R
 
D
W
 
W
W
 
Y
R
 
K
N
 
D

3aw9A Structure of udp-galactose 4-epimerase mutant
27% identity, 98% coverage: 1:311/318 of query aligns to 1:298/304 of 3aw9A

query
sites
3aw9A
M
 
M
R
 
R
V
 
I
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
N
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
Q
 
S
P
 
H
L
 
L
C
 
V
R
 
D
R
 
K
L
 
L
A
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
 
Y
H
 
E
V
 
V
A
 
V
G
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
-
Y
 
-
L
 
V
P
 
V
D
|
D
C
x
I
V
 
V
E
 
Q
R
 
R
R
 
D
P
 
T
A
 
G
G
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
H
-
 
V
R
|
R
L
x
D
V
x
L
A
 
K
D
 
D
G
 
Y
N
 
S
W
 
W
S
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
I
E
 
K
G
 
G
M
 
-
Q
 
D
A
 
V
V
 
V
V
 
F
H
 
H
L
x
F
A
|
A
A
|
A
R
 
N
V
x
P
H
 
E
V
|
V
M
 
R
H
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
T
H
 
T
D
 
E
P
 
P
L
 
I
A
 
V
E
 
H
F
 
F
R
 
N
A
 
-
A
x
E
N
 
N
G
 
V
A
 
V
G
 
A
T
 
T
L
 
F
R
 
N
L
 
V
A
 
L
E
 
E
Q
 
W
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
A
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
R
H
 
T
L
 
V
V
 
V
F
 
F
L
x
A
S
|
S
S
|
S
I
x
S
K
x
T
A
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
D
E
 
A
T
 
D
T
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
T
-
 
P
-
 
E
H
 
E
T
 
E
P
 
P
F
 
Y
G
 
K
P
 
P
L
 
I
N
 
S
A
 
V
A
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
P
 
-
Y
|
Y
G
 
G
I
 
A
S
 
A
K
|
K
L
 
A
E
 
A
A
 
G
E
 
E
Q
 
V
G
 
M
L
 
C
A
 
A
E
 
T
I
 
Y
A
 
A
A
 
R
R
 
L
T
 
F
G
 
G
L
 
V
A
 
R
V
 
C
T
 
L
V
 
A
L
 
V
R
 
R
P
x
Y
P
 
A
L
x
N
V
|
V
Y
 
V
G
 
G
P
 
P
-
 
R
-
x
L
-
 
R
-
x
H
G
|
G
V
|
V
K
 
I
G
 
Y
N
x
D
F
 
F
R
 
I
A
 
M
L
 
K
I
 
L
R
 
R
L
 
R
V
 
-
N
 
N
R
 
P
G
 
N
L
 
V
P
 
L
L
 
E
P
 
V
L
|
L
G
 
G
C
 
D
C
 
G
T
 
T
H
x
Q
N
 
-
R
 
R
R
x
K
S
 
S
L
x
Y
I
 
L
G
 
Y
L
 
V
G
 
R
N
 
D
L
 
A
V
 
V
D
 
E
A
 
A
I
 
T
R
 
L
A
 
A
V
 
A
L
 
W
D
 
K
Q
 
K
-
 
F
P
 
E
P
 
E
H
 
M
P
 
D
G
 
A
Q
 
P
C
 
F
R
 
L
V
 
A
F
 
L
T
 
N
L
 
V
C
 
G
D
 
N
A
 
V
E
 
D
A
 
A
P
 
V
S
 
R
T
x
V
A
 
L
D
 
D
L
 
I
V
 
A
R
 
Q
S
 
I
L
 
V
A
 
A
R
 
E
A
 
V
L
 
L
G
 
G
-
 
L
R
 
R
P
 
P
A
 
E
-
 
I
R
 
R
L
 
L
L
 
V
P
 
P
-
 
S
I
 
T
P
 
P
V
 
D
G
 
G
L
 
-
M
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
R
G
 
G
K
x
W
G
 
P
A
 
G
A
x
D
I
 
V
Q
 
K
R
 
Y
L
 
M
T
 
T
A
 
L
S
 
A
L
 
V
E
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
T
A
 
K
L
 
L
A
 
M
A
 
K
A
 
L
I
 
T
G
 
G
W
 
W
V
 
R
P
 
P
P
 
T
E
 
M
T
 
T
L
 
S
D
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
V
T
 
K
A
 
K
T
 
T
A
 
A
R
 
E

Q9LPG6 Trifunctional UDP-glucose 4,6-dehydratase/UDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 3,5-epimerase/UDP-4-keto-L-rhamnose-reductase RHM2; NDP-rhamnose synthase; Protein MUCILAGE-MODIFIED 4; Protein RHAMNOSE BIOSYNTHESIS 2; Rhamnose biosynthetic enzyme 2; AtRHM2; UDP-L-rhamnose synthase MUM4; EC 4.2.1.76; EC 1.1.1.-; EC 5.1.3.- from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
24% identity, 98% coverage: 3:313/318 of query aligns to 11:321/667 of Q9LPG6

query
sites
Q9LPG6
V
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
A
G
|
G
F
 
F
V
 
I
G
 
A
Q
 
S
P
 
H
L
 
V
C
 
A
R
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
I
E
 
R
L
 
N
G
 
Y
H
 
P
H
 
D
V
 
Y
A
x
K
G
 
I
A
 
V
V
 
V
R
 
L
G
 
D
Q
 
K
-
 
L
P
 
D
Y
 
Y
L
 
C
P
 
S
D
 
D
C
 
L
V
 
K
E
 
N
R
 
L
R
 
D
P
 
P
A
 
S
-
 
F
-
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
N
-
 
F
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
K
G
 
G
R
 
D
L
 
I
V
 
A
A
 
S
D
 
D
G
 
D
-
 
L
-
 
V
N
 
N
W
 
Y
S
 
L
A
 
L
A
 
I
L
 
T
E
 
E
G
 
N
M
 
I
Q
 
D
A
 
T
V
 
I
V
 
M
H
 
H
L
 
F
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
V
 
T
H
 
H
V
 
V
M
 
-
H
 
-
D
|
D
A
 
N
S
 
S
H
 
F
D
 
G
P
 
N
L
 
S
A
 
F
E
 
E
F
 
F
R
 
T
A
 
K
A
 
N
N
 
N
G
 
I
A
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
H
R
 
V
L
 
L
A
 
L
E
 
E
Q
 
A
A
 
C
A
 
K
Q
 
V
A
 
T
G
 
G
-
 
Q
I
 
I
G
 
R
H
 
R
L
 
F
V
 
I
F
 
H
L
 
V
S
 
S
S
 
T
I
 
D
K
 
E
A
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
E
E
 
T
T
 
D
T
 
E
H
 
D
T
 
A
P
 
A
F
 
V
G
 
G
P
 
N
L
 
H
N
 
E
A
 
A
A
 
S
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
P
 
P
V
 
T
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
G
 
S
I
 
A
S
 
T
K
|
K
L
 
A
E
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
M
G
 
L
L
 
V
A
 
M
E
 
A
I
 
Y
A
 
G
A
 
R
R
 
S
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
P
V
 
V
T
 
I
V
 
T
L
 
T
R
 
R
P
 
G
P
 
N
L
 
N
V
 
V
Y
 
Y
G
|
G
P
 
P
G
 
N
V
 
Q
-
 
F
-
 
P
K
 
E
G
 
K
N
 
M
F
 
I
R
 
P
A
 
K
L
 
F
I
 
I
R
 
L
L
 
L
V
 
A
N
 
M
R
 
S
G
 
G
L
 
K
P
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
I
G
 
H
C
 
G
C
 
D
T
 
G
H
 
S
N
 
N
R
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
Y
I
 
L
G
 
Y
L
 
C
G
 
E
N
 
D
L
 
V
V
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
F
R
 
E
A
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
-
Q
 
-
P
 
-
P
 
-
H
 
H
P
 
K
G
 
G
Q
 
E
C
 
I
-
 
G
R
 
H
V
 
V
F
 
Y
T
 
N
L
 
V
C
 
G
D
 
T
A
 
K
E
 
R
A
 
E
P
 
R
S
 
R
T
 
V
A
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
A
R
 
R
S
 
D
L
 
I
A
 
C
R
 
K
A
 
L
L
 
F
G
 
G
R
 
K
P
 
D
A
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
P
V
 
E
G
 
S
L
 
S
M
 
I
R
 
Q
L
 
F
G
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
V
L
 
E
G
 
N
K
 
R
G
 
P
A
 
F
A
 
N
I
 
D
Q
 
Q
R
 
R
L
 
Y
T
 
F
A
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
L
D
 
D
G
 
D
S
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
-
A
 
K
A
 
K
I
 
L
G
 
G
W
 
W
V
 
Q
P
 
E
P
 
R
E
 
T
T
 
N
L
 
W
D
 
E
E
 
D
G
 
G
L
 
L
T
 
K
A
 
K
T
 
T
A
 
M
R
 
D
W
 
W
W
 
Y

Sites not aligning to the query:

6kv9A Moee5 in complex with udp-glucuronic acid and NAD (see paper)
34% identity, 66% coverage: 3:212/318 of query aligns to 3:211/299 of 6kv9A

query
sites
6kv9A
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
N
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
Q
 
S
P
 
H
L
 
L
C
 
V
R
 
T
R
 
E
L
 
L
A
 
R
E
 
N
L
 
S
G
 
G
H
 
R
H
 
N
V
 
V
A
 
V
G
 
-
A
 
A
V
 
V
R
x
D
G
x
R
Q
x
R
P
 
P
Y
 
-
L
 
L
P
 
P
D
 
D
C
 
T
V
 
G
E
 
S
R
 
L
R
 
R
P
 
E
A
 
I
G
 
R
R
 
G
L
x
D
V
x
L
A
 
N
D
 
S
G
 
L
N
 
N
W
 
L
S
 
V
A
 
D
A
 
C
L
 
L
E
 
K
G
 
N
M
 
I
Q
 
S
A
 
T
V
 
V
V
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
R
 
L
V
x
P
H
 
G
V
 
V
M
x
R
H
 
P
D
 
S
A
 
W
S
 
T
H
 
Q
D
 
F
P
 
P
L
 
-
A
 
-
E
 
E
F
 
Y
R
 
L
A
 
R
A
x
C
N
 
N
G
 
V
A
 
L
G
 
A
T
 
T
L
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
A
A
 
C
A
 
V
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
E
H
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
V
L
x
A
S
|
S
S
|
S
I
x
S
K
x
S
A
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
G
E
 
A
T
 
D
T
 
G
H
 
V
T
 
M
P
 
S
F
 
E
G
 
D
P
 
D
L
 
L
N
 
-
A
 
P
A
 
R
P
 
P
V
 
L
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
L
 
L
E
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
G
 
L
L
 
A
A
 
L
E
 
A
I
 
F
A
 
A
A
 
A
R
 
R
-
 
G
-
 
D
T
 
A
G
 
E
L
 
L
A
 
S
V
 
V
T
 
G
V
 
A
L
 
L
R
 
R
P
x
F
P
 
F
L
x
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
Q
K
x
R
G
 
P
N
 
D
F
x
M
-
x
F
-
 
I
R
 
S
A
x
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
L
 
A
V
 
T
N
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
E
P
 
P
L
 
V
P
x
E
L
x
I
G
x
Y
C
 
G
C
 
D
T
 
G
H
 
T
N
x
Q
R
 
L
R
|
R
S
 
D
L
 
F
I
 
T
G
 
H
L
 
V
G
 
S
N
 
D
L
 
V
V
 
V
D
 
R
A
 
A
I
 
L

Sites not aligning to the query:

7ys9A Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) in complex with both udp-glucose and udp-galactose in chaina from mycobacterium tuberculosis
34% identity, 54% coverage: 1:171/318 of query aligns to 1:179/310 of 7ys9A

query
sites
7ys9A
M
 
M
R
 
R
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
N
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
Q
 
S
P
 
T
L
 
L
C
 
V
R
 
D
R
 
R
L
 
L
A
 
L
E
 
A
L
 
D
G
 
G
H
 
H
H
 
S
V
 
V
-
 
V
-
 
G
-
 
L
-
x
D
-
x
N
-
 
F
-
x
A
A
x
T
G
|
G
A
 
R
V
 
A
R
 
T
G
 
N
Q
 
L
P
 
E
Y
 
H
L
 
L
P
 
A
D
 
D
C
 
N
V
 
S
E
 
A
R
 
H
R
 
V
P
 
F
A
 
V
G
 
E
R
 
A
L
x
D
V
x
I
A
 
V
D
 
T
G
 
A
N
 
D
W
 
L
S
 
H
A
 
A
A
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
Q
M
 
H
-
 
R
-
 
P
Q
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
R
 
Q
V
x
I
H
 
D
V
 
V
M
x
R
H
 
R
D
 
S
A
 
V
S
 
A
H
 
-
D
 
D
P
 
P
L
 
-
A
 
-
E
 
Q
F
 
F
R
 
D
A
 
A
A
 
A
-
 
V
N
 
N
G
 
V
A
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
A
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
R
H
 
K
L
 
I
V
 
V
F
 
H
L
x
T
S
 
S
S
|
S
I
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
G
E
x
G
E
 
S
T
 
I
T
 
Y
H
 
G
T
 
T
P
 
P
-
 
P
-
 
E
F
 
Y
G
 
P
P
 
T
L
 
P
N
 
E
A
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
T
D
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
A
I
 
A
S
 
G
K
|
K
L
 
V
E
 
A
A
 
G
E
 
E
Q
 
I
G
 
Y
L
 
L
A
 
N
E
 
T
I
 
F
A
 
R
A
 
H
R
 
L
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
D
V
 
C
T
 
S
V
 
H
L
 
I
R
 
A
P
|
P
P
x
A
L
x
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7ysmA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) co-crystallized with udp-n-acetylglucosamine from mycobacterium tuberculosis
34% identity, 54% coverage: 1:171/318 of query aligns to 1:179/311 of 7ysmA

query
sites
7ysmA
M
 
M
R
 
R
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
N
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
Q
 
S
P
 
T
L
 
L
C
 
V
R
 
D
R
 
R
L
 
L
A
 
L
E
 
A
L
 
D
G
 
G
H
 
H
H
 
S
V
 
V
-
 
V
-
 
G
-
 
L
-
x
D
-
x
N
-
 
F
-
 
A
A
x
T
G
|
G
A
 
R
V
 
A
R
 
T
G
 
N
Q
 
L
P
 
E
Y
 
H
L
 
L
P
 
A
D
 
D
C
 
N
V
 
S
E
 
A
R
 
H
R
 
V
P
 
F
A
 
V
G
 
E
R
 
A
L
x
D
V
x
I
A
 
V
D
 
T
G
 
A
N
 
D
W
 
L
S
 
H
A
 
A
A
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
Q
M
 
H
-
 
R
-
 
P
Q
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
R
 
Q
V
x
I
H
 
D
V
 
V
M
x
R
H
 
R
D
 
S
A
 
V
S
 
A
H
 
-
D
 
D
P
 
P
L
 
-
A
 
-
E
 
Q
F
 
F
R
 
D
A
 
A
A
 
A
-
 
V
N
 
N
G
 
V
A
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
A
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
R
H
 
K
L
 
I
V
 
V
F
 
H
L
x
T
S
 
S
S
|
S
I
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
G
E
x
G
E
x
S
T
 
I
T
 
Y
H
 
G
T
 
T
P
 
P
-
 
P
-
 
E
F
 
Y
G
 
P
P
 
T
L
 
P
N
 
E
A
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
T
D
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
A
I
 
A
S
 
G
K
|
K
L
 
V
E
 
A
A
 
G
E
 
E
Q
 
I
G
 
Y
L
 
L
A
 
N
E
 
T
I
 
F
A
 
R
A
 
H
R
 
L
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
D
V
 
C
T
 
S
V
 
H
L
 
I
R
 
A
P
|
P
P
x
A
L
x
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7ystA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) in complex with both udp-glucose and udp-galactose in chain b from mycobacterium tuberculosis
34% identity, 54% coverage: 1:171/318 of query aligns to 1:179/312 of 7ystA

query
sites
7ystA
M
 
M
R
 
R
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
N
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
Q
 
S
P
 
T
L
 
L
C
 
V
R
 
D
R
 
R
L
 
L
A
 
L
E
 
A
L
 
D
G
 
G
H
 
H
H
 
S
V
 
V
-
 
V
-
 
G
-
 
L
-
x
D
-
x
N
-
 
F
-
 
A
A
x
T
G
|
G
A
 
R
V
 
A
R
 
T
G
 
N
Q
 
L
P
 
E
Y
 
H
L
 
L
P
 
A
D
 
D
C
 
N
V
 
S
E
 
A
R
 
H
R
 
V
P
 
F
A
 
V
G
 
E
R
 
A
L
x
D
V
x
I
A
 
V
D
 
T
G
 
A
N
 
D
W
 
L
S
 
H
A
 
A
A
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
Q
M
 
H
-
 
R
-
 
P
Q
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
R
 
Q
V
x
I
H
 
D
V
 
V
M
x
R
H
 
R
D
 
S
A
 
V
S
 
A
H
 
-
D
 
D
P
 
P
L
 
-
A
 
-
E
 
Q
F
 
F
R
 
D
A
 
A
A
 
A
-
x
V
N
 
N
G
 
V
A
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
A
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
R
H
 
K
L
 
I
V
 
V
F
 
H
L
x
T
S
 
S
S
|
S
I
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
G
E
x
G
E
 
S
T
 
I
T
 
Y
H
 
G
T
 
T
P
 
P
-
 
P
-
 
E
F
 
Y
G
 
P
P
 
T
L
 
P
N
 
E
A
 
T
A
 
A
P
 
P
V
 
T
D
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
A
I
 
A
S
 
G
K
|
K
L
 
V
E
 
A
A
 
G
E
 
E
Q
 
I
G
 
Y
L
 
L
A
 
N
E
 
T
I
 
F
A
 
R
A
 
H
R
 
L
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
D
V
 
C
T
 
S
V
 
H
L
 
I
R
 
A
P
|
P
P
x
A
L
x
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q9SYM5 Trifunctional UDP-glucose 4,6-dehydratase/UDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 3,5-epimerase/UDP-4-keto-L-rhamnose-reductase RHM1; Protein REPRESSOR OF LRX1 1; Rhamnose biosynthetic enzyme 1; AtRHM1; EC 4.2.1.76; EC 1.1.1.-; EC 5.1.3.- from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 3 papers)
25% identity, 98% coverage: 2:313/318 of query aligns to 8:319/669 of Q9SYM5

query
sites
Q9SYM5
R
 
N
V
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
I
G
 
A
Q
 
S
P
 
H
L
 
V
C
 
A
R
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
I
E
 
R
L
 
S
G
 
Y
H
 
P
H
 
D
V
 
Y
A
 
K
G
 
I
A
 
V
V
 
V
R
 
L
G
 
D
Q
 
K
P
 
-
Y
 
-
L
 
L
P
 
D
D
 
Y
C
 
C
V
 
S
E
 
N
R
 
L
R
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
K
-
 
H
-
 
S
P
 
P
A
 
N
G
 
F
R
 
K
L
 
F
V
 
V
A
 
K
D
 
G
G
 
D
N
 
I
W
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
D
L
 
L
-
 
V
-
 
N
-
 
H
-
 
L
-
 
L
-
 
I
-
 
T
E
 
E
G
 
G
M
 
I
Q
 
D
A
 
T
V
 
I
V
 
M
H
 
H
L
 
F
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
V
 
T
H
 
H
V
 
V
M
 
-
H
 
-
D
 
D
A
 
N
S
 
S
H
 
F
D
 
G
P
 
N
L
 
S
A
 
F
E
 
E
F
 
F
R
 
T
A
 
K
A
 
N
N
 
N
G
 
I
A
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
H
R
 
V
L
 
L
A
 
L
E
 
E
Q
 
A
A
 
C
A
 
K
Q
 
V
A
 
T
G
 
G
-
 
Q
I
 
I
G
 
R
H
 
R
L
 
F
V
 
I
F
 
H
L
 
V
S
 
S
S
 
T
I
 
D
K
 
E
A
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
E
E
 
T
T
 
D
T
 
E
H
 
D
T
 
A
P
 
L
F
 
V
G
 
G
P
 
N
L
 
H
N
 
E
A
 
A
A
 
S
-
 
Q
-
 
L
-
 
L
P
 
P
V
 
T
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
G
 
S
I
 
A
S
 
T
K
 
K
L
 
A
E
 
G
A
 
A
E
 
E
Q
 
M
G
 
L
L
 
V
A
 
M
E
 
A
I
 
Y
A
 
G
A
 
R
R
 
S
T
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
P
V
 
V
T
 
I
V
 
T
L
 
T
R
 
R
P
 
G
P
 
N
L
 
N
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
N
V
 
Q
-
 
F
-
 
P
K
 
E
G
 
K
N
 
L
F
 
I
R
 
P
A
 
K
L
 
F
I
 
I
R
 
L
L
 
L
V
 
A
N
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
Q
P
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
I
G
 
H
C
 
G
C
 
D
T
 
G
H
 
S
N
 
N
R
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
Y
I
 
L
G
 
Y
L
 
C
G
 
E
N
 
D
L
 
V
V
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
F
R
 
E
A
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
-
Q
 
-
P
 
-
P
 
-
H
 
H
P
 
K
G
 
G
Q
 
E
C
 
V
-
 
G
R
 
H
V
 
V
F
 
Y
T
 
N
L
 
I
C
 
G
D
 
T
A
 
K
E
 
K
A
 
E
P
 
R
S
 
R
T
 
V
A
 
N
D
 
D
L
 
V
V
 
A
R
 
K
S
 
D
L
 
I
A
 
C
R
 
K
A
 
L
L
 
F
G
 
N
R
 
M
P
 
D
A
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
P
V
 
E
G
 
A
L
 
N
M
 
I
R
 
K
L
 
F
G
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
V
L
 
D
G
 
N
K
x
R
G
 
P
A
 
F
A
 
N
I
 
D
Q
 
Q
R
 
R
L
 
Y
T
 
F
A
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
L
D
 
D
G
 
D
S
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
-
A
 
K
A
 
K
I
 
L
G
 
G
W
 
W
V
 
S
P
 
E
P
 
R
E
 
T
T
 
T
L
 
W
D
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
K
A
 
K
T
 
T
A
 
M
R
 
D
W
 
W
W
 
Y

6kvcA Moee5 in complex with udp-glucose and NAD (see paper)
34% identity, 66% coverage: 3:212/318 of query aligns to 3:210/299 of 6kvcA

query
sites
6kvcA
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
N
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
Q
 
S
P
 
H
L
 
L
C
 
V
R
 
T
R
 
E
L
 
L
A
 
R
E
 
N
L
 
S
G
 
G
H
 
R
H
 
N
V
 
V
A
 
V
G
 
-
A
 
A
V
 
V
R
x
D
G
x
R
Q
x
R
P
 
P
Y
 
-
L
 
L
P
 
P
D
 
T
C
 
G
V
 
S
E
 
L
R
 
R
R
 
E
P
 
I
A
 
R
G
 
G
R
x
D
L
|
L
V
 
N
A
 
S
D
 
L
G
 
-
N
 
N
W
 
L
S
 
V
A
 
D
A
 
C
L
 
L
E
 
K
G
 
N
M
 
I
Q
 
S
A
 
T
V
 
V
V
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
R
 
L
V
x
P
H
 
G
V
 
V
M
x
R
H
 
P
D
 
S
A
 
W
S
 
T
H
 
Q
D
 
F
P
 
P
L
 
-
A
 
-
E
 
E
F
 
Y
R
 
L
A
 
R
A
 
C
N
 
N
G
 
V
A
 
L
G
 
A
T
 
T
L
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
A
A
 
C
A
 
V
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
E
H
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
V
L
x
A
S
 
S
S
|
S
I
x
S
K
x
S
A
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
G
E
 
A
T
 
D
T
 
G
H
 
V
T
 
M
P
 
S
F
 
E
G
 
D
P
 
D
L
 
L
N
 
-
A
 
P
A
 
R
P
 
P
V
 
L
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
G
I
 
V
S
 
T
K
|
K
L
 
L
E
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
R
G
 
L
L
 
A
A
 
L
E
 
A
I
 
F
A
 
A
A
 
A
R
 
R
-
 
G
-
 
D
T
 
A
G
 
E
L
 
L
A
 
S
V
 
V
T
 
G
V
 
A
L
 
L
R
 
R
P
x
F
P
 
F
L
x
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
Q
K
x
R
G
 
P
N
 
D
F
x
M
-
x
F
-
 
I
R
 
S
A
x
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
L
 
A
V
 
T
N
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
E
P
 
P
L
 
V
P
x
E
L
x
I
G
x
Y
C
 
G
C
 
D
T
 
G
H
 
T
N
x
Q
R
 
L
R
|
R
S
 
D
L
 
F
I
 
T
G
 
H
L
 
V
G
 
S
N
 
D
L
 
V
V
 
V
D
 
R
A
 
A
I
 
L

Sites not aligning to the query:

6wjaA Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-galnac (see paper)
28% identity, 69% coverage: 2:219/318 of query aligns to 2:230/307 of 6wjaA

query
sites
6wjaA
R
 
R
V
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
N
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
Q
 
S
P
 
H
L
 
L
C
 
V
R
 
D
R
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
A
L
 
K
G
 
G
H
 
Y
H
 
A
V
 
V
-
 
R
-
 
V
-
 
L
-
x
D
-
x
D
-
 
L
-
x
S
A
x
T
G
|
G
A
 
K
V
 
V
R
 
G
G
 
N
Q
 
L
P
 
P
Y
 
-
L
 
M
P
 
G
D
 
D
C
 
A
V
 
G
E
 
L
R
 
E
R
 
L
P
 
L
A
 
V
G
 
G
R
 
D
L
x
A
V
 
A
A
 
D
D
 
A
G
 
A
N
 
L
W
 
L
S
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
V
E
 
Q
G
 
G
M
 
C
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
R
 
-
V
 
V
H
 
A
V
 
S
M
x
V
H
 
Q
D
 
A
A
 
S
S
 
V
H
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
H
R
 
Q
A
x
S
A
 
-
N
 
N
G
 
F
A
 
I
G
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
C
E
 
E
Q
 
A
A
 
M
A
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
R
H
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
A
S
 
S
S
x
A
I
x
A
K
x
A
A
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
N
E
 
N
T
 
G
T
 
E
H
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
I
G
 
A
P
 
E
L
 
D
N
 
T
-
 
P
A
 
K
A
 
S
P
 
P
V
 
L
D
 
T
P
 
P
Y
x
F
G
 
A
I
 
A
S
 
D
K
|
K
L
 
L
E
 
A
A
 
S
E
 
E
Q
 
Y
G
 
Y
L
 
L
A
 
D
E
 
F
I
 
Y
A
 
R
A
 
R
R
 
Q
T
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
E
V
 
P
T
 
V
V
 
I
L
 
L
R
 
R
P
x
F
P
x
F
L
x
N
V
x
I
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
R
V
 
Q
K
 
D
G
 
P
N
 
S
-
 
S
-
 
P
F
 
Y
R
 
S
A
x
G
L
x
V
I
 
I
R
 
S
L
 
I
V
x
F
N
 
S
R
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
A
G
 
G
L
 
R
P
 
P
L
 
I
P
x
T
L
 
L
G
x
F
C
 
G
C
 
D
T
 
G
H
 
G
N
 
Q
R
 
T
R
|
R
S
 
D
L
 
F
I
 
V
G
 
Y
L
 
V
G
 
A
N
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
K
A
 
I
I
 
L
R
 
V
A
 
Q
V
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6x3bA Structure of rmd from pseudomonas aeruginosa complexed with NADPH
28% identity, 99% coverage: 2:316/318 of query aligns to 7:299/300 of 6x3bA

query
sites
6x3bA
R
 
R
V
 
L
L
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
L
N
x
S
G
|
G
F
|
F
V
|
V
G
 
G
Q
 
K
P
 
H
L
 
L
C
 
Q
R
 
A
R
 
Y
L
 
L
A
 
A
E
 
-
L
 
-
G
 
A
H
 
A
H
 
H
V
 
T
A
 
P
G
 
W
A
 
A
V
 
L
R
 
L
G
 
P
Q
 
V
P
 
P
Y
 
H
L
 
R
P
 
Y
D
|
D
C
x
L
V
 
L
E
 
E
R
 
P
R
 
D
P
 
S
A
 
L
G
 
G
R
 
D
L
 
L
V
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
W
S
 
P
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
G
 
L
M
 
P
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
I
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
x
G
R
 
Q
V
x
T
H
 
Y
V
 
V
M
 
P
H
 
-
D
 
E
A
 
A
S
 
F
H
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
-
A
 
A
E
 
R
F
 
T
R
 
L
A
 
Q
A
 
I
N
 
N
G
 
L
A
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
L
R
 
N
L
 
L
A
 
L
E
 
Q
Q
 
A
A
 
L
A
 
K
Q
 
A
A
 
R
G
 
G
I
 
F
-
 
S
G
 
G
H
 
T
L
 
F
V
 
L
F
 
Y
L
 
I
S
 
S
S
|
S
I
x
G
K
x
D
A
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
Q
-
 
V
-
 
A
E
 
E
T
 
A
T
 
A
H
 
L
T
 
P
P
 
I
F
 
H
G
 
E
P
 
E
L
 
L
N
 
I
A
 
P
A
 
H
P
 
P
V
 
R
D
 
N
P
 
P
Y
|
Y
G
 
A
I
 
V
S
 
S
K
|
K
L
 
L
E
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
S
G
 
L
L
 
C
A
 
L
E
 
Q
I
 
W
A
 
G
A
 
I
R
 
T
T
 
E
G
 
G
L
 
W
A
 
R
V
 
V
T
 
L
V
 
V
L
 
A
R
 
R
P
 
P
P
 
F
L
 
N
V
x
H
Y
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
x
Q
K
 
K
G
 
D
N
 
S
F
 
F
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
A
R
 
R
A
 
Q
L
 
I
I
 
A
R
 
R
L
 
M
V
 
-
N
 
K
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
R
L
 
L
P
 
E
L
 
V
G
 
G
C
 
D
C
 
I
T
 
D
H
 
V
N
 
S
R
 
R
R
 
D
S
 
F
L
 
L
I
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
D
L
 
V
V
 
Q
D
 
D
A
 
V
I
 
L
R
 
S
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
D
 
R
Q
 
L
P
 
L
P
 
S
H
 
H
P
 
G
G
 
E
Q
 
A
C
 
G
R
 
A
V
 
V
F
 
Y
T
 
N
L
 
V
C
 
C
D
 
S
A
 
G
E
 
Q
A
 
E
P
 
Q
S
 
K
T
 
I
A
 
R
D
 
E
L
 
L
V
 
I
R
 
E
S
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
D
L
 
I
M
 
A
R
 
Q
L
 
V
G
 
E
A
 
L
G
 
E
L
 
I
L
 
V
G
 
Q
K
 
D
G
 
R
A
 
R
A
 
A
I
 
E
Q
 
Q
R
 
R
L
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
R
V
 
V
D
 
R
G
 
G
S
 
S
A
 
H
-
 
A
-
 
R
L
 
L
A
 
H
A
 
D
A
 
A
I
 
T
G
 
G
W
 
W
V
 
K
P
 
P
P
 
E
E
 
I
T
 
T
L
 
I
D
 
K
E
 
Q
G
 
S
L
 
L
T
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
L
R
 
S
W
 
D
W
 
W
R
 
E
N
 
S
K
 
R

6wj9B Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-glcnac (see paper)
28% identity, 69% coverage: 2:219/318 of query aligns to 3:231/308 of 6wj9B

query
sites
6wj9B
R
 
R
V
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
N
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
Q
 
S
P
 
H
L
 
L
C
 
V
R
 
D
R
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
A
L
 
K
G
 
G
H
 
Y
H
 
A
V
 
V
-
 
R
-
 
V
-
 
L
-
x
D
-
x
D
-
 
L
-
x
S
A
x
T
G
|
G
A
 
K
V
 
V
R
 
G
G
 
N
Q
 
L
P
 
P
Y
 
-
L
 
M
P
 
G
D
 
D
C
 
A
V
 
G
E
 
L
R
 
E
R
 
L
P
 
L
A
 
V
G
 
G
R
x
D
L
x
A
V
 
A
A
 
D
D
 
A
G
 
A
N
 
L
W
 
L
S
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
V
E
 
Q
G
 
G
M
 
C
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
R
 
-
V
 
V
H
 
A
V
 
S
M
x
V
H
 
Q
D
 
A
A
 
S
S
 
V
H
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
H
R
 
Q
A
x
S
A
 
-
N
 
N
G
 
F
A
 
I
G
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
C
E
 
E
Q
 
A
A
 
M
A
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
R
H
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
F
L
x
A
S
 
S
S
x
A
I
x
A
K
x
A
A
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
N
E
 
N
T
 
G
T
 
E
H
 
G
T
 
T
P
 
P
F
 
I
G
 
A
P
 
E
L
 
D
N
 
T
-
 
P
A
 
K
A
 
S
P
 
P
V
 
L
D
 
T
P
 
P
Y
x
F
G
 
A
I
 
A
S
 
D
K
|
K
L
 
L
E
 
A
A
 
S
E
 
E
Q
 
Y
G
 
Y
L
 
L
A
 
D
E
 
F
I
 
Y
A
 
R
A
 
R
R
 
Q
T
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
E
V
 
P
T
 
V
V
 
I
L
 
L
R
 
R
P
x
F
P
x
F
L
x
N
V
x
I
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
R
V
 
Q
K
 
D
G
 
P
N
 
S
-
 
S
-
 
P
F
 
Y
R
 
S
A
x
G
L
x
V
I
 
I
R
 
S
L
 
I
V
x
F
N
 
S
R
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
A
G
 
G
L
 
R
P
 
P
L
 
I
P
x
T
L
|
L
G
x
F
C
 
G
C
 
D
T
 
G
H
 
G
N
 
Q
R
 
T
R
|
R
S
 
D
L
 
F
I
 
V
G
 
Y
L
 
V
G
 
A
N
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
K
A
 
I
I
 
L
R
 
V
A
 
Q
V
 
G
L
 
L
D
 
E
Q
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6x3bB Structure of rmd from pseudomonas aeruginosa complexed with NADPH
28% identity, 99% coverage: 2:316/318 of query aligns to 3:296/297 of 6x3bB

query
sites
6x3bB
R
 
R
V
 
L
L
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
L
N
x
S
G
|
G
F
|
F
V
|
V
G
 
G
Q
 
K
P
 
H
L
 
L
C
 
Q
R
 
A
R
 
Y
L
 
L
A
 
A
E
 
-
L
 
-
G
 
A
H
 
A
H
 
H
V
 
T
A
 
P
G
 
W
A
 
A
V
 
L
R
 
L
G
 
P
Q
 
V
P
 
P
Y
 
H
L
 
R
P
 
Y
D
|
D
C
x
L
V
 
L
E
 
E
R
 
P
R
 
D
P
 
S
A
 
L
G
 
G
R
 
D
L
 
L
V
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
W
S
 
P
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
G
 
L
M
 
P
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
I
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
x
G
R
 
Q
V
x
T
H
 
Y
V
 
V
M
 
P
H
 
-
D
 
E
A
 
A
S
 
F
H
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
-
A
 
A
E
 
R
F
 
T
R
 
L
A
 
Q
A
 
I
N
 
N
G
 
L
A
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
L
R
 
N
L
 
L
A
 
L
E
 
Q
Q
 
A
A
 
L
A
 
K
Q
 
A
A
 
R
G
 
G
I
 
F
-
 
S
G
 
G
H
 
T
L
 
F
V
 
L
F
 
Y
L
x
I
S
 
S
S
|
S
I
x
G
K
x
D
A
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
Q
-
 
V
-
 
A
E
 
E
T
 
A
T
 
A
H
 
L
T
 
P
P
 
I
F
 
H
G
 
E
P
 
E
L
 
L
N
 
I
A
 
P
A
 
H
P
 
P
V
 
R
D
 
N
P
 
P
Y
|
Y
G
 
A
I
 
V
S
 
S
K
|
K
L
 
L
E
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
S
G
 
L
L
 
C
A
 
L
E
 
Q
I
 
W
A
 
G
A
 
I
R
 
T
T
 
E
G
 
G
L
 
W
A
 
R
V
 
V
T
 
L
V
 
V
L
 
A
R
 
R
P
 
P
P
 
F
L
 
N
V
x
H
Y
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
x
Q
K
 
K
G
 
D
N
 
S
F
 
F
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
A
R
 
R
A
 
Q
L
 
I
I
 
A
R
 
R
L
 
M
V
 
-
N
 
K
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
-
 
A
-
 
N
-
 
R
L
 
L
P
 
E
L
 
V
G
 
G
C
 
D
C
 
I
T
 
D
H
 
V
N
 
S
R
|
R
R
 
D
S
 
F
L
 
L
I
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
N
 
D
L
 
V
V
 
Q
D
 
D
A
 
V
I
 
L
R
 
S
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
D
 
R
Q
 
L
P
 
L
P
 
S
H
 
H
P
 
G
G
 
E
Q
 
A
C
 
G
R
 
A
V
 
V
F
 
Y
T
 
N
L
 
V
C
 
C
D
 
S
A
 
G
E
 
Q
A
 
E
P
 
Q
S
 
K
T
 
I
A
 
R
D
 
E
L
 
L
V
 
I
R
 
E
S
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
D
V
 
I
G
 
A
L
 
Q
M
 
V
R
 
E
L
 
L
G
 
E
A
 
I
G
 
V
L
 
Q
L
 
D
G
 
M
K
 
R
G
 
R
A
 
A
A
 
E
I
 
Q
Q
 
R
R
 
R
L
 
V
T
 
R
A
 
G
S
 
S
L
 
-
E
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
H
S
 
A
A
 
R
L
 
L
A
 
H
A
 
D
A
 
A
I
 
T
G
 
G
W
 
W
V
 
K
P
 
P
P
 
E
E
 
I
T
 
T
L
 
I
D
 
K
E
 
Q
G
 
S
L
 
L
T
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
L
R
 
S
W
 
D
W
 
W
R
 
E
N
 
S
K
 
R

2q1tA Crystal structure of the bordetella bronchiseptica enzyme wbmf in complex with NAD+ and udp (see paper)
26% identity, 81% coverage: 2:259/318 of query aligns to 9:275/332 of 2q1tA

query
sites
2q1tA
R
 
N
V
 
V
L
 
M
V
 
V
T
 
V
G
|
G
A
 
G
N
 
A
G
|
G
F
|
F
V
|
V
G
 
G
Q
 
S
P
 
N
L
 
L
C
 
V
R
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
-
 
V
-
 
N
-
 
Q
-
 
V
H
 
H
H
 
V
V
 
V
A
x
D
G
x
N
A
x
L
V
 
L
R
x
S
G
 
A
Q
 
E
P
 
K
Y
 
I
-
 
N
L
 
V
P
 
P
D
 
D
C
 
H
V
 
P
E
 
A
R
 
V
R
 
R
P
 
F
A
 
S
G
 
E
R
 
T
L
x
S
V
x
I
A
 
T
D
 
D
G
 
D
N
 
A
W
 
L
S
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
D
M
 
E
Q
 
Y
A
 
D
V
 
Y
V
 
V
H
 
F
L
 
H
A
x
L
A
|
A
R
x
T
V
 
Y
H
|
H
V
 
G
M
 
N
H
 
Q
D
 
S
A
 
S
S
 
I
H
 
H
D
 
D
P
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
-
R
 
H
A
 
E
A
x
N
N
 
N
G
 
T
A
 
L
G
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
K
L
 
L
A
 
Y
E
 
E
Q
 
R
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
L
G
 
K
H
 
H
L
 
F
V
 
K
F
 
R
L
 
L
S
 
K
S
 
K
I
 
V
-
 
V
-
 
Y
K
x
S
A
 
A
N
x
A
G
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
T
T
 
D
H
 
I
T
 
V
P
 
S
F
 
L
G
 
H
P
 
N
L
 
N
N
 
D
A
 
S
A
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
P
|
P
Y
|
Y
G
 
S
I
 
M
S
 
S
K
|
K
L
 
I
E
 
F
A
 
G
E
 
E
Q
 
F
G
 
Y
L
 
S
A
 
V
E
 
Y
I
 
Y
A
 
H
A
 
K
R
 
Q
T
 
H
G
 
Q
L
 
L
A
 
P
V
 
T
T
 
V
V
 
R
L
 
A
R
 
R
P
x
F
P
x
Q
L
x
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
G
K
 
A
G
 
G
N
 
R
F
 
W
R
|
R
-
 
G
-
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
W
-
x
R
-
 
N
-
x
V
-
 
T
-
 
P
A
 
T
L
x
F
I
 
I
R
 
Y
L
 
K
V
 
A
N
 
L
R
 
K
G
 
G
L
 
M
P
 
P
L
 
L
P
|
P
L
 
L
G
x
E
C
 
N
C
 
G
T
 
G
H
 
V
N
 
A
R
 
T
R
|
R
S
 
D
L
 
F
I
 
I
G
 
F
L
 
V
G
 
E
N
 
D
L
 
V
V
 
A
D
 
N
A
 
G
I
 
L
R
 
I
A
 
A
V
 
C
L
 
A
D
 
A
Q
 
D
P
 
G
P
 
T
H
 
-
P
 
P
G
 
G
Q
 
G
C
 
-
R
 
-
V
 
V
F
 
Y
T
 
N
L
 
I
C
 
A
D
 
S
A
 
G
E
 
K
A
 
E
P
 
T
S
 
S
T
x
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
A
R
 
T
S
 
K
L
 
I
A
 
N
R
 
E
A
 
I
L
 
T
G
 
G
R
 
N
P
 
N
A
 
T
R
 
E
L
 
L
L
 
D
P
 
R
I
 
L
P
 
P

2q1sA Crystal structure of the bordetella bronchiseptica enzyme wbmf in complex with nadh (see paper)
26% identity, 81% coverage: 2:259/318 of query aligns to 9:275/336 of 2q1sA

query
sites
2q1sA
R
 
N
V
 
V
L
 
M
V
 
V
T
 
V
G
|
G
A
 
G
N
 
A
G
|
G
F
|
F
V
|
V
G
 
G
Q
 
S
P
 
N
L
 
L
C
 
V
R
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
-
 
V
-
 
N
-
 
Q
-
 
V
H
 
H
H
 
V
V
 
V
A
x
D
G
x
N
A
x
L
V
 
L
R
x
S
G
 
A
Q
 
E
P
 
K
Y
 
I
-
 
N
L
 
V
P
 
P
D
 
D
C
 
H
V
 
P
E
 
A
R
 
V
R
 
R
P
 
F
A
 
S
G
 
E
R
 
T
L
x
S
V
x
I
A
 
T
D
 
D
G
 
D
N
 
A
W
 
L
S
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
D
M
 
E
Q
 
Y
A
 
D
V
 
Y
V
 
V
H
 
F
L
 
H
A
x
L
A
|
A
R
x
T
V
 
Y
H
|
H
V
 
G
M
 
N
H
 
Q
D
 
S
A
 
S
S
 
I
H
 
H
D
 
D
P
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
-
R
 
H
A
 
E
A
x
N
N
 
N
G
 
T
A
 
L
G
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
K
L
 
L
A
 
Y
E
 
E
Q
 
R
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
L
G
 
K
H
 
H
L
 
F
V
 
K
F
 
R
L
 
L
S
 
K
S
 
K
I
 
V
-
 
V
-
 
Y
K
x
S
A
 
A
N
x
A
G
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
T
T
 
D
H
 
I
T
 
V
P
 
S
F
 
L
G
 
H
P
 
N
L
 
N
N
 
D
A
 
S
A
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
P
|
P
Y
|
Y
G
 
S
I
 
M
S
 
S
K
|
K
L
 
I
E
 
F
A
 
G
E
 
E
Q
 
F
G
 
Y
L
 
S
A
 
V
E
 
Y
I
 
Y
A
 
H
A
 
K
R
 
Q
T
 
H
G
 
Q
L
 
L
A
 
P
V
 
T
T
 
V
V
 
R
L
 
A
R
 
R
P
x
F
P
 
Q
L
 
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
G
K
 
A
G
 
G
N
 
R
F
 
W
R
|
R
-
 
G
-
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
W
-
x
R
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
P
A
 
T
L
 
F
I
 
I
R
 
Y
L
 
K
V
 
A
N
 
L
R
 
K
G
 
G
L
 
M
P
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
E
C
 
N
C
 
G
T
 
G
H
 
V
N
 
A
R
 
T
R
 
R
S
 
D
L
 
F
I
 
I
G
 
F
L
 
V
G
 
E
N
 
D
L
 
V
V
 
A
D
 
N
A
 
G
I
 
L
R
 
I
A
 
A
V
 
C
L
 
A
D
 
A
Q
 
D
P
 
G
P
 
T
H
 
-
P
 
P
G
 
G
Q
 
G
C
 
-
R
 
-
V
 
V
F
 
Y
T
 
N
L
 
I
C
 
A
D
 
S
A
 
G
E
 
K
A
 
E
P
 
T
S
 
S
T
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
A
R
 
T
S
 
K
L
 
I
A
 
N
R
 
E
A
 
I
L
 
T
G
 
G
R
 
N
P
 
N
A
 
T
R
 
E
L
 
L
L
 
D
P
 
R
I
 
L
P
 
P

2pzjA Crystal structure of the bordetella bronchiseptica enzyme wbmf in complex with NAD+ (see paper)
26% identity, 81% coverage: 2:259/318 of query aligns to 7:273/330 of 2pzjA

query
sites
2pzjA
R
 
N
V
 
V
L
 
M
V
 
V
T
 
V
G
|
G
A
 
G
N
 
A
G
|
G
F
|
F
V
|
V
G
 
G
Q
 
S
P
 
N
L
 
L
C
 
V
R
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
-
 
V
-
 
N
-
 
Q
-
 
V
H
 
H
H
 
V
V
 
V
A
x
D
G
x
N
A
x
L
V
 
L
R
x
S
G
 
A
Q
 
E
P
 
K
Y
 
I
-
 
N
L
 
V
P
 
P
D
 
D
C
 
H
V
 
P
E
 
A
R
 
V
R
 
R
P
 
F
A
 
S
G
 
E
R
 
T
L
x
S
V
x
I
A
 
T
D
 
D
G
 
D
N
 
A
W
 
L
S
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
L
E
 
Q
G
 
D
M
 
E
Q
 
Y
A
 
D
V
 
Y
V
 
V
H
 
F
L
 
H
A
x
L
A
|
A
R
x
T
V
 
Y
H
|
H
V
 
G
M
 
N
H
 
Q
D
 
S
A
 
S
S
 
I
H
 
H
D
 
D
P
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
D
F
 
-
R
 
H
A
 
E
A
x
N
N
 
N
G
 
T
A
 
L
G
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
K
L
 
L
A
 
Y
E
 
E
Q
 
R
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
L
G
 
K
H
 
H
L
 
F
V
 
K
F
 
R
L
 
L
S
 
K
S
 
K
I
 
V
-
 
V
-
 
Y
K
x
S
A
 
A
N
x
A
G
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
T
T
 
D
H
 
I
T
 
V
P
 
S
F
 
L
G
 
H
P
 
N
L
 
N
N
 
D
A
 
S
A
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
P
|
P
Y
|
Y
G
 
S
I
 
M
S
 
S
K
|
K
L
 
I
E
 
F
A
 
G
E
 
E
Q
 
F
G
 
Y
L
 
S
A
 
V
E
 
Y
I
 
Y
A
 
H
A
 
K
R
 
Q
T
 
H
G
 
Q
L
 
L
A
 
P
V
 
T
T
 
V
V
 
R
L
 
A
R
 
R
P
x
F
P
 
Q
L
x
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
G
K
 
A
G
 
G
N
 
R
F
 
W
R
|
R
-
 
G
-
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
W
-
x
R
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
P
A
 
T
L
 
F
I
 
I
R
 
Y
L
 
K
V
 
A
N
 
L
R
 
K
G
 
G
L
 
M
P
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
E
C
 
N
C
 
G
T
 
G
H
 
V
N
 
A
R
 
T
R
 
R
S
 
D
L
 
F
I
 
I
G
 
F
L
 
V
G
 
E
N
 
D
L
 
V
V
 
A
D
 
N
A
 
G
I
 
L
R
 
I
A
 
A
V
 
C
L
 
A
D
 
A
Q
 
D
P
 
G
P
 
T
H
 
-
P
 
P
G
 
G
Q
 
G
C
 
-
R
 
-
V
 
V
F
 
Y
T
 
N
L
 
I
C
 
A
D
 
S
A
 
G
E
 
K
A
 
E
P
 
T
S
 
S
T
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
A
R
 
T
S
 
K
L
 
I
A
 
N
R
 
E
A
 
I
L
 
T
G
 
G
R
 
N
P
 
N
A
 
T
R
 
E
L
 
L
L
 
D
P
 
R
I
 
L
P
 
P

7k3pA The structure of the udp-glc/glcnac 4-epimerase from the human pathogen campylobacter jejuni
28% identity, 47% coverage: 2:149/318 of query aligns to 3:158/329 of 7k3pA

query
sites
7k3pA
R
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
S
G
|
G
A
 
G
N
 
A
G
|
G
F
x
Y
V
x
I
G
 
G
Q
 
S
P
 
H
L
 
T
C
 
L
R
 
R
R
 
Q
L
 
F
A
 
L
E
 
K
L
 
T
G
 
D
H
 
H
H
 
E
V
 
I
A
 
C
-
 
V
-
 
L
-
x
D
G
x
N
A
 
L
V
x
S
R
 
K
G
|
G
Q
 
S
P
 
K
Y
 
I
-
 
A
L
 
I
P
 
E
D
 
D
C
 
L
V
 
A
E
 
A
R
 
T
R
 
R
P
 
A
A
 
F
G
 
K
R
 
F
L
 
F
-
 
E
-
 
Q
-
x
D
V
x
L
A
 
S
D
 
D
G
 
F
N
 
Q
W
 
G
S
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
R
E
 
E
G
 
K
M
 
F
Q
 
D
A
 
A
V
 
I
V
 
V
H
 
H
L
x
F
A
|
A
A
 
A
R
 
S
V
x
I
H
 
E
V
 
V
M
 
F
H
 
-
D
 
E
A
 
S
S
 
M
H
 
Q
D
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
-
E
 
K
F
 
Y
R
 
Y
A
 
M
A
x
N
N
 
N
G
 
T
A
 
V
G
 
N
T
 
T
L
 
T
R
 
N
L
 
L
A
 
I
E
 
E
Q
 
T
A
 
C
A
 
L
Q
 
Q
A
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
N
H
 
K
L
 
F
V
 
I
F
 
F
L
 
S
S
 
S
S
 
T
I
 
A
K
 
A
A
 
T
N
 
Y
G
 
G
E
 
E
E
 
P
T
 
Q
T
 
T
-
 
P
-
 
V
H
 
V
T
 
S
P
 
E
F
 
T
G
 
S
P
 
P
L
 
L
N
 
-
A
 
-
A
 
A
P
 
P
V
 
I
D
 
N
P
 
P
Y
|
Y
G
 
G
I
 
R
S
 
S
K
|
K
L
 
L
E
 
M
A
 
S
E
 
E
Q
 
E
G
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2udpA Udp-galactose 4-epimerase complexed with udp-phenol (see paper)
24% identity, 98% coverage: 1:312/318 of query aligns to 1:328/338 of 2udpA

query
sites
2udpA
M
 
M
R
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
N
 
S
G
|
G
F
x
Y
V
x
I
G
 
G
Q
 
S
P
 
H
L
 
T
C
 
C
R
 
V
R
 
Q
L
 
L
A
 
L
E
 
Q
L
 
N
G
 
G
H
 
H
H
 
D
V
 
V
A
 
I
G
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
P
 
-
Y
 
-
L
 
I
P
 
L
D
|
D
-
x
N
-
x
L
C
|
C
V
x
N
E
x
S
R
 
K
R
 
R
P
 
S
A
 
V
G
 
L
R
 
P
L
 
V
V
 
I
A
 
E
-
 
R
-
 
L
D
 
G
G
 
G
N
 
K
W
 
H
S
 
P
A
 
T
A
 
F
L
 
V
E
 
E
G
 
G
-
x
D
-
x
I
-
 
R
-
 
N
-
 
E
-
 
A
-
 
L
M
 
M
Q
 
T
A
 
E
V
 
I
V
 
L
H
 
H
L
 
D
A
 
H
A
 
A
R
 
I
V
 
D
H
 
T
V
 
V
M
 
I
H
 
H
-
x
F
-
x
A
-
x
G
-
 
L
-
x
K
-
 
A
-
 
V
-
 
G
D
 
E
A
 
S
S
 
V
H
 
Q
D
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
-
E
 
E
F
 
Y
R
 
Y
A
 
D
A
 
N
N
 
N
G
 
V
A
 
N
G
 
G
T
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
I
E
 
S
Q
 
A
A
 
M
A
 
R
Q
 
A
A
 
A
G
 
N
I
 
V
G
 
K
H
 
N
L
 
F
V
 
I
F
 
F
L
x
S
S
 
S
S
|
S
I
x
A
K
x
T
A
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
D
E
 
Q
T
 
P
T
 
K
H
 
-
T
 
I
P
 
P
F
 
Y
G
 
V
P
 
E
L
 
S
-
 
F
-
 
P
N
 
T
A
 
G
A
 
T
P
 
P
V
 
Q
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
G
 
G
I
 
K
S
 
S
K
|
K
L
 
L
E
 
M
A
 
V
E
 
E
Q
 
Q
G
 
I
L
 
L
A
 
T
E
 
D
I
 
L
-
 
Q
A
 
K
A
 
A
R
 
Q
T
 
P
G
 
D
L
 
W
A
 
S
V
 
I
T
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
R
P
 
-
P
 
-
L
 
-
V
x
Y
Y
 
F
G
x
N
P
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
H
-
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
D
-
x
M
-
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
P
-
 
Q
G
 
G
V
 
I
K
 
P
G
 
N
N
|
N
F
x
L
R
 
M
A
 
P
L
 
Y
I
 
I
R
 
A
L
 
Q
V
 
V
N
 
A
R
 
V
G
 
G
L
 
R
P
 
R
L
 
D
P
 
S
L
 
L
G
x
A
C
x
I
C
x
F
T
 
G
H
 
N
N
 
D
R
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
V
R
|
R
S
 
D
L
x
Y
I
 
I
G
 
H
L
 
V
G
 
M
N
 
D
L
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
G
I
 
H
R
 
V
A
 
V
V
 
A
L
 
M
D
 
E
Q
 
K
P
 
L
P
 
A
H
 
N
P
 
K
G
 
P
Q
 
G
C
 
V
R
 
H
V
 
I
F
 
Y
T
 
N
L
 
L
C
 
G
D
 
A
A
 
G
E
 
V
A
 
G
P
 
N
S
 
S
T
x
V
A
 
L
D
 
D
L
 
V
V
 
V
R
 
N
S
 
A
L
 
F
A
 
S
R
 
K
A
 
A
L
 
C
G
 
G
R
 
K
P
 
P
A
 
V
R
 
N
L
 
Y
L
 
H
P
 
F
I
 
A
P
 
P
V
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
R
L
x
R
G
 
E
A
 
G
G
x
D
L
 
L
L
 
P
G
 
A
K
 
Y
G
 
W
A
 
A
A
 
-
I
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
D
 
D
G
 
A
S
 
S
A
 
K
L
 
A
A
 
D
A
 
R
A
 
E
I
 
L
G
 
N
W
 
W
V
 
R
P
 
V
P
 
T
E
 
R
T
 
T
L
 
L
D
 
D
E
 
E
G
 
M
L
 
A
T
 
Q
A
 
D
T
 
T
A
 
W
R
 
H
W
 
W

Query Sequence

>WP_011382485.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011382485.1
MRVLVTGANGFVGQPLCRRLAELGHHVAGAVRGQPYLPDCVERRPAGRLVADGNWSAALE
GMQAVVHLAARVHVMHDASHDPLAEFRAANGAGTLRLAEQAAQAGIGHLVFLSSIKANGE
ETTHTPFGPLNAAPVDPYGISKLEAEQGLAEIAARTGLAVTVLRPPLVYGPGVKGNFRAL
IRLVNRGLPLPLGCCTHNRRSLIGLGNLVDAIRAVLDQPPHPGQCRVFTLCDAEAPSTAD
LVRSLARALGRPARLLPIPVGLMRLGAGLLGKGAAIQRLTASLEVDGSALAAAIGWVPPE
TLDEGLTATARWWRNKES

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory