SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011386686.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011386686.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
48% identity, 90% coverage: 7:214/232 of query aligns to 8:219/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
E
 
E
Q
 
A
V
 
L
T
 
T
H
 
Y
A
 
A
F
|
F
D
 
P
T
 
G
T
 
G
H
x
V
P
 
K
V
x
A
L
 
L
D
 
D
G
 
D
V
 
L
D
 
S
F
 
L
Q
 
A
L
 
V
G
 
P
K
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
S
V
 
L
A
 
A
L
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
P
N
|
N
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
H
 
L
V
 
H
M
 
L
V
 
N
G
 
G
L
 
T
I
 
L
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
R
V
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
G
H
 
T
A
 
A
F
 
T
G
 
G
R
 
H
E
 
S
R
 
R
R
 
K
A
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
D
F
 
L
V
 
T
E
 
G
V
 
W
R
 
R
A
 
R
K
 
R
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
V
F
 
L
Q
|
Q
D
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
C
 
A
P
 
T
T
 
T
V
 
V
A
 
F
E
 
E
D
 
D
V
 
V
A
 
S
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
N
 
N
L
 
L
G
 
G
K
 
L
S
 
S
K
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
A
I
 
R
V
 
V
H
 
E
A
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
L
 
L
G
 
S
L
 
I
A
 
S
A
 
D
L
 
L
E
 
R
D
 
D
R
 
R
V
 
P
T
 
T
H
|
H
K
x
M
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
K
 
K
R
 
R
L
 
R
V
 
V
S
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
G
V
 
A
L
 
V
A
 
A
M
 
M
E
 
R
P
 
P
D
 
E
A
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
T
N
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
L
A
 
A
T
 
G
R
 
T
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
T
I
 
L
L
 
L
A
 
R
G
 
G
L
 
L
P
 
R
Q
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
M
-
 
T
M
 
L
V
 
V
I
 
F
V
 
S
S
 
T
H
|
H
D
 
D
R
 
V
E
 
E
V
 
L
I
 
A
E
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
D
R
 
R
R
 
V
V
 
A
T
 
L
L
 
F
A
 
R
G
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
V
L
 
L

Q5M244 Energy-coupling factor transporter ATP-binding protein EcfA2; ECF transporter A component EcfA2; EC 3.6.3.- from Streptococcus thermophilus (strain ATCC BAA-250 / LMG 18311) (see paper)
36% identity, 91% coverage: 4:214/232 of query aligns to 3:224/280 of Q5M244

query
sites
Q5M244
I
 
I
R
 
S
L
 
L
E
 
E
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
H
 
Y
A
 
T
F
 
Y
D
 
Q
T
 
S
T
 
G
H
 
T
P
 
P
V
 
F
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
A
L
 
L
D
 
F
G
 
D
V
 
M
D
 
T
F
 
V
Q
 
T
L
 
I
G
 
K
K
 
D
G
 
G
E
 
S
R
 
Y
V
 
T
A
 
A
L
 
F
L
 
I
G
 
G
A
 
H
N
 
T
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
I
L
 
M
H
 
Q
V
 
L
M
 
L
V
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
Y
R
 
L
P
 
P
K
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
H
 
K
-
 
V
-
 
D
-
 
D
A
 
T
F
 
I
G
 
I
R
 
N
E
 
S
R
 
Q
R
 
S
A
 
K
E
 
N
A
 
K
D
 
E
F
 
I
V
 
K
E
 
P
V
 
I
R
 
R
A
 
K
K
 
K
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
F
A
 
P
D
 
E
D
 
S
Q
|
Q
L
 
L
F
 
F
C
 
A
P
 
E
T
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
Q
N
 
N
L
 
F
G
 
G
K
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
E
E
 
Q
I
 
R
V
 
A
H
 
L
A
 
E
V
 
S
L
 
L
A
 
R
R
 
L
L
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
S
-
 
D
A
 
E
L
 
L
E
 
R
D
 
D
R
 
Q
V
 
N
T
 
P
H
 
F
K
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
M
R
 
R
L
 
R
V
 
V
S
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
G
V
 
I
L
 
L
A
 
A
M
 
M
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
N
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
P
A
 
Q
T
 
G
R
 
R
E
 
K
R
 
E
L
 
L
L
 
M
D
 
S
I
 
L
L
 
F
A
 
K
G
 
Q
L
 
L
P
 
H
Q
 
L
A
 
S
-
 
G
-
 
I
-
 
T
M
 
I
V
 
V
I
 
L
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
L
R
 
M
E
 
D
V
 
D
I
 
V
E
 
A
R
 
D
L
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
A
R
 
V
V
 
N
T
 
V
L
 
M
A
 
E
G
 
K
G
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V

8bmpB Cryo-em structure of the folate-specific ecf transporter complex in msp2n2 lipid nanodiscs bound to atp and adp (see paper)
35% identity, 91% coverage: 4:214/232 of query aligns to 2:223/281 of 8bmpB

query
sites
8bmpB
I
 
I
R
 
K
L
 
F
E
 
E
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
H
 
Y
A
 
V
F
x
Y
D
 
S
T
 
P
T
 
G
H
 
S
P
 
P
V
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
Q
V
 
L
D
 
N
F
 
F
Q
 
S
L
 
L
G
 
E
K
 
E
G
 
G
E
 
K
R
 
F
V
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
A
 
H
N
 
T
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
 
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
M
H
 
Q
V
 
H
M
 
F
V
 
N
G
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
K
P
 
P
K
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
I
H
 
E
A
 
I
F
 
A
G
 
G
R
 
Y
E
 
T
R
 
I
R
 
T
A
 
P
E
 
E
A
 
T
D
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
G
F
 
L
V
 
K
E
 
D
V
 
L
R
 
R
A
 
R
K
 
K
A
 
V
G
 
S
L
 
L
L
 
A
F
 
F
Q
 
Q
D
 
F
A
 
S
D
 
E
D
 
A
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
C
 
E
P
 
N
T
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
K
D
 
D
V
 
V
A
 
E
F
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
R
N
 
N
L
 
F
G
 
G
K
 
F
S
 
S
K
 
E
A
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
A
V
 
A
H
 
L
A
 
K
V
 
W
L
 
L
A
 
K
R
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
-
L
 
-
E
 
D
D
 
D
R
 
L
V
 
I
T
 
E
H
 
H
K
 
S
-
 
P
-
 
F
-
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
M
R
 
R
L
 
R
V
 
V
S
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
A
M
 
Y
E
 
E
P
 
P
D
 
E
A
 
I
L
 
I
L
 
C
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
A
N
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
P
A
 
M
T
 
G
R
 
R
E
 
L
R
 
E
L
 
M
L
 
M
D
 
Q
I
 
L
L
 
F
A
 
K
G
 
D
L
 
Y
P
 
Q
Q
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
H
-
 
T
M
 
V
V
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
N
R
 
M
E
 
D
V
 
D
I
 
V
E
 
A
R
 
D
L
 
Y
A
 
A
T
 
D
R
 
D
R
 
V
V
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
E
G
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
I

5d3mB Folate ecf transporter: amppnp bound state (see paper)
35% identity, 91% coverage: 4:214/232 of query aligns to 2:223/281 of 5d3mB

query
sites
5d3mB
I
 
I
R
 
K
L
 
F
E
 
E
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
H
 
Y
A
 
V
F
x
Y
D
 
S
T
 
P
T
 
G
H
 
S
P
 
P
V
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
Q
V
 
L
D
 
N
F
 
F
Q
 
S
L
 
L
G
 
E
K
 
E
G
 
G
E
 
K
R
 
F
V
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
A
 
H
N
x
T
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
 
T
L
 
L
L
 
M
H
 
Q
V
 
H
M
 
F
V
 
N
G
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
K
P
 
P
K
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
I
H
 
E
A
 
I
F
 
A
G
 
G
R
 
Y
E
 
T
R
 
I
R
 
T
A
 
P
E
 
E
A
 
T
D
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
G
F
 
L
V
 
K
E
 
D
V
 
L
R
 
R
A
 
R
K
 
K
A
 
V
G
 
S
L
 
L
L
 
A
F
 
F
Q
 
Q
D
 
F
A
 
S
D
 
E
D
 
A
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
C
 
E
P
 
N
T
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
K
D
 
D
V
 
V
A
 
E
F
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
R
N
 
N
L
 
F
G
 
G
K
 
F
S
 
S
K
 
E
A
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
A
V
 
A
H
 
L
A
 
K
V
 
W
L
 
L
A
 
K
R
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
-
L
 
-
E
 
D
D
 
D
R
 
L
V
 
I
T
 
E
H
 
H
K
 
S
-
 
P
-
 
F
-
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
M
R
 
R
L
 
R
V
 
V
S
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
A
M
 
Y
E
 
E
P
 
P
D
 
E
A
 
I
L
 
I
L
 
C
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
A
N
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
P
A
 
M
T
 
G
R
 
R
E
 
L
R
 
E
L
 
M
L
 
M
D
 
Q
I
 
L
L
 
F
A
 
K
G
 
D
L
 
Y
P
 
Q
Q
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
H
-
 
T
M
 
V
V
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
N
R
 
M
E
 
D
V
 
D
I
 
V
E
 
A
R
 
D
L
 
Y
A
 
A
T
 
D
R
 
D
R
 
V
V
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
E
G
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
I

8bmpA Cryo-em structure of the folate-specific ecf transporter complex in msp2n2 lipid nanodiscs bound to atp and adp (see paper)
35% identity, 84% coverage: 2:196/232 of query aligns to 4:202/278 of 8bmpA

query
sites
8bmpA
T
 
N
L
 
I
I
 
I
R
 
S
L
 
F
E
 
D
Q
 
H
V
 
V
T
 
T
H
 
-
A
 
-
F
|
F
D
 
D
T
 
S
T
 
P
H
 
R
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
D
V
 
L
D
 
S
F
 
F
Q
 
A
L
 
I
G
 
E
K
 
R
G
 
G
E
 
S
R
 
W
V
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
H
N
|
N
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
V
L
 
S
H
 
K
V
 
L
M
 
I
V
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
L
R
 
A
P
 
P
K
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
D
A
 
K
G
 
S
T
 
S
V
 
I
H
 
T
A
 
V
F
 
D
G
 
G
R
 
V
E
 
K
R
 
L
R
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
T
D
 
V
F
 
W
V
 
-
E
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
N
A
 
P
D
 
D
D
 
N
Q
 
Q
L
 
F
F
 
V
C
 
G
P
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
S
E
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
L
L
 
E
N
 
N
L
 
R
G
 
A
K
 
V
S
 
P
K
 
R
A
 
P
E
 
E
A
 
M
R
 
L
E
 
K
I
 
I
V
 
V
H
 
A
A
 
Q
V
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
D
L
 
V
G
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
D
L
 
Y
E
 
A
D
 
D
R
 
S
V
 
E
T
 
P
H
 
S
K
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
S
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
G
V
 
I
L
 
L
A
 
A
M
 
V
E
 
K
P
 
P
D
 
Q
A
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
S
T
 
T
N
 
S
A
 
M
L
 
L
D
 
D
E
 
P
A
 
E
T
 
G
R
 
K
E
 
E
R
 
Q
L
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
L
L
 
V
A
 
R
G
 
K
L
 
I
P
 
K
Q
 
E
-
 
D
-
 
N
-
 
N
-
 
L
A
 
T
M
 
V
V
 
I
I
 
S
V
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
D
R
 
L
E
 
E

8bmsB Cryo-em structure of the mutant solitary ecf module 2eq in msp2n2 lipid nanodiscs in the atpase closed and atp-bound conformation (see paper)
34% identity, 91% coverage: 4:214/232 of query aligns to 2:223/281 of 8bmsB

query
sites
8bmsB
I
 
I
R
 
K
L
 
F
E
 
E
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
H
 
Y
A
 
V
F
x
Y
D
 
S
T
 
P
T
 
G
H
 
S
P
 
P
V
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
Q
V
 
L
D
 
N
F
 
F
Q
 
S
L
 
L
G
 
E
K
 
E
G
 
G
E
 
K
R
 
F
V
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
A
 
H
N
x
T
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
M
H
 
Q
V
 
H
M
 
F
V
 
N
G
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
K
P
 
P
K
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
K
V
 
I
H
 
E
A
 
I
F
 
A
G
 
G
R
 
Y
E
 
T
R
 
I
R
 
T
A
 
P
E
 
E
A
 
T
D
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
G
F
 
L
V
 
K
E
 
D
V
 
L
R
 
R
A
 
R
K
 
K
A
 
V
G
 
S
L
 
L
L
 
A
F
 
F
Q
|
Q
D
 
F
A
 
S
D
 
E
D
 
A
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
C
 
E
P
 
N
T
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
K
D
 
D
V
 
V
A
 
E
F
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
R
N
 
N
L
 
F
G
 
G
K
 
F
S
 
S
K
 
E
A
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
A
V
 
A
H
 
L
A
 
K
V
 
W
L
 
L
A
 
K
R
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
-
L
 
-
E
 
D
D
 
D
R
 
L
V
 
I
T
 
E
H
 
H
K
 
S
-
 
P
-
 
F
-
x
D
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
 
Q
K
 
M
R
 
R
L
 
R
V
 
V
S
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
A
M
 
Y
E
 
E
P
 
P
D
 
E
A
 
I
L
 
I
L
 
C
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
A
N
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
P
A
 
M
T
 
G
R
 
R
E
 
L
R
 
E
L
 
M
L
 
M
D
 
Q
I
 
L
L
 
F
A
 
K
G
 
D
L
 
Y
P
 
Q
Q
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
H
-
 
T
M
 
V
V
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
N
R
 
M
E
 
D
V
 
D
I
 
V
E
 
A
R
 
D
L
 
Y
A
 
A
T
 
D
R
 
D
R
 
V
V
 
L
T
 
A
L
 
L
A
 
E
G
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
I

5d3mA Folate ecf transporter: amppnp bound state (see paper)
34% identity, 84% coverage: 2:196/232 of query aligns to 4:205/280 of 5d3mA

query
sites
5d3mA
T
 
N
L
 
I
I
 
I
R
 
S
L
 
F
E
 
D
Q
 
H
V
 
V
T
 
T
H
x
F
A
 
T
F
 
Y
-
 
P
D
 
D
T
 
S
T
 
P
H
 
R
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
D
V
 
L
D
 
S
F
 
F
Q
 
A
L
 
I
G
 
E
K
 
R
G
 
G
E
 
S
R
 
W
V
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
H
N
|
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
T
x
S
T
 
T
L
 
V
L
 
S
H
 
K
V
 
L
M
 
I
V
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
L
R
 
A
P
 
P
K
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
D
A
 
K
G
 
S
T
 
S
V
 
I
H
 
T
A
 
V
F
 
D
G
 
G
R
 
V
E
 
K
R
 
L
R
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
T
D
 
V
F
 
W
V
 
-
E
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
N
A
 
P
D
 
D
D
 
N
Q
 
Q
L
 
F
F
 
V
C
 
G
P
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
S
E
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
L
L
 
E
N
 
N
L
 
R
G
 
A
K
 
V
S
 
P
K
 
R
A
 
P
E
 
E
A
 
M
R
 
L
E
 
K
I
 
I
V
 
V
H
 
A
A
 
Q
V
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
D
L
 
V
G
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
D
L
 
Y
E
 
A
D
 
D
R
 
S
V
 
E
T
 
P
H
 
S
K
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
S
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
G
V
 
I
L
 
L
A
 
A
M
 
V
E
 
K
P
 
P
D
 
Q
A
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
S
T
 
T
N
 
S
A
 
M
L
 
L
D
 
D
E
 
P
A
 
E
T
 
G
R
 
K
E
 
E
R
 
Q
L
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
L
L
 
V
A
 
R
G
 
K
L
 
I
P
 
K
Q
 
E
-
 
D
-
 
N
-
 
N
-
 
L
A
 
T
M
 
V
V
 
I
I
 
S
V
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
D
R
 
L
E
 
E

Q5M243 Energy-coupling factor transporter ATP-binding protein EcfA1; ECF transporter A component EcfA1; EC 7.-.-.- from Streptococcus thermophilus (strain ATCC BAA-250 / LMG 18311) (see paper)
32% identity, 92% coverage: 1:213/232 of query aligns to 1:215/276 of Q5M243

query
sites
Q5M243
M
 
M
T
 
I
L
 
E
I
 
I
R
 
K
L
 
N
E
 
L
Q
 
K
V
 
F
T
 
K
H
 
Y
A
 
N
F
 
Q
D
 
D
T
 
Q
T
 
T
H
 
S
P
 
Y
V
 
T
L
 
L
D
 
N
G
 
D
V
 
V
D
 
S
F
 
F
Q
 
H
L
 
V
G
 
K
K
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
W
V
 
L
A
 
S
L
 
I
L
 
V
G
 
G
A
 
H
N
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
T
L
 
A
H
 
R
V
 
L
M
 
I
V
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
L
R
 
V
P
 
A
K
 
D
A
 
S
G
 
G
T
 
Q
V
 
I
H
 
I
A
 
V
F
 
D
G
 
G
R
 
Q
E
 
E
R
 
L
R
 
T
A
 
E
E
 
E
A
 
T
D
 
V
F
 
W
V
 
-
E
 
D
V
 
I
R
 
R
A
 
D
K
 
K
A
 
I
G
 
G
L
 
M
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
N
A
 
P
D
 
D
D
 
N
Q
|
Q
L
 
F
F
 
V
C
 
G
P
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
E
E
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
L
L
 
E
N
 
N
L
 
K
G
 
G
K
 
L
S
 
P
K
 
Y
A
 
K
E
 
E
A
 
M
R
 
V
E
 
S
I
 
R
V
 
V
H
 
Q
A
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
S
R
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
M
A
 
M
A
 
D
L
 
F
E
 
K
D
 
D
R
 
R
V
 
E
T
 
P
H
 
A
K
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
S
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
G
V
 
I
L
 
I
A
 
A
M
 
M
E
 
R
P
 
P
D
 
S
A
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
N
 
S
A
 
M
L
 
L
D
 
D
E
 
P
A
 
E
T
 
G
R
 
R
E
 
Q
R
 
E
L
 
L
L
 
I
D
 
Q
I
 
Y
L
 
I
A
 
E
G
 
D
L
 
I
P
 
R
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
Y
-
 
G
-
 
M
A
 
T
M
 
V
V
 
L
I
 
S
V
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
D
R
 
L
E
 
D
V
 
E
I
 
V
E
 
-
R
 
A
L
 
M
A
 
S
T
 
N
R
 
R
R
 
V
V
 
L
T
 
V
L
 
L
A
 
K
G
 
Q
G
 
G
R
 
K
L
 
V

8bmsA Cryo-em structure of the mutant solitary ecf module 2eq in msp2n2 lipid nanodiscs in the atpase closed and atp-bound conformation (see paper)
34% identity, 84% coverage: 2:196/232 of query aligns to 3:202/278 of 8bmsA

query
sites
8bmsA
T
 
N
L
 
I
I
 
I
R
 
S
L
 
F
E
 
D
Q
 
H
V
 
V
T
 
T
H
x
F
A
 
T
F
 
-
D
 
D
T
 
S
T
 
P
H
 
R
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
D
V
 
L
D
 
S
F
 
F
Q
 
A
L
 
I
G
 
E
K
 
R
G
 
G
E
 
S
R
 
W
V
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
H
N
|
N
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
V
L
 
S
H
 
K
V
 
L
M
 
I
V
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
L
R
 
A
P
 
P
K
 
D
-
 
D
-
 
L
-
 
D
A
 
K
G
 
S
T
 
S
V
 
I
H
 
T
A
 
V
F
 
D
G
 
G
R
 
V
E
 
K
R
 
L
R
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
T
D
 
V
F
 
W
V
 
-
E
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
V
G
 
G
L
 
I
L
 
V
F
 
F
Q
|
Q
D
 
N
A
 
P
D
 
D
D
 
N
Q
 
Q
L
 
F
F
 
V
C
 
G
P
 
A
T
 
T
V
 
V
A
 
S
E
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
L
L
 
E
N
 
N
L
 
R
G
 
A
K
 
V
S
 
P
K
 
R
A
 
P
E
 
E
A
 
M
R
 
L
E
 
K
I
 
I
V
 
V
H
 
A
A
 
Q
V
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
D
L
 
V
G
 
G
L
 
M
A
 
A
A
 
D
L
x
Y
E
 
A
D
 
D
R
 
S
V
 
E
T
 
P
H
 
S
K
x
N
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
|
Q
K
 
K
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
S
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
G
V
 
I
L
 
L
A
 
A
M
 
V
E
 
K
P
 
P
D
 
Q
A
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
S
T
 
T
N
 
S
A
 
M
L
 
L
D
 
D
E
 
P
A
 
E
T
 
G
R
 
K
E
 
E
R
 
Q
L
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
L
L
 
V
A
 
R
G
 
K
L
 
I
P
 
K
Q
 
E
-
 
D
-
 
N
-
 
N
-
 
L
A
 
T
M
 
V
V
 
I
I
 
S
V
 
I
S
 
T
H
|
H
D
 
D
R
 
L
E
 
E

4hluA Structure of the ecfa-a' heterodimer bound to adp (see paper)
34% identity, 90% coverage: 4:212/232 of query aligns to 3:215/265 of 4hluA

query
sites
4hluA
I
 
I
R
 
E
L
 
V
E
 
V
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
H
 
H
A
 
I
F
|
F
D
 
H
T
 
R
T
 
G
H
 
T
P
 
P
V
 
L
-
 
E
-
x
K
-
 
K
-
 
A
L
 
L
D
 
E
G
 
N
V
 
V
D
 
S
F
 
L
Q
 
V
L
 
I
G
 
N
K
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
C
V
 
L
A
 
L
L
 
V
L
 
A
G
 
G
A
 
N
N
 
T
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
V
 
I
M
 
V
V
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
E
P
 
P
K
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
D
V
 
V
H
 
L
A
 
Y
F
 
D
G
 
G
R
 
E
E
 
R
R
 
K
R
 
K
A
 
G
E
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
Y
E
 
E
V
 
I
R
 
R
A
 
R
K
 
N
A
 
I
G
 
G
L
 
I
L
 
A
F
 
F
Q
 
Q
D
 
Y
A
 
P
D
 
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
F
F
 
F
C
 
A
P
 
E
T
 
R
V
 
V
A
 
F
E
 
D
D
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
A
P
 
V
L
 
K
N
 
N
L
 
F
G
 
Y
K
 
P
S
 
D
K
 
R
A
 
D
E
 
P
A
 
V
R
 
P
E
 
L
I
 
V
V
 
K
H
 
K
A
 
A
V
 
M
-
 
E
L
 
F
A
 
V
R
 
G
L
 
L
G
 
D
L
 
F
A
 
D
A
 
S
L
 
F
E
 
K
D
 
D
R
 
R
V
 
V
T
 
P
H
 
F
K
 
F
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
K
R
 
R
L
 
R
V
 
V
S
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
V
M
 
H
E
 
E
P
 
P
D
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
N
 
V
A
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
R
A
 
E
T
 
G
R
 
K
E
 
T
R
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
R
I
 
I
L
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
W
A
 
K
G
 
T
L
 
L
P
 
G
Q
 
K
A
 
T
M
 
V
V
 
I
I
 
L
V
 
I
S
 
S
H
 
H
D
 
D
R
 
I
E
 
E
V
 
T
I
 
V
E
 
I
R
 
N
L
 
H
A
 
V
T
 
D
R
 
R
R
 
V
V
 
V
T
 
V
L
 
L
A
 
E
G
 
K
G
 
G
R
 
K

D5ARH0 Biotin transport ATP-binding protein BioM; ECF transporter A component BioM; EC 7.6.2.- from Rhodobacter capsulatus (strain ATCC BAA-309 / NBRC 16581 / SB1003) (see paper)
40% identity, 78% coverage: 32:213/232 of query aligns to 30:208/234 of D5ARH0

query
sites
D5ARH0
R
 
R
V
 
I
A
 
G
L
 
I
L
 
V
G
 
G
A
 
R
N
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
|
K
T
 
S
T
 
S
L
 
L
L
 
I
H
 
R
V
 
L
M
 
I
V
 
T
G
 
G
L
 
L
I
 
V
R
 
T
P
 
P
K
 
Q
A
 
K
G
 
G
T
 
R
V
 
V
H
 
V
A
 
V
F
 
N
G
 
G
R
 
V
E
 
D
R
 
-
R
 
-
A
 
V
E
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
R
V
 
A
E
 
G
V
 
A
R
 
L
A
 
G
K
 
T
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
D
 
N
A
 
P
D
 
D
D
 
H
Q
 
Q
L
 
I
F
 
I
C
 
F
P
 
P
T
 
V
V
 
V
A
 
R
E
 
D
D
 
E
V
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
L
L
 
E
N
 
Q
L
 
K
G
 
G
K
 
L
S
 
K
K
 
R
A
 
A
E
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
A
I
 
R
V
 
A
H
 
E
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
A
L
 
Q
G
 
G
L
 
R
A
 
A
A
 
D
L
 
W
E
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
L
T
 
C
H
 
H
K
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
 
R
R
 
Q
L
 
L
V
 
L
S
 
C
L
 
L
A
 
M
A
 
S
V
 
I
L
 
L
A
 
A
M
 
M
E
 
E
P
 
P
D
 
D
A
 
W
L
 
I
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
N
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
L
A
 
P
T
 
T
R
 
A
E
 
L
R
 
S
L
 
I
L
 
E
D
 
A
I
 
R
L
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
A
 
N
M
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
R
 
P
E
 
S
V
 
R
I
 
L
E
 
T
R
 
G
L
 
F
A
 
-
T
 
D
R
 
R
R
 
I
V
 
L
T
 
W
L
 
L
A
 
E
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
I

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
36% identity, 86% coverage: 3:201/232 of query aligns to 1:206/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
L
 
M
I
 
I
R
 
F
L
 
V
E
 
N
Q
 
D
V
 
V
T
 
Y
H
 
K
A
 
N
F
|
F
D
 
G
T
 
S
T
 
L
H
 
E
P
 
-
V
|
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
T
F
 
L
Q
 
K
L
 
V
G
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
V
V
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
H
 
R
V
 
C
M
 
I
V
 
N
G
 
L
L
 
L
I
 
E
R
 
E
P
 
P
K
 
T
A
 
K
G
 
G
T
 
E
V
 
V
H
 
F
A
 
I
F
 
D
G
 
G
-
 
V
R
 
K
E
 
I
R
 
N
R
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
V
D
 
N
F
 
I
V
 
N
E
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
Q
K
 
K
A
 
V
G
 
G
L
 
M
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
A
 
F
D
 
N
D
 
-
Q
 
-
L
 
L
F
 
F
C
 
P
P
 
H
-
 
L
T
 
T
V
 
A
A
 
I
E
 
E
D
 
N
V
 
I
A
 
T
F
 
L
G
 
A
P
 
P
L
 
V
N
 
K
L
 
V
G
 
K
K
 
K
-
 
M
S
 
N
K
 
K
A
 
K
E
 
E
A
 
A
R
 
E
E
 
E
I
 
L
V
 
A
H
 
V
A
 
D
V
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
L
A
 
D
L
 
K
E
 
K
D
 
D
R
 
Q
V
 
Y
T
 
P
H
 
I
K
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
R
 
Q
L
 
R
V
 
L
S
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
E
 
Q
P
 
P
D
 
E
A
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
N
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
P
A
 
E
T
 
M
R
 
V
E
 
K
R
 
E
L
 
V
L
 
L
D
 
N
I
 
V
L
 
M
A
 
K
G
 
Q
L
 
L
P
 
A
Q
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
M
A
 
T
M
 
M
V
 
V
I
 
V
V
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
E
-
 
M
-
 
G
-
 
F
-
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
G
E
 
D
R
 
R
L
 
V

4zirA Crystal structure of ecfaa' heterodimer bound to amppnp (see paper)
34% identity, 90% coverage: 4:212/232 of query aligns to 3:213/263 of 4zirA

query
sites
4zirA
I
 
I
R
 
E
L
 
V
E
 
V
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
H
 
H
A
 
I
F
|
F
D
 
H
T
 
R
T
 
G
H
 
T
P
 
P
V
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
A
L
 
L
D
 
E
G
 
N
V
 
V
D
 
S
F
 
L
Q
 
V
L
 
I
G
 
N
K
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
C
V
 
L
A
 
L
L
 
V
L
 
A
G
 
G
A
 
N
N
x
T
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
V
 
I
M
 
V
V
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
E
P
 
P
K
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
D
V
 
V
H
 
L
A
 
Y
F
 
D
G
 
G
R
 
E
E
 
K
R
 
G
R
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
Y
E
 
E
V
 
I
R
 
R
A
 
R
K
 
N
A
 
I
G
 
G
L
 
I
L
 
A
F
 
F
Q
|
Q
D
 
Y
A
 
P
D
 
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
F
F
 
F
C
 
A
P
 
E
T
 
R
V
 
V
A
 
F
E
 
D
D
 
E
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
A
P
 
V
L
 
K
N
 
N
L
 
F
G
 
Y
K
 
P
S
 
D
K
 
R
A
 
D
E
 
P
A
 
V
R
 
P
E
 
L
I
 
V
V
 
K
H
 
K
A
 
A
V
 
M
-
 
E
L
 
F
A
 
V
R
 
G
L
 
L
G
 
D
L
 
F
A
 
D
A
 
S
L
 
F
E
 
K
D
 
D
R
|
R
V
 
V
T
 
P
H
 
F
K
x
F
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
x
E
K
 
K
R
 
R
L
 
R
V
 
V
S
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
V
M
 
H
E
 
E
P
 
P
D
 
D
A
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
N
 
V
A
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
R
A
 
E
T
 
G
R
 
K
E
 
T
R
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
R
I
 
I
L
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
W
A
 
K
G
 
T
L
 
L
P
 
G
Q
 
K
A
 
T
M
 
V
V
 
I
I
 
L
V
 
I
S
 
S
H
 
H
D
 
D
R
 
I
E
 
E
V
 
T
I
 
V
E
 
I
R
 
N
L
 
H
A
 
V
T
 
D
R
 
R
R
 
V
V
 
V
T
 
V
L
 
L
A
 
E
G
 
K
G
 
G
R
 
K

2pclA Crystal structure of abc transporter with complex (aq_297) from aquifex aeolicus vf5
36% identity, 86% coverage: 17:215/232 of query aligns to 16:218/223 of 2pclA

query
sites
2pclA
H
 
Y
P
 
E
V
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
S
F
 
L
Q
 
S
L
 
V
G
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
F
V
 
V
A
 
S
L
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
H
 
Y
V
 
I
M
 
L
V
 
G
G
 
L
L
 
L
I
 
D
R
 
A
P
 
P
K
 
T
A
 
E
G
 
G
T
 
K
V
 
V
H
 
F
A
 
L
F
 
E
G
 
G
R
 
K
E
 
E
-
 
V
-
 
D
-
 
Y
-
 
T
R
 
N
R
 
E
A
 
K
E
 
E
A
 
L
D
 
S
F
 
L
V
 
L
E
 
R
V
 
N
R
 
R
A
 
-
K
 
K
A
 
L
G
 
G
L
 
F
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
F
A
 
-
D
 
-
D
 
-
Q
 
H
L
 
Y
F
 
L
C
 
I
P
 
P
-
 
E
-
 
L
T
 
T
V
 
A
A
 
L
E
 
E
D
 
N
V
 
V
A
 
I
F
 
V
G
 
P
P
 
M
L
 
L
N
 
K
L
 
M
G
 
G
K
 
K
S
 
P
K
 
K
A
 
K
E
 
E
A
 
A
R
 
K
E
 
E
I
 
R
V
 
G
H
 
E
A
 
Y
V
 
L
L
 
L
A
 
S
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
D
L
 
K
E
 
L
D
 
S
R
 
R
V
 
K
T
 
P
H
 
Y
K
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
Q
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
S
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
N
E
 
E
P
 
P
D
 
I
A
 
L
L
 
L
L
 
F
L
 
A
D
 
D
E
|
E
P
|
P
T
|
T
N
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
S
A
 
A
T
 
N
R
 
T
E
 
K
R
 
R
L
 
V
L
 
M
D
 
D
I
 
I
L
 
F
A
 
L
G
 
K
L
 
I
P
 
N
Q
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
T
A
 
S
M
 
I
V
 
V
I
 
M
V
 
V
S
x
T
H
 
H
D
 
E
R
 
R
E
 
E
V
 
L
I
 
A
E
 
E
R
 
-
L
 
L
A
 
T
T
 
H
R
 
R
R
 
T
V
 
L
T
 
E
L
 
M
A
 
K
G
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
V
L
 
V
G
 
G

8g4cB Bceabs atpgs high res tm (see paper)
38% identity, 76% coverage: 19:194/232 of query aligns to 22:203/248 of 8g4cB

query
sites
8g4cB
V
 
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
D
F
 
I
Q
 
H
L
 
I
G
 
E
K
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
F
V
 
V
A
 
S
L
 
I
L
 
M
G
 
G
A
 
A
N
x
S
G
 
G
S
|
S
G
 
G
K
 
K
T
|
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
H
 
N
V
 
V
M
 
L
V
 
S
G
 
S
L
 
I
I
 
D
R
 
Q
P
 
V
K
 
S
A
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
I
H
 
H
A
 
I
F
 
N
G
 
G
R
 
N
E
 
D
R
 
M
R
 
T
A
 
A
-
 
M
-
 
K
E
 
E
A
 
K
D
 
Q
F
 
L
V
 
A
E
 
E
V
 
F
R
 
R
A
 
K
K
 
Q
A
 
H
-
 
L
G
 
G
L
 
F
L
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
A
 
Y
D
 
-
D
 
N
Q
 
L
L
 
L
F
 
D
C
 
T
P
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
K
E
 
E
D
 
N
V
 
I
A
 
L
F
 
L
G
 
-
P
 
P
L
 
L
N
 
S
L
 
I
G
 
T
K
 
K
-
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
K
E
 
E
A
 
A
R
 
N
E
 
R
I
 
K
V
 
F
H
 
E
A
 
E
V
 
V
L
 
A
A
 
K
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
Y
A
 
E
L
 
L
E
 
R
D
 
D
R
 
K
V
 
Y
T
 
P
H
 
N
K
 
E
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
R
 
Q
L
 
R
V
 
T
S
 
S
L
 
A
A
 
G
A
 
R
V
 
A
L
 
F
A
 
I
M
 
H
E
 
D
P
 
P
D
 
S
A
 
I
L
 
I
L
 
F
L
 
A
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
N
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
S
A
 
K
T
 
S
R
 
A
E
 
S
R
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
N
I
 
K
L
 
L
A
 
S
G
 
Q
L
 
L
P
 
N
Q
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
N
-
 
A
A
 
T
M
 
I
V
 
I
I
 
M
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D

Sites not aligning to the query:

7tchB Bceab e169q variant atp-bound conformation (see paper)
37% identity, 77% coverage: 17:194/232 of query aligns to 19:202/245 of 7tchB

query
sites
7tchB
H
x
Q
P
 
E
V
|
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
D
F
 
I
Q
 
H
L
 
I
G
 
E
K
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
F
V
 
V
A
 
S
L
 
I
L
 
M
G
 
G
A
 
A
N
x
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
K
|
K
T
|
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
H
 
N
V
 
V
M
 
L
V
 
S
G
 
S
L
 
I
I
 
D
R
 
Q
P
 
V
K
 
S
A
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
I
H
 
H
A
 
I
F
 
N
G
 
G
R
 
N
E
 
D
R
 
M
R
 
T
A
 
A
-
 
M
-
 
K
E
 
E
A
 
K
D
 
Q
F
 
L
V
 
A
E
 
E
V
 
F
R
 
R
A
 
K
K
 
Q
A
 
H
-
 
L
G
 
G
L
 
F
L
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
A
 
Y
D
 
-
D
 
N
Q
 
L
L
 
L
F
 
D
C
 
T
P
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
K
E
 
E
D
 
N
V
 
I
A
 
L
F
 
L
G
 
-
P
 
P
L
 
L
N
 
S
L
 
I
G
 
T
K
 
K
-
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
K
E
 
E
A
 
A
R
 
N
E
 
R
I
 
K
V
 
F
H
 
E
A
 
E
V
 
V
L
 
A
A
 
K
R
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
Y
A
 
E
L
 
L
E
 
R
D
 
D
R
 
K
V
 
Y
T
 
P
H
 
N
K
x
E
L
 
I
S
 
S
G
|
G
G
|
G
Q
 
Q
K
 
K
R
 
Q
L
 
R
V
 
T
S
 
S
L
 
A
A
 
G
A
 
R
V
 
A
L
 
F
A
 
I
M
 
H
E
 
D
P
 
P
D
 
S
A
 
I
L
 
I
L
 
F
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
N
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
S
A
 
K
T
 
S
R
 
A
E
 
S
R
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
N
I
 
K
L
 
L
A
 
S
G
 
Q
L
 
L
P
 
N
Q
 
Q
-
 
K
-
 
R
-
 
N
-
 
A
A
 
T
M
 
I
V
 
I
I
 
M
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D

Sites not aligning to the query:

8w6iD Cryo-em structure of escherichia coli str k12 ftsex complex with atp- gamma-s in peptidisc
35% identity, 92% coverage: 3:215/232 of query aligns to 1:217/219 of 8w6iD

query
sites
8w6iD
L
 
M
I
 
I
R
 
R
L
 
F
E
 
E
Q
 
H
V
 
V
T
 
S
H
 
K
A
 
A
F
x
Y
D
 
L
T
 
G
T
 
G
H
 
R
P
 
Q
V
 
A
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
T
F
 
F
Q
 
H
L
 
M
G
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
M
V
 
A
A
 
F
L
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
H
N
x
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
H
 
K
V
 
L
M
 
I
V
 
C
G
 
G
L
 
I
I
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
K
V
 
I
-
 
W
-
 
F
-
 
S
-
 
G
H
 
H
A
 
D
F
 
I
G
 
T
R
 
R
E
 
L
R
 
K
R
 
N
A
 
R
E
 
E
A
 
V
D
 
P
F
 
F
V
 
L
E
 
-
V
 
-
R
 
R
A
 
R
K
 
Q
A
 
I
G
 
G
L
 
M
L
 
I
F
 
F
Q
|
Q
D
 
D
A
 
-
D
 
H
D
 
H
Q
 
L
L
 
L
F
 
M
C
 
D
P
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
E
 
D
D
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
I
G
 
P
P
 
L
L
 
I
N
 
I
L
 
A
G
 
G
K
 
A
S
 
S
K
 
G
A
 
D
E
 
D
A
 
I
R
 
R
E
 
R
I
 
R
V
 
V
H
 
S
A
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
D
R
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
L
A
 
D
L
x
K
E
 
A
D
 
K
R
 
N
V
 
F
T
 
P
H
 
I
K
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
x
E
K
 
Q
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
S
 
G
L
 
I
A
 
A
A
 
R
V
 
A
L
 
V
A
 
V
M
 
N
E
 
K
P
 
P
D
 
A
A
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
N
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
A
T
 
L
R
 
S
E
 
E
R
 
G
L
 
I
L
 
L
D
 
R
I
 
L
L
 
F
A
 
E
G
 
E
L
 
F
P
 
N
Q
 
R
A
 
V
M
 
G
V
 
V
I
 
T
V
 
V
-
 
L
-
 
M
-
 
A
S
 
T
H
|
H
D
 
D
R
 
I
E
 
N
V
 
L
I
 
I
E
 
S
R
 
R
L
 
R
A
 
S
T
 
Y
R
 
R
R
 
M
V
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
S
G
 
D
G
 
G
R
 
H
L
 
L
L
 
H
G
 
G

P0A9R7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
35% identity, 92% coverage: 3:215/232 of query aligns to 1:217/222 of P0A9R7

query
sites
P0A9R7
L
 
M
I
 
I
R
 
R
L
 
F
E
 
E
Q
 
H
V
 
V
T
 
S
H
 
K
A
 
A
F
 
Y
D
 
L
T
 
G
T
 
G
H
 
R
P
 
Q
V
 
A
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
T
F
 
F
Q
 
H
L
 
M
G
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
M
V
 
A
A
 
F
L
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
H
N
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
H
 
K
V
 
L
M
 
I
V
x
C
G
 
G
L
 
I
I
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
K
V
 
I
-
 
W
-
 
F
-
 
S
-
 
G
H
 
H
A
 
D
F
 
I
G
 
T
R
 
R
E
 
L
R
 
K
R
 
N
A
 
R
E
 
E
A
 
V
D
 
P
F
 
F
V
 
L
E
 
-
V
 
-
R
 
R
A
 
R
K
 
Q
A
 
I
G
 
G
L
 
M
L
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
A
 
-
D
 
H
D
 
H
Q
 
L
L
 
L
F
 
M
C
 
D
P
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
E
 
D
D
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
I
G
 
P
P
 
L
L
 
I
N
 
I
L
 
A
G
 
G
K
 
A
S
 
S
K
 
G
A
 
D
E
 
D
A
 
I
R
 
R
E
 
R
I
 
R
V
 
V
H
 
S
A
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
D
R
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
L
A
 
D
L
 
K
E
 
A
D
 
K
R
 
N
V
 
F
T
 
P
H
 
I
K
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
Q
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
S
 
G
L
 
I
A
 
A
A
 
R
V
 
A
L
 
V
A
 
V
M
 
N
E
 
K
P
 
P
D
 
A
A
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
N
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
A
T
 
L
R
 
S
E
 
E
R
 
G
L
 
I
L
 
L
D
 
R
I
 
L
L
 
F
A
 
E
G
 
E
L
 
F
P
 
N
Q
 
R
A
 
V
M
 
G
V
 
V
I
 
T
V
 
V
-
 
L
-
 
M
-
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
D
R
 
I
E
 
N
V
 
L
I
 
I
E
 
S
R
 
R
L
 
R
A
 
S
T
 
Y
R
 
R
R
 
M
V
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
S
G
 
D
G
 
G
R
 
H
L
 
L
L
 
H
G
 
G

8hd0A Cell divisome spg hydrolysis machinery ftsex-envc
34% identity, 92% coverage: 3:215/232 of query aligns to 1:217/218 of 8hd0A

query
sites
8hd0A
L
 
M
I
 
I
R
 
R
L
 
F
E
 
E
Q
 
H
V
 
V
T
 
S
H
 
K
A
 
A
F
x
Y
D
 
L
T
 
G
T
 
G
H
x
R
P
 
Q
V
x
A
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
T
F
 
F
Q
 
H
L
 
M
G
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
M
V
 
A
A
 
F
L
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
H
N
 
S
G
 
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
H
 
K
V
 
L
M
 
I
V
 
C
G
 
G
L
 
I
I
 
E
R
 
R
P
 
P
K
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
K
V
 
I
-
 
W
-
 
F
-
 
S
-
 
G
H
 
H
A
 
D
F
 
I
G
 
T
R
 
R
E
 
L
R
 
K
R
 
N
A
 
R
E
 
E
A
 
V
D
 
P
F
 
F
V
 
-
E
 
-
V
 
L
R
 
R
A
 
R
K
 
Q
A
 
I
G
 
G
L
 
M
L
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
A
 
-
D
 
H
D
 
H
Q
 
L
L
 
L
F
 
M
C
 
D
P
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
Y
E
 
D
D
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
I
G
 
P
P
 
L
L
 
I
N
 
I
L
 
A
G
 
G
K
 
A
S
 
S
K
 
G
A
 
D
E
 
D
A
 
I
R
 
R
E
 
R
I
 
R
V
 
V
H
 
S
A
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
D
R
 
K
L
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
L
A
 
D
L
 
K
E
 
A
D
 
K
R
 
N
V
 
F
T
 
P
H
 
I
K
 
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
 
E
K
 
Q
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
S
 
G
L
 
I
A
 
A
A
 
R
V
 
A
L
 
V
A
 
V
M
 
N
E
 
K
P
 
P
D
 
A
A
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
N
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
A
T
 
L
R
 
S
E
 
E
R
 
G
L
 
I
L
 
L
D
 
R
I
 
L
L
 
F
A
 
E
G
 
E
L
 
F
P
 
N
Q
 
R
A
 
V
M
 
G
V
 
V
I
 
T
V
 
V
-
 
L
-
 
M
-
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
D
R
 
I
E
 
N
V
 
L
I
 
I
E
 
S
R
 
R
L
 
R
A
 
S
T
 
Y
R
 
R
R
 
M
V
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
S
G
 
D
G
 
G
R
 
H
L
 
L
L
 
H
G
 
G

Q9AT00 Protein TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 3, chloroplastic; ABC transporter I family member 13; ABC transporter ABCI.13; AtABCI13; Non-intrinsic ABC protein 11; AtNAP11 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
31% identity, 99% coverage: 3:231/232 of query aligns to 84:332/345 of Q9AT00

query
sites
Q9AT00
L
 
L
I
 
I
R
 
E
L
 
C
E
 
R
Q
 
D
V
 
V
T
 
Y
H
 
K
A
 
S
F
|
F
D
 
G
T
 
E
T
 
K
H
 
H
P
 
-
V
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
S
F
 
F
Q
 
K
L
 
I
G
 
R
K
 
H
G
 
G
E
 
E
R
 
A
V
 
V
A
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
P
N
 
S
G
 
G
S
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
T
 
T
L
 
I
L
 
L
H
 
K
V
 
I
M
 
M
V
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
L
R
 
A
P
 
P
K
 
D
A
 
K
G
 
G
T
 
E
V
 
V
H
 
Y
A
 
I
F
 
R
G
 
G
R
 
K
E
 
K
R
 
R
R
 
A
A
 
G
E
 
L
A
 
I
D
 
S
F
 
D
V
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
S
A
 
G
-
 
L
K
 
R
A
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
S
A
 
A
D
 
-
D
 
-
Q
 
A
L
 
L
F
 
F
-
 
D
C
 
S
P
 
L
T
 
S
V
 
V
A
 
R
E
 
E
D
 
N
V
 
V
A
 
G
F
 
F
G
 
L
P
 
L
L
 
Y
N
 
E
L
 
R
G
 
S
K
 
K
-
 
M
S
 
S
K
 
E
A
 
N
E
 
Q
A
 
I
R
 
S
E
 
E
I
 
L
V
 
V
H
 
T
A
 
Q
V
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
A
L
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
G
L
 
V
E
 
E
D
 
N
R
 
R
V
 
L
T
 
P
H
 
S
K
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
K
R
 
K
L
 
R
V
 
V
S
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
V
 
S
L
 
L
-
 
I
-
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
T
-
 
K
-
 
E
A
 
V
M
 
I
E
 
E
P
 
P
D
 
E
A
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
N
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
P
A
 
I
T
 
A
R
 
S
E
 
T
R
 
V
L
 
V
L
 
E
D
 
D
I
 
L
L
 
I
-
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
H
-
 
M
-
 
T
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
K
P
 
P
-
 
G
-
 
K
-
 
I
Q
 
A
A
 
S
M
 
Y
V
 
L
I
 
V
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
Q
R
 
H
E
 
S
V
 
T
I
 
I
E
 
Q
R
 
R
L
 
A
A
 
V
T
 
D
R
 
R
R
 
L
V
 
L
T
 
F
L
 
L
A
 
Y
G
 
E
G
 
G
R
 
K
L
 
I
L
 
V
G
 
W
C
 
Q
R
 
G
P
 
M
N
 
T
P
 
H
P
 
E
G
 
F
A
 
T
N
 
T
A
 
S
P
 
T
D
 
N
P
 
P
I
 
I
F
 
V
E
 
Q

Query Sequence

>WP_011386686.1 NCBI__GCF_000009985.1:WP_011386686.1
MTLIRLEQVTHAFDTTHPVLDGVDFQLGKGERVALLGANGSGKTTLLHVMVGLIRPKAGT
VHAFGRERRAEADFVEVRAKAGLLFQDADDQLFCPTVAEDVAFGPLNLGKSKAEAREIVH
AVLARLGLAALEDRVTHKLSGGQKRLVSLAAVLAMEPDALLLDEPTNALDEATRERLLDI
LAGLPQAMVIVSHDREVIERLATRRVTLAGGRLLGCRPNPPGANAPDPIFES

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory