SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_011814428.1 NCBI__GCF_000015585.1:WP_011814428.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6hulB Sulfolobus solfataricus tryptophan synthase ab complex (see paper)
47% identity, 91% coverage: 14:424/454 of query aligns to 4:410/416 of 6hulB

query
sites
6hulB
I
 
L
P
 
P
R
 
K
A
 
Y
W
 
W
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
S
 
I
A
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
P
P
 
P
V
 
P
L
 
R
H
 
D
P
 
P
A
 
Q
T
 
G
R
 
A
E
 
Y
P
 
F
V
 
S
S
 
R
A
 
I
D
 
D
D
 
L
L
 
L
A
 
R
P
 
S
L
 
I
F
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
E
V
 
V
I
 
L
E
 
R
Q
 
Q
E
 
Q
L
 
F
T
 
T
T
 
I
E
 
E
R
 
R
E
 
Y
V
 
I
E
 
K
I
 
I
P
 
P
E
 
E
P
 
E
V
 
V
R
 
R
N
 
D
A
 
R
Y
 
Y
R
 
L
Q
 
S
W
 
I
-
 
G
R
 
R
P
 
P
A
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
R
 
R
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
E
K
 
E
A
 
Y
L
 
L
D
 
K
T
 
T
P
 
P
A
 
A
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
F
K
 
K
Y
 
Y
E
 
E
G
 
G
V
 
A
S
 
T
P
 
P
A
 
T
G
 
G
S
 
S
H
|
H
K
|
K
P
 
I
N
 
N
T
 
T
A
 
A
L
 
I
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
F
 
Y
Y
 
F
N
 
A
H
 
K
A
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
E
R
 
H
I
 
V
T
 
V
T
 
T
E
 
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
Q
|
Q
W
|
W
G
 
G
S
 
T
S
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
A
 
S
M
 
M
F
 
Y
D
 
N
L
 
M
D
 
K
I
 
S
E
 
T
V
 
I
F
 
F
M
 
M
V
 
V
G
 
K
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
K
 
E
Q
 
Q
K
 
K
P
 
P
Y
 
M
R
 
R
R
 
R
A
 
S
F
 
I
M
 
M
E
 
Q
S
 
L
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
V
I
 
Y
A
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
T
Q
 
N
E
 
L
T
 
T
A
 
E
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
S
 
K
V
 
I
L
 
L
A
 
E
D
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
Q
S
 
H
T
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
M
G
 
S
E
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
A
 
L
Q
 
-
R
 
K
D
 
N
D
 
E
T
 
F
K
 
R
Y
 
Y
A
 
L
L
 
V
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
L
N
 
D
H
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
L
H
 
H
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
Q
E
 
E
A
 
T
M
 
I
E
 
T
Q
 
Q
M
 
L
A
 
D
M
 
L
A
 
L
D
 
G
D
 
E
Y
 
D
P
 
A
D
 
D
T
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
G
C
 
C
T
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
F
 
F
A
 
G
G
 
G
I
 
F
V
 
T
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
I
G
 
G
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
N
G
 
K
P
 
K
S
 
G
V
 
K
E
 
R
A
 
Y
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
S
P
 
S
L
 
A
A
 
E
C
 
I
P
 
P
T
 
K
L
 
F
T
 
S
R
 
K
G
 
G
Q
 
E
F
 
Y
A
 
K
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
F
G
 
P
D
 
D
S
 
S
A
 
A
Q
 
G
L
 
L
T
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
V
K
 
K
M
 
M
H
 
I
T
 
T
L
 
L
G
 
G
S
 
K
G
 
D
F
 
Y
M
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
P
F
 
I
H
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
M
 
V
A
 
A
P
 
P
Q
 
T
I
 
L
S
 
S
H
 
L
L
 
L
K
 
T
D
 
K
L
 
E
G
 
G
Y
 
I
L
 
V
D
 
E
A
 
W
R
 
R
A
 
E
Y
 
Y
D
 
N
Q
 
E
L
 
R
D
 
E
C
 
I
F
 
F
A
 
E
A
 
A
G
 
A
L
 
K
E
 
I
F
 
F
A
 
I
R
 
E
A
 
N
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
I
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
E
|
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
I
K
 
R
A
 
A
V
 
V
I
 
V
E
 
D
E
 
E
A
 
A
Q
 
I
G
 
E
C
 
A
R
 
R
E
 
K
R
 
N
G
 
N
E
 
E
S
 
R
K
 
K
A
 
V
I
 
I
L
 
V
F
 
F
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
|
G
H
 
H
G
 
G
N
 
L
F
 
L
D
 
D
M
 
L
Q
 
S
A
 
N
Y
 
Y

4qysB Trpb2 enzymes (see paper)
43% identity, 93% coverage: 9:428/454 of query aligns to 6:416/418 of 4qysB

query
sites
4qysB
L
 
L
D
 
P
E
 
Q
A
 
D
R
 
E
I
 
I
P
 
P
R
 
A
A
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
S
 
L
A
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
P
T
 
E
R
 
E
E
 
L
P
 
P
V
 
P
S
 
P
A
 
Q
D
 
E
D
 
L
L
 
L
A
 
K
P
 
E
L
 
V
F
 
L
P
 
P
R
 
S
G
 
K
V
 
V
I
 
L
E
 
E
Q
 
L
E
 
E
L
 
F
T
 
A
T
 
K
E
 
E
R
 
R
E
 
Y
V
 
V
E
 
K
I
 
I
P
 
P
E
 
D
P
 
E
V
 
V
R
 
L
N
 
E
A
 
R
Y
 
Y
R
 
L
Q
 
Q
W
 
V
-
 
G
R
 
R
P
 
P
A
 
T
P
 
P
L
 
I
Y
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
E
K
 
E
A
 
Y
L
 
L
D
 
G
T
 
N
P
 
N
A
 
I
R
 
K
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Y
 
M
E
 
E
G
 
S
V
 
Y
S
 
T
P
 
Y
A
 
T
G
 
G
S
 
S
H
|
H
K
|
K
P
 
I
N
 
N
T
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
A
Q
 
H
A
 
V
F
 
Y
Y
 
Y
N
 
A
H
 
K
A
 
L
E
 
D
G
 
N
V
 
A
R
 
K
R
 
F
I
 
V
T
 
T
T
 
T
E
|
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
W
 
W
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
S
A
 
A
M
 
L
F
 
F
D
 
R
L
 
M
D
 
K
I
 
A
E
 
H
V
 
I
F
 
F
M
 
M
V
 
V
G
 
R
V
 
T
S
 
S
Y
 
Y
K
 
Y
Q
 
A
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
R
 
K
A
 
Y
F
 
M
M
 
M
E
 
Q
S
 
M
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
E
C
 
V
I
 
H
A
 
P
S
 
S
P
 
P
S
 
S
Q
 
D
E
 
L
T
 
T
A
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
R
S
 
Q
V
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
K
N
 
D
P
 
S
A
 
N
S
 
H
T
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
I
G
 
S
E
 
D
A
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
Y
A
 
-
A
 
A
Q
 
H
R
 
K
D
 
N
D
 
G
T
 
G
K
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
V
N
 
N
H
 
S
V
 
D
L
 
I
L
 
M
H
 
F
Q
 
K
T
 
T
V
 
I
T
 
A
G
 
G
V
 
M
E
 
E
A
 
A
M
 
K
E
 
K
Q
 
Q
M
 
M
A
 
E
M
 
L
A
 
I
D
 
G
D
 
E
Y
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
Y
V
 
I
I
 
I
A
 
G
C
 
V
T
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
F
 
Y
A
 
A
G
 
A
I
 
L
V
 
A
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
R
G
 
S
G
 
G
P
 
K
-
 
V
S
 
R
V
 
R
E
 
K
A
 
Y
I
 
I
A
 
A
V
 
S
E
 
G
P
 
S
L
 
S
A
 
E
C
 
V
P
 
P
T
 
K
L
 
M
T
 
T
R
 
K
G
 
G
Q
 
V
F
 
Y
A
 
K
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
G
 
P
D
 
D
S
 
T
A
 
A
Q
 
K
L
 
L
T
 
L
P
 
P
L
 
M
T
 
L
K
 
K
M
 
M
H
 
Y
T
 
T
L
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
D
F
 
F
M
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
P
F
 
V
H
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
M
 
V
A
 
A
P
 
P
Q
 
T
I
 
L
S
 
S
H
 
L
L
 
L
K
 
I
D
 
S
L
 
K
G
 
G
Y
 
I
L
 
V
D
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
D
Y
 
Y
D
 
S
Q
 
Q
L
 
E
D
 
E
C
 
S
F
 
F
A
 
K
A
 
W
G
 
A
L
 
K
E
 
L
F
 
F
A
 
S
R
 
E
A
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
Y
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
E
|
E
A
 
T
N
 
S
H
 
H
A
 
A
V
 
L
K
 
P
A
 
I
V
 
L
I
 
A
E
 
E
E
 
I
A
 
A
Q
 
E
G
 
E
C
 
A
R
 
K
E
 
K
R
 
S
G
 
G
E
 
E
S
 
R
K
 
K
A
 
T
I
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
S
L
 
F
C
x
S
G
 
G
H
 
H
G
 
G
N
 
L
F
 
L
D
 
D
M
 
L
Q
 
G
A
 
N
Y
 
Y
T
 
A
D
 
S
Y
 
V
L
 
L

4qysA Trpb2 enzymes (see paper)
42% identity, 93% coverage: 9:428/454 of query aligns to 6:406/408 of 4qysA

query
sites
4qysA
L
 
L
D
 
P
E
 
Q
A
 
D
R
 
E
I
 
I
P
 
P
R
 
A
A
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
S
 
L
A
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
E
P
 
E
L
 
L
A
 
P
P
 
P
V
 
P
L
 
Q
H
 
D
P
 
P
A
 
T
T
 
G
R
 
K
E
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
S
A
 
L
D
 
E
D
 
L
L
 
L
A
 
K
P
 
E
L
 
V
F
 
L
P
 
P
R
 
S
G
 
K
V
 
V
I
 
L
E
 
E
Q
 
L
E
 
E
L
 
F
T
 
A
T
 
K
E
 
E
R
 
R
E
 
Y
V
 
V
E
 
K
I
 
I
P
 
P
E
 
D
P
 
E
V
 
V
R
 
L
N
 
E
A
 
R
Y
 
Y
R
 
L
Q
 
Q
W
 
V
-
 
G
R
 
R
P
 
P
A
 
T
P
 
P
L
 
I
Y
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
E
K
 
E
A
 
Y
L
 
L
D
 
G
T
 
N
P
 
N
A
 
I
R
 
K
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Y
 
M
E
 
E
G
 
S
V
 
Y
S
 
T
P
 
Y
A
 
T
G
 
G
S
 
S
H
|
H
K
|
K
P
 
I
N
 
N
T
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
A
Q
 
H
A
 
V
F
 
Y
Y
 
Y
N
 
A
H
 
K
A
 
L
E
 
D
G
 
N
V
 
A
R
 
K
R
 
F
I
 
V
T
 
T
T
 
T
E
|
E
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
|
W
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
S
A
 
A
M
 
L
F
 
F
D
 
R
L
 
M
D
 
K
I
 
A
E
 
H
V
 
I
F
 
F
M
 
M
V
 
V
G
 
R
V
 
T
S
 
S
Y
 
Y
K
 
Y
Q
 
A
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
R
 
K
A
 
Y
F
 
M
M
 
M
E
 
Q
S
 
M
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
E
C
 
V
I
 
H
A
 
P
S
 
S
P
 
P
S
 
S
Q
 
D
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
I
G
 
S
E
 
D
A
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
A
 
-
Q
 
H
R
 
K
D
 
N
D
 
G
T
 
G
K
 
K
Y
 
Y
A
 
V
L
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
V
N
 
N
H
 
S
V
 
D
L
 
I
L
 
M
H
 
F
Q
 
K
T
 
T
V
 
I
T
 
A
G
 
G
V
 
M
E
 
E
A
 
A
M
 
K
E
 
K
Q
 
Q
M
 
M
A
 
E
M
 
L
A
 
I
D
 
G
D
 
E
Y
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
Y
V
 
I
I
 
I
A
 
G
C
 
V
T
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
F
 
Y
A
 
A
G
 
A
I
 
L
V
 
A
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
L
G
 
G
A
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
R
G
 
S
G
 
G
P
 
K
-
 
V
S
 
R
V
 
R
E
 
K
A
 
Y
I
 
I
A
 
A
V
 
S
E
 
G
P
 
S
L
 
S
A
 
E
C
 
V
P
 
P
T
 
K
L
 
M
T
 
T
R
 
K
G
 
G
Q
 
V
F
 
Y
A
 
K
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
G
 
P
D
 
D
S
 
T
A
 
A
Q
 
K
L
 
L
T
 
L
P
 
P
L
 
M
T
 
L
K
 
K
M
 
M
H
 
Y
T
 
T
L
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
D
F
 
F
M
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
P
F
 
V
H
 
Y
A
 
A
G
 
G
G
|
G
L
 
L
R
|
R
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
M
 
V
A
 
A
P
 
P
Q
 
T
I
 
L
S
 
S
H
 
L
L
 
L
K
 
I
D
 
S
L
 
K
G
 
G
Y
 
I
L
 
V
D
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
D
Y
 
Y
D
 
S
Q
 
Q
L
 
E
D
 
E
C
 
S
F
 
F
A
 
K
A
 
W
G
 
A
L
 
K
E
 
L
F
 
F
A
 
S
R
 
E
A
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
Y
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
E
|
E
A
 
T
N
 
S
H
 
H
A
 
A
V
 
L
K
 
P
A
 
I
V
 
L
I
 
A
E
 
E
E
 
I
A
 
A
Q
 
E
G
 
E
C
 
A
R
 
K
E
 
K
R
 
S
G
 
G
E
 
E
S
 
R
K
 
K
A
 
T
I
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
S
L
 
F
C
x
S
G
 
G
H
 
H
G
 
G
N
 
L
F
 
L
D
 
D
M
 
L
Q
 
G
A
 
N
Y
 
Y
T
 
A
D
 
S
Y
 
V
L
 
L

5dw3A Tryptophan synthase beta-subunit from pyrococcus furiosus with product l-tryptophan non-covalently bound in the active site (see paper)
30% identity, 76% coverage: 76:421/454 of query aligns to 44:377/383 of 5dw3A

query
sites
5dw3A
R
 
K
Q
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
A
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
D
 
G
T
 
G
P
 
-
A
 
A
R
 
K
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
A
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
P
 
T
N
 
N
T
 
N
A
 
A
L
 
I
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
A
 
F
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
M
D
 
K
I
 
V
E
 
D
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
A
V
 
E
S
 
D
Y
 
V
K
 
E
Q
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
R
 
V
A
 
F
F
 
R
M
 
M
E
 
K
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
V
I
 
I
A
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
V
S
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
-
 
R
-
 
T
L
 
L
G
 
K
I
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
T
R
 
F
D
 
E
D
 
Y
T
 
T
K
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
K
E
 
A
Q
 
Q
M
 
I
A
 
L
M
 
E
A
 
A
D
 
E
-
 
G
D
 
Q
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
A
A
 
M
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
-
 
N
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
G
G
 
G
A
 
K
A
 
G
L
 
L
R
 
E
G
 
S
G
 
G
P
 
K
S
 
H
V
 
S
E
 
A
A
 
S
I
 
L
A
 
N
V
 
A
E
 
G
P
 
Q
L
 
V
A
 
G
C
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
V
T
 
F
R
 
H
G
 
G
Q
 
M
F
 
L
A
 
S
Y
 
Y
D
 
F
Y
 
L
G
 
Q
D
 
D
S
 
E
A
 
G
Q
 
Q
L
 
I
T
 
K
P
 
P
L
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
T
H
 
H
T
 
S
L
 
I
G
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
A
 
A
G
 
P
G
 
G
L
 
L
R
 
D
Y
|
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
K
L
 
I
G
 
Q
Y
 
R
L
 
A
D
 
E
A
 
Y
R
 
V
A
 
T
Y
 
V
D
 
T
Q
 
D
L
 
E
D
 
E
C
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
L
 
H
E
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
 
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
Y
V
 
A
I
 
M
E
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
K
E
 
E
R
 
M
G
 
S
E
 
R
S
 
D
K
 
E
A
 
I
I
 
I
L
 
I
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
L

5vm5D Engineered tryptophan synthase b-subunit from pyrococcus furiosus, pftrpb2b9, with ser bound (see paper)
31% identity, 76% coverage: 76:421/454 of query aligns to 44:376/383 of 5vm5D

query
sites
5vm5D
R
 
K
Q
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
A
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
D
 
G
T
 
G
P
 
-
A
 
A
R
 
K
I
 
V
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
A
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
P
 
T
N
 
N
T
 
N
A
 
A
L
 
I
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
A
 
L
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
M
D
 
K
I
 
V
E
 
D
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
A
V
 
E
S
 
D
Y
 
V
K
 
E
Q
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
R
 
V
A
 
F
F
 
R
M
 
M
E
 
K
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
V
I
 
I
A
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
V
S
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
-
 
R
-
 
T
L
 
L
G
 
K
I
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
T
R
 
F
D
 
E
D
 
Y
T
 
T
K
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
K
E
 
A
Q
 
Q
M
 
I
A
 
L
M
 
E
A
 
A
D
 
E
-
 
G
D
 
Q
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
F
 
A
A
 
M
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
N
G
 
D
P
 
K
S
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
L
 
K
A
 
H
C
 
S
P
 
A
T
 
S
L
 
L
T
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
A
 
G
Y
 
V
D
 
S
Y
 
H
G
 
G
D
 
M
S
 
L
A
 
S
Q
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
-
H
 
Y
T
 
F
L
 
L
G
 
Q
S
 
D
G
 
G
F
 
Q
M
 
I
P
 
K
P
 
P
G
 
S
F
 
H
H
 
S
-
 
I
A
 
A
G
 
P
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
K
L
 
I
G
 
Q
Y
 
R
L
 
A
D
 
E
A
 
Y
R
 
V
A
 
A
Y
 
V
D
 
T
Q
 
D
L
 
E
D
 
E
C
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
L
 
H
E
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
Y
V
 
A
I
 
M
E
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
K
E
 
E
R
 
M
G
 
S
E
 
R
S
 
D
K
 
E
A
 
I
I
 
I
L
 
I
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
L

6am8B Engineered tryptophan synthase b-subunit from pyrococcus furiosus, pftrpb2b9 with trp bound as e(aex2) (see paper)
30% identity, 76% coverage: 76:421/454 of query aligns to 44:378/385 of 6am8B

query
sites
6am8B
R
 
K
Q
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
A
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
D
 
G
T
 
G
P
 
-
A
 
A
R
 
K
I
 
V
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
A
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
P
 
T
N
 
N
T
 
N
A
 
A
L
 
I
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
A
 
L
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
M
D
 
K
I
 
V
E
 
D
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
A
V
 
E
S
 
D
Y
 
V
K
 
E
Q
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
R
 
V
A
 
F
F
 
R
M
 
M
E
 
K
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
V
I
 
I
A
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
V
S
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
-
 
R
-
 
T
L
|
L
G
 
K
I
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
x
L
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
T
R
 
F
D
 
E
D
 
Y
T
 
T
K
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
x
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
K
E
 
A
Q
 
Q
M
 
I
A
 
L
M
 
E
A
 
A
D
 
E
-
 
G
D
 
Q
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
F
 
A
A
 
M
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
N
G
 
D
P
 
K
S
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
L
 
K
A
 
H
C
 
S
P
 
A
T
 
S
L
 
L
T
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
A
 
G
Y
 
V
D
x
S
Y
x
H
G
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
Y
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
-
 
D
D
 
E
S
 
E
A
 
G
Q
 
Q
L
 
I
T
 
K
P
 
P
L
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
S
H
 
H
T
 
S
L
 
I
G
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
A
 
A
G
 
P
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
|
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
K
L
 
I
G
 
Q
Y
 
R
L
 
A
D
 
E
A
 
Y
R
 
V
A
 
A
Y
 
V
D
 
T
Q
 
D
L
 
E
D
 
E
C
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
L
 
H
E
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
Y
V
 
A
I
 
M
E
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
K
E
 
E
R
 
M
G
 
S
E
 
R
S
 
D
K
 
E
A
 
I
I
 
I
L
 
I
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
|
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
L

Sites not aligning to the query:

5tciH Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - brd4592-bound form (see paper)
33% identity, 78% coverage: 79:431/454 of query aligns to 65:406/406 of 5tciH

query
sites
5tciH
R
 
R
P
 
P
A
 
S
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
A
 
A
R
 
T
R
 
R
L
 
L
E
 
S
K
 
Q
A
 
H
L
 
A
D
 
G
T
 
S
P
 
-
A
 
A
R
 
R
I
 
I
Y
 
F
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
N
P
 
H
A
 
T
G
 
G
S
 
S
H
 
H
K
|
K
P
 
I
N
 
N
T
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
R
A
 
R
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
V
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
W
 
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
C
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
C
E
 
V
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
G
V
 
I
S
 
D
Y
 
T
K
 
A
Q
 
R
K
 
Q
P
 
A
Y
 
L
R
 
N
R
 
V
A
 
A
F
 
R
M
 
M
E
 
R
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
E
C
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
V
P
 
Q
S
 
T
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
G
R
 
S
S
 
K
V
 
T
L
 
L
A
 
K
D
 
D
N
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
F
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
N
R
 
A
D
 
D
D
 
N
T
 
T
K
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
L
x
F
G
 
G
S
 
T
V
 
A
L
 
A
-
 
G
-
x
P
-
 
H
-
 
P
-
x
F
-
 
P
N
 
T
H
 
M
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
R
V
 
I
T
 
I
G
 
G
V
 
M
E
 
E
A
 
A
M
 
R
E
 
V
Q
 
Q
M
 
I
-
 
Q
A
 
G
M
 
Q
A
 
A
D
 
G
D
 
R
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
A
A
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
H
P
 
A
F
 
F
L
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
P
G
 
G
A
 
V
A
 
R
L
 
L
R
 
V
G
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
A
G
 
G
P
 
D
S
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
H
I
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
F
P
 
T
L
 
A
A
 
G
C
 
S
P
 
P
T
 
G
L
 
A
T
 
F
R
x
H
G
 
G
Q
 
S
F
 
F
A
 
S
Y
 
Y
D
 
L
Y
 
L
G
 
Q
D
 
D
S
 
E
A
 
D
Q
 
G
L
 
Q
T
 
T
P
 
-
L
 
-
T
 
I
K
 
E
M
 
S
H
 
H
T
 
S
L
 
I
G
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
A
 
S
G
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
W
L
 
L
K
 
K
D
 
E
L
 
A
G
 
G
Y
 
R
L
 
V
D
 
D
A
 
Y
R
 
R
A
 
P
Y
 
I
D
 
T
Q
 
D
L
 
S
D
 
E
C
 
A
F
 
M
A
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
G
E
 
L
F
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
I
E
 
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
G
V
 
A
I
 
L
E
 
K
E
 
L
A
 
G
Q
 
V
G
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
L
G
 
G
E
 
R
S
 
G
K
 
A
A
 
V
I
 
I
L
 
V
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
V
Q
 
E
A
 
T
Y
 
A
T
 
A
D
 
K
Y
 
W
-
 
F
-
 
G
L
 
L
A
 
L
G
 
G
N
 
N

Sites not aligning to the query:

6uapB Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - open form with brd6309 bound
33% identity, 78% coverage: 79:431/454 of query aligns to 64:405/405 of 6uapB

query
sites
6uapB
R
 
R
P
 
P
A
 
S
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
A
 
A
R
 
T
R
 
R
L
 
L
E
 
S
K
 
Q
A
 
H
L
 
A
D
 
G
T
 
S
P
 
-
A
 
A
R
 
R
I
 
I
Y
 
F
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
N
P
 
H
A
 
T
G
 
G
S
 
S
H
 
H
K
|
K
P
 
I
N
 
N
T
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
R
A
 
R
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
V
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
W
 
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
C
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
C
E
 
V
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
G
V
 
I
S
 
D
Y
 
T
K
 
A
Q
 
R
K
 
Q
P
 
A
Y
 
L
R
 
N
R
 
V
A
 
A
F
 
R
M
 
M
E
 
R
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
E
C
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
V
P
 
Q
S
 
T
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
G
R
 
S
S
 
K
V
 
T
L
 
L
A
 
K
D
 
D
N
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
A
I
|
I
G
x
N
E
 
E
A
 
A
V
x
F
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
N
R
 
A
D
 
D
D
 
N
T
 
T
K
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
L
x
F
G
 
G
S
 
T
V
 
A
L
 
A
-
 
G
-
x
P
-
 
H
-
 
P
-
x
F
-
 
P
N
 
T
H
 
M
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
R
V
 
I
T
 
I
G
 
G
V
 
M
E
 
E
A
 
A
M
 
R
E
 
V
Q
 
Q
M
 
I
-
 
Q
A
 
G
M
 
Q
A
 
A
D
 
G
D
 
R
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
A
A
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
H
P
 
A
F
 
F
L
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
P
G
 
G
A
 
V
A
 
R
L
 
L
R
 
V
G
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
A
G
 
G
P
 
D
S
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
H
I
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
F
P
 
T
L
 
A
A
 
G
C
 
S
P
 
P
T
 
G
L
 
A
T
 
F
R
x
H
G
 
G
Q
 
S
F
 
F
A
 
S
Y
 
Y
D
 
L
Y
 
L
G
 
Q
D
 
D
S
 
E
A
 
D
Q
 
G
L
 
Q
T
 
T
P
 
-
L
 
-
T
 
I
K
 
E
M
 
S
H
 
H
T
 
S
L
 
I
G
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
A
 
S
G
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
W
L
 
L
K
 
K
D
 
E
L
 
A
G
 
G
Y
 
R
L
 
V
D
 
D
A
 
Y
R
 
R
A
 
P
Y
 
I
D
 
T
Q
 
D
L
 
S
D
 
E
C
 
A
F
 
M
A
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
G
E
 
L
F
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
I
E
 
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
G
V
 
A
I
 
L
E
 
K
E
 
L
A
 
G
Q
 
V
G
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
L
G
 
G
E
 
R
S
 
G
K
 
A
A
 
V
I
 
I
L
 
V
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
V
Q
 
E
A
 
T
Y
 
A
T
 
A
D
 
K
Y
 
W
-
 
F
-
 
G
L
 
L
A
 
L
G
 
G
N
 
N

6usaB Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - aminoacrylate- and gsk1-bound form (see paper)
32% identity, 77% coverage: 79:428/454 of query aligns to 64:400/404 of 6usaB

query
sites
6usaB
R
 
R
P
 
P
A
 
S
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
A
 
A
R
 
T
R
 
R
L
 
L
E
 
S
K
 
Q
A
 
H
L
 
A
D
 
G
T
 
S
P
 
-
A
 
A
R
 
R
I
 
I
Y
 
F
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
N
P
 
H
A
 
T
G
 
G
S
 
S
H
|
H
K
|
K
P
 
I
N
 
N
T
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
R
A
 
R
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
V
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
C
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
C
E
 
V
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
G
V
 
I
S
 
D
Y
 
T
K
 
A
Q
 
R
K
 
Q
P
 
A
Y
 
L
R
 
N
R
 
V
A
 
A
F
 
R
M
 
M
E
 
R
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
E
C
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
V
P
 
Q
S
 
T
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
G
R
 
S
S
 
K
V
 
T
L
 
L
A
 
K
D
 
D
N
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
x
F
-
 
R
E
 
D
L
x
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
N
R
 
A
D
 
D
D
 
N
T
 
T
K
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
L
x
F
G
 
G
S
x
T
V
 
A
L
 
A
-
x
G
-
x
P
-
 
H
-
 
P
-
x
F
-
 
P
N
 
T
H
 
M
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
R
V
 
I
T
 
I
G
 
G
V
 
M
E
 
E
A
 
A
M
 
R
E
 
V
Q
 
Q
M
 
I
-
 
Q
A
 
G
M
 
Q
A
 
A
D
 
G
D
 
R
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
F
 
A
A
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
H
P
 
A
F
 
F
L
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
P
G
 
G
A
 
V
A
 
R
L
 
L
R
 
V
G
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
A
G
 
G
P
 
D
S
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
H
I
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
F
P
 
T
L
 
A
A
 
G
C
 
S
P
 
P
T
 
G
L
 
A
T
 
F
R
x
H
G
|
G
Q
 
S
F
 
F
A
 
S
Y
 
Y
D
 
L
Y
 
L
G
 
Q
D
 
D
S
 
E
A
 
D
Q
 
G
L
 
Q
T
 
T
P
 
-
L
 
-
T
 
I
K
 
E
M
 
S
H
 
H
T
 
S
L
 
I
G
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
A
 
S
G
 
A
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
W
L
 
L
K
 
K
D
 
E
L
 
A
G
 
G
Y
 
R
L
 
V
D
 
D
A
 
Y
R
 
R
A
 
P
Y
 
I
D
 
T
Q
 
D
L
 
S
D
 
E
C
 
A
F
 
M
A
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
G
E
 
L
F
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
I
E
|
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
G
V
 
A
I
 
L
E
 
K
E
 
L
A
 
G
Q
 
V
G
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
L
G
 
G
E
 
R
S
 
G
K
 
A
A
 
V
I
 
I
L
 
V
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
V
Q
 
E
A
 
T
Y
 
A
T
 
A
D
 
K
Y
 
W
L
 
F

6dweB Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - aminoacrylate- and brd0059-bound form
32% identity, 77% coverage: 79:428/454 of query aligns to 64:400/404 of 6dweB

query
sites
6dweB
R
 
R
P
 
P
A
 
S
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
A
 
A
R
 
T
R
 
R
L
 
L
E
 
S
K
 
Q
A
 
H
L
 
A
D
 
G
T
 
S
P
 
-
A
 
A
R
 
R
I
 
I
Y
 
F
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
N
P
 
H
A
 
T
G
 
G
S
 
S
H
|
H
K
|
K
P
 
I
N
 
N
T
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
R
A
 
R
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
V
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
C
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
C
E
 
V
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
G
V
 
I
S
 
D
Y
 
T
K
 
A
Q
 
R
K
 
Q
P
 
A
Y
 
L
R
 
N
R
 
V
A
 
A
F
 
R
M
 
M
E
 
R
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
E
C
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
V
P
 
Q
S
 
T
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
G
R
 
S
S
 
K
V
 
T
L
 
L
A
 
K
D
 
D
N
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
x
F
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
N
R
 
A
D
 
D
D
 
N
T
 
T
K
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
L
x
F
G
 
G
S
x
T
V
 
A
L
 
A
-
 
G
-
x
P
-
 
H
-
 
P
-
x
F
-
 
P
N
 
T
H
 
M
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
R
V
 
I
T
 
I
G
 
G
V
 
M
E
 
E
A
 
A
M
 
R
E
 
V
Q
 
Q
M
 
I
-
 
Q
A
 
G
M
 
Q
A
 
A
D
 
G
D
 
R
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
F
 
A
A
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
H
P
 
A
F
 
F
L
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
P
G
 
G
A
 
V
A
 
R
L
 
L
R
 
V
G
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
A
G
 
G
P
 
D
S
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
H
I
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
F
P
 
T
L
 
A
A
 
G
C
 
S
P
 
P
T
 
G
L
 
A
T
 
F
R
x
H
G
 
G
Q
 
S
F
 
F
A
 
S
Y
 
Y
D
 
L
Y
 
L
G
 
Q
D
 
D
S
 
E
A
 
D
Q
 
G
L
 
Q
T
 
T
P
 
-
L
 
-
T
 
I
K
 
E
M
 
S
H
 
H
T
 
S
L
 
I
G
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
A
 
S
G
 
A
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
W
L
 
L
K
 
K
D
 
E
L
 
A
G
 
G
Y
 
R
L
 
V
D
 
D
A
 
Y
R
 
R
A
 
P
Y
 
I
D
 
T
Q
 
D
L
 
S
D
 
E
C
 
A
F
 
M
A
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
G
E
 
L
F
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
I
E
|
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
G
V
 
A
I
 
L
E
 
K
E
 
L
A
 
G
Q
 
V
G
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
L
G
 
G
E
 
R
S
 
G
K
 
A
A
 
V
I
 
I
L
 
V
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
V
Q
 
E
A
 
T
Y
 
A
T
 
A
D
 
K
Y
 
W
L
 
F

6u6cB Crystal structure of tryptophan synthase from m. Tuberculosis - aminoacrylate- and gsk2-bound form (see paper)
32% identity, 77% coverage: 79:428/454 of query aligns to 65:401/405 of 6u6cB

query
sites
6u6cB
R
 
R
P
 
P
A
 
S
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
A
 
A
R
 
T
R
 
R
L
 
L
E
 
S
K
 
Q
A
 
H
L
 
A
D
 
G
T
 
S
P
 
-
A
 
A
R
 
R
I
 
I
Y
 
F
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
N
P
 
H
A
 
T
G
 
G
S
 
S
H
|
H
K
|
K
P
 
I
N
 
N
T
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
R
A
 
R
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
V
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
C
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
C
E
 
V
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
G
V
 
I
S
 
D
Y
 
T
K
 
A
Q
 
R
K
 
Q
P
 
A
Y
 
L
R
 
N
R
 
V
A
 
A
F
 
R
M
 
M
E
 
R
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
E
C
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
V
P
 
Q
S
 
T
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
G
R
 
S
S
 
K
V
 
T
L
 
L
A
 
K
D
 
D
N
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
x
F
-
 
R
E
 
D
L
x
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
N
R
 
A
D
 
D
D
 
N
T
 
T
K
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
L
x
F
G
 
G
S
x
T
V
 
A
L
 
A
-
x
G
-
x
P
-
 
H
-
 
P
-
 
F
-
 
P
N
 
T
H
 
M
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
R
V
 
I
T
 
I
G
 
G
V
 
M
E
 
E
A
 
A
M
 
R
E
 
V
Q
 
Q
M
 
I
-
 
Q
A
 
G
M
 
Q
A
 
A
D
 
G
D
 
R
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
F
 
A
A
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
H
P
 
A
F
 
F
L
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
P
G
 
G
A
 
V
A
 
R
L
 
L
R
 
V
G
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
A
G
 
G
P
 
D
S
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
H
I
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
F
P
 
T
L
 
A
A
 
G
C
 
S
P
 
P
T
 
G
L
 
A
T
 
F
R
x
H
G
|
G
Q
 
S
F
 
F
A
 
S
Y
 
Y
D
 
L
Y
 
L
G
 
Q
D
 
D
S
 
E
A
 
D
Q
 
G
L
 
Q
T
 
T
P
 
-
L
 
-
T
 
I
K
 
E
M
 
S
H
 
H
T
 
S
L
 
I
G
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
A
 
S
G
 
A
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
W
L
 
L
K
 
K
D
 
E
L
 
A
G
 
G
Y
 
R
L
 
V
D
 
D
A
 
Y
R
 
R
A
 
P
Y
 
I
D
 
T
Q
 
D
L
 
S
D
 
E
C
 
A
F
 
M
A
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
G
E
 
L
F
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
I
E
|
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
G
V
 
A
I
 
L
E
 
K
E
 
L
A
 
G
Q
 
V
G
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
L
G
 
G
E
 
R
S
 
G
K
 
A
A
 
V
I
 
I
L
 
V
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
V
Q
 
E
A
 
T
Y
 
A
T
 
A
D
 
K
Y
 
W
L
 
F

Sites not aligning to the query:

5ocwB Structure of mycobacterium tuberculosis tryptophan synthase in space group f222 (see paper)
32% identity, 77% coverage: 79:428/454 of query aligns to 60:396/399 of 5ocwB

query
sites
5ocwB
R
 
R
P
 
P
A
 
S
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
A
 
A
R
 
T
R
 
R
L
 
L
E
 
S
K
 
Q
A
 
H
L
 
A
D
 
G
T
 
S
P
 
-
A
 
A
R
 
R
I
 
I
Y
 
F
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
N
P
 
H
A
 
T
G
 
G
S
 
S
H
|
H
K
|
K
P
 
I
N
 
N
T
 
N
A
 
V
L
 
L
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
R
A
 
R
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
V
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
C
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
C
E
 
V
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
G
V
 
I
S
 
D
Y
 
T
K
 
A
Q
 
R
K
 
Q
P
 
A
Y
 
L
R
 
N
R
 
V
A
 
A
F
 
R
M
 
M
E
 
R
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
E
C
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
V
P
 
Q
S
 
T
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
G
R
 
S
S
 
K
V
 
T
L
 
L
A
 
K
D
 
D
N
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
F
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
N
R
 
A
D
 
D
D
 
N
T
 
T
K
 
Y
Y
 
Y
A
 
C
L
 
F
G
 
G
S
x
T
V
 
A
L
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
F
-
 
P
N
 
T
H
 
M
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
R
V
 
I
T
 
I
G
 
G
V
 
M
E
 
E
A
 
A
M
 
R
E
 
V
Q
 
Q
M
 
I
-
 
Q
A
 
G
M
 
Q
A
 
A
D
 
G
D
 
R
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
F
 
A
A
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
H
P
 
A
F
 
F
L
 
L
-
 
D
-
 
D
-
 
P
G
 
G
A
 
V
A
 
R
L
 
L
R
 
V
G
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
A
G
 
G
P
 
D
S
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
H
I
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
F
P
 
T
L
 
A
A
 
G
C
 
S
P
 
P
T
 
G
L
 
A
T
 
F
R
 
H
G
 
G
Q
 
S
F
 
F
A
 
S
Y
 
Y
D
 
L
Y
 
L
G
 
Q
D
 
D
S
 
E
A
 
D
Q
 
G
L
 
Q
T
 
T
P
 
-
L
 
-
T
 
I
K
 
E
M
 
S
H
 
H
T
 
S
L
 
I
G
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
A
 
S
G
 
A
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
W
L
 
L
K
 
K
D
 
E
L
 
A
G
 
G
Y
 
R
L
 
V
D
 
D
A
 
Y
R
 
R
A
 
P
Y
 
I
D
 
T
Q
 
D
L
 
S
D
 
E
C
 
A
F
 
M
A
 
D
A
 
A
G
 
F
L
 
G
E
 
L
F
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
M
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
I
E
|
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
G
V
 
A
I
 
L
E
 
K
E
 
L
A
 
G
Q
 
V
G
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
L
G
 
G
E
 
R
S
 
G
K
 
A
A
 
V
I
 
I
L
 
V
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
V
Q
 
E
A
 
T
Y
 
A
T
 
A
D
 
K
Y
 
W
L
 
F

5ixjD Tryptophan synthase beta-subunit from pyrococcus furiosus with l- threonine non-covalently bound in the active site (see paper)
31% identity, 76% coverage: 76:421/454 of query aligns to 44:376/394 of 5ixjD

query
sites
5ixjD
R
 
K
Q
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
A
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
D
 
G
T
 
G
P
 
-
A
 
A
R
 
K
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
A
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
P
 
T
N
 
N
T
 
N
A
 
A
L
 
I
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
A
 
F
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
M
D
 
K
I
 
V
E
 
D
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
A
V
 
E
S
 
D
Y
 
V
K
 
E
Q
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
R
 
V
A
 
F
F
 
R
M
 
M
E
 
K
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
V
I
 
I
A
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
V
S
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
-
 
R
-
 
T
L
 
L
G
 
K
I
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
T
R
 
F
D
 
E
D
 
Y
T
 
T
K
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
K
E
 
A
Q
 
Q
M
 
I
A
 
L
M
 
E
A
 
A
D
 
E
-
 
G
D
 
Q
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
A
A
 
M
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
N
G
 
D
P
 
K
S
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
A
L
 
-
A
 
G
C
 
G
P
 
K
T
 
G
L
 
L
T
 
E
R
 
S
G
 
G
Q
 
K
F
 
H
A
 
S
Y
 
A
D
 
S
Y
 
L
G
 
-
D
 
N
S
 
A
A
 
G
Q
 
Q
L
 
V
T
 
G
P
 
V
L
 
F
T
 
H
K
 
G
M
 
M
-
 
L
-
 
S
H
 
Y
T
 
F
L
 
L
G
 
Q
S
 
D
G
 
G
F
 
Q
M
 
I
P
 
K
P
 
P
G
 
T
F
 
H
H
 
S
-
 
I
A
 
A
G
 
P
G
 
G
L
 
L
R
x
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
K
L
 
I
G
 
Q
Y
 
R
L
 
A
D
 
E
A
 
Y
R
 
V
A
 
T
Y
 
V
D
 
T
Q
 
D
L
 
E
D
 
E
C
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
L
 
H
E
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
 
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
Y
V
 
A
I
 
M
E
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
K
E
 
E
R
 
M
G
 
S
E
 
R
S
 
D
K
 
E
A
 
I
I
 
I
L
 
I
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
L

5t6mA Structure of the tryptophan synthase b-subunit from pyroccus furiosus with b-methyltryptophan non-covalently bound (see paper)
31% identity, 76% coverage: 76:421/454 of query aligns to 44:376/383 of 5t6mA

query
sites
5t6mA
R
 
K
Q
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
A
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
D
 
G
T
 
G
P
 
-
A
 
A
R
 
K
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
A
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
P
 
T
N
 
N
T
 
N
A
 
A
L
 
I
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
A
 
F
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
M
D
 
K
I
 
V
E
 
D
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
A
V
 
E
S
 
D
Y
 
V
K
 
E
Q
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
R
 
V
A
 
F
F
 
R
M
 
M
E
 
K
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
V
I
 
I
A
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
V
S
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
-
 
R
-
 
T
L
 
L
G
 
K
I
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
T
R
 
F
D
 
E
D
 
Y
T
 
T
K
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
K
E
 
A
Q
 
Q
M
 
I
A
 
L
M
 
E
A
 
A
D
 
E
-
 
G
D
 
Q
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
A
A
 
M
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
N
G
 
D
P
 
K
S
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
A
L
 
-
A
 
G
C
 
G
P
 
K
T
 
G
L
 
L
T
 
E
R
 
S
G
 
G
Q
 
K
F
 
H
A
 
S
Y
 
A
D
 
S
Y
 
L
G
 
-
D
 
N
S
 
A
A
 
G
Q
 
Q
L
 
V
T
 
G
P
 
V
L
 
F
T
 
H
K
 
G
M
 
M
-
 
L
-
 
S
H
 
Y
T
 
F
L
 
L
G
 
Q
S
 
D
G
 
G
F
 
Q
M
 
I
P
 
K
P
 
P
G
 
T
F
 
H
H
 
S
-
 
I
A
 
A
G
 
P
G
 
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
K
L
 
I
G
 
Q
Y
 
R
L
 
A
D
 
E
A
 
Y
R
 
V
A
 
T
Y
 
V
D
 
T
Q
 
D
L
 
E
D
 
E
C
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
L
 
H
E
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
 
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
Y
V
 
A
I
 
M
E
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
K
E
 
E
R
 
M
G
 
S
E
 
R
S
 
D
K
 
E
A
 
I
I
 
I
L
 
I
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
L

7rnpA Engineered tryptophan synthase b-subunit from pyrococcus furiosus, pftrpb2b9_h275e with 4-cl-trp non-covalently bound (see paper)
30% identity, 76% coverage: 76:421/454 of query aligns to 44:378/384 of 7rnpA

query
sites
7rnpA
R
 
K
Q
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
A
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
D
 
G
T
 
G
P
 
-
A
 
A
R
 
K
I
 
V
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
A
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
P
 
T
N
 
N
T
 
N
A
 
A
L
 
I
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
A
 
L
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
M
D
 
K
I
 
V
E
 
D
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
A
V
 
E
S
 
D
Y
 
V
K
 
E
Q
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
R
 
V
A
 
F
F
 
R
M
 
M
E
 
K
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
V
I
 
I
A
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
V
S
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
-
 
R
-
 
T
L
|
L
G
 
K
I
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
T
R
 
F
D
 
E
D
 
Y
T
 
T
K
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
x
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
K
E
 
A
Q
 
Q
M
 
I
A
 
L
M
 
E
A
 
A
D
 
E
-
 
G
D
 
Q
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
A
A
 
M
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
-
 
N
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
G
G
 
G
A
 
K
A
 
G
L
 
L
R
 
E
G
 
S
G
 
G
P
 
K
S
 
H
V
 
S
E
 
A
A
 
S
I
 
L
A
 
N
V
 
A
E
 
G
P
 
Q
L
 
V
A
 
G
C
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
V
T
 
S
R
 
E
G
 
G
Q
 
M
F
 
L
A
 
S
Y
 
Y
D
 
F
Y
 
L
G
 
Q
D
 
D
-
 
E
S
 
E
A
 
G
Q
 
Q
L
 
I
T
 
K
P
 
P
L
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
S
H
 
H
T
 
S
L
 
I
G
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
A
 
A
G
 
P
G
 
G
L
 
L
R
 
D
Y
|
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
K
L
 
I
G
 
Q
Y
 
R
L
 
A
D
 
E
A
 
Y
R
 
V
A
 
A
Y
 
V
D
 
T
Q
 
D
L
 
E
D
 
E
C
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
L
 
H
E
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
 
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
Y
V
 
A
I
 
M
E
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
K
E
 
E
R
 
M
G
 
S
E
 
R
S
 
D
K
 
E
A
 
I
I
 
I
L
 
I
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
 
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
L

5dw0A Trpb from pyrococcus furiosus with l-serine bound as the external aldimine (see paper)
31% identity, 76% coverage: 76:421/454 of query aligns to 44:378/388 of 5dw0A

query
sites
5dw0A
R
 
K
Q
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
A
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
D
 
G
T
 
G
P
 
-
A
 
A
R
 
K
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
A
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
P
 
T
N
 
N
T
 
N
A
 
A
L
 
I
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
A
 
F
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
M
D
 
K
I
 
V
E
 
D
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
A
V
 
E
S
 
D
Y
 
V
K
 
E
Q
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
R
 
V
A
 
F
F
 
R
M
 
M
E
 
K
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
V
I
 
I
A
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
V
S
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
-
 
R
-
 
T
L
 
L
G
 
K
I
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
T
R
 
F
D
 
E
D
 
Y
T
 
T
K
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
K
E
 
A
Q
 
Q
M
 
I
A
 
L
M
 
E
A
 
A
D
 
E
-
 
G
D
 
Q
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
F
 
A
A
 
M
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
N
G
 
D
P
 
K
S
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
A
L
 
G
A
 
G
C
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
K
G
 
G
Q
 
L
F
 
E
A
 
S
Y
 
G
D
 
K
Y
 
H
G
 
S
D
 
A
S
 
S
A
 
L
Q
 
N
L
 
A
T
 
G
P
 
Q
L
 
V
T
 
G
K
 
V
M
 
F
H
 
H
T
 
G
L
 
M
G
 
L
S
 
S
G
 
Y
F
 
F
M
 
L
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
K
P
 
P
P
 
T
G
 
H
F
 
S
H
 
I
A
 
A
G
 
P
G
|
G
L
 
L
R
x
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
K
L
 
I
G
 
Q
Y
 
R
L
 
A
D
 
E
A
 
Y
R
 
V
A
 
T
Y
 
V
D
 
T
Q
 
D
L
 
E
D
 
E
C
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
L
 
H
E
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
Y
V
 
A
I
 
M
E
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
K
E
 
E
R
 
M
G
 
S
E
 
R
S
 
D
K
 
E
A
 
I
I
 
I
L
 
I
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
L

5t6mB Structure of the tryptophan synthase b-subunit from pyroccus furiosus with b-methyltryptophan non-covalently bound (see paper)
30% identity, 76% coverage: 76:421/454 of query aligns to 44:378/386 of 5t6mB

query
sites
5t6mB
R
 
K
Q
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
A
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
D
 
G
T
 
G
P
 
-
A
 
A
R
 
K
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
A
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
K
|
K
P
 
T
N
 
N
T
 
N
A
 
A
L
 
I
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
A
 
F
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
|
T
G
 
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
M
D
 
K
I
 
V
E
 
D
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
A
V
 
E
S
 
D
Y
 
V
K
 
E
Q
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
R
 
V
A
 
F
F
 
R
M
 
M
E
 
K
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
V
I
 
I
A
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
V
S
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
-
 
R
-
 
T
L
 
L
G
 
K
I
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
T
R
 
F
D
 
E
D
 
Y
T
 
T
K
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
 
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
K
E
 
A
Q
 
Q
M
 
I
A
 
L
M
 
E
A
 
A
D
 
E
-
 
G
D
 
Q
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
A
A
 
M
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
N
G
 
D
P
 
K
S
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
L
 
K
A
 
H
C
 
S
P
 
A
T
 
S
L
 
L
T
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
A
 
G
Y
 
V
D
 
F
Y
 
H
G
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
Y
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
-
 
D
D
 
E
S
 
E
A
 
G
Q
 
Q
L
 
I
T
 
K
P
 
P
L
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
T
H
 
H
T
 
S
L
 
I
G
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
A
 
A
G
 
P
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
|
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
K
L
 
I
G
 
Q
Y
 
R
L
 
A
D
 
E
A
 
Y
R
 
V
A
 
T
Y
 
V
D
 
T
Q
 
D
L
 
E
D
 
E
C
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
L
 
H
E
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
 
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
Y
V
 
A
I
 
M
E
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
K
E
 
E
R
 
M
G
 
S
E
 
R
S
 
D
K
 
E
A
 
I
I
 
I
L
 
I
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
L

1v8zA X-ray crystal structure of the tryptophan synthase b2 subunit from hyperthermophile, pyrococcus furiosus (see paper)
30% identity, 76% coverage: 76:421/454 of query aligns to 44:378/386 of 1v8zA

query
sites
1v8zA
R
 
K
Q
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
A
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
D
 
G
T
 
G
P
 
-
A
 
A
R
 
K
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
A
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
P
 
T
N
 
N
T
 
N
A
 
A
L
 
I
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
A
 
F
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
L
T
 
I
T
 
A
E
|
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
W
 
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
M
D
 
K
I
 
V
E
 
D
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
A
V
 
E
S
 
D
Y
 
V
K
 
E
Q
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
R
 
V
A
 
F
F
 
R
M
 
M
E
 
K
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
V
I
 
I
A
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
V
S
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
-
 
R
-
 
T
L
 
L
G
 
K
I
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
V
A
 
A
Q
 
T
R
 
F
D
 
E
D
 
Y
T
 
T
K
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
K
E
 
A
Q
 
Q
M
 
I
A
 
L
M
 
E
A
 
A
D
 
E
-
 
G
D
 
Q
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
F
 
A
A
 
M
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
N
G
 
D
P
 
K
S
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
L
 
K
A
 
H
C
 
S
P
 
A
T
 
S
L
 
L
T
 
N
R
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
A
 
G
Y
 
V
D
 
F
Y
 
H
G
 
G
-
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
Y
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
-
 
D
D
 
E
S
 
E
A
 
G
Q
 
Q
L
 
I
T
 
K
P
 
P
L
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
T
H
 
H
T
 
S
L
 
I
G
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
A
 
A
G
 
P
G
 
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
K
L
 
I
G
 
Q
Y
 
R
L
 
A
D
 
E
A
 
Y
R
 
V
A
 
T
Y
 
V
D
 
T
Q
 
D
L
 
E
D
 
E
C
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
L
 
H
E
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
Y
V
 
A
I
 
M
E
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
K
E
 
E
R
 
M
G
 
S
E
 
R
S
 
D
K
 
E
A
 
I
I
 
I
L
 
I
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
|
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
L

5ey5B Lbcats
31% identity, 76% coverage: 79:422/454 of query aligns to 49:379/383 of 5ey5B

query
sites
5ey5B
R
 
R
P
 
P
A
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
F
A
 
A
R
 
E
R
 
N
L
 
L
E
 
T
K
 
K
A
 
D
L
 
L
D
 
G
T
 
G
P
 
-
A
 
A
R
 
K
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
N
P
 
H
A
 
T
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
P
 
I
N
 
N
T
 
N
A
 
A
L
 
L
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
A
 
R
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
K
R
 
R
I
 
V
T
 
I
T
 
A
E
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
Q
|
Q
W
 
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
T
A
 
V
G
 
A
A
 
A
M
 
M
F
 
F
D
 
G
L
 
L
D
 
E
I
 
C
E
 
V
V
 
V
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
A
V
 
E
S
 
D
Y
 
I
K
 
E
Q
 
R
K
 
Q
P
 
A
Y
 
L
R
 
N
R
 
V
A
 
F
F
 
R
M
 
M
E
 
K
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
C
 
V
I
 
-
A
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
N
 
R
P
 
P
A
 
V
S
 
T
T
 
S
G
 
G
S
 
S
-
 
R
-
 
T
L
 
L
G
 
K
I
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
M
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
V
A
 
T
Q
 
N
R
 
V
D
 
E
D
 
D
T
 
T
K
 
F
Y
 
Y
A
 
I
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
V
N
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
-
 
M
H
 
M
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
R
E
 
Q
Q
 
Q
M
 
I
A
 
L
M
 
E
A
 
K
D
 
E
D
 
G
-
 
R
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
F
 
A
A
 
M
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
H
P
 
P
F
 
F
L
 
I
G
 
D
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
G
R
 
K
G
 
G
G
 
I
P
 
E
S
 
T
V
 
G
E
 
K
A
 
H
I
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
L
P
 
S
L
 
A
A
 
G
C
 
R
P
 
P
T
 
G
L
 
V
T
 
L
R
 
H
G
 
G
Q
 
A
F
 
M
A
 
T
Y
 
Y
D
 
L
Y
 
L
G
 
Q
D
 
D
S
 
-
A
 
-
Q
 
E
L
 
D
T
 
G
P
 
Q
L
 
I
T
 
I
K
 
E
M
 
A
H
 
H
T
 
S
L
 
I
G
 
-
S
 
-
G
 
-
F
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
A
 
S
G
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
T
G
 
G
Y
 
R
L
 
A
D
 
E
A
 
Y
R
 
V
A
 
S
Y
 
V
D
 
T
Q
 
D
L
 
D
D
 
E
C
 
A
F
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
F
L
 
Q
E
 
L
F
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
A
 
S
N
 
S
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
Y
V
 
A
I
 
M
E
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
P
G
 
-
C
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
L
G
 
S
E
 
K
S
 
D
K
 
Q
A
 
I
I
 
I
L
 
V
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
|
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
V
Q
 
N

6cuzA Engineered trpb from pyrococcus furiosus, pftrpb7e6 with (2s,3r)- ethylserine bound as the amino-acrylate (see paper)
30% identity, 76% coverage: 76:421/454 of query aligns to 44:378/383 of 6cuzA

query
sites
6cuzA
R
 
K
Q
 
T
W
 
W
-
 
A
-
 
G
R
 
R
P
 
P
A
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
R
 
Y
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
T
K
 
E
A
 
K
L
 
I
D
 
G
T
 
G
P
 
-
A
 
A
R
 
K
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
L
K
 
K
Y
 
R
E
 
E
G
 
D
V
 
L
S
 
V
P
 
H
A
 
G
G
 
G
S
 
A
H
|
H
K
|
K
P
 
T
N
 
N
T
 
N
A
 
A
L
 
I
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
P
Y
 
L
N
 
A
H
 
K
A
 
L
E
 
M
G
 
G
V
 
K
R
 
T
R
 
R
I
 
L
T
 
I
T
 
A
E
 
E
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
W
x
H
G
 
G
S
 
V
S
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
L
F
 
L
D
 
G
L
 
M
D
 
K
I
 
V
E
 
D
V
 
I
F
 
Y
M
 
M
V
 
G
G
 
A
V
 
E
S
 
D
Y
 
V
K
 
E
Q
 
R
K
 
Q
P
 
K
Y
 
M
R
 
N
R
 
V
A
 
F
F
 
R
M
 
M
E
 
K
S
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
C
 
V
I
 
I
A
 
-
S
 
-
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
V
S
 
N
T
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
R
G
 
T
I
 
A
-
 
K
-
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
-
 
R
E
 
D
L
 
W
A
 
E
A
 
A
Q
 
T
R
 
F
D
 
E
D
 
Y
T
 
T
K
 
H
Y
 
Y
A
 
L
L
 
I
G
 
G
S
|
S
V
 
V
L
 
V
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
N
 
T
H
 
I
V
 
V
L
 
R
L
 
D
H
 
F
Q
 
Q
T
 
S
V
 
V
T
 
I
G
 
G
V
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
K
E
 
A
Q
 
Q
M
 
I
A
 
L
M
 
E
A
 
A
D
 
E
-
 
G
D
 
Q
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
T
 
V
V
 
I
I
 
V
A
 
A
C
 
C
T
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
N
|
N
F
 
A
A
 
M
G
 
G
I
 
I
V
 
F
F
 
Y
P
 
P
F
 
F
L
 
V
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
N
G
 
D
P
 
K
S
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
L
I
 
V
A
 
G
V
 
V
E
 
E
P
 
A
L
 
G
A
 
G
C
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
K
G
 
G
Q
 
L
F
 
E
A
 
S
Y
 
G
D
 
K
Y
 
H
G
 
S
D
 
A
S
 
S
A
 
L
Q
 
N
L
 
A
T
 
G
P
 
Q
L
 
V
T
 
G
K
 
V
M
 
L
H
 
H
T
 
G
L
 
M
G
 
L
S
 
S
G
 
Y
F
 
F
M
 
L
-
 
Q
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
K
P
 
P
P
 
S
G
 
H
F
 
S
H
 
I
A
 
A
G
 
P
G
|
G
L
 
L
R
 
D
Y
 
Y
H
 
P
G
 
G
M
 
V
A
 
G
P
 
P
Q
 
E
I
 
H
S
 
A
H
 
Y
L
 
L
K
 
K
D
 
K
L
 
I
G
 
Q
Y
 
R
L
 
A
D
 
E
A
 
Y
R
 
V
A
 
T
Y
 
V
D
 
T
Q
 
D
L
 
E
D
 
E
C
 
A
F
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
F
L
 
H
E
 
E
F
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
L
E
|
E
A
 
S
N
 
A
H
 
H
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
 
Y
V
 
A
I
 
M
E
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
C
 
-
R
 
K
E
 
E
R
 
M
G
 
S
E
 
R
S
 
D
K
 
E
A
 
I
I
 
I
L
 
I
F
 
V
N
 
N
L
 
L
C
x
S
G
 
G
H
 
R
G
 
G
N
 
D
F
 
K
D
 
D
M
 
L

Query Sequence

>WP_011814428.1 NCBI__GCF_000015585.1:WP_011814428.1
MSETVKYVLDEARIPRAWYNISADLPAPLAPVLHPATREPVSADDLAPLFPRGVIEQELT
TEREVEIPEPVRNAYRQWRPAPLYRARRLEKALDTPARIYYKYEGVSPAGSHKPNTALPQ
AFYNHAEGVRRITTETGAGQWGSSLALAGAMFDLDIEVFMVGVSYKQKPYRRAFMESFGA
RCIASPSQETAFGRSVLADNPASTGSLGIAIGEAVELAAQRDDTKYALGSVLNHVLLHQT
VTGVEAMEQMAMADDYPDTVIACTGGGSNFAGIVFPFLGAALRGGPSVEAIAVEPLACPT
LTRGQFAYDYGDSAQLTPLTKMHTLGSGFMPPGFHAGGLRYHGMAPQISHLKDLGYLDAR
AYDQLDCFAAGLEFARAEGIIPAPEANHAVKAVIEEAQGCRERGESKAILFNLCGHGNFD
MQAYTDYLAGNLSDLGGSQVEAAMALSGLPSVER

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory